Дисертації: "Plantes en voie de disparition"

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Novi, Kristanti Alfinda. "Etude phytochimique de plantes menacées de disparition." Mulhouse, 1997. http://www.theses.fr/1997MULH0482.

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BEIS, STAMATIOS. "Le parler aroumain de metsovo description d'une langue en voie de disparition." Paris 5, 2000. http://www.theses.fr/2000PA05H029.

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Анотація:

L'etude presente est consacree a la description d'une variete de la langue aroumaine (parler de metsovo, nord-ouest de la grece). Cette langue, romane (proche du roumain), caracterisee par le statut des langues en voie de disparition et a tradition orale, appartient a la branche orientale des langues romanes est parlee en grece et dans d'autres pays balkaniques. Notre approche linguistique s'appuie sur les principes et les concepts de la linguistique fonctionelle et structurale developpee par andre martinet et ses continuateurs. Dans le chapitre preliminaire de ce travail, nous fournissons une serie de donnees extra- linguistiques qui permettent l'identification de cette langue et des aroumains, la communaute humaine qui la pratique. Avant la description des faits linguistiques, nous presentons les resultats d'une enquete personelle de type socio-linguistique qui permet de preciser le profil de la population parlant encore l'aroumain et les conditions de sa pratique actuelle en phonologie, nous proposons l'inventaire des phonemes de l'aroumainet l'etude de certains phenomenes essentiels. En syntaxe, l'accent est mis sur l'identification des classes syntaxiques et sur l'analyse du systeme nominal et verbal.

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3

Katsoyannou, Marianne. "Le parler gréco de Gallicianò (Italie) : description d'une langue en voie de disparition." Paris 7, 1995. http://www.theses.fr/1995PA070123.

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Анотація:

Le Gréco, variété dialectale du grec moderne parlée dans le sud de la péninsule italienne (Calabre), est aujourd'hui une langue en voie de disparition. Les locuteurs étant tous bilingues, l'étude des faits sociolinguistiques forme un ensemble avec la description grammaticale proprement dite. Du point de vue de la dialectologie, le gréco doit être classe parmi les variétés grecques dites méridionales. Dans ce cadre, la langue présente également une série de particularités dialectales : consonnes géminées, simplification du système casuel, tendance a réduire les oppositions aspectuelles, développement de constructions verbales périphrastiques. . . Dans la plupart des cas, ces particularités sont à mettre en relation avec un autre aspect de l'étude de la langue : il s'agit de la comparaison avec le calabrais, dialecte d'origine romane, comparaison qui met en évidence aussi bien les interférences entre les deux parlers que le caractère aréal de certains traits grammaticaux
Greko, a dying language, is a modern Greek dialect, currently spoken in south of Italy (region of Calabria). As Greko speakers are all bilingual, the grammatical description of the dialect involves the sociolinguistic study of the community. Classified as a meridional modern Greek dialect, Greko presents certain particularities : geminate consonants, simplifications in the system of cases, reduction of aspectual oppositions, development of periphrastic verbal constructions. . . In most cases, these particularities should be studied in relation to Calabrese, the romance dialect spoken in Calabria. The comparative approach brings forth the interaction between Greko and Calabrese, as well as the areal character of certain grammatical trends

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Vaillant, Adrien Alp. "Une langue en voie de disparition : le salar au sein de la turcophonie." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCF019.

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Анотація:

Le salar est un dialecte turc dont la plupart des locuteurs habitent le comté de Xunhua (35°05’’nord - 102°03’’est), dans le sud-est de la province chinoise du Qinghai, où leur présence est attestée depuis la fin du XIVe siècle. Si ces dernières années ont vu une augmentation des études sur ce parler à bien des égards atypique, il n’en reste pas moins l’un des parents pauvres de la turcologie. Réalisée précisément dans le but de contribuer à mieux le faire connaître, en s’appuyant pour ce faire à la fois sur la documentation disponible et sur des données recueillies par l’auteur dans le cadre d’un travail sur le terrain, la présente thèse en propose non seulement une description phonologique, grammaticale et lexicale, mais aussi, semble-t-il pour la première fois, une étude détaillée de son système d’écriture traditionnel, aujourd’hui moribond, qui constitue une adaptation de l’alphabet arabe. Une attention particulière a également été portée à la question de la nature des liens du salar avec les autres dialectes, actuels ou anciens, composant le domaine turc (en particulier ceux du groupe oghouz, auquel il apparaît possible que cette variété appartienne), notamment à travers la comparaison avec le turc de Turquie que permet la traduction dans ce dernier dialecte des exemples illustrant les points de grammaire abordés. Considéré comme une langue en danger par l’UNESCO, qui le classe dans la catégorie « vulnérable », le salar traverse une période critique, et les problèmes que soulèvent son statut en Chine, la place qu’il occupe dans la société où il est pratiqué, et les représentations dont il fait l’objet n’ont pas non plus été négligés dans ce travail, dont une partie a été consacrée à la mise en évidence d’un début de situation diglossique dans le cadre de laquelle parmi les réponses que tentent d’apporter certains Salars à la question de l’avenir de leur idiome figure un projet de revitalisation linguistique particulier
Salar is a Turkish dialect most speakers of which live in the county of Xunhua (35°05 north, 102°03 east) in the south-eastern part of the Chinese province of Qinghai where they have been present since the end of the fourteenth century. In spite of the fact that there has been lately an increase in the studies concerning this language, it is still a poor relative of turkology. Carried out with the aim of making it better known, with the support of the available documentation and data collected by the author in his investigation in the field, this thesis offers not only a phonological, grammatical and lexical description of Salar, but also, to the best of the author’s knowledge, for the first time, a detailed study of its nearly extinct traditional writing system that constitutes an adaptation of the Arabic alphabet. We have been particularly careful to take into account the links uniting Salar with other dialects, present and ancient, which form the Turkish domain (particularly with the Oghuz group to which this variety seems to belong) notably through the comparison with Turkey Turkish, based on the translations into the latter of the grammatical items dealt with. Classified as an endangered language by UNESCO, Salar is going through a critical period. The problems raised by its status in China, the position it occupies in the society where it is spoken and the representations to which it is subjected, have also been addressed in this work. A section has been devoted to the identification of a diglossic language situation in the context of which, among the concerns raised by some Salars about the future of their language, lies a project aiming at its revitalisation

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5

Grégoire, Delphine. "Recherches sur les évolutions de la police administrative : une notion en voie de disparition." Bordeaux 4, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR40003.

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Анотація:

L'étude des évolutions du pouvoir de police administrative révèle le décalage existant entre la réalité de ce pouvoir et l'analyse juridique traditionnelle. Derrière l'apparente stabilité du pouvoir de police administrative, il apparaît que celui-ci ne peut plus exclusivement aujourd'hui se définir en référence à la notion d'ordre public qui pour continuer cependant d'être présentée comme son fondement et sa finalité s'est étendue au point d'être dénaturée et de ne plus permettre de rendre compte et circonscrire ce pouvoir. Il en résulte pour la notion de police administrative une perte de repère qui n'est pas comblée du côté des sources nouvelles du droit de la police administrative, soit du côté des droits constitutionnel et européen qui, s'ils reconnaissent le pouvoir de police, tendent à atténuer tout à la fois les effets et les éléments de spécificité. Au final, la mise à jour des évolutions du pouvoir de police administrative aboutit à mettre en évidence une notion dépourvue de réel principe explicatif et limitatif, dont la reconnaissance n'entraîne aucune conséquence juridique particulière et dont il semble que l'on puisse se passer.

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Triki-Teurtroy, Sarah. "Répartition et biologie de la reproduction d'un oeillet en voie de disparition, Dianthus Gratianopolitanus Vill." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA112327.

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Анотація:

Suite à l’activité humaine, de nombreuses espèces voient leur répartition fragmentée et leurs effectifs diminués. Ceci entraîne une cascade d’effets négatifs possibles, tant d’un point de vue génétique que démographique ou reproductif. Dianthus gratianopolitanus Vill. (Caryophyllaceae) est un œillet endémique d’Europe, présent de manière éparse, dont l’habitat préférentiel, i. E. Les pelouses calcaires, a fortement diminué au cours du XXième siècle et fait toujours l’objet de menaces. Alors que la répartition actuelle est fortement fragmentée et pourrait correspondre au cas d’une relique glaciaire, les populations de D. Gratianopolitanus ne sont que moyennement différentiées génétiquement, indice d’une fragmentation récente. De même, les populations de D. Gratianopolitanus présentent une diversité génétique plus forte qu’attendue, surtout en comparaison avec D. Sylvestris Wulf. , espèce plus commune et qui partage le même type d’habitat. Ceci pourrait être expliqué par les capacités de reproduction végétative de D. Gratianopolitanus, comme observé pour Maianthenum bifolium (L. ) Schmidt. Les risques génétiques liés à une diminution de la diversité génétique semblent donc faibles, même si les probables forts taux d’autofécondation (déficit en hétérozygotes importants) peuvent représenter une menace à long terme. En revanche, la dernière « grande » population connue (plus de 200 touffes), localisée au Chasseron, Suisse, semble souffrir d’une limitation par le pollen, d’une probable limitation du recrutement et d’un possible fardeau génétique important. Ce dernier point nécessiterait toutefois des croisements entre populations pour permettre sa validation
Land use often provokes the fragmentation and the reduction in population size of concerned species, consequences which may have major negative effects on genetics, demography or reproduction and therefore on species survival. Dianthus gratianopolitanus Vill. (Caryophyllaceae) is a carnation endemic to Europe. This species has small and scattered populations, growing mainly on calcareous grasslands. This habitat is strongly threatened and has dramatically decreased during the twentieth century. Despite a current distribution that may correspond to that of a glacial relict and a strong fragmentation, genetic differentiation between populations is small, which may indicate a relatively recent fragmentation. Furthermore, genetic diversity is higher than expected for a species with such a fragmented distribution of small populations or in comparison with D. Sylvestris Wulf, which occurs in similar habitat but is far more common. These results may be attributable to the clonal abilities of D. Gratianopolitanus, as observed in Maianthenum bifolium (L. ) Schmidt. Therefore, extinction risk is probably less due to a loss of genetic diversity, even if the probable high selfing rates (revealed by heterozygote deficits) may lead to loss of genetic variation important for adaptability in the long run. Nevertheless, the large population (more than 200 tufts, located at the Chasseron, Switzerland) suffers from pollen limitation, a probable recruitment limitation and a possible genetic load. To confirm this last point, crossings between individuals from different populations are needed

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Melser, Su. "Implication du Glucosylceramide dans la voie sécretoire des plantes." Thesis, Bordeaux 2, 2009. http://www.theses.fr/2009BOR21637/document.

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Анотація:

Le rôle des lipides comme des acteurs moléculaires de la voie sécrétoire des plantes n'est pas encore complètement élucidé. Le Glucosylceramide (GlcCer) est synthétisé par la Glucosylceramide synthase (GCS) chez les plantes et constitue un des sphingolipides complexes clé dans les membranes, mais on connaît peu les exigences cellulaires pour le GlcCer. Cette étude repose sur le blocage de la biosynthèse de GlcCer, par l'utilisation d'inhibiteurs chez le tabac et l’arabidopsis, et la production de mutants d'Arabidopsis, pour déterminer l'impact de la biosynthèse du GlcCer sur la dynamique endomembranaire des cellules végétales. Dans une approche qui inclue la biochimie des lipides, l'imagerie de cellules vivantes, des études ultrastructurales par microscopie electronique à transmission et des études sur le développement de la plante entière, nous avons acquis une meilleure compréhension de l'impact de la synthèse du GlcCer dans les cellules végétales qui peut être résumée comme suit: (1) Sur la base d’un analyse théorique et de la microscopie de cellules vivantes on a déterminé que la GCS est situé dans le Réticulum Endoplasmique (au début de la voie sécrétoire) dans les cellules végétales, (2) PDMP est un inhibiteur spécifique de GCS chez les plantes, (3) La perturbation de la biosynthèse du GlcCer par le PDMP et par un approche génétique ont montré que le GlcCer est important pour le trafic normale des protéines et pour la dynamique des endomembranes, notamment dans le maintien de la structure de l’appareil de Golgi, (4) La régulation du trafic des protéines mediée par la synthèse du GlcCer pourrait être critique dans l’etablissement et le maintien de la polarité cellulaire, tel qu’il est suggéré par des changements dans la localisation des marqueurs polaires chez l’Arabidopsis traitée avec PDMP, et (5) Un bloc dans la synthèse du GlcCer peut conduire à des défauts importants dans le développement des plantes, comme le montrent des mutants d'Arabidopsis avec une croissance anormale des racines primaires et incapables à se développer jusqu’aux étapes reproductives. Les interactions potentielles entre GlcCer et les machineries de transport sont discutés, ainsi que les mécanismes cellulaires qui sont potentiellement déclenchés dans les cellules végétales pour compenser une perturbation de la biosynthèse du GlcCer
The role of lipids as molecular actors in protein secretion is not well understood in plants. Glucosylceramide (GlcCer) is synthesized by Glucosylceramide Synthase (GCS) in plants and constitutes a key complex sphingolipid in membranes, but little is known about the plant cellular requirements for GlcCer. This study relied upon the block of GlcCer biosynthesis, by the use of inhibitors in tobacco and Arabidopsis, and the production of Arabidopsis mutants, to determine the impact of GlcCer biosynthesis on plant cell endomembrane dynamics. In a comprehensive approach that included lipid biochemistry, live cell imaging, ultrastructural studies by Transmission Electron Microscopy, and whole plant developmental studies, we have gained a better understanding of the impact of GlcCer in plant cells that can be summarised as follows: (1) Based on theoretical analysis and live-cell microscopy the GCS is located to the Endoplasmic Reticulum (at the beginning of the secretory pathway) in plant cells, (2) PDMP is a specific inhibitor of GCS in plants, (3) Disruption of GlcCer biosynthesis using PDMP and genetic approaches showed that GlcCer is important for normal protein trafficking and endomembrane dynamics, notably in the maintenance of Golgi structure, (4) The regulation of protein trafficking by the synthesis of GlcCer could be critical in the establishment and maintenance of cell polarity, as suggested by defects in the localisation of polar markers in Arabidopsis treated with PDMP, and (5) A block in GlcCer synthesis may be conducive to severe defects in plant development, as Arabidopsis mutants showed abnormal primary root growth and inability to develop to reproductive stages. Potential interactions between GlcCer and the transport machineries are discussed, as well as cellular mechanisms that may be set off following a disruption of GlcCer biosynthesis in plant cells

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Nenez, Nathalie. "Evolution de l'importance de certaines plantes médicinales dans les spécialités médicamenteuses entre 1965 et 1992." Paris 5, 1998. http://www.theses.fr/1998PA05P143.

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Danancher, Delphine. "Apports de l'écologie comportementale à la conservation d'un poisson en voie de disparition : l'apron du Rhône (Zingel Asper)." Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10228.

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Анотація:

L'apron (Zingel Asper), poisson endémiquedu bassin du Rhône, est menacé de disparition. L'adaptation des modèles de capture-marquage-recapture (CMR) à l'étude de ses préférences de micro et de méso-habitat (faciès) ainsi que les travaux de génétique (relations d'apparentement, dispersion juvénile) ont révélé l'importance des déplacements, de l'hétérogénéité spatiale des habitats et du système d'appariement dans le maintien d'une des dernières populations viable d'apron (rivière Beaume, Ardèche). Le protocole de CMR a également permis l'estimation des rythmes de croissance et leur validation. Les résultats acquis au cours de ce travail ont été discutés en fonction des perspectives de conservation de l'espèce

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Wattelet, Valérie. "Rôle des acide lysophosphatidique acyltransférases dans la voie sécrétoire chez les plantes." Thesis, Bordeaux, 2019. http://www.theses.fr/2019BORD0333.

