Letteratura scientifica selezionata sul tema "Cultures – Rendements – Maladies"

Les rendements en agriculture biologique font l’objet de controverses et sont considérés comme plus faibles qu’en agriculture conventionnelle. En Afrique, l’agriculture biologique recouvre une grande diversité de pratiques et les rendements présentent de fortes incertitudes. Les analyses des rendements et des itinéraires techniques en agriculture biologique sont présentées pour trois cultures maraîchères au Sénégal. Les résultats sont ensuite comparés aux rendements usuels de l’agriculture conventionnelle. Deux types de données sont utilisés, provenant de parcelles d’agriculteurs : i) suivi de champs conduits selon des itinéraires techniques d’agriculture biologique vs. itinéraires techniques conventionnels ; ii) résultats issus des actions de l’organisation non gouvernementale ENDA-PRONAT, suivant un cahier des charges copié sur celui de l’agriculture biologique. Les suivis comparatifs de parcelles de chou pommé et de tomate en saison des pluies mettent en évidence des ratios de rendement agriculture biologique/conventionnelle de 74 et 40 % respectivement. Ces valeurs confirment la tendance générale des résultats de la littérature. Elles sont expliquées par une fertilisation azotée plus faible et l’absence de mesures de protection efficace contre les maladies et ravageurs des cultures. Les rendements en oignon des parcelles d’agriculture biologique chez les producteurs sont très variables : en moyenne de 19,4 t/ha à 11,0 t/ha suivant les années dans la zone des Niayes, 21,0 t/ha dans le Bassin arachidier et seulement 8,6 t/ha dans la vallée du fleuve Sénégal. Les rendements de la culture d’oignon au Sénégal observés dans la littérature varient aussi dans de grandes proportions, de 10,7 à 32 t/ha. Dans certains cas, les rendements en agriculture biologique sont supérieurs à ceux des itinéraires techniques de l’agriculture conventionnelle. Ce constat, déjà observé dans la littérature scientifique, montre que l’agriculture biologique est une voie de développement de l’agriculture à ne pas écarter en Afrique.

Etude du comportement de neuf cultivars de tomates (Solanum Lycopersicum L.) dans différentes zones agro-écologiques du Burkina Faso pendant l’hivernage. Ali GARANE1*, Koussao SOME1, Jeanne NiKIEMA1, Mamoudou TRAORE2 et Mahamadou SAWADOGO3 1* Institut de l’Environnement et de Recherches Agricoles (INERA/CREAF-Kamboinse), Département Production Végétale/Programme Cultures Maraîchères, Fruitières, Plantes à Tubercules, 01 BP 470 Ouagadougou 01, Burkina Faso. 2Institut de l’Environnement et de Recherches Agricoles (INERA/CREAF-Kamboinsè), Département Gestion des Ressources Naturelles/Système de Production, 03 BP 470 Ouagadougou 03, Burkina Faso. 3Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO/Unité de Formation et de Recherche en Science de la Vie et de la Terre (UO/UFR-SVT), Laboratoire de Génétique et Biotechnologie Végétale, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso. * Correspondance, courriel: ali_garane@yahoo.fr Mots clés: Tomate, performance, hivernage, maladies, Burkina Faso. Key words: Tomato, wintering, performance, diseases, Burkina Faso. Publication date 30/06/2019 http://www.m.elewa.org/JAPS 1. RESUME Objectif: Au cours de la saison hivernale 2014-2015, une étude portant sur neuf cultivars améliorés de tomate a été réalisée dans 5 zones agro-écologiques (Kamboinsè, Loumbila, Komgoussi, Yako et Salgo) du Burkina Faso. Les observations et mesures ont porté sur la sensibilité au flétrissement bactérien, le rendement et ces composants essentiels afin de déterminer les cultivars les mieux adaptés aux conditions de culture d’hivernage dans les zones de l’étude. Méthodologie