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Дисертації з теми "Plant diseases Epidemiology"

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1

Constable, Fiona Elizabeth. "Biology and epidemiology of Australian grapevine phytoplasmas." Title page, contents and abstract only, 2002. http://web4.library.adelaide.edu.au/theses/09PH/09phc756.pdf.

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2

Green, Kim Rebecca. "Studies on the epidemiology and control of yam anthracnose." Thesis, University of Reading, 1994. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.359525.

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3

Jenkinson, Peter. "Epidemiology of Fusarium in winter wheat (Triticum aestivum L.)." Thesis, Open University, 1994. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.386201.

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4

Williams, Iain S. "Aphid plant interactions and the epidemiology of sugar beet yellowing viruses." Thesis, University of East Anglia, 1997. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.389388.

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5

Pangga, Ireneo B. "Effects of elevated CO2 on plant architecture of Stylosanthes scabra and epidemiology of anthracnose disease /." [St. Lucia, Qld.], 2001. http://www.library.uq.edu.au/pdfserve.php?image=thesisabs/absthe16215.pdf.

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6

Lamptey, Joseph Nee Lante. "Impact and epidemiology of barley yellow dwarf viruses on potential biomass crops in the UK." Thesis, University of Reading, 1996. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.308052.

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7

Read, Peter James. "Epidemiology, effects and control of black dot disease of potato caused by the fungus Colletotrichum coccodes." Thesis, Cranfield University, 1993. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.359622.

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8

Bisnieks, Maris. "Barley yellow dwarf epidemiology /." Uppsala : Dept. of Entomology, Swedish University of Agricultural Sciences, 2006. http://epsilon.slu.se/200675.pdf.

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9

Botha, Adri. "A study on the etiology and epidemiology of black root rot of strawberries in the Western Cape." Thesis, Stellenbosch : Stellenbosch University, 2002. http://hdl.handle.net/10019.1/52712.

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Анотація:
Thesis (MScAgric)--University of Stellenbosch, 2002.
ENGLISH ABSTRACT: Historically root diseases have been a production-limiting problem for the strawberry industry worldwide. In the Western Cape Province of South Africa the most serious root disease is black root rot, which causes losses of up to 30%, annually. The aims of this study were to investigate aspects of the etiology and epidemiology of this disease in the Western Cape, and to provide information that can be incorporated in an integrated disease management strategy. In Chapter I a summary of published information on this disease is presented. Disease symptoms include severe stunting of plants, which have black, rotted, reduced root systems. Even though this disease is of great economic importance, the etiology remains unresolved. However, soilborne fungal root pathogens, particularly Pythium and Rhizoctonia spp. have been implicated as major role players. Control of this disease, as well as the other root diseases affecting strawberries, has relied on soil fumigation with broad spectrum chemical fumigants, in particular methyl bromide. However, due to the ozone depleting action of methyl bromide it was decided at the signing of the Montreal Protocol to remove this chemical from the market. This action has caused great demand for alternative measures to control root diseases on many crops including strawberries. Development of integrated disease management strategies is dependent upon a more complete understanding of the etiology, biology and ecology of the disease complex. In Chapter 2 fungal pathogens associated with diseased plants were isolated and Koch's postulates were carried out. The most frequently isolated fungal pathogens were Pythium irregulare, Rhizoctonia spp. and Cylindrocarpon destructans. Two morphotypes of Rhizoctonia were isolated viz. a brown and a white type. Pythium irregulare was isolated more frequently in July than in September, and was not isolated at all in November. Rhizoctonia spp. were present at all sampling dates but were more frequently isolated in November than at the other times. All the fungi that were tested were pathogenic and caused root lesions. Cylindrocarpon destructans and Coniella fragariae did not have a stunting effect on the plants. These results confirm a major role for Pythium and Rhizoctonia in the black root rot complex and suggest that there is a complimentary seasonal variation in occurrence between these two pathogens. The Rhizoctonia species and anastomosis groups of isolates obtained from diseased strawberries in the Western Cape Province were determined, and their pathogenicity and relative virulence assessed. Both binucleate and multinucleate types were recovered from diseased roots and identified as R. fragariae and R. so/ani, respectively. All isolates of R. solani were members of anastomosis group (AG) 6, whereas three AG types were identified among isolates of R. fragariae, viz. AG-A, AG-G and AG-I at a relative occurrence of 69%, 25%, 6% respectively. All Rhizoctonia isolates were pathogenic to strawberry, but R. solani (AG 6) was the most virulent causing severe stunting of plants. This is the first species confirmation and AG type identification of Rhizoctonia taxa causing root rot of strawberries in South Africa. An assessment of the presence and quantity of black root rot pathogens associated with soils prior to fumigation and post fumigation with methyl bromide, was made in Chapter 4. Isolations were also made from nursery plants to determine whether any black root rot pathogens were in the plants before transplanting. Results demonstrated that after fumigation the soil was free of all pathogenic fungi associated with the disease. However, the main pathogens involved in black root rot, viz. Rhizoctonia fragariae, R. solani and Pythium spp. were isolated from nursery plants. The fact that the plants are already infected with these pathogens renders the prospects for control of this disease difficult. Further studies are urgently required to develop production practices that can be included in disease management programmes. In vitro studies were carried out to determine the ECso values of different fungicides for isolates of Pythium irregulare, Rhizoctonia fragariae AG-A, AG-G and AG-I and R. solani AG 6. Benomyl, fludioxonil and tolc1ofos-methyl were used in these tests. Field trials were also conducted using these fungicides. In Chapter 5 it is shown that in general application of fungicides improved the yield and did not affect the survival rate of strawberry plants. Fludioxonil showed potential for short-term use. Applications of fungicides that targeted specific fungal genera were not sufficient to control the disease. Seasonal fluctuation of Pythium and Rhizoctonia spp. became apparent with the occurrence of Pythium being relatively high early in the season but low late in the season. Conversely, the occurrence of Rhizoctonia was low at the beginning of the season but high late in the season. In the short-term there is potential for fungicide applications as part of an integrated disease management strategy, but the economic feasibility of this practice needs to be assessed. In this study the major pathogens causing black root rot were identified in the Western Cape Province of South Africa, and important information regarding the epidemiology of the disease was reported. These results can be incorporated in an integrated management strategy to reduce losses of strawberry production, attJibutable to black root rot.
AFRIKAANSE OPSOMMING: Wortelsiektes is wêreldwyd 'n produksie-beperkende probleem vir die aarbeibedryf. . Swartwortelvrot, wat jaarliks verliese van tot 30% veroorsaak, is die belangrikste wortelsiekte in die Wes-Kaap Provinsie van Suid-Afrika. Die doelwitte van hierdie studie was om aspekte van die etiologie en epidemiologie van die siekte in die Wes- Kaap te ondersoek en inligting wat in geïntegreerde siektebestuurstrategië ingesluit kan word, te voorsien. In Hoofstuk 1 word 'n opsomming van gepubliseerde inligting aangaande die siekte uiteengesit. Siektesimptome sluit ernstige verdwerging van plante met swart verotte en verkleinde wortelstelsels in. Alhoewel die siekte van groot ekonomiese belang is, is die etiologie grootliks onbekend. Grondgedraagde wortelpatogene swamme, spesifiek Pythium en Rhizoctonia spp., is egter as belangrike rolspelers geïdentifiseer. Tot dusver het die beheer van hierdie siekte sowel as ander wortelsiektes van aarbeie berus op grondberoking met breë spektrum chemiese berokingsmiddels, spesifiek metielbromied. As gevolg van die osoonafbrekende aksie van metielbromied is daar egter tydens die ondertekening van die Montreal Protocol besluit om dié middel van die mark te verwyder. Hierdie besluit het 'n groot aanvraag na alternatiewe beheermaatreëls vir wortelsiektes van verskeie gewasse, insluitende aarbeie, veroorsaak. Die ontwikkeling van geïntegreerd siektebestuurstrategieë is egter afhanklik van 'n meer volledige begrip van die etiologie, biologie en ekologie van die siektekompleks. In Hoofstuk 2 is die patogene swamme wat met die siekte geassosieer word, geïsoleer, en is Koch se postulate uitgevoer. Die mees algemeen geïsoleerde patogene swamme was Pythium irregulare, Rhizoctonia spp. en Cylindrocarpon destructans. Twee morfotipes van Rhizoctonia is geïsoleer, nl. 'n bruin tipe en 'n wit tipe. Pythium irregulare is meer dikwels in Julie as in September geïsoleer, maar glad nie in November nie. Rhizoetonia het tydens alle monstertye voorgekom, maar is meer dikwels in November geïsoleer. Al die swamme wat getoets is, was patogenies en het letsels op die wortels veroorsaak. Cylindroearpon des true tans en Coniella fragariae het nie'n verdwergingseffek op plante gehad nie. Hierdie resultate bevestig die dominante rol van Pythium en Rhizoctonia in die swartwortelvrot kompleks en dui op 'n komplementêre seisoenale variasie in die voorkoms van hierdie twee patogene. Die Rhizoctonia spesies en anastomose groepe (AG) van die isolate geisoleer vanaf siek aarbeiplante in die Wes-Kaap Provinsie is bepaal, en die patogenisiteit en relatiewe virulensie is beraam. Sowel tweekernige as multikernige tipes is vanaf siek wortels geïsoleer en respektiewelik as R. fragariae en R. so/ani geïdentifiseer. Alle isolate van R. so/ani was lede van anastomose groep 6, terwyl drie AG tipes, nl. AGA, AG-G en AG-I onder die R. fragariae isolate geïdentifiseer is met relatiewe voorkomste van 69%, 25%, 6% respektiewelik. Alle Rhizoctonia isolate was patogenies op aarbeie, maar R. so/ani (AG 6) was die mees virulente en het ernstige verdwerging van plante veroorsaak. Hierdie is die eerste bevestiging van spesies en identifisering van AG tipes van Rhizoctonia taksa wat wortelvrot van aarbeie in Suid Afrika veroorsaak. In Hoofstuk 4 is 'n beraming van die voorkoms en hoeveelheid swartwortelvrot patogene geassosieer met grond voor, en na beroking met metielbromied, gemaak. Isolasies is ook vanaf kwekeryplante gemaak om te bepaal of enige swartwortelvrot patogene voor oorplanting in die plante teenwoordig was. Die resultate het getoon dat grond na beroking vry was van alle patogeniese swamme geassosieër met die siekte. Die hoof patogene betrokke in die swartwortelvrot kompleks, nl. Rhizoctonia fragariae, R. so/ani en Pythium spp. was egter in die kwekery plante teenwoordig. Die feit dat plante reeds met hierdie patogene geïnfekteer is, maak die vooruitsigte vir die beheer van hierdie siekte moeilik. Verdere studies word dringend benodig vir die ontwikkeling van produksiepraktyke wat by siektebestuursprogramme ingesluit kan word. In vitro studies om die ECso waardes van die isolate van Pythium irregulare, Rhizoctonia fragariae AG-A, AG-G en AG-I en R. so/ani AG 6 vir die fungisiedes benomyl, fludioxonil en tolclofos-metiel te bepaal, is uitgevoer. Hierdie fungisiedes is ook in veldproewe getoets. In Hoofstuk 5 is getoon dat aanwending van fungisiedes die opbrengs verbeter het en nie die oorlewing van aarbeiplante beïnvloed het nie. Fludioxonil het potensiaal vir korttermyn gebruik getoon. Die aanwending van fungisiedes wat spesifieke swamgenera teiken, was nie voldoende om die siekte te beheer nie. Seisoenale fluktuasies van Pythium en Rhizoctonia spp. het duidelik geword met die relatief hoë voorkoms van Pythium vroeg in die seisoen, maar lae voorkoms laat in die seisoen, terwyl die voorkoms van Rhizoctonia laag was aan die begin van die seisoen, maar hoog later in die seisoen. In die korttermyn is daar potensiaal vir fungisiedtoedienings as deel van 'n geïntegreerde siektebestuurstrategie, maar die ekonomiese haalbaarheid van hierdie praktyk moet bepaal word. In hierdie studie is die hoof patogene wat swartwortelvrot van aarbeie in die Wes-Kaap Provinsie van Suid-Afrika veroorsaak geïdentifiseer, en belangrike inligting rakende die epidemiologie van die siekte is aangeteken. Hierdie resultate kan in 'n geïntegreerde bestuurstrategie geïnkorporeer word om verliese van aarbeiproduksie, toeskryfbaar aan swartwortelvrot te, verminder.
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10

Jordan, Stephen Andrew. "Epidemiology and etiology of Eutypa dieback of grapevine and partial characterization of Eutypella vitis, a new pathogen of grapevine." Diss., Connect to online resource - MSU authorized users, 2008.

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11

Pretorius, Mathys Cornelius. "Epidemiology and control of Pseudocercospora angolensis fruit and leaf spot disease on citrus in Zimbabwe." Thesis, Stellenbosch : Stellenbosch University, 2005. http://hdl.handle.net/10019.1/20938.

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Анотація:
Thesis (MScAgric)--University of Stellenbosch, 2005.
ENGLISH ABSTRACT: Fruit and Leaf Spot Disease (FLSD) of citrus, caused by Phaeoramularia angolensis, is found only in 18 countries in Africa, the Comores Islands in the Indian Ocean and Yemen in the Arabian peninsula. The major citrus export countries in Africa are Morocco, South Africa, Swaziland, and Zimbabwe. Zimbabwe is the only country affected by FLSD. FLSD is a disease of major phytosanitary and economic importance and its devastating effect on citrus is highlighted by the fact that the damage is cosmetic, which renders the fruit unmarketable. Total crop losses are not uncommon in Kenya. The aims of the present study, therefore, was was to determine the occurrence of P. angolensis in Zimbabwe and neighbouring Mozambique, to compare these isolates with the Cercospora Fresen. isolates from Swaziland and South Africa, to determine the epidemiology of the pathogen and to implement an effective control strategy to prevent the spread of FLSD. Leaf samples with citrus canker-like lesions collected in the early 1990’s in Zimbabwe were found to be infected by the fungus, Phaeoramularia angolensis. Surveys were undertaken to determine the spread and intensity of FLSD in Zimbabwe and Mozambique. In Zimbabwe, P. angolensis was limited to an area above the 19° south latitude, predominantly the moist areas and not the low-lying drier parts of the country. In Mozambique, no P. angolensis symptoms were found. Observations during the survey indicated that no proper management systems were implemented by Zimbabwean growers. A cercosporoid fungus causing a new Fruit and Leaf Spot Disease on Citrus in South Africa was identified. From morphological and rDNA sequence data (ITS 1, 5.8S and ITS 2), it was concluded that the new disease was caused by Cercospora penzigii, belonging to the Cercospora apii species complex. The genera Pseudophaeoramularia and Phaeoramularia are regarded as synonyms of Pseudocercospora, and subsequently a new combination was proposed in Pseudocercospora as P. angolensis. Cercospora gigantea was shown to not represent a species of Cercospora, while Mycosphaerella citri was found to be morphologically variable, suggesting that it could represent more than one taxon. A control strategy for the control of FLSD was evaluated in the study. The data showed that P. angolensis in Zimbabwe can be managed successfully by the removal of all old and neglected orchards, and on timely fungicide applications. Trifloxystrobin + mancozeb + mineral spray oil (20 g + 200 g + 500 ml/100 l water) applied in November, January and March was the most effective treatment. Three applications of benomyl + mancozeb + mineral spray oil (25 g + 200 g + 500 ml/100 l water) applied during the same period, was the second most effective treatment, and two applications (November and January) of trifloxystrobin + mineral spray oil (20g + 500 ml/100 l water) and difenoconazole (40 g) per 100 l/water applied twice in November and January, the third most effective treatment. The spore trap and weather data showed that P. angolensis needs high moisture and temperatures in excess of 25°C for disease development. It is concluded that P. angolensis in Zimbabwe can be managed successfully by implementing a holistic approach, which should be supported by the authorities, organised agriculture and all technical personnel involved in citrus production.
AFRIKAANSE OPSOMMING: Blaar- en vrugvleksiekte (BVVS) op sitrus, veroorsaak deur Phaeoramularia angolensis, kom in 18 lande in Afrika voor asook die Comores Eilande in die Indiese Oseaan en Yemen op die Arabiese skiereiland. Marokko, Suid Afrika, Swaziland en Zimbabwe is die belangrikste uitvoerders van sitrus in Afrika. Van dié lande het slegs Zimbabwe blaar en vrugvleksiekte op sitrus. Hierdie siekte is van fitosanitêre en ekonomiese waarde en die nadelige effek van die siekte, wat slegs kosmetiese van aard is, is venietigend aangesien vrugte onbemarkbaar is. Totale opbrengsverliese is nie ongewoon in lande soos Kenya nie. Die doelwitte van die studie was dus om die voorkoms van P. angolensis in Zimbabwe te bepaal, om die Cercospora Fresen. isolate vanaf Swaziland en Suid-Afrika met mekaar te vergelyk, om die epidemiologie van die siekte vas te stel en om ‘n effektiewe beheermaatreël teen die siekte te ondersoek. Blaarmonsters met kankeragtige letsels wat in die vroeë 1990’s in Zimbabwe gevind is, het getoon dat die blare geinfekteer is met die swam, Phaeoramularia angolensis. Ondersoeke is geloots om die verspreiding en intensiteit van BVVS in Zimbabwe en Mosambiek te bepaal. In Zimbabwe was gevind dat P. angolensis beperk was tot gebiede bo die 19° Suid breedtegraad, wat die hoër vogtiger gebiede insluit eerder as die droeër, laagliggende gebiede. Geen P. angolensis simptome kon in Mosambiek gevind word nie. Tydens die opnames was dit duidelik dat geen geskikte beheerstrategieë toegepas word deur Zimbabwe se produsente nie. ‘n Nuwe cercosporoid swam, wat blaar en vrugvleksiekte op sitrus is in Suid Afrika veroorsaak is geidentifiseer. Morfologiese en rDNA volgorde (ITS 1, 5.8S en ITS 2) data het getoon dat die siekte veroorsaak word deur Cercospora penzigii wat tot die Cercospora apii spesie kompleks behoort. Die genus Pseudophaeoramularia kan as sinoniem van Pseudocercospora beskou word en ‘n nuwe kombinasie word voorgestel in Pseudocercospora as P. angolensis. Cercospora gigantea het getoon dat dit nie ‘n spesie van Cercospora kon verteenwoordig nie terwyl Mycosphaerella citri varieërend voorkom en meer as een takson kan verteenwoordig. ‘n Beheerstrategie vir die beheer van BVVS is ondersoek. Die data wys dat P. angolensis in Zimbabwe doeltreffend beheer kan word deur die uitroeiing van ou en verwaarloosde bome, en deur goed beplande fungisied bespuiting. Trifloxystrobin + mancozeb + minerale spuitolie (20 g + 200 g + 500 ml/100 l water), wat in November, Januarie en Maart toegedien is, was die mees effektiefste behandeling. Drie bespuitings van benomyl + mancozeb + minerale spuitolie (25 g + 200 g + 500 ml/100 l water) wat oor dieselfde tydperk toegedien is, was die naas beste behandeling. Trifloxystrobin (20 g) + minerale spuitolie (500 ml) per 100 l/water en difenoconazole (40 g) per 100 l/water, beide as twee bespuitings toegedien in November en Januarie, het die derde beste resultaat opgelewer. Die spoorlokval en klimatologiese data het getoon dat P. angolensis vogtige toestande en temperature hoër as 25°C benodig vir siekteontwikkeling. Die afleiding uit die studie is dat P. angolensis suksesvol beheer kan word indien ‘n holistiese benadering gevolg word en alle rolspelers naamlik die owerheid, georganiseerde landbou en tegniese personeel die proses ondersteun.
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Van, der Linde Ella Johanna. "Ergot of nut sedge in South Africa." Thesis, Pretoria : [s.n.], 2005. http://upetd.up.ac.za/thesis/available/etd-08042008-081413/.

