Добірка наукової літератури з теми "G-073"
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Статті в журналах з теми "G-073"
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Erwin, Terry L. "ARBOREAL BEETLES OF TROPICAL FORESTS: THE XYSTOSOMI GROUP, SUBTRIBE XYSTOSOMINA (COLEOPTERA: CARABIDAE: BEMBIDIINI). PART I. CHARACTER ANALYSIS, TAXONOMY, AND DISTRIBUTION." Canadian Entomologist 126, no. 3 (June 1994): 549–666. http://dx.doi.org/10.4039/ent126549-3.
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AbstractA group of subarboreal tropical beetles, the Xystosomi of subtribe Xystosomina new subtribe, is revised and reclassified based on a reevaluation of structural characters. Xystosomi are found in tropical Australia (Queensland) and tropical/subtropical America (Guerrero, México, to Aguas Blancas, Argentina). The largest concentration of species occurs near the equator in the Amazon Basin, but a significant radiation of flightless forms was recently discovered in the northern Andes of Colombia, Ecuador, and Venezuela. Xystosomina also includes the Mioptachyi, which at present is composed of the genera Mioptachys and Inpa.Seventy-six species of Neotropical and Australian Xystosomi are described or re-described, illustrated, or keyed. This assemblage includes 12 classic species, 24 species described in the last 3 decades, and 40 new species, a 6-fold increase since the time of Henry Walter Bates, the last 19th-century entomologist to study this remarkable lineage of carabid beetles. The Xystosomi are now arrayed in five genera: Philipis gen.nov. (type: Tachys trunci Darlington, Australia), Geballusa gen.nov. (type: Xystosomus microtretus Erwin, Costa Rica), Gouleta gen.nov. (type: Bembidion cayennense Dejean, Brazil), Batesiana gen.nov. (type: Xystosomus gruti Bates, Brazil), and Xystosomus Schaum (type: Xystosomus inflatus Schaum, Brazil).The following specific taxa are described as new (type-locality in parentheses): Geballusa rex (Brazil: 06°02′N 050°17′W), oligotreta (Panamá: 08°40′N 079°56′W), nannotreta (Brazil: 02°54′S 059°57′W), Gouleta gentryi (Perú: 12°50′S 069°20′W), Batesiana para (Brazil: 01°22′S 048°20′W), angustia (Perú: 05°08′S 074°45′W), samiria (Perú: 05°08′S 074°45′W), esheje (Perú: 05°08′S 074°45′W), crassa (Perú: 03°15′S 072°55′W), notesheje (Perú: 03°15′S 072°55′W), manusculptilis (Perú: 12°07′S 070°58′W), parapara (Brazil: 02°28′S 046°26′W), am (Perú: 05°08′S 074°45′W), indetecticostis (Ecuador: 00°57′S 077°48′W), nox (Ecuador: 00°57′S 077°48′W), parkeri (Perú: 03°15′S 072°55′W), hamatilis (Ecuador: 01°02′S 077°40′W), notparkeri (Colombia: 00°08′N 075°51′W), pfunorum (Perú: 03°15′S 072°55′W), quadrata (Perú: 03°15′S 072°55′W), protosculptilis (Perú: 12°50′S 069°20′W), misahualli (Ecuador: 01°02′S 077°40′W), depressisculptilis (Ecuador: 01°02′S 077°40′W), irisculptilis (Ecuador: 00°24′S 076°37′W), foveosculptilis (Brazil: 02°28′S 046°26′W), punctisculptilis (Perú: 03°15′S 072°55′W), eugeneae (Perú: 11°56′47″S 071°17′00″W), anchicaya (Colombia: 03°43′N 076°57′W), jefe (Panamá: 09°12′N 079°21′W), exigupunctata (Perú: 05°08′S 074°45′W), rosebudae (Ecuador: 00°57′S 077°48′W), equanegrei (Ecuador: 00°57′S 077°48′W), henryi (Ecuador: 00°28′S 077°53′W), baeza (Ecuador: 00°57′S 077°48′W), huacamayas (Ecuador: 00°28′S 077°53′W), dannyi (Ecuador: 00°57′S 077°48′W), alticola (Colombia: 04°21′S 074°22′W), jacupiranga (Brazil: 24°42′S 048°00′W), chiriboga (Ecuador: 00°15′S 078°44′W), wygo (Colombia: 04°53′N 074°31′W).The following names are resurrected from synonymy for good species: hilaris Bates and belti Bates. Several name combinations were changed as a result of the generic reorganization: Philipis trunci (Darlington), Geballusa microtreta (Erwin), G. polytreta (Erwin), Gouleta notiophiloides (Erwin), G. spangleri (Erwin), G. cayennense (Dejean), Batesiana bisulcifrons (Erwin), B. negrei (Erwin), B. hilaris (Bates), B. belti (Bates), B. ampliata (Bates), B. strigosa (Bates), B. gruti (Bates), B. nigripalpis (Erwin), B. villiersi (Perrault), B. apicisulcata (Erwin), B. iris (Erwin), B. sculpticollis (Bates), B. sulcicostis (Bates), B. anterocostis (Erwin), B. ovatula (Bates), B. grossipunctata (Erwin), B. batesi (Erwin), B. seriata (Erwin), B. sublaevis (Bates), B. aetholia (Erwin), B. parainsularis (Erwin), NEW COMBINATIONS.Results of the Xystosomi character analysis provided impetus for a reanalysis of the classification of the major lineages of the more inclusive group, Bembidiini, to discover where the Xystosomi might belong and, in turn, if our understanding of the Bembidiini itself needed adjustment. These results are implied in Part I, but presented in detail in a separate paper, Part II. Phylogeny and Zoogeography, along with supplemental taxonomic information.
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Crisanto-Juárez, Andrés U., Araceli M. Vera-Guzmán, José L. Chávez-Servia, and José C. Carrillo-Rodríguez. "CALIDAD DE FRUTOS DE TOMATES SILVESTRES (Lycopersicon esculentum var. cerasiforme Dunal) DE OAXACA, MÉXICO." Revista Fitotecnia Mexicana 33, Especial_4 (December 30, 2010): 7. http://dx.doi.org/10.35196/rfm.2010.especial_4.7.
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México posee diversos acervos genéticos de tomate (Lycopersicon esculentum Mill.) que fueron generados durante largos procesos de domesticación y diversificación, pero poco documentados en cuanto a calidad de frutos. Para evaluar la calidad física, química y nutricional de frutos de tomate silvestre (L. esculentum var. cerasiforme Dunal), se hizo una colecta de 17 muestras en ocho municipios del estado de Oaxaca, México. Las semillas de las muestras se sembraron, bajo un diseño de bloques al azar con tres repeticiones, en invernadero durante el ciclo primavera-verano 2009. En cada parcela experimental se tomó una muestra de frutos maduros (rojos), firmes y sanos, en la que se evaluaron los contenidos de licopeno, vitamina C, sólidos solubles, pH, azúcares reductores, acidez titulable, y las coordenadas cromáticas L*, a* y b*. Mediante un análisis de componentes principales se determinó que los contenidos de licopeno, sólidos solubles, pH, azúcares reductores, acidez titulable, y los parámetros de color, fueron las variables más importantes para describir la variabilidad evaluada. Un análisis de conglomerados reveló la presencia de tres grupos entre las colectas evaluadas. Se presentaron diferencias (P < 0.05) entre grupos y entre colectas en todas las variables. Las colectas L-063 y L-073, ambas de San Blas Atempa, sobresalieron en licopeno en base húmeda con 26.8 y 28.2 mg 100 g-1, y en base seca con 368.1 y 343.9 mg 100 g-1, respectivamente. En vitamina C sobresalieron las colectas L-074 de Santiago Nuyoó, L-076, L-077, L-078 y L-079 de San Blas Atempa, y L-080 de Nejapa de Madero, con más de 15 mg 100 g-1. El índice de color (a*/b*) correlacionó positivamente con todos los caracteres químicos y nutricionales, excepto con pH.
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Elimam, M. E., and E. R. Ørskov. "Factors affecting the fractional outflow of protein supplements from the rumen 3. Effects of frequency of feeding, intake of water induced by the addition of sodium chloride, and the particle size of protein supplements." Animal Science 40, no. 2 (April 1985): 309–13. http://dx.doi.org/10.1017/s0003356100025423.
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ABSTRACTFour experiments were conducted with lactating dairy cows offered a hay and concentrate diet (0·5:0·5) to investigate the effects of (1) the frequency of feeding a completely mixed diet (experiment 1) compared with feeding the concentrate fraction and the roughage fraction separately (experiment 2), and (2) the addition of sodium chloride to a completely mixed diet (experiment 3), on the fractional rate of outflow (FRO) of chromium (Cr)-treated fish meal from the rumen, and on milk yield and composition. The cows were offered the diet at either twice the maintenance requirement (experiments 1 and 2), or 2-5 x maintenance (experiment 3) in a 4 x 4 Latin-square design. The effect of the particle size of the Cr-treated soya bean meal was investigated in experiment 4.The frequency of feeding of the completely mixed diet had no significant effect on the rate of outflow of Cr-treated fish meal from the rumen, or on milk yield or composition. FRO per h were 0·070, 0·085, 0·079 and 0·086 when the diet was offered once, twice, four times or 12 times per day respectively. Increasing the frequency of feeding of the concentrate fraction of the diet had no significant effect on FRO. FRO per h were 0·073, 0·078, 0·081 and 0·081 when the concentrate fraction was offered once, twice, four times or 12 times per day respectively.The addition of NaCl to the diet significantly increased water intake (P < 0·001), but had no significant effects on FRO or milk yield. FRO per h were 0·074, 0·075, 0·076 and 0080 when 50, 265, 529 or 794 g of NaCl were added into the diet respectively. The respective intakes of water were 66·6, 74·1, 88·4 and 101·6 kg/day.The FRO per h of fine particles of Cr-treated soya bean meal was 0·085 and for coarse particles, 0·096. The difference was not significant.
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Pakul, V. N. "Variability and relationships of agronomic traits of spring soft wheat in the conditions of the northern forest-steppe of Western Siberia." Agricultural Science Euro-North-East 23, no. 1 (February 25, 2022): 44–53. http://dx.doi.org/10.30766/2072-9081.2022.23.1.44-53.
