Thèses : « Isolats de terrain »

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Siau, Anthony. « Biopuces à ADN pan-génomique de Plasmodium falciparum : mise au point d'une technique de marquage par radio-isotope adaptée aux petits échantillons biologiques et application à l'étude de la pathogénocité du parasite ». Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066092.

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L’exploration de l’ensemble du transcriptome de P. Falciparum est désormais accessible grâce à la technique des biopuces à ADN sur lame de verre (microarray). Mais cette technologie puissante reste cependant limitée à l’étude d’échantillons biologiques dont les quantités d’ARN totaux sont importantes. Bien que de nombreuses méthodes aient été développées afin d’adapter ces techniques aux faibles quantités d’ARN total, nous avons choisi d��utiliser une approche par biopuce à ADN hybridé à des sondes marquées avec des radio-isotopes, réputée très sensible. En comparant le transcriptome d’isolats de terrain de P. Falciparum susceptibles d’induire ou non in vitro l’apoptose des cellules endothéliales, nous avons pu identifier des gènes préférentiellement surexprimés dans les isolats apoptogènes. Par ailleurs, la technologie des biopuces radioactives a été aussi utilisée pour étudier les premières phases du développement des sporozoïtes de P. Falciparum dans son hôte. Nous avons ainsi pu identifier de nombreux gènes potentiellement impliqués dans l’infection hépatique.

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Bastos, Francisco Albuquerque. « OTIMIZAÇÃO DO PROCESSO DE PRODUÇÃO DE TIQUIRA EMPREGANDO ENZIMAS COMERCIAIS E FUNGOS ISOLADOS A PARTIR DOS BEIJUS UTILIZADOS NO MÉTODO TRADICIONAL ». Universidade Federal do Maranhão, 2013. http://tedebc.ufma.br:8080/jspui/handle/tede/955.

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Made available in DSpace on 2016-08-19T12:56:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao Francisco.pdf: 2147558 bytes, checksum: b0b562717d876cfad47f45868c73ab80 (MD5) Previous issue date: 2013-12-20
Tiquira, a strong content beverage from Maranhão ( Brazil ), obtained from cassava (Manihot esculenta Crantz.) has its production concentrated in several counties of the State, through a handmade process , rather primitive, in which the conversion of starch cassava is taken into fermentable sugars by fungi which is found on the native beijus of manioc where strains are picked at random. Alcoholic fermentation is also made by yeasts found in the environment. Its commercialization is practiced informally, making it difficult to record statistical data of production and the number of producers in the Ministry of Agriculture. In order to optimize this process, commercial enzymes, strains of fungi (Aspergillus niger), were used to in order to convert starch into fermentable wort and pressed yeasts for fermentation. The processes proposed here follow three steps: gelation of starch scarification and subsequent dextrinization the sugars, alcoholic fermentation and distillation of fermented wine. Substituting the mold for commercial enzymes in the proposed circumstances, the manufacturing of tiquira was performed in just 25 hours, whereas when using fungi isolated, the production of tiquira took approximately 136 hours for its processing. As one can see, there was a considerable reduction of time in the two cases presented here in relation to the traditional process, which takes approximately 20 days to achieve the distillate. It was also found that the fermentation and destillation of the wort resulting from the scarification of cassava is equivalent to that of cane sugar, and both processes can be processed with the same equipment by tiquira producers. It was shown that the concentrations of copper and ethyl carbamate were visibly reduced in comparison to the traditional process, enabling a better quality of the beverage, as well as reducing the risks to consumer health. From the experiments it can be concluded that the replacement of the traditional process by commercial enzymes, fungi isolated and pressed yeast are highly and technically recommended primarily to small producers.
A tiquira é uma bebida típica do Maranhão (Brasil), obtida a partir de mandioca (Manihot esculenta, Crantz.), sua produção se concentra em diversos municípios do Estado, através de um processo artesanal, bastante primitivo, no qual a conversão do amido de mandioca em açúcares fermentescíveis é feita por bolores nativos que surgem sobre os beijus de massa de mandioca, onde as cepas são colhidas ao acaso. A fermentação alcoólica também é feita por leveduras selvagens. Tem sua comercialização praticada de modo informal, dificultando o registro de dados estatísticos de produção e número de produtor no Ministério da Agricultura. Com o objetivo de otimizar o referido processo, utilizaram-se, enzimas comerciais, cepas de fungos (Aspergillus níger), para a conversão do amido em mosto fermentescíveis e leveduras prensadas para fermentação. Os processos aqui propostos seguiram três etapas: gelificação do amido com a posterior dextrinização e sacarificação a açúcares, fermentação alcoólica e destilação do vinho fermentado. Substituindo-se os bolores por enzimas comerciais nas circunstâncias propostas, a fabricação da tiquira foi realizada em apenas 25 horas, enquanto que ao utilizar fungos isolados, a produção do aguardente demorou, aproximadamente, 136 horas para o seu processamento. Evidenciou-se assim, uma considerável redução de tempo, nos dois processos aqui apresentados em relação ao processo tradicional, que demora, aproximadamente, 20 dias para a consecução do destilado. Verificou-se também que os processos de fermentação e destilação do mosto oriundos da sacarificação da massa de mandioca são equivalentes ao da cana-de-açúcar, podendo ser processados com os mesmos equipamentos, por pequenos produtores de tiquira. Comprovou-se que as concentrações de cobre e carbamato de etila foram visivelmente reduzidas nos processos propostos em relação ao processo tradicional, possibilitando uma melhor qualidade da bebida, assim como reduzindo os riscos à saúde dos consumidores. A partir dos experimentos realizados conclui-se que a substituição do processo tradicional por enzimas comerciais, fungos isolados e levedura prensada se mostra tecnicamente possível e recomendada, primordialmente, aos pequenos produtores.

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Escote, Marcia Tsuyama. « Estudo da transição metal-isolante em óxidos de terra-rara e níquel ». Universidade de São Paulo, 2002. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-11122013-170810/.

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Esta tese apresenta um estudo sistemático da síntese e das propriedades físicas de amostras policristalinas de Nd IND. 1-X R IND. X NiO IND. 3; R = Sm, Eu, 0 < OU = X < OU = 1. Estes materiais apresentam uma transição de fase metal-isolante MI em temperaturas 200 < OU = T IND. MI < OU = 400 K. Amostras foram produzidas a partir do método de precursores sol-gel, sinterizadas a 1000 GRAUSC e sob pressões de O IND. 2 de até 80 bar. O estudo da influência da substituição de R POT. 3+ na matriz de NdNiO IND. 3 foi realizado a partir das caracterizações através de medidas de difração de raios-X DRX, difração de neutrons como função da temperatura DRN, transporte elétrico ro(T), transporte térmico capa(T), coeficiente Seebeck S(T), calorimetria diferencial e susceptibilidade magnética qui(T). Os resultados de DRX revelaram que as amostras são monofásicas e cristalizam-se na estrutura perivskita distorcida ortorrombicamente, grupo espacial Pbnm. As medidas de DRN realizadas nas amostras de Nd IND. 1-XEu IND. X NiO IND. 3 mostraram a evolução dos parâmetros de rede e do volume da cela unitária V como função da temperatura. Estas caracterizações revelaram que, em T DA ORDEM DE T IND. MI, ocorre uma expansão em V, assim como um aumento do ângulo de ligação Ni-O e uma diminuição do ângulo de \"superexchange\" teta. Medidas de ro(T) revelam a ocorrência da transição MI em um amplo intervalo de temperatura 200 < OU = T IND. MI 400 K. Através destas medidas verificou-se também a presença de histerese térmica ocorre decresce continuamente com o aumento de x, até anular-se em x > 0,5 e em x > 0,35 para R=Sm e Eu, respectivamente. Este resultado foi confirmado através das medidas de capa(T) e S(T). Além disso, verificou-se a importância da contribuição da rede na capa(T). As medidas de S(T) indicam que os portadores de carga são elétrons e que a densidade de ) estados no nível de Fermi N(E IND. F) foi estimada ser da ordem de 10 POT. 23 (eVcm POT. 3) POT. -1. Os valores de T IND. MI e a presença ou não de histerese térmica foram verificados através das medidas de DSC. Um estudo foi feito para verificar qual a maneira mais precisa de subtrair a contribuição dos íons terras-raras nas medidas de susceptibilidade magnética qui(T) dos compostos Nd IND. 1-X R IND. X NiO IND. 3. Após estas correções foi possível verificar o ordenamento magnético da sub-rede do Ni POT. 3+ na região de temperatura T IND. n DA ORDEM DE 200 K para as amostras com x < 0,4 e x < 0,25 para R=Sm e Eu, respectivamente. Ajustes lineares feitos em qui(T) acima de temperaturas T > 200 K revelaram valores de momentos magnéticos efetivos müeff variando de 1,7 a 1,8 mü IND. B o que está em concordância com o valor esperado de müeff DA ORDEM DE 1,76 mü IND. B do íon livre de Ni POT. 3+. Adicionalmente, uma separação precisa do termo independente da susceptibilidade magnética foi efetuada e a susceptibilidade de Pauli dos materiais foi encontrada. Foi possível então obter uma estimativa da densidade de estados no nível de Fermi N(E IND. F), que gerou valores similares aos obtidos via medidas do coeficiente Seebeck. Entretanto, o comportamento de qui(T) corrigido abaixo de T IND. n revelou características de um antiferromagnetismo não convencional devido a um aumento monotônico de qui(T) com o decréscimo da temperatura e a presença de irreversibilidade nas curvas resfriadas a campo magnético zero ZFC e do refinamento de estrutura estimou-se que a valência no Ni nas amostras de Nd IND. 1-X R IND. X NiO IND. 3 DA ORDEM DE 3. Estimativas grosseiras da largura de bando W do O 2ro e da energia de transferência de carga delta para a série de compostos Nd IND. 1-X R IND. X NiO IND. 3 revelaram valores compatíveis com aqueles ) encontrados na literatura. De maneira geral, as caracterizações das propriedades estruturais, de transporte e magnéticas sugerem que os compostos Nd IND. 1-X R IND. X NiO IND. 3 podem ser classificados como sistemas onde correlações eletrônicas e flutuações dessas correlações ocorrem. Foram discutidas algumas limitações acerca da aplicabilidade dos modelos vigentes para a explicação da transição metal-isolante nos niquelatos aqui estudados.
This work reports a systematic study on the synthesis and general physical properties of polycrystalline samples of Nd IND. 1-X R IND. X NiO IND. 3; R = Sm, Eu, 0 < OU = X < OU = 1. These compounds exhibit a metal-insulator MI phase transition in a broad range of temperature 200 < OU = T IND. MI < OU = 400 K. The samples were prepared through sol-gel precursors and sintered at extreme conditions: high temperatures 1000 GRAUSC and under oxygen pressures up to 80 bar. These samples were characterized by several techniques including X-ray powder diffraction XRD, neutron diffraction as a function of temperature NRD, electrical resistivity ro(T), thermal conductivity capa(T), Seebeck coefficient S(T), differential scanning calorimetry DSC, and magnetic susceptibility qui(T). The results of XRD revealed that all samples are single phase and crystallize in an orthorhombic structure, space group Pbnm. The NRD data, combined with the Rietveld analysis, indicated small changes in the lattice parameters a, b, and c and in the volume V of the unit cell T DA ORDEM DE T IND. MI. Such a small change in these parameters is accompained by either a little decrease of the superexchange angle teta and a small expansion of the Ni-O bond-length. The ro(T) data exhibit interesting features such as: (1) a metallic-like behavior of ro(T) at high temperatures; (2) a huge increase of the magnitude of ro(T) at T DA ORDEM DE T IND. MI; and (3) a thermal hysteresis occurring just below T DA ORDEM DE T IND. MI in a temperature interval as large as 100K. Such a thermal hysteresis is characteristic of a first order MI transition and was found to vanish with increasing substitution of x. This strongly suggests that increasing x modify the character of this transition to second order. Thermal properties were carried out and confirmed the change of this MI transition with increasing x. In addition, an analysis of the capa(T) data indicate that phonons are the major thermal carriers in these nickelates. Also, the Seebeck coefficient S(T) data revealed features of a conventional metal at higher temperatures with electrons as carriers. An accurate analysis of the S(T) data based on simple band structure arguments indicate a density of states at the Fermi level of 10 POT. 23 (eVcm POT. 3) POT. -1 and energy gaps in the insulating regime close to 20 meV. The character of the first order transition in lightly substituted samples at T DA ORDEM DE T IND. MI was also inferred from the DSC data. The S(T) data confirmed the occurrence of the metal-insulator transition and the already observed change from first to second order character with increasing x. The magnetic susceptibility ípsilon(T) data have been precisely corrected by a systematic subtraction of the R POT.3+-ion contribution of the measured qui(T). Linear adjusts of the corrected curves above 150K where found to fit the Curie-Weiss law with effective magnetic moment of mü IND. EFF ~ 1.76 mü IND. B, which is close to the free-ion value of mü IND. EFF ~ 1.76 mü IND. B (Ni POT. 3+). These results indicate that the Ni POT. 3+ array displays an antiferromagnetic ordering below a well-defined temperature T IND. N, which is close to T IND.MI for Nd IND. 1-X R IND. X NiO IND. 3 and lightly substituted samples. However, the evolution of the susceptibility of the Ni POT. 3+ array displays features which are fingerprints of unconventional antiferromagnetic state. These features, observed mostly below T IND. N, include a field independent irreversibility of qui(T) and a systematic increase of qui(T) with decreasing temperature, resembling that of a paramagnet. An analysis of the electronic contribution to ípsilon(T) resulted in a density of states at the Fermi level close to the one estimated from the S(T) data. These results are discussed within the context of recent experimental results and theories employed to explain the origin of the metal-insulator transition in these nickelates.

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Lima, Raul Gomes Taveira de. « Estudo da viabilidade do EPS em sistemas de cobertura invertida ». Master's thesis, Departamento de Engenharia Civil, 2000. http://hdl.handle.net/10316/15778.

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Souza, Jean Carlo 1993. « Estudos de ressonância de spin eletrônico (RSE) em isolantes topológicos dopados com terras-rara ». [s.n.], 2017. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/326704.

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Orientador: Pascoal José Giglio Pagliuso
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Física Gleb Wataghin
Made available in DSpace on 2018-09-02T11:57:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_JeanCarlo_M.pdf: 4438731 bytes, checksum: aaba7a375b2b45b638619e944111c41b (MD5) Previous issue date: 2017
Resumo: A ideia de topologia na Física da Matéria da Condensada, apesar de ter surgido com o efeito Hall quântico inteiro, só voltou a ser explorada recentemente na busca de novas fases da matéria depois do surgimento dos Isolantes Topológicos (ITs) 2D. Após a previsão teórica, e a descoberta experimental, foi proposto que esta nova fase poderia ser generalizada para sistemas 3D, em que o volume do material seria isolante com estados metálicos de superfície que possuiriam canais de spin polarizados. Apesar de diversos experimentos e o surgimento de outras fases topológicas da matéria subsequentes, ainda há dúvidas sobre a natureza dos ITs 3D. Os efeitos topológicos mais claros ainda não foram observados de forma inequívoca e reprodutível experimentalmente e ainda seria de extrema valia encontrar técnicas experimentais que possam complementar os mais discutidos experimentos de ARPES. Nesta dissertação foram estudadas duas famílias distintas de materiais propostas como possíveis ITs 3D: os binários Bi2Se3 e Sb2Te3 e o half-Heusler YPdBi. Utilizando a técnica de auto-fluxo e a fusão estequiométrica, os sistemas foram sintetizados dopados com os terras-rara Gd3+, Nd3+ e Er3+ para realizar estudos de ressonância de spin eletrônico (RSE) e do papel dos efeitos de campo cristalino (CEF) - no caso do half-Heusler. Para o ternário YPdBi foram feitos dois estudos. Na família dos half-Heuslers, a ordem topológica surge da relação entre o acoplamento spin-órbita e a hibridização, que está ligada com a mudança do parâmetro de rede, então os efeitos de CEF poderiam estar refletindo a transição entre a trivialidade e a não-trivialidade. A partir das medidas de susceptibilidade magnética em função da temperatura das amostras dopadas com Nd3+ e Er3+ combinadas com os estudos de RSE, foi possível extrair os parâmetros de campo cristalino (CFP) de quarta e sexta ordem. Comparando esses dados com resultados anteriores para o material, supostamente, não-trivial YPtBi, observou-se uma mudança sistemática no sinal dos CFP. Resultados prévios para as amostras de YPtBi dopadas com Nd3+ mostram uma evolução não usual para uma forma de linha difusiva com a potência de micro-onda. Neste trabalho também foi realizado um estudo da forma de linha em função da potência. Apenas a ressonância do Nd3+ para os monocristais de 10% de Nd em YPdBi mostrou uma forma de linha difusiva que evolui com a potência da micro-onda. No caso dos binários Bi2Se3 e Sb2Te3, o objetivo era otimizar a rampa de tratamento térmico para obter monocristais melhores que poderiam permitir a observação de um espectro totalmente resolvido do Gd3+. Após mudanças no crescimento dos monocristais, o espectro totalmente resolvido foi obtido para as amostras de Bi2Se3. No caso do Sb2Te3 apenas uma linha central com a estrutura fina colapsada foi observada. Acompanhando o deslocamento g e a evolução da largura de linha dH da RSE do Gd3+ com a temperatura, o comportamento negativo do deslocamento g para toda a faixa de temperatura indica que elétrons do tipo p são os grandes responsáveis pela formação da superfície de Fermi residual destes sistemas. Um aumento no coeficiente angular de dH em função da temperatura, a taxa Korringa b, foi observado em baixas temperaturas, logo diferentes concentrações de Gd3+ foram utilizadas para estudar este comportamento. Novamente observou-se um comportamento anômalo em baixas temperaturas, o que poderia estar relacionado com a evolução dos CFP com a temperatura. Todos esses resultados foram discutidos levando-se em conta a possibilidade de existência de topologia não-trivial na estrutura eletrônica desses materiais, com foco particular na relação da interação spin-órbita e os efeitos de campo cristalino com a manifestação da topologia não trivial nesses sistemas
Abstract: The idea of topological systems in Condensed Matter Physics, although already explored in the Quantum Hall Effect, has recently become a topic of intense scientific investigation. In particular, great efforts have been dedicated to the search for new quantum phases since the proposal of the Topological Insulators (TIs) in 2D. After the theoretical prediction and the experimental discovery of the TIs in the 2D case, the existence of the Quantum Hall Spin Effect in 3D, 3D TIs, was proposed, where an insulator bulk and metallic surface states with spin polarized channels could be experimentally realized. Although many experiments have been performed, and some groups claimed the direct observation of such new topological phases, there is still a lot of controversy about the nature of the 3D TIs and about the actual microscopic origin of the metallic states on the surface of the studied materials. Other signatures of the topological phases have not been unambiguously and repeatedly measured yet and there is an obvious lack of a supplementary lab technique to be compared to the most used technique to probe these states, which is ARPES. In this work we have studied two different classes of 3D TIs: the binaries Bi2Se3 and Sb2Te3 and the half-Heusler YPdBi. We have been able to grow single crystals of these materials pure and rare-earth doped with Gd3+, Nd3+ and Er3+ using the self-flux technique and the stoichiometric melting. The aim was to use these crystals to study Electron Spin Resonance (ESR) as a potential probe to investigate the existence of the metallic surface states and to explore the possible of the crystalline electrical field (CEF) effects on the formation of the non-trivial electronic structure of these materials. Regarding the YPdBi, our ESR and magnetization studies have revealed that, in the half-Heusler family, the topological order emerges from the interplay between spin-orbit coupling and the hybridization, which is connected with the changes on the lattice parameter. Thus, the CEF effects could reflect the transition from trivial to nontrivial topology. From the magnetic susceptibility data as a function of temperature from the Nd3+ and Er3+ doped samples combined with the ESR studies, it was possible to extract the fourth and sixth order crystal field parameters (CFP). Comparing our data with the previous results from YPtBi, which is a putative non-trivial material, a systematic change in the sign of the CFP was observed. Previous results with the YPtBi Nd-doped samples show an unusual evolution of the Nd3+ ESR line to a diusive-like line shape as a function of the microwave power. In this work we have performed a similar study of the Nd3+ ESR line shape as a function of the microwave power. Only for the single crystal of 10% Nd in YPdBi resonance shows a diffusive-like line shape that evolves with the microwave power. In the case of the binaries Bi2Se3 e Sb2Te3, the aim of this work was to optimize the heat treatment used in previous works of our group to obtain better single crystals that could allow the observation of the full resolved spectra from Gd3+. After many changes in the single crystal growth method, we were able to observe fully resolved Gd3+ ESR spectra in the Bi2Se3 samples. Regarding the Sb2Te3 single crystals, only a single Gd3+ Dysonian ESR line was observed. Following the Gd3+ ESR dg and dH as a function of temperature, the observed negative behavior of dg, in the whole temperature range studied, indicates that p-type electrons are the main source for the formation of the small the Fermi surface of these materials. An increase of the angular coefficient of dH as a function of temperature, the Korringa rate b, at low temperatures was observed and different concentrations of Gd3+ were required to investigate this anomaly. Again this anomalous behavior at low temperatures was observed for the all Gd-doped samples, which could be related to an evolution of CFP with temperature. We discuss our results taking into account the existence of non-trivial topological states in our samples and the role of spin-orbit and CEF effects might have in the formation of such states
Mestrado
Física
Mestre em Física
132653/2015-0
CNPQ
CAPES
FAPESP

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Silva, Neto Gustavo Cunha da. « Um método para solução de problemas de otimização multiobjetivo em ambiente fuzzy ». Universidade Federal do Amazonas, 2011. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3689.

