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Teses / dissertações sobre o tema "Ions moléculairess"
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Tenanguena, Nongni Fresnelle. "Modélisation de la formation des ions moléculaires dans les plasmas froids de gaz rares". Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2024. http://www.theses.fr/2024TLSES080.
Texto completo da fonteResumo:
Les ions moléculaires, en particulier les ions dimères de gaz rares, ont une influence très importante sur le comportement des plasmas de gaz rares utilisés dans de nombreux domaines. Par conséquent, l'analyse et la compréhension de leur formation sont d'une grande importance pour la modélisation macroscopique de ces plasmas. L'objectif principal de ce travail est de calculer les constantes de réaction de formation des dimères dans les plasmas froids utilisant des gaz rares comme porteurs sur une large gamme de champs électriques réduits. Pour ce faire, nous avons utilisé des données mésoscopiques (sections efficaces) obtenues à partir de données microscopiques (potentiels d'interaction) pour l'argon afin de fournir des constantes de réaction pour la formation d'Ar_2^+. En outre, pour effectuer nos calculs, nous avons pris en compte les six états électroniques des ions Ar_2^+. Ces six états électroniques sont classés dans deux états de structure fine de l'ion atomique, l'état fondamental (_ ^2)P_(3/2) et l'état excité (_ ^2)P_(1/2). Une approche de trajectoire quasi-classique basée sur l'approche dynamique nonadiabatique du champ moyen et le modèle Diatomics In Molecules (DIM) des interactions des collisions complexes utilisés dans les études précédentes pour calculer les sections efficaces de collision ont été utilisés dans le présent travail. Ces sections efficaces de collision alimenteront un code Monte Carlo adapté et optimisé pour le calcul de données auxiliaires telles que les distributions d'énergie de collision qui sont importantes pour fournir des constantes de réactions de recombinaison ternaire thermiques moyennées des états fondamental et excité de l'ion dimère. Les constantes de réaction de recombinaison ternaire ainsi calculées sont comparées aux mesures expérimentales et théoriques disponibles dans la littérature. Les résultats que nous avons obtenus sont proches de ces valeurs expérimentales et théoriques pour des valeurs sélectionnées de champs électriques réduits, E/N = 1, 50 et 100 Td, dans les conditions standard de température T = 300 K et de pression P = 10^5 Pa. Ainsi, ces résultats devraient être utiles pour régler les générateurs de plasma froid pour des applications spécifiquesMolecular ions, in particular, dimeric rare-gas ions have a very important influence on the behavior of rare gas plasmas used in multiple fields. Therefore, the analysis and understanding of their formation are of great importance for the macroscopic modeling of these plasmas. The main objective of this work is to perform calculations of the rate constants of dimers ion formation in cold plasmas using rare gases as carriers over a wide range of reduced electric fields. To do so we have used mesoscopic data (cross sections) obtained from microscopic data (interaction potentials) for argon to provide reaction rate constants of the formation of Ar_2^+. Further, to perform our calculations we have considered all six lowest-lying electronic states of the Ar_2^+ ions. These six electronic states are classified in two fine structure states of the atomic ion, the ground state (_ ^2)P_(3/2) and the excited state(_ ^2)P_(1/2). A quasi-classical trajectory approach based on the nonadiabatic mean-field dynamics approach and Diatomics In Molecules (DIM) model of the interactions in collision complexes used in preceding studies to calculate the collision cross sections that we will use in the present work. These collision cross sections will feed a Monte Carlo code adapted and optimized for the calculation of auxiliary data such as collision energy distributions which are important to provide averaged, thermal ternary recombination rate constants of ground and excite states of the dimer ion. The ternary recombination rate constants calculated in this way are compared with the experimental measurements and theoretical available in the literature. The results we have obtained, are close to these experimental and theoretical values for selected values of reduced electric fields, E/N = 1, 50, and 100 Td, with standard conditions of temperature T = 300 K and pressure P = 10^5 Pa. Thus, these results are expected to be helpful in tuning cold plasma generators for specific applications
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Petrel, Christophe. "Déterminants moléculaires du site de fixation de modulateurs allostériques du récepteur aux ions calcium extracellulaires : pharmacologie et modélisation moléculaire". Paris 11, 2005. http://www.theses.fr/2005PA11T009.
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Quaglia, Luca. "Etats électroniques des ions moléculaires multichargés transitoires produits par une impulsion laser femtoseconde intense". Paris 11, 2001. http://www.theses.fr/2001PA112336.
Texto completo da fonteResumo:
Les états électroniques des ions moléculaires multichargés transitoires produits par une impulsion laser femtoseconde intense sont étudiés sous différents aspects expérimentaux et théoriques. Les états très excités sont appréhendés pour des éclairements laser de 101̂7 W/cm2̂ grâce à des mesures de fluorescence des fragments atomiques multichargés issus de l'explosion moléculaire. Ces mesures révèlent de façon directe l'existence d'ions moléculaires multichargés dans des états très excités et montrent que l'efficacité de production de ces ions dépend fortement de la configuration électronique initiale du système. Les états peu excités sont étudiés grâce aux spectres d'énergie cinétique de fragmentation dans la gamme d'éclairements de 101̂5-101̂6 W/cm2̂. Les spectres d'énergie expérimentaux sont discutés à l'aide de calculs de courbes de potentiel d'états électroniques d'ions moléculaires multichargés. Dans le cas de la fragmentation des molécules N2 et O2, la comparaison des résultats expérimentaux et théoriques révèle l'existence de plusieurs états peu excités des ions moléculaires correspondants et permet d'expliquer l'énergétique de la fragmentation des ions (N2)4̂+ et (O2) ̂4+ sans évoquer un étirement de la molécule pendant le processus de multiionisation. La population des états très excités est appréhendée grâce à une expérience à deux impulsions basée sur l'anisotropie d'émission des fragments, dont l'origine est caractérisée expérimentalement et interprétée à l'aide d'un modèle bidimensionnel de type Thomas-Fermi de l'interaction laser-molécule. Les expériences pompe-sonde montrent que la population des états très excités est négligeable pour des éclairements de 5x101̂5 W/cm2̂. L'anisotropie d'émission des fragments est due à une réorientation très rapide de l'ensemble du système moléculaire. Les calculs théoriques montrent que la réorientation à lieu pendant le processus de multiionisation et d'explosion coulombienne et que sa rapidité augmente avec l'éclairement laserElectronic states of transient multicharged molecular ions produced by an intense femtosecond laser pulse are studied using different experimental and theoretical techniques. Highly excited states are investigated in the 101̂7 W/cm2̂ laser intensity range with the help of fluorescence spectra of multicharged atomic fragments coming from the molecular explosion. These measures show the existence of highly excited multicharged molecular ions in a straightforward way. The production, efficiency of these highly excited ions strongly depends on the initial electronic configuration. Low excited states studies are based on fragmentation kinetic energy release spectra in the 101̂5-101̂6 W/cm2̂ laser intensity range. These spectra are analyzed with the help of calculations of potential energy curves of multicharged molecular ion electronic states. For the fragmentation of N2 and O2 molecules, the comparison of experimental and theoretical results shows the existence of several low excited states of the corresponding molecular ions and allows to explain the fragmentation energy release of (N2) ̂4+ and (O2)4̂+ ions without resorting to any stretching of the molecule during the multiple ionization process. Population of highly excited states is studied using a two-pulse experimental set-up based on the fragments emission anisotropy. The origin of this anisotropy is experimentally investigated and interpreted with the help of a Thomas-Fermi bidimensional model of the laser-molecule interaction. Pump-probe experiments show that the population of highly excited states is negligible in the 5x101̂5 W/cm2̂ laser intensity range. The fragments emission anisotropy is due to a very fast re-orientation of the molecular system. Theoretical calculations show that re-orientation takes place during the multiple ionization process and Coulomb explosion and gets faster as the laser intensity is increased
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Silva, Jr Humberto da. "Structure et dynamique des ions moléculaires froids : processus de formation et de destruction". Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS401/document.
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Ce travail concerne les mécanismes de formation, de destruction et de relaxation interne des ions moléculaires formes au cours de collisions inélastiques ultra-froides. Ces collisions sont étudiées expérimentalement dans des pièges hybrides mêlant un piège d'atomes ultra-froids et un piège d’ions refroidis par laser. Nous avons effectué une analyse théorique systématique des collisions binaires, assistées par la lumière, impliquant plusieurs sortes de paires atome/ion. Leur interaction mutuelle est décrite par des calculs de chimie quantique basés sur l'utilisation de potentiels de cœur effectifs très précis. La formation d’ions moléculaires par 'association radiative est prédite efficace pour tous les systèmes étudiés, avec une section efficace deux à dix fois plus grande que le processus concurrent, le transfert de charge radiatif. Les constantes de vitesse partielles et totales sont aussi calculées et comparées aux valeurs expérimentales disponibles. Des résonances de forme sont attendues avec une largeur très faible, et pourraient être observées avec la meilleure résolution expérimentale atteinte aujourd'hui. Les distributions vibrationnelles ont aussi été calculées. Elles montrent que les ions moléculaires formés ne sont pas créés dans leur état vibrationnel fondamental. Nous avons ensuite montré que ces ions moléculaires pouvaient être photodissociés par les lasers utilisés dans l’expérience pour le refroidissement et le piégeage. Par ailleurs nous avons étudié la relaxation vibrationnelle des ions formés. Dans les échelles de temps des différentes expériences, nous avons montré que celle-ci ne résulte pas d'une relaxation radiative associée au moment dipolaire permanent de l'ion, mais plutôt à des collisions avec les atomes ultra-froids environnants. Nous avons ainsi étudié cette relaxation interne pour les ions H₂⁺ (resp. Rb₂⁺) lors d'une collision avec des atomes ultra-froids de He (resp. Rb). Ces deux cas sont importants pour des expériences en cours. Nous avons décrit le calcul du potentiel d'interaction nécessaire pour l'obtention de la matrice de couplage qui intervient dans la résolution deséquations couplées multi-voies. En particulier il a été montré, dans le cas He-H₂⁺, que les interactions spin-rotation, du fait de la structure doublet de l'ion, n'ont qu'une faible influence sur la somme des sections efficaces d'état à état (avec ou sans effet vibrationnel). Ces calculs peuvent être donc simplifiés en traitant l'ion à un électron actif comme étant dans un état de spin nul. Dans le cas Rb-Rb₂⁺, l'étude de la relaxation vibrationnelle de l'ion Rb₂⁺ suite à des collisions froides avec des atomes de Rb se heurte à des difficultés supplémentaires: (i) l'échange des atomes identiques conduisant à des collisions réactives qui induisent des pertes dans le piège. (ii) la forte densité d'états internes due à la lourde masse du système. (iii) les interactions inter-voies encore présentes à très longues distances du fait cette forte densité. Néanmoins, nos calculs montrent que la forte anisotropie observée dans les surfaces d'énergie potentielle conduit à la relaxation efficace de l'ion Rb₂⁺ par collision avec des atomes de Rb. Cette tendance pourrait être très générale pour les ions moléculaires triatomiques présentant une forte anisotropie à courte distances et qui sont couramment utilisés dans les pièges hybridesThe work sheds light on the mechanisms, and their efficiency, for (i) formation, (ii) destruction and (iii) internal cooling of cold molecular ions by inelastic ultracold collisions, such as those studied in hybrid setups merging an ultracold atom trap and a laser-cooled ion trap. We have carried out a systematic and consistent analysis of light assisted binary collisions of many relevant atom/ion pairs using accurate effective core potential based quantum chemistry calculations. Radiative association is predicted to occur for all systems with a cross section two to ten times larger than the competitive channel of radiative charge transfer. Partial and total rate constants are also calculated and compared to available experiments. Narrow shape resonances are expected, which could be detectable at low temperature with an experimental resolution at the limit of the present standards. Vibrational distributions are also calculated, showing that the final molecular ions are not created in their internal ground state level. Once light-assisted formation of molecular ions is probed, we have checked their effective radiative lifetime due to the presence of several lasers in the experiments, which turns out to efficiently photodissociate the created ions. Moreover, besides an extremely slow internal relaxation due to the presence of a permanent electric dipole moment, at reasonably time scales, we have found evidences for the population of molecular levels being strongly influenced by collisions with surrounding ultracold atoms. We have further investigated the internal cooling of both H₂⁺ and Rb₂⁺ (with the respective isotopologues) in collisions with ultracold He and Rb atoms, respectively, due to their relevance for experimental implementations. We have described the calculation of the interaction potentials needed to obtain the coupling potential matrix elements used in a multichannel close coupling formalism. In particular, it is shown that the sum of the He-H₂⁺ state-to-state cross sections (with and without vibrational effects) accounting for the coupling between electronic spin and molecular rotation is dynamically equivalent to directly treating the collision problem of a molecular ion as a structureless spherical rotor interacting with the He atom. The additional difficulties of a close-coupling treatment for an effective internal cooling of sympathetically cold Rb₂⁺ ions in collisions with Rb atoms are discussed along the following lines: (i) the homonuclear nature of the problem, inducing trap losses from reactive collisions; (ii) the higher density of internal states due to the heaviness of the system; and, (iii) its long-range neutral-charged interaction. Nevertheless, strong evidence of an efficient internal cooling by inelastic collisions with Rb atoms is found, and may indicate a general trend for all similar heavy species currently found in hybrid trap experiments
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Gargaud, Muriel. "Transfert de charge entre ions multichargés et hydrogène atomique (et moléculaire) aux basses énergies (thermiques jusqu'à quelques KeV/nucléon) : aspects théoriques". Bordeaux 1, 1987. http://www.theses.fr/1987BOR10550.
