Дисертації з теми "Mise au point d'un outil diagnostique"

L'obésité sarcopénique (OS) est une condition caractérisée par la coexistence de l'obésité et de la sarcopénie, c'est-à-dire une réduction de la masse et de la fonction musculaires. Diagnostiquer l'OS est très complexe en raison de l'absence de critères diagnostiques universellement acceptés, ce qui entraîne des diagnostics imprécis et une estimation hautement variable de sa prévalence. Face à ces limitations, l'objectif de cette thèse était de développer un outil de diagnostic empirique pour l'OS aidé d'intelligence artificielle, basé sur l'analyse de la composition corporelle. Nous avons élaboré l'AIM-SO score dans une population de sujets en surpoids/obésité puis nous l'avons testé dans deux autres populations, l'une de patients avec obésité sévère subissant une chirurgie bariatrique, l'autre dans la population générale de l'UK Biobank. Une étude longitudinale a également été menée, avec un suivi à un an chez les sujets ayant subi une chirurgie bariatrique. Nous avons étudié les corrélations cliniques, en particulier cardiométaboliques et hépatiques, notamment histologiques per-opératoires, dans la cohorte bariatrique. La prévalence d'OS a été très proche entre ces trois cohortes. L'OS diagnostiquée par l'AIM-SO score était associée à de multiples comorbidités cardiométaboliques, ainsi qu'à une forme plus sévère d'atteinte inflammatoire et fibrosante du foie. Malgré la perte de poids, le bénéfice métabolique (rémission des comorbidités) après chirurgie bariatrique était moindre chez les patients ayant une OS. Des analyses préliminaires de la cohorte UK Biobank ont montré une association significative entre l'OS diagnostiquée par l'AIM-SO score et des paramètres de fonctionnalité musculaire, en particulier la force musculaire. Nous proposons ce nouvel outil diagnostique pour standardiser le diagnostic d'OS et identifier des patients en situation d'obésité avec sarcopénie dont le phénotype cardiométabolique et hépatique est plus sévère. Le diagnostic d'OS pourrait également renseigner le bénéfice attendu des différentes interventions à visée de réduction pondérale participant ainsi à une prise en charge médicale personnalisée
Sarcopenic obesity (SO) is a condition characterized by the coexistence of obesity and sarcopenia, the latter defined as a reduction in muscle mass and function. Diagnosing SO is highly complex due to the lack of universally accepted diagnostic criteria, leading to imprecise diagnoses and highly variable prevalence estimates. Given this scenario, this thesis aimed to develop an empirical diagnostic tool for SO using artificial intelligence, based on the analysis of body composition. We developed the AIM-SO score in a population of patients with overweight/obesity and tested it in two other populations: patients with severe obesity undergoing bariatric surgery (BS) and the general population of the UK Biobank. A longitudinal study with a one-year follow-up was conducted in subjects who underwent BS. We examined clinical correlations, particularly cardiometabolic and hepatic, including perioperative histological findings in the bariatric cohort. The prevalence of SO was similar across these three cohorts. SO diagnosed by the AIM-SO score was associated with multiple cardiometabolic comorbidities and more severe inflammatory and fibrosing liver damage. Despite weight loss, the metabolic benefit (remission of comorbidities) after BS was lower in patients with SO. Preliminary analyses of the UK Biobank cohort showed a significant association between SO diagnosed by the AIM-SO score and parameters of muscular functionality, particularly muscle strength. We propose this new diagnostic tool to standardize the SO diagnosis and identify patients with obesity and sarcopenia who exhibit more severe cardiometabolic and hepatic phenotype. Diagnosing SO could also inform the expected benefit of various weight loss interventions, thus contributing to personalized medical management

Les lyssavirus (rage et virus apparentes) sont des virus a arn negatif dont le genome est flanque de deux sequences precises (le leader et le trailer) qui sont indispensables a sa replication et a sa transcription. L'encapsidation du genome par la nucleoproteine (n) avec le complexe de replication/transcription viral constitue par la phosphoproteine (p) et la polymerase (l) est suffisante pour amorcer le cycle du virus. Dans le cadre d'un travail visant a creer un outil de genetique inverse pour lyssavirus, nous avons construit un vecteur permettant d'exprimer un minigenome rabique. Ce minigenome est compose d'un arn messager negatif de luciferase flanquee par le leader et le trailer du virus de la rage. L'extremite 3 precise du leader est obtenue par coupure de l'arn par le ribozyme de l'hepatite delta (arn auto catalytique), dont la sequence a ete clonee en aval de ce minigenome. Ce minigenome a ete exprime dans le cytoplasme de cellules de mammifere par l'intermediaire de l'arn polymerase de t7. La co-expression des proteines virales n, p et l a permis de trans-complementer le minigenome. Ce dernier a ete transcrit, donnant lieu a une expression specifique de luciferase, replique et a bourgeonne sous forme de virion pouvant infecter d'autre cellules. L'importance de l'extremite 5 de l'arn minigenomique a ete montree en ameliorant l'efficacite de la transcomplementation lorsqu'un ribozyme tete de marteau clivant l'arn en 5 a ete insere dans le vecteur d'expression. Un vecteur cassette lyssavirus a ete cree en introduisant des sites de restriction dans les ribozymes. Il permet de sous-cloner rapidement des sequences virales dans le vecteur d'expression, ce qui facilitera l'etude future des lyssavirus par genetique inverse. La complementation de minigenome rabique par virus assistant rage, mokola ou ebl-1 (lyssavirus tres divergeants du virus de la rage) a permis de montrer que les proteines du virus mokola sont capables de reconnaitre les sequences leader et trailer du virus de la rage, mais pas celles du virus ebl-1. Un outil de genetique inverse valable pour tous les lyssavirus a ainsi ete cree, il ouvre de nombreuses perspectives en particulier pour l'etude fonctionnelle de proteines virales mutantes, l'etude des sequences cis-regulatrices et a terme l'obtention de lyssavirus infectieux a partir de cadn.

