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Добірка наукової літератури з теми "Nanospectroscopy"

Автор: Grafiati
Опубліковано: 7 липня 2024
Оновлено: 7 липня 2024

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Зміст

  1. Статті в журналах
  2. Дисертації
  3. Книги
  4. Частини книг
  5. Тези доповідей конференцій

Статті в журналах з теми "Nanospectroscopy":

1

Çulha, Mustafa. "Nanospectroscopy." Analytical and Bioanalytical Chemistry 407, no. 27 (October 5, 2015): 8175–76. http://dx.doi.org/10.1007/s00216-015-9033-3.

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2

HIDA, Akira, Yutaka MERA, and Koji MAEDA. "STM-Nanospectroscopy." Hyomen Kagaku 23, no. 4 (2002): 224–32. http://dx.doi.org/10.1380/jsssj.23.224.

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Ulrich, Georg, Emanuel Pfitzner, Arne Hoehl, Jung-Wei Liao, Olga Zadvorna, Guillaume Schweicher, Henning Sirringhaus, et al. "Thermoelectric nanospectroscopy for the imaging of molecular fingerprints." Nanophotonics 9, no. 14 (August 21, 2020): 4347–54. http://dx.doi.org/10.1515/nanoph-2020-0316.

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Анотація:
AbstractWe present a nanospectroscopic device platform allowing simple and spatially resolved thermoelectric detection of molecular fingerprints of soft materials. Our technique makes use of a locally generated thermal gradient converted into a thermoelectric photocurrent that is read out in the underlying device. The thermal gradient is generated by an illuminated atomic force microscope tip that localizes power absorption onto the sample surface. The detection principle is illustrated using a concept device that contains a nanostructured strip of polymethyl methacrylate (PMMA) defined by electron beam lithography. The platform’s capabilities are demonstrated through a comparison between the spectrum obtained by on-chip thermoelectric nanospectroscopy with a nano-FTIR spectrum recorded by scattering-type scanning near-field optical microscopy at the same position. The subwavelength spatial resolution is demonstrated by a spectral line scan across the edge of the PMMA layer.
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Suleymanov, Yury. "Single-molecule nanospectroscopy." Science 373, no. 6550 (July 1, 2021): 70.14–72. http://dx.doi.org/10.1126/science.373.6550.70-n.

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5

Heun, S., Th Schmidt, B. Ressel, E. Bauer, and K. C. Prince. "Nanospectroscopy at Elettra." Synchrotron Radiation News 12, no. 5 (September 1999): 25–29. http://dx.doi.org/10.1080/08940889908261030.

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Meixner, Alfred J. "Nanophotonics, nano-optics and nanospectroscopy." Beilstein Journal of Nanotechnology 2 (August 30, 2011): 499–500. http://dx.doi.org/10.3762/bjnano.2.53.

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7

Kawata, Satoshi. "Plasmonics for Nanoimaging and Nanospectroscopy." Applied Spectroscopy 67, no. 2 (February 2013): 117–25. http://dx.doi.org/10.1366/12-06861.

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Анотація:
The science of surface plasmon polaritons, known as “plasmonics,” is reviewed from the viewpoint of applied spectroscopy. In this discussion, noble metals are regarded as reservoirs of photons exhibiting the functions of photon confinement and field enhancement at metallic nanostructures. The functions of surface plasmons are described in detail with an historical overview, and the applications of plasmonics to a variety of industry and sciences are shown. The slow light effect of surface plasmons is also discussed for nanoimaging capability of the near-field optical microscopy and tip-enhanced Raman microscopy. The future issues of plasmonics are also shown, including metamaterials and the extension to the ultraviolet and terahertz regions.
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Osborne, Ian S. "A cool route to nanospectroscopy." Science 354, no. 6313 (November 10, 2016): 716.4–716. http://dx.doi.org/10.1126/science.354.6313.716-d.

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Lekkas, Ioannis, Mark D. Frogley, Timon Achtnich, and Gianfelice Cinque. "Rapidly frequency-tuneable, in-vacuum, and magnetic levitation chopper for fast modulation of infrared light." Review of Scientific Instruments 93, no. 8 (August 1, 2022): 085105. http://dx.doi.org/10.1063/5.0097279.

