Дисертації з теми "Intercation"

Le déplacement d'objets allongés dans un fluide se retrouve dans de nombreux domaines tels que la récupération du pétrole, la production du papier ou la nage de micro-organismes. Dans ce travail, nous étudions le comportement d'une fibre cylindrique longue dans un écoulement en géométrie confinée (fracture, canal microfluidique). Dans un premier temps, les forces de trainée exercées sur la fibre ont été déterminées expérimentalement et numériquement en fonction de son orientation et de sa position dans l'ouverture. Lorsque la fibre est parallèle à l'écoulement, elle le perturbe faiblement et une modélisation 2D est suffisante ; au contraire, lorsqu'elle est perpendiculaire, l'écoulement devient 3D quand le blocage est incomplet. Pour cette orientation, la portance est suffisante pour maintenir l'objet au centre de l'écoulement. Pour un nombre de Reynolds de l'ordre de 20, cette position devient instable : le cylindre oscille entre les deux parois. Le seuil de l'instabilité est inférieur au seuil d'émission des tourbillons de Bénard-Von Kármán. La position du cylindre est modélisée par une équation de Van der Pol qui prédit quantitativement la bifurcation de Hopf du système. Une interprétation hydrodynamique des coefficients de cette équation est présentée. Nous présentons et validons ensuite une méthode de traitement d'image, qui détermine de manière analytique la forme d'une fibre avec une précision sub-pixel. De plus, l'angle du vecteur tangent et la courbure de la fibre - essentielle car reliée à son moment fléchissant - sont mesurés avec précision
The motion of elongated objects in a fluid is encountered in many scientific fields, ranging from oil recovery and paper production to microorganism swimming. In the present thesis we study the behavior of a long cylindrical fiber in a confined flow (fracture, microfluidic channel). We first determine both experimentally and numerically the drag on this object as a function of its orientation and position in the aperture. A fiber parallel to the flow only slightly perturbs the flow, and the force on it can be estimated using 2D models. On the contrary, if it is perpendicular to the flow, the latter becomes 3D if blockage is partial. In this configuration, the lift is sufficient to keep the cylinder in the middle of the flow. For Reynolds numbers higher than 20, this position becomes unstable and the cylinder oscillates between the walls. The threshold of this instability is lower than that of Bénard-Von Kármán vortex shedding. The position of the cylinder satisfies a Van der Pol equation, which allows for a quantitative prediction of the Hopf bifurcation of the system. A hydrodynamic interpretation of the coefficients of this equation is given. We also develop and validate a new image processing method, which give the shape of the fiber with a sub-pixel precision. Moreover, the tangent vector angle and the curvature, of interest because it is related to the bending moment, are accurately measured

Solvation Free Energy (SFE) is a fundamental quantity in chemical physics. It describes solvation behavior of substances in liquid media and has many important applications in solution chemistry, biophysics, pharmaceutics, medicine, and environmental sciences. In many applications (for example, screening of drug-candidate databases in a drug-discovery process) it is important to have a fast and accurate method for solvation free energy calculation. In this thesis two new methods for fast and accurate SFE calculations are proposed. The methods combine the theoretical basis of the integral equation theory of liquids with advanced computational techniques. The theoretical part of the methods is based on the Reference Interaction Site Model (RISM) and the three-dimensional RISM (3DRISM) molecular theories and semiempirical models for SFE calculations. The computational part of the methods is based on the multi-grid scheme which drastically increases the computational performance. Additional investigations of speed and accuracy of calculations are performed to determine the optimal parameters of the methods which allow one to calculate the SFE with a required accuracy and minimal computational expenses. The methods are benchmarked on extended sets of small organic and drug-like compounds. It is shown that both (RISM and 3DRISM-based) methods can be successfully used for SFE calculations. It is shown that the parameters of the methods are transferable between different classes of compounds. The average computation time per typical drug-like compound of about 20 atoms is 17 seconds on a single CPU core for the RISM-based method and about 3.5 minutes for more accurate 3DRISM-based method.