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Анотація:

Chez les eucaryotes, les lipides membranaires sont essentiels à la compartimentation et la régulation des voies de sécrétion. Par leurs propriétés physiques, ils sont essentiels aux courbures membranaires et à la régulation de la morphodynamique des endomembranes, de la morphologie des organites et de la formation des vésicules de transport. Chez l’animal, les acide lysophosphatidique acyltransférases (LPAATs) sont impliquées dans la régulation du trafic endomembranaire, mais rien n’est connu sur leur rôle chez la plante. Chez Arabidopsis thaliana, cinq LPAATs ont été identifiées. Nous avons déterminé leur activité enzymatique spécifique pour l'acide lysophosphatidique (LPA) pour produire de l'acide phosphatidique (PA). J'ai ensuite caractérisé leur localisation subcellulaire dans le système endomembranaire de la voie sécrétoire et étudié leur rôle présumé dans cette voie par approche génétique (mutants knock-out), biochimiques (inhibiteurs d'activité, analyses des lipides) et d'imagerie (microscopie confocale). En exploitant les lignées simples, doubles et triples mutantes des gènes LPAAT que j’ai produites, couplées à un traitement au CI-976 qui inhibe l'activité des LPAATs, j’ai montré suite à une analyse lipidique, que la quantité d’acide phosphatidique (PA) dépendante de l’activité LPAAT est essentielle pour l’adressage du transporteur d’auxine PIN2 et de l’aquaporine PIP2,7 vers la membrane plasmique.Ce travail souligne l’importance de la régulation des quantités de lipides dans les endomembranes et l’existence de seuils en-dessous desquels l’homéostasie membranaire peut être finement perturbée au point d’entraîner des disfonctionnements de la voie sécrétoire
In eukaryotic cells, membrane lipids are essential for compartmentalization and regulation of secretory pathways. According to their physical properties, they are essential to membrane curvature and regulation of endomembrane morphodynamics, organelle morphology, and vesicles. In animal cells, lysophosphatidic acid acyltransferases (LPAAT) are involved in the regulation of endomembrane trafficking, but nothing is known about their role in plants. In Arabidopsis thaliana, five LPAATs were identified. We determined their specific enzymatic activity for lysophosphatidic acid (LPA) to produce phosphatidic acid (PA). I then characterized their subcellular localization in the endomembrane system of the secretory pathway and their potential role in this pathway using genetical (knockout mutants), biochemical (activity inhibitors, lipid analyzes) and imaging (confocal microscopy) approaches. Using the single, double and triple mutant lines for LPAAT genes that I produced, in addition to CI-976 treatment that inhibits LPAAT activity, I showed, after lipid analysis, that phosphatidic (PA) dependent on LPAAT activity is essential for the trafficking of the auxin carrier PIN2 and the aquaporin PIP2,7 to the plasma membrane.This work highlights the importance of lipid regulation in endomembranes and thresholds under which membrane homeostasis can be finely disturbed to the point of causing dysfunction of the secretory pathway

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Capron, Arnaud. "Etude de la voie de protéolyse D-box-dépendante chez les plantes." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2003. http://www.theses.fr/2003STR13191.

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Mikail, Tamim. "Les privations de liberté individuelle sont-elles en voie de disparition ? : étude comparée entre les droits français, britiannique et syrien." Grenoble, 2010. http://www.theses.fr/2010GREND003.

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Анотація:

Dans les trois systèmes de procédure pénale français, britannique et syrien, nous pouvons généralement constater une insuffisance des garanties pour assurer la protection de la liberté individuelle contre l'utilisation abusive des privations de liberté avant jugement. Ainsi, en France et en Grande-Bretagne, plusieurs lois ont été adoptées ces dernières années qui montrent une volonté législative d'aggraver les privations de liberté. Ces lois, dans un sens croissant de sévérité, ont prolongé la durée de certaines privations de liberté, restreint certaines garanties, avantages, dispenses dont la personne privée de sa liberté pouvait bénéficier. Ce qui, par conséquent, engendre un déséquilibre entre deux impératifs : la sécurité et la liberté individuelle. La sécurité publique reste toujours une priorité. La privation de liberté est toujours préférable à d’autres moyens susceptibles de réaliser le même objectif. Cette réalité s’observe autant lors de la procédure préalable à l’établissement de la culpabilité qu'après l’établissement de ladite culpabilité
In the three systems of criminal procedure French, British and Syrian, we can usually find an insufficiency of guarantees to ensure the protection of individual liberty against the abusive use of deprivation of liberty before judgement. Thus, in France and Great Britain, several laws have been adopted in recent years show a legislative will aggravate the deprivation of liberty. These laws, in a growing sense of severity, extended duration of certain deprivations of liberty, restricted certain guarantees, advantages, exemptions which the person deprived of his liberty could benefit. That, consequently, generates an imbalance between two requirements : safety and individual freedom. Public safety remains always a priority. The deprivation of liberty is always preferable to other means suitable for carry out the same objective. This reality is observed as much at the time of the procedure prior to the establishment of the culpability as after the establishment of that culpability

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Seguela, Mathilde. "Etude de la voie de signalisation de la carence en fer chez Arabidopsis thaliana." Montpellier 2, 2007. http://www.theses.fr/2007MON20222.

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Анотація:

L'assimilation du fer par les plantes supérieures « non-graminées » repose sur un mécanisme en trois étapes : une H+-ATPase racinaire permet l'acidification du sol et la solubilisation du fer ferrique (Fe3+), la réductase ferrique FRO2 réduit le fer ferrique en fer ferreux (Fe2+) et ce dernier est ensuite transporté dans la plante par IRT1 (Iron Regulated Transporter), transporteur de fer majoritaire dans les racines. En conditions de carence en fer, l'expression des gènes IRT1 et FRO2 est fortement induite dans l'épiderme racinaire. Si la régulation de ces gènes par le statut en fer est bien documentée, les éléments senseurs, les voies de transduction du signal et les régions promotrices impliquées restent peu connus. Afin d'identifier de nouveaux éléments de la voie de signalisation de la carence en fer chez Arabidopsis thaliana, trois approches ont été développées. Un crible génétique, visant à identifier des mutants de régulation du gène IRT1 a été entrepris et a permis d'isoler un nouvel allèle du mutant frd3. La mutation dans le gène FRD3, codant un transporteur d'efflux de citrate dans le xylème, affecte la distribution du fer dans la plante lors de la germination ainsi qu'au stage adulte et semble modifier la spéciation du fer dans le xylème. Le rôle des phytohormones dans la voie de signalisation à la carence en fer a été testé et a permis de mettre en évidence que les cytokinines avaient un effet répresseur sur l'expression des gènes IRT1 et FRO2. Cette régulation est par contre indépendante du statut nutritionnel en fer et indépendante du facteur de transcription FIT. Plusieurs arguments suggèrent que les cytokinines réguleraient l'expression de ces gènes via une voie de signalisation « croissance » plutôt que par la voie de signalisation carence. La dernière approche a consisté à disséquer la région promotrice du gène IRT1 afin d'identifier les élements cis-régulateurs responsables de l'activité en réponse à la carence en fer. Ce travail a permis d'isoler une région d'environ 80pb nécessaire et suffisante à l'induction de l'expression racinaire en réponse à la carence en fer. Ce travail a permis de décrire de nouvelles régulations du gène IRT1 et de générer des outils pour isoler de nouveaux éléments de la voie de signalisation de la carence en fer
Iron uptake in non-graminaceous plants is achieved in a three step process. First, protons are released from the roots to solubilize ironbefore its reduction by the FRO2 feric reductase and uptake in roots cells by IRT1 transporter. In iron deficient conditions, IRT1 and FRO2 expression is strongly increased in root epidermal cells. The regulation of these two genes is well described, nevertheless, only few molecular components of the iron deficiency pathway has been described to date. In order to isolate new components regulating the root iron uptake machinery, three different approaches were developed. A genetic screen was performed to isolate mutants affected in IRT1 regulation. One mutant was isolated and shown to be allelic to frd3. The mutation in the FRD3 gene, which encodes for a citrate effluxer in xylem, affects iron speciation in xylem and iron remobilization during germination. The potential role of hormones in iron deficiency signal transduction was investigated. Cytokinins repress IRT1 and FRO2 expression irrespective of the iron status and independently of the transcription factor FIT. Rather we provide evidence or a regulation of IRT1 by a “growth” dependent pathway. The last strategy consisted in the IRT1 promoter analysis, in order to identify cis-regulatory elements of the iron deficiency response. A 80pb region was shown to be essential and sufficient for iron deficiency response in roots. This work shed light on new regulation of IRT1 gene expression and provided tools to unravel the molecular mechanisms driving the iron deficiency response

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HUSSELSTEIN, TANIA. "Enzymes de la voie de biosynthese des sterols de plantes : clonages d'alleles sauvages et mutants." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1998. http://www.theses.fr/1998STR13212.

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Le mutant stel d'arabidopsis thaliana, issu d'une mutagenese ems, se caracterise par l'accumulation de #7-sterols au detriment des #5-sterols accumules majoritairement dans les plantes sauvages. L'expression dans le mutant stel d'une #7-sterol-c5-desaturase sauvage d'arabidopsis thaliana, clonee par complementation fonctionnelle heterologue du mutant erg3 de saccharomyces cerevisiae, a permis de restaurer un phenotype sauvage apportant ainsi la preuve d'une deficience au niveau de l'etape de c5-desaturation chez ce mutant. Nous avons clone l'allele mute de la #7-sterol-c5 desaturase de la plante stel par une reaction de rtpcr a l'aide d'oligonucleotides deduits de la sequence sauvage et ainsi mis en evidence une mutation ponctuelle dans le phase ouverte de lecture de l'enzyme provoquant le remplacement d'une threonine par une isoleucine. Nous avons ensuite caracterise des alleles mutes de la #7-sterol-c5-desaturase, obtenus par mutagenese dirigee ou aleatoire, et ainsi identifie des amino acides indispensables pour une bonne activite catalytique de l'enzyme. Par complementation de fonction de mutants de levures ou par recherche de nouveaux sterols apres transformation de levures sauvages, nous avons egalement caracterise des alleles sauvages codant d'autres enzymes de la voie de biosynthese des phytosterols.

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Stotz, Marie Brouillard Raymond Goeldner Maurice. "Contribution à la chimie des flavonoïdes élaboration de squelettes flavylium sophistiqués, nouvelle voie d'accès aux flavan-3-ols et aux proanthocyanidines /." Strasbourg : Université Louis Pasteur, 2008. http://eprints-scd-ulp.u-strasbg.fr:8080/00000982.

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Jardinaud, Marie-Françoise. "Transformation génétique du colza et du mai͏̈s par la voie haploi͏̈de mâle." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT022A.

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L'utilisation des microspores en tant que cellules cibles de la transformation genetique presente certains avantages: origine unicellulaire des embryons et des plantes issus des microspores et haploidie. Le stock chromosomique des plantes haploides regenerees peut etre double permettant l'obtention directe de plantes dihaploides homozygotes. Le travail realise a eu pour objectif de transformer les microspores de mais (zea mays l. Hd 99 hd 222) et de colza (brassica napus l. Tapidor) par electroporation et biolistique dans le premier cas et uniquement par electroporation dans le deuxieme cas. Dans un premier temps, la possibilite de regenerer des plantes par cultures de microspores isolees de colza et de mais a ete verifiee. Les frequences de regeneration ont ete respectivement de 0. 15% a 0. 009%. Le transfert d'adn exogene a l'aide d'un appareil delivrant des impulsions en vagues carrees a ete mis en evidence dans les microspores de colza et de mais a l'aide de constructions genetiques portant le gene uida. Des resultats similaires ont ete obtenus chez le mais a l'aide d'un canon a particules pds 1000/he apres optimisation des divers parametres de tir. La transformation des microspores de mais par electroporation ou bombardement a ete realisee a l'aide d'un plasmide porteur du gene de resistance a la phleomycine fusionne au gene uid a, sous la dependance du promoteur de l'actine de riz actl. Les microspores ont ete cultivees en presence de 5 mg/l de phleomycine additionne apres 24 h de culture. Des microspores exprimant le gene uida apres 21 jours de culture ont ete observees, mais aucune plantule n'a ete regeneree a ce jour. Dans le cas du colza, la transformation genetique des microspores a ete realisee par electroporation en presence d'un plasmide porteur du gene de resistance a la phosphinothricine sous le controle du promoteur camv 35s. Les microspores electroporees ont ete mises en culture en presence de 100 mg/l de phosphinothricine. Huit plantes ont ete regenerees et acclimatees en serre, et la presence du gene pat a ete mise en evidence au sein de leur genome par pcr et southern

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Stotz, Marie. "Contribution à la chimie des flavonoïdes : Elaboration de squelettes flavylium sophistiqués.Nouvelle voie d'accès aux flavan-3-ols et aux proanthocyanidines." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2008. https://publication-theses.unistra.fr/restreint/theses_doctorat/2008/STOTZ_Marie_2008.pdf.

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Les flavonoïdes constituent une famille importante de métabolites secondaires du règne végétal. Du fait de leur abondance dans la nature, ces composés ont toujours constitué une source alimentaire importante pour l'homme et aujourd'hui, de nombreuses études montrent qu'une alimentation riche en flavonoïdes est bénéfique pour la santé humaine. La synthèse totale apparaît aujourd'hui comme la méthode de choix pour obtenir des flavonoïdes actifs à grande échelle. Dans ce contexte, nous avons cherché à développer de nouvelles stratégies de synthèse pour deux squelettes flavonoïdes: le squelette flavylium et le squelette flavan-3-ol. Concernant les dérivés flavylium, nous avons réactivé et optimisé un outil synthétique original permettant l'obtention non seulement de motifs flavylium classiques mais aussi de dérivés oligocationiques originaux. En parallèle, l'affinité de certains sels de flavylium synthétiques avec le récepteur GABAA a été testée avec succès. Le squelette chiral flavan-3-ol (monomérique et dimérique) a également fait l'objet d'ambitions synthétiques: notre approche a consisté en une stratégie convergente faisant intervenir un précurseur commun et original qu’est le cation flavylium
In the plant kingdom, flavonoids represent an important family of secondary metabolites. Because of their natural occurrence, these compounds have always been consumed by human beings and nowadays, several studies have shown that a flavonoid-rich diet is beneficial to human health. In order to obtain active flavonoids at a large scale, total synthesis appears today as the right method. In this context, we tried to develop new synthetic strategies for two flavonoid skeletons: the flavylium skeleton and the flavan-3-ol skeleton. Concerning flavylium derivatives, we reactivated and optimized an original synthetic tool that enables the obtention not only of classical flavylium compounds but also of original oligocationic derivatives. Moreover, the affinity of some synthetic flavylium cations with the GABAA receptor was successfully tested. The chiral flavan-3-ol skeleton (monomeric and dimeric) was studied: our approach consisted in a convergent strategy, with the intervention of an original precursor, the flavylium cation

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Barrada, Adam. "Découverte de nouveaux composants de la voie de TOR de plantes par une approche de génétique." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0165.

