Добірка наукової літератури з теми "Souches mutées"

Introduction : Streptococcus mutans est une bactérie principalement responsable de la maladie carieuse. Sur le plan socioéconomique trouver un moyen simple et peu coûteux s’avère nécessaire. Cette étude vise à évaluer l’effet antibactérien et la détermination de la concentration minimale inhibitrice de la curcumine synthétique et naturelle sur des souches de Streptococcus mutans en mode biofilm. Matériels et méthodes : La souche de Streptococcus mutans a été isolée à partir de prélèvements salivaires à l’aide d’un kit spécial (CRT Bacteria® d’Ivoclar) au service d’odontologie conservatrice endodontie du CHU de Tlemcen. La détermination de la concentration minimale inhibitrice a été faite par la technique de dilution en microplaques de 96 puits, avec des dilutions en série double de curcumine synthétique (Sigma- Aldrich, Saint-Quentin-Fallavier, France) et de curcumine naturelle (curcumine pure à 99 %, origine Inde), préparées dans le Bouillon Cœur-Cervelle® (BHIB) (Conda Pronadisa, Madrid, Spain) jusqu’à un volume final de 100 μl par puits. Puis une observation par un microscope électronique à balayage environnementale a été faite sur des lames de verre immergées dans une suspension de Streptococcus mutans incubées 48 heures à 37 °C et plongées pendant 30 minutes dans une solution de curcumine à sa concentration minimale inhibitrice. Résultats : La concentration minimale inhibitrice de la curcumine est de 64 μg/ml, et la microscopie électronique à balayage a montré une réduction significative du nombre des souches Streptococcus mutans adhérées. Conclusion : La curcumine est un agent antibactérien prometteur pour la prévention de la maladie carieuse.

Le L-fucose et les oligosaccharides contenant du L-fucose présentent des propriétés biologiques intéressantes notamment dans la prévention des métastases, dans la réaction d’inflammation, dans le traitement des arthrites rhumatoïdes, dans la vaccination (antigènes) et dans le domaine cosmétique contre la déshydration de la peau. Une production du L-fucose tout comme des oligosaccharides contenant du L-fucose en vue de leur utilisation dans des thérapies, a poussé des nombreux laboratoires à un screening des organismes synthétisant des polysaccharides contenant du L-fucose. Notre travail, s’est dans un premier temps sur la production et la caractérisation des polysaccharides des souches Sinorhizobium M5N1 cPRk290 notée N et Enterobacter notée Sc. Dans un second temps nous avons produit des oligosaccharides contenant du L-fucose dérivés des polysaccharides. Cette production d’oligosaccharides a nécessité l’utilisation de plusieurs méthodes (hydrolyse acide, hydrolyse thermique, production dans le milieu de culture et dégradation enzymatique). La méthode enzymatique a permis d’obtenir des oligosaccharides de manière reproductible
L-fucose and oligosaccharides containing of L-fucose present interesting biological properties notably in the prevention of the metastases, in the reaction of inflammation, in the treatment of rheumatoid arthritics, in the vaccination (antigens) and in the cosmetic domain against the dehydration of the skin. A production of L-fucose as of oligosaccharides containing of L-fucose with the aim of their use in therapies, pushed numerous laboratories to a screening of organisms synthetizing polysaccharides containing of L-fucose. Our work, concerned first of all the production of the polysaccharides by Sinorhizobium M5N1 cPRK290 noted N and Enterobacter noted Sc strains, later these polysaccharides were characterized. And secondly we produced oligosaccharides containing of L-fucose from polysaccharides. This production of oligosaccharides required the use of several methods (acid hydrolysis, thermal hydrolysis, in the medium of culture and enzymatic degradation). The enzymatic method allows to obtain oligosaccharides in a reproducible way

La compréhension de la régulation de la synthèse et sécrétion de cellulases dans le champignon Trichoderma reesei a fortement évolué ces dernières années. Cependant, le coût de production de cellulases reste encore un des principaux problèmes pour la production de bioéthanol à partir de lignocellulose. C’est dans ce contexte que mon projet de thèse s’inscrit, dans l’amélioration de la production de cellulases de T. reesei et son adaptation aux conditions industrielles. D’abord, nous avons réalisé une analyse du transcriptome sur une lignée de souches améliorées dans des conditions proches du procède industrielle avec lactose comme inducteur. Cette étude nous a permis de trouver des gènes spécifiquement régulés dans la souche plus performante, probablement impliqués dans sa grande capacité de production de cellulases. Dans un deuxième temps, nous avons identifié parmi les gènes régulés du transcriptome lesquels impliquées dans la production de cellulases. A cet effet, des souches mutées ont été construites et leur phénotype évalué. Trois de ces gènes mutés ont affecté la production de cellulase et leur fonction ont dévoilé des nouvelles mécanismes régules. Finalement, nous avons exploré les différences d’expression lorsque nous utilisons un hydrolysat de lignocellulose comme inducteur de cellulases à la place du lactose. Une étude du transcriptome dans ces conditions, nous a permis de caractériser les différences de régulation des gènes entre ces inducteurs. En outre, nous avons identifié un groupe des gènes probablement impliqué dans la détoxification qui peuvent être utilisés dans le futur pour développer une souche résistante aux inhibiteurs
A lot of progress had been done in recent years to understand the regulation of synthesis and secretion of cellulases in the fungus Trichoderma reesei. However, the production cost of cellulases still remains one of the most important limiting steps in the production of bioethanol from lignocellulose. It is in this context that my PhD project has been developed: to genetic engineering T. reesei strains to increase its cellulase production and its adaptation to industrial conditions. First, we conducted a transcriptome analysis to an improved lineage of industrial strains during cellulase production following conditions close to the industrial process (lactose as inducer and fed-batch culture in bioreactor). We found specifically regulated genes for the most performant strain, possibly involved in its high cellulase production capacity. Then, we identified which regulated genes from transcriptome were involved in cellulase production. For this purpose mutated strains for highly regulated genes were constructed and their phenotype assessed. Three mutated genes showed to impact cellulase production and their function gave us an insight into new mechanisms being regulated. Finally, we explored the expression differences when we used a lignocellulose hydrolysate as cellulases inducer instead of lactose. A transcriptomic study of cellulases production on lignocellulose hydrolysates and lactose, allowed us to characterize the differences in regulated genes between these inducers. In addition, a group of genes probably related to detoxification was identified and could be used in the future to develop an inhibitor resistant strain

