Дисертації: "Pirimidine"

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Fantinel, Leonardo. "Síntese de 2-fenil-3H-pirimidin-4-onas 6-metilsubstituídas e 4- trifluormetil-2-ureído pirimidinas." Universidade Federal de Santa Maria, 2009. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4171.

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Анотація:

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
This study was carried out in three parts: At first, three methods for the bromination of 6-alkylsubstituted 2-phenyl-3H-pyrimidin-4-ones was developed for the synthesis of: (i) a new series of 6-alkylsubstituted 5-bromo-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-ones, (ii) a new series of 6-(1-bromoalkyl)-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-ones, and (iii) e new series of 5-bromo-6-(1-bromoalkyl)-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-ones. On the second part, the brominated pyrimidines obtained, were used to synthesize new 6-methylsubstituted 2-phenyl-3Hpyrimidin-4-ones from the reaction of the brominated pyrimidinones with primary and secondary amines, pyridine and sodium azide. On the third part, a new series of 5- e 6-substituted 4-trifluoromethyl-2-ureido pyrimidines was prepared, in good yields, from the cyclocondensation reaction of β- alkoxyvinyl-trifluoromethylketones substituted and dicyanodiamide. The products synthesized in this study were obtained in good yields and were characterized by GC-MS and 1H e 13C RMN spectroscopy. The purity of the products was assured by elemental analysis. Some compounds such as 5-bromo-2-phenyl-6-propyl-3H-pyrimidin-4-one, 5-bromo-6-(1- bromopropyl)-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-one, 5-bromo-6-(1-bromobutyl)-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-one, 6-(1-azidoethyl)-5-bromo-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-one, 6-(1-azidopropyl)-5-bromo-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-one, and 6-(1-azidobutyl)-5-bromo-2-phenyl-3H-pyrimidin-4-one, exhibited significant antimicrobial activity against some microorganisms, such as Candida albicans, Saccharomyces cerevisiae, Staphylococcus aureus, Salmonela, Klebsiela pneumonie among others.
Este trabalho foi realizado em três etapas. Na primeira, foram desenvolvidos três métodos de bromação de 2-fenil-3H-pirimidin-4-onas 6-alquilsubstituídas para a obtenção de: (i) uma série inédita de 5-bromo-2-fenil-3H-pirimidin-4-onas 6-alquilsubstituídas, (ii) uma série inédita de 6-(1- bromoalquil)-2-fenil-3H-pirimidin-4-onas e (iii) uma série inédita de 5-bromo-6-(1-bromoalquil)-2-fenil-3H-pirimidin-4-onas. Na segunda etapa, as pirimidinas bromadas, obtidas na etapa anterior, foram utilizadas para sintetizar novas 2-fenil-3H-pirimidin-4-onas 6-metilsubstituídas através de reações das pirimidinonas bromadas com aminas primárias e secundárias, piridina e azida de sódio. Na terceira etapa, foi sintetizada uma nova série de 4-trifluormetil-2-ureído pirimidinas 5- e 6-substituídas a partir de reações de ciclocondensação entre -alcoxivinil-fluormetilcetonas substituídas e dicianodiamida. Os produtos sintetizados neste trabalho foram obtidos em bons rendimentos e foram caracterizados por CG-EM e RMN de 1H e 13C. A pureza dos produtos foi comprovada por análise elementar. Alguns compostos como 5-bromo-2-fenil-6-propil-3H-pirimidin-4-ona, 5-bromo-6-(1-bromopropil)-2-fenil-3H-pirimidin-4-ona, 5-bromo-6-(1-bromobutil)-2-fenil-3Hpirimidin-4-ona, 6-(1-azidoetil)-5-bromo-2-fenil-3H-pirimidin-4-ona, 6-(1- azidopropil)-5-bromo-2-fenil-3H-pirimidin-4-ona e 6-(1-azidobutil)-5-bromo-2-fenil-3H-pirimidin-4-ona, apresentaram atividade antimicrobiana significativa contra alguns microorganismos como Candida albicans, Saccharomyces cerevisiae, Staphylococcus aureus, Salmonela, Klebsiela pneumonie e outras.

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Bolcato, Chiara. "Progettazione sintesi e valutazione biologica di sistemi eterociclici quali antagonisti per i recettori adenosinici. Validazione di modelli recettoriali." Doctoral thesis, Università degli studi di Trieste, 2008. http://hdl.handle.net/10077/2567.

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Анотація:

2006/2007
La tesi illustra il lavoro di dottorato mirato allo sviluppo di nuovi antagonisti adenosinici attivi nei confronti dei vari sottotipi recettoriali del ligando naturale Adenosina.
XX Ciclo
1977

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Vaitiulionytė, Diana. "Furo[2,3-d]pirimidinų sintezė ir savybės." Master's thesis, Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), 2006. http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2006~D_20060613_174528-81935.

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Анотація:

We report herein on the results of N- and O-alkylation of 5-cyano-2-methylsulfanyl-4(3H)- pyrimidinone with 4-substituted ω-bromoacetophenones. Synthesized N-(phenacyl)-4- pyrimidinones and 4-(phenacyloxy)pyrimidines with suitable substituents in pyrimidine ring are versatile synthons for the preparation of fused pyrimidine heterocycles. Chemical properties of new furo[2,3-d]pyrimidines were investigated. The structure of synthesized compounds was confirmed by data of 1H NMR, IR and UV spectra.

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Juškėnas, Robertas. "Triciklių heterosistemų, turinčių pirazolo[3,4-d]pirimidino fragmentą, sintezė. Intramolekulinės pirimidino azoto atomo reakcijos su O,O-acetaliais tyrimas." Doctoral thesis, Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), 2014. http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2014~D_20140630_154058-49723.

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Анотація:

Heterociklų chemijos vystymasis turi didelę reikšmę įvairioms mokslo sritims ir pramonės raidai. Pagrindinis šios chemijos srities uždavinys – kurti naujus heterociklinių junginių sintezės metodus, leidžiančius paprasčiau, efektyviau gauti norimos struktūros junginius. Tai apima ne tik heterociklų formavimo būdus, bet ir jų funkcionalizavimą, leidžiantį sukurti įvairiomis cheminėmis ir fizikinėmis savybėmis pasižyminčių junginių įvairovę. Šios mokslo srities pasiekimai pritaikomi biochemijoje, farmacijoje, fotofizikoje ir kitose mokslo ir pramonės šakose. Šiame darbe buvo siekiama sukurti efektyvius heterosistemų sintezės būdus, kuriuos galima pritaikyti pirazolo[3,4-d]pirimidino fragmentą turinčių heterociklų formavimui. Šio darbo metu buvo susintetintos trys iki šiol neaprašytos heterociklinės sistemos atliekant peri-kondensuotų heterosistemų sintezę iš 3-amino-4-chlor-1-metil-6-metiltio-1H-pirazolo[3,4-d]pirimidino. Surastos tinkamos sąlygos 4-(2,2-dietoksietilmino)pirimidinų ciklizacijai į 3-etoksi-2,3-dihidroimidazo[1,2-c]pirimidinus. Ištirta pirimidino žiede esančių pakaitų įtaka šiai reakcijai. Parodyta, kad ši reakcija yra suderinama su tokiomis funkcinėmis grupėmis, kaip alkiltio-, cian-, amino-, formilgrupės. Surastas metodas 3-etoksi-2,3-dihidroimidazo[1,2-c]pirazolo[4,3-e]pirimidinų etoksigrupės pakeitimui benziltiogrupe.
The development of heterocyclic chemistry is important for various science areas and for the industry. The main task of this branch of chemistry is the search for the new, more effective synthetic methods for obtaining heterocyclic derivatives. That covers not only the formation of heterocycles, but also their functionalization, which leads to the creation of compounds having various chemical and physical properties. The accomplishments of this area are applied in biochemistry, pharmacochemistry, photophysics and other branches of science and industry. The creation of effective heterocycles synthesis methods, that may be applied for the formation of heterosystems based on pyrazolo[3,4-d]pyrimidine was the main aim in this work. During this work, three hitherto unknown peri-fused heterocyclic systems based on pyrazolo[3,4-d]pyrimidine scaffold were synthesized. The suitable conditions for the cyclization of 4-(2,2-diethoxyethyl)aminopyrimidines to 2,3-dihydroimidazo[1,2-c]pyrimidines were found. The influence of functional groups in pyrimidine moiety for the course of this reaction was investigated. It has been shown that functional groups including alkylthio, cyano, amino, formyl are tolerated in this type of reaction. The method for the replacement of ethoxy group with benzyl mercaptan in 3-ethoxy-2,3-dihydroimidazo[1,2-c]pyrazolo[4,3-e]pyrimidines has been found.

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Sūdžius, Jurgis. "Pirimidino junginių - potencialių karboanhidrazių slopuklių - sintezė ir savybės." Doctoral thesis, Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), 2011. http://vddb.laba.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2011~D_20110519_082321-15451.

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Šio darbo tikslas – pirimidino junginių – potencialių karboanhidrazių (CA) slopiklių –kūrimas. Teoriniai 4-[N-(pirimidin-4-il)]aminobenzensulfonamidų, turinčių pakaitus 2-, 5- ir 6-oje pirimidino žiedo padėtyje, sąveikos su aktyviuoju hCA centru tyrimai parodė, kad šie junginiai gali įsiterpti į aktyvųjį baltymo centrą ir su hCA turėtų sąveikauti kaip tipiški klasikiniai CA slopikliai. Tiksliniai 4-[N-(2,5,6-pakeisti pirimidin-4-il)amino]benzensulfonamidai sintetinti 4,6-dichlorpirimidinuose, 5-oje padėtyje turinčiuose cian-, formil- arba nitrogrupes, chloro atomą keičiant 4-aminobenzensulfonamidu. Bendradarbiaujant su Biotechnologijos instituto mokslininkais, kurie atliko hCA slopinimo susintetintais junginiais tyrimus, tobulintos šių junginių hCA slopinimo savybės. Slopiklių struktūros modifikuotos keičiant jungtuko tarp benzensulfonamido ir pirimidino fragmentų ilgį ir įvedant naujus pakaitus pirimidino žiede, kai kuriais atvejais taip sudarant naujas heterociklines sistemas. Šiuo tikslu ištirta pirimidin-5-karbaldehidų kondensacija su indolin-2-tionais. Nustatyta, kad 4-[N-(pirimidin-4-il)amino](metil-,etil-)benzensulfonamidai, 5-oje pirimidino žiedo padėtyje turintys cian-, formil- arba nitrogrupes, o 6-oje pirimidino žiedo padėtyje turintys benzilamino-, chlor-, metoksi- arba oksogrupes, yra nano- – mikromolinės eilės hCA slopikliai, galintys atrankiai slopinti hCAI, II ar XIII. Jų hCA slopinimo aktyvumą lemia sulfonamido grupės sąveika su katalitiniu cinko jonu ir... [toliau žr. visą tekstą]
The aim of the work was design of pyrimidine derivatives – potent carbonic anhydrase (CA) inhibitors. Theoretical investigation of interaction of 4-[N-(pyrimidin-4-yl)]aminobenzenesulfonamides containing substituents at 2-, 5- and 6- positions of pyrimidine ring with an active site of hCAs suggested that these compounds can fit into an active site of the enzymes and should interact with them as typical hCA inhibitors. Synthesis of target compounds was carried out by substitution of chloro group at 4,6-dichloropyrimidines containing cyano-, formyl- or nitro groups at position 5 of the pyrimidine ring with 4-aminobenzenesulfonamide. Regarding inhibition of hCAs with the synthesized compounds data acquired by the scientists of Institute of Biotechnology, structures of inhibitors were modified in order to improve their binding properties to hCA. It was performed by variation of a linker length between benzenesulfonamide and pyrimidine fragments and by introduction of new substituents at position 6 of the pyrimidine ring. In some cases these modifications led to the formation of new heterocyclic systems. For this purpose condensation of indoline-2-thiones with pyrimidine-5-carbaldehydes was investigated. It was determined that 4-[N-(pyrimidin-4-yl)amino](methyl-,ethyl-)benzenesulfonamides containing cyano-, formyl- or nitro groups at position 5 of the pyrimidine ring and benzylamino-, chloro-, methoxy- or oxo groups at position 6 of the pyrimidine ring inhibit hCA in... [to full text]

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Scapin, Elisandra. "Pirazolo[1,5-a]pirimidinas: síntese e bromação." Universidade Federal de Santa Maria, 2006. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10375.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The synthesis of a series of 2-methyl-7-trichloromethylpyrazolo[1,5-a]pyrimidines from the cyclocondensation reaction of 3-amino-5-methylpyrazole with 1,1,1-trichloro-4- alkoxyalk-3-en-2-ones [CCl3C(O)CH=C(R1)OR where R1 = H, Me, Et, Pr, Bu, t-Bu e R = Me, Et] in good yields (69-98%) is reported. Also, was performed the synthesis of 2- methyl-7-arylpyrazolo[1,5-a]pyrimidines from de cyclocondensation reaction of 3-amino-5-methylpyrazole with β-dimethylaminovinyl ketones [R2C(O)CH=CHNMe2, where R= Ph, Ph-4-NO2, Ph-4-Me, Ph-4-Br, Ph-4-F, Ph-4-Cl, pyrid-2-yl, pyrrol-2-yil, tien-2-yl e fur- 2-yl] in good yields (65-98%). Finally, was performed of the bromation reaction of 2- methylpyrazolo[1,5-a]-pyrimidines from the reaction of these compounds with Nbromosuccinimide (yields: 70-98%). All compounds were obtained in satisfactory purity and were identified by 1H, 13C, HMQC and HMBC spectroscopy, CG-MS and X-ray diffraction.
Este trabalho mostra a síntese de uma série de 2-metil-7-triclorometilpirazolo[1,5-a]pirimidinas a partir da reação de ciclocondensação do 3-amino-5-metilpirazol com 1,1,1-tricloro-4-alcoxi-3-alquen-2-onas [CCl3C(O)CH=C(R1)OR onde R1 = H, Me, Et,Pr, Bu, t-Bu e R = Me, Et em bons rendimentos (69-98%). Também foi realizada a síntese de 2-metil-7-arilpirazolo[1,5-a]pirimidinas a partir da reação de ciclocondensação de β- dimetilaminovinil cetonas [R2C(O)CH=CHNMe2, onde R= Ph, Ph-4-NO2, Ph-4-Me, Ph-4-Br, Ph-4-F, Ph-4-Cl, pirid-2-il, pirrol-2-il, tien-2-il e fur-2-il] com 3-amino-5-metilpirazol em bons rendimentos (65-98%). Finalmente, foi realizada a reação de bromação das 2-metilpirazolo[1,5-a]pirimidinas a partir da reação destes compostos com N-bromosuccinimida. Os compostos foram obtidos com grau de pureza satisfatório e identificados através de espectroscopia de RMN de 1H, 13C, HMQC, HMBC, CG-MS e de Difração de Raio-X.

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MONTE, Zenaide Severina do. "Pirimidinas: de potenciais fármacos a marcadores fluorescentes." Universidade Federal de Pernambuco, 2016. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/19607.

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CAPES
Compostos heterocíclicos do tipo pirimidina são conhecidos pela enorme riqueza de seus potenciais biológicos e farmacológicos. Numerosas reações de heterociclização que permitem a obtenção dessa classe de compostos são igualmente reconhecidas, devido à diversidade de atividades e do conhecimento prévio de inúmeras viabilidades sintéticas. As modificações estruturais obtidas na busca da otimização das rotas sintéticas conferem às novas moléculas diferentes propriedades físicas e alteram a reatividade das moléculas, acarretando em mudanças na distribuição nas células e nos tecidos. Essas discretas modificações estruturais podem revelar efeitos biológicos que haviam estado latentes ou eclipsados pelos efeitos colaterais do composto protótipo. Sendo assim, o presente trabalho apresenta a síntese por método convencional dos derivados da pirimidina 3a-q e 5o-q. Estes compostos foram avaliados quanto às propriedades duais: Antimicrobiana e Fotoluminescência, estas apresentaram resultados promissores, podem atuar como boas sondas fluorescentes. Foram realizados também estudos Espectrofotométricos em diferentes solventes além de determinarmos o Cálculo do Orbital Molecular de Fronteira nesta série. Realizou-se também a nanoencapsulação em lipossomas para o composto 3o. Obtivemos também p-arilamidinas 3a-j por método convencional e avaliamos as propriedades Antimicrobiana e Citotóxica, as quais apresentaram resultados significativos. Realizamos a síntese dos derivados pirimidínicos 3a-f e 6a-f pelo método em Irradiação em micro-ondas, em fase sólida e em solução, respectivamente. Estudamos também para estes as propriedades Antimicrobiana e Antioxidante, cujos os resultados foram satisfatórios. Foram obtidos bons rendimentos para todos os compostos obtidos. Um estudo inédito de RMN bidimensional, COSY, HSQC e HMBC foram aplicados às pirimidinas foi realizado, proporcionando a caracterização estrutural destes compostos. Os resultados obtidos apresentaram significativa potencialidades biológicas, farmacológicas e fotofísicas.
Heterocyclic compounds of pyrimidine are known for rich biological and pharmacological potential. A number of heterociclic reactions that enable the obtention of this class of compounds are also recognized, due to the diversity of activities and prior knowledge of their various synthetic viabilities. The structural modifications obtained in search for the best synthetic routes confered different physical properties on the new molecules and altered the reactivity of the molecules, resulting in changes in the distribution in cells and tissues. These discrete structural changes may reveal biological effects that may have been latent or eclipsed by the side effects of the compound prototype. This work presents the synthesis by conventional method of derivatives from pyrimidine 3a-q and 5o-q. These compounds were evaluated for dual properties: antimicrobial and photoluminescence. They showed promising results can act as fluorescent probes. Spectroscopic studies were carried out with different solvents and the Frontier Molecular Orbital calculation for this series was determined. Nanoencapsulation of liposomes for the compound 3o was prepared. The conventional method was used to obtain 3a-j p-arilamidinas. Results were significant for the antimicrobial and cytotoxic properties. Finally, the synthesis of pyrimidines derivatives 3a-f and 6a-f by a new method, solid phase micro-wave and in solution, respectively was carried out. We have studied both the Antimicrobial and Antioxidant properties with satisfactory results. Good yields were obtained for all compounds obtained. New studies of two-dimensional NMR, COSY, HSQC and HMBC were performed besides the characterization of the compounds by standard methods. The results show that the compounds obtained have great biological, pharmacological potential and Photophysical.

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Zanelato, Aurelio Izuka. "Investigação teórica do espalhamento de elétrons pela molécula de Pirimidina (C4H4N2)." Universidade Federal do Amazonas, 2014. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4814.

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CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Recently, several studies involving biological materials have associated the low energies electrons as one of the main responsible for causing cell damage through a great variety of processes. Having the knowledge on the whole path of the processes include obtaining the electron-(bio-molecules) interaction cross sections. However, up to date, there is not complete understanding of the whole situation. The goal of the present work was to provide additional information on these studies. In this work, we report a theoretical investigation on electron-molecule scattering for a important biological compound: Pyrimidine (C4H4N2). Differential cross sections (DCS), integral cross sections (ICS), total cross sections, and total absorption cross sections were obtained at the intermediate energy range (1-500 eV). Our calculated results were compared with experimental results and other theoretical results available in the literature. All the computational studies were performed using the EPolyScatD code at the “Laboratório de Espalhamento de Elétrons - Instituto de Ciências Exatas e Tecnologia, Universidade Federal do Amazonas (ICET-UFAM)”, located in Itacoatiara, Amazonas
Nos últimos anos, diversos trabalhos com materiais biológicos associaram os elétrons de baixa energia como um dos principais causadores de danos celulares, promovendo lesões citotóxicas, mutagênicas e cancerígenas, ao transferir energia à matéria através de vários processos. Para se ter uma compreensão mais quantitativa dos processos induzidos nas células pelas radiações, necessita-se de informações sobre as seções de choque da interação de elétrons com as moléculas constituintes do tecido biológico. No entanto, ainda existe uma grande lacuna de conhecimento entre o que ocorre efetivamente a partir da irradiação primária à série de eventos secundários responsáveis pelos danos celulares. Consequentemente, não existe uma relação quantitativa bem estabelecida entre a dose absorvida e os danos provocados nos materiais ou tecidos biológicos. E é com a motivação de tentar auxiliar no preenchimento dessa lacuna que o presente trabalho foi realizado. No presente trabalho, foram obtidas, através de cálculos teóricos, as seções de choque do espalhamento de elétrons por uma molécula de grande importância biológica: a Pirimidina (C4H4N2). Os parâmetros de interesse obtidos neste trabalho foram as seções de choque diferenciais elásticas (SCD), seções de choque integrais elásticas (SCI), seções de choque totais (SCT) e seções de choque de absorção total (SCAT). As seções de choque foram obtidas em uma faixa de energia que se inicia em 1 eV e se estende até 500 eV, em relação ao elétron incidente. Os resultados obtidos foram comparados com outros conjuntos de dados disponíveis na literatura. Os cálculos teóricos dos parâmetros de interesse deste trabalho foram efetuados a partir da utilização do pacote computacional denominado EPolyScatD, utilizando-se da infraestrutura disponível no Laboratório de Espalhamento de Elétrons, do Instituto de Ciências Exatas e Tecnologia, da Universidade Federal do Amazonas (ICET-UFAM), situado na cidade de Itacoatiara, estado do Amazonas.

