Letteratura scientifica selezionata sul tema "Morphométrie des grains"

The nutritive potentials of raw Ceiba pentandra (Kapok) seed, an oil seed, as a substitute for conventional oil seeds in livestock feed stuff, is tested. Twenty four rabbits of mixed breeds (New Zealand White × Chinchilla) and of both sexes, with mean initial weight of 1.25±0.25 kg, were used to investigate the effect of kapok seed meal on gastro-intestinal tract morphometry and carcass yield of growing rabbits. The diet was compounded using 0% (control diet), 10, 20 and 30% sundried raw delinted, undecorticated kapok seed meal. Each dietary treatment has six replicates. The animals were assigned to the diets in a completely randomized design (CRD). The study lasted for nine weeks. Weekly body weight changes of each rabbit were measured while gastrointestinal tract measurements and carcass yield were determined after the sacrifice of four (4) rabbits from each treatment at the end of the study. Results showed that treatment means varied significantly (p<0.05) with respect to weight gain, slaughter, dressed and head weights of rabbits; while relative head weights and dressing percentage were not significantly different (p>0.05) among treatment means. The entire relative GIT, oesophagus and caecum weight were not significantly different (p>0.05), while the relative stomach, small intestine and colorectum weights varied significantly (p<0.05) among treatment means. The GIT length, oesophagus, stomach, small intestine, colorectum and caecum (%GIT length) did not differ (p>0.05) among treatment means. 33.3% mortality was recorded from treatment 4 (30%, KSM). It can be concluded from this study that raw KSM may be included in the diet of rabbits up to 20% but a higher level of inclusion could be detrimental. In addition, a prolonged feeding of or making raw KSM as basal diet is not recommended. Le potentiel nutritif de la graine brute de Ceiba pentandra (Kapok), une graine oléagineuse, en tant que substitut des graines oléagineuses conventionnelles dans l'alimentation du bétail, est testé. Vingt-quatre lapins de races mixtes (New Zealand White × Chinchilla) et des deux sexes, avec un poids initial moyen de 1,25 ± 0,25 kg, ont été utilisés pour étudier l'effet de la farine de graines de kapok sur la morphométrie du tractus gastro-intestinal et le rendement en carcasse de lapins en croissance. . Le régime a été composé en utilisant 0 % (régime témoin), 10, 20 et 30 % de farine de graines de kapok brutes séchées au soleil, non décortiquées. Chaque traitement diététique a six répétitions. Les animaux ont été assignés aux régimes dans une conception complètement randomisée (CCR). L'étude a duré neuf semaines. Les changements de poids corporel hebdomadaires de chaque lapin ont été mesurés tandis que les mesures du tractus gastro-intestinal et le rendement en carcasse ont été déterminés après le sacrifice de quatre (4) lapins de chaque traitement à la fin de l'étude. Les résultats ont montré que les moyennes de traitement variaient significativement (p<0,05) en ce qui concerne le gain de poids, l'abattage, l'habillage et le poids de la tête des lapins ; tandis que les poids relatifs des têtes et le pourcentage d'habillage n'étaient pas significativement différents (p>0,05) entre les moyennes de traitement. Les poids relatifs totaux de l'intestin grêle, de l'œsophage et du caecum n'étaient pas significativement différents (p>0,05), tandis que les poids relatifs de l'estomac, de l'intestin grêle et du côlon variaient significativement (p<0,05) entre les moyennes de traitement. La longueur GIT, l'œsophage, l'estomac, l'intestin grêle, le colorectum et le caecum (% longueur GIT) ne différaient pas (p> 0,05) entre les moyennes de traitement. Une mortalité de 33,3 % a été enregistrée à partir du traitement 4 (30 %, KSM). On peut conclure de cette étude que le KSM brut peut être inclus dans l'alimentation des lapins jusqu'à 20 % mais qu'un niveau d'inclusion plus élevé pourrait être préjudiciable. De plus, une alimentation prolongée ou la fabrication de KSM cru comme régime de base n'est pas recommandée.