Ce travail rapporte le développement et la validation d'un système de mesure pour l'étude cinématique des rotations du genou en 3 dimensions. Pour cela, nous avons dans un premier temps étudié in‐vitro les avantages apportés par un système de mesure de référence par rapport à l'évaluation du clinicien. Dans un second temps, nous avons développé un outil de mesure optoélectronique utilisable dans un contexte clinique. Nous avons réalisé une étude de reproductibilité de ce système pour des mesures de rotation interne‐externe en charge sur une série de sujets sains. Enfin, nous avons utilisé le système en condition réelle lors d'une étude clinique de revue à 2 ans de recul. 16 sujets opérés d'une rupture partielle du LCA ont été revus lors d'une consultation. Des mesures de rotation interne‐externe du genou en charge ainsi que des mesures de proprioception ont été réalisées.

Le terrassement d’infrastructures routières, sous l’impulsion des maitres d’ouvrages, est en pleine mutation. Traditionnellement régis par des contraintes techniques et économiques, les problématiques environnementales, sous l’impulsion des réflexions du grenelle de l’environnement s’invitent au rang des priorités pour l’attribution des exécutants de travaux. Scientifiquement parlant, la recherche dans le secteur du BTP cherche à obtenir des bases de données adaptées aux spécificités de ce secteur de la construction. Le mode de fonctionnement d’un chantier de terrassement axe les problématiques sur des thématiques autres que celles des chaussées, des centrales d’enrobage, etc. En effet, les consommations de carburant et les émissions gazeuses inhérentes au fonctionnement d’un moteur à explosion représentent une part beaucoup plus importante que dans d’autres secteurs. A un litre par mètre cube de matériau déplacé, les impacts environnementaux ne sont pas négligeables. La première problématique consiste à identifier un mode de découpage de l’activité de terrassement afin d’imputer les consommations à chacune des tâches réalisées sur chantier et ainsi mettre en relief leur importance relative. Une bonne connaissance professionnelle de cette activité a permis de proposer la modélisation d’un terrassement en tâches élémentaires. La seconde problématique consiste à construire une base de données des émissions des engins de terrassement. A ce sujet, la littérature scientifique est très pauvre. Elle se base essentiellement sur les modèles établis pour le domaine des poids lourds routiers, et sur des émissions théoriques à partir d’équation de combustion. Le mode d’usage spécifique des engins ne permet pas de se contenter de ces données pour établir une émission représentative d’un cycle de conduite. La troisième problématique consiste donc à mettre au point une méthodologie de mesure permet d’obtenir les émissions des principaux polluants réglementés en conditions réelles d’utilisation des engins. Cette méthodologie de mesure regroupe la mise au point d’un protocole expérimental permettant de justifier la représentativité des mesures, et aussi l’adaptation d’appareils de mesures non destinés à cet usage pour permettre de répondre aux conditions expérimentales extrêmes. Le traitement de ces données correspond à la quatrième problématique. Cela a permis de développer une base de données établissant une première pierre dans ce domaine, certes limitée dans son exhaustivité par les moyens techniques et la durée de l’expérimentation dans le cadre d’une thèse. Cependant, l’obtention de ces premiers résultats, et la construction d’un outil de calcul adaptés aux besoins de l’entreprise de terrassement ouvre une opportunité d’approfondir ces résultats afin de les généraliser, avec en conclusion une ébauche de coopération future avec les constructeurs d’engins, jusqu’ici réticents pour ce genre de partenariat
Under the guidance of project managers, the earthwork sector undergoes profound changes. While it has long been conditioned by technical and economic constraints, earthworks have now to consider many environmental issues in order to comply with the French Grenelle Round Table laws and gain access to contracts. From an environmental point of view, current researches aim at creating database representative of the construction sector impacts. As a matter of fact, earthworks characteristics involve very different issues that these concerning pavements, hot mix plants, etc. While comparing to various construction sectors, the large volume of moved earth induces lager fuel consumption by working machines and related emission of toxic compounds. Since nearly one liter of fuel is consumed per cubic meter of moved material, the environmental impacts cannot be neglected. In a first step, we proposed a methodology for analyzing the earthwork activity by identifying elementary tasks and associated fuel consumption so as to probe their relative importance. This based on the extensive survey of earthworks and the development of a basic earthmoving model. In a second step, we constructed a database for earthwork machinery in-situ emissions. There is currently very little data available in the literature. Furthermore, the latter usually base on combusted fuel with average emission factors for heavy duty on-road transports and theoretical combustion equation data. This hardly fit to the specific and highly variable driving cycle of the earthwork machines. Hence, we developed an original approach that allowed measuring in-situ the actual regulated pollutants emissions of working machines. This included the set up of an innovative experimental protocol and use of several analyzers that were not initially designed to endure the extreme conditions typical of an earthwork site. Lastly, once the data have been collected and processed, these were implemented in the new database and a numerical tool dedicated to the calculation of earthwork machines emissions. In spite of the investigated fleet and collection time limitations, this thesis consists of the first stage to a broader environmental assessment of earthwork machines emissions. It thus sets a framework for future cooperation with machines manufacturers, which so far very were cautious over the idea such partnerships