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Barreto, Igor Ramon Lomba. "Planejamento de derivados 1H-pirazolo[1,5-a]pirimidina com potencial atividade antichagásica." Niterói, 2018. https://app.uff.br/riuff/handle/1/5822.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
A doença de Chagas, causada pelo parasita Trypanosoma cruzi, é uma infecção que possui maior impacto na América Latina, onde a doença é endêmica em vários países. No Brasil, há um grande número de casos, que representam aproximadamente 23% da população mundial infectada. O desenvolvimento de novas substâncias para o tratamento desta doença é de grande relevância, especialmente por apenas o benznidazol ser disponibilizado no Brasil. A enzima cruzaína, uma cisteíno protease essencial para a sobrevivência do parasita, é considerada um alvo terapêutico para a pesquisa e desenvolvimento de novos agentes antichagásicos e a determinação dos grupos ligantes e modos de interação contribui com a busca de novos fármacos com ação nesse alvo terapêutico. Este trabalho teve como objetivo o planejamento de novos compostos pirazolo[1,5-a]pirimidinas com potencial atividade antichagásica, visando a cruzaína como alvo terapêutico. No planejamento dos compostos, foram utilizadas, como ponto de partida, moléculas sintéticas com atividade inibitória reversível sobre a enzima cruzaína e/ou antiparasitária e o conceito de bioisosterismo. Na simulação de possíveis interações entre ligantes e enzima, foram utilizadas as técnicas computacionais de "docking" e dinâmica molecular. Foi realizado o mapeamento dos pontos de interação entre a cruzaína e uma série de cinco inibidores descritos na literatura para validação do protocolo de simulação. Na investigação computacional dos compostos planejados, foram encontradas interações semelhantes às descritas para os inibidores utilizados no protocolo de validação. Os resultados apontam o composto planejado 5-amino-2,7-dimetil-N-(pirimidin-2-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidina como o mais promissor para a inibição da cruzaína do T. cruzi e com viabilidade sintética para a sua obtenção
Chagas' disease caused by the parasite Trypanosoma cruzi is an infection with a greater impact in Latin America, where the disease is endemic in several countries. In Brazil, there are many cases, representing approximately 23% of the people worldwide infected. Accordingly, the development of new substances for the treatment of this disease is of great relevance, especially since there is only benznidazol available in Brazil. The cruzain enzyme, a cysteine protease essential for the survival of the parasite, has been considered as a therapeutic target in the research of new antichagasic agents, and the determination of the binding groups and modes of interaction contributes to the to the search for new drugs with action in this therapeutic target. The present work aimed the design of new pyrazolo[1,5-a]pyrimidines with potential antichagasic activity, hinting at cruzain as therapeutic target. Synthetic compounds with reversible inhibitory activity on the cruzain and / or antiparasitic activity, in addition to the concept of bioisosterism, were used as a starting point for new compounds design. The computational techniques of "docking" and molecular dynamics were used in the simulations of possible interactions between binders and enzyme. Validation of the simulation protocol was carried out by mapping of interaction between the cruzain and a series of five inhibitors described in the literature. The computational investigation of the designed compounds showed interactions with the enzyme in a similar way to those described for the inhibitors used in the validation protocol. The results point to the 2,7-dimethyl-N-(pyrimidin-2-yl)-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-amine as the most promising inhibition activity against cruzain and synthetic viability for its preparation

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Vargas, Pâmela Schütz de. "Reações de β-enaminodicetonas com ncn dinucleófilos: obtenção de pirimidinas e sistemas heterocíclicos fundidos". Universidade Federal de Santa Maria, 2016. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4288.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
In this study the reactivity of β-enamino diketones [RC(O)C(=CHNMe2)C(O)CO2Et, R = C6H5, 4-Me-C6H4, 4-MeO-C6H4, 4-F-C6H4, 4-Br-C6H4, 4-NO2-C6H4, tien-2-il] with NCN bisnucleophiles as amidine and guanidine was investigated. The tiopirimidines ethyl 2-benzylthio-pyrimidine-4-carboxylates, (65-91 %) and Ethyl 2-metiltiopirimidine-4-carboxylates (69-91 %) were obtained in a highly regioselective manner by cyclocondensation reaction of β-enamino diketones with benzylisothiourea hydrochloride and methylisothiourea sulfate, respectively. Following the studies, was also investigated the reactivity of β-enamino diketones with guanidine hydrochloride and was possible to synthesize 2-aminopyrimidines that were obtained in a regioisomeric mixture of compounds with yields of 64-89 % and the reaction of β-enamino diketones with 2-acethylguanidine led to a highly regioselective synthesis of 2-acethylaminopyrimidines-4-carboxylates in yields (74-88 %). Ethyl 2-benzylthio-pyrimidine-4-carboxylates obtained were cyclized with hydrazine monohydrate and pyrimidopyridazinones were obtained in 52-95 % yields. Finally, were β-enamino diketones were cyclocondensed with 3(5)-amino-5(3)methylpyrazole leading to pyrazolo[1,5-a]pyrimidines of highly regioselective manner. These, in turn, are cyclized with an equivalent amount of hydrazine monohydrate to form a series of pyrazolo-pyrimido-pyridazinone (43-68%) and when using excess hydrazine monohydrate pyrazole-pyridazinone were formed by ANRORC (Addition of Nucleophile followed by Ring-Opening and Ring-Closure)mechanism yields 62-84%. The reactions for the synthesis of these heterocyclic systems involving simple steps, mild conditions and short reaction times.
Nesta tese foi investigada a reatividade de β-enaminodicetonas [RC(O)C(=CHNMe2)C(O)CO2Et, em que R = C6H5, 4-Me-C6H4, 4-MeO-C6H4, 4-F-C6H4, 4-Br-C6H4, 4-NO2-C6H4, tien-2-il] frente NCN dinucleófilos como amidinas e guanidina. As tiopirimidinas 2-benziltio-pirimidinas-4-carboxilato de etila (65-91 %) e 2-metiltiopirimidinas-4-carboxilatos de etila (69-91 %) foram obtidas de maneira altamente regiosseletiva através da reação de ciclocondensação das β-enaminodicetonas com cloreto de benzilisotioureia e sulfato de 2-metilisotioureia, respectivamente. Já nas reações com cloridrato de guanidina foram obtidas 2-aminopirimidinas numa mistura regioisomérica de compostos com rendimentos de 64-89 % e a reação de β-enaminodicetonas com 2-acetilguanidina conduziu a uma síntese altamente regiosseletiva das 2-acetoamidopirimidinas-4-carboxilatos de etila em rendimentos de (74-87%). As 2- benziltio-pirimidinas-4-carboxilato de etila foram escolhidas para verificar o potencial sintético das pirimidinas sintetizadas, e, através da reação de ciclização destas com monoidrato de hidrazina foram obtidas as pirimido-piridazinonas, (52-95 %). Por fim, as β-enaminodicetonas foram ciclocondensadas com 3-(5)-amino-5(3)metilpirazol formando pirazolo[1,5-a]pirimidinas de maneira altamente regiosseletiva. Essas, por sua vez, foram ciclizadas com quantidade equivalente de monoidrato de hidrazina formando uma série de pirazolo-pirimido-piridazinona (43-68 %) e quando cilcizadas utilizando excesso de monoidrato de hidrazina formaram pirazolo-piridazinona através do mecanismo ANRORC (Addition of Nucleophile followed by Ring-Opening and Ring-Closure) com rendimentos de 62-84 %. As reações para a síntese desses sistemas heterocíclicos envolveram etapas simples, condições brandas e curtos tempos de reação.

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Bortolotto, Guilherme Pivotto. "Síntese de 1,2,4-triazol-5-ilamino pirimidinas trifluormetil substituídas." Universidade Federal de Santa Maria, 2009. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10456.

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This work describes the synthesis and characterization of fourteen 4-trifluoromethyl-2-[3-(pyridyl)-1H-1,2,4-triazol-5-ylamino]pyrimidines (6, 7), from the cyclocondensation reaction of N-[3-(pyridyl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]guanidines (4, 5), a 1,3-dinucleophile precursor of the type (N-C-N), with 1,1,1-trifluoro-4-alkoxy-3-alken-2-ones (1), a versatile 1,3-dieletrophile. The 1,1,1-trifluoro-4-alkoxy-3-alken-2-ones (1), of the general formula F3C-C(O)- CH=C(R)-OR1 where R1 = Me, Et and R = H, Me, Ph, 4-FPh, 4-MePh, 4-OMePh, Furyl, were obtained from trifluoroacetylation reactions of enolethers or acetals derived of acyclic ketones. The reactions of 1,1,1-trifluoro-4-alkoxy-3-alken-2-ones (1) with N-[3-(pyridyl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]guanidines (4, 5) was carried in ethanol in reflux for 18 hours, leading to end products in 40-68% yield. The compounds were characterized by 1H and 13C NMR experiments, and the purity these compounds proved by elemental analysis.
Este trabalho descreve a síntese e caracterização de uma série de catorze 4-trifluormetil-2-[3-(piridil)-1H-1,2,4-triazol-5-ilamino]pirimidinas (6, 7), a partir de reações de ciclocondensação de N-[3-(piridil)-1H-1,2,4-triazol-5-il]guanidinas (4, 5), precursores 1,3-dinucleofílicos do tipo (N-C-N), com 1,1,1-triflúor-4-alcóxi-3-alquen-2-onas (1), versáteis precursores 1,3-dieletrofílicos. As 1,1,1-triflúor-4-alcóxi-3-alquen-2-onas (1), de fórmula geral F3C-C(O)-CH=C(R)- OR1 onde R1 = Me, Et e R = H, Me, Ph, 4-FPh, 4-MePh, 4-OMePh, Furil, foram obtidas a partir de reações de trifluoracetilação de enoléteres ou de acetais derivados de cetonas acíclicas. As reações de 1,1,1-triflúor-4-alcóxi-3-alquen-2-onas (1) com N-[3-(piridil)-1H-1,2,4-triazol-5-il]guanidinas (4, 5) foram realizadas em etanol sob refluxo por 18 horas, levando aos produtos finais com rendimentos de 40-68%. Os compostos sintetizados foram caracterizados por experimentos de RMN de 1H e 13C, e sua pureza comprovada por Análise Elementar.

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Frizzo, Clarissa Piccinin. "Estrutura Molecular e Supramolecular de Pirazolo[1,5- a]pirimidinas." Universidade Federal de Santa Maria, 2010. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4195.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
This work describes the molecular and supramolecular structure of fourteen pyrazolo[1,5-a]pyrimidines from bond lengths, torsion angles, angles between planes and interatomic distances. The data discussed were originated from xray and theoretical calculations. Torsion angle N1-N8-C3a-N4, algles between planes of pyrazole and pyrimidine rings and the pyrazolo[1,5-a]pyrimidine RMS value showed that the fused rings are plane. The heterocyclic ring bond lengths demonstrated that the p-electrons are delocalized by resonance and the peripheral electronic distribution of this p-electrons is similar to the naphthalene. The bond length obtained from theoretical calculations (AM1, PM3, RM1 e ab initio) have a correlation with experimental for pyrazolo[1,5-a]pyrimidine ring bonds and for bonds of their substituents.The supramolecular assembly of pyrazolo[1,5-a]pyrimidine reveals that interactions type halogen···Lewis base (Cl···N, F···F, Cl···Cl, Cl···Br), halogen···p (F···p, Cl···p e Br···p) and p-p interactions (pyrazole, pyrimidine and aryl) were the main interactions observed by self-assembly of the pyrazolo[1,5-a]pyrimidines. The atoms in supramolecular synthons were invariable with modifications of substituent at C5. However, was sensitive to variations of substituents at C3. This composes a notable example of substituent effect in the synthon robustness. The halogenated functions at C7(CCl3, CF3), C3 (Br) and in remote positions at C5 (4-Br-Ph) present the competition between chlorine and bromine atoms in the formation of supramolecular synthons. These observations are in accordance with recent s-hole theory and are some of few experimental example of theory. Finally, the aromaticity of pyrazolo[1,5-a]pyrimidines was determined by geometric index HOMA (Harmonic Oscillator Model of Aromaticity) from theoretical (AM1, PM3, RM1 e ab initio) and x-ray bond length. In this work, was also proposing new parameters to heterocyclic HOMA calculations. The results show HOMA values higher than 0.900 that is in accordance with aromaticity properties of these systems.
Este trabalho apresenta o estudo da estrutura molecular e supramolecular de uma série de 14 pirazolo[1,5-a]pirimidinas a partir de dados de comprimentos e ângulos de ligação, ângulos diedros, ângulos entre planos, distâncias interatômica de interações intermoleculares. Os dados apresentados foram obtidos por difratometria de raios-X e cálculos teóricos de orbitais moleculares. Os dados do ângulo diedro N1-N8-C3a-N4, ângulo entre os planos do pirazol e da pirimidina, e a média da raiz quadrada dos átomos do anel pirazol[1,5- a]pirimidina demonstraram que os anéis pirazol e pirimidina formadores do anel fundido estão no mesmo plano. Os comprimentos de ligação entre os átomos do núcleo heterocíclico demonstraram que os elétrons-p estão deslocalizados caracterizando um sistema em ressonância e que a distribuição eletrônica se assemelha a do naftaleno, com os elétrons distribuídos pela periferia do sistema heterocíclico. Os comprimentos de ligação obtidos por cálculos teóricos (Austin Method 1, Parametrized Method 3, Recife Method 1 e ab initio) apresentaram boa correlação com dados experimentais tanto para o núcleo pirazolo[1,5-a]pirimidina quanto para os substituintes. Ainda foram realizados estudos da organização supramolecular das pirazolo[1,5-a]pirimidina. As principais interações intermoleculares observadas nas pirazolo[1,5- a]pirimidinas foram do tipo halogênio···base de Lewis (Cl···N, F···F, Cl···Cl, Cl···Br), halogênio···p (F···p, Cl···p e Br···p) e interações do tipo p-p (entre anéis pirazol, pirimidina e arila). Os átomos envolvidos na interação foram persistentes com a variação do susbtituinte no C5 do anel. Entretanto as interações foram modificadas pela mudança de substituintes no C3 do anel, constituindo um exemplo notável do efeito do substituinte no empacotamento cristalino. A presença de funções halogenadas nas posições C7(CCl3, CF3), C3 (Br) e em posições remotas de substituintes em C5 (4-Br-Ph) mostraram a competição entre átomos de cloro e de bromo na organização supramolecular destes compostos. Estas observações estão de acordo com a recente teoria sobre a existência de uma superfície com potencial positivo na ligação Chalogênio (s-hole) e constituem um dos poucos exemplos experimentais para esta teoria. Por fim, foi determinada a aromaticidade de pirazolo[1,5-a]pirimidinas usando o índice geométrico HOMA (Harmonic Oscilator Model of Aromaticity) a partir dos dados de comprimentos de ligações obtidos por difratometria de raios-X e obtidos por cálculos teóricos (AM1, PM3, RM1 e ab initio). Neste trabalho também foram propostos novos parâmetros para a adequação do cálculo de aromaticidade para heterociclos. Os resultados mostraram valores de HOMA maiores que 0,900, que são condizentes com as características de aromaticidade descritas para estes compostos.

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Peter, da Silva Falcão Emerson. "Novas pirimidinas : : síntese e avaliação de suas propiedades farmacológicas." Universidade Federal de Pernambuco, 2003. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/1864.

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Este trabalho descreve a síntese de três séries de compostos contendo o núcleo pirimidínico e sua avaliação farmacológica. Primeiro, foram sintetizados os compostos 4-amino-2,6-(diarildissubistituídos)- 5-carbonitrila-pirimidínicos (5a-h), a partir de intermediários arilamidínicos e bisnitrílicos. Segundo, foram reduzidos os nitro-compostos (5k-o) às suas respectivas aminas 4-amino-2-(arilsubistituídos)-6-(p-amino)-5-carbonitrila-pirimidínicos (6a-e). A condensação das aminas com o anidrido ftálico levou à terceira série de compostos 4-amino-2-(parilsubistituídos)- 5-ciano-6-{4-(N-ftalimidofenil)}-pirimidínicos (7a-e). As estruturas moleculares dos produtos foram confirmadas por métodos usuais de ressonância magnética nuclear de hidrogênios (RMN-H1), espectrometria no infravermelho (IV), espectrometria de massas (MS) e análise elementar. Os compostos (5a-h) apresentaram propriedades antiinflamatórias, com intensidade percentual variando de 4,9%, para o composto menos ativo (5e), a 47,8% para o mais ativo. A relação Dose/Resposta destas drogas foi avaliada. Os dados obtidos tornaram possível a avaliação da Relação Quantitativa Estrutura-Atividade Biológica (QSAR). Foi possível a síntese de uma nova droga (5i) cuja atividade antiinflamatória prevista deveria ser maior. O modelo teórico foi confirmado experimentalmente. Os compostos 5b e 5h foram avaliados em testes de atividade antitumoral in vivo usando como droga padrão de comparação o lapachol. Os resultados mostram que os novos compostos são ativos contra dois tumores, o sarcoma 180 e o carcinoma de Erhlich. O composto 5b apresentou as melhores inibições (77,47 e 91,21%). Ensaios de atividade citotóxica foram levados a cabo utilizando células neoplásicas (NCI-H292 e HEP2) para avaliar a atividade in vitro dos compostos 7a-e e 5b. As drogas demonstraram baixa citotoxidez frente às células HEP2, sendo todas inativas contra as células NCI-H292

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Santos, Barbara Helen Cortat. "Papel biológico dos dímeros de pirimidina em células humanas irradiadas com radiação UVA." Universidade de São Paulo, 2010. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-07122010-101150/.

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A radiação ultravioleta (UV) pode ser absorvida por diferentes moléculas celulares, incluindo o DNA no qual provoca distorções estruturais. As lesões mais comuns induzidas pela radiação UV são o ciclobutano de pirimidina (CPD) e o fotoproduto (6-4)-pirimidina-pirimidona [(6-4)PPs]. Estas lesões podem ser reparadas pela fotorreativação, caracterizada por ter uma única proteína (fotoliase) que remove lesões empregando luz visível (320-500 nm) como fonte de energia. Foram identificados dois tipos de fotoliases que diferem por sua especificidade ao substrato: CPD-fotoliase e (6-4)-fotoliase. Um outro mecanismo de reparo é o reparo por excisão de nucleotídeos (NER), um mecanismo que envolve múltiplos passos e proteínas. Enquanto os efeitos genotóxicos da UVC e UVB já estão relativamente esclarecidos e bem aceitos, ainda existem controvérsias sobre a genotoxicidade da radiação UVA, devido ao fato de ser fracamente absorvida pelo DNA. Alguns autores acreditam que os seus principais efeitos são gerados de forma indireta pela produção de espécies reativas de oxigênio enquanto outros acreditam que a UVA pode gerar danos ao DNA de forma direta, provocando a formação de dímeros de pirimidina. O objetivo deste trabalho foi verificar os efeitos genotóxicos da radiação UVA em fibroblastos humanos deficientes e proficientes em NER utilizando adenovírus recombinantes contendo uma ou outra fotoliase para verificar se as lesões CPD e (6-4)PP são geradas pela UVA e se elas teriam alguma importância nas respostas verificadas após irradiação. Foi verificado que as células deficientes no gene XPA são mais sensíveis à radiação UVA quando comparadas às células selvagens. Por meio da detecção imunológica, confirmamos a geração das lesões CPD, (6-4)PP e Dewar, fotoisômero da lesão (6-4)PP, após irradiação com UVA no genoma de células humanas. Empregando vetores adenovirais para transdução de fotoliase específica para lesões tipo CPD ou (6-4)PP, confirmamos que de fato essas lesões são formadas em células humanas deficientes em reparo de DNA após irradiação com UVA. Além disso, esses vírus permitiram verificar a relevância biológica dessas lesões na indução de morte celular em células XP-A irradiadas. De fato, os dados indicam que para doses baixas de radiação UVA essas lesões desempenham um importante papel na indução de morte. Não podemos descartar, porém, que lesões indiretas (provavelmente geradas por estresse oxidativo) também tenham papel na indução de morte pela radiação UVA, o que parece ser mais importante a doses médias e altas dessa radiação.
Ultraviolet radiation (UV) is absorbed by different cellular molecules, including DNA in which induces structural distortions. The most common lesions induced by UV radiation are the cyclobutane pyrimidine (CPD) and the photoproduct (6-4)-pyrimidine-pyrimidone [(6-4)PP]. These lesions can be repaired by the photoreactivation, characterized by a single protein (photolyase) that removes lesions using visible light (320-500 nm) as energy source. Two types of photolyases had been identified that differ by their substrate specificity: CPD-photolyase and (6-4)-photolyase. Another repair mechanism is the nucleotide excision repair (NER), a mechanism that involves multiple steps and proteins. While the genotoxic effects of UVB and UVC are already relatively well-understood and accepted, there is still controversy about the genotoxicity of UVA radiation, due to its low absorption by DNA. Some authors believe that the major effects are generated indirectly by the production of reactive oxygen species, while others believe that UVA can cause damage to DNA directly, inducing the formation of pyrimidine dimers. The aim of this study was to assess the genotoxic effects of UVA radiation in human fibroblasts deficient and proficient in NER, using recombinant adenovirus expressing the photolyases to verify if CPDs and (6-4)PPs are generated by UVA and whether they had any importance in the responses observed after irradiation. It was found that cells deficient in the XPA gene are more sensitive to UV radiation compared to wild type cells. By immunological detection, we confirm the generation of CPD, (6-4)PP and Dewar, photoisomer of the (6-4)PP lesion, in the genome of human cells after irradiation with UVA. Using adenoviral vectors for the transduction of photolyases specific for CPD or (6-4)PP lesions, we confirm that in fact these lesions are generated in human cells deficient in DNA repair after irradiation with UVA. Moreover, these viruses allowed us to verify the biological relevance of these lesions in the induction of cell death in irradiated XP-A cells. In fact, our data indicates that for low doses of UVA radiation, these lesions play important roles in the induction of death. We cannot rule out, however, that indirect lesions (probably caused by oxidative stress) could also have a role in the induction of death by UVA radiation, which seems to be more important in intermediate and high doses of this radiation.

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Barbosa, Sara Isabel Cadinha. "Compostos que interferem no metabolismo dos purina- e pirimidina-nucleótidos: utilização como agentes terapêuticos." Master's thesis, [s.n.], 2015. http://hdl.handle.net/10284/5160.