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Made available in DSpace on 2015-04-22T22:16:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gustavo Cunha.pdf: 1000425 bytes, checksum: fc84dd761ea9f58fc46869f1324d8e1d (MD5) Previous issue date: 2011-09-02
CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
This paper presents a model for solving multiobjective linear programming problems based on the calculation of the minimum fuzzy distance. The theoretical principles outline some elements of the fuzzy logic as well as crisp multiobjective optimization elements needed for the formulation of the model. Moreover, some classical multiobjective methods are presented and classified in three types: a priori, a posteriori and interactive. From these elements we formulate the method for finding an efficient solution from the minimal fuzzy distance, obtained through a subproblem which is calculated based on the L1 metric. At the end, a study case is done in the context of energy planning in isolated electric systems in which we analyze the inclusion of biodiesel as input for electricity generation taking into account the values of the overall cost for generation and number of direct jobs promoted using this technology. In addition, we evaluate, from the values obtained, the environmental impact represented here by the emission of carbon dioxide with the use of their inputs.
Neste trabalho apresenta-se um modelo para solução de problemas de programação linear multiobjetivo baseado no cálculo da distância mínima fuzzy. Os fundamentos teóricos discorrem sobre alguns elementos de lógica fuzzy bem como elementos de otimização multiobjetivo crisp necessários para formulação do modelo. Além disso, apresentam-se alguns métodos multiobjetivo clássicos que são classificados em três tipos: à Priori, à Posteriori e Interativos. A partir destes elementos, formula-se o método para encontrar uma solução eficiente a partir da distância mínima fuzzy, obtida através de um subproblema calculado com base na métrica L1. Ao final, faz-se um estudo de caso no contexto do planejamento energético de sistemas elétricos isolados sobre o qual se analisa a inclusão do biodiesel como insumo para geração de energia elétrica levando em consideração os valores do custo global para geração e número de empregos diretos promovidos com a utilização dessa tecnologia. Além disso, avalia-se, a partir dos valores obtidos, o impacto ambiental representado aqui pela emissão de dióxido de carbono com a utilização dos respectivos insumos.

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Gardosi, Giulia. « Stima del potenziale di liquefazione in terreni alluvionali di recente deposizione (sito di Isola Serafini, PC) ». Bachelor's thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2015. http://amslaurea.unibo.it/9464/.

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With the support of data collected by CPT tests on-site, in this report, we try to estimate the liquefaction potential in soils at high risk, due to the presence of sandy horizons. We began by acquiring some basic theory about the topic with the help of texts, articles and documents found in the web. The notions found here were consequently applied to two concrete case studies.  In the first part of the work, the phenomenon of liquefaction is analyzed at a theoretical level. Moreover, we want to find out the trigger factors and the possible side effects whenever this event occurs. In the second part of the work, we re-elaborated the data concerning tip resistance (qc) and resistance to friction side (fs) obtained by CPT tests taken in proximity of San Carlo (FE) and Isola Serafini (PC). We particularly chose to go through this specific process to estimate the land liquefaction potential.  The main purpose is finally to compare the results of both tests and to comment on them.

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Champigny, Pierre-Luc. « Biocompatibilité des bactéries lactiques et probiotiques et d'affinage avec des mycètes du camembert isolées de laits de terroir québécois ». Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/28391/28391.pdf.

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L’objectif de cette étude était de vérifier la biocompatibilité entre les mycètes du fromage Camembert et les bactéries lactiques (probiotiques ou d’affinage). La plupart des souches fongiques utilisées ont été isolées de laits en provenance du terroir québécois et deux laits d’origines différentes ont servi pour la fabrication de caillés modèles. La spectrophotométrie automatisée (SA) a été employée pour présélectionner des mélanges de souches mycéliennes et bactériennes biocompatibles. Des milieux à base de lait furent fermentés par des mycètes et étaient ensuite inoculés avec les bactéries. La croissance préalable des mycètes stimulait ou inhibait les bactéries, mais les effets étaient mineurs et variaient selon les souches. Par la suite, afin de confirmer ces résultats, des caillés modèles ont été inoculés simultanément par des combinaisons de bactéries et de mycètes. L’absence d’inhibition des bactéries par les mycètes observée en SA a été confirmée, mais les interactions en caillé modèle différaient de celles notées en SA en raison de l’évolution différente du pH dans les deux séries expérimentales. Finalement, des fromages Camembert probiotiques ont été fabriqués avec des souches du terroir et commerciales. Le Camembert s’est révélé un aliment intéressant pour favoriser la survie des bactéries lactiques. Par contre, aucun mélange de souches fongiques n’a été systématiquement meilleur qu’un autre pour stimuler la viabilité des probiotiques.
This study was carried out to verify the biocompatibility between the mycetes of Camembert cheese and lactic cultures (probiotic and ripening strains). Most of the fungi strains used had been isolated from different milk sources over the province of Quebec (Canada) and two different kinds of milk were used to produce cheese slurries. Automated spectrophotometry (AS) was employed to screen some biocompatible pairings of mycete and bacterial strains. A milk medium was fermented by yeasts and moulds and then inoculated with bacteria. The previous growth of the mycetes was sometimes stimulatory and sometimes inhibitory, but the effects were minor and varied as a function of the strains. Subsequently, to confirm these AS results, cheese slurries were inoculated simultaneously with different strains combinations. Finally, pilot scale Camembert cheese was produced to verify its ability to support probiotic bacterial cultures viability. The absence of inhibition of the bacteria by the mycetes in SA was confirmed, but the interactions in the cheese slurries differed from those noted in AS because of the different pH patterns in the two experimental series. Camembert was shown to have potential to favour the viability of probiotic bacterial strains during ripening and storage. However, no mycete mix was systematically better than another to stimulate this viability.

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Fedrizzi, Samanta Maria Gobbo. « \"Produção de metabólitos antimicrobianos e sideróforos de isolados provenientes de Terra Preta Antropogênica da Amazônia Ocidental\" ». Universidade de São Paulo, 2006. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-20032007-081838/.

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Résumé :

Os microrganismos atraem considerável atenção por serem uma fonte de compostos biotecnológicos e farmacêuticos. Diversos produtos naturais peptídicos produzidos por fungos e bactérias são sintetizados por grandes enzimas, conhecidas como peptídeo sintetase não ribossômica (NRPS) e policetídeo sintase (PKS). A bioprospecção dos microrganismos isolados do solo de Terra Preta Antropogênica (TPA) da Amazônia Ocidental é de grande importância para o conhecimento deste bioma tropical. Este estudo correlacionou a presença de sideróforos e de compostos antimicrobianos produzidos pelos microrganismos isolados de TPA e dos solos adjacentes com a presença dos genes que codificam para NRPS e PKS. Linhagens bacterianas foram isoladas das amostras do solo coletadas de 10, 20 e 40 cm de profundidade. Os isolados foram cultivados em meio líquido específico por 2 dias a 28oC. Um total de 143 isolados foi testado para a atividade de sideróforo e para isso, as linhagens foram inoculadas em um meio com baixa concentração de ferro (MM9) contendo o complexo cromoazurol S-Fe3. Do total, 72 isolados apresentaram reação positiva para a produção de sideróforo. O DNA genômico dos isolados foi extraído e a amplificação por PCR foi realizada usando iniciadores específicos para NRPS e PKS. Os resultados mostraram que quinze isolados apresentaram o gene que codifica para NRPS, vinte isolados para PKS e somente dez isolados apresentaram ambos os genes. A presença de genes de NRPS e PKS em 31% dos isolados testados sugere que a produção dos sideróforos possa ocorrer pela via não ribossomal. Dois isolados foram selecionados para estudos de identificação e caracterização dos compostos. O isolado TP11 foi identificado como Pseudomonas putida através de seqüenciamento do 16S rRNA e apresentou resultado negativo para hidroxamato e catecol, sugerindo que o tipo de sideróforo não possui nenhum destes grupos funcionais. O isolado TP16 foi identificado como Pseudomonas putida e apresentou produção de sideróforo do tipo catecol e hidroxamato, sugerindo a produção de mais de um sideróforo. Além disso, esta linhagem produziu um composto antimicrobiano, com atividade de sideróforo identificado por espectrometria de massas como pseudomonina com massa molar de 330 Da.
Microorganisms have attracted considerable attention as a source for biotechnological and pharmaceutical agents. Several peptidic natural products synthesized by fungi and bacteria are assembled by large enzymes, referred as nonribosomal peptide synthetase (NRPS) and polyketide synthase (PKS). Bioprospection of microorganisms isolated from Anthropological Dark Earth soil of Brazilian Occidental Amazon is of great importance to the knowledge of this tropical biome. This study aimed to correlate the presence of siderophores and antimicrobial compounds produced by microorganisms isolated from Dark Earth and adjacent soils of Brazilian Amazon with the presence of genes encoding NRPS and PKS. Bacterial strains were isolated from soil samples collected at 10, 20 and 40 cm depth. The isolates were grown in specific liquid medium for 2 d at 28oC. A total of 143 isolates were screened for siderophore activity and for this, bacterial strains were inoculated on plates containing an iron-limited medium (MM9) amended with a chromeazurol S-Fe3 complex. From the total, seventy-two isolates showed positive reaction for siderophore production. Genomic DNA of the isolates was extracted and PCR amplification was carried out using specific primers for NRPS and PKS. The results showed that fifteen isolates presented NRPS, twenty isolates presented PKS and only ten isolates showed both genes. The presence of NRPS and PKS genes in 31% of the isolates tested suggests that production of siderophores may occur by a nonribosomal pathway. Two isolates were selected for further studies. Isolate TP11 was identified as Pseudomonas putida by 16S rDNA sequencing analysis and was negative for hydroxamate and catechol, suggesting that the siderophore type has no hydroxamate- or catechol-type functional groups. The isolate TP16 was identified as Pseudomonas putida and showed the production of catechol and hydroxamate siderophore-type, suggesting the production of more than one siderophore. In addition, this strain produced an antimicrobial compound, with siderophore activity identified through mass spectrometry as pseudomonine with a molar mass of 330 Da.

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Carmo, Edson Júnior. « Clonagem e caracterização enzimática de uma lipase isolada de uma biblioteca metagenômica de terra preta de índio ». Universidade Federal do Amazonas, 2017. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5709.

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CAPES
The advancement of molecular technologies in the scientific field has enabled the development of various forms of access to the genetic material of organisms in order to locate, map, isolate, characterize and decode the target genes of a particular individual or a set of individuals coexisting in a specific environment. Metagenomic studies are very promising in several areas of biotechnology, such as the discovery of new molecules of industrial biotechnological interest, the investigation of new antibiotics and drugs, the bioremediation of environments impacted with toxic metals and the prospection of various enzymes. The objective of this work was characterize enzymatically a previously screened lipase enzyme from Metagenomic Library of Terra Preta de Índio. Lipase gene sequence was isolated from the metagenomic library and expressed in Pichia pastoris under control of PGK promoter. Recombinant lipase was characterized by hydrolysis activity of lipid substrates and synthesis ability in organic solvent. In silico analyzes infer the identification of extracellular lipase belonging to the lipase family, superfamily -hydrolase and lipase activity molecular function. Enzyme was efficiently produced in P. pastoris and recombinant lipase showed activity of 374.59 U/mL hydrolyzing p-nitrophenyl palmitate, Vmax (ap.) 143,4 U/mL.min-1, Km (ap.) 1,4 mM and Kcat (ap.) 103,7 S-1. Enzyme had maximum activity at pH 8.0, temperature 90 ºC and remained stable at high temperatures. Synthesis ability was evaluated by the formation of ethyl laurate by esterification reaction of lauric acid with ethanol, yielding 70% conversion in 45 minutes. Recombinant protein is characterized as an alkaline, thermotolerant, activated by calcium, EDTA e detergents.
O avanço das tecnologias moleculares no campo científico, possibilitou o desenvolvimento de diversas formas de acesso ao material genético dos organismos, de forma a ser possível localizar, mapear, isolar, caracterizar e decodificar os genes alvo de um indivíduo particular ou de um conjunto de indivíduos coexistentes em um ambiente específico. Estudos metagenômicos são bastante promissores em diversas áreas da biotecnologia, como nas descobertas de novas moléculas de interesse biotecnológico industrial, na investigação de novos antibióticos e fármacos, na biorremediação de ambientes impactados com metais tóxicos e na prospecção de enzimas diversas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar enzimaticamente uma enzima lipase previamente rastreada de uma Biblioteca Metagenômica de Terra Preta de Índio. A sequência correspondente ao gene de lipase foi isolada da biblioteca metagenômica, clonada e expressada em Pichia pastoris sob controle do promotor PGK. A lipase recombinante foi caracterizada pela atividade de hidrólise de substratos lipídicos e capacidade de síntese em solvente orgânico. Análises in silico da sequência proteica inferem a identificação de uma lipase extracelular pertencente à / - hidrolase e com função molecular para atividade lipásica. A enzima foi produzida eficientemente em P. pastoris e a lipase recombinante apresentou atividade de 374,59 U/mL hidrolisando p-nitrofenil palmitato, Vmax(ap.) 143,4 U/mL.min-1, Km(ap.) 1,4 mM e Kcat(ap.) 103,7 S-1. A enzima possuiu atividade máxima em pH 8,0, temperatura 90 ºC e se manteve estável em altas temperaturas. A capacidade de síntese foi avaliada pela formação de laurato de etila pela reação de esterificação do ácido láurico com etanol apresentando rendimento de 70% em 45 minutos de reação. A proteína recombinante se caracteriza como uma enzima alcalina, termotolerante, ativada por cálcio, EDTA e detergentes.

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Ferreira, Luciana Chaves. « Aspectos bioquímicos e moleculares de bactérias isoladas de Terra Preta Antropogênica (TPA) na região da Amazônia Brasileira ». Universidade de São Paulo, 2007. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-04032008-150358/.

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Résumé :

A Terra Preta Antropogênica (TPA) ocorre somente em sítios arqueológicos na região amazônica. Estes solos de origem antrópica foram enriquecidos em nutrientes, provavelmente pelo manejo de restos orgânicos e do fogo pelas populações pré-colombianas. Em TPA, a presença de material orgânico estável e a grande atividade biológica indicam que este tipo de solo pode ser um local de alta diversidade microbiana, constituindo numa fonte de germoplasma microbiano. Contudo, atualmente não se tem conhecimento da biologia e, sobretudo da estrutura e diversidade das comunidades microbianas deste solo. O conhecimento sobre a diversidade microbiana trará compreensão das funções exercidas pelas comunidades microbianas no solo e o conhecimento das suas interações com outros componentes da biodiversidade, além de benefícios econômicos e estratégicos, como a descoberta de microrganismos potencialmente exploráveis nos processos biotecnológicos. Metabólitos secundários, como antibióticos e toxinas microbianas, podem ser considerados como produtos naturais de importância ecológica. Muitos metabólitos secundários produzidos por fungos e bactérias desenvolvem atividades multifuncionais através da via não-ribossomal, pelas enzimas peptídeo sintetase e policetídeo sintase, que são enzimas multidomínio e podem estar envolvidas na produção de sideróforos e antibióticos. Este estudo teve como objetivo a busca por peptídeos não-ribossômicos produzidos por bactérias isoladas de TPA e suas caracterizações bioquímica e molecular. Através de cultivo, 150 isolados foram selecionados de TPA para análise taxonômica por amplificação e seqüenciamento do gene 16S rRNA, após análise de restrição por enzima de restrição para se conhecer o polimorfismo genético dos isolados. De acordo com o seqüenciamento pôde-se agrupar esses isolados em 17 grupos. Os resultados indicaram a presença dos gêneros Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter, Janthinobacterium, Staphylococcus e Massili. Metabólitos extracelulares foram extraídos dos cultivos bacterianos, usando acetato de etila e clorofórmio, seguidos pela concentração dos extratos, para determinação da capacidade antimicrobiana e a produção de sideróforo foi avaliada usando-se cromoazurol S (CAS). Os resultados mostraram que treze dos 17 isolados apresentaram genes NRPS ou PKS, ou para ambos os genes, associados à produção de peptídeos não-ribossômicos. De todos os isolados estudados, 97% apresentaram produção de sideróforos e algumas espécies dos gêneros Bacillus, Pseudomonas, Arthrobacter e Janthinobacterium mostraram positivas em inibir o crescimento de cinco bactérias testes. A produção de sideróforos do tipo hidroxamato foi positiva para 8 isolados e 7 isolados para o tipo catecol, sendo que 2 isolados não apresentaram reação. Os resultados obtidos em espectrometria de massas Q-TOF indicaram a presença do antibiótico fenazina para o isolado Pseudomonas putida BCM 20, considerado de importância no controle biológico de diversas bactérias patogênicas.
The Anthropogenic Dark Earth (ADE) occurs mainly in archeological sites in the Amazon region. These soils from anthropic origin were enriched with nutrients, probably by the management of organic residues and fire produced by pre-Colombian populations. In ADE, the presence of stable organic matter and high biological activity indicate that this type of soil can be a site of a highly microbial diversity, appointing as a source of microbial germplasm. However, at the present time there is little knowledge about its biology, and especially the structure and diversity of the microbial communities from these soils. The knowledge about microbial diversity will promote a better understanding of the function promoted by the soil microbial community and the knowledge of its interaction with components from biodiversity, likewise the economical and strategic benefits, as for example the discovery of potential microorganisms for exploring biotechnological processes. Secondary metabolites, like antibiotics and microbial toxins, may be considered as natural products of ecological importance. Many of the secondary metabolites produced by fungi and bacteria develop multifunctional activities via non-ribosomal for peptide enzymes and polypeptide synthesis, that are multi-domain enzymes and can be involved in the production of siderophore and antibiotics. This study had the objective of searching for non-ribosomal peptides produced by bacteria isolated from ADE and its biochemical and molecular characterization. Through cultivation in selective media, 150 strains were isolated from ADE for taxonomic analysis by amplification and sequencing of the 16S rRNA gene, after the restriction analysis by restriction enzyme for knowing the genetic strains polymorphism. From the sequencing, it was possible to select these strains in 17 groups, with predominant genera - Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter, Janthinobacterium, Staphylococcus and Massili. Extracellular metabolites were extracted from the cultivated bacteria, using ethylacetate and chloroform, followed by detection of antimicrobial metabolites from bacterial supernatants. Siderophore production was evaluated using ChromoBlue S (CAS). The results from the strains representing the 17 groups showed that at least thirteen strains presented NRPS or PKS gene, or for both genes, associated to the production of non-ribosomal peptides. From all the studied strains, it was found that 97% presented the production of siderophore and that several species from the genera Bacillus, Pseudomonas, Arthrobacter and Janthinobacterium proved to be positive on bacterial growth inhibition. The production of hydroxamate-type siderophore was positive to eight strains and seven strains for the cathecol type, and two strains did not present any reaction. The results obtained from the Q-TOF mass spectrometry confirmed the production of 6-hydroxyphenazine-1-carboxylic acid from the isolated identified as Pseudomonas putida BCM 20. This compound belongs to a fully studied group of antibiotics for biological control against several pathogenic bacteria.

