Littérature scientifique sur le sujet « Phylogenesi »
Créez une référence correcte selon les styles APA, MLA, Chicago, Harvard et plusieurs autres
Sommaire
Consultez les listes thématiques d’articles de revues, de livres, de thèses, de rapports de conférences et d’autres sources académiques sur le sujet « Phylogenesi ».
À côté de chaque source dans la liste de références il y a un bouton « Ajouter à la bibliographie ». Cliquez sur ce bouton, et nous générerons automatiquement la référence bibliographique pour la source choisie selon votre style de citation préféré : APA, MLA, Harvard, Vancouver, Chicago, etc.
Vous pouvez aussi télécharger le texte intégral de la publication scolaire au format pdf et consulter son résumé en ligne lorsque ces informations sont inclues dans les métadonnées.
Articles de revues sur le sujet "Phylogenesi"
Miyamoto, Michael M., et Walter M. Fitch. « Testing Species Phylogenies and Phylogenetic Methods with Congruence ». Systematic Biology 44, no 1 (mars 1995) : 64. http://dx.doi.org/10.2307/2413483.
Texte intégralBorges, Rui, João Paulo Machado, Cidália Gomes, Ana Paula Rocha et Agostinho Antunes. « Measuring phylogenetic signal between categorical traits and phylogenies ». Bioinformatics 35, no 11 (25 octobre 2018) : 1862–69. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty800.
Texte intégralMiyamoto, Michael M., et Walter M. Fitch. « Testing Species Phylogenies and Phylogenetic Methods with Congruence ». Systematic Biology 44, no 1 (mars 1995) : 64–76. http://dx.doi.org/10.1093/sysbio/44.1.64.
Texte intégralPalmer, Marike, Stephanus N. Venter, Alistair R. McTaggart, Martin P. A. Coetzee, Stephanie Van Wyk, Juanita R. Avontuur, Chrizelle W. Beukes et al. « The synergistic effect of concatenation in phylogenomics : the case in Pantoea ». PeerJ 7 (16 avril 2019) : e6698. http://dx.doi.org/10.7717/peerj.6698.
Texte intégralKim, Junhyong. « Large-Scale Phylogenies and Measuring the Performance of Phylogenetic Estimators ». Systematic Biology 47, no 1 (1 mars 1998) : 43–60. http://dx.doi.org/10.1080/106351598261021.
Texte intégralAris-Brosou, Stéphane, et Xuhua Xia. « Phylogenetic Analyses : A Toolbox Expanding towards Bayesian Methods ». International Journal of Plant Genomics 2008 (30 avril 2008) : 1–16. http://dx.doi.org/10.1155/2008/683509.
Texte intégralHinchliff, Cody E., Stephen A. Smith, James F. Allman, J. Gordon Burleigh, Ruchi Chaudhary, Lyndon M. Coghill, Keith A. Crandall et al. « Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life ». Proceedings of the National Academy of Sciences 112, no 41 (18 septembre 2015) : 12764–69. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1423041112.
Texte intégralCRUICKSHANK, ROBERT H. « Exploring character conflict in molecular data ». Zootaxa 2946, no 1 (8 juillet 2011) : 45. http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.2946.1.10.
Texte intégralDeBlasio, Dan F., et Jennifer H. Wisecaver. « SICLE : a high-throughput tool for extracting evolutionary relationships from phylogenetic trees ». PeerJ 4 (23 août 2016) : e2359. http://dx.doi.org/10.7717/peerj.2359.
Texte intégralLloyd, Graeme T., et Graham J. Slater. « A Total-Group Phylogenetic Metatree for Cetacea and the Importance of Fossil Data in Diversification Analyses ». Systematic Biology 70, no 5 (28 janvier 2021) : 922–39. http://dx.doi.org/10.1093/sysbio/syab002.
Texte intégralThèses sur le sujet "Phylogenesi"
Höhna, Sebastian. « Bayesian Phylogenetic Inference : Estimating Diversification Rates from Reconstructed Phylogenies ». Doctoral thesis, Stockholms universitet, Matematiska institutionen, 2013. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-95361.