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Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas
O conteúdo deste trabalho será desenvolvido em dois temas principais, um referente à utilização de compostos que interferem no metabolismo dos purina- e pirimidinanucleótidos como agentes antineoplásicos e outro referente à sua utilização como agentes antivirais. A síntese dos nucleótidos envolve a construção de ácidos nucleicos e a inserção dos derivados de nucleótidos noutras vias bioquímicas, sendo responsável por inúmeras funções do metabolismo celular. Existem patologias que envolvem enzimas essenciais do metabolismo dos nucleótidos, o que levou à síntese de novos fármacos. As doenças oncológicas continuam a matar milhares de pessoas e um tratamento eficaz e com sucesso tem sido um desafio. O mesmo se passa com algumas infeções virais, nomeadamente infeções provocadas pelo HIV. Para contornar os obstáculos enfrentados na terapia destas doenças têm sido usados análogos de nucleótidos e/ou nucleósidos como agentes terapêuticos. Estes têm o propósito de inibir a síntese de novo dos nucleótidos em determinadas etapas, estando envolvidos na replicação e síntese do RNA e DNA nas células em divisão. Atuam por inibição específica de enzimas no metabolismo dos nucleótidos/nucleósidos ou ainda por incorporação no DNA ou no RNA. This study will be developed into two main subjects; one related to the use of compounds which interfere with the metabolism of purine- and pyrimidine- nucleotides as antineoplastic agents; another related to their use as antiviral agents. The nucleotides’ synthesis involves the construction of nucleic acids and the introduction of the nucleotides’ derivatives into other biochemical pathways and it is responsible for numerous functions of cellular metabolism. There are pathologies involving key enzymes from the nucleotides’ metabolism, which led to the synthesis of new drugs. Cancer is a disease that continues killing thousands of people, an effective and successful treatment has been a challenge. The same happens with some viral infections, mainly infections caused by HIV. To overcome the obstacles faced in the therapy of these diseases it has been used nucleotide and/or nucleoside analogues as therapeutic agents. These agents have the purpose of inhibiting the de novo nucleotide synthesis in certain steps, by being involved in RNA and DNA replication and synthesis in dividing cells. They act by specific enzymes inhibition in nucleotide/nucleoside metabolism and by incorporation into DNA or RNA.

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Galve, Murillo Iñaki. "Síntesis de pirido[2,3-d]pirimidin-7(8H)-onas 2-arilamino sustituidas y derivados." Doctoral thesis, Universitat Ramon Llull, 2013. http://hdl.handle.net/10803/101403.

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Les Cinases de Proteïna (PKs) estan implicades en processos fonamentals de la regulació del cicle cel•lular. L’acumulació d’anomalies als mecanismes de control i el comportament disfuncional que se’n deriva han estat detectats a cèl•lules de diferents teixits afectades per càncer, desordres immunològics, endocrins, nerviosos, neurodegenaratius, cardiovasculars, malalties infeccioses, diabetis, Alzheimer, asma, restenosi, arteriosclerosi, leucèmia, artritis, etc. Però d’entre totes les PKs, les Cinases de Tirosina (TKs) han estat destacades com a l’element central de tots aquests processos i, per tant, han estat objecte d’una gegantina tasca investigadora que n’ha augmentat el seu innegable interès com a diana terapèutica. És per aquest motiu, que el desenvolupament d’inhibidors selectius de TKs ha esdevingut una àrea d’investigació molt activa. El Laboratori de Síntesi de l’IQS disposa d’una dilatada experiència de síntesi de compostos heterocíclics, especialment pirido[2,3-d]pirimidines, de gran semblança amb coneguts inhibidors de TKs. Malauradament, d’entre tots els building blocks emprats per les estratègies sintétiques desenvolupades, les guanidines (especialment les arilguanidines) sempre han limitat l’espai químic assequible per culpa de la poca diversitat d’aquests reactius comercialment disponibles. Per tant, l’objectiu fonamental d’aquest treball és desenvolupar una metodologia com més genèrica millor que permeti obtenir guanidines i, especialment arilguanidines, i que sigui compatible amb les eines sintètiques disponibles emprades per a l’obtenció massiva de pirido[2,3-d]pirimidines. Amb aquest objectiu s’optimitza un procediment de guanidinació d’amines amb àcid aminoiminometanosulfònic (AIMSOA, acrònim de l’anglès aminoiminomethanesulfonic acid) en metanol procurant acoblar-lo amb la reacció multicomponent de Victory. Desgraciadament els rendiments amb arilguanidines són baixos com a resultat de llur baixa nucleofília, llur degradació causada pel metanol i per la competència amb el dissolvent de reacció. Com a alternativa, s’assagen protocols de condensació de piridones en 1,4-dioxà per tal d’afavorir la nucleofília d’aquestes arilguanidines. Sorprenentment no s’obtenen directament les piridopirimidines sinó uns intermedis que després d’un procés de transposició de Dimroth donen lloc als heterobicicles esperats amb rendiments força superiors als descrits mitjançant altres metodologies. En darrer lloc, es planteja i estudia una nova proposta estratègica alternativa al tradicional plantejament del Laboratori de Síntesi de l’IQS per a la síntesi orientada a diversitat. Aquesta proposta implica la construcció de l’esquelet pirido[2,3-d]pirimidínic, seguida de la seva activació mitjançant bromació i diazotizació, i finalment introducció de la diversitat química desitjada. Arran d’aquest estudi s’ha obtingut i aïllat un intermedi de Wheland bicíclic mai descrit fins ara i que posteriorment és transformat per tractament amb DMSO en un terme piropirimidínic dibromat i deshidrogenat a l’anell piridònic. A més a més, s’han desenvolupat eines sintètiques per obtenir sistemes 4-oxopirido[2,3-d]pirimidínics partint de llurs anàlegs 4-amino, metodologies que són una alternativa molt atractiva de les estratègies ja desenvolupades.
Las Quinasas de Proteína (PKs) se hallan implicadas en procesos fundamentales de la regulación del ciclo celular. La acumulación de anomalías en los mecanismos de control y el consiguiente comportamiento disfuncional han sido detectados en células de diferentes tejidos afectadas por cáncer, desórdenes inmunológicos, endocrinos, nerviosos, neurodegenarativos, cardiovasculares, enfermedades infecciosas, diabetes, Alzheimer, asma, restenosis, arteriosclerosis, leucemia, artritis, etc. Pero de entre todas las PKs, las Quinasas de Tirosina (TKs) han demostrado ser un elemento central en todos estos procesos y, por tanto, han atraído sobre sí un enorme esfuerzo investigador que ha remarcado, su innegable interés como diana terapéutica. Así pues, el desarrollo de inhibidores selectivos de TKs se ha convertido en un área muy activa de investigación. El Laboratorio de Síntesis del IQS posee amplia experiencia en la síntesis de compuestos heterocíclicos, en especial pirido[2,3-d]pirimidinas, de gran similitud con inhibidores conocidos de TKs. Ahora bien, de todos los building blocks empleados en las estrategias sintéticas desarrolladas, las guanidinas (especialmente las arilguanidinas) siempre han limitado el espacio químico asequible por la poca diversidad de estos reactivos comercialmente asequibles. Por consiguiente, el objetivo fundamental del presente estudio es desarrollar una metodología para la obtención de guanidinas y, en especial de arilguanidinas, que sea compatible con las herramientas sintéticas disponibles para la obtención masiva de pirido[2,3-d]pirimidinas. A tal efecto se optimiza una guanidinación de aminas con ácido aminoiminometanosulfónico en metanol con vistas a poder acoplarlo con la reacción multicomponente de Victory. Desgraciadamente los rendimientos con arilguanidinas son bajos como consecuencia de su baja nucleofilia, su degradación por efecto del metanol y el efecto competente del disolvente de reacción. Para circunvalar este contratiempo se ensayan reacciones de condensación de piridonas en 1,4-dioxano para favorecer la nucleofilia de estas guanidinas. Sorpredentemente no se obtienen directamente las piridopirimidinas sino unos intermedios que tras un proceso de transposición de Dimroth rinden los heterobiciclos deseados con rendimientos bastante superiores a los referidos para otras metodologías. Por último, se propone y estudia una estrategia alternativa de síntesis orientado a diversidad. En este sentido, se construye el esqueleto pirido[2,3-d]pirimidínico para después activarlo mediante bromación y diazotización, y finalmente introducir la diversidad deseada. Fruto de este estudio se ha obtenido y aislado un intermedio de Wheland bicíclico que posteriormente rinde un término piropirimidínico dibromado y deshidrogenado en el anillo piridónico. Adicionalmente, se han desarrollado herramientas sintéticas para la obtención de sistemas 4-oxopirido[2,3-d]pirimidínicos a partir de sus análogos 4-amino.
Protein Kinases (PKs) are involved in basic cellular cycle regulatory mechanisms. Deregulation of those has been found on cells of different tissues with cancer, immunological disorders, endocrine disorders, nervous disorders, neurodegenerative disorders, cardiovascular disorders, infectious diseases, diabetes, Alzheimer syndrome, asthma, restenosis, atherosclerosis, leukemia, arthritis, and more. Among all the PKs huge family, Tyrosine Kinases (TKs) have been described as key point of those regulatory mechanisms and so stated as promising drug targets for treating such diseases. As a result of this biological knowledge, there have been a lot of developments in this field, resulting in some interesting and commercial TKs selective inhibitors. The Laboratori de Síntesi de l’IQS has developed some highly efficient heterocyclic synthetic procedures, especially for the synthesis of pyrido[2,3-d]pyrimidines that are structurally closely related to some well stated TKs inhibitors. Unfortunately, some of the building blocks used in those methodologies have a very narrow commercial variety and are only available from unusual vendors. This is the case for arylguanidines. As a result, the accessible chemical space is shortened. So then, the present work deals with the establishment of general procedures for the synthesis of arylguanidines and how to couple them with our previous described methodologies in order to obtain pyrido[2,3-d]pyrimidine libraries. Aminoiminomethanesulfonic acid (AIMSOA) is selected as guanidination agent and a protocol is optimized by Experimental Design. The coupling of this guanidination with the one-pot multicomponent Victory reaction is also studied. Unfortunately, coupling reaction yields with arylguanidines are very low as a result of lack of nucleophilicity, methanol mediated degradation and nucleophilic competition with this reaction solvent. Pyridone condensation with arylguanidines in 1,4-dioxane is stated as methodological alternative in order to improve nucleophilicity of the arylguanidines. Surprisingly, this procedure does not yield the expected pyridopyrimidines but a family of new, not previously described, heterobicyclic compunds that can be converted to the desired pyridopyrimidines through Dimroth rearrangement. The overall yields for the final pyridopyrimidines are higher with this new procedure than with the previous methodologies. Finally, a new global strategy is developed for the diversity oriented synthesis of 2-arylamino substituted pirido[2,3-d]pyrimidines. Firstly, the heterobicyclic skeleton is build and, secondly, this skeleton is activated by bromination and diazotization. Finally, diversity is introduced by substitution reactions. During this development a pyridopyrimidine Wheland intermediate, never described before ,has been isolated and its structure spectroscopically confirmed. The subsequent treatment of this compound with DMSO yields a new dibrominated pyridopyrimidine dehydrogenated on the pyridone ring. In addition, some synthetic procedures for the conversion of 4-aminopirido[2,3-d]pyrimidines into their 4-oxo analogues have been established. Such methodologies are auseful alternative to our old strategies for the synthesis of this kind of compounds.

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Tier, Aniele Zolin. "Efeito da Topologia Molecular no Empacotamento Cristalino de Pirazolo[1,5-a]pirimidinas." Universidade Federal de Santa Maria, 2013. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10550.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
This study shows the influence of the molecular topology of the crystal of a series of 14 pyrazolo[1,5-a]pyrimidines. The topological data were obtained from X-ray diffraction data and energy stabilization were determined by thermal analysis and chemical computations. Topological analysis carried out was Molecular Coordination Number (NCM) using the Voronoi-Dirichlet polyhedra and Hirshfeld surface. The NCM found for the majority of compounds was 14. Furthermore, it was determined contact area and the solid angle between molecules of the first coordination sphere of the cluster. Several correlations between data were performed, where it is possible highlight the correlation between the area of contact of the cluster molecules and the interaction energy and the solid angle and interaction energy were established. These correlations showed that there is a proportionality between the data, showing that the greater the contact area, the greater the interaction energy for a series of pyrazolo[1,5-a]pyrimidine studied in this thesis. As the contact area, solid angle also presents proportionality with the calculated interaction energy. Among the atom-atom contacts present on the surface of the test compounds was observed that contacts C∙∙∙H and C∙∙∙C are key to stabilize the crystals. This result corroborates the hypothesis that the contact surface between the molecules would be the driving force for the crystalline arrangement.
Este trabalho apresenta o estudo da influência da topologia molecular na organização cristalina de uma série de 14 pirazolo[1,5-a]pirimidinas. Os dados topológicos foram obtidos por difratometria de raios-X e os dados de energia de estabilização foram determinados por análises térmicas e cálculos computacionais. Dentre as análises topológicas realizadas destaca-se a determinação do Número de Coordenação Molecular (NCM) usando o Poliedro de Voronoi-Dirichlet e a Superfície de Hirshfeld. O NMC encontrado para a maioria dos compostos foi de 14. Além disso, foi determinada a área de contato, bem como o ângulo sólido entre as moléculas da primeira esfera de coordenação do cluster. Estabeleceu-se uma serie de correlações entre os dados obtidos, entre elas, destaca-se a correlação entre esta área de contato entre as moléculas do cluster e a energia de interação, bem como a correlação ângulo sólido e energia de interação. Ambas correlações mostraram que há uma proporcionalidade entre os dados, mostrando que quanto maior a área de contato, maior a energia de interação para a série de pirazolo[1,5-a]pirimidinas estudadas nesta dissertação. Assim como a área de contato, o ângulo sólido também apresenta uma proporcionalidade com a energia de interação calculada. Dentre os contatos átomo-átomo presentes na superfície dos compostos em estudo, observou-se que os contatos C∙∙∙H e C∙∙∙C são os principais para a estabilização dos cristais estudados. Este resultado corrobora com a hipótese de que a superfície de contato entre as moléculas seria a força motriz para o arranjo cristalino.

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VITAL, Fernando Antonio Chaves. "Novas 5-oxo Tiazolidino Pirimidinas: síntese e avaliação de suas atividades biológicas." Universidade Federal de Pernambuco, 2009. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/1557.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
As pirimidinonas são compostos heterocíclicos de seis membros com dois átomos de nitrogênio nas posições 1 e 3, e com ao menos uma carbonila ligada ao heterociclo. Esses compostos são amplamente conhecidos pelo seu vasto espectro de atividades farmacológicas, como atividades antiinflamatórias, antimicrobianas, antitumoral, antiviral, entre outras. O presente trabalho tem como objetivo a obtenção de novos derivados pirimidinônicos do tipo 2,3-diidro-7-aril-5-oxotiazolo[3,2- a]pirimidina-6-carbonitrila, a fim de avaliar algumas de suas possíveis atividades biológicas, a saber, atividades citotóxica, antimicrobiana, e antiinflamatória. Uma série de quatro compostos pirimidinônicos condensados ao anel tiazolidínico foi sintetizada, purificada e caracterizada por espectrometria de ressonância magnética nuclear de hidrogênio (RMN 1H), espectrometria de massas e no infravermelho (IV). Os compostos tiveram as suas potencias atividades citotóxica, antimicrobiana e antiinflamatória avaliadas, respectivamente, pelos métodos do MTT com determinação da densidade óptica, de difusão em disco, e de peritonite induzida por carragenina. Não foram observadas atividades citotóxica ou antimicrobiana em nenhum dos compostos testados. No ensaio de toxicidade aguda, que seguiu o protocolo 423 da OECD, não se observou toxicidade nos camundongos, na dose de 2000mg.kg-1. Na avaliação da atividade antiinflamatória, os compostos apresentaram índices de inibição da migração celular que ficaram entre 49,95% e 62,24%, na dose de 200μMol.Kg-1. Conclui-se que as drogas possuem bom potencial como possíveis agentes antiinflamatórios

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CARVALHO, Maíra de Almeida. "Aplicações de metodologias teóricas em estudos de QSAR-3D de Pirimidinas substituídas." Universidade Federal de Pernambuco, 2004. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/8915.

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Este trabalho tem em vista um estudo sistemático para a determinação de um modelo QSAR-3D para uma série homóloga de pirimidinas substituídas, cujas atividades anti-inflamatórias são conhecidas. Estudos preliminares de QSAR clássica, incluindo parâmetros calculados pelo método AM1, mostraram a importância de parâmetros eletrônicos na previsão, bem sucedida, de um novo composto mais ativo. Devido à dependência dos parâmetros eletrônicos dos modelos QSAR com a geometria e função de onda utilizada, foi realizada uma investigação sistemática do nível de cálculo e do conjunto de base na etapa inicial deste trabalho. A molécula não substituída (5h) foi selecionada como modelo para os demais compostos da série e, inicialmente, cálculos de orbitais moleculares em níveis AM1, HF e DFT e MP2 foram realizados para as funções de base com e/ou sem funções difusas e de polarização através do programa G98. A análise quimiométrica e comparações com dados de cristalografia de raio-X de sistemas similares sugeriram o emprego do método DFT-BP86/6-31G** para o estudo das demais moléculas desta série. Após a determinação do método e da função de base a serem utilizados, fez-se um estudo conformacional para determinação das geometrias de equilíbrio das pirimidinas substituídas e então foi avaliado o efeito da otimização completa ou parcial da geometria destas moléculas sobre a distribuição de cargas CHelpG, utilizando-se o método quimiométrico PCA. Por último, foi o estudo da SPE desta série para as moléculas totalmente otimizadas. Nesta etapa foram utilizados os níveis de cálculo AM1 e BP86/6-31G** para se avaliar o efeito da metodologia de cálculo na estimativa da SPE a partir de uma mesma geometria de equilíbrio. Utilizou-se o programa ALINHAMOL para estabelecer a geometria sob a qual seriam realizados os cálculos da SPE com o programa G98. Em seguida, o programa CAMOL foi utilizado para gerar uma matriz de dados do PE com a qual se desenvolveram os procedimentos de QSAR-3D. Foi feita uma análise sistemática da influência das variáveis de execução deste programa (valores de corte, etc.) na qualidade dos modelos quimiométricos (PCA e PLS) obtidos posteriormente. Nossos resultados indicaram que há um grande comprometimento entre o método/função de base e a SPE, uma vez que o padrão do gráfico dos escores de PC1 versus PC2 dependerá de maneira significativa da escolha da metodologia de cálculo. Já a análise de regressão, mostrou que não há grande influência das variáveis do programa CAMOL (VCDS e VCIS) com a qualidade de previsão dos modelos obtidos

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Brondani, Patrícia Bulegon. "Estudo de reações de N-alquilação de pirimidin-2-onas: síntese de novos análogos nucleosídicos modificados." Universidade Federal de Santa Maria, 2008. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10402.

