Дисертації з теми "Substitution matrices"

With the emergence and growth of large databases of information, efficient methods for storage and processing are becoming increasingly important. The existence of a metric distance measure between data entities enables efficient index structures to be applied when storing the data. Unfortunately, this is often not the case. Amino acid substitution matrices, which are used to estimate similarities between proteins, do not yield metric distance measures. Finding efficient methods for converting a non-metric matrix into a metric one is therefore highly desirable. In this work, the problem of finding such conversions is approached by embedding the data contained in the non-metric matrix into a metric space. The embedding is optimized according to a quality measure which takes the original data into account, and a distance matrix is then derived using the metric distance function of the space. More specifically, an evolutionary scheme is proposed for constructing such an embedding. The work shows how a coevolutionary algorithm can be used to find a spatial embedding and a metric distance function which try to preserve as much of the proximity structure of the non-metrix matrix as possible. The evolutionary scheme is compared to three existing embedding algorithms. Some modifications to the existing algorithms are proposed, with the purpose of handling the data in the non-metric matrix more efficiently. At a higher level, the strategy of deriving a metric distance function from a spatial embedding is compared to an existing algorithm which enforces metricity by manipulating the data in the non-metric matrix directly (the triangle fixing algorithm). The methods presented and compared are general in the sense that they can be applied in any case where a non-metric matrix must be converted into a metric one, regardless of how the data in the non-metric matrix was originally derived. The proposed methods are tested empirically on amino acid substitution matrices, and the derived metric matrices are used to search for similarity in a database of proteins. The results show that the embedding approach outperforms the triangle fixing approach when applied to matrices from the PAM family. Moreover, the evolutionary embedding algorithms perform best among the embedding algorithms. In the case of the PAM250 scoring matrix, a metric distance matrix is found which is more sensitive than the mPAM250 matrix presented in a recent paper. Possible advantages of choosing one method over another are shown to be unclear in the case of matrices from the BLOSUM family.

Most bioinformatic analyses start by building sequence alignments by means of scoring matrices. An implicit approximation on which many scoring matrices are built is that protein sequence evolution is considered a sequence of Point Accepted Mutations (PAM) (Dayhoff et al., 1978), in which each substitution happens independently of the history of the sequence, namely with a probability that depends only on the initial and final amino acids. But different protein sites evolve at a different rate (Echave et al., 2016) and this feature, though included in many phylogenetic reconstruction algorithms, is generally neglected when building or using substitution matrices. Moreover, substitutions at different protein sites are known to be entangled by coevolution (de Juan et al., 2013). This thesis is devoted to the analysis of the consequences of neglecting these effects and to the development of models of protein sequence evolution capable of incorporating them. We introduce a simple procedure that allows including the among-site rate variability in PAM-like scoring matrices through a mean-field-like framework, and we show that rate variability leads to non trivial evolutions when considering whole protein sequences. We also propose a procedure for deriving a substitution rate matrix from Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs): we first test the statistical compatibility of frequent genetic variants within a species and substitutions accumulated between species; moreover we show that the matrix built from SNPs faithfully describes substitution rates for short evolutionary times, if rate variability is taken into account. Finally, we present a simple model, inspired by coevolution, capable of predicting at the same time the along-chain correlation of substitutions and the time variability of substitution rates. This model is based on the idea that a mutation at a site enhances the probability of fixing mutations in the other protein sites in its spatial proximity, but only for a certain amount of time.

Différentes méthodes de cristallogenèse de la MgGa 11O 19 sont testées, notamment l'élaboration par tirage Czochralski. Affinement structural confirmant la structure de type magnétoplombite du composé. Substitution ionique permettant d'accroitre les paramètres cristallins du composé étudié en vue de son utilisation comme support pour la croissance d'hexaferrites alcalinoterreux. Détermination du domaine schématique de composition des aluminogallates La1-xNdxMgGa11O19. Étude des propriétés optiques du néodyme par réflexion diffuse, RPE et fluorescence.

