Littérature scientifique sur le sujet « Métabolites spécialisées »

À l'origine, nombre de «métiers » prenant en charge les jeunes enfants mobilisent ce que nous appellerons des qualités féminines ou maternelles : toute femme n’est-elle pas potentiellement toujours mère ? En s’appuyant sur un certain nombre de travaux historiques, notre travail cherche à déterminer la manière dont ces qualités sont utilisées, mais aussi métabolisées, tant par ce que Foucault appelle des formations de pouvoir et de savoir, que par les pratiques des personnels dans la crèche. Elles se transforment, au cours de ce processus en compétences féminines. C’est ce mouvement que nous avons appelé « processus de professionnalisation » que nous distinguons clairement de la définition anglo-saxonne traditionnelle de la profession. Les femmes qui travaillent dans les crèches tendent en effet, par ce « processus de professionnalisation » d’une part, à développer des savoirs propres et d’autre part, à expérimenter des régimes de pratiques qui peuvent, si leurs partenaires des savoirs spécialisés y consentent, donner lieu, à la place des habituelles imposition et aliénation. à ce que nous avons appelé une coproduction.

Résumé. La fatigue chronique est un symptôme peu spécifique, fréquent en consultation ambulatoire de l’adulte. Une fatigue physique persistante, d’étiologie indéterminée après élimination des causes courantes, doit faire évoquer des maladies rares telles que les erreurs innées du métabolisme (EIM). La principale caractéristique de la fatigue chronique dans les EIM est son caractère dynamique, aggravée par les situations entrainant une augmentation du métabolisme telles que l’effort physique, le froid, le jeûne ou un stress biologique. Devant de tels indices cliniques, il est important d’entreprendre une démarche diagnostique orientée permettant d’identifier les patients susceptibles d’avoir une EIM afin de les orienter vers un centre spécialisé. Les EIM entrainant une fatigue chronique sont les myopathies métaboliques, notamment les glycogénoses musculaires, les troubles de la béta-oxydation des acides gras et les maladies mitochondriales. Des analyses biochimiques et/ou moléculaires spécifiques permettent de poser le diagnostic et de mettre en place une prise en charge pluridisciplinaire.

Résumé. L’obésité est une maladie psychosomatique chronique et complexe d’origine multifactorielle souvent associée à comorbidités cardiovasculaires, métaboliques, respiratoires, orthopédiques et psychologiques. Ce contexte de polimorbidité nécessite d’un suivi à vie et d’une prise en charge multidisciplinaire spécialisé. De plus le caractère silencieux de ces maladies, associé au vieillissement de la population et l’augmentation de l’espérance de vie, augmente encore plus l’impact de la maladie chronique sur la globalité de la morbidité et de la mortalité. En Suisse l’obésité a désormais un caractère épidémique, comme dans le monde entier, et concerne environ le 11 % de notre population. Ce pourcentage augmente progressivement au point que l’obésité est considérée comme un problème de santé publique. En effet les coûts directs et indirects imputés à l’obésité correspondent à environ 8 % des dépenses totales de la santé. La prise en charge de cette maladie complexe doit être toujours à long terme et doit intégrer les aspects diététiques, comportementaux et psychologiques en fonction du profil du patient.

Le muscle, tissu d’importance économique majeure chez les animaux producteurs de viande, est un tissu composite comprenant en majeure partie des fibres musculaires qui constituent une population très hétérogène aux caractéristiques contractiles et métaboliques variées. Les relations entre type contractile des fibres et fonctionnement mitochondrial, un composant essentiel du métabolisme énergétique musculaire, restent mal connues. Leur compréhension est pourtant essentielle pour espérer mieux maîtriser l’impact du type de fibres sur les diverses composantes de la qualité de la viande. Une analyse fine de la composante mitochondriale du fonctionnement énergétique des fi-bres a donc été entreprise en relation avec leurs caractéristiques contractiles. Les résultats indiquent que, contrairement aux fibres rapides de types IIX et IIB, la régulation mitochondriale dans les fibres lentes de type I et, dans une moindre mesure, de type rapide IIA est hautement spécialisée avec une optimisation de l’efficacité des mitochondries (couplage entre oxydation et phosphorylation, capacité oxydative maximale), une restriction de leur perméabilité à l’ADP et un couplage fonctionnel entre les kinases mitochondriales et la production d’ATP, permettant un transfert efficace de l’énergie vers les myosines. De plus, la régulation mitochondriale et les transferts énergétiques sont modulés par l’activation calcium-dépendante des ATPases portées par les myosines.