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This work presents a study of the N-alkylation reactions of 4- (trichloromethyl)pyrimidin-2(1H)-one(2), 5-bromo-4-methoxy-4-(trichloromethyl)-3,4-dihydropyrimidin-2-(1H)-one (7), 4-methoxy-4-(trichloromethyl)-3,4-dihydropyrimidin-2(1H)-one (6), cytosine (1), 3-benzoylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione (or 3-benzoyl-uracil) (10), 3-benzoyl-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione (or 3-benzoyl-thymine) (11). The pyrimidines were tested with the alkylating agents chloro-acetamide (3a) and diethyl 2-bromomalonate (3b) in the presence of polar solvents (acetone, DMF, THF) and base (K2CO3 e NaH). The pyrimidines 4, 6, 8, and 9 were satisfactorily alkylated and in good to excellent yields. However, we were unable to alkylate 4-methoxy-4-(trichloromethyl)-3,4- dihydropyrimidin-2(1H)-one (6) and the cytosine (1). 3-Benzoyl-thymine 11 was only alkylated successfully in the presence of the alkylating agent 1. The alkylated products, 4-trichloromethyl-1-(methylcarbamoyl)-1H-pyrimidin-2-one (10), 4-trichloromethyl-1-(1,3-diethoxymalon-2-yl)-1H-pyrimidin-2-one (11), 5- bromo-4-trichloromethyl-1-(methylcarbamoyl)-4-methoxy-3,4-dihydropyrimidin- 2(1H)-one (14), 5-bromo-4-trichloromethyl-1-(1,3-diethoxymalon-2-yl)-4- methoxy-3,4-dihydropyrimidin-2(1H)-one (15), 3-benzoyl-1-(methylcarbamoyl)- 1H-pyrimidin-2,4-dione (18), 3-benzoyl-1-(1,3-diethoxymalon-2-yl)-1H-pyrimidin-2,4-dione (19) e 3-benzoyl-5-methyl-1-(methylcarbamoyl)-1H-pyrimidin-2,4-dione (20), can be considered acyclic nucleoside analogues. In the second stage of this work, a study of the substitution reactions on 1-[(E)-5,5,5-trichloro-2-methoxy-4-oxo-penten-2-yl]4-trichloromethyl-1Hpyrimidin-2-one (22) in the presence of amines and aminoalcohols (synthesis of enamino ketones), was done: 1-(5,5,5-trichloro-2-ethylamine-4-oxopent-2-enyl)- 4-trichloromethyl-1H-pyrimidin-2-one (24b), 1-(5,5,5-trichloro-2-propylamine-4-oxopent-2-enyl)-4-trichloromethyl-1H-pyrimidin-2-one (24c), 1-(5,5,5-trichloro-2-isopropylamine-4-oxopent-2-enyl)-4-trichloromethyl-1H-pyrimidin-2-one (24d),1-(5,5,5-tricloro-2-phenethylamino-4-oxopent-2-enyl)-4-tricloromethyl-1Hpyrimidin-2-one (24h), 1-(5,5,5-trichloro-2-(2-hydroxyethylamine)-4-oxopent-2-enyl)-4-trichloromethyl-1H-pyrimidin-2-one (24n), 1-(5,5,5-trichloro-2-(2-hydroxypropylamine)-4-oxopent-2-enyl)-4-trichloromethyl-1H-pyrimidin-2-one(24o). When the amine was methylamine the disubstitution product , 4-trichloromethyl-1-[N-methyl-3-(methylamino)but-2-enamide-4-yl]pyrimidin-2(1H)-one (24a), was obtained and, when the nucleophile was 2,2-dimethylethanolamina the product, 1-[(4,4-dimethyloxazolidin-2-ylidene)methyl]-4-(tricloromethyl)pyrimidin-2(1H)-one (24p), was obtained. Most products precipitated in the reaction vessel as pure compounds and in good yields.
Este trabalho apresenta um estudo das reações de N-alquilação de 4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (4), citosina (5), 5-bromo-4-metóxi-4-triclorometil-1,3H-pirimidin-2-ona (6), 4-metóxi-4-triclorometil-1,3H-pirimidin-2-ona (7), 3-benzoil-1H-pirimidina-2,4-diona (ou 3-benzoil-uracila) (8), 3-benzoil-5-metil-1H-pirimidina-2,4-diona (ou 3-benzoil-timina) (9). As pirimidinonas foram testadas com os agentes alquilantes cloro-acetamida (1) e malonato de dietila bromado (2) na presença de solventes polares (acetona, DMF, THF) e meio básico (K2CO3 ou NaH). As pirimidinonas 4, 6, 8 e 9 foram alquiladas satisfatoriamente e em rendimentos que variaram de bons a ótimos. Não foi possível realizar a alquilação da 4-metóxi-4-triclorometil-1,3H-pirimidin-2-ona (7) e da citosina (5). A pirimidinona 3-benzoil-timina (9) somente foi alquilada com sucesso na presença do alquilante 1. Os produtos alquilados, 4-triclorometil-1-(metil carbamoil)-1H-pirimidin-2-ona (10), 4-Triclorometil-1-(1,3-dietoximalon-2-il)-1H-pirimidin-2-ona (11), 5-bromo-1-(metil carbamoil)-4- metóxi-4-triclorometil-1,3H-pirimidin-2-ona (14), 5-bromo-4-triclorometil1-(1,3-dietoximalon-2-il)-4-metóxi--1,3H-pirimidin-2-ona (15), 3-benzoil-1-(metilcarbamoil)-1H-pirimidin-2,4-diona (18), 3-benzoil-1-(1,3-dietoximalon-2-il)-1Hpirimidin- 2,4-diona (19) e 3-Benzoil-5-metil-1-(metil carbamoil)-1H-pirimidina-2,4-diona (20), podem ser considerados análodos nucleosídicos acíclicos. Na segunda etapa do trabalho realizou-se um estudo das reações de substituição em 1-[(E)-5,5,5-tricloro-2-metóxi-4-oxo-penten-2-il-]-4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (22) na presença de aminas primárias e aminoálcoois levando a uma série de enamino cetonas triclorometiladas: 1-(5,5,5-tricloro-2-etilamino-4-oxopent-2-enil)-4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (24b), 1-(5,5,5- tricloro-2-propilamino-4-oxopent-2-enil)-4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (24c), 1-(5,5,5-tricloro-2-isopropilamino-4-oxopent-2-enil)-4-triclorometil- 1H-pirimidin-2-ona (24d), 1-(5,5,5-tricloro-2-fenetilamino-4-oxopent-2-enil)-4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (24h), 1-(5,5,5-tricloro-2-(2-hidroxietilamino)-4-oxopent-2-enil)-4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (24n), 1-(5,5,5-tricloro-2-(2-hidroxipropilamino)-4-oxopent-2-enil)-4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (24o). Quando a amina utilizada foi metilamina o produto de disssubstituição, 4-triclorometil-1-[-N-metil-3-(metilamino)but-2-enamida-4-il]-1H-pirimidin-2-ona (24a), foi obtido e, quando foi utilizado 2,2-dimetiletanolamina o produto de ciclização, 1-[(2-ilideno-4,4-dimetiloxazolidin)metil]-4-triclorometil-1H-pirimidin-2-ona (24p), foi obtido. De maneira geral, a maioria dos produtos precipitaram de forma pura no meio reacional quando utilizou-se excesso de nucleófilo, sendo obtidos em rendimentos moderados.

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OLIVEIRA, Janice Vasconcelos. "Desenvolvimento de lipossomas contendo composto 2-fenil-4-amino-6-p-fluorfenil-5-carbonitrila-pirimidina e avaliação de seu potencial antitumoral." Universidade Federal de Pernambuco, 2013. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/10564.

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CAPES
O aumento na incidência de neoplasias malignas no mundo tem estimulado pesquisas que visam desenvolver novos fármacos e alternativas terapêuticas que possibilitem debelar o problema. Neste sentido a tecnologia de liberação controlada de fármacos apresenta-se como ferramenta de grande relevância destacando-se os lipossomas. Compostos contendo o núcleo pirimidínico demonstram notável propriedade antineoplásica, descrita na literatura. O objetivo deste trabalho foi desenvolver e caracterizar lipossomas contendo composto 4- amino-pirimidínico-bissubstituido, avaliar sua citotoxidade e investigar a ação antitumoral in vivo, frente o Sarcoma 180, do fármaco isolado e encapsulado. Os lipossomas contendo composto 4-amino-pirimidínico-bissubstituido foram preparados pelo método de hidratação do filme lipídico e submetidos a ensaios de estabilidade acelerada e em tempos prédeterminados. Os ensaios de citotoxidade foram realizados utilizando o método colorimétrico MTT. Os experimentos in vivo foram submetidos, aprovados e devidamente protocolados junto à Comissão de Ética em Experimentação Animal (CEEA) da UFPE. Os testes de atividade antitumoral seguiram a metodologia de Santos e colaboradores (2005). Os cortes histológicos do tumor foram corados pela Técnica Hematoxilina-Eosina (HE). Após o processo de preparação, as formulações de lipossomas contendo composto 4-aminopirimidínico- bissubstituido demonstraram-se homogêneas. O diâmetro médio e o índice de polidispersão das vesículas foram 298,75 ± 30,37 nm e 0,37 ± 0,01, respectivamente. A eficiência de encapsulação foi de 82,93 ± 0,04%. Observou-se redução da viabilidade celular diante dos compostos testados. O teste in vivo utilizando lipossomas contendo p-Fpirimidina e sua forma livre demonstrou uma inibição tumoral de 66,47 ± 26,8% e 50,46 ± 16,24%, respectivamente. A determinação do índice mitótico revelou redução do número de mitoses dos grupos tratados. Os resultados demonstram que a incorporação de p-Fpirimidina em lipossomas, potencializou seu efeito citotóxico e antitumoral, viabilizando, portanto, seu uso terapêutico.

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Patoilo, Diana Torrão. "Síntese e transformações de Diels-Alder de 2-estirilcromonas: síntese de flavonas contendo unidades do ripo pirimidina." Doctoral thesis, Universidade de Aveiro, 2005. http://hdl.handle.net/10773/4980.

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Doutoramento em Química
Na primeira parte desta dissertação reporta-se a síntese de 2-estirilcromonas, 5-hidroxi-2-estirilcromonas e benziloxi-2-estirilcromonas; e de precursores de dienos do tipo o-quinodimetanos, 2,2-dióxido de 1,3-di-hidrobenzo[c]tiofeno, 2,2-dióxido de 4,7-dimetoxi-1,3-di-hidrobenzo[c]tiofeno e 6,6-dióxido de 2- metil-4-metoxi-5,7-di-hidrotieno[3,4-d]pirimidina. Na segunda parte desta dissertação reportam-se os estudos de reacções de Diels-Alder de 2-estirilcromonas com dienos gerados “in-situ”, por extrusão térmica de dióxido de enxofre, a partir de sulfonas, ambos atrás referidos. Estes resultados permitiram analisar a reactividade das 2-estirilcromonas como dienófilos em reacções de Diels-Alder em função dos seus substitutintes e estabelecer novos métodos de síntese de 2-[2-(3-aril-1,2,3,4-tetrahidronaftil)] cromonas, 2-[2-(3-aril-1,2,3,4-tetra-hidronaftil)]-5-hidroxicromonas, 2-{2-[3-(3,4-dibenziloxifenil)-5,8-dimetoxi-1,2,3,4-tetrahidronaftil]} benziloxicromonas, 2-[6-(7-fenil-2-metil-4-metoxi-5,6,7,8-tetrahidroquinazolil)] cromonas, 2-[7-(6-fenil-2-metil-4-metoxi-5,6,7,8-tetrahidroquinazolil)] cromonas, 2-[6-(7-fenil-2-metil-4-metoxi-5,6,7,8-tetrahidroquinazolil)]- 5-hidroxicromonas e de 2-[7-(6-fenil-2-metil-4-metoxi-5,6,7,8- tetra-hidroquinazolil)]-5-hidroxicromonas. Na terceira parte reportam-se os estudos de reacções de desidrogenação dos cicloaductos sintetizados com vista à obtenção das 2-[2-(3-arilnaftil)]cromonas, 2-[2-(3-arilnaftil)]-5-hidroxicromonas, 2-{2-[3-(3,4-dibenziloxifenil)-5,8- dimetoxinaftil]}benziloxicromonas, 2-[6-(7-fenil-2-metil-4- metoxiquinazolil)]cromonas, 2-[7-(6-fenil-2-metil-4-metoxiquinazolil)]cromonas, 2-[6-(7-fenil-2-metil-4-metoxiquinazolil)]-5-hidroxicromonas e de 2-[7-(6-fenil-2- metil-4-metoxiquinazolil)]-5-hidroxicromonas. Na caracterização estrutural dos compostos sintetizados recorreu-se a técnicas analíticas actuais, especialmente a estudos vários de espectroscopia de ressonância magnética nuclear (RMN), os quais incluíram sobretudo o estudo de espectros de RMN de 1H, de 13C e estudos bidimensionais de correlação espectroscópica homo e heteronuclear e de efeito nuclear de Overhauser.
In the first part of this dissertation the synthesis of 2-styrylchromones, 5- hydroxy-2-styrylchromones and benzyloxy-2-styrylchromones; and precursors of o-quinodimethane-type dienes, 2,2-dioxide of 1,3-dihydrobenzo[c]thiofene, 2,2-dioxide of 4,7-dimethoxy-1,3-dihydrobenzo[c]thiofene and 6,6-dioxide of 2- methyl-4-methoxy-5,7-dihydrotiene[3,4-d]pyrimidine is reported. In the second part we report the study on Diels-Alder reactions of 2- styrylchromones with dienes generated “in situ”, by extrusion of sulphur dioxide, from sulphones, both referred above. These results allow us to discuss the reactivity of 2-styrylchromones as dienophiles in Diels-Alder reactions according their substitutents and establishing new synthetic methods for 2-[2- (3-aryl-1,2,3,4-tetrahydronaphthyl)]-chromones, 2-[2-(3-aryl-1,2,3,4- tetrahydronaphthyl)]-5-hydroxychromones, 2-{2-[3-(3,4-dibenzyloxyphenyl)-5,8- dimethoxy-1,2,3,4-tetrahydronaphthyl]}-benzyloxychromones, 2-[6-(7-phenyl-2- methyl-4-methoxy-5,6,7,8-tetrahydroquinazolyl)]-chromones, 2-[7-(6-phenyl-2- methyl-4-methoxy-5,6,7,8-tetrahydroquinazolyl)]-chromones, 2-[6-(7-phenyl-2- methyl-4-methoxy-5,6,7,8-tetrahydroquinazolyl)]-5-hydroxychromones and 2-[7- (6-phenyl-2-methyl-4-methoxy-5,6,7,8-tetrahydroquinazolyl)]-5- hydroxychromones. In the third part we report the study on dehydrogenation reactions of the synthesised cicloadducts to obtain the 2-[2-(3-arylnaphthyl)]chromones, 2-[2- (3-arylnaphthyl)]-5-hydroxychromones, 2-{2-[3-(3,4-dibenzyloxyphenyl)-5,8- dimethoxynaphthyl]}benzyloxychromones, 2-[6-(7-phenyl-2-methyl-4- methoxyquinazolyl)]chromones, 2-[7-(6-phenyl-2-methyl-4-methoxyquinazolyl)] chromones, 2-[6-(7-phenyl-2-methyl-4-methoxyquinazolyl)]-5- hydroxychromones and 2-[7-(6-phenyl-2-methyl-4-methoxyquinazolyl)]-5- hydroxychromones. All synthesised compounds were characterised using modern analytical techniques, with special emphasis on exhaustive nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopic studies. The NMR methods used include 1H, 13C, two dimensional homonuclear and heteronuclear correlated spectroscopy and nuclear Overhauser effect experiments.
FCT
FSE
POCTI

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Jaime, Bezerra Mendonça Junior Francisco. "Síntese e avaliação da atividade antimicrobiana de novas 3,4-dihidro-2,6-diaril-4-oxo-pirimidina-5-carbonitrilas." Universidade Federal de Pernambuco, 2003. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/3396.

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Made available in DSpace on 2014-06-12T16:30:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5766_1.pdf: 286300 bytes, checksum: 342a5be7fb21363269f7df5a812925e0 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003
Compostos heterocíclicos do tipo pirimidinona são reconhecidos na terapêutica pela enorme riqueza de seu potencial farmacológico. Diversas atividades como: antiviral, antitumoral, antiinflamatórias, anticonvulsivantes, indutoras de interferon, antihistamínicas, antibióticas e herbicidas, entre outras, são extensamente relatadas na literatura. Numerosas reações de heterociclização que permitem a obtenção dessa classe de compostos são igualmente reconhecidas. Baseado nessa diversidade de atividades e do conhecimento prévio de inúmeras viabilidades sintéticas, unido à nossa contínua busca para o desenvolvimento de pirimidinonas biologicamente mais ativas, vislumbramos a possibilidade de obtenção de novos derivados 3,4-dihidro-2,6-diaril-4-oxo-pirimidina-5-carbonitrilas, através de pequenas modificações de metodologias anteriores a fim de testar suas possíveis propriedades farmacológicas. O método empregado para obtenção dos novos derivados pirimidinônicos, consistiu na reação de heterociclização produzida pela condensação de cloridratos de arilamidinas com benzilidenos derivados do cianoacetato de etila em meio metanólico sob ação da trietilamina. As arilamidinas foram preparados em duas etapas a partir de nitrilas aromáticas, sendo a primeira etapa a síntese de sais de iminoéteres por reação de nitrilas sob ação do etanol anidro e ácido clorídrico como catalisador. Em seguida esses sais são submetidos à ação da amônia. Do outro lado, temos a síntese dos benzilidenos derivados do cianoacetato de etila (intermediário de Michael), que foram obtidos através de reação de condensação de Knoevenagel entre aldeídos aromáticos e cianoacetato de etila, utilizando um catalisador básico (Et3N). Os 6 (seis) novos compostos sintetizados através dessa metodologia adaptada foram depois de devidamente purificados e caracterizados quanto as suas propriedades físicoquímicas obtidos com bons rendimentos e tiveram suas estruturas completamente elucidadas pelos métodos usuais de ressonância magnética nuclear de hidrogênio (RMN1H), infravermelho (IV) e espectrometria de massas de alta resolução. Os testes preliminares realizados, tendo em vista a avaliação das propriedades antimicrobianas dos compostos sintetizados, não demonstraram atividades promissoras, apenas sendo pouco ativos frente ao microorganismo Bacillus subtilis

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Dal, Pizzol Carine. "Desenvolvimento de nanopartícula lipídica sólida contendo um análogo de pirimidina e avaliação in vitro da atividade antitumoral." reponame:Repositório Institucional da UFSC, 2014. https://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/128894.

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Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Farmácia, Florianópolis, 2014
Made available in DSpace on 2015-02-05T20:27:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 331123.pdf: 8939835 bytes, checksum: c99e68a52a7441188881d0e1802660a8 (MD5) Previous issue date: 2014
Esta tese está sendo apresentada em quatro etapas. A primeira foi avaliar doze moléculas de análogos de pirimidina, quanto ao aspecto de citotoxicidade e tipo de morte celular em três linhagens celulares tumorais (L1210, B16F10 e CEM). Quatro moléculas apresentaram efeito citotóxico relevante. Assim, prosseguiu-se a avaliação da molécula C3, escolhida entre as quatro pela facilidade de obtenção.Testes preliminares apresentaram baixa solubilidade em água, o que dificultaria a administração parenteral. Desta maneira, a segunda etapa foi desenvolver uma formulação para facilitar a administração desta molécula in vivo. Neste sentido, foi realizada a avaliação da influência do emulsionante e do tipo de lipídeo nas características físico-químicas e na biocompatibilidade de nanopartículas lipídicas sólidas (NLS). Formulações foram preparadas com diferentes lipídeos (tripalmitina (TRP), monoestearato de glicerila (MEG) e ácido esteárico (AE)) e emulsionantes (polissorbato 80 e lecitina S75) em diferentes concentrações. Os estudos de biocompatibilidade celular realizados foram: viabilidade celular por MTT, análise da morfologia celular por laranja de acridina, ciclo celular por citometria de fluxo e hemólise de eritrócitos. As formulações demonstraram boa estabilidade físicoquímica e apresentaram um tamanho de partícula entre 116 a 306 nm, com índice de polidispersão (PI) entre 0,25 a 0,30 com valores negativos para o potencial zeta (PZ). As NLS produzidas com AE mostraram maior citotoxicidade in vitro quando comparadas com as NLS produzidas com TRP e MEG e apresentaram atividade hemolítica. A terceira etapa foi otimizar uma formulação de NLS aplicando um delineamento experimental. A partir desta otimização, NLS foram preparadas pelo método de ultrassom e o C3 foi incorporado em diferentes concentrações (250, 500 e 1000 µg.mL-1). Um método por cromatografia líquida de alta eficiência foi desenvolvido e validado para o doseamento do C3 incorporado nas NLS. A adição de diferentes quantidades de C3 nas formulações não afetou o diâmetro médio das nanopartículas. O PI foi menor que 0,22 para todas as formulações. O PZ das NLS apresentram valor negativo e houve variações entre as formulações preparadas indicando a adsorção do C3 na superfície das nanopartículas. A eficiência de encapsulação foi maior que 97% para as formulações desenvolvidas. O estudo de estabilidade revelou expulsão do C3 da NLS ao longo do tempo, assim um estudo de liofilização foi realizado. Boas características de ressuspensão foram atingidas e o teor de C3 foi mantido ao longo do tempo. O ensaio de liberação indicou uma eficiência na retenção do C3 pelas NLS. No estudo de citotoxicidade com linhagem celular tumoral L1210, as NLS contendo a molécula encapsulada apresentou um perfil de toxicidade semelhante à molécula livre. Por fim, como quarta etapa deste trabalho, visando facilitar uma possível passagem de escala, foi realizada uma comparação das características das NLS produzidas pela técnica de utltrassonicação e de homogeneização por alta pressão. Como conclusão, os resultados obtidos revelaram a capacidade de incorporação de uma molécula pouco solúvel em NLS, o que viabiliza a administração parenteral e torna este sistema adequado para testes in vivo.

Abstract: This thesis is presented in four steps. The first step in this work was the evaluation of the cytotoxicity of twelve pyrimidine analogs in three cell lines (L1210, B16F10 and CEM) and to assess the type of cell death induced by these molecules. Four molecules showed significant cytotoxic effect. Thus, C3 molecule was chosen to continue the study because it is easy to obtain it. Preliminary tests showed low solubility of the molecule in water, making it difficult to parenteral administration. Therefore, the second step was to develop a formulation to facilitate the administration of this molecule in vivo. In this regard, a review of the preliminary influence of the emulsifier and the lipid type on the physicochemical characteristics and biocompatibility of solid lipid nanoparticles (SLN) were performed. Formulations were prepared with lipids commonly used for production of SLN (tripalmitin (TRP), glyceryl monostearate (MEG) and stearic acid (SA) and emulsifiers(polysorbate 80 and lecithin S75) at different concentrations. Cell biocompatibility studies were performed: cell viability by MTT analysis of cell morphology with acridine orange stain, cell cycle by flow cytometry and hemolysis of erythrocytes. The formulations studied showed good physical-chemical stability and they showed the particlesize between 116 and 306 nm, polydispersity index (PI) 0.25 and 0.30 with negative zeta potencial (PZ) values. The SLN manufactured using SA showed greater cytotoxicity in vitro when compared to SLN produced with MEG and TRP, and SNL-SA showed hemolytic activity.The third step was to optimize a formulation of NLS applying an experimental design. The optimized formulation was prepared by the ultrasound method and C3 was incorporated at different concentrations in SLN (250, 500 and 1000 µg.mL-1). A high performance liquid chromatographic (HPLC) method was developed and validated for the quantitative determination of C3 in SLN. The addition of different amounts of C3 in the formulation did not affect the mean diameter of the nanoparticles. The PI was less than 0.22 for all formulations. PZ of the SLN showed a negative value and there were variations among the formulations prepared indicating adsorption of the C3 on the surface ofnanoparticles. The encapsulation efficiency was higher than 97% for allthe formulations developed. The stability study revealed expulsion ofthe C3 in SLN over time, and for this a lyophilisation study was conducted. Good proprieties of resuspension were established and the formulations stability were maintained over time. The release assay indicated a retention of the C3 in NLS. The cytotoxicity study with L1210 cell lines the SLN containing C3 encapsulated showed a similar profile to the free-molecule cytotoxicity. Finally, as a fourth step of this work, to facilitate a possibility to scale up, a comparison of the SLN physicochemical proprieties produced by the ultrasound method and high pressure homogenization was performed. The results showed that both techniques are suitable for the production of SLN. In conclusion, these findings suggest that a pyrimidine analogue loaded solid lipid nanoparticle is a promising formulation for parenteral administrations and that it suitable for in vivo testing.

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UBERTINI, FULVIA. "Pirimidina 5'-nucleotidasi umana, p5N-1: evidenze della formazione di un intermedio fosforilato e mutagenesi sito-diretta." Doctoral thesis, Università Politecnica delle Marche, 2008. http://hdl.handle.net/11566/242603.

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Renata, Leite Monteiro Maria. "6-Aril-Pirimidinas contendo uma função imida : síntese e avaliação das propriedades antimicrobianas." Universidade Federal de Pernambuco, 2005. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/1614.