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The purpose of the research is to study the variability and relationships of agronomic traits of spring soft wheat in the conditions of the northern forest-steppe of Western Siberia and to identify promising sources for use in the breeding process. Studies were carried out in 2018-2021. The objects of the research were 60 samples of spring soft wheat of various origin (Russia, Kazakhstan, Ukraine, China) from the collections of the N. I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources and Kemerovo Research Institute of Agriculture. Twenty-one samples of spring soft wheat with the growing period of 80-85 days have been identified. According to productivity the following samples have been selected: PM-83-17 (KP-072, Kemerovo, Russian Federation) - 236.0 g/m2, Lyutescents 5-17 (KP-073, Kemerovo, Russian Federation) - 240.0 g/m2, Omskaya 35 (k-64459, Omsk, Russian Federation) - 246 g/m2, Siberian Alliance (k-65242, Barnaul, Kemerovo, Russian Federation) - 252 g/m2, Lyutescents 105/4 (KP-071, Kemerovo, Russian Federation) - 294 g/m2, Ekada 70 (k-64547, Ulyanovsk, Russian Federation) - 310 g/m2 (OMGAU 90 standard - 173 g/m2). The Ekada 70 sample had he lowest yield variability, 19.8 %. The closest conjugation between the yield and the number of grains in the ear was revealed (r = 0.3702), the mass of 1000 grains (r = 0.3769) (confidence threshold R = 0.3323). The mass of grain per ear is largely determined by the mass of 1000 grains (r = 0.9879. The most valuable for breeding work are samples of Russian origin distinguished by a complex of traits: Siberian Alliance, Lyutescens 105/4, Ekada 70.
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Zhou, Yunping, Changwei Tian, and Chongqi Jia. "Association of fish and n-3 fatty acid intake with the risk of type 2 diabetes: a meta-analysis of prospective studies." British Journal of Nutrition 108, no. 3 (July 4, 2012): 408–17. http://dx.doi.org/10.1017/s0007114512002036.
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Results from observational studies on the association of fish and n-3 fatty acid consumption with type 2 diabetes mellitus (T2DM) risk are conflicting. Hence, a meta-analysis was performed to investigate this association from cohort studies. A comprehensive search was then conducted to identify cohort studies on the association of fish and/or n-3 fatty acid intake with T2DM risk. In the highest v. lowest categorical analyses, the fixed or random-effect model was selected based on the homogeneity test among studies. Linear and non-linear dose–response relationships were also assessed by univariate and bivariate random-effect meta-regression with restricted maximum likelihood estimation. In the highest v. lowest categorical analyses, the pooled relative risk (RR) of T2DM for intake of fish and n-3 fatty acid was 1·146 (95 % CI 0·975, 1·346) and 1·076 (95 % CI 0·955, 1·213), respectively. In the linear dose–response relationship, the pooled RR for an increment of one time (about 105 g)/week of fish intake (four times/month) and of 0·1 g/d of n-3 fatty acid intake was 1·042 (95 % CI 1·026, 1·058) and 1·057 (95 % CI 1·042, 1·073), respectively. The significant non-linear dose–response associations of fish and n-3 fatty acid intake with T2DM risk were not observed. The present evidence from observational studies suggests that the intake of both fish and n-3 fatty acids might be weakly positively associated with the T2DM risk. Further studies are needed to confirm these results.
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Zhao, Zhengqing, Yanpeng Li, and Zhongxin Zhao. "M-G-073 XYLARIA NIGRIPESWULING MITIGATES SPATIAL MEMORY IMPAIRMENT INDUCED BY RAPID EYE MOVEMENT SLEEP DEPRIVATION IN THE RAT." Sleep Medicine 12 (September 2011): S41—S42. http://dx.doi.org/10.1016/s1389-9457(11)70151-4.
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Asselot, R., V. Bouet, N. Delcroix, P. Pro-Sistiaga, R. Saulnier, L. Chazalviel, and F. Dauphin. "P.1.g.073 Pharmacological MRI: a tool to understand the paradoxical effects of serotonergic type 6 receptors modulation?" European Neuropsychopharmacology 25 (September 2015): S276. http://dx.doi.org/10.1016/s0924-977x(15)30323-0.
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Zhao, Hanqing, Shaoli Li, Ling Cao, Yi Yuan, Guanhua Xue, Yanling Feng, Chao Yan, Liqiong Wang, Zhaoyang Fan, and Hongmei Sun. "Surveillance of Mycoplasma pneumoniae infection among children in Beijing from 2007 to 2012." Chinese Medical Journal 127, no. 7 (April 5, 2014): 1244–48. http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0366-6999.20131654.
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Background Mycoplasma pneumonia (M. pneumoniae) is one of the key pathogens of community-acquired pneumonia. A global pandemic of M. pneumoniae has occurred since 2010. The aim of this study was to survey the prevalence of M. pneumoniae in children in Beijing from 2007–2012. Methods A total of 3 073 clinical specimens were obtained from pediatric patients with respiratory tract infections from January 2007 to December 2012, and examined by nested polymerase chain reaction. PCR products were visualized by 2% agarose gel electrophoresis, positive products sequenced, and compared with reference sequences in GenBank. Macrolide resistance-associated mutations were also detected for some positive samples. Results Of the 3 073 specimens, 588 (19.13%) were positive for M. pneumoniae, 12.4% of which were accompanied by viral infections. Positive rates for M. pneumoniae were highest in 2007 and 2012, showing a significant difference when compared with other years. Infections tended to occur in autumn and winter and positive rates were significantly higher for children aged 3–16. The rate of macrolide resistance-associated mutations was 90.7%, and the predominant mutation was an A→G transition (89.92%) at position 2063 in domain V of the 23S rRNA gene. Conclusions M. pneumoniae outbreaks occurred in 2007 and 2012 in pediatric patients in Beijing, which is consistent with the global prevalence of M. pneumoniae. M. pneumoniae can cause multi-system infections in children, and may be accompanied with viral infections. We determined that school-age children are more susceptible to this disease, particularly in autumn and winter. Gene mutations associated with macrolide resistance were very common in M. pneumoniae-positive specimens during this period in Beijing.
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Weeks, J. M., and P. S. Rainbow. "The Uptake and Accumulation of Zinc and Copper From Solution by two Species of Talitrid Amphipods (Crustacea)." Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom 71, no. 4 (November 1991): 811–26. http://dx.doi.org/10.1017/s0025315400053479.
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The exposure of two species of talitrid amphipods (Orchestia gammarellus and Orchestia mediterranea) to a range of zinc and copper concentrations in solution has enabled the categorization of the mode of metal accumulation adopted by these supralittoral amphipods. Both species showed net accumulation of dissolved zinc and copper at all experimental exposures between 20 and 1000 μig Zng 1 and 13 and 1000 μg Cu 1 in artificial sea-water. Studies using Zn have shown that the zinc uptake rates of both species (0·430 μg Zn g d, SE 0·032 and 0·408 µg Zn g d, SE 0·073 for O. gammarellus and O. mediterranea respectively at 10°C in 31·6 μg Zn 1) are not significantly different, and are low in comparison with other crustaceans. Laboratory results are related to field conditions, and it is concluded that Firth of Clyde O. gammarellus are more dependent upon a food source in order to meet both their copper and zinc requirements than are O. mediterranea which are able to obtain sufficient metabolic copper from solution. The use of talitrid amphipods in zinc and copper biomonitoring programmes is also discussed.
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Kampf, Anthony R., Jason B. Smith, John M. Hughes, Chi Ma, and Christopher Emproto. "New Minerals from the Redmond Mine, North Carolina, USA: I. Redmondite, Hydroredmondite, and Sulfatoredmondite, Three Minerals Containing the Novel [Pb8O2Zn(OH)6]8+ Structural Unit." Canadian Journal of Mineralogy and Petrology 61, no. 1 (January 1, 2023): 189–202. http://dx.doi.org/10.3749/2200059.
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Abstract The new minerals redmondite (IMA2021–072), [Pb8O2Zn(OH)6](S2O3)4, hydroredmondite (IMA2021–073), [Pb8O2Zn(OH)6](S2O3)4·2H2O, and sulfatoredmondite (IMA2021–089), [Pb8O2Zn(OH)6](SO4)4·6H2O, were found in the Redmond mine, Haywood County, North Carolina, USA, where they occur together in a highly unusual secondary assemblage that comprises a variety of rare Pb-Zn-Cu sulfates, thiosulfates, and carbonates. The properties of redmondite are as follows: colorless to shades of brown, transparent equant rhombs to about 1 mm; white streak; adamantine luster; brittle; Mohs hardness 2; conchoidal fracture; no cleavage; 5.757 g/cm3 calculated density; biaxial with α = 1.96–1.97, β = 1.97–1.98, γ = 1.97–1.98; extreme dispersion. The properties of hydroredmondite are as follows: colorless, transparent prisms, blades, and tablets up to about 1 mm; white streak; adamantine luster; brittle; Mohs hardness 2; curved and stepped fracture; good cleavages on {101} and ; 5.124 g/cm3 calculated density; biaxial (+) with α = 1.830(5), β = 1.880(calc), γ = 1.950(calc), 2Vmeas = 83(1)°. The properties of sulfatoredmondite are as follows: colorless, transparent wedge-shaped crystals to about 2 mm; white streak; adamantine luster; brittle; Mohs hardness 2; curved, irregular fracture; no cleavage; 5.173 g/cm3 calculated density; biaxial (+), α = 1.780(5), β = 1.850(calc), γ = 1.860(calc), 2Vmeas = 40(3)°; moderate r > v dispersion. Electron probe microanalyses provided the empirical formulae: Pb8.16Zn1.00S6+3.97S2−3.97O20H5.79, Pb8.00Zn1.00S6+4.00S2−4.00O22H9.98, and Pb8.00Zn0.99S6+4.00S2−0.89O29.11H17.98 for redmondite, hydroredmondite, and sulfatoredmondite, respectively. Redmondite is monoclinic, P21/c, a = 9.1672(4), b = 10.6576(4), c = 14.0620(10) Å, β = 101.173(7)°, V = 1347.83(12) Å3, and Z = 2. Hydroredmondite is monoclinic, P21/n, a = 12.5991(9), b = 9.2819(4), c = 12.9774(9) Å, β = 90.443(6)°, V = 1517.57(16) Å3, and Z = 2. Sulfatoredmondite is monoclinic, C2/m, a = 17.294(2), b = 7.3668(9), c = 12.7271(18) Å, β = 110.622(9)°, V = 1517.5(4) Å3, and Z = 2. The crystal structures of redmondite (R1 = 0.0346 for 2061 I > 2σI), hydroredmondite (R1 = 0.0346 for 3022 I > 2σI), and sulfatoredmondite (R1 = 0.0344 for 1661 I > 2σI) are all based on the same [Pb8O2Zn(OH)6]8+ structural unit.
Дисертації з теми "G-073"
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Perrone, Rosalba. "G-QUADRUPLEXES IN THE HIV-1 GENOME AS ANTIVIRAL TARGETS." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2014. http://hdl.handle.net/11577/3423796.