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Angeli, Sthela de Siqueira. "Epidemiologia comparativa de podridão do pessegueiro causada por Monilinia fructicola e Monilinia laxa: o monociclo." Universidade de São Paulo, 2009. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-11032009-154402/.

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Анотація:
Frente à recente detecção em território brasileiro de Monilina laxa, que assim como M. fructicola, é causadora da podridão parda do pessegueiro, e à falta de informações sobre a epidemiologia dos patógenos causadores da doença em regiões subtropicais, surgiu a necessidade deste trabalho, que teve por objetivos determinar as melhores condições de temperatura e molhamento para o desenvolvimento de M. fructicola e M. laxa in vitro e para a infecção e colonização pêssegos por conídios dos patógenos. Quatro isolados de M. fructicola e um isolado de M. laxa, provenientes de plantios do Estado de São Paulo e mantidos no laboratório de Epidemiologia da ESALQ, foram estudados. Foram avaliados os efeitos da temperatura e da duração do molhamento na germinação dos conídios in vitro e o efeito da temperatura no crescimento micelial e na esporulação dos patógenos. Ensaios para determinar a sensibilidade dos patógenos ao fungicida iminoctadina também foram conduzidos. Adicionalmente, pêssegos maduros foram adquiridos, feridos, inoculados com suspensão de conídios e incubados em diferentes temperaturas sob diferentes períodos de câmara úmida. Diariamente incidência e severidade foram avaliadas. A esporulação foi avaliada ao final de cada tratamento. A faixa ótima de temperatura para germinação de conídios de M. laxa, de 5 a 30ºC, é maior que a de M. fructicola, de 10 a 30ºC. O período de molhamento não teve influência na germinação dos conídios. A melhor faixa de temperatura para crescimento micelial tanto de M. fructicola quanto M. laxa de foi de 20 a 25ºC. A esporulação de M. laxa foi inversamente proporcional à temperatura de incubação. Não houve relação entre temperatura e produção de esporos em M. fructicola. Ambas as espécies mostraram-se sensíveis, in vitro, à molécula iminoctadina. A incidência da podridão parda foi superior a 80,9% em todos os tratamentos, para as duas espécies fúngicas. A 10ºC os períodos de incubação e de latência foram menores para M. laxa que para M. fructicola. A faixa ótima de temperatura para o desenvolvimento de lesões variou de 15 a 25ºC para os dois patógenos. A esporulação dos patógenos não mostrou relação com a temperatura nos ensaios in vivo. Diferenças nos sinais da espécie do patógeno foram observados nas lesões.
Due to the recent detection in Brazil of Monilinia laxa, that similar to M. fructicola causes the brown rot of peaches, and the lack of information about the epidemiology of the causal agents of this disease from subtropical regions, raised the need of such a study, which the aims were to determine the best temperature and wetness duration conditions to the development of M. fructicola and M. laxa in vitro and to infection and colonization of peaches by conidia from both pathogens. Four M. fructicola isolates and one M. laxa isolate, collected from infected fruit of São Paulo orchards and maintained at the Epidemiology Laboratory at ESALQ, were studied. Temperature and wetness duration effects on conidia germination in vitro and temperature effects on mycelial growth and sporulation of pathogens were evaluated. Trials to evaluate the sensitivity of isolates to the fungicide iminoctadine were also conducted. Furthermore, mature peaches were wounded on the surface, inoculated with a conidia suspension and incubated at different temperatures during different wet chamber periods. Incidence and severity of the disease were evaluated daily. Sporulation was evaluated at the end of each treatment. The favorable range of temperature to conidia germination of M. laxa, from 5 to 30ºC, was greater than M. fructicola range, from 10 to 30ºC. The wetness duration showed no influence on conidia germination. The best range of temperature for mycelial growth of both M. fructicola and M. laxa was from 20 to 25ºC. Sporulation of M. laxa showed an inverse relationship to the incubation temperature. No relationship between temperature and conidia production was found for M. fructicola. Both species were sensitive to the iminoctadine fungicide in vitro. Incidence of brown rot was greater than 80.9% in all treatments, for both species. At 10ºC incubation and latency periods were shorter for M. laxa than for M. fructicola. The best temperatures for lesion development varied between 15 and 25ºC for both pathogens. Sporulation of the two species showed no relationship to the temperature on the in vivo trials. Visual differences were observed on pathogen symptoms on fruit.
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Narita, Nobuyoshi 1961. "Epidemiologia do "Cowpea aphid borne mosaic virus" (CABMV) em maracujazeiros na região produtora da Alta Paulista, SP /." Botucatu : [s.n.], 2007. http://hdl.handle.net/11449/103210.

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Анотація:
Resumo: Dos vírus que infectam o maracujazeiro no Brasil, atualmente o Cowpea aphid borne mosaic virus (CABMV), é considerado fator limitante à cultura. Dependendo da velocidade de disseminação e idade com que as plantas são infectadas no campo, a cultura torna-se comercialmente improdutiva. O presente estudo teve como objetivo, avaliar a diversidade e a dinâmica populacional dos afídeos na região da Alta Paulista, SP e a possibilidade de transmissão do vírus pela semente. Assim, quatro locais (Leste e Oeste da cidade de Marília e Municípios de Ocauçú e Guaimbê) foram monitorados durante 24 meses com armadilhas amarelas de água do tipo Moericke. Constatou-se nas quatro regiões a predominância do gênero Aphis. Outras espécies coletadas foram Myzus persicae, Geopenphigus flocculosus, Brevicoryne brassicae, Rhopalosiphum spp, Dysaphis spp e Lipaphis erysimi. A flutuação populacional de formas aladas do gênero Aphis, caracterizou-se por apresentar maiores revoadas em maio, junho, agosto e setembro. As espécies de Aphis (A. fabae, A. gossypii, A. spiraecola) devem ser os principais vetores do CABMV na região. Plantios novos, ao lado de plantações infectadas, tornam-se infectadas em três meses. Nos testes de transmissão através de sementes, do total de 13056 semeadas oriundas de plantas doentes, germinaram 10592, e em avaliações visuais dois meses após a germinação, não foram observadas plantas sintomáticas, indicando a não transmissão pela semente.
Abstract: From the viruses were described infecting passionfruit plants in Brasil, and the Cowpea aphid borne mosaic virus (CABMV), is considered the most hazardous. Depending on the spread velocity of aphids and the age that the plants are infected, the crops doesn’t produce commercial fruits. The present study was designed to evaluate the diversity and dynamic population of aphids in the Alta Paulista, SP region and aspects of seed transmission. For this, four regions (East and West of Marília city, Guaimbê and Ocauçú) were monitored for 24 months using yellow water Moerick trap. The predominance of the genus Aphis was observed in the four evaluated areas. Other species founded in the area were: Myzus persicae, Geopenphigus flocculosus, Brevicoryne brassicae, Rhopalosiphum spp, Dysaphis spp and Lipaphis erysimi. The population curve of alate Aphis spp showed the highest frequency of flights during May, June, August and September. The Aphis spp (A. fabae, A. gossypii, A. spiraecola) probably is the most important vector of the CABMV in the region. New crops near old infected plants, were infected in three months. To evaluate properties of seed transmission, from 13056 collected from infected plants, 10592 were germinated and evaluated during two months for the presence of visual symptoms. No plants with simptoms were observed indicating no seed transmission.
Orientador: Marcelo Agenor Pavan
Coorientador: Valdir Atsushi Yuki
Banca: Renate Krause Sakate
Banca: Aloisio Costa Sampaio
Banca: Alexandre Levi R. Chaves
Banca: Hugo Kuniyuki
Doutor
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Santos, Eduardo Alvarez. "Duração do período de molhamento foliar: medida com sensores eletrônicos, variabilidade espacial em culturas e estimativa com modelos empíricos." Universidade de São Paulo, 2006. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11131/tde-09102006-140013/.

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A duração do período de molhamento (DPM) é de grande importância para a epidemiologia de doenças de plantas, pois desempenha papel fundamental em alguns processos epidemiológicos. Dessa forma, sua determinação torna-se indispensável para o entendimento da relação entre o clima e doenças de plantas. Sendo assim, este estudo teve como objetivos: definir uma posição padrão de instalação de sensores cilíndricos para a medida da DPM sobre gramado, avaliar a variabilidade espacial dessa variável em três diferentes culturas, relacionar a DPM medida em culturas agrícolas com aquela obtida em posto meteorológico e comparar a estimativa da DPM obtida com modelos empíricos com aquela medida com sensores eletrônicos. Na fase anterior à sua instalação no campo, todos os sensores eletrônicos foram previamente pintados com tinta látex e tratados termicamente. Após essa etapa, os sensores cilíndricos foram instalados sobre gramado a 30 cm de altura voltados para o sul. No período inicial, os sensores cilíndricos foram mantidos paralelos à horizontal, visando-se a avaliar a variabilidade entre os mesmos. Posteriormente, foram testados cinco diferentes ângulos de instalação. As medidas obtidas por esses sensores foram comparadas com a medida padrão, obtida por sensor de placa a 30 cm de altura e 45º de inclinação. Com a finalidade de se avaliar a variabilidade espacial da DPM, sensores eletrônicos de DPM foram distribuídos no dossel de três culturas: algodão, banana e café. As medidas obtidas nessas culturas foram comparadas com as fornecidas por sensor de placa em posição padrão. A estimativa da DPM foi feita por meio dos seguintes modelos: NHUR > 87%, CART, DPO e limiar estendido de umidade relativa para os períodos seco e chuvoso. As medidas obtidas por sensores cilíndricos sobre gramado apresentaram boa acurácia e precisão. A variação do ângulo de instalação não demonstrou ter efeito expressivo sobre a medida dos sensores cilíndricos para as condições locais. Contudo, é recomendável inclinar o sensor cilíndrico, uma vez que, trabalhos anteriores demonstram que esse pode superestimar a DPM quando instalado na horizontal. A avaliação da variabilidade espacial da DPM demonstrou que essa variável é influenciada pelas condições determinantes do microclima das culturas. O padrão de variação da DPM foi distinto para cada uma das culturas. Na cultura do algodão não foram observadas variações expressivas da DPM. Já no cafeeiro a DPM foi mais longa nas partes baixas da planta, enquanto que na cultura da banana essa foi mais longa no topo da cultura. Foram obtidas boas relações entre a DPM medida sobre gramado e aquela obtida no topo das culturas, demonstrando que é possível estimar tal variável por meio de dados obtidos em posto meteorológico. Os modelos NHUR > 87%, CART e DPO forneceram boas estimativas da DPM com erro absoluto médio variando de 1,4 a 2,8 h nos dois períodos avaliados. Durante a estação seca, os três primeiros modelos tenderam a subestimar a DPM. O modelo do limiar estendido de umidade relativa foi o que apresentou o pior desempenho entre os modelos avaliados, não sendo recomendável sua aplicação para condições semelhantes às deste estudo.
Leaf wetness duration (LWD) is a very important variable for plant disease epidemiology, since it plays an important role in some epidemiological processes. So its determination is essential for the understanding of the climate and plant disease relationship. Therefore, the objectives of this study were: to determine the standard deployment for cylindrical LWD sensors over turfgrass; to assess the spatial variability of this variable in three different crops; to relate the LWD measured at three different crop canopies to that obtained in a weather station; and to compare the LWD estimated by empirical model with that measured by electronic sensors. Before the field assessments, all electronic sensors were painted with white latex paint and submitted to a heat treatment. After this first stage, all cylindrical sensors where installed over turfgrass at 30-cm height deployed facing south. Firstly, all cylindrical sensors were deployed at horizontal in order to assess the variability among them. After that, five different deployment angles were tested. The measurements provided by those sensors were compared with the standard measurement, provided by flat plate sensors at 30-cm height and deployed at 45º. In order to assess the LWD spatial variability, electronic sensors were placed in three different crop canopies: cotton, banana and coffee. The measurements obtained in those crops were compared with LWD measured by flat plate sensors in a standard deployment over turfgrass. LWD were estimated using the following models: NHRH>87%, CART, DPD e extended threshold of relative humidity, for the dry and wet seasons. The measurements provided by cylindrical sensors over turfgrass had good accuracy and precision. The change in the angle of sensor deployment had no effect on LWD measured by cylindrical sensors, for the studied conditions. However, cylindrical sensors should not be deployed at horizontal because previous studies showed that they could overestimate LWD when deployed at horizontal. The LWD spatial variability assessment showed that this variable is dependent on the plant and/or crop conditions, which control the canopy microclimate. The pattern of variation of LWD was different for each crop assessed. In the cotton crop, LWD variations were negligible. On the other hand, in the coffee crop LWD was longer in the lower parts of the canopy while in the banana crop it was longer in the top of the canopy. A good correlation between LWD measured over turfgrass and that obtained in the crop top was achieved, which demonstrates that it is possible to estimate LWD using weather station data. The models NHRH>87%, CART, DPD provided good estimates of LWD with mean absolute error ranging from 1.4 to 2.8 h in both dry and wet periods. During the dry season, those models overestimated the LWD. The extended threshold model had the worst performance in relation to the other models, so it is not advised to use this model for similar climate conditions to this study.
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Narita, Nobuyoshi [UNESP]. "Epidemiologia do Cowpea aphid borne mosaic virus (CABMV) em maracujazeiros na região produtora da Alta Paulista, SP." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2007. http://hdl.handle.net/11449/103210.

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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-06Bitstream added on 2014-06-13T18:48:04Z : No. of bitstreams: 1 narita_n_dr_botfca.pdf: 1059911 bytes, checksum: 143b0648ea6b08ccae020a5da8744b97 (MD5)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
Dos vírus que infectam o maracujazeiro no Brasil, atualmente o Cowpea aphid borne mosaic virus (CABMV), é considerado fator limitante à cultura. Dependendo da velocidade de disseminação e idade com que as plantas são infectadas no campo, a cultura torna-se comercialmente improdutiva. O presente estudo teve como objetivo, avaliar a diversidade e a dinâmica populacional dos afídeos na região da Alta Paulista, SP e a possibilidade de transmissão do vírus pela semente. Assim, quatro locais (Leste e Oeste da cidade de Marília e Municípios de Ocauçú e Guaimbê) foram monitorados durante 24 meses com armadilhas amarelas de água do tipo Moericke. Constatou-se nas quatro regiões a predominância do gênero Aphis. Outras espécies coletadas foram Myzus persicae, Geopenphigus flocculosus, Brevicoryne brassicae, Rhopalosiphum spp, Dysaphis spp e Lipaphis erysimi. A flutuação populacional de formas aladas do gênero Aphis, caracterizou-se por apresentar maiores revoadas em maio, junho, agosto e setembro. As espécies de Aphis (A. fabae, A. gossypii, A. spiraecola) devem ser os principais vetores do CABMV na região. Plantios novos, ao lado de plantações infectadas, tornam-se infectadas em três meses. Nos testes de transmissão através de sementes, do total de 13056 semeadas oriundas de plantas doentes, germinaram 10592, e em avaliações visuais dois meses após a germinação, não foram observadas plantas sintomáticas, indicando a não transmissão pela semente.
From the viruses were described infecting passionfruit plants in Brasil, and the Cowpea aphid borne mosaic virus (CABMV), is considered the most hazardous. Depending on the spread velocity of aphids and the age that the plants are infected, the crops doesn t produce commercial fruits. The present study was designed to evaluate the diversity and dynamic population of aphids in the Alta Paulista, SP region and aspects of seed transmission. For this, four regions (East and West of Marília city, Guaimbê and Ocauçú) were monitored for 24 months using yellow water Moerick trap. The predominance of the genus Aphis was observed in the four evaluated areas. Other species founded in the area were: Myzus persicae, Geopenphigus flocculosus, Brevicoryne brassicae, Rhopalosiphum spp, Dysaphis spp and Lipaphis erysimi. The population curve of alate Aphis spp showed the highest frequency of flights during May, June, August and September. The Aphis spp (A. fabae, A. gossypii, A. spiraecola) probably is the most important vector of the CABMV in the region. New crops near old infected plants, were infected in three months. To evaluate properties of seed transmission, from 13056 collected from infected plants, 10592 were germinated and evaluated during two months for the presence of visual symptoms. No plants with simptoms were observed indicating no seed transmission.
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Barbosa, Júlio César. "Caracterização molecular e diversidade de fitoplasmas em pomares de citros no Estado de São Paulo." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-17032011-145314/.

