Увійти

Готові списки джерел за темами / DNA unzipping / Статті в журналах

Статті в журналах з теми "DNA unzipping"

Щоб переглянути інші типи публікацій з цієї теми, перейдіть за посиланням: DNA unzipping.

Автор: Grafiati

Опубліковано: 14 березня 2023

Оформте джерело за APA, MLA, Chicago, Harvard та іншими стилями

Оберіть тип джерела:

Ознайомтеся з топ-50 статей у журналах для дослідження на тему "DNA unzipping".

Біля кожної праці в переліку літератури доступна кнопка «Додати до бібліографії». Скористайтеся нею – і ми автоматично оформимо бібліографічне посилання на обрану працю в потрібному вам стилі цитування: APA, MLA, «Гарвард», «Чикаго», «Ванкувер» тощо.

Також ви можете завантажити повний текст наукової публікації у форматі «.pdf» та прочитати онлайн анотацію до роботи, якщо відповідні параметри наявні в метаданих.

Переглядайте статті в журналах для різних дисциплін та оформлюйте правильно вашу бібліографію.

1

Krautbauer, Rupert, Matthias Rief, and Hermann E. Gaub. "Unzipping DNA Oligomers." Nano Letters 3, no. 4 (April 2003): 493–96. http://dx.doi.org/10.1021/nl034049p.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

2

Chakrabarti, Buddhapriya, and David R. Nelson. "Shear Unzipping of DNA†." Journal of Physical Chemistry B 113, no. 12 (March 26, 2009): 3831–36. http://dx.doi.org/10.1021/jp808232p.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

3

Kafri, Y., D. Mukamel, and L. Peliti. "Melting and unzipping of DNA." European Physical Journal B - Condensed Matter 27, no. 1 (May 1, 2002): 135–46. http://dx.doi.org/10.1140/epjb/e20020138.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

4

Amnuanpol, Sitichoke. "Physical origin of DNA unzipping." Journal of Biological Physics 42, no. 1 (August 26, 2015): 69–82. http://dx.doi.org/10.1007/s10867-015-9393-0.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

5

Lubensky, David K., and David R. Nelson. "Pulling Pinned Polymers and Unzipping DNA." Physical Review Letters 85, no. 7 (August 14, 2000): 1572–75. http://dx.doi.org/10.1103/physrevlett.85.1572.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

6

Volkov, S. N., and A. V. Solov’yov. "The mechanism of DNA mechanical unzipping." European Physical Journal D 54, no. 3 (June 30, 2009): 657–66. http://dx.doi.org/10.1140/epjd/e2009-00194-5.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

7

CALVO, J., J. NIETO, J. SOLER, and M. O. VÁSQUEZ. "ON A DISPERSIVE MODEL FOR THE UNZIPPING OF DOUBLE-STRANDED DNA MOLECULES." Mathematical Models and Methods in Applied Sciences 24, no. 03 (December 29, 2013): 495–511. http://dx.doi.org/10.1142/s0218202513500577.

Повний текст джерела

Анотація:

The paper deals with the analysis of a nonlinear Fokker–Planck equation modeling the mechanical unzipping of double-stranded DNA under the influence of an applied force. The dependent variable is the probability density of unzipping m base pairs. The nonlinear Fokker–Planck equation we propose here is obtained when we couple the model proposed in [D. K. Lubensky and D. R. Nelson, Pulling pinned polymers and unzipping DNA, Phys. Rev. Lett.85 (2000) 1572–1575] with a transcendental equation for the applied force. The resulting model incorporates nonlinear effects in a different way than the usual models in kinetic theory. We show the well-posedness of this model. For that we require a combination of techniques coming from second-order kinetic equations and compensated compactness arguments in conservation laws.

