Добірка наукової літератури з теми "Plantes – Maladies cryptogamiques – Épidémiologie"

L'étude de la symptomatologie montre que les taches sur rameau sporulent dans la première quinzaine de mai. Les caractéristiques de croissance et de morphologie du champignon sont étudiées. Les facteurs influençant la sporulation sont la température et l'humidité relative. Des essais de lutte raisonnée montrent que les traitements les plus précoces, visant la protection des feuilles afin de diminuer l'inoculum, sont les plus efficaces

L’introduction de champignons pathogènes envahissants est une cause très importante d’émergence de maladies forestières. Depuis ces 30 dernières années, la chalarose affecte sévèrement les frênes en particulier Fraxinus excelsior. L’agent pathogène causant cette maladie est un ascomycète originaire d’Asie de l’Est, Hymenoscyphus fraxineus. Il fut observé pour la première fois dans les années 1990 en Pologne, puis s’est rapidement disséminé en Europe pour atteindre la France en 2008. La maladie se dissémine principalement par dispersion aérienne des ascospores. Cette thèse vise à étudier l’épidémiologie de la chalarose du frêne en déterminant les facteurs environnementaux influençant le développement d’H. fraxineus et en proposant un modèle de dispersion de la maladie. Le premier objectif de cette thèse visait à optimiser une méthode de piégeage de l’inoculum aérien pour ensuite l’utiliser dans le but d’étudier le patron de dispersion d’H. fraxineus. Nous avons ainsi mis en place une expérimentation pour confirmer la fiabilité des résultats obtenus par biologie moléculaire à partir de faibles quantités de cibles, comme ceux observés sur le front de la maladie. Cette méthode de piégeage de spores aériennes a alors été comparée à des cartes de présence de la chalarose réalisées grâce à des signalements de symptômes. L’étude a été réalisée à différentes échelles, locale (commune) et régionale, avec des zones d’échantillonnage de l’ordre de la 100aine de km sur le front de la chalarose. Grâce à ce travail, nous avons pu déterminer un rayon d’action autour de la source d’inoculum à l’intérieur duquel des stratégies de gestion seraient les plus efficaces pour limiter le développement de la maladie. Le deuxième objectif de cette thèse consistait à déterminer quels facteurs environnementaux influencent le développement de la maladie, ce qui s’avère être un enjeu important pour la gestion forestière et l’avenir du frêne en tant qu’essence forestière dans les prochaines décennies. Nous avons montré qu’une importante densité d’hôte et une grande humidité du milieu influencent positivement le développement de la maladie. Ce travail a également permis de confirmer sur le terrain la sensibilité de l’agent pathogène aux fortes températures estivales, suggérant que la zone étudiée du Sud-Est de la France pourrait présenter des été trop chauds pour le développement de la maladie. A plus large échelle, le changement climatique pourrait jouer en faveur des frênes. De plus, la présence d’un effet Allee dans la dynamique de population de l’agent pathogène a été suggérée par nos résultats expérimentaux. Le dernier objectif de cette thèse était de modéliser la dispersion de la maladie en France. Nos travaux ont permis de mettre en évidence une vitesse de dispersion d’environ 60 km / an. Un modèle de réaction-diffusion a été développé pour mettre en relation la dispersion, la dynamique de population d’H. fraxineus et les facteurs environnementaux influençant son développement. Ce modèle de dispersion qui utilise des données standards issues du système d’épidémio-surveillance forestier du Département de la Santé des Forêts apportera des connaissances utiles à la mise en place de stratégies de gestion. Cette thèse ouvre des perspectives sur le devenir du frêne dans un contexte de changement climatique et plus largement sur la gestion des invasions biologiques
Introduction of invasive pathogen fungi is a major cause of forest diseases emergence. For 30 years, a dieback has severely affected ashes and in particular Fraxinus excelsior. The pathogenic fungus causing the disease is an ascomycete originating from Eastern Asia, Hymenoscyphus fraxineus. It was observed for the first time in 90’s in Poland, then rapidly spread over Europe and was reported in France in 2008. The disease is mainly spread by airborne ascospores. The aim of this thesis is to study the epidemiology of H. fraxineus dispersal by determining environmental factors which impact pathogen development, and by proposing a dispersal model of the disease. The first objective of this thesis was to improve the trapping method of airborne inoculum and then, to use it to study the dispersal pattern of H. fraxineus. An experiment was set up to confirm the reliability