Дисертації з теми "004:61"

Objetivos La medicina traslacional requiere la explotación integrada de información biomédica para dar soporte a la investigación, sin embargo, resulta difícil el acceso al conocimiento biomédico, por ser heterogéneo y estar distribuido entre distintos sistemas de información. El objetivo principal de esta tesis es la investigación y desarrollo de soluciones basadas en las tecnologías de la Web Semántica para la integración de conocimiento biomédico utilizado en medicina traslacional. Metodología Para conseguir este objetivo, primero se lleva a cabo un estudio del estado del arte que incluye los formatos de representación más comunes de la información biomédica, las tecnologías de la Web Semántica y su aplicación en el ámbito biomédico, las propuestas de transformación de contenidos a representación semántica y los sistemas de integración de repositorios heterogéneos. Después, la solución propuesta se formaliza en tres pasos: (1) formalización de una metodología de transformación genérica de información, (2) formalización de un proceso de integración de recursos heterogéneos basado en transformación a una ontología OWL, (3) formalización de una plataforma de integración, gestión y explotación de información biomédica. Todas estas soluciones se implementan en herramientas web. Por último, las soluciones propuestas se validan en cuatro escenarios diferentes: clasificación automática de pacientes a partir de sus datos clínicos dentro un programa de cribado de cáncer de colon y recto; transformación entre modelos clínicos CEM y arquetipos openEHR; creación de un repositorio integrado de genes ortólogos, enfermedades y anotaciones sobre secuencias genómicas; representación OWL de bases de datos de componentes químicos. Resultados Como resultado se obtiene: • Un modelo de transformación genérica de datos. Está compuesto de reglas de correspondencia que permiten la transformación de instancias de entrada a una representación según un modelo de salida, de reglas de identidad que identifican instancias redundantes, y que usa patrones de diseño para realizar transformaciones más complejas. • Un modelo de integración de información biomédica heterogénea, que aplica el modelo de transformación y tiene como modelo de salida una arquitectura ontológica (ontología OWL y patrones de diseño de contenido ontológico) para la transformación e integración de recursos heterogéneos en un repositorio único. • Una plataforma de integración, gestión y explotación de información biomédica, que explota distintas representaciones OWL de modelos clínicos e incluye métodos de validación, anotación, comparación, y búsqueda semántica, además de permitir la ejecución de procesos de transformación e integración. • Dos herramientas web que implementación las soluciones. SWIT realiza la transformación de información a representación RDF/OWL, mientras que ArchMS implementa la plataforma integrada que permite la gestión y explotación de modelos y datos clínicos y su explotación en repositorios semánticos junto a otros recursos biomédicos externos. Conclusiones Los estándares de información clínica tratan de favorecer la interoperabilidad semántica de la información, mientras que propuestas como Linked Open Data fomentan la publicación y enlazado de los datos biomédicos. Sin embargo, los lenguajes utilizados para representar modelos clínicos resultan insuficientes para su gestión, mientras que la mayoría de métodos de publicación de datos en la Web de Datos no tienen en cuenta la semántica del contenido y son difíciles de generalizar. Utilizar modelos globales basados en ontologías OWL en la transformación e integración de contenidos permite definir una transformación dirigida por la semántica del dominio y utilizar esta semántica para explotar el repositorio final. OWL permite validar y comparar el contenido atendiendo a su semántica y facilita la integración de recursos. Las herramientas desarrolladas han demostrado ser efectivas en su utilización en distintos escenarios de validación, creando repositorios semánticos abiertos que contribuyen al desarrollo de la Web de Datos y permitiendo su explotación en el espacio tecnológico de la Web Semántica.
Summary Aims of the thesis Translational medicine requires intensive collaboration between different areas of biomedical informatics. However, this collaboration is difficult due to the fact that the biomedical knowledge generated by the different disciplines has the quality of being distributed and heterogeneous. This thesis aims to assist translational research by improving the integrated exploitation of biomedical information through the use of Semantic Web technologies. Methodology The methodology proposed is based on the analysis of the state of art, the formalization of the proposed methods, their implementation and their validation in application domains. The analysis of the state of art includes the study of the most common representation formats for biomedical information, the application of Semantic Web technologies to the biomedical domain, methods of content transformation to semantic representation and existing proposals for integrating heterogeneous repositories. The proposed solution is formalized in three steps: (1) formalization of a generic methodology for semantic data transformation, (2) formalization of a heterogeneous resources integration process based on the transformation into an OWL ontology, (3) formalization of an integrated platform for managing and exploiting the biomedical information. All these proposed solutions are implemented in web tools. The solutions have been validated in four different scenarios: study of clinical data from patients of a colorectal screening program for performing automatic classification of the patients; transformation between CEM clinical models and openEHR archetypes; creation of an integrated repository about orthologous genes, genetic disorders and information about genomic sequences annotations; transformation of a dataset of chemical components into an OWL representation. Results The main contributions of this work are: • A generic data transformation model between structured representation schemata. The definition of mappings transforms input instances into a representation guided by the output model. Identity rules identify redundant instances. The accepted input and output models are defined by a metamodel and the use of design pattern allows making more complex transformations. • A heterogeneous biomedical information integration model. Through the instantiation of the transformation model with an output model defined by an ontological architecture (OWL ontology and ontology design content patterns), different heterogeneous resources are transformed and integrated. • A platform for integrating, managing and exploiting biomedical information. The platform selects the most suitable OWL representations for clinical models and includes semantic methods for validating, annotating, comparing and searching together with the defined transformation and integration models. • Implementation of the transformation and integration models, and the integrated platform in two web applications. SWIT implements the transformation model while AchMS implements the integrated platform. Conclusions Al the clinical level, Electronic Health Record standards intend the achievement of semantic interoperability, while initiatives like Linked Open Data pursues the publication and sharing of biomedical datasets. However, the syntactic nature of languages used for clinical models representation is not enough for their management, while methods for datasets publication in the Web of Data make a syntactic transformation, guided by the logical schema of the source representation and there exists problems in the generalization of the methods. The use of global models based on OWL ontologies for representing information content allows the definition of transformation processes driven by the domain semantics, which can be exploited in the final repository. An OWL representation allows the validation and comparison of the content attending to its semantic, making easier the integration of different resources. The developed tools have demonstrated their effectiveness in different validation scenarios, creating semantic open datasets that will contribute to the development of the Web of Data and allowing their exploitation in the Semantic Web technological space.

The current approaches for the induction of medical procedural knowledge suffer from several drawbacks: the structures produced may not be explicit medical structures, they are only based on statistical measures that do not necessarily respect medical criteria which can be essential to guarantee medical correct structures, or they are not prepared to deal with the incremental arrival of new data. In this thesis we propose a methodology to automatically induce medically correct clinical algorithms (CAs) from hospital databases. These CAs are represented according to the SDA knowledge model. The methodology considers relevant background knowledge and it is able to work in an incremental way. The methodology has been tested in the domains of hypertension, diabetes mellitus and the comborbidity of both diseases. As a result, we propose a repository of background knowledge for these pathologies and provide the SDA diagrams obtained. Later analyses show that the results are medically correct and comprehensible when validated with health care professionals.