L'objectif de cette étude est d'évaluer la variabilité morphométrique des fruits et de la population de Boscia senegalensis en fonction de la toposéquence (plateau, versant et bas-fond) dans la région du Ferlo, au nord du Sénégal. Quinze individus de l'espèce ont été choisis au hasard, cinq par niveau topographique. Des mesures ont été effectuées sur les paramètres dendrométriques (hauteur et diamètre du houppier) des individus et sur les descripteurs morphométriques des fruits (diamètres transversaux du fruit et de la graine et nombre de graines, longueur du pédoncule, masses du fruit, de l'épicarpe et de la pulpe visqueuse). L'analyse en composantes principales et l'analyse factorielle discriminante ont montré l'existence d'une variabilité morphométrique des fruits en fonction du niveau topographique, ce qui n'est pas le cas pour le nombre de graines par fruit. Aucune corrélation n'a été observée entre les deux types de descripteurs évalués (<20%). Par contre, les variables fruits, fortement corrélées avec les unités topographiques (>50%), contribuent significativement à l'explication des variabilités observées. En effet, la pente est plus favorable au développement du pédoncule (1,30cm) et à la croissance du poids des fruits (2,33g et 1,23g) alors que la plaine est plus favorable au développement des dimensions des fruits (15,38mm et 16,75mm). L'étude a montré l'existence de morphotypes chez les individus de l'espèce en fonction de la toposéquence. Les résultats de cette étude pourraient être utiles dans le cadre d'un programme de sélection variétale et d'amélioration génétique de l'espèce, mais aussi pour sa conservation et son utilisation durable au Sahel.

Dans un contexte de crise socio-écologique remettant en question la capacité du système agricole industriel à garantir la sécurité alimentaire et une alimentation de qualité, l’agroécologie émerge comme une alternative de plus en plus crédible. Un des majeurs fondements réside dans la réintroduction de biodiversité cultivée dans les systèmes agro-alimentaires. Cette thèse s’intéresse à trois espèces de blés marginales, appelées « blés vêtus » : l’engrain, l’amidonnier et le grand épeautre. Elle vise à évaluer leur viabilité agronomique, ainsi que leur qualité nutritionnelle, en particulier la composition en protéines du gluten. Située en région lyonnaise, cette recherche adopte une approche participative. Elle répond ainsi à deux autres principes de l’agroécologie : la relocalisation des systèmes alimentaires et le décloisonnement de la recherche en dehors de la sphère académique. Au cours de la thèse, nous avons évalué 23 variétés de blés vêtus en comparaison à huit variétés de blé tendre, en collaboration avec un centre de ressources botaniques, une association paysanne et six paysan.ne.s. Il en résulte que l’engrain se distingue des trois autres espèces sur le plan agronomique et sur la composition du gluten. Cette espèce est notamment caractérisée par un potentiel de tallage et une teneur en protéines élevées, et par de faibles proportions de gluténines. L’étude révèle également une forte variabilité intra-spécifique, en particulier pour les variétés d’amidonnier, soulignant l’intérêt de ces espèces comme sources de diversité. Enfin, l’évaluation réalisée au cours de la thèse a permis d’identifier des variétés présentant des caractéristiques notables, tant au niveau agronomique que concernant la composition des protéines du gluten. Au-delà des résultats d’évaluation des variétés, cette thèse propose une analyse réflexive du processus de recherche participatif. Elle identifie les forces et les limites de l’approche menée, et suggère des pistes d’amélioration. En conclusion, cette thèse pose les bases pour la poursuite du projet d’évaluation des blés vêtus, tant du point de vue de la méthodologie d’évaluation que de l’approche participative
Amidst a backdrop of socio-ecological crisis that raises questions about the capacity of industrial agriculture to ensure food security and quality food, agroecology has emerged as an increasingly credible alternative. A pivotal aspect of agroecology is the reintroduction of cultivated biodiversity into agri-food systems. This thesis focuses on three marginal wheat species, known as "hulled wheats" : einkorn, emmer, and spelt. It aims to assess their agronomic viability, as well as their nutritional quality, with a specific focus on the composition of gluten proteins. Situated in the Lyon region, this research embraces a participatory approach, aligning with two core principles of agroecology : the relocalization of food systems and the breaking down of barriers between research and the wider community. During this thesis, we evaluated 23 hulled wheat varieties, in comparison with eight common wheat varieties. This work was done in collaboration with a botanical resource center, a farmers’ association, and six farmers. The results show that einkorn clearly differs from the other three species, in terms of agronomic features and gluten composition. In particular, einkorn is characterized by an elevated tillering potential, a high protein content, and a notably low proportion of glutenins. The study also revealed high levels of intra-specific variability, particularly within the set of emmer varieties, which highlights the value of these species as a source of diversity. Finally, the evaluation undertaken during this thesis enabled us to identify varieties with noteworthy characteristics, either agronomically or in relation to gluten protein composition. Beyond the results of the variety evaluation, this thesis provides a reflective analysis of the participatory research process, identifying its strengths and limitations, and presenting recommendations for its improvement. In conclusion, this thesis lays the groundwork for the continuation of the hulled wheat evaluation project, encompassing both the evaluation methodology and the participatory approach

