Gotowa bibliografia na temat „Nucléotides modifiés”

Biotechnology applications in livestock nutrition has significance in view of shortage of natural resources with associated conflicts, growing demand of animal products, by-products versus human population pressure necessitate needs for feed additives in livestock diets for better utilization of feeds and food materials which evolved from conventional, unconventional to novel alternative feed sources. The probiotic microorganisms, applications, mechanisms of action; advantages and safety of probiotics were explored. Prebiotics, their leading types, applications, safety of prebiotics and salient features of prebiotics as well as synbiotics, their impacts on livestock products (milk, meat, wool and eggs) quality as well as by-products. These microbes are involved in genetic manipulation of microbes in ruminants and monogastrics gastro-intestinal tracts (GIT’s) which are monumentally beneficial in the form of protection of protein microbes/requirements, amino acids and fats digestion, especially those from fibre in ruminants, and the reestablishment of natural and genetically modified microbes in the rumen. Genetically modified grains for nutritional improvements and anti–nutritional factors could include low phytate corn, high oil corn, and low oligosaccharide soybean. Growth promoters of phytochemicals and/or phytobiotic herbs are health boosters, in-feed enzymes, organic acids, digestive boosters, antimicrobial peptides, antibacterial and useful alternatives to antibiotics and hormones. Feed additives that also promote growth in heat stress conditions are electrolytes, betaine, amino acids, leaf extracts and trace minerals. Other additives for growth and better carcass quality products are in form of antioxidants as ractopamine, L-carnitine, amino acids, nucleotides in broiler diet, corn oil or fish oil. Organic acids (formic and propionic acids) serve as feed preservatives and are particularly effective. Others are lactic, citric, fumaric and sorbic acids plus their salts (such as calcium formate and calcium propionate). Mycotoxins are reduced through absorption and bioavailability by using numerous mycotoxin binders. Pre-mixtures are vitamins, minerals, carotenoids, acids, preservatives, needed in small amounts. Modern biotechnology holds promising diverse beneficial applications and solutions in different ways like environment protection, gut microbes’ manipulations, production of food (feeds, feed additives) for normal growth, better health, metabolic activities in a balanced diet, better welfare and well-being of our livestock and other emerging enterprises. Les applications de la biotechnologie dans la nutrition du bétail ont une importance compte tenu de la pénurie de ressources naturelles avec les conflits associés, la demande croissante de produits animaux, les sous-produits par rapport à la pression de la population humaine nécessitent des besoins en additifs alimentaires dans les régimes alimentaires du bétail pour une meilleure utilisation des aliments et des matières alimentaires qui ont évolué à partir de conventionnelles, non conventionnelles à de nouvelles sources d’alimentation alternatives. Les micro-organismes probiotiques, applications, mécanismes d’action ; les avantages et la sécurité des probiotiques ont été explorés. Les prébiotiques, leurs principaux types, leurs applications, la sécurité des prébiotiques et les principales caractéristiques des prébiotiques ainsi que des synbiotiques, leurs impacts sur la qualité des produits d’élevage (lait, viande, laine et œufs) ainsi que sur les sous-produits. Ces microbes sont impliqués dans la manipulation génétique des microbes chez les ruminants et les tractus gastro-intestinaux monogastriques (GIT) qui sont extrêmement bénéfiques sous la forme de protection des microbes/exigences protéiques, de la digestion des acides aminés et des graisses, en particulier celles des fibres chez les ruminants, et du rétablissement des microbes naturels et génétiquement modifiés dans le rumen. Les céréales génétiquement modifiées pour des améliorations nutritionnelles et des facteurs anti-nutritionnels pourraient inclure le maïs à faible teneur en phytates, le maïs à haute teneur en huile et le soja à faible teneur en oligosaccharides. Les promoteurs de croissance des phytochimiques et/ou des herbes phytobiotiques sont des boosters de santé, des enzymes alimentaires, des acides organiques, des boosters digestifs, des peptides antimicrobiens, des alternatives antibactériennes et utiles aux antibiotiques et aux hormones. Les additifs alimentaires qui favorisent également la croissance dans des conditions de stress thermique sont les électrolytes, la bétaïne, les acides aminés, les extraits de feuilles et les oligo-éléments. D’autres additifs pour la croissance et une meilleure qualité de carcasse se présentent sous forme d’antioxydants comme la ractopamine, la L-carnitine, les acides aminés, les nucléotides dans l’alimentation des poulets de chair, l’huile de maïs ou l’huile de poisson. Les acides organiques (acides formique et propionique) servent de conservateurs alimentaires et sont particulièrement efficaces. D’autres sont les acides lactique, citrique, fumarique et sorbique ainsi que leurs sels (tels que le formiate de calcium et le propionate de calcium). Les mycotoxines sont réduites par absorption et biodisponibilité en utilisant de nombreux liants de mycotoxines. Les pré-mélanges sont des vitamines, des minéraux, des caroténoïdes, des acides, des conservateurs, nécessaires en petites quantités. La biotechnologie moderne recèle diverses applications et solutions bénéfiques prometteuses de différentes manières, telles que la protection de l’environnement, les manipulations des microbes intestinaux, la production d’aliments (aliments pour animaux, additifs alimentaires) pour une croissance normale, une meilleure santé, des activités métaboliques dans une alimentation équilibrée, un meilleur bien-être et un meilleur bien-être de notre bétail et d’autres entreprises émergentes.