Texte intégralAt the time of the doctoral defense, the following papers were unpublished and had a status as follows: Paper 1: Manuscript. Paper 4: Accepted.
Ross, Edith. « Inferring tumour evolution from single-cell and multi-sample data ». Thesis, University of Cambridge, 2018. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/274604.
Texte intégralHamberg, Erlend Heggheim. « Inferring Phylogenies Using Evolutionary Algorithms : A maximum likelihood approach for constructing phylogenetic trees from molecular data ». Thesis, Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet, Institutt for datateknikk og informasjonsvitenskap, 2011. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:no:ntnu:diva-13687.
Texte intégralRoeser-Mueller, Kerstin [Verfasser], Erhard [Akademischer Betreuer] Strohm et Christoph [Akademischer Betreuer] Oberprieler. « Phylogenies and pheromones - Defensive symbionts, phylogenetic affiliations and olfactory communication in beewolves (Philanthini, Hymenoptera, Crabronidae) / Kerstin Roeser-Mueller. Betreuer : Erhard Strohm ; Christoph Oberprieler ». Regensburg : Universitätsbibliothek Regensburg, 2012. http://d-nb.info/1033688363/34.
Texte intégralMarchiselli, Simone. « Molecular phylogenesis of Mediterranean Octocorals ». Master's thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2013. http://amslaurea.unibo.it/4905/.
Texte intégralMecham, Jesse L. « Jumpstarting phylogenetic searches / ». Diss., CLICK HERE for online access, 2006. http://contentdm.lib.byu.edu/ETD/image/etd1403.pdf.
Texte intégralMcHugh, Sean W. « Phylogenetic Niche Modeling ». Thesis, Virginia Tech, 2021. http://hdl.handle.net/10919/104893.
Texte intégralMaster of Science
As many species face increasing pressure in a changing climate, it is crucial to understand the set of environmental conditions that shape species' ranges--known as the environmental niche--to guide conservation and land management practices. Species distribution models (SDMs) are common tools that are used to model species' environmental niche. These models treat a species' probability of occurrence as a function of environmental conditions. SDM niche estimates can predict a species' range given climate data, paleoclimate, or projections of future climate change to estimate species range shifts from the past to the future. However, SDM estimates are often biased by non-environmental factors shaping a species' range including competitive divergence or dispersal barriers. Biased SDM estimates can result in range predictions that get worse as we extrapolate beyond the observed climatic conditions. One way to overcome these biases is by leveraging the shared evolutionary history amongst related species to "fill in the gaps". Species that are more closely phylogenetically related often have more similar or "conserved" environmental niches. By estimating environmental niche over all species in a clade jointly, we can leverage niche conservatism to produce more biologically realistic estimates of niche. However, currently a methodological gap exists between SDMs estimates and macroevolutionary models, prohibiting them from being estimated jointly. We propose a novel model of evolutionary niche called PhyNE (Phylogenetic Niche Evolution), where biologically realistic environmental niches are fit across a set of species with occurrence data, while simultaneously fitting and leveraging a model of evolution across a portion of the tree of life. We evaluated model accuracy, bias, and precision through simulation analyses. Accuracy and precision increased with larger phylogeny size and effectively estimated model parameters. We then applied PhyNE to Plethodontid salamanders from Eastern North America. This ecologically-important and diverse group of lungless salamanders require cold and wet conditions and have distributions that are strongly affected by climatic conditions. Species within the family vary greatly in distribution, with some species being wide ranging generalists, while others are hyper-endemics that inhabit specific mountains in the Southern Appalachians with restricted thermal and hydric conditions. We fit PhyNE to occurrence data for these species and their associated average annual precipitation and temperature data. We identified no correlations between species environmental preference and specialization. Pattern of preference and specialization varied among Plethodontid species groups, with more aquatic species possessing a broader environmental niche, likely due to the aquatic microclimate facilitating occurrence in a wider range of conditions. We demonstrated the effectiveness of PhyNE's evolutionarily-informed estimates of environmental niche, even when species' occurrence data is limited or even absent. PhyNE establishes a proof-of-concept framework for a new class of approaches for studying niche evolution, including improved methods for estimating niche for data-deficient species, historical reconstructions, future predictions under climate change, and evaluation of niche evolutionary processes across the tree of life. Our approach establishes a framework for leveraging the rapidly growing availability of biodiversity data and molecular phylogenies to make robust eco-evolutionary predictions and assessments of species' niche and distributions in a rapidly changing world.