De nos jours, la compréhension des transferts de particules sédimentaires (Source to Sink) est un enjeu clef des géosciences. Un des challenges dans ce domaine est la caractérisation de l’origine et des processus de transfert des particules. L’utilisation de la morphométrie (la mesure de la forme d’une particule) est une méthodologie pouvant apporter des réponses à ces questions.La morphométrie des particules est utilisée en sédimentologie pour identifier les différents stocks sédimentaires, les transferts et les mécanismes de sédimentation. Actuellement, beaucoup d’analyses morphométriques sont généralement réalisées avec un Microscope Électronique à Balayage (MEB) couplé à une analyse d’image. Cette dernière consiste en un programme informatique qui distingue les particules de leur arrière-plan et calcule leur forme suivant différents paramètres tel que l’élongation, la circularité ou la convexité. Cette méthode complexe demande beaucoup de temps. Une nouvelle méthodologie est présentée dans cette thèse utilisant l’approche morphométrique grâce à un appareil de mesure en continue à flux dynamique (caméra couplée à une pompe péristaltique). Ce dernier consiste à prendre des images alors qu’un échantillon d’eau circule à travers une fenêtre d’écoulement, permettant à l’utilisateur d’analyser de grandes quantités de particules en un temps réduit. Des analyses statistiques sont réalisées sur les paramètres de forme, calculés au préalable par analyse d’image, afin de discriminer les différents stocks de particules. La problématique de ces travaux de thèse est de savoir si la morphométrie peut constituer un proxy du transfert particulaire dans les bassins versants. Pour cela, une approche en 4 étapes a été entreprise afin de (1) vérifier si les données de taille et de forme peuvent discriminer des échantillons de sédiments ; (2) utiliser ces résultats pour évaluer la contribution de sources sédimentaires dans des mélanges expérimentaux contrôlés ; (3) établir un protocole de mesure et de traitement automatisé des données sédimentaires ; et (4) appliquer cela à plusieurs hydrosystèmes. La première étude est réalisée sur le bassin versant du fleuve Thio, sur lequel une activité minière est présente. Des mesures de taille et de forme ont été effectuées sur des sédiments de laisses de crue afin d’estimer la part de cette activité minière dans les stocks sédimentaires du fleuve et de ses affluents. Un modèle de contribution des sources (les affluents) dans les mélanges (le fleuve) a été établi et montre des résultats cohérents. Ces résultats apportent des informations sur les transferts sédimentaires entre les affluents et le fleuve Thio qui seront comparées à d’autres études utilisant des méthodes de traçage sédimentaires différentes. La seconde étude se concentre sur le bassin versant karstique de la source du Hannetot. Des carottes sédimentaires ainsi que les matières en suspension ont été étudiés sur différents points du bassin versant. Les différents tests réalisés montrent des variations dans les contributions des sources sédimentaires dans le temps. Différents proxies saisonniers et météorologiques contrôlant ces variations ont été identifiés. La dernière étude est un cas appliqué au forage d’alimentation en eau potable de la ville de Gisors pompant dans un aquifère karstique. Son but est d’identifier l’origine des sédiments provoquant des pics de turbidité lors de fortes précipitations. Le modèle de contribution des sources isole plusieurs sources potentielles et montre une augmentation dans les contributions de certaines lors des pics de turbidité. Toutes ces études montrent l’intérêt de la morphogranulométrie en tant que traceur sédimentaire. Elles démontrent également que cette technique est d’autant plus intéressante lorsqu’elle est en combinaison avec d’autres méthodes de traçage sédimentaire
Source to sink is one of the main concepts in Earth Sciences for a better knowledge of hydrosystems dynamics. Regarding this issue, one challenge consists in the characterization by in-situ measurements of the sources of suspended sediment, or sediment source fingerprinting. Few methods can fully cover such requirements and among them, the methodology using the grain shape deserves to be developed. Indeed, morphometry of particles is widely used in sedimentology to identify different sedimentary stocks, source-to-sink transport and sedimentation mechanisms. Currently, most grain shape analyses are carried out with a scanning electron microscope coupled to image analysis to measure various size and shape descriptors on particles like elongation, circularity, bluntness or fractal dimension. However, complexity and time of analysis are the main limitations of this technique for a long-term monitoring of SPM transfers. Here we present