L'objectif de ce document est de présenter une étude sur la réaction de capture neutronique radiative du noyau instable du ¹⁷³Lu afin de déterminer sa section efficace (n,γ). Si globalement, pour les noyaux stables de nombreuses informations sont à disposition, il reste un véritable manque de données pour les noyaux radioactifs. La première partie de cette thèse se consacre à la présentation des différents formalismes impliqués dans le calcul d'une section efficace ainsi qu'à l'utilisation du code TALYS basé sur ces différents modèles. TALYS nous a permis d'évaluer la section efficace (n,γ) sur le ¹⁷³Lu en s'appuyant sur la connaissance de la réaction de capture sur le ¹⁷⁵Lu. Dans un deuxième temps, la section efficace (n,γ) sur le ¹⁷³Lu a été mesurée sur l'installation LANSCE avec le détecteur 4π DANCE. Cette expérience s'est révélée être un véritable défi tant pour la fabrication de la cible de ¹⁷³Lu que pour l'obtention de données dû à la grande radioactivité de cet isotope. Nous avons pu extraire des informations intéressantes comme le taux de capture total, identifier et caractériser de nouvelles résonances, déterminer des paramètres comme l'espacement moyen, les largeurs neutroniques et les largeurs γ ainsi que la valeur de la fonction densité. Tous ces nouveaux renseignements nous ont permis de reconstruire la section efficace (n,γ) sur le ¹⁷³Lu jusqu'à 200 eV. Grâce à ces différentes informations, nous avons estimé une correction à appliquer sur la section efficace évaluée par TALYS permettant in fine d'obtenir une nouvelle évaluation de cette quantité. La troisième partie de cette thèse est consacrée à apporter des informations supplémentaires sur la réaction ¹⁷³Lu(n,γ)¹⁷⁴Lu en utilisant la méthode de substitution. En premier lieu, nous avons testé la validité de cette méthode sur une réaction connue : ¹⁷⁵Lu(n,γ)¹⁷⁶Lu avec la réaction ¹⁷⁴Yb(³He,p)¹⁷⁶Lu puis dans un second temps nous avons regardé la réaction ¹⁷³Lu(n,γ)¹⁷⁴Lu avec la réaction ¹⁷⁴Yb(³He,t)¹⁷⁴Lu. Pour cela, la probabilité d'émission γ dans ces deux voies a été mesurée et comparée à un calcul TALYS. Cette comparaison a révélé de grandes disparités entre les réactions de transfert utilisées et les réactions induites par des neutrons. Notre investigation s'est alors orientée à regarder de plus près la distribution de spins du noyau composé formé. Celle-ci a pu être extraite grâce à un ajustement de la probabilité d'émission γ mesurée. Cette distribution montre que les réaction (³He,X) peuplent en réalité des spins beaucoup plus grands que ceux issus de la réaction (n,γ). La mesure des rapports des intensités de transitions γ corroborent aussi ce résultat même si les spins peuplés semblent être plus faibles. Cette expérience a mis clairement en évidence qu'une réaction induite par un faisceau d'³He ne pouvait pas se substituer à une réaction (n,γ). Tout au long de ce document, nous avons montré par différents aspects, à quel point il peut être difficile d'obtenir des informations sur les noyaux radioactifs tels que le ¹⁷³Lu et que pour le futur de nombreux défis tant expérimentaux que théoriques sont encore à relever.

