Gotowa bibliografia na temat „Bactéries – Effets des métaux”
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Artykuły w czasopismach na temat "Bactéries – Effets des métaux"
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Vavasseur, Alain. "Bioremédiation des sols et des eaux : application aux pollutions chimique et nucléaire". Pollution atmosphérique, NS 7 (1.06.2014): 80–86. http://dx.doi.org/10.54563/pollution-atmospherique.7832.
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La bioremédiation est une branche des biotechnologies qui utilise des mécanismes biologiques naturels ou détournés pour traiter des problèmes environnementaux. Les agents biologiques utilisés peuvent être de simples molécules organiques, comme de l’ADN ou des anticorps, ou bien des organismes vivants ou morts (bactéries, microalgues, champignons, algues et plantes supérieures). La phytoremédiation consiste plus spécifiquement à utiliser des plantes pour décontaminer des sols, des eaux ou de l’air pollués. Contrairement aux polluants organiques tels que les PCB, TNT, TCE, qui peuvent être métabolisés par les micro-organismes du sol ou les racines des plantes, les radionucléides ─ comme la plupart des métaux lourds ─ ne peuvent être dégradés, mais leur spéciation peut être modifiée et, par ce fait, leur biodisponibilité et leurs effets sur l’environnement. Ainsi, les stratégies de bioremédiation concernant les radionucléides vont consister en : - leur stabilisation/minéralisation afin de diminuer leur biodisponibilité grâce à un changement de leur état redox ; - pour les sols, leur extraction, en utilisant les mécanismes nutritifs des plantes ; - pour les solutions polluées, leur extraction, en utilisant les propriétés de « piège à cations » des parois végétales. En comparaison des méthodes physico-chimiques utilisées classiquement pour décontaminer les sols, mais qui conduisent à leur déstructuration et à une forte diminution de leur fertilité et de leur productivité, la bioremédiation est considérée comme une technique respectueuse de l’environnement. Un atout important de cette technique est également son coût, bien inférieur à celui des techniques traditionnelles de décontamination. Par contre, la bioremédiation ne peut être appliquée dans l’urgence, car les durées de traitement s’étalent sur plusieurs années ─ voire décennies ─ en fonction du degré de pollution. Les recherches actuelles portent donc essentiellement sur l’optimisation de ce temps de traitement. Nous présentons dans cet article différents exemples de bioremédiation in situ des métaux lourds et des radionucléides, et nous débattons en conclusion les aspects négatifs et positifs de cette technique.
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Payment, P. "Effets sur la santé de la recroissance bactérienne dans les eaux de consommation / Health significance of bacterial regrowth in drinking water [Tribune libre, texte anglais et français]". Revue des sciences de l'eau 8, nr 3 (12.04.2005): 301–14. http://dx.doi.org/10.7202/705225ar.
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La présence de bactéries hétérotrophes dans les eaux de consommation (robinet filtrée sur unités domestiques ou embouteillées) constitue un problème difficile à résoudre car on connaît très mal leurs effets sur la santé humaine. Deux points de vue s'affrontent: l'une perçoit ces bactéries comme des bactéries sans aucune importance quel que soit leur nombre, l'autre suppose que certaines d'entre elles sont potentiellement pathogènes et que l'on ne doit pas leur permettre de se multiplier indûment dans l'eau de consommation. Ces bactéries hétérotrophes sont présentes partout et elles trouvent dans l'eau de consommation une niche écologique qui permet parfois leur croissance en grand nombre (e.g., nodules du réseau, tuyauterie des maisons, chauffe-eau, eaux embouteillées, filtre à charbon actif, etc.). Elles ne sont généralement pas d'origine fécale et ne peuvent donc pas servir d'indicateur de pollution fécale. De plus, les indicateurs fécaux tels les coliformes ou Escherichia coli ne peuvent servir à décrire ce groupe de bactéries. Des études réalisées aux États-Unis chez des familles consommant de l'eau filtrée sur filtres à usage domestiques n'ont pas mis en évidence d'effet sur la santé de concentrations élevées de bactéries hétérotrophes. D'autres études ont suggéré qu'une forte croissance de ces bactéries pouvait même être inhibitrice de la croissance des coliformes fécaux et de certaines bactéries pathogènes. Enfin, on a mis en évidence dans certains cas un effet inhibiteur de la présence de grand nombre de ces bactéries lors de l'énumération des bactéries indicatrices par filtration sur membrane. Au contraire, des études canadiennes récentes suggèrent que la présence de bactéries hétérotrophes en grand nombre pourrait avoir des effets sur la santé des consommateurs d'eau. Ces effets ont été observés lors de la prolifération de la flore bactérienne hétérotrophe dans les réservoirs d'unités de filtration par osmose-inversée. Enfin, des bactéries possédant des facteurs de virulence, et pouvant donc initier des maladies, ont été identifiées dans les eaux de consommation et posent le problème sous un angle nouveau. Les indicateurs dont nous disposons pour évaluer les effets sur la santé des eaux de consommation sont de plus en plus remis en question. Les indicateurs de pollution fécale étant inadéquats pour l'évaluation des risques sur la santé il faudra maintenant nous tourner vers d'autres méthodes pour la surveillance des risques associés à la consommation d'eau. n est très difficile avec les informations dont nous disposons maintenant, de définir si l'on doit réglementer le nombre de bactéries hétérotrophes ou si l'on doit tout simplement faire tous les efforts pour éviter les recroissances non-contrôlées.
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Mion, Sonia, Benjamin Rémy, Laure Plener, Éric Chabrière i David Daudé. "Quorum sensing et quorum quenching : Comment bloquer la communication des bactéries pour inhiber leur virulence ?" médecine/sciences 35, nr 1 (styczeń 2019): 31–38. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2018310.
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La plupart des bactéries utilisent un système de communication, le quorum sensing, fondé sur la sécrétion et la perception de petites molécules appelées autoinducteurs qui leur permettent d’adapter leur comportement en fonction de la taille de la population. Les bactéries mutualisent ainsi leurs efforts de survie en synchronisant entre elles la régulation de gènes impliqués notamment dans la virulence, la résistance aux antimicrobiens ou la formation du biofilm. Des méthodes ont vu le jour pour inhiber cette communication entre bactéries et limiter leurs effets nocifs. Des inhibiteurs chimiques, des anticorps ou encore des enzymes capables d’interférer avec les autoinducteurs ont été développés et se sont montrés efficaces pour diminuer la virulence des bactéries à la fois in vitro et in vivo. Cette stratégie, appelée quorum quenching, a également montré des effets synergiques avec des traitements antibactériens classiques. Il permettrait notamment d’augmenter la sensibilité des bactéries aux antibiotiques. Ceci constitue une piste thérapeutique prometteuse pour lutter contre les infections bactériennes et limiter les conséquences de l’antibiorésistance.
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ZIAR, Hasnia, Imène YAHLA i Ali RIAZI. "Conjugated isomers of linoleic acid and health: What about those of bacterial origin ?" Nutrition & Santé 11, nr 01 (16.06.2022): 1–11. http://dx.doi.org/10.30952/ns.11.1.1.