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Recentemente, um fitoplasma do grupo 16SrIX foi associado a plantas de citros com sintomas de huanglongbing (HLB) no Estado de São Paulo. No entanto, em razão da ampla diversidade de fitoplasmas que tem se observado em várias culturas no Brasil, seria possível que além do fitoplasma do grupo16SrIX, outros fitoplasmas também pudessem estar associados a plantas de citros no Estado de São Paulo. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi investigar se outros fitoplasmas, além daquele do grupo 16SrIX, estão associados a plantas de citros no Estado de São Paulo. Amostras foliares de plantas de citros, plantas daninhas e cicadelídeos foram coletados entre os meses de Junho a Outubro de 2010, em pomares localizados em quatro municípios: Araraquara, Bebedouro, Piracicaba e Taquarituba. Análises de nested PCR evidenciaram a presença de fitoplasmas associados a plantas de citros (sintoma: clorose foliar); a plantas daninhas: Bidens pilosa (sintomas: filodia e virescência), Leonorus sibiricus (sintoma: deformação foliar), Solanum americanus (sintoma: superbrotamento foliar), Erigeron bonariensis (sintomas: avermelhamento e superbrotamento foliar) e Euphorbia heterophylla (sintoma: deformação foliar); e a cicadelídeos da espécie Agallia albidula (Uhler, 1895) (subfamília Agalliinae). A confirmação da presença e caracterização molecular dos fitoplasmas foi realizada através de análises de RFLP e seqüenciamento da região 16S rDNA. Uma ampla diversidade de fitoplasmas foi identificada. Fitoplasmas dos grupos 16SrIII e 16SrIX foram associados a plantas de citros em Piracicaba, enquanto um fitoplasma do grupo 16SrVII foi associado a plantas de citros em Bebedouro. Fitoplasmas do grupo 16SrIII foram associados a plantas daninhas das espécies B. pilosa, L. sibiricus e S. americanus em Piracicaba e fitoplasmas do grupo 16SrVII foram associados a plantas de E. bonariensis e E. heterophylla em Piracicaba e Taquarituba, respectivamente. Um fitoplasma do grupo 16SrIII foi associado a A. albidula em Taquarituba, sugerindo ser este um potencial inseto vetor de fitoplasmas em pomares de citros. Com base na análise da região 16S rDNA, muitos dos fitoplasmas encontrados apresentaram-se distintos dos fitoplasmas já relatados. Em virtude disto, estes fitoplasmas foram propostos como representantes de novos subgrupos pertencentes aos grupos 16SrIII, 16SrVII e 16SrIX. Os resultados obtidos neste estudo não nos permite a associação dos fitoplasmas encontrados com o HLB ou qualquer outra doença já descrita, sendo, portanto, necessários mais estudos visando confirmar o papel destes fitoplasmas como patógenos de citros e plantas daninhas.
Recently a phytoplasma of the 16SrIX group was associated with citrus trees exhibiting symptoms of huanglongbing (HLB) in Sao Paulo state. However, due to the wide diversity of phytoplasmas that have been observed in several crops in Brazil, it is possible that in addition to the phytoplasma of group 16SrIX other phytoplasmas could also be associated with citrus trees. Therefore, the objective of this study was to investigate if others phytoplasmas besides that of the 16SrIX group are associated with citrus plants in the São Paulo state. Leaf samples from citrus trees, weeds and cicadellids were collected between June and October of 2010 from citrus orchards of four municipalities of the Sao Paulo state: Araraquara, Bebedouro, Piracicaba and Taquarituba. Nested PCR analysis revealed the presence of phytoplasmas associated with citrus trees (symptom: leaf chlorosis), weeds: Bidens pilosa (symptoms: phyllody and virescence), Leonorus sibiricus (symptom: leaf distortion), Solanum americanus (symptom: witches broom), Erigeron bonariensis (symptoms: redning and witches broom) e Euphorbia heterophylla (symptom: leaf distortion); and cicadellids of specie Agallia albidula (Uhler, 1895) (subfamily Agalliinae). The confirmation of the phytoplasma presence and molecular characterization was carried out by RFLP analysis and sequencing of the 16S rDNA region. A wide diversity of phytoplasmas was verified. Phytoplasmas of the 16SrIII and 16SrIX groups were associated with citrus trees in Piracicaba, while a phytoplasma of the 16SrVII group was associated with citrus trees in Bebedouro. Phytoplasmas of the 16SrIII group were associated with weeds belonging to the species B. pilosa, S. americanus and L. sibiricus in Piracicaba and a phytoplasma of the 16SrVII group was identified associated with plants of E. bonariensis and E. heterophylla in Piracicaba and Taquarituba, respectively. A phytoplasma of the 16SrIII group was associated with A. albidula in Taquarituba, suggesting that this cicadelid is a potential vector of phytoplasmas in citrus orchards. Based on the analysis of the 16S rDNA region, many of the found phytoplasmas are distinct from those already reported. Due to this distinction, these phytoplasmas were proposed as representatives of new subgroups of the groups 16SrIII, 16SrVII and 16SrIX. The results of this study dont allow us associate the found phytoplasmas with HLB or any other described disease. Thus, more studies are needed to identify the role of theses phytoplasmas as pathogens of citrus trees and weeds.
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Barbosa, Francisco Ferraz Laranjeira. "Epidemiologia da clorose variegada dos citros no Estado de São Paulo." Universidade de São Paulo, 2002. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-11072002-160342/.

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O presente trabalho objetivou estudar tanto o progresso da Clorose Variegada dos Citros no tempo, quanto o arranjo espacial das plantas afetadas, visando caracterizar a dinâmica da doença em três regiões do Estado de São Paulo (Noroeste, Centro e Sul). Por meio de avaliação de sintomas visuais, foram mapeados, bimensalmente, três talhões de laranja-doce Pêra enxertada em limão Cravo, em três regiões do Estado de São Paulo, desde julho de 1998 até dezembro de 2000. O progresso no tempo foi avaliado por meio de ajuste a modelos matemáticos e análise das curvas de derivada. As curvas de progresso da CVC não puderam ser ajustadas a modelos conhecidos. O progresso da CVC apresentou diversos picos de derivada, em sua maioria coincidindo com a primavera e o verão. Para o estudo da dinâmica espacial, foram aplicadas as seguintes análises: seqüências ordinárias; áreas isópatas; lei de Taylor modificada; índice de dispersão e análise de dinâmica e estrutura de focos. Essas análises demonstraram pouca diferença no padrão espacial da doença entre as regiões, que pode ser considerado levemente agregado. Por meio de análise de autocorrelação, de densidade espectral, análise discriminante, e correlação de lags, procurou-se também estabelecer padrões na evolução de emissão de brotações pelas plantas, expressão de sintomas e detecção de infecções assintomáticas e a correlação dessas variáveis entre si e com o clima. Também foi feita a comparação entre estações do ano e regiões por meio de testes não-paramétricos. Número de novas brotações foi a variável que mais distinguiu entre as três regiões. As variáveis relacionadas à doença (infecções assintomáticas, infecções totais, sintomas e concentração bacteriana) apresentaram padrões sazonais, mas não foi observada diferença estatística entre as estações do ano. O pomar da região Noroeste apresentou maior quantidade de brotações novas e maior quantidade de sintomas. O pomar da região Sul apresentou maior quantidade de infecção assintomática. Não houve diferença de concentração bacteriana entre os pomares das três regiões.
This work aimed to evaluate the progress and spatial pattern of Citrus Variegated Chlorosis (CVC) in three regions in the state of São Paulo, Brazil. By bimonthly visual assessments three Pêra sweet orange/ Rangpur lime orchards in three regions (Northwest, Center and South) were mapped from july 1998 to december 2000. Progress was evaluated by fitting nine models do disease progress curves and by analysis of derivative curves. No model could be fitted to disease progress curves. Derivative curves showed peaks concentrated in spring and summer. To characterize spatial pattern the following analysis were used: ordinary runs, isopath areas;binary Taylor law; dispersion index and foci dynamics and structure analysis. All techniques showed small differences between regions and characterized CVC spatial pattern as slightly aggregated. By means of autocorrelation, spectral density analysis, discriminant analysis and lag correlation was tried to establish temporal patterns for vegatative flush emission, symptom expression, detection of assymptomatic infections. Also, was tried to establish correlations among variables and between them and weather variebles. A comparison by non-parametric tests was made between seasons and regions. Number of new vegetative flushes was the most distinctive variables for regions. The disease related variables (assymptomatic infections, total infection, symptoms and relative bacteria concentration) showed seasonal patterns but no statistical difference was found between seasons. Northwest orchard showed higher number of vegetative flushes. South orchard assymptomatic infections were higher than for the other orchards. There was no difference in relative bacteria concentration between regions.
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Megeto, Guilherme Augusto Silva 1984. "Avaliação da influência da temperatura e da precipitação na ocorrência da ferrugem asiática da soja por meio da técnica de árvore de decisão." [s.n.], 2012. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/256829.

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Orientadores: Stanley Robson de Medeiros Oliveira, Carlos Alberto Alves Meira
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agrícola
Made available in DSpace on 2018-08-20T23:34:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Megeto_GuilhermeAugustoSilva_M.pdf: 5556599 bytes, checksum: c545e13e7ec81e96cf9e6a3e46d01de2 (MD5) Previous issue date: 2012
Resumo: A ferrugem asiática, causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, atualmente é considerada uma das doenças mais importantes e agressivas da soja. A principal forma de controle é a aplicação calendarizada de fungicidas a qual desconsidera o risco de ocorrência da doença. Estudos epidemiológicos buscam compreender os fatores que influenciam na ocorrência e desenvolvimento das epidemias, especialmente aqueles relacionados ao ambiente tais como condições meteorológicas. Com o avanço da tecnologia da informação e do armazenamento de dados, técnicas de mineração de dados (data mining) apresentam-se promissoras para a descoberta de conhecimento em bases de dados epidemiológicos. Este trabalho tem como objetivo avaliar a influência da chuva e da temperatura na ocorrência da ferrugem asiática da soja utilizando árvores de decisão. Para tal, foram obtidos dados de ocorrências da doença em quatro safras, de 2007/2008 a 2010/2011, oriundos do banco de dados do Consórcio Antiferrugem, e dados meteorológicos, provenientes do sistema Agritempo. A análise exploratória dos dados permitiu obter subsídios para compor o conjunto de dados final e definir o escopo deste trabalho, buscando-se características intrínsecas à doença e sua interação com o ambiente, utilizando apenas variáveis de base meteorológica. As variáveis utilizadas foram relacionadas à precipitação e à temperatura, que deram origem a nove atributos avaliados para cada período temporal...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: The Asian soybean rust, caused by Phakopsora pachyrhizi, is now considered one of the most important and aggressive diseases of soybean. The main form of control is the scheduled application of fungicides which disregards the the risk of disease occurrence. Epidemiological studies seek to understand the factors that influence the occurrence and development of epidemics, especially those related to the environment such as weather conditions. With the development of information technology and data warehousing, data mining techniques appear to be promising for knowledge discovery in epidemiological databases. This study aims to evaluate the influence of rainfall and temperature on the occurrence of soybean rust by using decision trees models. To accomplish that, data of the occurence of the disease were collected from four seasons, 2007/2008 to 2010/2011, from the Consórcio Antiferrugem and weather data from the Agritempo system. Exploratory data analysis allowed for obtaining subsidies to generate the final data set and define the scope of this work, seeking intrinsic characteristics of the disease and its interaction with the environment, using only meteorological variables. The variables used were related to precipitation and temperature, resulting into nine attributes evaluated in different periods. Such attributes were related to the event of occurrence (Oc) and non occurrence (NaoOc) of the disease (assumed as the thirtieth day prior to the event of occurrence). The results include a predictive model and an interpretive model for classifying events of occurrences and non occurrences of the disease...Note: The complete abstract is available with the full electronic document
Mestrado
Planejamento e Desenvolvimento Rural Sustentável
Mestre em Engenharia Agrícola
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Cruz, Christian D. "Impact Of Foliar Diseases On Soybean In Ohio: Frogeye Leaf Spot And Septoria Brown Spot." Columbus, Ohio : Ohio State University, 2008. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc%5Fnum=osu1228070831.

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Gonçalves, Fabrício Packer. "Progresso poliético e quantificação de danos da Clorose Variegada dos Citros em laranjeiras \'Natal\' submetidas a déficits hídricos." Universidade de São Paulo, 2010. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-19042010-151206/.

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A Clorose Variegada dos Citros (CVC), causada pela bactéria Xylella fastidiosa, é atualmente a doença de maior incidência no Estado de São Paulo. A incidência e a severidade da doença são maiores nas regiões Norte e Noroeste do Estado, onde o clima é predominantemente quente e com déficit hídrico, principalmente no inverno. Embora não haja nada comprovado, alguns estudos indicam que o déficit hídrico aumenta a severidade dos sintomas nas plantas afetadas pela CVC. Além disso, até hoje não foi estabelecida uma função que relacione doença e dano. Dessa forma, o estudo presente objetivou avaliar o efeito de diferentes níveis de irrigação no progresso poliético da CVC, avaliar métodos de avaliação da doença e determinar uma função de dano para a CVC. Para isso, um experimento foi instalado no município de Bebedouro, região Norte do Estado de São Paulo sob o delineamento blocos ao acaso no esquema fatorial 3 x 2, com os seguintes tratamentos: sem irrigação, irrigado com 50% e 100% da evapotranspiração da cultura (ETc), combinados com inoculação natural e artificial de X. fastidiosa. Cada parcela foi constituída de 6 plantas úteis, havendo 4 repetições de cada tratamento, totalizando 144 plantas úteis. As variáveis quantificadas em cada árvore do experimento foram: (a) produção, considerando frutos assintomáticos e sintomáticos, no período de 2006 a 2008 e produção total referente às safras 2001 a 2005; (b) intensidade da doença, através da incidência de ramos com sintomas da CVC e utilizando uma escala descritiva; (c) vigor da planta, estimado pela medida da altura da planta, diâmetro da copa, diâmetro do tronco, volume de copa e do índice de área foliar (IAF). O modelo monomolecular foi utilizado para descrever o progresso poliético da incidência da CVC, no período de 2006 a 2008, para todos os tratamentos. A partir desse modelo foi possível observar que plantas sem irrigação apresentam maior incidência de ramos com sintomas que plantas irrigadas a 100% da ETc, principalmente quando inoculadas de forma artificial. Esse resultado ficou ainda mais evidenciado quando se avalia o número de frutos com sintomas (ø < 50mm) da CVC por tratamento. Também foi possível observar que os sintomas nas plantas são distribuídos de forma irregular, apresentando um gradiente decrescente significativo da parte superior para inferior. As variáveis relacionadas ao vigor da planta, na sua maioria, não apresentaram relação alguma com a produção em todos os tratamentos. De modo geral, as plantas do tratamento irrigado a 100% da ETc combinado com inoculação natural apresentaram maior produção total, considerando as safras de 2001 a 2008. A relação entre CVC e dano pode ser descrita pela equação (y=114,067*exp(-0,017555)*x) onde y é a produção da planta em Kg e x a incidência de ramos com CVC em porcentagem. A escala descritiva não permitiu avaliação precisa e apresentou baixa correlação entre os avaliadores, o contrário foi observado realizando a avaliação da CVC através da incidência de ramos com sintomas.
The Citrus Variegated Chlorosis (CVC) caused by the bacteria Xylella fastidiosa is nowadays the disease with the most incidence in the state of São Paulo. The incidence and severity of the disease are greater in the Northern and Northwestern regions of the state where the climate is predominately warm and presents a water deficits especially in the winter. Although there is no definite proof, some studies indicate that the water deficits increases the severity of the symptoms in plants affected by the CVC. Besides, up to the present there has not been a function which relates the damage to an intensity of the disease. In that manner, the present study has been conducted in order to evaluate the effect of different irrigation levels on the polyetic progress of the CVC as well as to study methods of assessment of the disease and determine the relationship between disease intensity and yield. In order to carry out this study, an experiment was conducted in the city of Bebedouro north of São Paulo state. The experimental design was in randomized blocks in a 3 x 2 factorial scheme with the following treatments: no irrigation, irrigated with 50% and 100% of the evapotranspiration of the crop (ETc), combined with natural and artificial inoculation of X. fastidiosa. Each group was made of 6 useful plants, with 4 repetitions for each treatment, totalizing 144 useful plants. The variables quantified in each tree of the experiment were: (a) (a) yield, considering asymptomatic and symptomatic fruit in the period 2006 to 2008 and total yield on the crops from 2001 to 2005; (b) intensity of the disease through incidence of branches with symptoms of CVC and using a descriptive scale; (c) plant vigor, estimated through measure of height, crown diameter, trunk diameter, canopy volume and of the leaf area index (LAI). The monomolecular model was used to describe the polyetic progress of CVC incidence between 2006 and 2008 for all treatments. From this model it was possible to observe that plants without irrigation present greater incidence of branches with symptoms than the ones irrigated at 100% of ETc, especially when inoculated in an artificial manner. This result was even more evident when the number of fruit with symptoms is evaluated (ø < 50mm) of CVC per treatment. It was also possible to observe that the symptoms in the plants are scattered in an irregular way, presenting a significant decreasing rate from the upper to the lower part. Most of the variables related to the plant vigor did not present any relation to the production in all treatments. In general, the plants from the irrigated treatment at 100%of ETc combined with natural inoculation presented more total yield considering the harvests from 2001 to 2008. The relationship between CVC and damage can be described by the equation (y=114,067*exp(-0,017555)*x) where y is the plant yield in Kg and x is the incidence in percentage of branches with CVC. The descriptive scale did not allow accurate assessment and showed a low correlation between the raters, the opposite was observed performing the assessment of CVC through the incidence of branches with symptoms.
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Blaise, Philippe. "Development of microcomputer applications in plant disease epidemiology /." [S.l.] : [s.n.], 1989. http://e-collection.ethbib.ethz.ch/show?type=diss&nr=8929.

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Wilson, Mark. "Epidemiology and biological control of fire blight of hawthorn." Thesis, University of Manchester, 1989. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.237267.

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Souza, Davi Carvalho de. "Progresso temporal e padrão espacial de epidemias da podridão parda do pessegueiro." Universidade de São Paulo, 2007. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-16032007-144126/.