Le premier matériau est conçu afin d’augmenter la ténacité des blocs céramiques poreux existants, trop fragiles lors de la mise en place dans la cavité osseuse à combler. Le composite est obtenu par infiltration d’une céramique poreuse avec une solution ou une nanodispersion à base de poly(E-caprolactone). Après séchage, les pores sont recouverts par une fine couche de polymère, comme mis en évidence par la microscopie électronique à balayage. La porosimétrie mercure et la tomographie X ont montré qu’après infiltration le diamètre des pores diminue mais l’interconnectivité des pores est préservée. Du point de vue mécanique, des essais de flexion 4 points, compression et traction ont permis d’apprécier le rôle bénéfique du poly(E-caprolactone) sur les propriétés à rupture. On constate un changement du type de rupture, de catastrophique pour la céramique poreuse seule à contrôlée pour le composite, accompagné d’une forte augmentation de l’énergie à rupture dans le cas du composite. Un suivi de la rupture (par loupe binoculaire et camera à haute résolution lors des essais mécaniques conventionnels et par microscopie électronique à balayage environnemental lors de traction in-situ) a montré que le mécanisme de renforcement principal dans ce type de composites est le pontage par des fibrilles. Ces fibrilles peuvent être de plusieurs tailles suivant la distribution de taille des pores de la céramique poreuse de départ. Trois types de céramique poreuse sont utilisés pour la fabrication des composites : alumine, hydroxyapatite-(β-tricalcium phosphate) et bioverre. Le deuxième matériau est obtenu par infiltration d’une mousse polyuréthane avec un ciment phosphocalcique à base d’alpha-TCP. Ce matériau est souple pendant la prise, ce qui devrait être favorable à la mise en place du substitut dans la cavité osseuse à combler. Après prise on obtient une fine couche de ciment sur la surface de la mousse. Ce composite présente une porosité interconnectée et possède une macro- et microporosité comme mis en évidence par microscopie électronique à balayage et tomographie X. La taille des macropores dans le composite est déterminée par la taille des pores de la mousse polymère et par la quantité de ciment utilisée ; la taille des micropores quant à elle est déterminée par le ratio liquide/poudre utilisé pour gâcher le ciment. Les essais de compression ont montré une nette augmentation du module d’Young et de la contrainte à rupture ; la rupture du composite est de type contrôlée avec un endommagement progressif de la structure. Des essais préliminaires de culture in-vitro avec des cellules stromales humaines de la moelle osseuse ont montré une bonne adhésion et prolifération des cellules. Outre l’α-TCP, le plâtre est le deuxième matériau inorganique qui a été utilisé comme revêtement de la mousse polymère
Bone substitute more easy to handle are obtained by infiltrating a porous ceramic (alumina, hydroxyapatite-beta tricalcium phosphate or bioglass) with a solution or a nanodispersion based on polycaprolactone. Pores are covered with a layer of polymer and rupture, which is catastrophic for the ceramic, becomes a controlled one in the case of the composite, with a strong increase in energy to break thanks to crack bridging by polymer fibrils. Another kind of composite material, pliable during insertion, is obtained by infiltrating a polyurethane sponge with plaster or a cement based on alpha tricalcium phosphate. After setting, a layer of cement is obtained on the surface of the pores, the Young modulus and the strength at break are increased in compression and rupture of the composite is of controlled type, with a progressive damage of the structure. In-vitro tests showed the cytocompatability of the composite

On sait que la matrice d'incidence associée à une substitution ne suffit pas pour déterminer complètement le système dynamique associé, même dans des cas très simples, il existe plusieurs substitutions associées à une même matrice car il existe de nombreux mots ayant le même abélianisé. Dans cette thèse, on étudie les points communs de deux lignes brisées associées à deux substitutions $sigma_1$ et $sigma_2$ irréductibles unimodulaires de type Pisot qui ont la même matrice d'incidence. On identifie les points communs de ces deux lignes brisées à partir d'un algorithme. On montre ainsi que l'intersection de ces deux lignes brisées est aussi une ligne brisée associée au point fixe d'une nouvelle substitution. On montre plus précisément que si $sigma_1$ vérifie la conjecture Pisot et $0$ est un point intérieur à son fractal de Rauzy alors ces points communs peuvent être engendrés par une substitution définie sur un alphabet appelé alphabet des paires équilibrées. Cette substitution est obtenue à partir d'un algorithme, l'algorithme des paires équilibrées. On obtient ainsi l'intersection des intérieurs des deux fractals de Rauzy. En prenant la clôture de cet ensemble on obtient un ensemble substitutif. La condition que $0$ est un point intérieur au fractal de Rauzy associé à la substitution $sigma_1$ nous permet de montrer que l'intersection des deux fractals de Rauzy est de mesure positive. Dans une deuxième partie du travail on s'intéresse à l'étude de la frontière du fractal de Rauzy. Le fractal de Rauzy est dit fractal mais c'est en fait sa frontière qui est fractale
The matrix of a substitution is not sufficient to completely determine the dynamics associated with it, even in the simplest cases since there are many words with the same abelianization. In this paper we study the common points of the canonical broken lines associated with two different irreducible Pisot unimodular substitutions σ1 and σ2 having the same incidence matrix. We prove that if σ1 verifies the Pisot conjecture and 0 is an inner point to the Rauzy fractal associated with the substitution σ1 then these common points can be generated with a substitution on an alphabet of so-called balanced pairs, and we obtain in this way the intersection of the interior of two Rauzy fractals