of the molecular biology test for low levels of target such as these observed at the disease front. This trapping method of airborne spores was then compared to maps of disease presence deriving from symptoms reports on ashes. The study was realized at different scales, landscape (village) and regional, with sampling area of about 100 km at the disease front. This work enabled us to determine a radius around inoculum source that would have to be manage for effectively limit the disease development. The second objective of the thesis aimed at determining environmental factors which influence disease development, which is an important issue for forest management and future of ashes in the next decade. We have shown that high host density and high humidity both positively impact disease development. This work confirmed the pathogen susceptibility to high summer temperatures in natural settings and suggests that the climate of Southeastern France should limit disease development. At a larger scale, climate change may work in favor of ashes. Moreover, an Allee effect presence in the population dynamic of H. fraxineus was suggest by our experimental results. The last objective of this thesis was to model the disease spread in France. Our works estimated the spread speed to 60 km per year. A reaction-diffusion model was developed to link dispersal disease according to H. fraxineus population dynamic and environmental factors which impact its development. This dispersal model which can use standard data of French forest health surveillance system will provide new knowledge useful to implement management strategies. This thesis offers perspectives on the future of ashes in a context of climate change and more broadly about the management of biological invasions

Les populations de frêne commun Européen (Fraxinus excelsior) sont aujourd'hui soumises à l'épidémie de chalarose. Les premiers dépérissements de frêne ont été signalés au début des années 90 en Pologne suite à l'introduction du champignon pathogène Hymenoscyphus fraxineus originaire du Nord Est de l'Asie. En 2022, l'épidémie s'étendait sur la majeure partie de l'aire de répartition de F. excelsior provoquant des mortalités importantes. L'impact du pathogène est d'autant plus élevé lorsque l'infection est massive. Cette thèse se focalise donc sur la source d'inoculum du pathogène présente sur les débris de feuilles de la litière. Avec pour objectifs de mieux comprendre les facteurs démographiques et environnementaux déterminants pour cette production d'inoculum. Le premier axe se focalise sur la dynamique de population d'H. fraxineus en lien avec la densité de son hôte et la densité dépendance de la production d'inoculum. La multiplication de ce champignon est exclusivement réalisée par reproduction sexuée, les conidies jouant le rôle de spermaties. Leur dispersion étant de quelques dizaine de centimètres, le succès de reproduction est fortement dépendant de la probabilité de rencontre des partenaires sexuels, elle-même dépendante de la densité de population du pathogène. Le suivi de la production de fructification (issue de la reproduction sexuée) en fonction de la densité de population d'H. fraxineus a été réalisé au sein d'un réseau de peuplement suivant un gradient de densité en frêne. Cette partie a mis en évidence, d'une part une densité de population d'H. fraxineus étroitement liée à la densité d'hôte, et d'autre part une production limitée de l'inoculum à faible densité de population, cette densité dépendance à faible effectif est appelé effet Allee. Le deuxième axe estime la persistance du pathogène dans les peuplements contaminés et l'évolution de sa capacité à produire de l'inoculum avec le temps. Cette persistance est un élément essentiel à prendre en compte dans le cadre d'une éradication mais également dans la compréhension du mécanisme d'établissement de la population. Le dispositif installé au sein de peuplements de frênes a permis de suivre la cinétique de dégradation de la litière de frêne en fonction de son taux de colonisation par H. fraxineus ainsi que le potentiel de fructification du champignon selon l'âge de la litière en cours de dégradation. La mise en évidence de la persistance de la litière colonisée par le pathogène pendant au moins trois ans et la capacité de ce dernier à fructifier durant cette période est une preuve qu'un réservoir d'inoculum s'installe durablement dans les peuplements contaminés. Ce réservoir d'inoculum pourrait jouer un rôle déterminant pour relancer une épidémie après une année défavorable à l'infection foliaire. Le troisième axe décrit les communautés fongiques présentes dans la litière de frêne en décomposition et au sein de laquelle H fraxineus poursuit son développement après la chute des feuilles