Thèses sur le sujet « Ovocytes – Croissance – Aspect moléculaire »
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Crozet, Flora. « Somatic cells enhance the oocyte developmental potential through cytoplasmic protrusions ». Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2021. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2021SORUS166.pdf.
Texte intégralRésumé :
Chez les femelles mammifères, les cellules somatiques qui entourent l’ovocyte, les cellules de la granulosa, coordonnent le développement ovocytaire post-partum, la croissance ovocytaire et la maturation méiotique, en dialoguant avec l’ovocyte. Ce dialogue est principalement établi par contact intercellulaire grâce à des protrusions des cellules de la granulosa, les projections transzonales (TZPs). Les TZPs ressemblent à des filopodes, résident dans la matrice extracellulaire entourant l’ovocyte, la zone pellucide, et établissent des jonctions gap et d’adhérence avec la membrane de l’ovocyte. Durant ma thèse, j’ai étudié le rôle des TZPs dans le développement ovocytaire. En générant un knockout total de la Myosine-X chez la souris, une protéine contenue dans les TZPs et participant à la formation des filopodes, nous avons obtenu des ovocytes avec une densité de TZPs réduite. Cela n’empêche pas l’ovocyte d’atteindre une taille canonique. Cependant, cela altère l’intégrité de la zone pellucide, l’adhésion ovocyte-matrice extracellulaire, et le transcriptome de l’ovocyte en fin de croissance, les transcrits dérégulés étant majoritairement sur-exprimés. Les ovocytes dépourvus de TZPs sont enclins à arrêter leur développement en métaphase de première division méiotique, bien que présentant un fuseau de division correctement assemblé et des chromosomes bien alignés. Nous proposons que les cellules somatiques modulent la synthèse ou la stabilité d’un sous-ensemble de transcrits ovocytaires par le biais de leurs protrusions cellulaires. Cette modulation améliore la capacité de l’ovocyte à terminer la maturation méiotique, et par extension, les chances de produire un embryonIn female mammals, somatic cells surrounding the oocyte, termed granulosa cells, coordinate the critical stages of post-partum oocyte development, i.e. oocyte growth and meiotic maturation, by dialoguing with the oocyte. This dialogue is primarily mediated by cell-cell contact carried out by granulosa cell protrusions termed transzonal projections (TZPs). TZPs are analogous to filopodia in their snake-like shape, but also in their structural composition. TZPs are located in the zona pellucida, the extracellular matrix surrounding the oocyte, and their extremities establish cellular junctions with the oocyte membrane, i.e. gap and adherens junctions. In my thesis, I investigated the role of TZP-mediated interaction between granulosa cells and the oocyte in oocyte development. By generating a total knockout of Myosin-X, a molecular motor contained in TZPs and participating in filopodia formation, we obtained mouse mutant oocytes with a reduced TZP density at the end of oocyte growth. This reduction does not impede the oocyte from reaching a canonical size. However, it impairs zona pellucida integrity, oocyte-matrix adhesion, and the oocyte transcriptome at the end of oocyte growth, with a subset of transcripts mostly up-deregulated. Importantly, TZP-deprived oocytes tend to cease their development at metaphase of the first meiotic division, despite a well-assembled division spindle and properly aligned chromosomes. We propose that somatic cells modulate the synthesis or stability of a subset of oocyte transcripts through their cellular protrusions. This modulation enhances the oocyte capacity to end meiotic maturation, and by extension, the chances of producing an embryo
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Vallée, Maud. « Identification de gènes spécifiques à l'ovocyte conservés au cours de l'évolution ». Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24138/24138.pdf.
Texte intégral
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Delaunay, Rudy. « Croissance moléculaire dans des agrégats d’hydrocarbures aromatiques polycycliques induite par des collisions avec des ions ». Caen, 2016. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01640994.
Texte intégralRésumé :
Cette thèse porte sur l'étude expérimentale de l'interaction entre des ions lents de basses énergies (de l'ordre du keV) et des molécules isolées ou des agrégats d'hydrocarbures aromatiques polycycliques neutres en phase gazeuse. L'utilisation de rayonnement ionisant sur ces systèmes moléculaires complexes a permis de mettre en évidence des processus de fragmentation statistique (redistribution de l’énergie à travers l’ensemble des degrés de liberté de la molécule cible) et non-statistique (collision binaire). Il a également été observé un mécanisme de croissance moléculaire lié à la formation de fragments à l’intérieur des agrégats à une échelle de temps très courte (< ps) à la suite de collisions binaires. La présence d’un environnement moléculaire autour des fragments créés lors de l’interaction permet d’initier un processus de réactivité entre les fragments et les molécules constituant l’agrégat. Plus particulièrement, l’étude se concentre sur l’importance du pouvoir d’arrêt électronique SE et nucléaire SN des ions projectiles. Lorsque SN est grand devant SN, la croissance moléculaire devient plus importante.
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Cloutier, Marc. « Études des mécanismes biomoléculaires de la croissance pulmonaire induite par l'occlusion trachéale : importance du sentier Rho/ROCK ». Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/27854/27854.pdf.
Texte intégral
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Bereterbide, Agnès. « Caractérisation génétique et moléculaire des anomalies du développement floral chez une lignée alloplasmique mâle-stérile de tabac ». Bordeaux 2, 2001. http://www.theses.fr/2001BOR28833.
Texte intégralRésumé :
La lignée alloplasmique de tabac Nta (rep)S représente le matériel d'étude. Elle est caractérisée par un phénotype mâle-stérile et par un défaut de développement des organes reproducteurs mâles. Ces derniers sont féminisés et certains d'entre eux fusionnent avec l'organe reproducteur femelle indiquant une perturbation de la frontière entre les verticilles 3 et 4 correspondant aux organes reproducteurs mâles et femelles, respectivement. Des analyses cytologiques ont révélé que les anomalies florales observées chez la lignée Nta (rep)S étaient dues à un défaut de fonctionnement du méristème floral. Afin de vérifier que le défaut cadastral était dû à une dérégulation du gène NtSUP, homologue de SUPERMAN (SUP) d'Arabidopsis, nous avons tenté de complémenter ce défaut par l'expression ectopique du gène SUP d'Arabidopsis. La surexpression de SUP chez la lignée Nta (rep)S a permis de restaurer (i) la frontière entre les verticilles 3 et 4, (ii) le développement des étamines et (iii) la fertilité mâle. En outre, l'analyse de la surexpression de SUP chez une plante mâle-fertile a permis de préciser les fonctions du gène SUP d'Arabidopsis : il exerce un contrôle négatif sur la prolifération, l'expansion et la différenciation cellulaire. La stérilité-mâle chez cette lignée alloplasmique étant transmise par voie maternelle, l'origine de la dérégulation de NtSUP par un mécanisme d'hyperméthylation a été démontrée. En utilisant comme sonde un fragment d'ADN génomique correspondant au gène NtSUP, nous avons montré que ce gène est sous-exprimé consécutivement à une hyperméthylation de sa séquence chez la lignée Nta(rep)S. Parrallmèlement et pour confirmer ces observations, l'analyse de l'effet d'un traitement hypométhylant de l'ADN chez la lignée alloplasmique Nta (rep)S a permis de montrer que la déméthylation conduit à une réactivation du gène NtSUP et à une restauration partielle du phénotype floralThe alloplasmic tobacco line (Nta(rep) combines the nucleus of Nicotiana tabacum with the cytoplasm of Nicotiana repanda. This line exhibits a male-sterile phenotype and a defect in male reproductive organ (stamens) development. The stamens are feminised and some of them are fused to the female reproductive organ (carpel) indicating a perturbation of the boundary between whorls 3 and 4 corresponding to the stamens and the carpel, respectively. Cytological analyses showed that floral anomalies in the Nta(rep)S line are due to an impairment of the floral meristem. To verify that the cadastral-type anomalies are linked to a misregulation of the NtSUP gene, homolog to the Arabidopsis SUPERMAN (SUP) we have tried to complement this defect by ectopic expression of Arabidopsis SUPERMAN gene. SUP over-expression in the fertile line led us to precise the SUP functions. SUP controls negatively cell proliferation but also cell expansion and differentiation. In the Nta(rep)S line, SUP over-expression had restored (i) the boundary between whorls 3 and 4 (ii) stamen development and (iii) the male fertility. As the male sterility is maternally inherited, a NtSUP misregulation by methylation process appeared to be an interesting way to investigate. A fragment of the NtSUP gene has been cloned and used as a probe to show that this gene is down-regulated by methylation in the Nta(rep)S line. To confirm these results, we analysed the effect of a hypomethylating treatment in the Nta(rep)S line. This treatment had for consequence a reactivation of the NtSUP expression and a partial restoration of the floral phenotype
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Daniel, Laurent. « Rôle des molécules d'adhésion et des glycoconjugués dans le processus cancéreux ». Aix-Marseille 2, 2001. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2001AIX20685.pdf.
Texte intégral
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Quillet, Renaud. « Définition moléculaire de l'origine des alteractions morphologiques liées à la dysfonction de Twist ». Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2002. http://www.theses.fr/2002STR13182.
Texte intégral
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Moulin, Julie-Alexandra. « Développement d'outils permettant l'évaluation quantitative de la maturité pulmonaire foetale à un temps gestationnel précis chez la souris ». Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24783/24783.pdf.
Texte intégral
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Guillemette, Stéphanie. « La contribution de Mek2 dans le développement du placenta murin ». Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24208/24208.pdf.
Texte intégral
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Roumanie, Olivier. « Mise en évidence et caractérisation des relations fonctionnelles entre la protéine RhoGAP Rgd1 et la protéine Vrp1 chez la levure Saccharomyces cerevisiae ». Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR28770.