La mission soho (solar and heliospheric observatory) lancee le 2 decembre 1995, destinee a l'etude du soleil a partir de l'espace, a emporte a son bord 5 instruments pour l'etude de l'atmosphere solaire. Afin de tirer le meilleur profit de l'ensemble des instruments embarques mais aussi des observations au sol, des operations coordonnees ont ete prevues. Pour cela, deux centres de coordinations des observations ont ete crees, un aux etats unis (eof experimenters operations facility) et un en europe (medoc multi experiment data operation center). Medoc, outre ses fonctions de coordination, permet aux scientifiques d'analyser les donnees et constitue un centre d'archivage. Dans ce cadre, mon travail a consiste a gerer l'interface avec les pis (principaux investigateurs) des instruments, utilisateurs privilegies de medoc. La gestion de cette interface a apporte de nombreuses informations pour le developpement de medoc, notamment en ce qui concerne le volume des donnees quotidiennes, le niveaux des donnees, l'echange de donnees entre les instruments, chose utile pour la planification des operations etc. Un exemple de phenomene solaire sur lequel se font des campagnes d'observations sont les protuberances eruptives. La modelisation et l'observation de ces structures constituent le deuxieme volet de ma these. Nous avons etudie l'effet des champs de vitesses sur le transfert du rayonnement emis par les protuberances eruptives. Nos calculs montrent que les raies lyman alpha et lyman beta de l'hydrogene presentent des profils asymetriques quand la vitesse de la structure augmente. Nous avons profite de soho pour observer les protuberances a partir de l'eof (et prochainement a partir de medoc)

Une étude comparative a été menée entre deux groupes d'adolescents, dont un était issu de milieux défavorisés, sur leurs connaissances, leurs attitudes et leur comportement alimentaire. Une importante revue de la littérature a été centrée sur les thèmes nécessaires. La première acquisition de ce travail a été la création d'un montage audio-visuel permettant à la fois un recueil de données et une éducation nutritionnelle de ces adolescents. Le second point a été la comparaison de deux groupes d'adolescents, l'un tout-venant, l'autre constitué de jeunes défavorisés. Des différences entre les groupes ont été trouvées. La troisième partie du travail propose une critique de la méthode, discute les résultats en regard des données scientifiques disponibles et propose des objectifs d'éducation nutritionnelle.

L’hormone de croissance est une molécule protéique à activité anabolisante dont les propriétés peuvent être mises à profit pour améliorer les performances sportives des chevaux de courses et accroître la rentabilité de production des animaux d’élevage. Cependant, la législation est très stricte car l’utilisation de cette molécule ou de sa forme recombinante est interdite par le code des courses et les directives européennes en vigueur. Malgré les progrès scientifiques spectaculaires réalisés ces dernières années, le dépistage de l’administration de l’hormone de croissance reste difficile en particulier les premiers jours suivant un traitement. Récemment, de nouvelles méthodes de détection et d’identification visant à améliorer le contrôle de l’emploi illicite de promoteurs de croissance se sont développées. Les travaux de thèse présentés dans ce manuscrit s’inscrivent dans ce contexte. Une approche non ciblée, de type métabolomique a été développée afin de mettre en évidence des perturbations métaboliques urinaires et plasmatiques chez des chevaux traités à l’hormone de croissance recombinante équine. Les résultats obtenus par LC-HRMS ont permis de montrer la faisabilité analytique, la pertinence et l’intérêt de cette approche puisque des modèles descriptifs et prédictifs autorisant la discrimination entre des chevaux contrôles et traités à l’hormone de croissance ont pu être établis et validés. Cette méthode est actuellement mis en oeuvre et testée au Laboratoire des courses Hippiques. Le développement de ces études métabolomiques en lien avec d’autres techniques « omiques » telles que la transcriptomique, ou la protéomique laisse penser que ces nouvelles stratégies pourront permettre de franchir un cap très significatif dans la lutte du contrôle anti-dopage dans les prochaines années
The growth hormone is a peptidic molecule with anabolic activity potentially used to improve horse athletic efficiency and to increase the production profitability of farm animals. However, the legislation is very strict and the use of this molecule or its recombinant form is strictly forbidden by the races code and the European directives in force. Despite the numerous scientific progresses achieved recently, the control of growth administration remains difficult. New methods of detection and identification to improve the control of illegal use of growth promoters have recently been developed. The phD thesis work presented in this manuscript has been conducted in this context. An untargeted approach based on metabolomic study was developed to highlight equine urinary and plasmatic metabolic disruptions induced by the administration of recombinant equine growth hormone. The results obtained by LC-HRMS have demonstrated the analytical feasibility, relevance and usefulness of this approach since descriptive and predictive models able to discriminate non-treated from growth hormone treated horses have been established and validated. This method is currently being assessed in the French laboratory of horse racing. The development of such new metabolomic studies in conjunction with other omic techniques such as transcriptomic or proteomic suggests that these new strategies could improve the anti-doping control in the future