Le système nerveux est formé de deux types de cellules: les cellules gliales et les neurones. Les astrocytes, comme la plupart des cellules gliales, ont longtemps été considérés essentiellement pour leur rôle de support et d’entretien du tissu nerveux. Mais, de plus en plus d’évidences plaident en faveur d’une implication beaucoup plus importante des astrocytes dans la communication nerveuse. Les astrocytes sont couplés les uns aux autres par des ‘gap-jonctions’ à travers lesquels peuvent circuler divers métabolites. C’est par ces jonctions que les astrocytes évacuent vers les capillaires, le potassium extracellulaire excédentaire généré par une intense activité neuronale. A travers ce réseau d’actrocytes se propagerait par exemple, des vagues d’ions calcium dont l’effet régulateur pourrait se faire sentir dans un grand nombre de synapses en même temps. Les prolongements astrocytaires qui entourent les synapses pourraient ainsi exercer un contrôle plus global sur la concentration ionique et le volume aqueux dans les fentes synaptiques. Le réseau astrocytaire constituerait donc un système de transmission non-synaptique qui se superposerait au système neuronal pour jouer un rôle majeur de modulation des activités neuronales. A cet effet, et dans l’espoir d’éclairer les neurochirurgiens et les spécialistes qui s’intéressent aux transplantations et à une meilleure maîtrise du transport et fonctionnement de l’influx nerveux. Le présent travail apporte une approche entre le transport et les propriétés électroniques d’une jonction miniature, une ‘microjonction’, dont la nanotechnologie ne saurait se passer, l’usage de jonctions P-N, un semi-conducteur dopé P (ions positifs) et un dopé N (ions négatifs), est très utilisé pour tous les dispositifs de type diode car ne laissant passer le courant que dans un sens, ce genre de jonction fait aussi apparaître des propriétés optiques intéressantes.

Introduction : Chez l’enfant, le syndrome d’apnées obstructives du sommeil (SAOS) constitue un trouble du sommeil fréquent dont la prévalence est d’environ 3 % entre trois et huit ans. Matériels et méthodes : Son origine est multifactorielle (hypertrophie de tissus mous pharyngés, étroitesse des voies aérifères osseuses, atteinte du tonus neuromusculaire). Les symptômes et les signes cliniques diurnes et nocturnes à rechercher sont directement en rapport avec l’obstruction des voies aérifères supérieures (VAS) ou avec la mauvaise qualité de sommeil. Après une évaluation anamnestique et clinique complètes, incluant une nasofibroscopie, le spécialiste ORL s’orientera vers une adéno-amygdalectomie ou vers un enregistrement nocturne par polysomnographie ou polygraphie pour confirmer le diagnostic chez l’enfant. Chez l’adolescent, la prévalence du SAOS serait entre 0,5 et 6 %. Les facteurs de risque principaux sont l’obésité, le sexe masculin et les antécédents d’amygdalo-adénoïdectomie. Outre les symptômes classiques du SAOS de l’enfant, ce syndrome peut, chez l’adolescent, se manifester par une sémiologie trompeuse à type de dyssomnie, somnolence diurne excessive et/ou troubles de l’humeur. Les diagnostics différentiels à type de conduites à risque, retard de phase ou narcolepsie doivent être systématiquement évoqués. L’enregistrement de la respiration pendant le sommeil s’impose. Même si l’index d’apnées/hypopnées obstructives est faible, il doit être considéré. Conclusion : Chez l’enfant comme chez l’adolescent, la prise en charge multidisciplinaire (ORL, orthodontiste, kinésithérapeute maxillo-facial, pneumologue) doit être précoce afin d’éviter les complications neurocognitives, comportementales, cardiovasculaires et métaboliques. Une chirurgie maxillo-faciale pourra être discutée à partir de l’âge de 15 ans. Il ne faudra pas oublier de veiller aux règles d’hygiène de vie et de sommeil ainsi qu’à la prise en charge de l’obésité.

