Дисертації з теми "Résistance à la colonisation"

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Lara, Oruno Denis. "Caraïbes en construction : espace, colonisation, résistance." Nice, 1991. http://www.theses.fr/1991NICE2011.

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Анотація:
Histoire des Caraïbes. Espace insulaire et continental. Préhistoire et protohistoire. Conquêtes et rupture. Résistance des Karibs. Pillage, traite négrière et système esclavagiste. Destruction du système colonial à partir de 1791 (Saint-Domingue). Abolition de l'esclavage dans les colonies britanniques et françaises. Lutte armée à Cuba (1895-1898). Économie et dépendance au XXe siècle. Dictatures. L'espace de Marcus Garvey. Les Caraïbes en guerre. La révolution cubaine. Fédération des West Indies. Black power. Crise économique et endettement. Les amérindiens. L'engrenage du sous-développement. La mer en héritages
History of the Caribbean. Islands and continental space. Prehistory and protohistory. Conquest and breaks. Karib resistance. Robbery, slave trade and slave system. Destruction of the colonial system since 1791 (Santo Domingo). Abolition of slavery in the british and french colonies. Armed struggle in Cuba (1895-1898). Economics and dependance during the XXth century. Dictatures. Marcus Garvey's area. The Caribbean in the IId world war. The cuban revolution. Federation of the West Indies. Black power. Economic crisis. Amerindians. Under-development. The legacy of the sea
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Jan, Alan. "Accélérer la restauration du microbiote intestinal pour renforcer la résistance à la colonisation contre les entérocoques résistants à la vancomycine." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2023. http://www.theses.fr/2023UPASB087.

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Анотація:
Le tractus gastro-intestinal est un réservoir d'agents pathogènes opportunistes ou de pathobiontes, qui profitent d'une dysbiose pour proliférer chez les patients fragilisés. Les ERV proviennent du tractus gastro-intestinal, où leur prolifération précède la dissémination dans la circulation sanguine et peut conduire à une infection systémique. La compréhension des mécanismes responsables de la résistance à la colonisation intestinale par les ERV est essentielle pour le contrôle des infections. Peu d'études ont identifié les bactéries commensales qui renforcent la résistance à la colonisation du microbiote par les ERV. J'ai cherché à identifier les bactéries commensales qui jouent un rôle clé dans l'effet barrière afin d'accélérer la restauration du microbiote intestinal après dysbiose antibiotique et de renforcer la résistance à la colonisation contre les ERV. J'ai effectué une analyse longitudinale de la composition du microbiote intestinal et des niveaux de portage d'ERV pendant la restauration du microbiote chez des souris colonisées par des ERV après dysbiose induite par des antibiotiques. En combinant les données biologiques et la modélisation mathématique, 15 espèces moléculaires (OTUs) à corrélation négative avec le portage d'ERV ont été identifiées. Six souches représentatives de ces OTU ont été collectées et utilisées en mélange avec une septième souche (Mix7) dans deux lignées de souris différentes colonisées avec l'ERV. Le Mix7 réduit le portage d'ERV et favorise une meilleure récupération du microbiote intestinal. Des différences dans l'effet du Mix7 entre les souris ont été observées avec des souris répondeuses et non répondeuses. Ces différences ont été associées à la variation de la composition pendant la récupération et du microbiote initial, fournissant des biomarqueurs potentiels pour prédire la réponse au Mix7. De plus, j'ai démontré que la souche du phylum Bacteroidota est nécessaire pour l'effet du Mix7 in vivo en présence d'au moins une des 6 autres souches. Dans un modèle murin de dysbiose persitante, des concentrations plus élevées d'acides gras à chaîne courte (acétate, propionate, butyrate) et d'un certain nombre de métabolites, y compris les acides biliaires, ont été observées chez les souris répondeuses par rapport aux souris non-répondeuses et aux souris témoins. Aucun des surnageants des 7 souches, seul ou en combinaison, n'inhibe la croissance de l'ERV in vitro. Il est intéressant de noter que 5 des 7 souches sont partagées entre l'homme et la souris et que 2 ont des équivalents fonctionnels. J'ai montré que la supplémentation avec un mélange de souches identifiées par modélisation mathématique améliore l'effet barrière contre les ERV par des mécanismes dépendant de la récupération et de la composition initiale du microbiote. A terme, ce travail permettra d'aller vers une médecine personnalisée en ciblant les patients à risque et susceptibles de répondre à la supplémentation avec des souches commensales anti-ERV, en fournissant de nouveaux produits biothérapeutiques vivants (LBP) et des biomarqueurs pour prédire la réponse au traitement. Les perspectives sont 1/ d'élargir l'effet à E. faecium pour lequel j'ai adapté un modèle de colonisation, 2/ de mieux comprendre le mécanisme à l'aide d'hypothèses basées sur la modélisation métabolique et en utilisant le milieu de culture que j'ai développé permettant la croissance des 7 souches et de l'ERV, 3/ d'explorer la représentation des espèces clés de l'effet barrière dans les bases de données du microbiome humain et 4/ d'isoler des souches humaines de ces espèces clés
The gastrointestinal tract is a reservoir of opportunistic pathogens or pathobionts, which benefit from dysbiosis to proliferate in fragilised patients. VRE originate from the gastrointestinal tract, where their proliferation precedes dissemination in the bloodstream, and may lead to systemic infection. Understanding the mechanisms responsible for resistance to intestinal colonisation by VRE is essential for infection control. Only few studies have identified commensal bacteria that enhance resistance to colonisation of the microbiota against VRE. I aimed to identify commensal bacteria, key in the barrier effect to accelerate gut microbiota recovery after antibiotic dysbiosis to enhance resistance to colonisation against VRE. I performed a longitudinal analysis of the gut microbiota composition and VRE carriage levels during microbiota recovery in mice colonised with VRE after antibiotic-induced dysbiosis. By combining biological data and mathematical modelling, I identified 15 molecular species (OTUs) that correlate negatively with VRE carriage. Six strains representative of these OTUs have been collected and used in mixture with a seventh strain (Mix7) in two different mice lines challenged with VRE. I found that Mix7 allows a reduction of VRE carriage and a better gut microbiota recovery. Differences in the effect of Mix7 between mice were observed with responder and non-responder mice. These differences were associated with variation in the composition during the recovery and of the initial microbiota, providing potential biomarkers to predict response to Mix7. Furthermore, the Bacteroidota strain is required for Mix7 effect in vivo in the presence of at least one of the 6 other strains. In a mice model of alternative stable state of dysbiosis, higher concentrations were observed in responder compared to non-responder and control mice for short-chain fatty acids (acetate, propionate, butyrate) and for a number of metabolites including bile acids. None of the supernatant of the 7 strains, alone or in combination, inhibits VRE growth in vitro. Interestingly, 5 of the 7 strains are shared between human and mice and 2 have human functional equivalents. I showed that supplementation with a mixture of strains identified through mathematical modelling improves the barrier effect against VRE through mechanisms dependent of the recovery and initial composition of the microbiota. Ultimately, this work will allow to move towards a personalised medicine by targeting patients at risk and susceptible to respond to the supplementation with commensal anti-VRE strains, providing novel lived biotherapeutic products and biomarkers to predict response to treatment. The perspectives are 1/ to extend the effect to E. faecium for which I have adapted a colonisation model, 2/ to better understand the mechanism by implementing hypotheses thanks to metabolic modelling and using the culture medium that I have developed allowing the growth of 7 strains and the VRE, 3/ to explore the representation of the key species in the barrier effect in human microbiome database and 4/ to isolate human strains of these key species
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Najmi, Sabah. "Stratégies de résistance à la colonisation du corps des femmes en Occident : le cas des musulmanes francophones en Ontario." Thesis, Laurentian University of Sudbury, 2013. https://zone.biblio.laurentian.ca/dspace/handle/10219/2127.

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Анотація:
Dans une perspective postcoloniale et féministe qui articule colonialité et corps des musulmanes francophones et canadiennes, notre thèse explore dans quelle mesure les expériences du racisme et du sexisme autant de l’islam et que de l’Occident modèlent le rapport que ces femmes entretiennent avec leur corps dans le contexte d’aujourd’hui exacerbé par les discours idéologiques et les violences entre l’islam et l’Occident qui réifient leur corps (femmes voilées, femmes-burqas, femmes niqabiques). Ses résultats montrent une résistance des musulmanes à la colonisation de leur corps par une agentivité inédite qui se tente, d’une part, dans une dépossession des valeurs orientales qui autorisent le mariage colonial, la mutilation sexuelle et de multiples actes de violence fondés sur le genre, et, d’autre part, dans un essai de neutralisation des influences de la culture du pornographique, de l’hypersexualisation, et des discours médiatiques et idéologiques occidentales qui les infériorisent.
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Ben, Lahcen Mohamed. "La résistance marocaine à la pénétration française dans le pays Zaian (1908-1921)." Montpellier 3, 1991. http://www.theses.fr/1991MON30026.

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Анотація:
L'etude de la resistance des zaian comprend 4 parties: la rpemiere traite le relief, la vie economique et la population pour expliquer la capacite de resistance des zaian. La deuxieme examine les debuts de la resistance. Elle s'articule en trois temps. En premier lieu nous avons analyse l'interaction du mouvement general et la riposte zaiane. Ensuite nous avons examine le sentiment religieux et national. Enfin, le protectorat, conscient que la plaine ne pouvait etre tenue que si la montagne etait conquise, prit d'assaut khenifra. La troisieme partie est consacree a la bataille d'el herri. Le premier chapitre en analyse les causes, le deuxieme expose l'accrochage et la troisieme les consequences de la bataille. La quatrieme partie porte sur la periode allant de 1914 a 1921. Premierement, de 1914 a 1918, la france, en guerre contre l'allemagne, fit cesser les combats. Les zaian, par contre continuerent la resistance sous forme de guerilla. Deuxiemement, de 1918 a 1921, la metropole, liberee de toute contrainte en europe conquit le pays. Enfin, les consequences de la "pacification" furent nefastes pour les zaian. La soumission les avait plonges dans une crise economique et sociale. Ils ont donc paye cher et meme tres cher leur heroisme. Conclusion: la haine a fait place a une estime reciproque. En 1956 l'abrogation du traite du protectorat scella l'amitie franco-marocaine
The study, treating the zaian resistance, consists of four parts: the first one deals with the relief, the economic life and the population in order to explain the zaian resistance capacity. It is divided in to three points : the interaction fo the general movement of the resistance and the zaian riposte; then, an analysis of the religious and national feeling. Finally, the invasion of khenifra which was due to the protectorate awareness that the plain couldn't be taken unless the mountain was conquered, the third part depicts el herri battle. The first chapter analyses the causes, the second describes the combat and the third one presents the consequences. The fourth part concerns the period extending from 1914 to 1924. First, from 1914 to 1918, france, at war against germany, had to cease the combat. But the zaian continued fighting in the form of guerilla wat. From 1918 to 1921, france, free from all constraint in europe conquered the zaian territory. Finally, the consequences of the "pacification" were harmful for the zaian. The submission plunged the latter in a period of economic and social crisis. Thus the zaian paid too much for their heroism. Conclusion: hatred gave place to a reciprocal esteem. In 1956 the abrogation 3of the protectorate treaty came to confirm the franco-moroccan friendship
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Ferreira, Aurora da Fonseca. "La Kisama (en Angola) du XVIe au début du XXe siècle : autonomie, occupation et résistance." Paris, EHESS, 2000. http://www.theses.fr/2000EHES0055.

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Le, Thomas Isabelle. "Histoire naturelle de la colonisation nasopharyngée par Streptococcus pneumoniae chez l'enfant vivant en crèche fermée." Paris 5, 1998. http://www.theses.fr/1998PA05P205.

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Gervais, Julie. "Identification et analyse fonctionnelle des effecteurs tardifs impliqués dans la colonisation systémique du colza par Leptosphaeria maculans." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS346/document.