La Directive Cadre Européenne sur l'Eau (DCE) a imposé à chaque état membre l'objectif d'obtenir une amélioration de la qualité des eaux de surface, pour d'atteindre le bon état écologique à l'horizon 2015. Cette directive implique non seulement d'évaluer le degré de pollution mais aussi de définir l'état écologique des milieux par rapport à un référentiel (se rapprochant de l'état " naturel "). Cela a conduit à définir une typologie des rivières basées sur les "conditions de référence". Bien que géographiquement éloignés du continent, les DOM font partie intégrante de l'Union européenne et sont soumis aux mêmes objectifs et obligations en termes de politiques environnementales. La Guyane française (GF) est une région d'outre-mer de la France située sur la côte nord-est de l'Amérique du Sud. La forêt primaire guyanaise reste l'une des moins touchés du monde, cependant, les exploitations aurifères et sylvicoles ont de fortes répercussions sur les milieux aquatiques. Les petits cours d'eau (profondeur inférieur à 1 m et da largeur inférieur à 10 m) représentent 70-80% du réseau hydrographique de la GF. La plupart des petits cours d'eau sont situés dans les zones boisées et présentent haute qualité écologique et certains, sinon la plupart d'entre eux, n'ont jamais été touchés par une activité humaine. L'objectif principal de cette thèse était de concevoir un indice capable d'évaluer la qualité écologique des petits cours d'eau de la GF. Nous avons d'abord analysé l'effet des perturbations humaines sur la qualité physicochimique des écosystèmes. Puis, nous avons établi la première typologie de la structure des communautés benthiques en fonction des conditions environnementales. L'identification de ces sous-régions écologique et des conditions de références nous a permis de construire un indice multimétrique. Enfin, une approche fonctionnelle basée sur les Ephémères a été utilisée afin de fournir de nouvelles informations sur l'écologie de cet ordre. Nous avons démontré que les variables physiques relatives au fond des cours d'eau et les matières en suspension différencient les sites orpaillés, tandis que les concentrations en nutriments ne sont pas significativement modifiées par les impacts humains. La biotypologie a montré que les sites caractérisés par des communautés d'invertébrés sont regroupées en deux sous-régions principales: la plaine alluviale côtière et le plateau des Guyanes. Les changements dans la composition de la communauté, et à un degré moindre la richesse taxonomique au sein de chaque sousrégion ont révélé des impacts écologiques liés à l'exploitation aurifère et forestière. Parmi les mesures décrivant la structure des communautés (métriques) calculées à partir des deux sous-ensembles de sites de références et impactés, nous avons sélectionné les paramètres présentant le meilleur compromis entre forte efficacité de la discrimination, faible spécificité, faible redondance et une grande stabilité dans les conditions de référence. L'IBMG est composé de deux métriques taxonomiques de richesse, deux métriques basées sur l'abondance, une métrique relative au trait biologique et un indice de diversité. Les résultats sur les communautés d'Ephémère ont mis en évidence le rôle important de cet ordre pour la bioévaluation de petits cours d'eau soumis à l'exploitation aurifère. Des recherches futures fondamentales sur la taxonomie et l'écologie de cet ordre pourront permettre d'améliorer l'outil d'évaluation biologique actuel. Enfin, ce travail à souligné le fait que les petites masses d'eaux de tête de bassin de Guyane abritent potentiellement une faune riche et spécifique
The European Water Framework Directive (WFD) aims to achieve a rapid improvement of the water quality, in each member state, and to achieve good ecological status of rivers by 2015. This new directive implies not only to assess the degree of pollution but also to define an ecological state of the environment in relation to a reference condition. This has prompted a large amount of works which yielded characterizations of both reference physical-chemical environments and biological communities in continental Europe, as well as practical tools (e. G. , biological indices) to evaluate water quality. Although geographically distant the continent, DOMs are an integral part of the European Union and are subject to the same objectives and obligations in terms of environmental policies. French Guiana (FG) is an overseas region of France located on the north-eastern coast of South America. The Guianese primary forest remains one of the least impacted of the World, however, gold mining and timber have strong localized impacts upon river ecosystems. Small streams (from headwaters to rivers with depth inferior to 1 meter and width inferior to10 meters) represent 70-80% of all running waters in FG. Most small streams are located in forested areas and exhibit high ecological quality; some if not most of them have never been impacted by any human activity. The main objective of this thesis was to design a biotic index to assess the ecological quality of small streams of FG. We first analysed the effects of disturbance on the physical-chemical quality of ecosystems. Then, we brought out the first typology of community structure in relation to environmental conditions. The identification of the sub-ecological regions and the references conditions allowed us to build a first multi-metric. Finally, a functional approach based on Ephemeroptera was used in order to provide new information on the ecology of this important order of macroinvertebrates. We first demonstrated that physical variables describing the river bottom, and suspended solids discriminate gold-mined from reference sites, while, whatever the type of impact encountered, nutrient concentrations do not prove relevant to measure human impacts. The bio-typology showed that sites characterized by invertebrate communities clustered into two major subsets: the coastal alluvial plain and the Guiana Shield. Changes in community composition, and to a lesser extent taxonomic richness within each sub region revealed ecological impacts of gold mining and logging. Among the biological metrics calculated from the hydro-ecoregions subsets of reference and impaired sites, we selected metrics exhibiting the best trade-off between high discrimination efficiency, low specificity, low redundancy and high stability under reference conditions. The IBMG is composed of two taxonomic richness-based metrics, two abundance-based metrics, one trait-related metric and a diversity index. Results on Ephemeroptera communities put in light the important role of this order for the bio-evaluation of small streams submitted to gold-mining. Future fundamental research on the ecology and the taxonomy of this order should thus improve the current bioassessment tool. Finally, this work highlighted the fact that headwater stream small of FG potentially harbor a rich and specific fauna