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In addition to their effect on body composition (fat reduction), conjugated linoleic acid isomers (CLA) can play several health benefits, including anti-cancer, anti-atherogenic, anti-adipogenic, anti-diabetic, anti-inflammatory, possible cholesterolemia regulation, and immune function stimulation. Probiotics have been found to produce CLA, however, there is still controversy in the results obtained on the production and effects of human gut bacterial CLA reported in literature. Most of the biological effects have been attributed to cis9, trans11, and trans10, cis12 isomers. The aim of this review was to highlight and discuss how probiotic bacterial CLA isomers provided health benefits. [Au-delà des effets des isomères conjugués de l’acide linoléique (conjugated linoleic acid isomers (CLA)) sur la composition corporelle (diminution de la graisse), ces composés bioactifs ont des effets sur la santé humaine, tels que les effets anti-can-céreux, anti-athérogéniques, anti-adipogéniques, anti-diabétiques, antiinflammatoires, impact potentiel sur la cholestérolémie et stimulation de la fonction immunitaire. Les bactéries probiotiques ont été trouvées capables de conjuguer l’acide linoléique. Toutefois, peu d’études ont mis le point sur cette production des isomères conjugués d’acide linoléique par des bactéries intestinales humaines et restent peu concluantes. Leurs effets santé ont été reliés à deux types d’isomères, à savoir le 9cis, 11trans et le 10trans, 12cis. La présente mise au point a pour objet de souligner les données disponibles concernant les effets des isomères CLA sur la santé, en particulier ceux produits par des bactéries probiotiques. Les mécanismes impliqués dans leurs activités sont aussi évoqués.]
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Meyer, Caroline, Sébastien Leblond, Bénédicte Jacquemin i Émeline Lequy. "Métaux, pollution de l’air et santé". médecine/sciences 36, nr 4 (kwiecień 2020): 376–81. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2020062.
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L’exposition à long terme aux particules atmosphériques a des effets bien documentés sur la santé humaine, mais le rôle des métaux reste à explorer. En France, la réglementation impose le suivi des teneurs ambiantes de certains métaux. Mais ces données, du fait d’un maillage trop large ou irrégulier, sont difficilement exploitables en épidémiologie à grande échelle. Les mousses, des végétaux capables d’accumuler les métaux atmosphériques, sont utilisées depuis plusieurs décennies en biosurveillance de la qualité de l’air. Elles fournissent des données exploitables en épidémiologie grâce auxquelles nous avons montré une association entre métaux d’origine anthropique et sur-risque de mortalité en France.
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Levallois, Alexandre, Laureen Nivelais, Olivier Basuyaux, Katherine Costil, Antoine Serpentini i Christelle Caplat. "Étude de la spéciation dans l’eau de mer de l’aluminium et du zinc libérés par la dissolution d’une anode galvanique". Matériaux & Techniques 110, nr 6 (2022): 605. http://dx.doi.org/10.1051/mattech/2023005.
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Parmi les sources anthropiques libérant des métaux dans l’environnement marin, le système de protection cathodique par anodique galvanique (GACP) est largement utilisé pour protéger contre la corrosion les structures métalliques immergées. Les anodes sont des alliages métalliques dont le composant principal est l’aluminium ou le zinc. Très peu d’études ont été réalisées pour étudier les effets biologiques potentiels des anodes. Dans le cadre d’une étude plus complète de mesures des effets biologiques associés à la dissolution d’une anode galvanique à base d’aluminium, cette étude propose de fournir des informations sur la spéciation de l’aluminium et du zinc qui sont les principaux constituants de l’anode utilisée en milieu marin. À partir d’un montage électrochimique accélérant la dissolution d’une anode et de la production d’eaux de mer enrichies par les métaux libérés, des échantillons d’eau ont été collectés dans le but d’analyser les formes dissoutes, labiles et particulaires des métaux. Les résultats montrent des différences de spéciation et de comportement entre l’aluminium et le zinc qui sont cependant soumis à des interactions fortes. Ils soulignent la formation d’agrégats colloïdaux enrichissant la fraction particulaire des deux métaux et la présence en plus ou moins grande quantité de leur fraction labile dans la fraction dissoute.
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Moreau, M. C. "effets immunomodulateurs des bactéries intestinales : le rôle des bifidobactéries". Journal de Pédiatrie et de Puériculture 14, nr 3 (maj 2001): 135–39. http://dx.doi.org/10.1016/s0987-7983(01)80054-2.
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Mathis, Paul. "Biomasse énergie, pollution atmosphérique et santé". Pollution atmosphérique, NS 7 (1.06.2014): 71–79. http://dx.doi.org/10.54563/pollution-atmospherique.7815.
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Cet article est une revue des effets qu’a sur la santé humaine l’utilisation de biomasse-énergie. Outre les émissions d’oxydes d’azote et de certains métaux, ces effets résultent essentiellement d’une combustion incomplète, source de polluants atmosphériques : particules fines, monoxyde de carbone, composés organiques volatils, hydrocarbures aromatiques polycycliques. La question est examinée sous quatre aspects : l’utilisation de combustibles solides pour la cuisson dans les pays pauvres, le chauffage au bois, l’incinération de déchets organiques, et les biocarburants. Dans tous les cas, des effets sanitaires sont établis, mais ils peuvent généralement être prévenus.
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Sola, F., J. Isaia, A. Masoni i B. Lahlou. "Effets des métaux lourds sur la physiologie des poissons". Journal français d’hydrologie 24, nr 1 (1993): 9–27. http://dx.doi.org/10.1051/water/19932401009.
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Vincent, Julia, Béatrice Colin, Isabelle Lanneluc, Philippe Refait, René Sabot, Marc Jeannin i Sophie Sablé. "La biocalcification bactérienne en milieu marin et ses applications". Matériaux & Techniques 110, nr 6 (2022): 606. http://dx.doi.org/10.1051/mattech/2023004.
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La précipitation du carbonate de calcium (CaCO3) biologiquement induite en milieu marin joue un rôle important dans le cycle biogéochimique du carbone. Cette biocalcification est gouvernée par quatre facteurs clés : le taux de carbone inorganique dissous dont dépend le taux de carbonates (CO32−) dans le système, le taux d’ions calciques (Ca2+), le pH et la disponibilité des sites de nucléation c’est-à-dire des zones de cristallisation primaire de la phase solide du minéral. Les bactéries impliquées dans la biocalcification marine vont alors agir sur un ou plusieurs de ces facteurs. Ce processus naturel, qui se produit dans divers contextes géologiques, peut être imité afin de développer un certain nombre de technologies permettant la séquestration des métaux lourds, la protection des métaux contre la corrosion, la restauration et le renforcement de matériaux préexistants et la consolidation de matériaux granulaires. Cette étude passe en revue les différentes activités métaboliques microbiennes menant à la précipitation du CaCO3 ainsi que leurs applications potentielles en milieu marin.
Rozprawy doktorskie na temat "Bactéries – Effets des métaux"
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Delorme, Thierry. "Tolérance aux métaux lourds des bactéries de sédiments fluviatiles : acclimatation au zinc d'une souche d'Alcaligenes piechaudii". Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10134.
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Bien que faiblement contamine par les metaux, le sediment de l'ile de grand-gravier, contient des bacteries metallo-resistantes. Une souche d'alcaligenes piechaudii (zn11) pouvant se developper sans acclimatation prealable au zinc, en presence de 8 mm de zinc, a ete isolee. Son acclimatation au zinc a ete plus particulierement etudiee. En presence de fortes concentrations metalliques, la cinetique de croissance d'a. Piechaudii zn11 presente une phase de latence d'autant plus importante que la concentration metallique est elevee. L'entree du zinc, par les transporteurs du magnesium, entraine des blocages du metabolisme bacterien, se traduisant par une perte de viabilite importante. La phase de latence est une phase de reparation cellulaire et d'induction d'un mecanisme d'efflux energie dependant, impliquant une atpase. L'induction de la resistance a 3mm par une culture en presence de 50m de zinc a ete caracterisee par deux phases. La premiere est probablement liee a un phenomene de stress. Les proteines de stress induites par la presence du zinc 50m protegeraient la cellule vis a vis des effets du zinc a de plus fortes concentrations metalliques. La seconde phase serait due a la mise en place du mecanisme d'efflux. Le phenomene de stress semble persister dans les bacteries acclimatees au zinc 3mm. La resistance d'a. Piechaudii zn11 au zinc est induite par des precultures en presence de differents metaux (cadmium, cobalt, et cuivre) ; la reciproque est egalement observee. Toutefois, la croissance des cellules acclimatees au zinc 3mm est inhibee par l'apport de faibles teneurs de ces metaux. Le mecanisme de resistance au zinc serait donc specifique. Seul l'isolement des genes de la resistance au zinc (non obtenu) indiquera si a. Piechaudii zn11 possede un seul mecanisme de resistance capable d'expulser les divers metaux testes, ou si chaque metal necessite son propre mecanisme, comme cela semble etre le cas avec le nickel
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Siron, Valérie. "Stabilité de nanoparticules d'oxyde métallique et effets toxicologiques". Paris 7, 2009. http://www.theses.fr/2009PA077138.
