Tesi: "Écrevisses – Résistance aux maladies"

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Boštjančić, Ljudevit Luka. "Through the maze of immunity : molecular characterisation of the freshwater crayfish immune response to the crayfish plague pathogen". Electronic Thesis or Diss., Strasbourg, 2024. http://www.theses.fr/2024STRAJ080.

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Abstract (sommario):

Les écrevisses d'eau douce sont un ancien groupe de crustacés décapodes. Ce sont des espèces clés des habitats d'eau douce qui jouent le rôle d'ingénieurs de l'écosystème, de régulateurs trophiques et d'indicateurs de la biodiversité. Au début du 20ème siècle, un effondrement des populations d'écrevisses européennes autochtones s'est produit en raison de l'introduction de l'oomycète pathogène invasif Aphanomyces astaci Schikora (1906), agent responsable de la peste des écrevisses. Par la suite, les introductions répétées d'espèces d'écrevisses d'eau douce invasives, infectées de manière latente par leurs souches respectives d'Ap. astaci, ont facilité la propagation du pathogène et accéléré le déclin des stocks d'écrevisses d'eau douce en Europe. Cependant, des infections latentes ont également été observées dans les populations d'écrevisses d'eau douce européennes. Dans ce contexte, ma thèse se concentre sur l'élucidation des mécanismes moléculaires qui sous-tendent la réponse immunitaire des écrevisses d'eau douce au pathogène Ap. astaci. J'analyse les profils d'expression génétique d'un hôte sensible et d’un hôte résistant pour élucider les voies moléculaires impliquées dans leur réponse immunitaire face au défi que représente Ap. astaci. Cela m'a conduit à la découverte de nouveaux facteurs de réponse immunitaire impliqués dans la réponse à Ap. astaci, tels que les peptides antimicrobiens (AMP), les récepteurs de reconnaissance de formes (PRR) et les facteurs de transcription. Ma quête pour élucider la dynamique de cette interaction hôte-pathogène a révélé que la progression de la maladie est corrélée à la progression du pathogène, qui se produit en plusieurs étapes. En outre, j'ai identifié et caractérisé de nouveaux facteurs de transcription, à savoir la protéine CCAAT-enhancer-binding (C/EBP) et l'homologue 1 de Krüppel (Kr-h1) comme gènes candidats dans l'immunité innée. En définitive, mes recherches mettent en évidence la complexité de l'immunité des écrevisses d'eau douce, en montrant comment différents mécanismes coévolutifs façonnent notre compréhension de cette interaction hôte-pathogène. Ces résultats peuvent faciliter les approches génomiques innovantes dans la gestion et la conservation de la maladie de la peste de l'écrevisse
Freshwater crayfish are an ancient group of decapod crustaceans. They are keystone species of freshwater habitats acting as ecosystem engineers, trophic regulators and biodiversity indicators. At the beginning of the 20th century, a collapse of native Europe freshwater crayfish populations occurred due to the introduction of the invasive oomycete pathogen, Aphanomyces astaci Schikora (1906), causative agent of the crayfish plague disease. Later, numerous introductions of invasive freshwater crayfish species, which are latently infected with their respective Ap. astaci strains, facilitated pathogen host-jumps and accelerated the decline of European freshwater crayfish stocks. However, latent infections have also been observed in European freshwater crayfish populations. In this context, my thesis focuses on elucidating the molecular mechanisms that underly the freshwater crayfish immune response to the pathogen Ap. astaci. I analyse both the susceptible and resistant host´s gene expression patterns to elucidate molecular pathways involved in the host immune response towards Ap. astaci challenge. This led me to the discovery of novel immune response factors involved in the response towards Ap. astaci, such as antimicrobial peptides (AMPs), pattern recognition receptors (PRRs), and transcription factors. My quest to elucidate the dynamics of this host-pathogen interaction has revealed that the disease progression is correlated to the pathogen progression, which occurs in multiple stages. Moreover, I identified and characterised novel transcription factors, namely CCAAT-enhancer-binding protein (C/EBP) and Krüppel homologue 1 (Kr-h1) as candidate genes in the innate immunity. Ultimately, my research highlights the complexity of the freshwater crayfish immunity, displaying how different coevolutionary mechanisms shape our understanding of this host-pathogen interaction. These results can facilitate the innovative genomic approaches in crayfish plague disease management and conservation

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Palloix, Alain. "Potentiel et limites d'une résistance polygénique : la résistance du piment (Capsicum annuum) à Phytophthora capsici". Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO10094.

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Bonduelle, Olivia. "Etude multiparamétrique des mécanismes de la réponse immunitaire contre les infections virales des voies respiratoires et après vaccination". Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066447.

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Abstract (sommario):

La protection immunitaire contre les infections virales respiratoires nécessite la mise en place de réponses innée et adaptative coordonnées. Durant ce travail de thèse, différents acteurs de ces réponses précoces et tardives ont été étudiés après infection et vaccination. Un modèle murin d’infection nasale par le virus de la vaccine nous a permis d’établir le rôle pivot de cellules dendritiques myéloïdes, exprimant le récepteur de chimiokine CX3CR1, dans l’initiation de la réponse lymphocytaire T. Ces résultats démontrent une coordination précoce des réponses innée et adaptative dans l'induction d'une réponse protectrice. Deux études cliniques ont permis d’étudier différents paramètres immunitaires et de modéliser la réponse induite après vaccination et infection par le virus influenza pandémique A(H1N1)pdm09. L'analyse multiparamétrique de 7 effecteurs de l’immunité adaptative met en évidence une forte hétérogénéité des réponses vaccinales, dépendante de la réponse antigrippale résiduelle. Une analyse en composantes principales identifie 5 profils de réponses adaptatives au vaccin. De plus, un an après vaccination, la mémoire immunitaire présente des caractéristiques similaires à la réponse induite après une infection modérée, alors que la qualité et l'intensité des réponses mémoires sont différentes après une infection sévère par le virus A(H1N1)pdm09. Ces résultats suggèrent qu’un équilibre entre les différents compartiments de la réponse cellulaire, après vaccination ou infection, est essentiel pour la protection immunitaire. Ces travaux ouvrent de nouvelles voies dans le choix des critères d’évaluation de l’efficacité vaccinale et des corrélats de protection
Immune protection against viral respiratory infections requires the induction of synchronized innate and adaptive immune responses. In this thesis, the role of various immune effectors acting in the early and late phases of the immune responses after infection and vaccination was studied. A murine model of vaccinia virus nasal infection allowed us to establish the pivotal role of myeloid dendritic cells expressing the CX3CR1 chemokine receptor in the initiation of specific T cell response. These results demonstrate the existence of an early coordination between innate and adaptive arms of the immune system, which is involved in the induction of a protective response. Data from two clinical studies were used to study various immune parameters after vaccination and infection with pandemic A(H1N1)pdm09 influenza virus and to model the induced responses. A multiparametric analysis of seven effectors of the adaptive immunity shows strong heterogeneity of vaccine-induced immune responses, depending on the residual anti-influenza response. A principal component analysis identifies five profiles of adaptive responses. In addition, a year after vaccination, specific immune memory has similar characteristics to the induced responses detected after a moderate viral infection. However, the quality and intensity of memory responses after pandemic vaccine are different from the one observed after a severe infection with A(H1N1)pdm09 influenza virus. These results suggest that a balance between the different compartments of the cellular immune responses after vaccination or infection is essential for immune protection. This work opens up new ways in the correlates of vaccine efficacy and protection

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Barnadas, Céline. "Épidémiologie moléculaire et résistance de Plasmodium vivax aux antipaludiques à Madagascar". Lyon 1, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/33/05/91/PDF/theseCeline_vivax.pdf.

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Abstract (sommario):

Notre objectif a été d’évaluer (i) l’importance de Plasmodium vivax dans les infections palustres à Madagascar, (ii) la sensibilité de ce parasite à la chloroquine et à la sulfadoxinepyriméthamine, (iii) et la place des marqueurs moléculaires pour la surveillance de la résistance aux antipaludiques et de la circulation des souches parasitaires. Pour cela, notre étude a été conduite sur 8 sites sentinelles. Les patients présentant un paludisme causé par P. Vivax ont été inclus dans des tests d’efficacité thérapeutique selon les critères de l’OMS. L’analyse de polymorphismes génétiques sur les gènes pvcrt-o, pvmdr1, pvdhfr et pvdhps, impliqués dans la résistance aux antipaludiques, ainsi que sur les gènes pvcsp, pvmsp3, pvmsp1 utilisés pour le génotypage des souches a été réalisée sur les isolats collectés. Des marqueurs microsatellites ont également été recherchés pour évaluer la diversité génétique de ces isolats, ainsi que la circulation des souches parasitaires et la propagation des isolats résistants
Our objective was to assess (i) the importance of Plasmodium vivax infections in Madagascar, (ii) the parasite sensitivity to antimalarial drugs, and (iii) molecular markers role to monitor antimalarial drug resistance. The study was led on 8 sentinel sites. An in vivo protocol was conducted according to WHO criteria. P. Vivax isolates were analysed for nucleotidic polymorphisms on pvcrt-o, pvmdr1, pvdhfr and pvdhps genes. We searched fro polymorphisms on pvcsp, pvmsp3, pvmsp1 genes and on microsatellites sequences to genotype the isolates from the in vivo protocol. Microsatellites markers were also used to assess the genetic diversity of the Malagasy isolates. Other microsatellites sequences located in the flanking regions of dhfr and dhps genes were identified to assess the origin and propagation of resistant clones

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Monteiro-Sepulveda, Milena. "Functional and immune alterations of the intestine in human obesity". Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066573.

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Abstract (sommario):

The intestinal epithelium has a determinant role in glucose homeostasis ensuring food digestion, nutrient absorption and gut-hormone release in response to dietary compounds. GLUT2, a high-capacity sugar transporter, is transiently recruited into the apical membrane of enterocytes in response to a sugar-rich meal. The consequent raise of serum insulin triggers GLUT2 internalization into the enterocytes, a mechanism that is lost in diabetic- or diet-induced insulin-resistant rodents. I could demonstrate an pathologic permanent apical GLUT2 location in the jejunum of morbidly obese subjects, who exhibit insulin resistance and type-2 diabetes. This apical GLUT2 location favors a bidirectional glucose transepithelial exchange. GLUT2 can also accumulate in enterocyte endosomes of obese subjects consuming a high-fat low-carbohydrate diet. Altered GLUT2 locations in enterocytes sign intestinal adaptations in human obesity (Diabetes J 2011). Obesity is a low-grade inflammatory disease, affecting the insulin sensitivity of many organs. Little is known about intestinal immunity in human obesity. I contributed to show that in obesity the intestinal mucosa is hypertrophic and contains an increased number of innate and adaptive immune cells. These modifications are associated to altered bioclinical parameters. The phenotype of jejunal T cell was determined in the epithelium and lamina propria by flow cytometry and by gene expression. The activity of T cell from obese, but not lean subjects impairs insulin sensitivity of Caco-2/TC7 enterocytes (2 manuscripts in preparation). Results show that immune adaptations of the small intestine lead to impaired insulin sensitivity of enterocytes and thereby may initiate the loss of GLUT2 trafficking, altering intestinal absorptive function in obesity
L'épithélium intestinal contribue à l'homéostasie glucidique assurant la digestion des aliments, l'absorption des nutriments et la sécrétion des entero-hormones aprs un repas. GLUT2, un transporteur de sucre à haute capacité, est transitoirement recruté dans la membrane apicale des entérocytes en réponse à un repas riche en sucre. L'augmentation de l'insulinémie provoquée par l'hyperglycémie postabsorptive déclenche l'internalisation de GLUT2 dans l'entérocyte, mécanisme qui est perdu chez les rongeurs diabétiques ou rendus résistants à l'insuline par le régime. Dans le jéjunum de sujets obèses morbides résistants à l'insuline et/ou diabétiques de type 2, j'ai montré une localisation anormalement permanente, de GLUT2 dans la membrane apicale des entérocytes. La localisation apicale de GLUT2 favorise un échange bidirectionnel transépithélial de glucose. GLUT2 peut aussi s'accumuler dans les endosomes des sujets dont l'alimentation est riche en graisse et plus pauvre en hydrate de carbone. Ces localisations anormales de GLUT2 dans les entérocytes sont un signe d'adaptation pathologique de l'intestin à l'obésité humaine (Diabetes J 2011). L'obésité est une maladie inflammatoire à bas grade, affectant la sensibilité à l'insuline de plusieurs organes. L'immunité intestinale est peu étudiée dans l'obésité humaine. J'ai montré que la muqueuse intestinale des sujets obèses est hypertrophique et associée à un accroissement du nombre de cellules de l'immunité innée et adaptative. Ces modifications sont en lien avec les changements biocliniques mesurés chez les sujets obèses. Le phénotype des lymphocytes T du jéjunum a été établi en cytométrie de flux et par l'expression de gènes. L'activité des lymphocytes T de sujets obèses, pas celle des sujets minces, dégrade la sensibilité à l'insuline des entérocytes Caco2/TC7 (2 manuscripts en préparation). Nos résultats suggèrent que l'adaptation de l'immunité intestinale dans l'obésité affecte la sensibilité à l'insuline des entérocytes modifiant la fonction d'absorption des sucres dans l'intestin

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Viau, Muriel. "Effets des superantigènes B in vitro et in vivo dans un modèle de souris transgèniques humanisées". Paris 13, 2004. http://www.theses.fr/2004PA132031.

