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Teses / dissertações sobre o tema "Vitis – Maladies – Lutte contre"

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Jousse, Cyril. "Contribution à la lutte contre les maladies du bois de la vigne, en particulier l'esca". Phd thesis, Université de Poitiers, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00185265.

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Resumo:
L'esca est un syndrome cryptogamique vasculaire de la vigne (Vitis vinifera). Une phase pionnière, sous la dépendance de Phaeoacremonium aleophilum (PA), Phaeomoniella chlamydospora (PC) et éventuellement de Eutypa lata (EL) permet la mise en place d'autres espèces. Depuis l'interdiction de l'arsénite de sodium, cette maladie n'est plus contrôlée.
Nous avons étudié les propriétés de PA, PC et EL, en particulier l'impact sur leur croissance de fongicides commerciaux et de fongicides systémiques synthétisés au laboratoire, ainsi que de molécules naturelles. Ces pathogènes ne présentent pas la même sensibilité à ces molécules et l'un d'eux (PA) est peu affecté par divers traitements. En parallèle, nous avons étudié les propriétés d'ambimobilité de l'acide salicylique (AS) et de quelques-uns de ses dérivés halogénés.
Nous avons montré que F 30, un dérivé acide du fenpiclonil, est mobile dans les boutures de vigne après application foliaire. Il est en partie retenu dans le bois et libère la molécule parent dans les racines. L'acide 5-chlorosalicylique (5-ClAS), connu pour être plus actif que AS pour stimuler les défenses naturelles, présente une mobilité voisine de celle de AS. Sur ces bases, F 30 et 5-ClAS ont été retenus pour des tests préliminaires de traitement par voie foliaire de boutures de vigne infectées.
Cette recherche exploratoire souligne la complexité de la problématique, une lutte chimique (fongicide), génératrice de contraintes, devant s'intégrer dans une stratégie globale de contrôle.
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Decante, Damien. "Répartition spatio-temporelle et migration de la cicadelle verte (Empoasca vitis Goethe) dans un agro-écosystème viticole". Bordeaux 2, 2007. http://www.theses.fr/2007BOR21405.

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Resumo:
L'éco-éthologie de Empoasca vitis a été étudiée dans le vignoble à différentes échelles temporelles (semaine, génération, année) et spatiales (parcelle, ilôt de production, appellation). Elle hiverne dans les abords des parcelles sur des plantes à feuillage persistant et migre vers des plantes hôtes intermédiaires (complémentation), avant de coloniser les parcelles au printemps. Le niveau des populations estivales (potentiellement nuisibles) est influencé par des migrations estivales de longue distance. Les répartitions intra-parcellaires des adultes et larves, cartographiées et comparées avec les caractéristiques agronomiques des parcelles, révèlent de fortes agrégations dans les zones vigoureuses. La présence de plantes-hôtes alternatives de E. Vitis aux abords des parcelles (supplémentation) ne semble pas augmenter les populations. L'effet régulateur des auxiliaires en provenance des abords n'a pas été démontré. Une végétation haute et dense induit l'accumulation des adultes migrants
The eco-ethology of Empoasca vitis was studied in vineyards at different temporal (week, generation, year) and spatial (plot, production site, small region) scales. This leafhopper hibernates near the plot on evergreen plants and, in spring, migrates towards different early-budding plants before ilmmigrating into the plots (complementation). Summer population levels (sometimes harmful) depend strongly on summer migrations taking place over longer distances. The intra-plot distribution of both adults and nymphs was mapped and compared to agronomical parameters. This revealed strong aggregations in areas of high plant vigour. The presence of potential alternative host plants of E. Vitis along the plot border (supplementation) did not seem to increase population levels. No impact of natural enemies from plot borders was detected. High and dense plot borders were shown to induce accumulation of migrating adults
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3

Legrand, Valérie. "L'eutypiose de la vigne : Caractérisation, structure et expression du gène Vr-ERE. Effets de sa surexpression chez divers Vitis". Toulouse, INPT, 2002. http://www.theses.fr/2002INPT003A.

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Resumo:
L'eutypiose est une grave maladie de dépérissement de la vigne provoquée par le champignon Eutypa lata. Il a été précédemment démontré au laboratoire que le parasite, présent au niveau du bois, agit par l'intermédiaire d'une toxine: l'eutypine. Aucun traitement curatif n'est disponible à ce jour. Un mécanisme de détoxication de l'eutypine a été caractérisé et un gène (Vr-ERE) codant pour une réductase a été isolé chez Vigna radiata. Afin de démontrer le rôle de l'eutypine dans la maladie, la stratégie retenue consiste à exprimer l'ADNc Vr-ERE codant l'eutypine réductase, chez la vigne. Ainsi, la forme réduite de l'eutypine ne sera plus phytotoxique. Tout d'abord, le gène Vr-ERE a été caractérisé et sa structure étudiée. Un gène homologue nommé Vr-ERE2 a été isolé chez Vigna radiata et l'expression de l'ADNc chez coli a permis de montrer que la protéine correspondante possédait également une activité eutypine réductase. L'analyse des séquences peptidiques déduites des séquences nucléotidiques révèle de fortes homologies avec CPRD 14, isolé à partir d'un génotype de Vigna unguiculata résistant à la sécheresse et avec la CAD1 d'Eucalyptus gunni. Des vignes de 110 Richter et de Portan, surexprimant le gène Vr-ERE ont été obtenues par transformation génétique via A. Tumefaciens. Chez la variété 110 R, la surexpression du transgène permet d'augmenter la tolérance à l'eutypine. Enfin, la possibilité d'utiliser le gène Vr-ERE en tant que gène de sélection en association avec l'eutypine, au cours des opérations de transformation génétique, a été étudiée. Ce gène, d'origine végétale, a été introduit en tandem avec un gène codant pour une chitinase, dans une construction génétique. Des lignées cellulaires de Gamay, sélectionnées en présence d'eutypine, surexpriment les deux transgènes et manifestent in vitro un niveau de tolérance à l'eutypine nettement supérieur à celui des cellules non transformées
Infection of grapevine by the fungus Eutypa lata, results in severe withering of the plant, a disease named Eutypa dieback, for which there is to date, no remedy. The parasite is localised in the woody parts of the plant and exerts it' s pathogenic effect through a toxin termed, eutypine. The Vr-ERE gene, encoding a reductase has been cloned from Vigna radiata, and has been proved, to be involved in detoxication mechanisms of eutypine. Vr-ERE gene has been characterized, sequenced and used to clone Vr-ERE2, a homologous gene from Vigna radiata. A functional protein Vr-ERE2 has been produced in E. Coli and was able too to reduce eutypine. Peptide sequence analysis translated from nucleotide sequences revealed strong homologies to CPRD 14 isolated from a drought resistant Vigna unguiculata variety and to CAD1 from Eucalyptus gunni. As a first step towards understanding the role of eutypine in dieback disease, over-expression of Vr-ERE has been attempted by Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of 110 Richter and Portan varieties. Over-expressing eutypine in variety 110 Richter confers protection towards Eutypa lata. The possibility of using eutypine as a selectable marker in genetic transformation studies has been tested in association with the Vr-ERE plant gene. A chimeric construction harbouring a chitinase gene, as well as the Vr-ERE gene has been introduced in an Agrobacterium tumefaciens binary vector and subsequently used to transform Gamay variety. Gamay cellular lines, selected on eutypine, have been shown to over-express both transgenes. The level of tolerance to eutypine in vitro is significantly higher than in non transformed cell lines
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Haidar, Rana. "Caractérisation, criblage et mise en oeuvre de souches bactériennes issues du vignoble bordelais pour la lutte biologique contre les champignons impliqués dans la Pourriture grise et l'Esca de la vigne". Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0155/document.

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Resumo:
Contre la pourriture grise et les maladies du bois (MdBs), qui sont des maladies cryptogamiques majeures de la vigne, la lutte biologique a un potentiel de développement considérable dans le contexte actuel de réduction des intrants chimiques en viticulture.L’objectif de cette thèse est de sélectionner et d'étudier des souches bactériennes antagonistes de Botrytis cinerea (Pourriture grise) et de deux champignons pathogènes clefs liés aux MdBs: Phaeomoniella chlamydospora et Neofusicoccum parvum. Les expériences de screening principales sont réalisées in vivo et in planta sur 46 souches bactériennes isolées dans le vignoble bordelais. Le niveau de protection par les souches antagonistes dépend significativement de la souche bactérienne, de l’espèce de champignon pathogène ciblée, du tissu ou organe végétal hôte, mais aussi pour N. parvum, du mode d’application de la souche bactérienne et, pour B. cinerea, du génotype lié aux transposons : transposa ou vacuma.Une réduction significative de 40 à 64% de la taille des nécroses dues à P. chlamydospora et/ou N. parvum est induite par trois souches bactériennes Pantoea agglomerans (S1), Paenibacillus sp. (S19) et Bacillus pumilus (S32) sur des boutures de vigne non greffées. Ces souches ont fait l'objet d'investigations approfondies pour déterminer leurs principaux modes d’action : Antibiose, production de composés volatils qui ont été identifiés et/ou induction de différents gènes de défense de la vigne.Concernant B. cinerea, les souches Enterobacter cowanii (S22), Enterobacter sp. (S23), Bacillus ginsengihumi (S38) et Bacillus sp. (S43, S46) présentent un pouvoir antagoniste important par production de composés volatils et diffusibles anti-Botrytis, ainsi que par compétition pour les nutriments par E. cowanii (S22)
Biological control of gray mold and grapevine trunk diseases (GTDs), which are major fungal diseases of grapevine, has a considerable potential development in the current context of reduction of chemical input in viticulture.The aim of this study was to select and study bacterial strains for antagonism against Botrytis cinerea, the causal agent of gray mold, and two key pathogens involved in GTDs: Phaeomoniella chlamydospora and Neofusicoccum parvum. The main screening experiments for antagonistic activity of 46 bacterial strains, isolated from Bordeaux vineyards, have been carried out under different in vivo and in planta conditions. The efficacy of protection by the antagonistic strains significantly depended on the bacterial strain, the targeted pathogen species, the host plant tissue or organ and, for N. parvum, also on the application mode of the bacterial strain and, for B. cinerea, on the transposon genotype: transposa or vacuma.A significant reduction in length of necrosis due to P. chlamydospora and/or N. parvum, ranging between 40 and 64% in non-grafted vine cuttings, resulted from three bacterial strains: Pantoea agglomerans (S1), Paenibacillus sp. (S19) and Bacillus pumilus (S32). These strains were thoroughly further investigated to determine their major modes of action by i) Antibiosis ii) production of antifungal volatile organic compounds, which have been identified, and/or iii) induction of different grapevine defense genes. Concerning B. cinerea, Enterobacter cowanii (S22), Enterobacter sp. (S23) Bacillus ginsengihumi (S38), Bacillus sp. (S43, S46) were of prime importance in the biocontrol by producing anti-Botrytis volatile and diffusible compounds or by competing for nutrients (case of E. cowanii S22)
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Bellee, Anthony. "Approches multidisciplinaires sur le mode d’action, l’efficacité et l’élaboration de stratégies d’utilisation d’actifs biologiques contre divers bioagresseurs de Vitis vinifera". Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0201.

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Resumo:
La vigne est une culture pérenne sensible à de nombreux bioagresseurs et sur laquelle il est nécessaire de réaliser de nombreux traitements pesticides, susceptibles de causer des problèmes environnementaux, de santé humaine et d’apparition de résistance au sein des populations de bioagresseurs. Aujourd’hui, il est indispensable de développer des stratégies nouvelles de lutte contre les bioagresseurs, plus raisonnées mais permettant de conserver une viticulture compétitive. L’utilisation de produits de biocontrôle semble, en ce sens, être une approche prometteuse permettant d’allier agriculture durable et intensive.Deux écoproduits généralistes à fort potentiel ont été identifiés, comme possédant des actions intéressantes sur les principales maladies cryptogamiques de la vigne. Le premier est un extrait naturel de plante, sans action fongicide directe mais capable de stimuler efficacement et de façon systémique les défenses de la plante. Le second, quant à lui, est un microorganisme qui possède une forte action antagoniste fongicide, mais aussi la capacité à stimuler les défenses de plante. Dans un premier temps, des études en conditions contrôlées ont mis en évidence l’efficacité des deux actifs pour inhiber le développement de diverses souches d’Erysiphe necator, Plasmopara viticola, Botrytis cinerea et Botryosphaeriaceae. En parallèle, des expérimentations au vignoble, ont confirmé le fort potentiel de ces produits de biocontrôle, avec des bonnes efficacités, particulièrement stable avec l’extrait naturel. Ces différentes études nous ont permis d’identifier et d’élaborer des stratégies d’utilisation pour ces deux produits de biocontrôle
Grapevine is a perennial crop sensitive to many fungal pathogens that require numerous pesticide treatments. However, its uses lead to environmental, human health and fungicide resistance problems. Developing sustainable pest management strategies while keeping a good wine quality is of major importance. In this sense, the use of bio-pesticides products seems to be a promising approach to combine sustainable and intensive agriculture.Two generalist bio-pesticides of great potential have been preliminary identified, forits actions on major fungal diseases of grapevine. The first one is a natural plant extract, with no direct fungicide action but able to systemically stimulate plant defenses. The second one is a microorganism showing strong antagonist fungicide actions, and important ability to stimulate plant defenses. First, the studies conducted in controlled conditions have demonstrated the effectiveness of both products in the suppression of various isolates of Erysiphe necator, Plasmopara viticola, Botrytis cinerea and Botryosphaeriaceae. In parallel,the good efficiencies of these products have been confirmed during vineyard assays. This was especially well demonstrated for the natural extract. As a whole, these studies confirm thepotential of these two products as promising bio-pesticides, of which the strategy of application have been further defined
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Battiston, Enrico. "Développement d’un outil innovant pour optimiser l'activité biologique des substances actives afin de contrôler des maladies fongiques chez Vitis vinifera L. Unmanned A erial Vehicle (UAV) - based remote sensing to monitor grapevine leaf stripe disease within a vineyard aff ected by esca complex Grapevine trunk diseases: a review of fifteen years of trials for their control with chemicals and biocontrol agents". Thesis, Reims, 2018. http://www.theses.fr/2018REIMS046.