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Nakamura, Fernanda Mancini. « Bioprospecção de bactérias degradadoras de hidrocarbonetos aromáticos isoladas de biocarvão de Terra Preta de Índio da Amazônia Central ». Universidade de São Paulo, 2014. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-26012016-150215/.

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Résumé :

Devido aos altos teores de húmus e matéria orgânica pirolisada, os solos de Terra Preta de Índio da Amazônia (TPA) apresentam uma dinâmica diferente de outros, com hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos em grandes quantidades. Os alcanos são os maiores constituintes da matéria orgânica do solo, pouco reativos, insolúveis e recalcitrantes, promovendo menor rendimento à produção de combustíveis fósseis e renováveis. Os hidrocarbonetos aromáticos, assim como alcanos, são encontrados no ambiente de forma natural ou introduzidos e podem ser tóxicos, mutagênicos ou carcinogênicos. O estudo das comunidades bacterianas desses locais é de interesse no entendimento da alta fertilidade destes solos e da ação do carvão na relação planta-solo-microrganismo, além de bioprospecções de novas vias metabólicas. Diversos estudos já avaliaram genes de interesse para biodegradação destes compostos na TPA, como bph (Brossi, 2014) em solo e ?-ARHDs (Germano, 2011) em solo e carvão, ambos para degradação de hidrocarbonetos aromáticos. Porém o gene alk, para degradação de alcanos, ainda não fora estudado em carvão de TPA e nenhum isolamento bacteriano deste carvão foi feito e o presente trabalho teve esta abordagem inovadora para os solos de TPA, aliando cultivo, biologia molecular e bioensaios. O carvão foi separado, diluído e plaqueado em cinco meios de cultivo, com posterior incubação microaerofílica. Ao final da obtenção dos isolados, uma seleção de singularidade de morfologia foi feita a fim de se trabalhar com riqueza de tipos bacterianos, resultando em 86 isolados. Na identificação molecular pelo gene 16S ribossomal bacteriano identificamos 24 gêneros: Burkholderia, Ralstonia, Pseudomonas, Achromobacter, Pantoea, Leclercia, Acinetobacter, Cupriavidus, Enterobacter, Variovorax, Leifsonia, Leclercia, Pantoea, Parapusiliimonas, Bordetella; Bacillus, Paenibacillus, Lysinibacillus, Brevibacillus, Rummeliibacillus; Arthrobacter, Streptomyces, Rhodoccocus; e Fibrobacterium, além de bactérias não cultivadas. Os meios GA e ES comprovaram ser um método com boa eficiência para isolamento de quantidade e variedade de bactérias do carvão, tanto aeróbias quanto anaeróbias facultativas, sendo pertencentes aos filos Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria e Bacteroidetes. Apenas 11 isolados possuem o gene alk. Observamos que 53,49% de isolados foram positivos para a degradação de 0,05% de fenantreno; 70,93% foram positivos para a degradação de 8% de óleo diesel; e 88,37% foram positivos para degradação de 0,05% de bifenil. Houve isolados com capacidade de degradar mais de um substrato, e até mesmo os 3 substratos. Este estudo demonstra que os biocarvões de TPA são um microhabitat para microrganismos com capacidade comprovada em metabolizar hidrocarbonetos aromáticos complexos e diversos como fonte de carbono e energia. Os isolados apresentam um grande potencial biotecnológico para a geração de moléculas ligadas aos processos metabólicos da biodegradação, principalmente os não-cultivados, podendo auxiliar processos de biorremediação de áreas contaminadas e, possivelmente, produção de biocombustíveis de segunda geração. Além disso, os dados gerados por este estudo fornecem informações sobre o papel dessas bactérias na ciclagem de nutrientes, que influenciam diretamente na resiliência e fertilidade dos solos de Terra Preta de Índio da Amazônia por serem capazes de degradar compostos recalcitrantes de carbono dos fragmentos de biocarvão, ácidos húmicos e, talvez, grupos funcionais aderidos, além de outras frações da matéria orgânica humificada
Due to high humus content and pyrolyzed organic matter, Amazonian Dark Earth Soils (ADE) show different dynamic than other soils, presenting high contents of aliphatic and aromatic hydrocarbons. Alkanes are the major constituents of soil organic matter, low reactive, insoluble and recalcitrant, promoting lesser yield on fossil and renovable fuels production, as well as pollute the environment when in high concentrations. Aromatic hydrocarbons, as well as alkanes, are found in environment due to natural e industrial processes, are insoluble and recalcitrants, and can be toxic, mutagenic and carcinogenic. The study of bacterial communities from these areas is of major interest to reveal the high fertility of these soils, and understand the biochar influences on the plant-soil-microrganism relation, besides discover novel bacteria, genes and proteins. Diverse studies had already evaluated genes of interest for the biodegradation of hydrocarbons on ADEs, like bph gene (Brossi, 2014) from soils and ?-ARHDs (Germano, 2011) from soils and biochar. However, the alk gene for the biodegradation of alkanes was never studied in biochar. Neither any bacterial isolation from the ADEs biochar was done until now, so this work has this innovative approach to the ADEs. Biochar was separated, dilluted and plated on five culture media, and microarophilic incubation. The isolates were selected by their morphology and 86 isolates were obtained. We identified 24 bacterial genera throught the 16S rRNA gene sequencing: Burkholderia, Ralstonia, Pseudomonas, Achromobacter, Pantoea, Leclercia, Acinetobacter, Cupriavidus, Enterobacter, Variovorax, Leifsonia, Leclercia, Pantoea, Parapusiliimonas, Bordetella; Bacillus, Paenibacillus, Lysinibacillus, Brevibacillus, Rummeliibacillus; Arthrobacter, Streptomyces, Rhodoccocus; and Fibrobacterium, in addition to uncultured-bacteria. GA and ES media were the best on variety and number of bacteria from biochar, such aerobic as well as facultative anaerobic bacteria, being from the phyla Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Bacteroidetes. The alk gene was found in 11 isolates. We observed 53,49% of isolates were positive for 0,05% phenanthrene degradation; 70,93% of isolates were positive for 8% diesel oil degradation; and88,37% of isolates were positive for 0,05% biphenyl degradation. There were isolates capable to degrade more than one substratum, even the three substrata. This study demonstrates that ADE biochars are a microhabitat for bacteria with proved capacity to metabolize complex aromatic hydrocarbons as carbon and energy sources. The isolates have great biotehcnological potential to generate molecules associated to metabolic process of biodegradation, mainly the uncultured ones, being helpfull for polluted areas bioremediation and, possibly, to the production of second generation biofuels. Furthermore, the generated data supplies the role of bacteria from ADE biochar on the nutrient cycle, wich directly influences the resiliance and fertility of ADEs, for microbiota being capable to degrade recalcitrant carbon fragments of biochar, humic acids and, possibly, adhered functional groups, besides other organic matter fractions, as well

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Oréfice, Bruna. « O número de Milnor de uma singularidade isolada ». Universidade Federal de São Carlos, 2011. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5823.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:27:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3945.pdf: 746734 bytes, checksum: 759f0299b121e175c4c8fc136f294b23 (MD5) Previous issue date: 2011-11-24
Financiadora de Estudos e Projetos
Given (X; 0) C (CN; 0) a weighted homogeneous germ of hypersurface with isolated singularity and f : (CN; 0) - C a germ of function finitely determined with respect to X, we show that UBR(f;X) = U(f) + U(X; f), where U(f) and U(X; f) denote the Milnor numbers of f and of the fiber X \ f��1(0), respectively, and UBR(f;X) is the Bruce-Roberts number of f with respect to X. We show that the logarithmic characteristic subvariety, LC(X), is Cohen-Macaulay and we get relations between the Bruce-Roberts number and the Euler obstruction. Given F : (CN; 0) ! Mm;n(C) a holomorphic function germ, let (X; 0) be the isolated determinantal singularity given by X = F-1(Ms m;n(C)) where Ms m;n(C) is the set of the complex matrices with rank less then s, with s an integer number between 0 and minfm; ng such that N < (m - s + 2)(n - s + 2), we will define the vanishing Euler characteristic of (X; 0) and the Milnor number of a holomorphic function germ with an isolated singularity at X, f : (X; 0) - C.
Dados (X; 0) C (CN; 0) um germe de hipersuperfície quase homogêneo com singularidade isolada e f : (CN, 0) - C um germe de função finitamente determinado com respeito a X, mostramos que UBR(f;X) = U(f) + U(X; f), onde U(f) e U(X; f) denotam o número de Milnor de f e da fibra X \ f-1(0), respectivamente, e _BR(f;X) é o número de Bruce-Roberts de f com respeito a X. Mostramos que a variedade logarítmica característica LC(X) é Cohen-Macaulay e obtemos relações entre o número de Bruce-Roberts e a obstrução de Euler. Dado F : (CN; 0) ! Mm;n(C) um germe de função holomorfa, seja (X; 0) a singularidade determinantal isolada dada por X = F-1(Ms m;n(C)) onde Ms m;n(C) é o conjunto das matrizes complexas com posto menor que s, com s um número inteiro entre 0 e minfm; ng tal que N < (m-s+2)(n-s+2), definimos a característica de Euler evanescente de (X; 0) e o número de Milnor de um germe de função holomorfa com uma singularidade isolada em X, f : (X; 0) - C.

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Resende, Bruno Messias Farias de. « Modelos matemáticos para isolantes topológicos em redes ». Universidade Federal de Uberlândia, 2017. http://dx.doi.org/10.14393/ufu.di.2018.90.

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CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Sistemas descritos por Hamiltonianos do tipo Dirac são ubíquos. Surgindo em materiais como grafeno, isolantes topológicos ou recentemente nos semimetais de Weyl. Devido ao interesse tecnológico e acadêmico desses materiais, caracterizar suas propriedades é essencial. Uma abordagem matemática para efetuar o estudo de tais sistemas consiste em discretizar o Hamiltoniano no espaço das posições, mas tal abordagem esbarra no problema da duplicação de férmions. De forma breve, esse problema atesta pela impossibilidade de simulação de férmions livres não massivos em uma rede discreta sem que alguma simetria ou propriedade da Hamiltoniana seja quebrada. No presente trabalho demonstramos que tal problemática não deveria ser causa de preocupação para o estudo de sistemas na matéria condensada, pois podemos utilizar a simetria quebrada para confinar os portadores de carga no sistema para remover os estados duplicados. Tal remoção é conseguida com a inserção de um termo quadrático em relação ao momento, conhecido como massa de Wilson. Nesse sentido podemos inserir um termo de Wilson com quebra de simetria necessária para o confinamento, tornando o problema de duplicação de férmions irrelevante, essa relação não tinha sido notada até o presente trabalho, e recentes resultados na literatura erroneamente atribuem a massa de Wilson com a quebra de uma simetria de reversão temporal, o que não necessariamente é verdade. Nesse contexto além de abordar essa relação a presente dissertação objetiva também elucidar alguns mal entendimentos a respeitos das massas de Wilson, quiralidade e outras simetrias. Para validar nosso argumento central estudamos diversos sistemas de interesse e comparamos com os resultados na literatura.
Hamiltonians of Dirac type are ubiquitous. Appearing in materials such as graphene, topological insulators or recently in the Weyl semimetals. Due to the technological and academic interest of these materials, characterizing their properties is essential. A mathematical approach to study these systems consists of discretizing the Hamiltonian in the space of positions, but such an approach causes the problem of doubling fermions (FDP). We demonstrate the FDP should not be a cause of concern for the study of confined systems because we can use the broken symmetry to confine in the system to remove the duplicate states. Such removal is achieved by inserting a quadratic term with respect to the moment, known as the Wilson mass. In this sense we can insert a Wilson term with symmetry breaking required for confinement, rendering the fermion duplication problem irrelevant, this relationship had not been noticed until the present work, and recent literature results erroneously attribute Wilson’s mass to break of a symmetry of time reversal, which is not necessarily true. In this context, in addition to addressing this relationship, the present dissertation also aims to elucidate some misconceptions regarding the Wilson masses, chirality and other symmetries. In order to validate our central argument we study several systems of interest and compare it with the results in the literature.
Dissertação (Mestrado)

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RODRIGUES, Eduardo de Oliveira. « Avaliação do uso de processo Fenton e Foto-Fenton para tratamento de Terra Fuller contaminada com Óleo Mineral Isolante ». reponame:Repositório Institucional da UNIFEI, 2015. http://repositorio.unifei.edu.br:8080/xmlui/handle/123456789/475.

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O Óleo Mineral Isolante (OMI) é o principal isolante termo-elétrico empregado em transformadores de alta tensão. Este óleo é utilizado por longos períodos de tempo e quando suas propriedades são comprometidas este é regenerado, utilizando para isto um argilo-mineral adsorvente chamado terra Fuller. Dentre os compostos de degradação, encontram-se as bifenilas policloradas que são altamente carcinogênicas. Desta forma, após a terra Fuller estar saturada pelo óleo, deve ser substituída passando a ser em termos ambientais um poluente. O presente trabalho utilizou os processos Fenton e foto-Fenton para tratamento de terra Fuller contaminada com OMI. Nestes processos, a reação entre íons ferro e H₂O₂ gera radicais hidroxilas (agente altamente oxidante) os quais são responsáveis pela degradação dos compostos. Para avaliação da eficácia do processo utilizou-se a técnica de demanda química de oxigênio (DQO), óleos e graxas e carbono total, cromatografia à gás (CG-MS). As técnicas de Espectroscopia Vibracional no Infravermelho com Transformada de Fourier (FT-IR), Análise de Área Superficial (BET), Difração de Raios-X (DRX) e a Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV) foram utilizadas para avaliar a estrutura da terra Fuller pós tratamento. A terra Fuller contaminada apresentou 297,0 g Kgˉ¹ de DQO, 34% m/m de OMI, 35% m/m de carbono total e 64 mg de PCB por Kg de terra Fuller. Utilizando-se a técnica de planejamento experimental fatorial com 2 níveis e 4 variáveis, utilizando concentração de H₂O₂ (1,47 mol Lˉ¹ e 2,07mol Lˉ¹), Fe²⁺ (1,7mmol Lˉ¹ e 40,0 mmol Lˉ¹), pH (2,5 e 4,0), com radiação UVλmax=254nm e sem radiação foram realizados os ensaios de degradação. O tempo de reação foi de 24 horas e todos os experimentos foram feitos em triplicata. O experimento cujas concentrações foram H₂O₂ (1,47 mol Lˉ¹), Fe²⁺ (1,7 mmol Lˉ¹), pH (4,0), com radiação UVλmax=254 nm foi o mais eficaz com remoção de 60% da DQO, 20 % de Óleo e graxa e 21% de Carbono Total. Determinou-se 64 mg de PCB por Kg de terra Fuller contaminada, e pela legislação do estado de São Paulo (Lei nº 12.288), referente a resíduos contendo PCB, deve-se considerar esse resíduo como Resíduo Perigoso classe I e descartá-lo em aterro apropriado., Após o tratamento foto-Fenton nas condições citadas houve uma redução de 90% de PCB, resultando em 6,6 mg de PCB por Kg terra Fuller contaminada e pela mesma legislação essa terra Fuller tratada poderá ser destinada a aterros comuns. Os espectros vibracionais no Infravermelho, Difração de Raios X e Microscopia Eletrônica de Varredura confirmaram que não houve mudança na estrutura física da terra Fuller indicando que a recuperação e a regeneração é possível, também a análise de BET mostrou um aumento de 3,25 vezes da área superficial em relação à terra Fuller contaminada. Estes resultados indicam que o processo foto-Fenton se mostrou eficaz no tratamento de terra Fuller contaminada com OMI.

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Vasconcelos, Hugo Menezes do Nascimento. « Propriedades estruturais e magnéticas do isolante topológico Bi2Se3 com aglomerados de FexSey ». Universidade Federal de São Carlos, 2016. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/8122.

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Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-21T12:45:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseHMNV.pdf: 4404722 bytes, checksum: 1983a667805c061a711a3694028b17b0 (MD5)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
In this work, we discuss the growth of Fe containing Bi2 Se3epilayers on the GaAs(111) substrate by molecular beam epitaxy (MBE) with Fe contents of in the 8- 20% range. It is shown that Bi2 Se3 film thin are grown with quality and the Fe form a phase segregation of Fe x Sey material that may have different stoichiometries possibity, leading to magnetic and superconducting results. Despite the composite structure, the surface state of Bi2 Se3 is preserved as shown with persistence of Dirac Cone of the Γ point by Angle-Resolved Photoemission Spectroscopy (ARPES). It was observed that higher Fe content deposited is increased formation of compound responsible for ferrimagnetic layers together with the superconducting phase supposed. The Fe3Se 4 was the most abundant type of segregation in all samples, with the results ferrimagnetic these samples at temperatures around 315 K.
Neste trabalho, abordamos o crescimento de Bi2 Se3 com adição de Fe em substrato de GaAs(111) por meio de epitaxia de feixe molecular (MBE), variando o teor de Fe depositado de 8% até 20%. É mostrado que os filmes de Bi2 Se3 são crescidos com qualidade e o Fe juntamente com o Se formam uma segregação de fases Fex Sey , material que pode ter diferentes estequiometrias levando a resultados magnéticos e possivelmente supercondutor. Apesar da estrutura compósita, a estrutura superficial do Bi2 Se3 é preservada como mostrado pela persistência do cone de Dirac no ponto Γ nas medidas de espectroscopia de fotoemissão de resolução angular (ARPES). Foi possível observar que quanto maior o teor de Fe depositado, ocorre uma maior formação de compostos responsável pela fase ferrimagnética em conjunto com a fase supostamente supercondutora. O Fe3Se 4 foi o tipo de segregação mais abundante em todas as amostras, levando a resultados ferrimagnéticos nessas amostras em temperaturas em torno de 315 K.