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Etude theorique de ces collisions dans le domaine des basses energies ou le modele moleculaire permet de decrire les processus de capture electronique conduisant a l'echange de charge, avec une base diabatique issue d'une base adiabatique modifiee par l'introduction de coordonnees de reaction appropriees pour tenir compte du transfert de l'electron au cours de la collision. Illustration par les resultats obtenus avec des ions si**(2+), n**(3+), al**(3+), c**(4+), o**(4+), si**(4+), ti**(4+), n**(5+), o**(5+)
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Tazi, Sami. "Description moléculaire des ions aux interfaces argile-eau". Paris 6, 2012. http://www.theses.fr/2012PA066471.
Texto completo da fonteResumo:
En prévision du stockage géologique en couche argileuse profonde des déchets nucléaires de vie longue, il est nécessaire de comprendre le transport et la rétention des radionucléides, en compétition avec les ions naturellement présents, dans les argiles. Les simulations moléculaires ont largement contribué à comprendre les différents mécanismes en jeu. Cependant sa contribution pour l’étude des ions multivalents à la surface des argiles est restée limitée du fait de l’inexistence de champs de force polarisables pour les argiles. Or les ions multivalents étant fortement polarisants, la polarisabilité ne peut être négligée pour les étudier aux interfaces. Au cours de ce travail, nous avons développé un champ de force polarisable pour les argiles, à partir d’une méthode originale qui repose uniquement sur des calculs ab initio. Nous présentons ici cette méthode et son application aux interactions ion-eau et intra-argile. Nous validons ensuite le champ de force pour les interactions ion-eau sur les propriétés statiques, dynamiques et thermodynamiques, et les interactions intra-argile sur les propriétés statiques et montrons l’intérêt d’un champ de force polarisable en validant cette interaction également sur les spectres infra-rouge. Afin de pouvoir simuler correctement les surfaces latérales des argiles, il est nécessaire de connaître les états de protonation de ses sites de bordure silanols et aluminols, qui jouent un rôle déterminant dans la sorption des ions sur ces surfaces. Ainsi nous avons calculé la valeur des différents pKa à partir d’une méthode originale qui prend ses fondements sur la théorie de Marcus et qui repose sur l’intégration thermodynamique. Ce nouveau champ de force ainsi que la connaissance des états de protonation des différents sites de bordure permettront l’étude du transport et de la rétention des ions multivalents aux interfaces argileusesIn the context of the geological disposal in clay-rich formations of long-lived nuclear waste, it is necessary to understand and quantify the transport and retention of radionuclides in clays. Molecular simulations have greatly contributed to understand the different mechanisms involved, including the competition with naturally occurring species. However its contribution has so far been somewhat limited to the case of simple ions, which are in general monovalent. The study of the multivalent ions on the surface of clays has been hindered by the lack of reliable polarizable force fields for clays. Indeed, multivalent ions being strongly polarizing, induction effects cannot be neglected to study them at interfaces. In this context, we have developed a polarizable force field for clays, from an original method relying on ab initio calculations only. We present here this method and its application to ion-water and intra-clay interactions. We then validate the force field for the ion-water interaction on static, dynamic and thermodynamic properties, and the intra-clay interactions on static properties. We further illustrate the interest of the polarizable force field by validating it on IR spectra. A second challenge for the lateral surfaces of clays is the necessity to determine the protonation state of the silanols and aluminols clay edge site, which play a fundamental role in the sorption of ions on these surfaces. To address this point we calculate the different pKa values from an original method inspired by the Marcus theory and that rely on thermodynamic integration. In conclusion, the newly developed force field and the knowledge of the different protonation states of the clay edge site will allow the study of the transport and retention of the multivalent ions on clay surfaces
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Nana, Ngassam Valéry. "Collisions électrons-ions moléculaires : états résonnants et dynamique de dissociation". Paris 11, 2004. http://www.theses.fr/2004PA112284.
Texto completo da fonteResumo:
La recombinaison dissociative et les processus compétitifs (désexcitation vibrationnelle, excitation vibrationnelle, excitation dissociative etc. ) sont particulièrement efficaces dans les nuages interstellaires où les conditions physiques extrêmes (très faible densité, basse température) favorisent les réactions exothermiques. Ils jouent aussi un rôle important dans d'autres types de plasmas " froids ". Dans ce travail, nous décrivons l'étude de la recombinaison dissociative et des processus connexes pour les ions moléculaires H2+, Ne2+ et HCNH+. Les premiers états moléculaires excités des molécules Ne2 et HCNH ainsi que leurs interactions sont calculés par des méthodes ab initio: calculs d'interaction de configurations dans la partie liée du spectre d'énergie et calculs de collisions électron-ion moléculaire par la méthode variationnelle complexe de Koh dans le continuum. Le traitement de la dynamique (H2+ et Ne2+ est faite dans le cadre de la théorie du défaut quantique multi-voies. Nous avons dû étendre le formalisme pour calculer de manière non perturbative la matrice de réaction K dans laquelle sont représentées toutes les interactions de courte portée, et pour prendre en compte de façon explicite les couplages non-adiabatiques entre voies de Rydberg ouvertes à la dissociation et avec le continuum de l'ionDissociative recombination and related processes are specially effective in interstellar media where the very low density and temperature favour exothermic reactions. They also play an important role in various types of “cold” plasmas. This work reports the study of dissociative recombination of H2+, Ne2+ and HCNH+ molecular ions. The molecular states and their mutual interactions (for Ne2+ + e- and HCNH+ + e- systems) are calculated by ab initio methods: CI calculations for the bound part of the energy spectrum and electron-molecule scattering within the framework of the complex Kohn variational method for the continuous part. The low-energy dynamics (H2+ et Ne2+) is then treated by the multichannel quantum defect method. Several extensions of the formalism were developed in order to take account of the “off the energy shell” effects and to explicitly include the non-adiabatic couplings of the Rydberg states open to dissociation either between them or with the ion continuum
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Trasobares, Sánchez Jorge. "High frequency electronics on nanodot molecular junctions : interaction between molecules, ions and waves". Thesis, Lille 1, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL10168/document.
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Une combinaison entre l’assemblage de monocouches au sommet de nano-cristaux d’or et la microscopie à sonde locale permet d’explorer l’interaction entre les molécules actives et son milieu, mais aussi démontrer expérimentalement une diode moléculaire peut travailler à haute fréquence. La fabrication des nanocristaux d’or par lithographie électronique rapide nous a permis leur caractérisation par des techniques nécessitant des surfaces millimétrique, mais également par des techniques en champ proche. La détection electrochimique d’un petit nombre de molécules par nanocrystal prévoit d’intéressantes recherches futures sur l’attache et la détection de molécules uniques sur la nano-particule d’or. D’un côté, cette étude confirme une théorie récente: les effets coopératifs entre les molécules ont un effet d’asymétrie sur « la courbe d’histogramme de conductance ». D’un autre côté, des théories d’électrochimie ont été utilisées pour investiguer les effets d’interaction entre molécules avec groupe redox et l’écart-type de l’énergie moléculaire. Cette étude nous a permis d’extraire des gammes d’énergie de couplage entre molécules, un premier pas vers une estimation quantitative expérimentale de ce paramètre clé pour les applications en électronique organique. A l’aide d’un AFM couplé à un système de mesure en hyperfréquences, nous mesurons les propriétés électroniques à l’échelle nanométrique. Nous prouvons une diode moléculaire à 18 GHz avec un ratio de redressement de 12 dB (facteur 4) à cette fréquence. Des petites capacitances, dans la gamme de l’aF ont en particulier permis d’observer ce comportement à hautes fréquencesAn attractive combination of self-assembled monolayers on top of “Au” single crystal Nanoparticles (AuNp) and Scanning Probe Microscopies permits to explore the interaction between active molecules in the junction, as well as with the media. At the same time, we demonstrate the experimental proof of a molecular rectifying diode working at gigahertz frequency. Device fabrication by fast e-beam lithography allows their characterization by techniques that may need millimeter scale surfaces as well as by near field Scanning Probe Microscopies. Detection of a little number of molecules per AuNP promises interesting future research in the challenge of grafting and detecting single molecules per nanoparticle. On the one hand, this investigation confirms a recent theoretical prediction that cooperative effects between molecules may have an effect on the asymmetry of the conductance histogram line shape. On the other hand, established electrochemical theories are exploited to investigate similar factors such as interaction between redox molecules and the modification of the energy level of molecular orbitals. This study permits extracting a range of coupling energies between molecules that may be a first step towards the quantitative experimental estimation of this key parameter in molecular electronics. Thanks to an AFM connected to Network analyzer, we characterize a molecular diode operating at high frequency to 18 GHz with a rectification ratio of 12 dB (factor 4) at this frequency. Small capacitances in the order of few aF permit to see this behavior at high frequencies
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Lacroix, Pascal G. "Composés moléculaires conducteurs et magnétiques". Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112062.
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Ce mémoire présente la synthèse et les propriétés physiques de composites moléculaires élaborés à partir de briques magnétiques (dinucléaires du cuivre) et de conducteurs organqiues (TCNQ). Dans le but de réaliser une réelle intéraction entre les électrons magnétiques des centres cuivriques et les électrons de conduction situés sur les empilements TCNQ, nous avons cherché à établir des ponts entre les deux pôles (l'un conducteur, l'autre magnétique) de nos composites au moyen de transferts de charge des entités TCNQ vers les ions cuivriques. Les structures électroniques des matériaux obtenus ont été discutées à partir de leurs propriétés magnétiques (spectres RPE et mesures de susceptibilité) et électriques (mesures de conctivité). Trois familles de matériaux sont à distinguer selon le taux de transfert : la première correspond aux systèmes pour lesquels aucun transfert n'est réalisé ; la deuxième, aux composés qui subissent un transfert partiel ; la dernière regroupe les composés dont les centres métalliques ont été réduits en cuivre(I). La situation du transfert partiel est la plus intéressante. Dans ces matériaux de grande conductivité cohabitent des ions cuivre(II) et cuivre(I). Par ailleurs, des insertions d'entités TTF dans des chalcogénures de phosphore bidimensionnels ont été réalisées. Elles conduisent également à des composites conducteurs et magnétiquesThis thesis reports on the synthesis and the physical properties of molecular materials containing both magnetic units (binuclear copper complexes) and organic conductors (TCNQ). In order to achieve an effective interaction between magnetic electrons (copper ions) and conducting ones (TCNQ stacks), we have built molecular composites in which magnetic and conducting units are present, with partial charge transfer from TCNQ to copper ions. The electronic structures of these materials have been studied with the help of magnetic (EPR spectra and magnetic susceptibility measurements) and electrical (conductivity) properties. Three kinds of materials have been found depending on the amount of charge transfer : the first one corresponds to systems where no charge transfer occurs, the second one to partial charge transfer and the third one to reduced copper(I) complexes. The case of partial transfer is the most interesting ; in this type of materials, copper(II) and copper(I) ions coexist. The materials belonging to this class are highly conducting. Intercalation of TTF molecules in two-dimensional phospho-chalcogenides of manganese and cadmiun has been achieved. Those intercalated phases exhibit interesting magnetic and conducting properties
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Collet, David. "Spectroscopie laser haute sensibilité des ions moléculaires en phase gazeuse : étude des ions N2+, Cl2+ et HBBr+". Lille 1, 2000. https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Num/2000/50376-2000-278.pdf.
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Les ions moleculaires en phase gazeuse presentent, de part leur forte reactivite, un interet majeur en astrophysique ainsi que pour les plasmas utilises dans la gravure des surfaces de metaux et de semi-conducteurs. Nous avons developpe un spectrometre laser uv dedie a leur etude spectroscopique a haute resolution. Un faisceau laser uv monomode continu est obtenu par le doublage en frequence dans une cavite externe d'un faisceau laser visible produit par un laser a colorant accordable en frequence. La faible largeur spectrale de ce rayonnement (fwhm 1 mhz) a permis d'associer des techniques de modulation de vitesse et de soustraction de bruit, permettant une detection des ions sensible et selective via leur spectre d'absorption (structure electronique, de vibration, et de rotation). Les etudes de faisabilite menees sur oh + et n 2 + ont confirme la validite de ce nouveau spectrometre uv. Des resultats originaux ont ete obtenus sur le systeme b 2 u + x 2 g + de n 2 +. L'utilisation d'un hamiltonien standard prenant en compte les perturbations observees a permis la determination de constantes moleculaires deperturbees et l'observation d'un effet d'interference. L'amelioration generale du spectrometre a favorise l'observation de nouvelles bandes chaudes du systeme a 2 u x 2 g + de n 2 + qui ont ainsi permis la caracterisation de l'etat a jusqu'a v = 14. Le type de decharge electrique utilise au laboratoire a ete caracterise pour n 2 + par les temperatures de rotation, de vibration et de translation. Nos etudes se sont poursuivies avec la premiere observation dans l'uv de cl 2 +. L'analyse d'une partie des spectres a permis la premiere mise en evidence de perturbations localisees. A l'universite de cambridge, nous avons observe pour la premiere fois la molecule protonee hbbr + via la bande fondamentale v 3 en utilisant un spectrometre infrarouge a diode laser.