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Resumo:
Ce travail a consisté en l'étude l'application du phosphate de calcium comme système de transporteur (" drug delivery ") pour la protection de la vigne (Vitis vinifera L.). Ce biomatériau a été étudié avec succès dans le domaine médical, de la fonctionnalité du phosphate de calcium avec des molécules anticancéreuses, à la mise au point d'un dentifrice innovant. Des essais préliminaires dans le contrôle des maladies fongiques de la vigne ont révélé des résultats prometteurs.Dans ce contexte, l'hydroxyapatite inorganique et biomimétique a été étudié en tant que système transporteur potentiel de substances bioactives autorisées en agriculture biologique pour la protection des plantes. À travers une approche multidisciplinaire, l'objectif de l'étude était d'évaluer l'efficacité de l'hydroxyapatite dans l'amélioration de l'activité biologique des composés de cuivre(II) pour lutter contre des maladies fongiques telles que le mildiou et les maladies du bois. Cette étude a pour ambition de contribuer à l'optimisation de la distribution et de la persistance des substances bioactives dans les tissus végétaux, y compris vasculaires, où des pathogènes nocifs peuvent se développer ainsi qu'à la réduction des quantités de fongicides.Cette recherche a ainsi permis de (i) comprendre l'interaction entre le système transporteur, la substance fonctionnelle et les tissus de la vigne ; (ii) démontrer le mécanisme sur lequel l'efficacité supérieure de la substance fonctionnelle est basé ; (iii) recueillir de nouvelles informations sur les mécanismes impliqués dans l'expression des symptômes des maladies du bois en étudiant les réactions de défense des plantes induites par les traitements
The research investigates the application of biomimetic calcium phosphate as innovative delivery system for grapevine (Vitis vinifera L.) protection purposes. This smart material was successfully studied in the biomedical field, from the functionalization of biomimetic calcium phosphate with anti-cancer molecules for localized releases, to the development of an innovative toothpaste for oral hygiene. Preliminary assays to implement the control of the grapevine fungal diseases, have revealed promising results. In this framework, the biomimetic inorganic hydroxyapatite was investigated as potential delivery system of bioactive substances allowed in organic agriculture for plant protection.Through a multidisciplinary approach, the study was aimed to evaluate the efficiency of hydroxyapatite in enhancing the biological activity of copper(II) compounds, on the control of relevant common diseases, like downy mildew, and complex fungal diseases, such as the grapevine trunk diseases. This aim is related to further ambitious goals: the significant reduction of the fungicides amounts applied in plant protection and the optimization of the distribution and persistence of the bioactive substances in the plant tissues, including the vascular ones, where harmful pathogens can develop. Overall, the experimental activities allowed: (i) to understand the interaction between delivery system, functional substance and grapevine tissues; (ii) to demonstrate the mechanism on which the higher efficacy of the functional substance is based; (iii) to collect new information on the mechanisms involved in the symptoms expression by studying the plant defense reactions induced by the treatments
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Compant, Stéphane. "Interaction entre la vigne, Vitis vinifera L. , et une bactérie endophytique, Burkholderia phytofirmans souche PsJN : colonisation, induction de défenses et résistance systémique contre Botrytis cinerea". Reims, 2007. http://theses.univ-reims.fr/exl-doc/GED00000953.pdf.

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Resumo:
Lors de ces travaux, l’interaction entre la vigne, Vitis vinifera L. , et une PGPR endophytique, Burkholderia phytofirmans souche PsJN, a été étudiée. Ceci a permis de caractériser des phénomènes de colonisation bactérienne, des réponses de défense de la plante, ainsi qu’une résistance systémique induite (ISR) permettant une protection contre l’agent pathogène Botrytis cinerea Pers. L’association entre la vigne et la souche PsJN a tout d’abord été étudiée en conditions gnotobiotiques en utilisant des plantules in vitro, la souche bactérienne de type sauvage ou des dérivés génétiques (PsJN::gfp2x et PsJN::gusA11). Ceci a permis de déterminer une colonisation épi- et endophytique des racines de vigne par la souche PsJN ainsi qu’une migration de la bactérie de l’intérieur des racines jusqu’aux feuilles, par le biais du flux d’évapo-transpiration de la plante via les vaisseaux du xylème. La colonisation de la vigne par la souche PsJN a ensuite été étudiée en conditions non stériles en utilisant des boutures fructifères dans le but de décrire une possible colonisation des inflorescences. Les résultats obtenus ont permis de montrer une colonisation épi- et endophytique du système racinaire par la bactérie et ensuite, une migration des racines jusque la rafle et les jeunes baies, en présence d’autres micro-organismes. La mise en place de composés de défense ainsi qu’une ISR induite par la souche PsJN a été ensuite déterminée sur des boutures fructifères. Ceci a été caractérisé avant sa progression systémique et avec des conditions plus stériles. Des événements précoces tels que l’accumulation de peroxyde d’hydrogène et d’oxyde nitrique, ainsi que la synthèse de composés phénoliques ont été caractérisés au niveau racinaire. De plus, il est apparu, d’après des résultats préliminaires, que la souche PsJN induit, au niveau local ainsi qu’au niveau systémique, des gènes codants des protéines PR dont la signalisation dépend de la voie de l’acide salicylique et / ou de l’acide jasmonique. Ceci a permis de suggérer que la souche bactérienne induit des mécanismes communs des phénomènes de résistance systémique acquise (SAR) et d’ISR. Ces phénomènes permettent, par la suite, une protection de la vigne au niveau floral vis à vis de l’infection causée par B. Cinerea Pers
The interaction between grapevine, Vitis vinifera L. , and an endophytic PGPR, Burkholderia phytofirmans strain PsJN, has been studied in this work. This has allowed to characterize phenomenons of bacterial colonization, some plant defence responses as well as induced systemic resistance (ISR) confering protection against the phytopathogen Botrytis cinerea Pers. Association between grapevine and strain PsJN has been studied, firstly, under gnotobotic conditions by using in vitro plantlets, PsJN wild-type strain or some genetically derivatives (PsJN::gfp2x and PsJN::gusA11). This has allowed to determine epi- and endophytic colonization of grapevine roots by strain PsJN as well as a migration of the bacterium from the endorhiza to the leaves, mediated by the plant transpiration stream via xylem vessels. Grapevine colonization by strain PsJN has been then monitored under non-sterile conditions by using fruiting cuttings, with a special emphasis on putative inflorescence colonization. Results have demonstrated an epi- and an endophytic colonization of the root system by strain PsJN and then, its spreading from the endorhiza to grape inflorescence stalk and to young berries, even in presence of other microorganisms. Plant defence compounds as well as a ISR induced by strain PsJN has been then determined on fruiting cuttings. This has been characterized before its systemic spreading inside plants and with some more sterile conditions. Some early events such as hydrogen peroxide and nitric oxide accumulations as well as phenolic compound synthesis have been characterized at the root level. In addition, preliminary results have demonstrated that strain PsJN induces locally and systemically some PR-encoding genes, dependent of salicylate and/or jasmonate signaling pathways. This has allowed to suggest that this bacterium induces common mechanisms of Systemic Acquired Resistance (SAR) and of ISR phenomenons. These phenomenons allow then a protection of grapevine flowers against infection caused by B. Cinerea Pers
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Rezgui, Awatef. "Étude de la microflore colonisant les tissus ligneux de Vitis vinifera : Intérêt pour le développement d’agents de biocontrôle contre une maladie du bois de la vigne, l’esca". Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0449/document.

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Resumo:
Les maladies du bois de la vigne (MDBs) et plus particulièrement l’esca, sont devenues en l’espace de deux décennies l’objet de préoccupations majeures puisqu’elles mettent en danger la pérennité de nombreux vignobles partout dans le monde. En Tunisie, ces maladies sont peu connues mais elles semblent être en pleine expansion et, en France, environ 13% du vignoble est improductif à cause des dépérissements qu’elles provoquent. Pour lutter contre les MDBs, les filières viticoles françaises et tunisiennes sont actuellement dans une impasse technique car elles ne disposent d’aucune méthode de lutte chimique « curative ». Dans ce contexte, l’objectif de cette thèse est de (i) déterminer quels agents pathogènes sont responsables des dégradations du bois de la vigne en Tunisie ? Les symptômes correspondent-ils à ceux de l’esca ? Existe-t-il une spécificité des agents pathogènes chez les ceps tunisiens ? Aussi (ii) afin de lutter contre ces maladies du bois (MDBs), de potentiels agents de biocontrôle bactériens ont été recherchés dans les parties ligneuses de ceps sélectionnés dans des vignobles tunisiens. Ils ont été caractérisés et des essais de protection in planta ont été réalisés. [...] Ces champignons ont été identifiés au niveau morphologique et moléculaire. Leur pathogénicité a été confirmée après inoculation sur jeunes plants de vigne. Des travaux originaux basés sur la co-inoculation de plants de vigne par ces 3 pathogènes ont montré qu’ils pouvaient rentrer en compétition entre eux au sein du végétal. Par ailleurs, sur le même thème, 2 autres pathogènes des MDBs, i.e. Phomopsis viticola et Diploidia seriata, ont été isolés dans une autre étude à partir de ceps prélevés dans la même région en Tunisie. Dans une deuxième étape, la microflore bactérienne colonisant les tissus ligneux de vignes prélevées dans le nord de la Tunisie a été étudiée afin de rechercher des agents de lutte biologique potentiels. La technique d’empreinte moléculaire Single-Strand Conformation Polymorphism (SSCP) a d’abord montré que les communautés bactériennes étaient différentes en fonction des tissus qu’elles colonisaient, i.e. le bois nécrosé ou sain. Soixante-neuf souches bactériennes ont été isolées par méthode pasteurienne, et les 19 souches les plus abondantes ont fait la suite de l’étude. L’identification moléculaire de ces souches par séquençage de l’ARNr 16S et du gène rpoB a montré l’existence de 4 genres colonisant les ceps de vignes : Bacillus, Curtobacterium, Pantoea et Pseudomonas. Ces bactéries ont été également caractérisées au niveau biochimique, métabolique et génétique. Des tests de sélection in vitro contre les trois pathogènes fongiques ont été effectués, suite auxquels, une souche B6 de B. subtilis a été sélectionnée pour des essais de protection in planta en serre. Par la suite, une étude combinant deux bactéries antagonistes isolées de bois de vigne tunisien, i.e. B. subtilis B6, et français, i.e. Pantoea agglomerans S5, a été réalisée pour lutter contre 2 agents pathogènes, Phaeomoniella chlamydospora (isolé des vignobles français) et N. parvum (isolé des vignobles tunisiens), impliqués dans les MDBs. Deux cépages, un fréquent en Tunisie, le Muscat d’Italie, et l’autre en France, le Cabernet Sauvignon, ont été utilisés. En effet, suivant l’agent pathogène et le cépage utilisés, les résultats de protection obtenus étaient différents. Les meilleurs résultats de protection ont été obtenus en combinant les bactéries et en les appliquant sur Muscat d’Italie contre les 2 champignons pathogènes. La spécificité et l’efficacité de la protection biologique a ici été démontrée
Grapevine trunk diseases (GTDs) such as esca are of major concern for viticulture worldwide. In Tunisia, knowledge about the symptoms of this disease and the microflora associated with, is still incomplete despite their ability to cause considerable damage to vineyards. In France, around 13% of whole vineyard is unproductive because of GTDs, and no effective treatment currently exists. In that context, the objectives of the present PhD study were: (i) to characterize the fungal microflora inhabiting the wood tissues of Tunisian esca-foliar symptomatic vines in order to identify the pathogens responsible for wood decay. (ii) To investigate the bacterial microflora colonizing the wood tissues of Tunisian grapevines cv. Muscat d’Italie in order to find a suitable Biological Control Agent (BCA) that can be applied to vineyards. First, in order to better characterize the microflora colonizing the wood tissues of vine, samples were collected from 10 vineyards in the north of Tunisia. Fungal isolates were obtained from trunk of grapevines showing decline, small and distorted leaves and chloroses. To identify the isolated fungal species, sequencing of the Internal Transcribed Spacer region of the rDNA was performed (ITS1 and ITS4 primers). Three pathogens, i.e. Lasidiodiplodia pseudotheobromae, Neofusicoccum parvum and Schizophyllum commune, described in the literature as involved in GTDs were isolated for the first time in Tunisia. Their pathogenicity was confirmed in planta. Moreover, the coinoculation of these 3 fungi in planta, showed that they displayed a competitive inhibition effect on each other. In another study, two others pathogens involved in GTDs, i.e. Phomopsis viticola and Diploidia seriata were also isolated from the same region. This PhD also aimed at identifying the bacterial microflora inhabiting the wood tissues of escafoliar symptomatic vines, i.e. necrotic and non-necrotic wood, using microbiological and molecular approaches. Complex bacterial communities, as shown by Single-Strand Conformation Polymorphism (SSCP) analyses, colonize both types of wood tissues. After isolation, the 19 most abundant cultivable strains were sequenced (16S rRNA and rpoB genes) and identified as belonging to four genera: Bacillus, Pantoea, Pseudomonas and Curtobacterium. They were then screened for their in vitro antagonistic traits against the three pathogenic fungi L. pseudotheobromae, N. parvum and S. commune. Based on the results obtained, two bacterial strains were selected: B. subtilis (strain B6) and Pantoea agglomerans (strain S5), respectively isolated from Tunisian and French grapevines. They were then tested in planta on young vines of cv Muscat d’Italie and Cabernet Sauvignon against two fungal pathogens involved in GTDs, i.e. N. parvum (isolated from Tunisian wood) and Phaeomoniella chlamydospora (isolated from French vines). Young vines of both cultivars were inoculated by B. subtilis B6, P. agglomerans S5 or the combination of B6+S5, singly or in combination with N. parvum and P. chlamydospora. In terms of plant protection, the most efficient condition to reduce in planta necrosis caused by the fungal pathogens in the two cultivars was the combination of the two bacteria. However, bacterial treatments were significantly more efficient to reduce necrosis caused by N. parvum or P. chlamydospora in Muscat d’Italie than in Cabernet Sauvignon
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Pierron, Romain. "Esca et vigne : compréhension des mécanismes de défense précoces du bois de la vigne Vitis vinifera L. suite à la maladie, colonisation des champignons in planta et proposition de moyens de lutte pour une viticulture durable". Phd thesis, Toulouse, INPT, 2015. http://oatao.univ-toulouse.fr/14651/1/Pierron.pdf.

