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  1. Thèses

Littérature scientifique sur le sujet « Réseau d'interactions génétiques »

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Thèses sur le sujet "Réseau d'interactions génétiques"

1

Rochette, Samuel. "Utilisation de pertubations environnementales et génétiques du réseau d'interactions protéine-protéine pour disséquer des processus cellulaires." Master's thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25483.

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Résumé :
Les protéines sont les machines moléculaires permettant à la cellule d’accomplir des fonctions biologiques. Pour accomplir ces fonctions, les protéines interagissent souvent entre elles de manière réversible et régulable, ce qui permet à la cellule de s’adapter rapidement à un environnement souvent instable en modulant ces interactions. Par conséquent, l’étude de la dynamique des interactions protéine-protéine est essentielle pour comprendre comment les cellules s’adaptent à diverses perturbations. Les deux chapitres de ce mémoire illustrent respectivement le développement d’une méthode pour i
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2

Deshpande, Jhelam Nitin. "Eco-evolutionary feedbacks and networks : from genes to landscapes." Electronic Thesis or Diss., Université de Montpellier (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024UMONG011.

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Résumé :
Il est reconnu depuis longtemps que l'écologie et l'évolution se rétroagissent l'une sur l'autre. En partant d'une compréhension mécaniste des liens entre l'écologie et l'évolution au niveau des processus, des mécanismes et des patrons, je présente les principaux défis à relever pour comprendre les rétroactions éco-évolutives : échelles de temps, interactions au sein des échelles d'organisation et entre elles, et structure spatiale (chapitre 1). Ensuite, en utilisant une perspective de réseaux hiérarchiques, je pose la question suivante : comment la prise en compte explicite des interactions a
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3

Bertin, Nicolas. "D'une représentation statique à un modèle dynamique des réseaux d'interaction protéine-protéine." Montpellier 2, 2006. http://www.theses.fr/2006MON20124.

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Résumé :
Afin d’appréhender la complexité des processus biologiques, il est important d’étudier la fonction des gènes dans le contexte de réseaux complexes d’interactions moléculaires. Pendant ma thèse, j’ai participé au développement d’outils informatiques facilitant la construction d’une ressource ORFéome (ensemble de séquences codantes clonées individuellement) couvrant ~60% des gènes prédits chez C. Elegans. Par la suite, ces mêmes outils ont servi à l’élaboration du premier ORFéome humain couvrant environ 8000 gènes et de l’ORFéome complet de la bactérie B. Melitensis. Dans le cadre d’un projet de
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4

Marois-Blanchet, François-Christophe. "Le rôle de la régulation transcriptionnelle dans l'évolution des réseaux d'interaction protéine-protéine." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/28445/28445.pdf.

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Résumé :
L’évolution par la duplication de gènes est maintenant reconnue comme un des mécanismes les plus importants dans l’évolution et plusieurs évidences ont été retrouvées dans le génome des organismes. Ce qui est moins connu, et plus débattu, est l’implication respective de la divergence de la régulation transcriptionnelle et de la divergence de la séquence codante dans l’évolution phénotypique. Nous avons établi une méthode nous permettant d’évaluer le rôle de la régulation transcriptionnelle dans la divergence des interactions protéine-protéine sur les gènes dupliqués chez l’organisme Saccharomy
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5

Diss, Guillaume, and Guillaume Diss. "Architecture et évolution des réseaux d'interactions protéines-protéines : exploration de la carte génotype-phénotype." Doctoral thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25454.

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Résumé :
Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdorales, 2014-2015<br>Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdorales, 2014-2015<br>La question des bases structurales du phénotype et de sa variation est une des questions les plus anciennes de la biologie. Le paradigme actuel stipule que le phénotype est exprimé à partir du génotype au travers de réseaux moléculaires dont l’architecture structure l’information génétique. Cette description mécanistique de la carte génotype-phénotype implique que c’est par la perturbation de l’architecture de ces réseaux que de
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6

Poisson, Ariane. "Etude des fonctions de la Menin, oncosuppresseur impliqué dans les Néoplasies endocriniennes multiples de type 1 : analyse du réseau d'interactions protéiques et identification de nouveaux partenaires." Nice, 2005. http://www.theses.fr/2005NICE4003.