Les travaux présentés dans ce manuscrit portent sur l’étude des propriétés photoniques de quatre espèces de diatomées du genre Coscinodiscus : C. wailesii, C. specie, C. radiatus et C. radiatus-cf. Les diatomées sont des micro-algues unicellulaires constituées d’une cellule unique encapsulée dans une matrice inorganique de silice poreuse appelée frustule. Nous avons effectué des cultures de ces espèces, puis extrait les frustules afin de les caractériser, tant du point de vue de leur composition que de leur morphologie, par microscopie électronique et tomographie RX. Le frustule est constitué de trois couches de silice (le foramen, le cribrum et le cribellum) présentant une structure poreuse hiérarchique, s’étendant du micromètre au nanomètre, et formant ainsi une matrice tridimensionnelle complexe pouvant présenter des propriétés photoniques. Le foramen et le cribrum présentent des réseaux de pores de périodicité importante dont les dimensions caractéristiques (taille des pores, pas du réseau…) sont de l’ordre de grandeur des ondes lumineuses. Les propriétés optiques des frustules ont alors été étudiées expérimentalement par imagerie spectrale et théoriquement par simulations numériques par la méthode des éléments finis. Nous avons ensuite mis en évidence un effet de concentration de la lumière visible transmise sur l’axe de la diatomée à quelques dizaines de micromètres derrière le frustule. Cet effet s’avère dépendre de la longueur d’onde incidente ainsi que de l’orientation du frustule. Finalement, nous avons montré, par approche théorique et simulations numériques, que cet effet de concentration de la lumière le long de l’axe est majoritairement dû au foramen et que les autres couches n’ont qu’un effet marginal. Une telle micro et nano-structuration complexe de la matière est actuellement inaccessible à l’échelle industrielle. Cette structure présente cependant des effets de concentration et de filtration des ondes lumineuses d’un grand intérêt dans de nombreux domaines (photovoltaïque, cosmétique, peinture…) et on peut donc envisager raisonnablement une utilisation directe des diatomées
The work presented in this thesis deals with the study of the photonic properties of four diatom species of the genus Coscinodiscus: C. wailesii, C. specie, C. radiatus et C. radiatus-cf. Diatoms are unicellular microalgae consisting of a single cell encapsulated in an inorganic matrix of porous silica called frustule. We performed cultures of these species, then extracted the frustules to characterize them, both in terms of their composition and their morphology, by electron microscopy and X-ray tomography. The frustule consists of three silica layers (the foramen, cribrum and cribellum) with a hierarchical porous structure, ranging from micrometer to nanometer scale, and thus forming a complex three-dimensional matrix that may have photonic properties. The foramen and cribrum have periodic pores networks whose characteristic dimensions (pore size, lattice constant…) are of the order of light wavelengths. The optical properties of the frustules were then studied experimentally by spectral imaging and theoratically by numerical simulations by finite element method. We demonstrated a concentration effect of visible light transmitted on diatom’s axis a few tens of micrometers behind the frustule. This effect appears to depend on the incident wavelength as well as the orientation of the frustule. Finally, we have shown by theoratical approach and numerical simulations, that light concentration effect along the axis is mainly due to the foramen and the rest of layers have only a marginal effect. Such complex micro and nano-structuring of matter is currently impossible on an industrial scale. This structure, however, has optical effects of light concentration and filtration of great interest in many fields (photovoltaics, cosmetics, paint…) and it is therefore reasonnable to consider a direct use of diatoms

Nous présentons un travail théorique en forte adéquation avec des résultats d’expériences qui a pour but de mieux comprendre la nature des processus de génération et de relaxation ultrarapides de porteurs chauds dans les métaux. Nous avons développé un code basé sur la résolution de l’équation de Boltzmann pour les électrons et les phonons, qui prend en compte,la diffusion des électrons par les phonons et l’absorption de photons assistée par phonons. Nous montrons l’importance des processus de diffusion Umklapp dans les processus d’absorption tant via les collisions électron-électron que les collisions électron-phonon. La non linéarité du signal de thermoréflectance avec l’énergie déposée nous permet de relier de manière quantitative les signaux de thermoréflectance à la modélisation. À l’aide d’une approche de type Pn, nous résolvons numériquement l’équation de Boltzmann à une dimension spatiale pour les électrons, ce qui nous permet de traiter le transport ultra-rapide sur des dimensions spatiales allant du régime balistique ( 10 nm) à des dimensions de plusieurs centaines de nanomètres tout en mettant en évidence l’effet des porteurs chauds photo-induits sur la dynamique du transport ultrarapide. Ce travail de modélisation nous permet de modéliser les résultats expérimentaux obtenus au LOMA ainsi que des résultats expérimentaux de la littérature
In the present work, we present a theoretical study aiming at understanding ultra-fast generation, elaxation and transport processes of hot carriers in metals. We have developed a numerical code solving the Boltzmann equation for both phonons and electrons which enables to model these ultrafast out of equilibrium processes. The importance of Umklapp processes in absorption mechanisms for electron-electron and electron-phonon scattering is shown. By using the Rosei model, experimental observable are extracted from microscopic calculations as the thermoreflectance signal. Numerical results are compared to experimental data. In general a good agreement is obtained. By coupling the present approach to experimental data, absolute thermoreflectance measurements can be carried out. Finally, Boltzmann equation for electrons with one spatial dimensions and three dimensions in momentum space is numerically solved. This enables to model ultrafast transport from ballistic spatial ( 10 nm) and temporal time scale ( 10 fs), beyond Fourier transport where the temperature is no longer defined, to macrocopic scales. The importance of describing the ultrafast transport of hot carriers is highlighted. The numerical predictions have been compared successfully with experimental results obtained in LOMA and in the litterature