Texte intégralRésumé :
La levure Saccharomyces cerevisiae est le premier organisme eucaryote dont le génome a été entièrement séquencé. L'analyse de sa séquence génomique a permis de détecter 6293 ORF qui doivent correspondre aux gènes permettant la vie autonome de la levure. 70 % de ces ORF correspondent à des gènes potentiels nouveaux. L'analyse fonctionnelle de l'ORF YBR260c a été entreprise. Elle a montré que cet ORF correspondait à un gène de S. Cerevisiae, qui a été nommé RGD1 pour Related GAP Domain 1. La protéine Rgd1 agit in vitro comme une GTPase Activating Protein (GAP) des petites protéines G Rho3 et Rho4 de la levure. Un crible génétique a permis de mettre en évidence une interaction létale synthétique entre les gènes RGD1 et VRP1 code pour la verproline, homologue de la protéine humaine WIP. La verproline interagit physiquement avec l'actine et les myosines de classe I, et elle est impliquée dans la croissance polarisée de la cellule. La caractérisation de l'interaction génique entre RGD1 et VRP1 a révélé l'implication des protéines Rho3 et Rho4, deux membres de la superfamille Ras. Les résultats obtenus à l'aide de formes mutantes de Rho3p et Rho4p sont en faveur d'une activité GAP de Rgd1p sur ces deux protéines in vivo. Les tests génétiques et fonctionnels qui ont été ensuite menés ont permis de mettre à jour les relations existant au sein de la cellule entre VRP1, RGD1, RHO3 ou RHO4 et des gènes liés au cytosquelette d'actine, en particulier avec l'homologue levure du gène WASP humain, LAS17. L'ensemble de ces résultats nous a permis de proposer un modèle biologique. Un complexe protéique, comprenant entre autre Vrp1p, travaillerait de concert avec une voie de signalisation cellulaire définie par les protéines Rho3 et Rho4 pour permettre la croissance polarisée de la cellule, Rgd1p, via son action GAP, agirait dans ce système comme un régulateur négtif de la voie Rho3/Rho4The yeast Saccharomyces cerevisiae is the first eucaryote whose genome was fully sequenced. The analysis of its genomic sequence has led to the discovery of 6293 ORF, which might correspond to genes allowing yeast autonomous life. 70 % of these ORF correspond to potential new genes. The functional analysis of the ORF YBR260c was initiated. It showed that this ORF corresponded to a S. Cerevisiae gene, which was named RGD1 for Related GAP Domain. The Rgd1 protein acts in vitro as a GTPase Activating Protein (GAP) for the yeast Rho3 and Rho4 small G proteins. Using a genetic screen, a synthetic lethal interaction between RGD1 and VRO1 genes was discovered. The VRP1 gene encodes a protein named verproline, which is homologous to human WIP protein. The verproline is an actin and myosins interacting protein involved in polarized growth. Characterization of RGD1-VRP1 genetic interaction revealed the implication of the Rho3 and Rho4 proteins, two members of the Ras superfamily. The results obtained using mutant forms of Rho3p and Rho4p are in favour of Rho3p and Rho4p being the targets of Rgd1p RhoGAP activity in vivo. Genetic and functional analyses made it possible to enlighten cellular relationships between VRP1, RGD1, RHO3 or RHO4 and cytoskeleton-linked genes, in particular the yeast counterpart of human WASP gene, LAS17. These results allow us to present a biological model. A proteic complex, including Vr1p, would act in concert with a signalling pathway defined by the Rho3 and Rho4 proteins to participate in polarized cell growth. Rgd1p, via its GAP activity, would act as a negative regulator of the Rho3/Rho4 pathway
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Bissonauth, Vickram. « Rôle essentiel de Mek1 dans le développement des tissus extra embryonnaires de la souris ». Thesis, Université Laval, 2006. http://www.theses.ulaval.ca/2006/23624/23624.pdf.
Texte intégral
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Côté, Caroline. « Caractérisation fonctionnelle et évolutive de régulateurs génétiques de croissance HD-Zip de classe III, chez le peuplier ». Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26721/26721.pdf.
Texte intégral
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Day, Arnaud. « La lignification des fibres périphloémiennes du lin (Linum usitatissimum L. ) : approches cytochimique, chimique et moléculaire ». Lille 1, 2004. https://ori-nuxeo.univ-lille1.fr/nuxeo/site/esupversions/591bb0bd-3841-4a7b-a571-f3cf36c2ba36.
Texte intégralRésumé :
Angiosperme dicotylédone de la famille des linacées, le lin (Linum usitatissimum) est la principale plante à fibres cultivée en France. L'intérêt industriel de cette plante repose sur la longueur et les propriétés exceptionnelles (finesse, résistances aux tensions et à l'usure) de ses fibres cellulosiques périphloémiennes. Ces dernières, localisées dans la tige, sont regroupées en faisceaux de quelques dizaines d'unités fortement associées entre elles et aux tissus environnant. De ce fait, leur exploitation requièrent une succession d'étapes biologiques (rouissage), mécaniques et chimiques (teillage et filage) afin d'obtenir leur dissociation et ceci au détriment de leurs propriétés intrinsèques. La présence de composés phénoliques limiterait l'efficacité de ces procédés agro-industriels en favorisant la cohésion intercellulaire de ces fibres. La caractérisation quantitative et qualitative de ces composés s'avère un prérequis à l'optimisation de la production et de l'utilisation des fibres de lin. A maturité ces fibres possèdent une structure pariétale caractéristique, leur paroi secondaire, constituée de l'extérieur vers le lumen, d'une S1, d'une importante S2 et d'une S3, représentent plus de 90 % de leur section transversale. Une approche microscopique basée sur la mise en œuvre de méthodes (immuno-)cytochimiques a permis de révéler la présence de lignine au niveau des zones mitoyennes et dans la paroi secondaire des cellules fibreuses. Des lignines condensées de type gai͏̈acyle ont été détectées au niveau de la lamelle moyenne, des jonctions tricellulaires et dans S1En outre, des lignines de type gai͏̈acyle-syTingyleont été identifiées en moindre quantité dans l'ensemble de la paroi secondaire. La quantification de ces lignines révèle une hypolignification marquée dans les fibres par rapport au bois. La caractérisation des lignines inscrustant les faisceaux fibreux du lin par thioacidolyse puis par oxydation alcaline par le nitrobenzène suggère la présence d'une lignine de type H-G-S possédant un très faible ratio S/G associé à un fort degré de condensation. Ces particularités des lignines des fibres de lin semblent s'accentuer au cours de leur maturation s'effectuant pendant quelques semaines après la floraison des plantes. La caféoyl-coenzyme A 3-O-Methyltransferase, CCoAOMT, est une enzyme clé de la voie de biosynthèse des lignines contrôlant leur synthèse et leur composition. Son étude a mis en évidence une corrélation positive entre i. L'expression du gène, ii. La présence de la protéine et iii. Son activité enzymatique, suggérant une régulation transcriptionnelle de cette enzyme. Par ailleurs, l'activité de cette enzyme et l'expression de ses gènes coi͏̈ncident avec les variations spatio-temporelles du dépôt des lignines dans les tiges. La production d'nne CCoAOMT recombinante a permis de tester in vitro la spécificité de substrat de cette enzyme. Ces analyses ont révélé l'implcation de la CCoAOMT dans la synthèse des unités gai͏̈acyles et syringyles proposannt ainsi une nouvelle voie dans la biosynthèse des monolignols
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Philips, Alexandre. « Interférences transcriptionnelles entre des facteurs de croissance et des ligands du récepteur aux oestrogènes dans des lignées cellulaires de cancer du sein humain ». Montpellier 1, 1993. http://www.theses.fr/1993MON1T020.
Texte intégral
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Bastelica, Delphine. « Etude de l'activation du plasminogène dans le tissu adipeux au cours de l'obésité ». Aix-Marseille 2, 2002. http://www.theses.fr/2002AIX20681.
Texte intégral
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Reber, Laurent. « Implication des mastocytes et de la voieSCF/c-Kit dans l'inflammation et le remodelage dans l'asthme et la fibrose pulmonaire ». Strasbourg, 2009. http://www.theses.fr/2009STRA6158.
Texte intégralRésumé :
Le stem cell factor (SCF) est le principal facteur de croissance des mastocytes. Nous avons montré que l’expression du SCF est sous la dépendance de la kinase nucléaire MSK1. Cette kinase est activée par les MAP kinases p38 et ERK en conditions inflammatoires. Une fois activée, MSK1 phosphoryle la Ser276 de la sous-unité p65 de NF-B, permettant à NF-B d’interagir avec son complexe co-activateur CBP et de se lier au 1er intron du gène codant le SCF. Nous avons ensuite étudié l’implication des mastocytes dans des modèles murins d’asthme chronique et fibrose. Nous avons pour cela comparé les réponses de souris sauvages et déficientes en mastocytes (KitWsh/Wsh), ayant ou pas subit un transfert adoptif de mastocytes dérivés de moelle osseuse. Nous avons ainsi pu montrer que le mastocyte joue un rôle central dans l’établissement d’une hyperréactivité bronchique et d’un remodelage bronchique, dans les mécanismes de fibrose pulmonaire et dans l’infiltration de cellules inflammatoiresStem cell factor (SCF) is one of the major mast cell growth factor. We found that SCF expression is controlled by the nuclear kinase MSK1. This kinase is activated by both the p38 and ERK MAP kinases in inflammatory conditions and phosphorylate the p65 subunit of NF-B. This phosphorylation occurs at Ser276 and regulates both the binding of NF-B to its coactivator CBP and to the first intron of the SCF gene. We next studied the implication of mast cells in murine models of chronic asthma and lung fibrosis. To do so, we compared the responses of wildtype mice to those of mast cell-deficient mice (KitWsh/Wsh mice), before and after adoptive transfert of bone marrow-derived cultured mast cells. We showed that mast cells play a key role in bronchial hyperresponsiveness and remodeling, as well as in pulmonary fibrosis and infiltration of inflammatory cells
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Vagner, Stéphan. « Controle de l'initiation alternative de la traduction du retrovirus murin mo-mul v et du facteur de croissance fibroblastique 2 humain ». Toulouse 3, 1995. http://www.theses.fr/1995TOU30095.
Texte intégralRésumé :
L'initiation alternative de la traduction permet la synthese de plusieurs formes proteiques a partir d'un seul messager par l'utilisation alternative de plusieurs codons d'initiation de la traduction sur ce messager. Nous nous sommes interesses aux mecanismes de controle de deux systemes d'initiation alternative de la traduction: un systeme retroviral, le virus de la leucemie murine (mo-mul v), ainsi qu'un gene eucaryote superieur, le facteur de croissance fibroblastique 2 (fgf-2) humain. L'arnm gag-pol du virus mulv possede deux codons d'initiation de la traduction (1 cug, 1 aug) permettant la synthese du precurseur gag des proteines de nucleocapside et d'un antigene de surface essentiel a la dissemination et aux effets pathogenes du virus. Le taux de synthese relatif de ces deux proteines est essentiel au bon deroulement du cycle replicatif. Le travail effectue a permis de montrer que ce retrovirus contient une sequence qui confere a son arnm la capacite d'etre traduit par un mecanisme original d'entree interne des ribosomes, different du mecanisme classique d'entree du ribosome par l'extremite 5' du messager. Cette sequence est la cible du facteur d'epissage ptb qui pourrait donc etre implique dans le mecanisme. Ce processus d'entree interne permet de controler l'initiation alternative de la traduction sur ce messager en selectionnant uniquement le codon aug. L'arnm du fgf-2 humain possede quant a lui quatre codons d'initiation de la traduction (3 cug et 1 aug) permettant la synthese de quatre isoformes fgf-2 ayant des localisations subcellulaires differentes et pouvant modifier les phenotypes cellulaires de facon diverse. On peut donc penser que le controle de l'expression relative des quatre isoformes fgf-2 a un impact important sur la cellule. Les resultats obtenus montrent qu'il existe dans la partie 5' de ce messager differents elements de controle en cis de l'utilisation des quatre codons d'initiation. Un d'entre eux correspond a un site d'entree interne des ribosomes. La presence de ce site peut potentiellement permettre la synthese de fgf-2 dans des conditions de stress ou durant la mitose. Finalement, trois proteines sont capables d'interagir specifiquement avec la partie 5' non traduite de ce messager. De facon interessante, ces proteines sont trouvees dans les types cellulaires transformes analyses qui produisent les quatre isoformes fgf-2 mais pas dans les types cellulaires normaux analyses qui produisent uniquement la petite forme de fgf-2. En conclusion, cette etude laisse penser que le processus d'initiation alternative de la traduction, en plus de contribuer a l'augmentation de la diversite genique, peut reguler l'expression relative de proteines avec des fonctions differentes, mais codees par le meme gene. De plus, la demonstration de l'existence du mecanisme d'entree interne des ribosomes sur deux messagers differents permet d'envisager une generalisation de ce processus pour de nombreux messagers. Le processus d'entree interne des ribosomes semble par ailleurs etre un nouveau mecanisme de regulation traductionnelle de l'expression des genes
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Chevron, Marie-Pierre. « Dystrophine et utrophine dans les dystrophies musculaires et au cours du développemnt des muscles squelettique, cardiaque et lisse humains ». Montpellier 1, 1994. http://www.theses.fr/1994MON1T023.