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Jonchière, Romain. "Solvatation supercritique de métaux précieux : apports de la simulation moléculaire". Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066103.
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En dépit des énormes intérêts économiques qu’il suscite, le transport des métaux précieux au sein des fluides hydrothermaux est encore mal compris et dépend de façon cruciale des espèces présentes en solution. Dans cette thèse, nous utilisons la dynamique moléculaire ab initio pour étudier plus particulièrement la solvatation de l'or et de l'argent sous leur forme d'ion monovalent. Après avoir étudié la correction des forces de dispersion nécessaire dans le cas de la simulation de l’eau, principal solvant géologique, nous avons pu nous consacrer à la modélisation des fluides hydrothermaux en augmentant progressivement la complexité des systèmes. Il nous a été ainsi possible de caractériser des systèmes H2O/CO2 en conditions supercritiques, d’identifier de nouveaux complexes et d’interpréter les signaux EXAFS expérimentaux en étudiant les complexes hydrosulfurés de l'or et chlorés de l'argent, et pour finir d’observer l'influence du CO2 sur la solvatation de nos ions métalliquesDespite the vast economic interest it attracts, precious metal transport through hydrothermal fluids is still not well understood, and crucially depends on the species present in solution. In this thesis, we use ab initio molecular dynamics to study the solvation of gold and silver as monovalent ions. After studying the correction of dispersion forces necessary to model water, the most common geological solvent, we have dedicated ourselves to modelling of hydrothermal fluids, gradually increasing the system’s complexity. Thus, we could characterise H2O/CO2 systems in supercritical conditions, identify new complexes and interpret experimental EXAFS signals by studying gold hydrosulphide and silver chloride complexes; and finally observe how CO2 influences the solvation of our metallic ions
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Gourmala, Chafika. "Synthèse et modélisation moléculaire d'oligosaccharides d'intérêt biologique". Paris 7, 2006. http://www.theses.fr/2006PA077105.
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Le Lewis x est un sucre qui est présent dans la tête polaire de certains glycolipides. Des études antérieures montrent qu'il y a reconnaissance moléculaire ente deux trisaccharides Lewis x en présence de l'ion calcium. Notre ambition, est de déterminer avec précision les groupements hydroxyles impliqués dans cette reconnaissance sous la médiation du calcium. La première partie de ce travail porte sur la synthèse d'oligosaccharides et plus précisément les synthèses du trisaccharide Lewis a et trisaccharides Lewis x désoxygènés en différentes positions du svnthon galactose ainsi que la description de leurs mécanismes réactionnels. La deuxième partie porte sur les calculs théoriques utilisant la dynamique moléculaire dans l'eau. Ces calculs se font dans le but de déterminer les propriétés physico-chimiques et aussi de connaître les interactions intermoléculaires entre trisaccharides Lewis x et spécifiquement les sites responsables de cette interaction en présence de l'ion calciumLewis x is a carbohydrate which presents in the polar head of some qlvcolipides. Former studies show that there is molecular recognition between two trisaccharides Lewis x In the presence of calcium. Our ambition is to determine with precision the groups hydroxyls implied in this recognition under the mediation of the calcium. The first part of this work relates to the synthesis of oliqosaccharides and more specificallv the svnthesis of the trisaccharide Lewis a and trisaccharides Lewis x deoxvgenized in various positions of the galactose unit and the description of the mechanisms of reactions. The second part relates to theoretical calculatlons usinq molecular dynamics in water. These calculations are done with an aim of determining the phvsicochemical properties and also of understanding the intermolecular interactions between the two trisaccharides Lewis x and specifically the sites responsible for this interaction in the presence of the ion calcium
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Masion, Armand. "Chimie moléculaire et colloïdale des complexes organiques de l'aluminium III partiellement hydrolysés". Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1993. http://www.theses.fr/1993INPL028N.
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Les acides organiques modifient considérablement le déroulement de l'hydrolyse de l'aluminium par blocage des oligomères intermédiaires entre le monomère et le tridecamère. Les précipités présentent une structure variable suivant l'échelle d'observation
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Dweik, Jalal. "Modélisation moléculaire du transfert membranaire". Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20188.
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L'objectif de ce travail de thèse est de mieux comprendre les forces physico-chimiques fondamentales qui régissent les interactions soluté-interface et soluté-soluté en milieu aqueux à l'intérieur des nanopores. Tout d'abord, nous étudions le transport des ions à travers les pores membranaires par une approche portant sur la physique méso- et macroscopique des fluides et en utilisant le « modèle de la charge d'espace ». Ce modèle, basé sur l'équation non-linéaire de Poisson-Boltzmann, est une théorie du champ moyenne qui ne tient compte que des interactions électrostatiques entre la membrane et les ions en solution. La compréhension à cette échelle du transport et de la sélectivité ionique à travers les membranes de nanofiltration n'est que partielle. Ensuite, donc, nous complétons l'approche méso et macroscopique par la méthode de « Dynamique moléculaire classique », particulièrement bien adaptée à l'échelle nanoscopique. Il s'agit de simuler l'interface « eau/vapeur » et le système « eau/nanopore », plus particulièrement les effets dus aux caractéristiques spécifiques des molécules et des ions : taille, charge, polarisabilité. Nous étudions les distributions moyennes des ions et des molécules et leurs corrélations/fluctuations. Nos simulations mettent en évidence le rôle important de la polarisabilité atomique et ionique sur la distribution des ions en milieux aqueux proches des interfaces et dans des nanopores. Cet effet pourrait être à l'origine de la sélectivité du transfert membranaire des ions de même valence et doit être mieux compris avant d'être intégré dans les théories mésoscopique du transport membranaireThe aim of this thesis is to better understand the physical and physicochemical phenomena involved in nano-confined aqueous solutions, especially the role of "solute-solute" and "solute-interface" interactions within nanopores. By a fundamental approach based on the meso- macroscopic physics of fluids, we study the ionic transport across the membrane pores using the “space charge model”. This model based on the nonlinear Poisson-Boltzmann “mean field theory”, takes into account the electrostatic interactions between the membrane and ions in solution. Understanding of Ionic transport and selectivity across nanofiltration membranes is only partial at this level of description. We therefore go beyond the meso and macroscopic approaches by performing "Molecular Dynamics" simulations, a method particularly well adapted to the nanoscale. We focus on a study of “Water/vapour” interfaces and “Water/nanopore” systems, more particularly effects due to the specific characteristics of molecules and ions: size, charge, polarizability. We study the distribution of the ions and molecules and their correlations/fluctuations. Our simulations reveal the important role played by atomic and ionic polarizability on the distribution of ions in aqueous solutions near interfaces and in nanopores. This effect may be at the origin of the filtration selectivity of nanoporous membranes for ions of the same charge valence and therefore must be better understood before being reliably integrated into mesoscopic theories of membrane transport
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Naban-Maillet, Jessie. "Energie interne et dissociations d' espèces moléculaires monochargées et de leurs adduits produits sous AP-MALDI : application à la détection d'agents chimiques". Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066302.
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Panten, Dietmar. "Spectroscopic properties of degenerate electronic states in negative ions". Université de Marne-la-Vallée, 2003. http://www.theses.fr/2003MARN0148.
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Ouaskit, Saïd. "Recherche d'effets de sillage sur la charge de fragments issus de la dissociation dans une feuille mince d'ions moléculaires rapides". Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO10036.
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Etude de la propagation des fragments formes dans la feuille mince sous l'influence de l'interaction des ions avec le milieu, de leur repulsion coulombienne mutuelle et des effets de sillage electronique derriere chaque ion: lorsque les particules chargees se deplacent avec une vitesse superieure a la vitesse de fermi de la cible solide, les electrons de la cible tendent a faire ecran sur la charge des ions et une densite de charge oscillatoire (stationnaire dans le referentiel du projectile) accompagne l'ion. Etude experimentale par l'analyse de la composante neutre h emergeant a o**(o) d'une feuille de c apres bombardement par des ions moleculaires heh**(+) et nh**(+) de 100 kev/mna: les oscillations ne sont pas mises en evidence, mais le rendement en atomes h est superieur a ce que l'on attendait, quand l'ion incident est aligne avec la direction du faisceau
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Focsa, Cristian. "Étude d'ions moléculaires métalliques par spectroscopie laser à modulation de vitesse". Lille 1, 1999. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1999/50376-1999-63.pdf.
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Les travaux décrits dans ce mémoire ont pour objet l'étude des ions moléculaires TiCl+ et TiF+ par spectroscopie laser à haute résolution. Nous avons utilisé un dispositif expérimental basé sur la technique d'absorption laser à modulation de vitesse afin d'enregistrer les spectres électroniques de ces ions dans la région du visible. Ceux-ci ont été produits grâce à une décharge électrique haute tension dans des mélanges gazeux He/TiCl4 et He/TiF#4. L'étude de TiCl+ a été réalisée en deux étapes. D'abord l'analyse des bandes intenses nous a permis de les attribuer à une transition 3[Delta]-X3[Phi], corrigeant ainsi l'attribution antérieure (3[Pi]-X3[Delta]). Nous avons aussi déterminé pour la première fois la structure spin-orbite des états [17. 8]3[Delta] et X3[Phi]. Ensuite nous avons mis en évidence un nouvel état électronique, A3[Delta], situé seulement ~350 cm-1 au-dessus de l'état fondamental X3[Phi]. La proximité des niveaux A3[Delta](v = 0) et X3[Phi](v = 1) donne lieu à de fortes interactions, ayant pour résultat un spectre très perturbé. Nous avons analysé 24 bandes, appartenant aux systèmes [17. 8]3[Delta](v = 0,1,2)-X3[Phi](v = 0,1) et [17. 8]3[Delta] (v = 0,1)-A3[Delta](v = 0). Elles ont été traitées ensemble en incluant dans le modèle des termes d'interaction entre les deux états électroniques inférieurs, ce qui nous a permis d'effectuer la déperturbation du complexe X3[Phi](v = 0,1)-A3[Delta](v = 0). En utilisant une nouvelle cellule de décharge, conçue pour travailler à température plus élevée, nous avons mis en évidence pour la première fois l'ion moléculaire TiF+, en enregistrant à haute résolution le système [17. 6]3[Delta]-X3[Phi]. Une analyse effective de ce système a été réalisée, conduisant aux premières constantes moléculaires pour cette espèce. Une méthode pseudo-atomique simple, la théorie du champ de ligand (LFT), a été utilisée afin d'interpréter les résultats expérimentaux obtenus. Les structures électroniques des ions TiCl+ et TiF+, ainsi que des molécules neutres associées, TiCl et TiF, ont été étudiées à l'aide de cette théorie.
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Iskandar, Waêl. "Étude des collisions à basse énergie entre ions multichargés et dimères de gaz rare". Caen, 2015. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01243329.
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Ce projet doctoral consiste en l’étude de la dynamique de l’interaction entre des ions multichargés et des dimères de gaz rare dans des collisions à basse énergie. Après capture d’un ou plusieurs électrons de la cible par le projectile, plusieurs états moléculaires ioniques peuvent être produits. Ces états vont ensuite relaxer en fragments chargés via plusieurs processus de dissociation. Expérimentalement, cette étude est réalisée en utilisant la technique COLTRIMS, particulièrement efficace puisqu’elle permet la détection en multi-coïncidence des fragments moléculaires et du projectile. Théoriquement, la dynamique de la collision est interprétée à l’aide d’un calcul classique basé sur le modèle de la barrière coulombienne mais adapté au traitement de cibles moléculaires tels que les dimères de gaz rares. Ce modèle s’est montré en bon accord avec les résultats expérimentaux, que ce soit en termes de production relative des différents processus de dissociation, ou en termes de dépendance angulaire entre l’orientation de la molécule et la direction du projectile diffusé. L’ensemble de ce travail a finalement permis d’établir une cartographie des processus dans le repère de la molécule cible et de mettre en évidence un nouveau processus de relaxation de l’ion moléculaire. Ce processus de relaxation est émetteur d’électrons de très basse énergie et pourrait avoir un rôle non négligeable dans l’estimation des dommages causés par impact d’ionWithin this thesis, the dynamics of collisions between low energy multi-charged ions and Van-der-Waals dimers is investigated theoretically and experimentally. During the interaction ion/dimer, electrons from the target can be captured by the projectile and produce ionic states of the dimer. These states will then relax into charged fragments via multiple dissociation processes. Experimentally, this study is performed by means of Cold-Target Recoil-Ion Momentum Spectroscopy, a powerful technique which allows the multi-coincidence detection of target ionic fragments and the projectile. Theoretically, the collision dynamics is investigated using a classical calculation based on the Coulombic Over-Barrier Model and adapted to treat diatomic molecules such as dimers. This model has shown good agreement with the experimental results, both in terms of relative production of the different dissociation processes, and in terms of angular dependence of the molecular orientation in respect with the scattered projectile direction. All of this work has finally enabled to provide, for the different processes, the two-dimensional probability maps p(b) in the molecular frame and to highlight a new relaxation mechanism of the molecular ion named Interatomic Coulombic Decay. This relaxation process is electron emitter of very low energy and could have a significant role in the assessment of damage caused by ion impact
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Sunyer, Emmanuel. "La diffusion du sodium dans la silice amorphe : étude par dynamique moléculaire classique". Montpellier 2, 2003. http://www.theses.fr/2003MON20063.