La qualite est une notion polysemique qui doit etre definie, caracterisee et mesuree avant de pouvoir etre geree. Par la methode pedagogique dite des representations, basee sur l'expression de l'inconscient collectif, les attentes de plusieurs groupes de consommateurs ont ete precisees et reliees aux differentes composantes de la qualite d'une prestation en restauration hors foyer. Ces resultats ont ete utilises pour elaborer un outil de maitrise de la qualite sous la forme d'un questionnaire constitue de 331 questions de detail organisees en 27 regles et 5 chapitres. L'outil a ete teste sur le terrain en restauration collective de type scolaire et a fait preuve de son efficacite en situation d'audit de controle. L'interet de ce type d'outil tient a sa valeur predictive supposee vis-a-vis des dangers: il s'agit alors d'un bon indicateur de niveau de risque. La restauration est le dernier maillon de la chaine de securite alimentaire et le point d'aboutissement de toutes les filieres ; a ce titre, ce secteur concentre tous les dangers: parmi ceux-ci, le peril fecal a ete choisi et etudie en fonction de son importance particuliere en sante publique. 59 questions ont ete selectionnees, parmi les 331 de l'outil qualite, comme ayant a priori une relation avec le peril fecal. La pertinence de ce choix a ete verifiee en comparant, dans 24 restaurants commerciaux et 17 restaurants collectifs, les reponses aux 59 questions a la mise en evidence dans les cuisines d'une contamination par e. Coli, temoin fiable de contamination fecale d'origine humaine. Les prelevements microbiologiques ont ete effectues dans chaque cuisine sur 4 types de sites, en surface a l'aide de petri-films (nd). Parallelement, deux enquetes epidemiologiques de comportement ont ete menees pour preciser l'importance du peril fecal et determiner les sites de prelevement. La correlation entre l'ensemble des 59 questions et les resultats microbiologiques est significative. L'analyse statistique multifactorielle a precise les questions les plus pertinentes face a ce danger specifique: dans le contexte de l'etude il existe des indicateurs macroscopiques fiables de la contamination des sites par e. Coli. L'importance des facteurs de comportement, donc de la formation du personnel, a ete soulignee. Cette etude appliquee au cas particulier du peril fecal pose les bases d'une strategie de controle et de lutte contre les dangers microbiologiques rencontres aux differentes etapes de la chaine de securite alimentaire a l'aide d'une approche systematisee ; dans le domaine de la restauration l'auteur propose la mise en place d'une demarche specifique de type haccp en parallele a la redaction d'un guide des bonnes pratiques d'hygiene (gbph)