L’objectif de la thèse est d’étudier d’une part l’effet du système contrarotatif surles performances du compresseur centrifuge et d’autre part l’influence de le système sur lazone de pompage lorsque le débit massique est très faible. Le mono rotor du compresseurcentrifuge conventionnel est remplacé par deux rotors qui tournent en sens inverse et ayantla même taille. Les autres composants du compresseur sont préservés. L’étude expérimentalemontre que l’utilisation d’un système contrarotatif améliore non seulement les performancesdu compresseur à des vitesses de rotation inférieures à la vitesse de conception, mais diminueaussi la zone de pompage. Le compresseur fonctionnant en mode contrarotatif offre unmeilleur taux de compression ainsi qu’un meilleur rendement que le compresseur conventionnel.Pour améliorer la zone de pompage, un mode de co-rotation est adopté pour permettreau compresseur de fonctionner à un débit inférieur à celui du compresseur de référence. Lalimite du pompage est alors repoussée jusqu’à 24%-28% de la plage de fonctionnement ducompresseur, vers les débits plus faibles. Le point limite est atteint lorsque la vitesse derotation du rotor en amont est comprise entre 48% et 64% de celle du rotor en aval. Lesrésultats de cette étude jouent un rôle important dans le développement d’une nouvellegénération de compresseur centrifuge pouvant fonctionner sous un très faible débit massique
The objective of the thesis is to study the effect of the counter-rotatingsystem on the performance of centrifugal compressors and the ability to improve a surgeregion when the flow is very low flow rate. The single rotor of the conventional centrifugalcompressor is replaced by two counter-rotating rotors, which have the same size. Theremaining components of the compressor are preserved. Experimental results show that theuse of a counter-rotating system not only improves the performance of the compressor atrotational speeds lower than the design speed but also decreases the instability region. Thecompressor operating in counter-rotating mode gives a better pressure ratio as well as abetter efficiency than the conventional compressor. A co-rotation mode is adopted to allowthe compressor to operate at a lower flow rate. The instability limit of the compressor isthen pushed back from 24% to 28% of the operating range towards the lower flow rates.The limit point is reached when the upstream rotor speed is between 48% and 64% of thedownstream rotor speed. The results of this study play an important role in the developmentof a new generation of centrifugal compressor that can operate at a very low mass flow rate

Lors du developpement precoce de la drosophile, le plan de l'embryon est defini par quatre systemes maternels. La molecule-cle du systeme anterieur est bicoid, facteur de transcription a homeodomaine. Il a ete montre que bicoid etait aide par un autre morphogene anterieur, hunchback. Bod et hb sont capables d'agir en synergie pour organiser un developpement anterieur correct. Le mecanisme moleculaire propose pour cette synergie fait intervenir des facteurs specifiques de la machinerie generale de transcription, les tafs. Dans un premier temps, nous avons ete amenes a tester la signification biologique des ces resultats in vivo. Des mouches transgeniques portant des deletions de la proteine bicoid ont montre que les domaines putatifs d'activation de la transcription de bicoid etaient dispensables pour son activite in vivo. Ceci suggere que les interactions observees in vitro avec des composants specifiques de la machinerie generale de transcription ne sont pas essentiels pour un developpement anterieur correct. Le systeme terminal anterieur a longtemps ete implique dans la modification de l'activite de bcd. A l'extremite la plus anterieure, tor est connu pour avoir une fonction negative sur l'activite de bcd (retraction des genes cibles de bcd) tandis que dans les regions posterieures de la tete presomptive, tor semble plutot augmenter la fonction de bcd. Dans une deuxieme partie, nous montrons que de multiples copies de bcd sont capables de restaurer le phenotype anterieur des mutants du systeme terminal. Ceci signifie que le seul role de tor dans l'anterieur est d'aider bcd a effectuer sa fonction. Nous avons aussi montres que tor n'agit pas sur bcd mais qu'il existe deux voies d'activation differentes des genes cibles de tor et bcd. Ces observations sont consistantes avec l'hypothese de l'apparition recente d'un centre morphogenetique anterieur (bcd et anterieur tor) chez les dipteres superieurs.