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Анотація:
We present an in-vacuum mechanical chopper running at high speed and integrated into a magnetic levitating motor for modulating optical beams up to 200 kHz. The compact chopper rotor allows fast acceleration (10 kHz s−1 as standard) for rapid tuning of the modulation frequency, while 1 mm diameter slots provide high optical throughput for larger infrared beams. The modulation performances are assessed using a reference visible laser and the high brightness, broadband, infrared (IR) beam of synchrotron radiation at the MIRIAM beamline B22 at Diamond Light Source, UK. For our application of IR nanospectroscopy, minimizing the temporal jitter on the modulated beam due to chopper manufacturing and control tolerances is essential to limit the noise level in measurements via lock-in detection, while high modulation frequencies are needed to achieve high spatial resolution in photothermal nanospectroscopy. When reaching the maximum chopping frequency of 200 kHz, the jitter was found to be 0.9% peak-to-peak. The described chopper now replaces the standard ball-bearing chopper in our synchrotron-based FTIR photothermal nanospectroscopy system, and we demonstrate improved spectroscopy results on a 200 nm thickness polymer film.
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Dery, Shahar, Suhong Kim, David Haddad, Albano Cossaro, Alberto Verdini, Luca Floreano, F. Dean Toste, and Elad Gross. "Identifying site-dependent reactivity in oxidation reactions on single Pt particles." Chemical Science 9, no. 31 (2018): 6523–31. http://dx.doi.org/10.1039/c8sc01956h.

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Статті в журналах

Дисертації з теми "Nanospectroscopy":

1

Zhang, D. "Quantitative fluorescence nanospectroscopy of nucleotide excision repair - from single molecules to cells." Enschede : University of Twente [Host], 2008. http://doc.utwente.nl/60257.

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Regmi, Raju. "Nanophotonic antennas for enhanced single-molecule fluorescence detection and nanospectroscopy in living cells membranes." Doctoral thesis, Universitat Politècnica de Catalunya, 2017. http://hdl.handle.net/10803/461707.

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Анотація:
Single-molecule fluorescence spectroscopy has revolutionized the field of biophysical sciences by enabling visualization of dynamic molecular interactions and nanoscopic features with high spatiotemporal resolution. Monitoring enzymatic reactions and studying diffusion dynamics of individual molecules (such as lipids and proteins) help us understand how these nanoscopic entities influence and control various biochemical processes. Nanophotonic antennas can efficiently localize electromagnetic radiation into nanoscale spatial dimensions comparable to single bio-molecules (<10 nm). These ultra-confined illumination hotspots thereby offer opportunity to follow single-molecule events at physiological expression levels. In this thesis, we explore various photonic nanoantenna platforms (double nanohole apertures, dimer nanogap antennas and planar "antenna-in-box'') and demonstrate their application in enhanced single-molecule fluorescence detection. Using fluorescence burst analysis, fluorescence correlation spectroscopy (FCS), time-correlated TCSPC measurements, and near field simulations, we quantify nanoantenna detection volumes, fluorescence enhancement factors and discuss the fluorescence photodynamic accelerations mediated by optical nanoantennas. An alternative to plasmonic structures, all-dielectric nanoantenna based on silicon nanogap is also demonstrated to enhance the fluorescence detection of single molecules diffusing in concentrated solutions. Further, using resonant planar "antenna-in-box'' devices we investigate the diffusion dynamics of phosphoethanolamine and sphingomyelin on the plasma membrane of living cells and discuss the results in the context of lipid rafts. Together with cholesterol depletion experiments, we provide evidence of cholesterol-induced nanodomain partitioning within less than 10 nm diameters and characteristic times being ~100 microseconds
La espectroscopia de fluorescencia de una sola molecula ha revolucionado el campo de las ciencias biofisicas, permitiendo la visualizacion de interacciones moleculares dinamicas y caracteristicas nanoscopicas con alta resolucion espaciotemporal. La monitorizacion de las reacciones enzimaticas y el analisis de la dinamica de difusion de moleculas individuales (como lipidos y proteinas) nos ayudan a comprender como estas entidades nanoscopicas influyen y controlan diversos procesos bioquimicos. Las antenas nanofotonicas pueden localizar eficientemente la radiacion electromagnetica en dimensiones espaciales en nanoescala, comparables a biomoleculas unicas (<10 nm). Estos hotspots de iluminacion ultra configurados ofrecen de este modo la oportunidad de monitorizar eventos de molecula unica a niveles de expresion fisiologica. En esta tesis, exploramos varias plataformas fotonicas de nanoantenas (double nanohole aperture, dimero nanogap antenas y "antenna-in-box" planares) y demostramos su aplicacion en la mejora de la deteccion una sola molecula de fluorescencia. Utilizando el analisis por explosion de fluorescencia, espectroscopia de correlacion de fluorescencia (FCS), medidas TCSPC correlacionadas en el tiempo y simulaciones de campo cercano, cuantificamos volumenes de deteccion de nanoantenas, factores de mejora de fluorescencia y discutimos las aceleraciones fotodinámicas de fluorescencia mediada por nanoantennas opticas. Las nanoantennas dielectricas basadas en nanogaps de silico se han propuesto como una alternativa en el realce de la deteccion de fluorescencia de difusion de moleculas unicas en soluciones concentradas. Ademas, utilizando dispositivos resonantes planares de "antenna-in-box", investigamos la dinamica de difusion de la fosfoetanolamina y la esfingomielina en la membrana plasmatica de las celulas vivas y discutimos los resultados en el contexto de las balsas lipidicas. Junto con experimentos de dismincion de colesterol, proporcionamos pruebas de division inducida por colesterol en el nanodominio dentro de diametros menors de 10 nm y con tiempos caracteristicos de ~100 microsegundos.
La spectroscopie de fluorescence d'une seule molécule a révolutionné le domaine des sciences biophysiques, permettant la visualisation d'interactions moléculaires dynamiques et de caractéristiques nanoscopiques à haute résolution spatio-temporelle. Le suivi des réactions enzymatiques et l'analyse de la dynamique de diffusion des molécules individuelles (telles que les lipides et les protéines) nous aident à comprendre comment ces entités nanoscopiques influencent et contrôlent divers processus biochimiques. Les antennes nanophotoniques peuvent localiser efficacement le rayonnement électromagnétique à des dimensions spatiales nanométriques, comparables à des biomolécules uniques (<10 nm). Ces hotspots d'éclairage ultra-configurés offrent la possibilité de surveiller les événements de molécules uniques à des niveaux d'expression physiologiques. Dans ce mémoire, nous examinons plusieurs plates-formes photoniques nanoantennas (nanotrou à double ouverture, I antennes Dimer nanoespace et plane « antenne-in-box ») et de démontrer son application dans l'amélioration de la détection d'une fluorescence seule molécule. Utilisation de l'analyse par spectroscopie de fluorescence d'explosion corrélation de fluorescence (FCS), les mesures TCSPC corrélées dans le temps et proches des simulations champ quantifier les volumes de détection de nanoantennas, les facteurs d'amélioration fluorescence et discuter des accélérations photodynamiques fluorescence médiée nanoantennas opticas. Des nanoantennas diélectriques à base de nanogap silico ont été proposées comme alternative dans l'amélioration de la détection par fluorescence de la diffusion de molécules uniques dans des solutions concentrées. En outre, l'utilisation de "plan d'antenne-in-box" dispositifs de résonance, nous étudions la dynamique de diffusion de phosphoéthanolamine et sphingomyéline dans la membrane plasmique des cellules vivantes et de discuter des résultats dans le contexte des radeaux lipidiques. Conjointement avec des expériences de réduction du cholestérol, nous fournissons des tests de division induits par le cholestérol dans le nanodomaine dans des diamètres plus petits de 10 nm et avec des temps caractéristiques de ~ 100 microsecondes.
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Regmi, Raju. "Nanophotonic antennas for enhanced single-molecule fluorescence detection and nanospectroscopy in living cell membranes." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0523/document.