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Abstract (sommario):

Les superantigènes (SAG) produits par des agents pathogènes ont la capacité de fixer une grande partie des immunoglobulines indépendamment du paratope. Notre travail a eu pour but d'étudier l'impact des SAg sur le système immunitaire. Nous avons montré que la fixation des SAg entraîne l'internalisation rapide du récepteur suivie par celle du CXCR4. In vivo, il y a une diminution spécifique des cellules utilisant les gènes fixées par les SAG. Les cellules B-1 péritonales et les cellules de la zone marginale spécialisées dans l'"immunité innée" sont affectées. Enfin, l'utilisation thérapeutique des SAg dans un modèle d'autoimmunité a permis de retarder le développementprécoce de la maladie. Ainsi, nous avons mis en évidence un nouveau mécanisme utilisé par les agents pathogènes pour affaiblir la réponse immunitaire de l'hôte. La compréhension des mécanismes impliqués permettra de mieux combattre les infections par les souches bactériennes multi-résistantes aux antibiotiques.

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Tasiemski, Aurélie. "Caractérisation et rôle des peptides antimicrobiens dans l'immunité innée de la sangsue Theromyzon tessulatum". Lille 1, 2001. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/2001/50376-2001-349.pdf.

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Garlatti, Virginie. "Systèmes effecteurs de l'immunité innée : reconnaissance et voies de signalisation". Grenoble 1, 2008. http://www.theses.fr/2008GRE10073.

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Abstract (sommario):

Le système immunitaire inné génère des réponses inflammatoires contre les pathogènes ou les cellules dangereuses mais est aussi impliqué dans l'élimination tolérogène des cellules apoptotiques. La reconnaissance des cibles est médiée par un grand nombre de protéines membranaires et solubles. Parmi celles-ci, on trouve les protéines de reconnaissance du complément : C1q, MBL (« mannose-binding lectin) et ficolines. Bien que les propriétés structurales de reconnaissances de la MBL aient été extensivement étudiées, celles des ficolines et du C1q restent à établir. Ceci était l'objectif de la première partie du projet présenté ici. Nous avons analysé par cristallographie aux rayons X la structure des domaines de reconnaissance de ces protéines en présence ou en absence de plusieurs ligands connus. Nous avons montré que les ficolines H et M possédaient un seul site de fixation, conservé au sein des domaines de type fibrinogène. Ce site conservé ne semble pas actif dans la ficoline L, mais de nouveaux sites ont été mis en évidence, créant une surface de reconnaissance étendue favorable à la fixation de larges polymères. Nous avons également trouvé un nouveau site de fixation de la phosphosérine sur C1q. Des propriétés particulières de la ficoline M ont été mises en évidence : la fixation de Neu5Ac, un marqueur du soi, et un changement conformationnel dépendent du pH. Comme l'étude des propriétés de reconnaissance de quelques récepteurs isolés ne lève pas le voile sur le comportement particulier des phagocytes en présence de débris cellulaires, nous avons commencé un nouveau projet afin de comprendre les voies de signalisations activées dans le phagocyte en réponse aux cellules apoptotiques. De nombreuses données suggèrent que le complexe GEF : DOCK/ELMO est commun à de nombreuses voies de signalisation mais aussi un point de régulation. Mon travail dans ce second projet était d'initier la mise en place d'outils cellulaires afin d'étudier le comportement de ce complexe dans différentes lignées cellulaires modèles. J'ai développé un test quantitatif de phagocytose ainsi que des outils pour détecter et sur-exprimer ELMO1. Nous avons également observé la re-localisation de cette protéine dans les coupes phagocytiques
The innate immune system triggers inflammatory defences against pathogens or dangerous cells but is also involved in the tolerogenic removal of apoptotic cells. Target recognition is mediated by a wide range of soluble or membrane proteins. Among them are the essential complement recognition proteins: mannose-binding lactin, C1q and ficolins. Whereas the structural recognition properties of mannose-binding lectin BL have been extensively studied, the corresponding properties of ficolins and C1q with their ligands had to be deciphered at the atomic level. This was thus the aim of the first part of the project presented here. This was experimentally studied through the X-ray structural analysis of the corresponding ficolins and C1q recognition domains, alone or in complex with several cognate ligands. We have shown that H- and M- ficolins possess only one binding site, conserved among fibrinogen-like domains. This conserved site does not seem to be active in L-ficolin, but new binding sites were discovered instead, defining a larger surface of recognition more suitable to the binding of elongated polymers. Interestingly, we also found a new binding site for phosphoserine in C1q. We also provided evidence for two unique properties of M-ficolin: the binding of Neu5Ac, a classical self-marker, and a pH-dependent conformational switch of the binding site. As recognition properties of a few recognition proteins do not explain the different behaviour of immune cells with altered-self debris, we initiated a new project to understand signalling pathways in phagocytes during apoptotic cells removal. Many data suggest that a GEF complex: ELMO/DOCK is common to many pathways activated by apoptotic cells recognition and is also a point of regulation. My work in this second project was to initiate the setup of cellular tools to study the behaviour of this complex in different model cell lines. I developed quantitative phagocytic tests and also tools for detection and surexpression of ELMO1 in different cells lines. We also observed the re-localisation of cellular ELMO1 in the phagocytic cup

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Millet, Anne. "Résistance aux pathogènes et régulation de la réponse immune chez Caenorhabditis elegans". Aix-Marseille 2, 2005. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2005AIX22040.pdf.

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Bozdogan, Bülent. "Mécanismes de résistance aux lincosamides et aux streptogramines chez les bactéries à Gram positif". Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05N132.

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Fopa, Fomeju Berline. "Impact des duplications du génome du colza (Brassica napus L. ) sur l’organisation des régions génomiques impliquées dans la résistance quantitative à Leptosphaeria maculans". Rennes, Agrocampus Ouest, 2014. http://www.theses.fr/2014NSARC114.

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Abstract (sommario):

Toutes les espèces végétales cultivées sont des polyploïdes récents ou anciens et possèdent des génomes plus ou moins dupliqués. Suite à un évènement de polyploïdisation, des modifications structurales ou fonctionnelles conduisent à des contenus en gène ou des régulations des copies des gènes différents entre les régions dupliquées. Ces événements peuvent être une source importante de diversification des gènes contrôlant les caractères complexes. Pour mieux comprendre le fonctionnement des facteurs génétiques contrôlant les caractères d’intérêt agronomique, il est donc nécessaire de les étudier en tenant compte des duplications présentes au sein du génome. Nous avons traité cette thématique chez le colza, une espèce au génome hautement dupliqué, avec l’objectif d’étudier l’impact des duplications sur l’organisation structurale et fonctionnelle des régions génomiques impliqués dans la résistance quantitative au Phoma. De nombreuses régions génomiques ont été identifiées confirmant la nature très polygénique de cette résistance. Leur distribution est quasi équivalente entre les génomes A et C du colza mais biaisée entre les sous-génomes issus de la triplication ancienne des Brasicas. Au moins 44 % des régions génomiques correspondent à des régions homéologues dupliquées de cinq blocs synténiques d’Arabidopsis thaliana. L’analyse génomique comparative avec A. Thaliana a montré que beaucoup des gènes maintenus dans plusieurs régions dupliqués sont impliqués dans la réonse au stress, ce qui converge avec les résultats obtenus dans d’autres espèces. La génomique comparative nous a également permis de dégager des hypothèses quant aux fonctions sous-jacentes aux régions impliquées dans la résistance quantitative du colza au Phoma
All crop species are recent or ancient polyploids and have more or less duplicated genomes. Following polyploidy events, structural and functional modifications result in differential gene content or regulation in the duplicated regions, which can play a fundamental role in the diversification o the genes underlying complex traits. To better understand the functioning of the genetic factors controlling the agronomic traits, I is necessary to analyze them in the light of the duplications in the genome. We have addressed this issue in oilseed rape, a species with a highly duplicated genome, with the aim of studying the consequences of genome duplications on the structural and functional organization of the genomic regions involved in quantitative resistance to stem canker. Numerous genomic regions were identified, which confirmed the high polygenic nature of this resistance. Their distribution was quite equivalent between A and C genomes of oilseed rape but a bias was observed in relation with the subgenomes deriving from the ancestral triplication event of Brassica clad. A least 44 % of the genomic regions corresponded to homologous duplicated regions of five Arabidopsis thaliana syntetic blocks. A comparative genomic analysis with A. Thaliana showed that many genes maintained in several duplicated regions were involved in the stress response, which converges with the results obtained in other species. Comparative genomics also allowed us to draw hypotheses on the function of genes underlying the QTL located in these genomic regions

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Chopy, Damien. "Modulation de la réponse immunitaire au cours d'une infection virale du système nerveux, l'étude du virus de la rage". Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066129.

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Abstract (sommario):

Le virus de la rage est responsable d’une encéphalomyélite fatale. Ce Rhabdovirus neurotrope et non lytique est transmis principalement par la morsure d’un animal enragé. Il infecte un neurone proche du site de morsure, migre au sein du système nerveux (SN) pour atteindre le cerveau où il se réplique massivement et déclenche les premiers symptômes de la maladie. L’objectif de cette étude est de préciser le caractère bénéfique ou délétère de la réponse immunitaire innée in vitro et in vivo sur 4 facteurs de la virulence rabique: l’accessibilité du virus au SN, la survie de la cellule infectée, la mise en place de la stratégie immunoévasive rabique et l’immunodépression induite par l’infection. Ce travail révèle un rôle ambivalent de l’immunité innée. D’une part, elle est bénéfique pour l’hôte car elle freine l’accessibilité du virus au SN, stimule la mort du neurone infecté et permet l’infiltration de cellules immunitaires dans le SN. A l’inverse, l’immunité innée stimule l’expression de B7H1 et donc l’immunoévasion rabique. De plus, le stress induit par l’infection dans le SN stimule la voie immuno-modulatrice cholinergique et favorise l’immunodépression rabique

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Olicard, Cécile. "Recherche de substances anti-virales chez l'huître creuse, Crassostrea gigas". La Rochelle, 2004. http://www.theses.fr/2004LAROS110.

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Barbier, Diane. "Impact du virus Influenza de type A sur la régulation de MUC5AC, l’une des principales mucines respiratoires". Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066683.

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Abstract (sommario):

Les virus Influenza de type A (VIA) sont les agents étiologiques de la grippe, une pathologie respiratoire aigue hautement contagieuse qui constitue une cause majeure de mortalité et de morbidité dans le monde. En effet, ces virus sont responsables d’épidémies saisonnières chaque année mais également de pandémies sévères chaque siècle. Au cours de l’infection grippale, l’organisme va mettre rapidement en place un système de défense immunitaire inné afin de limiter la propagation du virus et de l’éradiquer. En particulier, le mucus qui tapisse les voies aériennes supérieures, constitue une barrière physique potentiellement capable de capter et de séquestrer des pathogènes tels que des bactéries ou des virus. Au cours de ma thèse, nous nous sommes intéressés à la régulation de MUC5AC, l’une des principales mucines respiratoires, par le VIA in vitro dans des cellules épithéliales pulmonaires et in vivo chez la souris. Notre projet a été de mettre en évidence la voie de signalisation impliquée dans cette régulation et de discuter le rôle de l’expression de MUC5AC au cours de l’infection grippale. Nos résultats démontrent qu’à la fois des souches saisonnières et pandémiques, de type H3N2 ou H1N1, sont capables d’augmenter l’expression de MUC5AC au niveau de l’ARNm et au niveau protéique. Notre travail démontre également que l’induction de MUC5AC est dépendante de la réplication virale et de l’induction de protéases et implique la voie de signalisation EGFR/MEK/ERK/Sp1. Nos résultats dissèquent pour la première fois la voie d’induction de MUC5AC par le VIA et ouvrent de nouvelles perspectives pour la compréhension du rôle des mucines dans les infections virales

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Dostert, Catherine. "Etude de la réponse antivirale de la drosophile". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. http://www.theses.fr/2005STR13146.

