Gotowa bibliografia na temat „Apprentissage statistique profond”

Ces travaux de recherche visent à développer des méthodes d’apprentissage automatique pour l’analyse de l’électroencéphalogramme (EEG) continu. L’EEG continu est une modalité avantageuse pour l’évaluation fonctionnelle des états cérébraux en réanimation ou pour d’autres applications. Cependant son utilisation aujourd’hui demeure plus restreinte qu’elle ne pourrait l’être, car dans la plupart des cas l’interprétation est effectuée visuellement par des spécialistes.Les sous-parties de ce travail s’articulent autour de l’évaluation pronostique du coma post-anoxique, choisie comme application pilote. Un petit nombre d’enregistrement longue durée a été réalisé, et des enregistrements existants ont été récupérés au CHU Grenoble.Nous commençons par valider l’efficacité des réseaux de neurones profonds pour l’analyse EEG d’échantillons bruts. Nous choisissons à cet effet de travailler sur la classification de stades de sommeil. Nous utilisons un réseau de neurones convolutionnel adapté pour l’EEG que nous entrainons et évaluons sur le jeu de données SHHS (Sleep Heart Health Study). Cela constitue le premier system neuronal à cette échelle (5000 patients) pour l’analyse du sommeil. Les performances de classification atteignent ou dépassent l’état de l’art.En utilisation réelle, pour la plupart des applications cliniques le défi principal est le manque d’annotations adéquates sur les patterns EEG ou sur de court segments de données (et la difficulté d’en établir). Les annotations disponibles sont généralement haut niveau (par exemple, le devenir clinique) est sont donc peu nombreuses. Nous recherchons comment apprendre des représentations compactes de séquences EEG de façon non-supervisée/semi-supervisée. Le domaine de l’apprentissage non supervisé est encore jeune. Pour se comparer aux travaux existants nous commençons avec des données de type image, et investiguons l’utilisation de réseaux adversaires génératifs (GANs) pour l’apprentissage adversaire non-supervisé de représentations. La qualité et la stabilité de différentes variantes sont évaluées. Nous appliquons ensuite un GAN de Wasserstein avec pénalité sur les gradients à la génération de séquences EEG. Le système, entrainé sur des séquences mono-piste de patients en coma post anoxique, est capable de générer des séquences réalistes. Nous développons et discutons aussi des idées originales pour l’apprentissage de représentations en alignant des distributions dans l’espace de sortie du réseau représentatif.Pour finir, les signaux EEG multipistes ont des spécificités qu’il est souhaitable de prendre en compte dans les architectures de caractérisation. Chaque échantillon d’EEG est un mélange instantané des activités d’un certain nombre de sources. Partant de ce constat nous proposons un système d’analyse composé d’un sous-système d’analyse spatiale suivi d’un sous-système d’analyse temporelle. Le sous-système d’analyse spatiale est une extension de méthodes de séparation de sources construite à l’aide de couches neuronales avec des poids adaptatifs pour la recombinaison des pistes, c’est à dire que ces poids ne sont pas appris mais dépendent de caractéristiques du signal d’entrée. Nous montrons que cette architecture peut apprendre à réaliser une analyse en composantes indépendantes, si elle est entrainée sur une mesure de non-gaussianité. Pour l’analyse temporelle, des réseaux convolutionnels classiques utilisés séparément sur les pistes recombinées peuvent être utilisés
The objective of this research is to explore and develop machine learning methods for the analysis of continuous electroencephalogram (EEG). Continuous EEG is an interesting modality for functional evaluation of cerebral state in the intensive care unit and beyond. Today its clinical use remains more limited that it could be because interpretation is still mostly performed visually by trained experts. In this work we develop automated analysis tools based on deep neural models.The subparts of this work hinge around post-anoxic coma prognostication, chosen as pilot application. A small number of long-duration records were performed and available existing data was gathered from CHU Grenoble. Different components of a semi-supervised architecture that addresses the application are imagined, developed, and validated on surrogate tasks.First, we validate the effectiveness of deep neural networks for EEG analysis from raw samples. For this we choose the supervised task of sleep stage classification from single-channel EEG. We use a convolutional neural network adapted for EEG and we train and evaluate the system on the SHHS (Sleep Heart Health Study) dataset. This constitutes the first neural sleep scoring system at this scale (5000 patients). Classification performance reaches or surpasses the state of the art.In real use for most clinical applications, the main challenge is the lack of (and difficulty of establishing) suitable annotations on patterns or short EEG segments. Available annotations are high-level (for example, clinical outcome) and therefore they are few. We search how to learn compact EEG representations in an unsupervised/semi-supervised manner. The field of unsupervised learning using deep neural networks is still young. To compare to existing work we start with image data and investigate the use