Le métabolisme spécialisé joue un rôle essentiel dans les interactions plante-environnement. Sa caractérisation chez les plantes cultivées représente un enjeu scientifique important. Au cours de ma thèse, j’ai travaillé à la caractérisation du métabolisme spécialisé et de ses déterminants génétiques chez Brassica napus, et j’ai étudié sa régulation en réponse à l’infection par Leptosphaeria maculans, agent causal du phoma. J’ai contribué au développement d’une méthode de profilage métabolique ciblé et identifié 36 glucosinolates (GLSs) foliaires/racinaires, 32 composés phénoliques (PHLs) foliaires et 18 composés racinaires non documentés jusqu'à présent. La quantification des ces SMs dans 304 accessions de Brassica a permis de révéler des contrastesphytochimiques importants au sein du panel. L’analyse GWAS de ces variations phytochimiques a identifié 104 locus (QTLs). L’architecture génétique ainsi mise en évidence suggère un controle indépendant des sous-catégories de GLSs, PHLs et des nouveaux composés racinaires. Ces travaux fournissent une ressource utile pour l'écologie chimique et la sélection des Brassicas. En utilisant la même méthode de profilage ciblé, nous avons montré une induction des GLSs indoliques 14 jours après inoculation de la tige de B. napus par L. maculans. L'imagerie par spectrométrie de masse de la section transversale de tige de colza infectée a permis de révéler une spatialisation des réponses métaboliques suite à l’infection par L. maculans
Specialized metabolism plays an essential role in plant-environment interactions. Its characterization in cultivated plants represents a significant scientific challenge. During my thesis, I worked on the characterization of the specialized metabolism and its genetic determinants in Brassica napus (oilseed rape), and I studied its regulation in response to infection by Leptosphaeria maculans (causal agent of phoma). I contributed to developing a targeted metabolic profiling method and identified 36 foliar/root glucosinolates (GLSs), 32 foliar phenolic compounds (PHLs), and 18 previously undocumented root compounds. The quantification of these SMs in 304 Brassicaaccessions revealed important phytochemical contrasts within the panel. GWA analysis of these phytochemical variations identified 104 loci (QTLs). The genetic architecture thus highlighted an independent control of the subcategories of GLSs, PHLs, and new root compounds. This work provides a useful resource for Brassica chemical ecology and breeding. Using the same targeted profiling method, we showed induction of indole GLSs 14 days after inoculation of the B. napus stems with L. maculans. Mass spectrometric imaging of the cross-section of infected rapeseed stem revealed the spatialization of metabolic responses to L. maculans infection