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Анотація:
La spectroscopie de fluorescence de molécule individuelle a révolutionné le domaine des sciences biophysiques, en permettant la visualisation des interactions moléculaires dynamiques et des caractéristiques nanoscopiques avec une haute résolution spatio-temporelle. Le contrôle des réactions enzymatiques et l'étude de la dynamique de diffusion de molécules individuelles permet de comprendre l'influence et le contrôle de ces entités nanoscopiques sur plusieurs processus biophysiques. La nanophotonique basée sur la plasmonique offre des nouvelles opportunités de suivi d'évènements à molécule unique, puisque il est possible de confiner des champs électromagnétiques dans les hotspots à nano-échelle, à dimensions spatiales comparables à une molécule unique. Dans ce projet de thèse, nous explorons plusieurs plateformes de nanoantennas photoniques avec des hotspots, et nous avons démontré les applications dans l'amélioration de la spectroscopie de fluorescence de molécule individuelle. En utilisant la fluorescence burst analysis, l'analyse de fluctuations temporelle de fluorescence,TCSPC, nous quantifions les facteurs d'amélioration de fluorescence, les volumes de détection de nanoantennas; ainsi, nous discutons l'accélération de fluorescence photo dynamique. En alternative aux structures plasmoniques, des antennes diélectriques basées sur les dimères en silicone ont aussi démontré d'améliorer la détection de fluorescence à molécule unique, pour des concentrations micro molaires physiologiquement pertinentes. En outre, nous explorons des systèmes planaires antennas in box pour l'investigation de la dynamique de diffusion de la PE et de la SM dans les membranes des cellules vivantes
Single-molecule fluorescence spectroscopy has revolutionized the field of biophysical sciences by enabling visualization of dynamic molecular interactions and nanoscopic features with high spatiotemporal resolution. Monitoring enzymatic reactions and studying diffusion dynamics of individual molecules help us understand how these nanoscopic entities influence and control various biochemical processes. Nanophotonic antennas can efficiently localize electromagnetic radiation into nanoscale spatial dimensions comparable to single bio-molecules. These confined illumination hotspots there by offer the opportunity to follow single-molecule events at physiological expression levels. In this thesis, we explore various photonic nanoantenna platforms and demonstrate their application in enhanced single-molecule fluorescence detection. Using fluorescence burst analysis, fluorescence correlation spectroscopy (FCS), time-correlated TCSPC measurements, and near field simulations, we quantify nanoantenna detection volumes, fluorescence enhancement factors and discuss the fluorescence photodynamic accelerations mediated by optical antennas. Further, using resonant planar antenna-in-box devices we investigate the diffusion dynamics of phosphoethanolamine and sphingomyelin on the plasma membrane of living cells and discuss the results in the context of lipid rafts. Together with cholesterol depletion experiments, we provide evidence of cholesterol-induced nanodomain partitioning within less than 10~nm diameters and characteristic times being ~100 microseconds
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Petay, Margaux. "Multimodal and multiscale analysis of complex biomaterials : optimization and constraints of infrared nanospectroscopy measurements." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2023. http://www.theses.fr/2023UPASF092.

