Tesi: "Adaptation fonctionnelle"

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Hocine, Nadia. "Adaptation dans les jeux sérieux pour la rééducation fonctionnelle". Thesis, Montpellier 2, 2013. http://www.theses.fr/2013MON20245.

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Abstract (sommario):

L'accident vasculaire cérébral (AVC) est une des principales causes de handicap et de décès chez les adultes dans le monde. Un nombre important de travaux de recherche ont été émergés afin d'améliorer les stratégies de rééducation en incluant les jeux sérieux dans le processus thérapeutique. L'avantage des jeux sérieux consiste à fournir aux patients un environnement d'entraînement personnalisé et immersive. La thèse se focalise sur une technique d'adaptation qui vise à améliorer les résultats de l'entrainement des patients tout en maintenant leur motivation durant une session thérapeutique. La technique est basée sur l'évaluation des capacités motrices des patients hémiplégiques pour adapter dynamiquement la difficulté de jeu. Elle a été évaluée via des expérimentations avec des joueurs sains, des thérapeutes et des patients atteints d'AVC. Les résultats de l'évaluation montrent que la technique d'adaptation permet d'augmenter le nombre de tâches, le nombre de tâches réussies ainsi que l'amplitude du mouvement. En outre, elle permet également de maintenir la motivation des joueurs en la comparant aux stratégies de contrôle. Cela peut être donc prometteur pour améliorer la récupération de patients qui ont subi un AVC
A stroke is among the major causes of adults' disability and death worldwide. To date, a growing amount of research studies have been devoted to improve rehabilitation strategies by including serious games in the therapeutic process. The benefit of serious games lies in providing patients with a customized and immersive training environment. The thesis focuses on an adaptation technique that seeks to enhance the patients' training outcomes while maintaining their motivation. It is based on the assessment of the patient's motor abilities to dynamically adapt the game difficulty. The technique has been evaluated through experiments with healthy players, therapists and stroke patients. The results of the evaluation show that the adaptive technique has increased the training outcomes in terms of the number of tasks, number of successful tasks as well as the movement amplitude. In addition, it has also maintained the players' motivation compared with the control strategies. This can therefore be promising to enhance stroke patients' recovery

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Passerini, Delphine. "Diversité génétique, génomique et fonctionnelle de Lactococcus lactis". Thesis, Toulouse, INSA, 2011. http://www.theses.fr/2011ISAT0041/document.

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Abstract (sommario):

Lactococcus lactis est une espèce appartenant au groupe des bactéries lactiques, largement utilisées dans l’industrie pour leur capacité à produire de l’acide lactique au cours de la fabrication des produits laitiers fermentés. L’étude de la diversité globale de L. lactis ssp. lactis a été entreprise par l’intégration de données biologiques obtenues à partir d’analyses génétiques, génomiques, physiologiques, transcriptomiques et métaboliques. L’accès à la phylogénie de l’espèce par l’étude de la variabilité génétique du génome cœur par MLST (MultiLocus Sequence Typing) a permis de décrire deux groupes de souches : les souches environnementales, génétiquement très diverses, isolées de laits crus, de plantes ou d’animaux et les souches domestiquées, génétiquement très proches, isolées des levains utilisés dans l’industrie laitière. Malgré la perte de diversité génétique observée dans les souches domestiquées probablement associée à un processus de spécialisation à un environnement technologique, l’approche intégrative a permis de montrer que ce groupe présente une diversité génomique et fonctionnelle aussi importante que les souches environnementales. L’investigation des génomes de la sous-espèce lactis par la mesure de la taille des chromosomes et la caractérisation en nombre et en taille du contenu plasmidique, a révélé une variabilité de plus de 300 kb en capacité de codage génétique des souches domestiquées et environnementales. D’autre part, les souches domestiquées appartenant au biovar Diacetylactis ont montré des physiologies et des régulations métaboliques différentes, résultant en une production d’arômes de type diacetyl ou acétoïne variable selon la souche. Enfin, le séquençage du génome de la souche environnementale A12 isolée d’un levain de panification, et sa comparaison avec les 4 génomes actuellement séquencés de L. lactis a révélé un pangénome (ensemble des gènes de l’espèce) étendu, montrant que cette espèce offre un grand réservoir de diversité. Environ 20 % des gènes spécifiques de souches ont été mis en évidence témoignant des grandes capacités adaptatives de la sous-espèce. L’étude approfondie de la souche A12 par une analyse transcriptomique a permis de rendre compte des mécanismes impliqués dans l’adaptation d’une souche à un écosystème complexe
The Lactococcus lactis species belong to lactic acid bacteria group widely used for their ability to produce lactic acid in fermented dairy products. The study of the global diversity of L. lactis ssp. lactis was carry out by the integration of biological data obtained from genetic, genomic, physiological, transcriptomic and metabolic analyses. The genetic variability investigated by MLST (MultiLocus Sequence Typing) describe two strains groups according to their phylogeny : the “environmental” strains, displaying high genetic diversity and isolated from different natural environments such as raw milks, plants and animals and the “domesticated” strains, genetically closely related, isolated from starters in dairy industries. Despite the lost of genetic diversity in domesticated strains, probably associated to a specialisation process, the integrative approach showed a genomic and functional diversity as huge as in environmental strains. The characterization of chromosome size and plasmidic content of the lactis subspecies revealed a variation higher than 300 kb in genetic coding capacity for domesticated and environmental strains. Moreover, the domesticated strains belonging to the biovar Diacetylactis showed different physiologies and metabolic regulations resulting in variable amount of aroma produced according to the strains. Finally, the genome sequencing of the A12 strain isolated from sourdough bread and its comparison with 4 other L. lactis genomes already sequenced revealed a spread pangenome (all the genes of a species). Approximately 20 % of each genome correspond to strain specific genes, showing large adaptive capacities of the subspecies. The in-depth study of the A12 strain by transcriptomic analysis allows to highlight mechanisms involved in the adaptation of a strain to a complex ecosystem

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Crequer, Ewen. "Étude de l'adaptation chez Penicillium roqueforti : approches fonctionnelle et de génomique évolutive". Electronic Thesis or Diss., Brest, 2024. http://www.theses.fr/2024BRES0017.

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Abstract (sommario):

La domestication, qui implique une sélection forte et récente dans un environnement contrôlé, est un excellent modèle pour l’étude de l’adaptation locale. Penicillium roqueforti est un microorganisme dont deux des populations connues ont été domestiquées pour la production de fromages à pâte persillée. Dans le cadre de cette thèse, nous avons cherché à approfondir la caractérisation phénotypique des populations de P. roqueforti et à déterminer les causes génétiques de leurs différences. Pour ce faire, nous avons comparé les cinq populations, dont une associée à un fromage non-inoculé (Bleu de Termignon) mise en évidence dans ces travaux. La population “Termignon” présente une forte diversité génétique et des phénotypes intermédiaires entre les populations domestiquées et non-domestiquées. La comparaison phénotypique des populations a montré une différenciation des populations domestiquées cohérente avec une adaptation au milieu fromager et à une sélection pour une hypotoxigénicité. D’autre part, les populations non-domestiquées montrent un métabolisme plus diversifié que les populations non-fromagères, par une plus forte croissance sur des milieux variés et une production plus forte et diverse de métabolites. La comparaison génétique des populations, et la cartographie QTL de cinq croisements révèlent des translocations et transferts horizontaux dans les génomes parentaux, des indices quant à l’architecture génétique de la domestication de P. roqueforti, ainsi que les causes possibles de la diminution de production de toxines dans la population « non-Roquefort »
Domestication, which implies strong and recent selection in a controlled environment, is an excellent model for the study of local adaptation. Penicillium roqueforti is a filamentous fungus with four genetically and phenotypically differentiated populations, two of which have been domesticated for the production of blue-veined cheeses. In this thesis, we aimed to further study the phenotypic differences between P. roqueforti populations and to determine the genetic determinants of the differences. To do so, we compared five populations, including one described in this work and associated with non-inoculated cheese (Bleu de Termignon). Phenotypic differences of P. roqueforti populations were consistent with an adaptation to the cheese-making environment and selection for low toxicity. On the other hand, non-domesticated populations showed a more diverse metabolism than non-domesticated populations, characterized by better growth in various media and higher and more diverse metabolite production.The genetic comparison of the populations, and the QTL cartography of five crosses revealedgenomic translocation and horizontal transfer in parental strain lineages, clues to the genetic architecture of domestication of P. roqueforti, and the possible causes of the reduced toxin production in the “non-Roquefort” population

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Buisson, Jérémy. "Adaptation dynamique de programmes et composants parallèles". Rennes, INSA, 2006. http://www.theses.fr/2006ISAR0012.

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Abstract (sommario):

Les grilles de calcul résultent souvent de la mise en commun par des laboratoires de leurs ressources informatiques, fournissant une puissance de calcul supérieure à ce qu'un laboratoire seul peut posséder. La disponibilité des ressources n'est toutefois pas constante : outre les défaillances, l'absence d'une équipe unique d'administrateurs impose une maintenance fréquente ; les ressources sont partagées par les utilisateurs. Nous étudions en quoi l'adaptation dynamique, en permettant aux applications de prendre en compte les évolutions de leur environnement d'exécution, aide à obtenir de meilleures performances dans les grilles de calcul. Se pose notamment le problème de trouver un état global à partir duquel adapter les processus, auquel nous proposons une solution concrète pour les applications programmées selon le paradigme SPMD. Une validation expérimentale montre que ces travaux sont applicables dans un contexte de calcul haute performance, tel que celui des grilles de calcul
Grid platforms commonly result from the pooling of resources coming from several laboratories, providing a computational capacity that is higher than it could be expected from a single laboratory. However, resource availability is not constant: in addition to failures, maintenance frequency is raised by the presence of several administrator teams; and users share the resources. This thesis investigates how dynamic adaptation, which makes applications take into account their execution environment variability, may lead to higher performance in the context of grid computing. In particular, one of the major problems consists in finding an appropriate global state for adapting the processes. This thesis proposes a concrete solution to it in the context of applications written with the SPMD paradigm. Experimental validation shows that the proposals are relevant in the context of high performance computing, and in particular for grid computing

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Allaf, Oula. "Le Muscle epitrochlearis de rat et son adaptation à la demande fonctionnelle". Compiègne, 1997. http://www.theses.fr/1997COMP0998.

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Abstract (sommario):

Depuis toujours l'humanité accorde une importance particulière aux gestes sportifs. De vastes catégories de muscles existent chez l'être vivant et leurs évolutions se produisent avec les modifications fonctionnelles imposées par l'environnement. Dans ces conditions, certains muscles sont sollicités différemment et s'adaptent à la nouvelle fonction imposée. Cette sollicitation induit une réorganisation structurale et fonctionnelle, entraînant une évolution des caractéristiques biochimiques et mécaniques qui tend à refléter la plasticité musculaire. Dans ce travail, nous avons essayé d'induire une hyperactivité de nature posturale, obtenue grâce à la suspension du rat, sur un muscle phasique de la patte antérieure: l'épitrochléaris. Ainsi le rat doit utiliser ses pattes antérieures pour se déplacer et assurer sa posture. Les résultats obtenus montrent que l'épitrochléaris acquiert en 21 jours des caractéristiques de muscle plus lent: augmentation des fibres et des chaînes lourdes de myosine de type l, diminution de la vitesse maximale de raccourcissement, meilleure résistance à la fatigue et accroissement de la raideur. Par la modélisation de la relation force-vitesse, nous suggérons l'importance des chaînes légères de myosine dans ce processus adaptatif. De plus, nous montrons une augmentation du nombre total de fibres musculaires. Ceci serait le résultat d'une division mitotique des cellules satellites qui donneraient naissance à des fibres nouvelles indifférenciées et se transformeraient en fibres lentes. Cette étude confirme le lien entre types de fibres, protéines contractiles et propriétés mécaniques. La plasticité observée est sûrement liée au régime particulier de travail du muscle au cours de la suspension, notamment la nécessité d'une activité posturale importante
Since a long time, the humanity has given a particular place to the study of athletic gestures. It was discovered that a wide category of muscles existed in living beings and that their evolution occurred due to alterations imposed by their environment. Ln new conditions, some muscles respond in a new pattern and hence adapt themselves to a newly imposed function. This induces a structural and functional re-ordering of the muscles, leading to changes in biochemical and mechanical characteristics which tend to reflect muscle plasticity. Ln our work, a rats were suspended to induce hyperactivity of postural nature in a phasic muscle of the forelimb : the epitrochlearis. Thus, the rat has to use its forelimb to move around or to maintain his posture. Results show that, after 21 days, the epitrochlearis behaves as a slower muscle : fibbers and myosin heavy chains of type 1 are increased, maximal shortening velocity is decreased, resistance to fatigue is improved and stiffness is increased. Thanks to a model including the force-velocity relationship, the role of the myosin light chains in this adaptative process is emphasized. Moreover, an increase in the total number of muscle fibbers is observed. This could be the result of a mitotic division of satellite cells which are able to generate new undifferentiated fibbers. These fibbers should transform themselves into slow fibbers. This study confirms the relationship between fibber types, contractile proteins and mechanical properties. The observed plasticity is certainly related to the original work by the muscle during suspension, notably, the need of an important postural activity

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Amson, Eli. "Anatomie fonctionnelle du retour au milieu aquatique chez Thalassocnus (Mammalia, Tardigrada)". Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2014. http://www.theses.fr/2014MNHN0012.

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Mella-Flores, Daniella. "Diversité génétique et fonctionnelle des cyanobactéries picoplanctoniques marines et adaptation aux stress environnementaux". Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066359.