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Анотація:
Leptosphaeria maculans est un champignon pathogène, responsable de l’une des principales maladies du colza (Brassica napus), la nécrose du collet. Le cycle de vie infectieux de L. maculans est particulièrement complexe. Après l’infection primaire des feuilles et des cotylédons, le champignon développe une longue phase de vie endophytique dans la tige. Cette phase de vie, qui est entièrement asymptomatique, dure plusieurs mois, avant que la nécrose ne se développe à la base de la tige, préjudiciable à l'élaboration du rendement. Durant cette phase, le colza peut présenter une « résistance adulte » limitant l'apparition et la gravité des symptômes. Alors que les gènes fongiques exprimés au cours de l’infection primaire du colza sont largement étudiés, très peu de connaissances étaient disponibles concernant la phase de colonisation systémique. Pour expliquer la capacité du champignon à coloniser la tige sans induire de symptômes, nous avons donc émis l’hypothèse que L. maculans exprimait à ce stade des effecteurs, c'est-à-dire des petites protéines sécrétées, interférant avec le système de défense de la plante. L’objectif de ma thèse était d'identifier de tels effecteurs et de les caractériser afin de mieux comprendre la colonisation systémique du colza par le champignon. Un des enjeux sous-jacents de cette thèse était aussi d'identifier de nouvelles résistances permettant la reconnaissance spécifique de ces effecteurs, qui pourraient expliquer, au moins en partie, la résistance adulte observée dans certaines variétés.Par une approche transcriptomique, j'ai pu identifier 307 effecteurs candidats "tardifs", spécifiquement exprimés lors de la colonisation de la tige et 107 effecteurs "précoces", spécifiquement exprimés lors de la colonisation des cotylédons. J’ai confirmé que les gènes codant des effecteurs précoces de L. maculans sont spécifiquement localisés dans les régions pauvres en gènes et riches en éléments répétés du génome fongique. A l'inverse les gènes codant des effecteurs candidats tardifs sont absents de ces régions et sont localisés dans les régions riches en gènes du génome. Les effecteurs de L. maculans ont donc une localisation génomique distincte en fonction de leur profil d'expression.Une analyse approfondie de cinq de ces effecteurs tardifs a permis de montrer leur conservation dans les populations naturelles de L. maculans et leur implication dans la suppression de la mort cellulaire végétale. Ces résultats associés à l'analyse de leur profil d'expression dans des échantillons de tige issus du champ au cours d'une saison culturale ont permis de proposer le modèle suivant: L. maculans coloniserait la tige de colza en sécrétant des effecteurs supprimant la mort cellulaire et donc interférant avec les défenses de la plante. A la fin de la saison culturale, la diminution de l'expression de ces effecteurs permettrait au champignon de passer d'un stade de vie biotrophe à un stade de vie nécrotrophe et d’induire la nécrose au collet. Cette transition entre les deux modes de vie serait donc basée sur un équilibre entre effecteurs supprimant la mort cellulaire et effecteurs induisant la mort cellulaire.Dans le but d'identifier de nouvelles sources de résistance spécifiques et/ou faciliter l’identification de résistances quantitatives dans le matériel végétal, j'ai créé des souches fongiques sur-exprimant précocement des effecteurs tardifs. Avec ces souches transformées j'ai évalué par test cotylédonnaire une grande collection de génotypes de colza pour identifier de potentielles relations de type gène-pour-gène. Une variété présentant une réponse hypersensible à un effecteur tardif a ainsi pu être identifiée, le contrôle monogénique de cette réponse a été validé et sa cartographie génétique effectuée dans deux descendances. Cette approche permet donc effectivement d'identifier de nouvelles sources de résistances pour lutter efficacement contre la nécrose du collet
Leptosphaeria maculans is a pathogenic fungus, responsible for one of the main diseases of oilseed rape (Brassica napus), the stem canker disease. The infectious life cycle of L. maculans is especially complex. After the primary infection of leaves and cotyledons, the fungus develops a long endophytic stage in the stem. This infection stage, which is entirely asymptomatic, lasts several months before necrosis develops at the stem base, responsible of yield loss. At this stage, the oilseed rape may exhibit "adult resistance" limiting the onset and severity of symptoms. While the fungal genes expressed during the primary infection are extensively studied, very little knowledge was available concerning the systemic colonization. To explain the ability of the fungus to colonize the stem without inducing symptom, we have therefore hypothesized that L. maculans expressed effectors, i.e. small secreted proteins, interfering with the plant defense system.The objective of my thesis was to identify such effectors and to characterize them to better understand the systemic colonization of oilseed rape by L. maculans. One of the underlying challenges of this thesis was also to identify new resistances allowing the specific recognition of these effectors expressed during stem colonization, and which may explain, at least in part, the adult resistance observed in some varieties.Using a transcriptomic approach, I was able to identify 307 "late" effector candidates specifically expressed during stem colonization and 107 "early" effector candidates specifically expressed during cotyledon colonization. I confirmed that the genes encoding early effectors of L. maculans are specifically localized in gene-poor regions and rich in repeated elements of the fungal genome. Conversely, late candidate effectors are absent from these regions and are located in regions rich in genes of the genome. L. maculans effectors have thus a distinct genomic localization based on their expression profile.A detailed analysis of five of these late effectors showed their conservation in the natural populations of L. maculans and their involvement in the suppression of plant cell death. These results, associated with the analysis of their expression profile in stem samples from the fields during a growing season, allowed us to propose the following model: L. maculans would colonize systemically the oilseed rape stem by secreting effectors suppressing cell death and thus interfering with plant defenses. At the end of the growing season, the decreased expression of these effectors would allow the fungus to switch from a biotrophic to a necrotrophic lifestyle and to induce stem canker. This transition between the two ways of life would therefore be based on a balance between effectors suppressing and effectors inducing cell death.In order to identify new specific sources of resistance and / or to facilitate the identification of quantitative resistances in plant material, I created fungal strains over-expressing late effectors during cotyledon colonization. With these transformed strains I evaluated by cotyledonary test a large collection of oilseed rape genotypes to identify potential gene-for-gene. A variety with a hypersensitive response to a late effector was thus identified, the monogenic control of this response was validated and its genetic mapping carried out in two progenies. This approach therefore effectively enables the identification of new sources of resistance for effective control of L. maculans
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Gruson, Didier. "Infections sévères en réanimation : de la colonisation à l'infection à bactéries potentiellement résistantes : exemple de Pseudomonas aeruginosa." Bordeaux 2, 2004. http://www.theses.fr/2004BOR21098.

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Анотація:
L'infection sévère constitue une des raisons majeures d'admission et la complication principale des séjours en réanimation. Le défi lié à l'état infectieux grave est permanent : il faut apprendre à prévenir, comprendre et gérer ces situations difficiles. Nos travaux de recherche clinique concernent la prévention de la transmission de P. Aeruginosa, le développement d'une politique de "bon usage" des antimicrobiens, la limitation de l'émergence des résistances et l'optimisation de la prise en charge empirique des infections acquises. Nous avons analysé la transmission du pyocyanique dans une unité de réanimation, notamment chez le patient immunodéprimé. Après avoir caractérisé la résistance aux fluoroquinolones liée aux mutations de la cible, nous avons démontré l'intérêt d'une pratique de notation des antibiotiques dans la prévention des pneumopathies nosocomiales et de la résistance aux βlactamines de P. Aeruginosa responsable de pneumonies nosocomiales et corréler le phénotype de résistance par hyperproduction de céphalosporinases avec la pratique antibiotique empirique
The severe infection is the greater reason of the admission into the intensive care unit. Because this challenge is continuous, we should learn to prevent, to understand and to manage it. Our clinical research concerns the prevention of he colonisation due to P. Aeruginosa, the development of a good pactice in antibiotic usage, the decrease of the emergence in antibiotic resistance and the appropriateness of the empiric treatment of the ventilator-associated pneumonia. We have analysed the colonisation by P. Aeruginosa in an intensive care unit, especially in the cases of imunosuppressed patients. After characterize the resistance to quinolones due to mutations in the DNA gyrase and Topoisomerase IV, we have evaluated the positif impact of an antibiotics cycling protocol on the incidence of nosocomial pneumonia and the resistance to βlactams. We have compared the phenotypes of resistance in a context of pneumonia due to P. Aeruginosa and we have evaluated the incidence of the phenotype defined by the overproduction of cephalosporinases
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Lachat, Joy. "Identification des facteurs de résistance aux peptides antimicrobiens et de colonisation de l’insecte Riptortus pedestris chez la bactérie symbiotique Burkholderia insecticola." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS274.

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Анотація:
L’insecte phytophage Riptortus pedestris, appartenant au sous-ordre des Hétéroptères, est un ravageur notoire de cultures agricoles en Asie du sud-est qui se nourrit préférentiellement de plants de soja. Cette punaise est associée à une bactérie symbiotique du genre Burkholderia nommée Burkholderia insecticola, localisée dans une région spécifique de l’intestin de l’insecte appelée la région M4. Cette région M4, organisée en cryptes, constitue l’organe symbiotique dans lequel le symbiote prolifère de manière extracellulaire. Cette interaction favorise la croissance et le développement de la punaise. Récemment, il a été montré que Riptortus produit des peptides antimicrobiens au sein des cryptes, appelés “crypt-specific cysteine-rich peptides” ou peptides CCR pour lesquels le symbiote est particulièrement résistant. Il a été proposé que les peptides antimicrobiens de l’hôte,incluant les peptides CCR, participent à la colonisation spécifique de l’organe symbiotique par B. insecticola. Dans ce travail, une approche Tn-seq a été utilisée pour identifier les gènes bactériens impliqués dans la résistance aux peptides antimicrobiens et dans la symbiose. Dans un premier temps, la robustesse de la méthode Tn-seq a été évaluée en identifiant le génome essentiel de B. insecticola. Puis dans un second temps, les facteurs bactériens impliqués dans la résistance aux peptides antimicrobiens ont été caractérisés via une approche gènes-candidats et l’approche Tn-seq. Dans une dernière partie, une expérience de Tn-seq in vivo a permis d’évaluer l’ampleur du goulot d’étranglement sur la population symbiotique lors de l’infection de l’organe symbiotique et d’identifier les facteurs symbiotiques impliqués dans la colonisation de R. pedestris
The phytophagous insect Riptortus pedestris, belonging to the Heteroptera suborder, is a notorious crop pest in South-Eastern Asia which feeds preferentially on soybean plants. This bean bug is associated with a bacterial symbiont, a specific Burkholderia species named Burkholderia insecticola, located in the M4 region of the insect’s midgut. This M4 region is organized in crypts and constitutes the symbiotic organ where the symbiont proliferates extracellularly. This interaction promotes the growth and the development of the bean bug. Recently, it was demonstrated that Riptortus produces antimicrobial peptides in the midgut crypts called crypt-specific cysteine-rich peptides (CCR) for which the bacterial symbiont demonstrates a high resistance profile. It was proposed that host antimicrobial peptides, including the CCR peptides, contribute to the specific colonization of the symbiotic organ by B. insecticola. In this work, a Tn-seq approach was used to find bacterial fitness genes involved in antimicrobial peptide resistance and symbiosis. First, the robustness of the Tn-seq method was assessed by identifying the essential genome of B. insecticola. Second, the bacterial factors for antimicrobial peptide resistance were characterized, based on both a candidate-gene and the Tn-seq approach. Finally, a Tn-seq in vivo experiment was performed to reveal the infection bottleneck effect on the symbiotic population and to identify the bacterial symbiosis factors for the colonization of R. pedestris
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Baucheron, Sylvie. "Le système d'efflux AcrAB-TolC chez Salmonella enterica : rôle dans la résistance multiple aux agents anitmicrobiens et dans la colonisation in vivo." Tours, 2004. http://www.theses.fr/2004TOUR4039.

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L'émergence récente de salmonelles non-typhoïdes résistantes aux fluoroquinolones pose un problème thérapeutique chez l'homme. Nous avons montré que les deux mécanismes associés responsables de cette résistance chez des sérotypes de Salmonella enterica sont la modification des cibles, ADN-gyrase et topoisomérase IV, et la surexpression du système d'efflux AcrAB-TolC. Chez le clone épidémique S. Typhimurium DT104, résistant à plusieurs familles d'antibiotiques, nous avons démontré que la résistance au florfenicol et aux tétracyclines est due à une synergie entre le transporteur multidrogue AcrB et les transporteurs FloR et Tet(G), respectivement spécifiques du florfenicol et de la tétracycline. Chez S. Typhimurium DT104 et DT204, TolC, contrairement à AcrB, s'est avéré essentiel dans la résistance aux sels biliaires et dans la colonisation du poussin. Nous avons montré in vitro que l'utilisation d'un inhibiteur de pompe d'efflux permet de contrer la résistance à certains antibiotiques tels que les fluoroquinolones
The recent emergence of fluoroquinolone resistant Salmonella enterica non-typhi presents a therapeutic threat to human health. The two associated responsible mechanisms of this resistance in Salmonella enterica serovars were shown the modification of targets, DNA-gyrase and topoisomerase IV, and overproduction of the AcrAB-TolC efflux system. In the epidemic multidrug-resistant clone S. Typhimurium DT104, we showed that resistance to florfenicol and tetracyclines was mediated in a synergistic way by the florfenicol and tetracycline specific transporters FloR and Tet(G), respectively. In S. Typhimurium DT104 and DT204, TolC but not AcrB were shown to play an essential role in bile salts resistance and in colonisation of chicks. The in vitro use of an efflux pump inhibitor was shown to counter resistance to some antibiotics such as fluoroquinolones
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Zavala, José Manuel. "L'envers de la frontière : dynamique des relations inter-ethniques et stratégies de résistance des Mapuche du XVIIIe siècle." Paris 3, 1999. http://www.theses.fr/1999PA030049.

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Au xviiie siecle, apres un siecle et demi de tentatives de domination des mapuche, les espagnols n'arrivent toujours pas a consolider leur presence au sud du fleuve biobio. Cette difficulte a dominer les mapuche n'est pas le fruit d'une discontinuite geographique ou d'un refus de contact, mais, bien au contraire, le produit d'une interaction specifique entre les deux societes, dynamique des rapports dont les mapuche savent se servir pour mieux resister a la presence espagnole. Ceci pose le probleme de la relation entre societe coloniale et societe indigene et montre que les societes indiennes ont une histoire complexe dont seule une analyse detaillee des relations inter-ethniques peut rendre compte. A partir d'une analyse des materiaux historiques, ethnographiques et linguistiques disponibles, nous abordons les divers aspects du rapport hispanomapuche du xviiie siecle. Notre demarche methodologique consiste a decloisonner deux champs disciplinaires qui tendent chacun a donner une representation limitee et reductrice du rapport entre societes : d'une part, l'histoire des frontieres qui ne percoit la question que du seul point de vue de la societe coloniale et, d'autre part, les recherches ethnologiques recentes qui negligent l'importance considerable que le monde blanc a eu dans le developpement des societes indiennes. L'objectif de notre travail est d'arriver, grace a l'etude des mecanismes du contact inter-ethnique, a une meilleure comprehension de la societe mapuche dans le contexte colonial
In the eighteenth century, despite attempts over one and a half centuries to dominate the mapuche indians, the spaniards were still unable to secure a presence south of the river biobio. This difficulty to control the mapuche was not due to geographical conditions or to rejection of contact, but rather it arose due to the specific nature of the relations between the two societies. The mapuche were very good at using the interrelations between the two communities as a means to resist and to counteract spanish presence. This case addresses the nature of the variety of relations between colonial and native societies and reveals the complexity of their history. It shows how indigenous communities form patterns of adaptation to the dominant society, and that these patterns can be understood only through detailed analysis of the mechanisms of the those contacts. Using historical, ethnographic and linguistic material, this work studies various aspects of hispano-mapuche interrelations in the eighteenth century. The methodology followed imposes an anthropological discipline onto historical questions. Historians of frontiers are inclined to see the question from the colonial point of view, whilst anthropologists, focusing on the present, tend to neglect the considerable effect the whites have had upon the evolution and adaptation of native societies. This study is an attempt to propose a broader interpretation of the mapuche society found in colonial chile
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Lepelletier, Didier. "Rôle de l'antibiothérapie et des facteurs liés à l'hôte et à l'hospitalisation sur le risque de colonisation et d'infection par des bactéries résistantes aux antibiotiques." Nantes, 2006. https://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show/show?id=73871b95-bdbc-4921-80d5-d80b82d39f41.