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Анотація:
Dans le domaine du biomédical, l'étude des changements physico-chimiques induits par une pathologie au sein des tissus, à l'échelle cellulaire, peut être cruciale pour élucider les mécanismes à l'origine de ce phénomène. Toutefois, seules quelques techniques d'analyse permettent une description chimique à cette échelle. La nanospectroscopie infrarouge, en particulier l'AFM-IR (Microscopie à Force Atomique-Infrarouge) est prometteuse en permettant une description chimique des matériaux à l'échelle nanométrique. Actuellement, l'AFM-IR est souvent utilisée pour l'étude des cellules et micro-organismes, mais très peu pour l'étude des tissus biologiques en raison de la complexité de ces derniers. Pourtant, de nombreuses applications pourraient bénéficier d'une telle description, comme l'étude des phénomènes de minéralisation dans les tissus mammaires. Les microcalcifications mammaires (MCMs) sont des dépôts calciques anormaux (oxalates ou phosphates de calcium) et dont la composition est, dans la littérature, présumée associée à la nature des lésions : cancéreuses ou non. Malgré la multiplication des recherches sur le sujet au cours des dix dernières années, les processus de formation de ces MCMs et leur lien avec les pathologies et notamment les cancers du sein restent mal compris. Dans ce contexte, une description chimique des MCMs à l'échelle nanométrique pourrait fournir un nouvel éclairage et aider à la compréhension de leur genèse. Les biopsies mammaires (typiquement quelques millimètres à quelques centimètres) contiennent généralement plusieurs MCMs avec une forte dispersion en taille, de quelques centaines de nanomètres à un millimètre. Une stratégie de caractérisation multi-échelle est donc nécessaire pour décrire chimiquement l'entièreté de l'échantillon mais également accéder à une description fine des MCMs. Une approche multimodale et multi-échelle a ainsi été mise en place. Celle-ci permet d'étudier les propriétés morphologiques des MCMs en utilisant la microscopie électronique à balayage, ainsi que leurs propriétés chimiques à l'échelle micrométrique et nanométrique grâce à la microscopie et nanospectroscopie IR (e.g., AFM-IR). Bien que l'étude d'objets inorganiques et cristallins au sein d'une matrice organique par AFM-IR soit complexe, en raison des fortes variations locales des propriétés optiques et mécaniques au sein de ces matériaux hybrides, nous avons réussi à caractériser par AFM-IR des dépôts calciques au sein de tissus biologiques. La mise en œuvre d'une telle approche comporte plusieurs défis, tant d'un point de vue méthodologique qu'expérimental, notamment pour la préparation des échantillons, au cours des mesures, du traitement et de la gestion des données générées, ainsi que de leur interprétation. Tous ces aspects seront détaillés et des solutions proposées illustrant ainsi les capacités de l'AFM-IR pour l'étude des biomatériaux complexes
In the biomedical field, understanding the physicochemical changes at the cellular level in tissues can be crucial for unraveling the mechanisms of pathological phenomena. However, the number of techniques providing chemical descriptions at the cellular/molecular level is limited. Infrared (IR) nanospectroscopy techniques, particularly AFM-IR (Atomic Force Microscopy-infrared), are promising as they offer materials' chemical descriptions at the nanometer scale. Up to now, AFM-IR is mainly used in biology for studying individual cells or micro-organisms, but its direct application in biological tissues is relatively scarce due to tissue sections' complex nature. Yet, many applications could benefit from such description, such as mineralization phenomena in breast tissue. Breast microcalcifications (BMCs) are calcium-based deposits (such as calcium oxalate and calcium phosphate) hypothesized to be associated with some breast pathologies, including cancer. Despite increased research over the past decade, BMCs' formation process and connection with breast conditions remain poorly understood. Still, BMCs nanoscale chemical speciation might offer new insights into their chemical architecture. However, breast biopsies typically range from a few millimeters to a few centimeters, containing many BMCs ranging from hundreds of nanometers to a millimeter. Thus, a breast biopsy multiscale characterization strategy is required to provide both a global chemical description of the sample and a fine chemical description of BMCs. We, thus, propose a new multimodal and multiscale approach to investigate BMCs' morphological properties using scanning electron microscopy and their chemical composition at the microscale using IR spectromicroscopy, extending up to the nanometer scale thanks to AFM-IR analysis. Although AFM-IR measurements of inorganic and crystalline objects can be challenging due to their specific optical and mechanical properties, we demonstrate AFM-IR capabilities to characterize pathological deposits directly in biological tissues. Furthermore, implementing a multimodal and multiscale methodology comes with significant challenges in terms of sample preparation, measurements, data processing, and data management, as well as their interpretation: challenges which will be outlined and addressed
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Lang, Denny [Verfasser], Thomas [Gutachter] Taubner, Manfred [Akademischer Betreuer] Helm, and Manfred [Gutachter] Helm. "Infrared nanospectroscopy at cryogenic temperatures and on semiconductor nanowires / Denny Lang ; Gutachter: Thomas Taubner, Manfred Helm ; Betreuer: Manfred Helm." Dresden : Technische Universität Dresden, 2019. http://d-nb.info/1226942830/34.