of generative adversarial networks (GANs) for unsupervised adversarial representation learning. The quality and stability of different variants are evaluated. We then apply Gradient-penalized Wasserstein GANs on EEG sequences generation. The system is trained on single channel sequences from post-anoxic coma patients and is able to generate realistic synthetic sequences. We also explore and discuss original ideas for learning representations through matching distributions in the output space of representative networks.Finally, multichannel EEG signals have specificities that should be accounted for in characterization architectures. Each EEG sample is an instantaneous mixture of the activities of a number of sources. Based on this statement we propose an analysis system made of a spatial analysis subsystem followed by a temporal analysis subsystem. The spatial analysis subsystem is an extension of source separation methods built with a neural architecture with adaptive recombination weights, i.e. weights that are not learned but depend on features of the input. We show that this architecture learns to perform Independent Component Analysis if it is trained on a measure of non-gaussianity. For temporal analysis, standard (shared) convolutional neural networks applied on separate recomposed channels can be used

La vision par ordinateur est une branche de l'intelligence artificielle dont le but est de permettre à une machine d'analyser, de traiter et de comprendre le contenu d'images numériques. La compréhension de scène en particulier est un enjeu majeur en vision par ordinateur. Elle passe par une caractérisation à la fois sémantique et structurelle de l'image, permettant d'une part d'en décrire le contenu et, d'autre part, d'en comprendre la géométrie. Cependant tandis que l'espace réel est de nature tridimensionnelle, l'image qui le représente, elle, est bidimensionnelle. Une partie de l'information 3D est donc perdue lors du processus de formation de l'image et il est d'autant plus complexe de décrire la géométrie d'une scène à partir d'images 2D de celle-ci.Il existe plusieurs manières de retrouver l'information de profondeur perdue lors de la formation de l'image. Dans cette thèse nous nous intéressons à l’estimation d'une carte de profondeur étant donné une seule image de la scène. Dans ce cas, l'information de profondeur correspond, pour chaque pixel, à la distance entre la caméra et l'objet représenté en ce pixel. L'estimation automatique d'une carte de distances de la scène à partir d'une image est en effet une brique algorithmique critique dans de très nombreux domaines, en particulier celui des véhicules autonomes (détection d’obstacles, aide à la navigation).Bien que le problème de l'estimation de profondeur à partir d'une seule image soit un problème difficile et intrinsèquement mal posé, nous savons que l'Homme peut apprécier les distances avec un seul œil. Cette capacité n'est pas innée mais acquise et elle est possible en grande partie grâce à l'identification d'indices reflétant la connaissance a priori des objets qui nous entourent. Par ailleurs, nous savons que des algorithmes d'apprentissage peuvent extraire ces indices directement depuis des images. Nous nous intéressons en particulier aux méthodes d’apprentissage statistique basées sur des réseaux de neurones profond qui ont récemment permis des percées majeures dans de nombreux domaines et nous étudions le cas de l'estimation de profondeur monoculaire
Computer vision is a branch of artificial intelligence whose purpose is to enable a machine to analyze, process and understand the content of digital images. Scene understanding in particular is a major issue in computer vision. It goes through a semantic and structural characterization of the image, on one hand to describe its content and, on the other hand, to understand its geometry. However, while the real space is three-dimensional, the image representing it is two-dimensional. Part of the 3D information is thus lost during the process of image formation and it is therefore non trivial to describe the geometry of a scene from 2D images of it.There are several ways to retrieve the depth information lost in the image. In this thesis we are interested in estimating a depth map given a single image of the scene. In this case, the depth information corresponds, for each pixel, to the distance between the camera and the object represented in this pixel. The automatic estimation of a distance map of the scene from an image is indeed a critical algorithmic brick in a very large number of domains, in particular that of autonomous vehicles (obstacle detection, navigation aids).Although the problem of estimating depth from a single image is a difficult and inherently ill-posed problem, we know that humans can appreciate distances with one eye. This capacity is not innate but acquired and made possible mostly thanks to the identification of indices reflecting the prior knowledge of the surrounding objects. Moreover, we know that learning algorithms can extract these clues directly from images. We are particularly interested in statistical learning methods based on deep neural networks that have recently led to major breakthroughs in many fields and we are studying the case of the monocular depth estimation