an experimental morphometric approach using a morphogranulometer (a CCD camera coupled to a peristaltic pump). The camera takes pictures while the sample is circulating through a flow cell, leading to the analysis of numerous particles in a short time. The image analysis provides size and shape information discriminating various particles stocks by statistical analyses. The aim of this thesis is (1) to calibrate the device and understand how the size and shape data can discriminate pure sediment samples; (2) use those results to evaluate the contribution of contrasted sedimentary sources in a mix; (3) to establish a measurement and data analysis protocol; and (4) use those protocol and methodology for several case studies of sediment transfers in various hydrosystems. The first case study presented concern the watershed of the Thio river, on which there is mining activity. A sediment fingerprinting study using size and shape characterization was carried on. The sediment sources of the different tributaries of the Thio river were analyzed as sources and the sediments of the main river itself were used as mixes of these sources. A model of the contributions of the sources in the mixes was achieved and its results show great coherence. It brings information on the transfers of the sediments between the different tributaries and the Thio river which will be later combined to other studies using different fingerprinting methods to evaluate the impact of the mining activity in these transfers. The second study focus on the karstic watershed of the Hannetot spring. Measurements were carried out on various field samples, from suspended sediments to core samples. Several experiments allowed to identify the varying contributions of different sediment sources through time. Several proxies were identified, seasonal and meteorological, as controlling factor for these variations. The last study is also a fingerprinting study of a karstic system. Its aim is to evaluate the origin of sediment sampled during turbidity peaks in the drinking water well of the town of Gisors. The source contribution model identified several potential sources of sediments and shows the increased contributions of certain sources during the flood period. All those studies shows that size and shape measured with the morphogranulometer are a good tracer for fingerprinting studies. They also demonstrate that this technique performs better in combination to other methods and brings the need to carry more studies combining morphogranulometry with several other fingerprinting techniques

Le genre Cyrtorchis, groupait 18 espèces d’orchidées angraecoïdes endémiques d'Afrique tropicale, était connu pour ses grandes fleurs blanches, odorantes à long éperon bien adaptées pour des études sur la biologie de la reproduction. Il était également connu pour ses problèmes de délimitation taxonomique qui peuvent s’avérer préjudiciables pour la conservation des espèces.La présente thèse de doctorat ambitionne de résoudre les problèmes de délimitation au sein du genre au niveau inter et intraspécifique en utilisant une approche de taxonomie intégrative et de documenter sa biologie de la reproduction.Une inspection visuelle de 1752 spécimens, les analyses morphométriques et phylogénétiques ont été utilisées pour clarifier la taxonomie au sein du genre. L’inspection visuelle a permis de délimiter 27 morphogroupes à priori, desquels un échantillonnage de 171 spécimens représentant 20 morphogroupes a été utilisé pour les analyses morphométriques. Pour les reconstructions phylogénétiques, 69 spécimens représentant 21 des 27 morphogroupes ont été séquencés à partir de six marqueurs moléculaires. La caractérisation des patrons de floraison et l’observation et des pollinisateurs ont été réalisées au Cameroun grâce à un suivi phénologique en ombrière sur trois ans de 494 spécimens vivants représentant 15 taxons, et un suivi de la pollinisation naturelle in situ de deux de ces taxons. L’évaluation des facteurs affectant la production des fruits et des graines viables a été réalisée chez deux espèces du genre à travers 448 tests de pollinisation manuelle pour lesquels l’effet du système de pollinisation et de la limitation des ressources ont été examinés.Les approches morphologiques permettent de distinguer deux groupes correspondant aux deux sections préalablement identifiées pour le genre Cyrtorchis. Les analyses moléculaires quant à elles ne soutiennent que la monophylie d’une des deux sections, Cyrtorchis sect. Cyrtorchis. Huit taxons morphologiquement définis dans le genre incluant trois nouvelles espèces sont également bien supportés par les analyses morphométriques et phylogénétiques. Le point d’insertion des stipites au tier supérieur du viscidium semble être l’un des principaux caractères reproducteurs soutenant la monophylie du genre alors que d’autres traits (tels que la structure du viscidium, la forme des stipites et des lobes latéraux du rostelle) se révèlent être d’importants critères permettant d’inférer des relations phylogénétiques au sein du genre. Au final, cette analyse met en évidence 27 taxons au sein du genre(incluant six nouveaux taxons à décrire), dont 12 taxons, confirmé par les approches morphométriques et/ou phylogénétiques. La phénologie de la floraison des espèces en ombrière montre un pic de floraisons à la grande saison