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Target of rapamycin est une large kinase conservée chez la plupart des eucaryotes. Elle est au centre d’une voie de signalisation régulant la croissance, le métabolisme en fonction de l’environnement et a été largement étudiée chez l’homme du fait de son implication dans des maladies telles que le cancer. Chez les plantes, son étude est moins avancée mais le développement d’inhibiteurs ATP compétitifs chez l’homme a offert de nouvelles possibilités pour la recherche en biologie végétale. En effet, l’utilisation d’un inhibiteur de TOR nous a permis de réaliser le criblage d’une banque de mutants ethyl méthansulfonate et de découvrir une nouvelle cible de TOR : YAK1. Cette dernière régule la croissance en inhibant la prolifération. Le criblage de mutants a également permis de découvrir des mutations dans TOR affectant sa sensibilité ou son affinité pour l’inhibiteur. Ceci offre un nouvel outil pour étudier la fonction de TOR de plantes
Target of rapamycin is a large kinase existing in most eucaryots such as plants and animals. It is at the center of a signaling pathway regulating growth and metabolism in response to environmental changes, which has been the subject of many studies in humans because of its implication in diseases like cancer. However in plants, the exploration of this pathway is less advanced but the development of ATP competitive inhibitors in humans has offered new possibilities for plant research. Indeed, the use of a TOR inhibitor has allowed us to screen an ethyl methansulfonate mutant bank and discover a new target of TOR: YAK1. The latter regulates growth by inhibiting proliferation notably through cyclin-dependant kinase inhibitors. The screen also allowed us to uncover TOR mutations which potentially affect TOR activity and/or affinity to the inhibitor. This offers a new tool for the study of TOR function in plants

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Gréard, Camille. "La détection des variants alléliques comme voie d'amélioration génétique des plantes fourragères : exemple de la luzerne." Thesis, Poitiers, 2019. http://www.theses.fr/2019POIT2261.

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L’amélioration génétique de la luzerne (Medicago sativa), une légumineuse fourragère autotétraploïde, pourrait bénéficier de l’allele mining. Cette méthode consiste à rechercher, dans la diversité naturelle, des allèles ayant potentiellement un effet sur le phénotype. Pour évaluer l’intérêt de cette stratégie qui exploite la diversité naturelle, cinq gènes impliqués dans des caractères sélectionnés ont été retenus : CAD1 et CCoaOMT (digestibilité), CONSTANS-like (rendement fourrager), NHX1 (tolérance à la salinité) et WXP1 (tolérance à la sécheresse). La diversité de ces gènes a été étudiée en séquençant 387 génotypes cultivés et 20 génotypes sauvages. L’analyse des données confirme la présence d’un goulot d’étranglement durant la domestication et la sélection de la luzerne. CONSTANS-like et WXP1 révèlent de nombreux variants alors que CAD1, CCoaOMT et NHX1 sont très peu variables. Des variants ayant un effet potentiel sur le phénotype ont été identifiés dans les zones de la séquence protéique qui sont conservées au sein des Faboideae. L’impact sur le phénotype de deux variants du gène CONSTANS-like a été étudié : Constans-634, à l’origine d’un codon stop prématuré et Constans-4111, situé dans une région conservée du gène. Pour cela des croisements ont été réalisés afin d’obtenir une descendance avec toutes les doses possibles (AAAA, AAAB, AABB, ABBB and BBBB) pour chaque mutation étudiée. Des marqueurs KASPar ont été développés afin de déterminer les doses de mutations chez les descendants. Aucun génotype homozygote muté pour Constans-634 n’a été détecté parmi les 1505 descendants. Ce variant a induit une floraison plus précoce de trois jours pour les génotypes portant trois doses d’allèle muté. Le variant Constans-4111 a induit un effet additif sur la hauteur de tige. Les génotypes homozygotes de type sauvage étaient en moyenne 11,8 cm plus petits que les génotypes homozygotes portant trois ou quatre doses du variant. L’intégration de la stratégie allele mining dans les schémas de sélection des espèces végétales autotétraploïdes hétérozygotes a été discutée
Lucerne (Medicago sativa) is an autotetraploid forage legume, whose breeding could beneficiate from allele mining. This strategy is based on the natural diversity and consists in seeking alleles with a potential effect on the phenotype. The interest of this approach was evaluated by studying five genes of agronomic interest: CAD1 and CCoaOMT (digestibility), CONSTANS-like (forage yield), NHX1 (salt tolerance) and WXP1 (drought tolerance). The diversity of these five genes was evaluated by sequencing 387 genotypes of cultivated accessions and 20 genotypes of wild accessions. The results confirmed a bottleneck during lucerne domestication and selection. CONSTANS-like and WXP1 were very variable whereas CAD1, CCoaOMT and NHX1 contained very few variants. Variants with a potential strong impact on the phenotype were identified in conserved parts of protein sequence within the Faboideae. The impact on phenotype was studied for two mutations of the CONSTANS-like gene: constans-634, causing a premature stop codon and constans-4111, located in a conserved region of the gene. Genotypes carrying one to three doses of the mutations (AAAB, AABB and ABBB) were polycrossed in order to obtain offsprings with every allele combination (AAAA, AAAB, AABB, ABBB and BBBB). KASPar markers were developed to determine the mutation doses in offspring progeny. No homozygous genotype was found for constans-634 in the 1505 offspring progeny. This mutation induced a premature flowering of three days for the genotypes carrying three doses of the mutation. The mutation constans-4111 induced an additive effect on stem height and the homozygous genotypes without the variant where on average 11.8 cm shorter than homozygous genotypes carrying three or four doses of the variant. The application of allele mining strategy in plant schemes of heterozygous autotetraploid species was discussed

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Chardin, Camille. "Adaptation des plantes à la disponibilité en azote : la voie de signalisation nitrate dépendante de NLP7." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015SACLS186.

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L’azote est un des macronutriments essentiels pour les plantes. Dans les sols, l’azote est présent sous différentes formes organiques et inorganiques. Les plantes utilisent préférentiellement le nitrate, qui n’est pas toujours disponible en quantités suffisantes dans les sols. Récemment, une étude a permis de montrer que le facteur de transcription NLP7 est un régulateur majeur de la réponse primaire au nitrate. La localisation subcellulaire de cette protéine est régulée par le nitrate : en son absence, elle est localisée dans le cytoplasme alors qu’après ajout de nitrate, une rétention nucléaire est activée. Les mécanismes moléculaires de cette rétention restent encore à comprendre ainsi que la transmission du signal nitrate, de l’extérieur de la plante à la protéine NLP7. Le transporteur de nitrate NPF6.3 a été montré comme jouant un rôle dans la perception du nitrate, c’est donc un transcepteur. Notre hypothèse était que NPF6.3 est le récepteur de nitrate en amont de NLP7. Pour tester cette hypothèse, nous avons étudié par des approches génétiques les liens d’épistasie entre les deux gènes. L’étude de la biomasse et de l’expression des gènes sentinelles en réponse au nitrate chez les simples et double mutants a permis d’observer des phénotypes additifs. Nous avons pu montrer que le mécanisme de relocalisation rapide de la protéine NLP7 dans le noyau est toujours actif dans le fond mutant npf6.3. Ces résultats ont donc permis de montrer que NLP7 et NPF6.3 n’appartiennent pas à la même voie de signalisation mais que ces deux voies pourraient être dépendantes selon les conditions. D’autre part, peu de régulateurs de la réponse au nitrate sont connus. De manière intéressante, les gènes cibles de NLP7 sont enrichis en protéines régulatrices comme par exemple d’autres facteurs de transcription ou encore des protéines kinases, ce qui place NLP7 à un haut niveau hiérarchique de régulation dans la voie de signalisation en réponse au nitrate. En effet, ces cibles directes de NLP7 pourraient elles-mêmes être impliquées dans des voies de signalisation en aval de NLP7. Dans le but de disséquer la voie de signalisation en aval de NLP7, nous avons étudié deux cibles directes de NLP7, des Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinases (MAPKKKs), MAPKKK13 et MAPKKK14. Les MAPKs sont connues pour leur mode d’action en cascades de phosphorylations. Par des approches biochimiques en protoplastes, nous avons montré que MAPKKK13/14 sont capables d’activer des MAPKs du groupe C via MKK3. De plus, nous avons obtenu de premières indications montrant que certaines réponses développementales au nitrate ainsi que la réponse primaire au nitrate seraient partiellement modifiées dans les simples mutants mapkkk13 et mapkk14, et dans le double mutant mapkkk13/14
Nitrogen is one of the most important macronutrients for plants. In the soils, nitrogen can be found under different organic and inorganic forms. Plants preferentially use nitrate, which is not always available for plant uptake and assimilation in soils. Recently, it was shown that the NLP7 transcription factor is a master regulator of the primary nitrate response. Its subcellular protein localization is regulated by nitrate: without nitrate, the protein is localised in the cytoplasm whereas after nitrate resupply, a nuclear retention is observed. Molecular mechanisms of this nuclear-cytosolic shuttling and of the nitrate signal transduction from the external medium to the NLP7 protein are still unknown. It has been shown that the NPF6.3 nitrate transporter plays a role in the nitrate signal sensing, which made this protein a transceptor. Our hypothesis was that NPF6.3 is the nitrate sensor upstream of NLP7. To test this hypothesis, we studied by genetic approaches the epistasis link between the two genes. By studying the simple and double mutant’s biomass and sentinel gene regulation in response to nitrate, we observed additive phenotypes. We showed that the nuclear relocation mechanism of NLP7 is still active in the npf6.3 mutant background. All together, these results showed that NLP7 and NPF6.3 are not in the same signalling pathway but there would be an interplay depending on the conditions. On the other hand, only a few regulators of the nitrate response are known. Interestingly the direct target genes of NLP7 are highly enriched for regulatory proteins such as other transcription factors or protein kinases, which places NLP7 at a high hierarchical place in the nitrate signalling pathway. Indeed these direct targets of NLP7 may themselves be involved in signalling cascades downstream of NLP7. In order to identify molecular events downstream of NLP7, we studies two NLP7 direct targets, Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinases (MAPKKKs), MAPKKK13 and MAPKKK14. MAPKs are known to act as phosphorylation cascades. Using biochemical approaches in protoplasts, we have shown that MAPKKKK13/14 are able to activate Group C MAPKs via MKK3. In addition we showed in planta that nitrate addition indeed triggered the activation of group C MAPKs and that this activation is dependent on NLP7 and MKK3. Furthermore we obtained first indications that nitrate-dependent developmental traits and the primary nitrate response are partially impaired in the single mutants mapkkk13 and mapkkk14, and the double mutant mpkkk13mpkkk14

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Butaud, Jean-François. "Contribution à la connaissance d'un arbre insulaire en voie de disparition, le santal de Polynésie française (Santalarum insulare) : étude écologique, morphologique, génétique et chimique." Polynésie française, 2006. http://www.theses.fr/2006POLF0002.

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Le santal de Polynésie française (Santalum insulare) est menacé de disparition. Surexploité pour sont bois odorant, il ne se reproduit plus que végétativement suite à la prédation des graines par les rats et la disparition des disséminateurs. Par l'évaluation de l'impact de l'insularité et des perturbations humaines sur sa diversité, notre étude vise à sa gestion durable. Les analyses morphologiques, génétiques et chimiques indiquent des différenciations liées à l'isolement des îles, aux conditions écologiques et à l'exploitation. Cette diversité implique une gestion au niveau des unités évolutives, correspondant aux archipels, mais aussi au niveau de l'île ou des populations. Les investigations chimiques ont montré que ce santal produit une essence de qualité. Trois nouveaux sesquiterpènediols dont deux appartenant à un squelette inédit (elvirane) ont été décrits dans sa concrète. Les flavonoïdes des feuilles et les acides gras des amandes ont été déterminés pour la première fois
The French Polynesian sandalwood (Santalum insulare) is an endangered species. Overexploited for its fragrant heartwood, its reproduction is only realized by vegetative means due to seed predation by rats and extinction of dispersers. Due to the evaluation of insularity and human perturbations impact on its diversity, our work contributes to the strategy of sustainable management. Morphological, genetical and chemical investigations show differentiations linked to island isolation, ecological conditions and exploitation. This diversity imply sandalwood management not only at the evolutionary unit level corresponding to archipelago, but also at the local level of island, region or population. Chemical studies showed that this sandalwood gave a high grade essential oil. Three new sesquiterpenoids including a new backbone named elvirane were isolated and identified in its concrete. Flavonoids leave content and fatty acid composition of seeds were reported for the first time

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Bokström, Marianne. "Le ne dit « explétif » est-il en voie de disparition ? : Développement et usage depuis l´ancien franςais jusqu’au franςais contemporain dans des textes essentiellement littéraires". Thesis, Stockholms universitet, Romanska och klassiska institutionen, 2013. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-196931.

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Is the ne explétif on the way to disappearing? To find an answer we have searched in the French literature from about 800 in A.D., the Chant of Roland, to present times. The subject of this essay is the ne expletif, its frequency and development in relation to the conjunctions avant que, à moins que, sans que and their gradual equivalents. Our inquiries prove that this phenomenon exists since the era of our occidental literature, contrasting the ideas of some grammarians (Plattner and Togeby). In our essay we have not only described the aspects of the above mentioned conjunctions, but have also found three another exemples of à moins que in the Tales of La Fontaine and not only one “ Un lièvre en son gîte songeait … “ according to Togeby (1965:789). The editions of Grevisse from 1949 and 1955 but not the followings only refer to this tale as an exemple of à moins que. We have, among other things, criticized Damourette et Pichon (1911:5:532-533) for their selection of examples regarding avant que … ne. We have given some possible answers to our opening question and some future visions for the ne expletif.

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Condamines, Elisabeth. "Du côté de chez soi, les vacanciers fidèles de la proximité, une espèce en voie de disparition : étude monographique au Trez-Hir, station littorale finistérienne." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2006. http://www.theses.fr/2006VERS018S.

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La focalisation sur la définition statistique des vacances – quatre nuits hors de chez soi – et sur leur représentation la plus diffusée par les médias – le départ lointain en hébergement marchand – rend délicate l'observation de phénomènes vacanciers tels que les vacances fidèlement réalisées dans l'espace proche. Nous avons effectué, pour les mettre en évidence, une analyse monographique d'un espace littoral articulée à une enquête qualitative auprès de personnes ayant une fréquentation d'agrément de ce lieu. Davantage qu'une disparition, nous avons constaté une transformation des modes de relation à cet espace de proximité, au point qu'une part importante des vacanciers ne l’est plus, stricto sensu. Cela aggrave notre aveuglement, d'autant que les vacanciers, même les plus orthodoxes, hésitent à se définir comme tels lorsqu'ils effectuent ce type de séjour. Si des vacanciers ont du mal à préserver leurs pratiques anciennes et leur légitimité à être sur cet espace, littoral mais aussi périurbain, d'autres ont inventé, consentant ou contraints, de nouvelles manières d'y être présent ou d'y passer une partie de leurs vacances
Focusing on the statistical definition of the holidays - four nights out of home - and on their representation the most diffused by the media - the remote departure in commercial lodging - makes delicate the observation of certain kind of holidays such as the holidays carried out not far from home. We used, to highlight them, a monographic analysis of a littoral space, articulated with qualitative enquiries near people spending leisure times in this place. More than a disappearance, we observed a transformation of the modes of relation to this space of proximity, so much so that a significant share of them are not any more holidaymakers stricto sensu. That worsens our blindness, the more so, that holidaymakers, even the most orthodox, hesitate to define themselves as such when they carry out this kind of stay. If some of them have difficulties to keep up their old habits and their legitimacy to be on this littoral and urbanizing space, others have invented, agreeing or constrained, new manners of being present there or of passing part of their holidays there

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Ben, Ali Doha. "Production de dianthalexine et de protéines b dans des cellules de Dianthus caryophyllus L. élicitées par Phytophthora parasitica Dastur : approche de la voie de synthèse de la phytoalexine." Lyon 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LYO11665.