et résultats: Le dispositif expérimental est un bloc complet de Fisher randomisé de 4 répétitions avec des traitements constitués des variétés V1, V2, V3, V4, V5 , V6, V7, V8 et V9. Les plants ont été repiqués en ligne simple en parcelles élémentaires de 37,5 m2. Les écartements sont de 0,75 m sur 0,40 m, soit une densité de 33333 pieds/ha. Les variables suivantes de productivité ont été supérieures à Yako pour la densité chez les cultivars Thorgal, Gempride, Jaguard, Mongal, Nadira respectives de 67,75; 71,75; 80,12; 99,5 et 108,75 plants/37,5 m². A Salgo pour le poids moyen du fruit chez Jaguard (56,06 g) Mongal (55,63g), FBT5 (51,1 g) et Thorgal (48,8 g) et à Kongoussi pour Gempride (55,63 g). Les cultivars Rs et Nadira ont observé des rendements meilleurs à Yako respectifs de 28,72 et 28,73 t/ha. A Salgo, les hybrides Gempride, Mongal, FBT5, Jaguard et Thorgal ont été plus performant avec respectivement 21,65; 20,3; 20,0; 17,46 et 15,14 t/ha. Conclusion et application des résultats: Selon la moyenne des rendements, les meilleurs sites ont été par ordres décroissant Yako (19,044 t/ha), Salgo (17,44), Kongoussi (7,06 t/ha), Loumbila (6,87 t/ha) et Kamboinsè (2,97 t/ha). Dans le même ordre, les meilleures variétés ont été Nadira, Rs, Gempride, Jaguar, Thorgal, Mongal, FBT5 avec respectivement 13,87, 10,79; 10,23; 9,66; 8,23 et 7,08 t/ha. Si nous couplons à cela la tolérance aux flétrissements, Jaguar, Nadira et Gempride demeurent les meilleures variétés suivies de Mongal et FBT5. Les résultats obtenus sur les 5 sites ont montré une variabilité importante. Ce qui est peut-être du à la maitrise des techniques de production qui n’ont pas été homogènes d’un site à un autre et à la particularité de chaque variété. Pour améliorer la performance de ces variétés, il paraît indiqué de poursuivre les recherches dans une approche agronomique visant la maîtrise de l’eau d’irrigation, une gestion intégrée des ravageurs et maladies pendant le cycle cultural.

En République Démocratique du Congo en générale et dans la province du Maniema en particulier, la culture du Cacao « Theobroma cacao » est essentiellement pratiquée par des paysans qui utilisent des méthodes traditionnelles ou empiriques. Cette étude signale que les maladies pouvant attaquer la culture du Cacao existe bien à Kindu et ses environs et que les symptômes sont indicateurs d’une baisse de production, comme cela prouvé ailleurs. Cet état des connaissances pourrait être guidé par des tests d’expérimentations et d’analyses poussées pour mieux comprendre l’expansion du phénomène dans la province du Maniema en générale et dans la ville de Kindu particulier. Des paramètres liés à la maladie (l’incidence, le taux d’attaques foliaires, l’indice de gravité des symptômes et la chute précoce des cabosses, la perte de rendement) ont été étudiés. Les résultats obtenus ont montré que les Cacao de Kindu sont infectés avec une incidence variant entre (16,82%) et (54,22%) à Kindu et un taux d’attaque moyen variant entre 11% et 29%. Nous avons constaté d’après ces résultats, que 54,22% des plants infectés affichent des indices de sévérités ou Indice de Gravité des Symptômes IGS inquiétants qui varient de 1 à 4 susceptibles de faire baisser la production dans le zone étudiée. L’impact économique de maladies et ravageurs de la culture de Cacao s’est traduit par une perte de rendement au niveau des cabosses réduisant de façon significative les efforts des paysans cultivateurs. Il serait nécessaire de réglementer le contrôle et la distribution des semences saines et/ou matériels de culture sains, la sélection des variétés, l’éducation des paysans pour l’amélioration des techniques culturales et la maitrise des différents paramètres agronomiques.