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Abstract (sommario):

De par leur abondance et ubiquité, les picocyanobactéries marines des genres Prochlorococcus et Synechococcus jouent un rôle clé dans l’écosystème marin. Afin de mieux comprendre l'influence des facteurs environnementaux sur leur répartition, la diversité génétique et fonctionnelle de ces microorganismes à été étudiée par différentes approches. Dans le premier chapitre, la distribution des principaux clades phylogénétiques de ces deux genres a été étudiée le long d'un transect en Mer Méditerranée. Cette étude a permis de mieux comprendre la structure des populations de picocyanobactéries dans cette région et de mettre en évidence sa stabilité sur une échelle de temps de 10 ans, malgré une augmentation significative des températures de surface dans le bassin Levantin. Le second chapitre a été consacré à l'étude des réponses photophysiologiques et transcriptomiques des picocyanobactéries face aux stress lumineux et oxydant. Nos résultats ont mis en évidence que Prochlorococcus et Synechococcus répondent différemment à ces stress et des éléments de réponse ont été apportés quant au rôle respectif de la lumière et du stress oxydant sur les processus de photoacclimatation. Enfin, à travers l’étude des rythmes circadiens et de la production d’oxygène, nous avons exploré les conséquences physiologiques de la réduction génomique chez Prochlorococcus. Ainsi, nous avons pu mettre en évidence que malgré la perte de certains gènes impliqués dans ces processus physiologiques, cet organisme semble capable de maintenir ces fonctionnalités, bien que de manière réduite par rapport à Synechococcus. Les mécanismes compensateurs impliqués et leur mode de régulation restent encore à explorer.

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Grass, Vincent. "Étude fonctionnelle des intéractions génétiques du virus Zika avec les réponses antivirales de l'hôte". Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSEN010/document.

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Abstract (sommario):

Au cours des récentes épidémies, l’infection par le virus Zika (ZIKV) est à l’origine de microcéphalies chez le fœtus, d’avortements spontanés et du syndrome de Guillain–Barré chez l’adulte. L’infection par ZIKV représente donc un problème de santé publique. Il est nécessaire de comprendre la biologie de ce virus et quelles sont les réponses cellulaires impliquées. Dans les cellules infectées, les virus sont détectés par des récepteurs de la réponse immunitaire innée, tels que les Toll-like receptors (TLR). Cette reconnaissance conduit à la production de molécules antivirales, tel que l’interféron (IFN) de type I et III. De récents travaux montrent que l’activation de la voie TLR3 contribuerait au contrôle de la propagation de ZIKV et sa pathogénèse. Nous avons mis en place une approche pour cartographier les interactions génétiques entre le génome viral et différents régulateurs et effecteurs de cette réponse antivirale, incluant les étapes de reconnaissance du virus par TLR3. Cette approche est basée sur une combinaison de biologie moléculaire et d’évolution expérimentale qui repose sur le taux élevé de mutation de ZIKV et sa rapide faculté d’adaptation. J’ai pu mettre en avant l’apparition d’un phénotype de ZIKV face aux défenses antivirales de lignées cellulaires humaines qui se caractérise par une résistance à l’activation de la voie TLR3 et une meilleure propagation du virus après 5 passages. J’ai été capable d’observer que la population virale adaptée présente une perte d’activation des réponses antivirales (i.e. ISG15, MxA) 3h post-infection. La mise au point et la validation de l’approche CirSeq permet une analyse de précision des données de séquençage haut-débit, et permettra ainsi de prédire l’évolution de mécanismes d’échappement viral
Zika virus (ZIKV) infection causes neurological diseases and birth defects representing an important threat for human health. Recent studies demonstrated that interferon (IFN) response is pivotal for the control of ZIKV spread, its in utero transmission and protects against ZIKV-induced neurological diseases. It is necessary to understand the biology of this virus and what are the cellular responses involved. In infected cells, viruses are detected by receptors of the innate immune response, such as Toll-like receptors (TLRs). This recognition leads to the production of antiviral molecules, such as type I and III interferon (IFN). Recent work shows that activation of the TLR3 pathway contributes to controlling the spread of ZIKV and its pathogenesis. We have implemented an approach to map the interactions between the viral genome and different regulators and effectors of this antiviral response, including the TLR3 virus recognition steps. This approach is based on a combination of molecular biology and experimental evolution based on the high mutation rate of ZIKV and its rapid adaptation. I was able to highlight the appearance of a phenotype of ZIKV against the antiviral defenses of human cell lines that triggered resistance to activation of the TLR3 pathway and a better spread of the virus after 5 iterative passages. I was able to observe that the adapted viral population exhibited a loss of activation of antiviral responses (i.e. ISG15, MxA) 3h after infection. The implementation and validation of the CirSeq approach allows an analysis of the accuracy of high throughput sequencing data, as well as predicting the evolution of viral escape mechanisms

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Marques, da silva Wanderson. "Etude fonctionnelle du génome de Corynebacterium pseudotuberculosis par différentes stratégies protéomiques". Thesis, Rennes, Agrocampus Ouest, 2015. http://www.theses.fr/2015NSARB262/document.

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Abstract (sommario):

Corynebacterium pseudotuberculosis est une bactérie pathogène intracellulaire facultative, divisée en deux biovars : C. pseudotuberculosis ovis, agent de la lymphadénite caséeuse (petits ruminants), et C. pseudotuberculosis equi, responsable de lymphangites ulcéreuses (chevaux), mammites (bovins) et d’œdèmes cutanés (buffles). La génomique fonctionnelle a pour but d'élucider le rôle que joue chaque gène dans l'organisme, ainsi que l'interaction de ces gènes dans un réseau biologique. Au cours de ce travail de thèse, différentes stratégies protéomiques ont été adoptées pour l’étude fonctionnelle du génome de C. pseudotuberculosis : i) l’analyse du protéome extracellulaire des souches 1002_ovis et C231_ovis a permis la caractérisation totale de 60 protéines différentes de C. pseudotuberculosis dont 18 protéines sont régulées différemment ;ii) le protéome de la souche 1002_ovis été analysé en réponse au stress nitrosant révélant 58 protéines différentiellement régulées et impliquées dans différents processus biologiques susceptibles de favoriser la survie à ce stress ; iii) les souches 1002_ovis et 258_equi ont été utilisées pour induire des infections expérimentales sur modèle souris. L’analyse de leur protéome extracellulaire avant et après passage en série sur souris a permis d’identifier 250 protéines différentiellement régulées touchant diverses fonctions. Pour conclure, ce travail a permis de générer une base de données de protéines et de valider la fonctionnalité de différents gènes jusqu’alors prédits in silico seulement et des informations importantes sur les facteu
Corynebacterium pseudotuberculosis is a facultative intracellular pathogenic bacterium, subdivided into two biovars: C. pseudotuberculosis ovis, agent of caseous lymphadenitis (small ruminants), and C. pseudotuberculosis equi, which causes ulcerative lymphangitis (equines), mastitis (bovines), and oedematous skin disease (buffalos). Functional genomics aims to elucidate the role that each gene plays in organism, as well as the interactions of these genes into a biological network. In this PhD work, various proteomic approaches were used to evaluate the functional genome of C. pseudotuberculosis: i) the analysis of the exoproteome of strains 1002_ovis and C231_ovis enabled the characterization of 60 proteins of C. pseudotuberculosis of which 18 were differentially regulated; ii) the proteome of the strain 1002_ovis was analyzed after a nitrosative stress revealing 58 proteins differentially regulated when compared to the control conditionsThese 58 proteins are involved in different biological processes which may favor the survival of this pathogen under exposition to nitrosative stress; iii) the strains 1002_ovis and 258_equi were used in a murine model of experimental infection. A comparative analysis of their extracellular proteomes before and after passage in mice revealed that 250 proteins ibnvolved in various functions were differentially regulated in C. pseudotuberculosis. Altogether, this PhD work allowed the generation of a protein data base, as well as the validation of several genes previously predicted in silico, and generated information about factors that fa

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Herrera, Aude. "Adaptation génétique et fonctionnelle des communautés bactériennes dans les sols extrêmes de Nouvelle-Calédonie". Lyon 1, 2006. http://www.theses.fr/2006LYO10086.

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Abstract (sommario):

Grâce à leur fort potentiel adaptatif, les bactéries sont capables de se développer dans des sols fortement perturbés, caractérisés par des conditions édaphiques souvent hostiles à la vie. Ce programme de recherche a spécifiquement porté sur les sols de Nouvelle-Calédonie, véritables modèles de sols extrêmes en écologie. Ces sols, issus de roches ultramafiques, présentent en effet des carences en nutriments et des teneurs élevées en nickel. Par ailleurs, l'exploitation des mines de nickel a conduit à la destruction de la végétation sur de nombreux sites. Au cours de ces travaux, plusieurs méthodes complémentaires, basées sur des approches de microbiologie et de génomique environnementale, ont été utilisées, afin d'appréhender d'un point de vue taxonomique mais aussi fonctionnel l'adaptation des communautés bactériennes à ces sols, y compris des bactéries non-cultivées. Cette étude a permis de comprendre l'impact de l'anthropisation que représentent l'activité minière et les processus de revégétalisation sur les communautés bactériennes du sol, et suggère le fort potentiel adaptatif des Actinobactérie

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MEHL, HUBERT. "Adaptation cardiocirculatoire et hemodynamique au cours d'un programme court d'entrainement en endurance chez les transplantes cardiaques". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1993. http://www.theses.fr/1993STR1M101.

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Perrin, Christophe. "Adaptation a l'effort et benefice du reentrainement a l'exercice dans les b. P. C. O". Nice, 1992. http://www.theses.fr/1992NICE6525.

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Michalski, Nicolas. "Transduction mécano-électrique auditive : identification et caractérisation fonctionnelle de ses composants". Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066632.

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Abstract (sommario):

Je me suis intéressé au cours de ma thèse au complexe moléculaire de la transduction mécano-électrique des cellules sensorielles de la cochlée. Ce complexe, qui se situe dans la région apicale des stéréocils de la touffe ciliaire, permet la dépolarisation des cellules sensorielles suite à une stimulation sonore. Il est notamment constitué d’un canal mécanosensible qui serait connecté au lien apical qui unit chaque stéréocil au stéréocil le plus proche de la rangée voisine. Lorsque la touffe ciliaire est défléchie dans la direction excitatrice, les canaux de transduction s’ouvrent et l’entrée de cations donne naissance à un courant de récepteur. Ce courant subit une adaptation. La nature moléculaire du canal de transduction et des composants responsables de l’adaptation, n’est pas connue. Dans le but d’étudier les mécanismes de la transduction mécano-électrique auditive, j’ai développé durant ma thèse une technique d’enregistrement des courants de transduction. Je me suis ensuite intéressé au rôle dans la transduction mécano-électrique de deux protéines de la touffe ciliaire, dont le déficit est à l’origine d’un syndrome d’Usher : Vlgr1 et harmonine.

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Jukovskaya, Natalia. "Adaptation périphérique aux odeurs dans le bulbe olfactif : détection et conséquences sur l'hypérémie fonctionnelle locale". Paris 5, 2010. http://www.theses.fr/2010PA05T036.

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Abstract (sommario):

L'imagerie fonctionnelle utilise les changements hémodynamiques pour détecter l'activité neuronale dans le cerveau. Le fait que l'hypérémie fonctionnelle soit déclenchée par la libération de neurotransmetteurs et non par la consommation d'énergie par les neurones activés, est aujourd'hui admis. Cependant les mécanismes qui relient l'activité neuronale et les changements hémodynamiques sont peu connus. Nous avons utilisé le bulbe olfactif comme modèle biologique et la microscopie biphotonique pour étudier les relations entre la quantité de glutamate libérée localement par les terminaisons de cellules olfactives réceptrices et les changements de flux sanguin dans les capillaires. Nous avons démontré que l'hypérémie fonctionnelle a une relation complexe, positive ou négative avec la quantité de glutamate libéré localement en fonction de la présence ou non du phénomène d'adaptation périphérique. Dans le deuxième temps nous avons étudié l'homogénéité de l'activation des cellules olfactives réceptrices. Nous montrons qu'au cours d'une adaptation périphérique la dynamique des signaux calciques varient dans les terminaisons des cellules olfactives réceptrices
Functional Magnetic Resonance Imaging technique (fMRI) uses hemodynamic changes in the brain for mapping neuronal activity. Although it is recognized that functional hyperemia is triggered by neurotransmitter release rather than energy consumption by activated neurons, the mechanisms which link neuronal activity and hemodynamic changes are still under debate. We used the olfactory bulb as a biological model to study the relationship between the amount of locally released glutamate from olfactory receptor neuron terminals and blood flow changes in capillaries. We used two-photon laser scanning microscopy to measure in parallel with high spatial and temporal resolution vascular responses in individual capillaries and Ca2+variations in the terminals of Olfactory Sensory Neurons (OSN). Here we report that functional hyperemia is positively or negatively coupled to the amount of the locally released glutamate as measured for Ca2+signals, depending on the absence or the presence of peripheral adaptation. In parallel we investigated the extent for which OSNs are activated homogeneously. We report that during peripheral adaptation OSN terminals are not homogeneously activated

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Guermazi, Mohammad. "Le concept d'incapacité fonctionnelle : adaptation d'outils de mesure à la langue et au mode de vie". Dijon, 2004. http://www.theses.fr/2004DIJOMU06.