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Bilak, Hana. "DmMyD88, un nouvel élément pour l'étude des récepteurs Toll de la drosophile". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2004. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2004/BILAK_Hana_2004.pdf.

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Lefebvre, Christophe. "Étude de la réponse immunitaire chez la sangsue theromyzon tessulatum : approches différentielles". Lille 1, 2002. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/2002/50376-2002-101.pdf.

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Abstract (sommario):

Les modèles invertébrés ont apporté un renouveau dans l'étude de l'immunité innée. Les études présentées dans ce travail de thèse se sont intégrées à cette volonté de découvrir de nouveaux acteurs de l'immunité innée chez les invertébrés. Elles se sont appuyées sur des approches différentielles chez notre modèle, la sangsue Theromyzon tessulatum. D'abord, l'analyse biochimique par chromatographie liquide aura permis la mise en évidence de modulations peptidiques dans le liquide cœlomique après une infection par de LPS. Un peptide portant une activité anti-bactérienne a été détecté. Il fait l'objet de travaux plus approfondis concernant son activité et sa régulation après une infection expérimentale. Puis, l'analyse s'est orientée vers les modulations d'expression génique induites après une infection bactérienne au sein de l'organisme complet. Cette étude a été validée par l'élaboration de biopuces à ADN confectionnées à façon avec les candidats différentiels. Les gènes dont l'expression est modulée par l'infection expérimentale débouchent tous sur autant de perspectives afin de déterminer leur rôle dans l'immunité chez la sangsue. Le gène de la cystatine B est surexprimé après une infection bactérienne dans un seul type de cœlomocyte circulant dans le liquide cœlomique. La cathepsine L est retrouvée spécifiquement dans les mêmes cellules. Mais son gène n'est pas modulée par l'infection. Cette concentration dans un seul type de cellule circulante apporte de précieuses informations sur l'identité probable des cellules immunitaires de T. Tessulatum. Les résultats suggèrent l'importance de la balance Cystatines-Cathepsines dans l'immunité innée.

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Lafarge, Sandrine. "Signalisation dans le lymphocyte B humain au décours de son activation in vitro via les molécules de l'immunité innée". Saint-Etienne, 2008. http://www.theses.fr/2008STET007T.

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Abstract (sommario):

Une activation lymphocytaire B anormale ou déréglée est souvent la cause de nombreuses maladies auto-immunes ou cancéreuses, en particulier onco-hématologiques. Cette activation cellulaire est sous le contrôle de différentes voies de signalisation intracellulaire d'où l'émergence de nombreux axes d'études sur le rôle et la modulation de la signalisation. L'objectif de mon travail de thèse était donc d'étudier la signalisation dans les lymphocytes B in vitro dans un contexte expérimental inflammatoire. Les cytokines/chimiokinies et les TLR ayant un rôle majeur dans l'inflammation, nous avons dans un premier temps, détecté l'expression du TLR9 par les lymphocytes B. Ainsi, nous avons identifié deux populations lymphocytaires B distinctes (naïve et mémoire) exprimant toutes deux le TLR9 membranaire. Après stimulation par le sCD40L, l'IL-2, l'IL-10 et des oligonucléotides de type CpG-ODN, ces populations produisaient d'importantes quantités d'IL-6. Cette dernière induisant la différenciation des lymphocytes B en plasmocytes, ces données montrent le rôle indirect de la signalisation via le TLR9 dans la production d'anticorps en réponse à un signal de danger. Par la suite, nous nous sommes posé la question des mécanismes sous-jacents entrant en jeu lors de l'activation des lymphocytes B et nous sommes donc intéressés plus précisément à la signalisation intracellulaire. Tout d'abord, nous avons développé une technique d'analyse de cytométrie en flux permettant d'observer les voies de signalisation NF-κB et STAT3. Ensuite nous avons cherché à savoir si la voie de signalisation STAT3 était impliquée dans la production d'IgA lorsque le BCR n'était pas engagé par un antigène c'est à dire en cultivant des lymphocytes B en présence de sCD40L, IL10 et TGF-β. Nous avons tout d'abord montré que la production d'IgA, dans ce modèle, ne nécessitait pas d'ajout de TGF-β exogène et que cette production dépendait bien des voies intracellulaires NF-κB et STAT3. De plus, la voie STAT3 était directement activée par l'IL-10 sans dépendance vis à vis de IL-6 et coopérait avec la voie NF-κB, ce qui rendait la voie STAT3 encore plus sensible à l'IL-10 en augmentant l'expression d' IL-10R par les lymphocytes B. Ces travaux montrent une fois de plus l'importance de la voie intracellulaire STAT3 dans les réponses immunitaires. Le rôle prépondérant de la voie STAT3 dans le développement lymphocytaire B la désigne comme une cible potentielle pour le développement de vaccins muqueux, en particulier pour l'obtention de réponses humorales (IgA) aux interfaces muqueuses.

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Boisnard, Arnaud. "Caractérisation des QTL de résistance au Rice yellow mottle virus chez le riz et relation avec les facteurs d’initiation de la traduction de type 4E et 4G". Montpellier 2, 2007. http://www.theses.fr/2007MON20080.

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Abstract (sommario):

Cette étude présente la caractérisation de QTL de résistance partielle au virus de la panachure jaune chez le riz. Des approches de génétique et de cartographie classiques y ont été couplées à une approche gène candidat ciblée sur les facteurs d'initiation de la traduction, dont les virus semblent largement dépendre pour infecter les plantes. Dans une première étape, la cartographie des QTL a été optimisée grâce l'analyse combinée de deux populations. Dans une deuxième étape, les gènes des facteurs d'initiation de la traduction eIF4E et eIF4G ont été recherchés sur la séquence génomique du riz et leur positionnement a révélé trois co-localisations avec des QTL majeurs. Dans une troisième étape, des lignées quasi-isogéniques ont été développées dans le but de confirmer ou d'infirmer ces co-localisations. Le gène candidat eIF4E localisé sur le chromosome 1 a ainsi été invalidé. De même, sur le chromosome 2, le gène eIF4G-like a été invalidé, mais un deuxième candidat, eIF(iso)4G n'a pu être ni rejeté, ni confirmé. Enfin, sur le chromosome 12, une co-localisation entre un QTL majeur et un gène eIF4G-like a été confirmée et cartographiée finement à un intervalle de 1. 66 Mb, qu'une restriction à la recombinaison n'a pas permis de réduire encore. La région présente les caractéristiques des régions péricentromériques : peu de gènes et de nombreux éléments transposables insérés les uns dans les autres. La caractérisation du gène eIF4G-like a révélé la présence de polymorphismes non synonymes entre les allèles sensibles et résistants, ainsi que l'insertion dans un intron d'un rétrotransposon chez les allèles de résistance. Finalement, nos résultats révèlent que les gènes de la famille eIF4E ne gouvernent pas la résistance partielle, mais que deux gènes de la famille eIF4G constituent des candidats pour contrôler des QTL
This document presents the analysis of QTLs of partial resistance to Rice yellow mottle virus in rice. Classical genetic and mapping approaches were associated with a candidate-gene approach on eIF4E and eIF4G translation initiation factor genes, which seems to be largely involved in plant/virus interactions. In a first step, QTL mapping was improved by the analysis of two populations in a multi-cross design using an integrative map. In a second step, translation initiation factor eIF4E and eIF4G genes were identified on the rice genomic sequence; four of them were co-located with QTLs. In a third step, near-isogenic lines were developed in order to confirm or to reject these co-locations. EIF4E candidate gene, located near a major QTL on chromosome 1, was rejected. On chromosome 2, an eIF4G-like candidate gene was also rejected, whereas an eIF(iso)4G gene was neither confirmed, nor rejected. Finally, a co-location between a major QTL of chromosome 12 and an eIF4G-like gene was confirmed. The QTL was mapped to a 1,66 Mb interval, but a suppression of recombination impaired the reduction of this interval. The interval presents characteristics of pericentromeric regions: low gene density and large stretches of nested transposable elements. EIF4G-like characterization revealed non-synonymous polymorphisms between susceptible and resistant varieties, and the insertion of a retrotransposon in an intron, in resistant varieties. Finally, our results suggest that genes from eIF4E family do not control partial resistance and that two genes from eIF4G family are candidate for governing QTLs of resistance

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Martin, Estelle. "Les conséquences de l’infection par le virus chikungunya sur les vecteurs du genre Aedes". Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066306.

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Abstract (sommario):

Le virus chikungunya (CHIK) transmis par les moustiques Aedes aegypti et Aedes albopictus a émergé dans la région de l’Océan Indien en 2005-2006. Sur l’île de La Réunion, un changement de vecteur semble avoir favorisé la sélection d’un nouveau variant viral plus efficacement transmis par Ae. Albopictus. L’efficacité de ce système virus–vecteur est-elle associée à un cout de l’infection virale ? En se répliquant intensivement, le virus devient néfaste au vecteur qui pour réduire les effets négatifs de l’infection, peut modifier certains traits d’histoire de vie. Nous avons montré que l’infection virale conduit à une diminution de la survie qui est compensée par un investissement plus précoce de ses ressources vers la reproduction : Ae. Albopictus de La Réunion infectée par le virus CHIK pond plus tôt juste avant de mourir. A Mayotte, Ae. Aegypti et Ae. Albopictus co-existent et partagent souvent les mêmes gîtes larvaires entrainant une compétition pour les mêmes ressources nutritives. Nous avons montré que la compétition n’influe pas sur la compétence vectorielle. Néanmoins, lorsque les larves des deux espèces sont présentes en proportions équivalentes, Ae. Albopictus est favorisée : un meilleur taux de survie et un taux d’infection disséminée plus élevée. Pour contrôler l’infection virale, les moustiques ont développé des mécanismes de défense qui reposent entres autres sur l’ARN interférence (RNA). Nos résultats préliminaires montrent que la diminution de l’expression des gènes ago2 et dcr2 n’affectent pas la réplication du virus CHIK dans les conditions de laboratoires utilisées.

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Schikorski, David. "Mise en évidence de molécules impliquées dans la réponse immunitaire innée du système nerveux central de la sangsue médicimale Hirudo medicinalis". Lille 1, 2007. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/2007/50376-2007-303.pdf.

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Abstract (sommario):

Longtemps considéré comme un organe dépourvu de toute immunité, le système nerveux central (SNC) des vertébrés est capable de mettre en place une réponse immunitaire innée intrinsèque. Peu d'études ont porté sur cette réponse chez les invertébrés. Nous avons donc choisi d'étudier la réponse immunitaire innée du SNC d'un invertébré: la sangsue médicinale Hirudo medicinalis. En effet, le SNC de cet invertébré est capable de se réparer totalement suite à une blessure en présence ou non de micro-organismes pathogènes. Cette faculté implique l'existence d'une réponse immunitaire innée efficace au sein du SNC de cet animal. Au cours de cette étude, nous avons donc entrepris la recherche d'effecteurs moléculaires impliqués dans cette défense. Des approches biochimiques et moléculaires nous ont notamment permis de mettre en évidence au niveau du SNC la présence de deux peptides antibactériens, la neuromacine et l' Hmlumbricine, et d'une cytokine proinflammatoire, l'Hm-EMAP II. Le rôle de ces différentes molécules au cours de la réponse anti-infectieuse du système nerveux a également été étudié. D'une façon générale, l'ensemble de nos résultats indiquent que ces différentes molécules sont impliquées dans la réponse immunitaire innée du SNC de la sangsue médicinale. Par ce travail, nous montrons que la chaîne nerveuse d' H. Medicinalis est capable de répondre à une infection par la mise en place d'une réponse immunitaire innée élaborée et comparable à celle existant chez les vertébrés.

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Bussmann, Vincent. "Caractérisation physique et expression du gène NRAMP1 chez les petits ruminants : application à l'évaluation de son rôle dans la résistance du mouton à la salmonellose abortive ovine". Tours, 1999. http://www.theses.fr/1999TOUR3806.

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Percoco, Giuseppe. "Biomolécules et immunité cutanée en lien avec l'écologie microbienne de la peau". Rouen, 2012. http://www.theses.fr/2012ROUES007.