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G-quadruplexes are non-canonical nucleic acid structures: their presence and functional role have been established in telomeres, oncogene promoters and coding regions of the human chromosome. In particular, they act as silencers in the promoter regions of human genes and putative G-quadruplex forming sequences are also present in promoters of other mammals, yeasts, and prokaryotes. Moreover, they have been proposed to be directly involved in gene regulation at the level of transcription. We investigated G-quadruplex formation in the HIV-1 proviral genome to assess the potential for viral inhibition through G-quadruplex stabilization. Here we show that the HIV-1 LTR promoter exploits G-quadruplex-mediated transcriptional regulation with striking similarities to eukaryotic promoters and that treatment with a G-quadruplex ligand inhibits HIV-1 infectivity. In addition, we found three conserved putative G-quadruplex forming sequences uniquely clustered in the coding region for the accessory protein Nef that were efficiently stabilized or induced by G-quadruplex ligands. Upon incubation with a G-quadruplex ligand, Nef expression was reduced in a reporter gene assay and Nef-dependent enhancement of HIV-1 infectivity was significantly repressed in an antiviral assay. Finally, a comprehensive screening of G-quadruplex ligands against HIV-1 disclosed significant potential of some of them as HIV-1 inhibitors, likely with a G-quadruplex-mediated mechanism of action. These findings open up the possibility of inhibiting the HIV-1 by G-quadruplex-interacting small molecules, providing a new pathway to the development of anti-HIV-1 drugs with unprecedented mechanism of action.Sequenze di acidi nucleici ricchi di guanine possiedono la capacità di ripiegarsi in conformazioni secondarie non canoniche dette G-quadruplex. La presenza di sequenze G-quadruplex è stata evidenziata in numerose regioni del genoma umano, ad esempio le estremità telomeriche, i promotori di oncogeni e diverse sequenze codificanti. In particolare, la formazione di strutture G-quadruplex a livello delle regioni promotoriali del genoma umano risulta correlata al silenziamento dell’espressione genica. E’ interessante notare come la presenza di sequenze G-quadruplex nei promotori sia stata descritta anche per genomi di altri organismi eucarioti, tra cui lieviti, e procarioti. Queste evidenze supportano fortemente una funzione regolatoria ubiquitaria svolta dalle strutture G-quadruplex a livello promotoriale, dove agiscono per lo più come silenziatori. Inoltre, anche la presenza di strutture G-quadruplex in sequenze codificanti del genoma umano può regolare l’espressione genica, perturbando il processo di trascrizione. Il presente lavoro di tesi ha avuto come scopo principale lo studio della presenza e della formazione di strutture G-quadruplex a livello del genoma provirale di HIV-1 al fine di valutare possibili effetti antivirali mediati dalla stabilizzazione di queste strutture secondarie. A livello della regione LTR di HIV-1, dove è situato il promotore virale, abbiamo dimostrato la presenza di strutture G-quadruplex analoghe a quelle già descritte a livello di promotori eucariotici. I risultati ottenuti evidenziano per la prima volta una regolazione dell’espressione genica virale da parte di queste strutture. La stabilizzazione delle strutture G-quadruplex virali, mediata da un ligando specifico, è risultata sufficiente a reprimere l’attività promotoriale del virus. Lo stesso composto è risultato inoltre efficace nell’inibire la produzione di HIV-1 in cellule infettate. Anche a livello di sequenze codificanti proteine virali, in particolare la proteina accessoria Nef, abbiamo individuato un cluster di sequenze che possono formare strutture G-quadruplex. L’induzione e la stabilizzazione di queste strutture secondarie mediate da un ligando specifico hanno determinato una significativa riduzione dell’espressione della proteina, supportando ulteriormente la possibilità di una regolazione dell’espressione genica mediata dai G-quadruplex. Inoltre, il medesimo composto è risultato efficace nell’inibire la replicazione virale in cellule infettate con un meccanismo d’azione Nef-dipendente. Infine, è stato effettuato uno screening di ligandi G-quadruplex per valutarne il possibile effetto anti-HIV-1. Diversi composti sono risultati promettenti inibitori virali e sono stati oggetto di caratterizzazioni più approfondite per quanto riguarda il meccanismo d’azione antivirale. I risultati presentati in questa tesi pongono le basi per un’azione anti-HIV-1 mediata da strutture G-quadruplex indotte o stabilizzate da piccole molecole erappresentano un importante punto di partenza per lo sviluppo di composti antivirali con un meccanismo d’azione innovativo.
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Soldà, Paola. "Ligands-mediated modulation of G-quadruplex structures within the HIV-1 genome during lytic and latent state of infection." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2019. http://hdl.handle.net/11577/3422337.
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G-quadruplexes (G4s) are non-canonical nucleic acids secondary structures. Their presence has been firmly established in the human genome, as well as in that of many viruses. Our research group has previously identified highly conserved G4s in the U3 region of the HIV-1 genome and the long terminal repeat (LTR) promoter of the proviral genome. In the present work, we addressed how the RNA and DNA HIV-1 G4s can be modulated by various ligands (proteins and chemical compounds), leading to the regulation of important virulence processes. Unveiling so far unknown mechanisms in the HIV-1 infection regulation could help the discovery of new targets for the design of specific inhibitors to be proposed as new antivirals.
Initially, we focused on the identification of new RNA G4 binding proteins and the derived modulation. We proved that the HIV-1 nucleocapsid protein (NCp7) binds and unfolds the HIV-1 RNA U3 G4s. Importantly, the NCp7-mediated RNA G4 structure resolution favoured proceeding of the reverse transcription (RT). Conversely, the G4 ligand BRACO-19 (B19) stabilized the RNA G4 folding, thus hindering RT progression, and also counteracting the destabilizing activity of NCp7. On the one hand, our data pointed out the strength of NCp7 as chaperone protein that is able to process the extremely stable HIV-1 RNA G4s in order to allow viral retro-transcription to occur. On the other, they indicate a new target of G4 ligands that inhibit both RT and NCp7. This information brings out the possibility to develop selective U3 RNA G4 ligands, to be proposed as effective anti-HIV-1 drugs with an innovative mechanism of action.
We then moved to the investigation of the regulatory role of DNA LTR G4s on viral latency. We reported for the first time the actual folding of the viral LTR G4s within the context of HIV-1 latent chromatin, where the viral promoter is in a repressed state. Moreover, LTR G4s stabilization mediated by two G4 ligands down-modulated viral transcription, thus counteracting viral reactivation from latency. We presented here the possibility to selectively target LTR G4s to control viral latency and develop innovative antiretroviral drugs to manage HIV-1 infection. In this context, targeting LTR G4s constitutes the basis for the progress of new antiviral compounds with an unprecedented mechanism of action. However, the vast majority of G4 binders present high molecular weights and protonated side chains, which may cause bioavailability problems when subjected to in vivo studies. As a consequence, we here investigated the antiviral activity of a new series of Quindoline-derived compounds presenting more drug-like features. Our data highlight the importance to develop small druggable molecules to target viral G4s in order to handle viral infections.I G-quadruplex (G4s) sono strutture secondarie non canoniche degli acidi nucleici che sono state identificate in regioni regolatorie del genoma umano, così come in quelle di molti virus. Il gruppo di ricerca della Professoressa Richter ha precedentemente identificato strutture G4 altamente conservate nella regione U3 del genoma di HIV-1 e anche in una regione promotoriale del genoma provirale. In questa tesi tratteremo di come i G4 presenti nell’RNA e nel DNA di HIV-1 possano essere modulati da vari ligandi (sia proteine che composti chimici), ottenendo così la modulazione di importanti processi virologici. La scoperta di meccanismi finora sconosciuti nella regolazione dell’infezione da HIV-1 potrebbe portare all’identificazione di nuovi target per la progettazione di specifici inibitori da poter proporre come antivirali. Inizialmente ci siamo concentrati sull’identificazione di nuove proteine in grado di legare gli RNA G4 e sulla loro conseguente modulazione. Abbiamo dimostrato che la proteina virale nucleocapside (NCp7) è in grado di legare e svolgere il G4 nella regione U3 di HIV-1. E’ importante sottolineare che la risoluzione della struttura G4 mediata da NCp7 è stata osservata favorire il processo di trascrizione inversa. Al contrario, il ligando BRACO-19 (B19), stabilizzando il ripiegamento dell’RNA a G4, ha ostacolato la progressione della trascrittasi inversa, anche contrastando l’attività destabilizzante di NCp7. Da un lato, i nostri dati hanno sottolineato la forza della proteina NCp7 come chaperone che risolve le strutture G4 altamente stabili dell’RNA di HIV-1 al fine di consentire la trascrizione inversa virale. Dall’altro lato, abbiamo portato una nuova conseguenza dell’attività del ligando G4, legata all’inibizione dell’attività della trascrittasi inversa e di NCp7. Queste informazioni hanno messo in evidenza la possibilità di sviluppare ligandi selettivi per il G4 dell’RNA U3 di HIV-1 al fine di proporre terapie anti-HIV-1 più efficaci con un meccanismo d’azione innovativo. Siamo poi passati ad indagare il ruolo regolatorio che le strutture G4 nel DNA LTR di HIV-1 possono avere sulla latenza. Abbiamo dimostrato per la prima volta il folding autentico dei G4 virali nell’LTR in un contesto di cromatina latente, in cui il promotore si trova in uno stato inattivo. Inoltre, la stabilizzazione dei G4 dell’LTR mediata da due ligandi G4 ha inibito la trascrizione virale, contrastando così la riattivazione virale dalla latenza. Abbiamo quindi presentato la possibilità di bersagliare selettivamente i G4 virali nell’LTR di HIV-1 per controllare la latenza virale e sviluppare farmaci antiretrovirali innovativi per gestire l’infezione da HIV-1. In questo contesto, colpire selettivamente i G4 dell’LTR costituisce la base per l’avanzamento di nuovi composti antivirali con un meccanismo d’azione senza precedenti. Tuttavia, la maggior parte dei ligandi G4 presenta pesi molecolari elevati e sostituenti protonati che possono causare problemi di scarsa biodisponibilità quando sottoposti a studi in vivo. Di conseguenza, ci siamo focalizzati sullo studio dell’attività antivirale di una nuova serie di composti derivati dalla Quindolina che presentano caratteristiche chimico-fisiche più promettenti. I nostri risultati hanno dimostrato l’importanza di sviluppare piccole molecole per colpire selettivamente i G4 virali al fine di gestire le infezioni virali.
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BORTOLOTTI, Daria. "HLA-G MOLECULES IN INFECTION AND AUTOIMMUNE DISEASES." Doctoral thesis, Università degli studi di Ferrara, 2015. http://hdl.handle.net/11392/2389029.