L’intérêt de ces travaux est de proposer un nouveau composite BaAl2Si2O8 (BAS) renforcé par des fibres d’alumine ayant des propriétés physiques similaires tout en étant plus réfractaire que les composites SiO2 / SiO2. La forme cristalline hexagonale du BAS est la forme stable à haute température. Cependant, elle est métastable en dessous de 1590 °C et il est donc nécessaire de la stabiliser pour éviter les transformations cristallines. La stabilisation de la forme hexagonale par substitution atomique, notamment par du rubidium à hauteur de 5 % atomique a été la solution retenue. Concernant le composite à matrice BAS, le choix de fibres d’alumine est motivée par la compatibilité physico-chimique BAS / alumine. Diverses voies d’élaboration de la matrice BAS et du composite BAS / alumine ont été explorées. La voie d’élaboration par « reactive spark plasma sintering » (R-SPS) apporte un gain important en termes de réduction du temps d’élaboration et de rendement. Ce gain de temps évite donc l’exposition du BAS aux hautes températures et le risque de transformation de la phase hexagonale en monoclinique. Cependant la mise en forme par SPS de matériaux oxydes, dont le BAS, est confrontée à l’existence de gradients thermiques importants au sein de l’échantillon. C’est pourquoi, la mise en oeuvre d’un moule chauffant est développée comme une alternative au SPS. Ce système, en cours d’évaluation, devrait permettre l’utilisation de cycles thermiques équivalents à ceux du SPS, tout en limitant fortement les gradients thermiques
The main purpose of the present work is to propose a new BaAl2Si2O8 (BAS) composite reinforced with alumina fibers exhibiting similar physical properties but a higher refractoriness than SiO2 / SiO2 composites. The hexagonal crystal form of BAS is the stable one at high temperatures. However, it is metastable below 1590 °C and it is therefore necessary to stabilize it in order to prevent crystalline transformations. The stabilization of the hexagonal form by atomic substitution, including rubidium at 5 atomic % has been chosen. Regarding the matrix BAS composite, the alumina fibers selection has been justified by their low physical and chemical reactivity with this material. Several elaboration methods of the BAS matrix and of the BAS / alumina composite have been investigated. The development by "reactive spark plasma sintering" (R-SPS) brings an important benefit in terms of reduced elaboration time and yield. This saving time thus limits the BAS exposure to high temperatures and the risk of transformation into monoclinic. Nevertheless, the SPS shaping of oxide materials, including the BAS, is confronted with the presence of important thermal gradient within the sample. This is why shaping in a heating mold is currently in progress, as an alternative to the SPS. This system should allow the use the same thermal cycles as for SPS, but with lower thermal gradient

Dissertação para obtenção do Grau de Doutor em Engenharia Biomédica
A Engenharia de Tecidos apresenta actualmente soluções comerciais, para o tratamento de lesões provocadas por queimadura com perda total de pele, que não preenchem todos os requisitos para serem denominados de substitutos definitivos de pele. O objectivo deste trabalho consistiu no desenvolvimento e caracterização físico-química e biológica da componente dérmica de um substituto de pele baseada numa matriz de nanofibras, obtida através da técnica de electrofiação. Os polímeros escolhidos foram a gelatina (GEL), o quitosano (CS) e a policaprolactona (PCL), usando como solvente comum o ácido acético. Estes foram depositados individualmente e em mistura, resultando em três tipos de matrizes: unitárias, binárias e ternária. No sistema de matrizes unitárias apenas a de PCL é hidrofóbica. Em termos de propriedades mecânicas a de PCL é a mais elástica e dúctil e a de GEL a mais rígida e frágil. Os testes in vitro revelaram adesão e proliferação celular em todas as matrizes. Porém, apenas nas matrizes de PCL e CS foi observada migração de células em profundidade. Nos testes in vivo constatou-se uma boa integração das matrizes de CS e de GEL nas feridas, resultando numa cicatriz re-epitelizada ao final de 4 semanas. No sistema de matrizes binárias e ternária, a de PCL/GEL é a menos hidrofílica. Relativamente às propriedades mecânicas observou-se um domínio da componente CS nas misturas preparadas com este polímero. Já a matriz de PCL/GEL reflecte a mistura de ambos os componentes. Os testes in vitro apresentaram adesão e proliferação celular em todas as matrizes. Foram encontradas evidências de processos de invasão celular em todas as matrizes, excepto na matriz de PCL/GEL. Finalmente, em termos de testes in vivo destacou-se uma boa integração das matrizes de CS/GEL e de CS/PCL/GEL na lesão, resultando numa cicatriz re-epitelizada ao final de 4 semanas.
Fundação da Ciência e Tecnologia - bolsa de Doutoramento SFRH / BD / 37854 / 2007