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Abstract (sommario):

Interface entre l‟organisme et l‟environnement, la peau est le plus grand organe qui assure une fonction « barrière » vis-à-vis des stress biotiques ou abiotiques. Elle est constituée de trois couches cellulaires superposées: l‟hypoderme, le derme, et l‟épiderme. L’épiderme renferme également quatre couches cellulaires distinctes: la couche basale, la couche épineuse, la couche granuleuse et la couche cornée. Les kératinocytes issus de la couche basale, constituent le type cellulaire le plus abondant au sein de l‟épiderme. Dans ce projet, nous avons analysé l‟expression de nombreux gènes (gènes structuraux et gènes de défense) par PCR quantitative en temps réel, au sein des différentes couches épidermiques isolées d‟explant de peau humaine saine par microdissection laser (Laser Capture Microdissection, LCM). Nous avons ensuite évalué les effets de bactéries du microbiome cutané sur l‟expression de gènes de défense. La distribution des produits de ces gènes a également été examinée par une approche immunocytochimique. Les résultats majeurs obtenus sont décrits ci-après. 1) Nous avons optimisé le protocole de LCM pour isoler deux fractions épidermiques respectivement enrichies en kératinocytes de la couche basale et de la couche granuleuse (Percoco et al. , 2012. Experimental Dermatology 21, 531-534). Cet outil prometteur est maintenant aisément applicable à la recherche en Dermatologie. 2) Nous avons montré, que dans une peau humaine saine, les gènes responsables de l‟immunité innée, codant notamment pour les bêta-defensines humaines de type 2 et 3 (human beta-defensin, hBD), sont exprimés de façon différentielle au sein des couches épidermiques. 3) Nous avons observé que les trois bactéries Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus et Pseudomonas fluorescens sont capables de moduler positivement l‟expression des gènes codant pour des beta-defensines (hBD2 et hBD3) et des cytokines pro-inflammatoires (IL-1 alpha et bêta et IL-6). 4) En utilisant des anticorps spécifiques, nous avons localisé les produits de ces gènes dans les différentes couches épidermiques, à l‟échelle cellulaire par microscopie à épifluorescence, et à l‟échelle ultrastructurale par microscopie électronique à transmission (Percoco et al. , Soumis).

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Sire, Christelle. "Etude des effets de la protéine P1 et du virus de la panachure jaune du riz (Rice yellow mottle virus) sur l'extinction post-transcriptionnelle des gènes : application à la construction de vecteurs viraux chez le riz". Perpignan, 2005. http://www.theses.fr/2005PERP0598.

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Abstract (sommario):

Les virus phytopathogènes,ont développé des stratégies pour empêcher le mécanisme de silencing (PTGS), constituant une défense anti-virale efficace, grâce à la spécialisation d'une, ou plusieurs, de leurs protéines vers cette fonction. L'étude présentée porte sur l'analyse de la suppression du silencing, lors d'une interaction naturelle entre le Rice yellow mottle virus (RYMV), agent responsable de la panachure jaune en Afrique, et son hôte,le riz (Oryza sativa L. ). Pour ce virus hautement variable, la phylogénie d'une collection d'isolats de RYMV est bien caractérisée. L'ensemble de ces données, a été utilisé pour mener une étude comparative, qui a permis d'apprécier le rôle de la protéine P1, sur le PTGS du gène rapporteur gus chez O. Sativa et chez Nicotiana benthamiana. Cette analyse a révélé une forte variabilité sur l'efficacité de la suppression. Lors d'une infection de O. Sativa par différents isolats de RYMV, une aptitude différentielle à contourner le mécanisme de PTGS a été révélée, en fonction de leur phylogénie et de leur pathogénie : l'efficacité globale du RYMV pour la suppression de PTGS sur un transgène, n'est pas reliée à la phylogénie, et est inversement corrélée à son pouvoir pathogène. Ces résultats suggèrent que la suppression du PTGS lors d'une infection naturelle, est la résultante d'un mécanisme complexe. L'implication probable de la CP dans ce mécanisme, a été révélé par l'analyse de la dérégulation des miARN. Ces résultats sont d'autant plus intéressants, qu'ils pourront être mis à profit, pour l'optimisation de vecteurs d'expression et de VIGS développés dans une deuxième étude
Most plant viruses have evolved to conteract the defence mechanism based on RNA silencing. Thus, many viral proteins have been well studied for their features in silencing suppression. Among these proteins, P1 protein from Rice yellow mottle virus, responsible for serious disease in irrigated rice systems in Africa, has been described. This study characterised silencing suppression features of RYMV under natural infection on rice plants. Biolistic delivery assays on rice leaves and Agrobacterium-based leaf infiltration assays on Nicotiana benthamiana, determined that P1 undergoes silencing with variable efficiency when inoculating different P1. Moreover, as RYMV is a highly diverse virus, both at genetic scale or at pathogenicity scale, we attempted to evaluate variability of silencing suppression with RYMV particles. Infected O. Sativa with different RYMV isolates, exhibited contrasted silencing suppression on uidA transgene. We thus revealed that RYMV has a qualitative effect on silencing suppression, which is not correlated to virus phylogeny. Silencing suppression at virus scale was also inversely correlated to pathogenicity of isolates. These results suggested that silencing suppression occuring under RYMV infection, is a complex mechanism. Thus, the involvement of the coat protein, on miRNA accumulation regulation, was demonstrated in transgenic rice lines expressing this protein. Moreover these results will be usefull to improve RYMV-based expression and VIGS vectors, that have been developed in a second study. The purpose of this work is to assess the ability of construction of RYMV-based expression and VIGS vectors and to evaluate gene insertion constraint

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Leone, Philippe. "Etudes structurales de protéines impliquées dans la réponse immunitaire innée des insectes". Aix-Marseille 1, 2005. http://www.theses.fr/2005AIX11077.

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Abstract (sommario):

Apres une infection microbienne, l'activation de la réponse immunitaire innée dans l'hémolymphe des insectes implique principalement deux familles de protéines: les récepteurs qui interagissent spécifiquement avec des motifs moléculaires à la surface de l'intrus, et les protéases à serines qui amplifient et régulent le signal par des cascades protéolytiques. J'ai utilisé différents systèmes d'expression (bactérie, levure, cellules d'insectes) pour produire quatre clip-trypsines de la drosophile afin de résoudre leur structure cristallographique. Ces protéases à serines de type trypsine possèdent au moins un court domaine N-terminal riche en cystéines, appelé ‘clip' et responsable de la régulation de l'enzyme. Le meilleur résultat a été obtenu avec les cellules SF9 qui expriment et sécrètent correctement la clip-trypsine CG9733. D'autre part, le domaine clip de CG16705 a été renaturé à partir de corps d'inclusion exprimés dans la bactérie. Dans le contexte d'une collaboration avec le laboratoire IBMC (Strasbourg) j'ai exprimé le récepteur PGRP-SD dans des cellules S2 et résolu sa structure cristallographique. Cette protéine de reconnaissance du peptidoglycane (PGRP) isolé chez la drosophile est un récepteur des bactéries Gram+, comme PGRP-SA. Les résultats suggèrent toutefois que les deux récepteurs reconnaissent différemment le peptidoglycane de ces bactéries, et qu'ils interagissent avec des corécepteursdifférents. Bien que le site de fixation du peptidoglycane soit conservé, la comparaison des structures de PGRP-SA et PGRP-SD montre des changements importants dans son environnement proche, en particulier dans la répartition des charges électrostatiques. De plus l'analyse des résidus de surface met en évidence une région non conservée entre les deux récepteurs et probablement impliquée dans l'interaction avec un co-récepteur, ainsi qu'une crevasse hydrophobe conservée chez toutes les PGRP
Upon microbial infection, the activation of innate immunity in the hemolymph of insects involves principally two protein families: receptors which interact with specific molecular patterns on microorganisms, and serine proteases which amplify and regulate the signal through proteolytic cascades. I used different expression systems (bacteria, yeast and insect cells) to produce four drosophila clip-trypsins in order to solve their crystallographic structure. These trypsin-like serine proteases have at least one small N-terminal cysteine-rich domain called ‘clip' which is involved in the regulation of the enzyme. The best result was obtained with SF9 cells which expressed and properly secreted the clip-trypsin CG9733. The clip domain of CG16705 was also refolded from inclusion bodies expressed in bacteria. In collaboration with the laboratory IBMC (Strasbourg), I expressed the receptor PGRP-SD in drosophila S2 cells and solved its crystallographic structure. This peptidoglycan recognition protein (PGRP) from drosophila is a receptor for Gram+ bacteria, as PGRP-SA, but the data suggest they recognize different bacteria and interact with different co-receptors. Although the peptidoglycan binding site is conserved, the comparison of PGRP-SD and PGRP-SA structures reveals some differences, especially in the surface charge distribution. Furthermore, the analysis of surface residues highlights two regions: one that is not conserved between the two receptors and probably interacts with co-receptors, the other, a hydrophobic crevice that is highly conserved across the PGRP family

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Levy, Francine. "Analyse de la réponse immunitaire de la drosophile par une approche protéomique". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2005/LEVY_Francine_2005.pdf.

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Abstract (sommario):

Grâce au séquençage du génome de la drosophile en mars 2000, les analyses post-génomiques sur cet insecte ont connu un essor exceptionnel. L'étude de l'expression des gènes et de leurs produits peut être abordée soit en mesurant le niveau quantitatif des ARN messagers (transcriptomique), soit en étudiant directement les peptides/protéines présents à un instant donné (peptidomique/protéomique). Ces deux approches sont complémentaires, cependant seule la seconde permet d'étudier les modifications post-traductionnelles, jouant un rôle essentiel dans la fonctionnalité des protéines, ou encore les interactions au sein de complexes multiprotéiques fonctionnels. Au cours de ma thèse, j'ai mis en place une stratégie d'étude protéomique afin d'analyser les protéines de l'hémolymphe de drosophile contrôles ou infectées expérimentalement. Pour cela, deux techniques ont été utilisées : la première est basée sur l'électrophorèse bidimensionnelle, et la seconde sur le marquage différentiel isotopique des échantillons. En comparant les profils protéiques de l'hémolymphe des drosophiles avant et après infection, j'ai mis en évidence et identifié de nombreuses molécules dont la concentration relative varie significativement suite à l'infection. Certaines correspondent à des protéases ou des inhibiteurs de protéase, d'autres à des protéines sensorielles, des molécules antioxydantes, des protéines de liaison aux lipides, au calcium et au fer. Les résultats obtenus ont permis de mettre en évidence de nouveaux candidats dont l'implication dans la réponse immunitaire était insoupçonnée jusqu'alors. L'analyse protéomique globale réalisée au cours de ma thèse nous a ainsi permis d'ouvrir de nouvelles perspectives pour aborder l'étude des mécanismes de défense de la drosophile
Sequencing of the genome of the insect model, Drosophila melanogaster, which was completed in 2000, gave a great impetus to post-genomic studies. Investigation of gene and gene product expression can be achieved by transcriptomic and peptidomic/proteomic analyses. These approaches are complementary, however, only the latter allows the study of post-translational modifications, which play an important role in protein functionality, or interactions within protein complexes. Improvements in advanced techniques and bioinformatics provide new tools to characterize proteins involved in physiological processes, such as the immune response of Drosophila. Profiling of the proteins present in the hemolymph of noninfected flies versus flies infected by various microorganisms, was realized by two-dimensional gel electrophoresis and differential isotope labelling of samples. Through this differential analysis, various families of molecules were found to be regulated after the infection. Among them, I identified proteases, protease inhibitors, odorant binding proteins and molecules involved in the binding of lipids, calcium or iron. These molecules are thus new candidates for the further detailed investigation of innate immune mechanisms. In summary, this differential proteomic analysis of the immune response of Drosophila, provides new prospects for the study of proteins regulated during innate immunity

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Michel, Tatiana. "Rôle des protéines de reconnaissance du peptidoglycane (PGRPs) dans la réponse immunitaire de la drosophile". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2003. http://www.theses.fr/2003STR13107.

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Bischoff, Vincent. "Rôle des PGRPs dans l'activation et dans le contrôle de la réponse immunitaire de Drosophila melanogaster". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2006. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2006/BISCHOFF_Vincent_2006.pdf.

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Abstract (sommario):

Cette thèse porte sur le rôle des PeptidoGlycan Recognition Proteins au cours de la réponse immunitaire innée de la drosophile. Mes résultats démontrent que PGRP-SD coopère avec PGRP-SA et GNBP-1 dans la reconnaissance des bactéries à Gram-positif et l’activation de la voie immune Toll, contrôlant l’induction de certains peptides antimicrobiens. J’ai ensuite démontré que PGRP-SC1 et SC2, qui ont une activité enzymatique amidase, régulent activement la voie IMD. En dégradant le peptidoglycane, ces amidases diminuent en effet son pouvoir immuno-stimulateur. L’absence de contrôle de la réponse immunitaire à des effets développementaux, probablement liés à l’augmentation de l’apoptose. Un travail préliminaire sur PGRP-LF, indique que cette protéine fonctionne comme régulateur négatif des voies IMD et JNK. PGRP-LF agit en l’absence et en présence d’une infection, en limitant l’activation de ces deux voies de signalisation au cours du développement.