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Abstract (sommario):

Objectifs : analyse des difficultés de traduction en arabe des questionnaires et description des méthodes de traduction et de validation des tests, application aux indices fonctionnels. Méthodologie : Quatre indices fonctionnels ont été traduits en langue arabe et adaptés aux conditions socioculturelles et au mode de vie dela population tunisienne. La méthode d etraduction contre-traduction a été appliquée, suivie d'une révision par un comité d'expert et une étude préliminaire. Les qualités métrologiques de chaque indice ont été par la suite étudiées (validité et répétabilité) sur des populations de patients tunisiens. Résultats : Les difficultés de la traduction des indices fonctionnels sont explicitées, en particulier les différents types d'équivalence langue source/langue cible (sémantique, technique; idiomatique; conceptuelle. . . ). Les difficultés rencontrées sont dues essentiellement aux différences entre le littéraire et le dialecte. Un seul indice a été jugé valide sans modification du nombre d'items. Un indice a été validé après élimination de deux items. Les deux autres indices avaient des qualités métrologiques insuffisantes. Pour l'un nous avons proposé et validé une version modifiée, pour le deuxième nous avons développé et validé un nouvel indice. Conclusion : La méthode courante alliant traduction et contre-traduction est nécessaire mais reste insuffisante et doit être accompagnée au minimum d'un pré test et d'une révision par un comité d'experts. Des recommandations spécifiques pour la traduction adaptation des indices en langue arabe sont données. L'étude des qualités métrologiques est indispensable après toute traduction même la plus méthodique.

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Volle, Emmanuelle. "Organisation anatomo-fonctionnelle du cortex préfrontal latéral pour la mémoire de travail". Paris 6, 2007. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00803140.

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Abstract (sommario):

La mémoire de travail (MT) est un ensemble de processus cognitifs permettant la mise en représentation mentale d’informations et leur utilisation pour agir. Elle permet l’émergence de fonctions élaborées telles que le raisonnement ou la planification. La MT repose, entre autres, sur les propriétés du cortex préfrontal latéral (CPFL). Les théories actuelles proposent une division de cette structure en différentes régions fonctionnelles, spécifiques soit des informations à traiter (domaine visuel ou verbal) soit du traitement à effectuer (maintien en mémoire, manipulation, action). Ainsi notre objectif est de préciser dans quels processus de MT le CPFL est spécifiquement impliqué et quel est le principe d’organisation fonctionnelle de cette région. Les travaux de cette thèse s’appuient sur une approche multimodale combinant études lésionnelles modernes et IRM fonctionnelle. Les résultats montrent que le CPFL est impliqué dans la manipulation des informations et leur utilisation pour l’action, et que pour cela il est organisé en régions spécialisées pour un domaine d’information et d’autres qui ne le sont pas. Ces résultats posent la question de la connectivité entre ces régions et de son lien avec les fonctions cognitives élaborées.

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Lê, Sandra. "Neuropsychologie et neuro-imagerie fonctionnelle des troubles acquis de la perception visuelle : plasticité neuronale et adaptation comportementale". Toulouse 2, 2002. http://www.theses.fr/2002TOU20051.

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Abstract (sommario):

Cette étude a porté sur la neuropsychologie et la neuro-imagerie fonctionnelle d'un cas exceptionnel d'agnosie visuelle (SB) acquise dans l'enfance. Les lésions ont touché la voie ventrale (VV) bilatéralement, et la voie dorsale (VD) à droite. Les tests visuels ont montré que SB utilise une stratégie de reconnaissance visuelle au "trait par trait", et semble avoir préservé un module de traitement implicite des visages. Une expérience de détection de formes en IRM a montré que SB utilise des stratégies visuelles impliquant la VD gauche pouvant pallier une quasi-abence de la VV. Ces observations nous ont montré la nécessité de prolonger l'étude du "rôle" des voies ventrale et dorsale dans la perception visuelle. Enfin, une étude en neuro-imagerie sur la perception visuelle résiduelle du mouvement chez des hémianopsiques a montré que l'activité des aires occipitales latérales, mais pas celle du cortex clcarin, est nécessaire pour la discrimination du mouvement chez ces patients
Through an exceptional case of visual agnosia (SB) acquired in childhood, this thesis constitutes a neuropsychological and neuro-imaging approach to visual perception. Lesions affected the ventral stream (VS) bilaterally and the right dorsal stream (DS). Visual tests showed that SB uses a "feature by feature" visual recognition strategy. Two experiments revealed that SB may have retained a spared module for implicit face processing. A visual form detection experiment in fMRI showed that SB may have developed visual stategies involving the left DS and palliating for the quasi-absence of the VS. These observations showed us the necessity to further investigate the "role" palyed by the ventral and dorsal streams in visual perception. Finally, a neuro-imaging study was conducted on the visual residual discrimination of motion in hemianopes and showed that activation in the lateral occipital areas, but not in the calcarine cortex, is necessary for motion discrimination in these patients

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Gauci, Éléonore. "Adaptation de maillage orientée fonctionnelle et basée sur une métrique pour des simulations aérodynamiques en géométrie variable". Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018AZUR4227/document.

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Abstract (sommario):

En ce qui concerne les problèmes de Dynamique des Fluides Numériques, l’adaptation du maillage est intéressante pour sa capacité à aborder la convergence asymptotique et à obtenir une prévision précise pour des flux complexes à moindre coût. La méthode d’adaptation de maillage anisotrope réduit le nombre de degrés de liberté nécessaires pour atteindre la précision d’une solution donnée, ce qui a un impact positif sur le temps de calcul. De plus, il réduit la dissipation du schéma numérique en tenant compte automatiquement de l'anisotropie des phénomènes physiques à l'intérieur du maillage. Deux approches principales existent dans la littérature. L'adaptation du maillage basée sur les caractéristiques géométriques, qui est principalement déduite d'une estimation de l'erreur d'interpolation utilisant la hessienne du senseur choisi, contrôle l'erreur d'interpolation du capteur sur l'ensemble du domaine de calcul. Une telle approche est facile à mettre en place et a un large éventail d’applications, mais elle ne prend pas en compte l’EDP considérée utilisée pour résoudre le problème. D'autre part, l'adaptation de maillage orientée fonctionnelle, qui se concentre sur une fonctionnelle scalaire, prend en compte à la fois la solution et l'EDP dans l'estimation d'erreur grâce à l'état adjoint. Mais, la conception de cette estimation d'erreur est beaucoup plus compliquée. Cette thèse présente les résultats obtenus avec différentes méthodes de Dynamique des Fluides Numériques: les solveurs de flux arbitrairement lagrangiens-eulériens (ALE) avec schémas explicites et implicites sont présentés et couplés au mouvement de maillage, l’adaptation de maillage feature-based instationnaire pour les géométries mobiles prend en compte les changements des connectivités de maillage durant toute la simulation, l'état adjoint est étendu aux problèmes de géométries mobiles et l'adaptation de maillage instationnaire orientée fonctionnelle pour les maillages mobiles est déduite d'une estimation d'erreur a priori. Plusieurs exemples numériques issus du secteur aéronautique et du domaine de sécurité civile sont considérés
When dealing with CFD problems, mesh adaptation is interesting for its ability to approach the asymptotic convergence and to obtain an accurate prediction for complex flows at a lower cost. Anisotropic mesh adaptation method reduces the number of degrees of freedom required to reach a given solution accuracy, thus impact favorably the CPU time. Moreover, it reduces the numerical scheme dissipation by automatically taking into account the anisotropy of the physical phenomena inside the mesh. Two main approaches exist in the literature. Feature-based mesh adaptation which is mainly deduced from an interpolation error estimate using the Hessian of the chosen sensor controls the interpolation error of the sensor over the whole computational domain. Such approach is easy to set-up and has a wide range of application, but it does not take into account the considered PDE used to solve the problem. On the other hand, goal-oriented mesh adaptation, which focuses on a scalar output function, takes into consideration both the solution and the PDE in the error estimation thanks to the adjoint state. But, the design of such error estimate is much more complicated. This thesis presents the results obtained with different CFD methods : the Arbitrary Lagrangian Eulerian (ALE) flow solvers with explicit and implicit schemes are presented and coupled to the moving mesh process, the feature-based unsteady mesh adaptation for moving geometries takes into account the changes of connectivites during the whole simulation, the adjoint state is extended to moving geometries problems and goal-oriented unsteady mesh adaptation for moving meshes is derived from an a priori error estimate. Several numerical examples are considered in the aeronautics sector and the field of civil security

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Mano, Jean-Pierre. "Étude de l'émergence fonctionnelle au sein d'un réseau de neuro-agents coopératifs". Toulouse 3, 2006. http://www.theses.fr/2006TOU30067.

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Abstract (sommario):

Les systèmes autopoïétiques résultent de processus auto-organisés, de programmes développementaux et de l'effet de leur activité dans l'environnement. Les approches connexionnistes conventionnelles négligent nombre des ces interactions contrairement aux systèmes multi-agents adaptatifs qui, ouverts et autonomes, peuvent s'adapter à un environnement dynamique. Nous avons hybridé la granularité fonctionnelle des neurones artificiels avec les potentialités ontogéniques des systèmes multi-agents auto-organisateurs. Le neuro-agent utilise la coopération comme critère local d'ajustement de sa fonction nominale de traitement de l'information, des comportements de prolifération, de la connectivité et du niveau d'activité. L'apprentissage connexionniste ou régulation synaptique se distingue alors de l'adaptation du système ou ontogenèse affectant la structure du réseau. L'originalité de ce travail permet de reproduire des fonctions cognitives, sans supervision ni modèle sémantico-symbolique.

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Arivalagan, immanuel Jaison Rathina Raj. "Insights from shell proteome : biomineralization control and environmental adaptation in bivalves". Thesis, Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2017. http://www.theses.fr/2017MNHN0026/document.

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Abstract (sommario):

Le processus de biominéralisation confère aux organismes qui le développent une valeur adaptative. La coquille carbonatée des mollusques intègre les fonctions de protection biomécanique à différentes échelles. La coquille résulte de l'association de composés inorganiques et d'une matrice organique protéique, médiatrice du contrôle biologique de la minéralisation. L'analyse du protéome de la coquille chez 4 espèces de bivalves met en évidence deux patrons fonctionnels et leur degré de conservation phylogénétique : l'un lié au contrôle de la minéralisation stricto sensu ; l'autre à la protection immune. L'étude de populations vivant à l'état naturel en mer Baltique, dont les eaux présentent localement de fortes variations ioniques montre que le protéome intègre également l'impact de conditions environnementales limitantes. L'anthropocène impose un rythme adaptatif pressant aux organismes et la modification acido-basique des eaux océaniques est susceptible d'impacter sensiblement les organismes calcifiants. La signature de mécanismes adaptatifs du contrôle biologique de la biominéralisation se traduit dans le protéome de la coquille. Les implications sont particulièrement signifiantes dans un contexte d'intérêt de développement aquacole grandissant
In this study, the SMPs from four commercially important and divergent bivalve species crassostrea gigas (pacific oyster), Mya truncata (soft shell clam), Mytilus edulis (blue mussel) and Pecten maximus (king scallop) were extracted and analysed using standardized extraction protocol and proteomic pipeline. This enables us to identify critical elements of basic biomineralization tool kit for calcification process irrespective of their shell morphology, mineralogy and microstructure. In addition, it enables the identification of SMPs that are specific to calcite and aragonite mineralogies. The signifiant numbers of SMPs found species-specific were hypothesized as adaptation to their modus vivendi. In fact, the latter proteins possess immunity-related functions and fit into specific pathway, phenoloxidase, suggesting their role in defense against pathogen. The comparative study of shell proteome of mussels living in full marine condition, North Sea and the Iow saline Baltic Sea showed the modulation of the SMPs that constitute the basic biomineralization tool kit. Higher modulation of chitin related proteins and non-modulated protein such as carbonic anhydrase, EGF and fibronectin domain containing proteins points out the impaired scaffold and mineral nucleation process in Baltic mussel. The modulation of immunity related proteins denote the influence of biotic components. These investigations show the functional diversity of SMPs and their roles beyond shell formation in the bivalvesand put forth the idea that shell is dynamic, endowed with both biochemical and mechanical protection

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Volle, Emmanuelle. "ORGANISATION ANATOMO-FONCTIONNELLE DU CORTEX PREFRONTAL LATERAL POUR LA MEMOIRE DE TRAVAIL". Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00803140.

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Abstract (sommario):

La mémoire de travail (MT) est un ensemble de processus cognitifs permettant la mise en représentation mentale d'informations et leur utilisation pour agir. Elle permet l'émergence de fonctions élaborées telles que le raisonnement ou la planification. La MT repose, entre autres, sur les propriétés du cortex préfrontal latéral (CPFL). Les théories actuelles proposent une division de cette structure en différentes régions fonctionnelles, spécifiques soit des informations à traiter (domaine visuel ou verbal) soit du traitement à effectuer (maintien en mémoire, manipulation, action). Ainsi notre objectif est de préciser dans quels processus de MT le CPFL est spécifiquement impliqué et quel est le principe d'organisation fonctionnelle de cette région. Les travaux de cette thèse s'appuient sur une approche multimodale combinant études lésionnelles modernes et IRM fonctionnelle. Les résultats montrent que le CPFL est impliqué dans la manipulation des informations et leur utilisation pour l'action, et que pour cela il est organisé en régions spécialisées pour un domaine d'information et d'autres qui ne le sont pas.Ces résultats posent la question de la connectivité entre ces régions et de son lien avec les fonctions cognitives élaborées.

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Gries, Jean-Michel. "Qualité fonctionnelle du greffon et adaptation posologique de la ciclosporine au cours des greffes hépatiques : évaluation et perspectives". Paris 5, 1993. http://www.theses.fr/1993PA05P179.

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Mazurier, Mélanie. "Biodiversité et adaptation au pathogène racinaire Verticillium alfalfae chez Medicago truncatula : Importance de la micro-évolution". Thesis, Toulouse 3, 2018. http://www.theses.fr/2018TOU30057/document.