L'imagerie TEP par la technique de préciblage, exposée dans cette thèse, est proposée avec le gallium-68. Ce travail s'articule en deux axes. La première partie évalue une nouvelle technique de production chimique par le N,N′-(o-phénylène)dimalémide d'un anticorps bispécifique ciblant à la fois un antigène tumoral et un haptène. La seconde partie étudie le radiomarquage et les propriétés radiochimiques des complexes du 68Ga avec différents chélatants pour la fonctionnalisation de l'haptène bivalent di-HSGL. L'optimisation de la technique de synthèse de l'anticorps bispécifique a montré qu'un pourcentage de 5 % (p/p) de pepsine est suffisant pour obtenir une digestion optimale de l'anticorps en F(ab')2. Les études sur la réduction des ponts disulfures du F(ab')2 et sur l'intégrité des Fab' formés montrent qu'un réducteur doux limite la dégradation du Fab' tout en maintenant un bon rendement de réduction. L'étude d'affinité indique que l'affinité de l'anticorps bispécifique synthétisé avec le dimalémide est suffisante pour le ciblage efficace de tumeurs positives à l'antigène CEA. La deuxième partie de ce travail concerne l'étude radiochimique du chélatant cyclique DOTA et acyclique HBED complexés au 68Ga. L'ensemble des résultats de radiomarquage et des études de stabilité semblent montrer que l'HBED est un chélatant de choix pour le radiomarquage de l'haptène avec le 68Ga. Son radiomarquage est réalisable à faible température et avec une activité spécifique supérieure à celle du DOTA. Le rendement de radiomarquage du complexe HBED-68Ga et l'optimisation de la technique doivent permettre d'injecter le peptide radiomarqué sans purification du produit fini
In this study, the affinity enhancement system is proposed with nuclear imaging using gallium-68. This work is presented in two parts. The first part investigates new chemistry system used N,N′-(o-phenylene)dimalemide to produce a bispecific antibody which targets a tumour antigen and a hapten. The second part evaluates radiolabel and radiochemistry properties of 68Ga complexes using two chelators in order to radiolabel divalent hapten named di-HSGL. Synthesise optimisations show that the optimal digestion of antibody is realized with 5 % of pepsin (p/p). F(ab')2 reduction studies indicate that cysteamine, a soft powerful reducing agent, is enough to reduce disulfide bonds and does protect the integrity of created Fab'. Eventually, the affinity studies of the new divalent vector confirm the good affinity constants to both antigen and hapten. The second part presents radiochemistry studies of DOTA and HBED chelators for 68Ga. They show HBED is more interesting than DOTA to radiolabel hapten with 68Ga. Radiolabel is made at room temperature. Its specific activity is better than DOTA's one. Radiolabel rate and method optimization should allow to inject the final product without purification stage

Les morilles présentent une grande diversité de formes, difficiles à interpréter même pour les spécialistes. Ceci a engendré un grand nombre de classifications différentes. Par ailleurs, ces champignons présentent une grande variabilité de modes de vie, qui semblent fortement influencés par des facteurs micro-écologiques. Nous avons développé un outil moléculaire basé sur le polymorphisme de l'ADN ribosomal qui permet à la fois de clarifier la systématique ambigüe des morchellacees et une approche plus précise de leur écologie. Une étude préalable du polymorphisme isoenzymatique a montré que celui ci permet la séparation précise des souches y compris au sein d'une espèce, sans toutefois rendre compte des relations phylogénétiques. L'analyse par PCR/RFLP de l'espaceur interne transcrit de l'ADN, a permis la distinction de trois groupes d'espèces avec des longueurs de l'ITS qui varient entre 740 et 1230 pb ; le séquençage de cette région a autorisé une analyse de la phylogénie des morchellacees. Les distances phylogénétiques observées entre les groupes d'espèces au sein du genre morchella sont comparables voire supérieures à celles avec les genres voisins. Ceci suggère que de même que les fausses morilles Mitrophora et Verpa ont été exclues du genre Morchella au siècle dernier il paraîtrait justifié de scinder les vraies morilles en deux voire trois genre. L'analyse de la région ITS permet également de mettre en cause la valeur de certaines espèces de morille telle que M. Vulgaris. L'étude sur le terrain des associations avec des plantes a confirmé la double aptitude des morilles à la symbiose et au parasitisme. L'étude en conditions contrôlées a apporté une confirmation expérimentale de la spécificité de M. Elata pour Pinus banksiana, qui avait été décrite sur le terrain. La possibilité d'une association M. Esculenta-Betula pendula a en outre été démontrée. L'étude expérimentale a également renforcé l'hypothèse du caractère crucial de l'association des morilles à des plantes supérieures lorsqu'elles se développent dans un contexte écologique difficile.

Une etude a ete menee sur les zoophycos caracterisant les calcaires a cancellophycus jurassiques du sud-est de la france. Un certain nombre de coupes, souvent inedites, a ete selectionne en haute provence, ardeche et dans la region lyonnaise. Les resultats de ce travail sont originaux pour ce qui concerne la morphologie de la trace et, surtout, sa signification paleoenvironnementale. On propose une nouvelle interpretation morphologique: le terrier est construit en remontant dans le sediment. On suppose un substrat coherent pour permettre l'installation du terrier. Ce substrat se forme dans des conditions de ralentissement ou d'arret de la sedimentation. Le sediment typique est une pelmicrite a filaments. Zoophycos se developpe dans des milieux de talus ou les apports d'origine proximale (matiere organique) sont importants. Zoophycos peut etre utilise en analyse sequentielle: la trace se developpe surtout dans les niveaux tres calcaires correspondant a des fins de sequence. La trace disparait aux debuts des phases transgressives. Zoophycos se revele donc un bon outil paleogeographique, paleoecologique et sedimentologique