La réservaction est un nouveau concept au service du pouvoir d’agir de l’Enseignant et de celui de l’élève, élaboré au gré d’années d’observations de classes de l’école primaire/secondaire, de dialogues avec ces acteurs et d’analyse des discours de ce terrain guidé par une prescription évolutive : le Socle Commun des Connaissances, des Compétences et de Culture et les programmes officiels. En toute situation d’apprentissage, une certaine attitude en retrait de la part de l’apprenant est constatée (la réserve, aspect retenue), qui doit faire face à un formateur mais également à un groupe de pairs aux profils et potentiels divers et variés (la réserve, aspect ressources). Et malgré l’évolution des cadres faisant la part belle aux échanges, à l’expression orale et au dépassement de soi, la tâche de ce formateur de dédramatiser la situation d’apprentissage collectif, rendre agréable et motivante la réalisation d’efforts, reste complexe et pluridimensionnelle surtout selon l’objectif de se préparer à se révéler au monde, être prêt pour l’action. Quelle que soit la méthode pédagogique, l’organisation didactique ou l’explicitation des objectifs, la manière de faire entrer l’apprenant dans la réflexion ainsi que de «déclencher» l’engagement, le passage à l’action (visible) peut donner des invariants utiles et utilisables pour une recherche autonome d’amélioration de son pouvoir d’agir et donc d’efficacité par et pour tout professionnel concerné
“Reservaction” is a new concept serving teacher’s and pupil’s empowerment. From years of observations to many dialogues and analyses of speeches about school guided by official text: Common Base of Knowledge, Skills and Culture and Syllabus. Anytime in class, in teaching-learning process, a pupil’s retreat attitude is usually noticed face to the teacher and the group (of other pupils with some other level). In spite of evolution of time with ascension of exchanges, oral and idea of “excellence”, make learning less daunting is complex and plural work for the teacher, especially with the aim of preparation, readiness for action in Society… Nevertheless methods, organization or explanation, the way of making students work, go in the work, in reflexion, in exertion (effort), and make the thing of visible action could give some important traces/characteristics for improve and win effectiveness by and for all professionals of education

Un contribuable qui souhaite se révolter contre l'impôt peut investir dans l'évasion ou l'évitement, émigrer, faire appel à des groupes de pression afin d'obtenir des privilèges fiscaux, se livrer à une grève de l'impôt ou joindre une organisation et soutenir une campagne de limitation fiscale par le biais d'un referendum populaire. La plupart d'entre elles ont été étudiées par les économistes et ont donné naissance à une abondante littérature. En particulier, un grand nombre de chercheurs ont tenté de mettre à jour la relation entre la révolte légale et illégale. Nous insisterons ici sur la relation entre la révolte privée et publique, une dichotomie ignorée jusqu'à présent. Apres avoir catalogué les différentes formes que peut prendre la contestation fiscale, nous expliquerons le besoin d'explorer de façon théorique et à travers des exemples historiques les causes de la révolte fiscale en fonction de la forme qu'elle revêt (Chapitre 1). Après avoir donné une vue d'ensemble de la littérature sur les différentes formes de révoltes, nous démontrerons la nécessité d'une littérature jointe, capable de mettre à jour l'interdépendance entre les révoltes publiques et privées (Chapitre 2). Nous formaliserons la relation entre la révolte privée et la révolte publique dans un modèle spécifiant les coûts et bénéfices pour le contribuable de chaque forme de révolte, et démontrant leur interdépendance (chapitre 3). Nous nous concentrerons sur l'application du modèle de révolte fiscale afin d'expliquer un ensemble de paradoxes liés à la réponse des contribuables à l'impôt. Nous expliquerons pourquoi les caractéristiques d'un impôt sur la propriété semblent le prédestiner aux mouvements de révoltes publiques à travers deux grands mouvements américains de limitation fiscale: la révolte de 1930 et la Proposition 13 (Chapitre 4). Puis, nous explorerons et illustrerons l'interdépendance et de la substitution d'une forme de révolte à une autre au moyen de l'histoire fiscale de la Poll tax, et du mouvement Poujade (Chapitre 5). Grâce au modèle d'interdépendance des révoltes fiscales, nous expliquerons enfin la différence de réaction à l'impôt des contribuables dans des pays comme la France, les Etats-Unis et la Russie (Chapitre 6).