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Abstract (sommario):

Les légumineuses font parties des familles les plus cultivées à la fois pour l'alimentation humaine et pour l'alimentation animale. Une des maladies principales de la luzerne (Medicago sativa), plante fourragère la plus cultivée au monde, est la verticilliose causée par Verticillium alfalfae, un champignon du sol. Sans traitements phytosanitaires efficaces et pratiques pour les maladies causées par des pathogènes du sol, la protection des cultures passe par la sélection de variétés résistantes. Dans cette thèse, la légumineuse modèle Medicago truncatula a été utilisée afin d'identifier des gènes candidats à la résistance quantitative à Verticillium alfalfae V31-2 (Va V31-2). La première étape de ces travaux a révélé des sources de résistance à la souche Va V31-2 au sein de l'espèce M. truncatula. Pour cela, 261 lignées (dont 246 accessions issues du projet MtHapMap) ont été inoculées et le développement de flétrissements foliaires a été suivi pendant quatre semaines, suivi d'un réisolement du pathogène à partir des parties aériennes. Ces analyses ont révélé une grande biodiversité de réponse à la verticilliose au sein de l'espèce Medicago truncatula, avec une variabilité inter et intra-populations. Dans une seconde partie, des QTL pour la résistance partielle à la verticilliose ont été identifiés par génétique d'association (GWAS) permettant la découverte de nouveaux QTL de résistance à Va V31-2 et la confirmation de la présence d'un QTL majeur sur le chromosome 7 précédemment décrit. Selon les phénotypes de maladie utilisés pour l'étude de GWAS, les QTL détectés sont différents, ce qui suggère des contrôles génétiques différents pour l'évolution des symptômes de maladie et la colonisation des parties aériennes par Va V31-2. Une seconde analyse de GWAS menée sur 90 accessions de la population tunisienne Soliman a révélé des gènes candidats différents de ceux identifiés à partir de la collection MtHapmap, suggérant une possible adaptation locale. La validation fonctionnelle de gènes candidats pour la résistance partielle a été entamée, en privilégiant ceux situés sur le chromosome 7, à la convergence de différentes études génétiques. La mise en place d'un système d'inoculation in vitro de racines transgéniques a permis de révéler le rôle du gène Medtr7g070480 codant pour une protéine SEC14 dans la résistance à Va V31-2. L'extinction de l'expression de ce gène par microARN artificiel dans le génotype A17 (résistant) et F83005.5 (sensible) diminue la colonisation des racines par Va V31-2, alors que sa surexpression augmente la colonisation chez A17 : il s'agirait donc d'un gène de sensibilité. L'unique polymorphisme génétique entraînant une substitution non synonyme entre A17 et F83005.5 explique 18,5% de la variation du niveau de résistance observée au sein des 246 accessions MtHapmap. L'étude de l'expression racinaire du gène MtSEC14 24 heures après inoculation par Va V31-2 dans un panel de 14 accessions sensibles et résistantes n'a pas montré de différences significatives entre ces deux types d'accessions. En parallèle, des gènes orthologues aux gènes candidats à la résistance à V. alfalfae ont été identifiés chez d'autres plantes modèles (Lotus japonicus, Arabidopsis thaliana, Nicotiana sp.), puis la pathogénicité de Va V31-2 a été testée chez ces espèces en vue de leur éventuelle utilisation pour valider le rôle de ces gènes. Un unique orthologue à MtSEC14 a également été identifié chez Medicago sativa. Grâce à la synténie entre M. truncatula et M. sativa, nos travaux pourront très probablement être transférés à la luzerne cultivée. A notre connaissance, ces travaux mettent en évidence pour la première fois le rôle d'un gène de sensibilité dans une résistance partielle à un micro-organisme chez les Légumineuses
Pathogens, animals and weeds are responsible for losses ranging from 20% to 40% of global agricultural yield. Legumes are the second most grown crops after cereals as human and animal food, and their yield is also affected by pathogens. Verticillium alfalfae is a soil-borne pathogen causing high yield losses in alfalfa fields (Medicago sativa), the most worldwide legume forage crop grown. To date, there is no chemical control and crop breeding is the best way to protect alfalfa against V. alfalfae. However, Medicago sativa has a complex genome (allogamous and tetraploid), therefore in this work the model legume Medicago truncatula (diploid and self-fertile) was used to investigate genetic mechanisms involved in V. alfalfae V31-2 (Va V31-2) resistance. First, several sources of resistance were identified in M. truncatula biodiversity by assessing disease symptoms development in 261 lines from the Mediterranean basin inoculated by V. alfalfae V31-2. Reisolation of V. alfalfae V31-2 in M. truncatula stems was also led. These analyses revealed a great biodiversity of M. truncatula response towards Va V31-2. A genome wide association study (GWAS) on various disease phenotypes pinpointed several quantitative trait loci (QTL): one of them colocalized with a previous major QTL on chromosome 7 detected on LR4 and LR5 RILs populations. Both phenotypic and genetic analyses thus suggest the occurrence of different resistance mechanisms in M. truncatula populations towards V. alfalfae. Resistant candidate genes towards Va V31-2 were also identified by GWAS using 90 accessions of M. truncatula Soliman Tunisian population. These candidate genes are different from the pinpointed candidate gene of our previous GWAS analysis. These results might underline a local adaptation towards Verticillium. Consistencies between GWAS results with previous QTL and transcriptomic data led us to perform the functional validation with the candidate genes localized on chromosome 7. An original in vitro inoculation system of M. truncatula transgenic roots was used to validate Medtr7g070480 (gene encoding a SEC14 protein) as a key player towards V. alfalfae V31.2 in M. truncatula. Silencing the SEC14 gene using artificial microRNA in A17 (resistant) and F83005.5 (susceptible) lines decreases Va V31-2 colonization rate on transgenic roots whereas overexpressing MtSEC14 increases the colonization rate in A17. This MtSEC14 gene appears as a disease susceptibility gene. Moreover, 18.5% of the disease variation in the studied M. truncatula accessions is explained by the unique non-synonymous polymorphism between A17 and F83005.5 in MtSEC14. Root expression patterns of the SEC14 gene one day after inoculation by Va V31-2 was also analyzed in response to inoculation among a panel of 14 susceptible and resistant M. truncatula accessions of diverse geographic origins. No significant differences were found. At the same time, orthologous resistance candidate genes towards Va V31.2 in several other model species (Lotus japonicus, Arabidopsis thaliana, Nicotiana sp.) were discovered. Pathogenicity of Va V31-2 in these species was monitored to use them as potential model for functional validation. Only one orthologous gene of MtSEC14 has been identified in Medicago sativa. Because of a great synteny between M. truncatula and M. sativa, our work could be useful for alfalfa breeding. In this work and for the first time, a susceptibility gene involved in a quantitative resistance against microorganisms in Legumes was identified

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Delaforge, Elise. "Dynamique structurale et fonctionnelle du domaine C-terminal de la protéine PB2 du virus de la grippe A". Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015GREAV037/document.

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Abstract (sommario):

La capacité du virus de la grippe aviaire à traverser la barrière des espèces et à devenir fortement pathogène chez les mammifères est un problème majeur de santé publique. Chez les oiseaux, la réplication a lieu dans l'intestin, à 4C, tandis que chez les humains elle a lieu dans l'appareil respiratoire, plus froid, à 33C. Il a été montré que l'adaptation à la température du virus de la grippe a lieu par de nombreuses mutations de la polymérase virale, notamment dans le domaine 627-NLS situé en C-terminal de la protéine PB2. Ce domaine est impliqué dans l'adaptation à l'hôte et interagit avec la protéine de l'hôte, importine alpha, étant donc indispensable pour l'entrée de la polymérase virale dans le noyau de la cellule [Tarendeau et al., 2008]. Les structures cristallographiques du 627-NLS et du complexe importine alpha/NLS existent. Cependant, lors de la superposition de ces structures via leur domaine NLS commun, un important choc stérique entre le domaine 627 et l'importine alpha devient évident. Ceci indique qu'une autre conformation du 627-NLS est requise pour l'interaction avec l'importine alpha [Boivin and Hart, 2011]. Dans cette étude, nous avons examiné les bases moléculaires de l'adaptation inter-espèces du virus à travers l'étude de la structure et de la dynamique du 627-NLS aviaire et humain. Nous avons identifié deux conformations du 627-NLS en échange lent (10-100 s-1), correspondant apparemment à une conformation ouverte et une conformation fermée des deux domaines. Nous proposons que la conformation ouverte du 627-NLS est la seule conformation compatible avec l'interaction avec l'importine alpha, et que l'équilibre entre conformation ouverte et fermée pourrait jouer le rôle de thermostat moléculaire, contrôlant l'efficacité de la réplication virale chez différents hôtes. La cinétique et la dynamique de ce comportement conformationnel important ainsi que de l'interaction entre le 627-NLS et l'importine alpha ont été caractérisées par résonance magnétique nucléaire (déplacements chimique, augmentation paramagnétique de la relaxation, relaxation de spin, transfert de saturation par l'échange chimique), combinée à la diffusion des rayons X et des neutrons aux petits angles ainsi qu'au transfert d'énergie par résonance de type Förster. Aussi, nous avons déterminé les affinités d'une série de mutants évolutifs du 627-NLS pour l'importine alpha et du 627-NLS aviaire ou humain pour différents isoformes de l'importine alpha, montrant que les affinités observées sont cohérentes avec les préférences d'interactions vues in vivo
The ability of avian influenza viruses to cross the species barrier and become dangerously pathogenic to mammalian hosts represents a major threat for human health. In birds the viral replication is carried out in the intestine at 40°C, while in humans it occurs in the cooler respiratory tract at 33°C. It has been shown that temperature adaption of the influenza virus occurs through numerous mutations in the viral polymerase, in particular in the C-terminal domain 627-NLS of the PB2 protein. This domain has already been shown to participate in host adaptation and is involved in importin alpha binding and therefore is required for entry of the viral polymerase into the nucleus [Tarendeau et al., 2008]. Crystallographic structures are available for 627-NLS and the complex importin alpha/NLS, however, a steric clash between importin alpha and the 627 domain becomes apparent when superimposing the NLS domain of the two structures, indicating that another conformation of 627-NLS is required for binding to importin alpha [Boivin and Hart, 2011]. Here we investigate the molecular basis of inter-species adaptation by studying the structure and dynamics of human and avian 627-NLS. We have identified two conformations of 627-NLS in slow exchange (10-100 s-1), corresponding to an apparently open and closed conformation of the two domains. We show that the equilibrium between closed and open conformations is strongly temperature dependent. We propose that the open conformation of 627-NLS is the only conformation compatible with binding to importin alpha and that the equilibrium between closed and open conformations may play a role as a molecular thermostat, controlling the efficiency of viral replication in the different species. The kinetics and domain dynamics of this important conformational behaviour and of the interaction between 627-NLS and importin alpha have been characterized using nuclear magnetic resonance chemical shifts, paramagnetic relaxation enhancement, spin relaxation and chemical exchange saturation transfer, in combination with X-ray and neutron small angle scattering and Förster resonance energy transfer. Also, we have determined the affinities of various evolutionnary mutants of 627-NLS to importin alpha and of avian and human 627-NLS to different isoforms of importin alpha, showing that the observed affinities are coherent with the preferred interactions seen in vivo

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Doriat, Jean-François. "Adaptation fonctionnelle cérébrale et plasticité des récepteurs à la suite de convulsions expérimentales chez le rat au cours du développement". Nancy 1, 1998. http://www.theses.fr/1998NAN10353.

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Marion, Julia. "Le sevrage du porcelet à l'âge de 7 jours : adaptation structurale et fonctionnelle du pancréas exocrine et de l'intestin grêle". Rennes 1, 2002. http://www.theses.fr/2002REN10101.

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Abstract (sommario):

L'objectif de ce travail est l'étude des changements de l'expression des enzymes digestives pancréatiques et intestinales et de la morphométrie intestinale: 1- au cours des 2 semaines qui suivent un sevrage précoce chez le porcelet à l'âge de 7 jours et 2- en réponse au niveau alimentaire et à la supplémentation orale en IGF-I ou en extrait de colostrum bovin. Le niveau d'énergie ingérée constitue le principal facteur impliqué dans les changements de hauteur des villosités intestinales, mais son effet sur l'expression enzymatique est variable selon l'enzyme considérée. Enfin, la hauteur des villosités et la synthèse protéique de la muqueuse duodénale sont améliorées par l'extrait colostral riche en peptides bioactifs, mais non par l'IGF-I. L'adaptation digestive soit la rduction et la restauration de la hauteur des villosités et des activits des enzymes digestives observées après le sevrage du porcelet à l'âge de 7 jours sont qualitativement et quantitativement similaires à celles rapportées après un sevrage plus tardif.

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Bouali, Saoussen. "Adaptation fonctionnelle de la neurotransmission 5-HT dans des modèles de souris en relation avec la dépression et son traitement". Paris 6, 2004. http://www.theses.fr/2004PA066439.

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Bouatrous, Amal. "Conception et développement d’un environnement de rééducation fonctionnelle personnalisée basé sur la réalité virtuelle". Electronic Thesis or Diss., Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Atlantique Bretagne Pays de la Loire, 2024. http://www.theses.fr/2024IMTA0409.