Les génomes de bactériophages constituent la source la plus riche de nucléobases modifiées de toutes les formes de vie. Parmi celles-ci, la 2,6-diaminopurine (ou 2-aminoadénine), qui s’apparie avec la thymine en formant trois liaisons hydrogène, viole l’appariement des bases de Watson et Crick. La 2-aminoadénine, initialement trouvée dans le cyanophage S-2L, a également été détectée dans des bactériophages infectant des bactéries Gram-négatives et Gram-positives. La voie de biosynthèse de l’ADN contenant de la 2-aminoadénine ainsi que le mécanisme d’exclusion de l’adénine sont maintenant élucidés. Cet exemple de déviation naturelle d’un nucléotide de l’ADN ne représente qu’une des possibilités explorées par la nature et apporte une preuve de concept pour la biologie de synthèse d’acides nucléiques non canoniques.

Synthese de molecules permettant l'introduction dans des oligonucleotides de derives photoreactifs de la diamino-3,6 acridine ou proflavine, intercalant tres puissant et facilement detectable. Afin d'inserer l'intercalant a un niveau quelconque de la sequence, des nucleotides sont synthetises, dans lesquels l'intercalant a un niveau quelconque de la sequence, des nucleotides sont synthetises, dans lesquels l'intercalant est fixe sur la base par une chaine de type thioether, en une position ne perturbant pas l'appariement avec la base complementaire

Notre projet etait de mettre au point une methode de marquage rapide et selective d'acides nucleiques, l'objectif etant de pouvoir utiliser ceux-ci pour le resequencage sur puces a adn. Notre approche a consiste en la synthese de ribonucleotides triphosphates porteurs d'une fonction reactive. Ces triphosphates modifies ont ete incorpores par voie enzymatique dans des sequences d'arn afin de generer des acides nucleiques fonctionnalises. Les arn ainsi actives ont ensuite ete marques en utilisant un fluorochrome. Nous avons synthetise des nucleotides triphosphates en serie uridine, adenosine et cytidine porteurs de fonctions reactives de type oxyamine (onh 2) ou methylcetone (coch 3). Les fluorophores correspondants, modifies avec une fonction aldehyde ou oxyamine, ont ete prepares. Nous avons ensuite mis au point les conditions de post-marquage des acides nucleiques fonctionnalises. Les arn marques ont ete utilises pour le resequencage sur puces a adn. Les acides nucleiques detectes ont ete soit un fragment de l'arn 16s de mycobacterium tuberculosis soit un fragment du gene codant pour la transcriptase inverse de hiv-1. Apres hybridation sur puces, nous avons obtenu des pourcentages d'homologie voisins de 100%, montrant la selectivite et l'efficacite de notre methode de marquage.