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

8

Mathé, Jérôme, Hasina Visram, Virgile Viasnoff, Yitzhak Rabin, and Amit Meller. "Nanopore Unzipping of Individual DNA Hairpin Molecules." Biophysical Journal 87, no. 5 (November 2004): 3205–12. http://dx.doi.org/10.1529/biophysj.104.047274.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

9

Viasnoff, V., N. Chiaruttini, J. Muzard, and U. Bockelmann. "Force fluctuations assist nanopore unzipping of DNA." Journal of Physics: Condensed Matter 22, no. 45 (October 29, 2010): 454122. http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/22/45/454122.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

10

Li, Xinqiong, Guiqin Song, Linqin Dou, Shixin Yan, Ming Zhang, Weidan Yuan, Shirong Lai, et al. "The structure and unzipping behavior of dumbbell and hairpin DNA revealed by real-time nanopore sensing." Nanoscale 13, no. 27 (2021): 11827–35. http://dx.doi.org/10.1039/d0nr08729g.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

11

Lin, Yao, Xin Shi, Shao-Chuang Liu, Yi-Lun Ying, Qiao Li, Rui Gao, Farkhondeh Fathi, Yi-Tao Long, and He Tian. "Characterization of DNA duplex unzipping through a sub-2 nm solid-state nanopore." Chemical Communications 53, no. 25 (2017): 3539–42. http://dx.doi.org/10.1039/c7cc00060j.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

12

Weeks, J. D., J. B. Lucks, Y. Kafri, C. Danilowicz, D. R. Nelson, and M. Prentiss. "Pause Point Spectra in DNA Constant-Force Unzipping." Biophysical Journal 88, no. 4 (April 2005): 2752–65. http://dx.doi.org/10.1529/biophysj.104.047340.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

13

Hiroshima, M., and M. Tokunaga. "DNA Unzipping measurement with an ultrasensitive probe microscope." Seibutsu Butsuri 43, supplement (2003): S223. http://dx.doi.org/10.2142/biophys.43.s223_2.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

14

Lakatos, Greg, Tom Chou, Birger Bergersen, and Gren N. Patey. "First passage times of driven DNA hairpin unzipping." Physical Biology 2, no. 3 (September 12, 2005): 166–74. http://dx.doi.org/10.1088/1478-3975/2/3/004.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

15

Bergues-Pupo, Ana Elisa, Fernando Falo, and Alessandro Fiasconaro. "Resonant optimization in the mechanical unzipping of DNA." EPL (Europhysics Letters) 105, no. 6 (March 1, 2014): 68005. http://dx.doi.org/10.1209/0295-5075/105/68005.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

16

Singh, N., and Y. Singh. "Statistical theory of force-induced unzipping of DNA." European Physical Journal E 17, no. 1 (March 18, 2005): 7–19. http://dx.doi.org/10.1140/epje/i2004-10100-7.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

17

Stachiewicz, Anna, and Andrzej Molski. "Diffusive dynamics of DNA unzipping in a nanopore." Journal of Computational Chemistry 37, no. 5 (October 31, 2015): 467–76. http://dx.doi.org/10.1002/jcc.24236.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

18

Koch, Steven J., Alla Shundrovsky, Benjamin C. Jantzen, and Michelle D. Wang. "Probing Protein-DNA Interactions by Unzipping a Single DNA Double Helix." Biophysical Journal 83, no. 2 (August 2002): 1098–105. http://dx.doi.org/10.1016/s0006-3495(02)75233-8.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

19

Tee, Shern Ren, and Zhisong Wang. "How Well Can DNA Rupture DNA? Shearing and Unzipping Forces inside DNA Nanostructures." ACS Omega 3, no. 1 (January 10, 2018): 292–301. http://dx.doi.org/10.1021/acsomega.7b01692.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

20

Meng, Fu-Na, Zi-Yuan Li, Yi-Lun Ying, Shao-Chuang Liu, Junji Zhang, and Yi-Tao Long. "Structural stability of the photo-responsive DNA duplexes containing one azobenzene via a confined pore." Chemical Communications 53, no. 68 (2017): 9462–65. http://dx.doi.org/10.1039/c7cc04599a.