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L'émergence de bactéries résistantes aux antibiotiques est devenue un problème majeur de santé publique, notamment en milieu hospitalier. De nombreuses données épidémiologiques établissent un lien entre antibiothérapie et infections causées par des bactéries résistantes aux antibiotiques. Dans ce contexte, nous avons initialement réalisé deux études épidémiologiques sur des souches cliniques d’ Escherichia coli dans le but de préciser le rôle de l’antibiothérapie mais aussi des facteurs liés à l’hôte et à l’hospitalisation. Ces études ont permis de montrer une association significative entre l’exposition à un antibiotique et l’immunodépression et l’isolement d’une souche résistante. En particulier, l’exposition à une β-lactamine était associée à la résistance à l’amoxicilline et aux céphalosporines de 3ème génération (C3G) et l’exposition aux fluoroquinolones et au cotrimoxazole était respectivement associée à la résistance à ces molécules. Dans un deuxième temps, nous avons réalisé une étude prospective de la flore digestive de 933 patients hospitalisés dans cinq services différents du CHU de Nantes, incluant des services de médecine, chirurgie et de réanimation dans le cadre d’un Programme Hospitalier de Recherche Clinique national. Aucun entérocoque résistant à la vancomycine n’a été détecté, 585 patients étaient colonisés par une entérobactérie résistante à l’amoxicilline, parmi lesquelles 9,4% étaient résistantes aux C3G et 4,8% résistantes à l’ofloxacine. Cent quatre vingt quinze patients étaient colonisés par Pseudomonas aeruginosa, dont 23% à l’admission. L’exposition aux antibiotiques était impliquée dans chacune des résistances observées. L’antécédent d’hospitalisation ou l’hospitalisation dans certains services étaient également des facteurs de risque associés à l’isolement de souches résistantes. Les études de flore sont de réalisation et d’interprétation délicates mais s’avèrent intéressantes dans des situations épidémiques ou dans des contextes de surveillance épidémiologique ciblée
Antimicrobial resistance is a major heath problem, especially in hospital-acquired infections. Many epidemiological data showed an association between antibiotic use and infection caused by antibiotic-resistant bacteria. To assess the impact of antibiotic use and other factors, we performed two epidemiological studies on clinical Escherichia coli strains isolated from hospital patients. We showed a significant association between antibiotic use and immunosuppression and infection caused by resistant E. Coli. Previous use of β-lactamine was associated with amoxicillin- and third generation cephalosporin resistance, and previous use of fluoroquinolones and cotrimoxazole was associated with strains resistant to those antibiotics. In a second time, we performed a prospective study of the gut flora of 933 patients hospitalised in five different wards, including medicine and surgery wards and intensive-care units. No vancomycin-resistant Enterococci was isolated. 585 patients were colonised by an amoxicillin-resistant Enterobacteriaceae, with third generation cephalosporin- and ofloxacin resistance rates of 9. 4% and 4. 8%, respectively. One hundred and ninety five patients were colonized by Pseudomonas aeruginosa (23% on admission). Antibiotic use was implicated in all observed resistances. Previous hospital stay and hospitalisation in specific wards were also associated with antibiotic resistance. Studies of intestinal microflora are difficult to perform but are useful in epidemic situations and in target resistance surveillance programs
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Compant, Stéphane. "Interaction entre la vigne, Vitis vinifera L. , et une bactérie endophytique, Burkholderia phytofirmans souche PsJN : colonisation, induction de défenses et résistance systémique contre Botrytis cinerea." Reims, 2007. http://theses.univ-reims.fr/exl-doc/GED00000953.pdf.

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Lors de ces travaux, l’interaction entre la vigne, Vitis vinifera L. , et une PGPR endophytique, Burkholderia phytofirmans souche PsJN, a été étudiée. Ceci a permis de caractériser des phénomènes de colonisation bactérienne, des réponses de défense de la plante, ainsi qu’une résistance systémique induite (ISR) permettant une protection contre l’agent pathogène Botrytis cinerea Pers. L’association entre la vigne et la souche PsJN a tout d’abord été étudiée en conditions gnotobiotiques en utilisant des plantules in vitro, la souche bactérienne de type sauvage ou des dérivés génétiques (PsJN::gfp2x et PsJN::gusA11). Ceci a permis de déterminer une colonisation épi- et endophytique des racines de vigne par la souche PsJN ainsi qu’une migration de la bactérie de l’intérieur des racines jusqu’aux feuilles, par le biais du flux d’évapo-transpiration de la plante via les vaisseaux du xylème. La colonisation de la vigne par la souche PsJN a ensuite été étudiée en conditions non stériles en utilisant des boutures fructifères dans le but de décrire une possible colonisation des inflorescences. Les résultats obtenus ont permis de montrer une colonisation épi- et endophytique du système racinaire par la bactérie et ensuite, une migration des racines jusque la rafle et les jeunes baies, en présence d’autres micro-organismes. La mise en place de composés de défense ainsi qu’une ISR induite par la souche PsJN a été ensuite déterminée sur des boutures fructifères. Ceci a été caractérisé avant sa progression systémique et avec des conditions plus stériles. Des événements précoces tels que l’accumulation de peroxyde d’hydrogène et d’oxyde nitrique, ainsi que la synthèse de composés phénoliques ont été caractérisés au niveau racinaire. De plus, il est apparu, d’après des résultats préliminaires, que la souche PsJN induit, au niveau local ainsi qu’au niveau systémique, des gènes codants des protéines PR dont la signalisation dépend de la voie de l’acide salicylique et / ou de l’acide jasmonique. Ceci a permis de suggérer que la souche bactérienne induit des mécanismes communs des phénomènes de résistance systémique acquise (SAR) et d’ISR. Ces phénomènes permettent, par la suite, une protection de la vigne au niveau floral vis à vis de l’infection causée par B. Cinerea Pers
The interaction between grapevine, Vitis vinifera L. , and an endophytic PGPR, Burkholderia phytofirmans strain PsJN, has been studied in this work. This has allowed to characterize phenomenons of bacterial colonization, some plant defence responses as well as induced systemic resistance (ISR) confering protection against the phytopathogen Botrytis cinerea Pers. Association between grapevine and strain PsJN has been studied, firstly, under gnotobotic conditions by using in vitro plantlets, PsJN wild-type strain or some genetically derivatives (PsJN::gfp2x and PsJN::gusA11). This has allowed to determine epi- and endophytic colonization of grapevine roots by strain PsJN as well as a migration of the bacterium from the endorhiza to the leaves, mediated by the plant transpiration stream via xylem vessels. Grapevine colonization by strain PsJN has been then monitored under non-sterile conditions by using fruiting cuttings, with a special emphasis on putative inflorescence colonization. Results have demonstrated an epi- and an endophytic colonization of the root system by strain PsJN and then, its spreading from the endorhiza to grape inflorescence stalk and to young berries, even in presence of other microorganisms. Plant defence compounds as well as a ISR induced by strain PsJN has been then determined on fruiting cuttings. This has been characterized before its systemic spreading inside plants and with some more sterile conditions. Some early events such as hydrogen peroxide and nitric oxide accumulations as well as phenolic compound synthesis have been characterized at the root level. In addition, preliminary results have demonstrated that strain PsJN induces locally and systemically some PR-encoding genes, dependent of salicylate and/or jasmonate signaling pathways. This has allowed to suggest that this bacterium induces common mechanisms of Systemic Acquired Resistance (SAR) and of ISR phenomenons. These phenomenons allow then a protection of grapevine flowers against infection caused by B. Cinerea Pers
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Budin, Jacques. "Colonisation, acculturation et résistances : la région de Bône (Annaba, Algérie) de 1832 à 1914." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0546/document.

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Cette étude présente l’histoire des Algériens du monde rural de la région de Bône/Annaba, dans le Nord-Est de l’Algérie, de 1832, date de l’occupation militaire française de Annaba, à 1914. Pendant ces 70 ans, la région connait une mise en valeur coloniale remarquable. L’opposition des tribus à l’occupation française a souvent été forte et la prise de possession du territoire n’a été totale qu’au bout d’une quinzaine d’années. La résistance au système colonial se manifeste ensuite de manière diffuse et souvent désordonnée mais ne cesse pas. Deux insurrections armées éclatent en 1852 et 1871. Mais, en même temps, les « chefs indigènes » ainsi que les membres des forces supplétives de l’armée française collaborent activement avec les autorités françaises. La «politique indigène», paternaliste, des bureaux arabes militaires est abandonnée à partir de 1870, lors du passage à l’administration civile, qui se désintéresse alors presque totalement du sort des Algériens. Le déploiement de la colonisation bouleverse et désagrège la société rurale. L’organisation tribale est déstructurée par la création des douars-communes, par le discrédit des « chefs indigènes » et par la constitution de la propriété individuelle. Les dépossessions foncières et la limitation drastique des droits de pacage dans les forêts diminuent le potentiel agricole, prémisse d’un bouleversement à long terme de l’économie agraire. A la veille de la Première Guerre mondiale, une petite minorité des Algériens de la région de Bône est entrée dans la modernité. Globalement, la société rurale a réagi aux difficultés par un repli sur elle-même et s’est réfugiée dans la « tradition »
This study presents the history of rural Algerians of the Bône/Annaba region, in North-East Algeria, from 1832, date of the French occupation of Annaba, to the eve of the First World War. During those years, this region had known a remarkable colonial growth. The local tribes’ opposition to French occupation had often been fierce and the total possession of the territory only happened after about fifteen years. The resistance to the colonial system in the ensuing period was scattered and often disorderly but never ceased. Two armed insurrections broke out in 1852 and 1871. However, at the same time, native chiefs and members of auxiliary forces to the French army collaborated actively with French authorities. The politique indigène of the military Bureaus of Arab Affairs, paternalistic and authoritarian, but in some ways protective, was abandoned in 1870, during the transition to civil administration. This civil administration subsequently lost almost all interest in the fate of the Algerians. The spread of colonization shattered and disintegrated rural society. The tribal organization was de-structured by the new governance introduced by the creation of douars-communes, by the loss of credibility of the native chiefs and by the introduction of individual property. Land dispossession and the drastic limitation of pasture rights in the forests reduced the agricultural potential, premise of a long-term upheaval of the agrarian economy. At the eve of the First World War, a small minority of Algerians of the Bône region had entered modernity. Overall, the rural society reacted to difficulties by adopting an inward-looking attitude and by taking refuge in the “tradition”
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Angebault, Cécile. "Dynamique de la colonisation et émergence de microorganismes résistants au sein des flores commensales d'une population amérindienne vivant isolée en Guyane Française." Paris 7, 2012. http://www.theses.fr/2012PA077162.

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La thèse aborde le thème de la dynamique de colonisation par des microorganismes cibles et de l'émergence de résistances en s'appuyant sur un projet mené au sein d'une population Amérindienne entre 2006 et 2010. Une 1ère étude analyse la dynamique de la colonisation intestinale par les levures et trouve un profil de colonisation inattendu. La prévalence de portage était élevée et une majorité de porteurs étaient colonisés par des levures de l'environnement tandis que Candida albicans était rare. Ces résultats remettent en cause la place de C. Albicans comme commensal « normal » de l'être humain. Un 2nd travail étudie la colonisation intestinale par des entérobactéries porteuses de ß-lactamases à spectre étendu (E-BLSE). Le taux de portage était de 8% vs. 3% en 2000. Cette augmentation coïncidait avec la multiplication par 3 de la consommation de ß-lactamines, ce qui montre que l'association entre le portage d'E-BLSE communautaire et la consommation antibiotique. Un troisième travail étudie la dynamique de la colonisation nasale par Staphylococcus aureus. Une forte prévalence associée à un taux de portage persistant modéré a été observée. Aucun facteur épidémiologique n'était associé au portage, alors que 3 facteurs génétiques l'étaient. Ces résultats incitent à reconsidérer la place des déterminants génétiques dans la colonisation par S. Aureus. Le 4ème travail étudie le portage nasal de staphylocoques à coagulase négative résistants à la méticilline (SCN-MR). Le taux de portage était élevé et une grande diversité d'associations du complexe des gènes ccr et mec a été trouvée, ce qui met en évidence le rôle des SCN-MR nasaux dans l'évolution génétique des cassettes SCCmec
The thesis focuses on the dynamics of colonization of specific microorganisms and the emergence of resistance using the data of a project conducted over 4 years in an Amerindian tribe of Guiana. First, we focused on the dynamics of intestinal yeast colonization. We observed an unexpected colonization pattern with a high carriage prevalence. Most carriers were colonized with environmental yeasts whereas Candida albicans was rare. Our results may question the position of C. Albicans as a "normal" human commensal. A 2nd work focused on the intestinal colonization with extended-spectrum p-lactamase - producing enterobacteria (ESBL-E). The study evidenced an 8% ESBL-E carriage rate vs. 3% in 2000. This increase was concomitant with a 3-fold increase in the p-lactam consumption and highlighted how the community ESBL-E carriage is associated with antibiotic consumption. Third, we studied thé dynamics of Staphylococcus aureus nasal colonization. Overall carriage prevalence was high while persistent carriage prevalence was moderate. No epidemiological factors were associated with carriage but 3 genetic traits were associated. This suggests that host genetic might be determinant for S. Aureus nasal persistent carriage status. Last, we investigated the dynamics of nasal colonization with methicillin- resistant coagulase-negative staphylococci (MR-CoNS). A high diversity of ccr and mec gene complex associations was observed. 25% of carriers were persistent carriers. No epidemiological factor was associated with persistent carriage. Our results might reflect the important role of the SCN-MR reservoir in the occurrence of SCCmec rearrangement
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Lacroix, Fabrice. "Résistance de Salmonella Typhimurium aux détergents biologiques et chimiques : effet sur la colonisation intestinale et mise en évidence d'un gène de type acrB/F de Escherichia coli." Bordeaux 1, 1995. http://www.theses.fr/1995BOR10610.

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Le genre salmonella regroupe des bacteries a gram-negatif pathogenes pour l'homme et les animaux qui provoquent essentiellement des gastro-enterites, des speticemies et des affections genitales. Leur principal reservoir est le tube digestif des hommes et surtout des animaux ou elles peuvent etre portees asymptomatiquement. La probabilite d'atteindre l'intestin, porte d'entree de l'infection, de survivre et de coloniser les tissus depend notamment de la capacite des salmonelles a resister aux facteurs antibacteriens lies a la flore ou a l'hote, rencontres lors de leur transit intestinal. En particulier, les salmonelles sont resistantes aux sels biliaires physiologiquement deverses dans la partie proximale de l'intestin grele, au point que ces detergents biologiques sont utilises dans les milieux selectifs destines a les isoler. Ces bacteries resistent aussi a de nombreux detergents chimiques. En l'absence de souches sauvages virulentes hypersensibles aux sels biliaires, des mutants sensibles ont ete obtenus par insertion aleatoire du transposon tnphoa et testes in vitro et in vivo. Une collection de 3000 mutants transpositionnels de salmonella typhimurium c5 a ete constituee et 1432 de ces mutants ont ete cribles pour une hypersensibilite aux sels biliaires. Les trois souches mutantes retenues presentaient: (i) trois spectres differents de sensibilite aux sels biliaires et a divers detergents chimiques, (ii) trois insertions chromosomiques uniques et dans des sites differents. Le mutant lx1054 etait le plus sensible des trois mutants etudies. Le locus portant le transposon dans ce mutant a ete clone et partiellement sequence. Les polypeptides potentiellement codes par ces fragments d'adn presentaient une forte similarite avec les proteines acrb et acrf, des molecules d'efflux presentes dans la membrane cytoplasmique chez e. Coli. Le mutant lx1054 s'est revele instable phenotypiquement in vitro, et comme la souche sauvage, hypovirulent dans un modele murin. Afin de tester in vivo une souche a la fois sensible et virulente, la souche 312-21a3 de s. Typhimurium a ete mutee par recombinaison homologue du meme gene inactive par insertion d'une cartouche kanamycine. Le mutant obtenu, sensible aux detergents, etait virulent apres inoculation orale des souris. Cependant il presentait transitoirement une capacite reduite a coloniser la partie proximale de l'intestin grele de souris. La majorite des bacteries reisolees des souris etait redevenue resistante aux detergents. Les mecanismes de cette reversion phenotypique observee in vitro et in vivo restent inconnus. Ainsi, en utilisant des mutants sensibles aux sels biliaires et a certains detergents, il est montre que la capacite de resister a ces molecules participe a l'avantage selectif des salmonelles dans l'instestin grele. Un gene implique dans cette resistance a ete identifie
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Vallance, Jessica. "Lutte biologique par utilisation de l’oomycète Pythium oligandrum : colonisation de la rhizosphère et influence sur la dynamique des populations microbiennes." Brest, 2009. http://www.theses.fr/2009BRES2030.