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Cette etude a ete conduite sur le metabolisme de la dianthalexine, phytoalexine specifique de l'oeillet (dianthus caryophyllus l. ) induite dans les suspensions cellulaires d'oeillet apres elicitation avec du milieu de culture de phytophthora parasitica. La premiere partie a ete consacree a l'etude de la croissance des cellules d'oeillet en suspension et a la cinetique de synthese de la dianthalexine a la suite d'une elicitation. La deuxieme partie a ete consacree a demontrer la participation de la voie du shikimate a la biosynthese de la dianthalexine, par l'intermediaire de ses regulateurs a savoir ses produits finaux: la phenylalanine, la tyrosine et la tryptophane. La troisieme partie a concerne un autre moyen de defense que possedent les cellules vegetales vis-a-vis des differents stress. Il s'agit des proteines b dont la production n'est pas provoquee seulement par l'elicitation mais aussi par l'agitation des suspensions cellulaires

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Anne, Sara. "Influence de la nutrition cuprique sur les composantes du rendement du blé dur (Triticum durum) : et étude de la distribution du cuivre radioactif absorbé par voie racinaire." Toulouse, INPT, 1985. http://www.theses.fr/1985INPT007A.

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L'objectif poursuivi par cette étude est quadruple : 1. Vérifier les différents résultats obtenus précédemment en serre, concernant l'effet de la carence en cuivre au stade 4 de l'échelle de Frekes qui correspond au stade fin tallage-début montaison. 2. Analyser statistiquement les différents paramètres du rendement sur deux variétés de blé dur : Bidi 17 et Mondur. 3. Etudier en serre : la vitesse de migration du cuivre et sa distribution dans les différents organes du blé à l'aide du cuivre radioactif dont l'isotope est 64Cu ; l'effet d'un apport de cuivre sur des plantes carencées. 4. Appliquer en plein champ les résultats acquis en serre. En effet, les agriculteurs du Sud-Ouest ont des difficultés à obtenir régulièrement de hauts rendements en blé ; outre les conditions pédoclimatiques locales, il est possible qu'il existe certaines zones de déficience en cuivre. Ainsi, nous avons réalisé en plein champ, dans la zone du Lauragais et en conditions naturelles, des essais d'apport de cuivre en pulvérisation sanitaires aux stades 4 et 5 de l'échelle de Feekes. Les essais sont implantés dans les champs des agriculteurs après qu'ils aient effectué tous les travaux de séparation du sol, de fertilisation de fond et de couverture, de semis.

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Champion, Antony. "Contrôle de la division cellulaire chez les plantes : identification d'une voie de signalisation de type SIN (Septum Initiation Network)." Paris 11, 2003. http://www.theses.fr/2003PA112035.

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Chez les Eucaryotes, la progression dans le cycle cellulaire est étroitement contrôlée par des complexes mitotiques CDK/cycline. Les études menées chez S. Cerevisiae et S. Pombe démontrent l'existence d'une cascade de signalisation additionnelle, dont la fonction consiste à mettre en place la cytokinèse, en lien avec la sortie de mitose. Chez S. Pombe, cette voie de signalisation est nommée "Septum Initiation Network" (SIN). Par analogie avec la levure, nous avons identifie et analysé le rôle d'éléments d'une voie de signalisation végétale de type SIN. Nous avons mis en évidence chez A. Thaliana et B. Napus des protéines similaires à la protéine G monomérique spg1p (AtSGP1, AtSGP2), à la kinase cdc7p (AtMAP3Ke1, AtMAP3Ke2, BnMAP3Kel), et à la kinase sid1p (AtMAP4K α1, AtMAP4Kα2, BnMAP4Kα2) de S. Pombe. Ces protéines végétales sont les premières de cette nature à avoir été caractérisées chez un Eucaryote pluricellulaire. Elles pourraient participer à un module de signalisation conservé au cours de l'évolution chez les champignons et les plantes. Nous avons démontré l'existence d'interactions physiques et fonctionnelles entre ces éléments végétaux de type SIN et ceux de S. Pombe. Les protéines AtSGP1/2, BnMAP3Ke1 et BnMAP4Kα2 complémentent respectivement les mutants spg1-B8, cdc7-24 et sid1-239 de S. Pombe. De plus, nous avons montré que la surexpression des protéines végétales chez S. Pombe induit des anomalies de cytokinèse. Une analyse des interactions physiques entre les éléments végétaux et ceux de S. Pombe a permis de compléter et de confirmer l'existence d'une voie de signalisation végétale de type SIN. Toutefois, la complémentation partielle des mutants de levure suggère que les protéines homologues de plantes et de S. Pombe ont divergé au cours de l'évolution. En parallèle, nous avons étudié la localisation intracellulaire des composants de cette cascade de signalisation. Nos observations révèlent une co-localisation des éléments dans le nucléole, suggérant un mécanisme original de régulation de cette voie de signalisation. L'ensemble de ces données, ainsi que le profil d'expression des gènes végétaux et l'analyse du phénotype de plantes antisens pour le gène AtMAP3Ke1 nous ont conduits à proposer l'existence d'une voie de signalisation végétale de type SIN contrôlant la division cellulaire chez les plantes
The time course of events shared by Eucaryotes all along the cell cycle, is strictly controlled by mitotic complexes involving the CDK/cyclin proteins. Studies carried out on S. Cerevisiae and S. Pombe enlight the involvement of an additional signalling cascade, the function of which consists in keeping the cytokinesis in concordance with the end of the mitosis. In S. Pombe, the signalling pathway is named SIN for Septum Initiation Network. Led by the analogy shared with yeast, we identified and analyzed the role of many items of the corresponding plant pathway. We identified A. Thaliana and B. Napus homologues of the fission yeast G protein spg1p (AtSGP1, AtSGP2), the kinase cdc7p (AtMAP3Ke1, AtMAP3Ke2, BnMAP3Ke1) and the kinase sid1p (AtMAP4Kα1, AtMAP4Kα2, BnMAP4Kα2). These are the first characterized homologues of a multicellular Eucaryote. Thcy might participate in a signalling module conserved along the evolution between fungi and plants. We demonstrated the existence of physical and functional interactions between both the plant and the s. Pombe SIN elements. AtSGP1/2, BnMAP3Ke1 and BnMAP4Kα2 are capable of complementing the spg1-B8, cdc7-24 and sid1-239 S. Pombe mutants respectively. Furthermore, we displayed anomalies in the cytokinesis process of wild type S. Pombe over-expressing the SIN-related proteins. An analysis of physical interplays between plant elements and those of the fission yeast clearly evidenced and confirmed the existence of a plant SlN-related signalling pathway. Partial complementation of the yeast mutants indicated that plant homologous proteins diverged from their yeast counterparts to some extend. In addition, we showed that the components colocalized within the nucleolus, which suggests a yet unnoticed regulating mechanisms of this pathway. These data, added to the expression patterns of the corresponding plant genes, and to the phenotypes of AtMAP3Ke1 antisense plants, led us to propose the consistent picture of a SIN related signalling pathway, which controls plant cell division

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Ravanel, Stéphane. "Biosynthèse de la méthionine chez les plantes supérieures : étude biochimique et moléculaire des enzymes de la voie de transsulfuration." Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015), 1995. http://www.theses.fr/1995GRE10238.

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Chez les plantes, l'atome de soufre de la methionine derive de la cysteine par une serie de reactions dites de transsulfuration faisant intervenir la cystathionine et l'homocysteine comme intermediaires. En presence de cysteine et d'o-phosphohomoserine, la cystathionine gamma-synthase catalyse une synthese de cystathionine qui est ensuite clivee en homocysteine, pyruvate et ammoniac par la cystathionine beta-lyase. La mise au point de techniques de dosage tres sensibles de ces activites enzymatiques a permis de demontrer que la cystathionine gamma-synthase et la cystathionine beta-lyase sont presentes uniquement dans le stroma des chloroplastes. Ces enzymes ont ensuite ete purifiees a l'homogeneite a partir de chloroplastes de feuilles d'epinard et leurs proprietes cinetiques et physicochimiques ont ete definies. La cystathionine gamma-synthase et la cystathionine beta-lyase jouent un role primordial dans le metabolisme cellulaire puisque l'inhibition de l'une ou l'autre de ces enzymes par la propargylglycine ou l'aminoethoxyvinylglycine est letale pour la plante. Un adnc codant pour la cystathionine beta-lyase d'arabidopsis thaliana a ensuite ete clone par complementation fonctionnelle d'un mutant d'e. Coli deficient en activite enzymatique endogene. Cette proteine est synthetisee sous la forme d'un precurseur polypeptidique de 50,4 kda qui est importe et clive dans le chloroplaste pour obtenir une sous-unite mature de 46 kda. La cystathionine beta-lyase d'a. Thaliana a finalement ete surproduite dans e. Coli. La purification de la proteine recombinante en grande quantite permet d'initier une etude structurale de l'enzyme ainsi que le developpement d'un test de criblage automatise de molecules chimiques en vue de la mise au point d'herbicides nouveaux et specifiques

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SAID, RAJAA. "Etude par voie fermentaire des glucides du lait et analyse isotopique comparative de glucose et galactose d'animaux et de plantes." Nantes, 1996. http://www.theses.fr/1996NANT2026.

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Les sucres fermentescibles sont actuellement tres utilises en industrie telle que celle des boissons. Les processus intervenant dans la bioconversion des sucres en ethanol sont interessants a etudier en relation avec leur utilisations. La determination des contenus moleculaires en isotopes stables a ete source d'informations sur les biomecanismes dans les conditions naturelles, ce qui a pousse a developper de nouvelles methodes de mesure du fractionnement isotopiques. L'abondance naturelle du deuterium et carbone-13 implique des variations isotopiques faibles necessitant des techniques de mesure precises: la resonance magnetiques nucleaire (rmn) et la spectrometrie de masse isotopique (smri). Notre travail a consiste a etudier le fractionnement isotopique susceptible d'intervenir au cours du metabolisme des differents glucides du lait, notamment le lactose, le glucose et le galactose, par comparaison avec les glucides d'origine vegetale provenant des plantes. Nous avons extrait et purifie le lactose du lait. L'hydrolyse du lactose a ete ensuite mise au point, permettant la liberation du glucose et du galactose. Nous avons choisi la voie microbiologique pour etudier ces sucres. En effet, l'ethanol produit a partir de la fermentation des sucres constitue une sonde fiable et efficace pour l'analyse et la caracterisation de ces derniers. Afin d'analyser separement les trois sucres, nous avons ete amene a rechercher des levures specifiques. Apres plusieurs essais faits avec diverses souches de levure, notre choix a porte principalement sur candida utilis qui fermente le glucose et n'assimile ni le lactose ni le galactose, ce qui permet d'extraire le galactose restant et de le fermenter par une seconde levure specifique kluyveromyces fragilis. Dans le but de valider la methode, nous avons etudie l'effet du traitement d'hydrolyse sur les parametres biochimiques et isotopiques en effectuant des fermentations controles sur des glucides purs. Aucun fractionnement isotopique du au traitement n'est observe au niveau de la teneur en carbone-13 en depit de la longueur et de la complexite des traitements. En ce qui concerne le deuterium, le fractionnement observe est peu significatif. L'analyse isotopique faite sur des lactoses de laits de differentes provenances montre que la teneur en carbone-13 varie. Par contre, pour un lait donne, les differents glucides presentent la meme teneur en carbone-13 que celle du lait d'origine. La teneur en deuterium des ethanols de ces differents sucres ne varient pas ou peu en fonction des divers laits. Cependant, pour un meme lait, cette teneur est differente selon la nature du sucre. On a montre egalement que le regime alimentaire a une influence sur la teneur isotopique en carbone 13 et en deuterium des glucides du lait. Une discrimination importante a ete mise en evidence entre les glucides issus du metabolisme vegetal et ceux du metabolisme animal

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Dechaux, Céline. "Modulation de la voie de biosynthèse de la scopolamine chez Datura innoxia Mill : expression du gène h6h d'Hyoscyamus niger dans des racines transgéniques obtenues par transformation via Agrobacterium rhizogènes." Amiens, 2005. http://www.theses.fr/2005AMIE0507.

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Savarin, Julie. "Caractérisation de la voie TCTP (TRANSLATIONALLY CONTROLLED TUMOR PROTEIN) chez Arabidopsis thaliana : identification des régulateurs de son accumulation et importance de la voie au cours du développement embryonnaire." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSEN001.

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TCTP (Translationally Controlled Tumor Protein) est une protéine très conservée chez l'ensemble des eucaryotes. C’est une protéine vitale impliquée dans divers processus essentiels, et pour de nombreux organismes son absence conduit à la létalité dès les stades embryonnaires.Chez les animaux comme chez les végétaux, TCTP joue un rôle primordial dans la croissance et le développement des individus. En plus de son implication dans l’apoptose et la réparation de l’ADN, TCTP favorise la prolifération cellulaire, et se trouve donc être un élément important de la tumorigenèse. Chez les végétaux, la forte conservation de TCTP a permis la préservation de la plupart des fonctions décrites chez les animaux, mais les facteurs qui interviennent en amont ne sont pas encore connus.Par la mise en place, la conduite et la finalisation de deux cribles génétiques utilisant la plante modèle Arabidopsis thaliana, ce travail de thèse a cherché à identifier des facteurs situés en amont de TCTP. En parallèle, une seconde étude fut menée afin de mesurer l'impact de l'absence de TCTP sur les voies de l’auxine et des cytokinines au cours du développement embryonnaire, permettant de mieux comprendre l’origine de l’embryolétalité du mutant tctp
TCTP (Translationally Controlled Tumor Protein) is strongly conserved among eukaryotes. It is a vital protein implicated in various major processes, and its absence leads to early embryolethality in many organisms. In plants as in animals, TCTP is a key factor of growth and development. Implicated in apoptosis and DNA repair, TCTP is also an enhancer of cell proliferation, and is a key element of tumorigenesis. Major functions of TCTP are conserved between plants and animals, but upstream factors are not known yet. Using a genetic screen on the model plant Arabidopsis thaliana, the principal goal of this thesis was to discover regulators of TCTP.In parallel, the impact of TCTP knockout on auxin and cytokinin pathways during embryo development was investigated

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Deprost, Dorothée. "Etude du rôle de la voie de signalisation de TOR (Target Of Rapamycin) dans le contrôle de la croissance des plantes." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2005. http://www.theses.fr/2005VERS0028.