de pluie (entre août et octobre). Un décalage de la floraison est observé chez certains taxons distribués en sympatrie et un asynchronisme de la floraison entre population de la même espèce. La pollinisation naturelle est un évènement rare et difficile à observer chez les deux espèces étudiées (C. letouzeyi et C. okuensis). En effet, le taux de pollinisation/fructification est globalement faible (39 % de fleurs avec les pollinies emportées et 16 % de fruits produits chez C. okuensis ;31-15 % de fleurs avec les pollinies emportées et 7-4 % de fruits produits chez C. letouzeyi), et ce, à cause du nombre réduit des visites des pollinisateurs. Par ailleurs, les pollinisateurs des deux espèces ont été identifiés et la pollinisation par les sphinx est confirmée dans le genre. Les tests de pollinisation manuelles ont révélé que la pollinisation croisée semble être le système de pollinisation le plus efficace pour la production de fruits et de graines viables. Cependant, davantage d’espèces devront être testées pour confirmer ce patron. Les approches multidisciplinaires développées dans ce travail sont des bases solides pour la définition et la mise en œuvre de stratégies efficaces de conservation pour les espèces d’orchidées menacées. Afin de produire une révision taxonomique complète du genre, une phylogénie complète incluant les cinq taxons restants et ceux encore non résolus est nécessaire. Les nouveaux taxons identifiés devraient être décrits et les statuts de conservation évalués pour l’ensemble des espèces reconnues dans le genre.
The genus Cyrtorchis, grouped of 18 angraecoid orchids species endemic to tropical Africa, and was known for its large, white, fragrant flowers with a long spur well suited for studies on reproductive biology. It was also known for its taxonomic delimitation problems, which can be detrimental to the conservation of the species.This PhD thesis aims to address the delimitation problems within the genus at the inter- and intraspecific level using an integrative taxonomic approach and to investigate its reproductive biology.Visual inspection of 1752 specimens, morphometric and phylogenetic analyses was used to clarify the taxonomy within the genus. Visual inspection delineated 27 a priori morphogroups, from which a sample of 171 specimens representing 20 morphogroups was used for morphometric analyses. For phylogenetic reconstructions, 69 specimens representing 21 of the 27 morphogroups were sequenced with six molecular markers. The characterization of flowering patterns and the observation of pollinators were carried out respectively through a three-year shadehouse phenological survey of 494 living specimens representing 15 taxa and a survey of the natural in situ pollination of two taxa in Cameroon. The assessment of factors affecting fruit and viable seed production was carried out in two species of the genus through 448 hand pollination tests for which the effect of pollination system and resource limitation were examined.Morphological approaches allow to distinguish two groups corresponding to the two sections previously identified for the genus Cyrtorchis. Molecular analyses support only the monophyly of on of the sections, Cyrtorchis sect. Cyrtorchis. Eight morphologically defined taxa including three new species are also well supported by morphometric and phylogenetic analyses. The insertion point of the stipites at the rear third of the length of the viscidium appears to be one of the main reproductive characters supporting the monophyly of the genus while other traits (such as the viscidium structure, the shape of the stipites and the lateral lobes of the rostellum) are found to be important criteria for inferring phylogenetic relationships within the genus. Finally this analysis highlights 27 taxa within the genus (including six new taxa to be described), of which 12 taxa, confirmed by morphometric and/or phylogenetic approaches. Flowering of most species at the shadehouse is peaking during the main rainy season (between August and October). However, some sympatric species present non-overlapping flowering periods and an asynchronism of flowering between populations of the same species. Natural pollination is a rare event and difficult to observe in the two studied species. Indeed, the overall pollination/fruiting rate is low (39% of flowers with pollinia removed and 16% of fruits produced in C. okuensis; 31-15% of flowers with pollinia removed and 7-4% of fruits produced in C. letouzeyi) because of the reduced number of pollinators visits. Additionally, both species were found to be pollinated by hawkmoths. Manual pollination tests revealed that cross-pollination appears to be the most efficient pollination system to produce fruits and viable seeds. However, more species will need to be tested to confirm this pattern.The multidisciplinary approaches developed in this work provide a solid basis to define and implement effective conservation strategies for threatened orchid species. To produce a complete taxonomic revision of the genus, a completed phylogeny including the five remaining and the yet unresolved taxa is required. The newly identified taxa should be described and the conservation status assessed for all species recognised in the genus.
Option Biologie des organismes du Doctorat en Sciences
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