Cette thèse présente de nouvelles méthodes d’apprentissage structuré et parcimonieux sur les graphes, ce qui permet de résoudre une large variété de problèmes d’imagerie cérébrale, ainsi que d’autres problèmes en haute dimension avec peu d’échantillon. La première partie de cette thèse propose des relaxation convexe de pénalité discrète et combinatoriale impliquant de la parcimonie et bounded total variation d’un graphe, ainsi que la bounded `2. Ceux-ci sont dévelopé dansle but d’apprendre un modèle linéaire interprétable et on démontre son efficacacité sur des données d’imageries cérébrales ainsi que sur les problèmes de reconstructions parcimonieux.Les sections successives de cette thèse traite de la découverte de structure sur des modèles graphiques “undirected” construit à partir de peu de données. En particulier, on se concentre sur des hypothèses de parcimonie et autres hypothèses de structures dans les modèles graphiques gaussiens. Deux contributions s’en dégagent. On construit une approche pour identifier les différentes entre des modèles graphiques gaussiens (GGMs) qui partagent la même structure sous-jacente. On dérive la distribution de différences de paramètres sous une pénalité jointe quand la différence des paramètres est parcimonieuse. On montre ensuite comment cette approche peut être utilisée pour obtenir des intervalles de confiances sur les différences prises par le GGM sur les arêtes. De là, on introduit un nouvel algorithme d’apprentissage lié au problème de découverte de structure sur les modèles graphiques non dirigées des échantillons observés. On démontre que les réseaux de neurones peuvent être utilisés pour apprendre des estimateurs efficacaces de ce problèmes. On montre empiriquement que ces méthodes sont une alternatives flexible et performantes par rapport aux techniques existantes
This dissertation presents novel structured sparse learning methods on graphs that address commonly found problems in the analysis of neuroimaging data as well as other high dimensional data with few samples. The first part of the thesis proposes convex relaxations of discrete and combinatorial penalties involving sparsity and bounded total variation on a graph as well as bounded `2 norm. These are developed with the aim of learning an interpretable predictive linear model and we demonstrate their effectiveness on neuroimaging data as well as a sparse image recovery problem.The subsequent parts of the thesis considers structure discovery of undirected graphical models from few observational data. In particular we focus on invoking sparsity and other structured assumptions in Gaussian Graphical Models (GGMs). To this end we make two contributions. We show an approach to identify differences in Gaussian Graphical Models (GGMs) known to have similar structure. We derive the distribution of parameter differences under a joint penalty when parameters are known to be sparse in the difference. We then show how this approach can be used to obtain confidence intervals on edge differences in GGMs. We then introduce a novel learning based approach to the problem structure discovery of undirected graphical models from observational data. We demonstrate how neural networks can be used to learn effective estimators for this problem. This is empirically shown to be flexible and efficient alternatives to existing techniques

Les données temporelles constituent une partie importante des données digitales. Prévoir leurs prochaines valeurs est une tâche importante et difficile. Les méthodes statistiques standard sont fondées sur des modèles linéaires souvent limitées aux données de faible dimension. Ici, nous utilisons plutôt des méthodes d'apprentissage profond capables de traiter des données structurées en haute dimension. Dans cette thèse, nous nous intéressons aux modèles à variables latentes. Contrairement aux modèles auto-régressifs qui utilisent directement des données passées pour effectuer des prédictions, les modèles latents infèrent des représentations vectorielles qui sont ensuite prédites. Nous proposons d'abord un modèle latent structuré pour la prévision de données spatio-temporelles. Des variables latentes sont inférés à partir d'un ensemble de points dans l'espace où des données sont collectées (météo, trafic). Ensuite, la structure spatiale est utilisée dans la fonction dynamique. Le modèle est également capable de découvrir des corrélations entre des séries sans information spatiale préalable. Ensuite, nous nous intéressons à la prédiction des distributions de données. Nous proposons un modèle qui génère des variables latentes utilisées pour conditionner un modèle génératif. Les données textuelles sont utilisées pour évaluer le modèle sur la modélisation diachronique du langage. Enfin, nous proposons un modèle de prédiction stochastique. Il utilise les premières valeurs des séquences pour générer plusieurs futurs possibles. Ici, le modèle génératif n'est pas conditionné à une époque absolue, mais à une séquence. Le modèle est appliqué à la prédiction vidéo stochastique