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Nous avons étudié le rôle de la protéine kinase TOR (Target of Rapamycin), présente chez tous les eucaryotes, dans le contrôle de la croissance des plantes par les signaux de l'environnement. Nous avons d'abord pu montré que la protéine RAPTOR d'Arabidopsis thaliana était indispensable au développement embryonnaire. La disruption du gène AtTor est en général létal mais des plantes sur-exprimant ce gène ont été obtenus après insertion d'ADN-T dans la région 5' non traduite ou promotrice. Ces lignées présentent une croissance plus importante de la partie végétative et reproductrice, croissance qui est diminuée après l'extinction de l'expression d'AtTor par ARN interférence. De plus la résistance aux stress osmotiques et l'inhibition de la sénescence semblent liées au niveau d'expression d'AtTor. Nous avons également étudié les variations du transcriptome d'Arabidopsis résultant de la sur-expression d'AtTor. Ces résultats montrent le rôle central de TOR dans la croissance des plantes
We have studied the role of the TOR (Target of Rapamycin) protein kinase, which is present in all eucaryots, in the control of plant growth by signals coming from the environment. We have first shown that the RAPTOR protein is needed for embryonic growth in Arabidopsis thaliana. Disruption of the AtTor gene is lethal but plants over-expressing this gene were obtained following T-DNA insertions in the 5' untranslated region of the gene. These Arabidopsis lines displayed an enhanced growth rate in both the vegetative and reproductive parts. Conversely, silencing of the AtTor expression by RNAi resulted in a decreased growth. Moreover, resistance to stresses and inhibition of senescence appear to be direcly linked to AtTor expression. We have also studied the transcriptome variations in response to AtTor over-expression. These results demonstrate the central role of AtTor in regulating plant growth

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Saint-Macary, Marie-Emmanuelle. "Biosynthèse de la cystéine et de la méthionine chez le champignon phytopathogène Magnaporthe grisea : Analyse de la méthionine synthase et des enzymes de la voie de transsulfuration." Pau, 2006. http://www.theses.fr/2006PAUU3008.

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Les champignons filamenteux pathogènes sont à l'origine de maladies dévastatrices des cultures. Des études récentes suggèrent que les champignons présentent un besoin en composés soufrés pour leur développement sur la plante. La voie de biosynthèse des acides aminés soufrés est complexe et se compose à la fois des enzymes appartenant au métabolisme défini chez les plantes et chez Saccharomyces cerevisiae. Les champignons filamenteux synthétisent le précurseur de la méthionine, l'homocystéine, à partir de cystéine par la voie de transsulfuration directe (modèle plante) mais catalysent également la synthèse de cystéine à partir de l'homocystéine par les enzymes de la voie de transsulfuration inverse (modèle S. Cerevisiae). L'étape finale de biosynthèse de méthionine, catalysée par la méthionine synthase, est commune à tous les organismes. Afin de clarifier le rôle de la biosynthèse de la méthionine dans le processus infectieux, un mutant nul pour le gène de la méthionine synthase a été créé chez Magnaporthe grisea. Ce mutant est auxotrophe pour la méthionine et est incapable de développer des lésions sur feuilles intactes ou blessées. En particulier, ce mutant est incapable de développer les hyphes d'infection nécessaires à la pénétration de la plante. Le processus infectieux est restauré par l'addition de méthionine exogène ou après complémentation par le gène de la méthionine synthase. Les champignons filamenteux pathogènes nécessitent donc une synthèse de novo de méthionine pour initier leur cycle infectieux. L'analyse biochimique des mutants nuls indiquent que l'absence de la méthionine synthase s'accompagne d'une modification profonde des pools de métabolites soufrés. En particulier, les taux de glutathion, de glutamate, de sérine et de lysine chutent pendant que l'homocystéine, le Sadénosylhomocystéine et la cystathionine s'accumulent. Ces résultats indiquent que l'augmentation d'homocystéine est détoxiquée par la voie de transsulfuration inverse mais ne peut aboutir à la conversion en cystéine. D'autre part, ces données suggèrent une inter-régulation entre la biosynthèse de méthionine et celle du glutamate. Chez les champignons filamenteux, la voie de transsulfuration directe est décrite comme la voie majoritaire de synthèse de méthionine. Cette hypothèse a été validée par la création d'un mutant nul pour le gène codant la cystathionine gamma-synthase 1 (CGS1) de M. Grisea. Néanmoins, ce mutant ne présente qu'un fort retard de croissance sur milieu minimum conduisant à une pathogénie retardée et réduite. Ces résultats confortent l'hypothèse d'un besoin de synthèse de méthionine pour l'infection mais indiquent également l'existence d'une (ou plusieurs) voie(s) supplémentaire(s) permettant ce contournement métabolique. Deux gènes peuvent être à l'origine de cette reprise de croissance : un gène codant un homologue de la CGS1, appelé CGS2, et le gène codant l'homocystéine synthase (HCS1), enzyme permettant la sulfhydrylation directe d'une molécule en C4 pour former de l'homocystéine. Les mutants nuls pour les gènes CGS2 et HCS1 sont prototrophes et totalement pathogènes sur plantes. De plus, le double mutant pour les gènes CGS1 et CGS2 présente un phénotype de croissance et une pathogénie similaire à celles du mutant simple cgs1. La CGS2 n'est donc pas impliquée dans le contournement métabolique révélé dans le mutant cgs1. En revanche, le double mutant pour les gènes CGS1 et HCS1 présente un phénotype auxotrophe et l'évaluation du pouvoir pathogène est en cours de réalisation. Toutefois, ces résultats préliminaires démontrent que le contournement métabolique observé chez le mutant pour le gène CGS1 serait le résultat de l'activité de la voie de sulfhydrylation directe catalysée par la protéine HCS1. Au vu du rôle physiologique de la voie directe dans la biosynthèse de la méthionine chez M. Grisea, la voie de transsulfuration inverse a été étudiée. Le mutant nul pour le gène CGL1 codant pour la cystathionine gamma-lyase est prototrophe et pathogène sur plante. Néanmoins, l'analyse biochimique de ce mutant révèle une forte accumulation (40 fois) de cystathionine dans la cellule fongique et suggère un rôle de la voie inverse dans le catabolisme de l'excès d'homocystéine. De plus, le mutant pour la CGL1 présente d'importantes difficultés à sporuler indiquant un rôle de cette voie pour la biosynthèse de cystéine au cours de la sporulation
Filamentous fungi cause devastating diseases of agricultural crops. Recent studies highlighted a need for sulfur amino acids (methionine and cysteine) in the infectious process. To get insight into the physiological significance of sulfur amino acids biosynthesis in the infectious cycle, we have created null mutants of genes involved in the synthesis of homocysteine, cysteine and methionine by a gene deplacement strategy using a plant pathogenic model, Magnaporthe grisea. To this end the genes encoding cystathionine -synthase (CGS1, direct transsulfuration), methionine synthase and the cystathionine -lyase (CGL, reverse transsulfuration) were targeted. While suppression of the methionine synthase gene led to auxotrophy for methionine, mutants for CGS1 showed only strongly delayed growth, and mutants for CGL were prototroph on minimum medium. When tested on plants, only null mutants for methionine synthase were non pathogenic and the infectious cycle was fully restored upon addition of methionine. In the case of the null mutants for CGS1, the delay in development of disease symptoms was postulated to correspond to metabolic adaptation of the pathogen. This hypothesis was tested by analyzing single null mutants for the CGS2 gene, a homologue of CGS1 in M. Grisea, and for the HCS gene encoding homocystéine synthase which is involved in direct sulphydrylation activity for homocysteine built-up. All the single null mutants were prototroph and non pathogenic on plants. The double null mutant targeting CGS1 and CGS2 showed phenotype similar to the single mutant for CGS1. By contrast, the double mutant line for CGS1 and HCS was auxotroph and its growth was complemented by methionine. Altogether these experiments evidenced the role of the direct transsulfuration pathway in the biosynthesis of homocysteine. Biochemical analysis of the mutant for methionine synthase disclosed metabolite reorientations and molecular adaptation to remove toxic accumulated homocysteine. This compound was degraded through the reverse transsulfuration pathway with accumulation of cystathionine as an intermediate. Pleiotropic effects on glutathione, glutamate, serine and arginine pools resulted from the suppression of the methionine synthase gene. Accumulation of homocysteine led to that of adenosylhomocysteine, a potent inhibitor of the S-adenosylmethionine (SAM) dependent methylases. The built-up of SAM, favored by expression of the fungal SAM-methyltransferase gene, in presence of added methionine was a consequence of the growth restoration. Our analysis led to the finding that the reverse transsulfuration pathway is committed to homocysteine degradation when this toxic compound is in excess. Such interpretation was also confirmed through the accumulated cystathionine measured in the null mutant for CGL1 when grown in the presence of methionine. The integrated analysis of the mutants is a way to decipher the flux of sulfur in the growing pathogenic fungi during the infectious cycle

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Ouassou, Malika. "Bases évolutives de la diversification des glucosinolates chez les plantes de l'ordre des Brassicales." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS104.

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Dans la nature, les plantes sont confrontées à une multitude d’attaques extérieures, elles sont constamment menées à affiner leurs défenses contre ces attaques. Les plantes de l’ordre des Brassicales sont connues par leur capacité de synthétiser des métabolites secondaires appelés glucosinolates, ils sont des produits naturels riches en soufre. Après hydrolyse par des thioglucosidases appelées myrosinases, ils produisent plusieurs produits de dégradation qui sont toxiques pour des parasites comme les insectes herbivores ou les agents pathogènes. L’ordre des Brassicales regroupe plus de 130 molécules de glucosinolates, qui ont une structure de base commune, mais varient par leurs chaines latérales. La composition des glucosinolates varie au sein d’une espèce, entre espèces et entre les familles des Brassicales. L’espèce Arabidopsis thaliana produit environs 40 molécules de glucosinolates à partir de trois précurseurs d’acides aminés, phénylalanine, tryptophane et méthionine. Ces trois types de glucosinolates sont générés par trois voies de biosynthèse liées et se chevauchent partiellement. Les glucosinolates synthétisés à partir de la phénylalanine et à partir du tryptophane sont répandues chez les familles de Brassicales. Par contre, la biosynthèse des glucosinolates dérivés de la méthionine est une innovation évolutive chez les familles les plus jeunes de l’ordre, on trouve ces types de métabolites seulement chez les Brassicaceae et certaines Capparaceae. Cette nouvelle voie a conduit à une grande expansion de structures chimiques de glucosinolates et elle est particulièrement importante pour la défense des crucifères contre leurs ennemis naturels. Quelles sont les bases génétiques et évolutives d'une telle innovation adaptative ? Basée sur une approche combinant de la génomique comparative, de la reconstruction des phylogénies de gènes et des tests de la sélection, cette thèse s’inscrit à répondre à ces questions. L’histoire évolutive des glucosinolates montre de multiples duplications de gènes impliqués dans la biosynthèse des glucosinolates, souvent ciblées par la sélection positive et indicative des néofonctionnalisations. Notamment, il y avait deux vagues massives de la sélection positive dans l’histoire récente de la biosynthèse de glucosinolates, l’une après la séparation de l’ancêtre commun des Brassicaceae, Cleomaceae et Capparaceae d’un ancêtre partagé avec les Resedaceae, l’autre à la base des Brassicaceae. Ces résultats montrent que des innovations adaptives incluant de multiples gènes peuvent s’établir pendant une période relativement courte et que des duplications des génomes entiers ne sont pas forcément requis pour des changements complexes du métabolisme secondaire
In nature, plants are faced with a multitude of external attacks, they are constantly led to refine their defenses against these attacks. Plants of the order Brassicales are known by their capacity to synthesize secondary metabolites called glucosinolates, they are natural products rich in sulfur. After hydrolysis by thioglucosidases called myrosinases, they produce several degradation products that are toxic to parasites such as herbivorous insects or pathogens. The order Brassicales includes more than 130 molecules of glucosinolates, which have a common basic structure, but vary by their side chains. The composition of glucosinolates varies within a species, between species and between Brassicales families. The Arabidopsis thaliana species produces around 40 molecules of glucosinolates from three precursors of amino acids, phenylalanine, tryptophan and methionine. These three types of glucosinolates are generated by three linked and partially overlapping biosynthetic pathways. Glucosinolates synthesized from phenylalanine and from tryptophan are common in Brassicales families. On the other hand, the biosynthesis of glucosinolates derived from methionine is an evolutionary innovation in the youngest families of the order, these types of metabolites are found only in Brassicaceae and some Capparaceae. This new path has led to a large expansion of chemical structures of glucosinolates and is particularly important for the defense of cruciferous plants against their natural enemies. What are the genetic and evolutionary bases of such an adaptive innovation ? Based on a combined approach of comparative genomics, the reconstruction of gene phylogenies and selection tests, this thesis addresses these questions. The evolutionary history of glucosinolates shows multiple duplications of genes involved in glucosinolate biosynthesis, often targeted by the positive and indicative selection of neofunctionalizations. Notably, there were two massive waves of positive selection in the recent history of glucosinolate biosynthesis, one after the separation of the common ancestor Brassicaceae, Cleomaceae, and Capparaceae from an ancestor shared with Resedaceae. other at the base of Brassicaceae. These results show that adaptive innovations involving multiple genes can be established over a relatively short period of time and that full genome duplications may not be required for complex changes in secondary metabolism

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Debs-Louka, Espérance. "Destruction des micro-organismes par voie thermo-mécanique contrôlée dans des produits solides en morceaux ou en poudre : application aux épices et aromates." La Rochelle, 2000. http://www.theses.fr/2000LAROS049.

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Ce travail s'inscrit dans le cadre de la recherche d'une réponse au traitement des produits solides en morceaux ou en poudre en vue d'une amélioration de leur qualité microbiologique. L’étude a ainsi porté sur l'utilisation de deux agents antimicrobiens : la haute température et le dioxyde de carbone sous pression. La DIC/HTV (détente instantanée contrôlée / haute température vapeur) se présente comme un traitement thermique de type HTST : chauffage rapide par injection directe de vapeur d'eau et refroidissement induit par le passage instantané de la pression vers un vide primaire. L’étude de cinétique de destruction thermique des spores de Bacillus stearothermophilus a montré la faisabilité du procédé et a abouti à la détermination des caractères de thermorésistance de la souche. Le traitement par le Co 2 pressurisé a permis d'étudier la résistance de deux bactéries (Enterococcus faecalis et Escherichia coli) et d'une levure (Saccharomyces cerevisiae). L’ensemble de nos résultats confrontés à ceux de la bibliographie nous a permis de proposer un schéma d'inactivation par le Co 2 sous pression en fonction du paramètre étudié. L’impact de la détente rapide vers le vide - étape commune aux deux opérations de traitement thermique et par le Co 2 sous pression - a été étudié au plan structural par microscopie électronique à balayage dans le cas des spores de Bacillus stearothermophilus et de Saccharomyces cerevisiae. Cette étude a révélé qu'en plus des modifications morphologiques résultantes des traitements, la détente dite instantanée a un impact mécanique direct sur les micro-organismes impliquant presque systématiquement des dégradations structurales majeures. L’application au cas de quatre produits (épices et aromates) n'a été possible que par DIC/HTV. Des traitements isothermes ont, pour chaque produit, été réalisés en vue d'une bonne qualité hygiénique. Une contribution à la conception d'un réacteur industriel a été effectuée.

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Montiel-Jorda, Álvaro. "Influence de la température sur la voie de signalisation des hormones brassinostéroïdes : mécanismes moléculaires et conséquences pour la croissance et le développement des plantes." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS447.