Par assistance respiratoire mécanique partielle. Nous avons essayé de préciser la description du système hybride {Patient, Ventilateur} afin de construire un outil clinique de surveillance de l'IPV. Dans un premier temps, nous avons proposé d'aborder l'IPV comme la phénoménologie locale d'un réseau biologique communicant. L'IPV est alors la traduction de la communication établie à travers l'appareil respiratoire entre un oscillateur biologique et un oscillateur mécanique. Cette approche biologique permet à la fois d'utiliser les résultats de la théorie de la communication pour élaborer un score de désynchronisation, et de construire l'outil nécessaire pour calculer ce score en clinique. L'outil est un détecteur non-invasif de l'activité musculaire à partir de l'estimation de la pression musculaire par un modèle de la mécanique du système ventilatoire dont le traitement de signal est suffisamment robuste pour permettre son automatisation. Nous avons ensuite validé ces constructions chez des patients sous assistance partielle. Le score de désynchronisation est spécifiquement augmenté par la combinaison d'altérations de la voie de communication ou de la génération de l'activité inspiratoire à transmettre. La quantification automatique de l'IPV par un score spécifique de désynchronisation, reflet de l'altération de la transmission de l'information entre le patient et son ventilateur, et par une détection de l'activité inspiratoire, reflet du message à transmettre, devrait permettre d'améliorer l'analyse clinique du comportement des patients sous assistance partielle
Optimal Patient/Ventilator Interactions (PVI) is a determinant factor for pressure support therapy. We studied the hybrid system {Patient, Ventilator} in order to develop a clinical tool for PVI monitoring. In the first part, we described IPV as the expression of a local communication in a biological network. PVI reflect the communication process trough the respiratory system between a biological oscillator and a mechanical oscillator. This biological approach allows application of Shannon theory for the development of a de-synchronization score and the definition of an appropriate inspiratory muscle effort detector. For this purpose, we developed an automatic non-invasive detector based on a robust muscular pressure estimates continuously assessed with the help of passive mechanical respiratory models updated cycle by cycle. In the second part, we assessed these developments in patients under pressure support ventilation. The de-synchronization score was increased as the transmission channel was altered by additional noise or as the information source, the inspiratory effort, was decreased. An automatic titration of IPV by a de-synchronization score that assess channel transmission efficiency or by an inspiratory muscle effort detector that assess message generator efficiency might be helpful for respiratory function monitoring in patients under pressure support

Echelonne sur plusieurs annees, ce travail definit les parametres de la television a controle d'acces aux etats-unis, il retrace son histoire, esquisse le bilan de ses dix premieres annees d'existence et fait le point sur l'etat des techniques et des systemes qui permettront son essor et sa migration vers le numerique. Le memoire presente un panorama exhaustif de l'offre contemporaine et potentiel de programmes et de services offerst "a la carte", en evoquant a la fois les aspects techniques, economiques, sociologiques et accessoirement juridiques de la genese et de la croissance de la television a acces selectif. Enfin, une importance tout a fait particuliere est accordee a l'analyse de la convergence entre les differents grands groupes industriels des mondes de l'informatique, des telecommunications et des medias qui rend possible l'avenement de la television de demain, devenue interactive et transactionnelle
This thesis starts by defining conditional access television, otherwise known as "a la carte", and takes the reader through its first 10-year history. It discusses the technological, regulatory, sociological and business strategies underlying its development and its migration from analog pay-per-view to fully digital, fully switched, interactive television. The first part comprises an exhaustive review of the various services and program packages currently available on an "a la carte" basis in the united states and provides a description of their related distribution technology. The second part is devoted to an analysis and evaluation of the early forms of interactive television currently available in the united states. Finally, the third part analyzes the convergence between the entertainment, the telecommunications, and the computer industries currently under way, in order to allow the birth of a truly revolutionary new medium: interactive digital video delivered interchangeably via the television or the personal computer