Le niébé (Vigna unguiculata [L.] Walp.) est l’une des principales cultures du bassin arachidier sénégalais. Il joue un rôle important dans les programmes de sécurité alimentaire et dans les stratégies de développement socio-économique du pays. Toutefois, plusieurs contraintes (maladies, ravageurs, pression des adventices, etc.) entraînent des baisses de rendements de cette spéculation. Il est donc important, de trouver des solutions adéquates à ces contraintes ce qui passerait par la connaissance des agents responsables. C’est pourquoi cette étude était entreprise pour contribuer à l’amélioration de la production du niébé par la caractérisation de la flore adventice du niébé. Pour ce faire des inventaires ont été effectués dans les parcelles de niébé dans la zone de Niakhène en appliquant la méthode du « tour de champ ». Ceci a permis de recenser 92 espèces réparties dans 67 genres et 29 familles. Cette flore est dominée par les dicotylédones avec 76,09% des espèces recensées contre 23,93% de monocotylédones. Les familles dominantes sont les Fabaceae et les Poaceae avec respectivement 21,74% et 16,30% des espèces. Les thérophytes (77,17%) sont largement dominantes suivies des phanérophytes (16,30%). Les géophytes, les chaméphytes et les parasites regroupent respectivement 3,26%), 2,17% et 1,09% de la flore. Au plan biogéographique, les espèces Africaines sont plus importantes avec 41,30% de la flore suivies des espèces Pantropicales avec 28,26%. Cowpea (Vigna unguiculata [L.] Walp.) is one of the main crops of the Senegalese groundnut basin. It plays an important role in the country’s food security programs and socio-economic development strategies. However, several constraints (diseases, pests, weed pressure, etc.) lead to yield reductions in this crop. It is therefore important to find adequate solutions to these constraints, which would require knowledge of the agents responsible. This study was undertaken to contribute to the improvement of cowpea production by characterizing the cowpea weed flora. Inventories were carried out in the cowpea plots in the Niakhène area using the « field tour » method. This made it possible to identify 92 species distributed in 67 gendera and 29 families. This flora was dominated by dicotyledons with 76.09% of species recorded against 23.93% of monocotyledons. The dominant families were Fabaceae and Poaceae with 21.74% and 16.30% of species respectively. The therophytes (77.17%) were largely dominant followed by phanerophytes (16.30%). The geophytes, the chamaephytes and parasites group represented 3.26%, 2.17% and 1.09% of the flora, respectively. At the biogeographical level, African species are more important with 41.30% of the flora, followed by Pantropical species with 28.26%.

Pour réduire les difficultés des populations urbaines à l’accès à la terre et aussi pour améliorer la qualité de la production maraîchère en évitant les maladies telluriques, la mise au point d’un substrat adapté pour la culture hydroponique a été entreprise. Deux variétés de tomate, TMA97 et Lindo ont été évaluées sur trois substrats : fibres de coco, compost de soja et coques d’arachide. Les observations et mesures ont porté sur la croissance végétative, le délai de floraison puis les paramètres du rendement. Les résultats obtenus ont montré que la meilleure croissance a été obtenue avec la variété Lindo sur les fibres de coco. Le taux de fruits avarié le plus élevé (37%) a également été produit par Lindo sur ce substrat. Par contre, la variété TMA97 cultivée sur le compost de soja en a donné le plus faible (1,3%). Statistiquement, les rendements potentiels et nets ont été identiques chez les variétés de tomates étudiées. Mais numériquement, les rendements nets ont été plus élevés chez TMA97 que chez Lindo quel que soit le substrat utilisé. Chez la variété Lindo, les rendements nets les plus importants ont été obtenus avec le compost de soja. Les coques d’arachide ont donné les faibles rendements. Concernant la variété TMA97, les valeurs les plus élevées ont été produites sur les fibres de coco ; alors que lesplus petites valeurs ont été observées sur les coques d’arachide. Mots clés : Tomate, hydroponie, solution nutritive, substrat, rendement. English Title: Influence of coconut fiber, peanut shell and soybean compost substrates on the behavior of two tomato varieties TMA97 and Lindo in hydroponic cultivationTo reduce the urban population's difficulties in accessing land and also to improve the quality of vegetable production by avoiding telluric diseases, the development of a suitable substrate for hydroponic cultivation has been undertaken. Two varieties of tomato, TMA97 and Lindo were evaluated on three substrates: coconut fibers, soy compost and peanut shells. Observations and measurements focused on vegetative growth, flowering time, and yield parameters. The results obtained showed that the best growth was obtained with the Lindo variety on coconut fibres. The highest rate of damaged fruit (37%) was also produced by Lindo on this substrate. On the other hand, the variety TMA97 grown on soy compost gave the lowest (1.3%). Statistically, potential and net yields were identical in the tomato varieties studied. But numerically, the net yields are higher in TMA97 than in Lindo regardless of the substrate used. In the Lindo variety, the highest net yields were obtained with soy compost. Peanut shells gave low yields. For the TMA97 variety, the highest values were produced on coconut fibers; while the smallest values were observed on peanut shells. Keywords : Tomato, hydroponics, nutrient solution, substrate, yield.