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La signalisation des brassinostéroïdes (BR) est importante pour presque tous les aspects du développement des plantes, comme en témoigne le phénotype extrêmement nain et stérile des mutants défectueux du récepteur des brassinostéroïdes BRASINOSTEROID INSENSITIVE 1 (BRI1). De plus, il est un régulateur clé de la réponse des plantes à l'augmentation de la température ambiante (thermomorphogenèse) dans les parties aériennes de la plante, associé à la signalisation auxine et au facteur de transcription PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 4 (PIF4). Cependant, les rôles des mécanismes moléculaires de la thermomorphogenèse des racines restent insaisissables. Dans cette thèse, je décris en détail les mécanismes moléculaires conduisant à la thermomorphogenèse des racines des plantes exposées à une température ambiante élevée à la suite de la germination. Pour que les plantes allongent leur racine primaire à 26 ° C, par rapport à 21 ° C, elles régulent sélectivement la signalisation BR via la dégradation de BRI1 en fonction de la température. De manière surprenante, dans nos propres conditions, la signalisation auxine n’est pas nécessaire pour la thermomorphogenèse radiculaire, ce qui suggère une différence entre les réponses de thermomorphogenèse aérienne et racinaire. En utilisant une approche de mutagenèse dirigée, nous avons pu déterminer que la dégradation est déclenchée par une modification post-traductionnelle ciblant les lysines, probablement l’ubiquitination K63. Pour découvrir l’ubiquitine ligase E3 impliquée dans la dégradation de BRI1 induite par la température, nous avons effectué un criblage double hybride en levure en utilisant le domaine cytoplasmique de BRI1. Nous avons obtenu trois protéines candidates nommées DENSE AND ERECT PANICLE (DEP), qui se localisent de manière surprenante dans des microtubules corticaux (MTc) et sont apparues en même temps que la signalisation par le BR, suggérant un lien fonctionnel. L'interaction entre DEP1 et BRI1 a été confirmée par trois techniques différentes et, par conséquent, les mutants simples dep sont défectueux dans la perception de BR. D'un côté, ils sont hyposensibles à la réduction de la longueur de l'hypocotyle induite par le BR, mais de l'autre, ils sont hypersensibles au gravitropisme induit par le BR. Ces données suggèrent une interaction entre la signalisation par BR, la dynamique sous-cellulaire de BRI1 et les microtubules corticaux. Des recherches futures permettront de mieux comprendre l'importance biologique de l'interaction BRI1-MTc en général et de l'interaction BRI1-DEP1 en particulier
Brassinosteroid (BR) signaling is important for nearly all aspects of plant development, as attested by the extremely dwarf and sterile phenotype of mutants defective in the brassinosteroid receptor BRASINOSTEROID INSENSITIVE 1 (BRI1). In addition, it is a key regulator of plant responses to increase in ambient temperature (thermomorphogenesis) in the above-ground parts of the plant together with auxin signaling and the transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 4 (PIF4). However, the roles molecular mechanisms of root thermomorphogenesis remain elusive. In this thesis, I describe in great detail the molecular mechanisms leading to root thermomorphogenesis of plants exposed to elevated ambient temperature from germination. In order for plants to elongate their primary root at 26°C, compared to 21°C, they selectively downregulate BR signaling via the temperature-specific degradation of BRI1. Surprisingly, under our own conditions, auxin signaling is not required for root thermomorphogenesis, suggesting a difference between aerial and root thermomorphogenesis responses. Using a site-directed mutagenesis approach, we are able to pinpoint that the degradation is triggered by a post-translational modification targeting lysines, probably K63 ubiquitination. To find out the E3 ubiquitin ligase involved in the BRI1 temperature-induced degradation we carried out a yeast two hybrid screen using BRI1’s cytoplasmic domain. We obtained three candidate proteins named DENSE AND ERECT PANICLE (DEP) that surprisingly localize to cortical microtubules (cMTs) and arose at the same time as BR signaling, suggesting a functional link. The interaction between DEP1 and BRI1 was confirmed by three different techniques and, consequently dep single mutants are defective in BR percepton. On one hand, they are hyposensitive to the BR-induced reduction in hypocotyl length but on the other hand they are hypersensitive regarding BR-induced agravitropism. This data suggest an interplay between BR signaling, BRI1 subcellular dynamics and cortical microtubules. Future research will shed light on the biological significance of the BRI1-cMTs interaction in general and the BRI1-DEP1 interaction in particular

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Darghouth, Farida. "Etude analytique de l'Olea europaea L. Et Globularia alypum L. Et leurs transformations par voie chimique et microbiologique." Aix-Marseille 3, 1999. http://www.theses.fr/1999AIX30002.

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Les feuilles de l'olivier (olea europaea l. ) et de la globulaire (globularia alypum l. ) sont tres utilisees dans la medecine traditionnelle en tunisie les composes actifs sont des iridoides pour la globulaire de des secoiridoides pour l'olivier. La mise au point de methode de dosage par clhp a permis de definir un profil chromatographique et de comparer la teneur en compose actif selon le mode de sechage de ces deux plantes. L'etude de la teneur en oleuropeine dans les feuilles d'olivier au cours du temps est rapportee les iridoides de la feuille de globulaire et les secoiridoides de la feuille d'olivier ont ete transformes par voie chimique et microbiologique sous l'action des bacteries intestinales. Les produits de transformation de l'olivier ont pu etre separes, ainsi les secoiridoides de l'olivier sont transformes par voie chimique en deux composes f1 et f4 ou frideline en quantite importante, et par voie microbiologique en quatre composes : b1, b2 et b3 et son isomere. Ces produits sont des composes nouveaux l'identification des souches bacteriennes metabolisant l'oleuropeine en ces composes a ete realisee.

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Pujol, Claire. "Importation de macromolécules dans les mitochondries et chloroplastes d’Arabidopsis thaliana : Etude des séquences de double adressage des aminoacyl-ARNt synthétases et de la voie de synthèse du Gln-ARNtGln." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2008. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2008/PUJOL_Claire_2008.pdf.

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Au cours de ce travail de thèse, je me suis intéressée aux aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales de plantes, enzymes qui assurent l’aminoacylation des ARN de transfert au cours de la traduction. Toutes ces enzymes sont codées par le noyau puis importées dans les mitochondries. La majorité d’entre elles sont également chloroplastiques. Cette double localisation se fait grâce à une séquence d’adressage appelée ambiguë et située en N-terminal des protéines. Nous avons étudié les caractéristiques de ces séquences d’adressage par des expériences de mutagenèse dirigée et de délétion. Nous avons également étudié la voie de synthèse du Gln-tRNAGln dans les mitochondries et les chloroplastes, voie qui fait intervenir une Glutamyl-ARNt synthétase non discriminante et une amidotransférase ARNt-dépendante (AdT). Cette AdT d’Arabidopsis thaliana est la première AdT mitochondriale identifiée à ce jour
During this work, I was interested in the plant mitochondrial aminoacyl-tRNA synthetases, enzyme which catalyze the aminoacylation of the tranfer RNA during the translation. All these enzymes are encoded by the nucleus and then are imported into mitochondria. However, most of them are also chloroplastic. Dual targeting is determinated by an ambiguous signal located in the N-terminal part of these proteins. Thus mutation or deletion have been performed in order to caracterize these target sequences. We also studied the aminoacylation of the tRNAGln in plant mitochondria and chloroplasts. This pathway involves a non-discriminating Glutamyl-tRNA synthetase and the Glu-tRNAGln amidotransferase (AdT). Indeed this enzyme is the first AdT identified in mitochondria

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Michel, Marie. "Développement d'une nouvelle stratégie vaccinale bivalente anti-VIH-1 et anti-VHB dans les plantes transgéniques." Paris 5, 2007. http://www.theses.fr/2007PA05D008.

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Un polyépitope du VIH-1 restreint à l'allèle HLA*A2. 01 et fusionné à l'AgHBs du VHB a été optimisé afin d'obtenir la production de particules pseudo-virales (VLP) in vitro et in vivo. L'immunisation ADN d'un modèle murin transgénique humanisé a permis de mettre en évidence l'induction d'une réponse T CD8+ sécrétrice d'IFN-γ et CTL spécifique du VIH-1, ainsi que la production d'Ac anti-VHB. Les avancées dans les biotechnologies végétales ont permis le développement de produits vaccinaux administrables oralement dirigés contre le VHB. Le gène codant pour la protéine de fusion a donc été intégré dans le génome nucléaire de Nicotiana tabacum et d'Arabidopsis thaliana. La caractérisation des plantes transgéniques nous a permis de montrer qu'il est possible d'exprimer stablement des VLP chimériques dans ces espèces végétales. Enfin, l'analyse des clones issus de la première génération sexuelle de tabac nous assure de la pérennité de l'intégration et de l'expression des VLP chimériques
A fusion protein formed by an HIV-1 polyepitope restricted to the HLA*A2. 01 allele combined to HBV HBsAg has been optimized to obtain virus like particles (VLP) production in vitro and in vivo. An expression plasmid of the fusion protein has been used for DNA vaccination of humanized transgenic mice. This immunization induced gamma interferon-producing CD8+ T cells and anti-HIV-1 cytotoxic T lymphocytes as well as anti-VHB antibody production. The new developments in plant biotechnology allowed the production in plant of vaccines against HBV that can be administrated by ingestion. In order to experiment this strategy for HIV-1, the fusion protein gene has been inserted into the genome of Nicotiana tabacum and Arabidopsis thaliana. We were able to show the stable expression of VLP in these plants. Finally, the analysis of the first generation of tobacco-plants obtained by sexual reproduction showed the conservation of the fusion protein gene as well as the VLP production

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Mouillon, Jean-Marie. "Étude du métabolisme du folate chez les plantes : caractérisation de la 6-hydroxyméthyl-7,8-dihydroptérine pyrophosphokinase /7,8-dihydroptéroate synthase." Grenoble 1, 2000. http://www.theses.fr/2000GRE10015.

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L'acide folique est un cofacteur indispensable au transport des groupements monocarbones. Il intervient dans la synthese des acides nucleiques et joue un role important dans le metabolisme de certains acides amines. Les plantes, contrairement aux animaux, sont capables de synthetiser de novo le folate. Toutes les etapes enzymatiques de cette voie de synthese sont localisees dans les mitochondries de feuilles de pois. Nous avons montre que les deux premieres etapes, la dihydropterine pyrophosphokinase (hppk) et la dihydropteroate synthase (dhps) sont portees par une seule enzyme bifonctionnelle. Cette proteine a ete purifiee a partir de mitochondries de feuilles de pois et elle apparait comme une proteine mineure de la matrice mitochondriale. Nous avons isole et analyse l'adnc codant pour la proteine hppk-dhps. La sequence primaire de la proteine revele la presence d'une sequence d'adressage de type mitochondriale. Nous avons ensuite choisi de produire la proteine hppk-dhps de plante dans un systeme procaryote. La proteine hppk-dhps recombinante obtenue presente des proprietes catalytiques comparables a celles observees pour la proteine native. L'etude des proprietes biochimiques de l'activite dhps a montre que cette reaction est regulee par le produit de la reaction, le dihydropteroate, et les autres intermediaries de la voie de synthese du folate comme le dihydrofolate et le tetrahydrofolate. L'etude des proprietes biochimiques de l'activite hppk a egalement permis de mettre en evidence un mecanisme enzymatique sequentiel ordonne de fixation des substrats. Parallelement, nous avons etudie par rmn quels sont les differents donneurs d'unites monocarbonees transportees par le folate. Le catabolisme de la serine initie par l'activite serine hydroxymethyl transferase constitue la principale source des unites monocarbonees au sein des cellules non-photosynthetiques. Ce catabolisme est lie a l'activite glycine decarboxylase presente dans les mitochondries de ces cellules.

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Hassoun, Yasmine. "Etude de la régulation de la voie de biosynthèse des phospholipides en réponse au stress d'enveloppe chez Escherichia coli." Thesis, Aix-Marseille, 2020. http://www.theses.fr/2020AIXM0222.

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Chez E. coli, des enzymes localisées à la membrane interne assurent la synthèse des phospholipides (PL). La membrane lipidique, est une barrière entre l’environnement et le milieu intérieur, elle est soumise à différents stress. La synthèse des PL est sujette à une régulation fine en réponse à ces variations environnementales pour maintenir l’homéostasie de la membrane. La voie de synthèse des PL est bien étudiée, on sait peu de choses sur sa régulation transcriptionnelle. Des études transcriptomiques de la réponse au stress d’enveloppe par les facteurs sigmaE et le système CpxAR, ont montrées que les gènes des enzymes de synthèse des PL sont régulés par ces facteurs. De plus, il a été montré que le gène plsB, qui code pour la première enzyme de synthèse des PL, est induit par sigE et inhibée par le ppGpp. A partir de là, j’ai étudié la régulation en réponse au stress du gène psd, qui code pour la phosphatidyléthanolamine, le PL majoritaire d’E. coli. Pour commencer, j’ai confirmé que le premier promoteur de psd était induit par sigE, puis j’ai démontré que psd possédait un second promoteur induit par CpxR. Mon second projet a porté sur la caractérisation du gène clsB, qui code pour la cardiolipine synthase II qui synthétise de la cardiolipine (CL). clsB est en opéron avec les deux gènes de fonction inconnue ybhP et ybhN. Généralement, les produits des gènes en opéron œuvrent dans une voie commune, ont une fonction liée ou forment un seul complexe protéique. C’est pour cette raison que j’ai voulu déterminer le rôle de ybhP et ybhN dans la voie de synthèse de la CL et/ou dans la voie de synthèse des PL. La caractérisation de YbhP et YbhN est en cours
In E. coli, enzymes located on the inner membrane ensure the synthesis of phospholipids (PL). The lipid membrane is a barrier between the environment and the internal environment, it is subject to various stresses. PL synthesis is subject to fine regulation in response to these environmental variations to maintain membrane homeostasis. The pathway for PL synthesis is well studied, little is known about its transcriptional regulation. Transcriptomic studies of the envelope stress response by sigmaE factors and the CpxAR system have shown that genes for PL synthetic enzymes are regulated by these factors. In addition, it has been shown that the plsB gene, which codes for the first PL synthesis enzyme, is induced by sigE and inhibited by ppGpp. From there, I studied the stress response regulation of the psd gene, which encodes phosphatidylethanolamine, the major PL in E. coli. To begin with, I confirmed that the first promoter of psd was induced by sigE, then I demonstrated that psd had a second promoter induced by CpxR. My second project focused on the characterization of the clsB gene, which codes for cardiolipin synthase II which synthesizes cardiolipin (CL). clsB is in operon with the two genes of unknown function ybhP and ybhN. Usually, operon gene products work in a common pathway, have a related function, or form a single protein complex. It is for this reason that I wanted to determine the role of ybhP and ybhN in the pathway of LC synthesis and / or in the pathway of PL synthesis. The characterization of YbhP and YbhN is in progress

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Kane, Isabelle Céline. "La valorisation du prélèvement végétal : un pari écologique et économique pour le monde paysan en milieu sud-soudanien sénégalais." Lyon 3, 2006. https://scd-resnum.univ-lyon3.fr/in/theses/2006_in_kane_ic.pdf.

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Le milieu sud-soudanien est l'un des rares espaces encore préservés, riches en ressources végétales au Sénégal mais également une des régions les plus pauvres et rurales du pays. L'agriculture commerciale promue exclusivement pour soutenir et réaliser le développement de ces milieux ne cesse d'accumuler les déboires. Face à ces déconvenues économiques qui perdurent, s'impose l'exploitation d'autres voies de développement, la mise en valeur d'autres secteurs comme le prélèvement végétal (soit l'activité de cueillette) qui contribue déjà beaucoup au mode de vie paysan. Aussi, cette étude se propose d'étudier l'importance (ou le rôle) actuel du prélèvement végétal dans les systèmes de vie paysan et toutes les perspectives de valorisation offertes en milieu sud-soudanien sénégalais. Il s'agit surtout de démontrer ici que le développement rural n'est pas un monopole de l'agriculture commerciale et que ces activités riches en potentialités économiques et écologiques ont, elles aussi, leur place dans les grandes politiques de développement rural
The South Sudanese environment is one of the few areas in Senegal still preserved and rich in vegetal resources but also one of the poorest rural areas of the country. Commercial agriculture, which was promoted solely to support and develop these areas, has been accumulating problems. Confronted with these lasting economic setbacks, there is a need to exploit other means of development for the region as well as develop other sectors such as gathering, which is already a major help to the peasants' lifestyle. Therefore this study wishes to analyse the current role of vegetal gathering in the peasants' life's systems and also the developing prospects offered in the South Sudanese area in Senegal. What matters is to show at this point that the rural development is not the monopoly of the commercial agriculture and that these activities rich in economical and environmental potentials have also their interest in the major politics of rural development

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Xia, Yang. "Impact of varying NH₄⁺˸NO₃⁻ ratios in nutrient solution on C-isotope composition of leaf- and root-respired CO₂ and putative respiratory substrates in C₃ plants." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS222.