This thesis explores techniques, models and algorithms for an efficient management of Cloud systems and how to apply them to the healthcare sector in order to improve current treatments. It presents two Cloud-based eHealth applications to telemonitor and control smoke-quitting and hypertensive patients. Different Cloud-based models were obtained and used to develop a Cloudbased infrastructure where these applications are deployed. The results show that these applications improve current treatments and that can be scaled as computing requirements grow. Multiple Cloud architectures and models were analyzed and then implemented using different techniques and scenarios. The Smoking Patient Control (S-PC) tool was deployed and tested in a real environment, showing a 28.4% increase in long-term abstinence. The Hypertension Patient Control (H-PC) tool, was successfully designed and implemented, and the computing boundaries were measured
Aquesta tesi explora tèniques, models i algorismes per una gestió eficient en sistemes al Núvol i com aplicar-ho en el sector de la salut per tal de millorar els tractaments actuals. Presenta dues aplicacions de salut electrònica basades en el Núvol per telemonitoritzar i controlar pacients fumadors i hipertensos. S'ha obtingut diferents models basats en el Núvol i s'han utilitzat per a desenvolupar una infraestructura on desplegar aquestes aplicacions. Els resultats mostren que aquestes aplicacions milloren els tractaments actuals així com escalen a mesura que els requeriments computacionals augmenten. Múltiples arquitectures i models han estat analitzats i implementats utilitzant diferents tècniques i escenaris. L'aplicació Smoking Patient Control (S-PC) ha estat desplegada i provada en un entorn real, aconseguint un augment del 28,4% en l'absistinència a llarg termini de pacients fumadors. L'aplicació Hypertension Patient Control (H-PC) ha estat dissenyada i implementada amb èxit, i els seus límits computacionals han estat mesurats.
Esta tesis explora ténicas, modelos y algoritmos para una gestión eficiente de sistemas en la Nube y como aplicarlo en el sector de la salud con el fin de mejorar los tratamientos actuales. Presenta dos aplicaciones de salud electrónica basadas en la Nube para telemonitorizar y controlar pacientes fumadores e hipertensos. Se han obtenido diferentes modelos basados en la Nube y se han utilizado para desarrollar una infraestructura donde desplegar estas aplicaciones. Los resultados muestran que estas aplicaciones mejoran los tratamientos actuales así como escalan a medida que los requerimientos computacionales aumentan. Múltiples arquitecturas y modelos han sido analizados e implementados utilizando diferentes técnicas y escenarios. La aplicación Smoking Patient Control (S-PC) se ha desplegado y provado en un entorno real, consiguiendo un aumento del 28,4% en la abstinencia a largo plazo de pacientes fumadores. La aplicación Hypertension Patient Control (H-PC) ha sido diseñada e implementada con éxito, y sus límites computacionales han sido medidos.

La indústria alimentària incorpora als aliments extractes d’origen natural rics en molècules bioactives amb la finalitat de convertir-los en aliments funcionals, és a dir, que tinguin propietats beneficioses per a la salut més enllà del seu valor nutricional. Un dels principals reptes és millorar l'eficiència en la selecció de nous compostos bioactius per accelerar el desenvolupament de nous aliments funcionals. Les tècniques computacionals, com ara el cribratge virtual, poden exercir un paper essencial en la fase inicial del descobriment de noves substàncies bioactives. Durant la tesi s’han desenvolupat i validat diferents protocols de cribatge virtual per a IKK-2 i 11-HSD1 (dianes involucrades en inflamació crònica), els quals han permès trobar compostos i extractes d’origen natural amb propietats anti-inflamatòries. Aquests compostos bioactius poden ser de gran utilitat com a additius en l’alimentació funcional, ja que poden presentar activitat semblant a la dels fàrmacs emprats en el tractament de malalties cardiovasculars.
One of the main challenges in nutrigenomics is improving the efficiency of the selection (which is currently time consuming and expensive) of new bioactive compounds in order to expedite the development of new functional foods. Computational techniques, such as virtual screening, may play an essential role in accelerating the early stages of the discovery of new bioactive substances by efficiently searching for compounds that could activate or inhibit a known target. So, by modulating specific target functions in the body, molecules that act as IKK-2 or 11β-HSD1 inhibitors have beneficial physiological effects that can be of interest for preventing, retarding and/or reversing the metabolic syndrome. Because of their anti-inflammatory properties, natural extracts that contain these molecules have a promising role as ingredients in new functional foods. Therefore, this PhD thesis will focus on the development of virtual screening workflows that predict natural products that can inhibit both targets.

La retinopatia diabètica és una malaltia crònica i una de les principals causes de ceguesa i discapacitat visual en els pacients diabètics. L'examen ocular a través d'imatges de la retina és utilitzat pels metges per detectar les lesions relacionades amb aquesta malaltia. En aquesta tesi, explorem diferents mètodes innovadors per a la classificació automàtica del grau de malaltia utilitzant imatges del fons d'ull. Per a aquest propòsit, explorem mètodes basats en l'extracció i classificació automàtica, basades en xarxes neuronals profundes. A més, dissenyem un nou mètode per a la interpretació dels resultats. El model està concebut de manera modular per a que pugui ser utilitzat en d'altres xarxes i dominis de classificació. Demostrem experimentalment que el nostre model d'interpretació és capaç de detectar lesions de retina a la imatge únicament a partir de la informació de classificació. A més, proposem un mètode per comprimir la representació interna de la informació de la xarxa. El mètode es basa en una anàlisi de components independents sobre la informació del vector d'atributs intern de la xarxa generat pel model per a cada imatge. Usant el nostre mètode d'interpretació esmentat anteriorment també és possible visualitzar aquests components en la imatge. Finalment, presentem una aplicació experimental del nostre millor model per classificar imatges de retina d'una població diferent, concretament de l'Hospital de Reus. Els mètodes proposats arriben al nivell de rendiment de l'oftalmòleg i són capaços d'identificar amb gran detall les lesions presents en les imatges, que es dedueixen només de la informació de classificació de la imatge.
La retinopatía diabética es una enfermedad crónica y una de las principales causas de ceguera y discapacidad visual en los pacientes diabéticos. El examen ocular a través de imágenes de la retina es utilizado por los médicos para detectar las lesiones relacionadas con esta enfermedad. En esta tesis, exploramos diferentes métodos novedosos para la clasificación automática del grado de enfermedad utilizando imágenes del fondo de la retina. Para este propósito, exploramos métodos basados en la extracción y clasificación automática, basadas en redes neuronales profundas. Además, diseñamos un nuevo método para la interpretación de los resultados. El modelo está concebido de manera modular para que pueda ser utilizado utilizando otras redes y dominios de clasificación. Demostramos experimentalmente que nuestro modelo de interpretación es capaz de detectar lesiones de retina en la imagen únicamente a partir de la información de clasificación. Además, proponemos un método para comprimir la representación interna de la información de la red. El método se basa en un análisis de componentes independientes sobre la información del vector de atributos interno de la red generado por el modelo para cada imagen. Usando nuestro método de interpretación mencionado anteriormente también es posible visualizar dichos componentes en la imagen. Finalmente, presentamos una aplicación experimental de nuestro mejor modelo para clasificar imágenes de retina de una población diferente, concretamente del Hospital de Reus. Los métodos propuestos alcanzan el nivel de rendimiento del oftalmólogo y son capaces de identificar con gran detalle las lesiones presentes en las imágenes, que se deducen solo de la información de clasificación de la imagen.
Diabetic Retinopathy is a chronic disease and one of the main causes of blindness and visual impairment for diabetic patients. Eye screening through retinal images is used by physicians to detect the lesions related with this disease. In this thesis, we explore different novel methods for the automatic diabetic retinopathy disease grade classification using retina fundus images. For this purpose, we explore methods based in automatic feature extraction and classification, based on deep neural networks. Furthermore, as results reported by these models are difficult to interpret, we design a new method for results interpretation. The model is designed in a modular manner in order to generalize its possible application to other networks and classification domains. We experimentally demonstrate that our interpretation model is able to detect retina lesions in the image solely from the classification information. Additionally, we propose a method for compressing model feature-space information. The method is based on a independent component analysis over the disentangled feature space information generated by the model for each image and serves also for identifying the mathematically independent elements causing the disease. Using our previously mentioned interpretation method is also possible to visualize such components on the image. Finally, we present an experimental application of our best model for classifying retina images of a different population, concretely from the Hospital de Reus. The methods proposed, achieve ophthalmologist performance level and are able to identify with great detail lesions present on images, inferred only from image classification information.