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Une des principales limites de la lutte biologique réside dans la variabilité des résultats expérimentaux souvent imputée à la non-persistance des micro-organismes introduits sur les végétaux. Dans le cadre de cette thèse, Pythiurn oligandrum, un oomycète connu pour ses propriétés d’agent antagoniste et d’inducteur de résistance chez les plantes, a été utilisé. L’objectif principal a été d’étudier la colonisation et la persistance de P. Oligandrum après son introduction au niveau du système racinaire de plants de tomate en culture hors-sol, et d’apprécier son incidence sur les communautés microbiennes de la rhizosphère et des effluents de serre. Trois souches de P. Oligandrum ont d’abord été sélectionnées pour leur production d’oospores (structure de résistance) ainsi que de molécules ayant des effets positifs sur la croissance (une auxine : la tryptamine) et la résistance des plantes (un éliciteur : l’oligandrine). La colonisation des racines et des solutions circulantes par P. Oligandrum et Pythium dissotocum, un agent pathogène mineur très fréquent en hors-sol, a été estimée par méthodes culturales et moléculaires. L’antagoniste a persisté à des taux élevés tout au long de la saison culturale (avril à septembre), la rhizosphère des plantes ayant été colonisée à 90% par la souche produisant le moins d’oospores (détermination par Inter Simple Sequence Repeat). Malgré son abondance au niveau racinaire, peu ou pas de P. Oligandrum a été détecté dans les différents effluents de la serre. P. Dissotocum a, quant à lui, colonisé les racines et les effluents de drainage pendant les mois d’été. Un léger effet retard et une moindre colonisation au niveau des racines colonisées par l’antagoniste ont été mis en évidence. L’analyse des communautés microbiennes (fongiques et bactériennes) racinaires et circulantes par SSCP (Single-Strand Conformational Polymorphism) a révélé que ces communautés avaient subi des changements structurels importants au cours de la saison culturale. Ces évolutions temporelles sont intervenues indépendamment de l’inoculation et de la persistance de l’agent antagoniste P. Oligandrum. Des archées ont également été détectées durant toute la saison culturale dans les effluents mais uniquement aux mois de septembre et octobre au niveau des racines. Dans ce cas aussi, l’inoculation par P. Oligandrum ne semble pas avoir engendré d’effet sur ces communautés. Les résultats décrits précédemment reposent sur l’extraction et l’amplification d’ADN. Un des inconvénients de cette stratégie est qu’elle ne permet pas d’étudier les communautés microbiennes d’un point de vue fonctionnel. Afin d’évaluer et de comparer la diversité structurelle et fonctionnelle des populations fongiques rhizosphériques, ADN et ARN ont été extraits puis analysés par SSCP en fonction de trois cibles génétiques différentes: la région ITS1, l’ARNr 28S, la grande sous-unité de l’ARNr mitochondrial. Les informations générées par l’analyse de ces trois marqueurs génétiques sont relativement différentes, confirmant ainsi l’intérêt d’utiliser des amorces ciblant des régions de l’ADN très différentes pour obtenir une vision plus exhaustive de la microflore fongique
Biocontrol efficacy is mainly limited by the variability of the rhizosphere competence of the inoculated microorganisms. This doctoral thesis focused on Pythium oligandrum, an oomycete acknowledged as an antagonistic organism able to protect plants from pathogenic attacks. The aim of this work was to study the colonisation and the persistence of P. Oligandrum after its introduction in the root system of tomato plants grown in soilless culture; and to assess its impact on microbial communities colonizing the rhizosphere and the greenhouse effluents. Three strains of P. Oligandrum were selected on the basis of their ability to produce oospores (resting structures) and production of tryptamine (an auxin like compound) and of oligandrin (a glycoprotein elicitor). Real-time PCR and plate counting demonstrated the persistence of large amounts of the antagonistic oomycete in the rhizosphere throughout the cropping season (April to September). Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) analysis showed that, among the three strains inoculated, the one producing the lowest amount of oospores was detected at 90%. Despite its abundance on roots, no traces of P. Oligandrum were detected in the different effluents of the soilless greenhouse. P. Clissotocum (ubiquitous tomato root minor pathogen) colonized the rhizosphere and the effluents only in summer. There was a reduction of P. Dissotocum populations in inoculated root systems. Single-Strand Conformational Polymorphism (SSCP) analysis revealed that the genetic structure of microbial communities (fungi and bacteria) colonizing the rhizosphere and the effluents, evolved throughout the cropping season. This temporal evolution was independent from the inoculation and the persistence of the antagonist P. Oligandrum. Effluents were also colonized by Archaeabacteria but roots, only during the last two months of culture. These populations grew independently from P. Oligandrum. Results previously described, rely on DNA extraction and amplification. This strategy suffers from the inability to investigate active microbial communities. DNA and RNA data obtained by SSCP analysis of three different genetic regions (ITS1, rRNA 28S, mitochondrial RNA large subunit) highlighted the interest of using different primers for having an exhaustive view of the fungal microflora
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Garrault, Antoine. "La «résistance populaire» palestinienne face à l’occupation israélienne dans le contexte de l’après seconde Intifada en Cisjordanie (2005-2016). Territorialités et mobilisations." Thesis, Paris Est, 2017. http://www.theses.fr/2017PESC0096.

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L'objectif principal de ce travail est d'expliquer et de comprendre les relations existantes entre les territorialités en compétition dans l’espace cisjordanien et les mobilisations de groupes et d’activistes engagés dans la résistance populaire contre l’occupation israélienne entre 2005 et 2016. Les territorialités prises en considération dans ce travail rassemblent celles des acteurs israéliens de l’occupation, des militants palestiniens étudiés dans cette thèse et regroupés autour d’un objet construit que nous avons nommé la « RP » ainsi que celles des multiples agents politiques et sociaux présents dans ce conflit.Pour cela, nous adoptons une approche scientifique interactionniste propre à l’étude des relations de pouvoir, des politiques de conflits et de la sociologie des mobilisations. Nous accordons une place importante à la description de la situation de colonisation de peuplement et au décryptage de la configuration (au sens éliassien du terme) sociopolitique cisjordanienne afin d’analyser les interactions conflictuelles qui engagent les mobilisations de nos enquêtés. De manière générale et en relation avec notre objet d’étude, il apparaît que l’entrée par la notion de territorialité est tout à fait heuristique pour traiter notre problématique. Elle permet aussi d’expliquer et de comprendre les mobilisations de nos acteurs de la RP à partir de l’étude contextualisée de multiples processus politiques
The main goal of this research is to explain and understand the existing relationships between the territorialities in competition in the West Bank and the mobilizations of groups and individual activists involved in popular resistance against the territorial occupation between 2005 and 2016. The territorialities analysed in this work are threefold: those of the agents of the Israeli occupation; those of the Palestinian activists examined and defined in this thesis under our proposed term “PR” (Popular Resistance); and the territorialities of the various existing political and social entities in this conflict.To pursue this goal, we adopt an interactionist approach well-suited to the study of power relations, contentious politics and social movements. We choose to focus in particular on describing the situation of settler colonization and on the interpretation of the socio-political configuration in the West Bank (based on Norbert Elias’ theories), as these are central in order to analyze the conflictual interactions that motivate our interviewees to take part in the mobilization. In general, and as concerns our subject of study, the notion of territoriality appears to offer a heuristic approach to address our topic. It also enables us to explain and understand the mobilizations of our PR actors on the basis of a contextualized study of multiple political processes
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Le, Guyader Morgane. "« God Bless San Andres » : Esclavage, double colonisation et ethnicité post-émancipation dans la Caraïbe « colombienne »." Electronic Thesis or Diss., Antilles, 2022. http://www.theses.fr/2022ANTI0767.

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À partir de la fin du 18ème siècle, une petite société plantationnaire de coton est établie sur l’archipel de San Andres et Old Providence, situé à l’intersection des côtes nicaraguayennes, du Sud de la Jamaïque et du Nord de la Colombie. Entre 1834 et 1851, celle-ci se démantèle au cours du processus d’émancipation sous l’autorité du pasteur baptiste Philippe Beekman Livingston, descendant du principal négrier écossais de ces îles et issu d’une famille d’esclavagistes installée sur l’île d’Old Providence et à la Jamaïque. De son projet missionnaire s’apparentant au concept baptiste jamaïcain de Free Village, naît une société insulaire afro-anglo-créole « post-émancipation » fondée sur une idéologie égalitariste et dont le déploiement s’accélère à la fin du 19ème siècle. Si l’impitoyable rivalité entre les empires coloniaux a conduit la majorité des territoires caribéens à être successivement et/ou simultanément colonisés par les Britanniques et les Espagnols (entre autres), cet archipel se confronte, à partir du début du 20ème siècle, au prolongement du paradigme colonial cette fois incarné par la Colombie. Le gouvernement central colombien initie alors une politique d’acculturation par assimilation auprès de cette communauté insulaire jugée trop « afro », trop « antillaise » et trop « protestante » pour l’identité nationale que les élites politiques cherchent à affirmer. Localement connue comme la « colombianisation », cette politique assimilationniste reste aujourd’hui synonyme du traumatisme communautaire le plus explicite. Sur l’île de San Andres, à partir des années 1950, de profonds bouleversements démographiques, économiques, territoriaux, et socio-culturels sont annonciateurs d’un point de non-retour. Ne représentant plus que 30% de la population insulaire de l’île de San Andres, la minorisation de la communauté afro-anglo-créole, devient ainsi, à partir de la seconde moitié du 20ème siècle, l’expression la plus contemporaine du phénomène de double colonisation inhérent à la condition historique et politique de l’archipel.Ce phénomène de « dépossession » représente l’un des facteurs majeurs du processus identitaire contemporain des héritiers de la société livingstonienne, institutionnellement inauguré dans les années 1990 par la revendication communautaire d’une catégorie ethnique et autochtone : la catégorie raizal. Au-delà des approches inter-ethniques et généalogiques de l’émergence de la catégorie raizal, la thèse vise à comprendre les enjeux ontologiques de ce processus identitaire post-esclavagiste et postcolonial. Elle interroge son caractère « racinaire », bâti sur la mémoire du processus d’émancipation intrinsèquement reliée à la mémoire communautaire des terres, et dont le récit de la genèse puise dans la figure profondément paradoxale du pasteur Beekman Livingston, érigé en mythe fondateur de la communauté.En dépit de l’apparente insignifiance qui lui est souvent attribuée, en quoi la raïzalité est-elle l’éminente manifestation du récit moderne d’une inquiétude résistante d’exister ? Dans quelle mesure la raïzalité constitue-t-elle une réponse singulière à l’expérience violente de la dépossession ? Pourquoi dépasse-t-elle amplement les frontières de cet archipel injustement effacé de la carte régionale et mondiale des luttes d’existence contre-hégémoniques ?
From the end of the 18th century, a small cotton plantation society was established on the archipelago of San Andres and Old Providence, located at the intersection of the Nicaraguan Coast, southern Jamaica and northern Colombia. Between 1834 and 1851, this settlement was dismantled during the process of emancipation under the authority of the Baptist minister Philip Beekman Livingston, descendant of the main Scottish slave trader of both islands and from a family of slavers settled on Old Providence Island and Jamaica. From his missionary project, similar to the Jamaican Baptist concept of Free Village, was born a « post-emancipation » Afro-Anglo-Creole society based on an egalitarian ideology, whose deployment accelerated at the end of the 19th century. If the ruthless rivalry between colonial empires led the majority of Caribbean territories to be successively and/or simultaneously colonized by the British and the Spanish (among others), this archipelago was confronted, from the beginning of the 20th century, with the extension of the colonial paradigm, this time incarnated by Colombia. The Colombian central government then initiated a policy of acculturation by assimilation with this island community considered too « Afro », too « West Indian » and too « Protestant » for the national identity that the political elites were then trying to assert. Locally known as « Colombianization », this assimilationist policy remains today synonymous with the most explicit community trauma. On the island of San Andres, starting in the 1950s, profound demographic, economic, territorial, and socio-cultural upheavals were the harbingers of a point of no return. Representing only 30% of the island population of San Andres, the minorization of the Afro-Anglo-Creole community became, from the second half of the 20th century, the most contemporary expression of the phenomenon of double colonization inherent to the historical and political condition of the archipelago. This phenomenon of « dispossession » represents one of the major factors of the contemporary identity process of the heirs of the Livingstonian society, institutionnaly inaugurated in the 1990s by the community claim of an ethnic and indigenous category : the Raizal category. Beyond the inter-ethnic and genealogical approaches to the emergence of the Raizal category, the thesis aims to understand the ontological stakes of this post-slavery and postcolonial identity process. It questions its « root » character, built on the memory of the emancipation process intrinsically linked to the community memory of the land, and whose genesis is narrated by the paradoxical figure of Pastor Beekman Livingston, erected as the founding myth of the community. Despite the apparent insignificance often attributed to it, in what ways is Raizality a prominent manifestation of the modern narrative of a resistance to exist ? To what extent does Raizality constitute a singular response to the violent experience of dispossession ? Why does it go far beyond the borders of this unjustly erased archipelago on the regional and global map of counter-hegemonic struggles for existence ?
Desde finales del siglo XVIII, se estableció una pequeña sociedad de plantación de algodón en el archipiélago de San Andrés y Old Providence, situado en la intersección de la costa nicaragüense, el sur de Jamaica y el norte de Colombia. Entre 1834 y 1851, esta última fue desmantelada durante el proceso de emancipación bajo la autoridad del pastor bautista Philip Beekman Livingston, descendiente del principal comerciante de esclavos escocés de estas islas y de una familia de esclavistas asentada en la isla de Old Providence y en Jamaica. Su proyecto misionero, similar al concepto bautista jamaicano del Free Village, dio lugar a una sociedad insular afro-inglesa-kriol "post-emancipación" basada en una ideología igualitaria, que se aceleró a finales del siglo XIX. Mientras que la despiadada rivalidad entre los imperios coloniales hizo que la mayoría de los territorios del Caribe fueran colonizados sucesiva y/o simultáneamente por británicos y españoles (entre otros), este archipiélago se enfrentó, desde principios del siglo XX, a la extensión del paradigma colonial, esta vez encarnado por Colombia. El gobierno central colombiano inició entonces una política de aculturación a través de la asimilación de esta comunidad insular, considerada demasiado "afro", demasiado "antillana" y demasiado "protestante" para la identidad nacional que las élites políticas pretendían afirmar. Conocida localmente como "colombianización", esta política de asimilación sigue siendo hoy en día sinónimo del trauma comunitario más explícito. En la isla de San Andrés, a partir de los años 50, los profundos cambios demográficos, económicos, territoriales y socioculturales anunciaron un punto de no retorno. Con sólo el 30% de la población de la isla, la minorización de la comunidad afro-anglo-kriol se convirtió, a partir de la segunda mitad del siglo XX, en la expresión más contemporánea del fenómeno de la doble colonización inherente a la condición histórica y política del archipiélago. Este fenómeno de "desposesión" representa uno de los principales factores del proceso identitario contemporáneo de los herederos de la sociedad livingstoniana, inaugurado institucionalmente en los años 90 por la reivindicación comunitaria de una categoría étnica e indígena: la categoría raizal. Más allá de las aproximaciones interétnicas y genealógicas a la emergencia de la categoría raizal, la tesis pretende comprender las apuestas ontológicas de este proceso identitario post-esclavista y post-colonial. Cuestiona su carácter de "raíz", construido sobre la memoria del proceso de emancipación intrínsecamente ligado a la memoria comunitaria de la tierra, y cuya génesis es narrada por la figura profundamente paradójica del pastor Beekman Livingston, erigido en mito fundacional de la comunidad.A pesar de la aparente insignificancia que a menudo se le atribuye, ¿de qué manera la raizalidad es la manifestación prominente de la narrativa moderna de una necesidad vital y resistente de existir ? ¿En qué medida la raizalidad constituye una respuesta singular a la experiencia violenta del despojo? ¿Por qué va más allá de las fronteras de este archipiélago injustamente borrado en el mapa regional y mundial de las luchas contrahegemónicas por la existencia?
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Kambou-Ferrand, Jeanne-Marie. "L'installation des français dans les pays voltaïque (Burkina Faso) : conquête et résistances des populations." Paris 1, 1988. http://www.theses.fr/1988PA010527.