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Silva, Lucas Henrique Fortaleza. « Avaliação da produção de fitotoxinas por actinobactérias isoladas da Caatinga ». Universidade de São Paulo, 2015. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59138/tde-14122015-145453/.

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Résumé :

Metabólitos secundários produzidos por actinobactérias são uma inesgotável fonte de compostos com potentes atividades biológicas e estruturas intrínsecas. O desenvolvimento em instrumentação analítica tem contribuído significantemente para acelerar o processo de identificação e caracterização desses metabólitos bioativos. Sem dúvida alguma, a espectrometria de massas (MS) e o seu acoplamento com técnicas de separação, especialmente a cromatografia líquida (UHPLC-MS), tem sido reconhecida como a técnica mais eficiente em análises de produtos naturais. Nesta dissertação foi explorado o potencial da espectrometria de massas como ferramenta analítica para a identificação e caracterização estrutural de fitotoxinas produzidas por actinobactérias isoladas da rizosfera de plantas da caatinga. Foram produzidos noventa extratos de actinobactérias, dos quais quinze apresentaram alguma atividade para o bioensaio da Lemna minor e seis apresentaram atividade para o bioensaio da Chlorella vulgaris. Os extratos brutos ativos das actinobactérias Caat 7-38, Caat 8-6 e Caat 5-29 foram selecionados para caracterização dos compostos ativos, os quais foram isolados empregando o fracionamento guiado por bioensaios. No extrato bruto Caat 7-38, a actinomicina D foi identificada como fitotoxina, ao passo que para o extrato bruto Caat 8-6, foi possível inferir a atividade fitotóxica à presença do griseorhodin A. Já para o extrato bruto Caat 5-29, o composto identificado com atividade fitotóxica apresenta uma estrutura inédita, provavelmente pertencente à classe das anguciclinonas. Foi realizado ainda um estudo para avaliar o efeito da adição de terras raras ao meio de cultivo da actinobacteria Caat 7-38. Para os meios de cultivos contendo neodímio e, principalmente, lantânio ocorreu uma superprodução da actinomicina D, indicando assim, o grande potencial da aplicação das terras raras nos estudos de micro-organismos.
Secondary metabolites produced by actinomycetes are an inexhaustible source of compounds with potent biological activities and intrinsic structures. The development analytical instrumentation has contributed significantly to accelerate the identification and characterization of these bioactive metabolites. Undoubtedly, mass spectrometry (MS) and its coupling with separation techniques, especially liquid chromatography (UHPLC-MS) has been recognized as the most \"efficient\" technique in natural product analysis. In this work was explored the potential of mass spectrometry as an analytical tool for identification and structural characterization of phytotoxins produced by actinomycetes isolated from the rhizosphere of plants from the Caatinga biome. Ninety actinomycetes extracts were produced, of which fifteen showed some activity for the bioassay with Lemna minor and six showed activity for the bioassay with Chlorella vulgaris. The crude active extract of actinomycetes Caat 7-38, Caat 8-6 and Caat 5-29 were selected to characterize the active compounds, which were isolated using bioassay-guided fractionation. In the crude extract Caat 7-38, actinomycin D was identified as phytotoxin, while for crude extract Caat 8-6, it was possible to infer phytotoxic activity to the presence of griseorhodin A. For the crude extract Caat 5-29, the compound identified with phytotoxic activity presents a new structure, probably belonging to the class of anguciclinones. A study to evaluate the effect of addition of rare earths to the culture medium of actinobacteria Caat 7-38 was also carried out. To the culture medium containing neodymium and especially lanthanum occurred overproduction of actinomycin D, thus indicating the great potential of application of rare earths in the studies of microorganisms.

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Anversa, Jonas. « Cálculos de primeiros princípios em isolantes topológicos : HgTe/CdTe ». Universidade Federal de Santa Maria, 2014. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/3927.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The observation of the quantum spin Hall effect in the HgTe/CdTe heterostructure triggered the study of materials exhibiting a spin polarized electronic current at their surfaces/ interfaces. These states are topologically protected against perturbations preserving time reversal symmetry and presenting a linear dispersion, forming a Dirac cone. However, non-magnetic perturbations (that preserve time reversal symmetry) will certainly affect these surface/interface states. In this work we user the density functional theory to characterize the topologically protected states of the (001) HgTe/CdTe heterostructure. We observed that for a correct description of the HgTe band structure we use a GGA+U method. The topological states showed a Rashba-like in-plane spin texture. We analyzed the effects of external pressures and electric fields in the HgTe/CdTe heterostructures. We show that these perturbations modify the energetics and dispersion of the protected states, although not destroying the topological phase. Also, we study defects like antisite, vacancy and a Fe magnetic impurity at the interface of the (001) HgTe/CdTe heterostructure. We show that the antisite and the vacancy do not affect the spin polarization nor the energy dispersion of the protected states. On the other hand, the magnetic impurity significantly affects the topological states, degrading the spin polarization for the states close to the magnetic impurity and inducing out-of-plane spin components. Further, we study the (001) HgTe surface for different thicknesses of the HgTe sample, and with different terminations (Hg and Te). To the (001) HgTe samples with a thickness of 38 Å , the spin polarized states do not show a linear dispersion, however, when the thickness is increased we observe the formation of spin-polarized surface states with linear dispersion, characterizing the formation of a Dirac cone. Also, we show that biaxial pressures modify the energy dispersion of the spin polarized states. Finally, we study materials that turn topological insulators under external pressures as the anti-perovskite structures Sr3BiN and Ca3BiN, using the self-consistent GW method. We show that these materials present an inversion of the Bi-pz and Bi-s band edge states when subjected to biaxial tensile stress. We conclude that these materials can be characterized Topological Insulators under pressure.
A observação do efeito Spin Hall Quântico na heteroestrutura HgTe/CdTe motivou o estudo de materiais que exibem uma corrente eletrônica spin-polarizada nas suas interfaces/ superfícies. Estes estados são topologicamente protegidos frente a perturbações que preservam a simetria de reversão temporal e apresentam uma dispersão linear formando um Cone de Dirac. Entretanto, perturbações não-magnéticas (que preservam a reversão temporal) irão certamente afetar estes estados de interface/superfície. Neste trabalho, usamos a Teoria do Funcional da Densidade (DFT), para caracterizar os estados topologicamente protegidos da heteroestrutura HgTe/CdTe (001), que é um Isolante Topológico (IT) 2D. Para uma descrição mais correta das posições dos níveis na estrutura de bandas do HgTe, nós usamos o método GGA+U. Na heteroestrutura, a caracterização dos estados topologicamente protegidos mostrou uma textura de spin no plano da interface, do tipo Rashba. Analisamos os efeitos de perturbações externas na heteroestrutura HgTe/CdTe (001), como pressões e campo elétrico. Mostramos que ambas perturbações modificam a energia do ponto de cruzamento e a dispersão dos estados protegidos, mas não destroem a fase topológica. Estudamos também a presença de defeitos na interface HgTe/CdTe (001), como um anti-sítio, uma vacância e uma impureza magnética de Fe. A presença de um anti-sítio e de uma vacância não afetam a polarização de spin dos estados protegidos e nem sua dispersão. Por outro lado, a presença de uma impureza magnética afeta significantemente estes estados, degradando a polarização de spin para os estados próximos a impureza magnética e fazendo que o sistema apresente componentes de spin fora do plano da interface/superfície. Além disso, estudamos a superfície de HgTe com diferentes espessuras (38, 64, e 129 Å ) e terminações (Hg e Te). Para as estruturas com uma espessura de 38 Å , os estados com polarização de spin não apresentam uma dispersão linear, entretanto, quando aumentamos a espessura do material, observamos a formação dos estados de superfície com uma dispersão linear e polarização de spin, caracterizando a formação do cone de Dirac. Mostramos também, que pressões biaxiais modificam a dispersão dos estados com polarização de spin. Realizamos um estudo de materiais que são Isolantes Topológicos quando submetidos a pressões externas. Neste caso estudamos as estruturas antiperovsquitas Sr3BiN e Ca3BiN, usando método GW auto-consistente. Mostramos que esses materiais apresentam uma inversão dos níveis de energia Bi-pz e Bi-s quando sujeitos a pressão externa biaxial distensiva. Concluímos que estes materiais podem ser caracterizados como Isolantes Topológicos sob pressão.

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Bellete, Barbara Sayuri. « Estudo fitoquímico de Conchocarpus marginatus (Rutaceae), e avaliação do potencial biológico dos compostos isolados ». Universidade Federal de São Carlos, 2013. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6561.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5349.pdf: 6996225 bytes, checksum: 58705c45ef0e50d30f35cd6392ce7c15 (MD5) Previous issue date: 2013-03-27
Financiadora de Estudos e Projetos
The specie Conchocarpus marginatus is native from Espírito Santo. This plant, that was recently reclassified by PIRANI e KALLUNKI, does not show chemical or biological data in literature yet. In this way, the phytochemical study of Co. marginatus described in this work, aim to contributed to chemosystematic of Rutaceae family, and a better classification of this genus in the family. The study allowed the isolation and identification of 12 substances, and were found mainly alkaloids derived from antranilic acid. They are: 2-phenyl-1- methyl-quinolin-4-one (11), 2-phenyl-1-methyl-7-methoxy-quinolin-4-one (12), 1-hydroxy-3-methoxy-N-metilacridone (6), Arborinine (7), Methyl-arborinine (8), 1-hydroxy-3,6-dimethoxy-N-metilacridone (10), 1,2,3,6-tetramethoxyacridone (9), 1,2,3,6-tetramethoxy-N-metilacridone (4) e 1-hydroxy-2,3,6- trimethoxy-N-metilacridone (5). The last four substances are new structures. Two different biological assays were performed with some isolated compounds. Assays in vitro of chlorophyll inhibition were performed in chloroplasts isolated from spinach leaves, aiming to found models to new photosynthesis inhibitor herbicides, by study of Chl a fluorescence. Substances isolated from Co. marginatus analysed in this assay were active, and the substance 9 was the most active in Chl a fluorescence measures. This result indicates that this molecule could damage the OEC complex and one of his action site is located in FSII, binding to Qa environment. In cytotoxic assays, the substance 6 is the more promising molecule against cancerígenas MCF-7 (breast adenocarcinoma), NCI-460 (non-small cell lung cancer) and A375-C5 (melanoma) cancer cells, showing respectively GJ50 values of 25, 20 e 22 μM.
A espécie Conchocarpus marginatus é nativa do Espírito Santo. Esta planta, que foi reclassificada em 1998 por PIRANI e KALLUNKI, ainda não apresenta dados químicos ou biológicos na literatura. Desta forma, o estudo fitoquímico de Conchocarpus marginatus descrito neste trabalho, visa contribuir com a quimiossistemática da família Rutaceae e também com a melhor classificação do gênero dentro da mesma. O estudo desta espécie levou ao isolamento e identificação de 12 substâncias, onde foram encontrados principalmente alcalóides derivados do ácido antranílico, sendo estes o 2-fenil-1-metil-quinolin- 4-ona (11), 2-fenil-1-metil-7-metoxi-quinolin-4-ona (12), 1-hidroxi-3-metoxi-Nmetilacridona (6), Arborinina (7), Metil-arborinina (8), 1-hidroxi-3,6-dimetoxi- N-metilacridona (10), 1,2,3,6-tetrametoxi-acridona (9), 1,2,3,6-tetrametoxi-Nmetilacridona (4) e 1-hidroxi-2,3,6-trimetoxi-N-metilacridona (5). Destes, os quatro últimos alcalóides acridônicos citados são estruturas novas. Dois diferentes ensaios biológicos foram realizados com alguns dos compostos isolados. Com o objetivo de se encontrar modelos para novos herbicidas inibidores da fotossíntese, foram realizados ensaios in vitro de inibição da fotossíntese, em cloroplastos isolados das folhas de espinafre, através do estudo de fluorescência da Clorofila a (Chl a). As substâncias isoladas de Conchocarpus marginatus testadas frente a este ensaio se mostraram todas ativas, sendo a substância 9 a que se apresentou potencialmente mais ativa nas medidas de fluorescência Chl a. Esse resultado indica que esta causaria dano ao complexo OEC e um de seus sítios de ação está localizado sobre o FSII, prendendo-se ao ambiente de QA. Nos ensaios citotóxicos, a substância 6 se apresentou como a mais promissora contra as células cancerígenas MCF-7 (adenocarcinoma da mama), NCI-460 (câncer de pulmão) e A375-C5 (cancro de melanoma), apresentando valores de GI50 de 25, 20 e 22 μM, respectivamente.

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Cerqueira, Cristovam do Nascimento. « Estudo fitoquímico e quimiossitemático de Galipea, Swinglea (Rutaceae) e avaliação do potencial biológico dos compostos isolados ». Universidade Federal de São Carlos, 2011. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6582.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5773.pdf: 28798119 bytes, checksum: 8969d15b0ac7fba98e30be9b2199c2e7 (MD5) Previous issue date: 2011-06-07
Financiadora de Estudos e Projetos
The Galipea genus species classifications has been confuse since genus classification. Showing no agreement among taxonomists in several classification systems since 1823. However, Kallunki & Pirani corrected errors exist in the ancient botanical classification reclassify several species of Galipeas like Conchocarpus or Angostura. Thus, it was chosen a specie of Galipea (G. carinata) and one Angostura (A.bracteata) which previously belonged to Galipea in order to evaluate a possible parallelism between the classification proposed by Kallunki & Pirani with the chemical profile of the species studied. The phytochemical studies of the A. bracteata and G. carinata no led to the isolation of the secondary metabolites, though the research literature shows a relation of parallelism between the botanical classification based on morphology of species of the genus with the same chemical this one, but this relationship was only apparent when you compare the already isolated Conchocarpus s alkaloids with those of Angostura, where it was discovered that the alkyl and alquilarilquinolinicos alkaloids present in Angostura, are absent in Conchocarpus. In turn, the acridones and indolquinazolínicos alkaloids found in Conchocarpus were not observed in Angostura. The comparison of the aforementioned genres with Galipea was not discussed due to the few reported alkaloid (2-quinolone) for the species of this genus can not be classified as this specific. The Swinglea glutinosa, a species native to Asia, possesses many reports acridones alkaloids and coumarins isolated from its fruit, stem and roots, but these metabolites are reported from polar extracts, thus having no knowledge whatsoever of metabolites of low polarity. This work is also aimed at expanding the knowledge of the chemical profile of this species. The phytochemical study of S. glutinosa led to the isolation of two triterpenes: 3α-Hidroxiglutin-5-ene (08) and friedelin (09), a diterpene (2Z)-2-methyl-[2,5,5,8 a-tetrametildecaidronaftalen-1-yl] but-2-en-1-ol (07), two steroids, sitosterol (10) and stigmasterol (11), a flavanone: pinostrobine (07) and three amides: N-benzoiltiramida (01), N-{2 - [4 - (3-oxobutoxyl) phenyl] ethyl} benzamide (02), 2 (E) N-methyl-fenilacrilamide (05), the latter being new in the literature. The amide N-{2 - [4 - (2,3-dihydroxy-3-methyl-4-oxobutoxyl) phenyl] ethyl} benzamide (03) and carboxylic acid (04) acid 4 - {4 - [2 - (benzoilamino ) ethyl] phenoxyl} -2.3-dihydroxy-2-methylbutanoic was identified by GC-MS, where these two metabolites enhance the biogenesis of novel amide via O-prenylation then the loss due to carbon dioxide in several oxidations methyl terminal. Some of the compounds have their biological activity by testing tested against the Guignardia citricarpa of growth either in vitro mycelial where only the substance (08) showed an inhibition of about 50% and substance (07) stimulated the growth of the fungus. In the inhibition test of germination and appressorium formation, which evaluates the inhibition of fungal reproductive structure that is the main way of infection, the substance (08) showed an inhibition of 93.5% and 96.5% germination and training appressoria, respectively. The substance (02) inhibited 90.5% and 94.5% germination in appressorium formation. Thus, this work took place some fungicidal compounds with potential to control the fungus G. citricarpa.
A classificação das espécies do gênero Galipea tem sido confuso desde a descrição do gênero, não mostrando concordância entre os taxonomistas em vários sistemas de classificação desde 1823. Contudo Kallunki & Pirani retificaram os erros existentes nas antigas classificações botânicas reclassificando varias espécies de Galipea como Conchocarpus ou Angostura. Desta forma, foi escolhida uma espécie de Galipea (G. carinata) e uma de Angostura (A.bracteata) que antes pertencia à Galipea no intuito de avaliar um possível paralelismo entre a classificação proposta por Kallunki & Pirani com o perfil químico das espécies estudadas. Os estudos fitoquimicos de A. bracteata e G. carinata não levaram o isolamento de metabólitos sencudários, entretanto o levantamento bibliográfico mostrou uma relação de paralelismo entre a classificação botânica baseada na morfologia das espécies do gênero com o perfil quimico das mesmas. Contudo, essa relação só foi evidenciada ao se fazer a comparação dos alcaloides já isolados da Conchocarpus com aqueles de Angostura, em que se averiguou que os alcaloides alquil- e alquilarilquinolinicos presentes na Angostura, encontravam-se ausêntes em Conchocarpus. Por sua vez, os alcaloides acridônicos e indolquinazolínicos encontrados em Conchocarpus não eram observados em Angostura. A comparação dos gêneros supracitados com Galipea não foi discutido devido aos poucos alcaloides relatados (2-quinolona) para as espécies desse gênero não podendo ser classificado como específico desta. A Swinglea glutinosa, espécie nativa da Ásia, possue muitos relatos na literatura de alcaloides acridônicos e cumarinas isoladas de seus frutos, tronco, e raízes, entretanto esses metabólitos relatados são provenientes de extratos polares, não possuindo assim conhecimento algum de metabólitos de baixa polaridade. Assim, neste trabalho também se objetivou ampliar o conhecimento do perfil químico dessa espécie. O estudo fitoquímico da S. glutinosa levou ao isolamento de dois triterpenos: 3α-Hidroxiglutin-5-eno (08) e friedelina (09); um diterpeno: (2Z)-2-metil-[2,5,5,8a-tetrametildecaidronaftalen-1- il]but-2-en-1-ol (07); dois esteroides: sitosterol (10) e estigmasterol (11); uma flavanona: pinostrobina (07); e três amidas: N-benzoiltiramida (01); N-{2-[4-(3- oxobutoxil)fenil]etil}benzamida (02); 2(E)N-metil-fenilacrilamida (05), sendo a última inédita na literatura. A amida N-{2-[4-(2,3-diidróxi-3-metil-4- oxobutoxil)fenil]etil}benzamida (03) e o ácido carboxílico (04) ácido 4-{4-[2- (benzoilamino)etil]fenoxil}-2,3-diidróxi-2-metilbutanóico foram identificados via CGEM, onde estes dois metabolitos reforçam a biogênese da amida inédita via Oprenilação seguida a perda de dióxido de carbono devido às varias oxidadações na metila terminal. Alguns dos compostos isolados tiveram sua atividade biológica avaliada frente à Guignardia citricarpa pelo ensaio de crecimento micelial in vitro onde apenas a substância (08) apresentou uma inibição de cerca de 50% e a substância (07) estimulou o crescimento do fungo. No ensaio de inibição da germinação e formação de apressórios, que avalia a inibição da estrutura reprodutiva do fungo que é a principal forma de infeção, a substância (08) apresentou uma inibição de 93,5% na germinação e 96,5% na formação de apressórios, respectivamente. A substância (02) inibiu 90,5 % na germinação e 94,5% na formação de apressórios. Sendo assim, neste trabalho verificou-se alguns compostos com potencial fungistático no controle do fungo G. citricarpa.