Temporal data constitute a large part of data collected digitally. Predicting their next values is an important and challenging task in domains such as climatology, optimal control, or natural language processing. Standard statistical methods are based on linear models and are often limited to low dimensional data. We instead use deep learning methods capable of handling high dimensional structured data and leverage large quantities of examples. In this thesis, we are interested in latent variable models. Contrary to autoregressive models that directly use past data to perform prediction, latent models infer low dimensional vectorial representations of data on which prediction is performed. Latent vectorial spaces allow us to learn dynamic models that are able to generate high-dimensional and structured data. First, we propose a structured latent model for spatio-temporal data forecasting. Given a set of spatial locations where data such as weather or traffic are collected, we infer latent variables for each location and use spatial structure in the dynamic function. The model is also able to discover correlations between series without prior spatial information. Next, we focus on predicting data distributions, rather than point estimates. We propose a model that generates latent variables used to condition a generative model. Text data are used to evaluate the model on diachronic language modeling. Finally, we propose a stochastic prediction model. It uses the first values of sequences to generate several possible futures. Here, the generative model is not conditioned to an absolute epoch, but to a sequence. The model is applied to stochastic video prediction

La structure d'un réseau de neurones détermine dans une large mesure son coût d'entraînement et d'utilisation, ainsi que sa capacité à apprendre. Ces deux aspects sont habituellement en compétition : plus un réseau de neurones est grand, mieux il remplira la tâche qui lui a été assignée, mais plus son entraînement nécessitera des ressources en mémoire et en temps de calcul. L'automatisation de la recherche des structures de réseaux efficaces - de taille raisonnable, mais performantes dans l'accomplissement de la tâche - est donc une question très étudiée dans ce domaine. Dans ce contexte, des réseaux de neurones aux structures variées doivent être entraînés, ce qui nécessite un nouveau jeu d'hyperparamètres d'entraînement à chaque nouvelle structure testée. L'objectif de la thèse est de traiter différents aspects de ce problème. La première contribution est une méthode d'entraînement de réseau qui fonctionne dans un vaste périmètre de structures de réseaux et de tâches à accomplir, sans nécessité de régler le taux d'apprentissage. La deuxième contribution est une technique d'entraînement et d'élagage de réseau, conçue pour être insensible à la largeur initiale de celui-ci. La dernière contribution est principalement un théorème qui permet de traduire une pénalité d'entraînement empirique en a priori bayésien, théoriquement bien fondé. Ce travail résulte d'une recherche des propriétés que doivent théoriquement vérifier les algorithmes d'entraînement et d'élagage pour être valables sur un vaste ensemble de réseaux de neurones et d'objectifs
The structure of a neural network determines to a large extent its cost of training and use, as well as its ability to learn. These two aspects are usually in competition: the larger a neural network is, the better it will perform the task assigned to it, but the more it will require memory and computing time resources for training. Automating the search of efficient network structures -of reasonable size and performing well- is then a very studied question in this area. Within this context, neural networks with various structures are trained, which requires a new set of training hyperparameters for each new structure tested. The aim of the thesis is to address different aspects of this problem. The first contribution is a training method that operates within a large perimeter of network structures and tasks, without needing to adjust the learning rate. The second contribution is a network training and pruning technique, designed to be insensitive to the initial width of the network. The last contribution is mainly a theorem that makes possible to translate an empirical training penalty into a Bayesian prior, theoretically well founded. This work results from a search for properties that theoretically must be verified by training and pruning algorithms to be valid over a wide range of neural networks and objectives

Ce manuscrit de thèse résume trois ans de travaux sur l’utilisation des méthodes d’apprentissage statistique pour l’analyse automatique de signaux naturels. L’objectif principal est de présenter des outils efficaces et opérationnels pour l’analyse de signaux environnementaux, en vue de mieux connaitre et comprendre l’environnement considéré. On se concentre en particulier sur les tâches de détection et de classification automatique d’événements naturels.Dans cette thèse, deux outils basés sur l’apprentissage supervisé (Support Vector Machine et Random Forest) sont présentés pour (i) la classification automatique d’événements, et (ii) pour la détection et classification automatique d’événements. La robustesse des approches proposées résulte de l’espace des descripteurs dans lequel sont représentés les signaux. Les enregistrements y sont en effet décrits dans plusieurs espaces: temporel, fréquentiel et quéfrentiel. Une comparaison avec des descripteurs issus de réseaux de neurones convolutionnels (Deep Learning) est également proposée, et favorise les descripteurs issus de la physique au détriment des approches basées sur l’apprentissage profond.Les outils