Texte intégral
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Laugel, Nicolas. « Mécanismes de construction de films multicouches de polyélectrolytes : Relations entre les régimes linéaire et exponentiel et la perméabilité aux ions multivalents ». Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2007. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2007/LAUGEL_Nicolas_2007.pdf.
Texte intégralRésumé :
Les films muticouches de polyélectrolytes sont des revêtements organiques d’épaisseur allant du nanomètre au micromètre. Ils peuvent être classés en deux catégories aux propriétés distinctes, selon le régime de croissance de leur épaisseur : linéaire ou exponentiel. L’objectif essentiel de cette thèse a été d’approfondir la compréhension des interactions à l’origine de la formation de ces films et de leur structure interne. Le premier volet a permis d’établir une relation entre le régime de croissance des films formés à partir d’un couple de polyélectrolytes donné et l’enthalpie de la réaction de complexation du même couple en solution. La seconde partie a consisté en l’étude par voltampérométrie cyclique des interactions entre le ferrocyanure et un film multicouche à croissance exponentielle. Sur les bases de ces résultats, la construction par la technique de dépôt réactif et la caractérisation de films composites organiques-inorganiques ont enfin été réalisésPolyelectrolyte multilayer films are organic coatings with thicknesses ranging from nanometers to micrometers. The thickness of these films can increase either linearly or exponentially with the number of deposition steps. The aim of this thesis was to better the comprehension of the internal structure of these films, as well as the interactions that lead to their formation. The first part of this work allowed to establish a relation between the growth regime of a film built with a given polyelectrolyte pair and the complexation enthalpy of the same pair in solution. The second part was a study of the interactions between ferrocyanide and an exponential growing polyelectyrolyte multilayer film by cyclic voltammetry. The last part, taking advantage of the results yielded by the other parts, consisted in the build-up and characterization of organic-inorganic composite films, using a reactive deposition method
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Merret, Rémy. « Contrôle moléculaire de la croissance sous déficit hydrique : analyse cinématique et régulation de l'expression des aquaporines TIP1 dans l'apex de la racine du peuplier ». Thesis, Nancy 1, 2010. http://www.theses.fr/2010NAN10069/document.
Texte intégralRésumé :
Cette étude porte sur le contrôle moléculaire de l'expansion cellulaire dans l'apex de la racine du peuplier. L'étude a été focalisée sur la régulation de l'expression des aquaporines TIP1s sous deux niveaux de déficit hydrique. Un cadre conceptuel, combinant analyse de la densité de transcrits à haute résolution spatiale et un formalisme de la mécanique des fluides, a été établi pour décrire la régulation de l'expression des gènes dans le temps et l'espace, le long de l'apex. Deux états de croissance contrastés ont été étudiés : un où la croissance de l'apex de la racine est rétablie (après 3 jours de stress modéré, 80 mosmol kg-1, 100 g L-1 de polyéthylène glycol PEG à 3500 g mol-1) et un où elle est réduite (après 3 jours de stress fort, 250 mosmol kg-1, 200 g L-1 de PEG). L'analyse cinématique a révélé une sensibilité différentielle de la vitesse d'allongement relatif (REGR) selon le niveau de stress et la position le long de l'apex. Au niveau moléculaire, nous montrons que lorsque la croissance est réduite, les pics de densité de transcrits des TIP1s sont plus forts et décalés dans les premiers millimètres de l'apex, zone où la croissance des cellules est maintenue. Cependant les niveaux d'induction/répression n'étaient jamais plus élevés que dans la condition témoin, soulignant qu'une forte densité de transcrits n'est pas forcément synonyme d'une forte induction de l'expression. Focalisé sur la combinaison de deux processus dynamiques, l'expansion cellulaire et l'expression des gènes, cette étude a mis en évidence que les conclusions tirées de l'analyse de ces processus sont influencées par la façon dont le temps, l'espace sont considérésThis study consideres the molecular control of cell expansion in poplar root apex. The study was focused on the regulation of the TIP1 aquaporins expression under two levels of water deficit. A conceptual framework combining transcript density analysis (quantitative PCR) at a high spatial resolution and a fluid mechanics formalism was established to describe the regulation of gene expression in time and space along the root apex. Two contrasting growth status were both studied: root growth rate is either restored (after three days of moderate stress, 80 mmol kg-1, 100 g L-1 polyethylene glycol PEG 3500 g mol-1) or root growth rate is reduced (after 3 days of high stress, 250 mosmol kg-1, 200 g L-1 PEG). Kinematic analysis revealed a differential sensitivity of the relative elemental growth rate (REGR) according to the stress level and to the coordinate along the apex. At the molecular level, we showed that growth reduction was associated with a shift of maximal densities of transcripts towards the first millimeters of the apex, where cell expansion was maintained. Meanwhile the induction/repression levels were never stronger than in the control condition underlying that a high transcript density does not mean a high transcriptional induction. Focused on the combination of two dynamic processes, cell expansion and gene expression, my thesis showed that the conclusions issued from the analyses of these processes are influenced by the way time, space and age are considered
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Campeas, Arnaud. « Modélisation de l'hétérogénéité de croissance dans le système aquacole ». Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2008. http://www.theses.fr/2008INPL011N/document.
Texte intégralRésumé :
L’hétérogénéité de croissance est un problème récurrent en aquaculture dont le déterminisme est le résultat d’une interaction complexe de nombreux facteurs: alimentaires, populationnels, environnementaux et génétiques. Nous avons développé un modèle individu-centré (système multi-agent) pour reproduire in silico les phénomènes biologiques sous-jacents (Mo.B.I.Fish : Model of Behavioral Interaction of Fish). La première étape a consisté en l’élaboration d’un modèle de croissance capable de modéliser la prise de poids d’un poisson en fonction de son ingéré. Deux types de modèles ont été évalués (Scope For Growth et Dynamic Energy Budget) sur des données expérimentales de croissance et le SFG a été retenu. Il a ensuite été utilisé en validation pour évaluer l’importance de l’ingéré et d’autres facteurs dans l’hétérogénéité de croissance. La deuxième étape de modélisation a consisté en l’élaboration d’un modèle simulant les interactions sociales entre poissons. Ces interactions ont été simulées par un système multi agents qui reproduit des séries de combats entre deux individus dont l’issue est dépendante de leur poids, de leurs interactions passées, de leur génétique et d’un effet aléatoire. Le résultat de ces combats influence leur nourrissage individuel. A l’aide de 2 expérimentations ad hoc de croissance de perche en circuit fermé, nous avons pu calibrer et valider le modèle de façon à estimer l’importance des différents facteurs dans le déterminisme des combats. La comparaison entre le modèle et les données a été faite sur les variables « poids moyen »« coefficient de variation » et « coefficient de corrélation de Spearman ». Il est apparu ainsi que la taille avait une faible importance, et que le déterminisme des combats pouvait être, en première approche considéré comme purement aléatoire. L’effet mémoire permet de simuler le désordre des rangs de poids des poissons entre le début et la fin de la période de croissanceGrowth heterogeneity is a recurrent problem in fish aquaculture. Its determinism is the result of complex interactions between numerous factors: feeding rate, social interactions, environmental conditions and genetics. We developed an individualized based model (multi-agent system) to reproduce in silico biological phenomena (Mo.B.I.Fish : Model of Behavioral Interaction of Fish). The first step of modelling consisted of choosing a model that could simulate growth knowing the food intake. Two models were compared (Scope For Growth and Dynamic Energy Budget) to experimental data of growing fish: we finally chose the SFG. This model was used in validation to evaluate the relative influence of the food intake (combined with other factors) on growth heterogeneity. The second step of modelling consisted of building a model which simulated social interactions between fish. These interactions were simulated with a multi-agent system that reproduced fights between two fish, in which the final result depended on the weight, experience of each fish, genetic and random effect. The result of the fight had direct influence on the individual intake. Two experiments were conducted on perch in recirculating system, which provided to us data to both calibrate and validate the model. The output of the model was the mean weight, the coefficient of variation of the weight and the Spearman's rank correlation coefficient of fish weight. Hence we could estimate the relative importance of each factor in the determinism of the fights. We observed that size had little or no effect, and that the determinism could be considered as completely random. The experience effect also allowed simulating accurately the rank of the weight of fish between the beginning and the end of the experiments
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Bergeron, Francis. « Caractérisation du promoteur du gène platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRA) de rat dans les cellules de leydig ». Thesis, Université Laval, 2010. http://www.theses.ulaval.ca/2010/27165/27165.pdf.
Texte intégral
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Marie, Pauline. « De l'œuf à l'adulte : étude moléculaire et fonctionnelle de la répression des éléments transposables par les piARN au cours du développement chez drosophila melanogaster ». Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2016. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2016PA066426.pdf.
Texte intégralRésumé :
Chez les métazoaires, la mobilisation des éléments transposables est régulée par de petits ARN non codants appelés piARN pour "PIWI interacting RNA". Cette répression est très étudiée dans la lignée germinale adulte où elle est particulièrement efficace. Néanmoins, la mobilisation de ces éléments doit être régulée tout au long du développement de la lignée germinale, qui transmet l’information génétique à travers les générations. Durant ma thèse, j’ai utilisé le modèle D. melanogaster pour étudier la répression des éléments transposables au cours du développement de la lignée germinale femelle. J’ai ainsi pu montrer qu’une répression fonctionnelle par les piARN existe dès la fin de l’embryogenèse et que les gènes liés à la régulation chez l'adulte sont également nécessaires pour la répression au cours du développement. L’analyse de données de séquençage haut débit m’a permis de mettre en évidence la production de novo de piARN fonctionnels dans les gonades en formation. De plus, comme dans les ovaires adultes, j'ai pu remarquer une répression incomplète, ressemblant à la variégation, à tous les stades du développement. Des expériences de lignage cellulaire suggèrent fortement qu'une mémoire épigénétique précoce est initiée dans les cellules germinales embryonnaires et maintenue jusqu'au stade adulte. L'implication de l'Heterochromatin Protein 1a (HP1a) dans la production des piARN télomériques montrée par séquençage des piARN pourrait expliquer ce phénomène . Les données présentées ici montrent que piARN et leurs partenaires protéiques sont les composants d'un système de répression épigénétique continu tout au long de la vie des cellules germinalesIn metazoan germ cells, transposable element activity is repressed by small noncoding PIWI-associated RNAs (piRNAs). Numerous investigations in Drosophila have enlightened the mechanism of this repression in the adult germline. However, very little is known about piRNA-mediated repression during germline development. Nevertheless, to maintain the integrity of the genome, repression should occur throughout the lifespan of germ cells. During my PhD, I show that piRNA-mediated repression is active in the female germline, from late embryonic to pupal primordial germ cells, and that genes related to the adult piRNA pathway are required for repression during development. rhino-dependent piRNAs, exhibiting the molecular signature of the piRNA pathway "ping-pong" amplification step, are detected in larval gonads, arguing for de novo biogenesis of functional piRNAs during development. I also show that production of telomeric piRNAs depends on Heterochromatin Protein 1a (HP1a). Furthermore, as in adult ovaries, I observe an incomplete, bimodal and stochastic repression resembling variegation at all developmental stages. Clonal analyzes of this incomplete silencing strongly suggest that a cellular memory of an early repression decision is initiated in embryonic germ cells and further maintained until the adult stage. Taken together, the data presented here show that piRNAs and their associated proteins are epigenetic components of a continuous repression system throughout germ cell development
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Lethielleux-Juge, Christine. « Étude morphologique de l'architecture fine du mycélium de champignons mycorhiziens arbusculaires du genre Glomus ». Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25342/25342.pdf.