colonisées. A partir de données métabarcoding de l'ITS1 fongique, l'étude compare les communautés fongiques présentent sur les feuilles au moment de leur chute à l'automne et les communautés fongiques présentes sur les résidus foliaires au printemps. L'évolution des abondances de chaque espèce de la communauté fongique est confrontée à celle d'H. fraxineus. Les espèces identifiées comme ayant une abondance négativement corrélée à l'abondance d'H. fraxineus pourraient présenter une action antagoniste au développement hivernal du pathogène, limitant ainsi sa présence au printemps suivant et réduisant son pouvoir de production d'inoculum. Les travaux réalisés mettent en évidence l'importance de considérer la diversité des facteurs pouvant intervenir dans la production d'inoculum. Ces derniers peuvent être déterminants pour l'établissement d'une population du pathogène invasif étudié au sein des peuplements de frêne
Populations of common European ash (Fraxinus excelsior) are currently suffering from the chalarosis epidemic. The first ash dieback was reported in the early 1990s in Poland following the introduction of the pathogenic fungus Hymenoscyphus fraxineus, which originated in north-east Asia. In 2022, the epidemic had spread over most of the range of F. excelsior, causing significant mortality. The impact of the pathogen is all the greater when the infection is massive. This thesis therefore focuses on the pathogen's source of inoculum in leaf litter debris. The aim is to gain a better understanding of the demographic and environmental factors that determine inoculum production. The first axis focuses on the population dynamics of H. fraxineus in relation to the density of its host and the density dependent on inoculum production. This fungus multiplies exclusively by sexual reproduction, with conidia playing the role of spermatia. As they are dispersed over a distance of just a few dozen centimetres, reproductive success is highly dependent on the probability of sexual partners meeting, which in turn depends on the pathogen's population density. Fruiting body production (from sexual reproduction) was monitored as a function of H. fraxineus population density in a network of stands following an ash density gradient. This section highlighted, on the one hand, a population density of H. fraxineus closely linked to host density and, on the other hand, a limited production of inoculum at low population density. This density dependency at low numbers is known as the Allee effect. The second axis estimates the persistence of the pathogen in contaminated stands and changes in its capacity to produce inoculum over time. This persistence is an essential factor to take into account in eradication, but also in understanding the population establishment mechanism. The system installed in ash stands was used to monitor the degradation kinetics of ash litter as a function of its rate of colonisation by H. fraxineus, as well as the fungus' fruiting potential depending on the age of the litter during degradation. The persistence of litter colonised by the pathogen for at least three years and the ability of the pathogen to fructify during this period is proof that a reservoir of inoculum has been established on a long-term basis in contaminated stands. This reservoir of inoculum could play a decisive role in relaunching an epidemic after a year in which foliar infection is unfavourable. The third axis describes the fungal communities present in the decomposing ash litter in which H. fraxineus continues to develop after the colonised leaves have fallen. Using fungal ITS1 metabarcoding data, the study compares the fungal communities present on the leaves at the time of their fall in autumn and the fungal communities present on the leaf residues in spring. Changes in the abundance of each species in the fungal community were compared with those of H. fraxineus. The species identified as having an abundance negatively correlated with the abundance of H. fraxineus could have an antagonistic effect on the winter development of the pathogen, thus limiting its presence the following spring and reducing its inoculum production capacity. The work carried out highlights the importance of considering the diversity of factors involved in inoculum production. These factors may be decisive in the establishment of a population of the invasive pathogen studied in ash stands