Le présent travail portant sur l’effet des biopesticides, de Dithane et d’engrais organiques sur le rendement de la pomme de terre, Solanum tuberosum L, variété PNAP cultivée à Goma au Nord – Kivu est parti du constat selon lequel malgré l’existence et la multiplicité de techniques culturales, le processus du développement social présente le manque d’autonomie alimentaire. Ce constat est un défi et un problème du temps qui touche le secteur agropastoral, la sécurité alimentaire et toutes les couches de la société congolaise. A partir des questions de recherche les expérimentations, comme travail de terrain ont abouti aux résultats qui, à une grande échelle ont confirmé les hypothèses assignées : En vue de préserver la sécurité alimentaire et le développement social, la production et surtout l’amélioration du rendement de culture de la PDT dépendent de l’engagement du capital humain par ses interventions pour améliorer la valeur agronomique du sol et appliquer les techniques du contrôle bioécologique contre les maladies et ravageurs par l’exploitation rationnelle des intrants dont les Pour augmenter la valeur agronomique du sol, impacter positivement la productivité agricole, assurer l’autosuffisance alimentaire et préserver le développement social à Goma au Nord Kivu, les facteurs nutritionnels nécessaires à la croissance et au rendement de la PDT en culture, sont les sels minéraux fournissant le potassium ou les bases échangeables. Ceux-ci étaient en grandes proportions dans le substrat à compost que celui de la bouse de chèvre. L’amendement du sol n’avait pas beaucoup impacté le rendement de la PDT en Par contre l’impact positif s’est confirmé par les pesticides, en luttant contre les maladies et les ravageurs pour améliorer la productivité et le rendement. En plus de Dithane, la protection s’est bien confirmée avec l’usage des biopesticides fournis par les extraits aqueux des plantes dont l’ordre décroissant d’efficacité s’est révélée comme, Ail – Tabac –Eucalyptus. Avec ses recommandations utilitaires, ce travail constitue une réponse de taille comme apport de l’approche écoclimatique sous ses diversités et son adaptabilité, au processus du développement social bien assaini, face à l’insuffisance alimentaire, la pression des maladies et ravageurs des cultures et la pauvreté du sol cultural. Il ouvre à la valorisation et l’exploitation rationnelle des ressources à bord, le capital humain, pour le développement intégré.

RésuméLes champignons du genreTrichoderma, connus depuis 1887 pour leurs propriétés antagonistes, ont été utilisés comme agents de lutte biologique contre un large spectre de phytopathogènes. Récemment, certaines études ont démontré l'aptitude desTrichodermaà stimuler la croissance de certaines plantes. Ainsi, l'effet de six souches duTrichodermasur les paramètres de croissance et de rendement d'une culture de tomate en serre a été étudié. Les résultats montrent que toutes les souches duT. harzianumont stimulé la croissance de la tomate, notamment les biomasses végétative et racinaire, alors que leT. viriden'a pas eu un effet significativement différent par rapport au témoin. L'effet duTrichodermasur l'incidence des maladies foliaires a aussi été très net pour des souches deT. harzianumqui ont protégé à 100 % les feuilles de tomate. La colonisation des racines par les différentes souches duTrichodermane diffère pas significativement entre les souches duT. harzianum(86 à 100 %), alors qu'elle est significativement plus faible pour la souche TV1duT. viride.De même, les souches duTrichodermaont pu se maintenir à un niveau très élevé dans la rhizosphère par rapport aux témoins.