Texte intégral
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Guillemain, Isabelle. « Etude du rôle de la protéine Bcl-x dans le développement neuronal. Utilisation d'un modèle cellulaire, la lignée humaine Ntera2 ». Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20067.
Texte intégralRésumé :
Ce travail de these s'inscrit dans une strategie de reparation du systeme nerveux lese en favorisant une approche par transplantation cellulaire. Nous avons utilise un modele cellulaire, la lignee humaine ntera2. Une partie des cellules de cette lignee se differencie irreversiblement sous l'action de l'acide retinoique en neurones postmitotiques. L'optimisation de la survie et de la differenciation de ces cellules etant important dans cette strategie, nous nous sommes interesses au role des proteines de la famille de bcl-2 et plus particulierement a la proteine bcl-x durant le developpement neuronal. Dans un premier temps, nous avons recherche la localisation de la proteine bcl-x dans le systeme nerveux central (snc) postnatal et adulte. Alors que la proteine bcl-x l est exprimee de facon ubiquitaire dans le snc postnatal, sa presence se restreint dans le snc adulte a des regions connues pour leur plasticite. Dans un second temps, dans la perspective de greffer les neurones nt2 dans le snc, nous avons caracterise les phenotypes de neurotransmission exprimes par ces cellules. Ces cellules sont multipotentes et sont capables de former des synapses, ce qui en font un outil therapeutique interessant permettant de remplacer plusieurs types de neurones disparus lors de traumatismes ou de maladies neurodegeneratives. Au cours de la differenciation des cellules nt2, nous avons montre que les proteines bcl-x, bcl-2 et bax ont des profils d'apparition et d'expression differents. Ces proteines etant connues pour leur role dans l'apoptose, nous avons recherche la presence d'une mort cellulaire durant la differenciation des cellules nt2. Dans ce modele, il existe une mort apoptotique precoce dans les premiers jours de la differenciation touchant les cellules n'exprimant pas les marqueurs de differenciation. Lors de ce pic d'apoptose, l'expression de la proteine bax ne varie pas, celle de bcl-2 est indetectable et celle de bcl-x augmente. Une strategie utilisant des oligodeoxynucleotides antisens dirige contre l'arn de bcl-x l a ete utilisee pour preciser le role de la proteine bcl-x. Il semble que la presence proteine bcl-x l soit necessaire a la survie des cellules nt2 indifferenciees. En conclusion, chacune des proteines bcl-x l, bcl-2 et bax en plus de leur role connu dans l'apoptose pourraient jouer un role distinct et specifique dans les differentes etapes du processus de differenciation des cellules nt2.
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Fintz, Anne-Claire. « Contribution à la caractérisation des facteurs de survie des cônes rétiniens ». Strasbourg 1, 2002. http://www.theses.fr/2002STR13168.
Texte intégralRésumé :
L'hypothèse que la survie des cônes rétiniens dépende de la présence des bâtonnets a été auparavant démontrée par la transplantation de couches de photorécepteurs à 97% riches en bâtonnets chez la souris rd1, modèle de rétinopathie pigmentaire. Des études in vitro ont suggéré que cet effet dépende de facteurs diffusibles provenant de ces mêmes bâtonnets. L'identification de ce(s) facteur(s) permettrait d'élaborer de nouvelles thérapies dans le cas des rétinopathies pigmentaires humaines, maladies dégénératives héréditaires où la perte des bâtonnets porteurs d'une mutation génétique entraîne la dégénérescence secondaire des cônes conduisant irrémédiablement vers la cécité. Afin de caractériser les substances à l'origine de l'activité trophique observée sur le modèle de la souris rd1 nous avons validé un essai fonctionnel pour l'étude de la survie des cônes : la culture en monocouche de cellules rétiniennes d'embryons de poulet. Nous avons voulu déterminer la nature et la taille de ces facteurs diffusibles en utilisant conjointement l'essai fonctionnel enrichi en cônes et le modèle pathologique à savoir les explants rétiniens rd1 en culture. La dialyse et le chauffage de l'activité trophique promouvant la survie des cônes ont suggéré des molécules d'un poids moléculaire supérieur à 25 kDa, et thermosensibles. Parallèlement, le facteur neurotrophique dérivé d'une lignée cellulaire gliale (GDNF), 30kDa, ayant déjà montré un effet protecteur sur la fonctionnalité des photorécepteurs dans différents modèles expérimentaux a été testé sur l'essai fonctionnel des cônes de poulet embryonnaire et sur des cultures enrichies en bâtonnets de souris ou de rat. Nous avons montré une effet direct de GDNF sur la survie des bâtonnets mais pas sur celle des cônes. En attendant le criblage systématique des facteurs de survie des cônes rétiniens, l'ensemble de ces travaux a permis de tisser une trame d'analyse appliquée à l'étude d'autres facteurs neurotrophiques candidatsThe possibility that survival of cone photoreceptors depends on the presence of rod photoreceptors was previously demonstrated by transplantation of rod-enriched photoreceptor layers into the sub-retinal space of the retinal degeneration rd1 mouse, a model of Retinitis Pigmentosa (RP). In vitro experiments suggested that rod effects upon cones were mediated by soluble factors. Identification of these factors could enable us to design new therapies in the case of human RP, inherited diseases where loss of rods, the principal cellular sites of genetic mutations, trigger secondary cone degeneration leading to irremediable blindness. In order to characterise soluble factors involved in survival of rd1 mouse cones, we validated a functional assay for cone survival studies: chick embryonic retinal cell cultures. We aimed at determining the nature and the weight of these soluble factors by using both the enriched cone functional assay and rd1 mouse explants cultures. Dialyses and heating of conditioned medium promoting cone survival suggested thermolabile molecules of molecular weight superior to 25kDa. Similarly, glial cell line-derived neurotrophic factor (GDNF), a 30 kDa protein exhibiting neuroprotective effects on a range of neural types, has been previously shown to protect photoreceptors in different experimental models. It was tested upon chick cone-enriched and rat rod-enriched retinal cell cultures, and show to have a direct effect upon rod but not cone photoreceptor survival. While awaiting systematic screening of soluble factors promoting cone survival, these results establish the foundations for further studies on candidate neurotrophic factor testing
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Broquard, Coralie. « Le déterminisme sexuel de l'huître crassostrea gigas : du phénotype aux facteurs moléculaires sous-jacents ». Thesis, Normandie, 2019. http://www.theses.fr/2019NORMC264.
Texte intégralRésumé :
Le savoir relatif au mode de reproduction et au déterminisme sexuel de l’huître creuse Crassostrea gigas demeure limité. Etant une espèce hermaphrodite séquentielle, la détermination de son sexe a lieu plusieurs fois au cours de sa vie. Dans le cadre de cette thèse, les phénotypes sexuels des 6 premières années de vie de l’huître ont été identifiés au sein de deux cohortes. Ainsi, le sexe-ratio était biaisé vers les femelles dès la première maturité sexuelle, ainsi que pour toutes les années suivantes. Après six années de sexage, 42%, 32%, 19%, 5%, 1% et 0,1% des huîtres ont montré 0, 1, 2, 3, 4 et 5 changements de sexe. La fréquence des changements de sexe décroissait aussi avec l’âge des individus (34% entre les années 1-2 à 9% entre les années 5-6). Ces travaux de thèse ont également cherché à déterminer l’influence du sexe et du changement de sexe sur les paramètres morphologiques des individus. Ainsi, un dimorphisme sexuel a été identifié pour le poids total ainsi que la longueur, largeur et épaisseur de la coquille, en faveur des huîtres femelles, dont celles ayant changé de sexe dans le sens male vers femelle. Enfin, une analyse transcriptomique de la gonade d’individus à phénotypes contrastés (« vraies » femelles et « vrais » mâles) devait permettre d’approfondir les connaissances sur les facteurs moléculaires du déterminisme sexuel. Ainsi, cette approche a permis (i) d’identifier les profils d’expression d’homologues du déterminisme sexuel sur toute la période de ce mécanisme et (ii) d’identifier de nouveaux acteurs moléculaires d’intérêt surexprimés spécifiquement dans un sexe lors du déterminisme sexuel. Chaque pattern d’expression obtenu chez de « vrais » mâles ou de « vraies » femelles a ainsi pu être interprété à la lumière du plus probable futur phénotype du sexe, malgré l’hermaphrodisme séquentiel. Cette approche a permis d’affiner les hypothèses concernant le rôle des divers facteurs dans le déterminisme du sexe de l’huître creuseKnowledge about the mode of reproduction and the sex determination of the cupped oyster Crassostrea gigas remains limited. As a sequential hermaphroditic species, sex determination takes place several times during its lifetime. As part of this thesis, the sexual phenotypes of the first 6 years of life of oysters were identified in two cohorts. Thus, the sex ratio was biased towards females from the first sexual maturity, as well as for all subsequent years. After six years of sexing, 42%, 32%, 19%, 5%, 1% and 0.1% of oysters showed 0, 1, 2, 2, 3, 4 and 5 sex changes. The frequency of sex changes also decreased with age (34% between years 1-2 to 9% between years 5-6). This thesis work has also sought to determine the influence of sex and sex change on the morphological parameters of individuals. Thus, a sexual dimorphism was identified for the total weight as well as the length, width and thickness of the shell, in favour of female oysters, including those that have changed sex in the male to female direction. Finally, a transcriptomic analysis of the gonad of individuals with contrasted phenotypes ("true" females and "true" males) was to provide further knowledge on the molecular factors of sex determination. Thus, this approach made it possible (i) to identify the expression patterns of homologs of sex-determining genes, over the entire period of this mechanism and (ii) to identify new molecular actors of interest, overexpressed specifically in one sex during sex determination. Each expression pattern obtained in "true" males or "true" females could thus be interpreted in the light of the most probable future phenotype of the sex, despite sequential hermaphroditism. This approach allowed to refine hypotheses about the role of various factors in determining the sex of this cupped oyster
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Gamarra, Lazo Giselle del Carmen. « Modulation des taux plasmatiques d’insuline par l’apport de propylène glycol dans l’alimentation : effet sur la quantité, la qualité des ovocytes et des embryons produits in vitro chez des génisses laitières ». Thesis, Paris, AgroParisTech, 2014. http://www.theses.fr/2014AGPT0083.