proposés au cours de cette thèse sont testés et validés sur des enregistrements in situ de deux environnements différents : (i) milieux marins et (ii) zones volcaniques. La première application s’intéresse aux signaux acoustiques pour la surveillance des zones sous-marines côtières : les enregistrements continus sont automatiquement analysés pour détecter et classifier les différents sons de poissons. Une périodicité quotidienne est mise en évidence. La seconde application vise la surveillance volcanique : l’architecture proposée classifie automatiquement les événements sismiques en plusieurs catégories, associées à diverses activités du volcan. L’étude est menée sur 6 ans de données volcano-sismiques enregistrées sur le volcan Ubinas (Pérou). L’analyse automatique a en particulier permis d’identifier des erreurs de classification faites dans l’analyse manuelle originale. L’architecture pour la classification automatique d’événements volcano-sismiques a également été déployée et testée en observatoire en Indonésie pour la surveillance du volcan Mérapi. Les outils développés au cours de cette thèse sont rassemblés dans le module Architecture d’Analyse Automatique (AAA), disponible en libre accès
This manuscript summarizes a three years work addressing the use of machine learning for the automatic analysis of natural signals. The main goal of this PhD is to produce efficient and operative frameworks for the analysis of environmental signals, in order to gather knowledge and better understand the considered environment. Particularly, we focus on the automatic tasks of detection and classification of natural events.This thesis proposes two tools based on supervised machine learning (Support Vector Machine, Random Forest) for (i) the automatic classification of events and (ii) the automatic detection and classification of events. The success of the proposed approaches lies in the feature space used to represent the signals. This relies on a detailed description of the raw acquisitions in various domains: temporal, spectral and cepstral. A comparison with features extracted using convolutional neural networks (deep learning) is also made, and favours the physical features to the use of deep learning methods to represent transient signals.The proposed tools are tested and validated on real world acquisitions from different environments: (i) underwater and (ii) volcanic areas. The first application considered in this thesis is devoted to the monitoring of coastal underwater areas using acoustic signals: continuous recordings are analysed to automatically detect and classify fish sounds. A day to day pattern in the fish behaviour is revealed. The second application targets volcanoes monitoring: the proposed system classifies seismic events into categories, which can be associated to different phases of the internal activity of volcanoes. The study is conducted on six years of volcano-seismic data recorded on Ubinas volcano (Peru). In particular, the outcomes of the proposed automatic classification system helped in the discovery of misclassifications in the manual annotation of the recordings. In addition, the proposed automatic classification framework of volcano-seismic signals has been deployed and tested in Indonesia for the monitoring of Mount Merapi. The software implementation of the framework developed in this thesis has been collected in the Automatic Analysis Architecture (AAA) package and is freely available

La plupart des méthodes statistiques ne sont pas nativement conçues pour fonctionner sur des données incomplètes. L’étude des données incomplètes n’est pas nouvelle et de nombreux résultats ont été établis pour pallier l’incomplétude en amont de l’étude statistique. D’autre part, les méthodes de deep learning sont en général appliquées à des données non structurées de type image, texte ou audio, mais peu de travaux s’intéressent au développement de ce type d’approche sur des données tabulaires, et encore moins sur des données incomplètes. Cette thèse se concentre sur l’utilisation d’algorithmes de machine learning appliqués à des données tabulaires, en présence d’incomplétude et dans un cadre assurantiel. Au travers des contributions regroupées dans ce document, nous proposons différentes façons de modéliser des phénomènes complexes en présence de schémas d’incomplétude. Nous montrons que les approches proposées donnent des résultats de meilleure qualité que l’état de l’art
Most statistical methods are not designed to directly work with incomplete data. The study of data incompleteness is not new and strong methods have been established to handle it prior to a statistical analysis. On the other hand, deep learning literature mainly works with unstructured data such as images, text or raw audio, but very few has been done on tabular data. Hence, modern machine learning literature tackling data incompleteness on tabular data is scarce. This thesis focuses on the use of machine learning models applied to incomplete tabular data, in an insurance context. We propose through our contributions some ways to model complex phenomena in presence of incompleteness schemes, and show that our approaches outperform the state-of-the-art models