En aquesta tesi es presenta un model de coneixement clínic basat en taules de decisió que permet representar les fases de diagnòstic, tractament i pronòstic de diferents malalties. Les taules de decisió que s'obtenen per a cada fase del model han estat utilitzades per representar malalties reals a partir de guies de pràctica clínica. En el cas del diagnòstic s'han representat les vuit causes secundàries més comuns de la hipertensió arterial. En el cas del tractament i pronòstic s'han representat set diferents xocs en emergències. Les taules de decisió que hem obtingut per a cadascuna de les malalties s'han utilitzat com a base per crear dues eines d'entrenament mèdic, dirigides a residents. Totes dues eines s'han provat a l'Hospital Clínic de Barcelona amb diferents grups de residents. Després de les proves s'ha conclòs que les taules de decisió són adequades per a la representació del coneixement mèdic en totes tres fases. A més, les eines d'aprenentatge han estat efectives a l'hora d'ensenyar els procediments mèdics, especialment als residents amb menys experiència prèvia.
En esta tesis se presenta un modelo de conocimiento clínico basado en tablas de decisión que permite representar las fases de diagnostico, tratamiento y pronostico de distintas enfermedades. Las tablas de decisión que se obtienen para cada fase del modelo han sido utilizadas para representar enfermedades reales a partir de guías de práctica clínica. En el caso del diagnóstico se han representado las ocho causas secundarias más comunes de la hipertensión arterial. En el caso del tratamiento y pronóstico se han representado siete diferentes shocks en emergencias. Las tablas de decisión que hemos obtenido para cada una de las enfermedades se han usado como base para crear dos herramientas de entrenamiento médico, dirigido a residentes. Ambas herramientas se han probado en el Hospital Clínic de Barcelona con distintos grupos de residentes. Tras las pruebas se ha concluido que las tablas de decisión son adecuadas para la representación del conocimiento medico en las tres fases. Además, las herramientas de aprendizaje han sido efectivas a la hora de enseñar los procedimientos médicos, en especial a los residentes con menos experiencia previa.
In this thesis a clinical knowledge model based on decision tables is presented. This model allows us to represent the stages of diagnosis, treatment, and prognosis of different diseases. The decision tables obtained for each phase of the model have been used to represent real diseases from clinical practice guidelines. In the case of diagnosis, we represented eight of the most common secondary causes of hypertension. For the treatment and prognosis we represented seven different emergency shocks. The decision tables obtained for each disease have been used as the basis for two medical training tools aimed to residents. Both tools have been tested in the Hospital Clínic de Barcelona with different groups of residents. After testing, it was concluded that decision tables are suitable for the representation of medical knowledge in all three phases. In addition, the learning tools have been effective in teaching medical procedures, especially for untrained residents.

Volume visualization is a method of extracting information from volumetric data using interactive graphics. Volume visualization aims to assist visual interpretation of data by creating three-dimensional models that reproduce real objects with sufficient detail and speed to support interactive manipulation. Illustrative rendering enhances the perception of features in a volume. Volume rendering has two major goals: to obtain high quality images in real time, and to determine how to explore volume datasets in an effective way. In this thesis we advance in these two lines. We propose several methods to approximate global illumination with low computational cost, permitting realistic and illustrative rendering. We also present a method to automatically define transfer functions given a target distribution. In addition, we introduce a method to automatize the creation of exploded views. Finally, we explore techniques to select the best viewpoints for a volume. Several of our contributions are based on information theory.
La visualització de volums és un mètode per extreure informació de dades volumètriques mitjançant imatges interactives. L’objectiu és assistir la interpretació visual de dades creant models tridimensionals que reprodueixen objectes reals amb suficient detall i velocitat per permetre’n la manipulació interactivament. La visualització il·lustrativa millora la percepció de les característiques d'un volum. La visualització de volums té dos objectius principals: obtenir imatges d’alta qualitat en temps real, i determinar com explorar volums d'una manera efectiva. En aquesta tesi avancem en aquestes dues línies. Proposem diversos mètodes per aproximar la il·luminació global amb baix cost computacional, permetent la visualització realista i il·lustrativa. També presentem un mètode per definir automàticament funcions de transferència donada una distribució objectiu. A més, presentem un mètode per automatitzar la creació d’exploded views. Finalment, explorem tècniques per seleccionar els millors punts de vista d’un volum. Diverses de les contribucions estan basades en la teoria de la informació.

The understanding of certain data often requires the collection of similar data from different places to be analysed and interpreted. Multi-agent systems (MAS), interoperability standards (DICOM, HL7 or EN13606) and clinical Ontologies, are facilitating data interchange among different clinical centres around the world. However, as more and more data becomes available, and more heterogeneous this data gets, the task of accessing and exploiting the large number of distributed repositories to extract useful knowledge becomes increasingly complex. Beyond the existing networks and advances for data transfer, data sharing protocols to support multilateral agreements are useful to exploit the knowledge of distributed Data Warehouses. The access to a certain data set in a federated Data Warehouse may be constrained by the requirement to deliver another specific data set. When bilateral agreements between two nodes of a network are not enough to solve the constraints for accessing to a certain data set, multilateral agreements for data exchange can be a solution. The research carried out in this PhD Thesis comprises the design and implementation of a Multi-Agent System for multilateral exchange agreements of clinical data, and evaluate how those multilateral agreements increase the percentage of data collected by a single node from the total amount of data available in the network. Different strategies to reduce the number of messages needed to achieve an agreement are also considered. The results show that with this collaborative sharing scenario the percentage of data collected dramatically improve from bilateral agreements to multilateral ones, up to reach almost all data available in the network.