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A podridão parda do pessegueiro é uma das principais doenças da cultura no Estado de São Paulo e na maioria das regiões produtoras do mundo. No Brasil, seu agente causal é o fungo Monilinia fructicola (Wint) Honey, que infecta ramos, flores e frutos tanto em pré como em pós-colheita. A compreensão do comportamento epidemiológico da podridão parda do pessegueiro em condições tropicais é fundamental para o estabelecimento de estratégias de controle mais eficientes nos pomares brasileiros. Neste contexto o presente trabalho teve como objetivo caracterizar o progresso temporal e a distribuição espacial da epidemia da podridão parda do pessegueiro, em pomares comerciais sob condições naturais de infecção. O estudo foi realizado em áreas comerciais não tratadas e tratadas com fungicidas, em dois pomares no Estado de São Paulo, em 2005 e 2006. Realizaram-se amostragens quinzenais de frutos durante 3 meses após o florescimento. Foram colhidos, pelo menos, 300 frutos por amostragem, os quais foram tratados com o herbicida gramoxone para detecção da infecção latente. A análise temporal dos dados foi realizada por regressão não-linear entre a incidência da doença e o tempo, enquanto a distribuição espacial de frutos doentes foi avaliada por meio do índice de dispersão (D) e da lei de Taylor modificada, que relacionam variâncias observada e binomial. Nos dois anos e locais estudados, a podridão parda apresentou tendência de crescimento exponencial, com baixa incidência no início das amostragens e aumento expressivo no início da maturação dos frutos. O modelo exponencial apresentou melhor ajuste aos dados, nos dois anos e locais de estudo. Em 2005, a incidência da doença chegou a valores máximos no ponto de colheita, atingindo 70% em frutos de plantas tratadas e 66,4% nos de não tratadas. Nesse ano, a incidência da podridão parda em frutos de plantas sem e com fungicidas não diferiram entre si (P>0,05), tanto nos parâmetros do modelo quanto na área abaixo da curva de progresso da doença (AUDPC). Em 2006, as curvas de progresso da doença, para frutos de plantas não tratadas com fungicidas, foram semelhantes entre si e caracterizaram-se pelo rápido aumento da incidência de infecções a partir da maturação dos frutos, chegando, na última avaliação, a 59,17% em Holambra II e 74,37% em Jarinu. O controle químico foi eficiente em 2006, havendo baixa incidência de podridão parda em frutos de plantas tratadas, durante toda safra e nos dois locais. No pomar avaliado em 2005, a agregação de frutos doentes (4,7The brown rot of peach is one of the main diseases in peach orchards in the State of São Paulo and in most peach producing regions in the world. In Brazil, brown rot is caused by the fungus Monilinia fructicola and it attacks stems, blossoms and fruits in the pre and post harvest periods. The understanding of the brown rot epidemiologic behavior in tropical conditions is essential to the establishment of more efficient control strategies in Brazilian orchards. In this context, the present work aimed to characterize the temporal progress and the spatial distribution of the peach brown rot in commercial orchards under natural infection conditions. The study was carried out in untreated and fungicide-sprayed commercial areas in Paranapanema and Jarinu, SP, in 2005 and 2006. Fruit samplings were performed fortnightly during 3 months after blooming. At least 300 fruits were collected in each sampling and treated with gramoxone herbicide to detect latent infection. Temporal data analysis was done by non-linear regression between disease incidence (y) and time (x). The spatial pattern of diseased fruit was assessed by the dispersion index (D) and the modified Taylor?s power law which relate observed and binomial variances. During these two years in the area studied, brown rot presented a tendency for exponential growth with low incidence in the beginning of the season and expressive increase in the beginning of fruit ripening. The exponential model presented a better fit to the data for the two year study period. In 2005, the brown rot incidence reached maximum values during the harvest: 70% in treated trees and 66,4% in untreated trees. There was no significant difference (P>0.05) in brown rot incidence in trees with or without fungicide treatment in model parameters as well as in the area under the disease progress curve (AUDPC). In 2006, the disease progress curves for treated and untreated trees were not similar. Disease progress curves for untreated trees were characterized by the rapid increase in infections incidence after the ripening of the fruit, reaching in the last evaluation, 59,17% for Holambra II and 74,37% in Jarinu. Chemical control was effective in 2006, with low brown rot incidence in treated trees throughout the harvest in both sites. In the orchard evaluated in 2005, the aggregation of diseased fruit (4,7
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Warmington, Rachel Julie. "Pathogen diversity, epidemiology and control of sclerotinia disease in vegetable crops." Thesis, University of Warwick, 2014. http://wrap.warwick.ac.uk/67709/.

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Sclerotinia sclerotiorum is a necrotrophic fungal pathogen with a worldwide distribution and a wide host range, including many economically important crops. The control strategies for this pathogen and related species include using fungicides, biological control agents and cultural practices such as crop rotations. However, the genetic diversity and the long term survival structures (sclerotia) of this pathogen, combined with the recent discovery of the related species S. subarctica in England and the need for growers to implement integrated disease management strategies means that new control measures need to be sought. Biofumigation, using green manures which are macerated and ploughed into the soil, may be a useful new control approach in an integrated programme. Microcosm and in vitro experiments clearly showed that volatiles released from biofumigation crops have a direct inhibitory effect on the mycelial growth and carpogenic germination of S. sclerotiorum sclerotia. The most effective biofumigation crop for inhibiting carpogenic germination varied depending on whether the volatiles released from the biofumigant crops were in direct contact with the sclerotia when the most effective crop was Raphanus sativus ‘Terranova’, or in the vapour phase when the most effective crop was B. juncea ‘Vittasso’. Carrot root inoculations showed that the number of sclerotia produced on carrot roots was significantly affected by S. sclerotiorum isolate. However, the results also showed that the weight of individual sclerotia produced by different isolates was influenced by carrot accession, but not by S. sclerotiorum isolate. Additionally, the carrot plant and detached leaf inoculations showed significant differences in the rate of lesion progression of S. sclerotiorum on different carrot accessions, indicating differences in susceptibility to the pathogen. S. subarctica microsatellite haplotypes identified in this research were shown to be shared between Scotland and Norway, and between crop plants and meadow buttercup. However, the English population did not share any microsatellite haplotypes with any other population, and analysis indicated that this S. subarctica population in England may be isolated and inbred.
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Eckstein, Barbara. "Enfezamento do brócolis: identificação molecular de fitoplasmas, potenciais insetos vetores e hospedeiros alternativos, e análise epidemiológica da doença." Universidade de São Paulo, 2010. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-17092010-162527/.

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O brócolis (Brassica oleraceae var. italica) é uma das hortaliças mais importantes do país, cujo volume de comercialização na CEAGESP é de aproximadamente 13 mil toneladas por ano. Recentemente, uma nova doença tem causado perdas relevantes para as culturas instaladas na maior região produtora do Estado de São Paulo. Os sintomas característicos da doença são expressos pelo enfezamento da planta e necrose dos vasos de floema. Devido ao fato destes sintomas indicarem a presença de fitoplasmas nas culturas de repolho e couve-flor, localizadas na mesma região geográfica onde foi observada esta nova doença, levantou-se a suspeita de que estes mesmos agentes patogênicos pudessem estar associados com as plantas doentes de brócolis. Assim, o DNA total de plantas de brócolis sintomáticas foi analisado por PCR com primers específicos para a região 16S rDNA de fitoplasmas. Os resultados revelaram que estes patógenos estavam associados com as plantas doentes. Através das técnicas de RFLP do sequenciamento de nucleotídeos desta mesma região genômica, os fitoplasmas foram identificados como pertencentes aos grupos 16SrI, 16SrIII e 16SrXIII. Através de análise de RFLP, fitoplasmas também foram identificados em diversas espécies de plantas daninhas e em cigarrinhas da família Cicadellidae coletadas em áreas adjacentes a campos de produção de brócolis. Fitoplasmas do grupo 16SrIII foram identificados em plantas daninhas das espécies Agetarum conyzoides (mentrasto), Crotalaria lanceolata (crotalária), Lepidium virginicum (mentruz), Nicandra physalodes (juá-de-capote), Paulicourea marcgravii (erva-de-rato), Ricinus communis (mamona), Sida rhombifolia (guanxuma), Sonchus oleraceae (serralha amarela), Bidens pilosa (picão preto), Erigeron bonariensis (buva), Emilia sonchifolia (falsa serralha), Leonorus sibiricus (rubim), enquanto que fitoplasmas do grupo 16SrVII foram encontrados as últimas quatro espécies citadas. Com relação aos insetos, fitoplasmas foram detectados em indivíduos das subfamílias Deltocephalinae, Agalliinae e Typhlocybinae. Dentro da subfamília Deltocephalinae, a cigarrinha Balclutha hebe portava fitoplasma do grupo 16SrI, enquanto que cigarrinhas das espécies Atanus nitidus, Planicephalus flavicosta e Schapytopius fuliginosus abrigavam fitoplasmas do grupo 16SrIII. Nos tecidos de duas cigarrinhas da subfamília Agalliinae e uma da Typhlocybinae, as quais não foram identificadas quanto a espécie, foram encontrados fitoplasmas do grupo 16SrIII. As análises epidemiológicas revelaram um padrão espacial agregado de plantas doentes e a ocorrência de um maior progresso da doença nos bordos dos campos de cultivo de brócolis, que estão localizados nas proximidades de áreas com a presença de plantas daninhas.
Broccoli (Brassica oleraceae var. italica) is one of the most important vegetables in Brazil, whose trading volume in CEAGESP is approximately 13 000 tons per year. Recently, a new disease has caused significant losses in this crop cultivated in the largest producing region of the São Paulo State. The characteristic symptoms of the disease are expressed by plant stunting and necrosis of phloem vessels. Because these symptoms indicate the presence of phytoplasmas in cabbage and cauliflower crops, grown in the same geographical region, it was suspected that the same pathogens could be associated with the affected broccoli plants. Therefore, the total DNA from symptomatic plants of broccoli was analyzed by PCR with specific primers for the 16S rDNA of phytoplasmas. Through the techniques of RFLP and nucleotide sequencing of the same genomic region, the phytoplasmas were identified as belonging to the groups 16SrI, 16SrIII and 16SrXIII. Through RFLP analysis, phytoplasmas were also identified in several species of weeds and leafhoppers in the family Cicadellidae collected in adjacent areas of broccoli fields. Phytoplasmas belonging of the 16SrIII group were identified in the weeds belonging to the species Agetarum conyzoides, Crotalaria lanceolata, Lepidium virginicum, Nicandra physalodes, Paulicourea marcgravii, Ricinus communis, Sida rhombifolia, Sonchus oleraceae, Bidens pilosa, Erigeron bonariensis, Emilia sonchifolia, Leonorus sibiricus, while phytoplasmas of the 16SrVII group were found in the last four mentioned species. In respect to insects, phytoplasmas were detected in individuals from subfamilies Deltocephalinae, Agalliinae and Typhlocybinae. Within the subfamily Deltocephalinae, the leafhopper Balclutha hebe carried phytoplasmas of the 16SrI group, while that of the species Atanus nitidus, Planicephalus flavicosta e Schapytopius fuliginosus harbored phytoplasmas of the 16SrIII group. In the tissues of two leafhoppers of the subfamily Agalliinae and one of the Typhlocybinae, which were not identified as specie, were found phytoplasmas of the 16SrIII group. The epidemiological analysis revelead an aggregated pattern of the diseased plants and a higher progress of the diseased in the border of the broccoli fields, whitch were located nearby areas where the presence of weeds was abundant.
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Nita, Mizuho. "Epidemiology and management of Phomopsis cane and leaf spot of grape." Connect to resource, 2005. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc%5Fnum=osu1125542230.

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Thesis (Ph. D.)--Ohio State University, 2005.
Title from first page of PDF file. Document formatted into pages; contains xviii, 163 p.; also includes graphics (some col.). Includes bibliographical references (p. 156-163). Available online via OhioLINK's ETD Center
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Junior, Geraldo José da Silva. "Podridão floral dos citros: dinâmicas temporal e espacial, sensibilidade de Colletotrichum acutatum a fungicidas e controle da doença." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-13092011-095157/.

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A Podridão Floral dos Citros (PFC), causada por Colletotrichum acutatum, foi observada em 1956/57 em Belize e relatada posteriormente em 1979. Neste mesmo ano a PFC também foi relatada no Brasil e, desde então, tem causado prejuízos todas às vezes nas quais o período de florescimento coincide com a ocorrência de chuvas. O controle da PFC é realizado principalmente por meio de pulverizações preventivas com fungicidas. O uso indiscriminado de fungicidas com o mesmo modo de ação pode selecionar indivíduos resistentes. O conhecimento da epidemiologia da PFC pode gerar informações precisas a serem utilizadas na elaboração de estratégias de manejo no campo, bem como melhorar a eficiência do controle químico da doença. Assim, foi proposto este trabalho com os objetivos de: i) caracterizar as dinâmicas temporal e espacial da PFC em pomares jovens de laranja doce; ii) avaliar in vitro a sensibilidade de isolados de C. acutatum a fungicidas e; iii) avaliar o efeito de diferentes fungicidas, intervalos de aplicação e programas de pulverização no controle da PFC no campo. A dinâmica temporal e espacial da PFC foi caracterizada em três talhões de 2 a 4 anos de idade com 500 plantas cada. Crescimento explosivo da PFC foi observado com altas taxas diárias de progresso (r) descritas pelo modelo logístico de 0,55 após chuvas e período de molhamento foliar prolongado. A PFC apresentou padrão espacial variável, inicialmente aleatório e posteriormente moderadamente agregado, indicando existir contribuição de outras fontes para a disseminação do patógeno além das chuvas com ventos. Não houve correlação entre incidência de sintomas em flores e de cálices persistentes. Os cálices persistentes não são importantes fontes de inóculo. In vitro, ensaios de sensibilidade a fungicidas demonstraram que isolados de C. acutatum coletados no Estado de São Paulo em 2008 não apresentaram resistência aos fungicidas difenoconazole e carbendazim. Em casa-de-vegetação, os fungicidas carbendazim e a mistura (trifloxistrobina + tebuconazole) apresentaram efeito significativo quando aplicados em pré-inoculação e 24 h pós-inoculação de C. acutatum, mas somente a mistura foi efetiva 48 h após a inoculação. Nos experimentos de controle químico no campo, esta mistura fungicida foi mais eficiente que os demais produtos para o controle da PFC em áreas com alta incidência da doença. Quando a proporção de flores sintomáticas atinge 100%, a redução na produção será em torno de 70% em pomares adultos de laranja Pera. Pulverizações frequentes podem ser requeridas durante todo o período de florescimento para o controle da doença, embora sejam mais importantes quando ocorrem chuvas em dois ou mais dias consecutivos com prolongamento do molhamento foliar, principalmente durante a expansão das pétalas e abertura das flores.
Postbloom fruit drop (PFD), caused by Colletotrichum acutatum, was firstly observed in Belize during 1956-1957 and subsequently reported in 1979. In the same year the disease was also reported in Brazil. PFD causes severe damage when bloom period coincides with rains. The disease is controlled primarily by preventive fungicide sprays. The repeated use of fungicides with the same mode of action can select resistant individuals. The knowledge of PFD epidemiology can generate precise information to develop efficient control strategies and improve the efficacy of chemical control. Thus, this study aimed to: i) characterize the temporal and spatial dynamics of PFD in young sweet orange orchards, ii) evaluate in vitro the baseline sensitivity of C. acutatum to fungicides and, iii) evaluate the efficacy of different fungicides, spray intervals and fungicide application schedule for PFD control. The temporal and spatial PFD-dynamics was characterized in three 2-to-4-year-old orchards with 500 trees each. High daily disease progress rates (r) described by the logistic model of 0.55 were observed after rainfall and prolonged leaf wetness. The spatial pattern of diseased trees varied considerably, initially at random and latter moderately aggregated, suggesting the contribution by other pathogen spread mechanisms, beside rain with wind. There was no correlation between the incidence of diseased flowers and the incidence of persistent calyxes. These calyxes are not important sources of inoculum. In vitro, assays demonstrated that the isolates of C. acutatum from São Paulo State were not resistant to fungicides difenoconazol and carbendazim. In the greenhouse, carbendazim and the trifloxystrobin + tebuconazol mixture showed significant effects when applied prior to inoculation or 24 h after inoculation, however only the mixture was effective 48 h after inoculation. In the field, the fungicide mixture was more effective for PFD control in orchards with high disease incidence. When the proportion of symptomatic flowers reaches 100%, yield reduction can be as high as 70% in Pera sweet orange trees. Frequent sprays may be required during bloom period to control the disease, although sprays were more important when two or more rainy days with prolonged leaf wetness occurs, especially during petals expansion and flowers opening.
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Satija, Ambika. "Plant-Based Diets and Risk of Type 2 Diabetes and Coronary Heart Disease." Thesis, Harvard University, 2016. http://nrs.harvard.edu/urn-3:HUL.InstRepos:27201752.

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Plant-based diets, defined as “vegetarian” diets, are associated with reduced risk of type 2 diabetes (T2D) and coronary heart disease (CHD). To examine the health effects of gradual reductions in animal food consumption while increasing plant food intake, and to distinguish between healthy and less healthy plant foods, we created three graded plant-based diet indices using semi-quantitative food frequency questionnaires (SFFQ). In the overall plant-based diet index (PDI), all plant foods received positive scores while animal foods received reverse scores. In the healthful PDI (hPDI) healthy plant foods (e.g. whole grains, fruits) received positive scores, while less healthy plant foods (e.g. sweetened beverages, refined grains) and animal foods received reverse scores. In the unhealthful PDI (uPDI) less healthy plant foods received positive scores, while healthy plant foods and animal foods received reverse scores. This dissertation examined the reliability and validity of these diet indices, and evaluated their associations with T2D and CHD incidence. In chapter 1, we used data from The Women’s and Men’s Lifestyle Validation Studies (n=1354) to examine the reliability and validity of SFFQ-assessed plant-based diet indices. We found reasonable one-year reliability for the SFFQ-assessed indices. The indices correlated with energy-adjusted 7-day diet record nutrients and plasma biomarkers in expected directions, with hPDI associated with high dietary quality, and uPDI associated with poor diet quality. In chapters 2 and 3, we examined the associations of these indices with T2D and CHD. We included ~70,000 women from Nurses’ Health Study (NHS) (1984-2012), ~90,000 women from NHS2 (1991-2011), and ~40,000 men from Health Professionals Follow-up Study (1986-2010). Dietary data were collected every 2-4 years using SFFQs. We documented 16,162 incident T2D, and 7754 incident CHD cases during ~4,00,000 person-years of follow-up. In pooled multivariable-adjusted analysis, PDI was inversely associated with T2D and CHD. hPDI had a stronger inverse association with both endpoints, while uPDI was positively associated with both diseases. In conclusion, we found reasonable reliability and validity for three graded plant-based diet indices assessed with SFFQs. Our study suggests that plant-based diets, especially when rich in high-quality plant foods, are associated with substantially lower risk of T2D and CHD.
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Gomez, Sergio Gregorio Perez. "Quantificação de parâmetros monocíclicos da ferrugem alaranjada (Puccinia kuehnii) em cana-de-açúcar." Universidade de São Paulo, 2013. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-15052013-090620/.