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Chazara, Trokiner Olympe. "Diversité génétique structurale et fonctionnelle du CMH chez le Poulet : Implication pour la résistance aux maladies". Phd thesis, AgroParisTech, 2010. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00601989.

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Abstract (sommario):

Le complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) est une région génomique complexe des Vertébrés, encore imparfaitement connue chez le poulet, qui présente à certains locus une très grande variabilité génétique et qui joue un rôle central dans l'organisation de la réponse immunitaire d'un animal aux pathologies infectieuses. Le CMH est également une région de choix pour étudier le déterminisme génétique de l'adaptation aux agents pathogènes dans un contexte évolutif. De plus une meilleure connaissance du déterminisme génétique de la réponse immunitaire contre les agents pathogènes est un atout important pour développer une stratégie globale de lutte contre les maladies infectieuses. Nous avons donc entrepris d'utiliser les récents outils de la génomique, notamment des marqueurs génétiques de type SNP (Single Nucleotide Polymorphism) afin de caractériser la région B du CMH du poulet. En premier lieu, la diversité génétique a été évaluée dans plus de 80 races ou populations en utilisant le marqueur LEI0258. Ensuite, afin de couvrir l'ensemble de la région à l'aide de marqueurs SNPs, nous avons choisi d'identifier ces polymorphismes par reséquençage de 11 gènes d'intérêt et par comparaison des séquences obtenues entre elles et avec la séquence du génome et les séquences de référence disponibles dans les bases de données. En parallèle, ces travaux ont également permis d'améliorer la connaissance de certains gènes, notamment trois gènes de classe II non classiques de type DM. Une puce de 96 SNPs dédiée à la région B du CMH du poulet a été produite et devrait rapidement permettre d'exploiter des études d'infections expérimentales réalisées à l'INRA.

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Richard, Manon. "Clusters de gènes de résistance aux maladies chez le haricot commun : bases moléculaires, régulation et évolution". Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA112401.

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Abstract (sommario):

Le haricot commun est la légumineuse à graine la plus consommée au monde en alimentation humaine. Le génome du haricot possède plusieurs énormes clusters de gènes de résistance (R) qui ont la particularité de se cartographier en extrémité de groupes de liaison. Le génome du haricot commun (génotype Andin G19833) a été récemment séquencé et nous avons participé à ce projet en annotant la famille des NB-LRR (NL), classe prépondérante des gènes de résistance. Ces données génomiques nous ont permis de réaliser les 3 études suivantes. (i) L’identification des bases moléculaires de Co-x un gène R vis-à-vis d’une souche très virulente de C. lindemuthianum chez JaloEEP558 a été initiée. La cartographie fine de Co-x suivie du séquençage de la région cible chez JaloEEP558 (Co-x) a permis d’identifier un gène candidat codant une kinase atypique qui pourrait être la cible d’un effecteur fongique, gardée par un gène R. (ii) Des études récentes ont mis en évidence l’implication de petits ARNs (miRNAs induisant la production de phased siRNAs) dans la régulation de l’expression des NL. Le séquençage et l’analyse de banques de sRNAs de haricot nous ont permis d’identifier ce mécanisme et de mettre le doigt sur un nouveau mécanisme de régulation des NL impliquant des sRNAs de 24 nt. (iii) Des ADN satellites ont été étudiés à l’échelle du génome du haricot. L’étude des centromères de haricot a permis de mettre en évidence l’existence de 2 ADN satellites différents, Nazca et CentPv2. Nous avons également étudié un ADN satellite subtélomérique khipu précédemment identifié au niveau de 2 clusters de gènes R du haricot. L’étude de khipu à l’échelle du génome suggère l’existence d’échanges fréquents de séquences entre subtélomères de chromosomes non homologues. Ces résultats nous ont amenés à proposer que des éléments structuraux et une combinaison de mécanismes de régulation (TGS et PTGS) permettent la prolifération des NL sans effet néfaste pour la plante, conduisant à l’obtention de très gros clusters de NL dans le génome du haricot
Common bean is the main source of protein for human consumption in many developing countries. Several huge disease resistance (R) gene clusters have been mapped at the end of common bean linkage groups. The common bean genome (Andean genotype G19833) has recently been sequenced. Access to the complete genome sequence of common bean allowed us to annotate the Nucleotide Binding-Leucine Rich Repeat (NL) encoding gene family, the prevalent class of disease R genes in plants, and to perform the 3 following studies: (i) We have investigated the molecular basis of Co-x, an anthracnose R gene to a highly virulent strain of C. lindemuthianum, previously identified in the Andean cultivar JaloEEP558. Fine mapping of Co-x and sequencing of the target region in JaloEEP558, allowed us to identify a candidate gene encoding an atypical kinase. We hypothesised that this atypical kinase is a fungal effector target. (ii) Several recent studies have highlighted the role of small RNA (miRNAs that triggered phased siRNAs production) in the regulating of NL gene expression. Analyses of small RNAs libraries of common bean led to the identification of this mechanism in common bean and also allowed us to propose a new NL regulation pathway involving 24 nt sRNAs. (iii) We have studied centromeric and subtelomeric satellite DNAs at common bean genome level. We have identified 2 different satellite DNAs in common bean centromeres, Nazca and CentPv2. We have also conducted the analyze of the subtelomeric satellite khipu, previously identified in common bean R clusters and confirmed that frequent sequence exchange occurs between non-homologous chromosome ends in common bean genome. Together, these results led us to propose that both structural elements and a combination of regulatory mechanisms (TGS, PTGS) allow the amplification of NL sequences without detrimental effect for the plant leading to the large NL clusters observed in common bean

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Chazara, Olympe. "Diversité génétique structurale et fonctionnelle du CMH chez le Poulet : implication pour la résistance aux maladies". AgroParisTech, 2010. https://pastel.hal.science/index.php?halsid=35l606vho81sjdsfhrtdi0bke1&view_this_doc=pastel-00601989&version=1.

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Abstract (sommario):

Le complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) est une région génomique complexe des Vertébrés, encore imparfaitement connue chez le poulet, qui présente à certains locus une très grande variabilité génétique et qui joue un rôle central dans l'organisation de la réponse immunitaire d'un animal aux pathologies infectieuses. Le CMH est également une région de choix pour étudier le déterminisme génétique de l'adaptation aux agents pathogènes dans un contexte évolutif. De plus une meilleure connaissance du déterminisme génétique de la réponse immunitaire contre les agents pathogènes est un atout important pour développer une stratégie globale de lutte contre les maladies infectieuses. Nous avons donc entrepris d'utiliser les récents outils de la génomique, notamment des marqueurs génétiques de type SNP (Single Nucleotide Polymorphism) afin de caractériser la région B du CMH du poulet. En premier lieu, la diversité génétique a été évaluée dans plus de 80 races ou populations en utilisant le marqueur LEI0258. Ensuite, afin de couvrir l'ensemble de la région à l'aide de marqueurs SNPs, nous avons choisi d'identifier ces polymorphismes par reséquençage de 11 gènes d'intérêt et par comparaison des séquences obtenues entre elles et avec la séquence du génome et les séquences de référence disponibles dans les bases de données. En parallèle, ces travaux ont également permis d'améliorer la connaissance de certains gènes, notamment trois gènes de classe II non classiques de type DM. Une puce de 96 SNPs dédiée à la région B du CMH du poulet a été produite et devrait rapidement permettre d'exploiter des études d'infections expérimentales réalisées à l'INRA
The major histocompatibility complex (MHC) is a complex genomic region in Vertebrates, still imperfectly known in the chicken and which shows a great genetic variability. The MHC is also an interesting region for studying the genetic determinism of adaptation to pathogens in an evolutionary context. Moreover, the MHC plays a central role in the immune response of an animal to infectious diseases, while a better understanding of the genetic determinism of the immune response against pathogens is important for developing a comprehensive strategy to fight against infectious diseases. We therefore used recent tools of genomics, including genetic markers such as SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) to characterize the B region of the chicken MHC. First, genetic diversity has been evaluated in more than 80 breeds or populations with the LEI0258 marker. Then, to cover the entire region using SNP markers, we chose to identify these polymorphisms by resequencing 11 genes of interest and comparing the sequences obtained with the genome sequence and reference sequences available in databases. It also led to the improvement of the knowledge of a number of genes, including three DM-like non-classical class II genes. A 96 SNPs chip, dedicated to the B region of the chicken MHC, has been produced and will soon provide the genotypes of a number of infectious challenge studies conducted at INRA

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Abi, Khattar Ziad. "Impact de la résistance aux peptides antimicrobiens et aux composés toxiques sur les interactions bactéries-insectes : cas des infections par Photorhabdus luminescens et Bacillus cereus". Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20202.

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Abstract (sommario):

Les peptides antimicrobiens (PAMs) sont les principaux effecteurs de la réponse immunitaire humorale des insectes. Les entérobactéries des genres Photorhabdus et Xenorhabdus et les bacilles à Gram-positif Bacillus cereus et Bacillus thuringiensis sont capables d'infecter et tuer de nombreux insectes à l'état larvaire. Ceci suggère qu'ils développent des stratégies de résistance à ces peptides. L'objectif de ce travail a été d'identifier les gènes qui confèrent la résistance aux PAMs chez P. Luminescens et B. Cereus et d'étudier leur rôle dans l'infection chez les insectes. Dans un premier temps, nous avons démontré que la résistance in vitro aux PAMs des souches de Xenorhabdus n'est pas corrélée à leur virulence chez les insectes contrairement à celle de P. Luminescens et B. Thuringiensis. Chez P. Luminescens, nous avons identifié le gène msbB (lpxM) qui code une acétyltransférase impliquée dans l'acylation secondaire du lipide A du lipopolysaccharide. L'expression hétérologue de msbB de P. Luminescens chez un mutant lpxM de Klebsiella pneumoniae sensible aux PAMs complémente la résistance de ce mutant aux PAMs. En parallèle, nous avons étudié le rôle de la pompe à efflux MdtABC de P. Luminescens durant le processus infectieux. La délétion du gène mdtA de P. Luminescens a montré que ce gène n'est essentiel ni à la résistance à divers agents antimicrobiens (dont les PAMs) ni à la virulence chez les insectes. En utilisant une souche de TT01 contenant une fusion transcriptionnelle entre le promoteur du gène mdtA et le gène rapporteur codant la GFP (Green Fluorescent Protein), nous avons montré que l'expression des gènes mdtABC n'est pas constitutive in vitro mais qu'elle est significativement induite par le cuivre. Néanmoins, cet opéron est fortement induit après culture dans des surnageants de cultures bactériennes en phase stationnaire et durant les phases tardives de l'infection chez les insectes. Cette forte induction est observée exclusivement au niveau des bactéries qui colonisent les matrices extracellulaires de l'organe hématopoïétique de Locusta migratoria et du tube digestif de Spodoptera littoralis. Pour la première fois chez une bactérie entomopathogène, nous avons mis en évidence un signal spécifique d'un tissu de l'insecte induisant l'expression de gènes bactériens durant l'infection. Enfin, nous avons étudié le locus dlt de B. Cereus impliqué dans la D-alanylation des acides téchoïques chez les bactéries à Gram-positif et dont une région similaire est retrouvée chez P. Luminescens. Nous avons démontré qu'un mutant de l'opéron dlt de B. Cereus est fortement sensible in vitro à l'action des PAMs cationiques dont ceux de l'immunité innée des insectes tels que le lysozyme et un PAM inductible la cécropine B de Spodoptera frugiperda. Ce mutant est également avirulent par injection intrahémocoelique chez les insectes. Ces derniers résultats illustrent bien la corrélation entre la résistance aux PAMs et la virulence chez les bactéries entomopathogènes
Antimicrobial peptides (AMPs) are the major effectors of insect humoral immune response. Enterobacteria of the genera Photorhabdus and Xenorhabdus as well as the Gram-positive bacilli Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis are able to infect and to kill many insects at larval stage. That suggests that bacteria develop mechanisms of resistance to these AMPs. The goal of this study was to identify genes that confer resistance to AMPs in P. Luminescens and B. Cereus and to study their role in insect infections. In this study, we first demonstrated that in vitro AMP resistance of Xenorhabdus strains is not correlated with their virulence in insects unlike P. Luminescens and B. Thuringiensis strains. In P. Luminescens, we identified the msbB (lpxM) gene which encodes an acetyltransferase involved in the secondary acylation of lipid A moiety of the Lipopolysaccharide. The heterologous expression of P. Luminescens msbB gene in the AMP sensitive Klebsiella pneumoniae lpxM mutant restores AMP resistance to the wild-type levels. In addition, we addressed the role of P. Luminescens MdtABC efflux pump during the infection process. Inactivation of P. Luminescens mdtA gene allowed us to show that this gene is neither essential for in vitro resistance to various antimicrobial agents (including AMPs) nor for virulence in insects. Using a strain of P. Luminescens harbouring a transcriptional fusion of the mdtA gene promoter with a reporter gene encoding the Green Fluorescent Protein (GFP), we showed that in vitro mdtABC operon expression is not constitutive but it is significantly induced by copper. Nevertheless, this operon is highly induced in supernatants from stationary phase bacterial cultures as well as during late stages of insect infection. This strong mdtABC induction was only observed within bacteria colonizing the extracellular matrixes of Locusta migratoria hematopoietic organ and Spodoptera littoralis gut. For the first time in entomopathogenic bacteria, we identified a specific signal from an insect tissue that induces bacterial gene expression during infection. Finally, we studied the dlt locus of B. Cereus which is involved in teichoic acid D-alanylation in Gram-positive bacteria. A similar dlt region was also found in P. Luminescens. We have shown that a B. Cereus dlt operon mutant is highly sensitive to the in vitro action of AMPs including those of insect innate immunity such as lysozyme and the inducible AMP cecropin B of Spodoptera frugiperda. This mutant was also avirulent after intrahemocoelic injection within insects. These results illustrate the correlation between AMP resistance and virulence in entomopathogenic bacteria

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Vézilier, Julien. "Résistance aux insecticides et transmission de la malaria chez le moustique Culex pipiens". Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20038.