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L’esca est une maladie du bois de la vigne complexe et mal connue, contre laquelle aucun moyen de lutte efficace n’existe à ce jour. Ce travail s’est concentré sur les interactions précoces entre Vitis vinifera L. et les champignons associés au « young esca » P. chlamydospora et P. aleophilum dans deux types de tissus lignifiés : l’entre-nœud et le nœud (modèle plaie de taille). La colonisation 6 et 12 semaines après traitement des souches transformées P. aleophilum::gfp7 et P. chlamydospora::gfp1 a été observée. Les deux espèces coloniseraient différents tissus dans les premières semaines suivant l’infection. Les fibres du xylème constitueraient un tissu essentiel lors de l’interaction précoce entre P. aleophilum et la vigne, tandis que P. chlamydospora::gfp1 a seulement colonisé les vaisseaux du xylème après 12 semaines. Le bois de la vigne présenterait des réponses spécifiques à la présence de P. aleophilum 6 semaines après traitement, puis générales à la blessure 12 semaines après traitement, en microscopie. L’hypothèse de la spécificité de la réponse induite dans le bois de la vigne par ces deux espèces a été confirmée en étudiant l’expression de 11 gènes associés à la défense 10 h, 24 h, 48 h et 120 hpi. La réponse précoce du bois de la vigne serait spécifique suivant l’identité des pathogènes. Les tissus de l’entre-nœud ont été induits différemment par la blessure par rapport aux tissus dans la région nodale. Un modèle pour le criblage d’agents de biocontrôle ou d’éliciteurs contre l’esca en quelques mois en conditions de laboratoire a permis le développement d’un moyen de lutte durable et novateur, l’eau ozonée. L’eau ozonée présente des propriétés sporicides remarquables contre P. aleophilum in vitro. In planta l’application d’eau ozonée sur une blessure infectée en modèle plaie de taille a réduit de moitié la quantité de mycélium capable de se développer dans le bois 9 semaines après inoculation.
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Restrepo-Leal, Julian David. "Optimisation de la production d’effecteurs de Botryosphaeriacées pour maîtriser leur phytopathogénicité et exploiter leurs enzymes pour le bioraffinage du végétal". Electronic Thesis or Diss., Reims, 2024. http://www.theses.fr/2024REIMS027.

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La viticulture est constamment sous la menace de maladies, notamment fongiques. Au cours des dernières décennies, les maladies du bois de la vigne (MDB), des pathologies très destructives, menaçant la pérennité du vignoble, sont en pleine expansion. L'une des MDB les plus répandues dans le monde est le dépérissement à Botryosphaeriacées. Les champignons de cette famille utilisent de nombreuses armes biochimiques, y compris des enzymes dégradant les parois cellulaires des plantes (PCWDEs) et des métabolites secondaires phytotoxiques, pour coloniser la vigne. Nous souhaitions produire, purifier et caractériser des PCWDEs et des phytotoxines des Botryosphaeriaceae afin de mieux connaître les mécanismes qui sous-tendent leur pathogénicité et leur virulence. Nous cherchions également à tirer profit des Botryosphaeriaceae pour obtenir de nouvelles enzymes lignocellulolytiques qui pourraient être utiles au bioraffinage végétal. En utilisant des comparaisons génomiques, nous avons mis en évidence la richesse des enzymes actives sur les glucides (CAZymes), potentiellement impliquées dans la dégradation des parois cellulaires des plantes, dans le génome de Neofusicoccum parvum. Lorsqu'il est cultivé dans des fermentations en milieu liquide, N. parvum peut produire de nombreuses CAZymes et métabolites secondaires, notamment dans des milieux de croissance contenant des biomasses lignocellulosiques. Par ailleurs, nous avons établi une méthode de purification de la phytotoxine (R)-melléine en utilisant une approche innovante via la chromatographie de partage centrifuge. Enfin, nous avons également débuté une approche visant la production hétérologue de trois nouvelles CAZymes : une acétylxylane estérase, une pectate lyase et une cellulase encore non caractérisée. Dans l'ensemble, nos résultats ont permis de mieux comprendre l'influence de la biomasse lignocellulosique sur l'expression des facteurs de pathogénicité et de virulence chez N. parvum. Cette étude pourrait également être utile pour découvrir des enzymes plus efficaces pour des applications industrielles
Viticulture is constantly threatened by plant diseases, especially those caused by fungi. In the last decades, Grapevine Trunk Diseases (GTDs) have arisen as highly destructive and rapidly expanding pathologies. One of the most worldwide prevalent GTDs is Botryosphaeria dieback, caused by Botryosphaeriaceae. These fungal species may rely on many biochemical weapons, including Plant Cell Wall-Degrading Enzymes (PCWDEs) and phytotoxic secondary metabolites, to successfully colonize the grapevine. Here, we aimed to produce, purify, and characterize PCWDEs and phytotoxins from Botryosphaeriaceae to increase knowledge of their mechanisms underlying pathogenicity and virulence. We were also interested in taking advantage of Botryosphaeriaceae pathogens to obtain novel lignocellulolytic enzymes that may benefit plant biorefining. Using genomic comparisons, we highlighted the remarkable richness of Carbohydrate-Active Enzymes (CAZymes), potentially involved in the plant cell wall degradation, in the genome of Neofusicoccum parvum. When cultured in submerged fermentations, N. parvum could produce numerous CAZymes and secondary metabolites, notably in growth media containing lignocellulosic biomasses. Furthermore, we established a purification method for the virulence-factor-candidate phytotoxin (R)-mellein using an innovative approach via Centrifugal Partition Chromatography. We also started an approach to heterologously produce three novel CAZymes: an acetylxylan esterase, a pectate lyase, and an uncharacterized cellulase. Overall, our results provided insights into the influence of lignocellulosic biomass in the expression of pathogenicity and virulence factors in N. parvum. This study may also be helpful for the discovery of more efficient enzymes for industrial applications
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Nivault, Aurelia. "Diversité et traits d’histoire de vie des Botryosphaeriaceae et évaluation du potentiel de défense de différents cultivars de Vitis". Thesis, Bordeaux, 2017. http://www.theses.fr/2017BORD0811/document.

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Vitis vinifera L. représente l’une des cultures les plus répandues dans les pays producteurs de vin, laquelle est soumise à de nombreuses contraintes environnementales pouvant favoriser l’émergence des maladies de dépérissement du bois (MDB). La famille des Botryosphaeriaceae est responsable du Botryosphaeria dieback, provoquant des chancres et des nécroses qui conduisent à une dépréciation de la qualité du vin, voire à la mort des ceps. Les méthodes de lutte sont peu efficaces. Sept espèces sont retrouvées dans le vignoble français dont B. dothidea, D. intermedia, D. mutila, D. seriata, Do. viticola, N. parvum et L. viticola. Nous avons étudié différents traits d’histoire de vie de ces agents pathogènes : (i) leur agressivité in planta, (ii) leur adaptation à des contraintes environnementales (e.g. température, fongicides), (iii) la présence de mycovirus, pour acquérir des connaissances sur leur pouvoir adaptatif face aux contraintes environnementales et expliquer la variabilité de leur agressivité. En complément, l’évaluation de la sensibilité de cultivars de Vitis face à une infection par N. parvum et D. seriata a été réalisée, et le potentiel de défenses de différents cépages (Ugni Blanc, Cabernet-Sauvignon et Merlot) a été étudié. L’ensemble des travaux menés ont permis de révéler des espèces très agressives telles que N. parvum et L. viticola par rapport à D. seriata, lors d’inoculations en serre sur des boutures. Les températures optimales de croissance déterminées montrent que certaines espèces (ex. Lasidiplodia spp.) sont mieux adaptées à des températures élevées (33°C). Par ailleurs, la sensibilité de 65 souches et génotypes a été testée pour 9 fongicides avec des modes d’action différents (inhibiteurs de la respiration mitochondriale, de la biosynthèse des stérols, du cytosquelette, multi-sites, etc.). De nombreuses espèces sont peu ou pas sensibles à certains de ces fongicides et des souches résistantes ont été trouvées avec un facteur de résistance pouvant atteindre plus de 1000. D’autre part, la détection de mycovirus au sein des 65 isolats a permis d’identifier la présence de 6 mycovirus, dont Neofusicoccum luteum mitovirus 1 et Neofusicoccum luteum fusavirus 1. L’évaluation du potentiel de défense des trois cultivars Vitis face à une infection par N. parvum et D. seriata a montré des réponses différentes entre cépages et en fonction de l’agent pathogène. In fine, des analyses croisant les différents traits d’histoire de vie et les interactions plante-pathogènes ont été faites, et l’ensemble des résultats nous a fourni de nouvelles pistes d’étude pour lutter contre ces agents pathogènes
Vitis vinifera L. is largely cultivated in countries producing wine but an increase in grapevine trunk diseases (GTDs) have been observed due to the attack of several fungal pathogens including those belonging to the Botryosphaeriaceae family (Botryosphaeria dieback). Seven species were isolated in the French vineyards B. dothidea, D. intermedia, D. mutila, D. seriata, Do. viticola, N. parvum and L. viticola. Nowadays, no efficient products are available to control these diseases. Studying, different life traits of 65 strains of different genotypes of the Botryosphaeriaceae’s family, known to have members displaying different aggressiveness, would lead to a better understanding of these wood pathogens. Their in planta aggressiveness, their adaptation towards environmental pressures (temperature, fungicides), and the detection of mycoviruses were carried out. In order to have a better comprehension of the interaction within the plant, the expression analysis of genes involved in the plant defense were assayed upon 3 cultivars (Cabernet Sauvignon, Merlot, and Ugni-Blanc) but also on two species (N. parvum and D. seriata). L. viticola, and N. parvum, were shown to be more aggressive than D. seriata and. L. viticola is more adapted to higher temperature (33°C). Moreover, the strains tested with 9 different fungicides (mitochondrial respiratory, sterol biosynthesis, cytoskeleton or multisite inhibitors, etc.) showed lower sensitivity within some species, (with a resistance factor reaching a 1000). In addition, at least 6 mycoviruses were characterized. Amongst them, two mycoviruses were isolated from a N. luteum strain and were fully sequenced (Neofusicoccum luteum mitovirus 1 and Neofusicoccum luteum fusavirus 1). The three cultivars infected with either N. parvum or D. seriata showed different gene responses between themselves but also between the different strains inoculated. These different studies are giving us more information upon these Botryospheriaceae fungi, to find out new efficient or complementary methods in order to control GTDs
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Blanc, Sophie. "Cartographie génétique et analyse de la résistance au mildiou et à l'oïdium de la vigne chez Muscadinia Rotundifolia". Phd thesis, Université de Strasbourg, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00819905.

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Les variétés traditionnelles de vigne nécessitent de très nombreux traitements phytosanitaires pour lutter contre les maladies cryptogamiques qui touchent leurs parties herbacées, comme le mildiou et l'oïdium, causés par Plasmopara viticola et Erysiphe necator respectivement. Ces traitements, coûteux et préjudiciables pour l'environnement, pourraient être réduits par l'emploi de variétés résistantes. La vigne cultivée européenne (Vitis vinifera, 2n=38) est très sensible au mildiou et à l'oïdium. En conséquence, la résistance doit être introduite à partir d'autres Vitaceae ayant un niveau de résistance plus élevé à ces maladies. Plusieurs origines de résistance ont déjà été observées et inventoriées, en particulier chez l'espèce d'origine américaine Muscadinia rotundifolia (2n=40). Ces facteurs sont d'un intérêt majeur pour la sélection de variétés résistantes. Cependant, lors du processus d'introgression, des difficultés à obtenir des pépins viables en F1 ainsi que des anomalies phénotypiques dans les descendances en rétrocroisement ont été constatées. Afin d'optimiser la gestion des résistances provenant de cette espèce dans les programmes d'amélioration variétale, il est nécessaire de comprendre l'organisation génétique et génomique de M. rotundifolia, et de compléter la connaissance des facteurs de résistance issus de cette espèce. Dans ce contexte, les objectifs de la thèse sont : (i) de réaliser une analyse comparative des génomes de V. vinifera et M. rotundifolia et (ii) d'identifier de nouveaux facteurs de résistance chez M. rotundifolia utilisables à terme en sélection. Pour cela, une carte génétique de M. rotundifolia a été développée à partir d'une population de 200 individus issue de l'autofécondation de M. rotundifolia cv. Regale. Parallèlement, la même population a été testée pour son niveau de résistance au mildiou et à l'oïdium. Une carte génétique couvrant 950 cM a été réalisée. Elle comprend 191 marqueurs microsatellites répartis sur les 20 chromosomes de M. rotundifolia, et permet de conclure à un niveau de macrosynténie très élevé avec V. vinifera. Le groupe de liaison 20 de M. rotundifolia correspondrait à la partie inférieure du groupe de liaison 7 de V. vinifera. Par ailleurs, un QTL de résistance au mildiou a été détecté sur le groupe de liaison 18 de M. rotundifolia, au niveau d'une région riche en gènes de type NBS-LRR, et un nouveau QTL de résistance majeur à la l'oïdium a été mis en évidence sur le groupe de liaison 14 de M. rotundifolia. Ce QTL, nommé Ren5 pour 'Resistance to Erysiphe necator 5', montre une action précoce dans l'arrêt de la croissance du mycélium du pathogène, dès l'établissement des premiers stades de biotrophie du champignon. De plus, le QTL Ren5 a été confronté à deux souches supplémentaires d'E. necator, appartenant aux deux groupes d'oïdium retrouvés dans vignobles européens, contre lesquelles il reste efficace. Les données de cartographie génétique générées pour M. rotundifolia dans ce travail, ainsi que la mise en évidence de Ren5 et de son mode d'action, permettront d'améliorer la gestion des facteurs de résistance issus de cette espèce pour la sélection de variétés résistantes au mildiou et à l'oïdium.
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Alaphilippe, Aude. "Effets secondaires de l'utilisation d'un agent de lutte biologique : rôle des metabolites primaires de surfaces des feuilles dans l'interaction entre l'agent de lutte biologique et Cydia pomonella L". Paris, AgroParisTech, 2008. http://www.theses.fr/2008AGPT0039.

