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Articoli di riviste sul tema "Gene mapping"

Autore: Grafiati

Pubblicato: 4 giugno 2021

Ultima modifica: 1 agosto 2024

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1

Ehrhart, Friederike, Jonathan Melius, Elisa Cirillo, Martina Kutmon, Egon L. Willighagen, Susan L. Coort, Leopold M. G. Curfs e Chris T. Evelo. "Providing gene-to-variant and variant-to-gene database identifier mappings to use with BridgeDb mapping services." F1000Research 7 (3 settembre 2018): 1390. http://dx.doi.org/10.12688/f1000research.15708.1.

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Abstract (sommario):

Database identifier mapping services are important to make database information interoperable. BridgeDb offers such a service. Available mapping for BridgeDb link 1. genes and gene products identifiers, 2. metabolite identifiers and InChI structure description, and 3. identifiers for biochemical reactions and interactions between multiple resources that use such IDs while the mappings are obtained from multiple sources. In this study we created BridgeDb mapping databases for selections of genes-to-variants (and variants-to-genes) based on the variants described in Ensembl. Moreover, we demonstrated the use of these mappings in different software tools like R, PathVisio, Cytoscape and a local installation using Docker. The variant mapping databases are now described on the BridgeDb website and are available from the BridgeDb mapping database repository and updated according to the regular BridgeDb mapping update schedule.

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2

Lathrop, Gregory M., Dora Cherif, Cécile Julier e Michael James. "Gene mapping". Current Opinion in Biotechnology 1, n. 2 (dicembre 1990): 172–79. http://dx.doi.org/10.1016/0958-1669(90)90027-i.

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3

Frézal, Jean. "Genes, gene map, gene mapping". Cytogenetic and Genome Research 46, n. 1-4 (1987): 1–10. http://dx.doi.org/10.1159/000132469.

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4

Harrap, Stephen B. "Repetitive gene mapping". Journal of Hypertension 13, n. 5 (maggio 1995): 567. http://dx.doi.org/10.1097/00004872-199505000-00013.

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5

Stern, Victoria. "Mapping the Spine, Gene by Gene". Scientific American Mind 19, n. 5 (ottobre 2008): 8. http://dx.doi.org/10.1038/scientificamericanmind1008-8a.

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6

Daniels, D. L., e F. R. Blattner. "Mapping using gene encyclopaedias". Nature 325, n. 6107 (febbraio 1987): 831–32. http://dx.doi.org/10.1038/325831a0.

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7

Harper, P. S. "Gene mapping and neurogenetics." Journal of Medical Genetics 24, n. 9 (1 settembre 1987): 513–14. http://dx.doi.org/10.1136/jmg.24.9.513.

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8

Harper, P. S. "Human Gene Mapping 9". Journal of Medical Genetics 25, n. 11 (1 novembre 1988): 788. http://dx.doi.org/10.1136/jmg.25.11.788.

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9

Yates, J. R. W. "Human Gene Mapping 10". Journal of Medical Genetics 27, n. 5 (1 maggio 1990): 343. http://dx.doi.org/10.1136/jmg.27.5.343-a.

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10

SYKES, BRYAN. "Mapping Collagen Gene Mutations". Annals of the New York Academy of Sciences 580, n. 1 Structure, Mo (febbraio 1990): 385–89. http://dx.doi.org/10.1111/j.1749-6632.1990.tb17946.x.

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11

Lam-Po-Tang, P. R. L. "Human Gene Mapping 9.5." Pathology 22, n. 2 (1990): 127. http://dx.doi.org/10.1016/s0031-3025(16)36287-0.

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12

Henry, G. "Human Gene Mapping 10". Biochemical Education 18, n. 3 (luglio 1990): 157. http://dx.doi.org/10.1016/0307-4412(90)90244-i.

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13

He, Weigong, e Shibo Li. "Congenital cataracts: gene mapping". Human Genetics 106, n. 1 (31 gennaio 2000): 1–13. http://dx.doi.org/10.1007/s004390051002.

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14

He, Weigong, e Shibo Li. "Congenital cataracts: gene mapping". Human Genetics 106, n. 1 (gennaio 2000): 1–13. http://dx.doi.org/10.1007/s004399900169.

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15

Fallow, G. F., N. M. Highton, A. Landless, L. Mascia e D. H. Pantling. "Human gene mapping report". Chromosome Research 3, n. 4 (giugno 1995): 265. http://dx.doi.org/10.1007/bf00713055.

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16

Ooms, L., J. Nicholl, P. Bird e G. R. Sutherland. "Human gene mapping report". Chromosome Research 3, n. 7 (novembre 1995): 447. http://dx.doi.org/10.1007/bf00713898.

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17

Baker, E., A. D'Andrea, J. H. Phillips, G. R. Sutherland e L. L. Lanier. "Human gene mapping report". Chromosome Research 3, n. 8 (dicembre 1995): 511. http://dx.doi.org/10.1007/bf00713968.