L’esca est une maladie vasculaire très dommageable pour la vigne puisqu’elle provoque la mort du cep à plus ou moins long terme. Cette maladie, très complexe, met en jeu plusieurs champignons pathogènes parmi lesquels Phaeomoniella chlamydospora et Phaeoacremonium aleophilum sont considérés comme agents pionniers. Ces champignons sécrètent des molécules toxiques dans leur milieu de culture. Appliquées sur cellules de vigne, ces molécules agissent sur des étapes clés des réponses de la plante aux agents pathogènes : modifications du potentiel de membrane, des flux de protons, de l’absorption des nutriments et induction de la mort cellulaire. Ces modifications ont été reliées à des variations d’activité d’enzymes régulant ces divers processus : H+-ATPase de la membrane plasmique, NADPH oxydase et phénylalanine ammonia-lyase. La nature polypeptidique de composés sécrétés respectivement par P. Chlamydospora et P. Aleophilum a permis d’obtenir des anticorps polyclonaux dirigés contre ces molécules. Un test immunologique réalisé à partir d’empreintes de sarments sur membrane de nitrocellulose, méthode simple et peu destructive, a permis de détecter la présence ou non des champignons dans la plante. Ce test a été validé en serre sur des boutures de vigne inoculées sélectivement par chacun des champignons, puis utilisé au vignoble sur des plantes présentant ou non des symptômes de la maladie. Un traitement contre l’esca a été mis au point en utilisant un mélange de molécules présentant des propriétés antifongiques ou élicitrices de réactions de défense. Après détermination de l’activité antifongique du mélange sur P. Chlamydospora et P. Aleophilum en culture in vitro, un traitement a été réalisé en serre par pulvérisation foliaire de boutures de vigne inoculées sélectivement. L’efficacité du traitement a été contrôlée en utilisant le test de détection immunologique
Esca is a vascular disease very harmful to the vine since it causes long term stock death. This complex disease involves several pathogenic fungi among which Phaeomoniella chlamydospora and Phaeoacremonium aleophilum are viewed as the first invader fungi. The above mentioned fungi secreted several toxic molecules into their culture medium. Applied to grapevine cells, these molecules act on key stages of plant responses to pathogenic agents namely: modifications of membrane potential, proton fluxes, nutrient absorption and induction of cell death. These modifications have been linked with changes in enzyme activities controlling the following processes: H+-ATPase of the plasma membrane, NADPH oxidase and phenylalanine ammonia-lyase. The polypeptidic nature of certain compounds secreted by P. Chlamydospora and P. Aleophilum enabled us to obtain polyclonal antibodies directed against these polypeptides which were subsequently used for the optimisation and validation of a dot-blot method. This simple test could distinguish between infected and non-infected plants. This test was initially validated on grapevine cuttings grown in a greenhouse and which were inoculated selectively by each fungus. The test was then used in a vineyard on plants in the presence or absence of foliar esca symptoms. A treatment against esca was developed by either mixing molecules having antifungal action or inducing plant defence reactions. After verification of the antifungal activity of the association on P. Chlamydospora and P. Aleophilum on an in vitro culture, a treatment was evaluated in a greenhouse by foliar pulverization on grapevine cuttings inoculated selectively. The efficiency of the treatment was monitored by using the dot-blot method

Ce travail est consacre a l'etude chez le haricot, d'enzymes considerees comme proteines de defense: les b-1,3-glucanases. L'experimentation est realisee sur le modele phaseolus vulgaris-colletotrichum lindemuthianum, champignon responsable d'une anthracnose. Il s'agit d'une interaction de type gene pour gene. L'utilisation d'une part, de cultivars sensibles et resistants au pathogene et d'autre part, de plusieurs races physiologiques du champignon, a permis d'etudier les b-1,3-glucanases dans divers cas de compatibilite et d'incompatibilite. Il a ete ainsi demontre que: suite a l'inoculation de la plante par le champignon, l'activite b-1,3-glucanase est stimulee de facon plus precoce lors d'une situation de resistance que lors d'une situation de sensibilite; deux enzymes basiques, a activite b-1,3-endo-glucanase, sont elicitees dans l'interaction. Elles different des formes enzymatiques constitutives par leurs caracteristiques physicochimiques (pi, pm, stabilite) et leur action hydrolytique. Ces deux enzymes ont ete purifiees a homogeneite et sequencees; certaines des b-1,3-glucanases du haricot (constitutives ou elicitees) peuvent hydrolyser des parois cellulaires isolees du pathogene; ces enzymes sont en partie localisees dans les espaces intercellulaires de la plante; elles peuvent etre stimulees suite a l'absorption d'eliciteurs fongiques (endopolygalacturonase et fragments parietaux)