Nombre des succès de l’apprentissage profond reposent sur la disponibilité de données massivement collectées et annotées, exploités par des algorithmes supervisés. Ces annotations, cependant, peuvent s’avérer difficiles à obtenir. La conception de méthodes peu gourmandes en annotations est ainsi un enjeu important, abordé dans des approches semi-supervisées ou faiblement supervisées. Par ailleurs ont été récemment introduit les réseaux génératifs profonds, capable de manipuler des distributions complexes et à l’origine d’avancées majeures, en édition d’image et en adaptation de domaine par exemple. Dans cette thèse, nous explorons comment ces outils nouveaux peuvent être exploités pour réduire les besoins en annotations. En premier lieu, nous abordons la tâche de prédiction stochastique. Il s’agit de concevoir des systèmes de prédiction structurée tenant compte de la diversité des réponses possibles. Nous proposons dans ce cadre deux modèles, le premier pour des données multi-vues avec vues manquantes, et le second pour la prédiction de futurs possibles d'une séquence vidéo. Ensuite, nous étudions la décomposition en deux facteurs latents indépendants dans le cas où un seul facteur est annoté. Nous proposons des modèles qui visent à retrouver des représentations latentes sémantiquement cohérentes de ces facteurs explicatifs. Le premier modèle est appliqué en génération de données de capture de mouvements, le second, sur des données multi-vues. Enfin, nous nous attaquons au problème, crucial en vision par ordinateur, de la segmentation d’image. Nous proposons un modèle, inspiré des idées développées dans cette thèse, de segmentation d’objet entièrement non supervisé
Many successes of deep learning rely on the availability of massive annotated datasets that can be exploited by supervised algorithms. Obtaining those labels at a large scale, however, can be difficult, or even impossible in many situations. Designing methods that are less dependent on annotations is therefore a major research topic, and many semi-supervised and weakly supervised methods have been proposed. Meanwhile, the recent introduction of deep generative networks provided deep learning methods with the ability to manipulate complex distributions, allowing for breakthroughs in tasks such as image edition and domain adaptation. In this thesis, we explore how these new tools can be useful to further alleviate the need for annotations. Firstly, we tackle the task of performing stochastic predictions. It consists in designing systems for structured prediction that take into account the variability in possible outputs. We propose, in this context, two models. The first one performs predictions on multi-view data with missing views, and the second one predicts possible futures of a video sequence. Then, we study adversarial methods to learn a factorized latent space, in a setting with two explanatory factors but only one of them is annotated. We propose models that aim to uncover semantically consistent latent representations for those factors. One model is applied to the conditional generation of motion capture data, and another one to multi-view data. Finally, we focus on the task of image segmentation, which is of crucial importance in computer vision. Building on previously explored ideas, we propose a model for object segmentation that is entirely unsupervised

Cette thèse s’inscrit dans le domaine émergent de l’apprentissage automatique scientifique, qui étudie l’application de l’apprentissage automatique au calcul scientifique. Plus précisément, nous nous intéressons à l’utilisation de l’apprentissage profond pour accélérer des simulations numériques.Pour atteindre cet objectif, nous nous concentrons sur l’approximation de certaines parties des logiciels de simulation basés sur des Equations Différentielles Partielles (EDP) par un réseau de neurones. La méthodologie proposée s'appuie sur la construction d’un ensemble de données, la sélection et l'entraînement d’un réseau de neurones et son intégration dans le logiciel original, donnant lieu à une simulation numérique hybride. Malgré la simplicité apparente de cette approche, le contexte des simulations numériques implique des difficultés spécifiques. Puisque nous visons à accélérer des simulations, le premier enjeu est de trouver un compromis entre la précision des réseaux de neurones et leur temps d’exécution. En effet, l’amélioration de la première implique souvent la dégradation du second. L’absence de garantie mathématique sur le contrôle de la précision numérique souhaitée inhérent à la conception du réseau de neurones par apprentissage statistique constitue le second enjeu. Ainsi nous souhaiterions maitriser la fiabilité des prédictions issues de notre logiciel de simulation hybride. Afin de satisfaire ces enjeux, nous étudions en détail chaque étape de la méthodologie d’apprentissage profond. Ce faisant, nous mettons en évidence certaines similitudes entre l'apprentissage automatique et la simulation numérique, nous permettant de présenter des contributions ayant un impact sur chacun de ces domaines.Nous identifions les principales étapes de la méthodologie d’apprentissage profond comme étant la constitution d’un ensemble de données d’entraînement, le choix des hyperparamètres d’un réseau de neurones et son entraînement. Pour la première étape, nous tirons parti de la possibilité d’échantillonner les données d’entraînement à l'aide du logiciel de simulation initial pour caractériser une distribution d’entraînement