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Abstract (sommario):

L'évolution de la résistance aux insecticides chez les moustiques responsables de la transmission de maladies infectieuses compromet notre capacité à contrôler ces populations de vecteurs et pose de graves problèmes de santé publique. Mais les nombreuses modifications physiologiques associées au phénomène de résistance aux insecticides pourraient altérer l'épidémiologie de ces maladies de manière plus indirecte en modifiant la capacité vectorielle des moustiques. Afin d'étudier cette question nous avons mis en place un nouveau système expérimental composé du parasite aviaire Plasmodium relictum SGS1 et de son vecteur naturel le moustique Culex pipiens. Nous avons étudié l'effet de différents allèles de résistance aux insecticides (représentant deux mécanismes principaux i.e. la résistance métabolique ou la modification de la cible) sur une série de traits d'histoire de vie du parasite et du moustique. L'impact de ces différents allèles a été étudié d'une part, dans les conditions contrôlées de leur expression dans un même fond génétique (en utilisant plusieurs souches de moustiques isogéniques), et d'autre part, dans les conditions plus réalistes de leur expression dans un fond génétique hétérogène (utilisation de moustiques échantillonnés sur le terrain). Nous montrons que la résistance aux insecticides a des effets pleïotropes sur l'immunocompétence et les traits d'histoire de vie des moustiques. Son effet sur le développement de Plasmodium semble en revanche limité. Nous discutons d'une part, de la nécessité de poursuivre une approche multifactorielle (impliquant la physiologie, l'immunité et le comportement des moustiques) afin de mieux comprendre l'impact de la résistance aux insecticides sur la transmission de Plasmodium, et d'autre part des perspectives intéressantes qu'offrent ce nouveau système expérimental pour l'étude de l'écologie évolutive des maladies à vecteurs
The evolution of insecticide resistance in mosquitoes threatens our ability to control many-vector-transmitted diseases, thereby raising serious public health issues. Insecticide resistance entails numerous physiological changes in mosquitoes. This thesis investigates whether these physiological changes alter the quality of mosquitoes as vectors of malaria. To address this issue, we developed a new experimental system consisting in the avian malaria parasite Plasmodium relictum SGS1 and its natural vector, the mosquito Culex pipiens. We investigated the impact of two insecticide resistance mechanisms (target site resistance and metabolic resistance) on several mosquito and parasite life history traits relevant for malaria transmission. The effect of different insecticide resistant genes was investigated using both isogenic laboratory mosquito strains (i.e. against a homogeneous genetic background) and sympatric field caught mosquitoes (i.e. under the more realistic, albeit noisier, conditions of a heterogeneous genetic background). We show that insecticide resistance has a pleiotropic effect on several mosquito traits (immunocompetence, longevity, fecundity), whereas it has only a limited effect on Plasmodium development. We discuss, on the one hand, the need to pursue such a multi-factorial approach (combining the mosquito physiology, immunity and behavior) to better understand the impact of insecticide resistance on malaria transmission and, on the other hand, the promising perspectives offered by this new experimental system for studying the evolutionary-ecology of infectious diseases

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Charles, Marie Thérèse. "Bases physiologiques de la résistance aux maladies post-récolte induite par les rayons UV chez la tomate". Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp03/NQ51252.pdf.

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Meaux, Juliette de. "Polymorphisme moléculaire relatif à la résistance aux maladies dans les populations naturelles de haricot commun (Phaseolus vulgaris)". Paris 11, 2002. http://www.theses.fr/2002PA112001.

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Abstract (sommario):

La dissection moléculaire de la diversité aux loci complexes de gènes de résistance chez les plantes suggère que des pressions de sélection pourraient avoir contribué à leur évolution. Chez le haricot commun (Phaseolus vulgaris) 2 familles multigéniques de Gènes de Résistance Candidats (RGCs) ont été identifiées. L'une d'entre elles est une famille très complexe présentant un grand nombre de membres. Afin d'appréhender les forces évolutives qui ont contribué à leur évolution, la diversité RFLP présentée par ces deux familles de RGCs a été étudiée dans des populations naturelles de haricot commun échantillonnées dans différentes régions et différents pays. La diversité des populations étudiées à été antérieurement caractérisée pour des marqueurs neutres et pour des phénotypes de résistance à des souches de Colletotrichum lindemuthianum, l'un des agents pathogènes principaux du haricot. .
Molecular analysis of diversity at complex resistance gene loci suggest that selection could have contributed to their organisation. In common bean (Phaseolus vulgaris) two multigenic families of Resistance Gene Candidates (RGCs) have been identified, among which one shows a greater complexity with more numerous members than the other. In an attempt to bring insight into the question of the evolutionary forces which may have shaped their evolution, RFLP polymorphism for these 2 gene families was assessed in wild populations sampled across several regions. The populations had been previously assessed for diversity at neutral loci (RAPD) and diversity for resistance phenotypes to strains of Colletotrichum lindemuthianum, one of the major pathogen of bean. RGC polymorphism was detected for both gene families both within and among populations, at all geographical scales. The analysis of diversity shown by the less complex of the two families indicates that copy number polymorphism may be found at all geographical scales. .

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Waldschmidt, Ingrid. "Effet de l’effort, l’entrainement et l’inflammation sur l’immunité innée des voies respiratoires profondes du Trotteur Français". Caen, 2013. http://www.theses.fr/2013CAEN2095.

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Abstract (sommario):

Les chevaux athlètes sont couramment atteints d’affections respiratoires, touchant principalement les voies respiratoires profondes et à l’origine de contre-performance. Malgré la fréquence de ces affections, les mécanismes impliqués restent méconnus même si le lien entre l’inflammation respiratoire et l’immunité semble incontestable. Les pistes de recherche sont néanmoins nombreuses et les connaissances sur l’étiologie de ces affections nécessitent d’être améliorées. L’objectif global de cette thèse est de mieux comprendre l’impact de l’effort, l’entrainement et l’inflammation sur l’immunité innée respiratoire pulmonaire. Pour cela, la première partie de ce travail a consisté à établir un modèle expérimental d’évaluation de l’immunité innée pulmonaire du cheval, notamment un modèle de stimulation des TLR, récepteurs impliqués dans la reconnaissance des motifs pathogènes. Les macrophages alvéolaires ont été isolés des lavages broncho-alvéolaires des chevaux par adhésion et les conditions de stimulation des TLR 2/6, 3 et 4 ont été mises au point par PCR. La production de cytokines par les macrophages alvéolaires a été quantifiée par ELISA et l’expression des TLR par PCR. Ce modèle expérimental est utilisable dans divers conditions physiologiques ou pathologiques afin d’évaluer la capacité des macrophages alvéolaires à identifier des motifs pathogènes ex vivo. Ce modèle expérimental a été utilisé dans la seconde étape de ce travail afin d’évaluer l’effet de l’effort et l’entrainement sur l’immunité innée respiratoire des chevaux en suivi longitudinal. Un lot de 8 chevaux expérimentaux a été entrainé et des prélèvements respiratoires ont été réalisés à des étapes clés du protocole. Les macrophages alvéolaires ont été isolés et leur réponse immune évaluée selon le protocole préalablement défini. Les résultats de cette étude ont montré un effet modeste de l’effort ponctuel et un effet néfaste et durable de l’entrainement sur l’immunité innée respiratoire, notamment une immunosuppression anti-virale et anti-bactérienne. L’effet de l’inflammation a été évalué sur un lot de chevaux de terrain, souffrant d’affections respiratoires (IAD et infection bactérienne) en utilisant ce même modèle d’évaluation de l’immunité innée respiratoire. Les résultats de cette étude ont montré que la réponse des macrophages alvéolaires de chevaux atteint d’IAD n’est pas significativement différente de celle de chevaux sains tandis la réponse des cellules à la stimulation du TLR 4 est augmentée chez les chevaux atteints d’affections respiratoires. Cependant le nombre réduit de chevaux inclus dans l’étude nous oblige à rester prudent dans l’interprétation de ces résultats. Pour conclure, la réalisation de ces travaux a permis d’établir un modèle expérimental permettant d’évaluer la réponse immunitaire des macrophages alvéolaires face à des mimétiques de pathogènes. L’utilisation de ce modèle a permis de mettre en évidence l’impact négatif de l’entrainement sur l’immunité anti-virale et anti-bactérienne, expliquant en partie la plus grande susceptibilité des chevaux athlètes aux affections pulmonaires durant ces périodes. L’étiologie de l’IAD reste encore floue, des études complémentaires utilisant un effectif plus élevé de chevaux seraient nécessaires pour compléter nos résultats
Lower airway diseases are a common problem in sport and racing horses. Because the innate immunity plays an essential role in lung defense mechanisms against pathogens, we aimed to assess the effect of acute exercise, training and inflammation on pulmonary innate immune responses. In the first step of these PhD research, we evaluate an experimental model to assess equine pulmonary innate immune response which could be used in several conditions. Alveolar macrophages were isolated from broncho-alveolar lavages using an adhesion method and stimulated by TLR 2/6, 3 and 4 agonists. TLR are receptors able to recognize pathogen associated molecular patterns and to induce an immune response. Best conditions of alveolar macrophages stimulations were selected using PCR method. Evaluation of alveolar macrophages response to TLR ligands was performed by measurement of cytokine production in culture supernatants by ELISA. TLR relative expression was quantified by PCR. This experimental model was used in the second step of this work to evaluate the effect of strenuous exercise and training on respiratory innate immunity of horses. A longitudinal study was organized using eight young standardbred horses. Horses were trained and respiratory samplings were performed at different step of the protocol. Results of this study show a moderate effect of strenuous exercise and a negative and prolonged effect of training on alveolar macrophage response against viruses and bacteria. Effect of respiratory inflammation was assessed on owner horses presented at Cirale for respiratory affections. Pulmonary innate immunity was evaluated using the experimental model and compared between healthy horses and horses suffering of IAD and bacterial infection. Results show that alveolar macrophage response of IAD horses was not different from those of healthy horses. Alveolar macrophage response to TLR 4 stimulation was higher in bacterial infection group than in healthy group but the low number of horses included in each group need to take these results with caution. To conclude, this PhD research provides an experimental model to evaluate the ability of alveolar macrophages to recognize pathogens and initiate an immune response. The effect of strenuous exercise and training was assessed using this experimental model and show the negative impact of training on viral and bacterial immunity, which partly explain the high sensitivity of horses to respiratory affections during training periods. Molecular mechanisms involved in IAD stay unknown; complementary studies including higher number of horses should be required to complete these data

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Ballimi, Elsa. "Etude des interactions riz-Magnaporthe oryzae. Diversité, origine et évolution du locus du gène de résistance Pi33". Montpellier, ENSA, 2007. http://www.theses.fr/2007ENSA0035.