Les maladies d’origine tellurique sont difficilement contrôlables par la lutte chimique ou variétale et se caractérisent par des processus et des échelles spatio-temporelles différents de ceux des maladies aériennes. En particulier, les modes de dispersion des agents pathogènes du sol permettent l’apparition et le maintien d’une forte structure spatiale de ces maladies, qui se développent souvent sous forme de foyers. Cette agrégation influence à la fois la dynamique temporelle des épidémies et la relation dégâts-dommages, ce qui en fait un élément important du raisonnement des méthodes de lutte. L’objectif de cette thèse est de comprendre et de modéliser le développement spatio-temporel des épidémies d’origine tellurique afin d’en déduire des stratégies de gestion susceptibles de limiter les risques associés, en particulier en agissant sur la structure spatiale de ces maladies. Pour ce faire, deux modèles ont été développés. Le premier, spatialement explicite et assez détaillé biologiquement a été paramétré en conditions contrôlées dans le cas du piétin-échaudage du blé. Le test de ce modèle à l’aide de données issues du champ montre une bonne précision malgré un biais positif et indique des pistes pour améliorer la valeur prédictive du modèle. Le second modèle, plus simple et plus générique, utilise la théorie de la hiérarchie pour simuler le développement d’épidémies à plusieurs échelles spatiales simultanément. Il permet de tester des hypothèses concernant le fonctionnement des épidémies et les liens entre incidences à différentes échelles, et en particulier l’effet de la structure spatiale du peuplement hôte et de l’inoculum primaire sur la dynamique etl ‘agrégation de la maladie. Dans le cas du piétin-échaudage, pour lequel nous avons montré l’importance de la structure spatiale de l’inoculum primaire, ces simulations conduisent à préconiser des semis différents en fonction du rang dans la succession culturale
Soilborne diseases are difficult to control by fungicides or resistant cultivars ; they are characterized by processes and spatio-temporal scales that can be different from those of aerial pathogens. In particular, the dispersal processes of soiborne pathogens result in the appearance and persistence of strong spatial patterns, namely disease foci. Aggregation inflences both the temporal dynamics of diseases and their relation to crop losses thus making spatial pattern an important factor when assessing control methods. The objectives of this study were to understand and model the spatio-temporel develoment of soilborne epidemics in order to determine control strategies that may reduce disease risk through an effect on spatial pattern. To that end, two models were developed. The first one is spatially explicit and biologically realistic ; its parameters were measured for take-all disease of wheat. The model was tested with field data ; this showed that the model is precise but overestimates disease development. This test also provided possible avenues for improving the predictive ability of the model. The second model is simpler and more genetic ; it uses hierarchy theory in order to simulate disease spread across multiple spatial scales. Hypotheses concerning the behaviou of epidemics and the relationships between disease incidences at different spatial scales culd be tested using this model for example the effect of the host and inoculum spatial structures on disease dynamics and aggregation. In the case of take-all disease of wheat –for which we have demonstrated the importance of the spatial pattern of primary inoculum- the simulation results advocate for different sowing patterns according to the rank of consecutive wheat crops

Les plantes de grandes cultures, dont le lin fait partie, sont constamment confrontées à de nombreux pathogènes dont l’impact sur la production peut s’avérer dramatique, impliquant inéluctablement des intrants chimiques. Pour lutter contre ces microorganismes, les plantes utilisent l'immunité innée appelée M/PTI (Microbe/Pathogen-Associated Molecular Patterns Triggered Immunity). La perception des agents pathogènes se met en place lors de la reconnaissance des motifs conservés à la surface des micro-organismes (M/PAMPs), par des protéines membranaires de la cellule végétale appelées PRRs (Pattern Recognition Receptors). L’utilisation d’éliciteurs capables de mimer les M/PAMPs et d’améliorer la résistance des plantes lors d’un stress représente une méthode de lutte alternative à l’utilisation de pesticides. Ainsi, le criblage d’une chimiothèque de 1600 molécules a permis d’identifier cinq composés capables d’activer la mise en place des mécanismes de défense chez la plante modèle Arabidopsis thaliana. Dans le cadre de mon projet de thèse, nous avons testé la capacité de ces cinq potentiels stimulateurs de défense des plantes (SDP) à améliorer la résistance du lin face au champignon