plus efficace basée sur la variation locale de la fonction à approcher. Nous généralisons cette observation pour permettre son application à des problèmes variés d’apprentissage automatique en construisant une méthodologie de pondération des données appelée ”Variance Based Sample Weighting”. Dans un deuxième temps, nous proposons l’usage de l’analyse de sensibilité, une approche largement utilisée en calcul scientifique, pour l’optimisation des hyperparamètres des réseaux de neurones. Cette approche repose sur l’évaluation qualitative de l’effet des hyperparamètres sur les performances d’un réseau de neurones à l'aide du critère d'indépendance de Hilbert-Schmidt. Les adaptations au contexte de l’optimisation des hyperparamètres conduisent à une méthodologie interprétable permettant de construire des réseaux de neurones à la fois performants et précis. Pour la troisième étape, nous définissons formellement une analogie entre la résolution stochastique d’EDPs et le processus d’optimisation en jeu lors de l'entrainement d’un réseau de neurones. Cette analogie permet d’obtenir un cadre pour l’entraînement des réseaux de neurones basé sur la théorie des EDPs, qui ouvre de nombreuses possibilités d’améliorations pour les algorithmes d’optimisation existants. Enfin, nous appliquons ces méthodologies à une simulation numérique de dynamique des fluides couplée à un code d’équilibre chimique multi-espèces. Celles-ci nous permettent d’atteindre une accélération d’un facteur 21 avec une dégradation de la précision contrôlée ou nulle par rapport à la p rédiction initiale
Recent innovations in mathematics, computer science, and engineering have enabled more and more sophisticated numerical simulations. However, some simulations remain computationally unaffordable, even for the most powerful supercomputers. Lately, machine learning has proven its ability to improve the state-of-the-art in many fields, notoriously computer vision, language understanding, or robotics. This thesis settles in the high-stakes emerging field of Scientific Machine Learning which studies the application of machine learning to scientific computing. More specifically, we consider the use of deep learning to accelerate numerical simulations.We focus on approximating some components of Partial Differential Equation (PDE) based simulation software by a neural network. This idea boils down to constructing a data set, selecting and training a neural network, and embedding it into the original code, resulting in a hybrid numerical simulation. Although this approach may seem trivial at first glance, the context of numerical simulations comes with several challenges. Since we aim at accelerating codes, the first challenge is to find a trade-off between neural networks’ accuracy and execution time. The second challenge stems from the data-driven process of the training, and more specifically, its lack of mathematical guarantees. Hence, we have to ensure that the hybrid simulation software still yields reliable predictions. To tackle these challenges, we thoroughly study each step of the deep learning methodology while considering the aforementioned constraints. By doing so, we emphasize interplays between numerical simulations and machine learning that can benefit each of these fields.We identify the main steps of the deep learning methodology as the construction of the training data set, the choice of the hyperparameters of the neural network, and its training. For the first step, we leverage the ability to sample training data with the original software to characterize a more efficient training distribution based on the local variation of the function to approximate. We generalize this approach to general machine learning problems by deriving a data weighting methodology called Variance Based Sample Weighting. For the second step, we introduce the use of sensitivity analysis, an approach widely used in scientific computing, to tackle neural network hyperparameter optimization. This approach is based on qualitatively assessing the effect of hyperparameters on the performances of a neural network using Hilbert-Schmidt Independence Criterion. We adapt it to the hyperparameter optimization context and build an interpretable methodology that yields competitive and cost-effective networks. For the third step, we formally define an analogy between the stochastic resolution of PDEs and the optimization process at play when training a neural network. This analogy leads to a PDE-based framework for training neural networks that opens up many possibilities for improving existing optimization algorithms. Finally, we apply these contributions to a computational fluid dynamics simulation coupled with a multi-species chemical equilibrium code. We demonstrate that we can achieve a time factor acceleration of 21 with controlled to no degradation from the initial prediction