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Abstract (sommario):

La reconnaissance spécifique d’un agent pathogène suit souvent la théorie gène-pour-gène. Ne revue de la littérature à permis de mettre en évidence que 85 gènes et 347 QTL de résistance à M. Oryzae ont été cartographiés. Le produit du gène d’avirulence ACE1 présente l’originalité de ne pas être sécrété. Il se peut donc que le gène de résistance correspondant, Pi33, révèle un mécanisme de résistance original. Nous avons mis en évidence la présence du gène de résistance Pi33 à une fréquence élevée dans les riz cultivés indica. L’utilisation de couples de souches isogéniques a également permis de mettre en évidence Pi33 chez des espèces de riz sauvages. Ces résultats sont en faveur d’une origine ancienne de Pi33. En outre, l’introgression de Pi33 dans la variété IR64 à partir d’une accession de l’espèce sauvage O. Rufipogon a été caractérisée. De plus, une cartographie physique du locus de Pi33 a été réalisée dans une variété résistante. L’étude comparée des séquences de ce locus dans 3 variétés confirme son évolution complexe. Ainsi, 3 gènes candidats de type NBS-LRR ont été identifiés chez une variété sensible contre 7 chez une variété résistante. Le polymorphisme et l’expression des différents gènes candidats ont été caractérisés chez différentes variétés. Cette approche a permis de cibler 3 des NBS-LRR comme les candidats possibles pour Pi33. Différentes stratégies de clonage ont également été initiées ce qui a permis entre autre l’identification de 20 lignées mutantes pour lesquelles une caractérisation fonctionnelle de Pi33 est envisagée. Enfin, l’originalité de l’interaction ACE1/Pi33 pourrait se traduire par une originalité des réactions de défense. L’expression de gènes marqueurs de ces réactions a ainsi été comparée entre différentes interactions incompatibles et compatibles faisant intervenir ou non Pi33. Ces résultats semblent indiquer que même au sein de fonds génétiques différents, Pi33 entraînerait un profil d’expression conservé des gènes de défense
The specific recognition of the pathogen follows the gene-for-gene theory. A review of the literature allowed to show that 85 genes and 347 QTLs of resistance to Magnaporthe oryzae have already been mapped. The product of the avirulence gene ACE1 of M. Oryzae is original because it is not secreted. Consequently, the resistance gene corresponding to ACE1, Pi33, could reveal a resistance mechanism different from those already known. During this work, the presence of the resistance gene Pi33 was detected at a high frequency in the domesticated rice subspecies indica. Using couples of isogenic strains, Pi33 was also identified in some accessions of wild rice species, suggesting an ancient origin of Pi33. Moreover, we characterized the introgression of Pi33 from an accession of the wild species O. Rufipogon in the variety IR64. In addition, we constructed a physical map of the Pi33 locus in a resistant variety. A partial sequence of the locus in this resistant variety was obtained and compared with the sequence of two susceptible varieties. The comparative study of the locus in 3 varieties confirmed a complex evolution of the locus. 3 NBS-LRR candidate genes were identified in the susceptible variety Nipponbare and 7 in the resistant variety IR64. Sequence polymorphism and level of expression of various candidate genes was characterized in different varieties. Although this approach did not allow identifying Pi33, the identification of 20 mutant lines for Pi33 will allow a functional analysis of the gene. Cloning Pi33 was attempted by different approaches (mutants, complementation). This work is still in progress. Finally, because the originality of the interaction ACE1/Pi33 could result in an original regulation pathway, the expression of marker genes was compared between different incompatible and compatible interactions involving Pi33 or not. These results suggest that even within different genetic backgrounds, Pi33 contributes to a conserved defence pathway

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Ferrero, Frédéric. "Approche physio-pathologique et exploitation génétique de l'expression de la résistance à l'oïdium (sphaerotheca pannosa lev. , var. Rosae) dans le genre Rosa". Avignon, 2005. http://www.theses.fr/2005AVIG0314.

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Abstract (sommario):

L'oïdium du rosier est une maladie fongique foliaire, à lourdes conséquences économiques, provoquée par Sphaerotheca pannosa var. Rosae qui se développe sur l'hôte sans entraîner sa mort. Ce travail de thèse rapporte une étude en 4 étapes des relations hôte-parasite : 1- L'évaluation de l'expression des symptômes d'oïdium, dans une collection d'espèces botaniques et une de rosiers modernes. Elle a permis d'identifier des génotypes résistants. 2- Un programme de croisements pour évaluer la transmission de la résistance et les aptitudes à la combinaison. L'observation des ségrégations, sur les descendances d'un plan de croisement diallèle entre espèces 2x, a confirmé que le caractère de résistance était gouverné par plusieurs gènes. La démarche d'introgression de résistance, via un dihaploïde 2x de rosier moderne 4x, croisé avec R. Wichuraïana 2x, suivie de croisements frères–sœurs, s'est imposée pour fixer le caractère. 3- La recherche d'outils de criblage. Celle-ci a conduit à un test biologique d'évaluation de la résistance à l'oïdium et à des méthodes d'isolation et de maintien d'inoculum monoconidial. 4- L'étude de l'installation de la cuticule foliaire et de son efficience suivant : génotype, âge de l'organe et conditions d'environnement. Une méthodologie a été établie pour moduler l'installation de la cuticule sur des plantules issues d'in vitro. L'évapotranspiration cuticulaire de génotypes résistants a été mesurée inférieure à celle de sensibles. Enfin, une nutrition élevée en calcium activerait l'installation de la cuticule. En conclusion, l'ensemble de ces résultats contribue à la connaissance de la maladie et à la définition d'une stratégie pour la sélection du caractère de Résistance à l'oïdium
Powdery mildew of the rose tree induces heavy economic consequences. This disease is due to an external fungus Sphaerotheca pannosa var. Rosae that develops on the host without resulting in his death. This work of thesis points out a study in four steps of the relations host-parasite : 1- the evaluation of the expression of the symptoms of powdery mildew, in two collections, one of botanical species and another of modern rose trees. This approach allowed to identify resistant genotypes. 2- a program of crossings to evaluate the transmission of resistance and abilities for combination. The observation of the segregations, on the progenies from a diallele crossing plan between diploid species, confirmed that the character of resistance was controlled by several genes. The process for introgression of resistance, via a dihaploïd (2x) of modern rose tree (4x) cross with R. Wichuraïana (2x) followed with serial brother-sister crossings revealed as essential to fix the character. 3- the search for tools of sifting. This one led to a biological test of evaluation of resistance to powdery mildew and to methods for the isolation of the inoculum and following for the obtainment of mono-conidial isolates. 4- the study of the installation of the foliar cuticle and its efficiency according to : genotype, age of the organ and environmental conditions. A process was established to modulate the installation of the cuticle on plantlets resulting from in vitro. The cuticular evapotranspiration of resistant genotypes was measured lower than that of sensitive. At last, high calcium level in the nutrition of rose tree would activate the biosynthesis of the cuticle. In conclusion, the whole of these results contributes to the knowledge of the disease and to the definition of a strategy for the selection of the character of Resistance to powdery mildew

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Bouanani, Majida. "Immunité et autoimmunité humorale dans le modèle de la thyroglobuline humaine : profils de spécificité épitopique des autoanticorps dans différentes situations physiopathologiques". Montpellier 1, 1990. http://www.theses.fr/1990MON13522.

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Texereau, Joëlle. "Variabilités génétiques de l'immunité innée pulmonaire dans le risque infectieux : application à la mucoviscidose". Paris 12, 2006. http://www.theses.fr/2006PA120013.

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Abstract (sommario):

La mucoviscidose est une maladie génétique fréquente et incurable. Sa physiopathologie est imparfaitement comprise, surtout celle de l'atteinte pulmonaire qui conditionne le pronostic. Nous avons étudié le rôle potentiellement modificateur du phénotype de polymorphismes génétiques touchantla voie du monoxyde d'azote (NO) et les recepteurs Toll-like (TLRs). Un polymorphisme microsatellite du gène NOS1 a été associé à de fortes concentrations de NO expiré et à une fonction respiratoire préservée chez l'adulte atteint de mucoviscidose. L'absence de TLR2 et TLR4 était délétère pour les fonctions de défense antibactérienne du macrophage alvéolaire. Les patients proteurs du polymorphisme tlr2-753R[vers]Q, associé à une perte de la réponse cellulaire à l'infection, avaient un risque 4 fois plus élevé de colonisation bronchique chronique. Inversement, le polymorphisme tlr4-299D[vers]G, qui diminue la réponse inflammatoire, était associé à une fonction pulmonaire préservée et un meilleur pronostic
Cystic fibrosis is a frequent life-threatening disorder. Despite identification of the genetic defect, disease physiopathology remains unclear, especially for pulmonary involvement that conditions prognosis. Role of genetic background is suspected. Potential influence of genetic polymorphysms in nitric oxide (NO) pathway and pathogen recognition Toll-like receptors (TLRs) was studied. A repeat polymorphism within the regulatory region of the NOS1 gene was associated with high airway NO production and better lung function in adults with CF. High exhaled NO was linked to preserved transepithelial ion transport. Absence of TLR2 and TLR4 impaired antibacterial roles of alveolar macrophage. The tlr2-753R[to]Q variant allele, which results in aloss of cellular response to CF pathogens, conferred to carriers a fourfold risk of airway infection. By contrast, tlr4-299D[to]G polymorphism, which lowers inflammatory response, was associated with a better lung function and prognosis

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Flori, Laurence. "A la recherche des gènes contrôlant la résistance humaine au paludisme à P. Falciparum : apport des analyses de liaison génétique et d'association allélique avec la parasitémie et le risque d'accès palustre". Aix-Marseille 2, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX22037.

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Briolat, Jenny. "Nouvelles données en neuroimmunoendocrinologie : Effets des rythmes biologiques sur l'activité antibactérienne de l'ubiquitine sécrétée.Caractérisation des propriétés antimicrobiennes de la cateslytine, un peptide multifonctionnel dérivé de la chromogranine A". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. http://www.theses.fr/2005STR13045.

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Abstract (sommario):

La découverte de peptides antimicrobiens (PAMs) dans les granules de sécrétion des cellules chromaffines de la médullo-surrénale a orienté la thématique du laboratoire vers le concept de Neuroimmunologie. Depuis plusieurs années déjà, les recherches réalisées au sein de l’équipe du Dr. Marie-Hélène Metz-Boutigue visent à démontrer que suite à une maturation protéolytique au niveau intragranulaire , les peptides naturels dérivés des chromogranines (CGs), de la proenképhaline-A et de l’ubiquitine, font partie intégrante des facteurs de l’immunité innée. Ces protéines précurseurs et leurs peptides dérivés, qui sont stockés avec les catécholamines dans les granules chromaffines, sont libérés dans la circulation sanguine dans les situations de stress grâce à la mobilisation de l’axe hypothalamo-hypophyso-surrénalien et de la voie sympathique périphérique. L’équipe a pu montré que plusieurs de ces molécules possèdent des propriétés antimicrobiennes sans être toxiques pour les cellules de mammifères. La signification biologique de ces activités a été recherchée par l’examen de leur présence dans de nombreux fluides biologiques impliqués dans les mécanismes de défense (sécrétions de neutrophiles polymorphonucléaires (PMNs), liquides infectieux, drains post-opératoires, liquide céphalo-rachidien, urine, salive, sérum). Les travaux effectués, depuis une dizaine d’années, sur ces peptides ont montré que les activités antimicrobiennes sont modulées, d’une part, par des facteurs structuraux tels que la longueur de la chaîne polypeptidique et la présence de modifications post-traductionnelles qui sont spécifiques du tissu et de l’organisme étudié, et d’autre part, par l’état physiologique de l’organisme (âge, maladie, environnement…). Les recherches, présentées dans ma thèse, visent à analyser les facteurs biologiques capables de moduler l’expression de ces activités antimicrobiennes et à poursuivre la caractérisation de nouveaux peptides. Mes travaux sont articulés autour de deux grandes questions L’expression des peptides antimicrobiens, présents dans la glande surrénale, est-elle sous l’influence des rythmes biologiques ? Pour répondre à cette question, je me suis intéressée à leur expression dans la glande surrénale de hamster en fonction de différents états photopériodiques et hormonaux. Pour cette étude, notre équipe a établi une collaboration avec le laboratoire de Neurobiologie des Rythmes (Dir. Dr. Mireille Masson-Pevet) de l’unité CNRS UMR 7518 à Strasbourg. Parmi les peptides antimicrobiens dérivés des chromogranines, en existait-il un, présentant un spectre d’action plus large et une activité antimicrobienne plus performante que ceux découverts jusqu’à présent ? Pour cette étude, je me suis tout particulièrement intéressée à la catestatine (CGA344-364), un peptide dérivé de la chromogranine A qui présente deux caractéristiques remarquables qui ont retenu notre attention. Premièrement, il s’agit d’une séquence très conservée au cours de l’évolution et deuxièmement, ce peptide possède les propriétés amphipatiques spécifiques des PAMs. Mon premier axe de recherche a clairement montré que la photopériode joue un rôle important sur l’expression des peptides antimicrobiens, présents dans les granules chromaffines, avec un effet très marqué pour l’ubiquitine dont notre laboratoire a caractérisé la localisation intragranulaire. [. . . ]

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Zhang, Dan. "The expression and role of chromogranin A and its derived peptides in septic patients". Strasbourg 1, 2008. http://www.theses.fr/2008STR13063.