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Pace, Rafael Domingues Della. « Estudo de junções túnel magnéticas com barreiras isolantes piezoelétricas de AlN ». Universidade Federal de Santa Maria, 2015. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/3929.

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Résumé :

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
We analyze the possibility of using aluminum nitride (AlN) as a piezoelectric tunnel barrier in magnetic or non-magnetic tunnel junctions. Samples in the form of monolayers, bilayers, multilayers and tunnel junctions were produced by magnetron sputtering from an aluminum metal target. The insulating AlN barrier was grown in a reactive atmosphere of argon and nitrogen. Through the monolayers and bilayers we investigated the growth conditions of AlN onto different substrates, buffer, and cap layers. Using x-ray diffraction and transmission electronic microscopy it was possible to verify the excellent degree of texturing of AlN films with the direction <002> perpendicular the substrate plane. The multilayer showed that the use of AlN as a piezoelectric tunnel barrier is feasible, since the crystallographic structure remains when the thickness of the AlN is drastically reduced to a thickness so that quantum tunneling is possible. We also held magnetization measurements and tunnel magnetoresistance in magnetic tunnel junctions. It is important that the coercive fields of the electrodes are different, so that from the application of an external field can be obtained a situation where the magnetization of the electrodes point in opposite directions. The average thickness of the tunnel barrier in multilayers and tunnel junctions were obtained by x-ray diffraction and transmission electron microscopy. The nonlinear IxV curves of tunnel junctions were measured at room temperature and at lower temperatures, and showed a linear behavior at low voltages, and a nonlinear behavior for higher voltages. Measurements of tunnel magnetoresistance showed spin dependent tunneling. Simulations using the Simmons model for symmetric barrier allowed us to obtain the effective area of tunneling, effective thickness of the barrier, and the height of the barrier. Effective area values are some orders of magnitude smaller than the actual area of the junctions, and transmission electron microscopy pictures show that the tunnel transport occurs at some hot spots. In the measurements of the IxV curves we observe a minimum thickness of 6nm for the insulating barrier to be piezoelectric, as the polarization effect was detected. The curves have a shift to negative bias, both in magnetic and non-magnetic tunnel junctions. Using the results of the simulation we verified the exponential pattern of resistance, normalized by the effective area of tunneling, depending on the thickness of the insulator. For effective barrier thickness above 1nm, the barrier height increases with insulator thickness, as expected. For barrier thickness between 0;8 and 1nm, there is a decline in barrier height. We have not found recorded in the literature this type of behavior for normal insulating systems or for piezoelectric materials.
Nesta tese analizamos a possibilidade do uso de nitreto de alumínio (AlN) como barreira túnel piezoelétrica em junções túnel magnéticas ou não magnéticas. Amostras na forma de monocamadas, bicamadas, multicamadas e junções túnel foram produzidas pela técnica de "magnetron sputtering"a partir de um alvo metálico de alumínio. A barreira isolante de AlN foi crescida em uma atmosfera reativa de argônio e nitrogênio. Através das monocamadas e das bicamadas investigamos as condições de crescimento do AlN sobre diferentes substratos, e camadas "buffer"e camadas "cap". Utilizando difração de raio-x e microscopia eletrônica de transmissão foi possível verificar o excelente grau de texturização dos filmes de AlN com a direção <002> perpendicular ao plano do substrato. As multicamadas mostraram que a utilização do AlN como barreira túnel piezoelétrica é viável, pois a estrutura cristalográfica se mantém quando a espessura do AlN é drasticamente reduzida até uma espessura que ocorra o fenômeno de tunelamento quântico. Também foram realizadas medidas de magnetização e de magnetorresistência túnel em junções túnel magnéticas. Nestas, é importante que os campos coercivos dos eletrodos sejam diferentes, para que a partir da aplicação de um campo externo seja possível obter uma situação onde os momentos magnéticos dos eletrodos apontem em sentidos contrários. A espessura média da barreira túnel nas multicamadas e junções túnel foram obtidas através de difração de raio-x e de microscopia eletrônica de transmissão. As curvas IxV não lineares das junções túnel foram medidas a temperatura ambiente e a baixa temperatura, e apresentaram um comportamento linear a baixas tensões e uma relação não linear para tensões mais elevadas. Para a realização de simulações foi utilizado modelo de Simmons para barreira simétrica. Os parâmetros obtidos através deste modelo são, a área efetiva de tunelamento Se f , a espessura efetiva da barreria te f e a altura da barreira f0. Através da observação dos resultados da área efetiva que são algumas ordens de grandeza menores que a área real da junção, e das imagens de microscopia eletrônica de transmissão podemos afirmar que o transporte túnel se dá por "hot spots". Nas medidas das curvas IxV observamos uma espessura mínima de 6nm para a barreira isolante piezoelétrica onde o efeito de polarização foi detectado. As curvas sofrem um deslocamento para tensões negativas, isto ocorre tanto nas junções túnel magnéticas como nas não magnéticas. Utilizando os resultados dos ajustes foi possível verificar o caráter exponencial da resistência, normalizada pela área efetiva de tunelamento, em função da espessura do isolante. Para espessura efetiva da barreira, a partir de 1nm, a altura da barreira aumenta com a espessura do isolante. Resultado este esperado, mostrando uma tendência do crescimento da altura da barreia com a espessura. Para espessura de barreia entre 0;8 e 1nm, há presença de um declínio na altura da barreira. Não encontramos registro na literatura deste tipo de comportamento para sistemas isolantes normais nem para materiais piezoelétricos. Medidas de magnetorresistência túnel nas junções mostraram que o tunelamento é dependente de spin.

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Feresin, Fábio. « Desenvolvimento de compósito de poliuretano reforçado com nanofibrilas de celulose isoladas de candeia (Eremanthus erythropappus) ». Universidade Federal de São Carlos, 2016. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/7397.

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Submitted by Caroline Periotto (carol@ufscar.br) on 2016-09-21T13:32:42Z No. of bitstreams: 1 TeseFFdc.pdf: 5494642 bytes, checksum: 28556e90039888184ade6e821652fa63 (MD5)
Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-23T18:25:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseFFdc.pdf: 5494642 bytes, checksum: 28556e90039888184ade6e821652fa63 (MD5)
Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-23T18:25:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseFFdc.pdf: 5494642 bytes, checksum: 28556e90039888184ade6e821652fa63 (MD5)
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Não recebi financiamento
Candeia (Eremanthus erythropappus) is an important raw material due to the essential oil that can be extracted from the whole tree. The essential oil contains (-)--bisabolol that has an active principle with pharmacological properties with wide range of use in pharmaceutical and cosmetic industries. The extraction process of essential oil produces a large quantity of wood residue that only a small portion as reused. New Developments to provide feasible alternative applications for the remaining portion of wood residue make exploration process of candeia more rentable and sustainable. Cellulose was isolated from that wood residue of candeia by wet chemistry. Further processing with an ultrafine high shear grinder the bleached cellulose pulps, with and without 2,2,6,6-tetramethylpiperidine-1-oxyl (TEMPO) treatment, were led to the disruption of cell walls into nanofibrils. In the present study cellulose nanofibrils (NFC) isolated from wood residue of candeia were applied as additive for a waterborne polyurethane-based wood coating in order to improve the mechanical resistance. Coating suspensions containing up to 12 wt% were prepared by mechanical mixing. The addition of cellulose nanofibers to waterborne polyurethane demonstrated the enhancement of mechanical properties. The better mechanical performances were achieved for composites with a nanofibrils amount of 8 wt% and 12 wt%. Overall the mechanical properties were increased over 40%. Additionally, the nanofibrils have acted as a rheological modifier at the waterborne coating. Cinematic viscosity increased as increased the amount of NFC. As noticed on mechanical properties behavior the effect of nanofibrils content on the viscosity is more efficient with values of 8 wt% and 12 wt%.
A Candeia (Eremanthus erythropappus) é uma importante matéria-prima devido ao óleo essencial que pode ser extraído de toda parte da árvore. O óleo essencial contém (-)--bisabolol, substância com propriedades farmacológicas de uso nas indústrias farmacêuticas e de cosméticos. O processo de extração do óleo essencial produz uma grande quantidade de resíduo de madeira da qual somente uma pequena fração é reutilizada como fonte de energia no próprio processo produtivo. Novos desenvolvimentos para viabilizar aplicações alternativas da fração remanescente deste resíduo tornam o processo de exploração da candeia mais rentável e sustentável. A celulose usada neste estudo foi isolada do resíduo de candeia por processo químico via úmida. Posteriormente, por refino em moinho de alto cisalhamento, a polpa de celulose, com e sem tratamento com reagente 2,2,6,6-tetrametilpiperidino-1- oxilo (TEMPO), foi desfibrilada para obtenção de nanofibrilas. Neste estudo as nanofibrilas de celulose isoladas do resíduo de candeia foram utilizadas como aditivos em poliuretano disperso em água, que é utilizado comercialmente como base em formulações de vernizes e tintas com o objetivo de melhoria da resistência mecânica do verniz. Dispersões da resina contendo até 12% em massa de nanofibrilas na película seca foram preparadas por mistura mecânica. A adição de nanofibrilas de celulose na resina de poliuretano a base de água demonstrou melhoras em suas propriedades mecânicas (tensão e alongamento na ruptura e módulo elástico). Os melhores desempenhos mecânicos foram atingidos com o conteúdo de 8% e 12% em massa de nanofibrilas. De forma geral, as propriedades mecânicas foram aumentadas no mínimo 40% em relação à resina base. Adicionalmente, a nanofibrila de celulose agiu como modificador reológico na dispersão aquosa. A viscosidade cinemática aumentou em função do aumento da concentração de nanofibrilas de celulose. Como verificado no comportamento mecânico, o efeito da concentração de nanofibrilas na viscosidade também foi mais eficiente com níveis de 8% e 12% em massa da película seca.

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Furlan, Bianca [UNESP]. « Biodegradação de naftaleno, fenantreno e diesel por isolados do gênero Burkholderia da Amazônia ». Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2011. http://hdl.handle.net/11449/95001.

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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-03-29Bitstream added on 2014-06-13T18:31:32Z : No. of bitstreams: 1 furlan_b_me_rcla.pdf: 3556255 bytes, checksum: b8dadd1a50eb8caa4d6eb51e31dc8f1e (MD5)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
O gênero Burkholderia compreende um grupo de bactérias muito diversificado, ocupando vários nichos ecológicos e possui espécies que causam doenças, mas outras espécies apresentam habilidades importantes para os ramos da agricultura, biotecnologia e do ambiente, como a biodegradação. Essas bactérias são morfologicamente semelhantes e o gênero está dividido em dezessete genomovars, onde espécies semelhantes geneticamente são agrupadas, formando o Complexo Burkholderia cepacia (CBC). Por meio de estudos moleculares do gene 16S rRNA e do gene recA foi possível fazer a classificação adequada em espécies dos 450 isolados obtidos da Terra Preta Antropogênica (TPA) e adjacentes, em quatro sítios (TPA Caldeirão Cultivado; TPA Caldeirão Capoeira; TPA Hatahara e TPA Mina-I), foram obtidos 177 isolados do gênero Burkholderia. Desses isolados, pela análise do gene 16S rRNA foi possível classificar 157 isolados ao nível de espécie e pela análise do gene recA somente 105 isolados foram classificados neste mesmo nível. Esses isolados foram utilizados no teste de biodegradação dos hidrocarbonetos. Os hidrocarbonetos poliaromáticos (HPAs) são compostos orgânicos resultantes da combustão incompleta da matéria orgânica e dos derivados de petróleo, são pouco solúveis em água e muito tóxicos para as células, por isso, não são metabolizados por muitos micro-organismos e acabam contaminando e inviabilizando os ambientes. Nos testes de biodegradação os substratos utilizados foram o naftaleno, o fenantreno e o diesel, juntamente com o indicador redox 2,6- diclorofenol-indofenol (DCPIP), que sofre descoloração (de azul para incolor) quando as células utilizam os substratos como fonte de carbono para o crescimento celular, gerando elétrons que vão reduzir o indicador. Pela análise do teste, 19 isolados degradaram o naftaleno, 16 degradaram...
The genus Burkholderia comprises a very diverse group of bacteria occupying various ecological niches and has species that cause disease, but other species have important skills to the branches of agriculture, biotechnology and the environment, as biodegradation. These bacteria are morphologically similar genus and is divided into seventeen genomovars, where genetically similar species are grouped together, forming the Burkholderia cepacia complex (BCC). Through molecular studies of 16S rRNA and recA gene was possible to make the appropriate classification of species in 450 isolates of Terra Preta Antropogênica (TPA) and adjacent at four sites (TPA Caldeirão Cultivado; TPA Caldeirão Capoeira; TPA Hatahara e TPA Mina-I) were obtained 177 isolates of the genus Burkholderia. These isolates by 16S rRNA gene analysis was possible to classify 157 isolates to species level and the recA gene analysis only 105 isolates were classified in the same level. These isolates were used to test the biodegradation of hydrocarbons. Polyaromatic hydrocarbons (PAHs) are organic compounds resulting from incomplete combustion of organic matter and petroleum derivatives, are not very soluble in water and very toxic to cells, therefore, are not metabolized by many microorganisms to contaminate and render environments. In biodegradation tests the substrates used were naphthalene, phenanthrene and the diesel, along with the redox indicator 2,6- dichlorophenol-indophenol (DCPIP), who suffers discoloration (blue to colorless) when cells use the substrates as a source of carbon for cell growth, generating electrons that will reduce the indicator. By analysis of the test, 19 isolates degraded naphthalene, phenanthrene degraded the 16 and 126 degraded diesel, generating a total of 132 isolates of the genus Burkholderia that have the ability to degrade at least... (Complete abstract click eletronic access below)

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Medeiros, Lívia Soman de. « Prospecção química do metabolismo de fungos endofíticos isolados de maçã (Malus domestica) e goiaba (Psidium guajava) ». Universidade Federal de São Carlos, 2014. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6330.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Retido.pdf: 19733 bytes, checksum: 6aad255badc436a06364517de2344ab6 (MD5) Previous issue date: 2014-10-31
Universidade Federal de Minas Gerais
Few studies are targeted concerning the chemistry of the secondary metabolism from endophytic fungi associated to edible fruits. In this sense, it is worth to explore the the microbial metabolic skills, particularly from the fungi species naturally present in this host, since a plethora of compounds from different biossintetic groups with diverse bioactivities may have been directly introduced to human diet. Therefore, the aim of the work encompassed the chemical and metabolic investigation of the fungus isolated from sympthomless apple fruits, the specie Talaromyces rugulosus, as well as the fungus Setophoma sp. isolated from healthy guava fruits. The study was based on the chemical prospecting of the fungal metabolism by means of OSMAC approach. In this step, besides the screening of known metabolites, the investigation was carried out in order to encounter new natural products biossintetized by the studied strains. Aiming to reach a fast and effective dectection, the UHPLC-HRMS based dereplication combined to dedicated database queries was extensively applied. The use of these integrated approaches allowed the establishment of a broad chemical profile owned to each microorganism and has led to the identification of seven new depsides produced by Setophoma sp. and novel halogenated alkaloids by T. rugulosus through spectroscopic data, chiefly NMR and HRMS-MS. In addition to these results, the induction of known perilenequinones produced by Setophoma sp. strain was observed when it was submitted to the co-cultive with other fungi species. Some of the novel poliketides showed moderate antimicrobial activity against S.aureus, while the perilenequinones comprised a seeming inhibition of some tested Penicillium species. Concerning T. rugulosus, it was also verified if the fungus showed to be skillfull in biotransformations of compounds naturally owned to apples chemical composition, such as flavonoids and organic acids. Whereas any product from this proposal was detected, a remarkable production of multicolanic acid was observed by the use of the tested substrates into the culture medium, suggesting a likely marker for this specie. Finally, taking into account the fact that fruits represent a rich source of nutrients for its associated microbial inhabitants, it is worth to consider that secondary metabolites biosynthesis in loco be favoured. Therefore it was proposed the monitoring of the most common metabolites produced by T. rugulosus into commercial apple extracts. The detection study was carried out by UHPLC-MS/MS via dynamic MRM experiments, which allowed the detection of compounds potentially produced by the fungus in the evaluated apple extracts.
Poucos são os estudos dirigidos aos fungos endofíticos associados a frutos comestíveis no que tange a química do metabolismo secundário destes organismos. Neste sentido, esforços para o melhor conhecimento com relação à capacidade metabólica da microbiota fúngica existente nestes hospedeiros são relevantes já que, compostos das mais diversas classes biossintéticas e bioatividades podem ser potencialmente incorporados diretamente à dieta humana. Portanto, a proposta do trabalho envolveu a exploração química e metabólica de fungos isolados a partir de frutos saudáveis de maçã, a espécie Talaromyces rugulosus e a espécie Setophoma sp., isolada de goiaba. O estudo baseou-se na prospecção química do metabolismo fúngico aplicando-se a abordagem OSMAC. Neste enfoque, além do screening de compostos conhecidos, a investigação foi direcionada ao encontro de novos produtos naturais biossintetizados pelas espécies. Para uma detecção rápida e eficaz, a metodologia de derreplicação via UHPLC-HRMS e consultas a bancos de dados comerciais e in house foi amplamente utilizada. A prática destas abordagens integradas permitiu o estabelecimento do perfil químico inerente a cada micro-organismo o que conduziu à identificação de sete novos depsídeos produzidos por Setophoma sp. e novos alcaloides halogenados por T. rugulosus através de dados espectroscópicos de RMN e de HRMS-MS. Pela mesma abordagem, também houve o conhecimento sobre a indução da produção de conhecidas perilenequinonas por Setophoma sp. quando em co-cultivo a outras espécies fúngicas. Alguns dos novos policetídios isolados deste micro-organismo apresentaram moderata atividade antimicrobiana frente à bactéria S.aureus, enquanto que a perilenequinona estenfiperilenol, demonstrou aparente inibição ao crescimento de espécies do gênero Penicillium. A capacidade do sistema enzimático de T. rugulosus em biotransformar substratos naturais à composição dos frutos de maçã, como alguns ácidos orgânicos e flavonóides também foi avaliada. Não foram detectados produtos de biotransformação, porém constatou-se alta indução metabólica de ácido multicolâncio pela ação dos substratos testados, evidenciando um possível marcador da espécie quando em estresse ambiental. Por fim, considerando-se os frutos uma rica fonte nutricional à microbiota ali existente, podendo favorecer a biossíntese de metabólitos secundários in loco por estes organismos, foram monitorados alguns compostos comumente produzidos por T. rugulosus nos meios de cultura avaliados (que mimetizam o habitat natural microbiano. Através das técnicas analíticas de UHPLC-MS/MS via experimentos de MRM dinâmico, foram detectados dois metabólitos potencialmente produzidos por T. rugulosus nos extratos de maçãs comerciais avaliados.