Texte intégralRésumé :
L’Ovum Pick-Up (OPU) et la production d'embryons in vitro représentent une voie d’accélération du progrès génétique par la voie femelle. Ces techniques impliquent en autre la collecte d’ovocytes de qualité pour produire des embryons transférables. La qualité des ovocytes et les taux de développement embryonnaire in vitro sont impactés par la nutrition des donneuses avant OPU, les effets étant médiés par plusieurs métabolites et hormones impliqués dans la régulation du métabolisme énergétique. Les niveaux plasmatiques d'insuline et d’IGF1 accrus sont corrélés aux niveaux des apports énergétiques chez les génisses laitières. Les régimes augmentant les concentrations d'insuline influencent négativement la qualité des ovocytes. Néanmoins, une augmentation des concentrations d'insuline stimule en quelques jours le nombre des petits follicules. Ces résultats ont conduit à formuler l’hypothèse d’une modulation transitoire des concentrations d'insuline chez les donneuses d’ovocytes basée sur l'administration orale de propylène glycol (PG). En effet, le PG augmente les concentrations d'insuline et d’IGF-1 dans le plasma chez la vache au cours du post-partum. L’hormone antimüllérienne (AMH) est un marqueur endocrinien de la réserve de follicules ovariens sensibles aux gonadotrophines chez la vache. Il a été récemment établi que les concentrations plasmatiques d'AMH aident à prédire la réponse des donneuses d’embryons collectés in vivo. Dans cette thèse, nous avons étudié l'effet de l'administration de PG à court terme sur les niveaux d'insuline, la croissance folliculaire, la réponse à la stimulation de la croissance folliculaire au traitement FSH et la production d'embryons in vitro après OPU chez les génisses avec différents profils d’AMH circulante (haut H vs bas B). La relation entre la dose de PG chez les génisses laitières et la réponse à l'insuline a été établie, ainsi que les relations avec les concentrations plasmatiques d’hormones et métabolites du métabolisme énergétique. Puis, le nombre et la qualité morphologique des ovocytes et des embryons produits ont été déterminés chez les génisses donneuses ayant une alimentation restreinte. Enfin, les profils d'expression de gènes du système IGF dans les ovocytes et les cellules du cumulus et de gènes candidats de survie embryonnaire chez des blastocystes ont été évalués.Nos données ont montré que l'administration de PG chez les génisses laitières est associée à une élévation des concentrations plasmatiques d’insuline, d'IGF1 et de glucose et à une diminution de celles de β-hydroxybutyrate (BHB) et d’urée. Les concentrations d’IGF1 dans le liquide folliculaire ont augmenté. De plus, l’administration de PG a été associée à un nombre plus élevé de petits follicules (2- 3mm) le 2ème jour du cycle œstral par rapport au lot contrôle. Cet effet positif a été maintenu sur le nombre de follicules moyens (4-8mm) le 5ème jour du cycle, après stimulation de la croissance folliculaire dans le groupe AMH H. En outre, une augmentation significative du taux de blastocystes de qualité 1 après 7 jours de culture in vitro (exprimés en pourcentage d'ovocytes fécondés) a été observée chez les génisses du lot PG par rapport au lot contrôle. L’administration de PG a conduit au développement d’un nombre plus élevé de blastocystes épanouis le 7ème jour du cycle par rapport au contrôle, uniquement dans le groupe AMH H. De plus, le PG a modifié les profils d'expression des gènes du système IGF dans les cellules du cumulus et des gènes de survie étudiés chez les blastocystes. Par conséquent, nos données montrent que l'administration de PG a amélioré la production et la qualité des embryons in vitro, peut-être en raison des modifications du système IGF1 induites par le PG en début de vague folliculaire. Celles-ci pourraient moduler l'environnement folliculaire et impacter l’expression des gènes y compris jusqu'au stade blastocyste, l’effet étant cependant plus marque chez les génisses a profil haut d’AMHThe ovum pick-up and in vitro embryo production method in heifers can accelerate the speed of genetic progress through the female line. However, to be effective it requires high numbers of usable oocytes to be collected and high numbers of transferable embryos and high embryo survival after cryopreservation to ensure the maintenance of pregnancy after transfer. The variability in the quality of oocytes and embryo development rates in vitro may be influenced by the dietary intake of donor cattle before oocyte recovery and may be related to the concentrations of metabolites and hormones involved in regulating energy metabolism: in particular, increased levels of insulin and IGF1 were associated with high energy intake in dairy heifers. Moreover, in heifers, it was shown that diets that increase insulin concentrations negatively influence the quality of oocytes. However an increase in insulin concentrations over a short lapse of time has a positive effect on the growth of small follicles prior to superovulatory treatment. These findings support the idea that it may be possible to modulate insulin concentrations transiently to improve reproductive success. The addition of propylene glycol (PG) to the diet increases the concentrations of insulin and IGF1 in plasma in cows during the post-partum period. Anti-müllerian hormone (AMH) is an endocrine marker of the size of the pool of ovarian gonadotrophin-responsive follicles in the cow, and plasma AMH concentrations measured before stimulation of follicular growth with FSH hormone treatment can help predict the response of individuals. In this thesis, we investigated the effect of shortterm PG administration to modulate the levels of insulin, follicular growth, the superovulatory response and in vitro embryo production after OPU in heifers with different pre-experimental circulating AMH profiles (high, H vs. low, L). Firstly, the relationship between the dose of propylene glycol in dairy heifers and the insulin response was established. Secondly, the number and morphological quality of oocytes and embryos produced with and without a supplement of propylene glycol in feed-restricted heifers were determined. Thirdly, the gene expression patterns of the IGF system in oocytes and cumulus cells and the expression profile of selected candidate genes that are important for in vitro embryo development were evaluated. Plasma concentrations of some hormones and metabolites and their relationship with PG were also studied.Our data show that administration of PG increased plasma insulin, IGF1 and glucose concentrations and decreased plasma β-hydroxybutyrate (BHB) and urea concentrations in feed-restricted heifers. PG as an oral drench also increased IGF1 concentrations in follicular fluid. In addition, PG increased the number of small (2–3mm) follicles on Day 2 during the first follicle wave in both AMH groups (H and L) compared with the control treatment (water drench). PG only continued to have a positive effect on the number of medium (4–8mm) follicles on Day 5 after stimulation of follicular growth in the AMH H group. Additionally, there was a significant increase in Day 7 Grade 1 blastocysts (expressed as a percentage of fertilized oocytes) after PG compared with control treatment in both AMH groups of heifers. PG increased the number of expanded blastocysts at Day 7 compared with control but only in AMH H and not AMH L heifers. Additionally, PG modified the gene expression pattern of the IGF system in cumulus cells and produced changes in gene expression in blastocysts. Consequently, our data showed that PG administration is effective in improving in vitro embryo production probably due to the existence of epigenetic regulation induced by PG during follicular growth in the IGF1 system. This regulation system may modulate the follicular environment and level of gene expression up to the blastocyst stage more markedly in heifers with high compared to low AMH levels
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Marie, Pauline. « De l'œuf à l'adulte : étude moléculaire et fonctionnelle de la répression des éléments transposables par les piARN au cours du développement chez drosophila melanogaster ». Thesis, Paris 6, 2016. http://www.theses.fr/2016PA066426/document.
Texte intégralRésumé :
Chez les métazoaires, la mobilisation des éléments transposables est régulée par de petits ARN non codants appelés piARN pour "PIWI interacting RNA". Cette répression est très étudiée dans la lignée germinale adulte où elle est particulièrement efficace. Néanmoins, la mobilisation de ces éléments doit être régulée tout au long du développement de la lignée germinale, qui transmet l’information génétique à travers les générations. Durant ma thèse, j’ai utilisé le modèle D. melanogaster pour étudier la répression des éléments transposables au cours du développement de la lignée germinale femelle. J’ai ainsi pu montrer qu’une répression fonctionnelle par les piARN existe dès la fin de l’embryogenèse et que les gènes liés à la régulation chez l'adulte sont également nécessaires pour la répression au cours du développement. L’analyse de données de séquençage haut débit m’a permis de mettre en évidence la production de novo de piARN fonctionnels dans les gonades en formation. De plus, comme dans les ovaires adultes, j'ai pu remarquer une répression incomplète, ressemblant à la variégation, à tous les stades du développement. Des expériences de lignage cellulaire suggèrent fortement qu'une mémoire épigénétique précoce est initiée dans les cellules germinales embryonnaires et maintenue jusqu'au stade adulte. L'implication de l'Heterochromatin Protein 1a (HP1a) dans la production des piARN télomériques montrée par séquençage des piARN pourrait expliquer ce phénomène . Les données présentées ici montrent que piARN et leurs partenaires protéiques sont les composants d'un système de répression épigénétique continu tout au long de la vie des cellules germinalesIn metazoan germ cells, transposable element activity is repressed by small noncoding PIWI-associated RNAs (piRNAs). Numerous investigations in Drosophila have enlightened the mechanism of this repression in the adult germline. However, very little is known about piRNA-mediated repression during germline development. Nevertheless, to maintain the integrity of the genome, repression should occur throughout the lifespan of germ cells. During my PhD, I show that piRNA-mediated repression is active in the female germline, from late embryonic to pupal primordial germ cells, and that genes related to the adult piRNA pathway are required for repression during development. rhino-dependent piRNAs, exhibiting the molecular signature of the piRNA pathway "ping-pong" amplification step, are detected in larval gonads, arguing for de novo biogenesis of functional piRNAs during development. I also show that production of telomeric piRNAs depends on Heterochromatin Protein 1a (HP1a). Furthermore, as in adult ovaries, I observe an incomplete, bimodal and stochastic repression resembling variegation at all developmental stages. Clonal analyzes of this incomplete silencing strongly suggest that a cellular memory of an early repression decision is initiated in embryonic germ cells and further maintained until the adult stage. Taken together, the data presented here show that piRNAs and their associated proteins are epigenetic components of a continuous repression system throughout germ cell development
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Benkouider, Abdelmalek. « Fabrication and characterization of sige-based core-shell nanostructures ». Thesis, Aix-Marseille, 2015. http://www.theses.fr/2015AIXM4345.