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La composition isotopique (¹³C/¹²C) du CO₂ respiré par les feuilles et les racines dans l'obscurité et celle des substrats respiratoires putatifs, y compris les sucres solubles et les acides organiques (malate et citrate), l'activité de la PEPc ainsi que les échanges gazeux des feuilles ont été déterminés sur le haricot (Phaseolus vulgaris L.) et l’épinards (Spinacia oleracea L.) cultivés dans du sable avec différents rapports NH₄⁺: NO₃⁻ dans N fourni. Le CO₂ respiré par les feuilles était enrichi en ¹³C sous NO₃⁻ s’appauvrissant progressivement avec l’augmentation de la fraction de NH₄⁺ dans le N fourni, tandis que la composition isotopique du CO₂ issu de la respiration des racines restait inchangée quel que soit le rapport NH₄⁺: NO₃⁻. Nous avons suggéré qu'une plus grande quantité de pools enrichis en ¹³C fixés par la PEPc via la voie anaplérotique contribuait à la respiration foliaire sous NO₃⁻. Cependant, un effet similaire dans les racines attendu sous NH₄⁺ a été masqué en raison d'une refixation (par la PEPc) du CO₂ respiré (appauvrie en ¹³C). De manière inattendue, les modifications de la composition isotopique du C des métabolites individuels, leurs quantités, ainsi que l'activité de l’enzyme PEPc, présentaient des profils différents entre les deux espèces étudiées. Des expériences de double marquage (¹³C et ¹⁵N) sont nécessaires pour mieux comprendre l’impact de la plasticité métabolique du TCA sur l’écart isotopique entre le malate et le citrate et sur la composition isotopique du CO₂ respiré chez différentes espèces sous différentes formes d’azote
C-isotope composition of leaf- and root-respired CO₂ in the dark and that of putative respiratory substrates including soluble sugars and organic acids (malate and citrate), PEPc activity, as well as leaf gas exchanges were determined on bean (Phaseolus vulgaris L.) and spinach (Spinacia oleracea L.) plants grown in sand with varying ratios of NH₄⁺: NO₃⁻ in supplied N. Leaf-respired CO₂ was ¹³C enriched under NO₃⁻ nutrition and became progressively ¹³C depleted with increasing amount of NH₄⁺ in supplied N, while C-isotope composition of root-respired CO₂ remained unchanged across N-type gradient. We suggested that a higher amount of ¹³C enriched C-pools fixed by PEPc through anaplerotic pathway contributed to respired CO₂ in leaves under NO₃⁻ nutrition. However, a similar effect in roots expected under NH4+ nutrition was masked because of a rather ¹³C depleted C source (respired CO₂) refixation by PEPc. Unexpectedly, the changes in C-isotope composition of individual metabolites and their amounts as well as PEPc activity exhibited different patterns between the two species. Double labelling experiments (¹³C and ¹⁵N) are needed for better understanding the impact of metabolic plasticity of TCA on isotopic gap between malate and citrate and on C-isotope composition of respired CO₂ in different species under varying N-type nutrition

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Mancera-Martinez, Eder Alberto. "Fonction de la protéine cellulaire RISP (Reinitiation Supporting Protein) dans la reinitiation de la traduction chez les plantes." Thesis, Strasbourg, 2014. http://www.theses.fr/2014STRAJ084.

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Chez Arabidopsis, la protéine RISP est détournée par le virus CaMV pour assurer, ensemble avec la protéine virale TAV, la traduction de son ARN polycistronique. RISP a été identifiée comme une cible de la voie de signalisation de TOR et il a été montré que sa phosphorylation est requise pour promouvoir la réinitiation de la traduction activée par TAV. Les résultats que j’ai obtenus suggèrent que RISP, lorsqu’elle n’est pas phosphorylée, intervient ensemble avec eIF3, au niveau du complexe de pré-initiation 43S pour recruter le complexe ternaire grâce à l’interaction entre RISP et la sous-unité b du facteur eIF2. Il s’est avéré que RISP a la capacité, lorsqu’elle est phosphorylée, d’interagir non seulement avec la protéine ribosomique eL24 mais également avec eS6. Nos résultats indiquent que la liaison entre les sous-unités ribosomiques 60S et 40S sous l’effet de RISP, est régulée par la voie de TOR et qu’elle joue un rôle important dans le contrôle de la réinitiation de la traduction
Many factors are required to recruit the tRNAi and a 60S ribosomal subunit to the 40S ribosomal subunit preinitiation complex. This recruitment is normally strictly limited during reinitiation of translation if factors recruited during the primary translation event are shed from 40S. However, factor retention can occur during long ORF translation if the CaMV viral factor TAV is present. RISP is a downstream target of TOR and found either within the 43S preinitiation complex, if bound to eIF3, and/or attached to 60S, if phosphorylated by TOR. We show here that RISP interacts with subunit b of eIF2 before phosphorylation. Critically, TOR activation up-regulates phosphorylation of both RISP and eS6 as well as the binding of both factors. Importantly, eS6-deficient plants are less active in TAV-mediated reinitiation and are thus less susceptible to CaMV infection. It is attractive to propose that eS6 phosphorylation contributes to retention and re-use of 60S during 40S scanning

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Makarian, Joelle. "Rôle du facteur d’initiation eIF3h dans la réinitiation de la traduction et dans la pathogénèse virale chez les plantes." Thesis, Strasbourg, 2016. http://www.theses.fr/2016STRAJ089.

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La réinitiation de la traduction est un mécanisme permettant de traduire des ORF qui sont présents dans la région leader de différents ARNm cellulaires (uORF). La majorité des cas de réinitiation de la traduction chez les eucaryotes concerne des uORF de petite taille. Des stratégies alternatives ont été développées, entre autres par les virus, afin de réinitier la traduction après un long uORF. Le virus de la mosaïque du chou-fleur (CaMV) exprime un ARNm polycistronique codant la totalité des protéines virales. L’une d’entre elle, la protéine TAV (TransActivateur/Viroplasmine) est un facteur essentiel qui rend possible la réinitiation de la traduction après de longs ORF et qui, de plus, active la protéine kinase TOR. La sous-unité h du facteur d’initiation de la traduction eIF3, requise pour promouvoir la reinitiation après un petit ORF chez les plantes, a été identifiée comme étant une nouvelle cible de phosphorylation de la voie de signalisation de TOR. L’objectif principal de ma thèse a été d’élucider la fonction de la protéine eIF3h dans la réinitiation après un petit ORF ainsi que dans la réinitiation de la traduction, assurée par TAV, après un long ORF. Nous avons exploité les lignées transgéniques eif3h-1 d’Arabidopsis exprimant la protéine eif3h tronquée de son extrémité C-terminale, qui sont déficientes pour la réinitiation mais pas pour l’initiation de la traduction. Nous avons montré que la phosphorylation de eIF3h est essentielle pour stabiliser eIF3 au niveau des ribosomes durant l’élongation, ce qui favorise la ré-acquisition par le ribosome de facteurs nécessaires à la réinitiation de la traduction, et que la délétion de sa région Ct abolit son intégration dans le complexe eIF3. De plus, nous avons montré que eIF3h, la cible de la voie de signalisation de TOR, interagit avec S6K1. Des protoplastes préparés à partir des plantes mutantes eif3h-1 sont incapables de promouvoir la réinitiation après de longs ORF en présence de TAV. La surexpression de eIF3h, indifféremment de son état de phosphorylation, est indispensable pour restaurer la reinitiation assurée par TAV dans les protoplastes eif3h-1. Par ailleurs, les plantes eif3h-1 déficientes dans la réinitiation, sont résistantes à l’infection par le CaMV démontrant l’importance de eIF3h pour la réplication du CaMV. En revanche, ces plantes eif3h-1 peuvent être infectées par d’autres virus dont la traduction de l’ARN génomique est coiffe- ou IRES-dépendante. Ainsi, nos résultats suggèrent que eIF3h est un facteur de reinitiation important aussi bien pour la reinitiation après un petit qu’après un long ORF (controlée par TAV), et que TAV exploite cette machinerie cellulaire, et plus particulièrement TOR et eIF3h, pour exprimer ses propres protéines par réinitiation de la traduction
Translation of mRNAs that harbor upstream open reading frames (uORFs) within their leader regions operates via a reinitiation mechanism. In plants, reinitiation is up regulated by the target of rapamycin (TOR) signaling via phosphorylation of the subunit h of initiation factor 3 (eIF3). The eif3h-1 mutant expressing the C-terminally truncated eIF3h while maintaining high translation initiation efficiency is not active in reinitiation. Cauliflower mosaic virus (CaMV) pregenomic polycistronic RNA is translated via an exceptional mechanism of reinitiation after long ORF translation under control of CaMV protein TAV, which ensures activation of TOR. To find the link between underlying mechanisms, we examined eIF3h function in cellular and viral context. Here we show that eIF3h, if phosphorylated, has a role in recruitment of eIF3 into actively translating ribosomes that is a prerequisite for formation of reinitiation-competent ribosomal complexes. C-terminal truncation of eIF3h abolished its integration into the eIF3 complex and eIF3 loading on polysomes as manifested by the eIF3 core subunit c. We also show that eIF3h as a putative target of TOR/S6K1 binds S6K1 in vitro. eIF3h phosphorylation is not required for eIF3 complex formation. We demonstrated that eIF3h is essential for TAV to activate reinitiation after long ORF translation. Protoplasts derived from eif3h-1 mutant failed to support TAV function in reinitiation, which is restored only upon overexpression of recombinant eIF3h indifferent to its phosphorylation status. eif3h-1 mutant defective in reinitiation was found resistant to CaMV infection suggesting that eIF3h is critical for virus amplification. In contrast, viruses that evolve translation initiation dependent on either cap or the internal ribosome entry site infect reinitiation deficient mutant. Thus, we conclude that TAV exploits the basic cell reinitiation machinery, particularly TOR and eIF3h, to overcome cellular barriers to reinitiation after long ORF translation

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Jacques, Florian. "Rôle des enzymes ALDH10 dans la voie de biosynthèse de la carnitine et la physiologie de la plante chez Arabidopsis." Thesis, Compiègne, 2019. http://www.theses.fr/2019COMP2487.

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La carnitine est un acide aminé non protéinogène présent dans l’ensemble du vivant. Son rôle dans le transport intracellulaire des acides gras est bien caractérisé chez les animaux. Chez les plantes aussi, la carnitine intervient dans le métabolisme lipidique, mais son rôle précis demeure peu documenté. Chez les animaux et les levures, la carnitine est synthétisée à partir de la triméthyllysine (TML) via 4 réactions enzymatiques. L’identification chez les plantes de la TML et de la γ-butyrobétaïne, le précurseur direct de la carnitine, suggère que la voie de biosynthèse de la carnitine chez les plantes est similaire à celle des animaux. Une recherche d’homologues a permis d’identifier les deux aldéhyde déshydrogénases 10 (ALDH10) d’Arabidopsis comme potentiellement impliquées dans la synthèse de γ-butyrobétaïne. Dans le cadre de ce travail de thèse, l’implication des AtALDH10 dans la biosynthèse de carnitine et dans la physiologie de la plante a été étudiée. Dans un premier temps, les AtALDH10 recombinantes ont été caractérisées in vitro. Cette étude indique qu’elles peuvent synthétiser la γ-butyrobétaïne, ainsi que des osmoprotectants. Ensuite, un mutant perte de fonction pour les deux AtALDH10 a été généré et étudié. Il présente une sensibilité accrue au stress salin, une hampe florale plus haute, un nombre plus élevé de hampes florales secondaires, et des siliques de taille réduite contenant moins de graines viables. Les graines parvenant à maturité sont enrichies en protéines et en lipides, et le développement de la plante est plus rapide. Ces résultats suggèrent une intervention des AtALDH10 dans la réponse au stress hydrique, l’architecture de la plante, le développement précoce. La teneur en γ-butyrobétaïne dans les tissus est significativement réduite chez le mutant, confirmant le rôle des AtALDH10 dans la synthèse de γ-butyrobétaïne in planta. La teneur résiduelle en γ-butyrobétaïne semble suffisante pour maintenir une teneur en carnitine inchangée. Cela pose la question de la régulation de la voie de biosynthèse de la carnitine chez les plantes, et suggère un lien entre la γ-butyrobétaïne et la réponse au stress, les voies de signalisation et l’architecture de la plante. Outre ce travail, une recherche bioinformatique a permis d’identifier une protéine d’Arabidopsis dont la structure est proche de celle de l’enzyme humaine responsable de la conversion de la γ-butyrobétaïne en carnitine. L’étude de cette protéine n’a pas confirmé son implication dans la synthèse de carnitine. L’identification et la caractérisation de mutants affectés dans la synthèse de carnitine ou son intervention dans le transport des acides gras serait précieuse pour une meilleure compréhension du rôle de la carnitine chez les plantes
Carnitine is a non-proteinogenic amino acid present in all living organisms. Its role in theintracellular transport of fatty acids is well characterized in animals. In plants also, carnitine islinked to lipid metabolism, but its precise role remains poorly understood. In animals andyeasts, carnitine is synthetized from trimethyllysine (TML) through 4 enzymatic steps. The identification in plant tissues of TML and γ-butyrobetaine, the direct precursor of carnitine,suggests that its biosynthesis follows the same steps. A bioinformatics research of candidatesidentified the two ALDH10 enzymes as possibly involved in the synthesis of γ-butyrobetaine.The present study deals with the characterization of the AtALDH10s, to elucidate their role incarnitine biosynthesis and plant physiology. Firstly, the two AtALDH10s were characterized in vitro. This study demonstrates their capability to synthetize γ-butyrobetaine, as well as osmoprotectants. Secondly, an Arabidopsis loss-of-function for the two AtALDH10 has beenobtained and characterized. This mutant is more sensitive to salt stress, bears a longer main shoot and more secondary shoots, and smaller siliques containing less seeds. Its viable seeds are enriched in proteins and fatty acids, and the seedling development is faster. These resultssuggest an intervention of AtALDH10s in the resistance to osmotic stress, the control of plant architecture and the early development. The γ-butyrobetaine content is reduced in the mutant, confirming the involvement of AtALDH10s in the synthesis of γ-butyrobetaine in planta. The residual content of γ-butyrobetaine seems to be sufficient to maintain an unchanged level of carnitine in the mutant. These results raise the question of the regulation of the carnitine biosynthesis pathway and suggest that γ-butyrobetaine could be involved in response to osmotic stress, signalisation pathways and plant architecture. Besides this work, a bioinformatic research lead to the identification of a protein with a structure close to that of the enzyme involved in the conversion of γ-butyrobetaine into carnitine in humans. However, the characterization of this protein did not confirm its involvement in carnitine biosynthesis. The identification and characterization of mutants impaired in enzymatic activities linked to carnitine, such as its biosynthesis or its intervention in the transport of fatty acids, would be valuable to pave the way of a better understanding of the role of carnitine in plants

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Guirimand, Grégory. "Organisation cellulaire et subcellulaire de la voie de biosynthèse des alcaloïdes indoliques monoterpéniques de Catharantus roseus." Thesis, Tours, 2011. http://www.theses.fr/2011TOUR4014/document.