Ce travail de recherche repose sur l’hypothèse selon laquelle les TICE (Technologies de l’Information et de la Communication pour l’Éducation), Internet et d’autres développements de systèmes d’information, modifient fondamentalement et en profondeur, l’approche du contexte du management des archives et de la documentation en Afrique. Notre étude porte sur le développement en cours des technologies de l'information en général et sur l’usage des TICE en particulier dans l’enseignement supérieur africain tout en mettant l'emphase sur les dispositifs sénégalais mis en œuvre à l'EBAD (École de bibliothécaires, Archivistes et Documentalistes de Dakar, Sénégal) et leur réception chez les professionnels africains. Un tel bouleversement numérique implique nécessairement de nouvelles méthodologies pensées pour l' « action informationnelle », les pratiques à distance, et de nouveaux savoir-faire dans le traitement, la gestion, la recherche et la diffusion de l’information. C'est pourquoi les professionnels africains de l’information-documentation sont conduits aujourd’hui à s’impliquer et à s'adapter dans un nouveau rôle de médiateurs de l’information, qui suppose l’acquisition et la maîtrise de nouvelles compétences éducatives, informationnelles, documentaires et sociotechniques. Rôle des professionnels africains d’autant plus indispensable que la majeure partie de nos concitoyens sont analphabètes, à plus de 60%, notamment dans les langues où les ressources du Nord sont écrites.Or, il est admis que ces compétences ne peuvent être acquises que par la formation, et c’est la raison pour laquelle nous nous sommes fixé comme objectifs, à travers nos trois études empiriques, de dresser dans un premier temps l’état des lieux de la formation dans les LIS africaines, puis en interrogeant des professionnels de l'information, d’analyser leurs pratiques et leurs usages de l'information et des dispositifs de formation à distance, leurs besoins propres en formation et enfin nous esquissons les bases d’une réflexion prospective sur les perspectives d’avenir des métiers de l'information documentation en Afrique, dans des environnements complexes et en perpétuel mouvement
This research work is based upon the assumption that the ICTEs (Information and Communication Technologies for Education), Internet and other Information systems developments bring about a deep and fundamental change to the approach of the overall context of archive and documentation management in Africa. Our survey concerns the current development of information technologies in general and particularly the use of ICTEs in higher education in Africa, focussing on the mechanisms implemented at the School for Librarians in Dakar, Senegal, “EBAD” (École des bibliothécaires, Archivistes et Documentalistes de Dakar) and the way they are received by the African specialists. Such a significant digital upheaval necessarily implies new methodologies devised for “informational activities”, remote work and new know-hows in the processing, management, research and sharing of information. For that reason, African information and documentation specialists are now led to get involved and adapt to their new role of information mediators, which implies that they acquire and master new educational, informational, documentary and sociotechnical capabilities.This new role of African specialists is all the more necessary as the vast majority of our fellow citizens are illiterate (more than 60%, particularly in languages used by northern countries for the exchange of cultural resources and information).Now these capabilities can admittedly be acquired only by training; this is why we have set our goals through our three empirical studies: firstly, to review the current state of training in the African LIS, secondly by asking the specialists questions, to assess their practice of information and distance learning methods and to identify their own training needs. Thirdly, we are laying the base for the reflection on future prospects of jobs in the field of information / documentation in Africa, in complex and ever-changing environments

Chez les eucaryotes, la transcription in vitro des gènes tARN par l'ARN polymérase C purifiée requiert au moins deux facteurs de transcription. Nous avons isolé l'un de ces facteurs à partir d’extraits acellulaires de levure par des méthodes chromatographiques conventionnelles et par chromatographie d'affinité sur colonne de gènes de tARN. Ce facteur, que nous avons appelé Tau, correspond à une protéine de poids moléculaire élevé (au moins 300. 000), probablement multimérique. Le facteur Tau forme des complexes stables et spécifiques avec les gênes de tARN. Par digestion ménagée de l’ADN par la DNase I et par méthylation partielle du gène, nous avons montré que le site de fixation du facteur à l’ADN est dédoublé et correspond aux deux blocs promoteurs internes, A et B, des gènes de tARN. Le facteur Tau est vraisemblablement constitué de deux domaines interagissant chacun avec un bloc promoteur. Le domaine Tau B, qui se lie à la région du bloc B, a pu être libéré par protéolyse ménagée du facteur. La liaison du facteur Tau à une série de gènes du tARN3Leu eu, dont la distance entre les blocs A et B varie de 0 à 74 paires de bases (pb), a été étudiée. La liaison de Tau est optimale lorsque les blocs A et B sont séparés par 28 à 62 pb ; ni la spécificité, ni la force de l’interaction ne sont affectées par des variations dans l’orientation hélicale relative des blocs A et B. Dans les autres cas, l'affinité moindre du facteur s'accompagne d'un affaiblissement ou même d'une perte de la liaison de Tau au bloc A. L’analyse des gènes courts (dont la distance AB est inférieure à 21 pb) a révélé des rôles différents pour chaque domaine de Tau : reconnaissance et ancrage de la protéine au gène, pour le domaine Tau B et positionnement correcte de l’ARN polymérase au site d'initiation de la transcription, pour le domaine Tau A.