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Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4494_1.pdf: 2968685 bytes, checksum: 78b451af69b3432d863083edc34c0dee (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005
Os derivados pirimidínicos vêm ganhando destaque devido à sua grande importância biológica. Atividades antitumoral, antiinflamatória, antimicrobiana, anticonvulsivante, anti-hipertensiva, entre outras são atribuídas ao heterociclo da pirimidina. Por outro lado, compostos contendo a função imida vem ganhando grande importância dada às suas significantes atividades biológicas. Estes dados bibliográficos nos motivaram a obter compostos heterocíclicos pirimidínicos contendo uma função imida e avaliar as suas propriedades antimicrobianas. Inicialmente foram sintetizados os compostos 4-amino-2,6-(diaril-dissubstituídos)-5- carbonitrila-pirimidínicos (7a-d), a partir da reação de bisnitrilas com amidinas. Em seguida, foi feita a redução dos nitrocompostos às suas respectivas aminas (8a-d), utilizando Pd como catalizador. A última série de derivados 4-amino-2-aril-5-ciano-6- {3 e 4-(N-succinimidofenil)}pirimidina (9a-d) foi obtida através da condensação do grupo amino com o anidrido succínico. Os produtos obtidos foram identificados estruturalmente por espectroscopia de ressonância magnética nuclear de hidrogênio (RMN-1H), espectroscopia de infravermelho (IV) e espectrometria de massas (MS). Depois de caracterizados, os compostos (8a-d) e (9a-d) foram avaliados quanto à sua atividade antimicrobiana. Os resultados do teste de difusão em meio sólido não foram satisfatórios, mostrando apenas uma pequena inibição frente a Klebsiella pneumoniae e Pseudonocardia termophila, levando-nos a crer que as substâncias, por serem pouco solúveis, não se difundem no meio. Em meio líquido, os compostos apresentaram uma melhor resposta, visto que os microrganismos-teste foram sensíveis a todas as substâncias testadas

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Campos, Luana Janaína de. "Estudos QSAR de derivados de pirimidonas, pirimidinas e piridopirazinas carboxamidas inibidoras da HIV 1 integrase." Universidade Estadual do Oeste do Parana, 2015. http://tede.unioeste.br:8080/tede/handle/tede/8.

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Made available in DSpace on 2017-05-12T14:36:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAcaO_ Final.pdf: 7044304 bytes, checksum: 2c043ef6d78e2a532d7a87d8a9b74434 (MD5) Previous issue date: 2015-12-04
The computer-aided drug design field have attracted attention with regard to the discovery of new antiretroviral for use in AIDS pharmacotherapy. Thus, the aim of this study was to develop mathematical models that can predict the anti HIV1-IN activity of analogues not synthesized from pyrimidones, pyrimidines and pyridopyrazine carboxamides, reducing the time to obtain new prototypes of drugs. Therefore, it was selected from the literature, a set of 199 compounds described as strand transfer reaction inhibitors and developed 2D and 3D QSAR studies. For the 2D QSAR was used the Ordered Predictors Selection (OPS) methodology in order to develop the variable selection and Fractional Factorial Design (FFD) and OPS for the 3D QSAR. The models in both studies were constructed using partial least squares (PLS). Regarding the 3D QSAR studies, were employed two different methodologies for the calculation of the molecular interaction fields (MIFs): GRID and GRIND (GRid-INdependent descriptors). In addition, they were also used descriptors of pharmacokinetic properties from the Volsurf+ software (extracted from MIFs generated with GRID) for building models in combination with 2D descriptors. The statistical models with good quality were used to predict the activities of a second data set (prediction set, N=145). The resultants predictions were satisfactory. The Williams and Euclidean applicability domains for the set of samples reveal that the predictions did not occur by extrapolation. Moreover, the descriptor ET (total energy of the molecule), selected by the QSAR 2D model is consistent with earlier findings. Further, for the 3D study, the most relevant characteristics (N1-N1 interactions and DRY-O) are coherent with the pharmacophore of the class under study.
O campo do planejamento de fármacos auxiliado por computador tem atraído atenção no que se refere à descoberta de novos antirretrovirais para uso na farmacoterapia da AIDS. Com isso, o objetivo deste trabalho foi desenvolver modelos matemáticos que possam prever a atividade anti HIV1-IN de análogos ainda não sintetizados de pirimidonas, pirimidinas e piridopirazinas carboxamidas, agilizando assim a obtenção de novos compostos protótipos de fármacos. Desta maneira, foi selecionado da literatura um conjunto de 199 compostos descritos como inibidores da reação de transferência de fita e desenvolvido estudos de QSAR 2D e 3D. Para o primeiro utilizou-se a metodologia de seleção de variáveis Ordered Predictors Selection (OPS) e para o segundo Planejamento Fatorial Fracionário (Fractional Factorial Design, FFD) e OPS. Os modelos em ambos os estudos foram construídos através da regrressão por quadrados mínimos parciais (PLS). Em relação aos estudos de QSAR 3D, foram empregadas duas diferentes metodologias para o cálculo dos campos de interação molecular (Molecular Interaction Fields, MIFs): GRID e GRIND (GRId-INdependent descriptors). Ademais, foram também utilizados descritores de propriedades farmacocinéticas provenientes do software Volsurf+ (extraídos de MIFs gerados com GRID) para construção de modelos em associação com descritores 2D. Os modelos com boa qualidade estatística, foram empregados para predição das atividades de um segundo conjunto de dados (conjunto de predição, N=145). Os resultados para as previsões foram satisfatórios. Os domínios de aplicabilidade de Willians e Euclidiano em relação as amostras do conjunto de predição revelam que as predições não ocorreram por extrapolação. Além disto, o descritor ET (energia total da molécula), selecionado para o modelo QSAR 2D é consistente com achados bibliográficos prévios. Em relação ao estudo 3D, as características mais relevantes (interações N1-N1 e DRY-O) se mostram coerentes com o farmacóforo da respectiva classe sob estudo.

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Miret, Casals Laia. "Small molecules for modulating biological targets." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2014. http://hdl.handle.net/10803/279548.

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CHAPTER 1: Respiratory Infectious Diseases (RID) are diseases affecting the air passages, the bronchi and the lungs. They range from acute infections, such as pneumonia and bronchitis, to chronic conditions such as asthma, cystic fibrosis and chronic obstructive pulmonary disease. Respiratory lung infections are leading causes of morbidity and mortality worldwide with a considerable human, social and financial burden. RID can be caused by an increasing number of multi resistant bacteria to the existing antibiotics. Bacteria, which normally inhabit the mucus, grow out of control and consequently colonize and infect the lungs. The altered mucus leads to formation of bacterial microenvironments known as biofilms, which are difficult for antibiotics and inmunitary cells to penetrate. A potential key enzyme of bacteria, associated with chronic lung infections, to be targeted by antiproliferative drugs are ribonucleotide reductase enzymes (RNR). RNR enzyme provides deoxyribonucleotides for DNA synthesis which are needed for growth and spore germination of the pathogen. Inhibition of RNR enzymes could be a valuable therapeutic strategy for the treatment of RID. In the literature, it has been suggested that hydroxyurea (HU) and N-hydroxylamine derivatives can be used as antiproliferative drugs against bacterial lung infections. Therefore, a library of these compounds was synthesized and evaluated against four different bacteria lines: Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Burkholderia cenocepacia and Bacillus anthracis; all of them are opportunistic infectious pathogens affecting respiratory system. CHAPTER 2: Mitofusin-2 (Mfn2) participates in mitochondrial fusion and moreover, regulates mitochondrial metabolism. We have previously reported that Mfn2 is down regulated in muscle from obese or type 2 diabetic patients, and recently we have demonstrated that Mfn2 deficiency in liver or muscle leads to glucose intolerance and insulin resistance in mice. Therefore, activators of Mfn2 expression could be used as a valuable potential therapeutic strategy for the treatment of type 2 diabetes and obesity. For this purpose, we decided to search activators of mitofusin-2 expression by High Throughput Screening using a FDA-approved library. HeLa cells stably expressing luciferase under the control of 2 kb of human Mfn2 promoter were incubated with the library and compound LM1 was identified as a potent activator of Mfn2 transcriptional activity. Importantly, LM1 increased Mfn2 expression in HeLa and C2C12 cells. Furthermore, LM1 also induced the expression of the mitochondrial fusion protein Mfn1 and repressed the mitochondrial fission protein Drp1 in both cell lines. LM1 modulates the mitochondrial proteins involved in mitochondrial dynamics producing an elongation of the mitochondrial network. In addition, LM1 was able to increase Mfn2, Mfn1 and OPA1 protein levels and promoted mitochondrial elongation in MEFwt, MEF Mfn2-/- and MEF Mfn1-/- cells. However, mitochondrial elongation is more dependent of Mfn1 than Mfn2 due to the higher mitochondrial elongation of MEF Mfn2-/- compared to MEF Mfn1-/- cells. LM1 decreases the synthesis of pyrimidines by inhibiting dihydroorotate dehydrogenase (DHODH), which causes cell stress and p53 activation by phosphorylation at Ser15. p53 triggers Mfns up-regulation promoting mitochondrial elongation. The addition of external uridine, which reverses the deficiency in pyrimidines synthesis, prevents p53 and Mfns increase in C2C12 cells. Moreover, LM2, an inhibitor of complex III that indirectly inhibit DHODH, and consequently pyrimidine synthesis, also up-regulates p53 producing an increase in Mfns protein expression. LM2 also promotes mitochondrial elongation in HeLa, C2C12 and MEFwt cells. We can conclude that the depletion of pyrimidine pools, by complex III or DHODH inhibitors, cause cell stress, and trigger p53 accumulation and activation by p53 phosphorylation at Ser15, which causes cell cycle arrest. p53 up-regulates Mfns and down-regulates Drp1 promoting mitochondrial elongation that confer stress resistance on cells. Therefore, mitochondrial elongation represents an adaptive response against cell stress caused by LM1 and LM2.
CAPÍTOL 1: Les malalties respiratòries infeccioses com per exemple la pneumònia, la bronquitis, la fibrosis quística i la malaltia pulmonar obstructiva crònica són les principals causes de morbidesa i mortalitat a tot el món. Aquestes infeccions són causades per un nombre creixent de bacteris multi resistents als antibiòtics que existeixen actualment. Uns enzims indispensables pels bacteris són els enzims ribonucleòtids reductases (RNR), els quals produeixen els desoxiribonucleòtids per la síntesi d’ADN. Una molècula capaç d’inhibir l’enzim RNR pararia el creixement del bacteri, esdevenint una estratègia terapèutica en el tractament de les malalties respiratòries infeccioses. La hidroxiurea i els derivats de la N-hidroxilamina són inhibidors de l’enzim RNR. Per tant, vam decidir sintetitzar una llibreria d’hidroxilamines, a partir d’aldehids per aminació reductiva. Els compostos van ser avaluats en quatre línies diferents de bacteris: Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia, Staphylococcus aureus i Bacillus anthracis, que causen infeccions oportunistes en pacients que pateixen malalties respiratòries. CAPÍTOL 2: La mitofusina 2 és una proteïna mitocondrial que participa en la fusió mitocondrial i en regula el metabolisme. A més, Mfn2 està disminuïda en el múscul de pacients que pateixen obesitat o diabetis de tipus 2. Per tant, activadors de l’expressió de Mfn2 es podrien utilitzar com a tractament terapèutic. Per trobar activadors de Mfn2 es va portar a terme un cribratge d’alt rendiment amb la llibreria de compostos Prestwick utilitzant les cèl•lules HeLa que expressen de forma estable la proteïna luciferasa sota el promotor humà de Mfn2. El compost LM1, que va ser identificat, augmenta l’expressió de les proteïnes de fusió Mfn2, Mfn1 i OPA1, i disminueix la proteïna de fissió Drp1 en cèl•lules, produint una elongació de la xarxa mitocondrial. El compost LM1 i el LM2, que inhibeixen l’enzim DHODH directa o indirectament, causen la disminució de la síntesi de pirimidines que produeix un estrès cel•lular i l’activació i acumulació de p53. p53 produeix una parada de cicle cel•lular i modula les proteïnes involucrades en dinàmica mitocondrial promovent l’elongació mitocondrial. L’allargament de la xarxa mitocondrial proporciona més resistència a les cèl•lules que pateixen un estrès cel•lular.

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Rosa, Wilian Carvalho da. "Síntese de espiro[cromeno[4,3-d]pirimidinas-5,1 -cicloalcano] e 5,6-diidrobenzo[h]quinazolinas trifluormetil substituídas." Universidade Federal de Santa Maria, 2016. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10616.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The present dissertation initially describes new methods for the synthesis of 4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydrobenzo[h]quinazolines and 4-(trifluoromethyl)spiro[chromeno[4,3-d]pyrimidines-5,1'-cycloalkane], as new trifluoromethyl substituted heterocyclic systems. Cyclocondensation reactions type [3 + 3] involving 2,2,2-trifluoro-1-(1-methoxy-3,4-dihydronaphthalen-2-yl)ethanone and five amidines [NH2-(C=NH)R] conducted to the synthesis of a new series of five examples of 2-substituted 4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydrobenzo[h]quinazolines in 40-70% yield, where R = 2-substituent = H, methyl, phenyl, NH2 or SCH3. In sequence, a new series of nine unpublished 4-(trifluoromethyl)spiro[chromeno[4,3-d]pyrimidines-5,1'-cycloalkane] were obtained in 73-95% yield from cyclocondensation reactions type [3 + 3] involving 2,2,2-trifluoro-1-(4-methoxyspiro[chromene-2,1'-cycloalkane]-3-yl)ethanones and some amidines. These new spiro-heterocyclic structures have a methyl, phenyl or NH2 substituent attached to the position-2 and a 5-, 6- or 7-membered cycloalkane at the spiroposition-5, simultaneously. Finally, to demonstrate the synthetic utility of the 2-amino substituent attached to the obtained heterocycles, N-derivatization reactions of 4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydrobenzo[h]quinazolin-2-amine and 4-(trifluoromethyl)spiro[chromeno[4,3-d]pyrimidine-5,1'-cyclopentan]-2-amines employing 2,5-dimethoxytetrahydrofuran in acetic acid medium (Clauson-Kaas reaction) by two methods are described. The first method followed a two-step reaction procedure (35-55%) and the second an "one pot" method (45-55%). The "one-pot" method was the most advantageous by some experimental aspects. However, both methods allowed an efficient conversion of the 2-amino group into the 2-(1H-pyrrol-1-yl) substituent and the obtainment of four new examples of 2- (1H-pyrrol-yl)-substituted heterocyclic molecules.
A presente dissertação descreve, inicialmente, metodologias para a síntese de sistemas espiro[cromeno[4,3-d]pirimidinas-5,1‟-cicloalcano] e 5,6-diidrobenzo[h]quinazolinas, ambos trifluormetil-substituídos. Reações de ciclocondensação do tipo [3+3] entre 1-metóxi-2-trifluoracetil-3,4-diidro-naftaleno e diferentes amidinas conduziu à síntese de uma série de cinco 5,6-diidrobenzo[h]quinazolinas 2-substituídas (40-70 %), onde 2-substituinte = H, Metila, Fenila, NH2 e SCH3. Na sequência, obteve-se uma série de nove espiro[cromeno[4,3-d]pirimidinas-5,1‟-cicloalcano] (73-95 %) a partir de reações de ciclocondensação do tipo [3+3] envolvendo 2,2,2-triflúor-1-[4-metóxi-espiro(2H-cromen-2,1‟-cicloalcan)-3- il]etanonas e amidinas. Estas estruturas espiro-heterocíclicas apresentam substituintes metila, fenila e NH2 na posição 2 e um espiro-cicloalcano de 5, 6 ou 7 carbonos na posição 5. Finalmente, descreve-se reações de N-derivatização de 2-amino-4-(trifluormetil)-5,6-diidrobenzo[h]quinazolina e 2-amino-4-(trifluormetil)-espiro-[cromeno[4,3-d]pirimidinas-5,1'-cicloalcano] com 2,5-dimetoxitetrahidrofurano em meio ácido acético (Reação de Clauson-Kaas) por dois métodos. O primeiro método em duas etapas (35-55%) e o segundo na forma one pot (45-55%). O método one-pot foi o mais vantajoso em vários aspectos experimentais, porém ambos permitiram a inserção do substituinte 1H-pirrol-1-ila e a obtenção de quatro moléculas heterocíclicas 2-(1H-pirrol-il)-substituídas.

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Rosa, Fernanda Andreia. "Acilenaminonas: Síntese e Aplicação na Obtenção de Pirazóis, Pirazolo[3,4-d]piridazinonas e Pirazolo[1,5-a]pirimidinas." Universidade Federal de Santa Maria, 2009. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4174.

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Анотація:

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
The regioespecific synthesis of a series of 14 N-acylated enaminones (52-88%) from the acylation reaction of secondary β-enamino ketones [RC(O)CH=CHNR1R2; R = Ph, 4- FC6H4, 4-NO2C6H4, thien-2-yl, CCl3, CF3; R1 = H; R2 = Bn, Ph, 4-NO2C6H4] with trifluoroacetic anhydride or ethyl oxalyl chloride in pyridine is reported. On the other hand, when tertiary enaminone precursors [R = Ph, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4, 4-BrC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4-O2NC6H4, thien-2-yl, benzofur-2-yl, CCl3, CF3; R1,R2 = Me] were used, the acylation reaction led to a series of 17 C-acylated enaminones (75-95%). A series of 4-substituted-1H-pyrazole-5-carboxylates (73-94%) were obtained regiospecifically from the cyclocondensation reaction of non symmetrical enaminodiketones [RC(O)C(=CHNMe2)C(O)CO2Et; R = Ph, 4-MeOC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4-O2NC6H4, thien-2-yl, benzofur-2-yl, CCl3, CF3] with tert-butylhydrazine or carboxymethylhydrazine. The reaction of these pyrazole-5-carboxylates (R = 4-MeOC6H4, 4-FC6H4, benzofur-2-yl, CF3) with hydrazine lead to synthesis of 4- substituted-pyrazolo[3,4-d]pyridazinones (74-96%). In addition, the reaction of enaminodiketones (R = Ph, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4, 4-BrC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4- O2NC6H4, thien-2-yl, benzofur-2-yl) with 3-amino-5-methylpyrazole was performed, where a series of pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-7-carboxylates were obtained regiospecifically (53-79%).
A síntese de uma série de 14 enaminonas N-aciladas regioespecificamente (52-88%) foi realizada a partir da reação de acilação de enaminonas secundárias [RC(O)CH=CHNR1R2; R = Ph, 4-FC6H4, 4-NO2C6H4, tien-2-il, CCl3, CF3; R1 = H; R2 = Bn, Ph, 4-NO2C6H4] com anidrido trifluoracético e com cloreto de etil oxalila em piridina. Quando foram utilizados como precursores enaminonas terciárias [R = Ph, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4, 4-BrC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4-O2NC6H4, tien-2-il, benzofur-2-il, CCl3, CF3; R1,R2 = Me] a reação de acilação levou à obtenção regioespecífica de 17 enaminonas C-aciladas (75-95%). Uma série de 5-carboxietil-1H-pirazol 4-substituídos foi obtida regioespecificamente (73-94%) a partir da ciclocondensação das enaminodicetonas não simétricas [RC(O)C(=CHNMe2)C(O)CO2Et; R = Ph, 4-MeOC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4-O2NC6H4, tien-2-il, benzofur-2-il, CCl3, CF3] com tert-butilidrazina ou carboximetilidrazina. A reação destes pirazóis (R = 4-MeOC6H4, 4-FC6H4, benzofur-2-il, CF3) com hidrazina monoidrato levou à síntese de pirazolo[3,4-d]piridazinona 4- substituídas (74-96%). Também foi realizada a reação de ciclocondensação de enaminodicetonas (R = Ph, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4, 4-BrC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4-O2NC6H4, tien-2-il, benzofur-2-il) com 3-amino-5-metilpirazol onde as 7-carboxietilpirazolo[1,5-a]pirimidinas 6-substituídas foram obtidas regioespecificamente (53-79%).

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Fortes, Andressa Silveira. "Síntese de 2-Benzil(metil)tio-6-aril(metil)pirimidinas-4-carboxilato de Etila e seus Ácidos Derivados." Universidade Federal de Santa Maria, 2012. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10522.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
This work presents a simple and versatile synthetic strategy for the preparation of a novel series of Ethyl 2-Benzyl(methyl)tiopyrimidines-4-carboxylate 6-substituted and their acids derivatives. The Ethyl 2-Benzyl(methyl)tiopyrimidines-4-carboxylate 6-substituted were obtained from the reaction of 2-Benzyl(methyl)isothiourea with Ethyl 4-Aryl(methyl)-4-methoxy-2-oxo-3-butenoates (where Ar= Ph, 4-FC6H4, 4-BrC6H4, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4 and 4-NO2C6H4), in the presence of sodium carbonate in ethanol and water to produce the corresponding Ethyl 2-Benzyl(methyl)tiopyrimidines-4-carboxylate 6-substituted with good yields (52-94%). Acids derivatives of these Pyrimidines were obtained from the reaction one-pot" of 2-Benzyl(methyl)isothiourea with Ethyl 4-Aryl(methyl)-4-methoxy-2-oxo-3-butenoates (where Ar = Ph; 4-FC6H4, 4-BrC6H4, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4 and 4-NO2C6H4), in the presence of sodium carbonate in ethanol and water and, subsequently, with the addition of a solution of sodium hydroxide, producing the respective acids 2-Benzyl(methyl)thiopyrimidines-4-carboxylic 6-substituted with good yields (35-90%). The pyrimidines obtained in this study were identified by Hydrogen Nuclear Magnetic Resonance, Nuclear Magnetic Resonance Carbon-13, Infrared Spectroscopy, Elemental Analysis and Mass Spectroscopy.
Este trabalho apresenta uma estratégia sintética simples e versátil para a preparação de uma série de 2-Benzil(metil)tiopirimidinas-4-carboxilato de Etila 6-substituídas e seus Ácidos Derivados inédita. As 2-Benzil(metil)tiopirimidinas-4-carboxilato de Etila 6-substituídas foram obtidas a partir da reação de 2-Benzil(metil)isotiouréia com 4-Aril(metil)-4-metóxi-2-oxo-3-butenoatos de Etila (onde Ar= Ph, 4-FC6H4, 4-BrC6H4, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4 e 4-NO2C6H4), com a presença de carbonato de sódio em etanol e água, produzindo as respectivas 2-Benzil(metil)tiopirimidinas-4-carboxilato de Etila 6-substituídas com rendimentos bons (52-94%). Os ácidos derivados destas pirimidinas foram obtidas a partir da reação one-pot de 2-Benzil(metil)isotiouréia com 4-Aril(metil)-4-metóxi-2-oxo-3-butenoatos de Etila (onde Ar= Ph, 4-FC6H4, 4-BrC6H4, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4 e 4-NO2C6H4), com a presença de carbonato de sódio em etanol e água e, posteriormente, com a adição de uma solução de hidróxido de sódio, produzindo os respectivos Ácidos 2-Benzil(metil)tiopirimidinas-4-carboxílicos 6-substituídos com rendimentos bons (35-90%). As pirimidinas obtidas neste trabalho foram identificadas por Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio, Ressonância Magnética Nuclear de Carbono-13, Espectroscopia de Infravermelho, Análise Elementar e Espectroscopia de Massas.