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Kemel, Kamilia. "Mécanismes de passage transcutané : étude des interactions nanoparticules / peau." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS075.

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Анотація:
De nombreux systèmes nanoparticulaires ont été développés pour modifier la délivrance de molécules par la voie cutanée. Dans ce travail de thèse, nous nous sommes intéressés aux nanoparticules lipidiques type Janus (JNP), une forme galénique innovante caractérisée par la combinaison de deux compartiments, de polarité chimique opposée, un compartiment aqueux accolé à un compartiment lipidique. L’objectif principal a été la caractérisation des JNP. La spectroscopie ATR-FTIR a permis de mettre au point un descripteur IR permettant de suivre la stabilité physique des JNP à l’air libre et en fonction du temps. Le même descripteur a permis de suivre leur devenir à la surface de la peau, et de constater une pénétration significative à partir de 3 heures d’application. Nous avons prouvé que l’AFM-IR est une technique prometteuse pour étudier la nanostructure de la peau. De plus, elle a permis de montrer qu’après 24 heures d’application, les JNP se sont accumulées dans les premières couches du SC avec un gradient dans les couches plus profondes du SC. En revanche, il n’a pas été possible de déterminer si elles ont pénétré à l’état intact ou dégradé. Les JNP semblent avoir une influence sur la pénétration cutanée de l’acide hyaluronique, elles ont permis une augmentation significative de son flux de pénétration. La caractérisation de la phase lipophile des JNP par différentes techniques (LC-MS, DLS, Cryo-TEM, diffraction des rayons X…) a permis de mieux comprendre leur instabilité aux températures élevées (32°C - 43°C)
Many nanocarriers have been developed to improve the delivery of molecules into the skin. In this PhD thesis, we are interested in lipid-based Janus nanoparticles (JNP), an innovative galenic form characterized by the combination of two compartments of opposite chemical polarity, an aqueous compartment associated to a lipid compartment. The main aim was the characterization of JNP. ATR-FTIR spectroscopy allowed to identify an infrared descriptor to follow the physical stability of JNP in open air and over time. The same descriptor allowed to follow their behavior on the surface of the skin, and to note a significant penetration from 3 hours of application. AFM-IR has been shown to be a promising technique for studying the nanostructure of the human skin. In addition, it has shown that after 24 hours of application, JNP were accumulated in the first layers of the SC with a gradient in the deeper layers of the SC. However, it was not possible to conclude if they have penetrated in the intact or degraded form. JNP seem to have an influence on the cutaneous penetration of the hyaluronic acid, they allowed a significant increase of its penetration flux. The characterization of the lipophilic phase of JNP by different techniques (LC-MS, DLS, Cryo-TEM, X-ray diffraction...) allowed to better understand their instability at high temperatures (32°C - 43°C)
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Milhiet, Elodie. "Nanospectroscopie de molécules d’intérêt biologique." Paris 11, 2007. http://www.theses.fr/2007PA112150.