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Abstract (sommario):

L'accident vasculaire cérébral (AVC) est une cause majeure de décès et d'invalidité, souvent suivie de séquelles telles que l'hémiparésie des membres supérieurs, qui a un impact négatif sur l'indépendance des personnes dans leurs activités quotidiennes. La rééducation classique est nécessaire pour retrouver la fonctionnalité perdue, mais elle peut être monotone. La réalité virtuelle (RV) offre une solution attrayante, motivante et efficace, répondant aux exigences nécessaires à une rééducation réussie. L'objectif de cette thèse est de concevoir et de développer un environnement virtuel pour la rééducation fonctionnelle personnalisée des membres supérieurs après un AVC. Plus précisément, nous nous sommes intéressés à la rééducation fonctionnelle de la main par le biais de jeux sérieux basés sur la RV. Ainsi, deux jeux sérieux visant à améliorer les mouvements grossiers et fins de la main ont été mis en place en simulant deux exercices cliniques, et en utilisant le capteur de mouvement Leap Motion. Nous avons incorporé des éléments de jeux vidéo pour motiver les patients et personnaliser la difficulté en fonction de leurs capacités motrices. Enfin, nous avons mis en œuvre une approche permettant d'adapter dynamiquement la difficulté des jeux. Une collaboration étroite avec les thérapeutes et les patients a été maintenue durant le processus de conception, afin de répondre aux spécifications cliniques. Le système a été évalué en termes de précision de mesure sur des individus sains, ce qui s'est avéré satisfaisant. En outre, une évaluation clinique subjective avec des patients réels a montré que le système était accepté et motivant, renforçant l'engagement des patients dans leur rééducation
Stroke is a major cause of death and disability, often followed by sequelae such as upper limb hemiparesis, which has a negative impact on people's independence in their daily activities. Conventional rehabilitation is necessary to regain lost functionality, but can be monotonous. Virtual reality (VR) offers an attractive, motivating and effective solution, meeting the necessary requirements for successful rehabilitation. The aim of this thesis is to design and develop a virtual environment for personalized functional rehabilitation of the upper limbs after stroke. More specifically, we have focused on the functional rehabilitation of the hand using VR-based serious games. Thus, two serious games aimed at improving coarse and fine hand movements were set up by simulating two clinical exercises, and using the Leap Motion motion sensor. Incorporating video game elements to motivate patients and personalize difficulty according to their motor skills. Finally, we implemented an approach to dynamically adapt the difficulty of the games. Close collaboration with therapists and patients was maintained during the design process, in order to meet clinical specifications. The system was evaluated in terms of measurement accuracy on healthy individuals, which proved satisfactory. In addition, a subjective clinical evaluation with real patients showed that the system was accepted and motivating, reinforcing patients' commitment to their rehabilitation

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Plasse, Martial. "Loi de Wolff et terrestrialisation : adaptation structure / fonction". Thesis, Sorbonne université, 2019. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=http://theses-intra.upmc.fr/modules/resources/download/theses/2019SORUS303.pdf.

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Abstract (sommario):

Le mode de vie des tétrapodes éteints est souvent difficile à évaluer sans adaptations morphologiques évidentes, comme des palettes natatoires. Selon l’hypothèse de l’adaptation fonctionnelle de l’os, l’architecture de l’os trabéculaire s’adapte avec précision aux chargements physiologiques. Les études précédentes ont déjà montré une relation claire entre l’architecture trabéculaire et le comportement locomoteur, principalement chez les mammifères et les oiseaux. Toutefois, le lien entre l’architecture trabéculaire et le mode de vie a rarement été étudié. Ici, l’architecture trabéculaire de différents reptiles a été mise en relation avec une large variabilité de modes de vie (aquatique, amphibie, terrestre). Les humeri de squamates, de tortues et crocodyliens ont été scannés par micro-tomographie à rayons X. L’analyse de volumes sphériques extraits de la métaphyse proximale de ces humeri a montré un signal phylogénétique significatif pour un seul des paramètres trabéculaires mesurés. Les analyses discriminantes linéaires suggèrent une bonne séparation des modes de vie selon les espaces morphologiques. De plus, une nouvelle méthode a permis d’estimer des chargements articulaires à partir de modèles d’éléments finis, issus de têtes humérales entières de tortues. Des biais liés aux fixations de ces modèles et à la forme de ces articulations ont été identifiés. Des chargements différents ont été calculés entre les nages et la marche de tortues amphibies. Enfin, les locomotions de deux tortues fossiles ont été inférées. Grâce à ces deux méthodes, l’architecture trabéculaire semble être un outil efficace pour inférer le mode de vie et la locomotion de tétrapodes éteints, spécialement ceux impliqués dans la terrestrialisation ou les retours au milieu aquatique
The lifestyle of extinct tetrapods is often difficult to assess when clear morphological adaptations, such as swimming paddles are absent. According to the hypothesis of bone functional adaptation, the architecture of trabecular bone adapts sensitively to physiological loadings. Previous studies have already shown a clear relation between trabecular architecture and locomotor behavior, mainly in mammals and birds. However, the link between trabecular architecture and lifestyle has rarely been examined. Here, trabecular architecture of different clades of reptiles has been correlated with a wide range of lifestyles (aquatic, amphibious, terrestrial). Humeri of squamates, turtles and crocodylians have been scanned with X-ray computed microtomography. The analysis of spherical volumes extracted from the proximal metaphyses of these humeri showed a significant phylogenetic signal for one of measured trabecular parameters. Linear discriminant analyses suggest a good separation of lifestyles in the morphological spaces. Furthermore, a new method allowed to estimate articular loadings for finite elements models from entire humeral heads of turtles. Biases related to fixations of these models and to their articular shapes has been identified. Different loadings has been calculated between the swimming and the walking of amphibious turtles. Finally, locomotions of two fossil turtles have been inferred. Thanks to these two methods, the trabecular architecture seems to be an effective tool to infer the lifestyle and the locomotion of extinct tetrapods, especially those involved in the terrestrialization and returns to aquatic environment

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Schell, Eve. "Anastomose iléo-anale avec réservoir iléal en J. : adaptation fonctionnelle et réinsertion socio-professionnelle des opérés : à propos de 15 cas". Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1990. http://www.theses.fr/1990STR1M123.

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Devauchelle, Anne-Dominique. "Exploration du réseau cérébral impliqué dans les traitements syntaxiques et lexico-sémantiques des phrases". Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066295.

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Abstract (sommario):

Ce travail de thèse a pour but d’explorer les aires cérébrales impliquées dans les traitements syntaxiques et sémantiques des phrases en IRMf chez des adultes sains. Nous avons observé des effets d’adaptation lexico-sémantique dans la plupart des aires temporales et frontales impliquées dans le traitement des phrases. Nous avons trouvé plusieurs régions montrant des effets d’adaptation à la répétition de la forme des mots, du sens des mots et de la structure argumentale de la phrase. Mais aucun effet clair d’adaptation syntaxique n’a pu être observé. Enfin, l’implication des régions temporales supérieures antérieures et postérieures gauches, des régions frontales inférieures gauches et du putamen gauche dans la construction des constituants d’une phrase a été montrée. Ces résultats suggèrent qu’aucune aire cérébrale n’est impliquée dans la représentation de l’arbre syntaxique complet, alors que des aires sont impliquées dans la construction des constituants de la phrase

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Masson, Florence. "Hétérogénéité structurale et fonctionnelle de la membrane plasmique de feuilles de tabac (Nicotiana tabaccum c. V. Xanthi)". Montpellier 2, 1994. http://www.theses.fr/1994MON20060.

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Abstract (sommario):

La membrane plasmique constitue l'interface ou sont integres nombre de signaux endogenes ou environnementaux. Nous avons etudie la sensibilite a l'auxine de la h#+-atpase de la membrane plasmique de feuilles de tabac au niveau de sous-populations de membrane plasmique, en fonction de l'age de la plante (au cours du developpement), en fonction de l'age de la feuille (selon la position de la feuille dans la plante) et au cours de l'alternance photoperiodique. Dans tous les cas une heterogeneite de la sensibilite a l'hormone a ete mise en evidence. Nos resultats demontrent en particulier l'existence de gradients spatio-temporels de la sensibilite membranaire a l'hormone. Parallelement, la composition polypeptidique de la membrane a ete analysee par electrophorese bidimensionnelle quantifiee par analyse d'image. Dans tous les cas, plus des deux-tiers des proteines intrinseques de la membrane plasmique s'averent soumis a une dynamique forte. La comparaison des differentes cartographies montre que globalement, moins de 10% des proteines s'avere stable a court ou long terme (durant le nycthemere ou le developpement). L'ensemble de ces resultats demontre l'existence d'une importante dynamique fonctionnelle et structurale de la membrane, meme en conditions environnementales constantes. L'analyse de cette situation, insoupconnee jusqu'a present, suggere une integration forte entre la physiologie de la plante entiere et les caracteristiques de la membrane plasmique. La confrontation des deux approches, fonctionnelle et structurale, permet en outre de reperer des proteines membranaires marqueurs potentiels de la reponse a l'auxine ou du stade de developpement de la plante. La signification de ces differents marqueurs est discutee (i) en reference au mode d'action de l'hormone, (ii) a leur role eventuel au cours de l'induction florale ou (iii) a leur utilisation possible, lors de la mise en place des processus de senescence, pour caracteriser la maturite agrotechnologique de la feuille de tabac

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Alayrangues, Julie. "Etude des réponses oscillatoires bêta aux erreurs de mouvements : dissociation fonctionnelle et spatiale des modulations de puissance bêta observées pendant la période de préparation et après le mouvement". Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0090/document.

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Abstract (sommario):

À ce jour, le rôle des oscillations bêta n’a pas encore été clairement établi. Des travaux récents ont montré que l’activité bêta pendant la préparation du mouvement et celle suivant son exécution sont différemment modulées par les erreurs de mouvements. L’objectif du présent travail a été double : premièrement, déterminer si les modulations de puissance bêta pré- et post-mouvement recrutent des substrats cérébraux différents, deuxièmement, mieux cerner la nature des processus neuronaux reflétés. Grâce à une approche par analyse en composantes indépendantes, nous suggérons fortement que les réponses oscillatoires, aux erreurs cinématiques, observées avant et après le mouvement sont sous-tendues par des structures distinctes, respectivement clairement latéralisées et médiales. De plus, en contrastant différentes tâches motrices, nous montrons que ni l’une ni l’autre des deux activités bêta ne reflètent des mécanismes en lien direct avec les sorties motrices
The role of beta oscillations has not been clearly established yet. Recent work has shown that the beta activities observed during the preparation phase and after the movement are differently affected by movement errors. The aim of this thesis was twofold: first, to determine whether or not the pre- and post-movement beta power modulations recruit common neural substrates; second, to better understand the nature of the reflected neural processes. Using an independent component analysis approach, we strongly suggest that oscillatory responses to kinematic errors, observed before and after movement, are underpinned by distinct neural structures, respectively clearly lateralized and medial. Moreover, by contrasting different motor tasks, we show that neither of the two beta activities reflects mechanisms directly related to the output of the motor command

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Doré, Hugo. "Adaptation à la niche écologique chez deux représentants majeurs du phytoplancton marin, Synechococcus et Prochlorococcus : des gènes à l'écosystème". Thesis, Paris 6, 2017. http://www.theses.fr/2017PA066512/document.

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Abstract (sommario):

Les picocyanobactéries marines Prochlorococcus et Synechococcus sont les organismes photosynthétiques les plus abondants sur la planète et sont présentes dans presque tous les océans. Au cours de cette thèse, j'ai cherché à mieux comprendre les liens entre diversité génétique et adaptation à la niche écologique chez ces deux genres. Tout d'abord, l'étude de la répartition des populations de picocyanobactéries à l'échelle mondiale à l'aide d'un marqueur taxonomique très résolutif m'a permis de définir des unités taxonomiques écologiquement significatives, et d'identifier les principaux facteurs abiotiques influençant leur répartition. La deuxième partie de ce travail a visé à identifier les bases génétiques de l'adaptation des picocyanobactéries marines à des niches écologiques distinctes. L'étude comparative de 81 génomes non-redondants de ces organismes a révélé le rôle combiné des gains et pertes de gènes et des substitutions d'acides aminés dans la diversification des deux genres, et l'analyse de la répartition des gènes de picocyanobactéries marines dans l'océan mondial m'a permis de montrer que chaque communauté, adaptée à un environnement donné, possède un répertoire de gènes distinct. Enfin, le dernier volet de cette thèse a consisté en la caractérisation physiologique et transcriptomique de cinq souches de Synechococcus soumises à des stress lumineux et thermique afin d'analyser la variabilité écotypique de la réponse au stress. Les résultats obtenus au cours de cette thèse ont donc permis d'améliorer notre connaissance des niches écologiques occupées par les picocyanobactéries marines, et de mieux comprendre les mécanismes leur ayant permis de s'y adapter
The marine picocyanobacteria Synechococcus and Prochlorococcus are the two most abundant photosynthetic organisms on earth and are present in almost all oceans. During this PhD thesis, I explored the links between genetic diversity and niche adaptation in these two genera. First, the analysis of the distribution of picocyanobacterial populations at the global scale using a high-resolution taxonomic marker allowed me to define ecologically significant taxonomic units, to improve the delineation of their ecological niches and to identify the main abiotic factors influencing their in situ distribution. The second part of this work aimed at identifying the genetic bases of adaptation of marine picocyanobacteria to distinct niches. The comparative analysis of 81 non-redundant genomes of these organisms revealed the combined role of gene gains and losses and of substitutions in protein sequences in the diversification of both genera, and the analysis of the distribution of all known picocyanobacterial genes in the global ocean allowed me to show that each community, adapted to specific environmental conditions, possesses a distinct gene repertoire. Finally, the last part of this work has consisted in the physiological and transcriptomic characterization of five Synechococcus strains, which were submitted to light and thermal stresses in order to better understand the ecotypic variability of the stress response in this genus. Altogether, results obtained during this PhD provided many new insights into the ecological niches occupied by marine picocyanobacteria and the mechanisms allowing them to adapt to these various niches

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Vile, Denis. "Significations fonctionnelle et écologique des traits des espèces végétales : exemple dans une succession post-culturale méditerranéenne et généralisations". Thèse, Université de Sherbrooke, 2005. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/5080.