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C'est à cause de leur petite taille (une dimension inférieure à 100 nm) que les nanoparticules sont utilisées dans de nombreux domaines d'application (textiles, cosmétiques,. . . ). Certains de ces nanomatériaux sont déjà commercialisés. Cet essor des nanosciences n'a malheureusement pas été accompagné par les études toxicologiques adéquates. Le but de mon travail est donc d'apporter des éléments de réponse à cette problématique. Dans cette optique, l'analyse des interactions biologiques entre des nanoparticules d'oxyde de zinc (ZnO) semiconducteur utilisé dans les crèmes solaires, et Escherichia coli, une bactérie présente dans l'environnement, a été réalisée. Le comportement toxique des ZnO a été évalué dans deux milieux : un milieu de croissance classique, le Luria Bertani (LB), et un milieu environnemental, l'eau de Seine. Les résultats obtenus dans ce travail ont mis en évidence la nécessité d'une approche pluridisciplinaire pour étudier l'impact toxique des nanoparticules. Ainsi, des effets bactériostatique et bactéricide des nanoparticules ont été démontrés, mais la comparaison des effets biologiques observés lors d'une incubation avec des ions Zn2+, suggère une dissolution partielle des nanoparticules. Cette hypothèse a été confirmée par l'étude de la solubilité des nanoparticules dans les différents milieux. La composition du milieu joue indéniablement un rôle dans le potentiel toxique des ZnO. L'implication d'un stress oxydatif dans les mécanismes de toxicité des nanoparticules a également été observée en utilisant une souche mutée pour l'enzyme de la superoxyde dismutaseAs they are small, the nanoparticules which one of the dimensions is inferior to 100 nm, are used in many processes (textile, cosmetics,. . . ) and some nanomaterials are already included in consumer goods. Despite the rise of nanosciences, few studies have determined the ecotoxicological and environmental impact of the nanoparticles. The aim of this study is to find some answers to these issues. To do so, the study of the biological interactions between ZnO nanoparticles (semi conductor incorporated in the sunscreen composition), and a Escherichia coli, a bacteria présent in the environment, was performed. The toxic behaviour of ZnO nanoparticles was evaluated in two media: a growth medium Luria Bertani (LB), and an environmental medium, Seine river water. The results obtained in this work show that the toxic impact studies of nanoparticles needed a pluridisciplinary approach. Indeed, the bacteriostatic and bactericidal effects of nanoparticles were evidenced in this work, but a comparison of the biological effects obtained during incubation with Zn2+ ions, suggested the partial dissolution of the nanoparticles. This hypothesis was confirmed by solubility experiments performed in both media. The composition of the medium influences the potential toxicity of ZnO. The implication of oxidative stress in the mechanisms of nanoparticles toxicity was observed by using a mutant strain for the superoxide dismutase enzyme
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Vidal, Céline. "Etude taxonomique, phylogénétique et génétique des bactéries symbiotes des légumineuses métallicoles adaptées aux sites contaminés par le zinc et le cadmium". Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20232.
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Anthyllis vulneraria est une légumineuse présente sur les remblais d'anciennes mines de zinc, capable de fixer l'azote atmosphérique. Elle favorise l'installation d'autres espèces végétales et participe ainsi à une phytostabilisation rapide et durable de ces sites. La bactérie fixatrice d'azote symbiotique de l'écotype métallicole d'A. Vulneraria appartient à une nouvelle espèce bactérienne, Mesorhizobium metallidurans. Cette bactérie est présente de façon systématique sur tous les anciens sites miniers échantillonnés où un écotype d'Anthyllis métallicole a été répertorié. Afin de connaître son origine, une analyse comparative (génétique et phénotypique) de 164 Mesorhizobium associés à l'Anthyllis métallicole a été réalisée au niveau de sites contaminés et non contaminés. Les bactéries métallicoles se différencient des non métallicoles génétiquement, taxonomiquement et dans leurs capacités à tolérer les métaux. Ainsi M. Metallidurans apparaît particulièrement adapté à des milieux à forte teneur en Zn et en Cd. L'étude des rhizobia associés à plusieurs autres légumineuses métallicoles a révélé une forte diversité de bactéries. Il semble que les bactéries symbiotiques associées à différentes légumineuses métallicoles soient le résultat d'adaptations locales liées à des transferts horizontaux de gènes. Ainsi une bactérie saprophyte du sol fortement adaptée aux milieux contaminés et capable d'acquérir des gènes de nodulation sous pression de sélection de la plante hôte serait à l'origine de M. MetalliduransAnthyllis vulneraria is a legume present on heavy-metal-enriched spoil heaps of zinc and able to fix nitrogen. It facilitates installation of other vegetal species, allowing fast and lasting post-mining restoration of these sites. Nitrogen-fixing bacteria able to associate with a metallicolous A. Vulneraria ecotype belong to a new species, Mesorhizobium metallidurans. This bacterium is systematically found in all mining samples where metallicolous Anthyllis ecotype is present. To investigate on the origin of this bacterium, a comparative analysis (genetic and phenotypic) of Mesorhizobium associated with metallicolous Anthyllis was performed on contaminated and non contaminated soils. Metallicolous bacteria differ of non metallicolous genetically, taxonomically and in their capacities to tolerate metals. So, M. Metallidurans seems particularly adapted to high level of Zn and Cd. Study of rhizobia associated with several other metallicolous legumes revealed high genetic diversity. It seems that symbiotic bacteria associated with different metallicolous legumes are the result of local adaptations linked to horizontal transfers. Thus, a soil saprophytic bacterium highly adapted to contaminated and able to acquire nodulation genes under selection pressure of plant host would be at the origin of M. Metallidurans
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Oger-Duroy, Cécile. "Etude des bactéries résistantes au cadmium portant le gène cadA dans un environnement naturel contaminé par les métaux lourds : l'estuaire de la Seine". Rouen, 2003. http://www.theses.fr/2003ROUES019.
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Les communautés bactériennes de l'estuaire de Seine résistantes au cadmium sont étudiées par différentes approches de microbiologie classique et d'écologie moléculaire. La quantification de l'abondance en gène cadA dans l'ADN total des communautés bactériennes extrait d'échantillons de l'estuaire est possible grâce à une approche de biologie moléculaire, la PCR compétitive. Nous avons mis en évidence une pression de sélection par le cadmium sur les communautés bactériennes présentes au niveau de la vasière intertidale Nord et avons montré que les bactéries qui portent le gène cadA présentent la même dynamique que les matières en suspension dans la zone de turbidité maximale de l'embouchure, en période de faible débit. Par ailleurs, au sein de la population des Staphylococcus cultivables portant le gène cadA, la conservation des séquences de gène cadA pourrait être liée à la dissémination de ce gène par l'intermédiaire de plasmides ou de séquences d'insertion, les IS257In the Seine estuary cadmium-resistant bacterial communities was studied with different approaches of classical microbiology and molecular ecology. Molecular quantification of the cadA gene level in the total extracted DNA from environmental samples (water and sediments) in the microbial community, enabled us to study modifications in the genetic background of these communities. Those modifications could be related to the selection pressure by cadmium occurring on bacterial communities in contaminated sites such as the Northern intertidal mudflats. Moreover, high level of cadA gene in the water column of the mouth could be relied to the hydrodynamic of the environment during the maximum turbidity zone formation in low riverflow periods. This study focalized on the Staphylococcus population harboring cadA gene. The conservation of cadA gene sequences in the bacteria of this genus could be related to the dissemination of this gene with plasmids or insertion sequences IS257 intermediates
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Mohamad, Roba. "Adaptation des bactéries symbiotiques de légumineuses métallicoles : effets des métaux lourds et de la plante hôte sur la composition des populations de rhizobia symbiotiques d’Anthyllis vulneraria et de Lotus corniculatus". Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT153/document.