Les travaux présentés dans ce mémoire se situent dans le domaine de l'Aide à la Décision. Les Systèmes Interactifs d'Aide à la Décision (SIAD) sont développés afin d'aider au mieux les décideurs dans les organisations. Cette aide doit se traduire par une amélioration du la qualité de prise de décision plutôt que par une amélioration de son efficacité. Le processus de décision assisté par des SIAD est alors envisagé comme une succession d'aller / retour entre le décideur (utilisateur) et la machine ; l'automatisation de tels processus n'est donc pas envisageable. Nous montrons dans un premier temps comment l'introduction des Technologies de l'Information et de la Communication (TIC) vient considérablement modifier les processus de décision dans les organisations. Basé sur ce constat, le nouveau contexte de prise de décision, c'est à dire en situation asynchrone et distribuée, est analysé. Le contexte de décision évolue d'une situation mono-décideur en situation multi-acteurs, chacun des acteurs devant interagir voire coopérer avec les autres. Ce type particulier de coopération pour la prise de décision est étudié. La prise de décision est alors définie comme un processus de décision collaborative. Nous montrons en quoi les systèmes coopératifs actuellement développés ne supportent pas efficacement ce type de processus coopératif. Pour ces nouvelles organisations de travail, nous définissons de nouveaux outils, atelier logiciel, capables de supporter ces processus de décision : les Systèmes Coopératifs d'Aide à la Décision (SCAD) basés sur l'architecture classique des SIAD proposée par Sprague et Carlsson.

La gestion de l'eau peut être un domaine complexe, incertain et conflictuel. Dans différentes régions du monde il se confronte à de nombreux problèmes, tel que la disparité des intérêts liés à la ressource de l’eau, plusieurs décideurs, des réseaux administratives complexes, la distribution d'eau inefficace, divers événements socio-politiques et le changement climatique. Par conséquent, la prise de décision a lieu dans un système fortement interconnecté, dans lequel ni les ramifications décisionnels ni la complexité de ses impacts peuvent être négligés. Dans la région des Pouilles, la rareté de l'eau est le principal problème croissant qui touche les communautés humaines et plus qu’humaines.La pénurie d'eau génère la nécessité d'améliorer les processus décisionnels collaboratifs avec agents multiples. Les chercheurs suggèrent que la «tragédie des communs» pourrait être évitée si une ressource partagée était gérée de manière collective. Cela nécessite le développement d'outils dynamiques d’aide à la décision. Ceux-ci devraient être capables d'intégrer les différents cadres de problèmes détenues par les décideurs, de clarifier les différences entre les cadres, de soutenir la création d'un processus collaboratif pour la structuration d’un problème et de fournir des plates-formes communes et des espaces d'interaction.À cet égard, nous avons construit un espace d'interaction dynamique (DIS), mettant en évidence les points critiques opératoires et permettant aux analystes d'identifier une définition commune du problème. Les nouveaux défis de la collecte et de l'échange de connaissances et de la représentation des concepts structurés peuvent être résolus par une approche combinée. Les systèmes multi-agents joints aux systèmes dynamiques pourraient fournir des alternatives non conventionnelles qui utilisent des composants physiques et sociales, avec une attention particulière sur les comportements individuels et collectifs dans la gestion des ressources avec plusieurs décideurs.Dans notre étude de cas, le modèle a été utilisé comme une plate-forme pour la modélisation des organisations multi-agents, afin de soutenir la prise de décision collective dans la gestion de l'eau. Le modèle est capable de représenter un système de gestion de l'eau distribuée complexe, où les comportements simulés sont basées sur des observations sur le terrain et sur la participation des parties prenantes. De plus, l'approche de système multi-agents permet l'interaction et la formalisation des comportements des usagers de l'eau dans le processus de gestion. Une modélisation type systèmes dynamiques dans un environnement d'interaction entre agents de décision, nous permet d’intégrer explicitement les différents cadres et de simuler les interactions lors de l'adoption d'une nouvelle politique. Le modèle peut montrer comment la compréhension limitée de l'espace d'interaction affecte les actions suivies par chacun des décideurs et, enfin, comment elle pourrait conduire à des mécanismes de résistance systémique. En conclusion, le résultat est l’image la plus riche possible de la situation du problème existant, qui traite de la gestion de l'eau d'irrigation dans les systèmes agricoles
Water resource management can be a complex, uncertain and conflictual domain. It faces numerous problems in many regions of the world, such as the disparity of interests associated with the water resource, multiple decision makers, complex networks of administration, inoperative water distribution, various socio-political events and climate change. Consequently, environmental decision-making takes place in a highly interconnected system, in which neither the decisional ramifications nor the complexity of its impacts can be neglected. In the Apulia Region, water scarcity is the main rising problem and is affecting human and more-than-human communities.Water scarcity generates the need to enhance collaborative multi-agent decision-making processes. Researchers suggest that the “tragedy of commons” could be avoided when a shared resource is at stake, provided that communities interact and operate in a collective way and avoid, for example, the market rules constraints. This requires the development of dynamic decision-aiding tools. They should be capable to integrate the different problem frames held by the decision makers, to clarify the differences among those frames, to support the creation of a collaborative problem structuring process and to provide shared platforms and interaction spaces.In this regard, we built a dynamic interaction space (DIS), highlighting the operative criticalities and allowing the analysts to identify a shared problem definition. The emerging issues of gathering and exchanging knowledge and representing structured concepts can be solved through a combined approach. Multi-agent systems joined with system dynamics can provide unconventional alternatives that use physical and social components, with a particular focus on individual and collective behaviours in resource management with multiple decision makers.In our case study, the model was used as a platform for modelling multi-agent organizations, in order to support collective decision-making in water management. The model is capable of representing a distributed complex water management system, where simulated behaviours are based on field observations and on the participation of stakeholders. What is more, the multi–agent system approach enables the interaction and allows to formalize theIrene Pluchinotta – “Multi-Agent Modelling For Distributed Intelligent Decision In Water Management”iibehaviours of water users in the management process. A system dynamics modelling in an environment of interacting decision agents, allows us to explicitly consider the different frames and to simulate interactions when adopting a new policy. The model can showcase how the limited understanding of the interaction space affects the actions followed by each decision-makers and, finally, how it could lead to policy resistance mechanisms. In conclusion, the result is the richest possible picture of the existing problem situation that deals with irrigation water management in agricultural systems