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Masih, Emmanuel Isaac. "Lutte biologique contre Botrytis cinerea, agent de la pourriture grise de la vigne". Dijon, 2005. http://www.theses.fr/2005DIJOS049.

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La pourriture grise provoquée par Botrytis cinerea est une des maladies les plus importantes de la vigne. L'utilisation intense de traitements chimiques a conduit à la pollution environnementale et au développement de souches résistantes aux fongicides. Ce travail a permis de montrer le pouvoir antagoniste de bactéries, de levures et/ou d'oomycètes du genre Pythium contre B. Cinerea Après avoir sélectionné et identifié les microorganismes antagonistes, l'étude de leur mode d'action a été entreprise. En particulier, les activités enzymatiques et /ou élicitrices ont été étudiées pour les antagonistes retenus. Une relation entre le pouvoir antagoniste et les activités enzymatiques a été montrée et la synthèse, par les souches de Pythium, d'élicitines a été mise en évidence. Elle est en relation avec le déclenchement des mécanismes de défense de la vigne. L'utilisation des antagonistes comme agents de biocontrôle pourrait donc être envisagée pour améliorer la lutte contre Botrytis cinerea
Grey mould disease caused by Botrytis cinerea is one of the most important diseases of the grapevine. The intensive use of the chemical products to irradicate the grey mould disease resulted in environmental pollution, and appearence of the resistant varieties of the pathogen. This study of research showed the antagonism between the B. Cinerea and the bacteria and yeast, and the different isolates of the genus Pythium. The selected antagonistic microbes to Botrytis cinerea, were identified using morphological as well as genetical tools and the study of their mode of action was initiated. The enzymatic activities and the elicitation capability were also studied. These activities have a direct relationship with the trigerring of the natural defence mechanisms of the grapevine. In the following context, the use of the selected micorobes as biocontrol agents can be undertaken for the effective control of Botrytis cinerea
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Capini, Christelle. "Immunisation active anti-cytokine dans la lutte contre les maladies auto-immunes". Paris 6, 2003. http://www.theses.fr/2003PA066395.

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Pelat, Thibaut. "Obtention et ingénierie d'anticorps recombinants thérapeutiques et/ou prophylactiques dirigés contre les agents du risque biologique provoqué". Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20093.

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Les anticorps recombinants (Ac) de primates non humains (PNH) représentent une approche très prometteuse en vue de la prise en charge médicale d'agents du risque biologique provoqué (« armes biologiques »). Nous avons montré les avantages de cette approche et ses particularités méthodologiques. Un scFv neutralisant la toxine létale de B. Anthracis (2LF : KD= 1,02 nM), et dirigé contre la sous-unité « facteur létal », a été isolé à partir d'une banque immune de scFv de PNH exposée à la surface de phages, et caractérisé. Un autre scFv, 43RCA, neutralisant la ricine, a été isolé par la même technique puis évalué (en particulier : KD= 40 pM). Cette approche peut aussi s'appliquer à des pathogènes n'appartenant pas au risque biologique provoqué, puisqu'un scFv dirigé contre Aspergillus fumigatus a aussi été isolé (MS130i-IIIC3 : KD= 0,96 nM). Les outils d'analyse de séquences disponibles en ligne sur le site IMGT® ont permis de montrer la grande similarité de ces scFv avec leurs homologues humains. Des travaux d'ingénierie de fragments d'Ac ont aussi été réalisés, dont une maturation d'affinité in vitro (KD initial = 3,4 nM ; KD final = 0,18 nM). Une approche particulière de l'humanisation ("germline humanization") utilisant les régions charpentes (FR) d'IgM (rencontrés chez tous les sujets à la différence des FR d'IgG) et la standardisation IMGT® a été implémentée pour assurer une tolérance optimale de l'un de nos scFv. Des essais in vivo d'une IgG primatisée ont démontré ses capacités prophylactique et thérapeutique
Recombinant antibodies isolated from non-human primates represent very promising medical countermeasures against bioweapons. The advantages and methodological aspects of this approach have been described. An scFv, neutralizing the lethal toxin of Bacillus anthracis (2LF: KD= 1. 02 nM) and directed against the “lethal factor” subunit was isolated from a phage-displayed immune library, and characterised. Another scFv, 43RCA, neutralizing ricin, was obtained with the same methodology and tested (in particular: KD= 40 pM). This approach may also be used beyond bioweapons, as an scFv directed toward Aspergillus fumigatus was also isolated (MS130i-IIIC3: KD= 0,96 nM). On-line sequence analysis with IMGT tools allowed to show the high degree of similarity between these scFvs and their human counterparts. Antibody fragments were engineered, including an in vitro affinity maturation (KD initial = 3. 4 nM; KD final = 0. 18 nM). Utilizing IMGT standardisation and on-line tools, a “germline humanization” - utilizing FR derived from IgM, encountered by every Human, as opposed to IgG FR - was realized in order to ensure an optimal tolerance for one of our scFvs. A primatized IgG was tested in vivo and showed therapeutic and prophylactic capacities
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Bourgouin, Catherine. "Les Toxines de Bacillus thuringiensis israelensis et de Bacillus sphaericus leur utilisation en lutte biologique contre les vecteurs de maladies tropicales /". Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376121877.

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Sy, Abdoul Aziz. "Lutte biologique contre la pyriculariose du riz (Pyricularia oryzae cav. ) : stratégie et applications". Toulouse, INPT, 1987. http://www.theses.fr/1987INPT025A.

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Quatre vingt douze microorganismes sont testes sous l'angle de leur aptitude a inhiber les formes d'expression predominantes (mycelium, conidies) de pyricularia oryzae cav. Et/ou le developpement de la pyriculariose foliaire au phytotron. In vitro, on observe jusqu'a 100% d'inhibition de la croissance mycelienne et de la germination conidienne du parasite tandis que le taux maximum d'inhibition de la conidiogenese est estime a 74%
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Tachapattaworakul, Thunwadee. "Optimisation de la culture et de la traçabilité de la culture de Trichoderma atroviride destiné à la lutte biologique". Montpellier 2, 2006. http://www.theses.fr/2006MON20076.

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Cacas, Jean-Luc. "Rôle des lipoxygénases et des lipides acyles-hydrolases de type patatine dans l'exécution du processus de mort cellulaire hypersensible chez les plantes". Aix-Marseille 2, 2006. http://www.theses.fr/2006AIX22010.

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Leroy, Valentin. "Décontamination des grains de blé et d'orge par traitements aux ultrasons". Master's thesis, Université Laval, 2017. http://hdl.handle.net/20.500.11794/27917.

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La production céréalière, plus particulièrement le blé et l'orge, subit des pertes importantes de rendement occasionnées par la fonte des semis et les pourritures racinaires. Deux champignons sont majoritairement responsables de ces maladies chez le blé et l'orge : Fusarium graminearum et Bipolaris sorokiniana. L'utilisation des ultrasons comme une alternative « verte » aux fongicides pourrait permettre une culture biologique et minimiser les pertes économiques. L'objectif principal de ce projet consistait à établir les paramètres optimaux (puissance des ultrasons, présence d'éthanol, débit d'oxygène et temps de traitement) afin de réduire la contamination par B. sorokiniana des grains de blé et d'orge sous un seuil de 30 % tout en conservant la germination supérieure au seuil de 85 %. L'ensemble du projet de recherche exploratoire a permis de vérifier l'efficacité de traitements novateurs pour le blé contaminé. Le traitement de ces lots de grains sous forme sèche a révélé un maintien de la germination pour tous les types de traitement (ultrasons 30 W, oxygène en bullage dans l'éthanol et les deux techniques combinées) ainsi qu'une réduction significative du taux de contamination par B. sorokiniana (en moyenne en dessous de 15 %). Pour l'orge, ces traitements semblables ont permis le maintien de la germination ainsi qu'une faible diminution de la contamination par B. sorokiniana. Cette nuance peut être expliquée par la morphologie différente des deux grains. Une réelle avancée dans le domaine du traitement des grains sous forme sèche peut être mise en évidence pour sa rapidité de traitement. Il restera à vérifier l'efficacité du traitement sur d'autres lots et sur des quantités plus importantes pour vérifier la mise à l'échelle du dispositif (supérieure à 100 g). Pour l'avenir, une étude se basant sur le microcalorimétrie sera préconisée pour étudier les prémisses de la germination des grains traités.
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Demeule, Elizabeth. "Effet répressif de Bacillus subtilis et de Bacillus pumilus envers Rhizoctonia solani sur tomate et concombre de serre". Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66758.

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Les agents phytopathogènes telluriques constituent un problème majeur touchant les productions serricoles de concombre (Cucumis sativus L.) et de tomate (Solanum lycopersicum L.). Les traitements biologiques efficaces sont limités pour lutter contre ces agents pathogènes. Cette étude avait pour objectifs d’évaluer (1) l’effet antagoniste in vitro de Bacillus pumilus Meyer et Gottheil souche PTB180 et Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn souche PTB185 envers Rhizoctonia solani J.G. Kühn, Pythium ultimum Trow, Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, Phytophthora capsici Leonian, Fusarium oxysporum Schltdl. et F. oxysporum f.sp. radicis-lycopersici Jarvis & Shoemaker, (2) l’effet répresseur d’une application préventive des bactéries sur la pourriture du collet et la fonte des semis causées par R. solani, sur concombre ou tomate en serre et (3) l’effet des bactéries sur la croissance et la productivité des plants de tomate cultivés en serre. Lors des essais in vitro, PTB180 et PTB185, utilisés seuls et en mélange (1:1), ont fortement inhibé la croissance mycélienne des six agents phytopathogènes. Sur plantules de concombre et de tomate, le mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative (p<0,05) de la sévérité des symptômes de la pourriture du collet. PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont augmenté significativement la hauteur et la masse sèche des plants infectés par R. solani. Les essais sur graines de tomate montrent que PTB180 a augmenté significativement le taux de levée des graines et que PTB185 a réduit significativement la mortalité post-levée tout en favorisant la croissance des plantules. Les tests réalisés sur plants de tomate sains n’ont pas montré d’effet significatif de PTB180 et PTB185 sur la croissance et la productivité des plants. Les bactéries à l’étude pourraient éventuellement représenter une alternative aux fongicides de synthèse pour lutter contre les agents phytopathogènes.
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Mousques, Adeline. "Mise en évidence d'une nouvelle substance antifongique produite par une souche de Pseudomonas cepacia isolée du sol : action sur Botrytis Cinerea". Bordeaux 2, 1996. http://www.theses.fr/1996BOR20446.

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La pourriture provoquée par le champignon phytopathogène Botrytis cinerea représente un coût économique considérable en viticulture et dans de nombreuses cultures. Les moyens de lutte chimique actuels sont rendus insuffisants par l'émergence de souches résistantes. Des voies alternatives de traitement, telle que la lutte biologique sont donc envisagées. Une souche de Pseudomonas cepacia BA1. 92, isolée du sol manifeste un fort pouvoir antifongique à l'égard du champignon. Son action se traduit par une dégénérescence progressive des extrémités en croissance du mycélium. Cette dégradation semble liée à la fixation du principe actif sur certains constituants, vraisemblablement protéiques à la paroi fongique. La phase initiale de dépôt des microfibrilles de chitine (polymère de structure) observée lors de la néoformation de la paroi des protoplastes, est profondément pertubée par l'action du métabolite bactérien. Cette altération s'accompagne également d'un dérèglement important de l'activité secrétoire qui se manifeste par un relargage massif des protéines dans le milieu extérieur et une multiplication intracellaire de vésicules de type secrétoire. La stabilité à l'égard de la lumière, la polarité élevée, la composante osidique et le pois moléculaire de 662 Da, du composé responsable de l'activité antifongique, attestent de son originalité parmi les métabolites secondaires des bactéries du genre Pseudomonas déjà connus. Par ailleurs, d'autres agents de maladies cryptogramiques notamment les champignons responsables de l'Esca et de l'Eutypiose, sont sensibles in vitro à son action. Néanmoins ce métabolite est sans effet sur les levures œnologiques et les bactéries impliquées dans l'élaboration du vin.
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Malembic, Sylvie. "Evaluation de la stratégie planticorps comme méthode de lutte contre les mollicutes phytopathogènes : Action in vitro d'anticorps recombinants sur Spiroplasma citri : Résistance de tabacs exprimant des anticorps recombinants à l'infection par le phytoplasme du stolbur". Bordeaux 2, 2001. http://www.theses.fr/2001BOR28900.