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Deux légumineuses (Anthyllis vulneraria et Lotus corniculatus) adaptées aux métaux lourds constituent un matériel d’intérêt pour la phytostabilisation de sites miniers. Leur fonction de fixatrices biologiques d’azote grâce à leur symbiose avec des bactéries symbiotiques permet l’établissement efficace d’une couverture végétale durable limitant la dispersion des métaux dans l’environnement. Nos objectifs ont été d’étudier les effets des métaux lourds et de la plante hôte sur les populations symbiotiques naturellement associées à ces légumineuses en analysant (i) les populations symbiotiques associées à A. vulneraria sur 8 sites contaminés ou non (ii) les populations de rhizobia associées à L. corniculatus qui ont été comparées à celles d’Anthyllis. La distribution des souches de Mesorhizobium isolées de nodosités d’A. vulneraria et provenant de plusieurs sites contaminés ou non dépend des fortes teneurs en métaux lourds des sols qui sélectionnent fortement les souches symbiotiques résistantes et influencent leur composition taxonomique. Les souches appartenant à l’espèce M. metallidurans ont été retrouvées seulement dans les sites fortement contaminés. Deux nouvelles espèces potentielles et résistantes aux métaux semblent exister chacune sur un site minier distinct. L’une d’elle est proche de M. ciceri et de M. loti et tous ses membres présentent la particularité de ne pas posséder de gène cadA, un gène impliqué dans la tolérance aux métaux chez M. metallidurans. Par contre, les sites non contaminés révèlent une diversité taxonomique différente avec la présence de nouvelles espèces de Mesorhizobium sensibles aux métaux lourds. Quatre de ces nouvelles espèces ont été définies. A. vulneraria et L. corniculatus partagent la même diversité taxonomique dans les sites contaminés testés. Par contre, les propriétés symbiotiques des souches varient selon la plante hôte utilisée pour le piégeage. Les souches appartiennent soit au symbiovar (sv.) anthyllidis soit au sv. loti selon le site géographique d’origine et ceci indépendamment des teneurs en métaux lourds dans le sol. A. vulneraria s’associe avec les souches possédant les sv. anthyllidis ou sv. loti. En revanche, L. corniculatus ne s’associe qu’avec des souches du sv. loti. Dans tous les sols qu’ils soient contaminés ou non, A. vulneraria nodule préférentiellement avec le sv. anthyllidis. En conclusion, A. vulneraria et L. corniculatus établissent des symbioses avec les mêmes espèces de Mesorhizobium et s’associent préférentiellement avec un sv. Les taxons retrouvés dépendent fortement des sites d’isolement, ce qui pourrait traduire des adaptations particulières aux conditions environnementales. L’utilisation des ressources biologiques locales est une stratégie que nous recommandons pour la végétalisation d’anciens sites miniersTwo legumes (Anthyllis vulneraria and Lotus corniculatus) adapted to heavy metals form an interesting material for phytostabilisation strategy in mining sites. As biological nitrogen fixators, these legumes associated with compatible symbiotic bacteria provide an efficient establishment of a sustainable cover vegetation limiting metal dispersion in the environment. Our objectives were to study the effects of heavy metals and the host plant on symbiotic populations naturally associated with these legumes by analyzing (i) symbiotic populations associated with A. vulneraria on 8 contaminated and uncontaminated sites (ii) rhizobial populations associated with L. corniculatus that were compared with those of Anthyllis. The distribution of mesorhizobial strains isolated from A. vulneraria root-nodules from several contaminated and uncontaminated sites depends on high levels of heavy metals in soils by selecting highly resistant strains and impacting the taxonomic composition. Strains belonging to M. metallidurans were only found in highly contaminated sites. Two new potential metal-tolerant species were detected in two distinct mines. One of them was closely related to M. ciceri and M. loti and its members had the feature of not -possessing the cadA gene, a gene involved in metal-tolerance among M. metallidurans strains. By contrast, uncontaminated sites revealed a different taxonomic diversity with new species sensitive to heavy metals. Four of these new species were defined. A. vulneraria and L. corniculatus share the same taxonomic diversity in the contaminated sites tested. By contrast, symbiotic properties of the strains vary depending on the host plant used for trapping. Strains belong either to symbiovar (sv.) anthyllidis or to sv. loti according to geographic origins and independently of heavy metal levels in soils. A. vulneraria associated with strains of sv. anthyllidis or sv. loti. In contrast, L. corniculatus only associated with strains of sv. loti. In contaminated or uncontaminated soils, A. vulneraria was preferentially nodulated by sv. anthyllidis. In conclusion, A. vulneraria and L. corniculatus established symbiotic relationships with the same taxonomic groups of Mesorhizobium but associated with different symbiovars. The finding of taxonomic groups strongly depends on geographical sites, suggesting special adaptations to environmental conditions. Use of local biological resources is the strategy we recommend for revegetation of old mines
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Saint-Martin, Pascale. "Étude de deux protéines contenant du fer non hémique isolées du genre Desulfovibrio : la rubrérythrine (purification et caractérisation chez Desulfovibrio desulfuricans ATCC 27 774) et la rubrédoxine (effets de substitutions métalliques)". Compiègne, 1989. http://www.theses.fr/1989COMPD206.
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Les rubrédoxines possédant le centre fer-soufre le plus simple ont servi de modèles pour l'étude de fonctionnement des hydrogénases contenant des centres plus complexes. Les rubrédoxines de 3 souches de bactéries sulfato-réductrices du genre Desulfolvibrio (D. Desulfuricans ATCC 27 774 et Berre-Eau et D. Gigas) ont été modifiées par remplacement de leur centre actif ferrique par du nickel et les activités d'échange deuterium-proton et de production de H2 ont été mesurées par spectrométrie de masse. Les rubrédoxines natives sont inactives vis-à-vis de la molécule de D2. La substitution métallique engendre l'apparition d'activités d'échange et de production qui, bien que faibles par rapport à celles des hydrogénases, permettent de conclure à un rôle du nickel dans l'activation de la molécule d'hydrogène. Le rapport H2/H2+Hd donne une valeur correspondant à un clivage hétérolytique de D2. Le CO, inhibiteur des hydrogénases, entraîne une inhibition réversible des rubrédoxines à nickel. Le remplacement du fer par d'autres métaux de transition (cobalt ou cuivre) n'engendre pas de protéines actives vis-à-vis de la molécule de H2. Chez D. Desulfuricans ATCC 27 774, une nouvelle protéine présentant un spectre optique comparable à celui de la rubrédoxine, a été isolée. Elle contient du fer impliqué dans 2 structures différentes de type rubrédoxine et de type hémérythrine, cette caractéristique lui valant le nom de rubrérythrine. Elle est constituée de 2 sous-unités de 24 KDa. Son potentiel redox (+ 200 mV) est très élevé par rapport à celui des autres protéines d'oxydo-réduction des Desulfovibrio. Son rôle physiologique est toujours inconnu, bien qu'une protéine ayant une activité NADH-rubrérythrine oxydo-réductase ait été purifiée et caractériséeRubredoxin, the simplest iron-sulfur protein, has been used as a model for the study of mechanisms of hydrogenases which contain more complex centers. The active center of rubredoxins from 3 Desulfolvibrio strains (D. Desulfuricans ATCC 27 774 and Berre-Eau and D. Gigas) has been substituted by nickel and their deuterium-proton exchange and H2 production activities have been measured by mass-spectrometry. No net activity has been observed with native rubredoxin. Substitution with nickel leads to exchange and production activities, weak indeed when compared to those of hydrogenases. But it is clear that nickel plays a role in hydrogen activation. H2/H2+HD ratio is compatible with an heterolytic cleavage of D2 with formation of an hybrid. CO, which is an inhibitor of all types of hydrogenases, is a reversible of inhibitor for nickel-rubredoxins. No activity is observed after replacement of iron by other transition metals (cobalt or copper). A new protein has been isolated from D. Desulfuricans ATCC 27 774. It contains non heme iron implicated in two different structures : one of the rubredoxin type and one of the hemerythrin type. So it has been called rubrerythrin. The optical spectrum of this protein is comparable to the rubredoxin one, but it is composed by two 24 KDa subunits. The redox potential (+ 200 mV) is very high compared to other proteins found in Desulfovibrio. A protein with NADH-rubrerythrin oxydo-reductase activity has been purified and characterized. Nevertheless, the physiological role of rubrerythrin is still unknown
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Présent, Romain. "Biodisponibilité et dynamique de partition de métaux traces aux interphases microbiennes : effets de complexation intracellulaire et application aux biosenseurs bactériens". Thesis, Université de Lorraine, 2018. http://www.theses.fr/2018LORR0181/document.