Texte intégralRésumé :
Du fait de leur facilité de fabrication et de leurs propriétés physiques uniques, les nanofils (NFs) de semi-conducteurs présentent des potentialités d’application importantes elles pouvaient être comme briques élémentaires de nombreux dispositifs nano- et opto-électroniques. Différents procédés de fabrication ont été développés pour fabriquer et organiser ces nanofils en épitaxie sur silicium. Cependant, un des principaux problèmes réside dans le manque de reproductibilité des NFs produits naturellement. Pour obtenir un meilleur contrôle de leur périodicité, localisation, forme et taille, différents types de gravure ont été mis au point. Aujourd’hui, des incertitudes importantes persistent quant à leurs propriétés fondamentales, en raison d’un manque de corrélation entre les propriétés électroniques et optiques et les détails microscopiques (composition, structure, chimie ...etc.). L’objectif de ce travail est de développer deux types de procédés de fabrication : le premier "top-down" est basé sur la nanogravure directe par faisceau d’ions focalisés (FIB)de couches bi-dimonsionnelles de SiGe. Ce procédé permet de contrôler la taille des NFs, les déformations, et leur localisation précise. Il permet de fabriquer des réseaux de larges piliers. Les NFs réalisés par cette technique sont peu denses et de diamètre important. Le second procédé est de type "Bottom-Up" ; il s’appuie sur la croissance VLS à partir de catalyseurs métalliques (AuSi). Les NFs réalisés ont étudiés à l’échelle locale afin de mesurer la taille moyenne de contrainte ainsi que leur effet sur le confinement quantique et sur la structure de bande des NFsSiGe/Si core/shell nanowires (NWs) and nanodots (NDs) are promising candidates for the future generation of optoelectronic devices. It was demonstrated that the SiGe/Si heterostructure composition, interface geometry, size and aspect ratios can be used to tune the electronic properties of the nanowires. Compared to pure Si or Ge nanowires, the core-shell structures and exhibit extended number of potential configurations to modulate the band gap by the intrinsic strain. Moreover, the epitaxial strain and the band-offsets produce a better conductance and higher mobility of charge carriers. Recent calculations reported that by varying the core-shell aspect ratio could induce an indirect to direct band gap transition. One of the best configurations giving direct allowed transitions consists of a thin Si core embedded within wide Ge shell. The Germanium condensation technique is able to provide high Ge content (> 50%) shell with Si core whom thickness of core and shell can be accurately tuned. The aim of this work is to develop two types of synthesis processes: the first "top-down" will be based on direct nanoetching by focused ion beam (FIB) of 2D SiGe layer. This process allows the control of the size of NWs, and their precise location. The NWs achieved by this technique are not very dense and have a large diameter. The second processes called "bottom-up"; are based on the VLS growth of NWs from metal catalysts (AuSi). Grown NWs have been studied locally in order to measure the mean size and the strain and their effects on the quantum confinement and band structure of NWs
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Masselot, Véronique. « Influence des stabilisants sur la cristallisation d'un semi-liquide alimentaire : Application à la congélation des sorbets ». Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASB021.
Texte intégralRésumé :
Un sorbet est un dessert congelé et aéré, fabriqué à partir d’un mix constitué de jus de fruit concentré, de sucres et de stabilisants. L’étape la plus critique du procédé de fabrication des sorbets est l’étape de congélation-foisonnement qui a lieu dans un échangeur de chaleur à surface raclée (ECSR) ; c’est lors de cette étape que se forment les cristaux de glace et que l’air est introduit tandis que la solution résiduelle non congelée se concentre en sucres et en stabilisants. La qualité du produit final est fortement liée à la quantité initiale et à la taille des cristaux de glace formés dans l’ECSR ; ils doivent être les plus nombreux et les plus petits possibles. L’objectif scientifique de cette thèse est une meilleure compréhension de l’influence des stabilisants sur la microstructure (taille et nombre de cristaux et de bulles d’air) formée pendant la congélation d’un sorbet.Les propriétés rhéologiques du mix de sorbet avant sa congélation et de la solution résiduelle non congelée ont été explorées et quantifiées en fonction du type de stabilisant utilisé (CMC, HPMC, LBG). Des études de leurs propriétés tensioactives et de la diffusion des molécules d’eau ont été menées et les propriétés thermiques d’équilibre du mix ont été analysées. La microstructure de ces sorbets a été étudiée in situ au cours du procédé de congélation et ex situ en fin de congélation à l’aide d’outils de caractérisation performants (FBRM, Microtomographie à rayons-X et Cryo-MEB).L’ensemble des études réalisées a permis une meilleure compréhension de l’influence des molécules stabilisantes sur la mise en place de la microstructure d’un sorbet et notamment sur la taille et le nombre des cristaux de glace et des bulles d’air. Seul l’HPMC influence significativement la quantité d’air incorporée d’une part, et le nombre et la taille des cristaux de glace d’autre part. Il semblerait que ce stabilisant, en augmentant la fraction d’air, diminue la croissance des cristaux de glace. Les bulles d’air agiraient comme des barrières physiques lors de la congélation. La viscosité des mixes ou solution résiduelles, et la diffusion de l’eau dans ces systèmes ne sont pas des facteurs qui contrôleraient la cristallisationA sorbet is a frozen and aerated dessert made from a mix of concentrated fruit juice, sugars and stabilizers. The most critical step in the manufacturing process of sorbets is the freezing-foaming step that takes place in a scraped surface heat exchanger (SSHE). During this step, ice crystals are generated and air bubbles are introduced while the unfrozen residual solution concentrates in sugars and stabilizers. The quality of the final product is strongly related to the quantity and size of ice crystals formed in the SSHE; they must be numerous and as small as possible. The scientific objective of this thesis is a better understanding of the influence of stabilizers on the microstructure (number and size of ice crystals and air bubbles) formed during the freezing process of a sorbet.The rheological properties of the sorbet mix before freezing and of the unfrozen residual solution were explored and quantified according to the stabilizer added (CMC, HPMC, or LBG). Studies of their surfactant properties and of the diffusion of water molecules were carried out and the thermal equilibrium properties of the mix were analyzed. The microstructure of sorbets was characterized in situ during the freezing process and ex situ at the end of freezing using high-performance characterization tools (FBRM, X-ray micro-computed tomography and Cryo-SEM).This study provides a better understanding of the influence of stabilizers on the establishment of the microstructure of a sorbet and in particular on the size and number of ice crystals and air bubbles. HPMC is the only stabilizer that influences the amount of air incorporated, and also the number and size of ice crystals. It appears that this stabilizer, by increasing the amount of air, decreases the growth of ice crystals. The air bubbles would act as physical barriers during freezing. The viscosities of the mix or the unfrozen residual solution, and water diffusion do not influence the crystallization in these systems
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Genin, Anne. « Identification et caractérisation de CASC5 chez des patients atteints de microcéphalie primaire ». Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2013. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/209461.
Texte intégralRésumé :
Un des aspects les plus marquants de l'évolution des grands singes est l'augmentation relative du volume du cerveau, et en particulier du néocortex, qui culmine chez Homo sapiens. La microcéphalie primaire est une anomalie congénitale du développement cérébral humain caractérisée par un cerveau normalement formé mais de petit volume. Il en existe une forme isolée, non syndromique, dont la majorité des cas sont d'origine génétique et transmis sur le mode autosomique récessif (MCPH), qui constituent donc un modèle génétiquement simple qui résulte de l'altération d'un seul gène, essentiel dans le développement volumique du cerveau. Une consanguinité parentale est présente dans la majorité des cas, ce qui permet une approche puissante de localisation génomique de la mutation responsable, nommée cartographie d'homozygotie. A ce jour, huit gènes causant cette anomalie ont déjà été identifiés :BRIT1 (MCPH1), ASPM (MCPH5), CDK5RAP2 (MCPH3) et CENPJ (MCPH6), et plus récemment, STIL (MCPH7), CEP152 (MCPH9), WDR62 (MCPH2) et CEP135 (MCPH8). Tous ces gènes jouent un rôle au niveau du cycle cellulaire. Nous avons tenté, au cours de ce doctorat, d’identifier et de caractériser un nouveau gène du locus MCPH4 cartographié au laboratoire et situé sur le bras long du chromosome 15. Dans trois familles MCPH4 originaires de villages voisins du Maroc rural, nous avons affiné la zone de liaison à un segment de 3,7cM, contenant un haplotype commun sur une longueur de 2,7cM suggérant un déséquilibre de liaison autour d’une mutation ancestrale. Le LOD score combiné dans les trois familles était supérieur à 6. Parmi les gènes contenus dans cette région, nous avons sélectionné des candidats que nous avons ensuite analysés par séquençage direct de l’ADN de nos patients. Parmi ces gènes, CASC5 présentait un variant, homozygote chez nos patients, hétérozygote chez leurs parents sains et absent chez 150 contrôles non apparentés. Nous avons utilisé la technologie 454 de séquençage à haut débit de Roche pour séquencer les gènes de l’intervalle de 2.7Mb en une fois. Parmi les mutations identifiées, nous n’avons trouvé qu’une seule variation exonique inconnue qui correspondait à la variation faux-sens déjà identifiée dans le gène CASC5. CASC5 est une protéine centromérique requise pour l’alignement des chromosomes à la métaphase et pour le point de contrôle métaphasique de la progression mitotique. Il était donc potentiellement un très bon candidat causal de la microcéphalie primaire. CASC5 lie directement MIS12, BUB1, BUBR1 et Zwint-1, et fait partie du réseau KMN du kinétochore. Il est nécessaire à l’ancrage des centromères chromosomiques au fuseau mitotique, et est requis pour le contrôle du cycle cellulaire au niveau du Spindle-Assembly Checkpoint.
Nous avons ensuite confirmé que la mutation génère un défaut d’épissage chez nos patients consistant en la perte partielle de l’exon 18 dans l’ARNm. La perte de cet exon conduit à un déphasage du cadre de lecture provoquant l’apparition d’un codon STOP prématuré dans l’exon 19. Ceci prédit donc la formation d’une protéine tronquée, ou absente après dégradation par le mécanisme cellulaire de dégradation des ARNm non-sens. Par Western-Blotting nous avons pu révéler, en lignée lymphoblastoïdes, la protéine CASC5 endogène chez tous nos patients, y compris, à notre surprise, chez les sujets atteints.
Il est décrit dans la littérature qu’un knockdown de CASC5 provoque un mauvais alignement des chromosomes, une entrée prématurée en mitose et la formation de micronoyaux, conséquence d’un mauvais alignement des chromosomes pendant la métaphase. Les différentes études menées sur le phénotype cellulaire de nos patients en lignées lymphoblastoïdes n’ont pu révéler ces défauts. Notre hypothèse est que l’allèle muté est hypomorphe et que le phénotype cellulaire décrit en boites de culture ne s’observerait in vivo que dans certaines cellules du cerveau en cours de développement.
En parallèle de ces travaux, nous avons également contribué à l’identification de la cause d’une microcéphalie primaire syndromique, associée à un diabète insulino-requérant précoce, tansmis sur le mode récessif autosomique et identifié dans une famille d’origine marocaine. Notre laboratoire avait localisé la mutation dans une région de 3 cM du chromosome 4. Parmi les 39 gènes compris dans cette région, nous en avons sélectionné et séquencé plusieurs. Aucun n’a cependant montré de mutation. Un séquençage de l'exome complet de l’un de nos patients, a permis de mettre en évidence une mutation non-sens homozygote dans un gène de l’intervalle critique de liaison. La mutation ségrège avec le phénotype autosomique récessif chez les malades, leurs parents et leurs germains asymptomatiques. L’abondance du transcrit de ce gène a été mesurée en lignées lymphoblastoïdes de patients :il est présent en quantité similaire chez les patients et chez un contrôle non apparenté.