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18

Cannizzaro, Linda A. "Gene mapping in cancer". Cancer Genetics and Cytogenetics 55, n. 2 (settembre 1991): 139–47. http://dx.doi.org/10.1016/0165-4608(91)90069-7.

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19

Harper, P. S. "Human Gene Mapping 11. The Eleventh International Workshop on Human Gene Mapping". Journal of Medical Genetics 30, n. 1 (1 gennaio 1993): 87. http://dx.doi.org/10.1136/jmg.30.1.87.

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20

Lander, Eric S., e Harvey Lodish. "Mitochondrial diseases: Gene mapping and gene therapy". Cell 61, n. 6 (giugno 1990): 925–26. http://dx.doi.org/10.1016/0092-8674(90)90055-j.

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21

Little, P. F. R. "Gene mapping and the human genome mapping project". Current Opinion in Cell Biology 2, n. 3 (giugno 1990): 478–84. http://dx.doi.org/10.1016/0955-0674(90)90131-w.

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22

Sharma, M., S. Kaur, M. Saluja e P. Chhuneja. "Mapping and characterization of powdery mildew resistance gene in synthetic wheat". Czech Journal of Genetics and Plant Breeding 52, No. 3 (23 settembre 2016): 120–23. http://dx.doi.org/10.17221/187/2015-cjgpb.

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23

Kraft, Peter, e Steve Horvath. "The genetics of gene expression and gene mapping". Trends in Biotechnology 21, n. 9 (settembre 2003): 377–78. http://dx.doi.org/10.1016/s0167-7799(03)00191-4.

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24

Simpson, Elizabeth, Phillip Chandler, Anne McLaren, Els Goulmy, Christine M. Disteche, David C. Page e Malcolm A. Ferguson-Smith. "Mapping the H-Y gene". Development 101, Supplement (1 marzo 1987): 157–61. http://dx.doi.org/10.1242/dev.101.supplement.157.

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Abstract (sommario):

This paper uses cytotoxic and proliferative T cell clones specific for H-Y and restricted by MHC molecules to type mice and humans inheriting incomplete portions of the Y chromosome. The data have allowed us to map the H-Y antigen gene Hya in mouse to a position closely linked with, but separable from, Tdy on the Sxr fragment and thus presumably to a position of the normal mouse Y chromosome near the centromere. The human H-Y gene maps between deletion intervals 4B and 7, separate from TDF which is on interval 1. We are currently testing cells from a number of additional patients who have inherited different portions of the Y chromosome to pinpoint the mapping more closely. It is of interest that in mouse a Y-linked gene controlling spermatogenesis (Spy) maps near Hya on the Sxr fragment: they could be the same or closely linked genes. In man, a gene controlling spermatogenesis maps to Yq and the data so far do not exclude that it could be coincident with the H-Y gene.

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Kurtz, T. W., e E. M. St Lezin. "Gene mapping in experimental hypertension." Journal of the American Society of Nephrology 3, n. 1 (luglio 1992): 28–34. http://dx.doi.org/10.1681/asn.v3128.

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Abstract (sommario):

In the rat, the results of genetic linkage studies by "candidate" gene or "positional mapping" approaches have suggested that DNA sequences that regulate blood pressure may be located in the vicinity of the kallikrein gene family on chromosome 1, the gene for angiotensin-converting enzyme on chromosome 10, the renin gene on chromosome 13, and the major histocompatibility complex on chromosome 20. Some studies have also suggested that blood pressure regulatory genes may be located on the sex chromosomes. Pending the results of confirmatory studies, these experiments should be interpreted with caution. However, with confirmation of these studies, it should be possible to create a variety of new animal models that will provide excellent opportunities for investigating the molecular, biochemical, and physiologic determinants of high blood pressure. In addition, in genetic studies in humans with essential hypertension, it may be worthwhile to target chromosome regions that are homologous to those implicated in linkage studies of hypertension in rodents. By narrowing the focus on selected areas of the genome, experimental linkage studies in the rat may also be used to guide the detailed molecular approaches ultimately required to identify the specific DNA sequence alterations that give rise to increased blood pressure.

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26

Qu, Xianggui. "The Statistics of Gene Mapping". Technometrics 50, n. 1 (febbraio 2008): 94. http://dx.doi.org/10.1198/tech.2008.s537.

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27

Harper, P. S. "Gene mapping and medical genetics." Journal of Medical Genetics 22, n. 4 (1 agosto 1985): 241–42. http://dx.doi.org/10.1136/jmg.22.4.241.

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28

Shaw, D. J., J. D. Brook, A. L. Meredith, H. G. Harley, M. Sarfarazi e P. S. Harper. "Gene mapping and chromosome 19." Journal of Medical Genetics 23, n. 1 (1 febbraio 1986): 2–10. http://dx.doi.org/10.1136/jmg.23.1.2.

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29

Kong, A., e F. Wright. "Asymptotic theory for gene mapping." Proceedings of the National Academy of Sciences 91, n. 21 (11 ottobre 1994): 9705–9. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.91.21.9705.