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La biodisponibilité d'un métal pour un organisme donné correspond à la fraction de ce métal qui est potentiellement bioadsorbable et/ou biointernalisable. Elle dépend de la composition physicochimique du milieu, de la nature des surfaces biologiques considérées et elle est modulée par la réponse cellulaire des organismes. Dans un contexte environnemental, l’analyse des processus contrôlant la bioassimilation des métaux est essentielle pour une prédiction fiable de leur biodisponibilité et toxicité. Dans ce manuscrit sont détaillés des développements théoriques et expérimentaux visant à comprendre la dynamique de partition de contaminants métalliques aux interfaces microbiennes et les déterminants de leur biodisponibilité selon une approche qui dépasse les cadres thermodynamiques classiques (modèle BLM). Après une partie introductive et une revue de l'état de l'art, le troisième chapitre de cette thèse est dédié à l'élaboration d'un formalisme pour l'évaluation quantitative de la bio-partition hors-équilibre de métaux traces aux interfaces biologiques. Ce modèle théorique est basé sur les expressions des flux de contaminants depuis la solution extracellulaire vers la surface biologique par diffusion/conduction, des flux d'internalisation et excrétion à travers la membrane, et il tient compte de la cinétique de déplétion des métaux en solution. Le formalisme intègre par ailleurs les processus de complexation intracellulaire des métaux sur la base d'un mécanisme d'Eigen généralisé. Dans le quatrième chapitre, des souches d'Escherichia coli ont été génétiquement modifiées pour (i) limiter leurs capacités d'excrétion des métaux et (ii) sur-exprimer des protéines intracellulaires ayant une forte affinité pour ces métaux. Des données expérimentales issues de suivis cinétiques de déplétion de Cd(II) réalisées à différentes fractions volumiques en bactéries ont permis de conforter avec succès les bases de la théorie élaborée dans cette thèse pour la partition de métaux à des biointerfaces molles chargées. Un dernier chapitre est consacré à l’évaluation quantitative de la réponse de biosenseurs luminescents en présence de métaux. Ce formalisme décrit la façon avec laquelle la dérivée temporelle des biosignaux dépend de la dynamique d’internalisation du métal, de la cinétique de formation de complexes intracellulaires régulateurs des processus de transcription et de leurs stabilités, et des processus de bio-sorption passive. Une confrontation avec des données expérimentales issues de biosenseurs sensibles au cadmium a permis de mettre en évidence l’inapplicabilité des modèles d’équilibre de biodistribution des métaux, et de prédire la réponse des biosenseurs à des variations de la salinité du milieu, de la concentration cellulaire et de la concentration bulk de métauxBioavailability of metal ions toward living organisms refers to the metal fraction they potentially adsorb and/or internalize. It is governed by the physicochemical medium composition, the nature of the biological surface considered and it is further mediated by the cellular response of the organisms. Within an environmental context, a fine understanding of the processes controlling metal biouptake is mandatory to predict bioavailability and toxicity of metallic contaminants. Here are detailed theoretical and experimental developments to broaden our knowledge on dynamic partitioning of metallic contaminants at microbial interfaces beyond the standard thermodynamic representation (BLM model). After an introduction and a state of the art section, the third chapter is devoted to the elaboration of a rationale for the evaluation of the processes governing metal biouptake under relevant out-of-equilibrium conditions. The formalism expresses the fluxes of contaminants from bulk medium to the biosurface via conductive diffusion, the biouptake and excretion fluxes with account of metal depletion kinetics in the extracellular medium. It also includes chemodynamics of intracellular metal complexation as described by a generalized Eigen scheme. In the fourth chapter, strains of \textit{Escherichia coli} were genetically modified to limit metal excretion ability and overexpress strong intracellular proteinaceous chelators. Quantitative interpretation of metal depletion kinetic data confort the bases of the theory developed in this PhD work on metal partitioning at soft charged biointerfaces. The final chapter deals with a development of a theoretical framework for understanding -on a mechanistic level- the response of metal-sensitive whole-cell bioreporters. The theory explicitly deciphers how the time derivative of bioreporters signal intensity is governed by the dynamics of metal biouptake, by the formation kinetics and stability of the intracellular complexes acting as transcriptional regulators, and by passive biosorption. The model predictions are successfully collated with cadmium detection data collected with genetically modified Escherichia coli luminescent bioreporters that exhibit various lipopolysaccharidic surface structures. The analysis dismisses the applicability of thermodynamic metal biopartitioning models and it clearly defines the physicochemical medium composition in line with optimum biosensing of the bioavailable metal fraction
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De, Angelis Fabien. "Characterization of proteins involved in RND-driven heavy metal resistance systems of Cupriavidus metallidurans CH34". Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2010. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210154.