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Marzari, Mara Regina Bonini. "Síntese de pirazolo[1,5-a]pirimidinas e fluorfenilpirazóis trifluormetilados em ultrassom e síntese e aplicação de [2]rotaxanos." Universidade Federal de Santa Maria, 2014. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4287.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
This work presents the synthesis of three series of trifluoromethylated heterocycles by using ultrasound irradiation, nomely pyrazolo[1,5-a]pyrimidines, 2,4- difluorophenylpyrazoles and pentafluorophenylpyrazoles. The reactions were performed between trifluoromethylated enones ([CF3C(O)CH=C(R)(OMe], where R = Me, Bu, i-Bu, Ph, 4-MeC6H4, 4-FC6H4, 4-ClC6H4, 4-BrC6H4, 4-IC6H4, thien-2-yl, naphthyl and biphenyl) with three different nucleophiles, nomely (3)(5)-amine-(5)(3)- methylpyrazole, 2,4-difluorophenylhydrazine hydrochloride and pentafluorophenylhydrazine. The trifluoromethylated pyrazolo[1,5-a]pyrimidines were obtained within 5 minutes, giving yields of 61-98 %. The series of 2,4- difluorophenylpyrazoles was obtained in good yields (54-85 %) within 15 minutes by acidifying the reaction medium with PTSA. In the case of the pentafluorophenylpyrazoles, two steps were needed: Firtly the respective 4,5- dihydropentafluorophenylpyrazoles were synthesised and then subsequently submitted to dehydration reactions using PTSA for 15 minutes, giving yields of 54-81 %. The synthesized compounds were identified by 1H and 13C, and by 19F NMR spectroscopy in the some case, mass spectrometry and X-ray diffraction. In some cases homo/heteronuclear spatial interactions involving fluorine atoms have been useful for confirming the identity of the obtained isomer. Another part of this tesis was the synthesis of four mechanically interlocked molecules. Two [2]rotaxanes carrying an ester group in the macrocycle unity were synthesized by using two threads (fumaramide and succinamide derivatives). Once synthesized these [2]rotaxanes were submmited to hydrolysis reactions to give [2]rotaxanes with acid carboxilic group. These macromolecules were synthesized aiming at the formation of MOFs (metal organic frameworks). The synthesis of this compound was carried out by using copper (II) and [2]rotaxane derivative fumaramide. This product was identified by X-ray diffractometry.
Este trabalho apresenta a síntese de três séries de heterociclos trifluorometilados, utilizando irradiação de ultrassom (pirazolo[1,5-a]pirimidinas, 2,4-difluorofenilpirazóis e pentafluorofenilpirazóis). As reações foram realizadas entre enonas trifluorometiladas ([CF3C(O)CH=C(R)(OMe], onde R = Me, Bu, i-Bu, Ph, 4-Me-C6H4, 4-F-C6H4, 4-Cl-C6H4, 4-Br-C6H4, 4-I-C6H4, tien-2-il, bifen-2-il e naftil) e três dinucleófilos diferentes 3-amino-5-metilpirazol, cloridrato de 2,4-difluorofenilhidrazina e pentafluorofenilhidrazina. As pirazolo[1,5-a]pirimidinas trifluorometiladas foram obtidas em 5 minutos de reação com rendimentos de 61-98 %. A série de 2,4- difluorofenilpirazóis foi obtida, acidificando-se o meio de reação com APTS em 15 minutos de reação, e obtendo-se bons rendimentos (54-85 %) no processo. No caso dos pentafluorofenilpirazóis, foram necessárias duas etapas de reação: a primeira a síntese de 4,5-di-idropentafluorofenilpirazóis, e seguida de posterior reação de desidratação utilizando APTS em 15 minutos de reação, obtendo-se produtos com rendimentos de 54-81 %. Após a síntese desses compostos, os mesmos foram identificados por técnicas de RMN de 1H e 13C e de 19F, em alguns casos, espectrometria de massas e difratometria de raios-X. Em alguns casos, através de RMN, foi possível observar interações espaciais do tipo homo/heteronuclear envolvendo átomos de flúor, úteis na confirmação do isômero obtido. Em outra etapa deste trabalho foi desenvolvida a síntese de quatro moléculas mecanicamente entrelaçadas. Foram sintetizados dois [2]rotaxanos com grupamento éster no macrociclo, utilizando dois filamentos lineares (derivados da fumaramida de succinamida). Após a síntese desses [2]rotaxanos, foi realizada a reação de hidrólise dos grupamentos ésteres do macrociclo em grupamento ácidos. Essas macromoléculas foram sintetizadas visando à formação dos MOFs (Redes de metais orgânicas). A síntese desse composto foi realizada utilizando cobre (II) e o [2]rotaxano derivado da fumaramida. Esse produto foi identificado através de difratometria de Raios-X.

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Malavolta, Juliana Limana. "Síntese de Pirimidinas derivadas de 7,7,7-trialo-4-metoxi-6-oxo-4- heptenoatos de metila e bi-heterociclos trifluormetilados." Universidade Federal de Santa Maria, 2012. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10501.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
An efficient method to obtain pyrimidinones and pyrimidines trialomethylated from the cyclocondensation reaction of compounds of methyl 7,7,7-trihalo-4-methoxy-6-oxoheptenoate with urea and differents amidines providing the series of compounds pyrimidines and pyrimidinones trifluoromethylated and trichloromerthylated is reported.Some compounds of the series were selected and brought to reaction with hydrazine monohydrate obtaining the series of new 6-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-propanehydrazide, of which two were later brought to reaction with a series of β-alkoxyvinyltrifluoromethyl ketones giving the new series of bis-heterocyclic 4-[(5-(trifluoromethyl)-5-hydroxy-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl)-1-propan-1-one-3-yl]-6- (trifluoromethyl)pyrimidine compounds. The structures of all synthesized compounds were confirmed by 1H and 13C NMR data, and two-dimensional NMR techniques like HETCOR and COLOC, ans mass spectrometry data.
Este trabalho descreve um método eficiente para a obtenção de pirimidinonas e pirimidinas trialometiladas a partir da reação de ciclocondensação [3+3] dos compostos (7,7,7-trialo-4-metoxi-6-oxo-4-heptenoatos de metila com uréia e diferentes amidinas fornecendo a série de pirimidinas e pirimidinonas 6-trifluormetil substituídas e 6-triclorometil substituídas. Alguns compostos da série de pirimidinas trifluormetiladas foram selecionados e levados à reação com monohidrato de hidrazina obtendo-se a série de novas 6-trifluormetilpirimidina-4-propanohidrazida, das quais, duas posteriormente foram levadas à reação de ciclocondensação com uma série de β-alcoxivniltrifluormetil cetonas alquil e aril substituídas dando a nova série de compostos bi-heterocíclicos 4-[(5-(trifluormetil)-5-hidroxi-4,5-diidro-1H-pirazol-1-il)-1-propan-1-ona-3-il]-6-(trifluormetil)pirimidinas. As estruturas de todos os compostos sintetizados foram confirmadas por dados de RMN 1H, 13C e técnicas de RMN bidimensionais como HETCOR e COLOC, além de dados de espectrometria de massas.

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Pizzuti, Lucas. "Síntese de 4-(fur-2-il)- e 4-(tien-2-il)-pirimidinas a partir de β-Alcoxivinil trifluormetil cetonas". Universidade Federal de Santa Maria, 2005. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10401.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The cyclocondensation of the 1,1,1-trifluoro-4-methoxy-4-(2-heteroaryl)-3-buten-2-ones (heteroaryl = furyl and thienyl) with urea and amidines (acetamidine, benzamidine, guanidine, 1H-pyrazole-1-carboxamidine and 2-methyl-2-thiopseudourea) for synthesis of two 4-(2-heteroaryl)-6-trifluoromethylpyrimidinones and a series of ten 4-(2-heteroaryl)-6-trifluoromethylpyrimidines is reported. The reaction of the 1,1,1-trifluoro-4-methoxy-4-(2-heteroaryl)-3-buten-2-ones with urea was carried out in the presence of boron trifluoride etherate as a catalyst, at 50°C for 20 hours. The reactions of the same substracts with amidines were carried out in the presence of a 1 M solution of sodium hydroxide at r.t.-50°C for 1 hour. Under this conditions, only aromatic pyrimidines were obtained in 48-67%.
Este trabalho relata a síntese e isolamento de duas 4-(2-heteroaril)-6-trifluormetilpirimidinonas e uma série de dez 4-(2-heteroaril)-6-trifluormetilpirimidinas (heteroaril = furil e tienil), a partir da ciclocondensação de 1,1,1-trifluor-4-metoxi-4-(2-heteroaril)-3-buten-2-onas com uréia e amidinas (acetamidina, benzamidina, guanidina, 1Hpirazolil-1-carboxamidina e 2-metil-2-tiopseudouréia). A reação de 1,1,1-trifluor-4-metoxi-4-(2-heteroaril)-3-buten-2-onas com uréia ocorreu na presença de BF3.Et2O como catalisador, à 50°C por 20 horas. As reações dos mesmos substratos com amidinas ocorreu na presença de uma solução 1 M de NaOH à t.a.-50°C por 1 hora. Nestas condições, foram obtidas somente pirimidinas aromáticas com rendimentos entre 48-67%.

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Silva, Andreia Medianeira Pedrolo Weber da. "Síntese regiosseletiva de 4-trifluormetil-2-(metiltio)-3,4-diidropirimidin-4-óis 3,6-dissubstituídos com efeito inibitório enzimático." Universidade Federal de Santa Maria, 2012. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10536.

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This work reports a simple and versatile new strategy for the regiosselective synthesis of N3-substituted 6-alkyl(aryl or heteroaryl)-4-trifluoromethyl-2-(methylthio)-3,4-dihydropyrimidin-4-ols, which enabled to establish the regiochemistry of the cyclocondensation reaction between trifluoromethylated enones and N-substituted 2-methylisothioureas. The N3-substituted 6-alkyl(aryl or heteroaryl)-4-trifluoromethyl-2-(methylthio)-3,4-dihydropyrimidin-4-ols were obtained from the cyclocondensation reaction of 4-alkoxy-1,1,1-trifluoromethyl-3-alken-2-ones (enones) of general formula CF3C(O)CHCR(OCH3), where R = Me, Et, Pr, C6H5, 4-MeC6H4, 4-OMeC6H4, 4-FC6H4, 4-BrC6H4 and fur-2-yl, with different N-substituted 2-methylisothiourea sulfates of general formula [R1NHC(SCH3)NH]2.H2SO4, where R1 = Me, Et, Allyl and C6H5 in basic medium. The methodology used provided the synthesis of 18 novel dihydropyrimidinols in excellent yields (85-98%) and with high regioselectivity, because only the N3-substituted compounds were obtained. The inhibitory effect of the obtained products on the activity of the enzymes acetylcholinesterase, NTPDase and 5 -nucleotidase were evaluated, showing promising results, mainly for acetylcholinesterase. For this last study was carried out molecular modeling compound that showed a higher inhibitory effect on AChE.
Este trabalho apresenta uma nova estratégia simples e versátil para a síntese regiosseletiva de 6-alquil(aril ou heteroaril)-4-trifluormetil-2-(metiltio)-3,4-diidro pirimidin-4-óis N3-substituídos, a qual possibilitou a comprovação da regioquímica da reação de ciclocondensação entre enonas trifluormetiladas e 2-metilisotioureias N-substituídas. As 6-alquil(aril ou heteroaril)-4-trifluormetil-2-metiltio-3,4-diidropirimidin-4-óis N3-substituídos foram obtidos a partir da reação de ciclocondensação das 4-alcóxi-1,1,1-trifluormetil-3-alquen-2-onas (enonas) de fórmula geral CF3C(O)CHCR(OCH3), onde R= Me, Et, Pr, C6H5, 4-MeC6H4, 4-OMeC6H4, 4-FC6H4, 4-BrC6H4 e fur-2-il, com diferentes sulfatos de 2-metilisotioureias N-substituídas, de fórmula geral [R1NHC(SCH3)NH]2.H2SO4, onde R1= Me, Et, Alil e C6H5 em meio básico. A metodologia empregada proporcionou a síntese de 18 diidropirimidinóis inéditos em excelentes rendimentos (85-98%) e com alta regiosseletividade, pois apenas os compostos N3-substituídos foram obtidos. O efeito inibitório dos produtos obtidos sobre a atividade das enzimas acetilcolinesterase (AChE), NTPDases e 5 -nucleotidase foram avaliados, demonstrando resultados promissores, principalmente para a acetilcolinesterase. Para essa última foi realizado o estudo de modelagem molecular com composto que apresentou maior efeito inibitório sobre a AChE.

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Sūdžius, Jurgis. "Synthesis And Properties Of Pyrimidine Derivatives – Potent Carbonic Anhydrase Inhibitors." Doctoral thesis, Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), 2011. http://vddb.laba.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2011~D_20110519_082332-05105.

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The aim of the work was design of pyrimidine derivatives – potent carbonic anhydrase (CA) inhibitors. Theoretical investigation of interaction of 4-[N-(pyrimidin-4-yl)]aminobenzenesulfonamides containing substituents at 2-, 5- and 6- positions of pyrimidine ring with an active site of hCAs suggested that these compounds can fit into an active site of the enzymes and should interact with them as typical hCA inhibitors. Synthesis of target compounds was carried out by substitution of chloro group at 4,6-dichloropyrimidines containing cyano-, formyl- or nitro groups at position 5 of the pyrimidine ring with 4-aminobenzenesulfonamide. Regarding inhibition of hCAs with the synthesized compounds data acquired by the scientists of Institute of Biotechnology, structures of inhibitors were modified in order to improve their binding properties to hCA. It was performed by variation of a linker length between benzenesulfonamide and pyrimidine fragments and by introduction of new substituents at position 6 of the pyrimidine ring. In some cases these modifications led to the formation of new heterocyclic systems. For this purpose condensation of indoline-2-thiones with pyrimidine-5-carbaldehydes was investigated. It was determined that 4-[N-(pyrimidin-4-yl)amino](methyl-,ethyl-)benzenesulfonamides containing cyano-, formyl- or nitro groups at position 5 of the pyrimidine ring and benzylamino-, chloro-, methoxy- or oxo groups at position 6 of the pyrimidine ring inhibit hCA in... [to full text]
Šio darbo tikslas – pirimidino junginių – potencialių karboanhidrazių (CA) slopiklių –kūrimas. Teoriniai 4-[N-(pirimidin-4-il)]aminobenzensulfonamidų, turinčių pakaitus 2-, 5- ir 6-oje pirimidino žiedo padėtyje, sąveikos su aktyviuoju hCA centru tyrimai parodė, kad šie junginiai gali įsiterpti į aktyvųjį baltymo centrą ir su hCA turėtų sąveikauti kaip tipiški klasikiniai CA slopikliai. Tiksliniai 4-[N-(2,5,6-pakeisti pirimidin-4-il)amino]benzensulfonamidai sintetinti 4,6-dichlorpirimidinuose, 5-oje padėtyje turinčiuose cian-, formil- arba nitrogrupes, chloro atomą keičiant 4-aminobenzensulfonamidu. Bendradarbiaujant su Biotechnologijos instituto mokslininkais, kurie atliko hCA slopinimo susintetintais junginiais tyrimus, tobulintos šių junginių hCA slopinimo savybės. Slopiklių struktūros modifikuotos keičiant jungtuko tarp benzensulfonamido ir pirimidino fragmentų ilgį ir įvedant naujus pakaitus pirimidino žiede, kai kuriais atvejais taip sudarant naujas heterociklines sistemas. Šiuo tikslu ištirta pirimidin-5-karbaldehidų kondensacija su indolin-2-tionais. Nustatyta, kad 4-[N-(pirimidin-4-il)amino](metil-,etil-)benzensulfonamidai, 5-oje pirimidino žiedo padėtyje turintys cian-, formil- arba nitrogrupes, o 6-oje pirimidino žiedo padėtyje turintys benzilamino-, chlor-, metoksi- arba oksogrupes, yra nano- – mikromolinės eilės hCA slopikliai, galintys atrankiai slopinti hCAI, II ar XIII. Jų hCA slopinimo aktyvumą lemia sulfonamido grupės sąveika su katalitiniu cinko jonu ir... [toliau žr. visą tekstą]

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Azevedo, Ana Carolina de Almeida [UNIFESP]. "Avaliação do perfil de susceptibilidade a fluconazol e voriconazol frente a isolados de Candida spp. pelo método de disco-difusão." Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2005. http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/9094.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Introdução: Em 2004, o NCCLS padronizou a técnica de disco-difusão para ensaios com fluconazol. Este teste permite a análise de grande número de amostras com custo reduzido, resultado rápido e de fácil interpretação, não exigindo equipamento especial, sendo assim de grande utilidade em estudos de vigilância de resistência a fluconazol e voriconazol. Objetivos: 1) Avaliar a distribuição de espécies de Candida identificadas em diferentes materiais biológicos obtidos de pacientes hospitalizados. 2) Descrever o perfil de susceptibilidade pelo método de disco-difusão para as diferentes amostras de Candida spp. frente a fluconazol e voriconazol. 3) Avaliar a prevalência de isolados de Candida spp. resistentes a fluconazol. Material e Métodos: Foram incluídas todas as amostras de Candida spp. isoladas de diversos materiais biológicos, provenientes de dois hospitais terciários da cidade de São Paulo, entre janeiro de 1998 a dezembro de 2003. Após triagem de Candida albicans, utilizando-se meio cromogênico CHROMagar- Candida, os isolados de Candida não-albicans foram identificados por análise do perfil bioquímico pelo método comercial ID-32C, complementados por análise de microcultivo. O perfil de susceptibilidade das amostras frente a fluconazol e voriconazol foi realizado pelo método de disco-difusão, de acordo com a normatização do documento do NCCLS M44-A (2004). A determinação dos diâmetros dos halos inibitórios foi realizada utilizando de um sistema automatizado de leitura de placas para análise das imagens - BIOMIC. Resultados: Avaliou-se 4.625 isolados clínicos de Candida spp., incluindo 2.393 cepas de C. albicans (51,7%), 658 de C. tropicalis (14,2%), 503 de C. glabrata (11%), 495 de C. parapsilosis (10,8%), 292 de C. rugosa (6,3%), 195 de C. guilliermondii (4,2%), 53 de C. krusei (1,1%) e 36 de Candida spp. Na análise dos resultados qualitativos de susceptibilidade a fluconazol as amostras de C. albicans, C. parapsilosis e C. tropicalis apresentaram diâmetro dos halos inibitórios maiores, resultado este que sugere alta susceptibilidade destas cepas a fluconazol. Para os isolados de C. glabrata, C. krusei e C. rugosa os halos obtidos apresentaram menores diâmetros, dado compatível com susceptibilidade reduzida destas espécies a fluconazol. Em relação a voriconazol, os isolados de C. albicans, C. parapsilosis, C. glabrata e C. tropicalis apresentaram diâmetros dos halos inibitórios maiores. Para as amostras de C. krusei e C. rugosa, os halos apresentaram menor diâmetro em relação as espécies mais susceptíveis. Na análise dos resultados quantitativos de susceptibilidade a fluconazol as taxas de SDD/R para os isolados avaliados foram de 2,0 e 5,8%, respectivamente, sendo visto maior porcentagem de SDD/R com C. glabrata, C. krusei e C. rugosa. Com exceção das amostras de C. rugosa, todas as amostras testadas com voriconazol apresentaram valores de CIM90 ≤ 0,5μg/mL. Conclusão: 1. Em nosso estudo, das 4.625 espécies de Candida testadas, C. albicans foi a espécie prevalente em todos os fluídos biológicos avaliados. 2. Entre as leveduras de Candida não-albicans, as espécies mais freqüentes foram C. tropicalis, C. glabrata e C. parapsilosis em ambos os períodos avaliados. 3. Susceptibilidade dose-dependente (SDD) e resistência a fluconazol foram pouco freqüentes, ocorrendo em apenas 2,0 e 5,8% das amostras, respectivamente. As espécies com maior porcentagem de isolados SDD/R para fluconazol foram C. glabrata, C. krusei e C. rugosa. 4. Voriconazol apresentou melhor atividade in vitro comparado a fluconazol, mesmo em cepas fluconazol-resistentes. 5. Não houve aumento de resistência a fluconazol e voriconazol nas amostras de Candida spp. testadas ao longo do período avaliado.
Introduction: The disk diffusion for fluconazole and voriconazole recently standardized by the NCCLS M44-A is suitable to test a large number of samples.. Objectives: 1) Evaluate the distribution of Candida species identified in different biological materials obtained from hospitalized patients in 2 tertiary hospitals. 2) Describe the antifungal susceptibility profile of different Candida species by the disk diffusion technique, using fluconazole and voriconazole disks. 3) Assess the prevalence of fluconazole resistant Candida spp. isolates. Methods: All clinical samples of Candida species originated from various types of biological material, between January 1998 to December 2003 in 2 tertiary hospitals in São Paulo were evaluated in this study. After initial screening for Candida albicans in chromogenic medium CHROMagar® Candida, the samples of non-albicans Candida species were identified by analysis of their biochemical profiles in the commercial system ID 32C and supplemented with microcultive. In vitro susceptibility to fluconazole and voriconazole were evaluated by according to the NCCLS M44-A disk diffusion method that was determination of inhibition diameters was read and interpreted automatically by the BIOMIC® image-analysis plate reader system. Results: A total of 4,625 yeast isolates were tested, including the following species: 2,393 C. albicans (51,7%), 658 C. tropicalis (14,2%), 503 C. glabrata (11%), 495 C. parapsilosis (10,8%), 292 C. rugosa (6,3%), 195 C. guillermondii (4,2%), 53 C. krusei (1.1%) e 36 Candida spp. The analyses of the qualitative results of susceptility profile to fluconazole, C. albicans, C. parapsilosis and C. tropicalis showed large inhibition zones diameters, suggesting high susceptibility of these strains to this antifungal. Isolates of C. glabrata, C. rugosa and C. krusei exhibited smaller diameters, compatible with the reduced susceptibility of these species to fluconazole. Regarding voriconazole, the isolates of C. albicans, C. parapsilosis, C. tropicalis and C. glabrata showed large inhibition zones diameters. However, C. krusei and C. rugosa isolates generated smaller inhibition zones diameters than other species more susceptible. In the analyses of the quantitative results of susceptility profile to fluconazole, a percentage of SDD/R to the isolates evaluated were 2,0% and 5,8%, respectively. The species that exhibited the highest rate of DDS/R were C. glabrata, C. krusei and C. rugosa. Regarding voriconazole, the majority of all yeast isolates tested showed CIM90 ≤ 0,5 µg/mL, except the samples of C. rugosa. Conclusion: 1. Among 4,625 yeast cultures evaluated, C. albicans was the species with the greatest frequency in all biological materials evaluated. 2. Among non-albicans Candida species, C. tropicais, C. glabrata and C. parapsilosis were most frequently in both the period assess. 3. DDS/R were low frequency, occurring in 2,0% and 5,8% of the samples, respectively. The incidence of species judged as DDS/R to fluconazole was C. glabrata, C. krusei and C. rugosa. 4. Voriconazole exhibited better activity in vitro than fluconazole, even in isolates resistant-fluconazole. 5. The resistance of fluconazole and voriconazole did not increase in the isolates of Candida spp. during the evaluated period.
TEDE
BV UNIFESP: Teses e dissertações

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Obregon, Adriana Dornelles Carpes. "3-alcoxi-4-hidroxi pirrolidin-2-onas, 2-metilsulfanil pirimidina, enoilcarbamatos e 3-dialcoxi fosforiloxi trialometilados: síntese e potencial inibitório sobre a atividade da enzima acetilcolinesterase." Universidade Federal de Santa Maria, 2006. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4239.