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Entre as principais culturas do Brasil, a cana-de-açúcar é afetada por doenças responsáveis por reduções na produção. Entre elas, a ferrugem alaranjada, causada por Puccinia kuehnii relatada recentemente no país, tem merecido atenção dos Programas de Melhoramento Genético da cultura. Neste trabalho avaliaram-se parâmetros epidemiológicos monocíclicos da ferrugem alaranjada em duas variedades de cana, sob duas condições de temperatura. Plantas com 40 dias de idade das variedades SP891115 e RB855156, que se comportam como suscetível e medianamente resistente respectivamente, foram inoculadas com urediniósporos coletados de plantas com sintomas típicos da doença e colocadas em condições de alta umidade e 22 °C por 24 horas. Em seguida, as plantas foram transferidas para câmaras de crescimento com temperaturas de 18 oC e 25°C. Dois experimentos idênticos foram conduzidos, sendo que no primeiro o inóculo foi proveniente de plantas do campo, no segundo foi obtido em condições controladas. Avaliaram-se período de incubação, período de latência, germinação de esporos e formação de apressórios, freqüência de infecção, tamanho de pústula, severidade, esporulação e viabilidade dos esporos produzidos. O uso de inóculo produzido em condições controladas mostrou-se mais adequado para estudos dos parâmetros monocíclicos. A temperatura de 25 oC foi mais adequada para a manifestação da doença, em todas as variáveis avaliadas. A variedade RB 855156 mostrou maior nível de resistência poligênica que a variedade SP 891115, revelada por períodos de incubação e latência mais longos, menor frequência de infecção e menor área das pústulas. No caso das variáveis frequência de infecção e área das pústulas, a variedade RB 855156 mostrou menores valores somente a 18 oC, revelando que a resistência é influenciada pela temperatura. Não houve efeito da variedade de cana na esporulação ou na viabilidade dos esporos produzidos.
Among the main crops in Brazil, sugar cane is affected by several diseases responsible for reductions in yield. Among them, orange rust caused by Puccinia kuehnii, which was recently reported in the country, has deserved special attention by the breeding programs. In this work it were evaluated the monocyclic parameters of orange rust on two different varieties, under two conditions of temperature. Fortydays plants of SP891115 and RB855156 varieties, which are considered respectively susceptible and moderately resistant were inoculated with urediniospores collected from infected plants and kept in wet chamber at 22 °C for 24 hours. Then the plants were transferred to growth chambers with temperatures of 18 °C and 25 °C. Two identical experiments were conducted. Inoculum used in the first experiment was collected on naturally infected plants in the field while for the second experiment it was obtained through artificial inoculations. It were evaluated incubation and latency periods, spores germination and appressoria formation, frequency of infection, pustules size, severity, sporulation and viability of spores produced on each condition. The use of artificially obtained inoculums proved to be more suitable for monocyclic parameters study. Temperature of 25 °C was more suitable for disease development in all variables evaluated. Variety RB 855156 showed higher level of polygenic resistance than variety SP 891115 as revealed by longer incubation and latency periods, as well as by higher infection frequency and pustules area. Variety RB 855156 showed lower levels of infection frequency and pustules area only at 18 °C, revealing that its resistance is influenced by temperature. No effects of sugarcane variety on sporulation or spores viability were observed.
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Moreira, Alécio Souza. "Epidemiologia comparativa de três viroses em abobrinha de moita (Cucurbita pepo L.)." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-08022011-092407/.

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A abobrinha de moita (Cucurbita pepo L.), espécie pertencente à família Cucurbitaceae, apresenta significativa participação na produção mundial e brasileira desta família de plantas. Porém, como em toda cultura de importância econômica, as cucurbitáceas apresentam problemas fitossanitários causados por diferentes agentes etiológicos. Na produção brasileira de abóboras, já foi constatada a presença de 8 vírus, dentre eles os potyvirus PRSV-W (Papaya ringspot virus-type W) e ZYMV (Zucchini yellow mosaic virus) e o tospovirus ZLCV (Zucchini lethal chlorosis virus) têm sido considerados os mais importantes pela predominância em diversas regiões produtoras de cucurbitáceas no país e pelos consideráveis prejuízos que geralmente causam à produção. Considerando que a maioria dos estudos epidemiológicos existentes sobre estas três viroses são poucos e fragmentados, percebe-se que não há estudos que abordam em conjunto todos os parâmetros epidemiológicos de tais vírus. Assim, os objetivos deste trabalho foram estudar o progresso temporal e espacial destas três viroses e verificar a relação entre a epidemiologia das mesmas em campo de abobrinha de moita, além de melhor entender o patossistema em que a clorose letal (causada pelo ZLCV) está inserida Para isso, foram conduzidos experimentos com abobrinha de moita Caserta nos campos experimentais dos Departamentos de Fitopatologia e Nematologia (DFN) e Departamento de Genética (DGN) da Esalq/USP. Primeiramente foram conduzidos em 2009 dois experimentos simultâneos nas áreas do DFN e DGN para estudar a epidemiologia isolada da clorose letal acompanhada da dinâmica populacional do tripes Frankliniella zucchini, vetor deste vírus. Em seguida, em épocas diferentes 3 experimentos foram conduzidos em 2010 com o intuito de comparar as epidemiologias da clorose letal e dos mosaicos comum e amarelo, estes últimos causados por PRSV-W e ZYMV, respectivamente. Nos experimentos apenas com a clorose letal no ano de 2009, o modelo monomolecular foi o que melhor se ajustou aos dados de incidência e através das análises espaciais detectou-se agregação da doença ao final dos dois experimentos. Nos 3 experimentos realizados em 2010, variações na incidência, no ajuste do modelo e no comportamento espacial de cada virose foram freqüentes. Para a clorose letal, o modelo monomolecular ofereceu melhor ajuste apenas na 3ª época de plantio. Nas duas primeiras o modelo gompertz apresentou maior coeficiente de determinação. No comportamento espacial, novamente agregação da doença foi detectada ao final do ciclo da cultura. Para o mosaico amarelo, os modelos que melhores se ajustaram na 1ª, 2ª e 3ª épocas de plantio, foram o logístico e o monomolecular (este nas duas últimas), respectivamente. O padrão espacial desta doença foi ao acaso quando da baixa incidência da doença e agregado nos casos em que elevada incidência ocorreu. Já o mosaico comum apresentou a menor incidência nas 3 épocas. O modelo logístico foi o que melhor se ajustou em todas as épocas e a doença apresentou comportamento espacial ao acaso nos três experimentos. Nos levantamentos do tripes vetor do ZLCV, verificou-se preferência do mesmo por plantas sintomáticas e consideráveis correlações do número de insetos coletados com a incidência da clorose letal.
The zucchini squash (Cucurbita pepo L.) belonging to the Cucurbitaceae family, has a good share of world and brazilian output. However, as in every plants of economically important, cucurbits have problems caused by different etiological agents. In the Brazilian production of zucchini squash, already confirmed the presence of 8 viruses, including the potyviruses PRSV-W (Papaya ringspot virus-type W) and ZYMV (Zucchini yellow mosaic virus) and the tospovirus ZLCV (Zucchini lethal chlorosis virus) have been considered the most important viruses by the predominance in several cucurbits producing regions in the Brazil and the considerable damage on production. Whereas the most of the existing epidemiological studies about these three viruses are few and fragmented, it is clear that there are no studies that deal together all the epidemiological parameters of such viruses. The objectives of this work were to study the temporal and spatial progress of these three viruses and the relation between the epidemiology of these viruses in the same field of zucchini squash in addition to better understand the lethal chlorosis pathosystem (caused by ZLCV). Trials were carried out with zucchini squash \'Caserta in the experimental fields of the Departments of Plant Pathology and Nematology (DPP) and Department of Genetics (DGN) at Esalq/USP. The firsts were conducted in 2009 simultaneously in DPP and DGN to study the epidemiology of lethal chlorosis only and to study the population dynamic of thrips Frankliniella zucchini, the vector of this virus. In 2010 three experiments were carried out in different growing seasons in order to compare the epidemiology of the lethal chlorosis, yellow mosaic and common mosaic caused by ZLCV, PRSV-W and ZYMV, respectively. In the experiments with the lethal chlorosis in 2009, the monomolecular model was the best fit to the incidence data and spatial analysis indicated aggregation of the disease at the end of both experiments. In three experiments carried out in 2010, variations in incidence, in the fit of the model and in the spatial distribution of each virus were frequents. For lethal chlorosis, the monomolecular model provided a better fit only in the 3rd growing season. In the first and second growing seasons Gompertz model had the best coefficient of determination. In the spatial distribution, aggregation of disease was detected at the end of the crop cycle again. For yellow mosaic, the models that best fit in the 1st, 2nd and 3rd planting dates were the logistic and monomolecular (this in the last two) respectively. The spatial pattern of this disease were randomly when the disease incidence was low and aggregated when the disease incidence was high. The common mosaic had the lowest incidence in all three seasons. The logistic model was the best fit in all growing seasons and the disease showed a spatial random distribuctions in all experiments. The thrips vector of ZLCV prefer symptomatic plants and good correlations between the number of insects collected with the incidence of lethal chlorosis was found.
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Gasparoto, Maria Cândida de Godoy. "Epidemiologia comparativa entre \'Candidatus Liberibacter asiaticus\' e \'Candidatus Liberibacter americanus\' em ambiente controlado." Universidade de São Paulo, 2010. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-20102010-164555/.

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Huanglongbing é a mais destrutiva doença da citricultura mundial. Seu recente relato no Brasil, em 2004, e a detecção de duas espécies bacterianas associadas à doença -Candidatus Liberibacter asiaticus e Candidatus Liberibacter americanus resultaram em poucos estudos do comportamento do Huanglongbing nas condições dos pomares brasileiros. Os objetivos deste trabalho foram (i) comparar a eficiência de infecção por Candidatus Liberibacter asiaticus e Candidatus Liberibacter americanus em plantas cítricas inoculadas por meio de enxertia com as duas espécies bacterianas, separadamente, e mantidas sob diferentes temperaturas, e (ii) comparar o progresso temporal e espacial do Huanglongbing causado por ambas as espécies, a partir da infecção natural por Diaphorina citri, tendo plantas de citros ou Murraya paniculata (murta) como fonte primária de inóculo. Para alcançar o primeiro objetivo, dois experimentos foram conduzidos em câmaras de crescimento com temperatura e fotofase controladas. A incidência da doença foi determinada por Real-Time PCR de amostras foliares. As temperaturas mais amenas foram favoráveis à infecção por Candidatus Liberibacter americanus, enquanto que altas temperaturas não afetaram a infecção de Candidatus Liberibacter asiaticus. A eficiência de infecção para esta última espécie foi favorecida nas temperaturas de 17/22°C e 22/27°C (noturna/diurna, respectivamente). Para cumprir com o segundo objetivo, um experimento foi conduzido com diferentes fontes de inóculo, que corresponderam aos seguintes tratamentos: (i) plantas de laranjeira doce da variedade Natal infectadas por Candidatus Liberibacter asiaticus ou Candidatus Liberibacter americanus, (ii) unicamente plantas de Murraya paniculata infectadas por Candidatus Liberibacter americanus e (iii) unicamente plantas de laranjeira doce da variedade Natal infectadas por Candidatus Liberibacter americanus. Cada tratamento foi aplicado em um compartimento isolado de uma casade- vegetação. O primeiro tratamento foi repetido. Em todos os compartimentos, 156 a 158 plantas de laranjeira doce da variedade Valência foram dispostas ao redor das plantas fonte de inóculo. Psilídeos livres das bactérias foram periodicamente confinados em plantas fonte de inóculo e, posteriormente foram liberados na casa-de-vegetação para livre movimentação e multiplicação. Quando as duas espécies bacterianas estavam presentes nas diferentes plantas cítricas utilizadas como fonte de inóculo, houve maior detecção de Candidatus Liberibacter asiaticus e maior eficiência de aquisição desta espécie bacteriana por psilídeos. Quando somente Candidatus Liberibacter americanus estava presente nas plantas fonte de inóculo, a eficiência de transmissão foi maior quando Murraya paniculata foi utilizada como fonte de inóculo, mostrando que Diaphorina citri pode adquirir naturalmente Candidatus Liberibacter 12 americanus de Murraya paniculata e transmiti-la para plantas cítricas. A eficiência de aquisição da espécie Candidatus Liberibacter americanus também foi maior tendo Murraya paniculata como planta fonte de inóculo e não citros.
Huanglongbing is the most destructive disease of citrus worldwide. There are few studies on the behavior of Huanglongbing in the Brazilian orchards conditions due to the recent report in Brazil, in 2004. Two bacterial species were associated with the disease in Brazil: Candidatus Liberibacter asiaticus and Candidatus Liberibacter americanus. The aims of this work were (i) to compare the efficiency of infection by Candidatus Liberibacter asiaticus and Candidatus Liberibacter americanus in citrus graft-inoculated plants with both bacterial species, separately, and kept under different temperatures, and (ii) to compare the spatio-temporal progress of Huanglongbing caused by both species, naturally transmitted by Diaphorina citri, having infected citrus plants or Murraya paniculata (jasmine orange) as primary inoculum sources. To achieve the first objective, two experiments were carried out in plant growth chambers with controlled temperature and light. Disease incidence in the inoculated plants was determined by Real-Time PCR of the leaf samples. The milder temperatures were favorable to Candidatus Liberibacter americanus infection, while the higher temperatures did not affect the infection by Candidatus Liberibacter asiaticus. The infection by this latter species was favored by temperatures of 17/22ºC and 22/27°C (night/day, respectively). To achieve the second objective, an experiment was carried out with different sources of inoculum, corresponding to the following treatments: (i) Natal sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter asiaticus or Candidatus Liberibacter americanus, (ii) only Murraya paniculata plants infected by Candidatus Liberibacter americanus and (iii) only Natal sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter americanus. Each treatment was applied in an isolated compartment of a screenhouse. The first treatment was repeated. In all of the compartments, from 156 to 158 Valencia sweet orange plants were located around the source of inoculum plants. Psyllids free of the bacteria were periodically confined in source of inoculum plants and, after this period, they were set free, and allowed to the free movement and multiplication inside the screenhouse. When both bacterial species were present in the different citrus plants as source of inoculum, there was higher detection of Candidatus Liberibacter asiaticus than Candidatus Liberibacter americanus and higher acquisition efficiency of the former bacterial species than the later by psyllids. When only Candidatus Liberibacter americanus was present in the source of inoculum plants, the higher transmission efficiency was reached when Murraya paniculata served as source of inoculum, showing that Diaphorina citri can naturally acquire Candidatus Liberibacter americanus from Murraya paniculata and transmit it to citrus plants. The acquisition efficiency of the 14 Candidatus Liberibacter americanus species was higher with Murraya paniculata as source of inoculum than with citrus plants was the source of inoculum.
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Odenbach, Kylea J. "Epidemiology and Variability of Disease and Deoxynivalenol in Fusarium Head Blight of Wheat in Ohio." The Ohio State University, 2009. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1259765346.

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Martins, Thaïs Dias. "Aspectos epidemiológicos da ferrugem alaranjada da cana-de-açúcar." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-14022011-080631/.

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A ferrugem alaranjada da cana-de-açúcar (Puccinia kuehnii) foi relatada pela primeira vez no Brasil em dezembro de 2009. Em países onde a doença já ocorre, danos de até 40% foram relatados. Diante da presente situação, os objetivos deste estudo foram: (i) verificar a germinação de esporos sob diferentes temperaturas, in vitro, (ii) verificar aspectos epidemiológicos da ferrugem alaranjada sob diferentes períodos de molhamento foliar e temperaturas, in vivo, sob condições controladas, e (iii) desenvolver mapa de zona de risco de epidemia para o Estado de São Paulo. Para a germinação de esporos, in vitro, foram utilizadas lâminas de vidro, vertidas com ágarágua, onde foi espalhada suspensão de conídios sobre o meio de cultura, mantidas em câmara úmida por até 22 h e foram avaliados a porcentagem de esporos germinados e o comprimento dos tubos germinativos. No experimento in vivo, plantas de um mês de idade da variedade suscetível CL85-1040 foram inoculadas e destinadas a 36 tratamentos que representaram a interação entre seis temperaturas (10, 15, 20, 25, 30 e 35°C) e seis períodos de molhamento foliar (0, 4, 8, 12, 18 e 24 h). O experimento foi realizado duas vezes. A severidade da doença foi medida pela contagem de número de lesões na folha zero. Também foram medidos diâmetros das lesões, no último dia de avaliação. Para o desenvolvimento do mapa de zona de risco para o Estado de São Paulo, foram empregados dados meteorológicos dos anos de 2002 a 2005. Modelos de previsão foram utilizados para gerar índices e para calcular as porcentagens de dias favoráveis à infecção. No experimento in vitro observou-se que há germinação de urediniósporos a 10, 15, 20 e 25°C. No entanto, o crescimento do tubo germinativo é mais rápido conforme a temperatura aumenta, apresentando redução do crescimento na temperatura de 25°C ou superior. No experimento in vivo observou-se aparecimento da doença apenas nos tratamentos submetidos a 20 e 25°C, e que a 25°C o tamanho das lesões foi maior que a 20°C. O período de incubação e de latência variaram de 11 a 16 dias. O patógeno requereu o mínimo de 8 h de período de molhamento foliar para o sucesso de sua infecção e a ferrugem foi mais severa em períodos de molhamento a partir de 12 h. A zona de maior favorabilidade de epidemia para ferrugem alaranjada da cana-de-açúcar para o Estado de São Paulo é o Centro-norte. Esses resultados colaboram para o entendimento da epidemiologia da doença e favorecem subsídio para o seu manejo.
Sugarcane orange rust, caused by Puccinia kuehnii, was reported for the first time in Brazil in December of 2009. In countries where the disease already occurs, there were related damages around 40%. The objective of this study was: (i) to verify the spore germination under different temperatures in vitro; (ii) to verify the epidemiological aspects of orange rust under different leaf wetness duration and temperatures, in vivo, under controlled conditions; and (iii) to develop risk maps for the disease epidemic for Sao Paulo State. For spore germination, in vitro, water agar was poured on slides and spores suspension was spread on the media and kept under wet chamber for up to 22 h. In the in vitro evaluations, there was recorded the percentage of spore germination and the length of the germ tubes. For the in vivo experiment, pots with one-month-old plants of the susceptible variety CL85-1040 were inoculated and submitted to 36 treatments that represented the interaction of six temperatures (10, 15, 20, 25, 30 and 35°C) and six leaf wetness duration (0, 4, 8, 12, 18 and 24 h). This experiment was repeated twice. The severity of the disease was measured counting the number of lesions on the zero leaf. Diameter of lesions was also recorded on the last day of assessment. For the development of risk zones maps for the disease epidemic for Sao Paulo State, we used meteorological data from the years 2002 to 2005. Forecast models were used to create indexes and to calculate the percent of favorable days for the infection. The in vitro experiment shows that the urediniospores germinate at 10, 15, 20 and 25°C. However, the germ tube growth is faster as the temperature increases, reducing the growth as the temperature reaches 25°C or more. In the in vivo experiment, the disease just occurred at 20 and 25°C, and at 25°C the size of the lesions is superior than at 20°C. The incubation and latent period varied from 11 to 16 days, depending on the treatment. The pathogen required at least 8 h of leaf wetness duration for the success of the infection, and the disease was more severe at over 12 h of leaf wetness duration. The most favorable zone for orange rust epidemic in the Sao Paulo State is the North Central area.
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Baggio, Juliana Silveira. "Penetração de Rhizopus stolonifer em pêssegos não injuriados e progresso espaço-temporal da podridão mole." Universidade de São Paulo, 2013. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-13032013-161315/.