pathogène Fusarium oxysporum (Fo) f. Sp. Lini, responsable de la fusariose vasculaire. Les résultats ont révélé que parmi ces cinq, deux composés, un naturel holaphyllamine (HPA) et un synthétique M4, n’affectent ni la croissance des plantules de lin aux concentrations inférieures à 10 μM, ni le développement et la germination des spores de F. Oxysporum. Les analyses microscopiques ont montré que HPA et M4 à 1 μM sont capables d’induire un stress oxydatif et la production de dépôts de callose. Par ailleurs, des analyses transcriptomiques ont révélé que ces deux molécules induisaient l’expression de deux gènes de défense (Pathogenesis-Related) : PR-2 et PR-3 codant une β-(1,3)-glucanase et une endo-chitinase, respectivement pouvant être impliquées dans la dégradation de la paroi du champignon. Finalement, les plantes de lin prétraitées avec HPA ou M4 présentent une diminution dans l’intensité des symptômes foliaires de plus de 50 et 70 %, respectivement. L’ensemble de ces résultats montre que l’HPA et M4 sont des SDP car ils sont capables d’activer les mécanismes de défense du lin et d’améliorer sa résistance face à F. Oxysporum
Plants are surrounded by a diverse range of microorganisms that can cause serious crop losses and requires the use of pesticides. Flax is a major crop in Normandy and is regularly challenged by the pathogenic fungus Fusarium oxysporum (Fo) f. Sp. Lini. In order to protect themselves, plants use “innate immunity” called M/PTI (Microbe/Pathogen-Associated Molecular Patterns Triggered Immunity) as a first defense line against pathogens. Plants are able to perceive pathogens by the recognition of conserved motifs on the surface of the pathogens (M/PAMPs), by transmembrane protein receptors (PRRs, Pattern Recognition Receptors). The use of elicitors able to mimic M/PAMPs and activate plant defense may be an alternative for plant protection that could minimize the use of pesticides. Based on this, previous work was conducted by screening a chemical library of 1600 compounds and has allowed the identification of five compounds able to activate defense responses in Arabidopsis thaliana. During my PhD thesis, we tested those five compounds on their abilities to improve resistance of two commercially available flax varieties used for their fibers against F. Oxysporum, responsible of the vascular wilt. The data show that two of them, holaphyllamine (HPA) a natural compound and M4 a synthetic one, did not affect flax growth up to 10 μM. In addition, they did not have any negative effects on F. Oxysporum development and spores germination at the tested concentrations (up to 10 μM). Cell imaging analyses showed that HPA and M4 at 1 μM can induce oxidative burst as well as callose deposition in flax, a well-known marker of PAMP-elicited defense mechanisms. Furthermore, transcriptomic analyses showed that HPA and M4 induced changes in the expression patterns of two pathogenesisrelated (PR) genes (PR-2 and PR-3) coding for a β-(1,3)-glucanase and an endo-chitinase, respectively. These enzymes can degrade the fungal cell wall and stop its growth. Finally, flax plants pre-treated with HPA and M4 before infection with Fo f. Sp. Lini exhibited a decrease in the foliar disease symptoms by more than 50 % and 70 %, respectively. Together, these findings demonstrate that HPA and M4 are elicitors as they are able to activate defense responses in flax plants that lead to improving its resistance against Fo infection

Deux maladies cryptogamiques affectent les cocotiers du Brésil. Le Phyllachora torrendiella et le Botryosphaeria cocogena provoquent le dessèchement des feuilles ce qui entrave la culture intensive du cocotier. Le Phyllachora torrendiella a été rendu responsable de la maladie appellée 'Lixa pequena" ou 'Tar spot'. Cet Ascomycète se manifeste sous forme de pustules noires à la face supérieure des folioles de cocotier. Ces structures sont soit des périthèces à huit ascospores hyalines et unicellulaires, soit des spermogonies à spermaties également hyalines de type scolécospore. Ces spermogonies se développent seules dans les premiers temps de l'épidémie puis dans le stroma les portant se développe le périthèce. Les ascospores sont frappées de dormance. La germination n'a été obtenue qu'en présence de Gibbérellines. La culture du Pyllachora torrendiella n'a pas été possible car la croissance de l'hyphe est stoppée juste après la levée de dormance. Les dégâts du Botryosphaeria cocogena, conus sous le nom de maladie 'Queima das Folhas' ou 'Leaf blight', se présentent sous forme de lésions de couleur marron jaune, qui en confluant, provoquent le dessèchement foliaire des cocotiers. Cet Ascomycète est le plus souvent présent sous sa forme asexuée, proche des Sphaeropsis, à conidies généralement hyalines