Mecham, Jesse Lewis. « Jumpstarting Phylogenetic Searches ». BYU ScholarsArchive, 2006. https://scholarsarchive.byu.edu/etd/483.
Texte intégralKrig, Kåre. « Methods for phylogenetic analysis ». Thesis, Linköping University, Department of Mathematics, 2010. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-56814.
Texte intégralIn phylogenetic analysis one study the relationship between different species. By comparing DNA from two different species it is possible to get a numerical value representing the difference between the species. For a set of species, all pair-wise comparisons result in a dissimilarity matrix d.
In this thesis I present a few methods for constructing a phylogenetic tree from d. The common denominator for these methods is that they do not generate a tree, but instead give a connected graph. The resulting graph will be a tree, in areas where the data perfectly matches a tree. When d does not perfectly match a tree, the resulting graph will instead show the different possible topologies, and how strong support they have from the data.
Finally I have tested the methods both on real measured data and constructed test cases.
Pardi, Fabio. « Algorithms on phylogenetic trees ». Thesis, University of Cambridge, 2009. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.611685.
Texte intégralLivres sur le sujet "Phylogenesi"
The phylogenetic system : The systematization of organisms on the basis of their phylogenesis. Chichester [West Sussex] : Wiley, 1987.
Trouver le texte intégralFoster, Alan Dean. Phylogenesis. New York : Del Rey, 1999.
Trouver le texte intégralForey, Peter L., et Norman MacLeod. Morphology, shape and phylogeny. London : Taylor & Francis, 2002.
Trouver le texte intégralBoudreaux, H. Bruce. Arthropod phylogeny with special reference to insects. Malabar, Fla : R.E. Krieger Pub. Co., 1987.
Trouver le texte intégralArchitects, Foreign Office. Phylogenesis : Foa's ark. Barcelona : Actar, 2004.
Trouver le texte intégralArchitects, Foreign Office. Phylogenesis : Foa's ark. Barcelona : Actar, 2004.
Trouver le texte intégralBininda-Emonds, Olaf R. P., dir. Phylogenetic Supertrees. Dordrecht : Springer Netherlands, 2004. http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4020-2330-9.
Texte intégralScherson, Rosa A., et Daniel P. Faith, dir. Phylogenetic Diversity. Cham : Springer International Publishing, 2018. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-93145-6.
Texte intégralW, Warr Gregory, et Cohen Nicholas 1938-, dir. Phylogenesis of immune functions. Boca Raton, Fla : CRC Press, 1991.
Trouver le texte intégralLemey, Philippe, Marco Salemi et Anne-Mieke Vandamme, dir. The Phylogenetic Handbook. Cambridge : Cambridge University Press, 2009. http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511819049.
Texte intégralChapitres de livres sur le sujet "Phylogenesi"
Meireles, José Eduardo, Brian O’Meara et Jeannine Cavender-Bares. « Linking Leaf Spectra to the Plant Tree of Life ». Dans Remote Sensing of Plant Biodiversity, 155–72. Cham : Springer International Publishing, 2020. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-33157-3_7.
Texte intégralMatzke, Nicholas J. « Science Without Species : Doing Science with Tree-Thinking ». Dans Speciesism in Biology and Culture, 47–61. Cham : Springer International Publishing, 2022. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-99031-2_3.