This thesis deals with the detection of new multiple sclerosis (MS) lesions in longitudinal brain magnetic resonance (MR) imaging. This disease is characterized by the presence of lesions in the brain, predominantly in the white matter (WM) tissue of the brain. The detection and quantification of new lesions are crucial to follow-up MS patients. Moreover, the manual detection of these new lesions is not only time-consuming, but is also prone to intra- and inter-observer variability. Therefore, the development of automated techniques for the detection MS lesions is a major challenge
Aquesta tesi es centra en la detecció automàtica de lesions noves d'esclerosi múltiple (EM) en estudis longitudinals del cervell mitjançant l'ús d'imatges de ressonància magnètica (RM). Aquesta malaltia es caracteritza per la presència de lesions al cervell, predominantment en el teixit de la matèria blanca, i la detecció i la quantificació de les noves lesions són elements crucials per al seguiment dels pacients. No obstant això, la detecció manual d'aquestes noves lesions no només requereix de molt temps, sinó que també és propensa a la variabilitat intra- i inter-observador. Cal tenir en compte que les lesions d'EM són molt petites en comparació amb tot el cervell. Per tant, el desenvolupament de tècniques automàtiques per a la detecció de lesions d'EM és un gran repte

La retinopatia diabètica (RD) és una de les complicacions més comunes associades a la diabetis mellitus (DM). El seu adequat control requereix la implementació de programes de cribratge. En aquest treball es presenta un estudi prospectiu d'un total de 15.396 pacients caucàsics amb DM, que representen el 86,53% del total de pacients amb DM en les nostres àrees bàsiques de salut, amb un període de seguiment de 8 anys (2007- 2014). Tots els pacients van ser examinats amb una mitjana de 3,18 ± 1,11 visites al llarg de l'estudi. En els nostres resultats s'observa un augment en la incidència de la RD i edema macular diabètic (EMD), especialment en els pacients joves entre 31 i 70 anys, relacionat amb un mal control metabòlic. A més d'un augment de costos en la RD arran de la introducció dels nous tractaments amb anti-VEGF per l'EMD. La periodicitat dels controls de cribratge recomanats és d'1 any per a pacients amb DM2, i als 5 anys del diagnòstic en pacients amb DM1, segons les recomanacions de diferents societats científiques. No obstant això, amb la periodicitat recomanada només es criben un 30% de pacients a l'any. En els nostres resultats, la detecció de la retinopatia diabètica cada 2,5 anys és cost-efectiva, però s'ha d'ajustar als factors de risc de cada pacient. Per això, hem dissenyat un suport d'ajuda a la presa de decisions clíniques que pugui determinar amb una sensibilitat i especificitat del 80%, la probabilitat de desenvolupar retinopatia diabètica en cada pacient. L'ús d'aquest model informàtic pretén ajudar els metges a determinar la millor periodicitat de cribratge per a cada persona, de manera que es proporcioni una atenció adequada i s'emprin els recursos humans, materials i econòmics d'una manera més eficient.
La retinopatía diabética (RD) es una de las complicaciones más comunes asociadas a la diabetes mellitus (DM). Su adecuado control requiere la implementación de programas de cribado. En este trabajo se presenta un estudio prospectivo de un total de 15 396 pacientes caucásicos con DM, que representan el 86,53% del total de pacientes con DM en nuestras áreas básicas de salud, con un período de seguimiento de 8 años (2007-2014). Todos los pacientes fueron examinados con una media de 3,18 ± 1,11 visitas a lo largo del estudio. En nuestros resultados se observa un aumento en la incidencia de RD y edema macular diabético (EMD), especialmente en los pacientes jóvenes entre 31 y 70 años, relacionado con un mal control metabólico. Además de un aumento de costes en la RD a raíz de la introducción de los nuevos tratamientos con anti-VEGF para el EMD. La periodicidad de los controles de cribado recomendados es de 1 año para pacientes con DM2, y a los 5 años del diagnóstico en pacientes con DM1, según las recomendaciones de diferentes sociedades científicas. Sin embargo, con la periodicidad recomendada solo se criban un 30% de pacientes al año. En nuestros resultados, la detección de la retinopatía diabética cada 2,5 años es coste-efectiva, pero debe ajustarse a los factores de riesgo de cada paciente. Por ello, hemos diseñado un soporte de ayuda a la toma de decisiones clínicas que pueda determinar con una sensibilidad y especificidad del 80%, la probabilidad de desarrollar retinopatía diabética en cada paciente. El uso de este modelo informático pretende ayudar a los médicos a determinar la mejor periodicidad de cribado para cada persona, de manera que se proporcione una atención adecuada y se empleen los recursos humanos, materiales y económicos de una manera más eficiente.
Diabetic retinopathy (DR) is one of the most usual morbidities associated to diabetes mellitus (DM). Its appropriate control requires the implementation of expensive screening programs. This paper reports a prospective population-based study of a total of 15 396 Caucasian patients with DM, who represent 86.53% of the total patients with DM in our health care areas, were studied over an 8-year follow-up period (2007-2014). All patients were screened with a mean follow-up of 3.18 ±1.11 times for each patient over the 8 years. An increase in the incidence of DR and diabetic macular oedema (DMO) was observed, especially in the younger patients aged between 31 and 70 years. This is linked to bad metabolic control of DM. Our results suggest a greater number of ocular complications in the near future, if these current findings are not addressed. Furthermore, our results reveal an increased costs in DR since the new treatments with anti-VEGF for DMO. The periodicity of screening controls recommended in patients with DM is 1 year in DM2, and after five years of diagnosis in DM1 patients, according to the recommendations of different scientific societies. However, with the recommended periodicity, only a screening rate estimated at 30% per year. Screening for diabetic retinopathy every 2.5 years is cost-effective in our results, but should be adjusted to a patient's personal risk factors. Thus, we have build a classifier which may determine, with sensitivity and especifity levels over 80%, whether a diabetic person is likely to develop retinopathy. The use of this model in a decision support tool may help doctors to determine the best screening periodicity for each person, so that an appropriate care is provided and human, material and economic resources are more efficiently employed.