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Les phytoplasmes, bactéries phytopathogènes sans paroi de la classe des mollicutes, sont localisés exclusivement dans le phloème et ont résisté à la mise en culture. Responsables de nombreuses maladies de plantes, aucun moyen de lutte curative n'existe à ce jour. Une strátégie de lutte par transgénèse a été entreprise au laboratoire. Elle consiste à exprimer une immunoglobuline Ig) recombinante de type scFv spécifique du phytoplasme du stolbur, dans le tabac, hôte du phytoplasme. Afin d'évaluer l'efficacité de cette stratégie, nous avons étudié l'action des Ig sur le mollicute phytopathogène cultivé Spiroplasma citri. Nous avons montré que, tant les Ig natives que les scFv, dirigés contre la protéine majeure de sa surface, inhibent la multiplication de ce microorganisme. Nous avons ensuite réalisé l'ingénierie de scFv anti-stolbur pour leur expression dans le tabac suivant les voies d'adressage apoplastique (tabacs 35-pel-scFv et RSS-scFv-KD), afin d'évaluer la production des anticorps dans la sève élaborée où sont localisés les phytoplasmes. Nous avons mis en évidence que les tabacs 35-pel-scFv produisent les scFv en quantité importante mais ne montrent qu'une résistance transitoire à la maladie, les anticorps n'étant probablement pas ou peu adressés vers la sève élaborée. En effet, il a été récemment montré que les protéines de la sève sont produites dans le cytoplasme des cellules compagnes pour transiter via les plasmodesmes vers le tube criblé. Les tabacs pour lesquels l'expression du scFv est ciblée vers le cytoplasme de façon constitutive (35-scFv) ou spécifiquement dans les tissus du phloème (RSS-scFv-KD), malgré un bon niveau de transcription des ARNm du scFv, ne produisent pas d'anticorps détectables et résistent peu à la maladie. Les anticorps sont donc efficaces in vitro pour inhiber la croissance des mollicutes phytopathogènes, mais leur ciblage vers la sève élaborée s'avère difficile. Différentes stratégies envisagées pour optimiser ce ciblage sont discutées
Phytoplasmas are phloem-restricted wall-less bacteria of the class mollicutes which have resisted in vitro cultivation so far. They are responsible for numerous plant diseases and there is no curative method for disease control. An antibody-based resistance method is evaluated in our laboratory for the stolbur phytoplasma. It consists in expressing scFv recombinant immunoglobulins (Ig) specific for this phytoplasma in tobacco plants, natural hosts for this pathogen. First we demonstrated that both native Ig and recombinant scFv, specific for the major surface protein of the culturable phytopathogenic mollicute Spiroplasma citri, inhibit its growth in vitro. Secondly, we engineered various anti-stolbur scFv constructions for their expression in tobacco plants via the apoplastic (35-pel-scFv plants) or symplasmic (35-scFv and RSS-scFv-KD) pathway, to evaluate their production into the phloem sap were phytoplasmas are located. Our results indicate that scFv, although produced in large amounts in 35-pel-scFv tobaccos, were probably not, or only slightly, present in the phloem sap. Only a transient disease resistance was observed in these plants. Indeed, it has been recently demonstrated that many phloem sap proteins are produced in the cytoplasm of companion cells and that they move towards sieve tubes via plasmodesmatas. Transgenic tobaccos plants in which scFv expression was targeted to the cytoplasm either constitutively (35-scFv) or specifically to phloem tissues (RSS-scFv-KD), in spite of a good transcription of scFv mRNAs, did not produce detectable amounts of scFv. These tobaccos, as previously, showed little resistance to the disease. As scFv inhibit in vitro growth of phytopathogenic mollicutes, the plantibody strategy appears to be well adapted to control phytoplasma diseases. However, targeting scFv in the phloem sap has to be optimized and various alternatives for sap targeting are discussed
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Mille, Bruno. "La rhynchosporiose de l'orge à Rhynchosporium secalis (Oud. ) DAVIS : élaboration de nouvelles stratégies de lutte, importance relative des différentes sources d'inoculum". Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112110.

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De nouvelles stratégies de lutte contre la rhynchosporiose de l'orge sont proposées et certaines caractéristiques épidémiologiques de l'agent pathogène Rhynchosporium secalis (Oud. ) Davis, notamment le rôle des semences, précisées en révélant directement la présence du champignon sur ces dernières, ou indirectement lors d'essais au champ. Une première méthode d'analyse, "classique", comprend une désinfection préalable des grains d'orge (éthanol, hypochlorite de sodium et solution antibactérienne et antifongique), avant leur dépôt sur un milieu électif ("orge") et sélectif (terramycine + iprodione + procymidone + 2,4 D). Son taux de réussite est toutefois relativement faible. La deuxième, par immunofluorescence, permet l'analyse de routine des lots de grains. Une plus grande spécificité des immunsérums est obtenue lors de protocoles d'immunisation complexes faisant intervenir des formes antigéniques différentes (spores, mycélium). Les essais de traitements chimiques des semences et de pulvérisations de produits antifongiques sur le sol permettent d'estimer l'importance relative des types d'inoculum "semence" et "sol". Ils démontrent également l'intérêt de telles interventions en tant que techniques culturales. Les mélanges de variétés enfin peuvent aussi constituer une stratégie limitant l'extension de la maladie
New cultural practices against barley scald disease were proposed and some epidemiological characteristics of the fungal pathogen Rhynchosporium secalis (Oud. ) Davis, especially importance of seeds, assessed both directly showing its presence and indirectly by field trials. The first analysis method, a "classical" one, associated barley seeds disinfection with ethanol, sodium hypochlorite and bactericidal and fungicidal solution, before placing them on the elective ("barley") and selective medium (terramycine + iprodione + procymidone + 2,4 D). But the experiments were not adequatly successful. The second method, immunofluorescence, allowed routine analysis of seeds samples. Moreover, a higher specificity of immunsera was obtained by complex immunization procedures including different antigenic forms. The chemical treatments of seeds and sprayings of fungicides on the soil that were tested allowed estimation of the comparative importance of "seeds" and "soil" inoculum. They also demonstrated that such applications can be useful as cultural techniques. Lastly, varietal mixtures can be used as a strategy to limit disease spreading in the crop
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Martoub, Maria. "Impact global de l’huile minérale blanche sur le pathosystème plante-puceron-virus : vers de nouvelles perspectives de lutte contre les virus non persistants". Amiens, 2010. http://www.theses.fr/2010AMIE0121.

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Au champ, le contrôle de la transmission non persistante du virus Y de la pomme de terre repose sur l’utilisation d’huiles minérales blanches en épandage hebdomadaire. Si ces traitements sont efficaces, leurs modes d’action ne sont pas complètement élucidés. Au cours de ces travaux de thèse, nous avons été amenés à évaluer l’impact du traitement sur chacun des 3 partenaires du pathosystème : la plante, le virus et son vecteur, le puceron. Nous avons montré que le traitement des plants de pomme de terre avant leur infestation par des pucerons virulifères, réduit significativement la transmission du virus YNTN. De plus, celui-ci affecte le comportement et la physiologie du puceron colonisateur M. Euphorbiae. Nous avons caractérisé des effets négatifs sur l’orientation du puceron adulte et la survie des stades larvaires. Des effets probiotiques se traduisent par l’amélioration de la survie et de la reproduction des pucerons adultes, ainsi que de certains paramètres de la prise alimentaire. Etonnement, nous montrons que l’exposition directe du puceron au traitement suffit à déclencher des effets similaires : aphicides et probiotiques. Enfin, nous montrons que le traitement de la plante entraine des événements cellulaires précoces et tardifs similaires aux processus de perception et de signalisation en réponse à un bioagresseur. Les résultats obtenus placent l’huile minérale parmi les méthodes de lutte alternatives des plus prometteuses, pour son efficacité et qui répond aux préoccupations environnementales actuelles
Mineral oil weekly spray has been shown to efficiently reduce non persistent PVY transmission in the field. To date, its mode of action is poorly understood. In this project we assessed mineral oil effect on each partner of the plant – aphid – virus system. We showed that potato plant treatment prior to viruliferous aphid infestation, led to significantly reduced virus YNTN transmission. Besides, it affects M. Euphorbiae behaviour and physiology. Indeed, we characterized negative effects on adult orientation and nymphal survival. Other probiotic effects characterized were: enhanced longevity and reproduction of surviving adults, and some parameters related to feeding behaviour as well. Surprisingly, we demonstrated that direct aphid exposure to mineral oil is sufficient to trigger similar aphicid and probiotic effects. Eventually, we show that plant treatment triggers cellular events similar to pathogen perception and signalling response. Our results highlight the high-potential use of mineral oil as alternative method in virus transmission control, for its efficacy and environment friendly use as well
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Gbedjissi, Louis Ghélus. "Relations mollusques - diptères sciomyzidae, implications dans la lutte contre les distomatoses au Bénin". Avignon, 2003. http://www.theses.fr/2003AVIG0312.

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Sept Sepedon et 1 Sepedonella sont trouvées au Bénin. Les populations fluctuent selon le caractère aquatique permanent ou non des milieux, la pluviométrie et les fréquentations humaines. Les cycles de 6 espèces sont inédits. L'alimentation larvaire est testée avec les mollusque Biomphalaria pfeifferi, Lymnaea natalensis, Bulinus forskalii impliqués dans les parasitoses animales et humaines. Sepedon knutsoni et Sepedonella nana n'attaquent que l'oligochète Aulophorus furcatus. L'annélidophagie serait un comportement secondaire distinct de la malacophagie stricte des Sciomyzidae. Sepedon ruficeps est malacophage et annélidophage. S. Umbrosa, parasitoi͏̈de terrestre,force la bouche de Subulina octona. S. Trichrooscelis, parasitoi͏̈de de Succinea campestris consomme aussi Lymnaea natalensis. S. Ruficeps apparaît comme un agent potentiel au contrôle des mollusques nuisibles au Bénin. La prédation des L3 est la plus élevée et dépend aussi de la taille et de l'éthologie du mollusque-proie
Seven Sepedon and 1 Sepedonella are found in Benin. Population levels fluctuate following permanent or temporary states of aquatic habitats, rainfall and human activities. Complete life cycles are gave for 6 species. Larval predation is tested with various snails, Biomphalaria pfeifferi, Lymnaea natalensis, Bulinus forskalii, known to their implication as intermediate-host of animal or human distosomiasis. Sepedon knutsoni and Sepedonella nana attack and consume only on aquatic oligochaeta Aulophorus furcatus. This annelidophagous behavior is probably derived from the habitual malacophagous known for all Sciomyzidae larvae. Sepedon ruficeps larvae are both malacophagous and annelidophagous. S. Umbrosa larvae are parasitoid of the terrestrial gastropoda Subulina octona which is attacking by forcing its mouth. S. Trichrooscelis larval are parasitoi͏̈d of Succinea campestris, occasionnaly eat Lymnaea natalensis. With a higth predation by their instar larvae, S. Ruficeps is a very good species in a tentative to reduce the snails levels implicated in the distosomiasis. But, the larval predation to depend on size and snail behavior
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Martini, Jessica. "Acteurs et dynamiques d’action publique autour de la lutte contre les maladies chroniques dans un pays sous régime d’aide: Le cas de la lutte contre le diabète au Mali". Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2020. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/308303.

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Introduction. La présente thèse explore les processus de construction de l’action publique et la manière dont ils influencent la participation des associations de patients, à partir du cas d’une maladie chronique, le diabète, et dans le contexte d’un pays à faible revenu, le Mali. Si la question de la participation a été étudiée de longue date dans la littérature, en revanche elle a été peu étudiée en lien avec le diabète et en contexte africain en particulier. Cadre théorique. Une approche interdisciplinaire originale a fondé ce travail, intégrant des réflexions et cadres théoriques issus de la santé publique, des sciences politiques et de la sociologie. Dans une perspective d’action publique, l’accent a été mis sur les acteurs et leurs interactions, en prenant en compte différentes échelles d’action (locale, nationale et internationale). Méthodes. Les données ont été récoltées à Bamako sur une période longue, de 2008 à 2014, et à partir de plusieurs projets. La triangulation des sources (autorités nationales, partenaires internationaux, associations) et des techniques qualitatives d’enquête (entretiens, observations, revue documentaires) a été privilégiée.Résultats. La gouvernance du secteur de la santé et les dynamiques de la société civile malienne montrent l’engagement des autorités nationales et des partenaires internationaux en faveur de la participation de la société civile. Or, l’histoire de la lutte contre le diabète revèle les angles morts des stratégies et mécanismes promus en faveur de cette participation. La mise à l’agenda tardive du diabète par les autorités maliennes, au début des années 2000, suit la tendance internationale autour des maladies non transmissibles, mais elle contraste avec la mobilisation précoce des patients et des professionnels de santé engagés autour du diabète dès 1991. Différents facteurs peuvent expliquer cette dissonance entre stratégies nationales et internationales d’une part, et engagements locaux d’autre part. Les processus de mise à l’agenda, ainsi que la capacité des associations de patients à s’imposer sur la scène publique et politique, sont influencés par les représentations, les ressources, et les formes d’engagement des acteurs engagés aux différentes échelles et périodes.Discussion. Ce travail montre comment la mise à l’agenda d’une maladie et la place accordée aux patients dans l’action publique dépendent d’une co-responsabilité des multiples acteurs engagés. Il met également en évidence le caractère intermittent du partenariat entre associations de patients diabétiques et décideurs politiques, révélant ainsi le cloisonnement et la fragilité des acquis obtenus dans le cadre d’autres maladies, telles que notamment le VIH/sida.Conclusion. Ce travail invite à continuer l’analyse des politiques de santé dans une perspective d’action publique, en contexte africains mais également dans une perspective comparative avec les contextes des pays du Nord.
Doctorat en Santé Publique
info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Marchive, Chloé. "Identification et caractérisation fonctionnelle d'un gène codant un facteur de transcription de type WRKY chez la Vigne, VvVRKY1 : implication dans les mécanismes de défense". Bordeaux 1, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR13144.