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A Podridão Mole, causada por espécies do gênero Rhizopus, sendo a espécie R. stolonifer a mais comum, é uma das principais doenças pós-colheita de pêssegos. O desenvolvimento do patógeno prejudica a comercialização de pêssegos em mercados atacadistas e varejistas, consistindo em uma das principais causas de rejeição de frutos e da redução do preço de venda da caixa de pêssego. O fungo pode causar podridões em outros frutos e vegetais com níveis similares de perdas. Essa doença está intimamente relacionada à presença de danos físicos ou mecânicos, exemplificados pela presença de injúrias na superfície do fruto, já que Rhizopus é conhecido por penetrar seus hospedeiros via ferimentos. Poucos trabalhos investigaram os mecanismos de penetração do patógeno em pêssegos. Alguns concluíram que o fungo não produz enzimas que auxiliem na penetração direta de frutos. No entanto, observações da ocorrência da doença em pêssegos aparentemente não injuriados sugerem que a penetração direta pode ocorrer. A principal medida de controle da doença consiste no manejo cuidadoso dos frutos justamente para evitar ferimentos. O objetivo desse trabalho consistiu em avaliar os mecanismos de penetração de R. stolonifer em pêssegos, injuriados ou intactos, e caracterizar o progresso espaço-temporal da Podridão Mole nesses frutos. A atividade de enzimas esterases produzidas pelo fungo foi avaliada qualitativamente, a partir da reação de discos de micélio e suspensões de esporos do patógeno em água ou solução nutritiva em diferentes períodos de incubação (0, 4 e 8 horas) com substrato indoxil acetato, para observação da produção de cristais de coloração azul índigo. Os tratamentos que continham discos de micélio e suspensão de esporos em solução nutritiva, após 8 horas de incubação, adquiriram tonalidades mais escuras de azul, devido à formação de cristais oriundos da reação entre enzimas esterases e substrato. Avaliações ao espectrofotômetro foram conduzidas para determinar a quantidade de enzimas produzidas por R. stolonifer quando cultivado em meios com glicose ou cutina, como únicas fontes de carbono. O patógeno foi capaz de crescer em ambos os meios e observou-se maior atividade de enzimas esterases quando o patógeno foi cultivado em meio com cutina. Solução de diisopropil fluorofosfato, inibidor de enzimas cutinases, foi depositada sobre frutos e impediu a manifestação da Podridão Mole em pêssegos inoculados com suspensão de esporos do fungo em solução nutritiva. Pêssegos feridos ou não foram inoculados com suspensão de esporos de R. stolonifer em água e solução nutritiva para estudo do progresso espaço-temporal da Podridão Mole. Frutos sadios colocados próximos a frutos inoculados artificialmente apresentaram sintomas da doença, a qual se disseminou com mesma taxa de progresso em todos os tratamentos. O processo infeccioso de R. stolonifer em pêssegos e nectarinas também foi observado em microscopia óptica e eletrônica de varredura e verificou-se a penetração direta de tecidos intactos pelo fungo. Os resultados obtidos nesse trabalho demonstraram que R. stolonifer é capaz de penetrar diretamente frutos intactos através de esporos germinados em aporte nutritivo externo ao fruto e estolões miceliais. Essas estruturas produzem enzimas esterases, principalmente cutinases, que auxiliam no processo infeccioso.
Soft Rot, caused by Rhizopus stolonifer, is one of the main postharvest diseases on peaches. The pathogen development is prejudicial to the stone fruit commercialization in wholesale and retail markets and the disease can cause reduction in the price of peaches, being one of the main causes of fruit rejection. The pathogen has been responsible for causing rots in other types of fruit and vegetables, with similar level of losses. The disease is related to the occurrence of mechanical and physical damages and the presence of injuries on the fruit surface contributes to the infection by Rhizopus, which is known as a strictly wound parasite. Few studies have investigated the mechanisms of the pathogen penetration in peaches. Some have concluded that the fungus does not produce enzymes that assist in the direct penetration of fruit. However, observations of disease occurrence on apparently uninjured peaches suggest that direct penetration can occur. Careful management to avoid injuries on the fruit is the most important disease control measure. The objective of this research was to evaluate the penetration mechanisms of R. stolonifer on injured or uninjured peaches and characterize the spatio-temporal progress of Soft Rot on these fruit. To determine the esterase enzymes activity, produced by the pathogen, micelial discs and spore suspensions of R. stolonifer on water or nutrient solution in different incubation periods (0, 4 and 8 hours) were added to indoxyl acetate solution, to observe the presence of crystals of indigo blue color. The treatments with micelial discs or spore suspensions on nutrient solution, after 8 hours of incubation, showed darker shade of blue, because of the production of crystals from the reaction between the esterase enzymes and the indoxyl acetate. Spectrophotometer evaluations were carried out to determine the amount of enzymes produced by R. stolonifer when it was grown on culture media with glucose or cutin, as sole carbon sources. The pathogen was able to grow on both media and higher esterase activity was observed when the fungus was grown on cutin media. Diisopropyl fluorophosphate solution, a cutinase inhibitor, was placed over the fruit and prevented Soft Rot development on peaches inoculated with the fungus spore suspension on nutrient solution. Injured or uninjured peaches were inoculated with R. stolonifer spore suspensions on water or nutrient solution to study the spatiotemporal progress of Soft Rot. Healthy fruit placed next to artificially inoculated peaches showed symptoms of the disease, which has spread with the same rate of progress in all treatments. The infectious process of R. stolonifer on peaches and nectarines was also studied on optic and scanning electron microscopy and direct penetration of intact tissues by the fungus was observed. The results of this work showed that R. stolonifer is capable of direct penetration on uninjured peaches by spores germinated on external nutrient support and by micelial stolons. These structures produce esterase enzymes, especially cutinase, that help in the infectious process.
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Flynn, Rebecca Anne. "Developing a Guide and Template to Aid the Preparation of Mosquito Surveillance Plans in Ohio." Miami University / OhioLINK, 2018. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=miami1531496725016722.

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Carneiro, Luciana Celeste. "Caracterização epidemiológica da resistência parcial e análise da tolerância de genótipos de soja à ferrugem asiática." Universidade de São Paulo, 2007. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-14092007-163502/.

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O objetivo deste trabalho foi avaliar a resistência parcial e a tolerância à ferrugem asiática, em sete cultivares comerciais e três linhagens de soja. Os ensaios foram conduzidos no município de Jataí, GO, no ano agrícola de 2005/2006. Ensaios distintos foram realizados para avaliação da resistência parcial e para avaliação da tolerância, todos repetidos em três épocas de plantio, a fim de se obter intensidade variável da doença em diferentes estádios fenológicos da cultura. Nos ensaios para avaliação da resistência parcial, o delineamento experimental foi o de blocos cazualizados com cinco repetições e cada parcela experimental foi composta por cinco linhas de seis metros de comprimento. A severidade da doença foi estimada em intervalos semanais, a partir do surgimento dos primeiros sintomas até a desfolha completa. Os dados foram analisados por meio de regressão não linear e o modelo logístico foi o que apresentou melhor ajuste. As curvas de progresso da doença para os cultivares EMGOPA-315, Luziânia, Pintado, Conquista, COODETEC-219 e para as linhagens 1, 2, e, 3 não apresentaram estabilização assintótica da severidade em função da desfolha precoce, ficando evidente apenas a fase exponencial de crescimento da doença. As epidemias apresentaram comportamento explosivo e foram muito semelhantes, demonstrando que esses genótipos foram igualmente susceptíveis ao patógeno. Os cultivares Tianá e EMGOPA-313 foram os únicos que apresentaram estabilização assintótica da severidade, em níveis muito abaixo de 1, o que evidenciou a presença de resistência parcial nesses cultivares. Nos ensaios para avaliação da tolerância, o delineamento experimental foi o de blocos casualizados com cinco repetições, com delineamento dos tratamentos em parcelas subdivididas. As parcelas (5 linhas de 12 m de comprimento) foram compostas pelos genótipos, e as subparcelas (5 linhas de 6 m de comprimento), pelo tratamento ou não com fungicida tebuconazole (0,5 L.ha-1) para controle da ferrugem. A severidade da doença foi estimada uma única vez e a tolerância foi avaliada pela análise estatística da diferença de produtividade, peso de mil grãos e de número de vagens e grãos por planta, entre subparcelas tratadas e não tratadas com fungicida, em cada época de plantio. Nenhum genótipo avaliado mostrou-se tolerante à ferrugem asiática da soja.
This work aimed the evaluation of partial resistance and tolerance to soybean asian rust on seven soybean genotypes and 3 lines. The research was conducted at Jataí, GO, during the growing season of 2005/2006. Experiments for partial resistance evaluation were carried out separately from experiments to evaluate tolerance, and in order to have different levels of disease severity, on different soybean growth stages, three trials for each experiment were carried out, each one with a different planting date during the season. Experiments for partial resistance evaluation were arranged on a randomized block design and each experimental unit was made by five soybean lines, 6 m long. The disease severity was estimate on week intervals from the first pustules appearance to the total defoliation. Analyses were done by non linear regression and the logistic model presented the best fitness to the observed data. The early defoliation on cultivars EMGOPA-315, Luziânia, Pintado, Conquista, COODETEC-219 and on lines 1, 2, e, 3 did not allowed the disease progress curves to reach asymptotical stabilization and for such genotypes, just the exponential part of the disease growth could be seen. Epidemics presented an explosive growth and the disease progress curves for such genotypes were similar, suggesting that they were similarly susceptible to the pathogen. The cultivars Tianá e E-313 were the only ones that presented asymptotical stabilization of disease and that happened on severity levels much smaller than 1, what was considered an evidence of partial resistance on those cultivars. Experiments conducted for tolerance evaluation were arranged in a split plot design with five replicates. The main plots (5 soybean rows, 12 m long) were composed by the soybean genotypes and the subplots (5 soybean rows, 6 m long) were those with or without fungicide (tebuconazole 500 mL.ha-1) application for rust control. Disease severity was estimate only once and tolerance was evaluated by the statistical analyses of difference of yield, thousand grain weight and pod and grain numbers, between treated and untreated subplots. None soybean genotypes analyzed presented tolerance to soybean asian rust.
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Tomaseto, Arthur Fernando. "Capacidade de dispersão de Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Psyllidae)." Universidade de São Paulo, 2013. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11146/tde-21022013-160927/.

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O Greening ou Huanglongbing (HLB) é a doença mais devastadora dos citros na atualidade. Levantamentos mostram que a enfermidade está presente em cerca de 60% dos talhões do parque citrícola paulista, demostrando sua grande capacidade de disseminação. O psilídeo-asiático-dos-citros, Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Psylidae) é um importante vetor dos agentes causais associados ao HLB. Sua capacidade de dispersão está intimamente relacionada ao progresso da doença no campo. Não se tem conhecimento dos principais fatores que possam interferir no deslocamento do inseto até plantas cítricas. Sendo assim, a presente pesquisa teve como objetivo investigar a influência de alguns fatores ambientais sobre a dispersão do psilídeo D. citri, discutindo-os em relação à epidemiologia do HLB dos citros. Inicialmente foram realizados testes em laboratório para adaptação da metodologia de marcação, liberação e recaptura usando pó fluorescente. Grupos de psilídeos adultos foram marcados e sua sobrevivência avaliada, verificando a influência de quatro cores distintas de pó fluorescente (amarelo, azul, rosa e verde). Posteriormente realizaram-se estudos de campo com quatro liberações de psilídeos, com marcadores distintos, em quatro áreas experimentais circulares e adjacentes, sendo formadas por círculos concêntricos localizados a 18, 24 e 30 m de cada centro de liberação. Os insetos foram monitorados visualmente e por armadilhas adesivas amarelas. Nas 1ª e 2ª liberações, foi verificado o efeito das coberturas vegetais milho (Zea mays L.) e capim-braquiária (Brachiaria decumbens Stapf.) na dispersão de D. citri. Já nas 3ª e 4ª liberações, foi estudado o efeito de brotações no deslocamento do inseto. A influência dos ventos foi avaliada em ambas as situações. A análise de sobrevivência indicou que não houve interferência das quatro cores de pó fluorescente em D. citri, sendo a marcação visível no corpo dos insetos durante os 48 dias de avaliação. De acordo com as análises fatoriais, não foi observada qualquer interferência da cobertura vegetal milho, medindo 2 m de altura, na dispersão do inseto. Na presença de brotações, adultos de D. citri dispersaram menos em busca de novos hospedeiros, acumulando-se nas primeiras linhas de plantas cítricas. Após 6 horas da liberação, a capacidade de dispersão máxima de D. citri foi três vezes maior na condição de ausência de brotações. A dispersão média e a área total abrangida variaram assimptoticamente com o tempo, ou seja, o inseto possui inicialmente grande velocidade de dispersão, porém esta tende a se estabilizar com o incremento do tempo. Esses resultados deixam claro que D. citri realiza movimentos dependendo das condições fenológicas de seus hospedeiros, ressaltando a grande importância de se intensificar métodos de controle regionais em épocas em que o fluxo vegetativo das plantas cítricas não é tão intenso.
Greening or Huanglongbing (HLB) is the most devastating disease of citrus today. Surveys show that the disease is present in about 60% of the park stands citrus Sao Paulo, demonstrating its great ability to spread. The Asian citrus psyllid, Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Psylidae) is an important vector of the causative agents associated with HLB. Its ability to spread is closely related to disease progression in the field. There is no knowledge of the main factors that can affect the movement of the insect to citrus plants. Thus, the present study aimed to investigate the influence of some environmental factors on the dispersal of psyllid D. citri, discussing them in relation to the epidemiology of HLB of citrus. Initially tests were performed in the laboratory to adapt the methodology of marking, release and recapture using fluorescent powder. Groups of adult psyllids were marked and their survival assessed by checking the influence of four different colors of fluorescent powder (yellow, blue, pink and green). Subsequent studies were conducted with four field releases psyllids, with distinct markers on four experimental areas adjacent circular and being formed by concentric circles located at 18, 24 and 30 m for each center release. The insects were monitored visually and by yellow sticky traps. In the 1st and 2nd releases, was to determine the effect of cover crops maize (Zea mays L.) and grass (Brachiaria decumbens Stapf.) in the dispersal of D. citri. In the 3rd and 4th releases, were studied the effect of shootings in insect movement. The influence of the wind has been evaluated in both situations. Survival analysis indicated that there was no interference of the four colors of fluorescent powder on D. citri, and marking was visible on the body of insects during the 48 days of evaluation. According to the factor analysis, no interference of vegetation corn (measuring 2 m in height) was observed in the dispersal of the insect. In the presence of shoots, adult D. citri less dispersed looking for new hosts and it accumulate in the first lines of citrus plants. After 6 hours of release, the D. citri maximum dispersal was three times higher in the condition of absence of shoots. The dispersal medium and the total area covered varied asymptotically with time, ie the insect has initially high speed dispersal, but this tends to stabilize with increasing time. These results clearly show that D. citri performs movements depending on the phenology of its hosts, emphasizing the importance of intensifying regional control methods at times when the flow of plant citrus is not intense.
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Silva, Maria Cristina Canale Rappussi da. "Enfezamento da couve-flor: identificação molecular de fitoplasmas, evidência de potencial vetor e análise epidemiológica da doença." Universidade de São Paulo, 2010. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-03082010-083905/.