Магістерська дисертація викладена на 120 сторінках, літературних джерел 47; рис. 24, табл. 7, додатків 4. Мета – за результатами аналізу існуючих літературних і інформаційних джерел розробити та обґрунтувати програму превентивної фізичної реабілітації травм верхньої кінцівки в боксі із застосуванням сучасних технічних засобів і засобів фітнесу та визначити її ефективність. Актуальність роботи. В даний час спортивний травматизм, за різними джерелами, становить 2-5% від загального (побутового, виробничого та ін.). Деякі розбіжності в цифрах пов’язані з тим, що спортивний травматизм залежить, як від виду спорту, так і від ступеня залучення опитуваних людей до занять спортом. Бокс – популярний вид спорту, що відноситься до групи єдиноборств. Для спортсменів, які займаються боксом, характерним є високий атлетизм, спрямований на подолання опору супротивника, швидка реакція, витривалість, постійна зміна під час поєдинку статичних і динамічних напружень. Гострі травми опорно-рухового апарату у боксерів складають 66,16% від загальної кількості травм, причому значна їх частина припадає на руки. Зв’язок роботи з науковими програмами, планами, темами. Магістерська робота виконана відповідно до плану НДР «Розробка технологій фізичної терапії та технічних засобів їх здійснення» №01117U002933 від 01.04.2017 кафедри біобезпеки і здоров’я людини КПІ ім. Сікорського. Мета роботи: за результатами аналізу існуючих літературних і інформаційних джерел розробити та обґрунтувати програму превентивної фізичної реабілітації травм верхньої кінцівки в боксі із застосуванням сучасних технічних засобів і засобів фітнесу та визначити її ефективність. Завдання дослідження: 1. Провести аналіз існуючих програм превентивної фізичної реабілітації пошкоджень верхньої кінцівки в боксі традиційними засобами і різними технічними пристроями і засобами фітнесу з використанням наукової, науково-методичної та навчальної література, мережі Internet. 2. Навести анатомічні особливості будови великих суглобів верхньої кінцівки та механізмів їх травмування; особливості сучасних методів і засобів фізичної реабілітації після пошкоджень верхньої кінцівки в боксі за допомогою спеціальних фізичних вправ, в тому числі на різних типів технічних засобах. 3. Розробити програму превентивної фізичної реабілітації пошкоджень верхньої кінцівки в боксі засобами фітнесу зі структурною схемою і алгоритмом дії програми за допомогою спеціальних фізичних вправ, в тому числі на технічних засобах і засобах фітнесу. 4. Провести дослідження з виконанням констатувального і формувального педагогічного експерименту з представленням результатів. 5. Розробити техніку безпеки при проведенні реабілітаційних заходів з використанням спеціальних фізичних вправ, в тому числі на технічних засобах і засобах фітнесу. Об’єкт дослідження: травматизм верхньої кінцівки в боксі. Предмет дослідження: методи та засоби превентивної фізичної реабілітації травм верхніх кінцівок в боксі. Методи дослідження: аналіз науково-методичної літератури та інформаційних джерел, пов’язаних з превентивною фізичною реабілітацією травм верхніх кінцівок в боксі засобами фітнесу та технічними засобами; інструментальні методи дослідження (кистьова динамометрія); педагогічні методи дослідження – спостереження, педагогічний експеримент, методи математичної статистики. Наукова новизна роботи: – досліджені анатомічні та функціональні особливості великих суглобів верхньої кінцівки. За допомогою досліджень була розроблена програма превентивної фізичної реабілітації травм верхніх кінцівок в боксі засобами фітнесу; – після проведення дослідження було підтверджено позитивний вплив застосованих методів та засобів превентивної фізичної реабілітації травм верхньої кінцівки в боксі засобами фітнесу. Практичне значення отриманих результатів. Розроблена програма превентивної фізичної реабілітації травм верхніх кінцівок в боксі засобами фітнесу, за допомогою спеціальних вправ та технічних засобів. Програма, подана в роботі, може бути використана в діяльності спортивних клубів, спортивних залів, а також у навчальних курсах під час підготовки фахівців з фізичної терапії, на практичних заняттях студентів вищих навчальних закладів з фізичного виховання і спорту. За результатами досліджень було опубліковано1 тези та 2 статті. Отримано акт впровадження результатів в практику Громадської організації «Федерація боксу Києво-Святошинського району».
The master's thesis is presented on 120 pages and includes literary sources 47; Fig. 24, Table 7, Annexes 4. The purpose is to develop and substantiate a preventive physical rehabilitation program of upper limb injuries in boxing using modern technical and fitness equipment and to determine its effectiveness, as a result of the analysis of existing literary and information sources. Relevance of work. Currently, sports injuries, according to various sources, is 2-5% of the total (household, industrial, etc.). Some discrepancies in numbers are due to the fact that sports injuries depend on both the sport and the extent to which the respondents are involved in sports. Boxing is a popular type of martial arts. Athletes who practice boxing are characterized by high athleticism, aimed at overcoming the resistance of the opponent, rapid reaction, endurance, constant change during the fight of static and dynamic stresses. Acute musculoskeletal injuries in boxers account for 66.16% of the total number of injuries, with a considerable part of them being in the hands. Work relationship with scientific programs, plans, topics. The master's thesis was carried out in accordance with the plan of research and development of "Development of technologies of physical therapy and technical means of their implementation" №01117U002933 from 01.04.2017 Department of Biosafety and Human Health Sikorsky KPI. Purpose of the work: to develop and substantiate a preventive physical rehabilitation program of upper limb injuries in boxing with the use of modern technical and fitness equipment and to determine its effectiveness. Objectives of the study: 1. To analyze the existing preventive physical rehabilitation programs of upper limb injuries in boxing by traditional means and various technical devices and means of fitness using scientific, scientific-methodical and educational literature, Internet. 2. Give anatomical features large joints structure of the upper extremity and the mechanisms of their injury; features of modern methods and means of physical rehabilitation after damage of the upper limb in boxing by means of special physical exercises, including on different types of technical means. 3. To develop a preventive physical rehabilitation program of upper limb injuries in boxing by fitness means with a block diagram and action algorithm of the program by means of special physical exercises, including on technical means and fitness means. 4. To conduct research with performance of the ascertaining and forming pedagogical experiment with presentation of results. 5. To develop safety during rehabilitation activities with the use of special physical exercises, including technical and fitness equipment. Object of study: upper limb injuries in boxing. Subject of research: methods and means of preventive physical rehabilitation of upper limb injuries in boxing. Research methods: analysis of scientific and methodological literature and information sources related to the preventive physical rehabilitation of upper limb injuries in boxing by fitness means and technical means; instrumental research methods (wrist dynamometry); pedagogical methods of research - observation, pedagogical experiment, methods of mathematical statistics. Scientific novelty of the work: - the anatomical and functional features of the large joints of the upper extremity were investigated. Through research, a preventive physical rehabilitation program of upper limb injuries in boxing by fitness means was developed; - after the study, the positive impact of the applied methods and means of preventive physical rehabilitation of upper limb injuries in boxing by fitness means was confirmed. The practical significance of the results obtained. A preventive physical rehabilitation program of upper limb injuries in boxing by fitness means, with the help of special exercises and technical means. The program presented in the thesis can be used in the activities of sports clubs, gyms, as well as in training courses during the training of specialists in physical therapy, at practical classes of students of higher educational institutions in physical education and sports. As a result of the research, 1 theses and 2 articles were published. The act of putting the results into practice of the NGO Boxing Federation of Kyiv-Svyatoshinsky District was received.