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Les systèmes d’efflux tripartite de type Resistance, Nodulation and cell-Division (RND) sont essentiels dans le maintien de phénotypes de résistance multidrogues et contre les métaux lourds dans nombreuses bactéries Gram-négatives. Le transport de ces composés toxiques hors de la cellule est permis par l’assemblage d’une protéine de type antiporteur cation/proton (unité RND) insérée dans la membrane interne, connectée à une protéine insérée dans la membrane externe, pour former un canal de sorti qui traverse l’entièreté de l’enveloppe cellulaire. Le troisième composant du système, la protéine de type membrane fusion protein (MFP) qui est aussi appelée periplasmic adaptor protein (PAP), est requis pour permettre l’assemblage de tout ce complexe à trois composants. Cependant, les MFPs sont supposées jouer un rôle important et actif dans le mécanisme d’efflux du substrat. Pour mieux comprendre le rôle des MFPs au sein des systèmes d’efflux de type RND, nous avons étudié les protéines ZneB (précédemment appelée HmxB) et SilB, les composants périplasmiques des systèmes ZneCBA et SilABC responsables de la résistance aux métaux lourds chez Cupriavidus metallidurans CH34. Nous avons identifié la spécificité de liaison au substrat de ces protéines, montrant leur capacité à fixer le zinc (ZneB), ou le cuivre et l’argent (SilB). De plus, nous avons résolu la structure cristalline de ZneB à une résolution de 2.8 Å dans la forme apo- et avec un ion zinc fixé. La structure de ZneB possède une architecture générale composée de quatre domaines caractéristiques des MFPs, et la présence du site de coordination au zinc dans une région très flexible à l’interface des domaines β-barrel et membrane proximal. Les modifications structurales que la protéine subit lors de la fixation du zinc on été observée dans le cristal mais aussi en solution, ce qui suggère un rôle actif des MFPs dans le mécanisme d’efflux des métaux, vraisemblablement via la fixation et le relargage de l’ion à l’antiporteur. Les études de sélectivité de transport des antiporteurs ZneA et SilA montre que ces dernières et leurs protéines périplasmiques respectives ont des affinités similaires pour les métaux lourds. De plus, les études de transport ont apportés des arguments en faveur de l’hypothèse de capture cytoplasmique du substrat par l’antiporteur, tandis que la capacité des protéines périplasmiques à fixer les métaux lourds a apporté des arguments en faveur de l’hypothèse de capture périplasmique du substrat par l’antiporteur. Les deux modes de capture pourraient en réalité coexister ;cependant, le débat autour du compartiment cellulaire de capture du substrat par l’antiporteur est complexe et requiert de plus amples efforts afin d’être cerné. / Tripartite resistance nodulation cell division (RND)-based efflux complexes are paramount for multidrug and heavy metal resistance in numerous Gram-negative bacteria. The transport of these toxic compounds out of the cell is driven by the inner membrane proton/substrate antiporter (RND protein) connected to an outer membrane protein to form an exit duct that spans the entire cell envelope. The third component, a membrane fusion protein (MFP) also called periplasmic adaptor protein, is required for the assembly of this complex. However, MFPs are also proposed to play an important active role in substrate efflux. To better understand the role of MFPs in RND-driven efflux systems, we studied ZneB (formerly HmxB) and SilB, the MFP components of the ZneCAB and SilABC heavy metal RND-driven efflux complexes from Cupriavidus metallidurans CH34. We have identified the substrate binding specificity of the proteins, showing their ability to selectively bind zinc (ZneB), or copper and silver cations (SilB). Moreover, we have solved the crystal structure of the apo- and the metal-bound forms of ZneB to 2.8 Å resolution. The structure of ZneB displays a general architecture composed of four domains characteristic of MFPs, and it reveals the metal coordination site at the very flexible interface between the β-barrel and the membrane proximal domains. Structural modifications of the protein upon zinc binding were observed in both the crystal structure and in solution, suggesting an active role of MFPs in substrate efflux possibly through binding and release. The selectivity assays of the antiporter proteins ZneA and SilA demonstrated similar specificities in relation to their cognate MFPs toward heavy metal cations. Moreover, antiporter transport assays provide evidence for cytoplasmic substrate capture by this protein, whereas MFP substrate binding provides evidence for periplasmic substrate capture. Therefore, both modes of capture might co-exist; nevertheless, the substrate capture issue is a complex topic still needing consequent efforts to understand it.Doctorat en Sciences agronomiques et ingénierie biologique
info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Tambosi, Reem. "Stress and toxicity of metal in photosynthetic bacteria : multi-scale study of the effects and the targets of metal ions and nanoparticles Silver and Copper Acute Effects on Membrane Proteins and Impact on Photosynthetic and Respiratory Complexes in Bacteria Silver Effect on Bacterial Cell Membrane Structure Investigated by Atomic Force and Scanning Electron Microscopes Cadmium and Copper Cross-tolerance. Cu+ alleviates Cd2+ toxicity, and both cations target heme and chlorophyll biosynthesis pathway in Rubrivivax gelatinosus Additive effects of metal excess and superoxide, a highly toxic mixture in bacteria". Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASL070.
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L’usage intensif des métaux et des ions métalliques dans l'industrie et l'agriculture représente une menace sérieuse pour l'environnement et pour tous les êtres vivants en raison de la toxicité aiguë de ces ions. Cependant, cela peut aussi être un outil prometteur. En effet, les ions comme les nanoparticules d'argent sont très utilisés dans diverses applications médicales, industrielles et sanitaires. L'effet antimicrobien de ces nanoparticules est en partie lié aux ions Ag⁺ libérés et à leur capacité à interagir avec les membranes bactériennes. L'objectif de ce projet est d'étudier l'interaction entre un objet biologique (les bactéries) et des objets physiques (métaux), pour comprendre l'impact des métaux sous différentes formes (ions, nanoparticules et nanostructures) sur les cellules bactériennes en utilisant différentes approches: de physiologie, biochimie, génétique et de biologie cellulaire. Nous avons utilisé comme modèles biologiques, principalement la bactérie photosynthétique pourpre Rubrivivax (R.) gelatinosus, mais aussi Escherichia coli; et pour les objets physiques, nous avons utilisé l'argent comme métal principal mais aussi d'autres métaux (cuivre, cadmium et nickel) à titre de comparaison. Les principaux objectifs de ce travail sont: 1- d'étudier l'impact et les mécanismes de toxicité de ces ions métalliques / NPs sur les métabolismes bactériens respiratoire et photosynthétique. 2- Identifier des gènes bactériens impliqués dans la réponse à un excès d'ions Ag⁺. 3- Etudier l'internalisation et l'interaction des ions métalliques et des NP au sein des membranes biologiques. Ainsi, nous avons pu identifier, à la fois in vitro et in vivo, des cibles spécifiques d'ions Ag⁺ et Cu²⁺ dans la membrane des bactéries. Cela inclut des complexes impliqués dans la photosynthèse, mais également des complexes de la chaine respiratoire. Il a été démontré que les ions Ag⁺ et Cu²⁺ ciblent spécifiquement une bactériochlorophylle exposée au solvant dans les antennes de collecte de lumière du photosystème de la bactérie. Ceci présente également, à notre connaissance, la première preuve directe de dommages induits par des ions Ag⁺ sur les protéines membranaires impliquées dans ces métabolismes. Par ailleurs, nous avons également réalisé une étude comparative par microscopie (AFM/ MEB) de l'effet de l'Ag⁺ en solution ou des Ag-NPs synthétisés dans notre laboratoire, sur la morphologie des cellules bactériennesThe extensive use of metal ions in industry and agriculture represents a serious threat to the environment and to all living being because of the acute toxicity of these ions. However, it can also be a promising tool, silver ions and nanoparticles are some of the most widely used metals in various industrial and health applications. The antimicrobial effect of these nanoparticles is in part related to the released Ag⁺ ions and their ability to interact with bacterial membranes. The goal of this project is to study the interaction between biological subject (the bacteria) and physical objects (metals), and more specifically to understand the impact of metals in different forms (ions, nanoparticles and nanostructures) on the growth of the bacterial cells using different approaches : physiology, biochemistry, genetics and cell biology. We used as biological models, principally the purple photosynthetic bacterium Rubrivivax (R.) gelatinosus, but also Escherichia coli; and for physical objects, we used silver as main metal but also other metals (copper, cadmium and nickel) for comparison. The main objectives are: 1- to study the impact and the mechanisms of toxicity of these metallic ions/NPs on the bacterial respiratory and photosynthesis metabolisms. 2- To identify the bacterial genes involved in response to excess silver. 3- To study the internalization and interaction of metals ions and NPs within biological membranes. The results showed that we were able to identify, both in vitro and in vivo, specific targets of Ag⁺ and Cu²⁺ ions within the membrane of bacteria. This include complexes involved in photosynthesis, but also complexes involved in respiration. Ag⁺ and Cu²⁺ were shown to specificaly target a solvent exposed bacteriochlorophyll in the light harvesting antennae of the photosystem. This also presents, in our knowledge, the first direct evidence of silver ions damages to membrane proteins involved in these metabolisms. We also carried out a microscopy (AFM/ SEM) comparative study of the effect of Ag⁺ ions or Ag-NPs synthesized in our laboratory, on the bacterial cell morphology
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Zhang, Rui. "Temporal and spatial dynamics of trace metal acquisition by prokaryotic communities in the Southern Ocean". Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2024SORUS136.pdf.