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Afin de comprendre le rôle des facteurs de transcription WRKY dans les réactions de féfense de la Vigne (Vitis vinifera) contre des agents pathogènes, nous avons identifié un ADNc, VvWRKY1, codant une protéine présentant de fortes homologies avec les membres de cette famille multigénique. Après avoir vérifié la fonctionnalité de la protéine, traduite par sa capacité à se lier à l'ADN spécifiquement au niveau des boîtes W, l'étude de l'expression de ce géne chez la Vigne a été réalisée. VvWRKY1 est ainsi fortement régulé au cours du développement des feuilles et des baies de raisin. Des molécules de stress comme l'acide salicylique, l'éthylène, le peroxyde d'hydrogène induisent son expression dans les feuilles de Vigne alors que l'acide jasmonique la réprime. L'analyse fonctionnelle de VvWRKY1 a été entreprise par sur-expression chez le Tabac, Arabidopsis thaliana et la Vigne. Les résultats suggèrent une réelle implication de cette proteine dans la défense contre des champignons pathogènes. Effectivement, une sensibilité différente est observée dans les plantes transgéniques par rapport aux plantes sauvages vis-à-vis de différents champignons. Toutefois, les mécanismes sous-jacents n'ont pas encore été identifiés mais des expériences d'hybridation sur puces à ADN comparant les Vignes transgéniques et les Vignes sauvages ont permis d'identifier des gènes potentiellement régulés par VvWRKY1 dont deux gènes codant des lipoxygénases
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Affia, Hicham. "Évaluation de différents sels et mélanges de sels pour lutter contre "Pseudomonas cichorii" dans la laitue". Master's thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26797.

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Ce projet avait pour objectif d’évaluer l’efficacité de certains sels utilisés comme agents de conservation dans l’industrie agroalimentaire et pharmaceutique pour lutter contre la maladie des taches et des nervures noires de la laitue (Lactuca sativa), causée par la bactérie Pseudomonas cichorii. L’étude a permis 1) de déterminer les concentrations minimales inhibitrices (MICs) des sels et de mélanges de ces sels envers des souches virulentes de P. cichorii et 2) d’évaluer l’effet de ces sels et mélanges de sels, appliqués à des concentrations avoisinant les MICs, sur le développement de la maladie. Les résultats obtenus montrent une réduction significative, bien que partielle et variable, de la gravité des symptômes de maladie suite à l’application de NaHCO3 (160 mM), de AlCl3 (4 mM) et des mélanges Na2S2O5 + CaCl2 (12 mM), Na2S2O5 + AlCl3 (4 mM) et Na2S2O5 + NaHCO3 (125 mM). À la lumière des résultats obtenus, il est clair que les sels testés dans le cadre de cette étude ne permettent pas une réduction suffisamment marquée de la maladie pour envisager la commercialisation des plants. On ne peut toutefois exclure la possibilité que ces sels puissent permettre une réduction suffisante de la maladie des taches et des nervures noires lorsqu’utilisés avec des méthodes complémentaires de lutte dans un programme de lutte intégrée.
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Audette, Carolane. "Interaction entre le nématode à kyste (Heterodera glycines) et Phytophthora sojae chez le soya". Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/33829.

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Le nématode à kyste du soya (NKS), Heterodera glycines, est la principale cause de pertes économiques chez le soya aux États-Unis. Au Canada, on le retrouve en Ontario depuis 1988 et il continue à gagner du terrain chaque année. Il a été répertorié pour la première fois au Québec en 2013, et les producteurs de soya québécois ont déjà commencé à déployer des outils pour sa répression. La méthode de lutte la plus utilisée contre cet organisme est l’utilisation de gènes de résistance quantitative combiné à la rotation des cultures. Par contre, l’organisme causant le plus de dommages chez le soya à l’heure actuelle au Québec est la pourriture phytophthoréenne, causée par l’oomycète, Phytophthora sojae. Cette maladie racinaire peut, elle aussi, être réprimée grâce à des cultivars génétiquement résistants (résistance qualitative à gènes Rps). Sachant que le NKS se retrouve déjà dans certaines régions du Québec où sévit également P. sojae, il devient urgent de déterminer si les cultivars de soya présentement utilisés exprimeront une résistance satisfaisante contre ces agents pathogènes majeurs. Dans ce contexte, l’objectif principal de ce projet était d’évaluer l’interaction entre ces deux agents pathogènes du soya en fonction de la résistance (qualitative à gènes Rps / résistance quantitative au NKS) des cultivars utilisés. L’étude, réalisée en système hydroponique, a permis de démontrer qu’en présence d’un cultivar sensible aux deux organismes, P. sojae a un impact négatif sur la capacité du NKS à produire des kystes. Cela suggère que P. sojae pourrait influencer le développement du NKS. La présence du nématode, quant à elle, n’a pas influencé l’efficacité de la résistance qualitative à gènes Rps contre P. sojae. En conséquence, les cultivars résistants aux deux agents pathogènes représentent une bonne option pour prévenir et lutter contre ces affections.
The soybean cyst nematode (SCN), Heterodera glycines, is the leading cause of economic losses in soybean in the United States. In Canada, it has been found in Ontario in 1988 and continues to spread every year. It was identified for the first time in Quebec in 2013 and soybean growers have already begun to deploy management tools. The most commonly used control method against SCN is the use of quantitative resistance genes and crop rotation. However, the most damaging organism in soybean in Quebec currently is Phytophthora root rot, caused by Phytophthora sojae. This root disease can also be controlled by genetically resistant cultivars (qualitative resistance with Rps genes). Because SCN is now present in regions struggling with P. sojae, it is important to determine if the cultivars will express sufficient resistance against these two major pathogens. In this context, the main objective of this project was to evaluate the interaction between these two organisms on soybean, according to the resistance (qualitative Rps genes/ or quantitative resistance to SCN) of the cultivars used. This study, in a hydroponic system, demonstrated that P. sojae has a negative impact on SCN capacity to produce cysts produced. This suggests that P. sojae might influence SCN development. On the other hand, resistant cultivars were not affected by the presence of both pathogens and the presence of the nematode did not influence the efficacy of qualitative Rps resistance gene against P. sojae. As a result, cultivars resistant to both pathogens are a good option for preventing and controlling these diseases.
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Bouchard-Rochette, Mathieu, e Mathieu Bouchard-Rochette. "Bacillus pumilus et Bacillus subtilis pour lutter contre la pourriture grise chez la tomate et le concombre de serre". Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/38128.

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Resumo:
Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.
Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.
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Riffaud, Christine. "La bactériose du melon : écologie et stratégies de lutte contre Pseudomonas syringae pv. aptata". Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10017.

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La bactériose du melon, causée par Pseudomonas syringae pv. Aptata, est une maladie importante dans le Sud-Ouest de la France, avec des foyers éphémères dans le Sud-Est, entraînant des pertes économiques significatives lorsque les conditions sont favorables. L'optimisation de la lutte implique l'identification des réservoirs d'inoculum, une meilleure connaissance de la survie des bactéries en phase épiphyte et la recherche de sources de résistance au sein de l'espèce Cucumis melo. Cette étude a consisté à la mise au point d'une technique de détection et de son application pour détecter P. Syringae pv. Aptata dans des sources potentielles de contamination dans lesquelles la bactérie est capable de survivre en l'absence de culture de melon. Les résultats ont montré que P. Syringae pv. Aptata est présent naturellement à de faible fréquence dans les lacs collinaires servant à l'irrigation des cultures de melon pendant la période hivernale. De même, une étude en contamination artificielle a permis de montrer que P. Syringae pv. Aptata est capable de survivre dans le sol en association avec des déchets de culture. L'effet de la phase épiphyte sur les modifications phénotypiques des cellulus de P. Syringae pv. Aptata a été étudié. Les résultats montrent que P. Syringae pv. Aptata est capable de s'adapter lors de la colonisation épiphyte, en réduisant sa taille et en augmentant sa résistance à un oxydant, par rapport à une culture sur milieu synthétique. Nous avons également recherché les sources de résistance chez l'espèce Cucumis melo. Un génotype dont les fruits sont résistants à P. Syringae pv. Aptata a été trouvé parmi la collection de C. Melo. En revanche, les parties végétatives de tous les 282 génotypes testés sont sensibles à cet agent pathogène. L'ensemble des résultats obtenus permettra d'orienter les recherches vers des stratégies de contrôle plus efficaces contre cette nouvelle maladie en focalisant dans un premier temps sur les facteurs conduisant à la modification du phénotype de P. Syringae pv. Aptata en phase épiphyte et dans un second temps sur la détermination de l'importance épidémologique des différentes sources d'inoculum.
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Derckel, Jean-Paul. "Mécanismes de défense de la vigne (vitis vinifera L. ) contre Botrytis cinerea : caractérisation de chitinases et de ß-1,3-glucanases". Reims, 1997. http://www.theses.fr/1997REIMS018.

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Resumo:
Nous avons etudie les mecanismes de defense de la vigne contre botrytis cinerea et caracterise les chitinases et les -1,3-glucanases. Dans un premier temps, nous avons mis en evidence une activite chitinase dans tous les tissus de la vigne : racines, sarments, feuilles et baies. Cette activite est importante dans les baies (10 fois superieure a celle des autres tissus). Dans la vigne, 13 isoformes de chitinase dont 9 acides et 4 basiques sont constitutives. Elles sont inductibles par la dechirure et par l'acide salicylique. Cinq isoformes induites dans les feuilles sont constitutives des autres tissus etudies. Une sonde homologue a un fragment de gene de chitinase de vigne a ete realisee pour etudier la regulation de son induction. Dans un deuxieme temps, l'activite des chitinases et des -1,3-glucanases dans les baies de raisin a ete etudiee au cours du murissement. L'activite chitinase, absente au cours des premiers stades de developpement de la baie, augmente tout au long du murissement pour atteindre un etat stationnaire a maturation des baies. A contrario, aucune activite -1,3-glucanase n'a ete detectee dans les baies. L'induction de deux isoformes, chv 5 et chv 11 est responsable de l'augmentation de l'activite chitinase dans les baies. Le traitement des baies par la dechirure et par l'acide salicylique induit les activites chitinases et -1,3-glucanases. La chv 5 purifiee possede une activite anti-botrytis (inhibition de la germination des conidies). La chv 5 a ete sequencee, elle appartient a la classe iv des chitinases. Dans un troisieme temps, nous avons etudie l'induction differentielle des mecanismes de defense de la vigne contre b. Cinerea. Deux souches t4 et t8 de b. Cinerea on ete selectionnees pour leur agressivite differente face a la vigne. Les feuilles infectees par la souche la moins agressive (souche t4) montre une induction importante des mecanismes de defense (chitinases, -1,3-glucanases et metabolites secondaires). La souche la plus agressive (souche t8) induit tres peu ces mecanismes de defense avec pour consequence une necrose des tissus. En conclusion les chitinases et les -1,3-glucanases sont impliquees dans les mecanismes de defense de la vigne contre b. Cinerea.
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St-Laurent, Marianne. "Amélioration de la lutte biologique contre le tétranyque à deux points en framboisières sous grands tunnels : essais d'un supplément nutritif, de plantes-réservoirs et de brumisation". Master's thesis, Université Laval, 2017. http://hdl.handle.net/20.500.11794/29866.

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Les grands tunnels procurent de nombreux avantages pour la culture de framboises, dont l’amélioration des rendements et la qualité des fruits. Cependant, ils fournissent également un environnement idéal pour la prolifération du tétranyque à deux points, Tetranychus urticae, un important ravageur. Bien que plusieurs acaricides soient disponibles, les délais avant-récolte et le développement de résistance chez le tétranyque peuvent être problématiques. Les acariens prédateurs phytoséiides, tel Neoseiulus fallacis, sont reconnus pour leur efficacité à contrôler les tétranyques. Toutefois, de nombreuses introductions doivent souvent être faites au cours d’une saison, entraînant des coûts importants. Le principal objectif de cette étude était d’améliorer l’efficacité de la lutte intégrée contre les tétranyques tout en diminuant le nombre d’introductions de prédateurs dans la culture du framboisier sous grands tunnels. Les objectifs spécifiques étaient de déterminer l'efficacité de quatre stratégies de lutte intégrée en framboisière sous grands tunnels et d’estimer le coût ($/ha) de ces stratégies en les comparant à la lutte conventionnelle. Les méthodes de lutte testées combinent les différentes stratégies suivantes : l’introduction des prédateurs Neoseiulus fallacis, l’ajout de la plante-réservoir Sorbaria sorbifolia, l’utilisation du supplément nutritif à base de pollen pour prédateurs « Nutrimite » de Biobest ainsi que la brumisation des tunnels. Les essais se sont déroulés chez deux producteurs de framboises de la grande région de Québec. Les données recueillies par dépistage des tétranyques et des prédateurs ont démontrées que le supplément de pollen a un effet positif sur la capacité de prédation de N. fallacis et que la brumisation tend à diminuer les densités de population de T. urticae.
High tunnels show many benefits for raspberry production, including increased yield and improved fruit quality. However, this crop management approach also provides an environment that fosters outbreaks of the two-spotted spider mite, Tetranychus urticae. Although some miticides are available, pre-harvest application intervals and pesticide resistance development can be problematic. Phytoseiid predatory mites, such as Neoseiulus fallacis, are recognized for their efficacy in controlling spider mites. However, repeated introductions often must be made during a season, resulting in significant cost. To reduce these costs and thereby make biological control more attractive to growers, we tested a food supplement for predators, a banker plant and misting. The main objective of this study was to improve the effectiveness of integrated control against spider mites while decreasing the number of predator introductions in raspberry production under high tunnels. The specific objectives were to determine the effectiveness of four integrated pest management (IPM) strategies in raspberry under high tunnels and estimate their cost ($ / ha) in comparison to conventional control (mitices only) methods. The tested approaches combined different strategies: introduction of Neoseiulus fallacis predators; addition of Sorbaria sorbifolia as a banker plant; use of a pollen-based food supplement for predators, “Nutrimite", from Biobest; and misting. Tests were conducted at two raspberry farms in the greater Quebec City (Quebec, Canada) area. Data collected by monitoring populations of both spider mites and predators show that the pollen supplement has a positive effect on the predatory ability of N. fallacis and that misting tends to reduce T. urticae densities.
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Ali-Haimoud, Djamel-Eddine. "Contribution à l'étude de la lutte biologique contre Drechslera teres (Sacc. ) Shoem. , parasite de l'orge". Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT007A.