碩士
臺灣大學
化學工程學研究所
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Proteins are essential elements for living organisms and play a crucial role in various physiological activities. An enzyme is a protein molecule that serves as a biological catalyst. Proteins/enzymes with correct conformations are able to serve appropriate biological functions. Proteins that misfold may not only lose their normal biological function but also form aggregates which lead to a variety of diseases. In this thesis, we attempt to explore the interactions between the polypeptides and protein molecules. The preservation of protein conformation was carried out by copolypeptides with different compositions through various processes such as entrapment, or adsorption. Moreover, we examined the effects of polypeptides on folding, structural changes, aggregation, and amyloid fibrillation of proteins. In the first part of the thesis, we report the immobilization of a model enzyme, papain, within silica matrices by combining vesiclization of poly-L-lysine-b-polyglycine block copolypeptides with following silica mineralization. The polypeptide mediated silica-immobilized enzyme exhibits enhanced pH and thermal stability and reusability, comparing with the free enzyme and the vesicle encapsulated enzyme (e.g. after 48 hr incubation at 25°C, the percentage residual activities for the immobilized and the untreated papain samples were found to be ~68.5% and ~29.6% of that of the free papain at 0 hr, respectively). The enhanced enzymatic activity in the immobilized enzyme is due to the confinement of the enzyme in the polypeptide mediated silica matrices. Kinetic analysis shows that the enzyme functionality is determined by the structure and property of silica/polypeptide matrices. In the second part of the thesis, with hen egg-white lysozyme and bovine insulin as the model systems, we show the results regarding the influences of two random copolypeptide D,L-lysine-co-glycine and D,L-lysine-co-L-phenylalanine on the in vitro protein fibrillation. Our TEM and ThT fluorescence results show that the observed inhibitory effects on amyloid fibrillation are significantly dependent on the amount and the composition ratio of polypeptide chains. For instance, the percentage reduction in hen lysozyme fibrillation was found to be approximately 35 % or 65% for the case of 1 mM or 2 mM random copolypeptide, respectively. The addition of 0.5 mM or 1 mM random copolypeptide results in approximately 25 % or 80% reduction, respectively, in fibrillogenesis derived from bovine insulin. The copolypeptides with a higher fraction of glycine or L-phenylalanine residue exhibit higher inhibitory potency against fibril formation. Moreover, we examine the structural changes in both proteins and inhibition mechanisms through CD spectroscopy, ANS fluorescence, intrinsic fluorescence spectroscopy, and SDS-PAGE. The major driving forces for the association of HEWL and copolypeptides are likely hydrogen bonding and hydrophobic interactions. We believe that the outcome of this work may contribute to the understanding of molecular mechanism(s) of the fibril formation and provide potential treatment strategies against the amyloid formation associated with amyloid disease.