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Tassinari, Martina. "G-quadruplexes in the HIV-1 LTR promoter: targeting and binding proteins." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2018. http://hdl.handle.net/11577/3424965.
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G-quadruplexes (G4s) are non-canonical nucleic acids secondary structures that may form in G-rich sequences and regulate key biological processes. We have previously identified three mutually exclusive and functionally significant G4s in the unique long terminal repeat (LTR) promoter of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1): their formation decreases viral transcription, with an effect that is enhanced by the presence of the cellular protein nucleolin and G4 ligands. Given that most available G4 binders display yet insufficient selectivity towards different G4s, we explored the possibility to selectively target LTR G4s, challenge which constitutes the basis for the development of anti-HIV-1 compounds with unprecedented mechanism of action.
By screening of a commercially available library of drug-like small molecules, we found a new class of compounds that displayed a clear-cut selectivity for viral over cellular G4s and showed a promising G4-mediated antiviral activity.
In addition, we proposed a conceptually new approach to selectively target G4s, which was successfully tested on HIV-1 LTR-IV G4. We employed naphthalene diimide-peptide nucleic acid (NDI-PNA) conjugates to combine the stabilizing activity of a G4 ligand, with fingerprint recognition of the nucleotide sequence proximal to the G4 of interest. The conjugate was able to stabilize LTR-IV G4 through the NDI, and, at the same time, to prevent the formation of the most stable G4 (LTR-III) by a PNA specifically designed to bind the 5’-flanking region of LTR-IV G4. The NDI-PNA was also successfully modified with a nuclear localization signal (NLS) to achieve cell entry without affecting activity. This innovative method is fundamental to reach the specific discrimination between LTR-III and LTR-IV G4s, whose balance seems to act as regulatory element of the viral promoter. It could be used to modulate the folding and unfolding of unique G4s within the full-length LTR G-rich sequence in order to better investigate their single role and function.
Overall, these findings clearly highlight the possibility to selectively recognize G4s through both small molecules and NDI-PNA conjugates and pave the way to develop novel antiviral compounds that may complement current clinical AIDS therapies.
Finally we looked for new proteins that specifically recognize LTR G4s and modulate the folding/unfolding of these structures. We identified and characterized the cellular protein hnRNP A2/B1, the first one shown to unfold G4s in the HIV-1 LTR promoter. We thus present new insights in the regulation mechanisms of HIV-1 transcription and we propose a new possible target for the design of specific inhibitors.I G-quadruplex sono strutture secondarie non canoniche che gli acidi nucleici possono formare in regioni ricche di guanine e regolano importanti processi biologici. Il nostro gruppo di ricerca ha identificato tre G-quadruplex mutualmente esclusivi e rilevanti dal punto di vista funzionale, localizzati nella regione LTR del promotore del virus dell’immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1): la loro formazione inibisce la trascrizione virale, effetto che è incrementato dalla proteina cellulare nucleolina e da ligandi specifici. Poiché la maggior parte di composti leganti G-quadruplex conosciuti non sono in grado di riconoscere in modo sufficientemente selettivo G-quadruplex diversi, noi abbiamo indagato la possibilità di riconoscere in modo selettivo i G-quadruplex nella regione LTR di HIV-1, concetto alla base dello sviluppo di nuovi composti anti-HIV-1 caratterizzati da un innovativo meccanismo d’azione. Attraverso lo screening di una libreria commerciale di piccole molecole farmaco-simili, abbiamo identificato una nuova classe di composti con una netta selettività per i G-quadruplex virali rispetto a quelli cellulari e una promettente attività antivirale G-quadruplex mediata. Inoltre, abbiamo proposto un approccio completamente innovativo per il riconoscimento selettivo dei G-quadruplex, il quale è stato testato con successo sui G-quadruplex della regione LTR di HIV-1. A tale scopo, abbiamo utilizzato un coniugato formato da una naphthalene diimide (NDI) e da un PNA, con l’obiettivo di combinare la stabilizzazione di un composto legante G-quadruplex con il riconoscimento specifico della sequenza nucleotidica prossimale al G-quadruplex di interesse. L’utilizzo del coniugato ha permesso di stabilizzare in modo specifico il G-quadruplex LTR-IV attraverso la porzione NDI, allo stesso tempo prevenendo la formazione del G-quadruplex più stabile (dLTR-III), grazie alla presenza di un PNA disegnato per legare la regione fiancheggiante LTR-IV in posizione 5’. Il coniugato è stato inoltre implementato con una sequenza di localizzazione nucleare (NLS) per permettere l’entrata nelle cellule, senza interferire con la sua attività specifica. Questa strategia innovativa è fondamentale per riuscire a discriminare in modo specifico LTR-III e LTR-IV, il cui equilibrio sembra essere un elemento regolatore del promotore virale. Potrà inoltre essere utilizzato per modulare la formazione e la destabilizzazione di specifici singoli G-quadruplex all’interno della sequenza di lunghezza completa ricca in guanine della regione LTR, con lo scopo di investigare meglio il loro singolo ruolo e funzione. Complessivamente, questi risultati evidenziano la possibilità di riconoscere in modo selettivo i G-quadruplex attraverso l’utilizzo sia di piccole molecole sia di coniugati NDI-PNA e aprono la strada per lo sviluppo di nuovi composti antivirali che possono affiancare l’attuale terapia clinica per l’AIDS. Infine, abbiamo ricercato nuove proteine che riconoscano in modo specifico i G-quadruplex nella regione LTR di HIV-1 e modulino la loro stabilizzazione/destabilizzazione. Abbiamo identificato e caratterizzato, hnRNP A2/B1, la prima proteina cellulare in grado di destabilizzare i G-quadruplex nella regione LTR di HIV-1. Abbiamo quindi mostrato nuove evidenze nel meccanismo regolatorio della trascrizione di HIV-1, proponendo inoltre un nuovo possibile bersaglio per lo sviluppo di inibitori specifici.
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Butovskaya, Elena. "G-quadruplexes in the HIV-1 genome: structure and targeting." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2017. http://hdl.handle.net/11577/3422271.
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Nucleic acids may form non-canonical tetraplex secondary structures called G-quadruplexes. G-quadruplexes have been found in eukaryotic and prokaryotic genomes, including viruses. Located in key functional regions of genomes, G-quadruplexes play important regulatory roles in transcription, replication and translation processes. Particularly, G-quadruplex-mediated transcription regulation of oncogene promoters has been widely described.
Previous studies demonstrated that a set of dynamic G-quadruplex structures in the promoter region of the HIV-1 Long Terminal Repeat (LTR) regulates viral transcription acting as repressor elements. G-quadruplex-directed targeting with stabilizing ligands enhances their inhibitory effect, resulting in decrease of viral production and suggesting viral G4 structures as potential antiviral targets.
We aimed at 1) develop antiviral compounds selective for viral G-quadruplexes over cellular structures. We screened a newly designed series of NDI-core based G-quadruplex ligands and pointed out structural features of the compounds that led to improve the selectivity.
2) We identified by nuclear magnetic resonance the deep structural coordinates of the G-quadruplex targets as the preliminary necessary step for rational drug design approach. We described the singular hybrid quadruplex/duplex topology of the major G-quadruplex component within the LTR region, which allows novel implication for selective recognition of viral structures.
3) We also explored the formation of G-quadruplex structures at the HIV-1 RNA genome level, which emerged as a pre-integration target for the antiviral activity of a well-known G-quadruplex ligand. We investigated the formation, stability and involvement of RNA G-quadruplexes in the reverse transcription process and the role of the HIV-1 nucleocapsid protein in controlling folding of these structures.Acidi nucleici ricchi in guanine possono formare strutture secondarie alternative chiamate G-quadruplex. I G-quadruplex sono stati caratterizzati in diversi tipi di genomi, tra cui genomi virali e umano. Nel genoma umano le strutture G-quadruplex sono prinicipalmente localizzate in importanti regioni funzionali, dove possono assumere ruoli regolatori dei processi come trascrizione, replicazione a traduzione. In particolare, la regolazione della trascrizione dei promotori degli oncogeni mediata dalle strutture G-quadruplex è stata ampiamente descritta, evidenziando che i G-quadruplex promotoriali agiscono principalmente da silenziatori del processo trascrizionale. I precedenti studi, condotti dal nostro gruppo di ricerca hanno dimostrato che una serie di strutture G-quadruplex al livello del Long Terminal repeat (LTR) del genoma provirale di HIV-1 è coinvolta nella regolazione della trascrizione virale. La stabilizzazione di queste strutture con i ligandi specifici si traduce in repressione dell’attività promotoriale e in inibizione della produzione del virus in cellule infettate, suggerendo che i G-quadruplex nella regione LTR di HIV-1 possono essere dei promettenti target antivirali. Lo scopo principale di questa tesi è stato quello di individuare composti con attività antivirale che mostrano un legame preferenziale verso le strutture G-quadruplex virali. Abbiamo testato una nuova serie di composti leganti G-quadruplex sviluppata a partire dal NDI-core e abbiamo identificato dei componenti strutturali responsabili della maggiore affinità verso le strutture G-quadruplex virali che possono guidare verso ulteriore miglioramento della selettività. L’obiettivo di utilizzare un approccio razionale per lo sviluppo dei composti selettivi ha richiesto di individuare le coordinate strutturali del target. Abbiamo identificato che il componente G-quadruplex prevalente nella regione LTR considerata è foldato in una topologia molto particolare, descritta come struttura ibrida quadruplex/duplex e presenta interessanti implicazioni per il riconoscimento selettivo da parte delle piccole molecole.
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Artusi, Sara. "G-quadruplexes in the HSV-1 and HHV-6 genomes as antiviral targets." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2015. http://hdl.handle.net/11577/3423957.
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Guanine-rich nucleic acids can fold into G-quadruplexes, four-stranded secondary structures which are implicated in important regulatory functions at the genomic level in humans, prokaryotes and viruses. Because the herpes simplex virus-1 (HSV-1) genome is remarkably rich in guanines, we aimed at investigating both the presence of G-quadruplex forming sequences at the viral genome level and the possibility to target them with G-quadruplex ligands to obtain anti-HSV-1 effects with novel mechanisms of action.
Here we show that HSV-1 displays six clusters of repeated sequences that form very stable G-quadruplexes. These sequences are located in the inverted repeats and in two gene-coding regions (ICP0 and UL36) of the HSV-1 genome. One G-quadruplex repeat is located in the promoter region of the multifunctional protein γ134.5.