Повний текст джерела

Анотація:

Herein, the structural stability of single azobenzene modified DNA duplexes, including the trans form and cis form, has been examined separately based on their distinguishable unzipping kinetics from the mixture by an α-hemolysin nanopore.

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

21

Bockelmann, U., and V. Viasnoff. "Theoretical Study of Sequence-Dependent Nanopore Unzipping of DNA." Biophysical Journal 94, no. 7 (April 2008): 2716–24. http://dx.doi.org/10.1529/biophysj.107.111732.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

22

OHARA, Masayuki, Yusuke SEKIYA, and Ryuji KAWANO. "Hairpin DNA Unzipping Analysis Using a Biological Nanopore Array." Electrochemistry 84, no. 5 (2016): 338–41. http://dx.doi.org/10.5796/electrochemistry.84.338.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

23

Bhattacharjee, Somendra M., and D. Marenduzzo. "DNA sequence from the unzipping force? One mutation problem." Journal of Physics A: Mathematical and General 35, no. 26 (June 21, 2002): L349—L356. http://dx.doi.org/10.1088/0305-4470/35/26/101.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

24

Xiao-Feng, Wang, Lei Xiao-Ling, and Fang Hai-Ping. "What Governs the Unzipping Process of Double-Stranded DNA." Chinese Physics Letters 23, no. 5 (April 28, 2006): 1339–42. http://dx.doi.org/10.1088/0256-307x/23/5/076.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

25

Kapri, Rajeev, and Somendra M. Bhattacharjee. "Unzipping DNA by force: thermodynamics and finite size behaviour." Journal of Physics: Condensed Matter 18, no. 14 (March 24, 2006): S215—S223. http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/18/14/s06.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

26

Kumar, Sanjay, and Debaprasad Giri. "Probability distribution analysis of force induced unzipping of DNA." Journal of Chemical Physics 125, no. 4 (July 28, 2006): 044905. http://dx.doi.org/10.1063/1.2219115.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

27

Bergues-Pupo, A. E., J. M. Bergues, and F. Falo. "Unzipping of DNA under the influence of external fields." Physica A: Statistical Mechanics and its Applications 396 (February 2014): 99–107. http://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2013.10.050.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

28

Mathé, J., A. Arinstein, Y. Rabin, and A. Meller. "Equilibrium and irreversible unzipping of DNA in a nanopore." Europhysics Letters (EPL) 73, no. 1 (January 2006): 128–34. http://dx.doi.org/10.1209/epl/i2005-10368-7.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

29

Volkov, Sergey N., Ekaterina V. Paramonova, Alexander V. Yakubovich, and Andrey V. Solov’yov. "Micromechanics of base pair unzipping in the DNA duplex." Journal of Physics: Condensed Matter 24, no. 3 (December 16, 2011): 035104. http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/24/3/035104.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

30

Cervantes-Salguero, Keitel, Ibuki Kawamata, Shin-ichiro M. Nomura, and Satoshi Murata. "Unzipping and shearing DNA with electrophoresed nanoparticles in hydrogels." Physical Chemistry Chemical Physics 19, no. 21 (2017): 13414–18. http://dx.doi.org/10.1039/c7cp02214j.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

31

Lam, Pui-Man, J. C. S. Levy, and Hanchen Huang. "Excluded volume effect in unzipping DNA with a force." Biopolymers 73, no. 3 (2004): 293–300. http://dx.doi.org/10.1002/bip.10584.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

32

Herskowitz, Lawrence J., Anthony L. Salvagno, Linh Le, and Steven J. Koch. "Proof of Principle for Shotgun DNA Mapping by Unzipping." Biophysical Journal 96, no. 3 (February 2009): 291a. http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2008.12.1442.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

33

Dame, Remus T., Michael A. Hall, and Michelle D. Wang. "Single-Molecule Unzipping Force Analysis of HU-DNA Complexes." ChemBioChem 14, no. 15 (September 2, 2013): 1954–57. http://dx.doi.org/10.1002/cbic.201300413.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

34

Rissone, Paolo, and Felix Ritort. "Nucleic Acid Thermodynamics Derived from Mechanical Unzipping Experiments." Life 12, no. 7 (July 20, 2022): 1089. http://dx.doi.org/10.3390/life12071089.