Les objectifs de notre travail de recherche sont de contribuer à l'amélioration de la connaissance du comportement mécanique des sols grossiers à matrice, et de proposer une procédure rationnelle de caractérisation de leur comportement mécanique. En vue d'atteindre ces objectifs, il est important de comprendre l'effet des gros éléments dans ces sols. Pour cela, nous travaillerons sur des sols grossiers de référence à matrice sableuse, en vue de mieux comprendre l'effet des inclusions sur le comportement mécanique des mélanges. Ces travaux s'inscrivent dans le prolongement des recherches développées dans le cadre de la thèse de Pedro [2004]. Ces travaux rentrent également dans le cadre du projet de coopération bilatéral franco-libanais CEDRE entre l'ENPC-CERMES et l'Université Libanaise, Faculté de Génie, Beyrouth. (Intro. Auteur)

Cette thèse concerne l’élaboration et la caractérisation de multicouches à base de CrN pour le remplacement du chrome électrolytique. L’objectif principal est d’élaborer des revêtements, dont les propriétés (structurales, mécaniques, tribologiques, etc …) sont contrôlables par pulvérisation cathodique magnétron. Les structures des dépôts sont caractérisées par diverses techniques telles que la Spectroscopie à Décharge Luminescente (SDL), la Diffraction de Rayons X (DRX), la Microscopie Electronique à Balayage (MEB), la Microscopie Electronique à Transmission (MET). Les propriétés mécaniques, tribologiques et de corrosion des dépôts sont évaluées en utilisant respectivement un nano-indentateur, des tests de rayure et de pion-disque et des mesures de polarisation dynamique. La première étude concerne la synthèse du nitrure de chrome. Les courbes de la tension de la décharge et de la pression totale en fonction du débit d’azote injecté sont utilisées pour prévoir la phase d’obtention du nitrure de chrome. L’analyse optique par spectroscopie d’émission (OES) a permis de corréler le taux d’azote dans les revêtements avec la tension de polarisation du substrat. La deuxième étude concerne le système Cr-Zr-N. Dans un premier temps, le zirconium est introduit en solution solide dans CrN pour former CrN(Zr). Des multicouches CrN/ZrN à l’échelle nanométrique sont ensuite élaborés avec des périodicités comprises entre 11. 7 et 66. 7 nm. Concernant la dureté des revêtements, on a montré que CrN(Zr) présente un maximum de dureté de 240 GPa à 1,5 at. % de ZrN. Par ailleurs, les multicouches CrN / ZrN présentent une valeur de dureté constante de 29 GPa. Les essais de corrosion réalisés sur ses dépôts ont montré une bonne stabilité chimique des revêtements et de faibles densités de courant. Du silicium est ensuite ajouté au système multicouche CrN / ZrN. Les revêtements multicouches CrSiN / ZrN et CrN / ZrSiN avec des périodicités différentes sont synthétisés et forment des structures nanocristalline/amorphe. Une amélioration de la tenue à la corrosion pour le système CrSiN /ZrN est observée comparée aux monocouches CrN et ZrSiN. De même, la structure CrN / ZrSiN permet une bonne combinaison de la dureté élevée de ZrSiN et de l’excellente résilience de CrN. De plus, on constate que l’addition du silicium dans ZrN empêche de manière efficace la corrosion de type piquration
This research focuses on the synthesis and characterization of CrN based multilayer coatings for the replacement of electrolytic chrome. The studied materials include chromium nitrides coatings Cr-Zr-N ternary multiple phase and multilayer coatings and Si added CrN / ZrN multilayer coatings. The main objective of this thesis si to deposit the controllable coating structure and properties based on a magnetron sputtering technology so that the coating performance can be optimized to satisfy the replacement of Cr in industry scale. Coating structures are characterized by various techniques such as glow discharge optical spectrometer (GDOS), X-ray diffraction (XRD), scaning electronic microscope (SEM), transmission electronic microscope (TEM). The mechanical, tribological and corrosion properties of the deposited coatings are evaluated using nanoindentation, scratch test, pin-on-disk, dynamic polarization techniques respectively. The first study is related to chromium nitride coatings with controllable structure; The hysteresic curve and target voltage versus nitrogen flow rate curve are used to predict the phase evolution on chromium nitride. Optical emission spectroscopy (OES) analysis for various RF biases reveals that the increased substrate bias leads the nitrogen content to decrease. The second study is concentrated on Cr-Zr-N system. Solid solution CrN(Zr) coatings and nanoscale multilayer CrN/ZrN coatings with bilayer thickness (^) ranging from 11. 7 to 66. 7 nm are prepared. CrN(Zr) coatings show a maximum hardness value of approximately 24 GPa while CrN / ZrN multilayers present constant hardness of 29 GPa. In corrosion tests, these coatings show good chemical inert and very low corrosion current densities. To enhance the performance of CrN / ZrN multilayers, a further effort to add Si into CrN / ZrN multilayer is carried out. The deposited CrSiN / ZrN multilayer coatings with ^ from 13. 4 nm to 86. 9 nm have nanocrystalline/amorphous structure (nc-CrSiN / a-ZrN). They demonstrate elevated corrosion potentials in comparison with the single layers. On the other hand, CrN / ZrSiN multilayers with ^ from 11 nm to 153 nm form nancrystalline/amorphous period structure (nc-CrN / a-ZrSiN). This multilayer structure shows a good combination of high hardness from ZrSiN and good toughness from CrN. The addition of Si into ZrN individual layer has been shown to be an efficient way to inhibit pitting corrosion