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Les principaux resultats de cette etude preliminaire montrent qu'a partir du phylloplan et des residus de recoltes de l'orge, des antagonistes tres actifs in vitro contre les principales sequences biologiques du pathogene peuvent etre isoles. Ce sont principalement differentes especes de trichoderma qui inhibent totalement la morphogenese des organes sclerotioides sur pailles, leur myceliogenese et egalement l'agressivite du mycelium qui en est issu. Ces antagonistes de meme qu'une espece de cephalosporium et une espece d'acremonium sont egalement tres actifs sur la sporulation du resting mycelium sur paille. Parmi les differentes especes de trichoderma utilisees, t. Koningii et t. Pseudokoningii sont capables egalement de reduire en conditions controlees l'expression de la maladie a partir de l'inoculum seminicole. La germination conidienne de d. Teres semble etre une sequence biologique hautement sensible aux antagonistes, a l'exception de fusarium graminearum, cephalosporium sp et ascochyta sp. Cette etude montre egalement que si certains de ces microorganismes conservent in vivo leur pouvoir de s'opposer au bon deroulement de certaines sequences biologiques et epidemiologiques de d. Teres (tels les trichoderma spp), d'autres au contraire se revelent etre de pietres candidats pour la lutte contre le developpement de la maladie in vivo et en conditions controlees. Ainsi, il semble donc qu'il n'existe pas de methode de screening preponderante par rapport a telle ou telle autre methode et que la multiplication de ces derniers soit une condition sine qua non a un choix exhaustif reel de tous les antagonistes potentiels existant dans un environnement donne. L'etude comparee des deux formes du pathogene montre que ces dernieres reagissent differemment aux traitements a l'aide des antagonistes. Ce comportement a deja ete observe par differents auteurs, notamment concernant l'environnement chimique et pourraient expliquer la soudaine explosion de cette maladie en france, particulierement celle due a la forme maculata, liee a l'inadequation de la lutte chimique actuellement pratiquee. Nos resultats montrent par ailleurs que certains antagonistes agissent en fait par effet synergique car ils inhibent in vitro certaines sequences biologiques du pathogene et induisent l'elicitation de proteines de defenses chez l'hote. Ainsi, l'actinomycete micromonospora 6 induit la production d'une chitinase chez l'orge qui est egalement produite lors de l'attaque par d. Teres. Les pr proteines pourraient constituer un outil efficace de l'amelioration genetique de l'orge si l'on etablit une relation (qualitative ou quantitative) entre leur production et la resistance a l'helminthosporiose
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Cedeno, Virna. "Prévention des maladies et amélioration génétique de la crevette : Litopenaeus vannamai en Equateur". Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20243.

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Gravel, Valérie. "Lutte contre Pythium ultimum chez la tomate de serre : une approche microbienne". Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24523/24523.pdf.

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Allaire, Mathieu, e Mathieu Allaire. "Diversité fonctionnelle des Pseudomonas producteurs d'antibiotiques dans les rhizosphères de conifères en pépinières et en milieu naturel". Master's thesis, Université Laval, 2005. http://hdl.handle.net/20.500.11794/18046.

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Resumo:
La production de millions de semis voués à la reforestation est affectée par les problèmes de pourritures racinaires. Afin de développer des agents de biocontrôle adaptés aux pépinières, nous criblons les populations de Pseudomonas spp. des rhizosphères d’épinettes provenant de pépinières et de milieu naturel, pour détecter des gènes de production d’antibiotiques. Nous avons isolé plusieurs souches portant des gènes de production de phloroglucinol, de pyrrolnitrine, de cyanure d’hydrogène et de phénazines. L’analyse de ces gènes montre que pour les producteurs de phloroglucinol, un génotype est dominant dans les pépinières, alors qu’un génotype différent est dominant chez les souches provenant de milieu naturel. Ces dernières possèdent également les gènes de synthèse de la pyrrolnitrine et leur capacité d’inhiber Cylindrocladium floridanum in vitro est supérieur. De plus, en se basant sur la séquence du gène phzC, nous avons isolé trois groupes de producteurs de phénazines, dont deux provenant de milieu naturel et un de pépinière. L’analyse du gène de la portion 16s de l’ARN ribosomal confirme que ces trois groupes appartiennent à différente espèces.
La production de millions de semis voués à la reforestation est affectée par les problèmes de pourritures racinaires. Afin de développer des agents de biocontrôle adaptés aux pépinières, nous criblons les populations de Pseudomonas spp. des rhizosphères d’épinettes provenant de pépinières et de milieu naturel, pour détecter des gènes de production d’antibiotiques. Nous avons isolé plusieurs souches portant des gènes de production de phloroglucinol, de pyrrolnitrine, de cyanure d’hydrogène et de phénazines. L’analyse de ces gènes montre que pour les producteurs de phloroglucinol, un génotype est dominant dans les pépinières, alors qu’un génotype différent est dominant chez les souches provenant de milieu naturel. Ces dernières possèdent également les gènes de synthèse de la pyrrolnitrine et leur capacité d’inhiber Cylindrocladium floridanum in vitro est supérieur. De plus, en se basant sur la séquence du gène phzC, nous avons isolé trois groupes de producteurs de phénazines, dont deux provenant de milieu naturel et un de pépinière. L’analyse du gène de la portion 16s de l’ARN ribosomal confirme que ces trois groupes appartiennent à différente espèces.
Fluorescent Pseudomonas spp. that produce antibiotics such as 2,4-diacetylphloroglucinol and phenazines show biocontrol activity against many important soil borne fungal pathogens. We isolated several strains of Pseudomonas carrying genes for DAPG and PCA synthesis from the rhizosphere of black spruce (Picea mariana) and white spruce (Picea glauca) in two different conifer nurseries and in one natural stand. Sequence analysis of a portion of the phlD gene revealed that one dominant genotype was present in both nurseries and that a different genotype was dominant in the natural forest. Strains from the natural forestwere also found to have the genes for pyrrolnitrin synthesis but lack pyoluteorin biosynthesis genes. Furthermore, in vitro anitfungal assays against Cylindrocladium floridanum showed a much stronger inhibition by strains isolated from natural forest than from nursery. Analysis of phenazine genes revealed 3 groups of phenazines-producers; one from a nursery and two from natural stand.
Fluorescent Pseudomonas spp. that produce antibiotics such as 2,4-diacetylphloroglucinol and phenazines show biocontrol activity against many important soil borne fungal pathogens. We isolated several strains of Pseudomonas carrying genes for DAPG and PCA synthesis from the rhizosphere of black spruce (Picea mariana) and white spruce (Picea glauca) in two different conifer nurseries and in one natural stand. Sequence analysis of a portion of the phlD gene revealed that one dominant genotype was present in both nurseries and that a different genotype was dominant in the natural forest. Strains from the natural forestwere also found to have the genes for pyrrolnitrin synthesis but lack pyoluteorin biosynthesis genes. Furthermore, in vitro anitfungal assays against Cylindrocladium floridanum showed a much stronger inhibition by strains isolated from natural forest than from nursery. Analysis of phenazine genes revealed 3 groups of phenazines-producers; one from a nursery and two from natural stand.
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Bouchard-Rochette, Mathieu. "Bacillus pumilus et Bacillus subtilis pour lutter contre la pourriture grise chez la tomate et le concombre de serre". Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/38128.

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Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.
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Barrera, Gaytan Juan Francisco. "Dynamique des populations du scolyte des fruits du caféier, hypothenemus hampei (Coléoptera : Scolytidae), et lutte biologique avec le parasitoi͏̈de Cephalonomia stephanoderis (Hymenoptera : Bethylidae), au Chiapas, Mexique". Toulouse 3, 1994. http://www.theses.fr/1994TOU30085.

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Ce travail porte sur l'etude de la dynamique des populations d'un insecte ravageur du fruit du cafeier hypothenemus hampei (ferrari) (coleoptera: scolytidae), et sa lutte biologique avec le parasitoide cephalonomia stephanoderis betrem (hymenoptera bethylidae) au chiapas (mexique). Ce ravageur, d'origine africaine, a ete observe pour la premiere fois au mexique en 1978. Le memoire comprend trois sections. Sont tout d'abord presentees des generalites sur la region etudiee (le soconusco) la plante-hote (le cafeier) et l'insecte ravageur (le scolyte). Puis, sont abordees des recherches complementaires sur la dynamique des populations d'h. Hampei ; en particulier, le type de reproduction a ete etudie en detail ainsi que le cycle biologique de ce scolyte dans la nature, les relations liant l'infestation et la phenologie du cafeier (coffea arabica l. ), l'effet de l'ombrage sur l'intensite des attaques et la distribution spatio-temporelle de l'infestation durant quatre annees. Une methode d'echantillonnage binomial sequentiel de ce scolyte est proposee pour evaluer ses niveaux de population. La troisieme partie debute par des generalites sur la lutte biologique utilisee contre h. Hampei, insistant particulierement sur c. Stephanoderis, parasitoide introduit au mexique en 1988. Puis, sont presentees des recherches complementaires sur la biologie de ce parasitoide, son acclimatation dans les cafeieres mexicaines, son elevage de masse et son impact sur les populations d'h. Hampei au champ. Enfin, sur la base des resultats obtenus, est suggeree une methode de lutte biologique contre le ravageur pour la region cafeiere du chiapas
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Bala, Kanak. "Biological control of Botrytis cinerea, a destructive plant-pathogen". Dijon, 2007. http://www.theses.fr/2007DIJOS047.

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Il est connu que les ‘pesticides’ (produits phytopharmaceutiques) utilisés depuis plus de 100 ans en agriculture sont néfastes, autant pour les vivants que pour l’environnement. Il est urgent de développer un remplacement de ces produits toxiques à l’homme et à son entourage. Le but de ce travail est double : d’abord, trouver les micro-organismes non pathogènes dans les vignobles et, ensuite, les mettre en concurrence avec les parasites de la vigne. Nous envisageons de tirer bénéfice sur deux fronts : 1. Lutte biologique contre les maladies cryptogamiques de la vigne, 2. Déclenchement de la résistance chez la vigne contre les maladies. Les micro-organismes utilisés deviennent ainsi, des ‘bio-fongicides’ qui remplacent les produits chimiques. La vigne est attaquée par plusieurs parasites; les plus importants en Bourgogne sont : le mildiou par Plasmopara viticola, l’oïdium par Uncinula necator, et la pourriture grise par Botrytis cinerea. Pour cette thèse nous avons choisi de nous concentrer sur la « pourriture grise » de la vigne et d’autres végétaux, maladie provoquée par le redoutable champignon, Botrytis cinerea. Nous avons isolé quelques espèces de Pythium non pathogènes à partir du sol de vignobles ainsi que d’autres sols agricoles et forestiers. .
The pesticides used in agriculture for controlling phyto-pathogens have hazardous health effects on plants, animals and humans. Massive application of toxic pesticides is a serious problem today in almost all developing countries. Developing safer, environment-friendly biological products may help in overcoming the risks posed by pesticides and may also help in protecting public health, thereby promoting safer means of pest control. This thesis aims at the Biological control of plant diseases by non-phytopathogenic microorganisms, isolated from soil of vineyards and rhizosphere of crop fields. Introduction of these microorganisms leads to a twofold benefit 1. Biological control of the disease by the antagonist effect of the micro-organisms; 2. Enhanced disease resistance in plants to phytopathogens. Hence, these microorganisms could serve as an alternative to chemical control of plant diseases. Grapevine is challenged every year by fungal and viral and bacterial parasites. Among the fungal, the major ones are downy mildew by Plasmopara viticola, powdery mildew by Uncinula necator, black rot by Guignardia bidwellii, phomopsis leaf, cane spot and fruit rot disease by Phomopsis viticola, Eutypa Dieback by Eutypa armeniaceae and grey mould by Botrytis cinerea. Crown gall by bacterial parasite Agrobacterium tumefaciens, and viral diseases includes Peach Rosette mosaic virus disease, tomato ringspot and tobacco ringspot by nematode Xiphinema americanum. .
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Pichard, Brigitte. "Bacillus polymyxa, inhibiteur de parasites microbiens du chou-fleur". Brest, 1992. http://www.theses.fr/1992BRES2018.