Повний текст джерела

Анотація:

Force-spectroscopy techniques have led to significant progress in studying the physicochemical properties of biomolecules that are not accessible in bulk assays. The application of piconewton forces with laser optical tweezers to single nucleic acids has permitted the characterization of molecular thermodynamics and kinetics with unprecedented accuracy. Some examples are the hybridization reaction between complementary strands in DNA and the folding of secondary, tertiary, and other heterogeneous structures, such as intermediate and misfolded states in RNA. Here we review the results obtained in our lab on deriving the nearest-neighbor free energy parameters in DNA and RNA duplexes from mechanical unzipping experiments. Remarkable nonequilibrium effects are also observed, such as the large irreversibility of RNA unzipping and the formation of non-specific secondary structures in single-stranded DNA. These features originate from forming stem-loop structures along the single strands of the nucleic acid. The recently introduced barrier energy landscape model quantifies kinetic trapping effects due to stem-loops being applicable to both RNA and DNA. The barrier energy landscape model contains the essential features to explain the many behaviors observed in heterogeneous nucleic-acid folding.

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

35

Bujold, Katherine E., Johans Fakhoury, Thomas G. W. Edwardson, Karina M. M. Carneiro, Joel Neves Briard, Antoine G. Godin, Lilian Amrein, et al. "Sequence-responsive unzipping DNA cubes with tunable cellular uptake profiles." Chem. Sci. 5, no. 6 (2014): 2449–55. http://dx.doi.org/10.1039/c4sc00646a.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

36

Barbieri, Carlo, Simona Cocco, Rémi Monasson, and Francesco Zamponi. "Dynamical modeling of molecular constructions and setups for DNA unzipping." Physical Biology 6, no. 2 (July 1, 2009): 025003. http://dx.doi.org/10.1088/1478-3975/6/2/025003.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

37

Liu, Aihua, Qitao Zhao, D. M. Milan Krishantha та Xiyun Guan. "Unzipping of Double-Stranded DNA in Engineered α-Hemolysin Pores". Journal of Physical Chemistry Letters 2, № 12 (23 травня 2011): 1372–76. http://dx.doi.org/10.1021/jz200525v.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

38

Lam, Pui-Man, and Yi Zhen. "Force induced unzipping of DNA with long range correlated noise." Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment 2011, no. 06 (June 30, 2011): P06023. http://dx.doi.org/10.1088/1742-5468/2011/06/p06023.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

39

Zhang, Jie, Yunqi Yan, Soumyadyuti Samai, and David S. Ginger. "Dynamic Melting Properties of Photoswitch-Modified DNA: Shearing versus Unzipping." Journal of Physical Chemistry B 120, no. 41 (October 7, 2016): 10706–13. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.6b08297.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

40

Kafri, Y., D. Mukamel, and L. Peliti. "Denaturation and unzipping of DNA: statistical mechanics of interacting loops." Physica A: Statistical Mechanics and its Applications 306 (April 2002): 39–50. http://dx.doi.org/10.1016/s0378-4371(02)00483-1.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

41

Muzard, J., M. Martinho, J. Mathé, U. Bockelmann, and V. Viasnoff. "DNA Translocation and Unzipping through a Nanopore: Some Geometrical Effects." Biophysical Journal 98, no. 10 (May 2010): 2170–78. http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2010.01.041.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