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Alves, Clayton Queiroz. « Flavonóides antioxidantes e derivados de ácido gálico isolados de cenostigma gardnerianum tul. (leguminosae) ». Programa de Pós-Graduação em Química da UFBA, 2007. http://www.repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/9995.

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Submitted by Edileide Reis (leyde-landy@hotmail.com) on 2013-04-23T11:32:04Z No. of bitstreams: 1 Clayton.pdf: 1700881 bytes, checksum: bef0a31461056b467bc6eb1389d5bdf6 (MD5)
Made available in DSpace on 2013-04-23T11:32:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Clayton.pdf: 1700881 bytes, checksum: bef0a31461056b467bc6eb1389d5bdf6 (MD5) Previous issue date: 2007
Este trabalho descreve o estudo fitoquímico dos extratos polares de Cenostigma gardnerianum Tul., além da realização de ensaios de avaliação antioxidante das substâncias isoladas. O gênero Cenostigma pertence à família Leguminosae e compreende quatro espécies, sendo três delas endêmicas do Brasil. Das espécies conhecidas, apenas uma apresenta estudo químico preliminar. C. gardnerianum é conhecida popularmente como “canela-de-velho” ou “catingueira”, e pode ser encontrada no cerrado e caatinga baianos. Esta espécie é utilizada como forrageira podendo, portanto, ser empregada na alimentação de animais, constituindo assim uma importante fonte de recursos para o homem do sertão, principalmente em época de secas. Utilizando-se métodos cromatográficos usuais (CC, CCDC em sílica, poliamida e permeação em gel de Sephadex), do extrato AcOEt das folhas de C. gardnerianum foram isoladas o Ácido gálico, Galato de metila e o Ácido elágico. Foram isolados, ainda deste extrato, os flavonóides: Quercetina; Quercetina-3-O-S Dglicopiranosídeo; Quercetina-3-O-(6’’-O-galoil)-S-D-glicopiranosídeo; Quercetina-3-O-(6’’-O-E-p-cumaroil)-S-D-glicopiranosídeo; Agathisflavona e Vitexina. Do extrato clorofórmico das folhas foi isolada a Escoparona. Do extrato AcOEt das cascas do caule foi isolado um novo derivado do ácido gálico, caracterizado como Galato de metila-2-C-S-Dglicopiranosídeo, uma substância rara nesta classe de compostos. As estruturas das substâncias isoladas foram elucidadas através da análise dos dados obtidos pelos dados de EM, de RMN de 1H , 13C e DEPT, além de técnicas bidimensionais (HMBC e HMQC). Os testes de atividade antioxidante, in vitro, utilizando as metodologias da co-oxidação do S-caroteno/ácido linoleico e do seqüestro do radical estável DPPH, demonstraram que as substâncias Quercetina-3-O-S-D-glicopiranosídeo e Quercetina-3-O-(6’’-O-galoil)-S-Dglicopiranosídeo apresentaram excelente atividade, enquanto que a Quercetina-3-O-(6’’-O-Ep-cumaroil)-S-D-glicopiranosídeo apresentou atividade moderada, e as substâncias Agathisflavona e Galato de metila-2-C-S-D-glicopiranosídeo apresentaram baixa ou nenhuma atividade, respectivamente.
Salvador

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Santos, Regina Maria Geris dos. « Metabolismo secundário dos fungos Penicillium sp e Fusarium moniliforme isolados como endofíticos de Melia azedarach (Meliaceae) ». Universidade Federal de São Carlos, 2003. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6068.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DoutRMGS.pdf: 15258875 bytes, checksum: b9c0d83986b9c6afa772cbed4e891474 (MD5) Previous issue date: 2003-11-21
From healthy tissues of M. azedarach, 59 isolates of endophytic fungi were obtained, representing eight genera (one Ascomycetes, one Basidiomycetes and six Hyphomycetes). Genera Aspergillus and Penicillium were the most found in this present study. Extracts of two fungal strains, Penicillium sp e Fusarium moniliforme were investigated chemically. This investigation resulted in the isolation of 34 pure compounds. Three were obtained from F. moniliforme: two depsidipeptides (bassiatin and a new natural product) and the ergosterol peroxide. From the Penicillium sp were isolated 10 novel meroterpenes (preaustinoid A, preaustinoid B, preaustinoid A2, preaustinoid A1, austinolide, preaustinoid B1, isoaustinone, austinoneol, preaustinoid B2, and preaustinoid A3), three known meroterpenes(acetoxydehydroaustin, dehydroaustin, and neoaustin). The other two meroterpenes are still to be identified. In addition, it has been found five lignans compounds (two were identified as novel natural products), six alkaloids (three of them identified as verruculogen, Tr-2 and its isomer), two lactones derivatives (penicillic acid and dehidropenicillic acid), one nucleoside (uridine) and two poliols (eritritol and mannitol). Some extracts and fractions from these two microorganisms were submitted to biological assays (antibacterial and insecticidal). The meroterpene dehydroaustin showed a great insecticidal activity against the mosquito Aedes aegyptii. An analytical strategy, based on liquid-chromatography-mass spectrometry hyphenation was established for the comparison of the secondary metabolites composition of the host plant and the fungus Penicillium sp. This methodology had the meroterpenes and limonoids from M. azedarach as targets in order to compare the metabolism between these two associated organisms. Liquid chromatography-mass spectrometry methodology allowed the standard meroterpenes identification in the extracts derived from this microorganism cultivated on rice and maize, as well as, other metabolites, verruculogen, uridine and a new lignan. Gas chromatography-mass spectrometry analysis supplied the apolar constituents identification of the fungus on distinct substrates. Biogenetics studies involving molecular biology related to meroterpenes were carried out using the tetraketide precursor 3,5 dimethyl orsellinic acid. As a result of this, were found three related genes to polyketides (non-reduced, partially reduced, and highly modified) and C-methyltransferase gene. It suggests a relationship between these genes and the meroterpenoid production. Further studies should be carried out in order to investigate this relation.
Dos tecidos sadios de M. azedarach foram obtidos 59 isolados de fungos endofíticos, representando oito gêneros (um Ascomycetes, um Basidiomycetes e seis Hyphomycetes), sendo Aspergillus e Penicillium os mais encontrados neste estudo. Os extratos de dois fungos, Penicillium sp e Fusarium moniliforme foram investigados quimicamente. Essa investigação resultou no isolamento de 34 compostos. Três deles foram obtidos de F. moniliforme: dois depsidipeptídeos (bassiatina e um novo produto natural) e o peróxido de ergosterol. Dos extratos de Penicillium sp foram isolados 10 meroterpenos de estruturas inéditas (preaustinóide A, preaustinóide B, preaustinóide A2, preaustinóide A1, austinolídeo, preaustinóide B1, isoaustinona, austinoneol, preaustinóide B2 e preaustinóide A3), três já descritos na literatura (acetoxidehidroaustina, dehidroaustina e neoaustina) e dois meroterpenos em identificação. Também foram isoladas cinco lignanas (duas foram identificadas como novos produtos naturais), seis alcalóides (três identificados como verruculogenina, TR-2 e seu isômero), duas lactonas (ácido penicílico e ácido desidropenicílico), um nucleosídeo (uridina) e dois polióis (eritritol e manitol). Alguns extratos e frações desses dois microrganismos foram submetidos a ensaios biológicos (antibacteriano e inseticida) e o meroterpeno dehidroaustina destacou-se por sua atividade contra as larvas do mosquito Aedes aegyptii. Outros estudos paralelos foram realizados com o fungo Penicillium sp, como o desenvolvimento de metodologias de análises por técnicas hifenadas a espectrometria de massas para a análise dos extratos oriundos do cultivo para averiguação da produção dos metabólitos secundários frente a um determinado substrato. Os métodos utilizando cromatografia líquida acoplada a espectrometria de massas permitiram a identificação dos meroterpenos utilizados como padrões, bem como os metabólitos verruculogenina, uridina e a lignana nos extratos desse microrganismo cultivado em arroz e milho. Adicionalmente foi realizado o estudo dos limonóides nos extratos a partir dos tecidos de M. azedarach por estas metodologias, com o objetivo de comparar o perfil metabólico dos dois organismos associados. As análises realizadas por cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas permitiram a identificação dos constituintes apolares do fungo cultivado na presença de diferentes substratos. Os estudos biogenéticos envolvendo biologia molecular dos meroterpenos foram realizados com o tetracetídeo precursor, o ácido 3,5-dimetilorselínico. Como resultado, foram encontrados três genes relacionados a policetídeos não reduzidos, parcialmente reduzidos e totalmente modificados e um gene que expressa a produção das enzimas C-metiltransferases, sugerindo uma possível relação desses genes na produção de meroterpenos, a qual dever ser constatada através da continuidade deste trabalho, agora envolvendo ambos os precursores policetídico e terpenoídico dessa classe de substâncias.

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Santos, Gabriel Franco dos. « Identificação e estudo do fungo Mucor circinelloides isolado do tronco de Pinus taeda, com ênfase em biotransformação da carvona ». Universidade Federal de São Carlos, 2012. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6529.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4413.pdf: 14486486 bytes, checksum: b1db822e0c1f598c763487b5331706a6 (MD5) Previous issue date: 2012-03-28
Financiadora de Estudos e Projetos
Identification and study of the fungus Mucor circinelloides isolated from the trunk of Pinus taeda, with emphasis on the carvone biotransformation. Fungi associated with plants have been studied ripping seeking the discovery of new substances and the understanding of the ecological interactions between plants and microorganisms. This study aimed to identify a fungus associated with the trunk of Pinus taeda using morphological analysis with images obtained by optical microscopy and scanning electron microscopy (SEM), genetic sequencing of the 18S ribosomal region, and proteome analysis by MALDI-TOF. The fungus was identified as Mucor circinelloides and its metabolism was studied. A mixture of 3-epiergosterol and ergosterol, glucosilceramidas mixture, and 3-glucopyranosyl-sitosterol were identified. The emphasis of this work was on the biotransformation of carvone, which is one of the main monoterpenes found in nature and one of the most commercialized. From the biotransformation experiment it was possible to isolate two trihydroxylated products and also dihydrocarvona, dihydrocarveol and neo-dihydrocarveol identified by GC-MS. The biotransformation products were identified by GC-MS and were proposed a pathway biotransformation. After that was performed also an estimative of production for some products and consumption estimated of (4R) - and (4S)-carvone, which is consumed in less than four hours of the experiment, showing a very rapid metabolism as reported in several genera of Mucor.
Identificação e estudo do fungo Mucor circinelloides isolado do tronco de Pinus taeda, com ênfase em biotransformação da carvona. Fungos associados a plantas tem sido intensamente estudados buscando a descoberta de novas substancias e o entendimento das interacoes ecologicas entre plantas e microorganismos. Este trabalho visou a identificacao de um fungo associado ao tronco do Pinus taeda utilizando para isso a identificacao morfologica com imagens de microscopia optica e microscopia eletronica de varredura (MEV), identificacao por sequenciamento genetico da regiao 18S ribossomal, e identificacao por perfil proteomico usando MALDI-TOF. O fungo foi identificado como Mucor circinelloides e seu metabolismo foi estudado, sendo identificadas uma mistura de ergosterol e 3-epiergosterol, mistura de glucosilceramidas, e o 3-glucopiranosil sitosterol. A enfase do trabalho foi a biotransformacao da carvona, que e um dos principais monoterpenos encontrados na natureza e um dos mais comercializados. Com o experimento de biotransformacao foi possivel isolar dois produtos trihidroxilados como tambem identificar alguns outros como dihidrocarvona, dihidrocarveol e neo-dihidrocarveol por GC-MS. A partir dos produtos identificados foi proposto um caminho de biotransformacao como tambem uma estimativa de producao para alguns produtos e estimativa de consumo da (4R)- e (4S)-carvona, que e consumida em menos de 4 horas de experimento, mostrando um metabolismo muito acelerado conforme e relatado em diversos generos de Mucor.

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ROCHA, Cláudia Quintino da. « Estudo fitoquímico, avaliação da atividade analgésica e antiinflamatória de extratos e substâncias isoladas de Arrabidaea brachypoda (DC.) Bureau (Bignoniaceae) ». Universidade Federal de Alfenas, 2010. https://bdtd.unifal-mg.edu.br:8443/handle/tede/390.

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Résumé :

No Brasil, diversas espécies de bignoniaceas têm uso medicinal e algumas atividades bio-farmacológicas foram comprovadas experimentalmente, como as atividades antitumoral, anti-inflamatória e antimicrobiana. Metabólitos secundários como naftoquinonas, lignanas, triterpenos e flavonóides foram previamente isolados de espécies desta família. No entanto, a composição química e as atividades biológicas da maior parte delas permanecem desconhecidas. O presente trabalho tem por objetivo o estudo químico e a avaliação da atividade analgésica e anti-inflamatória das raízes, caules, folhas e compostos isolados de Arrabidaea brachypoda. Para tal estudo foram obtidos extratos hexânico, clorofórmico, acetato etílico e etanólico das diferentes partes da planta para o estudo fitoquímico, além dos etanólicos brutos para as avaliações farmacológicas. s compostos isolados foram identificados por comparação com padrões autênticos, temperatura de fusão e técnicas espectroscópicas usuais. A atividade anti-inflamatória foi avaliada no modelo de edema de pata, peritonite induzida por LPS e granuloma comparando os resultados com os grupos controle . Para os ensaios de analgesia foram usados os seguintes modelos animais: contorção abdominal, formalina, “tail-flick” e “hot plate”. Compararam-se os resultados obtidos com os padrões: positivo (morfina) e negativo (CMC). Os resultados apresentados no teste de edema de pata para os extratos e para a substância RABEC-1 demonstraram uma redução do edema das patas dos ratos nos grupos tratados em relação aos grupos controles. No ensaio do granuloma, ocorreu uma redução na formação do tecido granulomatoso nos animais tratados com o extrato etanólico da raiz e também uma redução no número de células leucocitárias no ensaio da Peritonite induzida por LPS. Nos modelo de analgesia foi observado que os extratos da raiz e da folha apresentaram atividade analgésica periférica, enquanto que o composto RABEC-1, apresentou atividade analgésica central e periférica. Esses resultados indicam que os extratos da raiz e folha e a substância isolada de A. brachypoda testados, podem constituir alvo potencial no desenvolvimento de novos medicamentos para o controle farmacológico da dor e de processos inflamatórios. O presente trabalho contribui desta forma, para o conhecimento da química e da atividade farmacológica de A. brachypoda.
In Brazil, several species of Bignoniacea have medicinal and some biological activities have been proven experimentally, such as anti-tumor activity, anti-inflammatory and antimicrobial. Naphthoquinones, lignans, triterpenes and flavonoids were previously isolated from species of this family. However, the chemical composition and biological activities of most of them remain unknown. This paper aims to study the chemical and evaluation of analgesic and anti-inflammatory of roots, stems, leaves and isolated compounds from Arrabidaea brachypoda. For this study were obtained the hexanic, chloroformic, ethylic acetate and ethanolic extracts from different parts of the plant for phytochemical studies, in addition to ethanolic extracts for pharmacological evaluations. The compounds were identified by comparison with authentic standards, melting temperature and the usual spectroscopic techniques. The anti-inflammatory activity was evaluated in the model of paw edema, peritonitis and LPS-induced granuloma by comparing the results with the control groups. For tests of analgesia were used the following animal models: abdominal writhing, formalin, tail-flick "and" hot plate ". We compare the results with the patterns: positive (morphine) and negative (CMC). The results presented in the test paw edema for the extracts and the substance RABEC-1 showed a reduction in paw edema of mice in treated groups compared to control groups. In the granuloma test, there was a reduction in the formation of granulomatous tissue in animals treated with ethanol extract of the root and also a reduction in the number of leukocytes in the trial of peritonitis induced by LPS. In the model of analgesia was observed that extracts of root and leaf showed peripheral analgesic activity while the compound RABEC-1, showed activity central and peripheral. results indicate that extracts of root and leaf and the substance isolated from A. brachypoda tested, may be a potential target for use in therapy of pain and inflammation. This work thus contributes to the knowledge of chemistry and pharmacological activity of A. brachypoda.
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

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Santos, Luiz Fernando Arruda. « Contribuição ao estudo do metabolismo micromolecular de Xylaria sp., um fungo endofítico isolado de Sapindus saponaria ». Universidade Federal de São Carlos, 2006. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6416.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2003.pdf: 2958413 bytes, checksum: 4160426061ec67f4e48d4d92b60d4806 (MD5) Previous issue date: 2006-12-15
Universidade Federal de Sao Carlos
This work reports the study of a surprising plant microorganism relationship, involving the plant Sapindus saponaria, which is rich in antigungal saponins, and an endophyte fungus isolated from the pericarpe of the fruits collected in the host plant, and identified as Xylaria sp. The main objective of this work was to understand the survival mechanism of this fungus in such inhospitable ambient. It was found that this fungus biotransforms the structure of the saponins present in S. saponaria, making it less toxic, allowing the fungus to survive in the plant tissue. The reaction involved in this survival mechanism was a hidroxilation at ring C of the aglicone skeleton of saponins present in S. saponaria. This study also had as objective the stablishment of a fast method for the isolation and identification of saponins and ASOG (Acyclic Sesquiterpene Oligoglycosides) present in the plant s fruits. For the isolation of these compounds, the Sephadex® LH-20 column showed to be very efficient and the mass spectrometry technique (ESI-MS) was used as a rapid method of identification of this substances. The Xylaria sp. fungus was cultivated in synthetic mediums for the isolation of secondary metabolites. The microorganism showed a great potential for the production of several compounds, especially the isocoumarins. The analytical tools used to monitor all the experiments reported here comprises chromatographic and spectrometric techniques as HPLC, GC, open column chromatography, MS and MS/MS, 1D NMR and 2D NMR. Mechanisms of fragmentation were tentativelly suggested for all compounds studied by mass spectrometry.
Esse trabalho relata o estudo de uma surpreendente relação planta-microrganismo envolvendo a planta Sapindus saponaria, uma espécie extremamente rica em saponinas, em concentrações elevadas, as quais são compostos que possuem ação antifúngica bastante acentuada e, e um fungo do gênero Xylaria. O trabalho em questão teve por objetivo compreender o mecanismo de sobrevivência deste fungo em um ambiente tão inóspito. A resposta encontrada para esta questão foi que o fungo realiza uma biotransformação na estrutura das saponinas presentes em S. saponaria, possibilitando assim a sobrevivência deste nos tecidos da planta. Trata-se de uma reação de hidroxilação localizada no esqueleto triterpênico das saponinas presentes em S. saponaria. Outro objetivo do estudo foi encontrar um método rápido para o isolamento e identificação de saponinas e OGSA (Oligoglicosídeos Sesquiterpênicos Acíclicos) presentes nos frutos da planta. Para o isolamento destes compostos a fase estacionária Sephadex® LH-20 apresentou grande eficiência e a técnica de espectrometria de massas (MS) foi utilizada como um método rápido para identificação destas substâncias. O fungo Xylaria sp. foi cultivado em meios sintéticos para isolamento de metabólitos secundários. O microrganismo apresentou grande potencial para produção de diversos compostos, dando destaque para a classe das isocumarinas. Para realização deste trabalho foram utilizadas técnicas cromatográficas e espectrométricas como HPLC, GC, cromatografia em coluna, MS e MS/MS, 1D NMR e 2D NMR. Foram realizadas propostas de fragmentação para todos os compostos estudados por espectrometria de massas.