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POISSON, Lionel. "Ions métalliques monochargés, solvatés par des molécules d'eau : Collision et Photofragmentation". Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2001. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00007079.
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La solvatation joue un grand rôle dans la réactivité des métaux cationiques. Comprendre celle-ci passe, entre autres, par l'étude de l'interaction entre ces ions et le milieu environnant. Une approche possible, celle suivie au cours de cette de thèse, est d'étudier l'énergétique et la structure d'agrégats formés à partir d'un ion métallique entouré par un nombre fini de molécules de solvant. Les travaux rapportés dans cette thèse portent sur les cations monochargés M(H2O)n+ avec M=Fe,Co,Au et n=1...10, synthétisés par irradiation laser d'un barreau métallique suivit d'une détente supersonique. Des expériences de collision sur He et Ne ont été conduites afin de déterminer des énergies de seuil de fragmentation, ainsi que des sections efficaces. Pour effectuer cette étude, nous avons utilisé un spectromètre de masse à temps de vol, adapté par la mise au point d'un dispositif de Wiley-McLaren à double impulsion permettant de varier l'énergie de collision à résolution en masse constante. Des calculs de dynamique moléculaire ont été réalisés pour comprendre et modéliser le transfert d'énergie entre les agrégats et He. Ceux-ci, par comparaison avec l'expérience, ont permis de déterminer des énergies de liaison, et de proposer des mécanismes de fragmentation. Des expériences de photofragmentation sur ces mêmes agrégats ont été interprétées grâce aux résultats de l'étude collisionnelle. Les expériences réalisées ont mis en évidence la présence de plusieurs structures pour la plupart des agrégats étudiés. En particulier, montré l'existence d'espèces filamentaires métastables, c'est-à-dire disposant de molécules d'eau en couches de solvatation externes, alors que la première couche reste incomplète. Les proportions des différentes structures ont été déterminées par le nombre de molécules d'eau directement liées à l'ion. L'étude des espèces métastables permet une exploration complète, donc une bonne connaissance, de la surface de potentiel ion métallique - solvant.
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Calvez, Guillaume. "Synthèse et étude des applications potentielles de matériaux moléculaires à base d'entités hexanucléaires de terres rares". Rennes, INSA, 2009. http://www.theses.fr/2009ISAR0024.
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Les polymères de coordination sont des composés infinis constitués de centres métalliques liés les uns aux autres par des ligands organiques. Les polymères de coordination à base de terres rares élargissent le champ d’application de ces composés grâce aux propriétés magnétiques et optiques des terres rares. L’objectif des travaux réalisés lors de cette thèse est d’utiliser un hexanucléaire octaédrique de terres rares en tant que centre métallique au sein de polymères de coordination. La réactivité du complexe a posé problème, conduisant soit à l’altération, soit à la non réaction de l’entité hexanucléaire octaédrique. Une solution à ce problème a été la synthèse solvothermale, permettant de faire réagir cette entité dans un milieu réactionnel moins agressif à son égard. Un polymère de coordination a été obtenu et caractérisé, un faisceau de preuves apportent la certitude qu’il s’agit d’un polymère de coordination contenant des entités hexanucléaires en guise de centres métalliquesCoordination polymers are infinite compounds made up of metallic centres bound to one another by organic ligands. Rare-earth-based coordination polymers broaden the application field of this kind of compounds thanks to the exceptional magnetic and optic properties of rare earth ions. The goal of the works achieved during this PhD was to be able to use a rare-earth-based polynuclear entity –the octahedral rare earth based hexanuclear entity– as a metallic centre in coordination polymers. The reactivity of the complex has been a problem resulting either in an alteration or in a non-reaction of the octahedral hexanuclear entity. A solution to this problem has been the solvothermal synthesis, which makes it possible to have the complex react in a medium which is less aggressive towards it. A coordination polymer has been obtained and characterised, several proofs show with certainty that it is a coordination polymer containing octahedral hexanuclear entities as metallic centres
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Montout, Lory. "Exploration in silico d'une mini spectrine, l'α-actinine : dynamique et interactions". Paris 7, 2011. http://www.theses.fr/2011PA077232.
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La superfamille des spectrines est un groupe important de protéines du cytosquelette. Bien qu'ayant des fonctions très différentes, les membres de cette famille partagent un niveau surprenant d'homologie structurale, et sont composés de domaines conservés tels que les répétitions spectrines, les domaines CH de liaison à l'actine et les mains EF. Jusqu'à présent, des études ont porté sur les propriétés mécaniques de 2 à 3 unités répétitives de la spectrine ou sur le "rod domain" de l'alpha-actinine, sans tenir compte du rôle potentiel des domaines globulaires. Dans ces travaux de thèse, la mécanique du modèle de l'alpha-actinine entière a été examinée. Dans un premier temps, une étude hiérarchique par analyse de modes normaux du domaine central de l'alpha-actinine a été réalisée afin d'évaluer l'effet de l'organisation 3D des répétitions sur la mécanique du système. Le développement d'un outil d'analyse spécifique a permis de caractériser finement la nature des mouvements. L'impact des domaines globulaires sur ces propriétés mécaniques a aussi été exploré. Dans un second temps, l'influence de la concentration ionique sur la flexibilité du "rod domain" a été examinée. Nous montrons ainsi que : les caractéristiques structurales du "rod domain" lui confèrent ses propriétés mécaniques uniques ; les domaines globulaires modifient le comportement mécanique de la fibre ; l'écrantage des charges à la surface du "rod domain" par les ions modifie sa flexibilité. Cette étude ouvre la voie vers l'extrapolation des caractéristiques mécaniques de l'alpha-actinine aux autres membres de la superfamille des spectrinesThe spectrin superfamilly is a large group of cytoskeletal proteins. Although they have very different functions, the members of this family share a surprising level of structural homology and are composed of conserved domains such a spectrin repeats and globular actin binding domains and EF hands. So far, studies have focused on the mechanical properties of 2 to 3 repetitive units of spectrin or the rod domain of the alpha-actinin, regardless the potential role of the globular domains. In this thesis work, the mechanical model of the entire alpha-actinin was examined. Initially, a hierarchical study by normal modes analysis of the central domain of the alpha-actinin was performed to evaluate the effect of the 3D organization of the repeats on the mechanics of the system. The development of a specific analysis tool allowed us to finely characterize the nature of movements. The impact of the globular domains on these mechanical properties was also explored. In the second part of this work, the influence of ion concentration on the flexibility of the rod domain was discussed. We thus show that : the structural characteristics of the rod domain give it its unique mechanical properties, and the globular domains alter the mechanical behaviour of the fibre ; the screening of charges on the surface of the rod domain by ions changes its flexibility. This study opens the way to the extrapolation of the mechanical properties of alpha-actinin to the other members of the superfamily of spectrin
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Sèche, Edouard. "Potentialisation par capture de neutrons : une étude à l'échelle moléculaire sur l'ADN". Orléans, 2003. http://www.theses.fr/2003ORLE2025.
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Certaines tumeurs, comme les glioblastomes, n'offrent pas aux radiothérapeutes un large choix de traitement. Sensibles aux neutrons, elles sont toutefois très difficiles à traiter, car la sensibilité de la tumeur est très proche de celle des tissus sains environnants. Lors d'une radiothérapie par les neutrons rapides, des neutrons sont ralentis et diffusés par chocs sur les protons de l'eau. Ils peuvent alors être captés par les noyaux d'un isotope stable du bore, le 10B. S'ensuit alors une réaction nucléaire qui génère deux particules : une particule alpha et un noyau de lithium de TEL élevé. La potentialisation par capture de neutron a été étudiée à l'échelle moléculaire, par ses effets sur l'ADN : coupures de chaînes et dommages aux bases, proportion d'effet direct. D'autres résultats concernent la comparaison de différents faisceaux de neutrons, des flux de neutrons thermiques générés dans ces faisceaux, et des paramètres qui peuvent influencer ces flux.
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Cavalieri, Sylvain. "Dopage avec ions simples et complexes de couches d'arséniure de gallium épitaxiés par jets moléculaires". Nice, 1986. http://www.theses.fr/1986NICE4041.
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Faisabilité d'une méthode de dopage ionique avec le soufre utilisant une source d'ions travaillant à très basse énergie par collisions électroniques avec l'hydrogène sulfure. Application de la méthode à l'hydrogénation du cristal par des espèces ioniques. Exposé des résultats
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Vallée, Fabienne. "Étude de l'état des produits formés dans des réactions de recombinaison dissociative électrons-ions d'intérêt atmosphérique : N⁺₂ +e, O₂⁺ +e, CO₂⁺ + e, H₂O⁺ +e". Paris 11, 1986. http://www.theses.fr/1986PA112278.
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Dans ce mémoire sont présentés les résultats de travaux concernant la détermination, par absorption V. U. V. , de la nature et de l’état des produits formés dans la recombinaison dissociative d’ions moléculaires avec les électrons. L’étude a porté sur la R. D. De N+2, O+2, CO+2 et H2O+, choisis pour leur intérêt atmosphérique ou astrophysique. Parmi les voies de sortie de la réaction N+2 + e, le canal 2D + 2D est le canal largement majoritaire que les ions soient ou non excités vibrationnellement ; pour H2O+ + e, les facteurs de branchement (F. B. ) sont de 50% vers O + H + H et de 50% vers OH + H ; le quatrième positif de CO produit par R. D. De CO+2 provient de niveaux vibrationnels d’autant plus élevés que l’excitation vibrationnelle de CO+2 est plus importante. Pour O+2, le F. B. Vers O(1S) serait inférieur à 5% et de l’ordre de 15% vers O(1D). L’étude est ici compliquée par la désexcitation de l’état 1D par collisions et a nécessité l’aide d’une modélisation approfondie de l’expérience. Ces études comportent la détermination, sous différentes conditions, du profil des raies atomiques utilisées. L’expérience est très proche d’une post-décharge en écoulement : par décharge d’arc électrique dans une tuyère simplement convergente est créé un jet de gaz rare, fortement ionisé, qui forme une bouteille de choc et devient ensuite subsonique et quasiment uniforme. L’injection dans cette zone du gaz moléculaire produit, par échange de charge avec les ions monoatomiques du gaz rare des ions moléculaires qui se recombinent très rapidement avec les électrons. L’état des produits est alors étudié en absorption - voire en émissions - dans l’U. V.
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Simon, Claude. "Caractérisation de surfaces organiques moléculaires et polymères par SIMS statique : effet de la métallisation". Metz, 1996. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/1996/Simon.Claude.SMZ9639.pdf.
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La spectrométrie de masse d'ions secondaires statique (static SIMS ) est une technique très sensible permettant l'analyse chimique de l'extrême surface d'un échantillon. Des monocouches et des multicouches moléculaires et polymères préparées sur un substrat métallique sont analysées par sims statique afin d'étudier les paramètres responsables de la formation des ions principaux du spectre de masse. L'influence du substrat métallique, ainsi que de la métallisation, est étudiée. Sur des polymères massifs, la métallisation par l'argent permet d'élargir la gamme des masses détectables et de trouver des ions provenant de la cationisation de fragments polymères par le métal. Enfin, une étude d'oligomères de surface d'un polymère est réalisée par SIMS statiqueStatic SIMS (secondary ion mass spectrometry) is a very powerfull technique, allowing the analysis of the uppermost layers of a sample surface. Monolayers and multilayers of molecular and polymeric organic samples, prepared on metal substrates, are analyzed by static SIMS in order to determine the parameters that are responsible of the formation of main mass spectrum peaks. The influence of the metal substrate, as well as the metallization effect, are studied. On bulk polymers, silver metallization allows an increase of the accessible mass range, and detection of ions arising from cationization of polymer fragments by the metal. Finally, a study of surface oligomers is realized by static SIMS
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Joinet, Angélique. "Production de faisceaux d'ions radioactifs chimiquement réactifs par séparation en ligne". Paris 11, 2003. http://www.theses.fr/2003PA112163.