La synthese d'oligodesoxyribonucleotides, constitues d'unites nucleotidiques de configuration anomerique alpha a ete realisee selon deux approches; la methode au phosphotriester en phase liquide et la methode au phosphoramidite sur support solide, automatisee. Ces oligonucleotides modifies ont ete obtenus avec de bons rendements et une grande purete et ont ete caracterises. Les etudes physico-chimiques ont montre leur fort pouvoir d'hybridation, par appariement des bases, avec des sequences d'acides nucleiques complementaires selon des polarites paralleles. Les duplex mixtes alpha: beta appartiennent a la famille b de l'adn. En outre, les oligonucleotides alpha sont tres resistants a l'hydrolyse par differentes nucleases. Les oligonucleotides alpha et leur duplex se sont reveles capables d'inhiber in vitro l'activite polymerasique des transcriptases inverses du vih et du m-mlv. Les duplex adn alpha: arn beta sont capables in vitro de bloquer l'activite des rnases h de e. Coli et d'embryon de drosophile

Ce mémoire est consacré à l'étude des potentialités synthétiques de deux phosphonodithioesters mono et difluorés. Le difluorodithioester est préparé par réaction de l'anion lithié d'un difluorométhylphosphonate avec du disulfure de carbone et del'iodométhane. L'analogue monofluoré est obtenu par action de deux équivalents d'éthanethiolate sur le dithioester difluoré. La réaction de Diels-Alder du phosphonodithioester difluoré avec des diènes conduit aux dihydrothiopyranes. Les réactions de désulfanylation et de cis-dihydroxylation des cycloadduits permettent d'approcher des structures thiaglycosidiques. Les phosphonodithioesters sont de bons agents N-thioacylants. Avec des esters d'amino acides, des pseudopeptides sont obtenus avec de bons rendements. Des nucléotides sont préparés à partir de mono et difluorophosphonothioacétamido-l,3-diols. La réaction d'oléfination d'aldéhydes à partir de thioamides et de thiazolines dérivés du fluorophosphonodithioacétate de méthyle sont étudiées.

Ce projet porte sur la synthèse d'oligonucléotides modifiés décorés par des groupements chimiques rappelant les chaines latérales des acides aminés impliqués dans la catalyse enzymatique des protéases à sérine, à savoir l'acide aspartique (Asp), la sérine (Ser) et l'histidine (His) afin d'en mimer l'activité protéolytique. L'approche synthétique de type phosphoramidite a été mise en oeuvre. De ce fait nous avons synthétisé des phosphoramidites fonctionnalisés avec une fonction acide carboxylique rappelant l'Asp, une fonction hydroxyle pour la Ser ou un imidazole pour l'His, correctement protégés pour être ensuite incorporés au sein de séquences oligonucléotidiques, et des phosphoramidites convertibles, qui portent une fonction chimique réactive permettant une conjugaison post synthèse supportée et automatisée de l'oligonucléotide. Ces deux types de phosphoramidites offrent la possibilité de les combiner et donc d'obtenir des séquences hautement fonctionnalisées. Les séquences oligonucléotidiques ont été choisies afin d'apporter un contrôle topologique structurant. Les structures secondaires envisagées sont de type bulge, épingle à cheveux et jonction trois voies car stables grâce aux appariements Watson et Crick entre les bases tout en ayant une flexibilité importante due à la présence de bases non appariées. Les travaux présentés dans ce manuscrit décrivent la synthèse des phosphoramidites modifiés ainsi que l'incorporation du nucléotide convertible de type alcyne au sein de séquences qui ont été conjuguées par CuAAC, et qui ont permi d'obtenir une jonction trois voies qui a été caractérisée par dichroïsme circulaire, gel de polyacrylamide et par dénaturation thermique
We are interested in the synthesis of modified oligonucleotides decorated by chemical fonctions mimicking the amino acids side chains involved in enzymatic catalysis of serine proteases, acid aspartic (Asp), serine (Ser) and histidine (His), in order to mimic proteolytic activity. The phosphoramidite synthetic approach was choosen. We synthesised functionnalized phosphoramidites bearing either a carboxylic acid function reminding Asp, a hydroxyle function for Ser or an imidazole for His properly protected for their incorporation in oligonucleotides sequences, and convertible phosphoramidites, bearing a reactive function that permits a conjugation post automated oligonucleotides solid phase synthesis. Oligonucleotides sequences have been choosen in order to have a perfect structural control. The envisaged secondary structures are bulge, hairpin and three way junction because of their stability, thanks to Watson et Crick base pairing, and their flexibility thanks to the unpaired bases. The work presented here regards the synthesis of modified phosphoramidites and their incorporation of the convertible alkyne in sequences then conjugated by CuAAC reaction to form a three way junction whose stability and physico-chemical behavior have been evaluated