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Abstract (sommario):

Les recherches présentées dans ma thèse portent sur l’étude du rôle de la chromogranine A (CGA) et de ses peptides dérivés dans l’immunité innée. Dans la partie de recherche clinique, nous avons montré que la concentration sérique de CGA à l’admission en réanimation augmente chez les patients atteints de sepsis et de SIRS. De plus, elle est un marqueur pronostique indépendant pour les patients admis en réanimation médicale. Dans la partie de recherche fondamentale, nous démontrons par des techniques de cytométrie en flux et d’imagerie calcique que la chromofungine et la catestatine, deux peptides antimicrobiens dérivés de la CGA, provoquent une entrée spécifique de Ca2+ dans les neutrophiles par des mécanismes d’activation d’iPLA2. Nous proposons que ces deux peptides jouent un rôle dans l’activation des neutrophiles. L’ensemble de ces résultats sont importants pour comprendre le rôle biologique de la CGA et de ses peptides dérivés dans l’immunité innée
Research results presented in my thesis concern the role of chromogranine A (CGA) and its derived peptides in the innate immunity. In the clinical research part, we have demonstrated that serum CGA on admission increases significantly in the group of sepsis and SIRS patients. Moreover, it is an independent prognostic marker for medical ICU patients. In the basic research part, we found that chromofungin and catestatin, two CGA derived antimicrobial peptides, can provoke a specific Ca2+ entry on neutrophils via a mechanism involving iPLA2 activation. We proposed that these 2 peptides can play a role in neutrophils activation. All together, our results are important to understand the biological role of CGA derived peptides in the innate immunity

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Poitrineau, Karine. "Evolution de la résistance aux ennemis naturels et intéractions multiples : théorie et système biologique drosophiles-parasitoi͏̈des". Montpellier 2, 2004. http://www.theses.fr/2004MON20016.

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Poumarat, François. "Epidémiologie de l'infection à Mycoplasma bovis chez les bovins en France". Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO11739.

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Allorent, Delphine. "Analyse et modélisation épidémiologique de la tache angulaire du haricot ("Phaseolus vulgaris") due à "Phaeoisariopsis griseola"". Montpellier 2, 2005. http://www.theses.fr/2005MON20041.

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Corbel, Vincent. "Interactions entre insecticides sur "Anopheles gambiae" giles et "Culex quinquefasciatus" say et impact sur l'évolution de la résistance". Montpellier 2, 2003. http://www.theses.fr/2003MON20076.

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Teillet, Florence. "Caractérisation fonctionnelle structurale de la protease MASP-3 associée à la MBL et aux ficolines". Grenoble 1, 2006. http://www.theses.fr/2006GRE10118.

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Abstract (sommario):

La voie lectine du complément, élément majeur de la défense innée, est déclenchée par la fixation sur des pathogènes de complexes associant une protéine de reconnaissance oligomérique, MBL ou ficolines, et la protéase MASP-2. MASP-1 et -3, ainsi qu'un fragment tronqué de MASP-2 (MAp19) sont également associés aux protéines de reconnaissance mais leurs fonctions sont inconnues. Le travail porté principalement sur la caractérisation de l'assemblage MBUMASP-3. Il a été montré que les 2 formes oligomériques majeures de lai MBL circulent dans le sérum sous forme trimérique et tétramérique et qu'elles fixent les MASPs de manière comparable avec une stoechiométrie MBL:MASP de 1 :2. Par ailleurs, la structure de la région d'interaction CUB1-EGF-CUB2 de MASP-3 a été résolue à 2,35 A et montre un homodimère disposé de manière tête-bêche dans lequel tous les modules sont localisés dans le même plan. Chaque module EGF possède un site de liaison du Ca2+ stabilisant l'interface du dimère et un 2nd ion Ca2+ est fixé à la partie distale de chaque module CUB1. De plus, un 3ème ion Ca2+, fixé dans chaque module CUB2, stabilise la protéine. La caractérisation de mutants ponctuels a mis en évidence des résidus impliqués dans l'interaction MBUMASP-3: K55 de la MBL et y56, F103, H218 et y225 de MASP-3, ces derniers étant également impliqués dans l'interaction avec les ficolines. Ces résidus définissent 2 sites d'interaction dans les modules CUB1 et CUB2 de chaque monomère stabilisés par un ion Ca2+. Ces sites sont homologues et localisés dans le même plan, ce qui suggère qu'un dimère de MASP-3 interagit avec des sites homologues sur 4 triples hélices de collagène de la MBL ou des ficolines
Oligomeric recognition protein, MBL or ficolins, and the MASP-2 protease. MASP-1 and -3 and a truncated form of MASP-2 (Map19) are also associated to the recognition protein but their function is unknown. The aim of this work was to characterize the MBUMASP-3 complex assembly. We provide evidence that the two major forms of MBL in human serum are trimers and tetramers and bind the MASP and MAp19 in similar ways with a 1:2 stoichiometry. Ln addition, the x-ray structure of the CUB1-EGF-CUB2 interaction domain of MASP was solved and refined to a resolution of 2. 35 À. The structure reveals a head-to-tail homodimer in which ail six modules are located within the same plane. A Ca2+ ion bound to each EGF module stabilizes the dimer interface and a second Ca2+ ion is bound to the distal part of each CUB1 module. Moreover, a third Ca2+ ion is bound to each CUB2 module and stabilizes the protein. Using site-directed mutagenesis, we have identified several residues involved in the interaction between MBL and MASP-3: K55 of MBL and y56, F103, H218 an y225 of MASP-3. These residues are also involved in the interaction with the ficolins. These mutations define two binding sites in the CUB and CUB2 modules of each monomer, both stabilized by Ca2+ ions. The fact that t'Jese sites are homo logo us and located within the same plane strongly suggests that a MASP-3 dimer interacts with homologous interaction sites on 4 collagen triple helices of MBL or ficolins

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Lemanceau, Philippe. "Réceptivité des sols aux fusarioses vasculaires : étude critique des théories proposées". Lyon 1, 1988. http://www.theses.fr/1988LYO19012.

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Derache, Chrystelle. "Rôle de ß-défensines aviaires dans la résistance du poulet à l'infection intestinale à Salmonella Enteritidis". Thesis, Tours, 2009. http://www.theses.fr/2009TOUR4010.

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Abstract (sommario):

Les entérobactéries du genre Salmonella représentent une préoccupation majeure de santé publique car elles sont responsables de la majorité des cas de toxi-infections alimentaires dans le monde. La persistance de Salmonella Enteritidis dans les élevages de volailles, sous forme de portage bactérien intestinal, constitue une source de contamination importante pour les produits alimentaires qui en sont issus. Parmi, les nombreuses solutions mises en place, l’amélioration de l’immunité de la muqueuse digestive des oiseaux faisant barrière à la colonisation bactérienne représente une stratégie de lutte alternative à l’utilisation controversée des antibiotiques. Au cours de la réponse de l’hôte contre l’infection des salmonelles, il avait été montré que les gènes de ß-défensines aviaires, AvBD1 et AvBD2, sont fortement exprimés dans l’intestin des poulets résistants à la colonisation bactérienne. Les ß-défensines sont des peptides cationiques capables de détruire les bactéries mais aussi, chez les mammifères, d’attirer les cellules immunitaires. Dans ce contexte, la compréhension du mode d’action des deux ß-défensines aviaires contre l’infection intestinale des poulets par les salmonelles a constitué l’objectif principal du travail de thèse. Tandis que les AvBD1 et AvBD2 ont été initialement identifiées à partir de cellules hétérophiles, nous avons cherché à savoir si les cellules épithéliales intestinales, constituant la première barrière rencontrée par les bactéries, pouvaient les exprimer. Une procédure de culture primaire de cellules épithéliales intestinales isolées d’embryons d’oiseaux a été développée. Les cellules ont montré les caractéristiques de cellules épithéliales confirmées par l’expression de protéines du cytosquelette. Elles ont été capables d’exprimer les gènes d’AvBD1 et d’AvBD2, avec des taux différents selon la lignée d’animaux dont elles sont issues. De plus, cette expression s’est avérée modulable par les salmonelles qui sont capables d’inhiber l’expression d’AvBD2 dans les cellules épithéliales intestinales de la lignée la plus sensible. En parallèle, nous avons extrait trois ß-défensines aviaires de la moelle osseuse, AvBD1, AvBD2 et AvBD7, afin d’évaluer leur activité antimicrobienne. La séquence primaire de ces trois ß-défensines caractérisée par spectrométrie de masse a permis de mettre en évidence des modifications post-traductionnelles dans la partie C-terminale d’AvBD1 et dans la partie N-terminale d’AvBD7. L’activité antimicrobienne mesurée avec les trois ß-défensines a révélé des activités élevées contre des bactéries Gram + et Gram -, avec cependant une moindre efficacité d’AvBD2 contre les bactéries Gram -. La spécififcité d’AvBD2 contre les Gram + est retrouvée chez la ß-défensine du manchot empereur, AvBD103b de structure tridimensionnelle connue. Nous avons alors cherché à résoudre la structure de la ß-défensine 2 de poulet par résonance magnétique nucléaire afin d’analyser les relations entre la structure et l’activité des peptides AvBD2 et AvBD103b. La comparaison de leurs structures nous a permis de proposer un mode d’action de ces deux ß-défensines et plus particulièrement d’AvBD2. Finalement, l’ensemble des résultats obtenus permet de préciser le rôle des ß-défensines aviaires dans le phénotype de résistance/sensibilité à l’invasion intestinale des salmonelles. Outre leur effet antibactérien qui peut être contrecarré par les salmonelles, il semblerait que ces défensines aviaires puissent participer à d’autres fonctions comme le chimiotactisme permettant le recrutement de cellules immunocompétentes. Le spectre d’activité antibactérienne des ß-défensines aviaires caractérisées ouvre de plus des perspectives d’application thérapeutique dans un domaine où les antibiotiques sont plus que sujets à caution
Salmonella is a bacterial enteropathogen representing the main cause of food poisoning worldwide. Persistence of Salmonella Enteritidis in poultry flocks in the form of intestinal carriage represents an important source of contamination of poultry derived food products. Improving immunity of the mucosal barrier of the bird intestine to fight bacterial colonisation is a strategy alternative to the controversial use of antibiotics. During the study of chicken response to Salmonella infection, it had been shown that avian ß-defensin genes (AvBD1 and 2) were highly expressed in intestinal tissue of birds resistant to Salmonella colonisation. ß-defensins are cationic peptides able to kill bacteria and also, in mammalian species, to attract cells of the animal immune defence. In this context, understanding the mechanism of action of these two avian ß-defensins against intestinal infection of birds by Salmonella represented the main objective of the thesis work. While AvBD1 and 2 were initially identified from heterophils, we were interested in determining whether the intestinal epithelial cells, which constitute the first barrier encountered by the bacteria, were able to express them. A primary culture of intestinal epithelial cells has been developed from chicken embryos of divergent inbred lines either resistant or susceptible to Salmonella intestinal carriage. The cells exhibited characteristics of epithelial type according to morphology and expression of specific cytoskeletal proteins. They were shown to express the two ß-defensin genes AvBD1 and AvBD2 according to the chicken line. Furthermore, S. Enteritidis interfered with AvBD2 expression only in the cells from the susceptible line. In parallel, we were interested in preparing these ß-defensins in order to assess their antibacterial activity. Chicken bone marrow was used to isolate ß-defensins by acetic acid extraction followed by chromatographic separation. Three purified ß-defensins, AvBD1, AvBD2 and AvBD7 were characterized by mass spectrometry, revealing post-translational modifications in AvBD1 C-terminal end and AvBD7 N-terminal end. Antimicrobial activity measured by radial diffusion assay has shown a high efficiency against Gram + and Gram – except for AvBD2 with a lower potency against Gram – bacteria. Antibacterial spectrum of AvBD2 showed specificity towards Gram + bacteria as well as the king penguin AvBD103b whose three-dimensional structure has been described. This prompted us to resolve the structure of AvBD2 by nuclear magnetic resonance in order to analyze structure-activity relationships by comparing these two avian ß-defensins. This approach has led us to propose a mechanism of action for these two ß-defensins and particularly for AvBD2 in the intestinal mucosa. Finally, taken together the results allow to further define the role of avian ß-defensins in the phenotype of resistance/susceptibility to intestinal invasion by Salmonella. In addition to their antibacterial activity, which can be overcome to some extend by Salmonella, they could display other functions such as chemotaxis allowing recruitment of immune competent cells. The characterization of the activity spectrum of these avian ß-defensins opens perspectives of therapeutic application in a domain where antibiotics use should be avoided

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