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Abstract (sommario):

Ce travail de thèse a pour objectifs principaux de comprendre la réponse des espèces végétales aux modifications des facteurs du milieu et l'effet des changements de compositions spécifique et fonctionnelle sur le fonctionnement des écosystèmes, en utilisant une approche centrée sur les traits biologiques des espèces. Ce travail participe au développement théorique et expérimental de l'approche fonctionnelle. Une formalisation du concept de stratégie fonctionnelle des végétaux par l'utilisation de la modélisation par équations structurales est proposée. Cette formalisation permet d'étudier la réponse coordonnée d'un complexe de traits inter-reliés aux changements des conditions environnementales. Un schéma conceptuel reliant les traits potentiels, mesurés en conditions contrôlées, les traits réalisés en conditions naturelles et leurs effets sur les processus écosystémiques est développé. Les hypothèses sont testées par une approche comparative menée sur les espèces dominantes de différents stades d'une succession post-culturale en région méditerranéenne. Enfin, un dernier objectif vise à relier traits structuraux et fonctionnels des feuilles sur un grand nombre d'espèces, indépendamment de leur taxinomie et de leur position écologique. La constitution de bases de données associées à une approche de modélisation permet dans ce cas de démontrer des patrons généraux et de tester des hypothèses sur les mécanismes qui contrôlent la vitesse de photosynthèse.

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Loseille, Adrien. "Adaptation de maillage anisotrope 3D multi-échelles et ciblée à une fonctionnelle pour la mécanique des fluides.Application à la prédiction haute-fidélité du bang sonique". Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00361961.

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Abstract (sommario):

En mécanique des fluides (CFD), l'adaptation de maillage anisotrope est reconnue pour sa capacité à réduire le ratio entre le nombre de degrés de liberté et la précision du calcul. Cependant, son application dans le cas d'écoulements compressibles avec des chocs pose les problématiques suivantes : (i) les schémas numériques d'ordre élevé de type shock capturing retombent à l'ordre un dans les chocs, (ii) les senseurs utilisés pour l'adaptation prescrivent dans les chocs des tailles qui tendent vers zéro. Il est donc nécessaire de prescrire une taille minimale. On perd alors tout l'intérêt d'une adaptation anisotrope. On apporte une réponse à ces problématiques en considérant une adaptation anisotrope multi-échelles du maillage basée sur le modèle de maillage continu. On alors montre que le processus adaptatif converge dans les chocs si le schéma numérique utilisé est non compressif. La prescription d'une taille minimale n'est plus nécessaire. On retrouve également un ordre deux de convergence dans tout le domaine, même en présence de chocs. Si on se donne des informations supplémentaires (fonctionnelle précise à observer, équation aux dérivées partielles, schéma numérique utilisé pour la résoudre) les méthodes génériques précédentes ne sont plus op- timales dans la distribution des degrés de liberté. On étudie cette problématique dans le cas particulier des équations d'Euler pour des fonctionnelles scalaires. Ce type d'étude est très bien adapté pour le calcul de grandeurs d'intérêt comme la portance ou la traînée en aérodynamique. On propose une estimation d'erreur a priori pour le contrôle de l'erreur d'approximation sur une fonctionnelle. Cette estimation est ensuite minimisée sur l'espace des maillages continus afin de décrire le maillage anisotrope optimal. Enfin, on applique l'adaptation multi-échelles à la prédiction haute-fidélité du bang sonique.

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Benayad, Ahmed. "Conception de capteurs-émetteurs et réalisation d'un ensemble de télémesure pour l'étude de la marche normale ou appareillée en rééducation fonctionnelle". Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1991. http://www.theses.fr/1991INPL060N.

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Abstract (sommario):

L'objectif de cette recherche est la conception de capteurs-émetteurs et la réalisation d'un ensemble de télémesure spécialement adapté aux handicapés moteurs. Cet appareillage installé dans deux cannes et des semelles, assiste le patient au cours de la rééducation. L'objectif premier est de déterminer la force d'appui exercée sur la canne afin de pouvoir contrôler l'amplitude de la contrainte mécanique en rééducation. Les différentes étapes de conceptions et de réalisations du système sont analysées. à toutes ces réalisations, des solutions sont apportées pour résoudre les problèmes d'émission et de réception du signal issu des capteurs et en particulier à ceux de l'amplification, du filtrage et de l'adaptation de l'antenne. L'analyse, l'interprétation, la méthodologie et la précision des signaux reçus sont exposées à l'aide de graphes

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Loseille, Adrien. "Adaptation de maillage anisotrope 3D multi-échelles et ciblée à une fonctionnelle pour la mécanique des fluides : Application à la prédiction haute-fidélité du bang sonique". Paris 6, 2008. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00361961v2.

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Abstract (sommario):

L’adaptation de maillage anisotrope est reconnue pour sa capacité à réduire le ratio entre le nombre de degrés de liberté et la précision du calcul. Son application dans le cas d’écoulements compressibles pose les problématiques suivantes : les schémas numériques d’ordre élevé retombent à l’ordre un dans les chocs, les senseurs utilisés pour l’adaptation prescrivent dans les chocs des tailles qui tendent vers zéro. Il est donc nécessaire de prescrire une taille minimale. On perd alors l’intérêt d’une adaptation anisotrope. On apporte une réponse à ces problématiques en considérant une adaptation anisotrope multi-échelles du maillage basée sur le modèle de maillage continu. Si on se donne des informations supplémentaires, les méthodes génériques précédentes ne sont plus optimales dans la distribution des degrés de liberté. On étudie cette problématique dans le cas particulier des équations d’Euler pour des fonctionnelles scalaires. On propose une estimation d’erreur a priori pour le contrôle de l’erreur d’approximation sur une fonctionnelle. Enﬁn, on applique l’adaptation multi-échelles à la prédiction haute-ﬁdélité du bang sonique
Hessian based unstructured mesh adaptation has already proved its efficiency to improve the ratio between solution accuracy and the number of degrees of freedom. However, when dealing with flows with shocks, several problematics occur : (i) a loss of convergence order generally due to the presence of steep gradients or genuine discontinuities in the flow, even if a provably spatially high order method is employed, (ii) error estimates may prescribe a size converging to zero in the discontinuity vicinity. These problems lead to the loss of anisotropy. We show that these problems can be solved by using a particular multi-scales mesh adaptation procedure based on a continuous mesh model. With this approach, prescribing a minimal size is not required and anisotropy is fully preserved. Global second order mesh convergence is numerically observed even with flows with shocks. When more information is given (as the EDP or a functional output), hessian based mesh adaptation is no more optimal in the distribution of degrees of freedom in the computational domain. We address this issue by considering an a priori error estimate to control approximation error on functionals when the flow is governed by the Euler equations. This estimate allows us to derive an anisotropic mesh prescription. Finally, all adaptive strategies are applied to predict high-fidelity sonic boom signature of complex aircrafts

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Jaouen, Thomas. "Etude structurale et fonctionnelle de porines générales et spécifiques de bactéries du genre Pseudomonas psychotrophes et mésophiles : influence de la température de croissance sur leurs comportements ionophores". Rouen, 2005. http://www.theses.fr/2005ROUES013.

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Abstract (sommario):

Chez des bactéries psychrotrophes et mésophiles du genre Pseudomonas, organismes ubiquitaires capables de se développer dans la plupart des environnements naturels, l'adaptation aux basses températures s'accompagne d'une diminution de la perméabilité membranaire, à laquelle participe la porine majoritaire aspécifique OprF : sa valeur de conductance unitaire majoritaire diminue lorsqu'elle est purifiée à partir de cellules cultivées à basse température, plutôt qu'à la température optimale de croissance. La protéine OmpA, homologue de l'OprF, issue de la bactérie psychrotrophe Erwinia carotovora ssp carotovora, présente deux états de conductance simultanés, qui ne présentent pas de différence significative en fonction de la température de croissance. Nos résultats suggèrent que ces protéines homologues peuvent adopter deux conformations alternatives, dont le repliement serait thermorégulé dans le cas de l'OprF, via des interactions intimes avec d'autres composants thermosensibles, comme le lipopolysaccharide. En revanche, aucune différence dans l'activité canal en fonction de la température de croissance n'a pu être observée pour des porines spécifiques, structuralement différentes, appartenant à la famille de l'OprD chez P. Fluorescens MF0. L'étude des séquences des gènes oprD, oprE1 et oprE3 chez différentes espèces de Pseudomonas montre une grande variabilité de ces protéines au niveau des longues boucles exocellulaires prédites, en contact direct avec le milieu environnant. Ceci indique que ces protéines pourraient constituer des canaux spécifiques pour un large éventail de substrats, et semble révéler d'autres aspects du potentiel d'adaptation des Pseudomonas
In psychrophilic and mesophilic bacteria from the Pseudomonas genus, organisms that can develop in the majority of the natural environments, adaptation to low growth temperature includes a decrease in outer membrane permeability, and the major non specific porin OprF participates to this phenomenon: its major conductance value decreases depending on whether it was purified from cultures grown at optimum or low temperature. The OprF-homolog OmpA from the psychrotrophic bacterium Erwinia carotovora ssp carotovora MFCL0 presents two simultaneous conductance states, wich differs slightly according to growth temperature. Our results suggest that these proteins could adopt two alternative conformations, and that folding is thermoregulated for OprF, via strong interactions with other thermosensitive components such as lipopolysaccharide. In contrast, no difference in channel forming properties according to growth temperature was observed for structurally different outer membrane proteins from the OprD family of specific porins in Pseudomonas fluorescens MF0. Sequence analysis of the oprD, oprE1 and oprE3 genes from various Pseudomonas species shares highly variable regions in the predicted long external loops that interact directly with the external medium. This suggests that these proteins are likely to be specific channels for a wide range of nutrients, and reveals others features of the Pseudomonas adaptation potential

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Loustau, Sébastien. "Performances statistiques de méthodes à noyaux". Phd thesis, Université de Provence - Aix-Marseille I, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00343377.

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Abstract (sommario):

Cette thèse se concentre sur le modèle de classification binaire. Etant donné $n$ couples de variables aléatoires indépendantes et identiquement distribuées (i.i.d.) $(X_i,Y_i)$, $i=1,\ldots ,n$ de loi $P$, on cherche à prédire la classe $Y\in\{-1,+1\}$ d'une nouvelle entrée $X$ où $(X,Y)$ est de loi $P$. La règle de Bayes, notée $f^*$, minimise l'erreur de généralisation $R(f)=P(f(X)\not=Y)$. Un algorithme de classification doit s'approcher de la règle de Bayes. Cette thèse suit deux axes : établir des vitesses de convergence vers la règle de Bayes et proposer des procédures adaptatives.

Les méthodes de régularisation ont montrées leurs intérêts pour résoudre des problèmes de classification. L'algorithme des Machines à Vecteurs de Support (SVM) est aujourd'hui le représentant le plus populaire. Dans un premier temps, cette thèse étudie les performances statistiques de cet algorithme, et considère le problème d'adaptation à la marge et à la complexité. On étend ces résultats à une nouvelle procédure de minimisation de risque empirique pénalisée sur les espaces de Besov. Enfin la dernière partie se concentre sur une nouvelle procédure de sélection de modèles : la minimisation de l'enveloppe du risque (RHM). Introduite par L.Cavalier et Y.Golubev dans le cadre des problèmes inverses, on cherche à l'appliquer au contexte de la classification.

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Boixel, Anne-Lise. "Environmental heterogeneity, a driver of adaptation to temperature in foliar plant pathogen populations?" Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASA010.