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A partir de 1885, la plupart des missions d'exploration européennes envoyées du soudan ou de la cote, en Afrique occidentale, visait les pays voltaïques, et surtout le pays mossi. Ces missions qui précédèrent la conquête n'obtinrent pas le traite tant convoite avec le royaume mossi de Ouagadougou. La conquête des pays voltaïques par la France commença en 1895 avec le traité Destenave au Yatenga et fut considérée comme terminée en 1900 avec la soumission des Touaregs du sahel sud. Les conventions franco-allemandes de délimitation (23 juillet 1897), et franco-britanniques de partage (14 juin 1898) mirent fin aux rivalités européennes dans les zones frontalières du soudan avec le Togo et la Gold-Coast. Le système d'exploitation colonial s'organisa à partir de 1900, parallèlement à la pacification par les colonnes de répression, en s'appuyant sur les cadres de l'administration indigène. La résistance des populations fut générale, se manifestant par des formes de résistance passive ou armée, liées aux systèmes politiques des sociétés voltaïques et à leurs antécédents historiques. Les lobi du sud-ouest opposèrent aux Français une guérilla préjudiciable au bon fonctionnement de l'administration coloniale. En 1914, hormis la région mossi, les pays voltaïques acceptaient difficilement le système d'exploitation colonial instaure par la France : impôts et corvées, dont les abus furent a l'origine des révoltes de 1915 - 16. La nécessité d'un contrôle administratif plus strict des populations de ces régions imposa la création de la colonie de la haute volta en 1919.
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Guimendego, Maurice. "Les populations du Centre-Est de l'Oubangui-Chari (actuelle Centrafrique) face à l'implantation coloniale française 1900-1945 : contribution à l'étude des résistances anticoloniales." Paris, EHESS, 1999. http://www.theses.fr/1999EHES0061.

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L'histoire des contacts entre les colonisateurs et les populations de l'oubangui-chari nous a toujours ete presentee comme une suite de relations quasi amicales tissees sur la base d'une confiance aveugle. Les differents mouvements de resistance qui ont ponctue ces rencontres ne seraient du point de vue de l'administration coloniale, que de negligeables malentendus vite enrayes aussitot l'autorite politique instauree. Or, il s'est deroule entre 1885 et 1925 en oubangui-chari de veritables guerres de conquete. Cette these s'est attachee a faire etat de ces affrontements et a mettre en exergue l'attitude des populations locales face au processus de l'implantation coloniale. Seule region a avoir connu le commerce libre et le feroce regime concessionnaire, ses populations ont souffert de mille maux tels que le portage, la cueillette du caoutchouc, la culture industrielle du coton, la famine, la trypanosomiase humaine et le recrutement des "volontaires" pour les deux grands conflits mondiaux mais aussi pour la construction du chemin de fer congo-ocean. Mais le caractere exceptionnel de cette region releve de nombreux concours de circonstance tels que la presence massive des fonctionnaires noirs ou d'origine antillaise, la participation des tirailleurs senegalais a son administration et la parution du roman batouala (prix goncourt 1921) de rene maran qui y officia longtemps en qualite d'administrateur. L'ouvrage ci-dessus ne se limita pas a la simple denonciation des errements de la pratique coloniale mais fit du centre-est de l'oubangui-chari le centre du monde colonial.
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Couderc, Clotilde. "Impact des antibiotiques sur l’histoire naturelle de la colonisation nasale par Staphylococcus aureus." Thesis, Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066585.

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L'objectif était d'étudier l'histoire naturelle de la colonisation nasale par S. aureus, en particulier l'impact des antibiotiques sur l'acquisition et la persistance de S. aureus résistant (SARM) ou sensible à la méticilline (SASM). Ce travail s'est appuyé sur les données issues d'une cohorte prospective multicentrique incluant des patients hospitalisés dans des centres de médecine physique et réadaptation et non colonisés par S. aureus à l'admission. 1) Les facteurs de risque d'acquisition de SARM et de SASM ont été examinés à l'aide d'une analyse cas-cas-témoins nichée. L'utilisation de fluoroquinolones, le sexe masculin et une plus grande intensité des soins à l'admission étaient significativement associés à l'acquisition de SARM. L'aide à la toilette et l'utilisation d'un dispositif urinaire étaient significativement associées à l'acquisition de SASM. 2) Les facteurs influençant la perte de colonisation ont été examinés à l'aide de modèles de Cox à fragilité partagée. L'utilisation de fluoroquinolones et la présence d'une plaie positive pour une souche différente de celle du nez étaient significativement associées à la décolonisation de SASM. Le phénotype de résistance à la méticilline n'était pas associé à la durée de colonisation par S. aureus, les durées médianes estimées de colonisation par SARM et par SASM étant respectivement de 3 et 2 semaines. Ce travail offre un nouvel éclairage sur l'histoire naturelle de la colonisation nasale par S. aureus en discriminant les facteurs relatifs à la forme résistante et à la forme sensible de la bactérie. Ces résultats montrent un impact différentiel des fluoroquinolones sur l'acquisition et la persistance de SARM ou de SASM
The objective was to study the natural history of nasal S. aureus colonization, particularly the impact of antibiotics on methicillin-resistant (MRSA) or methicillin-sensitive (MSSA) S. aureus acquisition and persistence. This work was based on data provided by a prospective multicenter cohort including patients hospitalized in long-term-care facilities and not colonized with S. aureus at admission. 1) Risk factors for MRSA or MSSA acquisition were investigated using a nested case-case-control analysis. Fluoroquinolone use, male sex and more intensive care at admission were significantly associated with MRSA acquisition. Body-washing assistance and use of a urination device were significantly associated with MSSA acquisition. 2) Factors influencing the time to loss of colonization were investigated using shared-frailty Cox models. Fluoroquinolone use and the presence of a wound positive for a non-nasal strain were significantly associated with MSSA decolonization. The methicillin resistance phenotype was not associated with S. aureus colonization duration, and estimated median time to MRSA or MSSA decolonization was 3 or 2 weeks respectively. This work provides new insights into the natural history of nasal S. aureus colonization discriminating factors for the methicillin-resistant or -sensitive phenotypes of the bacteria. These results strongly suggest a distinct impact of fluoroquinolones on MRSA or MSSA acquisition and persistence
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Picard, Marion. "Étude de l'implication d’une voie MyD88/IL-22 dans le contrôle de la colonisation par la bactérie segmentée filamenteuse." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCB107/document.

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L’intestin des mammifères est colonisé par une dense communauté microbienne avec lequel il a établi, au cours d’une longue co-évolution, des relations mutualistes. Ces relations, bien qu’essentiellement basées sur des avantages métaboliques permettent également la maturation complète du système immunitaire, dont le développement est initié in utero par un programme génétique. Chez la souris, seule la SFB a été décrite comme présentant un fort pouvoir immunostimulant permettant la coordination d’un large panel de réponses immunes, notamment IgA et Th17 dont le site d’induction préférentiel serait les plaques de Peyer. La première partie de ma thèse a contribué à la finalisation de travaux consacrés à l’étude des caractéristiques des réponses IgA et Th17 induites par SFB. Nous avons ainsi mis en évidence la capacité de la SFB à stimuler la maturation post-natale de follicules lymphoïdes isolés et de tissus lymphoïdes tertiaires qui se substitueraient aux plaques de Peyer en tant que sites inducteurs des réponses IgA et Th17 stimulées par SFB. Cependant, ce microbiote constitue aussi une source antigénique importante pouvant représenter une menace pour l’intégrité de l’hôte. Notamment, la SFB peut provoquer une inflammation chronique délétère en périphérie de l’intestin, chez des souris prédisposées génétiquement. Cela suggère l’existence de mécanismes capables de réguler la colonisation par la SFB, afin d’éviter tout phénomènes compromettant l’intégrité physiologique de l’hôte. À l’aide de souris immunodéficientes axéniques ou seulement colonisées par SFB, nous avons pu mettre en évidence un rôle de la voie de signalisation des TLR dans le contrôle de la colonisation par SFB. Cependant, ni les peptides anti-microbiens, ni les IgA ne semblent impliqué dans le contrôle de la colonisation par SFB
The mammalian intestine is heavily colonized by a huge microbial community. During a long coevolution process, the host has evolved mutualistic relationships with its microbiota. Thes relationships, mainly based on metabolstic advantages, also allow the full maturation of the host immune system, which development is initiated in utero by a genetic program. In mice, only SFB has been yet described to display strong immunostimulant properties allowing the coordination of a large panel of immune responses, more specifically IgA and Th17 responses, which preferential induction sites might be the Peyer's patches. The first part of my thesis contributed to complete a work dedicated to the characterization of the IgA et Th17 responses induced by SFB. We have underscored SFB capacity to stimulate the post-natal maturation of isolated lymphoid follicles and also tertiary lymphoid tissues that would substitute to Peyer's patches as inductors sites of both IgA and Th17 responses induced by SFB. However, this microbiote also constitutes a potential antigenic threat for the host integrity. Notably, the SFB could provoke chronic deleterious inflammation in peripheric compartment in genetically predisposed individuals. It suggests the establishment of highly regulated mechanisms regulating SFB colonization, to avoid compromising events for the host homeostasis. In a second part of my thesis, with the help of immunodeficient axenic mice, we have shown a role of TLR signaling pathways in the control of SFB colonization. However, antimicrobial peptides, IgA, IL-17 or IL-22 seem to be involved int eh control of SFB colonization
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Brand, Magdalena. ""Boxer Bangui" : les femmes libres aux frontières des politiques sexuelles de l'expatriation française en Centrafrique." Thesis, Paris 8, 2016. http://www.theses.fr/2016PA080102/document.

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Pendant mes recherches, j'ai habité le QUARTIER LATIN de Bangui (RCA), également appelé SOWETO, où les femmes étaient cheffes de famille. Les autres habitant-e-s de la ville les appellent les « FEMMES LIBRES, CAR TELLEMENT ELLES ONT USE DE LEUR LIBERTE, C’EST DEVENU PEJORATIF ». Pour vivre, elles partaient travailler chaque nuit dans les espaces de loisirs des expatriés français, dans les bars, dans les restaurants et dans les boîtes de nuit du centre-ville, comme employées domestiques, serveuses, prostituées et cuisinières. L'objet de cette thèse est l'analyse des rapports de pouvoir qui traversent les échanges économico-sexuels entre des hommes expatriés français et des femmes centre-africaines à Bangui. La recherche amènera à analyser le travail sexuel et domestique des femmes centre-africaines dans les espaces de loisirs et de consommation des expatriés comme étant au cœur de la construction de la communauté expatriée et de la constitution d’une classe de femmes qui, entre contraintes et recherche d’autonomie, négocient la valeur de leurs vies dans la ville.« SI LES GENS DISENT QUE TU ES UNE PUTE, TU ENTENDS MAIS TU FERMES TES OREILLES, PARCE QUE, TOI, TU SAIS POURQUOI TU LE FAIS : POUR L'AVENIR. C'EST UN TRAVAIL. TU LE FAIS POUR CE QUE TU AS DECIDE D'ETRE DANS TON CŒUR »
During my fieldwork, I lived in the LATIN QUARTERS in Bangui (Central African Republic), named SOWETO, where women are head of household. Other people call them « FREE WOMEN, BECAUSE THEY USE THEIR FREEDOM SO MUCH, IT BECOMES PEJORATIVE ». To earn their living, they work every night in the recreational areas of French expatriates, bars, restaurants and downtown nightclubs, as domestic workers, waitresses, prostitutes and cooks. The purpose of this thesis is to analyze power relations that structure sexual-economic exchanges between French expatriate men and Central-African women in Bangui. The research will lead to analyze sexual and domestic work of Central-African women as the heart of the construction of the French expatriate community, and of the existence of a class of women who, between constraints and search for autonomy, negotiate the value of their lives in the city.« If people say that you are a whore, you hear them but you shut your ears, because inside you, you know why you do it: for the future. It’s a job. You do it for what you have decided to be in your heart »
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Engambé, André. "Les méthodes coloniales et leurs impacts en Afrique Équatoriale française jusqu’en 1958 : cas du Moyen-Congo." Paris 10, 2011. http://faraway.parisnanterre.fr/login?url=http://www.harmatheque.com/ebook/9782343072487.