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A couve-flor está entre as folhosas mais produzidas na região do Cinturão Verde de São Paulo. A planta apresenta alto valor nutricional para os consumidores e relevante importância econômica e social para os agricultores. Em campos comerciais, têm sido observadas plantas exibindo sintomas de enfezamento e deformação da inflorescência, além da necrose dos vasos condutores. A doença foi denominada de enfezamento e a sua incidência e severidade têm se tornado mais intensas nos últimos anos, afetando a produção e levando ao abandono do cultivo. O quadro sintomatológico levantou a suspeita de que a doença pudesse estar sendo causada por fitoplasmas. Desta forma, este trabalho teve como objetivos detectar e identificar os fitoplasmas associados às plantas doentes de couve-flor, demonstrar a sua patogenicidade, buscar possíveis insetos vetores do agente patogênico e analisar a distribuição espacial da doença no campo. Amostras de plantas coletadas na região do Cinturão Verde ou enviadas de outras localidades tiveram o DNA total extraído e submetido a reações de PCR. A amplificação de fragmentos genômicos de 1,2 kb evidenciaram a presença de fitoplasmas nos tecidos de 66% das plantas sintomáticas. A detecção de fitoplasmas em plantas assintomáticas revelou a ocorrência de infecção latente e que plantas sem sintomas aparentes podem ser portadoras do patógeno. O emprego de PCR com primers específicos, análises convencionais e virtuais de RFLP e análise filogenética permitiram a identificação de fitoplasmas afiliados aos grupos 16SrIII-J, 16SrXIII e 16SrXV-A, com predominância para a ocorrência do grupo 16SrIII. Secções histológicas feitas à mão da região vascular de plantas de couve-flor doentes observadas em microscópio de luz revelaram que a região do floema apresentava-se escurecido e com início de degeneração celular. Fitoplasmas do grupo 16SrXIII foram encontrados em cigarrinhas da espécie Balclutha hebe coletadas em campo cultivado com couve-flor. Estes insetos foram utilizados em experimentos de transmissão e foram capazes de inocular fitoplasmas em plantas sadias de couve-flor e vinca. A transmissão também ocorreu a partir de plantas doentes de couve-flor para plantas sadias de vinca, através do emprego da planta parasita cuscuta. Análise epidemiológica da doença foi feita em dez campos de cultivo de couve-flor, localizados no município de Sorocaba-SP. Análises do índice de dispersão, lei de Taylor modificada e áreas isopatas evidenciaram que plantas de couveflor com sintomas de enfezamento encontraram-se agregadas no campo, e que os focos da doença tinham início nos bordos da cultura. O presente trabalho demonstrou que o enfezamento da couve-flor está associado aos fitoplasmas, os quais podem estar sendo transmitidos por cigarrinhas, sendo que, em termos epidemiológicos, a doença tem padrão agregado de distribuição no campo.
Cauliflower is among the most produced vegetable in the region of the Green Belt of Sao Paulo State. It has high nutritional value and relevant social and economic importance for farmers. In commercial fields, it has been observed plants exhibiting symptoms of stunting, deformation of the inflorescence and conductive vessel necrosis. The disease was named cauliflower stunt and its incidence and severity have become more intense in the past years, the production is being affected and the field is abandoned by the growers. The symptomatology raised the suspect that the disease could be caused by phytoplasmas. Thus, this study aimed to detect and identify phytoplasmas associated to diseased cauliflowers, demonstrate its pathogenicity, look for possible insect vectors of the pathogen and analyse the spatial distributions of disease in the field. Plant samples collected in the region of the green belt or sent from other locations had the total DNA extracted and subjected to PCR reactions. Amplification of genomic fragments of 1.2 kb revealed the presence of phytoplasmas in 66% of the symptomatic plants. The detection of phytoplasmas in asymptomatic plants revealed the occurrence of latent infection and that plants without visible symptoms may be infected. The use of specific primers, conventional and virtual RFLP analysis and phylogenetic analysis allowed the identification of phytoplasmas affiliated to 16SrIII-J, 16SrXIII and 16SrXV-A groups, and predominantly the occurrence of 16SrIII group. Histological sections made by hand of the vascular region of symptomatic cauliflower were observed under light microscope and revealed that the phloem was darkened and with beginning of cellular degeneration. The 16SrXIII phytoplasma was found in Balclutha hebe from cauliflower field. These insects were used in experiments and were able to transmit phytoplasmas to healthy cauliflower and periwinkle. The transmission also occurred from diseased cauliflower to healthy periwinkle through the parasitic plant dodder. Epidemiological analysis of the disease was made in ten plots of cauliflower, located in Sorocaba, SP. Dispersion index, modified Taylors law and isopath areas analysis showed that cauliflower plants with symptoms of stunting were aggregated in field and initial foci were at the edge of the plot. This study demonstrated that cauliflower stunt is associated with phytoplasmas, that may be being transmitted by insects (Homoptera) and, in epidemiological terms, the diseased plants show aggregated pattern of distribution in the field.
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Sanoamuang, Niwat. "Epidemiological aspects of MBC resistance in Monilinia fructicola (Wint.) Honey and mechanisms of resistance." Lincoln University, 1992. http://hdl.handle.net/10182/1362.

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Isolates of Monilinia fructicola (Wint.) Honey obtained from stone fruit orchards in Hawkes Bay, North Island and from Californian fruit exported to New Zealand, were tested for resistance to methyl benzimidazole carbamate (MBC). Resistant isolates from the North Island had EC₅₀ values of >30,000, and most isolates from the imported fruit had of values approximately 1.5 mg a.i./l carbendazim. Sensitive isolates failed to grow on 1 mg a.i./l carbendazim. A detached peach shoot system was used in controlled conditions for estimation of values for incubation period, latent period and rate of spore production on flowers (cv Glohaven). The same variables and the rate of colonisation of host tissue were measured on fruit (cv Fantasia) in controlled conditions. An inoculum density of 1x10⁴ spore/flower or fruit greatly increased fitness in vivo compared to an inoculum density of 1x10² spore/flower (fruit). Isolates varied considerably, but there was no consistent relationship between the degrees of resistance and fitness. This was in contrast to earlier studies with dicarboximide resistant strains of M. fructicola. The survival in the field of 10 isolates resistant or sensitive to MBC or dicarboximide fungicides on twig cankers and mummified fruit was compared. The ability to produce conidia on twig cankers inoculated in late spring 1989 was maintained by all sensitive and MBC resistant isolates for at least 1 year. The production of conidia on mummified fruit inoculated in February 1990 decreased after 2-3 months in the field but some conidia were still produced on all fruit in the following spring. Dicarboximide resistant isolates produced less conidia than either the MBC resistant and the sensitive isolates. The pathogenicity and fitness of all isolates were similar to the original values after survival for 1 year. A technique was developed to produce apothecia reliably from inoculated peach (cv Black Boy) and nectarine (cv Fantasia) fruit in controlled conditions in the laboratory. The fruit were inoculated with resistant or sensitive isolates, or combinations, and were incubated for 8 weeks at 25°C (±1°C) with 12 hours photoperiod of fluorescent light (Sylvania 2x65 W, daylight) to produce mummified fruit. The fruit were then buried in moist autoclaved peat moss for 10 weeks at 25°C (±1°C) in the dark to form stromata. These fruit were then hydrated with running tap-water (total hardness (CaCO₃) = 47 g/m³ and conductivity at 20°C = 12.7 mS/m) for 72 hours. The hydrated mummified fruit were placed in moist peat moss and were incubated for 13-14 weeks at 8°C (±0.5°C) in the dark. At the end of this period, stipe initials were visible. Differentiation of stipe initials into mature apothecia occurred within 15-20 days after transfer to 12°C (±2 °C) with a 12 hour photoperiod of fluorescent and incandescent light. All isolates produced apothecia when treated in this way. A technique for isolation of ascospore sets in linear arrangement was developed for tetrad analysis of the inheritance of resistance. At least 3 hours of fluorescent and incandescent light at 12°C (±2°C) was essential to allow ascospore ejection from individual asci taken from apothecia previously maintained in a 12 hour photoperiod at 12°C (±1°C). A water film on the surface of water agar was necessary to hold a set of ejected ascospores in linear sequence. Single ascospores were obtained in sequence with the aid of a micromanipulator. Genetic analysis of MBC resistant isolates was carried out on ascospores derived from apothecia produced in the laboratory. Analysis of ascospore sets in linear arrangement and ascospore populations indicated that resistance to >30,000 mg a.i./l carbendazim (high-resistant) is governed by a single major gene and is affected by gene conversion mechanisms. Crossing over was frequent, suggesting that recombination of resistance with other characters, such as pathogenicity and fitness, may occur readily. The segregation ratio (1:1) from most resistant isolates revealed that heterokaryons containing both resistant and sensitive alleles were common in resistant populations and that resistance is dominant. Allozyme analysis of ascospore progeny through electrophoresis revealed a narrow genetic base of M. fructicola in New Zealand. The technique for reliable apothecial production in controlled conditions developed in this study provided an important step for the determination of the biology of M. fructicola strains resistant to MBC fungicides, and the complexity of its life cycle. Genetic heterogeneity in field populations can be conserved in one isolate through heterokaryosis, thus providing for adaptability of the pathogen to the changing environmental conditions. Knowledge on genetic variability, overwintering ability, pathogenicity and fitness factors may be useful for future management strategies of stone fruit brown rot. Special emphasis should be made in particular to prevent primary infection on blossoms, which would delay the establishment of recombinant strains of M. fructicola and the onset of brown rot epidemics.
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Viljanen-Rollinson, S. L. H. "Expression and detection of quantitative resistance to Erysiphe pisi DC. in pea (Pisum sativum L.)." Lincoln University, 1996. http://hdl.handle.net/10182/1657.

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Characteristics of quantitative resistance in pea (Pisum sativum L.) to Erysiphe pisi DC, the pathogen causing powdery mildew, were investigated. Cultivars and seedlines of pea expressing quantitative resistance to E. pisi were identified and evaluated, by measuring the amounts of pathogen present on plant surfaces in field and glasshouse experiments. Disease severity on cv. Quantum was intermediate when compared with that on cv. Bolero (susceptible) and cv. Resal (resistant) in a field experiment. In glasshouse experiments, two groups of cultivars, one with a high degree of resistance and the other with nil to low degrees of resistance to E. pisi, were identified. This indicated either that a different mechanism of resistance applied in the two groups, or that there has been no previous selection for intermediate resistance. Several other cultivars expressing quantitative resistance were identified in a field experiment. Quantitative resistance in Quantum did not affect germination of E. pisi conidia, but reduced infection efficiency of conidia on this cultivar compared with cv. Pania (susceptible). Other epidemiological characteristics of quantitative resistance expression in Quantum relative to Pania were a 33% reduction in total conidium production and a 16% increase in time to maximum daily conidium production, both expressed on a colony area basis. In Bolero, the total conidium production was reduced relative to Pania, but the time to maximum spore production on a colony area basis was shorter. There were no differences between the cultivars in pathogen colony size or numbers of haustoria produced by the pathogen. Electron microscope studies suggested that haustoria in Quantum plants were smaller and less lobed than those in Pania plants and the surface area to volume ratios of the lobes and haustorial bodies were larger in Pania than in Quantum. The progress in time and spread in space of E. pisi was measured in field plots of cultivars Quantum, Pania and Bolero as disease severity (proportion of leaf area infected). Division of leaves (nodes) into three different age groups (young, medium, old) was necessary because of large variability in disease severity within plants. Disease severity on leaves at young nodes was less than 4% until the final assessment at 35 days after inoculation (dai). Exponential disease progress curves were fitted for leaves at medium nodes. Mean disease severity on medium nodes 12 dai was greatest (P<0.001) on Bolero and Pania (9.3 and 6.8% of leaf area infected respectively), and least on Quantum (1.6%). The mean disease relative growth rate was greatest (P<0.001) for Quantum, but was delayed compared to Pania and Bolero. Gompertz growth curves were fitted to disease progress data for leaves at old nodes. The asymptote was 78.2% of leaf area infected on Quantum, significantly lower (P<0.001) than on Bolero or Pania, which reached 100%. The point of inflection on Quantum occurred 22.8 dai, later (P<0.001) than on Pania (18.8 dai) and Bolero (18.3 dai), and the mean disease severity at the point of inflection was 28.8% for Quantum, less (P<0.00l) than on Pania (38.9%) or Bolero (38.5%). The average daily rates of increase in disease severity did not differ between the cultivars. Disease progress on Quantum was delayed compared with Pania and Bolero. Disease gradients from inoculum foci to 12 m were detected at early stages of the epidemic but the effects of background inoculum and the rate of disease progress were greater than the focus effect. Gradients flattened with time as the disease epidemic intensified, which was evident from the large isopathic rates (between 2.2 and 4.0 m d⁻¹) Some epidemiological variables expressed in controlled environments (low infection efficiency, low maximum daily spore production and long time to maximum spore production) that characterised quantitative resistance in Quantum were correlated with disease progress and spread in the field. These findings could be utilised in pea breeding programmes to identify parent lines from which quantitatively resistant progeny could be selected.
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Behlau, Franklin. "Epidemiologia do cancro cítrico (Xanthomonas axonopodis pv. citri) em laranja 'Pêra' (Citrus sinensis) sob condições de controle químico e cultural." Universidade de São Paulo, 2006. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-22082006-153211/.

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Анотація:
O cancro cítrico, causado pela bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri, é uma das doenças mais importantes da citricultura. O estudo do efeito de medidas alternativas de controle para o manejo desta doença assume grande importância tanto para áreas citrícolas onde a erradicação de plantas não é a principal medida de controle do cancro cítrico, como no Estado do Paraná, como para regiões onde a prática da erradicação vem sendo adotada como principal medida de controle da doença, como no Estado de São Paulo. Instalado em pomar citrícola do município de Ourizona, na região Noroeste do Estado do Paraná, este trabalho buscou estudar o progresso dessa importante doença em campo sob condições de proteção química das plantas, utilizando produto cúprico; e cultural, por meio de quebra-vento. Além disso, importantes informações relacionadas ao efeito de cada tratamento sobre a produção das plantas de laranja ‘Pêra’ também foram obtidas. Enquanto a aplicação de cobre apresentou efeito significativo na redução dos níveis de cancro cítrico, o emprego de quebra-vento pouco ou nada contribuiu para o controle da doença. Após 29 avaliações mensais, plantas submetidas à aplicação de bactericida cúprico apresentaram valores médios de AUDPC* de incidência da doença nas folhas de cerca de 20 %, nível 44 % inferior ao observado para as plantas não protegidas quimicamente. O mesmo comportamento foi observado para a severidade da doença. Após 18 avaliações mensais foi possível observar que plantas submetidas à aplicação de produto cúprico apresentaram em média folhas com níveis de AUDPC* de severidade 37 % menores do que plantas não protegidas quimicamente. Em 2004, quando os níveis da doença foram relativamente elevados, plantas submetidas ao controle químico apresentaram produção 54 % superior àquelas não tratadas. Em 2005, quando os níveis de cancro foram menores, não foi observada diferença na produtividade entre os tratamentos. Nas duas safras, plantas tratadas com bactericida apresentaram menor incidência da doença em frutos e maior proporção de frutos colhidos em relação a carga total da planta (colhidos + caídos). Dos modelos testados, o logístico foi o mais adequado para descrever o progresso temporal do cancro cítrico nos dois anos estudados para todos os tratamentos. Nas duas safras estudadas a proporção de frutos colhidos foi a variável que apresentou função de dano com maior coeficiente de determinação (R2) quando relacionada aos níveis de incidência e severidade de cancro cítrico observados.
Citrus canker, caused by Xanthomonas axonopodis pv. citri, is one of the most important diseases to citrus production. The effect of alternative measures of citrus canker control is very important to areas where plant eradication is the most important measure of control, as in Sao Paulo State, as well as to areas where eradication is not a major component of canker control, as in Parana State. This work aimed to study the progress of citrus canker in field conditions under chemical control, by using copper sprays; and cultural control, by using windbreak. Field plots were installed in a citrus orchard of ‘Pêra’ sweet orange located in Ourizona county, northwest of Parana State, Brazil. Information regarding the effect of each treatment alone or in combination was assessed. Whereas copper sprays showed significant effect on reducing citrus canker levels, windbreak did not contribute significantly to disease control. After 29 monthly assessments, plants submitted to copper sprays showed values of AUDPC* of citrus canker incidence near to 20 %. This disease level was 44 % lower than that observed to plants not protected with copper compound. The same pattern was observed to disease severity. After 18 monthly assessments, plants sprayed with copper showed values of AUDPC* of disease severity 37 % lower than that observed to plants of the check plots. In 2004, when the citrus canker level was higher, plants treated with copper yielded 54 % more than that not sprayed. In 2005, when the citrus canker level was lower, no significant difference was observed between treatments. In both seasons, plants sprayed with copper showed lower citrus canker incidence on fruits and higher rate of harvested fruits. Among the temporal models tested, the logistic was the most appropriate to describe citrus canker incidence over time in both years studied to all treatments. In both harvests the rate of harvested fruits was the variable that showed the higher coefficient of determination (R2) when related to citrus canker incidence and severity levels.
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Freitas, Debora Maria Sansini. "Tomato severe rugose virus (ToSRV) e Tomato chlorosis virus (ToCV): relações com a Bemisia tabaci biótipo B e eficiência de um inseticida no controle da transmissão do ToSRV." Universidade de São Paulo, 2012. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-25102012-083603/.