Cette revue de littérature couvre la botanique, la domestication, l’écologie, les systèmes de culture, la transformation ainsi que les contraintes et perspectives pour une production durable des ignames en Afrique tropicale. L’igname est un taxon d’espèces essentiellement tropicales qui nécessitent des températures élevées. Ainsi, la germination est optimale entre 25 et 30 °C, alors que des températures inférieures à 15 °C ou supérieures à 35 °C la retardent. La culture de l’igname se pratique avec succès dans des zones où la pluviométrie varie entre 1000 et 1800 mm ; toutefois, il est possible de cultiver l’igname avec une pluviométrie de 600 mm mais le rendement reste faible. L’igname, pour la croissance végétative et une bonne tubérisation, préfère des sols limono-sableux ou sablo limoneux, ayant une conductivité hydraulique de 15 cm/h, une densité apparente comprise entre 1,1 et 1,6 g.cm−3 et surtout légers, profonds (> 0,6 m), bien drainés, riches en matière organique, en azote, en potasse, en magnésium et en calcium ; un pH compris entre 5 et 7 est aussi propice à une bonne culture d’igname. Au-delà des paramètres édaphiques et des facteurs climatiques, les pratiques culturales, notamment le type de cultivar, la densité de plantation, la date de plantation, les adventices, les maladies et ravageurs, sans occulter l’histoire des parcelles et les pratiques paysannes de gestion du sol, ont un effet sur la productivité des ignames. Les facteurs déterminant le choix des variétés d’igname cultivées par les producteurs sont principalement : la qualité culinaire des tubercules, la productivité, la valeur commerciale, la facilité de multiplication, la qualité des cossettes, la précocité de tubérisation, la conservation, la facilité de culture, le rôle dans l’alimentation et l’importance pour les cérémonies rituelles.

Description de l’étude. Le maraîchage est une activité productive de l’agriculture urbaine et périurbaine à Kinshasa. Il est moins exigeant en termes de coûts d’investissements, motivant ainsi les agriculteurs à cultiver une diversité de légumes. Mais les spéculations maraîchères sont confrontées à plusieurs contraintes qui limitent leur rendement dans les sites de production à Kinshasa. Littérature. Les principales spéculations maraîchères cultivées à Kinshasa sont dominées par les légumes feuilles, fruits, bulbes et racines. Ces cultures maraîchères sont confrontées à une gamme de contraintes et aléas dont les plus importants sont l’insécurité foncière, la faible fertilité naturelle des sols, l’incidence des maladies et ravageurs, le faible encadrement technique, les aléas climatiques et le faible approvisionnement en intrants. En outre, les systèmes de commercialisation des légumes à Kinshasa tels qu’ils sont organisés constituent un autre problème empêchant le développement de l’activité maraîchère. Cet article décrit les principales spéculations maraîchères cultivées dans les zones urbaines et périurbaines de Kinshasa, analyse les contraintes majeures liées à la conduite de ces cultures et propose des pistes de solutions pour la durabilité de cette activité. Conclusion. Pour lever les contraintes liées au maraîchage à Kinshasa, une véritable dynamique organisationnelle agissant comme un moteur de mobilisation et d’élaboration des stratégies au sein des périmètres maraîchers s’avère indispensable. Cela nécessite une volonté politique de l’État prêt à subventionner, former et encourager les maraîchers pour le développement de cette activité dans les zones urbaines et péri-urbaines de Kinshasa. Description of the subject. Market gardening is a productive activity in urban and peri-urban agriculture in Kinshasa. It is less demanding in terms of investment costs, thus motivating farmers to cultivate a diversity of vegetables. But market gardening is faced with several constraints which limit their yield in production sites in Kinshasa. Literature. The main market garden crops grown in Kinshasa are dominated by the leafy vegetables, fruits, bulbs and roots. These market gardening crops are faced with a range of constraints and hazards, the most important of which are land insecurity, low natural soil fertility, the incidence of diseases and pests, weak technical supervision, climatic hazards and the low supply of inputs. In addition, the vegetable marketing systems in Kinshasa as they are organized constitute another problem preventing the development of market gardening activity. This article describes the main market gardening crops grown in the urban and peri-urban areas of Kinshasa, analyzes the major constraints linked to the management of these crops and proposes possible solutions for the sustainability of this activity. Conclusion. To remove the constraints linked to market gardening in Kinshasa, a real organizational dynamic acting as a driving force for mobilization and development of strategies within market gardening areas is essential. This requires political will from the State ready to subsidize, train and encourage market gardeners for the development of this activity in the urban and peri-urban areas of Kinshasa.