Le travail porte sur un exopolysaccharide secrète par une souche mutée de rhizobium meliloti. La structure du polysaccharide déterminée en faisant appel à des techniques chimiques d'hydrolyse totale, de réduction et de méthylation correspond à celle d'un polyglucuronane. L'utilisation de la r. M. N. Met en évidence la présence de substituants de type acétate en position c2 et c3 repartis de façon aléatoire. Compte-tenu de l'originalité de cette structure, une étude des propriétés en solution a été réalisée. A partir des résultats obtenus en viscosimètre, diffusion de la lumière et chromatographie d'exclusion stérique du polymère (masse molaire m#w=170000), on constate qu'il a un comportement de chaîne semi-flexible comparable à celui des alginates et acide polygalacturonique avec toutefois une influence non négligeable du taux d'acétate. Comme les autres polyuronides, il forme un gel en présence d'ions divalents tels que le calcium, mais peut aussi conduire à des gels thermoreversibles en présence d'ions monovalents

La maladie de Huntington (MH) est une maladie neurodégénérative progressive et létale. Il n'existe pour l'instant aucun traitement curatif de cette maladie génétique qui est causée par une expansion anormale de répétitions de CAG dans la séquence codante du gène de la Huntingtine (HTT). L'expression d'une isoforme mutée de la protéine HTT (mut-HTT) est associée aux pertes neuronales massives observées dans le striatum et le cortex des patients. De nombreuses études ont montré qu'une diminution de l'expression de la mut-HTT permet de réduire les symptômes et d'augmenter l'espérance de vie de modèles murins de la MH. Cette réduction du niveau de la mut-HTT est l'objectif de plusieurs approches thérapeutiques en cours de développement pré-clinique comme clinique. Dans ce projet, nous avons mené une campagne de criblage à haut débit dans le but d'identifier des composés chimiques capables de réduire le niveau de la mut-HTT dans des cellules souches neurales ou des neurones striataux dérivés de cellules souches pluripotentes humaines issues de patient. A l'aide d'un test biologique, miniaturisé et automatisé, détectant la mut-HTT, nous avons identifié par criblage d'une chimiothèque de molécules de repositionnement, plusieurs composés capables de réduire le niveau cellulaire de la mut-HTT. L'activité de ces molécules, parfois différente suivant le phénotype cellulaire considéré, a été confirmée par différentes approches biochimiques. L'ensemble de ces résultats ouvrent des perspectives quant à l'utilisation de ces molécules chimiques pour le traitement de la MH
Huntington's Disease (HD) is a fatal and progressive neurodegenerative disease. There is no cure for this genetic disease caused by an abnormal CAG-repeats expansion within the coding sequence of the Huntingtin (HTT) gene. The mutated isoform of the protein (mut-HTT) is associated with massive neuronal loss in the striatum and the cortex. Several studies have demonstrated that reduction of mut-HTT levels decreases symptoms associated with HD and increases life span in mouse model of the disease. Both pre-clinical and clinical programs aimed at HTT-lowering are currently under development. In this project, we perfomed a high throughput screening to identify small molecules with mut-HTT lowering activities in neural stem cells or striatal neurons derived from patient-specific human induced pluripotent stem cells. We miniaturized and automated an assay to detect mut-HTT level in human cells that was used for the screening of drug repurposing libraries. We identified several small molecules with mut-HTT-lowering cellular activities. Additional biochemical analyses confirmed those activities and for some revealed cell type specificity. Overall, these results open up new therapeutic perspectives for patients with Huntington's Disease

L'observation que nous avons faite d'une plus grande fréquence de souches de Staphylococcus aureus hypermutables isolées chez les patients atteints de mucoviscidose que chez un panel de souches témoins nous a amené à étudier les mécanismes de l'hypermutabilité chez cette espèce. L'analyse des gènes du système de réparation des mésappariements, mutS et mutL, a montré pour quatre souches cliniques une relation de cause à effet entre l'altération de ces gènes et leur phénotype hypermutable. Nous avons montré que ces gènes étaient co-transcrits chez S. aureus et que l'invalidation de l'un ou l'autre conduisait à un phénotype hypermutable. Nous avons mis au point un modèle pour l'étude de l'effet de ces gènes sur la recombinaison chez S. aureus, qui semble montrer que tous deux n'ont qu'un rôle limité dans le phénomène chez cette espèce. Cette propriété d'hypermutabilité a aussi un impact sur la résistance aux antibiotiques des souches. En effet, la résistance aux antibiotiques du groupe des macrolides est de plus en plus fréquente chez les souches de S. aureus isolées lors de la mucoviscidose, et nous avons montré qu'elle n'était pas due à des gènes de résistance portés par des plasmides ou des transposons mais, de façon très inhabituelle, à des mutations de la cible ribosomale des macrolides. Nous avons ainsi mis en évidence des mutations dans les gènes rrl (codant l'ARN ribosomal), rplD et rplV (codant respectivement les protéines ribosomales L4 et L22).