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La méthode de séparation d'isotope en ligne (ISOL), permet de produire par réaction de spallation, de fragmentation ou de fission des faisceaux d'ions radioactifs plus ou moins loin de la vallée de la stabilité. Bombardée par un faisceau primaire de forte intensité, la cible de production est épaisse, ce qui permet d'obtenir de forte production. Le problème est de trouver des matériaux de cible qui à haute température, relâchent rapidement les produits de réactions arrêtés dans la cible. Cette méthode radiochimique, optimisée pour fonctionner avec une source d'ions utilise les propriétés thermochimiques comme la pression de vapeur, la diffusion et la désorption. Le délai dû au transfert de masse limite l'efficacité de production et en particulier celle des isotopes de courte durée de vie. Pour les éléments des groupes chimiques 14 et 16 qui sont chimiquement réactifs vis-à-vis de leur environnement de production, cette technique a été inefficace. L'introduction du processus d'évaporation chimique apporte une solution. Cette technique, au cours de laquelle un agent chimique est introduit dans la cible, assure le transport de l'élément en question vers la source d'ions, sous forme de molécules. Les faisceaux d'ions radioactifs de sélénium et de soufre déficients en neutrons ainsi que les faisceaux d'étain riches en neutrons sont de grands intérêts pour la communauté des physiciens. L'objectif de nos travaux a été d'optimiser l'ensemble cible source, afin d'obtenir des faisceaux d'ions radioactifs ayant une intensité et une pureté exploitable. Tout d'abord, des mesures hors ligne ont permis de trouver des matériaux de cible adaptés au relâchement de ces isotopes et de plusieurs autres éléments. Ensuite, des mesures en ligne ont permis d'étudier la formation, la stabilité et l'ionisation des molécules COSe, COS, SnS et GeS. Un des grands avantages de la méthode d'évaporation chimique est d'obtenir des molécules volatiles et de réduire la contamination isobarique. Les travaux de cette thèse qui s'inscrivent dans le cadre du projet EURISOL, visant à construire une nouvelle génération d'accélérateur qui délivrerait des faisceaux de fortes intensités et d'une grande pureté, ont démontré qu'un traitement physico chimique des isotopes dans leur environnent est crucialThe isotope separation on line method allows to produce by spallation, fragmentation or fission reaction, radioactive ion beams far from the valley of stability. A thick target is irradiated by a high intensity primary beam. Therefore, high production can be achieved. The problem is to find target material that releases rapidly at high temperature, the reaction products stopped into the target. This radiochemical method, optimised to work with an ion source, is based on the thermochemical properties as vapour pressure, diffusion and desorption. The delay due to the mass transfer will have some consequences on the production efficiency, and particularly for the short half life isotopes. This technique has been inefficient for the 14 and 16 group elements, which are chemically reactive in their production environment. The introduction of the chemical evaporation can solve the problem. Chemical specie is introduced into the target, allowing the transportation of the element as a molecule towards the ion source. The neutron deficient selenium and sulphur radioactive ion beams and the neutron rich tin beams are of great interest for the physicist community. The goal of my work has been to optimise the target and ion source unit in order to achieve high intensity and purity. First, off line measurements allowed to find target material dealing to a fast release of these isotopes and of several elements. Afterwards, we studied the formation, stability and ionisation of the COSe, COS, SnS and GeS molecules by on line measurements. One advantage of the chemical evaporation method is to obtaine volatile molecules and to reduce isobaric contamination. This thesis has been done in the frame of the EURISOL project. This would construct a new generation accelerator, that would deliver high intensity and high purity ion beams. And this work demonstrates that a chemical physical treatment of isotopes in their environment is crucial
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Legent, Guillaume. "Assemblages moléculaires : modélisation et étude expérimentale par spectrométrie d’émission d’ions secondaires (SIMS)". Rouen, 2007. http://www.theses.fr/2007ROUES048.
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Ce mémoire comporte deux parties. La première, théorique et de modélisation, décrit le concept de «functionning-dependent structure» (FDS). Il s’agit d’assemblages qui ne perdurent que tant qu’ils sont en train d’assurer une fonction et se défont dès qu’ils ne fonctionnent plus. Le modèle repose sur l’assemblage de deux enzymes michaeliennes en activité. Nous montrons que les FDS permettent l’émergence de comportements nouveaux, tant en régime stationnaire qu’en régime transitoire, impossible à générer avec les deux enzymes libres. La seconde partie est une approche expérimentale fondée sur l’interaction d’un faisceau d’ions avec la surface d’un échantillon biologique. Les particules issues de la recombinaison atomique et les autres particules émises sont analysées et permettent d’obtenir des images grâce à la technologie NanoSIMS 50 (Secondary Ion Mass Spectrometry). Nous montrons à l’aide de systèmes physico-chimiques et d’une modélisation que l’on peut déterminer si deux macromolécules sont colocalisées avec une précision de l’ordre de 2nmThis thesis is in two parts. The first part involves theory and modelling and describes the concept of “functioning-dependent structures” (FDS). These are structures that only last during the time that they fulfil a function and that disappear once they have fulfilled that function. The FDS model is based on the assembly of two Michaelis-Menten type enzymes that are actively catalysing their reactions. We show that FDSs, both in stationary and transient regimes, have emergent properties and can generate new behaviours that cannot be generated by two enzymes not in the form of an FDS (i. E. “free”). The second part involves experiments that are based on the interaction of a beam of ions with the surface of a biological sample. The particles produced, including those produced by atomic recombination, are analysed and imaged using a NanoSIMS 50 (Secondary Ion Mass Spectrometry). We show here using physico-chemical systems and modelling that this technique allows two macromolecules to be colocalised with a precision of around 2 nm
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Pouvesle, Jean-Michel. "Réactivité des espèces métastables et des ions moléculaires de l'hélium dans des plasmas a pression élevée". Orléans, 1986. http://www.theses.fr/1986ORLE0216.
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Caractérisation des réactions de transfert de charge et d'excitation à partir, respectivement, des ions moléculaires et des métastables atomiques et moléculaires de l'hélium avec divers atomes et molécules
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Barmaki, Samira. "Ionisation de l'ion moléculaire d'hydrogène H²⁺ en champ laser intense et bref". Bordeaux 1, 2004. http://www.theses.fr/2004BOR12865.
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Nous avons présenté une étude théorique de la dynamique des processus multiphotoniques lors de l'interaction de l'ion moléculaire d'hydrogène H²⁺ avec un champ laser intense et de courte durée. Dans un premier temps, nous avons décrit, dans l'approximation de Born Oppenheimer, une méthode de calcul de la structure électronique et vibrationnelle de H²⁺ basée sur l'utilisation de fonctions B-splines. Nous avons ensuite présenté des résultats de sections efficaces d'ionisation de l'ion en présence d'un champ de faible éclairement et de longue durée d'impulsion, obtenus par un traitement perturbatif de l'interaction. Enfin, nous avons étudié la dynamique de H²⁺ soumis à un champ laser de fort éclairement et de courte durée en résolvant l'équation de Schrödinger dépendante du temps avec une méthode spectrale, ce qui nous a conduit au calcul des distributions énergétiques des fragments issus de la dissociation et de l'ionisation de l'ion moléculaire.
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Ren, Hua. "Aspects moléculaires des hélicases de la famille de RecQ". Phd thesis, École normale supérieure de Cachan - ENS Cachan, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00448084.
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Dans les cellules, le déroulement de l'ADN double-brin est catalysé par une famille de protéines appelées hélicases. Ces protéines sont présentes chez tous les organismes des virus jusqu'à l'homme. Parmi ces hélicases, celles de la famille RecQ jouent un rôle essentiel dans le métabolisme de l'ADN en facilitant de nombreux processus cellulaires tels que la réplication, la réparation, la recombinaison, la transcription et la maintenance des télomères. Chez l'homme, il existe cinq membres de la famille RecQ identifiés comme RECQ1, BLM, WRN, RECQ4 et RECQ5. Les mutations dans BLM, WRN et RECQ4 sont associées à une prédisposition au cancer. En plus du domaine hélicase très conservé et contenant sept motifs bien distincts, la plupart des hélicases de la famille RecQ possèdent également un domaine RecQ C-terminal (RecQ-Ct) et un domaine hélicase RNase D (HRDC). Au cours de ce travail, nous nous concentrons sur les mécanismes intrafonctionnels de certains membres de la famille RecQ des hélicases. Tout d'abord, nous avons utilisé deux isoformes naturels de l'hélicase RECQ5 humain comme modèle pour étudier la modulation fonctionnelle du domaine hélicase avec le doigt de zinc. Ici, nous montrons que la variante tronquée RECQ5α de l'hélicase RECQ5β issue d'un épissage alternatif et composée uniquement du domaine hélicase ne possède ni l'activité ATPase ni l'activité de déroulement de l'ADN. A l'inverse, et ce de matière étonnante, cette protéine est dotée d'une forte activité de réhybridation du brin déroulé. Les mesures quantitatives indiquent que l'amélioration de l'affinité de la protéine pour l'ADN que lui confère le doigt de zinc est à l'origine de ses activités ATPase et hélicase. Le plus important est que l'on constate que le doigt de zinc est capable d'agir comme un facteur moléculaire à même de supprimer l'activité de re-synthèse du brin déroulé par le domaine hélicase et de déclencher l'activité de déroulement d'ADN à travers une modulation de la fixation à l'ADN. Ensuite, nous avons analysé les propriétés biochimiques de deux isoformes de l'hélicase RecQ de Bacillus subtilis : SubL et SubS. Parmi elles, SubS ne dispose pas du domaine HRDC. Nos études montrent que le domaine HRDC est crucial pour Bacillus subtilis RecQ hélicases dans la résolution des intermédiaires de réplication et / ou de réparation de l'ADN tels que les jonctions de Holliday et la jonction de kappa. Les activités ATPase, hélicase et l'activité de rehybridation du brin déroulé sont plus importantes en présence du domaine HRDC. Ces résultats nous permettent de spéculer sur l'importance du domaine HRDC des activités de la famille de RecQ hélicase. Nous avons découvert que dans la famille RecQ, le 12 domaine HRDC peut augmenter les activités ATPases et hélicases. De manière intéressante, le domaine HRDC de Bacillus subtilis joue un rôle critique dans la résolution des intermédiaires de réplication ou de réparation de l'ADN et des jonctions de Holliday. Nous suggérons l'hypothèse que le domaine HRDC des hélicases RecQ participe à exposer leurs fonctions dans le processus de réparation de l'ADN. Dans la dernière partie, nous nous sommes intéressés à l'existence et au rôle du doigt d'arginine dans la protéine BLM. Ces études ont été menées afin de démontrer son rôle dans l'hydrolyse d'ATP et dans la conversion en mouvement mécanique permettant à la protéine de progresser le long de l'ADN. Nos études démontrent que le résidu R982, situé à proximité du γ-phosphate de l'ATP, fonctionne comme un doigt d'arginine dans la protéine BLM. Nos conclusions indiquent en outre que ce doigt d'arginine interagit avec d'autres motifs conservés situés autour du γ-phosphate des nucléotides et qu'ils effectuent ensemble les fonctions enzymatiques au sein d'un réseau complexe.
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Tinti, Fabrice. "Interaction à longue distance entre ions cuivre(II) : systèmes binucléaires à pont étendu". Paris 11, 1987. http://www.theses.fr/1987PA112072.
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Nous étudions l’antiferromagnétisme moléculaire dans des complexes binucléaires du cuivre (II) à ligand pontant étendu : la distance séparant les deux ions paramagnétiques est supérieure à 6 Å. Deux problèmes sont à résoudre : -pour quelle distance maximale entre les ions cuivriques, est-il possible de détecter une interaction ? - pour une distance donnée et une géométrie donnée, quel est le système moléculaire pontant le plus efficace pour transmettre l'interaction entre les centres métalliques éloignés ? Parmi les méthodes physiques qui permettent d'étudier les interactions faibles entre centres paramagnétiques (dont nous discutons l'intérêt et les limites), nous avons utilisé les mesures de susceptibilité magnétique et la RPE. Nos résultats portent sur trois séries de complexes où les ligands pontants sont des diacides carboxyliques, des diamines aromatiques ou des dihydroxyquinones. Dans chaque série, nous faisons varier de façon systématique la distance entre les ions Cu(II), la symétrie de l'environnement de l'ion cuivrique et celle du complexe Nous obtenons ainsi plusieurs exemples de couplage supérieur à celui observé jusqu'alors pour des distances analogues. Un modèle orbitalaire simple permet d'interpréter nos résultatsWe study the molecular antiferromanetism in binuclear copper (II) complexes with extended bridging ligand where the distance between the two paramagnetic ions is over 6 A in length. Two problems are to be solved: - is it possible to detect an interaction for which there is a maximal distance between the two copper (II) ions? - Which is the most efficient molecular system for transmitting interactions between two distant metal centers for a given geometry and a given length? Among the physical methods which permit the study of weak interactions between paramagnetic centers (which we delineate), we have used magnetic susceptibility measurements and ESR. Our results extend through three series of complexes where the bridging ligands are carboxylic acids, aromatic diamines and dihydroxyquinones. In each serie, we vary systematically the distance between the copper( II) ions, the enviromental symmetry of the copper(II) ion and of the complexe itself. We thus obtain many examples of coupling observed to be superior then that the coupling of already known compounds with analogous distances. A simple orbital model permits the interpretation of our results
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Delaunay, Rudy. "Croissance moléculaire dans des agrégats d’hydrocarbures aromatiques polycycliques induite par des collisions avec des ions". Caen, 2016. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01640994.