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Abstract (sommario):

Les facteurs environnementaux, au premier rang desquels la température, ont un impact sur la biologie des micro-organismes foliaires. Ils peuvent aussi modifier significativement leurs dynamiques populationnelles, voire leurs trajectoires évolutives. Classiquement, les modèles épidémiologiques, utilisés pour mieux gérer les maladies des plantes, intègrent l’influence des conditions météorologiques. Ils s’intéressent surtout à des réponses et des effets moyennés, ne tenant compte ni des variations des réponses individuelles, ni de l’hétérogénéité des changements environnementaux aux échelles réellement perçues par les agents pathogènes. Ces deux niveaux de simplification sont acceptables lorsque les états individuels et les variables continues qui leur sont associées, peu diversifiés, sont représentatifs de ceux de l'ensemble de la population. Il en va différemment lorsque les populations présentent des niveaux substantiels de variation individuelle susceptibles d’influencer leur capacité à s’adapter à leur environnement, et, par voie de conséquence, la dynamique des épidémies sous un climat fluctuant ou changeant. Pour mettre en évidence les conséquences de ces hypothèses réductrices, j’ai étudié comment la variation individuelle et l'hétérogénéité environnementale affectent simultanément la fitness, la composition phénotypique et la résilience des populations d'un agent pathogène foliaire (Zymoseptoria tritici) dans des couverts de blé. Trois étapes clés ont structuré l’exploration de ce cas d’étude. Tout d’abord, un protocole in vitro de phénotypage haut débit a été spécifiquement développé, validé et utilisé pour caractériser la diversité des réponses à la température de populations de Z. tritici échantillonnées à des échelles climatiques contrastées (variation spatiale et saisonnière) ainsi que leurs patrons d’adaptation. Les variations environnementales spatio-temporelles rencontrées dans les couverts de blé, considérées comme exerçant des pressions sélectives différentielles sur ces sensibilités thermiques individuelles, ont ensuite été examinées. Enfin, la façon dont la sélection de « thermotypes » (groupes fonctionnels rassemblant des individus présentant une même sensibilité thermique) détermine la dynamique adaptative des populations en réponse à l'hétérogénéité environnementale a été étudiée. Pour cela, des approches expérimentales (in vitro, in planta et in natura) et de modélisation (in silico) ont été couplées. Elles ont notamment porté sur plusieurs générations de populations placées dans des environnements sélectifs de plus en plus complexes. Ces travaux ont montré que le fait de négliger l'amplitude réelle de la variation phénotypique inter-individuelle d'une population microbienne et l'hétérogénéité des pressions de sélection, s’exerçant des échelles phyllo- à mésoclimatiques, conduit à sous-estimer la résilience de cette population, et donc son potentiel adaptatif. Les résultats de cette thèse, à l’interface entre épidémiologie, micrométéorologie et écologie, améliorent notre compréhension d’une part, de l'importance de la variation individuelle dans la dynamique adaptative des populations et, d’autre part, de la manière dont l'hétérogénéité environnementale permet de maintenir des populations globalement très diverses. Elle permet finalement d’expliquer l’existence de patrons d’adaptation, à la fois à des échelles locales et à des échelles très larges, par des dynamiques adaptatives «à deux vitesses»
Environmental drivers, most notably temperature, affect the biology of phyllosphere microorganisms but also induce changes in their population dynamics, even in their evolutionary trajectories. The impact of climate on foliar plant disease epidemics is usually considered in forecasting models to inform management strategies. Such models focus on averages of environmental drivers but disregard both individual variation within populations and the scale and extent of biologically relevant environmental changes. These simplifications are glossing over substantial levels of individual variation that may have important consequences on the capacity of a population to adapt to environmental changes, and thus on the dynamics of epidemics in a fluctuating or changing climate. To examine the range of validity and consequences of these simplifying assumptions, I investigated how individual variation and environmental heterogeneity jointly affect fitness, phenotypic composition and resilience of populations of a foliar pathogen (Zymoseptoria tritici) inhabiting wheat canopies. Three complementary ways of exploration were adopted in this case study. First, an in vitro high-throughput phenotyping framework was developed, validated, and used to characterise the diversity in patterns of thermal responses existing across Z. tritici populations that were sampled over contrasted scales (spatial and seasonal variation of temperature). Second, the spatio-temporal thermal variations encountered in a wheat canopy, considered as a habitat exerting fluctuating selective pressures on these differential thermal sensitivities of individuals, were investigated in depth. Third, the way selection of “thermotypes” (functional groups of individuals displaying a similar thermal sensitivity) occurs and drives dynamics of Z. tritici populations was examined. To this end, both empirical (in vitro, in planta and in natura) and theoretical (in silico) competition experiments were conducted under increasingly complex selective environments. This research work demonstrates that glossing over the natural extent of individual phenotypic diversity in a phyllosphere microbial population and over the heterogeneity of selective pressures – from phyllo- to mesoclimate – leads to underestimate the resilience of this population, and thus its adaptive potential to environmental variations. In doing so, the results of this thesis, at the interface between epidemiology, micrometeorology, and ecology, improve our understanding of how important is individual variation to population dynamics and how environmental heterogeneity allows to maintain population diversity. Finally, this thesis provides insight into how large-scale patterns and local population processes are interlinked and display a “two-tier” adaptive dynamics

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Kassi, N'Dja Justin. "Successions secondaires post-culturales en forêt dense semi-décidue de Sanaimbo (Côte d'Ivoire) : nature, structure et organisation fonctionnelle de la végétation". Amiens, 2006. http://www.theses.fr/2006AMIED005.

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Abstract (sommario):

La succession secondaire post-culturale a été étudiée le long d’une chronoséquence jachères incluses dans une matrice de forêt semi-décidue (Côte d’Ivoire). Après analyse de la flore locale, nous avons utilisé la méthode phytosociologique synusiale intégrée pour décrire les assemblages d’espèces et construire un modèle qualitatif de la dynamique spatio-temporelle des communautés végétales. Les attributs structurels et fonctionnels de la diversité végétale ont ensuite été analysés de manière quantitative. Une forêt secondaire proche de la forêt ancienne se reconstitue dès la trentième année de l’abandon des champs. Cette forêt peut recouvrer la structure et la fonction au cours de la quatrième décennie de recolonisation et la composition spécifique une décennie plus tard. La succession étudiée est déterministe conformément aux prédictions de la théorie des niches et du modèle de tolérance. Toutefois le hasard intervient dans les premiers stades plus sensibles aux facteurs historiques
Postcultural secondary successions have been investigated along a chronosequence of fallows embedded into a semi-deciduous tropical forest matrix (Ivory Coast). I surveyed the local species pool. Then I described species assemblages using an integrated synusial approach to build up a qualitative model of the spatio-temporal dynamics of plant communities. Structural and functional attributes of plant diversity were then quantitatively described. A secondary forest ressembling the old-growth develops as soon as 30 years after field abandonment. This forest may recover structure and function during the fourth decade of recolonization and species composition one decade later. The invasion by Chromolaena odorata did not appear to slow down the succession. I found a deterministic succession consistently with predictions of both the niche theory and the tolerance model. However hazard plays a role especially in the earliest stages of the succession that seem to be sensitive to historical factors

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Stevens, Laurence. "Adaptation structurale et fonctionnelle des protéines contractiles des fibres musculaires de soleus de rat à diverses situations d'atrophie : contribution à la connaissance des perturbations enregistrées en microgravité". Compiègne, 1992. http://www.theses.fr/1992COMPD448.

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Abstract (sommario):

Les propriétés contractiles des fibres musculaires pelées du soleus de rat ont été examinées dans trois situations d'inactivité musculaire d'une durée de 15 jours (vol, spatial, microgravité simulée et dénervation). Les résultats montrent que l'inactivité du soleus, muscle lent à fonction antigravitaire, conduit à une atrophie musculaire importante caractérisée par une diminution du diamètre des fibres et une chute de force. L'analyse des propriétés d'activation des fibres musculaires par les ions calcium ou strontium révèle que les effets ne sont pas identiques pour les trois modèles d'inactivité. Ceci suggère que selon le modèle utilisé, les différentes protéines impliquées dans la contraction musculaire (myosine, tropomyosine et troponines) ne sont pas modifiées de façon identique ou en même temps. Toutefois, toutes les données indiquent une transformation fonctionnelle des fibres du soleus en un type rapide. L'augmentation des cinétiques de contraction des fibres atrophiées confirme cette transformation. Par ailleurs, les caractéristiques d'élasticité des fibres sont modifiées dans le sens d'une augmentation de compliance, témoignant de l'importance du rôle de la composante élastique dans les perturbations survenant lors d'une période d'atrophie. L'analyse électrophorétique de la composition en myosine montre que les transformations fonctionnelles s'accompagnent de modifications structurales puisque des isoformes rapides de myosine apparaissent. Enfin, les expériences de dénervation suggèrent l'existence d'une influence du support nerveux sur le développement de l'atrophie musculaire

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Stoll, Chloé. "Rôle de la surdité précoce et de la langue des signes dans la plasticité fonctionnelle du champ visuel". Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017GREAS040/document.

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Abstract (sommario):

L’expérience sensorielle précoce atypique ou l’expertise dans un domaine sont des phénomènes connus pour modifier certains aspects du traitement visuel. La surdité précoce profonde et la pratique de la langue des signes pourraient ainsi être deux sources distinctes de modulation du traitement visuel. Cette thèse s’intéresse à déterminer l’impact respectif de la surdité et de l’impact de la langue des signes dans le traitement de l’espace visuel périphérique et le traitement des visages et des expressions faciales. Ces processus ont été choisis puisqu’ils sont sollicités dans la communication en langue des signes. En effet, les signes de paroles sont perçus par le champ visuel périphérique inférieur et il est en même temps nécessaire de porter une attention particulière au visage de son interlocuteur qui délivre des informations syntaxiques, grammaticales ou encore affectives indispensables à la compréhension du discours.Pour cela, une première série d’études explore l’effet de la surdité et de la langue des signes sur le traitement visuel périphérique et notamment dans l’espace périphérique inférieur. Les résultats montrent que la pratique de la langue des signes chez les entendants peut influencer des aspects spécifiques du traitement visuel de l’espace inférieur et que principalement la rapidité du traitement visuel de bas niveau. La deuxième série d’études explore l’effet de la surdité et de la langue des signes sur le traitement des visages et notamment la reconnaissance des visages et des expressions faciales. Les résultats montrent des différences dans la stratégie d’exploration des visages pour la reconnaissance des visages chez les sourds signeurs avec un effet de la pratique de la langue des signes dans les mécanismes de prise de décision de reconnaissance des visages. Enfin, la surdité associée à la pratique de la langue des signes ne semble pas affecter les seuils de catégorisation d’émotions. Les résultats de nos six études enrichissent la littérature actuelle sur la plasticité sensorielle chez les personnes sourdes signeuses et illustrent l’importance de contrôler systématiquement l’effet de la langue des signes puisqu’elle semble induire des modifications dans le traitement visuel qui lui sont propres. Mots clés : Surdité, langue des signes, plasticité visuelle, périphérie visuelle, reconnaissance des visages, reconnaissances des émotions
Our visual system presents some flexibility and experience has been shown to tune it. Early profound deafness and sign language experience can therefore be considered as two potential sources of visual plasticity. The aim of this thesis is to untangle the respective impact of deafness (or auditory deprivation) and sign language experience on peripheral visual field perception and face processing and facial expressions recognition; two crucial mechanisms for sign language communication. Signs are indeed perceived in the lower part of the peripheral visual field and faces provided syntactic, grammatical or affective information to precise or nuances linguistic gestures. A first series of studies explores deafness and sign language experience effects on peripheral visual perception and more particularly in the lower visual space from basic to more complex visual processing. Results suggest that sign language experience in hearing population can affect some aspect of lower visual field processing and that early deafness mainly increase speed of low-level visual processing. The second series of studies explores deafness and sign language experience impact on face processing and more particularly on face recognition and expression recognition. Results suggest a difference in gaze strategy to explore and recognize face in deaf signers supported by a shift in decision-making strategy in both deaf and hearing signers for face recognition. Finally, deafness combined to sign language experience doesn’t seem to affect thresholds for facial expression recognition and categorization. Altogether the results from these six studies provide new insight in our current knowledge about visual perception in early deaf signers and highlight the importance to systematically control sign language experience since its experience can have an impact in both hearing and deaf signers. Key words: Deafness, sign language, visual plasticity, visual periphery, face recognition, facial expression recognition

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Hashoum, Hazem. "Impact du changement climatique sur les interactions biotiques en forêt méditerranéenne : approches chimique, écophysiologique et fonctionnelle". Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0480/document.

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Abstract (sommario):

L’objectif de cette thèse est d’étudier les interactions allélopathiques dans la forêt de chêne pubescente en région méditerranéenne et d’envisager comment ces interactions peuvent être affectées par le changement climatique. Nous avons montré que l'arbre dominant Q. pubescens et ses espèces compagnes A. monspessulanum et C. coggygria ont des potentialités allélopathiques différentes en fonction du stade phénologique des feuilles ce qui pourrait affecter la germination et la croissance des plantes herbacées de sous-étage. Ces différences d'effet allélopathique peuvent résulter non seulement de différences dans la quantité des composés allélopathiques produits, mais aussi de différences qualitatives observées en fonction du stade phénologique. Cela suggère que l’effet allélopathique puisse varier dans le temps de manière à correspondre au stade de développement des plantes herbacées cibles. Sur l’une des plantes cibles utilisées dans les bioessais, les effets allélopathiques ont d’autre part été accentués en changeant les conditions environnementales (hydriques et/ou thermiques) ce qui suggère des modifications éventuelles des potentiels allélopathiques des plantes à attendre avec le changement climatique. Nos résultats en pépinière ont montré le potentiel allélopathique de cotinus et pinus sur la croissance des plantules de chêne, quelques soient les conditions d’arrosage (stressé ou non stressé. En affectant notamment la biomasse du système racinaire dont la croissance est un élément clé des espèces méditerranéennes pour résister à la sécheresse estivale prolongée, ces interactions pourraient jouer un rôle important dans les processus de régénération du chêne pubescent
The aim of this thesis is to study allelopathic interactions in the downy oak forest in the mediterranean region and to consider how these interactions can be affected by climate change. We have shown that the dominant tree Q. pubescens and its companion species A. monspessulanum and C. coggygria have different allelopathic potentialities, evaluated in vitro on herbaceous target plants, depending on the phenological stage of the leaves, which could in natura affect the germination and growth of understory herbaceous plants. These differences in allelopathic effect may result not only from differences in the quantity of allelopathic compounds produced, but also from qualitative differences observed as a function of the phenological stage. This suggests that the allelopathic effect may vary over time to match the stage of development of the target herbaceous plants. On one of the target plants used in the bioassays, the allelopathic effects were further accentuated by changing the water and / or thermal conditions which suggests possible modifications of the allelopathic potential of the plants to be expected with climate change.Our results in the plant nursery showed the allelopathic potential of cotinus and pinus on the growth of oak seedlings, whatever the watering conditions (stressed or unstressed). By affecting in particular the biomass of the root system, the growth of which is a key element of the mediterranean species to resist the prolonged summer drought, these interactions could play an important role in the regeneration processes of downy oak

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Maynaud, Géraldine. "Adaptation aux métaux lourds de populations de rhizobia impliquées dans la phytostabilisation de déblais miniers : Identification des mécanismes d’adaptation au Zn et au Cd, et structuration des populations de rhizobia adaptées aux sites miniers". Thesis, Montpellier 2, 2012. http://www.theses.fr/2012MON20074/document.