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Анотація:
La spectroscopie de molécule unique joue aujourd’hui un rôle majeur dans de nombreux domaines allant de la physique fondamentale à la biologie. Dans ce contexte, mes travaux ont conduit au développement théorique et instrumental de deux méthodes d’investigation orientées vers la biologie. La première visait à caractériser la dynamique de complexation du calcium par la sonde calcique fluorescente Oregon Green Bapta5N communément employée pour l’analyse des signaux intracellulaires. Pour y parvenir, nous avons développé un dispositif expérimental de spectroscopie de corrélation de fluorescence à un et deux photons présentant une sensibilité proche de la molécule unique. Grace à ce dernier, nous avons pu étudier plusieurs aspects de la photophysique de la sonde et avons évalué ses limites ainsi que l’intérêt de l’appliquer in vivo. La seconde a consisté à développer une technique d’Hybridation In-Situ de Fluorescence (FISH) semi-quantitative afin de cartographier l’expression de gènes dans le cerveau de drosophiles adultes. Nous avons surmonté deux difficultés majeures, en obtenant, pour la première fois, des résultats reproductibles et semi-quantitatifs chez la drosophile adulte. Je présente ici une nouvelle approche où l’amplification enzymatique a été remplacée par une détection optimisée et un protocole réduisant l’impact de l’autofluorescence. Des résultats sur divers gènes exprimés dans le cerveau des drosophiles adultes y sont exposés au même titre qu’une étude visant à mieux comprendre une pathologie de retard mental. Pour conclure, j’ai mis en évidence la capacité de notre technique à résoudre des sondes uniques ce qui ouvre la voie vers de nouvelles applications
Single-molecule-like spectroscopy plays a major role in many domains, from fundamental physics to biology. In this framework, my dissertation focuses on instrumental and theoretical developments of two biological-related applications. The first experiment aims at characterizing the dynamics of calcium binding by the fluorescent calcium probe Oregon-green Bapta5N commonly employed in cell signaling analysis. To achieve it, I have developed an experimental set-up of fluorescence correlation spectroscopy that exhibits sensitivity close to that of single-molecule detection. Either monophotonic or biphotonic excitations can be used. I have investigated the several aspects of the photophysics of the probe and evaluated the interest and limitations of such an approach for future in-vivo measurements. The second one is devoted to the development of a semi-quantitative Fluorescent In-Situ Hybridization (FISH) technique for mapping gene expression in the adult drosophila brain. Two difficulties have to be solved. First, we succeeded in obtaining reproducible results with drosophila adult brain. Secondly, while most of the FISH protocols are not quantitative since they need a strong enzymatic, we achieved semi-quantitative detection of RNA probes. I will present results on a new approach for which enzymatic detection is replaced by a sensitive detection and a protocol which reduces autofluorescence contribution. Results will be presented for several genes in adult drosophila brain to validate the methods as well as an interesting application on a mental retardation disease. To conclude, I show that the method exhibits a single RNA sensitivity which opens the way to new applications
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Mathurin, Jérémie. "Nanospectroscopie infrarouge avancée : développements instrumentaux et applications." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS188/document.

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Depuis une dizaine d’années, les technologies de champ proche appliquées à la spectroscopie infrarouge ont connu de rapides progrès permettant d’atteindre maintenant l’échelle du nanomètre. Dans le cadre de ma thèse, l’une de ces techniques, appelées AFM-IR et qui consiste à un couplage entre la microscopie à force atomique (AFM) et un laser accordable dans le domaine de l’infrarouge, va être présenté plus en détail.Le but de ma thèse va être de présenter les différents développements qui ont eu lieu dans le domaine de cette technique, comme l’AFM-IR en résonance forcée, l’AFM-IR en mode tapping ou les débuts du développement de l’AFM-IR avec des sources spectralement continues. Ces développements majeurs ont eu pour conséquence de populariser la technique et de voir une rapide augmentation du nombre d’utilisateurs. Cependant l’AFM-IR reste une technique récente et non triviale à maitriser, car elle demande à la fois des connaissances en AFM, mais aussi en spectroscopie infrarouge.Les dernières avancées technologiques ont permis de s’approcher de la résolution nanométrique. Les conséquences sont multiples et notamment cela permet d’ouvrir la technique à de nouveaux champs d’applications. Or qui dit nouveaux domaines dit nouvelles problématiques, mais surtout nouveaux challenges expérimentaux. Il est donc important d’identifier les verrous technologiques et limitations associés à ces développements pour garder un esprit critique sur ce qui peut être ou non obtenu en AFM-IR et éviter des erreurs d’interprétation et/ou d’analyse qui pourraient avoir des conséquences néfastes dans les champs d’applications étudiés
For 10 years, near-field technologies applied to infrared spectroscopy have reached milestones and now are able to make analysis at nanoscale. In my PhD thesis, I will focus on one of these techniques: the so-called AFM-IR technique which combined an atomic force microscope (AFM) with a pulse laser tunable in the infrared spectral range.The main goal of my PhD thesis will be to present the last developments which appears for this technique such as resonance enhanced AFM-IR, tapping mode AFM-IR or the first measurements of AFM-IR with broadband sources. These developments are major in the field of the technique and have led to high increase of the numbers of users. However, AFM-IR remains a recent and complicated technique where user has to master in the same time atomic force microscopy and infrared spectroscopy.The last technological developments allow measurements at the nanoscale. This has multiple consequences, especially it opens new applications fields. It also generates new problematic and new experimental challenges. As a consequence, it is necessary to understand new technological limitations created by these new developments in order to stay critical of the results obtained with an AFM-IR measurement and avoid analysis and interpretation errors which can have bad consequences on the different fields of study
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Ballout, Fouad [Verfasser], Martina [Akademischer Betreuer] Havenith, and Daniel [Akademischer Betreuer] Hägele. "Vibrational nanospectroscopic imaging / Fouad Ballout. Gutachter: Martina Havenith ; Daniel Hägele." Bochum : Ruhr-Universität Bochum, 2016. http://d-nb.info/1095884816/34.