Depuis une cinquantaine d’années, de nombreuses études ont décrit les spongiaires comme de formidables ressources de produits naturels originaux. Ces découvertes ont attisé la curiosité de nombreux scientifiques issus de domaines variés (chimie, biochimie, biologie moléculaire) qui mettent leurs connaissances en commun afin de comprendre le fonctionnement de ces animaux si particuliers. Les travaux envisagés dans ce manuscrit portent sur les éponges du genre Haliclona issu de l’ordre des Haplosclérides. En effet, ce groupe taxonomique révèle des familles de molécules très particulières, notamment les alcaloïdes 3-AP et les polyacétylènes, qui présentent un potentiel pharmacologique à exploiter. En outre la diversité chimique retrouvée au sein de ce genre remet en question la validité de la classification actuelle des Haplosclérides déjà discutée par les données de biologie moléculaire. L’intérêt particulier porté à ces composés originaux concerne également les voies métaboliques permettant d’aboutir à leur biosynthèse. Ainsi les alcaloïdes 3-AP ne trouvant aucun équivalent notamment dans le monde terrestre, la description de leur voie de biosynthèse n’a alors été envisagée que sous forme d’hypothèses. Afin d’éclaircir les différentes problématiques posées par ce groupe de spongiaires, les études menées pendant ce doctorat ont fait appel à des méthodes et techniques variées tels que les méthodes d’extraction et d’analyses de la chimie des produits naturels classique, l’outil récent qu’est la métabolomique ou encore les expériences de « feeding » et l’utilisation de composés radio-marqués
Since about fifty years, several studies described sponges as astounding resources of original natural products. These discoveries aroused scientist’s curiosity in various areas (chemistry, biochemistry, molecular biology) and to understand these animal’s functioning, they share their knowledge. The proposed work in this manuscript, focus on sponges of genus Haliclona from the order Haplosclerida. Indeed, this taxonomic group reveal peculiar chemical families, including 3-AP alkaloids and polyacetylenic compounds, displaying pharmacological potential to be exploited. Besides, chemicalDépôt de thèseDonnées complémentairesdiversity encountered in this genus challenge the actual classification of Haplosclerida group already disputed by biomolecular data. The particular interest in these original compounds also concerns metabolic pathways leading to their biosynthesis. In this way, 3-AP alkaloids, which don’t have any equivalent particularly in terrestrial area, the description of their biosynthesis pathway was only considered by hypothesis. To resolve various problematics proposed by this sponges’ group, studies conducted through this PhD appeal to several methods and technics like usual natural products chemistry extraction and analytical technics, recent tool named metabolomic or feeding experiments with radiolabelled compounds

Dans cette étude, le palmier Astrocaryum sciophilum a été choisi comme modèle pour l'étude de ses endophytes foliaires. Du fait de sa longévité, nous avons cherché à mettre en évidence une communauté compétitive d’endophytes en fonction de l’âge de ses feuilles. Afin d’évaluer si les métabolites produits par ces endophytes pourraient être utilisés en santé humaine, les extraits de chaque endophyte ont été testés contre Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM) ainsi que pour leur activité quorum quenching (QQ). En parallèle, afin d’identifier un rôle écologique de protection de la plante par ces endophytes, des co-cultures ont été réalisées avec le phytopathogène Fusarium oxysporum. Plusieurs extraits de souches ont été sélectionnés afin d’isoler et d’identifier le ou les métabolites responsables des activités biologiques observées. Différents outils analytiques ont permis de guider le processus d’isolement (LC-MS/MS, réseaux moléculaires et imagerie par spectrométrie de masse). L’étude de la communauté d’endophytes isolée des feuilles âgées n’a pas mis en évidence un arsenal chimique plus compétitif. Toutefois, deux souches bactériennes du genre Luteibacter sp. ont montré un extrait actif sur SARM et de nombreux extraits de bactéries présentent une activité QQ. Par la suite, le métabolome secondaire du genre Colletotrichum a été étudié à l’aide des réseaux moléculaires et un champignon de la famille des Xylariaceae a été étudié pour son activité contre F. oxysporum. Dans le cadre de cette thèse, sept souches endophytes ont été étudiées chimiquement permettant l’isolement et l’identification de 42 molécules dont dix sont nouvelles
The palm Astrocaryum sciophilum is the host plant model chosen in this work. Indeed, due to the longevity of its leaves, we expected to highlight a competitive community of endophytes within the oldest leaves. Thus, 197 endophytes have been isolated and identified from different leaves of six palm specimens. In order to evaluate whether the compounds produced by these microorganisms could be used for the treatment of human disease, the ethyl acetate extracts of each endophyte were tested against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) as well as for a quorum quenching (QQ) activity. Simultaneously, co-culture were carried with the fungi Fusarium oxysporum in order to highlight endophytes providing plant protection against phytopathogens. We selected extracts in order to isolate and identify the bioactive metabolites. Various analytical tools have been used to improve the isolation process (LC-MS/MS, molecular networking or MS imaging).The study of the endophytic community isolated from older leaves did not show a more competitive chemical arsenal. However, two Luteibacter strains exhibited an ethyl acetate extract active against MRSA and several bacteria provide quorum quenching extracts. The metabolome of Colletotrichum genus was studied using molecular networking and a fungus from the Xylariaceae family was studied for its capacity to inhibit F. oxysporum’s growth. In our study, seven endophyte strains were chemically investigated leading to the isolation and identification of 42 molecules whose ten are new