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Cette thèse porte sur l'étude expérimentale de l'interaction entre des ions lents de basses énergies (de l'ordre du keV) et des molécules isolées ou des agrégats d'hydrocarbures aromatiques polycycliques neutres en phase gazeuse. L'utilisation de rayonnement ionisant sur ces systèmes moléculaires complexes a permis de mettre en évidence des processus de fragmentation statistique (redistribution de l’énergie à travers l’ensemble des degrés de liberté de la molécule cible) et non-statistique (collision binaire). Il a également été observé un mécanisme de croissance moléculaire lié à la formation de fragments à l’intérieur des agrégats à une échelle de temps très courte (< ps) à la suite de collisions binaires. La présence d’un environnement moléculaire autour des fragments créés lors de l’interaction permet d’initier un processus de réactivité entre les fragments et les molécules constituant l’agrégat. Plus particulièrement, l’étude se concentre sur l’importance du pouvoir d’arrêt électronique SE et nucléaire SN des ions projectiles. Lorsque SN est grand devant SN, la croissance moléculaire devient plus importante.
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Billebaud, Annick. "Etude expérimentale de l'émission électronique secondaire de cibles minces de carbone sous l'impact de projectiles rapides : ions lourds, ions hydrogène (atomiques, moléculaires, ou sous forme d'agrégats)". Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO10170.
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Le theme central de ce travail est l'etude de l'emission electronique par les surfaces d'une cible solide mince lorsqu'elle est traversee par des projectiles charges rapides. Le ralentissement dans la matiere d'un ion rapide se fait essentiellement par des processus d'interaction inelastiques avec les electrons du milieu (ionisations, excitations): ce transfert d'energie aux electrons du solide est a l'origine du phenomene d'emission electronique secondaire. La description phenomenologique et theorique de ce phenomene fait l'objet du premier chapitre. Nous nous sommes interesses a l'emission electronique de feuilles minces de carbone bombardees par differents types de projectiles. La mesure de l'emission electronique induite par l'impact d'agregats d'hydrogene entre 40 et 120 kev/proton fait l'objet du second chapitre. Ces projectiles, constitues de plusieurs atomes, nous ont permis de mettre en evidence et d'etudier les effets collectifs d'une telle interaction. Nous avons etendu notre etude de l'emission electronique a des projectiles d'hydrogene moleculaire et atomique, ainsi qu'a des ions hydrogene negatifs, a des energies inferieures a 2 mev: grace a la mise au point d'un dispositif experimental permettant de mesurer la statistique des electrons secondaires, nous avons pu etudier, entre autres, le role joue par les electrons du projectile sur l'emission d'electrons. Nous decrivons cette experience dans le chapitre trois. Enfin, le chapitre quatre decrit la mesure de rendements electroniques induits par des ions argon tres energetiques (13 mev/u) et hautement charges delivres par la sortie moyenne energie (sme) du ganil de caen, que nous avons analysee dans le cadre d'un modele semi-empirique de l'emission electronique secondaire. L'ensemble de ces experiences apporte de nouveaux resultats sur l'interaction de projectiles composes de plusieurs constituants avec la matiere, ainsi que sur les consequences d'importants depots d'energie dans les solides
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Sisourat, Nicolas. "Etude théorique de phénomènes d'interférences au cours de collisions atomiques et moléculaires". Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066369.
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Au cours de cette thèse, nous avons mis au point des modèles et des programmes informatiques originaux pour étudier les processus électroniques au cours de collisions entres particules lourdes (ion, atome ou molécule) pour des énergies allant de quelques keV à plusieurs MeV. Nous avons utilisé une approche semi-classique non perturbative, consistant à résoudre l'équation de Schrödinger dépendante du temps (ESDT) pour les électrons du système dans le champ des noyaux en mouvement. Deux types de méthodes ont été développées pour résoudre l'ESDT. La première, totalement numérique, repose sur la méthode des différences finies. La seconde, semi-analytique, consiste à développer la fonction d'onde sur des bases analytiques. Nous avons appliqué ces programmes à l'étude de plusieurs systèmes, en particulier pour la description de l'ionisation d'atomes ou de molécules par impact d'ions, ainsi que pour l'examen des processus biélectroniques lors de collisions ion-atome et ion-molécule.
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Lattouf, Elie. "Etude expérimentale de la formation de l’ion d’hydrogène négatif lors de collisions entre un ion positif et une cible atomique ou moléculaire". Caen, 2013. http://www.theses.fr/2013CAEN2075.
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La formation de l’ion négatif d’hydrogène (H–) lors de collisions entre un ion positif et une cible atomique ou moléculaire neutre est étudiée expérimentalement à des énergies d’impact de l’ordre du keV. Les sections efficaces doublement différentielles de formation des ions H– sont mesurées en fonction de leur énergie cinétique et de leur angle d’émission lors des collisions OH+ + Ar et O+ + H2O à 412 eV/u. M. A. Ces ions peuvent être émis à haute énergie (keV) lors de collisions violentes quasi-élastiques à 2 corps impliquant un fort transfert d’impulsion au centre H. Cependant, les anions H– sont préférentiellement émis à faible énergie (eV) lors de collisions douces à plusieurs corps (> 2) qui résultent en un faible transfert d’impulsion. La formation des ions H– par capture électronique fait suite à l’excitation ou l’ionisation de la molécule. La dynamique de la fragmentation moléculaire est modélisée afin de simuler l’émission des ions H–. L’accord globalement satisfaisant entre la simulation et l’expérience facilite l’interprétation des observations expérimentalesThe formation of the negative hydrogen ion (H–) in collisions between a positive ion and a neutral atomic or molecular target is studied experimentally at impact energies of a few keV. The doubly-differential cross sections for H– formation are measured as a function of the kinetic energy and emission angle for the collision systems OH+ + Ar and O+ + H2O at 412 eV/a. M. U. These H– ions can be emitted at high energies (keV) in hard quasi-elastic two-body collisions involving a large momentum transfer to the H center. However, H– anions are preferentially emitted at low energy (eV) due to soft many-body (> 2) collisions resulting in a low momentum transfer. The formation of H– ions by electron capture follows excitation or ionization of the molecule. The molecular fragmentation dynamics is modeled to simulate the emission of H– ions. The overall good agreement between the simulation and the experiment leads to the understanding of most of the experimental observations
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Bernard, Christophe. "Etude par dynamique moléculaire de la structure et des propriétés spectroscopiques de verres silicatés dopés par des ions terres rares". Angers, 2000. http://www.theses.fr/2000ANGE0021.
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Dans le travail présenté ici, nous avons étudié par dynamique moléculaire la structure et les propriétés spectroscopiques de verres dopes par des ions terre rare. Afin d'étudier les liens entre structure locale des ions dopants et propriétés spectroscopiques, nous avons applique une pression hydrostatique sur un verre na 2o-2sio 2:eu 3 +. La pression agit principalement sur les structures les plus souples du verre, angles inter tétraédriques et environnement du sodium. On observe également une augmentation de la coordination eu-o qui passe de 7,17 à pression ambiante a 8,00 a 20 gpa. Les changements de structure observés par simulation restant faibles, les modifications des propriétés spectroscopiques de l'europium permettent partiellement de reproduire les changements observes expérimentalement. Nous avons également analyse le verre sio 2-geo 2:eu 3 + qui est constitué d'unités sio 4 et geo 4 reparties de façon homogène dans la matrice. L'étude de l'environnement local de l'europium montre que celui-ci se place préférentiellement au voisinage du germanium. La coordination moyenne eu-o de 6,35 traduit la présence de deux types de sites majoritaires avec 6 et 7 premiers voisins oxygène. L'accord entre les spectres de luminescence expérimental et simule valide à la fois les environnements déterminés par dynamique moléculaire et la méthode de calcul du spectre simule. Enfin, l'étude du verre sio 2-tio 2 dope avec de l'erbium a montré que le titane est présent sous forme de tétraèdres tio 4 distribues de façon homogène dans la matrice de silice. La présence de titanes avec cinq voisins oxygène est compatible avec une séparation de phase sio 2 / tio 2 qui pourrait être observée pour une concentration plus élevée en titaneIn the work presented here, we studied the structure and spectroscopic properties of glasses doped with rare earth ions by molecular dynamics. In order to study the links between local structure of the doping ions and spectroscopic properties, we applied a hydrostatic pressure on a na 2o-2sio 2:eu 3 + glass. The pressure acts mainly on the softer structures of the glass, inter-tetrahedral angles and the sodium environment. An increase in eu-o coordination is also observed, from 7. 17 at room pressure to 8. 00 at 20 gpa. As the structural changes observed by simulation remain small, the changes in the spectroscopic properties of europium partially reproduce the changes observed experimentally. We also analysed the sio 2-geo 2:eu 3 + glass which is made up of sio 4 and geo 4 units homogeneously distributed in the matrix. The study of the local environment of europium shows that it is preferentially located in the vicinity of germanium. The average eu-o coordination of 6. 35 reflects the presence of two types of majority sites with 6 and 7 first oxygen neighbours. The agreement between the experimental and simulated luminescence spectra validates both the environments determined by molecular dynamics and the method of calculation of the simulated spectrum. Finally, the study of sio 2-tio 2 glass doped with erbium showed that titanium is present as tio 4 tetrahedra distributed homogeneously in the silica matrix. The presence of titanium with five oxygen neighbours is consistent with a sio 2 / tio 2 phase separation that could be observed at higher titanium concentration
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Molina, John Jairo. "Multi-scale modelling of ions in solution : from atomistic descriptions to chemical engineering". Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066363.
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Les ions en solutions ont un rôle fondamental dans de nombreux processus physiques, chimiques et biologiques. Dans le cadre des applications industrielles, l’ingénieur les décrits par des modèles analytiques simples, qui sont paramétrisés et ajustés afin de reproduire des données expérimentales. Dans ce travail, nous proposons une procédure multi-échelle à gros-grains pour obtenir ces modèles simples à partir de descriptions atomiques. D’abord, les paramètres de forces classiques pour des ions en solutions sont extraits de calculs ab-initio. Des potentiels effectifs (McMillan-Mayer) ion-ion sont ensuite obtenus à partir des fonctions de distribution de paire mesurées dans des simulations de dynamique moléculaire. Avec ces potentiels effectifs, nous pouvons établir une description à solvant continu des électrolytes. Finalement, nous mettons en œuvre un calcul de perturbation, pour définir la meilleure représentation possible pour ces systèmes, en termes de sphères dures chargées (éventuellement associées). Le modèle final ainsi obtenu est analytique et il ne contient pas de paramètres ajustables. On montre qu’il est en bon accord avec les résultats exacts obtenus par des simulations Monte-Carlo pour la structure et la thermodynamique. La thèse se termine en proposant la mise au point d’une analyse similaire pour la viscosité des électrolytes, obtenue à partir d’une base moléculaireIons in solution play a fundamental role in many physical, chemical, and biological processes. For industrial applications these systems are usually described using simple analytical models which are fitted to reproduce the available experimental data. In this work, we propose a multi-scale coarse graining procedure to derive such models from atomistic descriptions. First, parameters for classical force-fields of ions in solution are extracted from ab-initio calculations. Effective (McMillan-Mayer) ion-ion potentials are then derived from radial distribution functions measured in classical molecular dynamics simulations, allowing us to define an implicit solvent model of electrolytes. Finally, perturbation calculations are performed to define the best possible representation for these systems, in terms of charged hard-sphere models. Our final model is analytical and contains no free “fitting” parameters. It shows good agreement with the exact results obtained from Monte-Carlo simulations for the thermodynamic and structural properties. Development of a similar model for the electrolyte viscosity, from information derived from atomistic descriptions, is also introduced
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Szutkowska, Marta. "Mécanismes Moléculaires par lesquels le pH acide augmente la stabilité de l'ARNm du cotransporteur BSC1". Paris 7, 2007. http://www.theses.fr/2007PA077238.