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This work presents a study of the several organic compounds such as trihalomethylated enaminones, γ-amino alcohols, oxazinones, oxazines, dihydrofuranones, pyrrolidin-2-ones, 2-methylsulfanyl pyrimidine, enoylcarbamates and 3-dialkoxy phosphoryloxy on the acetylcholinesterase enzyme activity. Also, this work shows the effect per se of organic solvents on the AChE of different cerebral structures of rats. The N- and N-O-alkylated 3-alkoxy-5-hydroxy-trifluormethyl-pyrrolidin-2-ones and trifluoromethylated enoylcarbamates showed in vitro inhibitory effect of the AChE activity in the striatum cerebral of rat, at the concentration 1.0 mM. The dimethyl-[(2-methylsulfanyl-4-trichloromethyl-6-pyrimidin-ylmethoxy)-ethyl] amine showed significant inhibitory effect (p<0.001) in vitro on AChE activity of the striatum cerebral of rat, in the concentration 0.1mM. The in vivo effect of this pyrimidine was significant (p<0.001) in the concentration of 10mg/Kg in the AChE activity in striatum and erythrocyte of rat. Finally, the trifluoromethylated 3-diethoxy-phosphoryloxy ethyl carbamates show significant inhibitory effect (p<0.001) on the purified AChE activity at the concentration of 0.001 mM.
Este trabalho apresenta um estudo de várias classes de compostos orgânicos: enamino compostos, γ-aminoálcoois, oxazinonas, oxazinas, diidrofuranonas, pirrolidin-2-onas, 2-metilsulfanil pirimidina, enoilcarbamatos e 3-dialcoxi fosforiloxi trialometilados sobre a atividade da enzima acetilcolinesterase. Também demonstra o efeito per se de solventes orgânicos sobre a atividade da AChE em diferentes estruturas cerebrais de rato. As 3-alcoxi-5-hidroxi-5-trifluormetil pirrolidin-2-onas N-alquiladas e N-O-alquiladas e os enoilcarbamatos trifluormetilados mostraram efeito inibitório significativo (p<0,05) sobre a atividade in vitro da AChE de estriado cerebral de rato, na concentração de 1,0 mM. A dimetil-(2-metilsulfanil-4-triclorometil-6-pirimidinilme-toxi)etil] amina mostrou efeito inibitório significativo (p<0,001) sobre a atividade in vitro da AChE de estriado cerebral de rato na concentração de 0,1mM. O efeito in vivo dessa pirimidina foi significativo (p<0,001) na concentração de 10 mg/Kg sobre a atividade da AChE em estriado cerebral e membrana de eritrócitos de rato. Finalmente, as 3-dietoxi-fosforiloxi carbamatos de etila trifluormetilados mostraram efeito inibitório significativo (p<0.001) sobre a atividade da AChE purificada em concentrações a partir de 0.001 mM.

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Aquino, Estefania da Costa. "Aplicação de 5-bromo-1,1,1-trifluor-4-metoxipent-3-en-2-ona na síntese de pirróis, pirazóis, pirimidinas e 1,2,3-triazóis." Universidade Federal de Santa Maria, 2015. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4275.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
This thesis reports the synthesis of various series of trifluoromethyl substituted nitrogenated heterocycles, such as pyrroles, pyrazoles, pyrimidines and 1,2,3-triazoles, exploiting the synthetic versatility of 5-bromo-1,1,1-trifluoro-4-methoxypent-3-en-2-one in reactions with nitrogenated nucleophiles. In this way, synthesis of a novel series of 4-amino-3-trifluoromethyl-1H-N-substituted pyrroles was performed through two reaction steps. In the first stage is an addition reaction of primary or secondary amine in the 4-position of 5-bromo-1,1,1-trifluoro-4-methoxy-3-penten-2-one furnishing 4-amino-5-bromo-1,1,1-trifluoropent-3-en-2-one. The second stage is a nucleophilic substitution of the bromine by a primary amine followed by an intramolecular cyclocondensation reaction resulting in the formation of pyrroles with yields from 50 to 98%. Through the reaction of 5-bromo-1,1,1-trifluoro-4-methoxypent-3-en-2-one with sodium azide, 5-azido-1,1,1-trifluoro-4-methoxypent-3-en-2-one was obtained. This compound was subjected to cycloaddition reaction [3 + 2] with terminal alkynes, allowing the synthesis of a novel series of 1,1,1-trifluoro-4-methoxy-5-(4-alkyl/aryl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-pent-3-en-2-one (I) in good yields (74-90%). Through this reaction a wide range of bi-heterocycle compounds was obtained. For example, the reaction of compound I with 2-methylisothiourea sulfate gave a series of 4-(1H-1,2,3-triazol-1-yl)-methyl-6-trifluoromethyl pyrimidine (72-79%). In a second step, the SCH3 group of these pyrimidines was oxidized to SO2CH3 and subsequently substituted by primary and secondary amines to give a series of 2-aminopyrimidines derivatives in yields of 70-93%. Furthermore, the reaction with N1-substituted 2-methylisothiourea sulphates furnished two products: a 4-pyrimidinone and 1,4-dihydropyrimidine derivatives, depending on the reaction conditions employed. From the reaction of compound I with hydrazines and hydrazides a series of 4-[(4-alkyl/aryl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-5-hydroxy-5-trifluoromethyl-4,5-dihydro-1H-pyrazole, in yields of 77-90%, was obtained. The products obtained in this study were characterized by 1H- and 13C- NMR, mass spectrometry, high resolution mass spectrometry, elemental analysis, and X-ray diffraction. Keywords: 5-bromo-1,1,1-trifluoro-4-methoxypent-3-en-2-one, 5-bromo-4-enaminoketone, 4-amino-3-trifluoromethyl-1H-pyrroles N-substituted, 1,2,3-triazole, pyrimidine, pyrazolines, bi-heterocycles.
Esta tese apresenta a síntese de várias séries de heterociclos nitrogenados trifluormetil substituidos, tais como pirróis, pirazóis, pirimidinas e 1,2,3-triazóis, explorando-se a versatilidade sintética de 5-bromo-1,1,1-trifluor-4-metoxipent-3-en-2-ona em reações com nucleófilos nitrogenados. Dessa forma, a síntese de uma série inédita de 4-amino-3-trifluormetil-1H-pirróis N-substituídos foi realizada através de duas etapas reacionais. Na primeira etapa ocorre uma reação de adição de amina primária ou secundária na posição-4 da 5-bromo-1,1,1-trifluor-4-metoxipent-3-en-2-ona para a formação de 4-amino-5-bromo-1,1,1-trifluorpent-3-en-2-ona. Na segunda etapa ocorre a substituição nucleofílica do bromo por uma amina primária e consequente ciclocondensação intramolecular para a formação dos pirróis com rendimentos entre 50 a 98%. Através da reação da 5-bromo-1,1,1-trifluor-4-metoxipent-3-en-2-ona com azida de sódio, obteve-se a 5-azido-1,1,1-trifluor-4-metoxipent-3-en-2-ona, a qual, pela reação de cicloadição [3+2] com alcinos terminais possibilitou a síntese de uma série inédita de 1,1,1-trifluor-4-metóxi-5-(4-alquil/aril-1H-1,2,3-triazol-1-il)-pent-3-en-2-ona (I), com bons rendimentos (74-90%). Por intermédio destes compostos foi obtida uma vasta gama de bi-heterociclos. Por exemplo, a reação do composto I com sulfato de 2-metilisotioureias possibilitou a obtenção da série de 4-(1H-1,2,3-triazol-1-il)metil-6-trifluormetil pirimidinas (72-79%). Em uma segunda etapa, o grupamento SCH3 destas pirimidinas foi oxidado a SO2CH3 e, posteriormente substituído por aminas primárias e secundárias, obtendo-se, assim, uma série de 2-aminopirimidinas derivadas com rendimentos de 70-93%. Além disso, a reação com os sulfatos de 2-metilisotioureia N1-substituídos levou a obtenção de dois produtos: uma 4-pirimidinona e uma 1,4-diidropirimidina, dependendo da condição reacional empregada. A partir da reação do composto I com hidrazinas e hidrazidas proporcionou a obtenção de uma série de 4-[(4-alquil/aril-1H-1,2,3-triazol-1-il)metil]-5-hidróxi-5-trifluormetil-4,5-diidro-1H-pirazol com rendimentos de 77-90%. Os produtos obtidos neste trabalho foram caracterizados por Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio e Carbono-13, Espectrometria de Massas, Espectrometria de Massas de Alta Resolução, Análise Elementar e Difratometria de Raio-X.

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Berzosa, Rodríguez Xavier. "Diseño y síntesis de una quimioteca de sistemas 5,6-dihidropirido[2,3-d]pirimidin-7(8H)-ona no sustituidos en C4 como inhibidores potenciales de tirosina quinasas." Doctoral thesis, Universitat Ramon Llull, 2010. http://hdl.handle.net/10803/9299.

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Les Tirosina Cinases (TKs) són un grup de Proteïna Cinases claus en la senyalització cel·lular. Aquestes Cinases estan implicades, entre d'altres, en processos de creixement tumoral, fet que fa que la recerca d'inhibidors de TKs sigui una àrea d'investigació molt important en química mèdica.
En aquest context es desenvolupa el present treball en el qual es pretenen sintetitzar inhibidors potencials de Tirosina Cinases amb estructura 4-hidrogenpirido[2,3-d]pirimidínica. Molècules amb aquesta estructura han presentat elevada activitat com inhibidors de TKs pel que en primer lloc s'aborda la síntesis de la 6-(2,6-diclorofenil)-2-(4-(2-(dietilamino)etoxi)fenilamino)-8-metil-5,6-dihidropirido[2,3-d]pirimidin-7(8H)-ona. Aquest compost és anàleg a una de les estructures piridopirimidíniques que ha presentat millors resultats d'activitat inhibidora de TKs.
D'altra banda, es desenvolupa un nou procediment per a l'obtenció de sistemes 5,6 dihidropirido[2,3-d]pirimidínics 4-hidrogen substituïts basat en una addició de Michael inusual. S'utilitza com metilè actiu el 3,3-dimetoxipropionitril, no utilitzat prèviament en addicions d'aquest tipus. L'esmenta't nitril, per addició sobre un acrilat de metil 2-aril substituït rendeix èsters 4-cianopentanoics o 4-cianopentenoics en funció de la temperatura de reacció. La posterior reacció d'aquests adductes de Michael amb guanidines desemboca en els sistemes 6 aril-5,6 dihidropirido[2,3-d]pirimidínics 4-hidrogen substituïts desitjats.
Aprofitant l'experiència obtinguda amb el 3,3-dimetoxipropionitril es desenvolupa un procediment d'obtenció de pentanodioats substituïts per addició de Michael de 3,3 dimetoxipropionat de metil sobre èsters -insaturats. La posterior reacció d'aquests pentanodioats amb guanidina rendeix 3-(2-amino-1,6-dihidro-6-oxo-pirimidin-5-il)propanoats de metil que poden ser considerats com anàlegs de cadena oberta dels sistemes pirido[2,3-d]pirimídinics.
Las Tirosina Quinasas (TKs) son un grupo de Proteína Quinasas claves en la señalización celular. Dichas quinasas están implicadas, entre otros, en procesos de crecimiento tumoral, por lo que la búsqueda de inhibidores de TKs es un área de investigación muy importante en química médica.
En este contexto se desarrolla el presente trabajo en el que se pretenden sintetizar inhibidores potenciales de Tirosina Quinasas con estructura 4-hidrógenopirido[2,3-d]pirimidínica. Moléculas con dicha estructura han presentado elevada actividad como inhibidores de TKs por lo que en primer lugar se aborda la síntesis de la 6-(2,6-diclorofenil)-2-(4-(2-(dietilamino)etoxi)fenilamino)-8-metil-5,6-dihidropirido[2,3-d]pirimidin-7(8H)-ona. Dicho compuesto es análogo a una de las estructuras piridopirimidínicas que ha presentado mejores resultados de actividad inhibidora de TKs.
Por otro lado se desarrolla un nuevo procedimiento para la obtención de sistemas 5,6 dihidropirido[2,3-d]pirimidínicos 4-hidrógeno sustituidos basado en una adición de Michael inusual. Se utiliza como metileno activo el 3,3-dimetoxipropionitrilo, no usado previamente en adiciones de este tipo. Dicho nitrilo, por adición sobre un acrilato de metilo 2-aril sustituido rinde ésteres 4-cianopentanoicos o 4-cianopentenoicos en función de la temperatura de reacción. La posterior reacción de estos aductos de Michael con guanidinas desemboca en los sistemas 6 aril-5,6 dihidropirido[2,3-d]pirimidínicos 4-hidrógeno sustituidos deseados.
Aprovechando la experiencia obtenida con el 3,3-dimetoxipropionitrilo se desarrolla un procedimiento de obtención de pentanodioatos sustituidos por adición de Michael de 3,3 dimetoxipropionato de metilo sobre ésteres -insaturados. La posterior reacción de dichos pentanodioatos con guanidina rinde 3-(2-amino-1,6-dihidro-6-oxo-pirimidin-5-il)propanoatos de metilo que pueden ser considerados como análogos de cadena abierta de los sistemas pirido[2,3-d]pirimidínicos.
Tyrosine Kinases (TKs) are a group of Protein Kinases key in cell signaling. These kinases are involved in tumor growth processes, so the search for TK inhibitors is a very important research area in medicinal chemistry.
Present work is developed in this context, so the aim of the work is to synthesize potential inhibitors of TKs with a 4-unsubstituted pyrido[2,3-d]pyrimidinic structure. Molecules with this structure have presented high activity as TKs inhibitors. Therefore the synthesis of 6-(2,6-dichlorophenyl)-2-(4-(2-(diethylamino)ethoxy)phenylamino)-8-methyl-5,6-dihydropyrido[2,3-d] pyrimidin-7(8H)-one is addressed. This is an analogous compound to a one of the most active pyridopyrimidine systems described as TK inhibitors.
On the other hand, a new procedure for obtaining 4-unsubstituted 5,6 dihydropyrido[2,3-d]pyrimidinic systems is described. Such process is based on an unusual addition in which 3,3 dimethoxypropanenitrile is used as an active methylene compound. This compound had not previously been used in this kind of additions. The reaction of this nitrile with methyl 2-arylacrylates yields 4-cyanopentanoic esters or 4-cyanopentenoic esters depending on the reaction temperature. The subsequent reaction of these Michael adducts with guanidines leads to desired 4-unsubstituted 6-aryl-5,6-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidine systems.
Using the experience obtained with 3,3-dimethoxypropionitrile a procedure for obtaining new substituted alkyl pentanedioates by Michael addition of methyl 3,3 dimethoxypropionate on -unsaturated esters has been developed. The subsequent reaction with guanidine yields methyl 3-(2-amino-1,6-dihydro-6-oxo-pyrimidin-5-yl)propanoates that can be considered as open-chain analogues of pyrido[2,3-d]pyrimidines.

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Canelli, Tommaso. "Development of tandem C-H borylation/functionalization procedures for late stage functionalization of compounds." Master's thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2015. http://amslaurea.unibo.it/9273/.

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The development of procedures for the iridium catalyzed C-H borylation of 1-aryl pyrazolopyrimidines and 1-aryl indazoles is reported. Investigation on the activity of the catalyst revealed the combination of an iridium (I) precursor and tetramethylphenantroline as the best catalytic system. Moreover, the procedures are regioselective resulting in the selective borylation of different C-H bonds within the substrates. The application of C-H borylation to late stage functionalization is demonstrated: a biologically active compound in AstraZeneca's project underwent tandem borylation/oxidation reaction, in order to obtain a functionalized product containing an OH group.

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Calheiro, Tainara Paulus. "(Benzo[d]azolil)guanidinas: reações de ciclocondensação com trifluoracetil enol éteres na síntese de N-(pirimidinil)-1H-(benzo[d]azolil)aminas e N-derivados." Universidade Federal de Santa Maria, 2014. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10590.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The present research describes a simple and efficient procedure to synthesize a novel series of twenty N-(pyrimidinyl)-1H-(benzo[d]azolyl)amines, from the cyclocondensation reaction of (benzo[d]azolyl)guanidines with 4-alkoxy-4-alkyl(aryl/heteroaryl)-1,1,1-trifluoroalk-3-en-2-ones and 2,2,2-trifluor-1-(2-methoxycyclohexen-1-en-1-yl)ethanone. The (benzo[d]azolyl)guanidines precursors were further obtained from reactions of cyanoguanidine with o-phenylenediamine or 2-aminothiophenol and the trifluoromethylated vinyl ketones from trifluoroacetylation of enolethers or acetals. The reactions were optimized for water as solvent and when were carried out in under reflux for 1 24 h allowed to isolate the respective N-(pyrimidinyl)-1H-(benzo[d]azolyl)amines in 60 to 90 % yields.
O presente trabalho descreve um procedimento simples e eficiente para sintetizar uma nova série de 20 N-(pirimidinil)-1H-(benzo[d]azolil)aminas a partir de reações de ciclocondensação de (benzo[d]azolil)guanidinas com 4-alcóxi-4-alquil(aril/heteroaril)-1,1,1-trifluor-3-alquen-2-onas ou 2,2,2-triflúor-1-(2-metoxiciclohexen-1-en-1-il) etanona. As (benzo[d]azolil)guanidinas precursoras foram obtidas previamente a partir de reações de cianoguanidina com o-fenilenodiamina ou 2-aminotiofenol e as vinil cetonas trifluormetiladas a partir de reações de trifluoracetilação de enoléteres ou acetais. As reações de ciclocondensação foram otimizadas para o meio aquoso, sob refluxo e em tempos reacionais de 1 a 24 horas, levaram ao isolamento das respectivas N-(pirimidinil)-1H-(benzo[d]azolil)aminas em rendimentos de 60 90 %. Uma vez que as N-(pirimidinil)-1H-(benzo[d]azolil)aminas apresentaram uma baixa solubilidade na maioria dos solventes orgânicos, foram realizadas reações de N-alquilação com a finalidade estudar a reatividade e as mudanças nas suas propriedades físicas e espectroscópicas. Utilizou-se como agentes alquilantes iodometano, brometo de alila e brometo de benzila, os quais levaram a formação de novas heteroaril aminas terciárias N-alquiladas com rendimentos de 52 82 %. Finalmente, as estruturas dos compostos foram determinadas com o auxílio e aplicação simultânea de experimentos de RMN de 1H, 13C{1H}, em estados líquido e sólido, Espectrometria de Massas, Espectroscopia no Infravermelho, e a sua pureza comprovada por Análise Elementar ou por Espectrometria de Massas de Alta Resolução (HRMS).

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Albertí, Aguiló Francisca M. "Complejos con ligandos derivados de purinas y pirimidinas N-sustituidas e iones metálicos de transición: Contribución a la Química Bioinorgánica y a la Arquitectura Molecular." Doctoral thesis, Universitat de les Illes Balears, 2009. http://hdl.handle.net/10803/9459.