Treatment of HSV-1 infected cells with the G-quadruplex ligands BRACO-19 and TMPyP4 induced significant inhibition of virus production and reduction of viral transcripts. BRACO-19 was able to inhibit Taq polymerase processing at G-quadruplex forming sequences in the HSV-1 genome, and caused a decreased intracellular viral DNA in infected cells. The last step targeted by BRACO-19 was viral DNA replication, while no effect on virus entry in the cells was observed. A different TMPyP4-mediated mechanism of action was on the contrary observed. Despite its capability to affect Taq polymerase processing, TMPyP4 did not inhibit intracellular viral DNA and it appeared to prevent HSV-1 maturation/egress by stimulating the autophagy process.
As a second part of the study, we extended this innovative antiviral approach to human herpes virus-6 (HHV-6). One of the main HHV-6 features is the presence of tandem repeats of the telomeric sequence (TTAGGG)n at the genome termini (DR). This peculiarity is thought to be responsible for the viral integration in specific human chromosomes, occurring in the 1-2% of the world population. To date, the telomeric G-quadruplex structure had been extensively characterized. We showed that BRACO-19 and TMPyP4 displayed a great antiviral activity against both HHV-6A and HHV-6B.
In the third part of this study, by using specific DNA G-quadruplex-interacting antibodies, for the first time we visualized viral DNA G-quadruplexes in infected cells at crucial time points for the viral replication cycle, in which viral DNA is likely in a single-stranded state.
This work, besides presenting the first evidence of extended G-quadruplex sites in key regions of the HSV-1 and HHV-6 genomes, points out G-quadruplexes as innovative potential antiviral targets in novel therapeutic interventions, based on the use of G-quadruplex ligands.Acidi nucleici ricchi di guanine possono formare una particolare struttura secondaria nota come G-quadruplex, il quale è implicato nella regolazione di importanti processi biologici a livello del genoma umano, di procarioti e virus. Dato che il genoma dell’herpes simplex virus-1 (HSV-1) è notevolmente ricco in guanine, il nostro studio è stato mirato all’individuazione di sequenze virali in grado di foldare in G-quadruplex e, in secondo luogo, alla possibilità di colpire selettivamente questa conformazione non-canonica con specifiche molecole chimiche, al fine di sviluppare una terapia antivirale innovativa. Il nostro studio dimostra la presenza di sei gruppi composti da sequenze altamente ripetute capaci di formare strutture G-quadruplex particolarmente stabili. Queste sequenze sono state individuate a livello delle regioni terminali del genoma di HSV-1 e all’interno di due regioni codificanti (geni ICP0 e UL36). Un cluster di sequenze G-quadruplex, inoltre, è situato nella regione promotoriale deputata all’espressione della proteina multifunzionale γ134.5. Il trattamento di cellule infettate con BRACO-19 e TMPyP4 ha mostrato una significativa inibizione di HSV-1 e una riduzione dell’espressione di alcuni trascritti virali. BRACO-19 si è dimostrato efficace nell’inibire l’elongazione di regioni G-quadruplex del genoma di HSV-1, da parte dell’enzima Taq; è stato in grado di diminuire il DNA virale intracellulare, opportunamente estratto da cellule infettate e trattate; inoltre, mentre nessun effetto è stato osservato sull’entry di HSV-1, l’ultimo step del ciclo virale inibito da BRACO-19 corrisponde alla replicazione del DNA virale. Un diverso meccanismo d’azione è stato, invece, osservato in seguito al trattamento con TMPyP4. Nonostante questa porfirina sia riuscita ad inibire l’attività della Taq, non è riuscita, al contrario, ad influenzare i livelli di DNA virali intracellulari. TMPyP4 sembra essere efficace nell’inibire la maturazione/uscita di HSV-1, attraverso un’induzione dell’autofagia. In una seconda parte dello studio, abbiamo esteso questa promettente strategia antivirale all’herpes virus umano 6 (HHV-6), il quale presenta una caratteristica molto peculiare. Ad entrambe le estremità del suo genoma (DR) contiene, infatti, numerose ripetizioni della sequenza telomerica umana (TTAGGG)n. Questa caratteristica è ritenuta responsabile dell’integrazione di HHV-6 in alcuni cromosomi umani (1-2% della popolazione). Ad oggi, la struttura G-quadruplex della sequenza telomerica è stata studiata in dettaglio e completamente caratterizzata. Abbiamo, quindi, testato BRACO-19 e TMPyP4 su cellule infettate sia con HHV-6A che HHV-6B, ottenendo anche in questo caso dei risultati molto incoraggianti. Infine, in una terza parte del lavoro, è stato possibile visualizzare per la prima volta G-quadruplex virali a livello del DNA in cellule infettate, grazie all’impiego di anticorpi ad alta affinità per questa struttura. La specificità di segnale è data dal fatto che l’incremento di fluorescenza è avvenuto nel corso della replicazione virale in cui il DNA è presente come singolo filamento. Questo lavoro, oltre a mostrare l’esistenza di estese regioni G-quadruplex in siti chiave del genoma di HSV-1 e HHV-6, mette in luce le potenzialità del G-quadruplex come target innovativo in terapie antivirali nuove e mirate, basate sull’impiego di leganti specifici per questa particolare conformazione secondaria del DNA.
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Moscatelli, Silvia. "Polymorphism of biological helices: elongation- and counterion-mediated effects." Doctoral thesis, Università Politecnica delle Marche, 2016. http://hdl.handle.net/11566/243094.
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Questo lavoro centrato sull'analisi dell'auto-assemblaggio di eliche biologiche, in particolare frammenti di DNA con diverse lunghezze e strutture di Guanosina 5'-monofosfato(G-quadruplessi) in presenza di alcuni ioni, in questo caso argento e litio. I DNA corti sono molto attrattivi per le loro applicazioni nel drug delivery e per il DNA origami come possibile modello per nanomacchine e materiali 3D intelligenti. Il G-quadruplesso rappresenta l'organizzazione supramolecolare dei G-quartetti, anelli planari costituiti da quattro GMP legate tramite legame idrogeno di Hoogsteen. Le tetradi di GMP si impilano una sull'altra e l'impilamento è stabilizzato dalla presenza di cationi monovalenti (Na+,K+, ecc). I G-quadruplessi sono interessanti poichè sequenze ricche di G si possono trovare
nei telomeri (la regione a singolo filamento all'estremità dei cromosomi). La formazione dei G-quadruplessi comporta una generale riduzione nell'estensione dei primer da parte della telomerasi; questo enzima che estende le sequenze telomeriche nei cromosomi è espresso ad alti livelli nelle cellule tumorali permettendo loro di replicarsi indefinitamente portando
all'immortalizzazione che conduce al processo di carcinogenesi. Quindi l'interesse per i G-quadruplessi è legato alla loro possibile attivitti-cancro. Dall'altro lato i G-quadruplessi possono essere usati per la nanoelettonica. Infatti sono stati proposti come basi per nanofilamenti molecolari poichè l'elevata rigidità strutturale e stabilità in varie condizioni, aumenta la migrazione di cariche attrverso il G-filamento. In questa tesi viene presentata l'analisi su DNA e G-quadruplessi tramite esperimenti di scattering a piccolo angolo di raggi X e
neutroni (SAXS e SANS), diffrazione di raggi X e neutroni (XRD e ND) e microscopia
ottica a luce polarizzata. In particolare per i G-quadruplessi è stata evidenziata la formazione della fase LC smettica, diversa dalle fasi esagonale e colesterica solitamente trovate.This work is focused on the analysis of the self-assembly mechanism of biological helices, in particular DNA fragments with dfferent length and Guanosine 5- monophosphate struc- tures (G-quadruplex) in presence of some ions, in this case Silver and Lithium. Short DNA are very attractive for their possible applications in drug delivery and for the DNA origami used as possible template for nanomachine and 3D smart materials. Instead G- quadruplex is the supramolecular organization of G-quartets, planar rings constituted by four GMP linked by Hoogsteen hydrogen bonds. The GMP tetrads stack one on the top of another and the stacking is stabilized by the presence of monovalent cation (Na+, K+, etc). G-quadruplexes are interesting because G-rich sequences can be found in telom- eres (the single-stranded DNA regions at the end of chromosomes). The formation of G-quadruplexes involves a generally reduction of the effiency of primer extension by telomerase; this enzyme extends the telomeric sequences in chromosome and it is expressed in high level in cancer cells allowing them to replicate indefinitely and bringing to an immortalization condition that leads to the carcinogenesis process. Therefore the interest in G-Quadruplexes is linked with the several hypotheses on possible anti-cancer activities. On the other side G-quadruplex can be used for nanoelectronics. They were in fact proposed as building blocks of molecular nanowires because the higher structural rigidity and stability under various conditions, increasing the probability of charge mi- gration through the G-wires. In this thesis, it is presented an analysis on the DNA and G-quadruplex structures by Small Angle X-Ray and Neutron Scattering (SAXS and SANS), X-Ray and Neutron Dffraction (XRD and ND) and Polarized Optical Microscopy experiments. In particular for the G-quadruplex it is highlight the formation of a smectic LC phase, dfferent from the usually found hexagonal and cholesteric phase.
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Lago, Sara. "Investigation of the Role of Dna G-Quadruplex Structures in Human Transcription, Cancer and Viral Infections." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2018. http://hdl.handle.net/11577/3425882.
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The present manuscript contains a report of the research activity conducted for the Ph.D. project regarding the study of DNA G-quadruplex structures in a rare type of human cancer (Liposarcoma) and in the genome of two world-wide spread viruses: HIV-1 and HSV-1.Il manuscritto contiene una descrizione e discussione dei risultati ottenuti in ambito del progetto di ricerca di dottorato riguardante lo studio delle strutture G-quadruplex delDNA in un tumore umani raro (il liposarcoma) e nel genoma di due virus a diffusione mondiale, quali: HIV-1 e HSV-1.
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Zorzan, Eleonora. "Comparative molecular targets for anticancer chemotherapy: new insights and perspectives." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2016. http://hdl.handle.net/11577/3424507.
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The past thirty years have reported the introduction of multiple anticancer therapies targeting various aspects of the cancer hallmarks, which are essential for successful tumor propagation and dissemination. In this sense, the evolution of molecular-scale technology has been central to the identification of new cancer targets.
The receptor tyrosine kinase (RTK) Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma virus homolog (c-KIT) is a critical regulator of growth, differentiation, migration and proliferation in the hematopoietic system, in germ cells and melanocytes. Since it activates a number of intracellular signaling pathways implicated in the tumor progression, it is one of the most studied proto-oncogenes as well as the target of drugs belonging to the family of tyrosine kinase inhibitors (TKIs). Actually, TKIs are employed for the treatment of human and canine c-KIT-dependent tumors as an alternative to standard chemotherapy. Nevertheless, multiple resistance phenomena frequently occur.
Recently, the discovery of G-quadruplex (G4) structures highlighted a new role for DNA in cancer biology. DNA G4 are four-stranded globular nucleic acid secondary structures, formed in specific G-rich sequences with biological significance; among these ones, the human telomeres and the promotorial region of oncogenes such as c-KIT.