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30

WOMACK, JAMES E. "Main Session II: Gene mapping". Animal Genetics 20, n. 4 (24 aprile 2009): 330–31. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.1989.tb00880.x.

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31

Ott, Jurg, e Josephine Hoh. "Statistical Approaches to Gene Mapping". American Journal of Human Genetics 67, n. 2 (agosto 2000): 289–94. http://dx.doi.org/10.1086/303031.

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32

Alting-Mees, M. A., e J. M. Short. "pBluescript II: gene mapping vectors". Nucleic Acids Research 17, n. 22 (1989): 9494. http://dx.doi.org/10.1093/nar/17.22.9494.

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33

Morton, N. E., e A. Collins. "The future of gene mapping". Genetic Analysis: Biomolecular Engineering 14, n. 1 (marzo 1997): 25–27. http://dx.doi.org/10.1016/s1050-3862(96)00170-2.

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34

Simsek, M. "Restriction mapping and gene analysis". Biochemical Education 24, n. 2 (aprile 1996): 117–19. http://dx.doi.org/10.1016/0307-4412(95)00158-1.

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Smith, M. J., e P. N. Goodfellow. "Gene mapping and genetic diseases". Current Opinion in Cell Biology 1, n. 3 (giugno 1989): 460–65. http://dx.doi.org/10.1016/0955-0674(89)90006-9.

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Frischauf, Anna-Maria. "Gene-mapping techniques and applications". Trends in Genetics 8, n. 2 (febbraio 1992): 78. http://dx.doi.org/10.1016/0168-9525(92)90358-b.

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Barker, Peter E. "Gene Mapping and Cystic Fibrosis". American Journal of the Medical Sciences 299, n. 1 (gennaio 1990): 69–72. http://dx.doi.org/10.1097/00000441-199001000-00015.

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Dorozynski, A. "Gene Mapping the Industrial Way". Science 256, n. 5056 (24 aprile 1992): 463. http://dx.doi.org/10.1126/science.256.5056.463.

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Lécuyer, Eric, e Pavel Tomancak. "Mapping the gene expression universe". Current Opinion in Genetics & Development 18, n. 6 (dicembre 2008): 506–12. http://dx.doi.org/10.1016/j.gde.2008.08.003.

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Galland, Joel, e Mark H. Skolnick. "A gene mapping expert system". Computers and Biomedical Research 23, n. 4 (agosto 1990): 297–309. http://dx.doi.org/10.1016/0010-4809(90)90023-6.

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Musarella, Maria A. "Gene mapping of ocular diseases". Survey of Ophthalmology 36, n. 4 (gennaio 1992): 285–312. http://dx.doi.org/10.1016/0039-6257(92)90096-c.

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Frattini, Annalisa, Sara Faranda e Paolo Vezzoni. "Computer Gene Mapping byEagI-Based STSs". Genomics 38, n. 1 (novembre 1996): 87–91. http://dx.doi.org/10.1006/geno.1996.0597.

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Chen, R., E. A. Stahl, F. A. S. Kurreeman, P. K. Gregersen, K. A. Siminovitch, J. Worthington, L. Padyukov, S. Raychaudhuri e R. M. Plenge. "Fine mapping the TAGAP risk locus in rheumatoid arthritis". Genes & Immunity 12, n. 4 (10 marzo 2011): 314–18. http://dx.doi.org/10.1038/gene.2011.8.

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Kitajima, H., M. Sonoda e K. Yamamoto. "HLA and SNP haplotype mapping in the Japanese population". Genes & Immunity 13, n. 7 (23 agosto 2012): 543–48. http://dx.doi.org/10.1038/gene.2012.35.

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Le Bras, Alexandra. "Mapping gene expression in C.elegans neurons". Lab Animal 50, n. 9 (9 agosto 2021): 241. http://dx.doi.org/10.1038/s41684-021-00835-7.

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46

Weghe, A. "1. Gene mapping and population genetics". Animal Genetics 20, n. 1 (24 aprile 2009): 1–24. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.1989.tb01908.x.

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Dobrovic, A., e Marshall Graves. "Gene mapping in marsupials and monotremes". Cytogenetic and Genome Research 41, n. 1 (1986): 9–13. http://dx.doi.org/10.1159/000132189.

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Dawson, G. W., e Marshall Graves. "Gene mapping in marsupials and monotremes". Cytogenetic and Genome Research 42, n. 1-2 (1986): 80–84. http://dx.doi.org/10.1159/000132256.

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Dawson, G. W., P. G. Johnston e Marshall Graves. "Gene mapping in marsupials and monotremes". Cytogenetic and Genome Research 45, n. 1 (1987): 1–4. http://dx.doi.org/10.1159/000132415.

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Reeve, J. P., e B. Rannala. "DMLE+: Bayesian linkage disequilibrium gene mapping". Bioinformatics 18, n. 6 (1 giugno 2002): 894–95. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/18.6.894.

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