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Анотація:

El principal objetivo de la Tesis ha consistido en la síntesis y caracterización de ligandos derivados de purinas y pirimidinas N-sustituidas y el posterior estudio de su química de coordinación con iones metálicos de transición. Los resultados obtenidos pueden dividirse en tres apartados. En el primero se aborda la síntesis y caracterización de poli(2-pirimidil)poliazaalcanos y sus respectivos complejos de Ag(I), estudiando todas las estructuras cristalinas obtenidas por difracción de rayos X. El segundo bloque ha consistido en la preparación de adeninas N6-sustituidas y el posterior estudio de los compuestos de coordinación con Ru(III) y Cu(II). Por último, se evalua la actividad biológica de algunos de los compuestos preparados. En concreto, la actividad citoquinina in vivo e in vitro de las adeninas N6-sustituidas en plantas de Amaranthus caudatus. L. Asimismo, se ha estudiado la interacción de los complejos de Ru(III) preparados con ADN plasmídico pBR322

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Martins, Demétrius Bernardes. "Síntese de 2-[3h-pirazol-2-il]trifluormetilpirimidinas Alquil, aril e heteroaril substituidas." Universidade Federal de Santa Maria, 2004. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/10391.

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Анотація:

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
This work describes a general methodology for the synthesis of a novel series of 4-alkyl, 4-aryl, heteroaryl-2-[5-methyl-4-(2-hidroxyethyl)-3-oxo-1,2-dihydro-3H-pyrazol-2-yl]-6(4)-trifluoromethylpyrimidines. The precursors β-alkoxyvinyl trihalomethyl ketones of the general formula, F3C-C(O)-C(R2)=C(R)OR1, where R= H, CH3, i-Pr, Ph, 4-OCH3Ph, 2-C4H3O, 2-C4H3S, R1= CH3, C2H5 and R2 = H, CH3, R-R2= -(CH2)3-, were obtained from trifluoroacetylation reactions of enoleters and acetals derived from alkyl, cicloalkyl, methyl Ketones and 4-substituted acetophenones, propiophenones. And the precursor amidínico synthesized from 2-acetyl-butyrolactone with aminoguanidine bicarbonate in the presence of acetate of ammonium. The compounds objective of this study was obtained from the reaction of cyclocondensation reaction of 4-alkoxy-1,1,1-trifluoro-3-alken-2-ones with 1-amidino-4-(2-hydroxyethyl)-3-methyl-3-pyrazolin-5-one in the presence of anhydrous potassium carbonate. With yield of 35-80%. All the compounds 3H-pyzolil-pyrimidine were identified by 1H, 13C and 19F NMR spectra, IR, CG-MS and the purity of the compounds confirmed for it analyzes elemental.
Este trabalho descreve uma metodologia geral para síntese de uma série de novas 4-alquil-, 4-aril-, 4-heteroaril-2[5-metil-4-(2-hidroxietil)3-oxo-1,2-diidro-3H-pirazol-2-il]-6(4)-trifluormetilpirimidinas. Os precursores β-alcoxivinil trifluorometil cetonas de formula geral F3C-C(O)-C(R2)=C(R)OR1, onde R= H, CH3, i-Pr, Ph, 4-OCH3Ph, 2-C4H3O, 2-C4H3S, R1= CH3, C2H5 e R2 = H, CH3, R-R2= -(CH2)3- foram obtidas a partir de reações de trifluoracetilação de enoléteres e acetais derivados de alquil, cilcloalquil (heteroaril) metil cetonas, acetofenonas e propiofenonas 4-substituidas. E o precursor amidínico sintetizado a partir de 2-acetil-butirolactona reagindo com aminoguanidina bicarbonato na presença de acetato de amônio. Os compostos alvo deste estudo foram obtidos a partir da reação de ciclocondensação de 4-metoxi-4-alquil(aril)(heteroaril)-1,1,1-trifluor-3-alquen-2-onas frente a 5-metil-4-(2-hidroxietil)-3-oxo-1,2-diihidro-3H-2-amidinopirazol na presença de carbonato de potássio anidro, com rendimentos que variaram de 35 80%. Todos os compostos 3H-pizolil-pirimidina foram identificados por técnicas espectroscopicas de RMN (1H, 13C, 19F), IR, e CG-MS e a pureza dos compostos confirmada por analise elementar .

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Cabeza, Brasa María del Carmen. "Implicación de los polimorfismos de las enzimas del metabolismo de las pirimidinas en los trastornos metabólicos y morfológicos asociados a la infección por VIH-1 y al targa." Doctoral thesis, Universitat Autònoma de Barcelona, 2013. http://hdl.handle.net/10803/129130.

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ANTECEDENTES: Desde la introducción de los primeros fármacos antirretrovirales inhibidores de la transcriptasa inversa análogos timidínicos de los nucleótidos (ITINs) como AZT y d4T, el mayor problema ha sido tratar de evitar el desarrollo de efectos secundarios como los asociados a la toxicidad mitocondrial (lipodistrofia, neuropatía periférica o pancreatitis) HIPÓTESIS: Los polimorfismos de las enzimas de la vía de las pirimidinas, como la Timidilato Sintasa (TS), que se asocian con menor actividad enzimática, se relacionan a su vez con mayores concentraciones intracelulares de fármacos y por tanto con más riesgo de toxicidad mitocondrial y efectos secundarios. METODOLOGÍA: Estudio prospectivo no aleatorizado realizado en pacientes con infección por VIH-1 en tratamiento antirretroviral basado en inhibidores de la transcriptasa inversa análogos timidínicos (AZT y d4T). Estudio de casos y controles con pacientes VIH-1 que recibían d4T y habían desarrollado pancreatitis, neuropatía periférica o lipodistrofia. Se realizó un análisis multivariante en ambos casos. RESULTADOS: En el primer estudio, la concentración media en pacientes con y sin lipodistrofia fue de 20.60 fmol/l x106 cels y de 13.85 fmol/l x106cels (p= 0.013) respectivamente. Las dos variables independientes asociadas al desarrollo de lipodistrofia fueron la presencia de una condición definitoria de SIDA y los niveles intracelulares de d4T-TP. Los polimorfismos asociados a menor actividad de la TS se asociaron con concentraciones intracelulares de d4T-TP mayores (21.40 fmol/106 céls vs 11.50 fmol/106 céls; p<0.0001). En el segundo trabajo, en el análisis multivariante, los factores a asociados con menor probabilidad de aparición de la pancreatitis y de la neuropatía periférica fueron la cifra de CD4 nadir >200 céls/mm3 y la presencia de síndrome de lipodistrofia. El único factor asociado con mayor probabilidad de desarrollo de pancreatitis y/o neuropatía fue el genotipo de TS de baja expresión.
BACKGROUND: Since the introduction of the first nucleotide reverse transcriptase inhibitors thymidine analogues such as AZT and d4T (NRTIs), the major problem has been to try to avoid the development of side effects such as those associated with mitochondrial toxicity , lipodystrophy peripheral neuropathy or pancreatitis. HYPOTHESIS: Polymorphisms of the pyrimidine pathway enzymes, as Thymidylate Synthase (TS) which are associated with decreased enzymatic activity, are related to higher drug intracellular concentrations and therefore more risk of mitochondrial toxicity and side effects. METHODS: A prospective non-randomized study of patients with HIV-1 infection receiving d4T- based regimens. A case-control study of HIV-1 patients receiving d4T-based regimens who had developed pancreatitis, peripheral neuropathy or lipodystrophy. Multivariate analysis was performed in both cases. RESULTS: In the first study, the average concentration in patients with and without lipodystrophy was 20.60 fmol / l x106 cels and 13.85 fmol / l x106cels (p = 0.013) respectively. The two independent variables associated with the development of lipodystrophy were the presence of an AIDS-defining condition and the intracellular levels of d4T-TP. Polymorphisms associated with reduced activity of TS concentrations were associated with d4T-TP intracellular older (11.50 vs. 21.40 fmol/106 fmol/106 Cels, p <0.0001). In the second study, in multivariate analysis, the factors associated with lower probability of occurrence of pancreatitis and peripheral neuropathy were the nadir CD4 count> 200 cells/mm3 and the presence of lipodystrophy syndrome. The only factor associated with increased likelihood of developing pancreatitis and / or neuropathy was TS low expression genotype.

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Fiss, Gabriela Fehn. "Síntese de heterociclos via reações de ciclocondensação de a-etiloxalil e -pirazolil(alquil) b-dimetilaminoenonas com1,2- OU 1,3-Dinucleófilos." Universidade Federal de Santa Maria, 2009. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4175.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Chemoselective synthesis of ethyl 4-pirimidinecarboxylates and/or ethyl 5-pirimidineoxalates via cyclocondensation reaction of b-dimethylaminoenones [R1C(=O)C(=CNMe2)C(=O)CO2Et, where R1 = Ph, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4, 4-BrC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4-O2NC6H4, 2-thienyl, benzo[b]furan-2-yl and CF3] with NCN 1,3- dinucleophiles such as benzamidine hydrochloride or 1H-1-pyrazolyl-carboxamidine hydrochloride (50-86%); utilization of ethyl 4-pirimidinecarboxylates (when R1 = Ph, 4-MeOC6H4, 4-FC6H4 and 2-thienyl) in the cyclization reaction with hydrazine monohydrate, leading to 7,8-dihydropyrimido[4,5-d]pyridazin-8-ones (81-92%). In this work it was also studied the condensation reaction of (3,5-dimethyl-1H-1- pyrazolyl)alkylketones with N,N-dimethylformamide dimethylacetal, with the aim to obtain b-dimethylaminoenones [PhC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimethyl-1H-1-pyrazolyl), PhC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimethyl-1H-1-pyrazolylmethyl) and MeC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimethyl-1H-1-pyrazolyl)] (92-98%); and synthesis of 1,4 -biazoles via cyclocondensation reaction of b-dimethylaminoenones with different 1,2-dinucleophiles such as hydrazine monohydrate, terc-butylhydrazine hydrochloride,phenylhydrazine hydrochloride, carboxymethylhydrazine or hydroxylamine hydrochloride (50-80%). The X-ray diffraction technique was used in the elucidation of the stereochemistry of PhC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimethyl-1H-1-pyrazolylmethyl) and regiochemistry of the cyclocondensation reactions.
Síntese quimiosseletiva de 4-pirimidinocarboxilatos de etila e/ou 5-pirimidinoxalatos de etila via reação de ciclocondensação de b-dimetilaminoenonas [R1C(=O)C(=CNMe2)C(=O)CO2Et, onde R1 = Ph, 4-MeC6H4, 4-MeOC6H4, 4-BrC6H4, 4-ClC6H4, 4-FC6H4, 4-O2NC6H4, 2-tienil, benzo[b]furan-2-il e CF3] com 1,3-dinucleófilos do tipo NCN, tais como cloridrato de benzamidina ou cloridrato de 1H-1-pirazolil-carboxamidina (50-86%); utilização de 4-pirimidinocarboxilatos de etila (quando R1 = Ph, 4-MeOC6H4, 4-FC6H4 e 2-tienil) na reação de ciclização com monoidrato de hidrazina, levando a 7,8-diidropirimido[4,5-d]piridazin-8-onas (81- 92%). Neste trabalho, também foi estudada a reação de condensação de (3,5-dimetil-1H-1-pirazolil)alquilcetonas com N,N-dimetilformamida dimetilacetal, visando a obtenção de b-dimetilaminoenonas [PhC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimetil-1H-1-pirazolil), PhC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimetil-1H-1-pirazolilmetil) e MeC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimetil-1H-1-pirazolil)] (92-98%); e síntese de 1,4 -biazóis via reação de ciclocondensação de b-dimetilaminoenonas com diferentes 1,2-dinucleófilos, tais como monoidrato de hidrazina, cloridrato de terc-butilidrazina, cloridrato de fenilidrazina, carboximetilidrazina ou cloridrato de hidroxilamina (50- 80%). A técnica de difração de raios-X foi utilizada na elucidação da estereoquímica de PhC(=O)C(=CNMe2)(3,5-dimetil-1H-1-pirazolilmetil) e regioquímica das reações de ciclocondensação.

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Frigo, Leandro Marcon. "Obtenção de novos heterociclos derivados do ácido levulínico." Universidade Federal de Santa Maria, 2013. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4263.

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This study describes the attainment of twenty three (23) bis-heterocycles derived from the Levulinic Acid: Bis-Pyrazoles (6a-k) by the reaction of cyclecondensation between the 3-(5-(trifluoromethyl)-4,5-dihydro-1H-pyrazol-3-il)propanohidrazidamand a series of replaced β-alcoxiviniltrifluorometilcetonas. 1,3,4-oxadiazole 2-5-disubstituted (8-11) by reactions like [4 + 1] [OCNN+C], through the reactions of cyclecondensation between the 3-(5-(trifluoromethyl)-4,5-dihydro-1H-pyrazol-3-yl)propanohidrazida with different orthoesters as well as with carbon disulfide. It was also produced hydrazides (16c-d, g-h e 17c-d, g-h) derived of synthesized pyrimidines, to be used as precursorsn in the synthesis of bis-heterocycles, derivatizated of the reaction of those with some β- Ketones alcoxiviniltrifluormetil. The bis-heterocycles were obtained by the ordinary methodology, with efficiency between 61-97%.It was also gotten other original compounds (3i-k, 5), used as precursors in this study. The structure of these synthesized compounds were confirmed by the data of RMN 1H, 13C, besides the data of mass spectrometry.
Este trabalho descreve a obtenção de 23 novos bis-heterociclos derivados do Ácido Levulínico: Bis-Pirazóis (6a-k) a partir da reação de ciclocondensação entre o 3-(5-(trifluorometil)-4,5-dihidro-1H-pirazol-3-il)propanohidrazida e uma série de β-alcoxiviniltrifluorometilcetonas substituídas; 1,3,4-oxadiazóis 2-5-dissubstituídos (8-11) via reações do tipo [4 + 1] [OCNN+C], através de reações de ciclocondensação entre a 3-(5-(trifluorometil)-4,5-dihidro-1H-pirazol-3-il)propanohidrazida com diferentes ortoésteres, bem como com dissulfeto de carbono. Foram produzidas ainda, hidrazidas( 16c-d, g-h e 17c-d, g-h) derivadas de pirimidinas sintetizadas, para serem utilizadas como precursores na síntese de bis-heterociclos, derivatizados da reação destas com algumas β-alcoxiviniltrifluormetil cetonas. Os bis-heterociclos foram obtidos por metodologia convencional, com rendimentos entre 61-97%. Foram obtidos ainda outros compostos inéditos (3i-k, 5) utilizados como precursores nesse trabalho. As estruturas dos compostos sintetizados foram confirmadas por dados de RMN 1H, 13C, além de dados de espectrometria de massas.

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Juškėnas, Robertas. "Synthesis of tricyclic heterosystems based on pyrazolo[3,4-d]pyrimidine framework. Study of intramolecular reaction of pyrimidine nitrogen atom with O,O-acetals." Doctoral thesis, Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), 2014. http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2014~D_20140630_154044-28576.

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The development of heterocyclic chemistry is important for various science areas and for the industry. The main task of this branch of chemistry is the search for the new, more effective synthetic methods for obtaining heterocyclic derivatives. That covers not only the formation of heterocycles, but also their functionalization, which leads to the creation of compounds having various chemical and physical properties. The accomplishments of this area are applied in biochemistry, pharmacochemistry, photophysics and other branches of science and industry. The creation of effective heterocycles synthesis methods, that may be applied for the formation of heterosystems based on pyrazolo[3,4-d]pyrimidine was the main aim in this work. During this work, three hitherto unknown peri-fused heterocyclic systems based on pyrazolo[3,4-d]pyrimidine scaffold were synthesized. The suitable conditions for the cyclization of 4-(2,2-diethoxyethyl)aminopyrimidines to 2,3-dihydroimidazo[1,2-c]pyrimidines were found. The influence of functional groups in pyrimidine moiety for the course of this reaction was investigated. It has been shown that functional groups including alkylthio, cyano, amino, formyl are tolerated in this type of reaction. The method for the replacement of ethoxy group with benzyl mercaptan in 3-ethoxy-2,3-dihydroimidazo[1,2-c]pyrazolo[4,3-e]pyrimidines has been found.
Heterociklų chemijos vystymasis turi didelę reikšmę įvairioms mokslo sritims ir pramonės raidai. Pagrindinis šios chemijos srities uždavinys – kurti naujus heterociklinių junginių sintezės metodus, leidžiančius paprasčiau, efektyviau gauti norimos struktūros junginius. Tai apima ne tik heterociklų formavimo būdus, bet ir jų funkcionalizavimą, leidžiantį sukurti įvairiomis cheminėmis ir fizikinėmis savybėmis pasižyminčių junginių įvairovę. Šios mokslo srities pasiekimai pritaikomi biochemijoje, farmacijoje, fotofizikoje ir kitose mokslo ir pramonės šakose. Šiame darbe buvo siekiama sukurti efektyvius heterosistemų sintezės būdus, kuriuos galima pritaikyti pirazolo[3,4-d]pirimidino fragmentą turinčių heterociklų formavimui. Šio darbo metu buvo susintetintos trys iki šiol neaprašytos heterociklinės sistemos atliekant peri-kondensuotų heterosistemų sintezę iš 3-amino-4-chlor-1-metil-6-metiltio-1H-pirazolo[3,4-d]pirimidino. Surastos tinkamos sąlygos 4-(2,2-dietoksietilmino)pirimidinų ciklizacijai į 3-etoksi-2,3-dihidroimidazo[1,2-c]pirimidinus. Ištirta pirimidino žiede esančių pakaitų įtaka šiai reakcijai. Parodyta, kad ši reakcija yra suderinama su tokiomis funkcinėmis grupėmis, kaip alkiltio-, cian-, amino-, formilgrupės. Surastas metodas 3-etoksi-2,3-dihidroimidazo[1,2-c]pirazolo[4,3-e]pirimidinų etoksigrupės pakeitimui benziltiogrupe.

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Moresco, Rafael Noal. "Associação entre os níveis de D-dímero, produtos de degradação da fibrina/fibrinogênio (PDF) e troponina cardíaca T na investigação dos distúrbios tromboembólicos." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2005. http://hdl.handle.net/10183/5216.

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Armelin, Paulo Roberto Gabbai. "Modelagem molecular de derivados pirimidínicos e estudos de docking nas enzimas ciclooxigenase 1 e ciclooxigenase 2." Universidade Federal de São Carlos, 2010. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6975.

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Financiadora de Estudos e Projetos
In this research molecular docking was used to study enzime-ligand complexes of Cyclooxygenase 1 (COX-1) and Cyclooxygenase 2 (COX-2) with pyrimidine derivatives, aiming at understanding the possible mechanisms of action of these compounds and, thus, suggest modifications that could increase their specificity. The chosen ligands were a series of 25 substituted pyrimidines with known activity. The three-dimensional structures of these compounds were obtained by molecular modeling and that of the enzymes from the PDB and PDBSum under the codes 2OYE and 1CX2 for COX-1 and COX-2 respectively. The binding sites chosen for the docking studies were 20 Å around the crystallographic ligands IM8-700 (2OYE) and SC-558 (1CX2). In the COX-1 formed complexes the SO2Me moiety is positioned in such a way as to form hydrogen bonds with Ile517 and Phe518. The benzo[b]thiophen-2-ylmethyl-[2-(4-methanesulfonylphenyl)-6-trifluoromethylpyrimidin-4- yl]amine formed the most favorable complex with COX-1. In COX-2, the enzyme-ligand interaction pattern shows the SO2Me group in the side pocket, forming hydrogen bonds with His90 and Arg513 and the different substituent groups of the pyrimidine ring form hydrogen bonds with Arg120 and Tyr355. The presence of a small lipophilic pocket in COX-2 and the docking results suggest that the ligands 2, 15, 17, 22 and 23 may have their activity enhanced by the addition of a hydrophobic group on the phenyl or thiophenyl rings so this group can interact within this pocket. In both cases the mechanism of inhibition is probably competitive. As the search for new anti-inflammatory drugs must deal with a subtle balance of COX-2 and COX-1 inhibitions, the ligands 2 and 22 that showed better results for COX-2 rather than for COX-1 would be the most promising ones and therefore, those that should be tested in vivo.
Neste trabalho, o docking molecular foi utilizado para o estudo da formação de complexos alvoligante das enzimas Ciclooxigenase 1 (COX-1) e Ciclooxigenase 2 (COX-2) com derivados pirimidínicos, com a finalidade de entender os possíveis mecanismos de ação e, assim, propor modificações nos compostos visando diminuir prováveis efeitos colaterais. Os ligantes escolhidos foram uma série de 25 pirimidinas substituídas com atividade conhecida. As estruturas tridimensionais destas moléculas foram obtidas por modelagem molecular e as das enzimas dos bancos de dados PDB e PDBSum sob o código 2OYE e 1CX2 para COX-1 e COX- 2 respectivamente. Os sítios de ligação escolhidos para os cálculos de docking foram de 20 Å ao redor dos ligantes cristalográficos IM8-700 (2OYE) e SC-558 (1CX2). Das pirimidinas analisadas as que formaram complexo com a COX-1 se orientaram com a porção SO2Me formando ligações de hidrogênio com a Ile517 e Phe518. Sendo o benzo[b]tiofen-2-ilmetil-2-(4- metanosulfonilfenil)-6-trifluorometilpirimidina-4-il]amina o mais favorável para a formação de complexo com a COX-1. Para a COX-2, os compostos que se ligaram mostram um padrão que inclui ligações de hidrogênio entre a porção SO2Me e a His90 e Arg513 do bolso lateral e entre a Arg120 e Tyr355 com os grupos substituintes do anel pirimidínico. A presença de um pequeno bolso lipofílico na COX-2 e os resultados de docking permitem sugerir que os ligantes 2, 15, 17, 22 e 23 poderiam mostrar melhor atividade mediante a adição de um grupo hidrofóbico no anel fenila ou tiofenila para que este grupo se posicione dentro desse bolso. Em ambos os casos o tipo de inibição provável é o competitivo. Como a busca por novos fármacos antiinflamatórios deve lidar com um equilíbrio entre a inibição de COX-2 e COX-1, os ligantes 2 e 22 que apresentaram resultados favoráveis para a COX-2 e não tanto para a COX-1 seriam os mais promissores e, portanto, aqueles que poderiam ser testados in vivo.

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