In the first part of this dissertation, three compounds were proved to bind in silico c-KIT G4 and were tested in human and canine cell lines to check for their potential usefulness as therapeutic agents. Interesting results, e.g. c-KIT mRNA and protein inhibition, were obtained with an anthraquinone derivative (AQ1) that caused a block of cell proliferation.
In another study, the occurrence of c-KIT mutations was investigated in matched primary and metastatic canine cutaneous mast cell tumor (MCT), to make a recommendation for the best therapeutic choice. In dogs, 10-30% of MCTs possess c-KIT mutations, and the relevance of the mutational status for the therapy with TKIs is nowadays accepted also in this species; however, little is known on c-KIT mutational status in metastatic MCTs. In all analyzed dogs, there was a perfect concordance between c-KIT mutational status in primary MCT and the relative lymph node metastasis. This has a relevant implication for clinical practices.
Finally, during the Ph.D. program, a collaboration was established with the Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, and particularly with Dr. Patrice Dubreuil. In his most recent articles, he discovered a set of genes that are frequently mutated in human systemic mastocytosis (SM) and cooperate with c-KIT in the disease malignant evolution. In the last study illustrated in this Ph.D. thesis, the mutational profile of these hotspot genes in canine MCTs samples has been screened, in order to find molecular similarities between the two diseases, thereby justifying the use of domestic dog as an animal model in comparative oncology.Negli ultimi trent’anni, l’evoluzione delle tecnologie in campo medico-scientifico ha permesso la più profonda conoscenza dei meccanismi molecolari alla base dello sviluppo, della crescita e della diffusione del tumore. Tutto ciò ha permesso di sviluppare le cosiddette terapie mirate, identificando nuovi bersagli terapeutici. Il recettore tirosin-chinasico c-KIT è un fattore critico per la regolazione della crescita, differenziazione, migrazione e proliferazione delle cellule germinali, di quelle del sistema ematopoietico e dei melanociti. c-KIT è anche coinvolto nell’attivazione di numerosi meccanismi intracellulari implicati nella progressione tumorale e, allo stesso tempo, è uno dei proto-oncogeni più studiati ed il bersaglio di farmaci appartenenti alla famiglia degli inibitori tirosin-chinasici (TKIs). Attualmente, i TKIs sono approvati come trattamento alternativo alla chemioterapia tradizionale in tumori c-KIT dipendenti in uomo e cane tuttavia, fenomeni di resistenza a questi farmaci si verificano frequentemente. Negli ultimi anni, la scoperta di strutture secondarie del DNA chiamate G-quadruplex (G4) ha evidenziato un nuovo ruolo degli acidi nucleici nella biologia tumorale. Tali conformazioni si formano in specifiche sequenze del DNA ricche in residui di guanina, localizzate principalmente nei telomeri e nelle regioni promotoriali di alcuni oncogeni come c-KIT. Nella prima parte di questa tesi di dottorato, tre composti scelti sulla base della loro capacità di legare e stabilizzare le conformazioni G4 sono stati testati in linee cellulari stabilizzate di uomo e cane al fine di determinare la loro efficacia come potenziali agenti terapeutici. In questo senso, alcuni risultati interessanti in termini di blocco della proliferazione nonché della trascrizione e traduzione di c-KIT si sono ottenuti con un derivato della famiglia degli antrachinoni chiamato AQ1. In un altro studio proposto, il profilo mutazionale di c-KIT è stato analizzato in una coorte di campioni di mastocitoma del cane composti da tumore primitivo e relativa metastasi linfonodale. Nel cane infatti, la percentuale tra il 10 ed il 30% dei mastocitomi presenta almeno una mutazione di c-KIT nel tumore primitivo, tuttavia, poche conoscenze si hanno relativamente al profilo mutazionale nelle metastasi. Dai risultati ottenuti, tutti i cani analizzati hanno dimostrato avere una perfetta concordanza tra tumore primitivo e metastasi in termini di status mutazionale di c-KIT con rilevanti implicazioni cliniche per la scelta della miglior terapia da attuare da parte degli oncologi veterinari. Infine, nel corso del secondo anno di dottorato, è nata una collaborazione con il Dr. Patrice Dubreuil del Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, a Marsiglia. Nei suoi recenti articoli sulla mastocitosi dell’uomo, egli ha scoperto un set di geni che presentano mutazioni in talune percentuali di casi e cooperano con c-KIT nello sviluppo delle forme più gravi ed aggressive della malattia. Nell’ultima pubblicazione illustrata in questa dissertazione, è stato eseguito lo screening del profilo mutazionale di questi nuovi geni in campioni di mastocitoma di cane al fine di trovare analogie molecolari che possano giustificare l’uso del cane come animale modello nell’oncologia comparata.
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Callegaro, Sara. "G-quadruplexes in the herpes simplex virus type 1 and measles virus genomes: new antiviral targets." Doctoral thesis, Università degli studi di Padova, 2017. http://hdl.handle.net/11577/3427277.
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G-quadruplexes (G4s) are four-stranded secondary structures formed by guanine-rich nucleic acids; they are implicated in important functions as epigenetic regulators at the genomic level in humans, prokaryotes and viruses. They act as silencers in the promoter regions of human genes and, moreover, they have been proposed to be directly involved in gene regulation at the transcription level.
Since the Herpes Simplex Virus Type 1 (HSV-1) genome is significantly rich in guanines (68%) and its G4 sequences are massively present during viral replication, we aimed at investigating the possibility to target the HSV-1 G4s by a core extended naphthalene diimide (c-exNDI) G4–ligand to obtain anti HSV-1 effects with an innovative mechanism of action.
Biophysical and biomolecular analysis proved that c-exNDI stabilized the HSV-1 G4s in a concentration-dependent manner and was able to inhibit Taq polymerase processing at G4 forming sequences. Additionally, we proved that c-exNDI preferentially recognized HSV-1 G4s over cellular telomeric G4s, the most represented G4s within cells. Treatment of HSV-1 infected cells with c-exNDI at low nanomolar concentrations induced significant virus inhibition with low cytotoxicity. The mechanism of action was ascribed to a G4-mediated inhibition of viral DNA replication, with consequent impairment of viral gene transcription.
Our data suggested that the observed potent antiviral activity and low cytotoxicity mainly depend on a combination of c-exNDI affinity for HSV-1 G4s and their massive presence during infection.
Since the vast majority of G4-ligands share the common characteristic of a large aromatic surface which makes them not well druggable, we then aimed at investigating the ability of an in-house library of compounds, previously designed to target promoters in cancer cells, to bind and stabilize HSV-1 G4s and to exert an antiviral activity against HSV-1. We demonstrated that all compounds of the library were able to bind and stabilize HSV-1 G4s in a concentration-dependent manner with different affinities and, again, to induce polymerase stalling because of a steric hindrance linked to the G4 stabilization. Treatment of HSV-1 infected cells with all compounds of the library showed a conspicuous decrease in viral production in the low nanomolar range. Two of the four compounds were also only mildly cytotoxic and thus showed promising selectivity indexes (SI). The mechanism of action, once again, was ascribed to the G4-mediated inhibition of viral DNA replication. Since all compounds of the library possess (i) promising chemical features (i.e their small size, smaller than other well known G4-ligands such as B-19 and NDIs) and (ii) potent activities in the low nanomolar range with no cytotoxicity, this makes them suitable for future development as novel anti HSV-1 G4-ligands with more drug-like characteristics than previous developed G4-ligands, and as promising compounds for the treatment of ACV-resistant herpetic infections.
In the third part of this study, by using a pull-down approach, we aimed at identifying viral and cellular proteins able to interact specifically with G4 structures within HSV-1 infected cells. We preliminarily identified both cellular and viral proteins directly implicated in replication and transcription processes. Concerning cellular proteins, we identified hnRNPU, nucleolin, nucleophosmin and histone proteins (11 and 12), some of them being already reported for their ability to bind G4s during replication. Identification of histone proteins opens the possibility that G4s are involved in the latent maintenance of the viral genome. Besides viral proteins we identified the transcription factor ICP4, the single-stranded DNA binding protein ICP8, PAP1 polymerase processing factor and VP5. The identification of the two transcription factors and of the polymerase processing factor confirmed the hypothesis of a direct involvement of G4s in the viral genome replication and transcription and the identification of the major capsid protein VP5 suggested a possible role of G4s as a driving force for viral genome encapsidation in the virions assembly process.
Finally, by investigating the negative-stranded RNA genome of Measles Virus (MV) we demonstrated the presence of seven G4-putative folding sequences. Six of these sequences displayed the ability to fold into G4 structures while one showed a hairpin-like conformation. All sequences were bound and stabilized by B-19 G4-ligand and treatment of MV infected cells with B-19 induced a pronounced reduction in the viral genome accumulation.