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Les oligoéléments tels que le fer, le manganèse, le nickel et le cuivre jouent un rôle essentiel dans la croissance et le métabolisme des microorganismes procaryotes et eucaryotes phototrophes et non phototrophes dans l'océan, et influencent ainsi le cycle biogéochimique des principaux éléments. Alors que l'impact de la limitation en Fe sur les microorganismes phototrophes (phytoplancton) a été largement étudié, les liens entre les micronutriments et les procaryotes hétérotrophes restent jusqu'à présent peu étudiés. Cette thèse étudie le potentiel métabolique des microbes marins taxonomiquement diversifiés pour acquérir des métaux traces en utilisant une approche métagénomique et donne ainsi un aperçu de la contribution des taxons procaryotes au cycle des éléments mineurs et majeurs à des échelles temporelles et spatiales dans l'Océan Austral.L'objectif du chapitre 1 est d'étudier la stratégie des procaryotes pour acquérir différentes formes chimiques de Fe au cours de la saison. Sur la base d'échantillons obtenus par un échantillonneur autonome à distance, des observations métagénomiques saisonnières à haute résolution dans la région naturellement fertilisée en Fe au large des 'îles Kerguelen sont présentées. La dynamique saisonnière suggère un découplage temporel des besoins des procaryotes en Fe et en carbone organique pendant l'efflorescence printanière du phytoplancton et un accès concerté à ces ressources en fin d'été. Les stratégies écologiques donnent un aperçu de la manière dont le Fe pourrait façonner la composition de la communauté microbienne, avec des implications potentielles sur la transformation de la matière organique dans l'océan Austral.La question de savoir comment la disponibilité des métaux traces sélectionne les taxons procaryotes et les rétroactions potentielles des processus microbiens sur la distribution des métaux traces dans l'océan est abordée dans le chapitre 2. Les liens réciproques potentiels entre divers taxons procaryotes et Fe, Mn, Cu, Ni ainsi que l'utilisation apparente de l'oxygène (AOU) dans 12 masses d'eau bien définies du sud de l'océan Indien (SWINGS - South West Indian Ocean GEOTRACES GS02 Section cruise) ont été étudiés. L'analyse ‘Partial Least Square Regression' (PLSR) révèle que les masses d'eau sont associées à des vecteurs latents particuliers qui sont une combinaison de la distribution spatiale des taxons procaryotes, des éléments traces et de l'AOU. Cette approche fournit de nouvelles informations sur les interactions potentielles entre les taxons procaryotes et les métaux traces en relation avec la reminéralisation de la matière organique dans des masses d'eau distinctes de l'océan.Dans le chapitre 3, les gènes liés au transport des métaux-traces par les communautés procaryotes habitant les différentes masses d'eau échantillonnées au cours de la campagne SWINGS ont été étudiés. Ces résultats couvrent 42 échantillons prélevés de la surface jusqu'à la profondeur à 13 stations dans la zone subtropicale, subantarctique, frontale polaire et antarctique. L'abondance des gènes associés au transport du Fe, du Mn, du Ni et du Cu dans les fractions libres (<0,8 µm) et attachées aux particules (>0,8 µm) a été déterminée à la fois au niveau de la communauté et dans les ‘metagenome assembled genomes' (MAG). Les résultats révèlent des différences dans l'abondance normalisée (GPM) en fonction de la localisation géographique dans les eaux de surface et entre les masses d'eau en profondeur. Ces dernières étaient particulièrement prononcées pour les transporteurs de sidérophores, Mn, Ni et Cu. Chaque masse d'eau contenait un ensemble distinct de MAG abondants et ceux-ci se sont révélés différents dans leurs répertoires de transporteurs de métaux traces. Ces observations suggèrent que les métaux traces étudiés ici pourraient jouer des rôles distincts dans le métabolisme microbien dans différentes masses d'eau, avec des rétroactions potentielles sur leur cycle dans l'océanTrace metals such as iron (Fe), manganese (Mn), nickel (Ni), and copper (Cu) play critical roles for the growth and metabolism of phototrophic and non-phototrophic prokaryotic and eukaryotic microorganisms in the ocean, and thereby influence the biogeochemical cycling of major elements. While the impact of Fe limitation on phototrophic microorganisms (phytoplankton) has been extensively investigated, the links between micronutrients and heterotrophic prokaryotes remains thus far poorly studied. This thesis investigates the metabolic potential of taxonomically diverse marine microbes to acquire trace metals using a metagenomics approach and thereby provides insights into the contribution of prokaryotic taxa to the cycling of minor and major elements on temporal and spatial scales in the Southern Ocean.The objective of Chapter 1 is to study the strategy of microbes to acquire different chemical forms of Fe under seasonally changing organic carbon requirements. Based on samples obtained by a remote autonomous sampler, high-resolution seasonal metagenomics observations from the naturally Fe-fertilized region off Kerguelen Island are presented. The results show pronounced, but distinct seasonal patterns in the abundance of genes implicated in the transport of different forms of Fe and organic substrates, of siderophore biosynthesis and carbohydrate active enzymes. The seasonal dynamics suggest a temporal decoupling in the prokaryotic requirements of Fe and organic carbon during the spring phytoplankton bloom and a concerted access to these resources after the summer bloom. Taxonomic assignments revealed differences in the prokaryotic groups harboring genes of a given Fe-related category and pronounced seasonal successions were observed. The ecological strategies provide insights on how Fe could shape microbial community composition with potential implications on organic matter transformations in the Southern Ocean.The question of how the availability of trace metals selects for prokaryotic taxa and the potential feedbacks of microbial processes on the trace metal distribution in the ocean is addressed in Chapter 2. The potential reciprocal links between diverse prokaryotic taxa and Fe, Mn, Cu, Ni as well as apparent oxygen utilization (AOU) across 12 well-defined water masses in the Southern Indian Ocean (SWINGS- South West Indian Ocean GEOTRACES GS02 Section cruise) was investigated. Partial Least Square Regression (PLSR) analysis reveals that the water masses are associated with particular latent vectors that are a combination of the spatial distribution of prokaryotic taxa, trace elements and AOU. This approach provides novel insights on the potential interactions between prokaryotic taxa and trace metals in relation to organic matter remineralization in distinct water masses of the ocean.In Chapter 3, genes related to trace-metal transport by the prokaryotic communities inhabiting the distinct water masses sampled during the SWINGS cruise were investigated. These results cover 42 samples collected from surface to depth at 13 stations in the Subtropical, Subantarctic, Polar Frontal and Antarctic zones. The abundance of genes associated with the transport of Fe, Mn, Ni and Cu in the free-living (<0.8 µm) and particle-attached fractions (>0.8 µm) were determined both at the community level as well as in metagenome assembled genomes (MAGs). The results reveal differences in the normalized abundance of these genes (GPM) depending on geographic location in surface waters, and among water masses at depth. These latter were particularly pronounced for transporters of siderophores, Mn, Ni and Cu. Each water mass contained a distinct set of abundant MAGs and these were found to differ in their repertoires of trace metal transporters. These observations suggest that the trace metals considered here could play distinct roles in microbial metabolism in different water masses, with potential feedbacks on their cycling in the ocean
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Dumaz, Patrick. Contribution à la modélisation des effets visqueux dans les métaux: Applications à l'alliage 800. Grenoble: A.N.R.T, Université Pierre Mendes France (Grenoble II), 1985.
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Champoux, Louise. Exposition au mercure et ses effets chez le plongeon huard (Gavia immer) sur les lacs du Québec. Sainte-Foy, Qué: Service canadien de la faune, 2006.