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Des problemes d'ordre phytosanitaire dus a des parasites microbiens se posent constamment en agriculture. Les moyens de lutte actuels sont insuffisants contre la plupart des bacteries phytopathogenes. C'est le cas de xanthomonas campestris pv. Campestris, responsable de la nervation noire du chou-fleur. Une souche de bacillus polymyxa (bp1), isolee de semences de chou-fleur, inhibe in vitro plusieurs micro-organismes phytopathogenes. Elle synthetise des substances antifongiques et antibacteriennes, en quantites variables selon les conditions de culture. La production des premieres est favorisee par un milieu a base de lactose et de soytone, celle des secondes par du lactose et un melange d'acides amines. Les deux antibiotiques antibacteriens produits sont des nouveaux peptides denommes gavaserine et saltavaline, en fonction de leur composition en acides amines. La gavaserine contient egalement un acide gras. Les substances antifongiques sont purifiees par les methodes classiques de precipitation et chromatographies. Leurs identifications sont en cours. La souche bp1, ou du moins les antibiotiques qu'elle produit, peut etre utilisee pour traiter les semences de chou-fleur. Elle protege la plante de la nervation noire due a xanthomonas campestris pv. Campestris et peut en meme temps diminuer les fontes de semis causees par alternaria brassicicola. Elle preserve le pouvoir germinatif et le rendement en matiere fraiche des plantules
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Leyronas, Christel. "Avancées dans la compréhension des Neotyphodium et Epichloe, clavicipitacées endophytes des graminées fourragères et à gazon : méthodes de lutte". Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2005. http://www.theses.fr/2005INAP0001.

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Delannoy, Etienne. "Caractérisation de péroxydases associées à la défense du cotonnier ("Gossypium hirsutum") contre "Xanthomonas campestris" pathovar "Malvacearum"". Montpellier 2, 2003. http://www.theses.fr/2003MON20175.

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Poilleux, Francine. "La fédération girondine de lutte contre les maladies respiratoires : adaptation d'une structure à l'évolution de la pathologie respiratoire". Bordeaux 2, 1994. http://www.theses.fr/1994BOR2M222.

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Bernatchez, Alex. "Étude des propriétés antibactériennes de composés d'huiles essentielles contre des agents pathogènes d'aquaculture". Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/40301.

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L’aquaculture est à la base de l’alimentation de nombreux pays orientaux où la demande croît constamment. Afin de répondre aux besoins alimentaires de la population, les aquaculteurs doivent souvent élever le poisson dans des conditions extrêmes et stressantes pour l’animal. Conséquemment, le système immunitaire des poissons est diminué et les infections bactériennes deviennent fréquentes. Plusieurs traitements antibactériens sont à la disposition des aquaculteurs, mais ceux-ci sont rarement souhaitables comme ils ont souvent une faible efficacité ou peuvent stresser davantage les individus élevés. Ainsi, l’investigation de nouveaux agents antibactériens potentiels est cruciale. La communauté scientifique s’est éveillée dans les dernières années aux propriétés antibactériennes, antifongiques et antivirales des huiles essentielles et de leurs composantes. Dans la présente étude, neuf composantes retrouvées dans différentes huiles essentielles ont été évaluées face à quatre des agents pathogènes les plus répandus en aquaculture, soit Aeromonas salmonicida, Flavobacterium columnare, Streptococcus iniae et Vibrio parahaemolyticus. La concentration minimale inhibitrice des neuf molécules a été déterminée, démontrant la cinnamaldéhyde comme étant le meilleur agent antibactérien parmi celles-ci. Des combinaisons de molécules ayant inhibé la croissance bactérienne n’ont pas démontré d’effet synergique lorsque combinées ensemble. La microscopie électronique à transmission a été utilisée pour observer les altérations visibles de la membrane bactérienne et des structures extracellulaires chez S. iniae après exposition à la cinnamaldéhyde. Aucune différence visible n’était observable entre les bactéries exposées et non exposées à la cinnamaldéhyde. La capacité de la cinnamaldéhyde à inhiber la formation de biofilm a été évaluée par coloration au cristal violet. Les résultats observés suggèrent que cette molécule peut affecter négativement la formation de biofilm de certaines bactéries à l’étude. À la lumière des résultats de cette étude, la cinnamaldéhyde semble être un agent antibactérien d’intérêt dans le traitement ou la prévention d’infections bactériennes en aquaculture.
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Marcillaud, Laurence. "Etude des propriétés antimicrobiennes d'un extrait végétal : applications dans les domaines viticole et œnologique". Bordeaux 2, 1998. http://www.theses.fr/1998BOR20632.

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En viticulture, les maladies cryptogramiques restent un problème prépondérant surtout lié à l'apparition de souches résistantes rendant les moyens de lutte actuels insufffisants. L'étude de nouveaux principes actifs d'origine végétale semble une voie de recherche intéressante. Un extrait de pépins et de pulpe de Citrus paradisii manifeste un pouvoir fongicide à l'égard de plusieurs champignons pathogènes de la vigne. Son activité se traduit par une variation de la perméabilité membranaire. Cette action semble liée à l'insertion du principe actif de l'édifice phospholopidique, la cellule perdant alors toute résistance aux phénomènes de plasmolyse. De plus cette activité a pour effet secondaire une modification des processus respiratoires cellulaires. Les premiers essais au vignoble laissent apparaître une activité comparable à celle de la bouillie bordelaise vis-à-vis du mildiou et une faible activité dans le traitement de la pourriture grise sur cépage blanc. Les propriétés antioxydante et anti-microbienne du produit peuvent être également appliquées aux processus de vinification. Ainsi, nous avons pu réaliser des vinifications en l'absence de dioxyde de soufre remplacé par l'extrait végétal. Pour ce qui concerne le mutage et la conservation des vins blancs liquoreux, il a été possible de réduire les doses de dioxyde de soufre.
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Tremblay, Vanessa. "Évaluation de différents extraits végétaux et sels organiques et inorganiques pour lutter contre la tache bactérienne de la laitue". Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/34485.

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La tache bactérienne (Xanthomonas campestris pv. vitians) cause d’importantes pertes économiques dans la culture de la laitue (Lactuca sativa) lorsque les conditions sont propices à son développement. Un seul produit étant homologué au Canada contre cette maladie, peu d’options s’offrent aux producteurs pour lutter contre cette dernière. Cette étude avait pour objectif d’évaluer différents sels (benzoate de sodium, bicarbonate de sodium, carbonate de sodium, métabisulfite de sodium et sorbate de potassium) et extraits végétaux à base de feuilles de chêne (Quercus rubra), choux frisés (Brassica oleracea var. sabellica) et clous de girofle (Syzygium aromaticum) pour lutter contre la tache bactérienne. Sur la base des concentrations bactéricides minimales (CBMs), les sels se sont avérés plus toxiques envers X. campestris pv. vitians que les extraits végétaux avec des valeurs de CBM inférieures. Parmi les extraits végétaux testés, les extraits à l’éthanol de feuilles de chêne et les extraits de clous de girofle se sont révélés les plus toxiques envers la bactérie. Le bioessai I a montré l’efficacité du carbonate de sodium et du benzoate de sodium à réprimer la maladie en présence d’une pression de maladie faible à modérée. De même, différents extraits de clous de girofle, feuilles de chêne et choux frisés (en combinaison ou non avec un sel) ont permis une réduction marquée de la maladie lors des bioessais II et III. En présence d’une forte pression de maladie (bioessai IV), aucun des traitements ayant causé une réduction intéressante de la tache bactérienne lors des essais I, II et III n’a toutefois mené à une réduction suffisamment importante de la maladie pour permettre la commercialisation des laitues. Plusieurs extraits végétaux et sels ont montré au cours de cette étude un potentiel prophylactique intéressant qui pourrait éventuellement être exploité dans un programme de lutte intégrée contre la tache bactérienne de la laitue.
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Pellan, Lucile. "Décryptage des mécanismes impliqués dans le biocontrôle des champignons mycotoxinogènes des céréales". Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTG036.

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Décryptage des mécanismes impliqués dans le biocontrôle des champignons mycotoxinogènes des céréales.Les céréales sont le premier facteur d'exposition des consommateurs aux mycotoxines, des métabolites secondaires toxiques synthétisés par certaines moisissures et présentant un risque pour la santé humaine et animale. Les espèces Fusarium graminearum et Fusarium verticillioides sont ainsi responsables de la production de mycotoxines de type trichothécènes et fumonisines, respectivement, d’un impact élevé surtout en pré-récolte. Avec la diminution de l'utilisation des pesticides en raison de leur toxicité, une stratégie alternative pour lutter contre ces maladies fongiques au champ, peut-être l'utilisation de micro-organismes antagonistes. Non-pathogènes, ces agents de biocontrôle (BCAs) sont capables de limiter la progression des Fusaria et leur synthèse de mycotoxines à l’aide de différents mécanismes biologiques cependant encore mal connus. Dans ce contexte, les objectifs de cette étude sont d’évaluer par quels mécanismes trois BCAs commerciaux sélectionnés (Streptomyces griseoviridis, Trichoderma asperellum, Pythium oligandrum) peuvent moduler la croissance et la production de mycotoxines des pathogènes du genre Fusarium, in vitro et in situ. Des activités antagonistes et des niveaux variables d'inhibition de la croissance (jusqu’à 80%) et de la mycotoxinogenèse (jusqu’ à 90%) ont été observés in vitro selon les BCAs, les pathogènes ou les conditions de culture. Les hypothèses sont ensuite vérifiées et complétées grâce à la mise au point d’une toolbox de tests spécifiques de certains modes d’action. Leur chronologie est évaluée tout au long de l’interaction, de la germination des spores pathogènes jusqu’à la formation de périthèces de conservation, en testant une grande diversité de mécanismes des BCAs : synthèse de composés anti-germinatifs, mycophagie, synthèse d’enzymes chitinolytiques, émission de composés volatils antifongiques, inhibition des voies de biosynthèse des mycotoxines, bio-transformation de mycotoxines, compétition spatiale et nutritionnelle ou impact sur la conservation du pathogène. S. griseoviridis présente des capacités de compétition nutritionnelle, mais sa stratégie principale est basée sur l'antibiose, à travers la synthèse de nombreux composés antifongiques qui compense un déficit important en capacité de colonisation spatiale. Cependant, il peut être à l’origine de stimulation de production de mycotoxines. T. asperellum est capable d'activer un très large éventail de défenses et d'attaques combinant la synthèse de divers composés antifongiques (métabolite, enzymes, COVs), avec différentes cibles (spores, mycélium, mycotoxines), et une action directe par mycoparasitisme. L’efficacité de P. oligandrum est principalement due à sa forte capacité à coloniser l'environnement, avec une action directe via la prédation microbienne et la réduction de la formation de périthèces. Ces comportements in vitro ont pu également être analysés chez F. graminearum in situ tout au long de son cycle de vie (de la colonisation des épis à la survie dans les résidus de culture), et mis en perspectives avec les différents modes d’action identifiés chez chacun des BCAs. L’ensemble du projet a permis d’importantes avancées dans le décryptage des mécanismes d’actions des BCAs, et propose des voies d’amélioration pour optimiser l'utilisation et l'efficacité de ces antagonistes et donc limiter l'utilisation des produits phytopharmaceutiques, tout en maintenant une production saine avec de faibles niveaux de mycotoxines
Deciphering the mechanisms involved in the biocontrol of mycotoxinogenic fungi of cereals.Cereals are the first factor of consumer exposure to mycotoxins, toxic secondary metabolites synthesized by particular moulds and which present a risk for human and animal health. The species Fusarium graminearum and Fusarium verticillioides are thus responsible for the production of trichothecenes and fumonisin-like mycotoxins, respectively, with a high impact especially in pre-harvest. With the decrease of pesticide use due to their toxicity, an alternative strategy to control these fungal diseases in the field may be the use of antagonistic microorganisms. Non-pathogenic, these biocontrol agents (BCAs) are able to limit the progression of Fusaria and their synthesis of mycotoxins through various biological mechanisms, however still poorly understood. In this context, the objectives of this study are to evaluate by which mechanisms three selected BCAs (Streptomyces griseoviridis, Trichoderma asperellum, Pythium oligandrum) can modulate the growth and mycotoxin production of Fusarium pathogens, in vitro and in situ. Antagonistic activities and varying levels of inhibition of growth (up to 80%) and mycotoxinogenesis (up to 90%) have been observed in vitro depending on BCAs, pathogens or culture conditions. The hypotheses are then verified and completed thanks to the development of a toolbox of tests specific to certain modes of action. Their chronology is evaluated throughout the interaction, from pathogenic spore germination to the formation of perithecia, by testing a wide variety of BCA mechanisms: synthesis of anti-germinative compounds, mycophagy, chitinolytic enzyme synthesis, emission of volatile antifungal compounds, inhibition of mycotoxin biosynthesis pathways, mycotoxin bio-transformation, spatial and nutritional competition or impact on pathogen conservation. S. griseoviridis presents nutritional competition capacities, but its main strategy is based on antibiosis, through the synthesis of numerous antifungal compounds that offsets a significant deficit in spatial colonization capacity. However, it can stimulate the mycotoxin production. T. asperellum is capable of activating a very wide range of defenses and attacks combining the synthesis of various antifungal compounds (metabolite, enzymes, VOCs), with different targets (spores, mycelium, mycotoxins), and a direct action by mycoparasitism. The efficacy of P. oligandrum is mainly due to its strong capacity to colonize the environment, with a direct action via microbial predation and reduction of perithecia formation. These in vitro performances could also be analyzed in F. graminearum in situ throughout its life cycle (from colonization of ears to survival in culture residues), and put into perspective with the different modes of action identified in each of the BCAs. The whole project has led to important advances in deciphering the mechanisms of action of BCAs and proposes ways of improvement to optimize the use and efficacy of these antagonists. Thus limit the use of chemical plant protection products, while maintaining a healthy production with low levels of mycotoxins
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