L’incorporation de sous-produits agricoles ou de matériaux naturels dans la matrice cimentaire confère des propriétés intéressantes aux composites élaborés. L’objectif de cette thèse est d’élaborer un matériau pouvant répondre aux exigences mécaniques, thermiques et de durabilité des matériaux de construction en zone tropicale humide. Dans un premier temps, l’activité pouzzolanique d’une pouzzolane naturelle, de cendres de tronc de bambou et de cendres de bagasse de canne à sucre ont été évaluées. L’influence de leur incorporation a été ensuite étudiée sur les propriétés mécaniques et la durabilité des mortiers exposés à des ions chlorures et sulfates. Dans un second temps, l’influence de l’ajout de fibres de bagasse sur les propriétés thermiques et mécaniques des composites a été étudiée en fonction de différents paramètres (teneur en fibres, environnement de vieillissement, type de matrice cimentaire).Les résultats obtenus ont permis de montrer que les matériaux étudiés possèdent une activité pouzzolanique et qu’il est possible de les incorporer au ciment afin de lutter contre la corrosion. De plus, les composites élaborés avec des fibres de bagasse sont plus isolants que ceux élaborés sans fibres. Cependant, du point de vue des propriétés mécaniques, l’incorporation de fibres de bagasse diminue les contraintes à la flexion des composites
The incorporation of crop wastes or natural materials in the cement matrix confers interesting properties to composites prepared. The aim of this thesis is to develop a material that can reach the mechanical, thermal and durability requirements for building materials in the humid tropical zone. Firstly, pozzolanic activity of a natural pozzolan, bamboo stem and sugar cane bagasse ashes has been determined. Influence of their incorporation on mechanical properties and durability of mortars exposed to chloride and sulphate ions was studied. Secondly, influence of addition of bagasse fibers on thermal and mechanical properties of composites was studied as a function of various parameters (fibers content, curing, type of cement matrix).These results has shown that the materials studied have pozzolanic activity and it is possible to incorporate them into the cement to fight against corrosion. Moreover, composites elaborated with bagasse fibers are more insulating than those elaborated without fibers. However, from the viewpoint of mechanical properties, incorporation of bagasse fibers decreases flexural strength of composites in the present work and under the conditions producing procedures that were adopted

The diploma thesis deals with possibility of utilization raw materials from alternative sources for production of cement-bonded particleboards. In theoretical part the possibilities of modifying composition of cement-bonded slabs with emphasis on their matrix are discussed in detail. On basis of the findings and their evaluation, waste from the formatting of cement-bonded particleboards, micronized limestone, heat sink and high temperature fly ash were selected to the composition modification. The mentioned raw materials were analyzed and subsequently tested as substitutes for the matrix of cement-bonded particleboards in the experimental part. The properties of the proposed materials were tested even in the longer term, including the microstructure.