En conclusion, notre travail a permis l’identification d’un nouveau gène muté chez des patients atteints de microcéphalie primaire, CASC5, avec un haut degré de preuve de causalité de cette mutation, impliquant ainsi une protéine du réseau KMN du kinétochore dans le développement volumique du cerveau humain. Nous avons par ailleurs contribué à l’identification d’un nouveau gène causant microcéphalie primaire et diabète juvénile, dont le mécanisme biologique est en cours d’investigation.
Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques
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Ammar, Mohamed Raafet. « Rôle de la phospholipase D1 dans le trafic membranaire : implication dans le développement neuronal et l'exocytose régulée ». Phd thesis, Université de Strasbourg, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00998047.
Texte intégralRésumé :
La croissance neuritique est un mécanisme complexe qui fait toujours l'objet d'intenses investigations. Les donnés actuelles ont permis de mettre en évidence l'implication de trois mécanismes principaux dans la croissance neuritique : i) la dynamique du cytosquelette, ii) le trafic intracellulaire et l'apport membranaire au niveau du cône de croissance et iii) la signalisation cellulaire, principalement via la voie MAPK-ERK1/2, qui abouti à la régulation de la transcription.La PLD1 et son produit l'acide phosphatidique semblent être au centre de voies majeures impliquées dans le développement neuronal. Mes travaux ont permis d'approfondir nos connaissances sur le rôle cellulaire de la PLD1 au cours de la croissance neuritique. J'ai montré que la PLD1 en collaboration avec la kinase RSK2 régule la fusion des vésicules positives pour Ti-VAMP/VAMP7 au cours de la croissance neuritique. D'autre part, j'ai établi que la PLD1 joue un rôle important dans le maintien de la signalisation endosomale de la voie MAPK-ERK1/2-RSK2-CREB induite par les neurotrophines. J'ai également montré que la PLD1 régule l'activation de mTOR/p70S6K en réponse au BDNF. La dérégulation des voies MAPK-ERK1/2 et mTOR/p70-S6K pourraient être à la base de la réduction de l'arborisation dendritique et de la maturation des épines dendritique observée dans les neurones corticaux Pld1-/- en culture. En plus de l'implication de RSK2 dans la régulation de la PLD1, j'ai également montré que la PLD1 régule l'activation de RSK2 en réponse aux neurotrophines, probablement via une boucle de rétrocontrôle. Ainsi les donnés obtenus suggèrent un lien fort entre les deux protéines au cours du développement neuronal. A la lumière de ces donnés, un dysfonctionnement de ce mécanisme pourrait expliquer le retard mental observé chez les patients atteints du syndrome de Coffin-Lowry causé par la perte de l'activité kinase de RSK2. D'autre part, les résultats obtenus suggerent un rôle de la PLD1 dans l'exocytose des vésicules.
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Qureshi, Abdul Wahid. « Les microvésicules splénocytaires effecteurs de la sénescence endothéliale : impact de l'âge et protection par apport nutritionnel d'une formule optimisée d'acides gras poly-insaturés eicosapentaénoïque et docosahexaénoïque, EPA/DHA 6/1 ». Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ077.
Texte intégralRésumé :
L’âge conduit à une senescence progressive des cellules endothéliales (ECs) favorisant une dysfonction endothéliale et vasculaire, souvent associée aux maladies cardiovasculaires. Nous avons étudié son impact sur l’émission de microvésicules (SMVs) par les leucocytes isolés de la rate de rats jeunes, d’âge moyen, ou vieux (J, MA,V) et caractérisé leurs propriétés pro-sénescentes sur des EC primaires d’artères coronaires porcines. Avec l’âge, le stress oxydant s’accumule dans la rate et l’émission de SMVs augmente. Seules les SMVs de MA et O induisent une sénescence des ECs prématurée avec une activité Senescence-Associated-β-galactosidase et un stress oxydant augmentés, la surexpression des marqueurs p53, p21, p16, un phénotype pro-inflammatoire et pro-arthérogène et une sous-expression de la eNOS. Un gavage de 7 jours avec des omega-3 EPA:DHA 6:1 mais pas EPA:DHA 1:1, réduit le stress oxydant splénique des MA et des O, et la vésiculation. EPA:DHA 6:1 abolit le caractère pro-sénescent des SMVs de MA, probablement via la réduction du stress oxydant et en prévenant l’activation du système angiotensine localAgeing is associated with progressive endothelial senescence favoring endothelial and vascular dysfunction, often associated with cardiovascular diseases. We investigated in young, middle-aged and old rats (Y, MA, O) the impact of ageing on the shedding of spleen-derived leukocytes microvesicles (SMVs) and measured their pro-senescent effects in porcine primary coronary artery endothelial cells (ECs). Oxidative stress accumulates in spleen tissue and SMVs shedding increases with age. SMVs from MA, O but not Y rats induced premature endothelial senescence, with increased Senescence-Associated-β-galactosidase activity and up-regulated p53, p21, p16. SMVs shifted ECs towards a pro-inflammatory and pro-atherothrombotic phenotype with increased endothelial oxidative stress and down-regulated eNOS. Short-term intake of omega-3 EPA:DHA 6:1 but not EPA:DHA 1:1 reduced age-related oxidative stress and SMVs shedding in MA and O spleen tissues, and abolished SMVs-induced premature endothelial senescence in MA, most probably by reducing oxidative stress and preventing the activation of the local angiotensin system
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Blandin, Anne-Florence. « Rôle de l'intégrine α5β1 dans la biologie du glioblastome et dans la résistance aux thérapies anti-EGFR ». Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAJ066/document.
Texte intégralRésumé :
Le glioblastome multiforme (GBM) est la tumeur cérébrale primaire la plus fréquente. Une dérégulation des voies de signalisation de l’EGFR et un fort potentiel invasif sont les caractéristiques principales du GBM. Malheureusement, les essais cliniques impliquant des thérapies anti-EGFR dans le traitement des GBM demeurent inefficaces. Nous avons précédemment montré que le récepteur de la fibronectine, l’intégrine α5β1, est associé avec un mauvais pronostic et une résistance des patients au temodal. Les intégrines peuvent coopérer avec les récepteurs aux facteurs de croissance et ainsi amplifier leur potentiel oncogénique. Ici, nous avons cherché à déterminer le rôle de l’intégrine α5 dans la résistance aux thérapies anti-EGFR. Utilisant la lignée U87 de GBM, on a dans un premier temps confirmé que l’activation de l’intégrine sous l’influence de la fibronectine, potentialisait la signalisation de l’EGFR. La perte d’expression d’α5 sensibilise les cellules U87 aux anti-EGFR (cetuximab, gefitinib) dans des essais de clonogénicité en soft agar. L’expression d’ α5 favorise la résistance aux 2 drogues lors de la migration cellulaire. Pour aller plus loin, nous avons développé un nouveau test basé sur la quantification de l’évasion cellulaire à partir d’une sphère tumorale. La perte d’ α5 augmente la sensibilité des cellules U87 à 2 TKI réversibles spécifiques de l’EGFR, gefitinib et erlotinib, mais n’a pas d’effet sur l’efficacité du lapatinib, un TKI irréversible ciblant EGFR, ErbB2, ErbB3 et ErbB4. Grâce à la microscopie confocale, nous avons montré l’effet important du gefitinib sur l’endocytose de l’intégrine et de l’EGFR. Ces résultats suggèrent que l’expression d’ α5 favorise la résistance aux TKI par l’activation des voies de signalisation des récepteurs ErbB ou en contrôlant le trafic membranaire de l’EGFR. On a aussi montré que pour favoriser l’adhésion cellulaire, l’intégrine α5 stimulait la fibrillogénèse. Dans les cellules migrant à distance de la sphère, l’intégrine α5 est strictement engagée dans des adhésions cellule-substrat contenant la protéine FAK activée. Nos résultats soulignent le rôle central du couple fibronectine/ intégrine α5 dans l’invasivité du GBM et la résistance aux thérapies anti-EGFRGlioblastoma multiforme (GBM) is the most common primary brain tumor. Alteration of the EGFR pathway and high invasive potential are hallmarks of GBM. Unfortunately, trials using anti-EGFR therapies for the treatment of GBM reveal limited efficacy. We previously showed that overexpression of the fibronectin receptor, α5β1 integrin, is associated with a poor prognosis for patients and is responsible for chemoresistance to temodal. Integrins can cross-talk with growth factor receptors and amplified their oncogenic activity. Here, we sought to determine the potential role of α5 integrin in resistance to anti-EGFR therapy. Using U87 GBM cell line, we first confirmed that fibronectin-mediated integrin activation potentiated EGFR signaling. Loss of α5 integrin expression sensitized U87 cells to anti-EGFR drugs (cetuximab, gefitinib) in soft agar clonogenic assay. α5 expression can trigger resistance to both drugs on cell migration. To go further, we developed a new assay based on the quantification of cell evasion from tumor spheroids. α5 depletion increased U87 cell sensitivity to gefitinib and erlotinib, 2 EGFR-selective reversible TKI, but had not effect on lapatinib efficacy, an irreversible TKI that target EGFR, ErbB2, ErbB3 and ErbB4. Confocal microscopy revealed a strong impact of gefitinib on EGFR and integrin endocytosis. These results suggested that α5 expression may trigger resistance to TKI either by activating ErbB pathways or by controlling EGFR membrane trafficking. We also showed that to promote cell adhesion, α5 integrin stimulated fibronectin fibrillogenesis. As cells moved away from the spheroids, α5 became strictly engaged in cell-substratum adhesion sites where it recruited activated FAK. Our work highlights the pivotal role of fibronectin/α5β1 integrin in invasivity of GBM and resistance to anti-EGFR drugs
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Obara, Tiphaine. « Modélisation de l’hétérogénéité tumorale par processus de branchement : cas du glioblastome ». Thesis, Université de Lorraine, 2016. http://www.theses.fr/2016LORR0186/document.