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BSC1 est le transporteur majeur de NH4+ dans la branche large ascendante de l'anse de Henle (MTAL). Il joue un rôle important dans la régulation rénale du bilan acido-basique de l'organisme. L'acidose métabolique stimule BSC1 en augmentant l'abondance de son ARNm et de sa protéine. Le pH acide augmente la stabilité de l'ARNm du BSC1 en agissant sur sa partie 3' non traduite (3'-UTR). ζ-cristalline (ζ-cris) et HuR sont deux protéines qui stabilisent les ARNm en se fixant sur des motifs AUUUA (AREs). Notre projet était de déterminer un rôle éventuel de ζ-cris et de HuR dans l'augmentation de la stabilité de l'ARNm du BSC1 par 1 pH acide. La présence de ζ-cris et HuR est déterminée par Western Blot et microscopie confocale. Six mutants sont obtenus par délétion des AREs et l'abondance des ARNm du BSC1 sauvage (WT) ou mutés est mesurée par Slot Blot et RT-qPCR. Nos résultats sont : 1) La délétion de 4 motifs sur 6 diminue la stabilité de l'ARNm du BSC1. L'effet le plus marquant est observé pour le motif ARES (position : 4350). ARE3 et ARE6 (position : 4491) sont responsables de l'effet du pH acide. 2) ζ-cris est présente dans la MTAL et les cellules TAL. Son abondance est augmentée par le pH acide. La sur-expression de ζ-cris stimule, alors que son invalidation inhibe, aussi bien l'expression du BSC1 WT que l'effet du pH. Les motifs ARE2 et ARE3 sont des motifs cibles de ζ-cris. 3) HuR est présente dans la MTAL et les cellules TAL. Le pH acide stimule HuR par translocation di noyau vers le cytoplasme. L'invalidation de HuR inhibe l'effet du pH acide. L'ARNm du BSC1 coimmunoprécipite avec HuR dans des complexes ARNm/protéines mais les ARE cibles de HuR restent à déterminerTransport of NH4+ via the medullary thick ascending limb (MTAL)-specific BSC1 cotransporter is critical for acid excretion by the kidney. Metabolic acidosis enhances mRNA and protein abundances of BSC1. We have shown that acidic pH increases mRNA stability of BSC1 via involvement of the 3'untranslated region (3'UTR). Ç-crystalline (ζ -crys) and HuR are proteins that bind AUUUA motifs (ARE) and protect mRNAs from degradation. Here, we determine the role of the 3'UTR-containing ARE and of ζ -crys and HuR in acid pH- increased stability of BSC1. ζ -crys and HuR were detected by Western Blot and confocal microscopy. BSC1 mutants were generated by deletion of ARE and the abundance of BSC1 WT and mutants mRNAs were quantified by Slot Blot or RT-qPCR. We report: 1 Deletion of 4 out of 6 AREs decreased the stability of BSC1. The most relevant effect was observed for the ARE3 (position: 4350, 86% losing). ARE3 and ARE6 (position: 4491) are responsible for pH effect. 2 ζ -crys is expressed in both MTAL tubules and TAL cells and its abundance is induced by acidic pH. Overexpression of ζ -crys increased the stability of WT but not the mBSC1 Δ 3'UTR mRNA. Moreover, acid pH failed to induce any additional effect on BSC1 in cells overexpressing ζ -crys. RNAi-silencing of ζ -crys resulted in an inhibition of BSC1 expression and acid pH effect. ARE2 and ARE3 are the targets of ζ -crys. 3 HuR is expressed in MTAL and TAL cells, and acid pH stimulates its shuttling from nucleus to cytoplasm. Silencing of HuR inhibited acid pH effect. BSC1 mRNA is co-immunoprecipitated with HuR antibody in purified mRNA /proteins complexes but the interaction of HuR with specific ARE remains to be determined
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Nouicer, Rachid. "Processus de Fusion-Fission et Spectroscopie Gamma des Produits Binaires dans les Collisions entre Ions Lourds L'egers (40 < ANC < 60)". Phd thesis, Université de Strasbourg, 1997. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00805800.
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Le travail de cette thése a montré d'une part le rôle significatif du mécanisme de \underline{Fusion-Fission Asymétrique} dans les collisions entre ions lourds légers (A$_{\rm NC} \le$60) et, d'autre part, le \underline{Désalignement des Spins} dans un systéme {\it oblate-oblate} mettant en évidence pour \underline{la premiére fois le {\it mode papillon} lors de la réaction dans les résonances quasi-moléculaires}. Ces deux aspects, l'un macroscopique l'autre beaucoup plus lié á des effets microscopiques, sont certes différents d'un point de vue conceptuel, mais tout á fait complémentaires pour une compréhension globale des systémes di-nucléaires. \par \hspace*{0.5cm}Dans la premiére partie, les réactions $^{35}$Cl $+$ $^{12}$C et $^{35}$Cl $+$ $^{24}$Mg á 8 MeV/nucléon (expérience effectuée á Saclay) ont fait l'objet de mesures inclusives et de mesures exclusives. La nature des produits donnant naissance au mécanisme de fusion-fission asymétrique a été vérifiée. Il a été également démontré que dans ce domaine en énergie le processus \underline{ternaire} est trés faible. La deuxiéme partie est consacrée á l'étude de la réaction $^{28}$Si $+$ $^{28}$Si réalisée sur une énergie de résonance E$_{\rm lab.}$~=~111.6 MeV auprés de l'accélérateur VIVITRON de Strasbourg avec le multidétecteur EUROGAM Phase II. Le moment angulaire J$^{\pi}$ = 38$^{+}$ a été mesuré pour les voies inélastique et mutuelles de la voie de sortie $^{28}$Si $+$ $^{28}$Si. La mise en évidence du \underline{désalignement} \underline{des spins} a été interprété á l'aide du modéle moléculaire par le \underline{mouvement papillon}''mouvement Butterfly''. La spectroscopie $\gamma$ semble indiquer une nouvelle transition $\gamma$ dans la désexcitation du $^{32}$S qui est $0^{+} (8507.8\ keV) \to 2^{+}_{1} (2230.2\ keV) $.
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Louvradoux, Thomas. "Spectroscopie à haute résolution de H2+ : production et refroidissement sympathique d'ions piégés". Thesis, Université de Paris (2019-....), 2019. http://www.theses.fr/2019UNIP7168.
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L'objectif du projet est de réaliser la spectroscopie vibrationnelle à deux photons sans effet Doppler de haute résolution sur l'ion moléculaire H2+ afin d'obtenir une mesure optique directe du rapport de la masse du proton à celle de l'électron. Les ions H2+ doivent être piégés et refroidis, mais ne peuvent être refroidis que par refroidissement sympathique par l'intermédiaire d'ions Be+ refroidis par laser. Après une introduction générale, la deuxième partie de ce manuscrit décrit le piégeage d'ions et présente le piège linéaire que nous utilisons afin de piéger les ions H2+ et Be+, ainsi que les méthodes qui permettent de créer les ions Be+ soit par impact électronique, soit par photo-ionisation d'un jet d'atome de Be. Dans la troisième partie nous présentons la source d'ions H2+ sélective en état interne utilisant la photo-ionisation multiphotonique résonante d'H2 à l'aide d'un laser en impulsion à 303 nm puis nous présentons les ions moléculaires froids sélectionnés en état interne obtenus. Dans la quatrième partie nous présentons le modèle de la spectroscopie par photo-dissociation photonique résonante (REMPD) qui nous permet d'observer la transition dans H2+. Dans la cinquième partie nous présentons la conception et la réalisation de la source laser à 313 nm permettant de refroidir les ions Be+ par refroidissement Doppler. La sixième partie présente l'observation de cristaux de Coulomb de Be+ ainsi que des cristaux mixtes de Be+ et H2+, elle présente aussi les différentes techniques expérimentales qui nous permettent d'obtenir et d'observer ces cristaux. La septième partie décrit la source de spectroscopie à 9,17 µmThe objective of the project is to perform high-resolution Doppler-free two-photon vibrational spectroscopy on the H2+ molecular ions in order to obtain a direct optical measurement of the electron to proton mass ratio. The H2+ ions must be trapped and cooled but can only be cooled by sympathetic cooling using Be+ laser cooled ions. After a general introduction, the second part of this manuscrit describes ion trapping and presents the linear trap we use to trap H2+ and Be+ ions, as well as the methods used to create Be+ ions either by electronic impact or by photo-ionization of a stream of Be atoms. In the third part we present the state selective H2+ ion source using resonance enhanced multiphoton ionisation (REMPI) with a 303 nm pulsed laser, then we present the state-selected cold molecular ions obtained. In the fourth part we present a model for the resonance enhanced multiphoton dissociation spectroscopy technique that we use in order to detect the transition in H2+. In the fifth part we present the design and realization of the 313 nm laser source for Doppler cooling of Be+ ions. The sixth part presents the observation of Coulomb crystals of Be+ as well as mixed crystals of Be+ and H2+, it also presents the different experimental techniques that allow us to obtain and observe these crystals. The seventh part describes the spectroscopy source at 9,17 µm
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Jana, Chandramohan. "Modelling the structure and IR spectra of micro-hydrated ions". Palaiseau, Ecole polytechnique, 2014. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01120935/document.
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La micro-hydratation d’ions a été modélisée par une combinaison de méthodes classiques et quantiques. Les structures, la dynamique et les spectres IR d’agrégats ioniques micro-hydratés allant de 1 à 216 molécules d'eau ont été examinés en mettant l’accent sur la comparaison avec des résultats expérimentaux récents. La modélisation quantique a été utilisée pour fournir des valeurs de référence pour la calibration du champ de force polarisable AMOEBA. L’extension du jeu de paramètres a été réalisée dans certains cas, en particulier lorsqu’il a été nécessaire d’améliorer les termes d’interaction électrostatique et de polarisation. La dynamique moléculaire classique a ensuite été utilisée avec deux objectifs distincts: (1) l'exploration extensive des surfaces d'énergie potentielle pour des systèmes de grande taille avec de nombreux minima de basse énergie, pour lesquels un échantillonnage statistique est nécessaire, et (2) le calcul des spectres IR par transformée de Fourier de la fonction d’autocorrélation du moment dipolaire (DACF) à différentes températures. L'hydratation du cation Zn2+ a été étudiée en détail. Alors que le nombre de coordination (CN) de Zn2+ est clairement établi à six en solution aqueuse, des études expérimentales et théoriques récentes en phase gazeuse ont mis en évidence un modèle complexe pour les petits agrégats jusqu'à 12 molécules d'eau avec un CN de l’ordre de 5 ou peut-être même 4. Nos calculs allant de 6 à 216 molécules d'eau permettent une description précise de l’évolution du CN en fonction de la taille de l’agrégat. La tryptamine complexée aux ion et potassium et à une ou deux molécules d'eau a été étudiée afin d'interpréter des spectres IR en phase gazeuse de ces espèces. Une attention particulière a été portée à l'électrostatique, en particulier les charges atomiques, et sur le rôle des structures de départ des simulations de dynamique moléculaire. Il a alors été possible d'étudier en détail les phénomènes dynamiques dépendant de la température et d’obtenir une bonne concordance avec les spectres IRPD. Enfin, l'hydratation de l'anion sulfate avec un nombre maximum de 100 molécules d'eau a été analysée en mettant l'accent sur l'existence de liaisons O-H libres sur la surface de l’agrégat en fonction de sa taille. En accord avec les expériences IRPD, nous constatons que les petits agrégats sont compacts et sans liaison pendante. Ces dernières apparaissent avec une bande de vibration caractéristique quand environ 25 molécules d'eau sont présentes. Globalement, ces résultats mettent en évidence les conditions requises pour une modélisation précise de l’hydratation d'ions. Il s'agit notamment de prendre en compte un traitement raffiné des interactions électrostatiques et de polarisation, un échantillonnage étendu des surfaces d'énergie potentielle, le traitement adapté des conditions aux limites des agrégats, y compris d’un mur de confinement répulsif, et des simulations de longue durée pour atteindre la convergence des fonctions de distribution radiale. Avec de tels développements, il est maintenant possible d'obtenir une description réaliste des structures et de la dynamique d’agrégats ioniques microhydratés de grande taille, ainsi que leur dépendance en température, comme le montre la comparaison avec l’expérience, en particulier la spectroscopie vibrationnelleIon micro-hydration has been modeled by a combination of classical and quantum methods. The structures, dynamics and IR spectra of micro-hydrated cluster ions ranging from 1 to 216 water molecules have been considered with special emphasis on the comparison to recent experimental data. Quantum modeling has been used to provide reference values against which the polarizable AMOEBA force field could be calibrated. Extension of the parameter set was carried out in some cases, in particular when improvement of the electrostatic and polarization energy terms was deemed necessary. Classical molecular dynamics was then used with two different aims: (1) extensive exploration of potential energy surfaces for large cases with numerous low energy minima, for which statistical sampling is required, and (2) computation of IR spectra through Fourier transform of the Dipole moment AutoCorrelation Function (DACF), at various temperatures. The hydration of Zn2+ was studied in detail. While the coordination number (CN) of zinc cation is firmly established to be six in bulk solution, recent experimental and computation studies in the gas phase have unveiled a complex pattern for small clusters with up to 12 water molecules with a CN more near 5 or maybe even 4. Our calculations, performed from 6 to 216 water molecules, allow a precise description of CN evolution with cluster size. Sodiated tryptamine with one or two water molecules attached was investigated in order to interpret gas phase IR spectra of these species. Particular care was taken of electrostatics - especially atomic charges - and of starting structures in molecular dynamics simulations. It was then possible to investigate temperature-dependent dynamics in detail and to obtain good agreement with IRPD spectra. Finally, the hydration of the sulfate anion with up to 100 water molecules was analyzed focusing on the existence of dangling O-H bonds on the cluster surface as a function of cluster size. In agreement with IRPD experiments, we find that small clusters are compact with no dangling bond. The latter appear when ca. 25 water molecules are present with a characteristic vibrational band. Overall, these results underline the requirements for accurate modeling of ion hydration. These involve refined treatment of electrostatic and polarization interactions, extensive sampling of the potential energy surfaces, careful treatment of cluster boundaries including a confining repulsive wall, and long-time simulations to attain converged radial distribution functions. With such developments at hand, it is now possible to obtain a realistic picture of structures and dynamics of large micro-hydrated cluster ions, as can be judged from the comparison to experiment, especially vibrational spectroscopy
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Batat, Pinar. "Communication moléculaire photo-ionique : les études ultrarapides de composés supramoléculaire". Thesis, Bordeaux 1, 2011. http://www.theses.fr/2011BOR14336/document.