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Abstract (sommario):

La symbiose entre Anthyllis vulneraria et Mesorhizobium metallidurans, mise en évidence dans l'ancienne mine Zn/Pb des Avinières à St Laurent-le-Minier (Gard) permet une entrée d'azote dans les sols grâce à la fixation biologique qui favorise l'installation d'une végétation pérenne d'intérêt pour limiter la pollution métallique via l'érosion éolienne et hydrique. M. metallidurans ayant la particularité de résister à de fortes concentrations en Zn et Cd, la recherche des gènes d'adaptation aux métaux lourds a été mise en œuvre pour mieux connaitre cette bactérie impliquée dans des opérations de phytostabilisation, par des approches de génétique moléculaire et de transcriptomie (RNAseq). Les gènes codant pour des systèmes de séquestration, d'exclusion, de réduction et d'efflux des métaux lourds, dont cadA1, codant pour une PIB-ATPase exportant Cd/Zn ont été identifiés chez deux souches métallicoles associées à Anthyllis ; M. metallidurans STM 2683T (mine des Avinières) et Mesorhizobium sp. STM 4661 (mine d'Eylie). Une étude fonctionnelle de cadA1 a permis de caractériser son rôle dans la résistance aux métaux lourds chez M. metallidurans. Ce gène a ensuite été testé comme marqueur de résistance pour étudier la diversité et la répartition des symbiotes d'Anthyllis sur des sites miniers et non pollués. Pour cela ce travail a été complété par des analyses phénotypiques de tolérance au Zn et Cd et des analyses phylogénétiques basées sur des marqueurs taxonomiques et symbiotiques. La contrainte métallique exercée par les environnements miniers semble influencer la composition et la diversité bactérienne avec une plus forte proportion (i) de phénotype métallicole lié à la présence du gène cadA1 et (ii) de rhizobia appartenant à M. metallidurans ou à une espèce très proche. La plante hôte semble quant à elle influencer la diversité symbiotique des rhizobia, indépendamment de la contrainte métallique
Efficient nitrogen-fixing symbiosis between Anthyllis vulneraria and Mesorhizobium metallidurans, identified in the highly Zn/Pb polluted mining site of Avinières (St Laurent-le-Minier, Gard county, France) has recently been described as a potential key bioremediation agent for stimulating the growth of a sustainable plant cover and thus limit heavy metal dispersion from contaminated sites. M. metallidurans strains were shown to be resistant to high Zn and Cd concentrations. The aim of our work was to identify and characterize genes involved in heavy metal adaptation in M. metallidurans by using genetic and transcriptomic approaches (RNAseq technology). Putative genes involved in heavy metal adaptation mechanisms such as exclusion, binding, reduction and efflux, like cadA1, encoding an efflux system PIB-type ATPase involved in Zn and Cd export, were identified in two Mesorhizobium strains associated with Anthyllis: M. metallidurans STM 2683T (Avinières mine) and Mesorhizobium sp. STM 4661 (Eylie mine). Functional studies allowed us to characterize the cadA1 efflux protein as involved in metal tolerance in M. metallidurans. Then, cadA1 was used as a metal-resistance marker to study the diversity and the distribution of Anthyllis symbionts from mine soils and unpolluted soils. This work was completed by Zn- and Cd-tolerance phenotype assays and phylogenetic analyses using taxonomical and symbiotic markers. Metals in mine environments seemed to influence the bacterial composition and the diversity with a high proportion of (i) metal-tolerant phenotypes consistent with the detection of the cadA1 gene and (ii) strains belonging to the M. metallidurans species or to a bacterial species close to it. The plant-hosts seemed to impact symbiotic diversity independently of the metal-tolerant property

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BASSET-MENS, Claudine. "Propositions pour une adaptation de l'Analyse de Cycle de Vie aux systèmes de production agricole. Mise en œuvre pour l'évaluation environnementale de la production porcine". Phd thesis, Agrocampus - Ecole nationale supérieure d'agronomie de renneS, 2005. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00009828.

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Abstract (sommario):

La question traitée dans cette thèse a été celle de la fiabilité des résultats d'Analyse de Cycle de Vie (ACV) appliquée aux productions agricoles. La production porcine a été prise comme cas d'étude. Construite autour du fil conducteur de l'incertitude des résultats d'ACV, cette thèse a eu pour objet de rechercher et hiérarchiser les sources d'incertitude de ces résultats, afin de contribuer à leur réduction. Cette réduction de l'incertitude peut être atteinte par une meilleure prise en compte de la variabilité des systèmes à la fois anthropiques et environnementaux. A cette fin, des références ont été produites sur la performance environnementale et son incertitude (à l'aide de scénarios favorable et défavorable) pour trois modes de production de porc contrastés répondant respectivement aux cahiers des charges de la production conventionnelle raisonnée, du label rouge fermier d'Argoat et de l'agriculture biologique. L'influence de la qualité des pratiques de fertilisation a également été analysée en évaluant un quatrième scénario de production conventionnel sur-fertilisé. Pour ces scénarios moyens types, une distinction claire a été obtenue pour chaque indicateur, grâce à l'usage de références sur les émissions spécifiques des postes clé de ces systèmes. Le scénario label rouge est notamment apparu comme une alternative intéressante au scénario conventionnel. Pour chaque scénario des points faibles ont été mis en évidence, ainsi que d'importantes marges d'amélioration. L'incertitude liée aux modèles d'évaluation des impacts a été étudiée en analysant dans un premier temps les concepts sous-jacents et modèles employés en ACV pour les catégories d'impact affectant les écosystèmes (eutrophisation, effet de serre, toxicité, acidification). Dans un second temps, une analyse des sources de variabilité principales pour la catégorie eutrophisation aquatique, impact prépondérant pour les systèmes de production agricoles, a permis de proposer un cadre d'amélioration pour son évaluation. La mise en oeuvre de ces propositions pour l'étape du devenir du nitrate dans les bassins versants a confirmé l'existence d'une importante marge d'amélioration pour évaluer l'eutrophisation aquatique. Elle a également permis de montrer la sensibilité du résultat du changement climatique à l'usage de ces facteurs de devenir du nitrate et l'importance du transfert potentiel de pollution depuis le compartiment eau (nitrate) vers le compartiment air (N20) par le processus de dénitrification dans les zones humides. A l'échelle courante de mise en oeuvre de l'ACV, c'est à dire pour des systèmes de production moyens à une grande échelle (région, pays), la hiérarchisation finale des sources d'incertitude a permis d'identifier comme source principale d'incertitude, celle liée aux modèles d'évaluation des impacts. Pour produire une ACV comparative pertinente d'exploitations réelles, la connaissance et la modélisation des émissions directes sur le site d'exploitation, tenant compte des pratiques de l'agriculteur et du milieu, devraient être profondément améliorées.

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Acher, Audrey. "Corrélats cérébraux de l'adaptation de la parole après exérèse de la cavité orale". Phd thesis, Université de Grenoble, 2014. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01071506.

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Abstract (sommario):

Ce travail étudie les corrélats cérébraux de l'adaptation de la parole et de la motricité oro-faciale après l'exérèse chirurgicale d'une tumeur intra-orale. Une attention particulière est portée à la recherche de corrélats révélant une redéfinition des buts de la tâche, une réorganisation de la coordination motrice, et une modification des représentations internes du système moteur.Trois tâches ont été étudiées : production de mouvements oro-faciaux silencieux ; production de voyelles ; production de syllabes. Les activités cérébrales ont été mesurées par IRM fonctionnelle au cours de 4 sessions, en pré-opératoire, puis 1 mois, 3 mois et 9 mois après la chirurgie. Onze patients et onze sujets sains ont été enregistrés. Pour les patients, trois types de données informant sur leur récupération motrice ont été acquis aux mêmes périodes : données praxiques ; signal acoustique de parole ; auto-évaluation de la qualité de parole. Trois analyses statistiques ont été menées sur les données cérébrales : (1) une analyse " cerveau entier " sur les amplitudes des activations ; (2) une analyse de la localisation de l'activation principale dans le cortex moteur primaire ; (3) une analyse en régions d'intérêt dans le réseau cérébral de la parole, via un modèle linéaire général dans lequel le facteur Groupe (Patients/Sains) a été remplacé par une covariable continue, l'" Indice d'Adaptation Motrice " ou " IAM ", mesurant le niveau de dégradation de la parole, puis son amélioration dans les mois suivants l'opération. Les effets et les interactions des facteurs Groupe (ou IAM), Session et Tâche sur la variable dépendante ont ainsi été mesurés. Toutes tâches et toutes sessions confondues, les patients se distinguent des sujets sains par une activité cérébrale plus faible dans les zones sensori-motrices oro-faciales. Des effets de la session sont observés pour toutes les tâches, pour les patients et les sujets sains. Seules les tâches de motricité silencieuse et de production des voyelles révèlent des effets de la session sur l'activité cérébrale significativement différents pour les patients et les sujets sains. Ainsi, pour la motricité silencieuse, 1 mois après l'opération, les patients montrent, pour la tâche linguale, une forte activité dans le Lobule Pariétal Supérieur (LPS) et dans le Cortex Pré-Frontal Dorso-Latéral (CPFDL). Pour les voyelles, 3 mois après la chirurgie, l'activité cérébrale des patients décroît dans le cervelet et croît fortement dans le Lobule Pariétal Inférieur ; de 3 à 9 mois après la chirurgie, l'activité croît dans les zones motrices (Cortex Moteur Primaire et Aire Motrice Supplémentaire) et elle décroît dans le Gyrus Temporal Supérieur. Les patients montrent aussi 1 mois après l'opération, tous articulateurs confondus, une localisation plus dorsale de l'activité dans le Cortex Moteur Primaire. Pour des tâches motrices silencieuses, nos observations suggèrent que, immédiatement après l'opération, les patients pourraient réactualiser leur modèle interne du système moteur (activité dans le LPS), devenu imprécis, tout en ré-élaborant leurs stratégies de coordination (activité dans le CPFDL). Pour la production des voyelles, tâche plus complexe et plus précise, nos résultats suggèrent que 3 mois après l'opération, les patients utiliseraient moins les modèles internes devenus trop imprécis. Le retour à une activation forte dans les zones motrices 9 mois après l'intervention suggère que l'adaptation de la production des voyelles est quasiment achevée, et la baisse concomitante de l'activation dans le cortex auditif est cohérente avec l'hypothèse qu'il existerait de nouveau une adéquation entre la copie d'efférence auditive et le feedback auditif externe. Pour la production de syllabes, les résultats sont les moins pertinents parmi les 3 tâches. Une réorganisation plus tardive, au-delà de 9 mois, due à la plus grande complexité de la tâche, pourrait en être une explication potentielle.

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Aubin, Jean-Baptiste. "Estimation fonctionnelle par projection adaptative et applications". Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066473.

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Vincent, Thomas. "Modèles hémodynamiques spatiaux adaptatifs pour l'imagerie cérébrale fonctionnelle". Paris 11, 2010. http://www.theses.fr/2010PA112365.

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Abstract (sommario):

Les approches développées dans cette thèse s'inscrivent au sein des méthodes d'analyse en imagerie cérébrale fonctionnelle (ICF) cherchant à caractériser la spécialisation des structures cérébrales. La technique centrale d'ICF fut l'imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (IRMf) qui fournit une mesure indirecte, hémodynamique, de l'activité neuronale. Les méthodes d'analyse portant sur ces données se divisent classiquement en : (i) une tâche de localisation des activations et (ii) une tâche d'estimation de la fonction de réponse hémodynamique (FRH) faisant le lien entre les stimulations du paradigme et le signal d'IRMf observé. Cette thèse traitent les tâches (i) et (ii) simultanément en un modèle de détection-estimation conjointe (DEC), respectant l'interdépendance évidente de ces deux processus. L'approche DEC a été ici étendue pour exprimer un modèle de corrélation spatiale sur les niveaux de réponse locaux associées à la FRH, rendant l'approche mutli-variée tant pour la détection que pour l'estimation. Dans le cadre bayésien, cette modélisation s'opère par l'expression d'un a priori par champ de Markov discret faisant intervenir un facteur de régularisation. Un traitement du cerveau entier non-supervisé pour ce paramètre a été mis en place, prenant en compte l'hétérogénéité des géométries des régions cérébrales. L'approche est validée sur la surface corticale, mais également dans le volume à travers plusieurs analyses de groupe dans des conditions d'acquisition différentes. Ces dernières ont permis d'évaluer l'impact de la méthode en terme de significativité des activations ainsi que son positionnement par rapport à l'approche classique
The approaches developed in this PhD take place in the analysis of functional brain imaging seeking the characterization of brain structures specialization. The central modality was functional magnetic resonance imaging (fMRI) which provides an indirect, hemodynamic, measure of the neural activity. Data analysis methods are conventionally divided into: (i) a localization task of activations and (ii) an estimation task i. E. Characterizing the hemodynamic response function (HRF) linking the stimulations provided by the paradigm to the observed fMRI signal. This PhD addresses the tasks (i) and (ii) simultaneously in a joint detection-estimation model (JDE), respecting the obvious interdependence of these two processes. The JDE approach here has been extended to express a model of spatial correlation on the local response level associated with the HRF, enabling the approach to be multivariate for the detection as well as the estimation tasks. In the Bayesian framework, this modeling is achieved by the expression of a prior discrete Markov field involving a regularization factor. The unsupervised treatment regarding this parameter for the whole brain has been developed by adaptively taking into account the heterogeneity of the geometries of brain regions. The approach is validated on the cortical surface, but also in the volume through several group analyses with different acquisition conditions. These were used to assess the impact of the method in terms of significance of activation and its positioning relative to the traditional approach

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Tesi sul tema "Adaptation fonctionnelle"

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