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A cultura do tomateiro (Solanum lycopersicum L.) é importante mundialmente devido ao alto consumo de seus frutos. Nos últimos anos surgiram nesta cultura no Brasil alguns vírus emergentes com altas taxas de disseminação, como begomovírus e crinivírus, transmitidos pela Bemisia tabaci biótipo B, que podem causar danos à produção do tomateiro. A espécie de begomovírus atualmente mais encontrada no Brasil, em plantios de tomateiro, é o Tomato severe rugose virus (ToSRV). De 2002 a 2004, pesquisadores relataram incidências desse vírus em mais da metade das amostras com sintomas de geminiviroses coletadas em vários estados brasileiros e sua presença continua sendo verificada frequentemente. No ano de 2006, um crinivírus, o Tomato chlorosis virus (ToCV), foi relatado no Brasil, infectando plantas de tomate no Estado de São Paulo e atualmente encontra-se presente em diveros estados brasileiros. Os objetivos desse trabalho foram: determinar os períodos mínimos de acesso à aquisição e à inoculação do ToSRV e do ToCV pela B. tabaci biótipo B; identificar o período de retenção do ToSRV no inseto e a interação do ToSRV e do ToCV na aquisição e na transmissão por esse aleirodídeo. Também foi avaliada a eficiência do inseticida cloridrato de cartape no controle da disseminação primária e secundária do ToSRV pela B. tabaci biótipo B em tomateiros em gaiolas em casa de vegetação. Finalmente avaliou-se a eficiência do aleirodídeo Trialeurodes vaporariorum na transmissão de um isolado brasileiro do ToCV. Os períodos mínimos de acesso à aquisição e à inoculação de ambos os vírus pela B. tabaci biótipo B foram de cinco minutos. O tempo de retenção do ToSRV em B. tabaci biótipo B foi de 25 dias. A eficiência de um único adulto de B. tabaci na transmissão simultânea do ToSRV e do ToCV para tomateiros foi de 44,7%, similar àquela da transmissão isolada do ToRSV (47,4%) e do ToCV (44,7%). A eficiência de T. vaporariorum na transmissão do ToCV foi inferior à da B. tabaci biótipo B. Usando 40 insetos por vaso com duas plantas as eficiências de transmissão foram 57,7% e 100%, respectivamente. O inseticida cloridrato de cartape reduziu a infecção secundária do ToSRV pela B. tabaci biótipo B, mas não foi eficiente para reduzir a infecção primária em tomateiros.
Tomato (Solanum lycopersicum) is one of the leading vegetables grown and consumed in Brazil and in the world, after potato. The importance of tomato is related to its high consumption worldwide and also its nutritive value. Presently the most important virus diseases responsible for yield losses on tomato crops in Brazil are those caused by begomovirus and crinivirus, both transmitted by Bemisia tabaci biotype B. At the moment the prevalent species of begomovirus is Tomato severe rugose virus (ToSRV). From 2002 to 2004, researchers reported incidence of this virus in more than half of the symptomatic tomato samples collected in several Brazilian states. In 2006, a crinivirus, Tomato chlorosis virus (ToCV), was reported for the first time in Brazil, infecting tomato plants in the State of São Paulo and at present the virus occurs in several Brazilian states. The objectives of this study were to determine the minimum acquisition and inoculation access periods of ToSRV and ToCV by B. tabaci biotype B; identify the retention period of ToSRV in the insect; and the interaction of ToSRV and ToCV on the transmission by this aleyrodidae. It was also evaluated the effectiveness of the insecticide cartap hydrochloride in controlling the primary and secondary spread of ToSRV by B. tabaci biotype B on tomato plants in a greenhouse. Finally, it was evaluated the efficiency of Trialeurodes vaporariorum in the transmission of a Brazilian isolate of ToCV. The minimum acquisition and inoculation access periods for both viruses by B. tabaci biotype B were five minutes. The maximum retention time of ToSRV in B. tabaci biotype B was 25 days. The efficiency of a single adult of B. tabaci to simultaneously transmit ToSRV and ToCV to tomato plants was 44.7%, similar to the transmission of ToRSV (47.4%), and ToCV (44.7%) separately. T. vaporariorum was less efficient than B. tabaci on the transmission of ToCV. Using 40 insects per pot with two plants, transmission efficiencies were 57.7% and 100%, respectively. The insecticide cartap hydrochloride reduced secondary infection of ToSRV transmitted by B. tabaci biotype B, but was not effective in reducing the primary infection in tomato.
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Lopes, Ueder Pedro. "Doenças do Morangueiro: Etiologia, epidemiologia e sensibilidade a fungicidas." Universidade Federal de Viçosa, 2014. http://locus.ufv.br/handle/123456789/1068.

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Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais
The culture of strawberry , Fragaria x ananassa Duch, has faced several problems, among which we highlight those caused by pathogens. In addition to widely known diseases such as gray mold, new diseases have caused serious damage to the crop. In order to study the various problems of strawberry culture, this study aimed to: i) identify the causal agent of a postharvest fruit rot in strawberry , ii) to study the temporal and spatial dynamics of the redness in strawberry, whose etiology is still unknown; iii) determine the species of Botrytis that cause gray mold in strawberry in Brazil iv) conduct a survey of the current situation of fungicides for control of gray mold on strawberry v) to study the sensitivity of isolates of B. cinerea to dicarboxamide and benzimidazole fungicides. In order to identify the causal agent of post harvest fruit rot of strawberry, isolates from symptomatic fruits were analyzed by morphologic and phylogenetic analyzes. After confirming the pathogenicity of the isolates, species identification as Neofusicoccum kwambonambiense and N. parvum was taken. This is the first report of the occurrence of Neofusicoccum kwambonambiense in Brazil and the first report of Neofusicoccum spp. causing rot in strawberry. By studying the pattern of temporal and spatial distribution of the redness of strawberry was conducted in four areas of commercial cultivation. With the data on incidence of disease progress curves and dispersion maps were constructed, and analysis of aggregation of plants by ordinary runs test. The results showed that the disease has a similar disease biotic distribution pattern similar to diseases which are dispersed in the row. To achieve other goals, isolates were obtained from plants with symptoms of gray mold on various properties of different cities in the states of Espírito Santo, Minas Gerais and São Paulo, totaling 200 isolates. Initially, a study was conducted to verify the occurrence of other species of Botrytis in the fields of strawberry cultivation in Brazil. For this, the extraction of DNA from all strains was performed, followed by PCR with the specific species and B. cinerea and B. caroliniana primers. Despite the morphological variation observed among isolates , all were identified as B. cinerea . The survey on the practices used to control gray mold on strawberry was performed directly with the producers, who were asked about the products used for the control of disease, efficiency of these products and use of the practice of removing diseased material . It was possible to observe many problems, especially reduced use of cultural control measures, the use of products not recommended for culture and the low level of knowledge of the farmers. Finally, the sensitivity analysis of the isolated main culture fungicides (iprodione , procymidone and thiophanate- methyl) was carried. Thus, a total of 100 isolates were grown in culture medium containing different doses of the fungicide was used. The results showed that 89% of isolates were insensitive to thiophanate-methyl fungicide, 36% to and 54% to procymidone. Considering the limited number of fungicides registered for the control of gray mold and the low sensitivity of isolates of B. cinerea to these products , it becomes difficult to manage this important disease of strawberry.
A cultura do morangueiro, Fragaria x ananassa Duch, tem enfrentado diversos problemas, dentre os quais destacam-se os causados por patógenos. Além de doenças amplamente conhecidas, como o mofo cinzento, novas doenças vêm causando sérios danos à cultura. Visando estudar os diversos problemas da cultura do morangueiro, este trabalho teve por objetivos: i) identificar o agente causal de uma podridão pós-colheita em frutos de morango; ii) estudar a dinâmica temporal e espacial do vermelhão do morangueiro, cuja etiologia é ainda desconhecida; iii) determinar as espécies de Botrytis que causam mofo cinzento em morangueiro no Brasil; iv) realizar um levantamento da situação atual do uso de fungicidas para controle do mofo cinzento do morangueiro; v) estudar a sensibilidade de isolados de B. cinerea aos fungicidas dicarboxamidas e benzimidazóis. A fim de identificar o agente causal da podridão pós-colheita de frutos de morango, isolados obtidos a partir de frutos sintomáticos foram analisados por meio de análises morfológicas e filogenéticas. Após a confirmação da patogenicidade dos isolados, foi feita a identificação das espécies como Neofusicoccum kwambonambiense e N. parvum. Este é o primeiro relato da ocorrência de Neofusicoccum kwambonambiense no Brasil e o primeiro relato de Neofusicoccum spp. causando podridão em morango. O estudo do padrão de distribuição temporal e espacial do vermelhão do morangueiro foi realizado em quatro áreas de cultivo comercial. Com os dados de incidência da doença foram construídas curvas de progresso e mapas de dispersão, além da análise de agregação de plantas pelo teste de ordinário runs. Os resultados mostraram que a doença apresenta comportamento semelhante a uma doença biótica com padrão de distribuição semelhante ao de doenças que se dispersam na linha de plantio. Para atingir os demais objetivos, foram obtidos isolados a partir de plantas com sintomas do mofo cinzento, em diversas propriedades de diferentes cidades nos estados do Espírito Santo, Minas Gerais e São Paulo, totalizando 200 isolados. Inicialmente, foi realizado um estudo para verificar a ocorrência de outra espécie de Botrytis nos campos de cultivo de morango no Brasil. Para isso, foi feita a extração de DNA de todos os isolados, seguindo-se à reação de PCR com primers específicos para as espécies B. cinerea e B. caroliniana. Apesar da variação morfológica observada entre os isolados, todos foram identificados como B. cinerea. O levantamento sobre as práticas utilizadas para controle do mofo cinzento do morangueiro foi realizado diretamente com os produtores, que foram questionados quanto aos produtos utilizados para o controle da doença, eficiência de controle dos produtos e uso da prática de retirada de material doente. Foi possível observar diversos problemas, destacando-se o reduzido uso de medidas de controle cultural, o uso de produtos não recomendados para a cultura e o baixo nível de conhecimento dos produtores. Por fim, foi realizada a análise de sensibilidade dos isolados aos principais fungicidas utilizados na cultura (iprodiona, procimidona e tiofanato-metílico). Para isso, foi utilizado um total de 100 isolados, os quais foram crescidos em meio de cultura contendo diferentes doses dos fungicidas. Os resultados mostraram que 89% dos isolados foram insensíveis ao fungicida tiofanato-metílico, 36% ao iprodiona e 54% ao procimidona. Considerando o número restrito de fungicidas registrados para o controle do mofo cinzento e a baixa sensibilidade dos isolados de B. cinerea a estes produtos, torna-se difícil o manejo dessa importante doença do morangueiro.
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González, Domínguez Elisa. "Biology, epidemiology and control of Fusicladium eriobotryae, causal agent of loquat scab." Doctoral thesis, Universitat Politècnica de València, 2014. http://hdl.handle.net/10251/38715.

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El moteado del níspero, causado por el hongo Fusicladium eriobotryae es la principal enfermedad que afecta al cultivo del níspero, produciendo pérdidas importantes en la cosecha en los años con condiciones climáticas adecuadas. Sin embargo, no existen estudios sobre la epidemiología y el control de esta enfermedad, por lo que éstos constituyen el principal objetivo de la presente Tesis. Para ello, se va ha caracterizar in vitro y en campo la influencia de las principales variables climáticas en el desarrollo de F. eriobotryae, desarrollándose ecuaciones matemáticas que modelicen esta relación. Por otro lado, se va a llevar a cabo un modelo epidemiológico para el moteado del níspero capaz de predecir, en función de las principales variables climáticas el riesgo de infección. Además, se realizará un estudio del control de la enfermedad que comprenderá, por un lado, la evaluación in vitro y en planta de la efectividad de las principales materias activas utilizadas para el control del moteado del níspero, y por otro la evaluación del grado de resistencia de una colección de aislados de F. eriobotryae a DMI y Metil-Tiofanato y la caracterización molecular de la misma.
González Domínguez, E. (2014). Biology, epidemiology and control of Fusicladium eriobotryae, causal agent of loquat scab [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/38715
TESIS
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Hodge, Brian Allen. "Occurrence, Diversity, and Impact of Viruses in Ohio." The Ohio State University, 2020. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1606307407425512.

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Ingram, Russell J. "Cause and Impacts of the Early Season Collapse of Lilium grayi (Gray’s lily), on Roan Mountain, TN/NC." Digital Commons @ East Tennessee State University, 2013. https://dc.etsu.edu/etd/1190.

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A population of the rare Southern Appalachian endemic species Lilium grayi, (Gray’s lily) Roan Mountain, TN/NC was monitored for 2 years to determine the cause and impact of an early season collapse. High concentrations of the Lilium spp. host-specific fungal phytopathogen, Pseudocercosporella inconspicua (G. Winter) U. Braun were associated with 19/20 symptomatic and 0/30 asymptomatic plants. Strength of the association between pathogen and disease and the replication of disease symptoms in 4/4 healthy hosts showed that P. inconspicua was the causal agent of the disease referred to as lily leaf spot. Disease had a severe impact on the population with 59% of mature and 98% of adolescent plants undergoing early senescence. Only 32% of mature plants produced capsules and they were frequently diseased. A recurring spatiotemporal pattern typical of an infectious disease suggested that the lily leaf spot disease is capable of causing sequential annual epidemics of unknown long-term consequences to the stability of the host population.
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Thielman, Justin. "Do Characteristics of the Built Environment Influence Walking Behaviour Among Urban Adults? A Conceptual Framework, Systematic Review, and Research Plan." Thesis, Université d'Ottawa / University of Ottawa, 2014. http://hdl.handle.net/10393/31716.

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Objectives were to improve conceptualization of associations between built environment characteristics (BECs) and walking, synthesize evidence on associations, and propose future research that addresses limitations in existing studies. I designed a conceptual framework of hypothesized BEC - walking associations. I conducted a systematic review, searching MEDLINE, EMBASE, PsycINFO, and TRID for studies investigating BEC - walking associations. Two reviewers screened articles for inclusion. I assessed methodological quality and extracted data from included studies. I used the framework’s hypothesized associations to categorize and synthesize results, then analyzed study limitations and proposed future research that would address many limitations. The review identified 13 studies with 64 estimates that met all criteria. None of the framework’s hypothesized associations had a statistically significant majority of estimates that were statistically significant. Evidence is lacking on BEC – walking associations and more research is needed that addresses methodological issues such as heterogeneous BEC measures and geographic homogeneity.
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Cruz, Christian D. "Wheat blast: quantitative pathway analyses for the Triticum pathotype of Magnaporthe oryzae and phenotypic reaction of U.S. wheat cultivars." Diss., Kansas State University, 2013. http://hdl.handle.net/2097/16387.

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Doctor of Philosophy
Department of Plant Pathology
William W. Bockus
James P. Stack
Wheat blast, caused by the Triticum pathotype of Magnaporthe oryzae (MoT), is a serious disease of wheat causing yield failures and significant economic losses during epidemic years in Brazil, Paraguay, and Bolivia. Although outbreaks occur only sporadically, wheat blast is considered a major disease affecting wheat production in South America and may be a threat to the wheat crop in the United States. Wheat is a major crop in the U.S. and wheat exports from the U.S. are important to food security of several countries around the World. Thus, it is important to understand the potential for MoT entry and establishment into the U.S. and to test U.S. wheat cultivars for susceptibility to MoT. The hypotheses of this research project were a) importing wheat grain from Brazil does not pose a risk for MoT establishment in the U.S., and b) resistance to MoT head infection does not exist in U.S. hard red winter wheat elite cultivars. Quantitative pathway analysis models were used to estimate the risk of MoT entry and establishment, in the coterminous U.S. and in a more targeted area within southeast North Carolina, via the importation of wheat grain from Brazil. The pathway model predicted that significant risk for MoT entry and establishment exists in some areas of the U.S. However, in approximately 60% of the coterminous U.S. winter wheat production areas the risk of MoT establishment was estimated to be zero. With respect to winter wheat growing areas in the U.S., conditions for MoT establishment and wheat blast outbreak occur only in small, restricted geographic areas. A higher resolution pathway analysis based on a ground transportation corridor in North Carolina indicated that conditions for MoT establishment exist seven out of ten years. Among U.S. cultivars tested, a continuum in severity to head blast was observed; cultivars Everest and Karl 92 were highly susceptible with more than 90% disease severity, while cultivars PostRock, Jackpot, Overley, Jagalene, Jagger, and Santa Fe showed less than 3% infection.
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Holm, Tilda, and Patrik Svensson. "Vegansk kost och typ 2-diabetes." Thesis, Högskolan i Skövde, Institutionen för hälsovetenskaper, 2021. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:his:diva-20206.

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Introduktion: Kardiovaskulära sjukdomar är en av de vanligaste sjukdomarna världen över och står årligen för 18 miljoner dödsfall, en tredjedel av alla dödsfall. En av dessa sjukdomar är diabetes som en av elva i världen har i någon form och mörkertalet är stort. Typ 2-diabetes (T2D) kan vara ärftlig men är också påverkbart. Riskfaktorerna kan förebyggas genom en hälsosam livsstil som innefattar fysisk aktivitet och hälsosam kost, som kan reducera övervikt. En skyddsfaktor är frukt och grönsaker, något som en vegansk diet till stora delar består av. Syfte: Syftet med denna studie är att genom två perspektiv (primär- och sekundärprevention) undersöka om en vegansk kost minskar risken för T2D. Metod: Med en strukturerad litteraturstudie har datainsamling skett via databaser PubMed och Cochrane Library. Vald analysmetod var innehållsanalys. Resultat: Från 21 granskade artiklar framkom sex olika kategorier: 1) Prevention, prevalens och incidens av T2D (veganer löper lägre risk att drabbas av T2D); 2) Vikt, BMI och kroppsmått (en vegansk kost främjar viktnedgång och sänkt BMI vid övervikt); 3) Blodvärden och blodtryck (både systoliskt och diastoliskt blodtryck, HbA1c, glukos, c-peptid, betacellsfunktion och insulinkänslighet förbättras av en vegansk kost); 4) Hormoner (GLP-1, GIP, PYY och amylin optimeras av en vegansk kost); 5) Metabolism (TMAO minskar medan och postprandial metabolism stärks av vegansk kost); och 6) Kolesterol (vegansk kost förbättrar värden för LDL, HDL samt triglycerider). Slutsats: I sin helhet visade resultatet på att en vegansk kost kan minska risken för T2D bland vuxna (≥18 år) på både primär och sekundär nivå.
Introduction: Cardiovascular disease (CVD) is one of the most common diseases worldwide and accounts for 18 million deaths annually, which is one-third of all deaths. One risk factor for CVD is type 2 diabetes (T2D). Globally, one in eleven persons has T2D and undetected cases are high. T2D can be hereditary but people can also be susceptible to T2D. The risk factors can be prevented through a healthy lifestyle including physical activity and healthy diet, which can reduce obesity. A protective factor is dietary intake of fruits and vegetables, something that a vegan diet largely contains. Aim: The aim of this study is to investigate through two perspectives (primary and secondary prevention) whether a vegan diet reduces the risk of T2D. Methods: A systematic literature review accomplished data collection using two databases, PubMed and the Cochrane Library. The analysis method chosen was content analysis. Results: Of 21 articles reviewed, six different categories emerged: 1) prevention, prevalence and incidence of type 2 diabetes (vegans are at lower risk of developing T2D); 2) body weight, body mass index (BMI) and body measurements (a vegan diet promotes weight loss, decreased BMI); 3) Blood values and blood pressure (systolic and diastolic blood pressure, HbA1c , glucose, c-peptide, beta cell function and insulin sensitivity are enhanced by a vegan diet); 4) Hormones (GLP-1, GIP, PYY and amylin are optimized by a vegan diet); 5) Metabolism (TMAO decreases and postprandial metabolism is enhanced by vegan diet); and 6) Cholesterol (vegan diet improves LDL, HDL and triglycerides). Conclusion: The results showed that a vegan diet can reduce the risk of type 2-diabetes among adults (≥18 years) at both primary and secondary levels.
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