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Silva, Estefânia Viano da. « Estudo químico de carboidratos isolados do micélio do cogumelo medicinal Grifola frondosa (“Maitake”) ». Universidade Federal de Goiás, 2014. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/4683.

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Résumé :

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-10-20T17:56:33Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Estefânia Viano da Silva - 2014.pdf: 4645592 bytes, checksum: f3321dacb1ccfd2f2b017d08f8e3b578 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-10-20T17:58:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Estefânia Viano da Silva - 2014.pdf: 4645592 bytes, checksum: f3321dacb1ccfd2f2b017d08f8e3b578 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
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The mushrooms have been used as food and medicine for thousands of years. Among them, Grifola frondosa (“Maitake”) may be on the most versatile and promising medicinal mushrooms for use as a dietary supplement. Besides the high nutritional value, they are a good source of compounds such as carbohydrates that can act as biological response modifiers. In this work, β-D-glucans (PSF2-GfM and MRSF2K-GfM fractions) and heteropolysaccharides unusual in the literature (MEPF3CW-GfM and PF2K-GfM fractions) were isolated from the mycelium, grown in solid culture, of the G. frondosa, by successive aqueous and alkaline extractions, followed by fractionation through freeze-thawing, precipitation of soluble material with a Fehling solution, and dialysis using a membrane with an exclusion limit of 1000 kDa. The chemical structures were established based on monossacharide composition, periodate oxidation, methylation analysis, HPSEC-MALLS and NMR studies. The branched β-D-glucans (GLC-GfM) found were similar to those previously described for the fungus, which contains a (13)- linked β-Glcp main-chain, substituted at O-6 by single-unit -Glcp side-chains, on the average of one to every third residues of the backbone, but with different molar masses and water solubility. In adittion, novel heteropolymers were obtained. One was a fucomannogalactan (FMG-GfM), with a molar mass of 175 x 103 g mol-1, was shown to have a main chain of (1→6)-linked α-D-Galp and 3-O-Me-α-DGalp, both of which are partially substituted at O-2, principally, by 3-O-α-D-Manp-α-LFucp groups. The other was a fucoxylomannan (FXM-GfM) (Mw 202 x 103 g.mol-1), which consisted of backbone of (13)-linked α-D-Manp units, totally substituted at O-4 mainly by 4-O-α-L-Fucp-β-D-Xylp disaccharide. Thus, the polymers obtained from Grifola frondosa may could be good candidates for evaluation of its biological effect, considering the results obtained for others similar mushrooms polysaccharides.
Os cogumelos têm sido usados como alimentos e remédios por milhares de anos. Entre eles, o “Maitake” (Grifola frondosa) pode ser um dos cogumelos medicinais mais versáteis e promissores para o uso como um suplemento dietético. Além do valor nutricional elevado, eles são uma boa fonte de compostos, como os carboidratos, que podem agir como modificadores de resposta biológica. Neste trabalho, foram isolados do micélio (cultivado em meio sólido) de G. frondosa as β-D-glucanas (frações PSF2KGfM e MRSF2K-GfM) e heteropolissacarídeos (frações MePF3CW-GfM e PF2K-GfM) não comumente encontrados na literatura, por sucessivas extrações aquosas e alcalinas, seguido por fracionamento através do processo de congelamento/degelo, precipitação das frações solúveis em água com solução de Fehling e diálise em membranas com limite de exclusão de 1000 kDa. A estrutura química foi determinada através das análises de composição mossacarídica, oxidação com periodato de sódio, metilação, HPSEC-MALLS e RMN. As β-D-glucanas (GLC) isoladas foram similares àquelas previamente descritas para este fungo, as quais contém uma cadeia principal formada por unidades de 3-O-β-D-Glcp, podendo ser substituídas em O-6 por terminais não redutores de β-Glcp (1 ramificação a cada três unidades da cadeia principal), distinguindo-as quanto à solubilidade em água e tamanho (massa molar). Além destas, foram obtidos novos heteropolímeros. Um deles foi uma fucomanogalactana (FMGGfM), com uma massa molar de 175 x 103 g mol-1, a qual possui um core constituído por unidades de 6-O-α-D-Galp e 6-O-(3-O-Me-α-D-Galp), sendo ambas parcialmente substituídas em O-2 por 3-O-α-D-Manp-α-L-Fucp. O outro heteropolissacarídeo isolado consiste em uma fucoxilomanana (FXM-GfM) (Mw 202 x 103 g.mol-1) formada por unidades de α-D-Manp unidas por ligações glicosídicas do tipo (13) as quais se encontram ramificadas em O-4 principalmente pelo dissacarídeo 4-O-α-L-Fucp-β-DXylp. Considerando os efeitos terapêuticos apresentados por moléculas similares descritas para macrofungos, estes podem ser bons candidatos para avaliação do efeito biológico.

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Fidelis, Queli Cristina. « Metab?litos especiais isolados de folhas e galhos de Ouratea ferruginea Engl. (Ochnaceae) ». Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, 2011. https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/1138.

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Résumé :

Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-07-27T13:08:18Z No. of bitstreams: 1 2011 - Queli Cristina Fidelis.pdf: 8250271 bytes, checksum: f51d246c251bca4327f02da1e892ff77 (MD5)
Made available in DSpace on 2016-07-27T13:08:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 - Queli Cristina Fidelis.pdf: 8250271 bytes, checksum: f51d246c251bca4327f02da1e892ff77 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25
Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico, CNPq, Brasil.
This work describes the phytochemical study of the stems and leaves of Ouratea ferruginea Engl., Ochnaceae. The material for study was collected in the campus of Embrapa in Bel?m, Par? state, and identified by Dra Silvane Taveres Rodrigues. The compounds described in this phytochemistry investigation were isolated by the solvents partition and chromatographyc techniques of the extracts obtained by maceration at room temperature with hexane, ethyl acetate and methanol. The structures were determined through analysis of data provided by IR, 1H and 13C NMR (1D an 2D techniques), mass spectrometry including GCMS and HPLC-MS of natural compounds and some derivatives. From the stem dichloromethane extract friedelin, friedelinol, sitosterol, stigmasterol, campesterol, 3-b-O-Dglucopyranosyl- stigmasterol, 2,6-dimethoxy?benzoquinine, 2,6-dimethoxy-hydroquinone, the isoflavones: 5,4'-dihydroxy-7,3',5'-trimethoxy-isoflavone, 5-hydroxy-7,3',4',5'-tetramethoxyisoflavone, 5,4'-dihydroxy-7,3'-dimethoxy-isoflavone, 7,5-dihydroxy-3',4',5'-trimethoxyisoflavone, 7,5,4?-trihydroxy-3?,5?-dimethoxy-isoflavone, and ferulic and syringic aldehyde were isolated. From the dichloromethane partition of the methanol extract of the stem vanillic acid, 4 ((1E)-3-hydroxy-1-propenyl)-2-methoxyphenol and 3,5-dimethoxy-4-hydroxydihydrocinamaldehyde were isolated. From hexane fraction of methanol extract from the leaves lupeone was isolated, and from the dichloromethane methanol partition were identified the biflavonoids amentoflavone and 7-methyl-amentoflavone, known as sequoiaflavone, along with syringic acid. From the ethyl acetate of the methanol extracts partition the epicatechin which absolute configuration was defined by circular dichroism spectral analysis was isolated. The sequioflanove is been identified in Ochnaceae for the first time. From the polar fraction the total phenol were determined by adapted Folin-Denis and precipitation with casein methods and by NMR spectral analysis.
Este trabalho descreve o estudo fitoqu?mico de caule e folhas da esp?cie vegetal Ouratea ferruginea Engl, Ochnaceae. O material para estudo foi coletado no campus da Embrapa em Bel?m do Par? e identificado pela Dra Silvane Tavares Rodrigues. As subst?ncias descritas nesta investiga??o fitoqu?mica foram isoladas atrav?s de parti??o com solventes e t?cnicas cromatogr?ficos de extratos obtidos atrav?s de macera??o a frio com hexano, acetato de etila e metanol. As estruturas foram determinadas atrav?s da an?lise de dados fornecidos por espectrometria na regi?o do infravermelho, RMN 1H e 13C (t?cnicas 1D e 2D), de massas incluindo CG-EM e CLAE-EM das subst?ncias naturais e de alguns derivados. Do extrato em diclorometano do caule foram isolados friedelina, friedelinol, sitosterol, estigmasterol, campesterol, 3-b-O-D-glicopiranosil-estigmasterol, 2,6-dimetoxi benzoquinona, 2,6-dimetoxi hidroquinona, as isoflavonas 5,4?-diidroxi-7,3?,5?-trimetoxiisoflavona, 5,4?-diidroxi-7,3?-dimetoxi-isoflavona, 5-hidroxi-7,3?,4?,5?-tetrametoxiisoflavona, 7,5-diidroxi-3?,4?,5?-trimetoxi-isoflavona, 7,5,4?-triidroxi-3?,5?-dimetoxiisoflavona, al?m dos alde?dos sir?ngico e fer?lico. Da parti??o em diclorometano do extrato metan?lico do caule foram isolados ?cido van?lico, 4((1E)-3-hidroxi-1-propenil)-2- metoxifenol e 3,5-dimetoxi-4-hidroxi-diidrocinamalde?do. Das folhas foi isolada a lupeona na parti??o em hexano do extrato metan?lico; e na parti??o em diclorometano foram identificados os biflavon?ides amentoflavona e 7-metil-amentoflavona, conhecida como sequoiaflavona, e o ?cido sir?ngico. Na parti??o em acetato de etila foi isolado a epicatequina cuja configura??o absoluta foi definida com an?lise do espectro de dicro?smo circular. A sequioflavona est? sendo registrada pela primeira vez em Ochnaceae. Das fra??es polares foram determinados o teor de fen?is totais e taninos por m?todos de Folin-Denis e precipita??o com case?na, adaptados, al?m de an?lise com espectros de RMN.

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Kai, Priscila Marques. « Medição interativa por imagens de colônias de isolados do Corynespora cassiicola em placas de petri ». Universidade Federal de Goiás, 2018. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/8765.

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Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-08-06T11:20:43Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Priscila Marques Kai - 2018.pdf: 8253899 bytes, checksum: 434f30c52017af9e1b62f134e846b0ec (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
The use of chemicals as a form of prevention, protection and control to combat diseases that affect plants, is a feasible solution involving control measures, that over the years, with the improvement of these products, raise the effectiveness of such chemicals. However, due to the emergence of microorganisms resistant to these products, new tests need to be performed in the laboratory, requiring the effort of the specialist in phytopathology and to investigate these microorganisms, with research of genetic analysis, resistance to chemical products, among others. One of the methods used includes laboratory tests, periodically verifying the growth of the fungal colony with measurements using a ruler or caliper. However, this method, although it is most commonly used, is also imprecise, since measurements of the same plaque by different professionals may result in different measurements. Due to this, the development of a method that assists professionals in phytopathology, for measurement of fungal colony growth in Petri dishes, provides other means of measurement besides the traditional use of visual analysis by ruler or pachymeter. For this, processes were developed involving region segmentation, unnecessary information removal and colony size calculation by color analysis. The study was developed using images containing Petri dishes with growing fungus colonies, comparing the manual method performed by the specialist in Phytopathology and the performed by digital image processing. It was possible to verify the application and potential of the method developed for creating mobile applications. Therefore, this work presents a method for measuring fungal colony on Petri dishes from isolates of the fungus Corynespora cassiicola, using techniques involving processing from images captured by mobile device, with the purpose of assisting the professional, providing other means besides a manual process.
O uso de produtos químicos como forma de prevenção, proteção e controle para o combate a doenças que afetam plantas, é uma solução factível envolvendo medidas de controle, que ao passar dos anos, com o melhoramento desses produtos, elevam a efetividade de tais químicos. No entanto, devido ao surgimento de microrganismos resistentes a esses produtos, novos testes precisam ser realizados em laboratório, exigindo esforço do especialista em fitopatologia a fim de investigar estes microrganismos, com pesquisas a partir da análise genética, resistência a produtos químicos, dentre outros. Um dos métodos utilizados engloba testes laboratoriais, verificando periodicamente o crescimento da colônia de fungos com medições com uso de régua ou paquímetro. Entretanto, este método, apesar de ser o mais comumente utilizado, é também impreciso, pois medições de uma mesma placa por profissionais diferentes podem resultar emmedidas distintas. Devido a isto, o desenvolvimento de um método que auxilie profissionais em fitopatologia, para medição do crescimento da colônia de fungos em placas de Petri, fornece outros meios de medição além do uso tradicional de análise visual por régua ou paquímetro. Para isto, foram desenvolvidos processos de manipulação de imagens, envolvendo segmentação de regiões, remoções de informações desnecessárias e o cálculo do tamanho da colônia por análise de cores. O estudo foi desenvolvido com uso de imagens contendo placas de Petri com colônias de fungo em crescimento, realizando comparações entre o método manual realizado pelo especialista em Fitopatologia e o realizado pelo processamento digital de imagens. Foi possível verificar a aplicação e potencial do método desenvolvido para criação de aplicações para dispositivos móveis. Portanto, este trabalho apresenta um método para medição da colônia de fungos em placas de Petri, de isolados do fungo Corynespora cassiicola, utilizando técnicas envolvendo processamento a partir de imagens captadas por dispositivo móvel, com objetivo de auxiliar o profissional, disponibilizando outros meios além do processo manual.

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Graebner, Ilmar Bernardo. « Estudo dos constituintes quimicos isolados de plantas medicinais da região do vale do purus no acre (amazônia) ». Universidade Federal de Santa Maria, 2003. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/4153.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
The present work describes especially the extraction, isolation and identification of the chemical compounds of the tuber of Humirianthera ampla Miers (Icacynaceae) and the barks of the Himatanthus sucuuba Spruce (Apocynaceae). From the tuber of H. ampla, the diterpenes Humirianthol (3,18:14,16- diepoxi-3,15-dihydroxi-7-pimaren-17,6β-olida) (18) and acrenol (15,16-diol-3β,20- epoxi-3α-hydroxi-9-epi-7-pimaren-19,6β-olida) (19), isolated and identificated in the master studies, have your stereogenic centers definites at X ray technique and, at Horeau method. Though were isolated and identificated β-amyrin (37), sitosterol glycoside (45), plumeride (32) and glicoplumeric acid (1β-O-DGlicopyranosilpluméric) (33). From the barks of the H. sucuuba Wood were isolated one mixture the α-amyrin cinamate and α-lupeol cinamate, and allamandine-A (43), plumericin (44), and plumericin at to plumeride glycoside (32). The structures of the isolated compounds were established by spectral analysis (1H RMN, 13C RMN, COSY, DEPT 135O, DEPT 90O, HMQC, HMBC e NOESY), Infrared, X ray and comparisons among closely related compounds. Acetate derivatization from the diterpenes humirianthol and acrenol exhibited antifungic activity against Candida albicans and Sacharomyces cerivisae. The cloroformic fraction from the barks of the Himatanthus sucuuba exhibits activity against Staphylococcus aureus, S. epidermidis , Micrococcus luteus, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli and Salmonella setubal and antifungic activity against Candida albicans e Sacharomyces cerivisae. The allamandin A (43) and plumericin (44) exhibited activity equal to the cloroformic fraction.
O presente trabalho trata especialmente a extração, isolamento, identificação e atividade biológica de metabólitos secundários isolados dos tubérculos da espécie Humirianthera ampla Miers (Icacinaceae) e da casca do tronco da espécie Himatanthus sucuuba Spruce.(Apocynaceae) Dos tubérculos da espécie Humirianthera ampla, os diterpenos Humirianthol (3,18:14,16 diepoxi 3,15-dihidroxi 7-pimareno-17,6β-olida) (18) e acrenol (15,16 diol-3β,20 epóxi-3α-hidroxi 9 epi-7 -pimareno-19,6β-olida) (19) isolados e identificados em um trabalho anterior, tiveram seus centros estereogênicos definidos através da técnica de difração de raios X e pelo método Horeau. Ainda foram isolados e identificados os constituintes β-amirina (37), β-sitosterol glicosilado (45), plumerídeo glicosilado (32) e ácido glicoplumérico (1β-O-β-Dglicopiranosilplumérico) (33). Da casca da espécie H. sucuuba, foram isolados uma mistura de cinamato de α amirina e cinamato de α lupeol, allamandina A (43), plumericina (44) e o plumerídeo glicosilado (32). As estruturas dos compostos isolados foram elucidadas por análises espectroscópicas e espectrométricas como: RMN 1H, RMN 13C (COSY, DEPT 135O, DEPT 90O, HMQC, HMBC e NOESY), EM-ESI, Infravermelho, difração de raios X, reações de derivatizações e comparação com dados existentes na literatura. Os derivados acetilados dos diterpenos humirianthol (18) e acrenol (19), apresentaram considerável atividade antifúngica contra Candida albicans e Sacharomyces cerevisae A fração clorofórmica da casca da Himatanthus sucuuba apresentou atividade antimicrobiana contra Staphylococcus aureus, S. epidermidis, Micrococcus luteus, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli e Salmonella setubal, e antifúngica contra Candida albicans e Sacharomyces cerevisae. A mesma atividade foi observada para os metabólitos allamandina A (43) e plumericina (44), ambos metabólitos isolados desta fração.

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Gomes, Clélio Brasil Cardoso. « Transição de fase Superfluido-Isolante de Mott em redes ópticas via modelo de Jaynes-Cummings-Hubbard ». Universidade Federal de Sergipe, 2013. https://ri.ufs.br/handle/riufs/5338.