Texte intégralRésumé :
Grâce aux progrès de la recherche, on sait aujourd’hui guérir près d’un cancer sur deux. Cependant, certaines tumeurs, telles que les glioblastomes restent parmi les plus agressives et les plus difficiles à traiter. La cause de cette résistance aux traitements pourrait provenir d’une sous-population de cellules ayant des caractéristiques communes aux cellules souches que l’on appelle cellules souches cancéreuses. De nombreux modèles mathématiques et numériques de croissance tumorale existent déjà mais peu tiennent compte de l’hétérogénéité intra-tumorale, qui est aujourd’hui un véritable challenge. Cette thèse s’intéresse à la dynamique des différentes sous-populations cellulaires d’un glioblastome. Elle consiste en l’élaboration d’un modèle mathématique de croissance tumorale reposant sur un processus de branchement de Bellman-Harris, à la fois multi-type et dépendant de l’âge. Ce modèle permet d’intégrer l’hétérogénéité cellulaire. Des simulations numériques reproduisent l’évolution des différents types de cellules et permettent de tester l’action de différents schémas thérapeutiques sur le développement tumoral. Une méthode d’estimation des paramètres du modèle numérique fondée sur le pseudo-maximum de vraisemblance a été adaptée. Cette approche est une alternative au maximum de vraisemblance dans le cas où la distribution de l’échantillon est inconnue. Enfin, nous présentons les expérimentations biologiques qui ont été mises en place dans le but de valider le modèle numériqueThe latest advances in cancer research are paving the way to better treatments. However, some tumors such as glioblastomas remain among the most aggressive and difficult to treat. The cause of this resistance could be due to a sub-population of cells with characteristics common to stem cells. Many mathematical and numerical models on tumor growth already exist but few take into account the tumor heterogeneity. It is now a real challenge. This thesis focuses on the dynamics of different cell subpopulations in glioblastoma. It involves the development of a mathematical model of tumor growth based on a multitype, age-dependent branching process. This model allows to integrate cellular heterogeneity. Numerical simulations reproduce the evolution of different types of cells and simulate the action of several therapeutic strategies. A method of parameters estimation based on the pseudo-maximum likelihood has been developed. This approach is an alternative to the maximum likelihood in the case where the sample distribution is unknown. Finally, we present the biological experiments that have been implemented in order to validate the numerical model
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Bedon, Frank. « Structure génique et caractérisation fonctionnelle de facteurs de transcription MYB-R2R3 impliqués dans la formation du xylème chez les conifères ». Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24997/24997.pdf.
Texte intégral
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Feral-Martin, Cédric. « Influence de la morphologie d’oxydes à base de cérium sur les relations (micro)structures/propriétés ». Thesis, Bordeaux 1, 2010. http://www.theses.fr/2010BOR14076/document.
Texte intégralRésumé :
Les oxydes à base de Cérium, ont fait l’objet de nombreuses études ces dernières décennies et se sont révélés des matériaux de choix, dans le domaine de la catalyse hétérogène. L’objectif à l’heure actuelle, est donc d’accroître la réactivité de ces oxydes, tout en élargissant leur gamme de températures optimales d’utilisation. Dans ce contexte particulier, il semble possible de moduler les propriétés des oxydes à base de cérium en contrôlant la morphologie des cristallites. Ce travail de thèse a donc été consacré à la détermination, l’élaboration et à la caractérisation de matériaux oxydes à base de cérium de morphologies contrôlées. Nous avons tout d’abord déterminé cristallographiquement et thermodynamiquement les morphologies accessibles au système étudié puis par traitement hydrothermale assistée par chauffage micro-ondes nous avons synthétisé les dites morphologies. Après caractérisation de la réactivité par ATG et thermographie Infrarouge nous avons optimisé ces matériaux par un dopage extrinsèque tout d’abord (dépôt de métaux précieux), puis par un dopage intrinsèque ensuite (Yttrium et Fer). Enfin, l’obtention de morphologies non accessibles cristallographiquement nous a amené à approfondir le(s) processus de germination croissance de ces particules et la forte réactivité des matériaux dopés fer nous a poussé à une caractérisation fine de la microstructure de ces matériaux. Au final nous avons pu corréler l’influence de la morphologie des cristallites sur la réactivité propre de l’ensemble des familles de matériaux étudiésRecent decades, numerous studies on cerium-based oxides have been realized and have revealed that cerium-based oxides were materials of choice in the field of heterogeneous catalysis. The aim now is therefore to increase the reactivity of these oxides, while expanding their range of optimal temperatures of Use. In this particular context, it seems possible to modulate the properties of cerium-based oxides by controlling the morphology of the crystallites. This thesis has been devoted to the identification, development and characterization of materials based on cerium oxides of controlled morphology. We first determined possible morphologies for the studied system, by hydrothermal synthesis by micro-wave assisted heating we have synthesized these morphologies and we characterized reactivity of these materials by infrared thermography and TGA. We have optimized these materials first, by extrinsic doping (deposition of precious metals) and then by intrinsic doping (Yttrium and Iron). New morphologies have been synthesized so we have studied the processes of nucleation-growth set in. The high reactivity of iron-doped materials has led us to a detailed characterization of the microstructure of these materials. Finally correlation reactivity/morphologies of crystallites have been achieved
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Semenchenko, Kostyantyn. « Development of tumour therapies : from target validation of TTLL12 to tests of a small molecule XRP44X in pre-clinical models of cancer ». Thesis, Strasbourg, 2014. http://www.theses.fr/2014STRAJ107.
Texte intégralRésumé :
Les modifications post-traductionnelles de la tubuline sont des cibles attrayantes pour la thérapie du cancer. TTLL12 est impliqué dans la détyrosination de la tubuline, la triméthylation de l’histone H4K20 et le cancer de la prostate. La thèse porte sur les effets de la surexpression de TTLL12 sur ces modifications à différents stades du cycle cellulaire et sur la sensibilité à des agents ciblant les microtubules. Les résultats montrent que TTLL12 affecte ces modifications indépendant du cycle cellulaire et réduit la sensibilité des cellules à paclitaxel. XRP44X est un nouvel inhibiteur de la signalisation Ras-ERK-Elk3. Ses propriétés antitumorigène ont été montré in vitro et dans certaines études in vivo. Le projet de thèse était une continuation des études pré-cliniques sur XRP44X dans des modèles de cancer de la prostate de souris. Les résultats montrent que XRP44X est un inhibiteur efficace de la tumorigenèse et des métastases, ce qui peut être dû à son effet sur Elk3Tubulin posttranslational modifications are an attractive target for cancer therapy. TTLL12 isinvolved in tubulin detyrosination, histone H4K20 trimethylation and prostate cancer. The thesis addresses the effects of TTLL12 overexpression on these tubulin and histone modifications at different stages of the cell cycle and on sensitivity to microtubule-targeting agents. The results show that TTLL12 over expression affects tubulin detyrosination and H4K20 trimethylation independently of cell cycle phase and reduces cell sensitivity totaxanes.XRP44X is a novel inhibitor of Ras-ERK1/2-Elk3 signalling and tubulin-binding agent. Itsantitumorigenic properties had been shown in vitro and in initial in vivo studies. The thesis project was a continuation of pre-clinical studies on XRP44X in mouse prostate cancer models. The results show that XRP44X is an effective inhibitor of tumorigenesis and metastasis in prostate cancer, which may be due to its effect on Elk3
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Roignant, Jeanne. « Biologie de développement du bois en réponse à des sollicitations mécaniques environnementales ». Thesis, Université Clermont Auvergne (2017-2020), 2018. http://www.theses.fr/2018CLFAC032/document.
Texte intégralRésumé :
Les arbres ont la capacité de percevoir des sollicitations mécaniques quotidiennes dues au vent et d’acclimater leur croissance et leur développement en conséquence. Ce stress mécanique se traduit essentiellement par des flexions des organes, en particulier des branches et de la tige. Des études antérieures ont montré que la croissance en diamètre du peuplier était stimulée en réponse aux flexions mimant l’effet du vent. Cette augmentation de la croissance s’accompagne d’une modification de la nature du bois mis en place, qui a pu être observé chez quelques conifères et angiospermes, et nommé « bois de flexion ». Mais la caractérisation anatomique de ce bois a été peu approfondie, et les acteurs moléculaires de sa formation n’ont jamais été recherchés. De plus, dans la plupart de ces études les sollicitations mécaniques appliquées à la tige sont des flexions multidirectionnelles et d’intensité non contrôlée. Or, la déformation étant la variable physique perçue par la plante, il est nécessaire de contrôler l’amplitude de la flexion appliquée à la tige. Grâce à un dispositif expérimental original, nous avons appliqué des flexions unidirectionnelles sur de jeunes tiges de peupliers tout en contrôlant l’intensité des déformations appliquées. Cette étude a montré que la perception des déformations s’effectuait à une échelle locale, conduisant à une ovalisation de la tige. Nous avons pu également différencier le bois formé sous des déformations en tension, que nous avons nommé Tensile Flexure Wood, du bois formé sous des déformations en compression, que nous avons nommé Compressive Flexure Wood. Les analyses anatomiques et moléculaires montrent que l’intensité des déformations en valeur absolue ne suffit pas à expliquer toutes les réponses et que le signe (tension ou compression) de ces déformations joue également un rôle. Chez des arbres stimulés par des flexions unidirectionnelles plus fréquentes, la croissance et la différenciation cellulaire sont modulés encore différemment, notamment dans la zone en compression, apportant à la tige un bénéfice adaptatif face aux sollicitations suivantes. Le gène CLE12.2 appartenant à la famille des gènes CLAVATA, gènes impliqués dans les régulations méristématiques, a été montré mécanosensible. Une approche de génomique fonctionnelle du gène CLE12.2 par l’utilisation de plants transgéniques présentant une sous- ou une surexpression du gène nous a permis d’émettre l’hypothèse d’une implication du peptide CLE12.2 dans la régulation des voies de biosynthèse de la paroi cellulaire. Cette étude a permis de mettre en avant la complexité des mécanismes moléculaires impliqués dans la formation du bois et apporte de nouvelles connaissances pour la poursuite des études sur l’acclimatation des arbres au ventTrees have the ability to perceive daily mechanical stresses related to wind and to acclimate their growth and development accordingly. Wind essentially results in organs bending, in particular in branches and stem. Previous studies have shown that growth diameter of poplar stem increased in response to bending; mimicking wind mechanical effect. This growth increment goes along with a change in the structure of the wood formed under bending stimulation. This type of reaction wood has been described for some conifers and angiosperms species, and was called "flexure wood". Until now, its anatomical characteristics have been poorly described, and the molecular actors of its formation have never been investigated. In addition, in most of these previous studies the mechanical stresses applied to the stem were bidirectional bendings with an uncontrolled intensity. Because mechanical strains constitute the physical variable perceived by the plant, it appeared necessary to carefully control the bending amplitude applied to the stem. Thanks to an original experimental setup, we applied unidirectional bendings on young poplar stems, while controlling its intensity. This study showed that the strains are perceived at a local scale and that the secondary growth response was also local, leading to stem ovalization. We also distinguished the wood formed under tension we named “Tensile Flexure Wood” from the wood formed under compression we named “Compressive Flexure Wood”. The anatomical and molecular analyzes show that the strain intensity in absolute value is not enough to explain all the answers and that the sign (tension or compression) of these strains also plays a role. In trees stimulated by more frequent unidirectional bendings, growth and cell differentiation are modulated even differently, especially in the area under compression, bringing to the stem an adaptive benefit to the following solicitations. The CLE12.2 gene, which belongs to the CLAVATA gene family involved in meristematic regulation, has been shown to be mechanosensitive. Functional analysis of the CLE12.2 gene in transgenic plants with under- or overexpression of the gene allowed us to hypothesize that the CLE12.2 peptide is involved in the regulation of the cell-wall biosynthesis pathways. This work highlighted the complexity of the molecular mechanisms involved in wood formation and brings new knowledge for further studies on trees acclimation to wind