Ces travaux de thèse portent sur l’étude chimique d’espèces marines échantillonnées en Méditerranée. Dans le cadre du projet VALBIM, co-financé par la région PACA et en étroite collaboration avec la société BioPreserv à Grasse mais également avec la Mycoteca Universitatis Taurinensis (MUT) de l’Université de Turin, nous avons isolé et caractérisé 21 molécules dont 14 se sont avérées nouvelles. L’étude de l’algue Caulerpa taxifolia a conduit à la caulerpényne et à quatre nouveaux dérivés de l’acide pyruvique sulfatés. Les travaux sur l’ascidie Polysyncraton sp. ont conduit aux bolascidines A-D, quatre nouveaux métabolites de type bolaamphiphiles dont il n’existe pas à notre connaissance d’équivalent naturel ou synthétique. La première étude chimique de l’éponge Hexadella racovitzai a conduit à deux dérivés de la bromotyrosine, la psammapline A et une nouvelle molécule, la 4-Osulfatocyclobispsammapline A. Par ailleurs, trois nouvelles crambescines C1, conjointement avec une crambescine A2 déjà répertoriée, ont été isolées de Crambe crambe. L’étude du champignon marin Stachybotrys chartarum, isolé de l’éponge Aplysina cavernicola, a conduit à la satratoxine H et à deux nouveau dérivé, la 2,3-dihydrosatratoxine H et l’épi-chartarutine G, ainsi qu’à trois dérivés stachybotrylactame déjà répertoriés dans la bibliographie. Les différents métabolites ont été évalués pour leurs propriétés antibactériennes et cytotoxiques. Ces travaux ont bénéficié de nouvelles approches analytiques (calculs des spectres de dichroïsme circulaire électroniques par TDDFT, réseaux moléculaires) permettant de renforcer l’intérêt des études liées à l’écologie chimique et à la recherche de nouvelles molécules bioactives potentiellement valorisables dans différents domaines
This PhD work focuses on the chemical study of marine species sampled in the Mediterranean Sea. As part of the VALBIM project, cofinanced by the region PACA and in close collaboration with the SME BioPreserv in Grasse but also with the Mycoteca Universitatis Taurinensis (MUT) of the University of Turin, we have isolated and characterized 21 molecules in total.14 of them were never reported before. The study of the seaweed Caulerpa taxifolia led to caulerpenyne and four new sulphated pyruvic acid derivatives. The work on the ascidian Polysyncraton sp. led to bolascidins A-D, four new metabolites which belong to the bolaamphiphile family, which, to the best of our knowledge, have no natural or synthetic equivalent. The first chemical study of the sponge Hexadella racovitzai led to two bromotyrosine derivatives, psammapline A and a new molecule, 4-O-sulfatocyclobispsammapline A. In addition, three new C1 crambescins, together with one crambescine A2 already reported, have been isolated from Crambe crambe. For all isolated marine invertebrate metabolites, the producer(s) remain(s) to be explored. The study of the marine fungus Stachybotrys chartarum, isolated from the sponge Aplysina cavernicola, led to satratoxin H and three stachybotrylactam derivatives already reported in the literature, and to 2,3-dihydrosatratoxin H and epi-chartarutine G, two new natural products. The different metabolites were evaluated for their antibacterial and cytotoxic properties. This work benefited from new analytical approaches (calculations of electronic circular dichroïsm spectra by TDDFT, molecular networking) and reinforced the interest of studies related to chemical ecology and search for new bioactive molecules to be valorized in different areas