Добірка наукової літератури з теми "CcdA antitoxin"
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Статті в журналах з теми "CcdA antitoxin"
Aguirre-Ramírez, Marisela, Jesús Ramírez-Santos, Laurence Van Melderen, and M. Carmen Gómez-Eichelmann. "Expression of the F plasmid ccd toxin–antitoxin system in Escherichia coli cells under nutritional stress." Canadian Journal of Microbiology 52, no. 1 (January 1, 2006): 24–30. http://dx.doi.org/10.1139/w05-107.
Повний текст джерелаBurger, Virginia M., Alexandra Vandervelde, Jelle Hendrix, Albert Konijnenberg, Frank Sobott, Remy Loris, and Collin M. Stultz. "Hidden States within Disordered Regions of the CcdA Antitoxin Protein." Journal of the American Chemical Society 139, no. 7 (February 8, 2017): 2693–701. http://dx.doi.org/10.1021/jacs.6b11450.
Повний текст джерелаMadl, Tobias, Laurence Van Melderen, Natacha Mine, Michal Respondek, Monika Oberer, Walter Keller, Leila Khatai, and Klaus Zangger. "Structural Basis for Nucleic Acid and Toxin Recognition of the Bacterial Antitoxin CcdA." Journal of Molecular Biology 364, no. 2 (November 2006): 170–85. http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2006.08.082.
Повний текст джерелаLepka, Daniela, Tobias Kerrinnes, Evelyn Skiebe, Birgitt Hahn, Angelika Fruth, and Gottfried Wilharm. "Adding toYersinia enterocoliticaGene Pool Diversity: Two Cryptic Plasmids from a Biotype 1A Isolate." Journal of Biomedicine and Biotechnology 2009 (2009): 1–10. http://dx.doi.org/10.1155/2009/398434.
Повний текст джерелаKwak, Yee Gyung, George A. Jacoby, and David C. Hooper. "Effect of Qnr on Plasmid Gyrase Toxins CcdB and ParE." Antimicrobial Agents and Chemotherapy 59, no. 8 (June 8, 2015): 5078–79. http://dx.doi.org/10.1128/aac.00524-15.
Повний текст джерелаCotrim, Camila Aparecida, Saulo Santesso Garrido, Eliane Trovatti, and Reinaldo Marchetto. "Síntese, caracterização e estudos de interação de um análogo da antitoxina CcdA empregando fluorescência no estado estacionário." Química Nova 33, no. 4 (2010): 841–45. http://dx.doi.org/10.1590/s0100-40422010000400014.
Повний текст джерелаWu, Alma Y., Muhammad Kamruzzaman, and Jonathan R. Iredell. "Specialised functions of two common plasmid mediated toxin-antitoxin systems, ccdAB and pemIK, in Enterobacteriaceae." PLOS ONE 15, no. 6 (June 30, 2020): e0230652. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0230652.
Повний текст джерелаIsaeva, A. S., E. E. Kulikov, N. V. Ravin, B. D. Dorokhov, K. K. Tarasyan, and A. V. Letarov. "Application of the new ccdAB-type natural toxin-antitoxin module for stabilization of inheritance of expressive plasmid vectors based on the bacteriophage N15 replicon in Escherichia coli cells." Microbiology 79, no. 5 (October 2010): 638–45. http://dx.doi.org/10.1134/s0026261710050085.
Повний текст джерелаHudson, Lauren K., Lisha Constantine-Renna, Linda Thomas, Christina Moore, Xiaorong Qian, Katie Garman, John R. Dunn, and Thomas G. Denes. "Genomic characterization and phylogenetic analysis of Salmonella enterica serovar Javiana." PeerJ 8 (November 20, 2020): e10256. http://dx.doi.org/10.7717/peerj.10256.