Ce projet s'inscrit dans une démarche interdisciplinaire visant à résoudre les problématiques liées à l’helminthosporiose, une maladie cryptogamique causée par Pyrenophora teres, réduisant considérablement les rendements de l'orge (Hordeum vulgare L.).Dans ce travail, un modèle d'apprentissage profond combinant les architectures Cascade R-CNN et U-Net a été développé pour quantifier les symptômes de la maladie sur les feuilles d’orge. Le modèle a atteint une précision de 95 % dans la détection des lésions et s’est avéré particulièrement efficace pour identifier les petites lésions quatre jours après l'infection. Ce modèle a été validé par des mesures classiques et des méthodes de détection par PCR, fournissant ainsi un outil robuste pour la gestion automatisée des maladies en conditions réelles.En parallèle, une méthode de détection précoce basée sur l'analyse des k-mers des génomes de P. teres a permis de concevoir des amorces et une sonde TaqMan spécifiques, capables d’identifier P. teres f. sp. teres et P. teres f. sp. maculata avant l’apparition des symptômes. Cette détection sur plantes asymptomatiques, validée par qPCR et ddPCR, est une première à notre connaissance. Cette approche constitue donc une avancéemajeure pour la gestion de l’helminthosporiose chez l’orge, et plus généralement des maladies en milieu agricole.Dans le cadre des changements climatiques, les projections montrent que la température annuelle moyenne et les précipitations du trimestre le plus froid influencent la répartition future de P. teres. Les modèles prévoient une expansion de la présence du pathogène vers l'Amérique du Nord, l’Océanie et l’Europe d'ici 2040. L’analyse des souches hybrides a révélé une diversification accrue des effecteurs et métabolites secondaires,renforçant l’adaptabilité et la virulence du pathogène. Parmi les effecteurs identifiés figurent Kex2, RCLR-like motifs, MoCDIP11, ainsi que ToxB, PIN_09941, MoCDIP8, ToxB et Nip1, soulignant le rôle crucial des recombinaisons génétiques dans la pathogénicité des souches hybrides.Ce travail a permis de mettre en évidence l’importance de l’intégration des outils technologiques en biocontrôle pour élaborer des stratégies durables de gestion des maladies phytopathogènes dans un environnement en constante évolution
This project adopts an interdisciplinary approach to address the challenges posed by net blotch, a phytopathogenic disease caused by Pyrenophora teres, affecting barley (Hordeum vulgare L.) within the context of climate change. This disease is one of the most destructive, significantly reducing crop yields.In this work, a deep-learning model combining Cascade R-CNN and U-Net architectures was developed to quantify disease symptoms on barley leaves. The model achieved a 95% accuracy in lesion detection and demonstrated a particular effectiveness in identifying small, irregular lesions four days post-infection. This model was validated through classical measurements and PCR-based detection methods, providing a robust tool for automated disease management under real conditions.Additionally, a novel early detection method was developed based on k-mer analysis of P. teres genomes, leading to the design of primers and a TaqMan probe capable of detecting both P. teres f. sp. teres and P. teres f. sp. maculata before symptom onset. This detection before symptoms occurrence, validated through qPCR and ddPCR, is the first one in our knowledge. Thus, this approach represents a major breakthrough for net blotch management in barley and more largely for managing diseases in agricultural settings.In the context of climate change, projections revealed that annual mean temperature and precipitation during the coldest quarter are key factors influencing the future distribution of P. teres. Models predict a potential expansion of this pathogen to North America, Oceania, and Europe by 2040. Genomic analysis of hybrid strains showed an increased diversity of effectors and secondary metabolites, enhancing pathogen adaptabilityand virulence. Key effectors identified include Kex2, RCLR-like motifs, MoCDIP11, as well as ToxB, PIN_09941, MoCDIP8, and Nip1, highlighting the crucial role of genetic ecombination in the pathogenicity of hybrid strains.This study emphasizes the importance of integrating genomic tools, climate modeling, and biocontrol technologies to develop sustainable disease management strategies for phytopathogens in an evolving environment