42

Stachiewicz, Anna, and Andrzej Molski. "Sequence-Dependent Unzipping Dynamics of DNA Hairpins in a Nanopore." Journal of Physical Chemistry B 123, no. 15 (March 28, 2019): 3199–209. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.9b00183.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

43

Lam, Pui-Man, and J. C. Levy. "Unzipping DNA from the condensed globule state—Effects of unraveling." Biopolymers 79, no. 6 (2005): 287–91. http://dx.doi.org/10.1002/bip.20292.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

44

Cocco, S., R. Monasson, and J. F. Marko. "Force and kinetic barriers to unzipping of the DNA double helix." Proceedings of the National Academy of Sciences 98, no. 15 (July 10, 2001): 8608–13. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.151257598.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

45

Lee, C. H., C. Danilowicz, R. S. Conroy, V. W. Coljee та M. Prentiss. "Impacts of magnesium ions on the unzipping of λ-phage DNA". Journal of Physics: Condensed Matter 18, № 14 (24 березня 2006): S205—S213. http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/18/14/s05.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

46

Sutherland, Todd C., Michael J. Dinsmore, Heinz-Bernhard Kraatz, and Jeremy S. Lee. "An analysis of mismatched duplex DNA unzipping through a bacterial nanopore." Biochemistry and Cell Biology 82, no. 3 (June 1, 2004): 407–12. http://dx.doi.org/10.1139/o04-005.

Повний текст джерела

Анотація:

A 50-base Guide strand was synthesized that consisted of a central 10-base probe sequence flanked by two tracts of 20 adenine residues. Target sequences of 10 bases containing up to three mismatches were prepared and hybridized to the Guide strand in 1 M KCl. The transport of these constructs through single α-hemolysin pores was analysed by measuring the current blockade as a function of time. Complementary dsDNA takes significantly longer (840 ± 60 µs) to pass through the pore than a sequence of the same length containing a single (590 ± 45 µs) and a double (270 ± 50 µs) mismatch. Constructs involving three mismatches were indistinguishable from Guide ssDNA transport (120 ± 30 µs). The results suggest that dsDNA must unzip as it is transported through the nanopore. Duplexes containing mismatches unzip more quickly and can be distinguished from those with perfect complementarity.Key words: DNA unzipping, bacterial nanopores, DNA transport, single-molecule detection, DNA mismatch.

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

47

Rao, V. B. "A virus DNA gate: Zipping and unzipping the packed viral genome." Proceedings of the National Academy of Sciences 106, no. 21 (May 18, 2009): 8403–4. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.0903670106.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

48

Bockelmann, U., Ph Thomen, B. Essevaz-Roulet, V. Viasnoff, and F. Heslot. "Unzipping DNA with Optical Tweezers: High Sequence Sensitivity and Force Flips." Biophysical Journal 82, no. 3 (March 2002): 1537–53. http://dx.doi.org/10.1016/s0006-3495(02)75506-9.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

49

Nelson, David R. "Extended Abstract: Plateaus and Jumps in Single-Molecule DNA Unzipping Experiments." Journal of Biological Physics 31, no. 3-4 (December 2005): 241–42. http://dx.doi.org/10.1007/s10867-005-6062-8.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

50

Perera, Rukshan T., Aaron M. Fleming, Amberlyn M. Peterson, Jennifer M. Heemstra, Cynthia J. Burrows та Henry S. White. "Unzipping of A-Form DNA-RNA, A-Form DNA-PNA, and B-Form DNA-DNA in the α-Hemolysin Nanopore". Biophysical Journal 110, № 2 (січень 2016): 306–14. http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2015.11.020.

Повний текст джерела

Стилі APA, Harvard, Vancouver, ISO та ін.

Ми пропонуємо знижки на всі преміум-плани для авторів, чиї праці увійшли до тематичних добірок літератури. Зв'яжіться з нами, щоб отримати унікальний промокод!