Introducció: El dolor a les Unitats de Cures Intensives Neonatals (UCIN) està present pels nombrosos procediments que es realitzen. Patir dolor intens i continuat al principi de la vida pot provocar conseqüències futures. La primera mesura per tractar el dolor és la correcta valoració del mateix. Les escales desenvolupades posseeixen un component important de subjectivitat. L'aplicació de la intel·ligència artificial (IA) podria permetre la monitorització contínua i en temps real del dolor i integrar-lo com la cinquena constant vital. L'objectiu d'aquesta tesi es diseñar i implementar un sistema intel·ligent i automàtic per avaluar el dolor als nounats ingressats a les UCIN. Material i mètode: Estudi experimental, avaluatiu. Un prototip analitza els paràmetres conductuals i fisiològics. Mitjançant la IA s'emet una puntuació de dolor que apareix al monitor estàndard de constants vitals. Es realitzaren 11 medicions en nounats d'edats compreses entre 25 a 42 setmanes de gestació ingressats a la UCIN de l'Hospital Universitari Joan XXIII de Tarragona. Per a l'avaluació humana (observador A i B) del dolor s'utilitzaren les escales Premature Infant Pain Profile (PIPP) i Susan Givens Bell (SGB). El coeficient de correlació de Spearman s'utilitzà per a la validació del prototip. Per l'anàlisi de la variança i la comparació de mitjanes s'utilitzà la prova ANOVA. Resultats: Mostra n=11. Edat gestacional 32.00±7.23 setmanes; pes 2046.50±1409.27 grams. El 63.6% de la mostra foren nens (n=7). Dolor observador A en PIPP: 2.6±1.4, en SGB: 2.4±1.3. Dolor observador B en PIPP: 2.9±1.4, en SGB: 2.2±1.5. Dolor prototip:1.55±0.69. ANOVA entre PIPP- prototipo(observador A i B): F=3.62 (p=0.03). Mesures de valor de SGB- prototipo (observador A i B): F=2.99 (p=0.06). Conclusions: El disseny del prototip i la seva connexió es realitzaren èxitosament però els valors calculats no es correlacionaren. Millorant el software i creant una versió 2.0 s'obtindrien resultat més ajustats a la realitat.
Introducción: El dolor en las Unidades de Cuidados Intensivos Neonatales (UCIN) está presente por los numerosos procedimientos que se realizan. Sufrir dolor intenso y continuado al principio de la vida puede producir consecuencias futuras. La primera medida para tratar el dolor es la correcta evaluación del mismo. Las escalas desarrolladas poseen un componente importante de subjetividad. La aplicación de la inteligencia artificial (IA) podría permitir la monitorización continua y a tiempo real del dolor e integrarla como la quinta constante vital. El objetivo es diseñar un sistema inteligente y automático para valorar el dolor en neonatos ingresados en UCIN. Material y método: Estudio experimental, evaluativo. Un prototipo analiza con los parámetros conductuales y fisiológicos. Mediante IA, se emite una puntuación de dolor que aparece en el monitor estándar de constantes vitales. Se realizaron 11 mediciones en neonatos de edades comprendidas de 25 a 42 semanas de gestación ingresados en UCIN del Hospital Universitario Joan XXIII de Tarragona. Para la evaluación humana (observador A y B) del dolor se utilizaron las escalas Premature Infant Pain Profile (PIPP) y Susan Givens Bell (SGB). El coeficiente de correlación de Spearman se utilizó para la validación del prototipo. Para el análisis de la varianza y comparación de medias se utilizó la prueba ANOVA. Resultados: Muestra n=11. Edad gestacional 32.00±7.23 semanas; peso 2046.50±1409.27 gramos. El 63.6% de la muestra fueron niñas (n=7). Dolor observador A en PIPP:2.6±1.4, en SGB: 2.4±1.3. Dolor observador B en PIPP:2.9±1.4, en SGB: 2.2±1.5. Dolor prototipo:1.55±0.69. ANOVA entre PIPP- prototipo (observador A y B): F=3.62 (p=0.03). Medias de valor de SGB- prototipo (observador A y B): F=2.99 (p=0.06). Conclusiones: El diseño del prototipo y su conexión se realizaron exitosamente pero los valores calculados no se correlacionan. Mejorando el software creando una versión 2.0 se obtendrían resultados más ajustados a la realidad.
Introduction: Pain is a recurrent topic in Neonatal Intensive Care Units (NICUs), due to the number of procedures performed in such scenarios. Suffering from intense and continuing pain in the first days of life, can entail consequences in the future. The first measure to deal with pain is its correct assessment. The developed scales include some important subjectivity aspects. The use of artificial intelligence (AI) may allow the continuous monitoring, in real time, of the pain so it can be integrated as the fifth vital sign. The goal of this thesis is to design and implement an intelligent and automatic system to assess pain in neonates hospitalised in a NICU. Material and method: Experimental study, evaluative. A prototype analyses behavioural and physiological parameters. By means of the AI a level for pain is computed, which is displayed on a standard vital signs monitor. 11 measures were conducted with neonates (gestational ages between 25 and 42 weeks) hospitalised in the NICU of Hospital Universitari Joan XXIII in Tarragona. For the human assessment of pain (observer A and B) scales Premature Infant Pain Profile (PIPP) and Susan Given Bell (SGB) were used. The Spearman correlation coefficient was used for the validation of the prototype. The ANOVA test was used for comparing variances and averages. Results: Sample n=11. Gestational age 32.00±7.23 weeks; weight 2046.50±1409.27 g. The 63.6% of the sample were boys (n=7). Pain observer A in PIPP: 2.6±1.4, in SGB: 2.4±1.3. Pain observer B in PIPP: 2.9±1.4, in SGB: 2.2±1.5. Pain in prototype 1.55±0.69. ANOVA between PIPP-prototype (observer A and B) F=3.62 (p=0.03). Measures of value SGB-prototype (observer A and B) F=2.99 (p=0.06). Conclusions: The design of the prototype and its connection was successfully performed, but the computed values are not correlated. By improving the software and creating a version 2.0, better results would be expected.

Prostate and breast cancer are the most common cause of cancers in men and women, respectively. Medical imaging plays an important role in breast and prostate cancer detection and evaluation. Then to prove that our web-based medical application could be applied in different medical disciplines, the main part of this thesis is the implementation of two frameworks as a Java applet interface designed as a web-based tool in the domains of mammography from X-rays in radiology, and of prostate imaging from an Magnetic Resonance Imaging (MRI). This aims to facilitate the diagnosis of new mammographic and prostate cases by providing a set of image processing tools that allow a better visualization of the images, and a set of drawing tools used to annotate the suspicious regions (overlays). Each annotation allows including the attributes considered by the experts when issuing the final diagnosis. The overall set of overlays is stored in a database as eXtensible Markup Language (XML) files associated with the original images. Finally, an exhaustive evaluation of the results is also discussed in this thesis. For the application on mammography, the experimental study is performed in order to evaluate the scalability, complexity and response speed at the proposed tool. For the application on MRI of prostate cancer, the evaluation focused on the decrease of the variability of the expert assessments when collaborative work is performed. To conclude, a new architecture with the main goal of managing patient databases with potentially multi-modal imaging is presented such as for an MRI of the prostate cancer and evaluation from potentially several experts.
En aquesta tesi es realitza una revisió bibliogràfica de les principals publicacions recents en els últims anys en aplicacions mèdiques basades en web. Aquest estudi analitza els avantatges i inconvenients dels treballs d’investigació en el camp de la imatge mèdica, així com les arquitectures de base de dades per a la gestió d’imatges digitals. La part principal d’aquesta tesi és la implementació d’una eina basada en la web amb la finalitat de demostrar la integritat i aplicació en diferents disciplines mediques. En aquest sentit, l’aplicació proposada en aquest projecte de tesis ha sigut implementada com a eina d’ajuda al diagnòstic de càncer de mama i pròstata. L’objectiu és facilitar el diagnòstic proporcionant un conjunt d’eines de processat d’imatge que permetin una millor visualització de les imatges, i un conjunt d’eines d’anotació de regions sospitoses o malignes (superposicions). Cada anotació permet incloure tots els atributs i especificacions considerades pels experts a l’emetre el diagnòstic final. S’han dissenyat diferents arquitectures per a la gestió de base de dades (per exemple PACS per emmagatzemar imatges monogràfiques). Per altra banda, el conjunt global d’anotacions s’emmagatzemen en una base de dades d’arxius XML associats a les imatges originals. Conseqüentment, aquesta nova arquitectura es presenta amb l’objectiu d’obtenir una base de dades de casos diagnosticats i validats per radiòlegs experts per a la formació de radiòlegs novells. Finalment, conclusions i noves línies d’investigació associades al projecte com a treball futur són presentades en aquesta tesi.