Le blé (Triticum aestivum L.) et l'orge (Hordeum vulgare L.) figurent parmi les principales céréales cultivées dans le monde de par leur importance économique et sociale. Cependant, leurs rendements peuvent chuter de plus de 40% lorsqu'elles sont infectées par l'ascospore Zymoseptoria tritici, provoquant la septoriose du blé, et par Pyrenophora teres responsable de l'helminthosporiose de l'orge. Ainsi, afin de minimiser le recours aux produits phytosanitaires, l'objectif de cette thèse était d'identifier une souche pouvant réduire significativement les symptômes causés par ces deux agents pathogènes. La souche Bacillus velezensis BE2 DSM115797, a ainsi été retenue pour ses propriétés antifongiques, tant in vitro qu'in planta. Une étude approfondie des mécanismes d'action a révélé qu'en étant appliquée au niveau des racines de blé et d'orge, la bactérie réduisait significativement les symptômes foliaires, en induisant une résistance systémique de la plante. Des études transcriptomiques et métabolomiques ont confirmé que la bactérie, une fois appliquée, ne déclenchait pas de réponse de défense dans la plante. Cependant, après une infection pathogène, les plantes inoculées avec la souche BE2 démontraient une activation plus marquée de leurs mécanismes de défense, témoignant d'un effet de potentialisation chez la plante. À l'échelle de la bactérie, un antagonisme direct a également été démontré avec l'identification de métabolites secondaires présentant des effets antifongiques sur les deux champignons. De plus, la production de ces métabolites variait en fonction de la présence des pathogènes
Wheat (Triticum aestivum L.) and barley (Hordeum vulgare L.) are among the main cereals cultivated worldwide due to their economic and social significance. However, their yield can drop by more than 40% when infected by the ascospore Zymoseptoria tritici, causing wheat septoria, and by Pyrenophora teres, which causes net blotch. Therefore, to reduce the use of pesticides, this project aimed to identify a strain that can significantly reduce the symptoms caused by these two pathogens. The strain Bacillus velezensis BE2 DSM115797 was chosen for its antifungal properties, both in vitro and in planta. An in-depth study of the mechanisms of action revealed that, when applied to the roots of wheat and barley, the bacterium significantly reduced leaf symptoms, inducing systemic resistance in the plant. Transcriptomic and metabolomic studies confirmed that the bacteria, once applied, did not trigger an immediate response in the plant. However, after a pathogenic infection, plants inoculated with the BE2 strain showed a more pronounced activation of their defense mechanisms, leading to a potentiating effect in the plant. At the bacterial level, a direct antagonism was also demonstrated with the identification of secondary metabolites that have antifungal effects on both fungi. Moreover, the production of these metabolites varied based on the presence of the pathogens

Les relations entre les états de développement végétatif ou reproductif de la vigne et la sensibilité aux attaques de l’oïdium et du botrytis sont complexes et pauvrement documentées dans la littérature. L’état de croissance de la plante peut agir de façon directe ou indirecte sur les maladies et ce travail a cherché à étudier et à décrire ces relations. Pour cela, un dispositif expérimental a été installé sur une parcelle près de Montpellier avec différentes modalités de gestion du sol (enherbement permanent ou semi-permanent, désherbage total, irrigation) qui ont permit de créer des conditions de croissance contrastées. L’hypothèse selon laquelle le développement épidémique de l’oïdium et du botrytis est positivement corrélé aux états de croissance de la vigne a été vérifiée. Pour le botrytis, les deux facteurs principaux qui expliquent cette relation positive sont les conditions climatiques et micro climatiques en interaction avec les états de croissance de la vigne. Pour l’oïdium, le facteur explicatif majeur a été la population d’organes sensibles à partir de la floraison. Un schéma théorique général qui prend en compte cette relation croissance-maladie, ainsi que les mécanismes explicatifs est proposé. Les conditions qui défavorisent la croissance et le rendement de la vigne défavorisent aussi le développement des maladies. Paradoxalement ces conditions ne permettent pas forcement de satisfaire les objectifs de rendement et de qualité. En effet, l’état de croissance qui produit le rendement le plus élevé est celui de la modalité irriguée et fertilisée (optimum de production). Le niveau de croissance qui prévient le plus les dégâts sur grappes est celui de la modalité avec un enherbement permanent (optimum sanitaire). Entre ces deux extrêmes, on trouve la modalité avec un enherbement semi-permanent, qui produit des rendements et des dégâts de maladies intermédiaires ainsi que le raisin qui a été jugé le meilleur pour la production de vin