Texte intégralZrzavý, Jan, Stanislav Mihulka, Hynek Burda, Sabine Begall et David Storch. « Phylogenese ». Dans Evolution, 155–214. Berlin, Heidelberg : Springer Berlin Heidelberg, 2013. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-39696-0_3.
Texte intégralZrzavý, J., D. Storch, S. Mihulka, Hynek Burda et Sabine Begall. « Phylogenese ». Dans Evolution, 146–205. Heidelberg : Spektrum Akademischer Verlag, 2009. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-8274-2233-0_3.
Texte intégralScheunpflug, Annette. « Phylogenese ». Dans Handbuch Pädagogische Anthropologie, 305–15. Wiesbaden : Springer Fachmedien Wiesbaden, 2013. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-531-18970-3_27.
Texte intégralPeter, Helga. « Phylogenese ». Dans Springer Reference Medizin, 1. Berlin, Heidelberg : Springer Berlin Heidelberg, 2020. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-54672-3_751-1.
Texte intégralToepfer, Georg. « Phylogenese ». Dans Historisches Wörterbuch der Biologie, 34–87. Stuttgart : J.B. Metzler, 2011. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-476-00461-1_3.
Texte intégralRieppel, Olivier. « The Evolutionary Turn in Comparative Anatomy ». Dans Phylogenetic Systematics, 1–33. Boca Raton : Taylor & Francis, 2016. | Series : Species and systematics : CRC Press, 2016. http://dx.doi.org/10.1201/b21805-1.
Texte intégralRieppel, Olivier. « Epilogue ». Dans Phylogenetic Systematics, 323–25. Boca Raton : Taylor & Francis, 2016. | Series : Species and systematics : CRC Press, 2016. http://dx.doi.org/10.1201/b21805-10.
Texte intégralRieppel, Olivier. « Of Parts and Wholes ». Dans Phylogenetic Systematics, 35–66. Boca Raton : Taylor & Francis, 2016. | Series : Species and systematics : CRC Press, 2016. http://dx.doi.org/10.1201/b21805-2.
Texte intégralActes de conférences sur le sujet "Phylogenesi"
Forghani, Majid Ali, Artyom L. Firstkov, Pavel Alexandrovich Vasev et Edward S. Ramsay. « Visualization of the Evolutionary Trajectory : Application of Reduced Amino Acid Alphabets and Word2Vec Embedding ». Dans 32nd International Conference on Computer Graphics and Vision. Keldysh Institute of Applied Mathematics, 2022. http://dx.doi.org/10.20948/graphicon-2022-275-287.
Texte intégralForghani, Majid, Pavel Vasev, Edward Ramsay et Alexander Bersenev. « Visualization of the Evolutionary Path : an Influenza Case Study ». Dans 31th International Conference on Computer Graphics and Vision. Keldysh Institute of Applied Mathematics, 2021. http://dx.doi.org/10.20948/graphicon-2021-3027-358-368.
Texte intégralJamil, H. M., G. A. Modica et M. A. Teran. « Querying phylogenies visually ». Dans Proceedings 2nd Annual IEEE International Symposium on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE 2001). IEEE, 2001. http://dx.doi.org/10.1109/bibe.2001.974405.
Texte intégralDaskalakis, Constantinos, Elchanan Mossel et Sébastien Roch. « Optimal phylogenetic reconstruction ». Dans the thirty-eighth annual ACM symposium. New York, New York, USA : ACM Press, 2006. http://dx.doi.org/10.1145/1132516.1132540.
Texte intégralChristinat, Yann, et Bernard M. E. Moret. « Inferring Transcript Phylogenies ». Dans 2011 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). IEEE, 2011. http://dx.doi.org/10.1109/bibm.2011.11.
Texte intégralSnell, Q., M. Whiting, M. Clement et D. McLaughlin. « Parallel Phylogenetic Inference ». Dans ACM/IEEE SC 2000 Conference. IEEE, 2000. http://dx.doi.org/10.1109/sc.2000.10062.