Made available in DSpace on 2016-04-26T20:27:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vanessa Rahal Canado.pdf: 1017567 bytes, checksum: e2882c38d8ba54122acb3ac62e62d51c (MD5) Previous issue date: 2008-04-09
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
The main objective of this dissertation is to construct the essential rules connected to the levy ( regras matrizes de incidência tributária ) of the COFINS tax, based on provisions contained under specific laws which govern the four main collection regimes of said contribution: cumulative , noncumulative , single-phase taxation and tax substitution . Based on the provisions of Complementary Law n. 70/91 and of Law n. 9.718/98, we have constructed, besides the generic rule of levy of the COFINS in the cumulative regime , other 6 (six) specific rules, referred to herein as differentiated treatments in the cumulative regime . Essentially, from the provisions under Law n. 10.833/03, besides the generic rule of levy of the COFINS in the non-cumulative regime , we identified 12 (twelve) more specific rules of levy, also referred to as "differentiated treatments in the non-cumulative regime." In turn, with regard to the tax substitution COFINS regime, solely the manufacturers and wholesale sellers of cigarettes remained, according to the provisions under Article 3 of Complementary Law n. 70/91 and Article 29 of Law n. 10.865/04. Finally, based on the provisions of Laws n. 9.718/98 (Articles 4, 5 and 6), n. 10.147/00, n. 10.485/02, n. 10.560/02 and n. 10.833/03 (Article 49), we could identify 12 (twelve) rules of the levy of the COFINS in the so-called single-phase taxation regime. Besides the aforementioned legislation, specific provisions under Provisional Measure n. 2.158-35/01 and Laws n. 10.684/03, n. 10.865/04, n. 10.925/04, n. 11.051/04 and 11.196/05 were also necessary for the analysis and description of the rules of levy of the COFINS which were constructed herein
Esta dissertação tem como principal objetivo construir as normas tributárias de incidência (regras-matrizes de incidência tributária) da COFINS, a partir de enunciados prescritivos contidos em leis específicas que regem os quatro principais regimes de apuração da referida contribuição: cumulativo , não-cumulativo , de incidência monofásica e de substituição tributária . Tomando-se por base os enunciados da Lei Complementar n. 70/91 e da Lei n. 9.718/98, foi possível construirmos, além da regra-matriz de incidência tributária genérica , para apuração da COFINS no regime cumulativo , outras 6 (seis) regras específicas, que denominamos de tratamentos diferenciados no regime cumulativo . A partir, essencialmente, dos enunciados da Lei n. 10.833/03, além da regra de incidência genérica da COFINS no regime não-cumulativo , pudemos construir mais 12 (doze) normas específicas de incidência, que denominamos, também, de tratamentos diferenciados no regime nãocumulativo . No regime de substituição tributária , restaram apenas os fabricantes e comerciantes atacadistas de cigarros, conforme disposições do artigo 3º, da Lei Complementar n. 70/91 e do artigo 29, da Lei n. 10.865/04. Por fim, descrevendo acerca dos enunciados das Leis n. 9.718/98 (artigos 4º, 5º e 6º), n. 10.147/00, n. 10.485/02, n. 10.560/02 e n. 10.833/03 (artigo 49), pudemos construir 12 (doze) regras-matrizes de incidência tributária da COFINS no regime denominado de incidência monofásica . Além das leis acima citadas, também prescrições específicas da Medida Provisória n. 2.158-35/01 e das Leis n. 10.684/03, n. 10.865/04, n. 10.925/04, n. 11.051/04 e n. 11.196/05 foram necessárias para a delimitação das normas construídas