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Partouche, David. "Analyse de l’assemblage de peptides amyloïdes bactériens." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLX084/document.

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Hfq est une protéine bactérienne qui a un rôle pleiotropique. La principale fonction de la protéine Hfq bactérienne consiste à répondre aux stress que peut rencontrer la bactérie lors d’un changement environnemental, en utilisant essentiellement un contrôle post-transcriptionnel. La protéine, par sa capacité à interagir avec les ARN et notamment les petits ARN non codant, permet ainsi une régulation rapide de l’expression génétique. En outre la protéine interagit aussi avec l’ADN qu’elle aide à se structurer. Les mutations dans le gène qui code pour Hfq ont des effets pleïotropes (déterminant plusieurs caractères phénotypiques).D’un point de vue structural, la protéine adopte un repliement de type Sm, caractérisé par un oligomère toroïdal reposant sur la formation d’un feuillet β continu à 30 brins. Cependant, outre cette région Sm N-terminale, Hfq possède également une région C-terminale (CTR) de taille et de séquence variables selon les bactéries. Mon travail de thèse a porté sur l’analyse de cette région CTR chez la bactérie Escherichia coli. Cette région a en effet la capacité de former une structure de type amyloïde : structures auto-assemblées in vivo, à proximité de la membrane interne et dans le nucléoïde.Par l’utilisation de diverses techniques physico-chimiques (microscopie moléculaire, spectroscopie et microscopie infrarouge, dichroïsme circulaire et diffusion aux petits angles), mon travail a consisté à caractériser l’assemblage de cette région de Hfq ainsi que les facteurs l’influençant en particulier la présence d’acide nucléique. Une partie de mon travail de thèse a aussi consisté à mettre en place une méthode d’imagerie corrélative innovante permettant d’analyser la signature chimique et morphologique d’une fibre amyloïde unique. Mon travail a enfin porté sur l’analyse de l’effet de composés inhibant l’agrégation de la structure amyloïde, ce qui pourrait constituer une piste pour développer une nouvelle classe d’antibiotiques
Hfq is a pleiotropic bacterial protein that determines several phenotypic characteristics. Its main function is to facilitate responses to stresses that bacteria may encounter during environmental changes, mainly by using post-transcriptional genetic control. The protein, by its capacity to interact with RNA, in particular small non-coding RNA, enables a rapid regulation of gene expression. In addition, the protein also interacts with DNA and compacts it. From a structural point of view, the protein adopts an Sm-like fold, characterized by a toroidal oligomer formed by a continuous 30-stranded β-sheet. Besides its conserved N-terminal Sm domain, Hfq also possesses a C-terminal region (CTR) that can vary in size and sequence between bacteria. My PhD work focused on the analysis of this CTR region in Escherichia coli bacteria. Indeed, this region has the capacity to form an amyloid structure. This structural dynamic is related to the formation of self-assembled structures in vivo, in the proximity of the inner membrane and in the nucleoid.Using various physicochemical techniques (molecular microscopy, spectroscopy and infrared microscopy, circular dichroism and small angle X-ray scattering), my work consisted in characterizing the assembly of this region of Hfq, as well as the factors influencing its assembly (in particular, the presence of nucleic acids). A part of my work consisted in setting up an innovative correlative–imaging method to analyze the chemical and morphological signature of a single amyloid fibre. Finally, my work focused on the analysis of the effect of compounds that inhibit the aggregation of the amyloid structure, which could constitute a new way to develop a novel class of antibiotics

Книги з теми "Nanospectroscopy":

1

Dhara, Sandip, Deep Jariwala, and Soumen Das. Nanoscopy and Nanospectroscopy. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323.

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2

Jariwala, Deep, Soumen Das, and Sandip Dhara. Nanoscopy and Nanospectroscopy. Taylor & Francis Group, 2023.

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3

Jariwala, Deep, Soumen Das, and Sandip Dhara. Nanoscopy and Nanospectroscopy. Taylor & Francis Group, 2023.

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4

Jariwala, Deep, Soumen Das, and Sandip Dhara. Nanoscopy and Nanospectroscopy. Taylor & Francis Group, 2023.

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5

Jariwala, Deep, Soumen Das, and Sandip Dhara. Nanoscopy and Nanospectroscopy. Taylor & Francis Group, 2023.

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6

Egner, Alexander, and Prabhat Verma. Nanoimaging and Nanospectroscopy II. SPIE, 2014.

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7

Egner, Alexander, and Prabhat Verma. Nanoimaging and Nanospectroscopy V. SPIE, 2018.

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8

Egner, Alexander, and Prabhat Verma. Nanoimaging and Nanospectroscopy IV. SPIE, 2017.

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9

Egner, Alexander, and Prabhat Verma. Nanoimaging and Nanospectroscopy III. SPIE, 2015.