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Après la Traite négrière qui écuma pendant des siècles l'Afrique, son intérieur restait encore totalement inconnu. Si jusque-là seules les côtes étaient visitées, le continent gardait encore de nombreux mystères. Dans la seconde moitié du XIXe siècle, des explorateurs déferlent, mûs par le désir de découverte. Côté français, Pierre Savorgna De Brazza (au terme de deux voyages) arrive au Gabon, crée Franceville, avant de descendre le cours de I'Alima et signer à Mbé, en 1880, un accord de cession avec le roi Makoko. Toutefois, par suite des rivalités qui opposent encore les puissances occidentales sur le terrain, le chancelier allemand Bismarck convoque une conférence internationale à Berlin en 1884-1885. De celle-ci, découle la « balkanisation » du continent donnant ainsi naissance aux grands ensembles de territoires. En 1910, l’Afrique Equatoriale Française (A. E. F. ) est créée, avec elle le Moyen-Congo. Les Compagnies concessionnaires, qui s'y trouvent depuis 1899, pillent systématiquement les ressources naturelles. Le recouvrement de l'impôt dit « de capitation » le travail forcé, le portage, les diverses prestations. . . Sont autant de méthodes auxquelles sont soumises les « indigènes ». Partout, s'abattent abus et exactions jusque-là inconnus des populations. La justice, devenue bicéphale, condamne les autochtones à un droit bien différent du leur. L’Indigénat est né. Au plan politique, non seulement des partis naissent, mais ils le sont à l'image de ceux de la métropole. Les leaders récalcitrants, comme Matsoua, sont jugés et conduits en prison. La politique française se trouve alors aux antipodes des motivations de l'idéologie coloniale affirmée. D’où, une farouche résistance. In fine, les impacts qui en découlent ne peuvent être que néfastes : souffrances, décès, appauvrissement, misère, dépeuplement. . . Même si plus tard, le 28 novembre 1958, grâce à De Gaulle, le Moyen-Congo devient une République
After the slave draft (wilking) which skimmed during centuries Africa, its inside remained still totally unknown. If up to there only coast was visited, the continent kept numerous mysteries. In the second half of the XIXe century, explorers unfurl, moved by the desire of discovery. French side, Pierre Savorgnan De Brazza (two journeys) arrives to the Gabon, creates Franceville, before withle (going down) Alima and sign with Mbé, in 1880, an agreement of transfer with king Makoko. However, as a result of the rivalries which still set the western powers on the ground, the German chancellor Bismarck summons (convenes) an international conference in Berlin in 1884-1885. Of this one, ensues the "balkanization" of the continent so giving birth to the complexes of territories. In 1910, French Equatorial Africa (A. E. F. ) and the Middle-Congo are created. The concessionary companies, which are there since 1899, plunder systematically natural resources. The tax collection says “about capitation”, the hard labour, the portage, the diverse services (performances) are so many methods to which are subjected the “natives”. Everywhere, abuses and exactions came up to the strangers of the populations. The justice, become bicephale, condemns the Natives (autochtons) for a right very different from theirs. The Native population was born. To the political plan (shot), not only parties are born, but they are it just like those of the metropolis. The contrary leaders, as Matsoua, are judged and led (driven) in prison. Simon Kimbangou, then liking of the "black divine word", pay of his life in 1921. The French politics (policy) is then to the antipodes of the motivations of the asserted colonial ideology. Where from, a wild resistance. In fine, the impacts which ensue from it can be only fatal: sufferings, death, impoverishment, poverty, depopulation. . . Even if later, on November 28st, 1958, thanks to De Gaulle, the Middle-Congo becomes
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Bury-Moné, Stéphanie. "Mécanismes d'adaptation de Helicobacter pylori à l'acidité gastrique." Paris 7, 2003. http://www.theses.fr/2003PA077019.

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Dupont, Chloé. "Achromobacter & Pandoraea : diversité et évolution adaptative de populations persistantes au cours de la mucoviscidose et dans l'environnement." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT105/document.

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La persistance bactérienne implique une adaptation aux conditions et aux contraintes environnementales, parfois associée à une diversification des génotypes et des phénotypes des populations bactériennes impliquées. Dans le cadre des infections chroniques, la mucoviscidose (CF) est une des pathologies humaines parmi les plus étudiées en termes de persistance et d’adaptation de pathogènes opportunistes. Certains pathogènes opportunistes d’origine environnementale, comme les bactéries des genres Achromobacter et Pandoraea, considérés comme émergents dans cette pathologie, sont capables de coloniser chroniquement les voies respiratoires des patients CF (VRCF). La colonisation et la persistance impliquent des mécanismes d’adaptations étudiés pour P. aeruginosa mais mal connus pour les bactéries émergentes.Nous avons étudié la persistance de bactéries du genre Achromobacter dans les VRCF de 13 patients, ainsi que dans de réseau d’eau d’un centre de soins dentaires, et la persistance de Pandoraea pulmonicola dans les VRCF d’un patient, durant des périodes de colonisation allant jusqu’à 7 ans. En parallèle, nous avons étudié la diversité génomique et phénotypique de populations d’Achromobacter dans les expectorations de 9 patients. Enfin, une investigation environnementale au domicile de 3 patients colonisés chroniquement par Achromobacter a été menée dans le but de connaître la diversité et l’écologie des bactéries de ce genre dans l’environnement proche des patients. Lors de ces différentes études, les espèces d’Achromobacter et Pandoraea ont été identifiées par méthodes moléculaires et la dynamique du génome ainsi que la diversité phénotypique ont été étudiées.Nous avons observé une diversité d’espèces de bactéries du genre Achromobacter colonisant les VRCF, incluant une espèce non décrite. Les patients colonisés chroniquement l’étaient par un clone unique d’Achromobacter ou de P. pulmonicola, appuyant l’idée de l’acquisition initiale d’un clone environnemental qui persiste dans le temps. Une importante diversité génomique et phénotypique a été observée au cours du temps mais aussi au sein de populations à un temps donné. Nous avons également mis en évidence une importante diversité de profils d’antibiorésistance au sein de chaque expectoration, dont l’impact clinique reste à évaluer. Enfin, une diversité d’espèces du genre Achromobacter a été observée au domicile des patients alors que le clone d’A. xylosoxidans adapté aux VRCF des patients n’a pas été isolé dans leurs environnements domestiques. Ces résultats suggèrent qu’après la colonisation initiale et la spécialisation des clones colonisant les VRCF, ceux-ci seraient secondairement incapables de survivre dans l’environnement.Un clone qui colonise les VRCF s’adapte rapidement aux conditions environnementales particulières de cet habitat et subit une diversification génomique et phénotypique intense par spécialisation de génotypes à différentes niches écologiques, aboutissant à une population clonale diversifiée. Cette diversité assure certainement la persistance de la population clonale par "l’hypothèse d’assurance" selon laquelle quelle que soit la pression environnementale exercée, une bactérie ou un sous-groupe de bactéries sera capable d’y résister.Mots clés : Achromobacter, adaptation, colonisation chronique, diversité, écologie, environnement, épidémiologie, évolution, génomique, mucoviscidose, Pandoraea, persistance, phénotype, réseau d’eau, résistance aux antibiotiques
Bacterial persistence involves adaptation to environmental conditions and constraints, sometimes associated with genotype and phenotype diversification of bacterial populations. In the context of chronic infections, Cystic Fibrosis (CF) is a human disease among the most studied in terms of persistence and adaptation of opportunistic pathogens. Some environmental opportunistic pathogens like Achromobacter and Pandoraea genera are considered as emerging in CF and are able to chronically colonize CF Respiratory Tract (CFRT). Adaptation mechanisms required for colonization and persistence were studied for P. aeruginosa but remain largely unknown for emerging bacteria. We studied Achromobacter spp. persistence in the CFRT of 13 patients and in a dental care unit water network, and Pandoraea pulmonicola persistence in the CFRT of one patient, during colonization periods up to 7 years. In parallel, we studied Achromobacter population genomic and phenotypic diversity in sputum samples from 9 patients. Finally, we made an environmental investigation to study the diversity and the ecology of Achromobacter spp. in household of 3 Achromobacter chronically colonized CF patients. During these studies, Achromobacter and Pandoraea species were identified by molecular methods and genome dynamic and phenotypic diversity were studied.Diversity of Achromobacter species colonizing the CFRT is described and included an undescribed species. Chronically colonized patients had a unique Achromobacter or Pandoraea clone in their CFRT, supporting the initial acquisition of one environmental clone which persists over time. A large genomic and phenotypic diversity has been observed over time and also at the intra-specimen level. A wide antibiotic susceptibility profile diversity was observed within samples and its clinical impact remains to be assessed. Finally, Achromobacter species diversity was observed in patient domestic environment but the Achromobacter clone adapted to the patient CFRT was not isolated. These results suggested that after initial colonization and specialisation the CFRT, colonizing clones might secondarily be unable to survive in the environment.A colonizing clone quickly adapts to the specific local conditions of the CFRT and undergoes intense genomic and phenotypic diversification with genotype specialization to the different ecological niches of the heterogeneous CFRT, resulting in a diversified clonal population. This diversity certainly insures the population persistence according to the “bet hedging” theory stating that regardless of the environmental pressures, a bacteria or a subgroup of bacteria will be able to persist.Key words : Achromobacter, adaptation, antibiotic susceptibility, chronic colonization, Cystic Fibrosis, diversity, ecology, environment, epidemiology, evolution, genomic, Pandoraea, persistence, phenotype, water network
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Le, Guern Rémi. "Colonisation digestive par entérobactéries productrices de carbapénémase dans un modèle murin : aggravation de la pneumopathie à Pseudomonas aeruginosa." Thesis, Lille 2, 2019. http://www.theses.fr/2019LIL2S033.

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L’altération du microbiote digestif provoquée par une antibiothérapie augmente le risque de colonisation par des bactéries multirésistantes. Dans un modèle murin, nous avons étudié l’impact d’une colonisation digestive par entérobactéries productrices de carbapénémase (EPC) sur la sévérité d’une pneumopathie à Pseudomonas aeruginosa. Les souris colonisées par EPC présentaient une pneumopathie plus sévère (score clinique et perméabilité alvéolo-capillaire), ainsi qu’une mortalité plus élevée par rapport aux groupes contrôles ou ayant simplement reçu une injection de clindamycine. Une transplantation de microbiote fécal restaurait le pronostic. Les cellules dendritiques et les lymphocytes T CD4 étaient diminués au niveau pulmonaire dans le groupe colonisé par EPC. Au niveau du microbiote digestif, on observait une quasi-extinction des Muribaculaceae associée à une expansion du genre Hungatella chez les souris colonisées par EPC. Certains métabolites du tryptophane potentiellement impliqués dans la réponse immunitaire étaient modifiés dans le groupe colonisé par EPC. Une colonisation digestive asymptomatique peut ainsi entraîner des effets délétères sur la réponse de l’hôte
Antibiotics disrupt the gut microbiota, and are considered a risk factor of colonization by multidrug-resistant bacteria. In a murine model, we studied the impact of digestive colonization with carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) on the severity of Pseudomonas aeruginosa pneumonia. Mice colonized by CPE presented a more severe pneumonia (clinical score and alveolocapillary permeability) and a higher mortality compared to controls or mice that received only clindamycin. Fecal microbiota transplant was associated with better outcomes. After infection by P. aeruginosa, lung dendritic cells and CD4 T lymphocytes were decreased in mice colonized by CPE. Gut microbiota was specifically altered in mice colonized by CPE: Muribaculaceae relative abundance was greatly reduced, associated with an expansion of the Hungatella genus. Tryptophan metabolites were modified by CPE colonization. Asymptomatic digestive colonization with CPE had a detrimental effect on the host response to P. aeruginosa pneumonia
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Cordonnier, Thomas. "Perturbations, diversité et permanence des structures dans les écosystèmes forestiers." Phd thesis, ENGREF (AgroParisTech), 2004. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00000909.

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Cette thèse traite de l'impact des perturbations naturelles et anthropiques sur les structures des populations et des communautés afin de discuter la problématique d'une gestion forestière qui s'inspire des - et compose avec les - perturbations naturelles. En première partie, nous étudions les effets d'un gradient de perturbations sur la diversité des communautés de plantes. A l'aide de modèles de dynamique en patchs ("patch models"), nous montrons que la relation perturbations-diversité dépend des mécanismes de compétition (hiérarchie compétitive, "founder effect"), des mécanismes de coexistence (compromis entre compétition et colonisation, niche de succession), des mécanismes affectant le processus de colonisation (limitation par le recrutement, fréquence dépendance négative des taux de colonisation et immigration) et enfin des mesures de diversité privilégiées (richesse en espèce, diversité de Shannon). L'élaboration d'hypothèses mécanistes intégrant les caractéristiques de l'agent de perturbations (dont les actions anthropiques), les descripteurs utilisés (intensité, fréquence, stochasticité etc.), les traits de vie des espèces, les mécanismes de coexistence et les facteurs biotiques et abiotiques contrôlés permettraient d'affiner les prédictions qualitatives et quantitatives sur la relation perturbations-diversité et de favoriser ainsi leurs dimensions opérationnelles. En seconde partie, nous rappelons différents concepts (équilibre, résistance, résilience, persistance, constance, permanence) permettant de caractériser le comportement des systèmes en présence de perturbations. Nous présentons une méthode d'analyse basée sur le concept de permanence qui permet d'évaluer différents scénarios écologiques ou scénarios de gestion. La permanence consiste à se focaliser sur le comportement des variables lorsque ces dernières sont proches de valeurs jugées critiques (ex. extinction d'une espèce). Nous appliquons cette méthode d'évaluation à la problématique des forêts de protection dans les Alpes du Nord. A partir d'un modèle de dynamique de pessières d'altitude, nous testons différents scénarios de gestion (prélèvements agrégés/aléatoire, différents taux de prélèvements) et déterminons leurs conséquences sur la dynamique d'indicateurs de propriétés de stabilité (diversité des hauteurs, diversité des diamètres) et d'indicateurs de fonction de protection (somme des diamètres pour les chutes de blocs, taille des trouées pour les avalanches). La possibilité d'améliorer conjointement propriétés de stabilité et efficacité de protection dépend de la nature et de l'intensité des interventions ainsi que du type de danger. Cette partie permet d'illustrer une réflexion de gestion basée sur des compromis plutôt que sur l'optimisation simultanée d'un ensemble d'indicateurs. En conclusion, nous replaçons nos résultats dans le contexte d'une gestion qui s'appuie sur la connaissance du processus de perturbation. La notion de dynamique en patchs (trouées) et la notion de permanence représentent, selon nous, des cadres conceptuels et méthodologiques intéressant pour établir un pont entre écologie des perturbations et gestion forestière. Nous ouvrons des perspectives de recherche à partir de l'exemple des sapinières-pessières dans les Alpes du Nord, exemple qui intègre à la fois la problématique de la coexistence des espèces et celle de la réalisation des fonctions de production et de protection dans des écosystèmes gérés où dominent les perturbations par le vent.
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Chachaty, Elisabeth. "Evaluation de l'impact des antibiotiques sur la flore intestinale des sujets sainsnotamment sur la colonisation par "Clostridium difficile" ou par des entérobactéries résistantes : comparaison de méthodes de typage des souches de "C difficile"." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA114842.