Texte intégralOcaña, Kary, Micaella Coelho, Guilherme Freire et Carla Osthoff. « High-Performance Computing of BEAST/BEAGLE in Bayesian Phylogenetics using SDumont Hybrid Resources ». Dans Brazilian e-Science Workshop. Sociedade Brasileira de Computação - SBC, 2020. http://dx.doi.org/10.5753/bresci.2020.11190.
Texte intégralBansal, Mukul S. « Phylogenetic uncertainty and transmission network inference : Lessons from phylogenetic reconciliation ». Dans 2016 IEEE 6th International Conference on Computational Advances in Bio and Medical Sciences (ICCABS). IEEE, 2016. http://dx.doi.org/10.1109/iccabs.2016.7802785.
Texte intégralGerasimchuk, A. L., P. A. Bukhtiyarova, D. V. Antsiferov et D. A. Ivasenko. « Diversity and activity of cultivated lipophilic bacteria from fat-containing industrial wastes ». Dans 2nd International Scientific Conference "Plants and Microbes : the Future of Biotechnology". PLAMIC2020 Organizing committee, 2020. http://dx.doi.org/10.28983/plamic2020.085.
Texte intégralKiryushkin, A. S., E. D. Guseva, E. L. Ilina et K. N. Demchenko. « Study of the DEEPER ROOTING 1 (DRO1) expression features in the cucumber (Cucumis sativus) root system architecture formation ». Dans 2nd International Scientific Conference "Plants and Microbes : the Future of Biotechnology". PLAMIC2020 Organizing committee, 2020. http://dx.doi.org/10.28983/plamic2020.121.
Texte intégralRapports d'organisations sur le sujet "Phylogenesi"
Nierzwicki-Bauer, S. A. Phylogenetic relationships among subsurface microorganisms. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), janvier 1991. http://dx.doi.org/10.2172/6106595.
Texte intégralNierzwicki-Bauer, S. A. Phylogenetic relationships among subsurface microorganisms. Progress report. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), décembre 1991. http://dx.doi.org/10.2172/10106325.
Texte intégralBruice, Thomas C. DNG and RNG Phylogenetic Single Cell Probes. Fort Belvoir, VA : Defense Technical Information Center, février 1999. http://dx.doi.org/10.21236/ada360479.
Texte intégralPace, Norman R. Phylogenetic Analysis of Marine Picoplankton Using rRNA Sequences. Fort Belvoir, VA : Defense Technical Information Center, juin 1989. http://dx.doi.org/10.21236/ada209595.
Texte intégralLapedes, A. S., B. G. Giraud, L. C. Liu et G. D. Stormo. Correlated mutations in protein sequences : Phylogenetic and structural effects. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), décembre 1998. http://dx.doi.org/10.2172/296863.
Texte intégralPace, Norman R. Phylogenetic Analysis of Marine Picoplankton Using Tau RNA Sequences. Fort Belvoir, VA : Defense Technical Information Center, février 1991. http://dx.doi.org/10.21236/ada254451.
Texte intégralNierzwicki-Bauer, S. A. Phylogenetic relationships among subsurface microorganisms. Project technical progress report. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), août 1993. http://dx.doi.org/10.2172/10171574.
Texte intégralBalkwill, D. L., et R. H. Reeves. Physiological and phylogenetic study of microbes from geochemically and hydrogeologically diverse subsurface environments. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), janvier 1991. http://dx.doi.org/10.2172/5026959.
Texte intégralGardner, S., et C. Jaing. Interim Report on Multiple Sequence Alignments and TaqMan Signature Mapping to Phylogenetic Trees. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), mars 2012. http://dx.doi.org/10.2172/1047247.
Texte intégralMarsh, Terence L. Phylogenetic & ; Physiological Profiling of Microbial Communities of Contaminated Soils/Sediments : Identifying Microbial consortia... Office of Scientific and Technical Information (OSTI), mai 2004. http://dx.doi.org/10.2172/824396.
Texte intégral