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Catharanthus roseus est une plante tropicale de la famille des Apocynacées d’intérêt thérapeutique en raison de sa capacité à synthétiser des alcaloïdes indoliques monoterpéniques (AIM) utilisés en chimiothérapie anticancéreuse. La teneur en AIM in planta est très faible notamment en raison d’une haute compartimentalisation cellulaire et subcellulaire de la voie de biosynthèse. Si la compartimentalisation cellulaire était bien caractérisée, très peu de données de localisation subcellulaire in situ étaient disponibles au début de cette thèse. Une connaissance fine de cette compartimentalisation est cependant nécessaire pour identifier les transports inter-compartiment de métabolites intermédiaires, limitant potentiellement le flux métabolique, afin d’améliorer ensuite le rendement de biosynthèse des AIM par ingénierie métabolique. Dans ce contexte nous avons réalisé une étude exhaustive de la localisation subcellulaire des enzymes de cette voie par imagerie GFP dans des cellules de C. roseus transformées par biolistique permettant d’établir un nouveau modèle intégré d’organisation cellulaire et subcellulaire de la biosynthèse des AIM
Catharanthus roseus is a tropical plant from the Apocynaceae family with a great therapeutic value due to its ability to synthesize monoterpene indole alkaloids (MIA) used in cancer treatment. The yields of these molecules in planta are very low due to a very high level of compartmentation of the biosynthetic pathway at both cellular and subcellular levels. While the cellular compartmentation was widely characterized, very few in situ subcellular localization data were available at the beginning of this PhD. An accurate knowledge of this compartmentation is necessary to identify intermediate metabolites transport events from one compartment to another one, in order to increase the MIA biosynthesis yield by metabolic engineering approaches. In this context we have proceed to the exhaustive study of the subcellular localization of these enzymes by in vivo GFP imaging in C. roseus cells transformed by biolistic. Potential interprotein interactions of these enzymes have also been studied by BiFC. Altogether, our results enabled us to draw an integrated model of the cellular and subcellular organization of MIA biosynthesis in situ

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Rondet, Damien. "Caractérisation d'une nouvelle voie de signalisation impliquée dans la défense stomatique et applications agronomiques." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0083.

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La défense pré-invasive ou stomatique est un mécanisme qui consiste en la fermeture des pores stomatiques présents sur les organes aériens des plantes lorsque celles-ci sont en contact avec certains agents pathogènes. Cette fermeture empêche ces derniers de pénétrer dans l’hôte et de le coloniser. Ce mécanisme s’active chez Arabidopsis inoculée par la bactérie Pseudomonas syringae pv tomato (Pst) DC3000. Des travaux préliminaires de notre groupe avaient montré que la carbonylation de protéines cibles par des espèces réactives électrophiles (EREs) représentait une étape cruciale de la signalisation cellulaire nécessaire à la mise en place de cette défense. Par des approches de marquage ciblé et de purifications couplées à des identifications par spectrométrie de masse en tandem (nanoLC-MS/MS), nous avons pu caractériser une sérine-thréonine protéine kinase qui joue un rôle déterminant dans ce mécanisme de défense. En effet, des plantes mutées sur le gène codant cette protéine ont perdu la capacité à induire la fermeture de leurs stomates et à déployer la défense stomatique vis-à-vis de la bactérie. De plus, l’introduction de la chimie click (cycloaddition alcyne-azide catalysée par le cuivre), dans nos approches de marquage, nous a permis d’identifier un ensemble de protéines très probablement carbonylées et susceptibles de jouer un rôle crucial dans ces évènements cellulaires qui contribuent à une part de l’immunité végétale. Enfin, les EREs étant capables d’induire la fermeture des stomates, nous avons cherché à savoir, dans le cadre de l’établissement d’une preuve de concept, si leur application sur des plantes permettrait la protection de ces dernières contre Pst
Pre-invasive or stomatal defense is a mechanism which consists of closing the stomata present at surface of aerial organs of plants when they are in contact with certain pathogens. This closure prevents them from entering and colonizing the host. This mechanism is activated in Arabidopsis inoculated by the bacterium Pseudomonas syringae pv tomato (Pst) DC3000. Preliminary work by our group had shown that carbonylation of target proteins by reactive electrophile species (RES) was a crucial step of the cell signaling required to set up this defense. Through targeted tagging and purifications approaches coupled with tandem mass spectrometry identifications (nanoLC-MS/MS), we have been able to characterize a serine-threonine protein kinase that plays a crucial role in this defense mechanism. Indeed, plants mutated on the gene encoding this protein have lost their ability to trigger stomatal closure and to deploy the stomatal defense against the bacteria. In addition, the use of the click chemistry and notably, the copper-catalyzed alkyne-azide cycloaddition, in our tagging approaches has enabled us to identify a set of proteins that are most likely carbonylated and likely to play a significant role in these cell events that contribute to part of plant immunity. Finally, since RES are able to induce stomatal closure we sought to find out, in the context of establishing a proof-of-concept, whether their application to plants would enable them to be protected against the Pst

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Vialart, Guilhem. "Identification et caractérisation fonctionnelle de gènes impliqués dans la voie de biosynthèse des furocoumarines chez les végétaux supérieurs." Thesis, Université de Lorraine, 2012. http://www.theses.fr/2012LORR0390/document.

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Les furocoumarines sont des métabolites secondaires qui dérivent de la voie de biosynthèse des phénylpropanoïdes. Ces phytoalexines interviennent notamment dans les mécanismes de défense des plantes tels que la résistance aux bioagresseurs. Le déterminisme moléculaire de cette voie de biosynthèse est encore mal connu mais il a néanmoins été démontré depuis les années 1960 que les enzymes catalysant les différentes étapes de la voie la synthèse des furocoumarines appartenaient à différentes familles. Les travaux présentés dans ce document se sont focalisés sur deux familles d'enzymes : les dioxygenases oxoglutarate dépendantes et les cytochromes P450s. La première étape de la voie de biosynthèse des furocoumarines consiste en une ortho-hydroxylation du p-coumarate qui mène à la formation de l'umbelliférone. Basé sur des travaux récents sur Arabidopsis, six gènes codants pour des dioxygénases ont été isolés chez Ruta graveolens, Citrus limetta et Pastinaca sativa. Les protéines correspondantes présentent plus de 58% d'identité avec la Féruloyle 6' Hydroxylase (F6'H) d'A. thaliana. La caractérisation fonctionnelle de ces enzymes a été réalisée dans un système d'expression hétérologue procaryote. Sur les 6 enzymes, trois n'ont pu être exprimée efficacement, et deux présentent une activité F6'H similaire à celle décrite pour A. thaliana. La dernière enzyme dispose de caractéristiques nouvelles non décrites à ce jour. Elle est en mesure de réaliser l'hydroxylation du féruloyle coA et du p-coumaroyle coA. Ces études in vitro ont été complétées par une exploration des fonctions de la protéine dans la plante. Une analyse fine du profil d'expression du gène a permis de mettre en évidence une expression qui est en corrélation avec le niveau de production d'umbelliférone. La fonction de la protéine a également été validée par une analyse des produits formés dans des feuilles de Nicotiana benthamiana transformées transitoirement. Les cytochromes P450 catalysent 60% des réactions de la voie de biosynthèse de furocoumarines. Un travail de criblage fonctionnel de cytochromes P450 identifiés au préalable chez Ammi majus et Thapsia garganica a été entrepris. Les analyses de bio-informatiques et les modifications apportées au niveau du mode opératoire pour l'expression dans la levure ont permis d'émettre des hypothèses concernant le rôle de certains P450 candidats. Ces travaux exploratoires et préliminaires font supposer de nouvelles conjectures relatives à cette voie de biosynthèse
Furanocoumarins are secondary metabolites deriving from the phenylpropanoid biosynthetic pathway. These phytoalexins are especially involved in plant defense mechanisms against insects or phytopatogenous fungi and bacteria. The molecular control of this biosynthetic pathway is still poorly understood even though it has been demonstrated since the 1960s that enzymes catalyzing the different steps are belonging to different enzymatic families. The work presented here is focused on two enzyme families: oxoglutarate dependent dioxygenases and cytochrome P450s. The first step in the furanocoumarins biosynthetic pathway is the ortho-hydroxylation of p-coumarate, which leads to the formation of umbelliferone. Based on a recent work done on Arabidopsis, we isolated six genes encoding dioxygenases from Ruta graveolens, Citrus limetta and Pastinaca sativa. The corresponding proteins share more than 58% identity with the A. thaliana féruloyle 6' Hydroxylase (F6'H). The functional characterization of these enzymes was performed in a prokaryotic heterologous expression system. Of the six enzymes, three could not be functionnaly expressed and two exhibited a similar F6'H activity as described for A. thaliana. The last enzyme has new properties not described to date. It is able to achieve both hydroxylation of féruloyle CoA and p-coumaroyle CoA. These in vitro studies were completed by a functional exploration of the protein in planta. A detailed analysis of the gene expression pattern highlighted a link with the level of umbelliferone synthesis. The function of the protein was also confirmed by an analysis of the products formed in transiently transformed Nicotiana benthamiana leaves. Cytochrome P450s catalyze 60% of the reactions of the furanocoumarin biosynthetic pathway. Therefore, a functional screening of cytochrome P450 previously identified in Ammi majus and Thapsia garganica was undertaken. The bioinformatic analyses and the changes undertaken in the procedure for expression in yeast allowed drawing hypotheses on the function of some of these P450 candidates. These exploratory and preliminary experiments allowed suggesting new hypotheses about the biosynthetic pathway

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Ginis, Olivia. "Identification de facteurs de transcription régulateurs de la voie de biosynthèse des alcaloïdes indoliques monoterpéniques chez Catharanthus roseus." Thesis, Tours, 2012. http://www.theses.fr/2012TOUR4014/document.

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Catharanthus roseus est une plante tropicale qui produit spécifiquement des alcaloïdes indoliques monoterpéniques (AIM) d’intérêt thérapeutique. Chez C. roseus, la branche terpénique incluant la voie du méthylérythritol phosphate (MEP) est considérée comme limitante et présente une régulation transcriptionnelle coordonnée en réponse aux hormones inductrices de l’accumulation alcaloïdique. Lors de ce travail, suite à des analyses bioinformatiques et à la caractérisation de promoteurs de gènes de la voie MEP, nous avons identifié de nouvelles familles de facteurs de transcription impliquées dans la régulation de la biosynthèse des AIM. Des membres de la famille des ZCT, des WRKY et des RR type B interagissent avec le promoteur du gène hds de la voie MEP et régulent son activité. Ces travaux ont permis d’approfondir les connaissances sur les réseaux transcriptionnels régulateurs de la biosynthèse des AIM. L’utilisation de ces nouveaux facteurs de transcription activateurs peut désormais être envisagée dans le cadre d’expériences d’ingénierie métabolique afin d’augmenter l’accumulation d’alcaloïdes d’intérêt pharmaceutique chez C. roseus
Catharanthus roseus is a tropical plant producing specifically monoterpene indole alkaloids (MIA) of high interest due to their therapeutical values. In C. roseus cells, the terpenoid branch including the methyl erythritol phosphate pathway (MEP) provides the MIA terpenoid moiety and is regarded as limited for MIA biosynthesis. This branch presents a coordinated transcriptional regulation in response to hormonal signals leading to MIA production. In this context, bioinformatic analysises and functional characterization of MEP pathway gene promoters allowed the identification of new transcription factor families involved in the MIA pathway regulation. Members of ZCT proteins, WRKY and type B RR families specifically interact with the hds promoter from the MEP pathway and regulate its activity. This work permits to gain into insight the transcriptional network controlling the MIA biosynthesis. It is possible now to consider using transcription factor that act as activators and target genes from the terpenoid branch to increase the accumulation of alkaloids of pharmaceutical interest in C. roseus by metabolic engineering approaches

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Gakière, Bertrand. "Dérégulation de la biosynthèse de la méthionine chez les plantes supérieures : analyses phénotypiques, moléculaires et biochimiques de plants d'Arabidopsis thaliana exprimant des ARN antisens ou sens de la cystathionine [gamma]-synthase ou de la cystathionine [bêta]-lyase." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1999. http://www.theses.fr/1999GRE10058.

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Анотація:

Les plantes, a la difference des autres eucaryotes, possedent tout l'equipement enzymatique necessaire a la synthese de novo de methionine, un aminoacide qui, outre ses roles dans la synthese proteique, est aussi le precurseur, via la s-adenosylmethionine, de la plupart des methylations cellulaires mais aussi de la synthese de l'ethylene, des polyamines et de la biotine. L'importance de cet aminoacide chez les plantes est attestee par l'utilisation d'inhibiteurs provoquant des carences avec leurs corteges d'effets dramatiques sur la croissance et la developpement des plantes. Malgre la caracterisation recente des trois enzymes de la voie metabolique, la cystathionine -synthase, la cystathionine -lyase et la methionine synthase, leur regulation reste a eclaircir. Des strategies arn antisens et sens ont ete developpees ciblant les deux premieres enymes de la voie afin d'y identifier les etapes regulatrices clef. Les plantes d'arabidopsis exprimant l'arn antisens de la cystathionine -synthase montrent une modeste diminution de la teneur en methionine malgre une reduction dramatique du niveau de l'enzyme ciblee. Cette diminution de la teneur en methionine engendre de nombreuses alterations phenotypiques qui peuvent etre presque entierement compensees par un apport de methionine exogene. Les plantes d'arabidopsis exprimant l'arn antisens de la cystathionine -lyase presentent une augmentation de l'activite cystathionine -lyase, ce qui est contraire aux resultats attendus. Les premieres mesures effectuees dans ces plantes indiquent la presence d'une autre enzyme pouvant utiliser la cystathionine comme substrat. Il en resulte une augmentation du niveau de methionine libre dans la plante. Les plantes obtenues par une strategie antisens ciblant la cystathionine -lyase sont naines et fleurissent prematurement alors que celles obtenues par une strategie sens sont massives et de floraison tardive et ne surproduisent pas de methionine, suggerant une interconnection entre metabolisme de base et mecanismes hormonaux. Les plantes d'arabidopsis exprimant l'arn sens de la cystathionine -synthase presentent une elevation du niveau d'homocysteine et de methionine libre pouvant s'accompagner de difficultees developpementales. L'existence de phenotypes affectant les etapes de germination et de mise a fleur ainsi que la taille des organes nous conduisent a envisager une etude de la regulation spatiotemporelle de la biosynthese de la methionine chez les plantes. Le clonage de la methionine synthase, ultime etape de la synthese de la methionine, nous permettra d'etendre nos investigations. Cette etude nous apporte une comprehension nouvelle de la biosynthese de la methionine chez les vegetaux superieurs qui pourrait permettre l'amelioration de la qualite nutritionnelle des alimentations d'origine vegetale et de valider les enzymes de la biosynthese de la methionine en tant que cibles herbicides potentielles.

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Дисертації з теми "Plantes en voie de disparition"

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