Since (i) G4s are well conserved and distributed within different viral genomes (as described by our group in HIV-1, HSV-1, and MV) because of their central roles in regulating biological processes and (ii) different G4-ligands have been demonstrated to be active against different viruses (i.e B-19, c-exNDI and G4-ligands of an in-house library in this thesis) with a G4-mediated inhibition of viral DNA replication, we can strongly encourage and confirm the hypothesis using G4s as novel broad range drug targets against different etiological agents and G4-ligands as novel innovative therapeutic molecules.I G-quadruplex sono strutture secondarie a quattro filamenti che possono essere formate all’interno di acidi nucleici ricchi nella composizione di guanine; i G-quadruplex sono implicati in importanti funzioni biologiche: questi agiscono come regolatori epigenetici a livello genomico in cellule umane, procariotiche e anche in virus. I G-quadruplex agiscono come silenziatori a livello di regioni promotoriali in geni umani e, inoltre, sono stati riportati in letteratura per il loro diretto coinvolgimento nella regolazione dell’espressione genica. Poiché il virus dell’Herpes Simplex di Tipo 1 (HSV-1) possiede un genoma caratterizzato da un’elevata percentuale di basi guanine (il 68%), e le strutture G-quadruplex identificate sono massivamente presenti durante la replicazione del virus stesso, abbiamo deciso di investigare la possibilità di agire direttamente su tali G-quadruplex attraverso l’utilizzo di un Naftalene Diimmide con core esteso (c-exNDI) per ottenere un’attività antivirale caratterizzata da un innovativo meccanismo d’azione. Mediante caratterizzazione biofisica e biomolecolare abbiamo dimostrato che tale composto (c-exNDI) è in grado di stabilizzare sequenze G-quadruplex in modo concentrazione-dipendente e, ulteriormente è in grado di inibire il processamento della Taq polimerasi, in fase di elongazione del DNA, in corrispondenza delle strutture G-quadruplex. Abbiamo inoltre dimostrato che il composto testato (c-exNDI) è in grado di riconoscere preferenzialmente i G-quadruplex virali rispetto ai G-quadruplex formati a livello delle regioni telomeriche che, all’interno di una cellula eucariotica, rappresentano i G-quadruplex maggiormente presenti. Il trattamento di cellule infettate con HSV-1 con il composto in analisi, utilizzato a basse concentrazioni, ha causato una significativa inibizione della produzione virale con parallela scarsa citotossicità sulle cellule. Infine, abbiamo dimostrato che il meccanismo d’azione di tale composto risiede nell’inibizione G-quadruplex-mediata della replicazione del DNA virale, con conseguente alterazione a valle della trascrizione genica. Tali dati suggeriscono che la potente attività antivirale e la scarsa citotossità di tale composto dipendono principalmente da una combinazione di maggiore affinità del composto per i G-quadruplex virali e dalla loro massiccia presenza durante il processo di infezione. Poiché la maggior parte dei composti leganti G-quadruplex è caratterizzata da un’ estesa superficie aromatica planare che li rende scarsamente farmaco-simili, ci siamo focalizzati sullo studio di una libreria di composti, precedentemente creata per agire sui G-quadruplex presenti nei promotori di oncogeni in cellule tumorali, al fine di valutare la capacità di tali composti di legare e stabilizzare i G-quadruplex presenti in HSV-1 e di esprimere un’attività antivirale diretta contro il medesimo virus. In questa parte di progetto abbiamo dimostrato che tutti i composti della libreria sono in grado di legare e stabilizzare i G-quadruplex virali secondo un meccanismo concentrazione-dipendente e, nuovamente, sono in grado di alterare la processività della polimerasi attraverso un ingombro sterico correlato alla formazione della struttura G-quadruplex. Il trattamento di cellule infettate da HSV-1 con ciascuno dei composti della libreria a basse concentrazioni, ha mostrato una cospicua diminuzione della produzione virale. Poiché due dei quattro composti sono risultati scarsamente citotossici, per questi sono stati ottenuti promettenti indici di selettività (SI). Il meccanismo di azione di tali composti, come già visto in precedenza, è stato ascritto all’inibizione G-quadruplex-mediata della polimerasi in fase di replicazione del DNA virale. Poiché tutti i composti della libreria sono caratterizzati da (i) strutture chimiche promettenti (dimensione più contenuta rispetto a quella di composti leganti G-quadruplex precedentemente sviluppati come BRACO-19 (B-19) e le Naftalene Diimmidi) e (ii) mostrano una potente attività contro HSV-1 a basse concentrazioni e una scarsa citotossicità, possono essere considerati composti fortemente adatti per lo sviluppo di nuovi farmaci leganti G-quadruplex contro HSV-1, e contro ceppi di HSV-1 resistenti al trattamento con Acyclovir (ACV), con caratteristiche fortemente farmaco-simili. Nella terza parte del presente progetto di tesi, mediante un approccio di pull-down, abbiamo cercato di identificare proteine, sia cellulari che virali, in grado di interagire con strutture G-quadruplex presenti in cellule infettate. Risultati preliminari hanno portato all’identificazione di proteine sia cellulari che virali direttamente implicate in meccanismi di replicazione e trascrizione del genoma virale. Per quanto riguarda le proteine cellulari, abbiamo identificato le proteine nucleari ribonucleoproteina U (hnRNPU), nucleolina, nucleofosmina e le proteine istoniche 11 e 12; alcune di queste proteine (hnRNP, nucleolina e nucleofosmina) erano già state riportate in letterature per la loro capacità di legare i G-quadruplex durante la replicazione della cellula. L’identificazione delle proteine istoniche 11 e 12 suggerisce la possibilità che le strutture G-quadruplex siano direttamente coinvolte nel mantenimento del genoma virale nel processo di latenza che tale virus è in grado di stabilire a livello di cellule del sistema nervoso centrale nell’uomo. Tra le proteine virali abbiamo identificato il fattore di trascrizione ICP4, la proteina legante il DNA a singola catena ICP8, il fattore di processività della polimerasi PAP1 e la proteina capsidica VP5. L’identificazione delle proteine ICP4, ICP8 e PAP1, direttamente implicate in meccanismi di replicazione e trascrizione, conferma l’ipotesi di un diretto coinvolgimento delle strutture G-quadruplex nei meccanismi di replicazione e trascrizione del genoma virale. Inoltre, l’identificazione della proteina capsidica VP5 suggerisce la possibilità che le strutture G-quadruplex siano direttamente coinvolte nel processo di incapsidamento delle particelle virali neo-formate come guida per l’incapsidamento del genoma virale. Infine, attraverso lo studio del genoma RNA a singolo filamento a polarità negativa del virus del Morbillo (MV), abbiamo dimostrato la presenza di sette sequenze caratterizzate da un’elevata probabilità di formare strutture G-quadruplex. Sei delle sette sequenze identificate hanno mostrato effettiva capacità di formare strutture secondarie G-quadruplex, mentre per una è stata dimostrata la capacità di formare una struttura secondaria a forcina. Tutte le sequenze hanno mostrato una stabilizzazione a seguito del legame con il composto B-19 e il trattamento delle cellule infettate ha mostrato una pronunciata riduzione nella sintesi del genoma virale. In conclusione, dato che (i) le sequenze G-quadruplex sono fortemente conservate e distribuite in molteplici genomi virali (come ad esempio è stato dimostrato nel virus dell’Immunodeficienza Umano HIV-1, in HSV-1 e in MV) a causa della loro implicazione nella regolazione di diversi processi biologici, e (ii) diverse molecole leganti G-quadruplex (B-19, c-exNDI e piccole molecole di una libreria di composti) si sono dimostrate attive contro diversi virus attraverso un meccanismo di inizibione G-quadruplex-mediata della replicazione, possiamo confermare che le strutture G-quadruplex possono essere considerate come un ottimo bersaglio farmacologico per il trattamento di infezioni causate da diversi agenti eziologici e, inoltre, che piccole molecole in grado di legare e stabilizzare i G-quadruplex possono rappresentare innovativi farmaci con un nuovo meccanismo d’azione.
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Konferent︠s︡ii︠a︡ molodykh uchenykh i spet︠s︡ialistov IPPI RAN (30th 2007 Zvenigorod, Russia). Informat︠s︡ionnye tekhnologii i sistemy "ITiS-07": Sbornik trudov konferent︠s︡ii, 18-21 senti︠a︡bri︠a︡ 2007 g. Moskva: IPPI RAN, 2007.
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Regionalʹnai︠a︡ nauchno-prakticheskai︠a︡ konferent︠s︡ii︠a︡ "Nepreryvnoe ėkologicheskoe obrazovanie i ėkologicheskie problemy" (2005 Krasnoi︠a︡rsk, Russia). Nepreryvnoe ėkologicheskoe obrazovanie i ėkologicheskie problemy: Regionalʹnai︠a︡ nauchno-prakticheskai︠a︡ konferent︠s︡ii︠a︡, 06-07 okti︠a︡bri︠a︡ 2005 g. : sbornik stateĭ po materialam konferent︠s︡ii. Krasnoi︠a︡rsk: SibGTU, 2005.
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Nat͡sionalna mladezhka shkola s mezhdunarodno uchastie Sistemi za avtomatizat͡sii͡a na inzhenernii͡a trud i nauchnite izsledvanii͡a (3rd 1989 Albena, Bulgaria). Treta Nat͡sionalna mladezhka shkola s mezhdunarodno uchastie Sistemi za avtomatizat͡sii͡a na inzhenernii͡a trud i nauchnite izsledvanii͡a: SAITNI '89 : sbornik nauchni dokladi i sŭobshtenii͡a, Albena, 02-07 oktomvri 1989 g. Bulgaria: [s.n., 1989.
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Botín, Fundación Marcelino, ed. Itinerarios 07-08: XV becas de artes plásticas : Leonor Antunes, Christian Bagnat, Mira Bernabeu, Rafel G. Bianchi, Cabello/Carceller, Iñaki Garmendia, Carlos Irijalba, Isabel María, Renata Lucas : del 23 de enero al 15 de marzo de 2009. Santander: Fundación Marcelino Botín, 2009.
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Diurnal variation of aromatic hydrocarbons (BTEX: benzene, toluene, ethylbenzene and p-xylene) in ambient air was determined in an urban site located in Monterrey, during North’s season 2020. Samples were collected using active sampling by a vacuum pump at a controlled flow of 200 ml/min during 1.5 h, considering three sampling periods: morning (07:00 - 08:30 h), midday (14:00 - 15:30 h) and afternoon (17:30- 19:00 h). Samples were desorbed with carbon disulfide and the extracts were analyzed by gas chromatography with ionization flame detection. Ethylbenzene and p-xylene were the dominant hydrocarbons (mean concentration: 18.581 g/m3 and 18.039 g/m3, respectively). Mean values for benzene and toluene were 15.137 g/m3 and 15.503 g/m3, respectively. All BTEX showed a diurnal pattern with higher values during the afternoon. From a meteorological study (wind roses) and chimiometric analysis (principal component analysis) were identified relations among the measured variables and their possible emission sources (industrial and vehicular sources). It was carried out a health risk assessment, considering both, carcinogenic and non-carcinogenic (respiratory and cardiovascular diseases) related to BTEX inhalation founding that population in the study site could develop cancer in the lifetime by benzene inhalation.
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FERREIRA, G. E. A., A. B. TEIXEIRA, J. G. B. SARNI, G. I. SILVA, A. H. SILVA, L. P. CRUZ, A. C. P. RODRIGUES, L. M. BERTIPAGLIA, and V. R. HERLING. "PRODUÇÃO DE MASSA SECA DE FORRAGEM E COMPOSIÇÃO MORFOLÓGICA DO CAPIM-IPYPORÃ (BRACHIARIA RUZIZIENSIS VS. BRACHIARIA BRIZANTHA) COM A INOCULAÇÃO DE SEMENTES COM BIOESTIMULANTE." In Avanços da Pesquisa e Inovação em Sistemas Agrícolas: Conjunturas da Ciências Agrárias, 101–11. Editora Científica Digital, 2023. http://dx.doi.org/10.37885/230914328.