Повний текст джерелаChandra, Soumyanetra, Kritika Gupta, Shruti Khare, Pehu Kohli, Aparna Asok, Sonali Vishwa Mohan, Harsha Gowda, and Raghavan Varadarajan. "The high mutational sensitivity of ccdA antitoxin is linked to codon optimality." Molecular Biology and Evolution, September 7, 2022. http://dx.doi.org/10.1093/molbev/msac187.
Повний текст джерелаДисертації з теми "CcdA antitoxin"
Saavedra, De Bast Manuel. "Systèmes Ta de la famille ccd, de simples gènes égoïstes?" Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2009. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210045.
Повний текст джерелаEntre-temps, la compréhension de l’évolution des génomes bactériens a connu des avancées significatives. L’impressionnante capacité d’adaptation des bactéries est aujourd’hui majoritairement attribuée au transfert horizontal de gènes (THG) provoqué par les éléments génétiques mobiles (phages, plasmides, transposons…). Dans le débat du rôle des systèmes TA chromosomiques, très peu d’attention a été accordée aux relations phylogénétiques et interactions entre systèmes plasmidiques et chromosomiques co-existant au sein d’un même hôte ainsi qu’à l’impact du THG sur leur évolution. Notre travail de thèse vise à mieux comprendre la biologie des systèmes TA en tenant compte de ces paramètres. Nous nous sommes intéressés à des systèmes homologues au système plasmidique ccdF. Nous avons étudié expérimentalement les 4 systèmes ccd (ccd1, ccd2, ccd3 et ccd4) qui co-habitent au sein du chromosome d’Erwinia chrysanthemi 3937 (une bactérie phytopathogène), leurs interactions intragénomiques et les interactions de ces systèmes avec le système plasmidique ccdF. Ce cadre expérimental a mené à la construction du modèle d’anti-addiction. Ce modèle propose que certains systèmes chromosomiques puissent conférer un avantage sélectif à leurs hôtes bactériens en interférant avec le PSK médié par leurs homologues plasmidiques. Cet avantage sélectif pourrait permettre la fixation de systèmes TA latéralement acquis au sein des populations bactériennes. Nous avons également recherché de nouveaux systèmes ccd au sein des génomes bactériens afin d’avoir un aperçu de leur distribution, des contextes génétiques dans lesquels ils existent et de l’implication du THG dans leur dispersion. Les réflexions qui ont accompagné notre recherche nous ont mené à proposer une synthèse sur le rôle des systèmes TA (plasmidiques et chromosomiques). Celle-ci se nourrit des avancées qui ont été effectuées, ces dernières années, dans la compréhension de l’évolution des génomes bactériens, de la théorie hiérarchique de la sélection naturelle et des processus non-adaptatifs et contingents qui pourraient expliquer la présence et la propagation des systèmes TA au sein des génomes bactériens sans que ceux-ci en soient les agents causaux.
Doctorat en sciences, Spécialisation biologie moléculaire
info:eu-repo/semantics/nonPublished
Wilbaux, Myriam. "Le système toxine-antitoxine ccdO157 d'Escherichia coli: caractérisation fonctionelle et distribution." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2008. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210503.
Повний текст джерелаAu cours de ce travail, nous avons caractérisé un homologue du système toxine-antitoxine ccd du plasmide F (ccdF) qui se situe dans le chromosome de la souche pathogène E. coli O157:H7 EDL933 entre les gènes folA et apaH (ccdO157). Les systèmes ccdF et ccdO157 coexistent naturellement dans les souches d’E. coli O157:H7, le système ccdF se trouvant sur le plasmide pO157 qui dérive du plasmide F. Nos résultats montrent que l’antitoxine plasmidique CcdAF neutralise l’effet de la toxine chromosomique CcdBO157, tandis que l’antitoxine chromosomique CcdAO157 ne contrecarre pas la toxicité de la toxine plasmidique CcdBF. Nous avons également montré que le système ccdF cause une tuerie post-ségrégationelle, lorsqu’il est cloné dans un plasmide instable, dans une souche possédant le système chromosomique ccdO157. Le système ccdF est donc fonctionnel en présence de son homologue chromosomique.