Texto completo da fonteResumo:
Des molécules ou assemblages moléculaires organiques (dérivés d’hémicyanine ou du BODIPY) ont été étudiés en solution par des méthodes optiques complémentaires : absorption stationnaire et fluorescence, absorption transitoire et fluorescence résolue en temps (échelle femtoseconde et picoseconde). Ces méthodes ont permis de caractériser différents processus tels que le transfert de charge intramoléculaire, le transfert d'énergie et le transfert d'électron photoinduit. Elles ont ainsi permis de démontrer l’intérêt de certains chromophores de type AzaBODIPY émettant dans le proche IR, dans des applications d’imagerie et de thérapie photodynamique. La photostabilité et l’absorption à deux photons ont également été étudiées dans le cas d’autres dérivés du BODIPY pouvant être appliqués à la détection d’espèces ioniques. Dans le cas des hémicyanines, des dérivés amphiphiles dotés d’une couronne reconnaissant spécifiquement certains cations ont également été étudiés sous forme de films de Langmuir-Blodgett et en présence de différents cations, le but étant de former des membranes artificielles iono- et photosensiblesUltrafast femtosecond transient absorption measurements (30 fs FWHM pulses) and complementary picosecond spectroscopies (20 ps FWHM pulses, streak camera detection), as well as steady state absorption and fluorescence measurements, were used to study a range of molecules and molecular assemblies. Processes such as intramolecular charge transfer, electronic energy transfer and photoinduced electron transfer were characterized. Amphiphilic azacrown-containing hemicyanine dyes and resulting iono- and photosensitive artificial membranes were studied using Langmuir-Blodgett techniques in the presence of various cations. Among a range of other molecules studied, NIR emitting aza-BODIPY dyes were studied by time-resolved methods in order to investigate their suitability for Photodynamic Therapy applications and imaging. Differently functionalized BODIPY dyes were investigated with respect to photostability, two photon absorption and ion sensing
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Bhowmick, Indrani. "Synthèse et caractérisation de matériaux moléculaires magnétiques incorporant des ions métalliques 3d et 4d/5d connectés par des ponts cyanures". Thesis, Bordeaux 1, 2012. http://www.theses.fr/2012BOR14567/document.
Texto completo da fonteResumo:
Dans cette thèse, nous avons synthétisé de nouveaux matériaux moléculaires hétérométalliques pontés par des groupements cyanures en utilisant la chimie de coordination donneur-accepteur. Les précurseurs moléculaires basés sur un ion métallique 3d (MnII/III, FeII, NiII, CuII) agissent en tant qu’unités acceptrices, alors que les précurseurs 4d (RuIII) et 5d (ReIV) de type trans-cyanido ont été utilisés comme groupements donneurs. Le chapitre I présente une approche théorique avec quelques exemples des matériaux magnétiques de basse dimensionnalité : molécule et chaîne aimant qui illustrent le rôle du ligand cyanido pour concevoir les matériaux magnétiques. En outre, nous avons sélectionné des précurseurs cyanido à base de métaux 4d/5d pour leur anisotropie magnétique plus élevée par rapport aux ions de métaux 3d. Le choix des précurseurs moléculaires, leur synthèse et leur caractérisation ont été largement décrits dans le chapitre II. Au cours de ce travail de recherche, nous avons obtenu de nombreux systèmes moléculaires hétérométalliques mais également des systèmes unidimensionnels. Les chapitres III, IV et V décrivent la synthèse, la structure cristallographique et la caractérisation magnétique de tous les complexes synthétisés. L’empilement cristallin compact des molécules conduit à un état fondamental antiferromagnétique pour la plupart des complexes ce qui perturbe souvent les phénomènes de relaxation magnétique. Nous avons donc établi les diagrammes de phases magnétiques pour la plupart de ces systèmes. De plus, certaines des chaînes ReIV/MnIII et une chaîne ReIV/FeII présentent des comportements magnétiques de type "chaîne aimant" et donc une bistabilité magnétiqueIn this thesis, we have synthesised new cyanido bridged heterometallic molecule-based magnetic materials with the tool of simple donor-acceptor coordination chemistry. The 3d metal ion (MnII/III,FeII, NiII, CuII) based molecular precursors acted as acceptor building blocks, whereas the 4d (RuIII)and 5d (ReIV) trans-cyanido type molecular precursors were used as donor moieties.Chapter I contains a theoretical approach with examples of low dimensional magnetic materials:Single Molecule and Single Chain Magnets that illustrate the role of the cyanido ligand to design such magnetic materials. Furthermore, we emphasized the 4d/5d metal based cyanido precursors for their higher magnetic anisotropy over the 3d metal ions. The choice of molecular precursors, their synthesis and characterization were extensively described in chapter II. In this research work, we have obtained many heterometallic molecular complexes and also one dimensional systems. Chapter III, IV and V contain the synthesis, X-ray crystallographic and magnetic characterization of all the newly synthesized complexes. The close crystal packing of the molecules lead to an antiferromagnetic ground state for most of the complexes and this often perturbed the magnetic relaxation phenomena. As expected, we have found metamagnetic phase diagrams for most of these systems. Some of the ReIV/MnIII and a ReIV/FeII one dimensional compounds exhibited Single-Chain magnet like properties and thus magnetic bistability
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Marciante, Mathieu. "Dynamique d'ions en pièges radiofréquences". Thesis, Aix-Marseille 1, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX10040/document.
Texto completo da fonteResumo:
Les pièges radio-fréquences (rf) permettent de confiner des particules chargées (atomes ou molécules) dans un domaine restreint de l'espace. Alliés aux techniques de refroidissement laser, ils permettent l'étude et le contrôle de la matière au niveau atomique. Dans cette thèse sont présentés différents résultats obtenus au moyen de simulations numériques, utilisant la technique de la dynamique moléculaire. Cette thèse se compose de quatre parties. Une première partie rassemble les connaissances indispensables pour appréhender la dynamique des ions en pièges rf. La deuxième partie présente les résultats d'une étude sur l'influence du couplage coulombien sur le refroidissement laser Doppler d'un ensemble d'ions confinés en quadrupôle linéaire. La troisième partie s'intéresse aux propriétés des structures en anneau d'ions, obtenues à basse température au sein des multipôles linéaires d'ordres supérieurs au quadrupôle. Une dernière partie présente une proposition permettant l'obtention de sites supplémentaires où le champ rf s'annule dans les multipôles linéaires d'ordres supérieurs, offrant la possibilité d'obtenir des structures non soumises au forçage rfRadio-frequency (rf) traps allows one to confine charged particles (atoms or molecules) in a small region of space. These traps, with laser cooling technics, allows one to study and to control matter at the atomic level.In this thesis are shown different results obtained by numerical simulations using molecular dynamics technics. This thesis is formed of four parts. A first part introduce the necessary knowledge to comprehend the ion dynamics in rf traps. The second part present the results from a study on the influence of coulomb coupling on the doppler cooling of trapped ions in a linear quadrupole rf trap. The third part is a study of the properties of ring structures of ions, obtained for low temperatures in linear higher order rf traps. A last part of the thesis is a proposal allowing one to obtain additional rf field-free regions in linear higher order rf traps
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Capron, Michael. "Étude de l'interaction entre ions multichargés et systèmes complexes d'intérêt biologique : effets de l'environnement à l'échelle moléculaire". Phd thesis, Université de Caen, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00741879.
Texto completo da fonteResumo:
Cette thèse présente l'étude de l'interaction d'ions multichargés de basse énergie (quelques 10 keV) avec des systèmes complexes d'intérêt biologique (acides aminés et base azotée). Dans ce cadre, l'objectif de travail se situe dans la compréhension et la mise en évidence d'effets de l'environnement moléculaire. Afin d'étudier ce phénomène, les spectres en temps de vol des produits cationiques issus de la collision ont été comparés dans le cas de molécules isolées ou au sein d'agrégats purs ou mixtes. Il est apparu que l'environnement moléculaire permettait d'une part de protéger la molécule en autorisant la répartition de l'énergie et de la charge après la collision (se traduisant par une diminution de la fragmentation globale, la fermeture de certaines voies, ...). D'autre part, l'environnement semble susceptible de fragiliser certaines liaisons intramoléculaires comme l'illustre l'apparition de nouvelles voies de fragmentions dans les agrégats d'adénine. Enfin, l'agrégat constitue également un premier environnement chimique avec lequel la molécule va pouvoir interagir. Les spectres obtenus avec des agrégats hydratés d'adénine signent par exemple le transfert d'un proton depuis les molécules d'eau vers la base azotée. Plus surprenant encore, les ions multichargés semblent induire la formation de liaisons peptidiques au sein d'agrégats de beta-alanine. Ce dernier résultat a été étudié plus en détails en fonction de la taille des agrégats ou de l'ion projectile utilisé. Un certains nombre de critères (flexibilité et géométrie de la molécule, testées en utilisant d'autres acides aminés) ont été avancés pour prédire la formation de liaisons peptidiques.
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Indrajith, Suvasthika. "Croissance moléculaire induite dans les agrégats d'hydrocarbures linéaires par la collision avec des ions et des électrons". Thesis, Normandie, 2021. http://www.theses.fr/2021NORMC201.
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Cette thèse est consacrée à l’étude expérimentale en phase gazeuse des collisions entre des particules ionisantes de faible énergie et des agrégats neutres d’hydrocarbures linéaires faiblement liés entre eux. Ces expériences ont eu comme objectif d’analyser les processus subséquents aux transferts d’énergie et de charge lors de la collision. Il s’agit de la fragmentation et de la croissance moléculaire via la mise en place de liaisons covalentes entre les molécules formant ces agrégats. Les travaux expérimentaux dans ce manuscrit ont permis d’éclairer les rôles respectifs de l’ionisation électronique et des pouvoirs d’arrêt nucléaire et électronique des projectiles sur la croissance au sein des agrégatsd’hydrocarbures linéaires. À cette fin, des études complémentaires ont été menées avec des faisceaux d’ions de basse énergies (keV) fournis par le GANIL (Caen), qui représente la majorité des résultats présentés, et des expériences utilisant des électrons ont aussi été réalisées à l’Institut de Chimie - Physique J.Heyrovsky (Prague, République Tchèque)The work presented in this thesis concerns the experimental study in gas phase of the collisions between low energy ionizing particles and weakly bonded, neutral clusters of linear hydrocarbons. The purpose of these experiments was to analyze the processes subsequent to the energy and charge transfers during the collision, which are the fragmentation and molecular growth via the formation of covalently bonded molecules forming these clusters. The experimental work in this manuscript has shed light on the respective roles of electronic ionization and the nuclear and electronic stopping powers of projectiles on growth mecanisms within the clusters. To this end, the studies were carried out with low energy ion beams (keV) supplied by GANIL (Caen), which represents the majority of the results presented here, and experiments using electrons were also carried out at the J. Heyrovsky Institute of Chemistry - Physics (Prague, Czech Republic)
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Seghrouchni, Samira. "Recherches dans la série des tétraazaporphyrinogènes : modifications structurales et étude dynamique : RMN des complexes de ruthénium (II)". Montpellier 2, 1993. http://www.theses.fr/1993MON20011.
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L'ensemble de ce travail concerne les effets de modifications apportees aux ligands sur le comportement des complexes macrocycliques tetrapyrazoliques du ruthenium (ii); une partie synthetique importante concerne diverses variations au sein des macrocycles. Une etude rmn dynamique a montre que non seulement le macrocycle a une influence sur le comportement des complexes, mais aussi, et quelquefois de facon primordiale, la nature des ligands axiaux
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Laurent, Oscar. "Ions et gaz dans les verres de silice : étude dynamique et approches topologiques". Thesis, Paris 6, 2016. http://www.theses.fr/2016PA066243/document.
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La théorie de la rigidité permet de prédire les comportements de nombreuses propriétés de verres, que ce soit avec la composition, la température ou la pression, tout en réduisant la structure de ceux-ci à un simple critère mécanique : flexible, isostatique ou rigide sur-contraint. Des travaux récents ont mis en évidence l'utilité d'une telle analyse, tant de manière expérimentale que théorique. Dans cette thèse, nous appliquons une méthode d'établissement de contraintes à partir de simulations par dynamique moléculaire, afin d'explorer la rigidité dans différentes conditions de température, pression ou composition pour des verres ayant des potentiels d'application. Cet algorithme de dénombrement de contraintes, radiales ou angulaires, nous a permis de définir des zones de compositions particulières dans les verres d'oxydes, avec une compréhension différente de la structure et des contraintes entourant les ions dans la silice. Par la suite, nous avons aussi pu montrer des effets topologiques faibles des gaz nobles dans la silice, et relier les anomalies dynamiques observées dans la silice sous pression à des conditions de rigidité du réseauRigidity theory allows to predict the behavior of many properties of glasses with respect to composition, while considering the underlying network as simple mechanical trusses that can be flexible, isostatic or stressed-rigid. Some recent works showed how useful such an analysis can be, either theoretically or experimentally. In the thesis we will use a method to analyse topological constraints from molecular dynamics simulations in order to establish the rigidity of silica systems of interest under various conditions of composition, pressure and temperature. Applying this constraints counting algorithm to radial and angular constraints in soda-lime systems allowed us to establish composition intervals of isostatic properties while giving a novel comprehension of the constraints and the structure surrounding the ions. We later highlight the faint influence of noble gases atoms upon silica when melted in the bulk. That study also allowed us to link dynamical anomalies of silica under pressure to rigidity changes of the network