Serious games are games designed to entertain and also to teach or transmit some knowledge. They are present in many areas such as military, health, manufacturing, education or medicine, just to name a few. One of their main advantages is their capability to recreate scenarios to experiment with situations that otherwise would be impossible in the real world due to required safety, cost, and time. In addition, serious games enhance the development of analytical and spatial, strategic, or psychomotor skills. Unfortunately, despite the advantages of serious games there are still some aspects that need further research and development. On the one hand, there are communities such as visually impaired players which have many difficulties to access them since most of serious games rely on impressive graphics and immersive visual experiences. On the other hand, there are topics of relevant importance such as first-aid protocols that have been considered but only taking into account players with experience on the topic. With the aim to overcome these limitations and exploit serious games advantages as much as possible.
Els jocs seriosos són jocs que, a més a més d'entretenir, ensenyen o transmeten algun coneixement. S'apliquen en diferents àrees com poden ser la militar, la salut, la indústria, l'educació o la medicina, entre d'altres. Un dels seus principals avantatges és la seva capacitat per recrear escenaris que permeten experimentar amb situacions que d'una altra manera serien impossibles a la vida real a causa de la seguretat, el cost o el temps que requeririen. A més a més, els jocs seriosos milloren el desenvolupament d'habilitats analítiques, espacials, estratègiques o psicomotrius. Malauradament, tot i els avantatges dels jocs seriosos, encara hi ha certs aspectes en els que cal més recerca i desenvolupament. D'una banda, hi ha comunitats, com les persones amb discapacitats visuals, que hi tenen moltes dificultats d'accés, ja que la majoria de jocs seriosos es basen en gràfics i experiències visualment immersives. D'una altra banda, encara hi ha temes importants com els protocols de primers auxilis que, tot i haver estat considerats en l'entorn dels jocs seriosos, només han tingut en compte als usuaris experts en la matèria deixant-ne fora altres perfils de judadors. L'objectiu d'aquesta tesi es ajudar a superar aquestes limitacions i aprofitar al màxim els avantatges dels jocs seriosos

El objetivo principal de esta tesis es la aplicación integrada de enfoques metodológicos de las disciplinas Ingeniería del Software y Auditoría de Sistemas de Información a la Bioinformática, en función de la identificación y caracterización de las aportaciones de esta disciplina a los trabajos de investigación en el área de la Epidemiología Genómica de las Enfermedades Cardiovasculares. Dado que el ámbito de aplicación así definido es demasiado amplio, se ha establecido un tema específico, el cálculo del riesgo cardiovascular a escala individual, sobre el cual giran los trabajos de investigación y se describen las aportaciones concretas de esta tesis.
El ámbito de la Epidemiología Genómica de las Enfermedades Cardiovasculares está caracterizado por el Framingham Heart Study (Massachusetts, EE.UU., 1948 ) y los factores de riesgo cardiovascular son de tipo genético y ambiental. Dado que la lista actual de factores genéticos implicados en las enfermedades cardiovasculares contiene casi 3.000 genes, de la misma se han elegido un reducido subconjunto de los cuales se tiene información sobre sus polimorfismos y fenotipos patológicos: CETP, APOE, APOA1, LIPC, SR-BI y PLIN. Este último gen también se ha estudiado comparativamente en población general de la Comunidad Valenciana. Se ha desarrollado un estudio completo de cada uno de los genes relacionados. Los resultados obtenidos permiten descubrir unas interesantes interacciones gen*ambiente, gen*sexo, gen*dieta, gen*diabetes 2 y gen*obesidad, asociados a los polimorfismos de los genes estudiados y que se identifican en cada estudio. En resumen, se ofrecen datos concretos de asociaciones reales observadas entre variaciones genéticas y fenotipos cardiovasculares, así como de interacciones gen*ambiente.
En el ámbito de la Bioinformática, se ha desarrollado un modelo para el cálculo del riesgo cardiovascular a escala individual y un modelo para la aplicación de la Auditoría Bioinformática en el análisis y control de las funciones bioinformáticas. También se han desarrollado soluciones específicas para la resolución de problemas planteados en el protocolo científico del laboratorio genómico.
En conclusión, la Bioinformática, entendida como una disciplina científico-técnica, es indispensable como instrumento de integración en la investigación genómica cardiovascular en los distintos niveles de adquisición, tratamiento, análisis, almacenamiento y salvaguarda de datos. Sin embargo, debido a su reciente desarrollo, tropieza todavía con las dificultades derivadas de la ausencia de un cuerpo teórico común y consistente, que permita dar respuesta rápida a las grandes demandas de proceso de información ómica que se están detectando en la actualidad.

Inflammatory myopathies are a heterogeneous family of rare autoimmune diseases affecting multiple organs and systems, including the skin, the lungs, the muscles and/or the joints. Accurately defining their pathogenesis and classifying them correctly are key for understanding and managing these diseases. In this doctoral thesis we explored specific autoantibody-defined myositis subsets and quantitatively compared the ability of autoantibodies to the 2017 EULAR/ACR classification standard to predict the phenotype of patients with myositis. We also performed RNA sequencing on 119 muscle biopsies of patients with different types of myositis and 20 controls. We studied the differential expression, performed pathway analysis and developed exploratory machine learning pipelines to define the specific expression profiles and pathogenic pathways in each disease subgroup. With these studies we determined that the autoantibodies outperform current clinical criteria to predict the phenotype of myositis patients and discovered unique expression profiles in the muscle tissue of patients with different types of myositis.
Las miopatías inflamatorias son una familia heterogénea de enfermedades autoinmunes raras que afectan a múltiples órganos y sistemas, incluidos los músculos, la piel, los pulmones y/o las articulaciones. Definir con precisión su patogenia y clasificarlas correctamente es clave para comprender y manejar estas enfermedades. En esta tesis doctoral exploramos subconjuntos específicos de miositis definidas por autoanticuerpos y comparamos cuantitativamente la capacidad de los autoanticuerpos con la clasificación EULAR/ACR de 2017 para predecir el fenotipo de pacientes con miositis. Además, realizamos la secuenciación de ARN en 119 biopsias musculares de pacientes con diferentes tipos de miositis y 20 controles. Estudiamos la expresión diferencial, realizamos análisis de vías y desarrollamos procesos de aprendizaje automático exploratorios para definir los perfiles de expresión específicos y las vías patogénicas en cada subgrupo de enfermedades. Con estos estudios determinamos que los autoanticuerpos superan los criterios clínicos actuales para predecir el fenotipo de los pacientes con miositis y descubrimos perfiles de expresión únicos en el tejido muscular de pacientes con diferentes tipos de miositis.
Les miopaties inflamatòries són una família heterogènia de malalties autoimmunes rares que afecten múltiples òrgans i sistemes, inclosos els músculs, la pell, els pulmons i/o les articulacions. Definir-ne amb precisió la patogènia i classificar-les correctament és clau per comprendre i manejar aquestes malalties. En aquesta tesi doctoral explorem subconjunts específics de miositis definides per autoanticossos i comparem quantitativament la capacitat dels autoanticossos amb la classificació EULAR/ACR de 2017 per predir el fenotip de pacients amb miositis. A més, realitzem la seqüenciació d'ARN en 119 biòpsies musculars de pacients amb diferents tipus de miositis i 20 controls. Estudiem l'expressió diferencial, fem anàlisis de vies i desenvolupem processos d'aprenentatge automàtic exploratoris per definir els perfils específics d'expressió i les vies patogèniques a cada subgrup de malalties. Amb aquests estudis determinem que els autoanticossos superen els criteris clínics actuals per predir el fenotip dels pacients amb miositis i descobrim perfils d'expressió únics al teixit muscular de pacients amb diferents tipus de miositis.