Dans ce travail de thèse, nous présentons plusieurs contributions visant à améliorer l'utilisation des modèles de Markov cachés (MMC) dans les systèmes d'intelligence artificielle. Nous nous sommes concentrés sur trois objectifs : l'amélioration de l'apprentissage de MMC, l'expérimentation d'un nouveau type de MMC et la visualisation de dissimilarité pour mieux comprendre les interactions entre MMC. Dans la première partie, nous proposons, évaluons et comparons plusieurs nouvelles applications
de métaheuristiques biomimétiques classiques (les algorithmes génétiques, l'algorithme de fourmis artificielles API et l'optimisation par essaim particulaire) au problème de l'apprentissage de MMC. Dans la
deuxième partie, nous proposons un nouveau type de modèle de Markov caché, appelé modèle Markov caché à substitutions de symboles (MMCSS). Un MMCSS permet d'incorporer des connaissances a priori dans le processus d'apprentissage et de reconnaissance. Les premières expérimentations de ces modèles sur des images démontrent leur intérêt. Dans la troisième partie, nous proposons une nouvelle méthode de représentation de dissimilarité appelée matrice de scatterplots pseudo-euclidienne (MSPE), permettant de mieux comprendre les interactions entre des MMC. Cette MSPE est construite à partir
d'une technique que nous nommons analyse en composantes principales à noyau indéfini (ACPNI). Nous terminons par la présentation de la bibliothèque HMMTK, développée au cours de ce travail. Cette dernière intègre des mécanismes de parallélisation et les algorithmes développés au cours de la thèse.

碩士
銘傳大學
資訊管理學系碩士班
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Least Significant Bit (LSB), a kind of information hiding techniques, can embed a secret into a cover image to prevent the revelation of secrets to malicious people. Since the method is quite simple and it will destroy cover images, the substitution matrix is proposed to improve the image quality of cover images and the security of secrets. Basically, the construction of optimal substitution matrices is intrinsically a combinatorial optimization problem. Nowadays, some optimization methods have been applied to the construction of substitution matrices, such as greedy algorithms and genetic algorithms. Ant Colony Optimization (ACO) Algorithm, which is also a kind of optimization methods, was derived from the observation of real ants’ behavior. Researchers found that real ants use the chemicals called “pheromones” to communicate with each other and form the shortest path connecting a nest of ants and a food source. It has been shown that ACO Algorithm is effective to solve many combinatorial optimization problems and its efficiency is better than that of genetic algorithm and simulated annealing. Therefore, in this thesis, the ACO algorithm will be exploited to construct optimal substitution matrices for efficiency consideration. In addition, we also propose position substitution matrices to further improve the image quality. Thus, instead of using only the color substitution matrix, we combine color and position substitution matrices to conceal secrets in cover images. Experimental results show that the addition of position matrices is effective in improving the image quality of cover images.

A Engenharia de Tecidos surge da necessidade recorrente de regenerar ou recriar órgãos e tecidos danificados devido a vários tipos de trauma. A carência de funcionalidades resultante pode ser resolvida através da implantação de substitutos bio-sintéticos. O presente trabalho consiste na produção de matrizes porosas 3D baseadas em réplicas invertidas de cristais coloidais com futura aplicação em substituintes ósseos sintéticos para fraturas de não-união. O substituinte ósseo consiste numa estrutura denominada Inverse colloidal crystal (ICC), em que a sua organização singular resulta numa homogénea proliferação celular e num aumento das propriedades mecânicas, quando comparada com outros substituintes. O primeiro passo para a obtenção desta estrutura é a produção de microesferas de poliestireno, por uma técnica baseada em microfluídica. Posteriormente as microesferas são empacotadas resultando numa estrutura coesa com ligações entre microesferas vizinhas. O preenchimento dos espaços vazios entre microesferas pelo biomaterial pretendido e posterior remoção das microesferas dá origem à estrutura porosa do ICC. ICCs poliméricos (ϕCs = 1,00) e compósitos (ϕCs = 0,86 e ϕHA = 0,14; ϕCs = 0,67 e ϕHA = 0,33; ϕCs = ϕHA = 0,50) são produzidos e as suas propriedades mecânicas são testadas através de ensaios de compressão e comparadas com outros substituintes sintéticos. Para avaliação do comportamento dos materiais em contacto com meio biológico, foram realizados testes de citotoxicidade que revelaram uma viabilidade celular acima dos 80% em todos os ICCs.