et unicellulaires. La forme sexuée s'observe dans certaines plantations, sous forme de périthèces à huit ascospores hyalines et unicellulaires. Le gamétophyte mâle a été observé juste avant la formation des périthèces et produit des microspores ovoïdes à rôle de spermaties. La production périthéciale a été maîtrisée en culture sur un milieu semi-synthétique. Le Botryosphaeria cocogena est un Ascomycète caractérisé comme monoécique et homothallique. En réalité, ces deux Ascomycètes forment un complexe parasitaire sur le cocotier. Le Botryosphaeria cocogena est un champignon de faiblesse. Il pénètre dans la feuille grâce au stroma de Phyllachora torrendiella, qui lui tient lieu de porte d'entrée. Le Botryosphaeria cocogena envahit dans un premier temps, les espaces inter-cellulaires des tissus foliaires puis rapidement investit toutes les cellules à l'exception des tissus conducteurs qui restent indemnes. Le Botryosphaeria cocogena est légèrement moins virulent sur les hybrides par rapport aux races pures de cocotiers. L'étude de souches géographiquement distantes a montré une faible variabilité au sein de l'espèce. Il a été mis en évidence la présence d'un autre Botryosphaeria, le Botryosphaeria rhodina, uniquement sur les lésions présentes sur les noix de coco ou le rachis. Ce champignon n'est pas spécifique du cocotier et pénètre à la faveur d'une blessure. (voir la 4e de couverture)

On ne dispose a l'heure actuelle d'aucune variete de tournesol presentant un degre absolu de resistance a slerotinia sclerotiorum, champignon responsable de la pourriture blanche, ni de marqueurs biochimiques de resistance a cette maladie. C'est pourquoi des marqueurs moleculaires de tolerance du tournesol a ce parasite ont ete recherches. Un systeme d'infection localisee au niveau du collet de jeunes plantes a ete mis au point en conditions controlees. Il permet de discriminer les genotypes sensibles des tolerants. L'effet de l'infection sur l'expression des genes de la petite sous-unite de la ribulose-1,5-bisphosphatecarboxylase (ssu), enzyme cle du metabolisme photosynthetique, et des genes des glycoproteines riches en hydroxyproline (hrgp), proteines parietales associees a la defense, a ete etudie par hybridation northern. L'inoculation du collet provoque dans les feuilles une diminution du taux des arn de la ssu detectable des le 2eme jour dans une lignee sensible (ha89) et seulement au 8eme jour dans une lignee tolerante (ps3b). Inversement, l'infection induit a distance l'accumulation de plusieurs transcrits hrgp des le 2eme jour chez ps3b, plus tardivement (3eme jour) et de facon transitoire chez ha89. Ces effets differentiels de l'infection sont partiellement reproduits par l'absorption d'acide oxalique, toxine produite par sclerotinia sclerotiorum capable de reproduire en partie les symptomes de la maladie in situ. Cette molecule toxique joue un role d'eliciteur puisqu'elle induit l'augmentation des transcrits d'une proteine de defense: hrgp. Une modification du taux des arn de la ssu et de hrgp pourrait donc etre retenue comme marqueur moleculaire refletant le degre de tolerance des plantes de tournesol a sclerotinia sclerotiorum

L'objectif de ce travail est de trouver un moyen de diagnostic precoce par le test elisa, de ceratocystis fimbriata f. Platani, agent du chancre colore du platane. Cette grave maladie sevit dans plusieurs pays du sud de l'europe, dont le sud-est de la france. Un antiserum est fabrique avec les extraits proteiques de l'isolat de c. Fimbriata entr2. Il reconnait l'antigene homologue, ainsi que d'autres isolats, au total 10, provenant de suisse ou de marseille. L'antiserum ne reconnait aucun de champignons lignivores couramment rencontres dans notre region sur platane. Sa confrontation avec 12 especes de ceratocystis issues de diverses essences forestieres ne montre de parente serologique qu'avec c. Olivacea. Donc on peut dire que l'antiserum est dote d'un bon niveau de specificite et un spectre de detection large. Dans le cas de bois peu contamine, la mise en evidence de c. Fimbriata f. Platani n'est possible que par le test elisa. Une amplification des reponses est etudiee avec le systeme biotine-avidine qui permet une hausse significative des densites optiques. Des techniques tres fines, empruntees a la geostatistique, sont etudiees pour apprecier quantitativement la repartition spatiale du parasite au sein des arbres infectes. Cette demarche indispensable a permis de raisonner un mode d'echantillonnage optimal au sein des arbres apparemment sains. C. Fimbriata f. Platani peut etre detecte par ses aromes dont la composante principale est l'acetate d'isobutyle. La validation de cette technique doit etre poursuivie sur des echantillons de bois de platane provenant d'arbres apparemment sains