Le systeme developpe constitue un outil pedagogique permettant a des etudiants de tester et de mettre au point des protocoles. Il autorise une experimentation simulee de ces derniers dans un cas de figure choisi par l'utilisateur et offre en outre, dans un contexte graphique, une assistance a la recherche d'erreurs comportant notammant, la possibilite d'une execution pas a pas. L'aspect mise au point des protocoles est aborde et un certain nombre de fonctions assistant l'utilisateur dans la recherche d'erreurs sont decrites

Le syndrome de Lynch (LS) est la 1ère cause de cancer colorectal familial. Il est dû à des mutations germinales mono-alléliques affectant les gènes du système de réparation des mésappariements (MMR, MisMatch Repair), principalement MLH1 et MSH2. Le diagnostic repose sur la détection de mutations MMR pathogènes, ce qui pose le problème de l’interprétation fonctionnelle des variants identifiés, souvent équivoque puisque 30% des altérations MLH1 et MSH2 détectées sont des variants de signification incertaine (VSI). Notre objectif était de développer un test fonctionnel permettant de discriminer ces VSI. L’inactivation du système MMR rend les cellules tolérantes aux lésions de méthylation sur l’ADN et leur permet d’échapper à l’apoptose. Notre stratégie expérimentale repose sur la capacité de variants MLH1 et MSH2 à complémenter la déficience MMR d’une lignée cellulaire en culture. En bref, une restauration de la sensibilité à la méthylation est attendue si le variant transfecté est non pathogène. Nous avons d’abord testé 40 variants MLH1 et MSH2 dont le caractère pathogène ou neutre est connu. La méthode a permis de classer correctement 39/40 variants ce qui a permis de valider notre approche. La technique, qui a ensuite été appliquée à une série de 49 VSI MLH1 et MSH2 à caractériser, a permis de proposer une classification pour 41/49 (83%) des VSI. Les autres données disponibles (cliniques, somatiques, in silico et éventuellement fonctionnelles) confirment nos résultats. À terme, ce test de signalisation des dommages à l’ADN pourrait être disponible en diagnostic de routine pour étudier tous les VSI détectés chez les patients et aider au diagnostic du LS
Lynch syndrome (LS) is the leading cause of familial colorectal cancer. It is due to mono-allelic germ-line mutations affecting the genes of the MisMatch Repair (MMR) system, mainly MLH1 and MSH2. The diagnosis is based on the detection of pathogenic MMR mutations, which raises the issue of the functional interpretation of the identified variants, often equivocal since 30% of the detected MLH1 and MSH2 alterations are variants of uncertain significance (VUS). Our goal was to develop a functional test to discriminate these VUS. Inactivation of the MMR system makes the cells tolerant to DNA methylation lesions and allows them to escape apoptosis. Our experimental strategy relies on the ability of MLH1 and MSH2 variants to complement the MMR deficiency of a cell line. Briefly, a restoration of sensitivity to methylation is expected if the transfected variant is non-pathogenic. We first tested 40 MLH1 and MSH2 variants whose pathogenicity or neutrality was known. The method correctly classified 39/40 variants, which validated our approach. The technique, which was then applied to a series of 49 MLH1 and MSH2 VUS to be characterized, made it possible to propose a classification for 41/49 (83%) of the VUS. The other available data (clinical, somatic, in silico and eventually functional) confirm our screen results. In the future, this DNA damage signaling assay could be available in routine diagnostics to study all the detected VUS in patients and improve the diagnosis of LS

La communication phéromonale chez les lépidoptères, si sensible et spécifique, constitue un modèle de choix pour l'étude des bases moléculaires de la réception olfactive. La spécificité de ce système serait assurée dès le niveau périphérique, dans l'antenne, par l'intervention d'une diversité de protéines impliquées dans la chimioréception des odorants. Le ver à soie, Bombyx mori, est une espèce particulièrement appréciée pour l'étude des mécanismes olfactifs : la réponse des mâles à la phéromone est connue, l'espèce est manipulable génétiquement et les séquences génomiques sont accessibles sur Internet. Au cours de mon travail de thèse, j'ai pu identifier et caractériser au niveau moléculaire une diversité de gènes olfactifs appartenant à différentes familles par des techniques bioinformatiques d'analyse du génome et de biologie moléculaire. Leurs patrons d'expression ont notamment été analysés afin de vérifier si leur localisation tissulaire était compatible avec une fonction chimiosensorielle. Certains de ces gènes (BmPBP2, BmPBP3, BmAOX2) pourraient coder pour des protéines spécifiquement impliquées dans la réception phéromonale alors que d'autres (BmAOX1, BmSNMP2) pourraient intervenir aussi dans la réception de molécules moins spécifiques. Par leurs interactions combinées et séquentielles avec les molécules odorantes, ces différentes familles de protéines permettraient d'assurer leur reconnaissance spécifique au cours des différentes étapes périphériques de la réception olfactive. Par ailleurs, j'ai pu participer à la mise au point chez le ver à soie d'un outil novateur d'analyse fonctionnelle in vivo basé sur l'expression par transgenèse de RO dans les antennes du ver à soie. Ce système a été développé avec un récepteur phéromonal mâle-spécifique, BmOR1. Les femelles des lignées transgéniques exprimaient fortement le récepteur dans leurs antennes, mais se sont révélées incapables de répondre au composé phéromonal (Bol) au cours d'enregistrements électrophysiologiques. L'utilisation future d'un nouveau promoteur spécifique des neurones olfactifs, pOR2, pourrait permettre de développer le premier système stable d'analyse fonctionnelle in vivo chez un lépidoptère.