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Частини книг з теми "Nanospectroscopy":

1

Dazzi, A., A. Deniset-Besseau, and H. Yang. "Infrared Nanospectroscopy." In Encyclopedia of Biophysics, 1–6. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2019. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-35943-9_10080-1.

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2

Bhowmik, Debanjan, and Chandrabhas Narayana. "Far-Field Spectroscopy and Surface-Enhanced Raman Spectroscopy (SERS)." In Nanoscopy and Nanospectroscopy, 97–129. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323-5.

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3

Dhara, Sandip, Deep Jariwala, and Soumen Das. "Conclusions and Future Directions." In Nanoscopy and Nanospectroscopy, 253–54. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323-7.

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4

Mujumdar, Sushil, Rabisankar Samanta, and Sandip Mondal. "Dielectric and Metallodielectric Nanophotonics and Optical Confinement." In Nanoscopy and Nanospectroscopy, 51–73. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323-3.

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5

Kumar Sahu, Binaya, Pratap K. Sahoo, and Sandip Dhara. "Plasmonic and Optical Confinement." In Nanoscopy and Nanospectroscopy, 39–49. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323-2.

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6

Ravindran, T. R., and Sandip Dhara. "Theory of Light Scattering and Applications." In Nanoscopy and Nanospectroscopy, 1–38. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323-1.

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7

Krayev, Andrey, Jeremy F. Schultz, Nan Jiang, Sreetosh Goswami, Agnès Tempez, Sharad Ambardar, Dmitri V. Voronine, et al. "Near-Field Nanospectroscopy and Tip-Enhanced Raman Spectroscopy (TERS)." In Nanoscopy and Nanospectroscopy, 131–252. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323-6.

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8

Madapu, Kishore K. "Optical Nanoscopy." In Nanoscopy and Nanospectroscopy, 75–95. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003248323-4.

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9

Liu, Gang Logan. "Plasmon Resonance Energy Transfer Nanospectroscopy." In Encyclopedia of Nanotechnology, 3264–77. Dordrecht: Springer Netherlands, 2016. http://dx.doi.org/10.1007/978-94-017-9780-1_23.

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10

Winter, Patrick M., Gregory M. Lanza, Samuel A. Wickline, Marc Madou, Chunlei Wang, Parag B. Deotare, Marko Loncar, et al. "Plasmon Resonance Energy Transfer Nanospectroscopy." In Encyclopedia of Nanotechnology, 2126–39. Dordrecht: Springer Netherlands, 2012. http://dx.doi.org/10.1007/978-90-481-9751-4_23.

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Тези доповідей конференцій з теми "Nanospectroscopy":

1

Jin, Mingzhou, Feng Lu, and Mikhail A. Belkin. "Infrared Nanospectroscopy in Liquid." In CLEO: QELS_Fundamental Science. Washington, D.C.: OSA, 2016. http://dx.doi.org/10.1364/cleo_qels.2016.fm2b.4.

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2

Altug, Hatice, Ahmet A. Yanik, Ronen Adato, Serap Aksu, Alp Artar, and Min Huang. "Plasmonics for ultrasensitive biomolecular nanospectroscopy." In Nanophotonics. IEEE, 2010. http://dx.doi.org/10.1109/omems.2010.5672182.

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3

El-Khoury, Patrick. "Tip-enhanced Raman scattering beyond chemical nanoscopy (Conference Presentation)." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2320313.

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4

Ushenko, Alexander, Viktor Zhytaryuk, M. I. Sidor, O. Ya Wanchulyak, A. V. Motrich, I. V. Soltys, O. V. Pavliukovich, and N. Pavliukovich. "System 3D Jones-matrix polarimetry of polycrystalline films of biological fluids." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2320533.

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5

Bhattarai, Ashish, Alan G. Joly, Wayne P. Hess, and Patrick El-Khoury. "Visualizing local electric field with tip-enhanced Raman spectroscopy (Conference Presentation)." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2320612.

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6

Krayev, Andrey. "On the nature of increased TERS/TEPL signal in wrinkles of 2D materials (Conference Presentation)." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2320659.

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7

Yano, Taka-aki. "Ultralow-loss field-enhanced spectroscopy using plasmonic and dielectric nanostructures (Conference Presentation)." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2320769.

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8

Kim, YoungBum, Yongjun Lee, Shrawan Roy, and Jeongyong Kim. "Near-field imaging of exciton complexes of monolayer MoS2 with chemical treatment (Conference Presentation)." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2320875.

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9

Bujak, Lukasz, and Marek Piliarik. "Interferometric scattering (iSCAT) microscopy for high fidelity tracking at microseconds timescales." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2321086.

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10

Neutsch, Krisztian, Lena Gö­ring, and Nils C. Gerhardt. "Common-path digital holographic microscopy for 3D nanoparticle localization." In Nanoimaging and Nanospectroscopy VI, edited by Prabhat Verma and Alexander Egner. SPIE, 2018. http://dx.doi.org/10.1117/12.2321175.

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