Au cours de la dernière décennie, l'apprentissage profond a atteint un niveau de maturité suffisant pour devenir le choix privilégié pour résoudre les problèmes liés à l'apprentissage automatique ou pour aider les processus de prise de décision.En même temps, l'apprentissage profond n'a généralement pas la capacité de quantifier avec précision l'incertitude de ses prédictions, ce qui rend ces modèles moins adaptés aux applications critiques en matière de risque.Une solution possible pour résoudre ce problème est d'utiliser une formulation bayésienne ; cependant, bien que cette solution soit élégante, elle est analytiquement difficile à mettre en œuvre et nécessite des approximations. Malgré les énormes progrès réalisés au cours des dernières années, il reste encore beaucoup de chemin à parcourir pour rendre ces approches largement applicables. Dans cette thèse, nous adressons certains des défis de l'apprentissage profond bayésien moderne, en proposant et en étudiant des solutions pour améliorer la scalabilité et l'inférence de ces modèles.La première partie de la thèse est consacrée aux modèles profonds où l'inférence est effectuée en utilisant l'inférence variationnelle (VI).Plus précisément, nous étudions le rôle de l'initialisation des paramètres variationnels et nous montrons comment des stratégies d'initialisation prudentes peuvent permettre à l'inférence variationnelle de fournir de bonnes performances même dans des modèles à grande échelle.Dans cette partie de la thèse, nous étudions également l'effet de sur-régularisation de l'objectif variationnel sur les modèles sur-paramétrés.Pour résoudre ce problème, nous proposons une nouvelle paramétrisation basée sur la transformée de Walsh-Hadamard ; non seulement cela résout l'effet de sur-régularisation de l'objectif variationnel mais cela nous permet également de modéliser des postérités non factorisées tout en gardant la complexité temporelle et spatiale sous contrôle.La deuxième partie de la thèse est consacrée à une étude sur le rôle des prieurs.Bien qu'étant un élément essentiel de la règle de Bayes, il est généralement difficile de choisir de bonnes prieurs pour les modèles d'apprentissage profond.Pour cette raison, nous proposons deux stratégies différentes basées (i) sur l'interprétation fonctionnelle des réseaux de neurones et (ii) sur une procédure évolutive pour effectuer une sélection de modèle sur les hyper-paramètres antérieurs, semblable à la maximisation de la vraisemblance marginale.Pour conclure cette partie, nous analysons un autre type de modèle bayésien (processus Gaussien) et nous étudions l'effet de l'application d'un a priori sur tous les hyperparamètres de ces modèles, y compris les variables supplémentaires requises par les approximations du inducing points.Nous montrons également comment il est possible d'inférer des a posteriori de forme libre sur ces variables, qui, par convention, auraient été autrement estimées par point
Throughout the last decade, deep learning has reached a sufficient level of maturity to become the preferred choice to solve machine learning-related problems or to aid decision making processes.At the same time, deep learning is generally not equipped with the ability to accurately quantify the uncertainty of its predictions, thus making these models less suitable for risk-critical applications.A possible solution to address this problem is to employ a Bayesian formulation; however, while this offers an elegant treatment, it is analytically intractable and it requires approximations.Despite the huge advancements in the last few years, there is still a long way to make these approaches widely applicable.In this thesis, we address some of the challenges for modern Bayesian deep learning, by proposing and studying solutions to improve scalability and inference of these models.The first part of the thesis is dedicated to deep models where inference is carried out using variational inference (VI).Specifically, we study the role of initialization of the variational parameters and we show how careful initialization strategies can make VI deliver good performance even in large scale models.In this part of the thesis we also study the over-regularization effect of the variational objective on over-parametrized models.To tackle this problem, we propose an novel parameterization based on the Walsh-Hadamard transform; not only this solves the over-regularization effect of VI but it also allows us to model non-factorized posteriors while keeping time and space complexity under control.The second part of the thesis is dedicated to a study on the role of priors.While being an essential building block of Bayes' rule, picking good priors for deep learning models is generally hard.For this reason, we propose two different strategies based (i) on the functional interpretation of neural networks and (ii) on a scalable procedure to perform model selection on the prior hyper-parameters, akin to maximization of the marginal likelihood.To conclude this part, we analyze a different kind of Bayesian model (Gaussian process) and we study the effect of placing a prior on all the hyper-parameters of these models, including the additional variables required by the inducing-point approximations.We also show how it is possible to infer free-form posteriors on these variables, which conventionally would have been otherwise point-estimated

Ce chapitre détaille comment analyser une image numérique en vue d’obtenir des informations sur les données cachées par une méthode de stéganographie. Après une présentation des objectifs, plusieurs stratégies de détection sont ensuite détaillées, notamment les méthodes statistiques utilisant le rapport de vraisemblance, les méthodes par apprentissage reposant soit sur l’extraction de caractéristiques, soit sur l’utilisation de réseaux de neurones profonds.