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Symposium international sur les ions métalliques en biologie et en médecine (06 2000 San Juan, Porto Rico). Metal ions in biology and medicine: Proceedings of the sixth International symposium on metal ions in biology and medicine, held in San Juan, Puerto Rico, USA, on May 7-10, 2000 = Les ions métalliques en biologie et en médecine : sixième Symposium international sur les ions métalliques en biologie et en médecine, San-Juan, Porto-Rico, États-Unis, 7-10 mai 2000. Montrouge: J. Libbey Eurotext, 2000.
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4
author, Holah J. T., red. The effect of wiping and spray wash temperature on bacterial retention of abraded domestic sink surface. Toronto, Ont: Nickel Development Institute, 1993.
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5
International, ASM, red. Relational analysis: Guidelines for estimating the high- and low-temperature properties of metals. Materials Park, Ohio: ASM International, 2011.
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6
N, Alekseenko N., red. Radiation damage of nuclear power plant pressure vessel steels. La Grange Park, Ill., USA: American Nuclear Society, 1997.
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7
Harlal, Choudhury, Cary R, World Health Organization, International Labour Organisation, United Nations Environment Programme, International Program on Chemical Safety. i Inter-Organization Programme for the Sound Management of Chemicals., red. Barium and barium compounds. Geneva: World Health Organization, 2001.
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V, Ellis Harry, i McCann Joy L, red. Toxicology and biological monitoring of metals in humans: Including feasibility and need. Chelsea, Mich: Lewis Publishers, 1986.
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Melber, C. Palladium. Geneva: World Health Organization, 2002.
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Khassanova, Lylia, Ivan Maymard, Zilara Khassanova, Philippe Collery i Jean-Claude Étienne. Metal Ions in Biology and Medicine: Volume 7. Libbey Eurotext Limited, John, 1990.
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BURGAIN, Jennifer, i Marie-Bénédicte ROMOND. "Bactéries lactiques et bifidobactéries". W Mise en oeuvre des procédés enzymatiques et des bactéries lactiques dans les industries agro-alimentaires, 181–87. ISTE Group, 2023. http://dx.doi.org/10.51926/iste.9137.ch7.
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Les bactéries lactiques et les bifidobactéries sont utilisées dans la fabrication de produits fermentés. Lorsqu'elles sont présentes en quantité suffisante et que leur vitalité est préservée, elles peuvent avoir des effets bénéfiques potentiels sur la santé de l'hôte. Ce chapitre analyse l'évolution historique des probiotiques et, plus précisément, des prébiotiques. Il aborde les questions qui jalonnent les avancées en bactériologie depuis Louis Pasteur et pose les bases de la réflexion réglementaire européenne.
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BURGAIN, Jennifer, i Marie-Bénédicte ROMOND. "Lactobacilles : sélection des souches et effets probiotiques". W Mise en oeuvre des procédés enzymatiques et des bactéries lactiques dans les industries agro-alimentaires, 227–39. ISTE Group, 2023. http://dx.doi.org/10.51926/iste.9137.ch9.
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Les lactobacilles sont des bactéries lactiques présentes dans les aliments fermentés tels que le yaourt, le fromage, le pain ou la choucroute. Ils jouent un rôle clé au niveau du microbiote intestinal. Lacticaseibacillus rhamnosus GG est considérée comme une bactérie probiotique modèle et fait l'objet de nombreuses études cliniques visant à démontrer ses effets bénéfiques sur la santé. Dans ce chapitre, le potentiel probiotique de certaines espèces récemment reclassées (Lacticaseibacillus casei, Lacticaseibacillus paracasei, Lacticaseibacillus rhamnosus, Lactobacillus acidophilus) est mis en évidence et discuté.
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VILLENEUVE, Jacques, Stéphanie MULLER, Antoine BEYLOT, Faustine LAURENT i Frédéric LAI. "L’empreinte environnementale des ressources minérales". W L’économie des ressources minérales et le défi de la soutenabilité 1, 145–69. ISTE Group, 2021. http://dx.doi.org/10.51926/iste.9024.ch6.
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Notre consommation de ressources minérales et de métaux induit des effets environnementaux dont la mesure implique la connaissance de la production de ces ressources dans le monde et des impacts environnementaux de cette production. La mesure de l’empreinte environnementale de notre consommation est accessible via les tables d’entrées-sorties multirégionales dont les intérêts et les limites sont discutés dans cette étude.
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Prud'homme, Pamela, Simon Aubin i Pierre-Luc Cloutier. Revue de littérature sur la composition des poussières de bois brûlé. IRSST, grudzień 2024. https://doi.org/10.70010/wmat6356.
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Résumé L’année 2023 a été marquante pour l’industrie forestière québécoise alors que plus de 1 000 000 d’hectares de forêt ont été ravagés par les feux. La transformation du bois brûlé soulève de nombreuses questions sur la santé et la sécurité des travailleurs, notamment sur la manière de mesurer l’exposition aux poussières de bois brûlé dans les scieries. Sachant qu’il n’existe pas de méthode permettant d’évaluer spécifiquement l’exposition professionnelle aux poussières de bois brûlé, l’objectif principal de ce rapport consiste à effectuer une revue de la littérature pour déterminer leur composition. Selon cette composition, des méthodes de prélèvement et d’analyse pourraient être suggérées, puis des effets potentiels sur la santé des travailleurs pourraient être identifiés. Pour la revue de la littérature, aucun article traitant spécifiquement des poussières de bois brûlé (issu de feux de forêt) n’a été repéré. Toutefois, 13 articles sur la composition du bois torréfié et des biochars ont été retenus pour analyse, car ces matériaux se rapprochent du bois brûlé manipulé par les travailleurs. Le principal constat de ces articles est que la composition du bois torréfié et des biochars dépend des conditions de combustion (température, durée, présence d’oxygène, etc.) et du substrat de bois (espèce d’arbre et conditions de croissance). L’hétérogénéité de ces conditions lors des feux de forêt fait que la composition du bois brûlé manipulé par les travailleurs est très variable. Il s’agit d’une limite importante pour tirer des conclusions bien définies. Plusieurs groupes de composés ont été identifiés et mesurés dans le bois torréfié et les biochars, notamment la composition chimique élémentaire, les oxydes, les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP), le pourcentage de matière organique et les métaux. Dans les biochars de bois, qui sont du charbon de bois, les résultats ont révélé qu’ils sont principalement composés de carbone issu de la dégradation de la cellulose, de l’hémicellulose et de la lignine. Les oxydes et les métaux sont présents dans le bois brûlé, mais dominent dans les cendres. Les HAP sont présents en faible quantité ou sous les limites de détection des méthodes utilisées. D’après ces résultats, il est suggéré de poursuivre la surveillance habituelle de la qualité de l’air dans les scieries. De plus, en présence de bois brûlé, les mesures suivantes sont recommandées : Fraction inhalable des particules (mesure gravimétrique non spécifique); HAP; Métaux. Aucun seuil d’exposition acceptable ne peut être proposé pour les poussières de bois brûlé en raison du manque de données sur les effets sur la santé. De plus, aucun indicateur spécifique ne peut être recommandé pour le suivi de l’exposition aux poussières de bois brûlé étant donné la variabilité de la composition de la poussière. La revue de la littérature n’a pas apporté d’information précise ni robuste concernant les effets potentiels supplémentaires des poussières de bois brûlé sur la santé comparativement aux poussières de bois sain. Selon les sources consultées, les poussières de bois brûlé sont peu documentées et non réglementées (incluant le Règlement sur la santé et la sécurité du travail). La documentation et la caractérisation plus détaillées des expositions à ces poussières par des évaluations environnementales en hygiène du travail permettraient d’identifier des contaminants dont les effets sur la santé mériteraient des actions préventives spécifiques afin de prévenir des atteintes néfastes sur la santé chez les travailleurs exposés aux poussières de bois brûlé.