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Objetivo: O presente trabalho teve o objetivo de avaliar a produção de massa de forragem e a composição morfológica do capim-ipyporã, em função da inoculação de sementes incrustas e não incrustadas com o bioestimulante comercial Bioenergy, a base de aditivos e extrato das algas marrons (Ascophyllum Nodosum). Métodos: As sementes foram inoculadas e o experimento conduzido em casa de vegetação, com sistema de irrigação automático. O delineamento foi inteiramente casualizado em fatorial 2 x 4. Os tratamentos foram constituídos em: cobertura de sementes (incrustadas ou não incrustadas) e doses de bioenergy (0, 2, 4 e 6 mL/kg de semente). A semeadura deu-se em quarenta vasos com 3,5 kg de terra em 25/07/2020, sendo semeadas 12 sementes por unidade experimental. A germinação iniciou-se em 31/07/2020. Após um período de 75 dias de crescimento vegetativo, as plantas foram cortadas à altura de 20 cm da base do solo e a forragem armazenada em sacos de papel pardo identificados para determinar a massa de forragem. Após a pesagem, foram colocados em estufa de circulação forçada de ar a 65 oC por 72 horas. Ao atingir peso constante, o material teve separação morfológica em lâmina foliar, colmo e bainha e material morto e pesados separadamente. Resultados: Sementes não incrustadas tiveram acréscimos na MSF até a dose 4 mL/kg de semente (13,8 g/vaso), diminuindo posteriormente na dose 6 mL/kg de semente (12,9 g/vaso). Por outro lado, sementes incrustadas tiveram maior MSF para o controle e 2 mL/kg de semente (15,6 e 15,4 g/vaso, respectivamente). Nas doses 4 e 6 mL/kg de semente, a MSF do capim-ipyporã decresceu, apresentando médias semelhantes (12,2 g/vaso). Conclusão: A produção de massa de forragem e de seus componentes morfológicos lâmina foliar e colmo e bainha não apresentaram diferença significativa em relação a cobertura de sementes, exceto a massa seca de material morto. A inoculação da semente com Bioenergy não afeta a produção de massa de forragem e de seus componentes morfológicos. A participação percentual de lâmina foliar cresce e a de colmo e bainha diminui com as doses de Bionergy, enquanto que a de material morto não se altera.
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"Guide: Guide for Utility Connector Interfaces for Serviceable Spacecraft (AIAA G-072-1995)." In Guide: Guide for Utility Connector Interfaces for Serviceable Spacecraft (AIAA G-072-1995). Washington, DC: American Institute of Aeronautics and Astronautics, Inc., 1995. http://dx.doi.org/10.2514/4.474125.001.
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Aljohani, Hanadi G., Gehan A. Hegazy, Aliaa A. Alamoudi, Ghada M. Agabnoor, Ali M. El-Halawany, and Ahmed M. Al-Abd. "Abstract LB-073: Mansonone-G is more potent antiproliferative against liver cancer cells than its coumarin derivative (mansorin-A) despite their antagonistic interaction with 5-fluorouracil." In Proceedings: AACR Annual Meeting 2018; April 14-18, 2018; Chicago, IL. American Association for Cancer Research, 2018. http://dx.doi.org/10.1158/1538-7445.am2018-lb-073.
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Dumacheva, Elena, Natal'ya GONChAROVA, Luiza SAYFUTDINOVA, Yuliya PEChEGINA, and Elena USOL'CEVA. "Selection of non -traditional honey and feed culture Phacelia tanacetifolia Benth. at Central Black Earth Region." In Multifunctional adaptive fodder production 29 (77). ru: Federal Williams Research Center of Forage Production and Agroecology, 2022. http://dx.doi.org/10.33814/mak-2022-29-77-140-147.
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New breeding samples of the Phacelia tanacetifolia species have been studied. The yield of seeds in sectional samples changed from 16 g/m2 to 37 g/m2. In 30 % of the samples, the indicator is significantly 21.4–32.1 % inferior to the standard, in 30 % of the samples by 25.0–32.1 % higher than the standard, and in 40 % of the samples was at the level of the standard. The yield of the dry mass of plants in collection samples changed from 140 g/m2 to 205 g/m2. According to the complex of household-useful features, selection samples 02/18, 03/18, 07/18 and 16/18 stood out in the nursery. It is planned to include them in the breeding program to create new varieties with high indicators of seed and feed productivity for the Central Black Earth region.
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Younis, T., D. Rayson, and C. Skedgel. "Abstract P6-07-07: Febrile neutropenia primary prophylaxis with granulocyte-colony stimulating factors (G-CSF) in breast cancer." In Abstracts: Thirty-Sixth Annual CTRC-AACR San Antonio Breast Cancer Symposium - Dec 10-14, 2013; San Antonio, TX. American Association for Cancer Research, 2013. http://dx.doi.org/10.1158/0008-5472.sabcs13-p6-07-07.
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5
Hattori, Junichi, Koichi Fukuda, Tsutomu Ikegami, and Wen Hsin Chang. "Temperature Effects on Static Characteristics of Complementary Field-Effect Transistors with Si and Ge Nanosheets." In 2022 International Conference on Solid State Devices and Materials. The Japan Society of Applied Physics, 2022. http://dx.doi.org/10.7567/ssdm.2022.g-2-07.
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6
HUANG, Xingyu, Yuki ITOYA, Zhuo LI, Takuya SARAYA, Toshiro HIRAMOTO, and Masaharu KOBAYASHI. "Modeling and Simulation of Antiferroelectric FETs with Oxide Semiconductor Channel Using Half-Loop Hysteresis for Memory Applications." In 2022 International Conference on Solid State Devices and Materials. The Japan Society of Applied Physics, 2022. http://dx.doi.org/10.7567/ssdm.2022.g-6-07.
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7
Hosseini, Maryamsadat, Alicja Leśniewska, Gyana Pattanaik, Robert Clark, Anish Dangol, Marleen H. van der Veen, Nicolas Jourdan, et al. "Super-conformal CVD Ruthenium with 1 Angstrom Liner in Advanced MOL Local Interconnect." In 2022 International Conference on Solid State Devices and Materials. The Japan Society of Applied Physics, 2022. http://dx.doi.org/10.7567/ssdm.2022.g-10-07.
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8
Miyata, Ryusuke, Daisuke Tadaki, Daichi Yamaura, Shun Araki, Madoka Sato, Maki Komiya, Teng Ma, Hideaki Yamamoto, Michio Niwano, and Ayumi Hirano-Iwata. "Solvent-free Lipid Bilayer Microarray for Parallel Recordings of Transmembrane hERG Channel Activities." In 2021 International Conference on Solid State Devices and Materials. The Japan Society of Applied Physics, 2021. http://dx.doi.org/10.7567/ssdm.2021.g-6-07.
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9
Sato, Hirotaka, Teruaki Takarada, Shuto Kawaguchi, Yu Hao Chang, and Hiroshi Kawarada. "Electric Signal Propagation up to a Transmission Distance 25 m in Seawater utilizing Diamond Solution Gate FET." In 2021 International Conference on Solid State Devices and Materials. The Japan Society of Applied Physics, 2021. http://dx.doi.org/10.7567/ssdm.2021.g-5-07.
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10
Matsushima, Toshinori, and Chihaya Adachi. "Insolubilization of the organic hole transport layer through siloxane network formation for efficient perovskite light-emitting diodes." In 2021 International Conference on Solid State Devices and Materials. The Japan Society of Applied Physics, 2021. http://dx.doi.org/10.7567/ssdm.2021.g-1-07.
Повний текст джерелаЗвіти організацій з теми "G-073"
1
Dumont, R., and J. Potvin. Apparent conductance with electromagnetic anomalies, MEGATEM II Survey Chibougamau 2006, parts of NTS: 32 G/10 - 32 G/11 - 32 G/06 - 32 G/07, Quebec. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2006. http://dx.doi.org/10.4095/222436.
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2
Dumont, R., and J. Potvin. Residual total magnetic field with electromagnetic anomalies, MEGATEM II Survey Chibougamau 2006, parts of NTS: 32 G/10 - 32 G/11 - 32 G/06 - 32 G/07, Quebec. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2006. http://dx.doi.org/10.4095/222440.
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3
Dumont, R., and J. Potvin. Electromagnetic decay constant (TAU) with electromagnetic anomalies, MEGATEM II Survey Chibougamau 2006, parts of NTS: 32 G/10 - 32 G/11 - 32 G/06 - 32 G/07, Quebec. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2006. http://dx.doi.org/10.4095/222443.
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4
Dumont, R., and J. Potvin. Residual total magnetic field with EM anomalies, MEGATEM II Survey Chibougamau 2006, parts of NTS: 32 G/10 - 32 G/11 - 32 G/06 - 32 G/07, Quebec. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2006. http://dx.doi.org/10.4095/222460.
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5
Coyle, M., and F. Kiss. Geophysical Series, NTS 23 G/07, Shabogamo Lake aeromagnetic survey. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2011. http://dx.doi.org/10.4095/289047.
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6
Dumont, R., and J. Potvin. Second vertical derivative of the total magnetic field with Keating coefficients, MEGATEM II Survey Chibougamau 2006, parts of NTS: 32 G/10 - 32 G/11 - 32 G/06 - 32 G/07, Quebec. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2006. http://dx.doi.org/10.4095/222448.
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7
Kiss, F., J. Potvin, M. Coyle, and M. McLeod. Magnetic first vertical derivative map, 21G/07 g,h, New Brunswick. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2002. http://dx.doi.org/10.4095/213428.
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8
Dumont, R., and J. Potvin. Residual total magnetic field with EM anomalies, MEGATEM II Survey Chibougamau 2006, parts of NTS: 32 G/07 - 32 G/10, Quebec. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2006. http://dx.doi.org/10.4095/222462.
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9
Buckle, J. L., M. Coyle, J. M. Carson, B. J. A. Harvey, and G. Delaney. Geophysical Series, southern Athabasca Basin geophysical survey, Saskatchewan, NTS 74 G/07, Ispatinow Island. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2009. http://dx.doi.org/10.4095/247368.
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10
Bourdeau, J. E., M. W. McCurdy, S. J A Day, and R. G. Garrett. Regional lake sediment geochemical data from north-central Saskatchewan (NTS 074-A, B, G, and H): reanalysis data and QA/QC evaluation. Natural Resources Canada/CMSS/Information Management, 2021. http://dx.doi.org/10.4095/329204.
Повний текст джерелаАнотація:
This report presents the geochemical data, quality assurance and quality control (QA/QC) results of the re-analysis of lake sediment samples collected from north-central Saskatchewan (NTS 074-A, B, G and H). The original lake survey was conducted in 1986 and the re-analysis in 2021. Original survey results are presented in OF1359. A total of 1,290 lake sediment samples were re-analyzed, covering an area of 17,000 km2, averaging a density of 1 sample per 13 km2. Samples were measured for 65 elements via modified aqua-regia - ICP-MS and 35 elements via INA analysis. To ensure high quality data, the geochemical data was evaluated for contamination, accuracy, precision and fitness-for-purpose. QA/QC results have identified a number of elements to be monitored carefully for future analyses. Overall, the data are of good quality.