La utilització d'Internet com a font d'informació sanitària és molt freqüent. La qualitat d'aquesta informació és extraordinàriament variable. Els segells de qualitat presents a les webs mediques, concedits per sistemes d'acreditació, constitueixen un instrument de millora dels serveis d'informació sanitària a Internet.

A la present tesi s'analitzen les propostes i recomanacions de les principals iniciatives d'acreditació, s'estudia la percepció que tenen els responsables de webs mediques respecte a la utilitat dels segells d'acreditació i la prevalença d'ús d'aquests segells en les webs de contingut sanitari.

Conclusions: la gran diversitat de recomanacions d'acreditació dificulta l'estandardització, els responsables de webs sanitàries reconeixen que el segell de WMA influeix positivament en la qualitat d'aquestes webs i existeix un ús moderat dels segells de qualitat i les webs que els presenten acostumen a ser de millor qualitat que el resta.
La utilización de Internet como fuente de información sanitaria es muy frecuente. La calidad de esta información es extraordinariamente variable. Los sellos de calidad presentes en las webs médicas, otorgados mediante sistemas de acreditación, constituyen un instrumento de mejora de los servicios de información sanitaria en Internet.

En la presente tesis se analizan las propuestas y recomendaciones de las principales iniciativas de acreditación, se estudia la percepción que tienen los responsables de webs médicas respecto a la utilidad de los sellos de acreditación y la prevalencia de uso de dichos sellos de calidad en las webs de contenido sanitario.

Conclusiones: la gran diversidad de recomendaciones de acreditación dificulta la estandarización, los responsables de webs sanitarias reconocen que el sello de WMA influye positivamente en la calidad de dichas webs, existe un uso moderado de los sellos de calidad y las webs que los presentan acostumbran a ser de mejor calidad que el resto.
The use of Internet as a health information source is very common. The quality of this information is widely variable. The quality seals and trust marks owned by the medical websites and granted by accreditation programmes, are good tools to improve the health services on the Internet.

In this dissertation the different guidelines of the main accreditation programmes are analysed. The perception of the responsible personnel in charge of medical websites on the accreditation seal usefulness is studied as well as the prevalence usage of the quality seals in these web sites.

Conclusions: the standardization is very difficult considering the wide number of guidelines and quality criteria. The responsible personnel in charge of medical websites admit that the WMA seal has a positive influence in the quality of their websites and that the seals are moderately used although the webs presenting them are usually of a higher quality then the rest.

У дисертації здійснено комплексне дослідження проблеми впровадження комп’ютерно орієнтованої методики розвитку іншомовної комунікативної компетентності майбутніх фахівців лікувальної справи. Описано та проаналізовано комп’ютерно орієнтовані методики розвитку іншомовної комунікативної компетентності майбутніх спеціалістів лікувальної справи в університетах зарубіжних країн. Розглянуто та проаналізовано електронні освітні ресурси у вітчизняних медичних університетах, зокрема у Тернопільському національному медичному університеті ім. І. Я. Горбачевського (ТНМУ). Розроблено та науково обґрунтовано організаційно-педагогічну модель розвитку іншомовної комунікативної компетентності майбутніх спеціалістів лікувальної справи. Розроблено критерії, рівні й дескриптори оцінювання іншомовної комунікативної компетентності майбутніх фахівців лікувальної справи. Надано рекомендації щодо використання комп’ютерно орієнтованої методики розвитку іншомовної комунікативної компетентності майбутніх спеціалістів лікувальної справи, зокрема запропоновано авторську організаційно-педагогічну модель розвитку іншомовної комунікативної компетентності майбутніх спеціалістів лікувальної справи
The complex research of use of computer oriented methodology of foreign communicative competence development of future medical specialists is carried out in dissertation. Computer oriented methods of foreign communicative competence development of future medical specialists at foreign universities is analyzed and described. Electronic educational resources at Ukrainian medical universities and I. Horbachevsky Ternopil National Medical University (TNMU) is described and analyzed. At first organizational and pedagogical model of foreign communicative competence development of future medical specialists is developed and scientifically substantiated; the characteristics of foreign communicative competence (gnostic, communicative, emotional) and components of foreign communicative competence of future medical specialists are singled out: linguistic (usage by personality language material in language units), sociolinguistic (ability to use language in particular society), discursive (ability to understand and achieve coherence in perception and creation of utterances in a foreign language, use it in speech in different discourses; strategic (ability to compensate by verbal and nonverbal means of shortcomings in foreign language proficiency); socio-cultural (awareness of social-cultural context of foreign language); social (ability and willingness to communicate with those, who use this language as native); professional (knowledge, skills and abilities that provide understanding of professional problems and adequacy of conclusions, objectification of special terms, separation of main data, assessment of their significance from standpoint of professional activity, overcoming of the psychological barrier during communication by foreign language and activation the communicative potential of individuality based on awareness of own need for communication; evaluation criteria, levels and descriptors of foreign communicative competence development of future medical specialists are developed; the content of basic concept is clarified: foreign communicative competence of future medical specialists, as a confirmed ability to apply linguistic, sociocultural, communicative knowledge, skills, abilities and attitudes for foreign language, intercultural and interpersonal communication in professional medicine and life experience, to exchange experiences with native speakers for personal development and lifelong learning; theoretical and methodical bases of computer-oriented usage of foreign communicative competence development of future medical specialists in system of medical education were further developed. The recommendations of usage computer oriented methodology of foreign communicative competence development of future medical specialists are given, in particular, the author’s organizational and pedagogical model of foreign communicative competence development of future medical specialists is proposed. Materials of thesis research can be used in the training of future medical specialists for the syllabus development of foreign language at higher medical institutions, to improve the skills of medical workers, to develop educational and methodological support for computer-based environment at higher medical institutions for foreign languages learning and foreign communicative competence formation of future medical specialists