Le système ccdO157 est absent du chromosome de la souche de laboratoire E. coli K-12 MG1655, où une région intergénique de 77 pb sépare les gènes folA et apaH. Celle-ci contient une séquence cible pour la transposition. Nous avons étudié la distribution du système ccdO157 au sein de 523 souches d’E. coli représentatives de l’ensemble des sérogroupes décrits. Nos résultats montrent que le système ccdO157 est présent au sein de souches appartenant à 47 sérogroupes différents. Nos résultats mettent en évidence la diversité de la région intergénique folA-apaH d’E. coli. Celle-ci peut contenir gènes codant pour des protéines présentant de l’homologie avec des protéines d’espèce bactériennes éloignées d’E. coli ou d’organismes eucaryotes, ainsi qu’un élément génétique mobile, l’IS621, ce qui montre que le système ccdO157 a intégré le chromosome d’E. coli via le transfert horizontal de gènes.
Doctorat en Sciences
info:eu-repo/semantics/nonPublished
Tandon, Himani. "Computational studies on interacting proteins with special reference to toxin-antitoxin systems." Thesis, 2019. https://etd.iisc.ac.in/handle/2005/4971.
Повний текст джерелаGuptha, Kritika. "Molecular Determinants of Mutant Phenotypes in the CcdAB Toxin -Antitoxin System." Thesis, 2017. http://etd.iisc.ernet.in/2005/3634.
Повний текст джерелаGuptha, Kritika. "Molecular Determinants of Mutant Phenotypes in the CcdAB Toxin -Antitoxin System." Thesis, 2016. http://etd.iisc.ac.in/handle/2005/3634.
Повний текст джерелаWang, Ling Yi, and 王齡苡. "CcdAB(Sm), a Chromosomal Toxin-Antitoxin Module, Mediates Cell Death in Serratia marcescens Multicellular Behavior." Thesis, 2010. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/64863291456604535525.
Повний текст джерела長庚大學
醫學生物技術暨檢驗學系
98
Toxin-antitoxin (TA) modules are gene pairs specifying for a toxin and its cognate antitoxin and are found on the chromosomes of many bacteria including pathogens. It has been demonstrated that chromosomal TA systems influence bacterial multicellular behaviors such as biofilm formation and fruiting body formation. However, the role of TA systems in swarming behavior, another type of bacterial multicellular behavior, remains elusive. Swarming is a complex multicellular behavior requires the integration of chemical and physical signals, which leads to the physiological and morphological differentiation of the bacteria from nonmotile vegetative cells into highly-motile swarmer cells. Here we demonstrated that approximately 90% of cells undergo cell death in vegetative cell population during swarming development in Serratia marcescens. A pair of chromosomal TA module named ccdAB(Sm) was identified. Deletion of ccdAB(Sm) caused dramatic reduction of dead cells during swarming development and showed precocious swarming motility. Interestingly, deletion of rssBA, a two-component system regulating swarming initiation, also reduced cell death during swarming. Furthermore, the transcription of ccdAB(Sm) and their upstream genes are negatively regulated by RssAB signaling which led to cell death in early swarming development. Taken together, these findings provide evidences that RssAB regulates cell death through a chromosomal TA module, CcdAB(Sm), in swarming development.
Bhowmick, Jayantika. "CcdB : Stability, folding and application to design novel antibacterials." Thesis, 2020. https://etd.iisc.ac.in/handle/2005/5134.
Повний текст джерелаMHRD, India
Частини книг з теми "CcdA antitoxin"
Deghorain, Marie, Nathalie Goeders, Thomas Jové, and Laurence Van Melderen. "Type II Toxin-Antitoxin Loci: The ccdAB and parDE Families." In Prokaryotic Toxin-Antitoxins, 45–67. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2012. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-33253-1_4.
Повний текст джерела