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Le, Gac Julie. "Splendeurs et misères du Corps Expéditionnaire Français en Italie : (novembre 1942 - juillet 1944)." Thesis, Cachan, Ecole normale supérieure, 2011. http://www.theses.fr/2011DENS0061.

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En portant pour la première fois depuis la défaite de 1940 l’étendard tricolore sur le sol européen, le Corps Expéditionnaire Français accomplit un geste capital pour le relèvement national. La force du symbole ne saurait occulter ses vicissitudes. La thèse propose une histoire totale du CEF, du débarquement allié en Afrique du Nord en novembre 1942 à son retrait d’Italie en juillet 1944. Au-delà des opérations militaires, il importait de revenir sur la genèse du CEF : d’évaluer la mobilisation générale de l’AFN à laquelle répondent sans enthousiasme Européens et indigènes, d’étudier les affres de la fusion entre l’armée d’Afrique et les Forces Françaises Libres et d’observer les liens entre Français et Alliés, alors que les armes fournies par Washington accentuent la dépendance tricolore. Enjeu diplomatique pour Alger, la participation française est examinée à la lumière des débats sur la stratégie méditerranéenne. Théâtre d’opérations secondaire, la campagne d’Italie se révèle fort éprouvante. La thèse analyse alors l’anatomie de la bataille : la violence de la guerre de positions pendant l’hiver 1943-1944, les souffrances des combattants et les pertes physiques et psychiatriques. Elle s’intéresse aussi aux loisirs des soldats, à l’exercice de la discipline et à la nature des relations coloniales au sein de l’armée. La thèse évalue ensuite le rôle du CEF dans la libération de Rome en juin 1944. Cette victoire est toutefois ternie par les nombreux viols et pillages commis à l’encontre des civils italiens. Enfin, si le CEF marque une étape décisive dans la reconstruction de l’armée française, il révèle également la césure qui se dessine entre la métropole et son Empire
By fighting under the tricolour flag for the first time on European soil since the defeat of 1940 the French Expeditionary Corps (FEC) made an important symbolic gesture towards national recovery. The symbolism of this historical moment should not, however, obscure the difficulties behind it. This thesis presents a wide-ranging study of the FEC from the Allied landings in North Africa in November 1942 to the FEC’s withdrawal from Italy in July 1944. It not only examines military operations but also highlights the political and diplomatic difficulties faced during the FEC’s creation: the lukewarm public response to the levée en masse in French North Africa, the problematic amalgamation of Vichy’s Army of Africa with the Free French Forces and the uneasy relationship between French and Allied leaders, French diplomacy impeded by dependence on U.S. arms. French participation in the Italian campaign is also examined in the light of Allied debates on military strategy in the Mediterranean Theatre. Though a peripheral war zone, the Italian peninsula was the scene of a gruelling struggle. This thesis offers a detailed analysis of the combat experience: the violence of the war of attrition in the winter of 1943-44, the suffering of the combatants and the physical and psychiatric casualties. It also examines questions relating to soldiers’ leisure, discipline and colonial relations within the army. It then evaluates the role of the FEC in the liberation of Rome in June 1944, a victory tarnished by incidents of rape and looting. Ultimately, while the FEC marks a decisive step in the reconstruction of the French Army, it also reveals a growing rift between France and its Empire
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Urli, Morgane. "Réponse des rabres forestiers aux changements globaux : approches biogéographique et écophysiologique." Phd thesis, Université Sciences et Technologies - Bordeaux I, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00821979.

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Les aires de répartition des arbres pourraient être grandement affectées par le changement climatique. Les résultats d'analyses paléogéographiques ont montré que ces dernières se sont déjà déplacées avec les variations passées du climat. Ces études ont permis de déterminer la direction et la vitesse de migration des espèces, données utilisées actuellement pour générer des prédictions sur l'évolution de l'aire de répartition des espèces forestières en réponse au réchauffement du climat. Cependant, le contexte écologique dans lequel les arbres font face à ces changements est très différent par rapport aux changements climatiques passés : l'augmentation actuelle des températures est plus rapide, les surfaces susceptibles d'être colonisées sont occupées par des écosystèmes très différents et variés (forêts, surfaces agricoles, zones urbaines). Par conséquent, les arbres pourront-ils faire face à la rapidité des changements globaux actuels ? Auront-ils la capacité de migrer pour trouver des conditions plus favorables ou pourront-ils s'adapter et survivre à de nouvelles conditions environnementales ? Dans un premier temps, l'analyse de données historiques (plans d'aménagements de l'Office Nationale des Forêts et Inventaires Forestiers Espagnols) a permis de mettre en évidence des évènements de colonisation et d'extirpation et de quantifier la vitesse de migration de populations situées au cœur ou aux marges de leur aire de répartition. Une colonisation massive de Quercus ilex dans les dunes boisées atlantiques (limite Nord d'aire de répartition) a été mise en évidence au cours des 130 dernières années, confirmant les tendances prédites par les modèles. Cependant, les vitesses de colonisation de cette espèce restent bien inférieures aux déplacements de son bioclimat estimés à partir de modèles de niche. Les espèces localisées en limite Sud d'aire de répartition présentent des remontées altitudinales plus importantes que pour celles situées au cœur de leur aire. En conclusion, nos résultats montrent que les changements globaux ont déjà impactés la répartition des arbres malgré l'existence d'un décalage temporel entre les réponses migratoires des espèces forestières et le déplacement de leur bioclimat. Le stress hydrique est le facteur prépondérant pouvant expliquer le dépérissement des arbres dans un milieu dont la disponibilité en eau est limitée, notamment en marge chaude d'aire de répartition. Nous avons, par conséquent, étudié la résistance à la sécheresse et ses mécanismes chez les plusieurs espèces d'Angiospermes. Nos résultats montrent qu'un seuil de 90% d'embolie mène à des dommages physiologiques irréversibles de la plante et à la mort par déshydratation. Ce seuil est considérablement plus élevé que celui précédemment observé chez les conifères. L'étude du fonctionnement hydraulique d'espèces de chênes co-occurrentes nous a permis de montrer que la survie de Q. robur pourrait être menacée dans les forêts atlantiques dans un contexte de sécheresses de plus en plus intenses car il y subit des taux d'embolie native élevés. Au contraire, Q. ilex présente des taux d'embolie négligeables sur ce même site d'étude.Les vitesses réelles de migrations constituent des données empiriques essentielles qui nous renseignent sur les capacités migratoires effectives des arbres. Elles pourront être intégrées dans les modèles de répartition, tout comme les seuils d'embolie induisant la mort des arbres.
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Ratet, Gwenn. "Contributions à l’étude de l’échappement des leptospires au système immunitaire : mise en évidence chez la souris de la colonisation rénale chronique à l’aide de leptospires bioluminescents, et rôle de la lipoprotéine LipL21 dans l’échappement du peptidoglycane à la reconnaissance par les récepteurs Nods." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015PA05T012.

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Hamdi, Ghazi. "Les lieux de sociabilité dans la ville de Tunis à l'époque coloniale : ville européenne et cosmopolitisme 1881-1938." Thesis, Montpellier 3, 2013. http://www.theses.fr/2013MON30096.

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Cette thèse porte sur la sociabilité dans la ville de Tunis à la période coloniale. Cette ville qui a connuun dédoublement urbain, par l'installation d'une ville européenne à côté de la ville arabe. C’est cephénomène particulier qui justifie notre thèse, dont les conséquences ne se réduisent pas au seul cadrephysique, mais touchent aussi bien la société, les normes et les valeurs culturelles.Les corpus de notre étude sont des composants urbains publics de la ville de Tunis qui peuvent êtreorganisés ou spontanés ; les rues, les cafés et les salles de spectacles, dans lesquels on a testél’intensité de la sociabilité. Chaque espace se caractérise par une forme urbaine spécifique, ce qui luidonne plusieurs formes d'occupations, manifestant l'entente ou le conflit et de multiples manières decontrôles policiers.Dans la société coloniale, on trouve des structures d’intégration qui idéalisent la société réelle et desstructures de refus comportant le projet d’une société future meilleure pour ses membres. Nous endéduisons un conflit entre trois communautés ; la nation française qui tente de garder sa haute mainsur la Tunisie, les italiens qui rêvent de reconstruire leur ancien empire Romain, et les tunisiens quiaspirent à retrouver leur indépendance. Ce contexte a permis l'émergence de la personnalité nationaletunisienne. En effet, la loi qui régissait la vie sociale dans la ville de Tunis à l’époque coloniale ; c’estle conflit du pouvoir
This thesis speaks about the sociability in the town of Tunis in the colonial era.This town that lived a double urban life; Arabian and European at the same time. This phenomenon is the main point in this thesis, not only as concerns the place of life but also society values and cultural characteristics.The places of interest in our research are urban and public constituents that are formal and informal: roads, Cafés, Theatres....where we tested the degree of sociability. Each space is characterised by a pacific urban feature that takes many forms of occupations reflecting conflict of harmony, and multiple manners of police control.In the colonial society, we find different modes of integration that idealize the local society or refuse it aiming at sitting the project of a future society considered better for members. We deduce a conflict between three communities: a first one that is the French nation that tries to keep an upper hand on Tunisia, a second one which consists of the Italians who dream of building their ancient Roman Empire, a third one that includes Tunisians who want to regain power over their country and to get independence. This context led to the emergence of a national personality. In fact the main characteristic of the social life in Tunis in the colonial era is a conflict of powers
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Bellahsene, Tarik Pinon Pierre. "La colonisation en Algérie." Saint-Denis : Université de Paris 8, 2008. http://www.bu.univ-paris8.fr/web/collections/theses/BellahseneThese1.pdf.

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Reproduction de : Thèse de doctorat : Architecture : Paris 8 : 2006.
Titre provenant de l'écran-titre. Le complément de titre connaît plusieurs variantes. Le complément de titre retenu est celui de la thèse imprimée et non celui indiqué sur l'écran-titre : "les cas des centres en Kabylie du Djurdjura, 1857-1899, une illustration de la plaine vers la montagne". Bibliogr. [20] p. en fin du tome I. Notes bibliogr. Lexique.
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Déry, Steve. "La colonisation agricole au Vietnam." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape8/PQDD_0016/NQ48535.pdf.

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Inglis, Timothy J. J. "Colonisation of the ventilated airway." Thesis, University of Southampton, 1990. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.259486.

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Poncelet, Marc. "Sciences sociales, colonisation et développement : une histoire sociale du siècle d'africanisme belge." Lille 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LIL12005.

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Le champ belge des etudes en developpement est l'heritier direct des sciences coloniales, institution savante tres specifique du royaume, institution nee de et autour de l'unique colonie : le congo. Colonie capitaliste par excellence, celui-ci fut investi d'emblee du schema du developpement. C'est autour de ce dernier que s'organiserent les infrastructures savantes propres a l'outre mer, que s'accumula le patrimoine africaniste. Mettre ces connaissances en perspective ainsi que les aleas de leur legitimite et leur perilleuse reconversion requiert principalement l'explication sociologique des procedures etablies et socialisees de production d'une "science congolaise en metropole" selon des axes disciplinaires, ideologiques et institutionnels
The belgian development studies are rightful heir to colonial social sciences. This scientific institution is born and grow up with the lonely colony : the belgian congo. Capitalist in the higher sense of the word, congo has been immediately perceived under development scheme. Throughout this concept was built scholar institutions specially dedicated to aversea and the african scientific patrimony. An outlook of the knowledge, of his legitimacy process, of this perilous redeployment need a sociological explanation of established and socialized proceedings and dealings of production of congolese science in the mother country following the greatest kinds of instituted knowledge, ideologies and scholar institutions
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Richards, Luke. "Pneumococcal colonisation models of the nasopharynx : the role of virulence factors and host immunity during colonisation." Thesis, University of Leicester, 2011. http://hdl.handle.net/2381/9411.

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The human nasopharynx is the most important ecological niche for Streptococcus pneumoniae and the establishment of nasopharyngeal carriage is an essential pre-requisite to invasive pneumococcal disease. Virulence factors which mediate long term carriage and the immunogenicity of individual bacterial components are of interest to the development of vaccines which currently fall short of protecting against >90 known serotypes of pneumococci. This thesis contains a long term mouse model of nasopharyngeal carriage conducted in outbred mice, using both wild type and attenuated isogenic mutant pneumococcal strains. Whilst serotype-2 (D39) and serotype-3 (A66) pneumococci were carried asymptomatically in the nasopharynx for at least 21 days, mutants that lacked neuraminidases, PspA and pneumolysin were cleared from the nasopharynx <14 days. Both the carriage of WT-D39 and the clearance of the pneumolysin negative (PlnA-) were associated with the generation of serum IgM anti-capsular antibody, and IgG anti-PspA, which correlated to bacterial numbers in the nasopharynx. Carriage also stimulated anti-capsular IgA in the cervical lymph nodes, and a local macrophage cellular response. Using attenuated carriage it was possible to model the effects of subsequent exposure to pneumococci, in the form of future carriage events and invasive disease. Prior colonisation significantly shortened the duration of carriage from >28 days to <14 days within the same serotype however, both the polysaccharide capsule and conserved protein antigens contribute to protection. Colonisation could also protect mice from a normally fatal invasive challenge with both D39 and A66. Immune sera alone from previously colonised mice was able to delay onset of fatal pneumonia, however the presence of both PspA and capsule antigens were not indispensible to the protection in this instance. Taken together, the results in this thesis support existing data about the immunogenicity of capsule and conserved proteins which may inform the creation of novel and more efficacious pneumococcal vaccines.
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Picard, Aleth. "Villes et colonisation : Algérie : 1830-1870." Université Paris-Est Créteil Val de Marne (UPEC), 1987. http://www.theses.fr/1987PA120062.