Quelle que soit la nature d'une production, l'usure d'un outil a des conséquences importantes sur elle. L'usure est un phénomène commun à toutes les industries, et la maîtrise de ce phénomène constitue toujours une avancée pour les industriels qui font l'effort de le comprendre. Ce travail porte sur l'analyse et la compréhension du phénomène complexe de l'usure des outils lors de la coupe de matériau bois ou dérivé du bois. Nous avons étudié l'impact de la corrosion et de l'abrasion sur l'usure d'une arête de coupe dans la seconde transformation du bois. Compte tenu des spécificités liées au matériau bois et à sa coupe, l'étude de la corrosion s'est fait par l'intermédiaire d'un test d'électrochimie alors que l'étude du phénomène abrasif a nécessité la création d'un banc d'essais spécifique : TEEMO. En complément de ces études nous avons procédé à une pré-analyse des températures générées durant un usinage. Les résultats obtenus au travers de ce projet valident la théorie de départ, à savoir que la corrosion interagit avec l'abrasion pour générer l'usure globale d'une arête de coupe. Aux vues de ces travaux, la composition chimique d'un matériau de coupe est un facteur aussi important dans la lutte contre l'usure que les propriétés mécaniques du matériau
For each kind of production, the tool's wear can make important consequences on her. Wear is a common subject through the industry, and this phenomenon mastering always makes an advancement for entreprises who are interested in. This work deals with the wear phenomenon decomposition between different processable studies in order to permit a study and a global comprehension of this complex phenomenon. That's why we decided to separate the general cutting hedge general wear in wood industry second transformation between two parts : corrosion and abrasion. According to the wood material and his cutting specificities, the corrosion study was made by an electrochemistry test adaptation whereas the abrasion one needed the creation of a specific testing stand : TEEMO. To complete this study, we carried out experiments on generated temperature during the machining process. Through all this project, the results validates the departure theories i. E. Corrosion and abrasion have interaction to generate the cutting hedge global wear. With the sights of this work, the chemical composition of the cutting material is a factor as important as the material mechanic properties against the wear

Ce travail est axe autour d'un theme : la geochimie des elements en traces et d'un outil : l'analyse par activation neutronique. Notre methode s'appuie sur une geochimie comparee des elements en traces et sur les proprietes particulieres des elements hygromagmaphiles. Le but de ce memoire est de faire le point sur les differents travaux entrepris et les resultats obtenus durant ces 25 dernieres annees tant dans le domaine de la geochimie des elements en traces qu'au niveau de l'outil. Du point de vue analytique, nous avons developpe des protocoles permettant d'elargir son champ d'application et effectue des tests d'inter comparaisons pour valider notre outil et en faire un outil geochimique performant. L'application a l'etude des grands domaines geodynamiques, en vue d'un inventaire de leurs proprietes geochimiques, s'est concretisee par la realisation d'une banque de donnees riche et homogene. Du point de vue geochimique, sur la base d'une geochimie comparee et systematique, nous avons defini des criteres d'identification des divers processus et propose des modeles simples de representation faisant apparaitre les signatures geochimiques specifiques des facteurs determinant les proprietes des roches magmatiques. Ainsi avons nous reussi a remonter jusqu'aux empreintes heritees des sources et donc du manteau mettant en evidence une zonation geochimique du manteau a l'origine des morb (hygma : hygromagmaphile mantle array), correlee aux variations des rapports isotopiques. Nous l'interpretons comme le resultat d'une differenciation en systeme ouvert decrit par une loi de type rayleigh l'extension des caracteristiques geochimiques des sources des morb aux domaines de subduction fait apparaitre des fractionnements des elements hygromagmaphiles, tels thorium, tantale dont le rapport caracterise les 2 grands types de magma, celui des dorsales (th/ta<3) et celui des zones de subduction (th/ta>3). Enfin, reprenant le concept d'isoter (isotope like trace element ratio) propose par c. J. Allegre, nous faisons une analyse globale des donnees dans des diagrammes log-log afin d'en extraire les empreintes les plus caracteristiques de la geodynamique chimique du manteau, l'utilisation des coordonnees logarithmiques permettant une reduction complementaire des empreintes des processus magmatiques. Ainsi les couples th/ta, tb/yb permettent-ils une distinction des grands domaines mantelliques.