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Résumé :
La compréhension de la Néoplasie Endocrinienne Multiple de type 1 (NEM1) repose sur l’élucidation du rôle du gène MEN1, dont les mutations prédisposent à ce syndrome familial. Identifié en 1997, ce gène ne nous a dévoilé que peu d’éléments sur sa fonction biologique. C’est un oncosuppresseur qui code pour une protéine nucléaire de 610 acides aminés, la Menin, dont aucune homologie avec une protéine ou un domaine connu n’a pu être trouvée. Ce que nous ont appris les études physiopathologiques, tant sur les patients atteints de NEM1 que sur les souris invalidées pour le gène MEN1, c’est que la M
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7

Bresso, Emmanuel. "Organisation et exploitation des connaissances sur les réseaux d'interactions biomoléculaires pour l'étude de l'étiologie des maladies génétiques et la caractérisation des effets secondaires de principes actifs." Phd thesis, Université de Lorraine, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00917934.

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Résumé :
La compréhension des pathologies humaines et du mode d'action des médicaments passe par la prise en compte des réseaux d'interactions entre biomolécules. Les recherches récentes sur les systèmes biologiques produisent de plus en plus de données sur ces réseaux qui gouvernent les processus cellulaires. L'hétérogénéité et la multiplicité de ces données rendent difficile leur intégration dans les raisonnements des utilisateurs. Je propose ici des approches intégratives mettant en œuvre des techniques de gestion de données, de visualisation de graphes et de fouille de données, pour tenter de répon
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8

Pluchon, Pierre-François. "Exploration du réseau d’interactions impliqué dans la maintenance génomique de l'Archaea hyperthermophile Pyrococcus abyssi." Thesis, Brest, 2012. http://www.theses.fr/2012BRES0070/document.

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Résumé :
Les organismes vivants doivent reproduire et transmettre ne variatur l’information contenue dans les chromosomes. Ainsi, la conservation de l’intégrité du génome est un processus biologique fondamental. La maintenance génomique constitue l’ensemble des processus biologiques impliqués dans la conservation, la duplication et la transmission de l’information génétique contenue dans les chromosomes. La machinerie réplicative des Archaea est décrite comme une version simplifiés de celle connue chez les Eucaryotes faisant des Archaea un excellent modèle d’étude de la réplication. Contrairement à la
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Kamenova, Stefaniya. "Réseaux d'interactions, biodiversité et services éco-systémiques en milieu agricole : que nous apprennent les coléoptères carabiques ?" Thesis, Poitiers, 2013. http://www.theses.fr/2013POIT2319.

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Résumé :
Le contrôle des ravageurs est l'un des principaux services éco-systémiques rendus par la biodiversité à l'agriculture. Les communautés d'insectes auxiliaires, hébergées par les espaces agricoles présentent des niveaux de diversité, spécifique et fonctionnelle, élevés et leurs biologie et traits de vie sont bien décrits et étudiés. Ces communautés constituent donc un excellent modèle pour aborder des questions d'intérêt à la fois fondamental et appliqué sur les mécanismes à l'origine de la biodiversité et sur l'impact de la biodiversité sur l'approvisionnement en services éco-systémiques. Dans
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Chettaoui, Chafika. "Mécanismes de conception de modèles discrets fondés sur la théorie des jeux pour l'étude des réseaux d'interactions biologiques : application à la migration métastasique." Phd thesis, Université d'Evry-Val d'Essonne, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00419193.

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Résumé :
La théorie des jeux permet de décrire des systèmes d'interactions complexes entre agents. Dans le cadre de la modélisation des interactions moléculaires, nous avons appliqué cette théorie afin d'étudier la dynamique des réseaux d'interactions à partir d'observations. L'objet est de calculer les équilibres correspondant à des phénotypes cellulaires. Le modèle permet de valider la cohérence des réseaux étudiés impliqués dans la migration métastasique via une molécule PAI-1 et permet également de proposer des prédictions sur la structure de ces réseaux. Afin d'accélérer le calcul des équilibres,
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