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La colonisation de l'algerie par la france au debut du xixeme siecle se traduit, quant a l'amenagement du territoire, par des travaux de transformation des villes existantes et par la fondation de centres de colonisation et de villages agricoles. Le reseau de villes, mis en oeuvre par les ingenieurs du genie (service responsable de l'ensemble des travaux civils et militaires), constitue un corpus d'une vingtaine de villes. Ce travail presente une analyse annee par annee des projets a partir des archives du genie de vincennes. La lecture des plans et des apostilles des ingenieurs militaires nous renseigne tant sur les methodes de travail de ce corps que sur la conception de la ville au xixeme siecle et le fait colonial lui meme. Ces realisations, quoique tres differentes, prefigurent deja les travaux haussmanniens de paris et des principales villes de france et les interventions, bien plus tardives, sur les villes des protectorats et des colonies francaises du debut du xxeme siecle
French colonisation in algeria at the begining of the ninetheenth century resulted, as far as national developpement is concerned, in convention works of existing towns and in the creation of settlements and agricultural villages. The towns network, set up by the military engineerin (service responsable for all the civil and military works) consists in an about twenty towns corpus. This work presents a project's analysis year after year based on vincennes military engineering archives. Plans and apostils reading of military engineers provides information on this body's working methods as well as on the urban design ine the ninetheenth century and on colonial matter. Although they are quite different, these projects announce already haussmann's works in paris and in the main french towns as welle as the operations made much later on french protectorates and colonies at the begining of twentieth century
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Wong, En En Hazel. "Host epithelial responses to Neisserial colonisation." Thesis, Imperial College London, 2010. http://hdl.handle.net/10044/1/6045.

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Neisseria meningitidis is a bacterium that colonises the human nasopharyngeal mucosal surface. Occasionally, it can migrate from the nasopharynx to cause potentially lifethreatening meningitis and septicaemia. In contrast, closely related bacteria such as Neisseria lactamica, colonise the nasopharynx but do not cause invasive disease. Interaction differences between N. meningitidis and N. lactamica with the human host at the colonisation stage are poorly defined. I hypothesise that early interactions of N. meningitidis and N. lactamica with respiratory epithelial cells are associated with differential host cell responses, and that these may be capable of altering the outcome of the interaction. Experiments were undertaken to describe the interactions of N. meningitidis and N. lactamica with a human bronchial epithelial cell line. Association and invasion studies indicated a similar extent of association and invasion of N. meningitidis and N. lactamica. Human epithelial gene expression profiles in response to N. meningitidis and N. lactamica were determined using a genome wide microarray platform. Comparison of live and dead bacteria enabled the identification of host responses specifically to live Neisseria while comparison of the N. meningitidis capand pilE- mutants allowed the identification of host responses to non-capsule and pili factors, such as secreted proteins. Selected genes were further verified at the transcript and protein level. Host metabolic and energy production processes were associated with both neisserial species, suggesting that both N. meningitidis and N. lactamica utilise host resources for energy. In contrast, the data indicated that while N. meningitidis down-regulates host defence genes, N. lactamica initiates a proinflammatory response, suggesting specific colonisation processes that may lead to different clinical outcomes. Treatment of the epithelial cells with neisserial secreted proteins showed that they may be directing some of these differential responses, suggesting novel mechanisms for modulation of the host response.
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Saïdi, Hédi. "Société, économie et colonisation d'une région en Tunisie pendant la colonisation française : Dar Elbey de 1880 à 1919." Paris 8, 2003. http://www.theses.fr/2003PA08A003.

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Sanford, Jane. "Shipping sheep : a zooarchaeology of Greek colonisation." Thesis, University of Cambridge, 2012. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/244937.

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This PhD thesis (totaling approximately 55,000 words) argues for the value of biometric studies of domesticates as a means by which to examine controversial questions in archaeological research. Taking the Greek colonisation of southern Italy and the Adriatic coast of Croatia as case studies faunal material was examined from Greece and both of these areas to determine what data domesticates could provide as to the scale and process of Greek colonisation in these regions. Distinct varieties of sheep and cattle were identified from Greece through bone measurements. These Greek livestock could then be traced to colonies in Italy, although not necessarily in Croatia. It was argued from the scale of evidence for domesticate translocation it Italy that a substantial majority of settlement in these colonies came from settlement relocation of families or groups from Greece, but that some indigenous or “other” variety livestock were included in the domesticate makeup of each colony site. Some provisional data from Archaic and later indigenous sites from Italy suggested that Greek livestock varieties were traded throughout the colonial landscape. Data from Croatia was less clear, as no conclusive evidence for Greek livestock translocation to colonies could be found. Likewise, no evidence was found of trade in Greek livestock varieties with indigenous settlements.
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Akers, D. E. "Colonisation of sugar beet by Myzus persicae." Thesis, University of East Anglia, 1988. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.235344.

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Twomey, Anne Law Faculty of Law UNSW. "The de-colonisation of the Australian states." Awarded by:University of New South Wales, 2006. http://handle.unsw.edu.au/1959.4/35217.

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Demay, Aline. "Tourisme et colonisation en Indochine (1898-1939)." Thèse, Paris 1, 2011. http://hdl.handle.net/1866/10096.

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Comment le tourisme s’est-il développé dans un territoire en pleine expansion coloniale ? Comment tourisme et colonisation se sont-ils conjugués ? Quel lien peut-on établir entre ces deux dynamiques ? C’est ce à quoi cette thèse tente de répondre en démontrant l’instrumentalisation du tourisme par les politiques coloniales. Elle se divise en sept chapitres abordant successivement le transfert des pratiques touristiques de l’Europe à l’Indochine, leurs implantations, leurs intégrations aux politiques de mise en valeur des années 1920, les conséquences spatiales de leurs implantations (construction de voies de communication et d’hébergements hôteliers) et la communication instaurée par l’Etat pour promouvoir l’Indochine comme une destination touristique auprès des Indochinois comme des touristes étrangers.
How did tourism develop in a rapidly expanding colonial territory? How were tourism and colonization combined? What links were established between these two processes? These are the questions that this thesis addresses by demonstrating the exploitation of tourism by colonial policies. This thesis is divided into seven chapters dealing successively with the transfer of European tourism practices to Indochina, their location, their integration into the politics of territorial development in the 1920s, the spatial consequences of their implementation (construction of roads and hotel accommodation), and the attempts of the State to promote Indochina as a touristic destination for both Indochinese and foreign tourists alike.
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Dawson, Helen Sarah. "Island colonisation and abandonment in Mediterranean prehistory." Thesis, University College London (University of London), 2005. http://discovery.ucl.ac.uk/1383657/.

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This thesis studies the colonisation and abandonment of Mediterranean islands in prehistory by placing them within a comparative framework. The geographical scope is pan-Mediterranean and chronologically it encompasses prehistory from the time when the earliest-known human records are found on a few islands to the time when most Mediterranean islands had been colonised (approximately from the end of the Pleistocene to the end of the Iron Age). By questioning established geographical boundaries and chronological restrictions and by incorporating recent theoretical advances in island archaeology, this thesis provides alternative explanations to colonisation paradigms prevalent in the 1980s and 1990s, expanding these to include considerations of abandonment and recolonisation. After investigating leading theoretical approachesto colonisation and abandonment, the study reviews the bulk of available publications on Mediterranean islandbased projects from the past ten years, and presents a series of revised colonisation and abandonment dates and models for the islands. At a broader level') these new data indicate the need for clearer distinctions between different types of island-human interaction (e. g. visitation, utilisation, occupation, establishment, abandonment, and re-colonisation). The thesis therefore also analyses - through a series of case studies - how human activity on islands varied spatially and temporally and potential reasons behind different colonisation and abandonment processes. The resulting observations are placed against the backdrop of the changing palaeogeography of the prehistoric Mediterranean, by taking into account changes in sea levels and in the islands' environments, and contextualised within the broader scheme of reference of Mediterranean prehistory.
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Cohen, J. M. "Colonisation-induced protection against Streptococcus pneumoniae disease." Thesis, University College London (University of London), 2011. http://discovery.ucl.ac.uk/1124359/.

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Streptococus pneumoniae is an important human pathogen, yet in most individuals it establishes only transient nasopharyngeal colonisation without causing disease. Using murine models, this thesis explores the hypothesis that colonisation induces acquired immune responses which protect against subsequent pneumonia. Colonisation models with wild-type (WT) and mutant S. pneumoniae were established in outbred CD1 mice. Mutants lacked either capsule or lipoproteins, or were auxotrophs unable to replicate in vivo. WT colonisation protected against subsequent pneumonia. Mutants were cleared more rapidly than WT, were not immunogenic and did not protect. When the auxotroph was supplemented, colonisation, immunogenicity and protection were improved, suggesting duration of a colonisation event is an important factor in determining immunogenicity. This may be one factor explaining the poor immunogenicity of the other mutants. The mechanism by which previous colonisation protected against subsequent lethal pneumonia was then defined in a series of studies in inbred CBA/Ca mice. Colonisation induced both mucosal and systemic antibody responses to bacterial surface antigens but not capsule. There was also evidence of more robust cytokine production during subsequent pneumonia, including systemic and mucosal IL-17 responses dependant on the presence of CD4-cells. Protection was primarily against systemic invasion following pneumonia. Passive transfer studies and experiments using genetically modified mice demonstrated that systemic antibody was both necessary and sufficient to protect, and in vitro and in vivo models showed this to be via opsonophagocytosis and bloodstream clearance of bacteria. Antigenic protein targets of protective serum were defined using Western blotting and multiplex bead immunoassay techniques. Overall this thesis demonstrates that nasopharyngeal colonisation can protect against lethal pneumonia in mice via opsonophagocytic antibody against surface proteins thus preventing bacteraemia.
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Phan, Hien Diem. "La colonisation française, et le droit vietnamien." Perpignan, 2008. http://www.theses.fr/2008PERP0915.

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Le droit français s'est infiltré au Vietnam presque aussi rapidement que la langue française. Depuis l'éclosion de son premier droit écrit, l'étude du droit vietnamien ne peut être séparée de celle de ses origines et des nouvelles valeurs occidentales qu'on y décèle. Pendant la période coloniale, plusieurs codes - tels que le code civil, le code de procédure civile et commerciale, le code de procédure pénale et le code pénal -ont été promulgués dans les trois "pays" vietnamiens (Cochinchine, Annam, et Tonkin). Tous ces textes s'inspiraient très fortement des codes français. Les Accords de Genève de 1954 sur le Vietnam ont consacré la reconnaissance des droits nationaux fondamentaux - indépendance, souveraineté, unité et intégrité territoriale - du peuple vietnamien. Dès lors, du point de vue des législations et des juridictions, les nouveaux codes vietnamiens sont rentrés plus nettement encore dans la famille des codes d'inspiration occidentale, mais non anglaise, pour ne pas dire qu'ils sont d'inspiration française. Suivant cette évolution, après avoir décrit les institutions législatives vietnamiennes pendant la colonisation française, il conviendra de présenter les versions successives du droit vietnamien ainsi que le plan de l'évolution et du développement actuels du système législatif jusqu'en 2010
French law infiltrated Vietnam almost as quickly as French language did. Since the eclosion of its first written law, the study of the Vietnamese law can’t be separated from the study of its origins and of the new western values that can be detected in it. During the colonial period, several codes - such as the civil code, the commercial law and civil law procedure, the criminal law procedure and the penal code - have been promulgated in the three Vietnamese “countries” (Cochinchina, Annam and Tonkin). All these texts were heavily inspired by French law. The 1954 Geneva Agreements on Vietnam have recognised the fundamental national rights - independence, sovereignty, unity and territorial integrity - of Vietnamese people. Since then, with regard to legislations and jurisdictions, the new Vietnamese codes belonged even more clearly to the codes with a western - but non English - influence, not to say with a French influence. Following this evolution, after having described the Vietnamese legislative institutions during French colonisation, it should, then, be appropriate to present the successive versions of the Vietnamese law and also the contemporary evolution and development plans of the legislative system until 2010
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Matos, Fábio Emanuel Lopes de. "Colonisation of artificial substrates in chemosynthetic ecosystems." Master's thesis, Universidade de Aveiro, 2010. http://hdl.handle.net/10773/903.

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Mestrado em Ecologia, Biodiversidade e Gestão de Ecossistemas
A região do Golfo de Cádiz é caracterizada pela presença de vários vulcões de lama com diversas características geológicas. Estas estruturas têm sido alvo de investigação nos últimos anos nas áreas de geologia e ecologia. O presente trabalho visa o estudo dos processos de colonização em quatro desses vulcões recorrendo ao uso de dispositivos de colonização (CHEMECOLI) preenchidos com substratos orgânicos (madeira e alfalfa) e inorgânicos (carbonatos). Conjuntos de três CHEMECOLI, cada um com um tipo de substrato, foram depositados ao longo de um gradiente de profundidade: Mercator (354m), Meknès (698m), Darwin (1100m) e Carlos Ribeiro (2197m). No Mercator, três sets foram colocados com o objectivo de estudar a sucessão ecológica da comunidade de macrofauna. Dois desses conjuntos já foram recolhidos e analisados assim como cada um dos sets colocados no Meknès e no Darwin. O tempo de imersão variou entre 10 meses e dois anos. A biodiversidade de metazoários recrutados foi estudada com particular interesse pelas espécies de bivalves e poliquetas quimiotróficas. Em todos os dispositivos de colonização houve recrutamento independentemente da duração da experiência. Diferenças significativas foram observadas entre as comunidades dos diferentes substratos. Os substratos orgânicos foram mais densamente colonizados que os carbonatos. Na alfalfa os grupos de invertebrados mais abundantes foram os anfípodes e os poliquetas enquanto as amostras de madeira foram densamente colonizada por bivalves perfuradores de madeira. Espécies quimiotróficas, na sua maioria bivalves das famílias Solemyidae e Mytilidae, foram recrutadas com sucesso quase exclusivamente nos substratos orgânicos. O recrutamento de espécies características do ambiente circundante foi reduzido. ABSTRACT: The Gulf of Cadiz encompasses around forty mud volcanoes, with diverse geological settings, which have been the focus of geological and ecological surveys in the last years. The present study includes a combination of site surveys and replicate colonization experiments (CHEMECOLI) using organic (wood and alfalfa grass) and inorganic (carbonate) substrata in some of this chemosynthetic ecosystems. Sets of CHEMECOLI, each with one of the three substrates, were deployed in four mud volcanoes along a depth gradient: Mercator (354m), Meknès (698m), Darwin (1100m) and Carlos Ribeiro (2197m). In Mercator three sets were deployed in order to illustrate temporal variations of the assemblages. Two sets from Mercator and the ones from Meknès and Darwin were already recovered and analysed. The immersion times range from 10 months to two years. The biodiversity of the recruited metazoan, with particular attention to bivalve and polychaetes symbiotic species, are being analysed. The recruitment of metazoans was successfully recorded in all the CHEMECOLI independently of the duration of the experiments. Significant differences were observed between the substrate. The organic substrates were more densely colonised than the carbonates. In alfalfa grass, the amphipods and polychaetes are the most abundant groups while the wood experiments are densely colonised by wood-boring bivalves. Chemotrophic species, mostly Solemyid and Mytilid bivalves, were recovered mainly in organic substrates and the recruitment of background taxa was generally low.

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