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Résumé :

We study the phase transition super uid-Mott insulator in optical lattices through model Jaynes-Cummings-Hubbard using the fermion approximation. Initially we did a review of the Jaynes-Cummings model that is a model that describes the interaction between an atom with two levels and a quantized electromagnetic eld. Then we stu- died the properties of the phase transition super uid-Mott insulator (SF-MI) through the model Bose-Hubbard and we discuss the characteristics of the two quantum phases and the conditions for phase transition. Apply the model Jaynes-Cummings-Hubbard in order to study the in uence of topology of network Bravais linear, square, single cubic (SC), body-centered cubic (BCC) and face-centered cubic (FCC) in the phase transi- tion SF-MI to different numbers of excitation and different detuning values between the atom and the eld and we found that the Mott lobes and the critical hopping terms are not renormalizable only for the FCC network. But the regime from many excitations, the critical hopping is renormalizable to all networks and is independent of detuning. Then we study the Jaynes-Cummings-Hubbard model for a chain with the addition of the Kerr effect (nonlinear optical effect) through the approximation of fermions (FA). We observed that the Kerr effect does not cause large changes in the energy spectrum. However, the properties of the phase transition SF-MI undergoes signicant changes due to the Kerr effect. Another important feature which has been observed is that the Kerr effect favors the phase MI.
Estudamos a transi¸c ao de fase superfluido-isolante de Mott (SF-MI) em redes ´opticas via modelo Jaynes-Cummings-Hubbard utilizando a aproxima¸c ao de f´ermions. Inicialmente fazemos uma revis ao do modelo Jaynes-Cummings que descreve a intera¸c ao de um ´atomo de dois n´ıveis com um campo eletromagn´etico quantizado. Em seguida estudamos as propriedades da transi¸c ao de fase SF-MI no modelo Bose-Hubbard e discutimos as caracter´ısticas das duas fase qu anticas e as condi¸c oes para a transi¸c ao de fase. Aplicamos o modelo Jaynes-Cummings-Hubbard com a finalidade de estudarmos a influ encia da topologia das redes de Bravais linear, quadrada, c´ubica simples (SC), c´ubica de corpo centrado (BCC) e c´ubica de faces centradas (FCC) na transi¸c ao de fase SF-MI para diferentes n´umeros de excita¸c ao e diferentes valores de dessintonia entre o ´atomo e o campo e encontramos que os l´obulos de Mott n ao s ao renormaliz ´aveis apenas para a rede FCC. Mas no regime de muitas excita¸c oes, as redes BCC e FCC passam a ter o mesmo comportamento enquanto que as demais continuam com sua depend encia no n´umero de vizinhos. Em seguida, estudamos o modelo de Jaynes-Cummings-Hubbard para uma cadeia com a adi¸c ao do efeito tipo Kerr (efeito ´optico n ao-linear) atrav´es da aproxima¸c ao de f´ermions (FA). Observamos que o efeito tipo Kerr n ao provoca grandes altera¸c oes no espectro de energia. No entanto, as propriedades de transi¸c ao de fase SF-MI passam por mudan¸cas significativas devido ao efeito tipo Kerr. Outra caracter´ıstica importante que foi observada ´e que o efeito tipo Kerr favorece a fase MI.

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Primieri, Cornélio. « Avaliação da estabilidade a oxidação de óleo vegetal de crambe (Crambe abyssinica Hochst) como fluido isolante ». Universidade Estadual do Oeste do Parana, 2012. http://tede.unioeste.br:8080/tede/handle/tede/820.

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Made available in DSpace on 2017-07-10T15:14:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cornelio Primieri.pdf: 3721204 bytes, checksum: 8dabdaaf2812e1f80bfd5bfcd26f1dd1 (MD5) Previous issue date: 2012-02-24
This research aimed overall assessment of a new plant insulating fluid, using as raw vegetable oil culture of crambe (Crambe abyssinica Hochst). Specific objectives were to evaluate the oxidation stability of crambe oil with various types of typical antioxidants used in edible vegetable oils available in the domestic market, aiming at a new plant insulating fluid, using a raw vegetable oil that does not compete with human food chain / animal. The experiment was conducted at the Research Laboratory of Oil Chemistry of College Assis Gurgacz-FAG. In the municipality of Cascavel / PR, a Latitude 24 º 56 'South, Longitude 53 º 30' W and altitude of 682 m in the period from September to December 2011. The methodology used was called Rancimat equipment, a device which simulates the two main parameters that affect the oxidation stability of greases matters, which are the action of high temperatures and the presence of oxygen, which presents results as an induction period which is represented by periods in hours. From the data collected during testing of the samples prepared using the Rancimat temperatures of 110 ° C and 130 ° C, an average was calculated for each typ e of antioxidant, as well as their concentrations and mixtures. The survey results showed that the sample that showed the best oxidation stability at 110 ° C was obtaine d from the use of antioxidant TBHQ in a concentration of 0.3% m / m (52.96 h). The worst case was the DBPC 0.1% m / m (6.72 h). At temperatures of 130 ° C, the best re sult was TBHQ 0.3% m / m (12.67 h) and DBPC worst case was 0.1% m / m (0.61 h). Thus, we conclude that to obtain a new fluid-based insulation plant crambe is feasible to use the antioxidant TBHQ, with a concentration of 0.3% m / m.
A presente pesquisa teve como objetivo geral a avaliação de um novo fluído vegetal isolante, utilizando como matéria prima o óleo vegetal da cultura do crambe (Crambe abyssinica Hochst). Como objetivo específico a avaliação da estabilidade à oxidação do óleo de crambe com diversos tipos de antioxidantes típicos utilizados em óleos vegetais comestíveis disponíveis no mercado nacional, visando um novo fluído vegetal isolante, utilizando matéria prima um óleo vegetal que não compete com a cadeia alimentar humana/animal. O experimento foi conduzido no Laboratório de Pesquisas em Óleo Química da Faculdade Assis Gurgacz-FAG, no município de Cascavel/PR, a uma Latitude 24º56 Sul, Longitude de 53º30 Oeste e altitude de 682 m, no período de setembro a dezembro de 2011. A metodologia utilizada foi a do equipamento denominado de Rancimat, equipamento este que simula os dois principais parâmetros que afetam a estabilidade a oxidação das matérias graxas, que são a ação das temperaturas elevadas e a presença de oxigênio, o que apresenta como resultados um período de indução que é representado por períodos em horas. A partir dos dados coletados nos ensaios das amostras elaborados no Rancimat utilizando temperaturas de 110ºC e 130ºC, foi calculada uma média para cada tipo de antioxidante, bem como suas concentrações e misturas. Os resultados da pesquisa demonstraram que a amostra que apresentou a melhor estabilidade a oxidação a 110ºC foi obtida do uso do antioxidante TBHQ com uma concentração de 0,3% m/m (52,96 h). O pior caso foi o DBPC a 0,1% m/m (6,72 h). Para temperaturas de 130ºC, o melhor resultado foi o TBHQ a 0,3% m/m (12,67 h) e o pior caso foi o DBPC a 0,1% m/m (0,61 h). Deste modo, conclui-se que para obter-se um novo fluído vegetal isolante a base de crambe é viável a utilização do antioxidante TBHQ, com uma concentração de 0,3% m/m.

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AMAZONAS, Járlesson Gama. « Investigação da transição isolante-metal do CDM via algoritmos computacionais e estudo de nano-dispositivos orgânicos ». Universidade Federal do Pará, 2007. http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/5083.

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Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-04-22T17:03:22Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InvestigacaoTransicaoIsolante.pdf: 1507266 bytes, checksum: a7658fb68a7537b9da5c535cf5297e02 (MD5)
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CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Apresentamos neste trabalho um estudo teórico sobre polímeros orgânicos conjugados. É conhecido que estes sistemas, em geral semicondutores ou isolantes, sob dopagem química podem vir a adquirir propriedades elétricas de material condutor. E ainda, sob ação de campo elétrico, pequenos oligômeros podem apresentar comportamento equivalente ao de dispositivos usuais, mas com inúmeras vantagens como, por exemplo, tamanho extremamente reduzido (alguns nanômetros). Dessa forma no primeiro capítulo faremos uma breve introdução sobre polímeros orgânicos conjugados mostrando alguns resultados experimentais obtidos para o polímero 4-dicianometileno-4,4-ciclopenta [2,1-b: 3,4b’] ditiofeno – CDM, que é o objeto central de estudo desta dissertação. O capítulo 2 trata dos métodos quânticos utilizados. Citaremos a Teoria de Hartre-Fock (HF) e suas derivações semi-empíricas. A técnica de Interação de configuração (CI) e a Teoria do Funcional da Densidade (DFT) também serão tratadas neste capítulo. O capítulo 3 é dedicado a descrever as características de alguns dispositivos usuais como diodos e transistores. Aqui o fundamental é entender a composição, o funcionamento e principalmente, como se comportam suas curvas características corrente versus voltagem (IxV). Citaremos ainda alguns dispositivos eletrônicos extremamente pequenos. No capítulo 4 começa nossos resultados e discussões referentes a análise da transição isolante-metal em CDM sob ação de dopagem. Primeiramente a nível semiempírico, obtivemos a caracterização ótica de oligômeros de CDM neutro e na presença de defeitos conformacionais do tipo bipólarons negativo e positivo. Partindo de geometrias otimizadas via métodos AM1 e PM3 obtivemos o espectro de absorção para sistemas com e sem carga. A nível Hartree-Fock calculamos a Estrutura de Bandas e a Densidade de Estados (DOS) para o PCDM no estado neutro e dopado. O cálculo da DOS e da Dispersão foram realizados através de programas computacionais desenvolvidos aqui no Grupo de Física de Materiais da Amazônia (GFMA). Apresentamos ainda neste capítulo o espectro de absorção teórico para oligômeros de CDM com diversas configurações com geometrias totalmente otimizadas pelo DFT. No capítulo 5 temos os resultados relativos à análise de nanodispositivos baseados em tetrâmeros de CDM com e sem carga. As curvas do deslocamento de carga versus voltagem apresentam características de curvas de dispositivos usuais. Analisamos também o espectro de absorção teórico dos nanodispositivos para valores de tensão nula e em pontos de saturação de corrente nas regiões direta e reversa.
We present in this work a theoretical study on conjugated organic polymers. These systems, in general semiconductors or insulators, when doped, show an increase in electrical conductivity. Under action of electric field, small oligomers can present a similar behavior to of usual devices, but with innumerable advantages as, for example, size extremely reduced (some nanometers). In the first chapter we will make a brief introduction on organic polymers conjugated showing some experimental results for 4-dicianometileno-4,4-ciclopenta polymer [2,1-b: 3,4b'] ditiofeno - CDM, that is the central object of study. Chapter 2 deals with the used quantum methods. We will cite the Hartre-Fock (HF) approximation and its semiempirical derivations. The Configuration Interaction (CI) method and the Density Functional Theory (DFT) also will be treated in this chapter. Chapter 3 is dedicated to describe the characteristics of some usual devices as diodes and transistors. We will still cite some extremely small electronic devices. Chapter 4 describes our results and quarrels about the possibility the of the transistion insulator-metal in CDM when doped. We got the characterization optics of oligomers of CDM with null charge and in the presence of defects of the type bipolaron. From the Hartree-Fock level we calculate the Structure of Bands and the Density of States (DOS) for the PCDM in the neutral and doped state. The calculation of the DOS and the Dispersion had been carried through computational programs developed here in the Group GFMA. We still present in this chapter the theoretical absorption spectra for oligomers of CDM with geometry fully optimized by DFT. In chapter 5 we have the relative results to the analysis of nanodevice based on tetramers of CDM with and without charge. The curves of the charge displacement versus voltage present characteristics of curves of usual devices. We also analyze the theoretical absorption spectra of the nanodevice for values of null tension and in points of current saturation.

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Thomasi, Sérgio Scherrer. « Aplicacão de LC-SPE/NMR na caracterização de substâncias isoladas de cultivos da bactéria marinha Streptomyces cebimarensis SS99BA-2 ». Universidade Federal de São Carlos, 2014. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6299.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5859.pdf: 8428715 bytes, checksum: 1818210d95744ce8daf3a59dda0bf966 (MD5) Previous issue date: 2014-03-21
Financiadora de Estudos e Projetos
Marine microorganisms are living beings with extraordinary abilities, once they have developed physiological and metabolic capabilities that allow them to survive in an environment filled with adverse conditions, such as high pressure, excessive salinity and extreme temperatures. Thus, these living beings have great potential for the production of metabolites which normally cannot be produced by soil bacteria. The overall objective of this study was to elucidate the metabolite profile of the bacterium Streptomyces cebimarensis SS99BA-2 isolated from marine sediment in São Sebastião, a city located in the northern coast of São Paulo State, using the LC-SPE/NMR hyphenated technology. Ethyl acetate and butanol extracts of bacterial fermentation broths showed, respectively, biological activity against Escherichia coli and Candida albicans, and cytotoxic activity against tumour cells SF-295 (central nervous system). The optimization of the chromatographic conditions, together with the optimization of parameters for SPE retention, and for NMR acquisition and processing, led to the identification of at least eight known substances. This strategy did not require bench isolation methods, from very small amounts, approximately 3 mg, of crude extracts and permited to identify: maltol, 5-hydroximaltol, 4-hydroxibenzoic acid, N-acetyltyramine, isomaltol, 3-(N)-propanesulfonic acid, dehydroxinocardamine and nocardamine. In addition, six new compounds were isolated, including four belonging to a rare class of pyrazin-2(1H)-onic secondary metabolites named: giovaninone A, giovaninone B, giovaninone C and giovaninone D, and two belonging to an extremely cytotoxic class of antitumor phosphated polyketides: thomasicine A and thomasicine B. The results show that the LC-SPE/NMR coupling technology is extremely useful in the natural products field, since organic compounds can be identified in a rapid, safe and reproductible way. Moreover, it can be observed that the chemistry of marine microorganisms is still very little explored and reveal a promising field in the obtaining of potential candidates for pharmaceuticals, since these organisms are able to be cultivated in large scale through the use of bioreactors.
Micro-organismos marinhos são seres com habilidades extraordinárias, uma vez que apresentam características fisiológicas e metabólicas que lhes permitem sobreviver num ambiente repleto de condições adversas, como alta pressão, salinidade excessiva e temperaturas extremas. Muitos deles também apresentam um grande potencial para a produção de metabólitos que normalmente não podem ser produzidos por bactérias terrestres. Diante disso, o objetivo geral do presente estudo foi elucidar o perfil metabólico de uma linhagem de bactéria isolada de sedimento marinho em São Sebastião, litoral norte do estado de São Paulo, Streptomyces cebimarensis SS99BA-2, utilizando a técnica hifenada LC-SPE/NMR. Extratos de acetato de etila e butanólicos dos caldos fermentativos dessa bactéria apresentaram, respectivamente, atividade biológica contra Escherichia coli e Candida albicans e atividade citotóxica contra células tumorais SF-295 (sistema nervoso central). A otimização da separação cromatográfica, somada à otimização dos parâmetros de retenção por SPE e de aquisição e processamento de RMN, levou à identificação de pelo menos oito substâncias conhecidas sem a necessidade de isolamento de bancada a partir de quantidades muito pequenas, aproximadamente 3 mg, de extratos brutos: maltol, 5-hidróximaltol, ácido 4-hidróxibenzóico, isomaltol, N-acetiltiramina, ácido 3-(N-morfolino)-propanossulfónico, dehidróxinocardamine e nocardamine, além de seis compostos inéditos na literatura, sendo quatro pertencentes à uma classe rara de metabólitos secundários pirazin-2(1H)-ônicos: giovaninona A, giovaninona B, giovaninona C e giovaninona D e dois pertencentes à uma classe de policetídeos fosfatados antitumorais com potencial citotóxico: thomasicina A e thomasicina B. Os resultados mostram que a técnica hifenada LC-SPE/NMR é extremamente valiosa na área de produtos naturais, uma vez que substâncias orgânicas podem ser identificadas de forma rápida, segura e reprodutível. Além disso, verifica-se que a química de micro-organismos marinhos ainda é muito pouco explorada e revela um campo promissor na obtenção de possíveis candidatos a fármacos, uma vez que esses organismos são passíveis de cultivos em larga escala através do uso de bioreatores.

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Sá, Israel Cívico Gil de. « Estudo fitoquímico de Rhabdodendron amazonicum, Conchocarpus inopinatus e avaliação dos compostos isolados na inibição da fotossíntese ». Universidade Federal de São Carlos, 2010. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6471.

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Universidade Federal de Minas Gerais
The Rhabdodendron amazonicum is a species of the monogeneric family Rhabdodendraceae, whose species are concentrated in the Amazon, Guianas and northern Bahia-Brazil. Phytochemical study of ethanolic extract of Rhabdodendron amazonicum leaves led to the isolation of a esterified steroid with cinnamic acid, the sitosteril cinnamate, two compounds of the class of ionone sesquiterpenes, Blumenol C and rhabdodendronlactona (unpublished). Another compound nor-ionone was identified via GC-MS analysis, selecting the chromatogram peak corresponding to ion m/z 208, which was identified as 1,5,5-trimethyl-6β-hydroxy-6-but-2-enyl-cyclohexa-1-ene-3- one. The identification of this compound reinforce the proposed biogenesis for rhabdodendronlactona from Blumenol C. Phytochemical study of methanolic extract of stem Conchocarpus inopinatus led to the isolation of three alkaloids: one acridones (methylarborinine), one quinolones (1-methyl-2-phenyl-4- quinolone) and one furoquinoline (dictamnine) and two coumarins, the marmesin and scopoletin. All substances, except for scopoletin were submitted to the inhibition tests of electron transport basal, phosphorylating and uncoupled. But only the marmesin showed inhibitory activity in the basal and uncoupled electron transport. Through measures of chlorophyll fluorescence, analyzing the parameters related to transient OJIP, could suggest the marmesin action in the pool of quinones, inhibiting the transport of electrons from this region. However, to confirm this mechanism of action would require the implementation of other partial reactions involving donors and acceptors of electrons, which were not possible due to the low quantity of isolated compound.
A Rhabdodendron amazonicum é uma espécie da família monogenérica Rhabdodendraceae, cujas espécies estão concentradas na Amazônia, Guianas e no norte da Bahia-Brasil. O estudo fitoquímico do extrato etanólico das folhas da Rhabdodendron amazonicum levou ao isolamento de um esteróide esterificado com o ácido cinâmico, o cinamato de sitosterila, dois compostos da classe dos sesquiterpenos iononas, blumenol C, e a rhabdodendronlactona (inédita). Um outro composto nor-ionona foi identificado via a análise CG-EM, selecionando no cromatograma o pico correspondente ao íon m/z 208, o qual foi identificado como 1,5,5-trimetil-6β-hidroxi-6-but-2-enilciclohex- 1-eno-3-ona. A identificação deste composto reforça a proposta de biogênese para a rhabdodendronlactona a partir do blumenol C. O estudo fitoquímico do extrato metanólico do caule da Conchocarpus inopinatus levou ao isolamento de 3 alcalóides, sendo 1 acridônico (metilarborinina), 1 quinolônico (1-metil-2-fenil-4-quinolona) e 1 furoquinolínico (dictamina); e duas cumarinas: a marmesina e a escopoletina. Todas as substâncias, com exceção da escopoletina, foram submetidas aos ensaios de inibição do transporte de elétrons basal, desacoplado e fosforilante. Mas somente a marmesina apresentou atividade de inibição no transporte de elétrons basal e desacoplado. Através de medidas de fluorescência da clorofila a, analisando os parâmetros relacionados aos transientes OJIP, pode-se sugerir a ação da marmesina no pool das quinonas, impedindo o transporte de elétrons a partir desta região. Porém para confirmar tal mecanismo de ação, seria necessário a realização de outras reações parciais envolvendo doadores e aceptores de elétrons, o que não foi possível devido à pouca quantidade do composto isolado.

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Bitencourt, Evandro Leite. « Prospecção química de carboidratos isolados dos basidiomas das linhagens branca e cinza do cogumelo medicinal Grifola frondosa (“Maitake”) ». Universidade Federal de Goiás, 2015. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/4757.

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Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-10-23T19:44:00Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Evandro Leite Bitencourt - 2015.pdf: 4223075 bytes, checksum: fe60d827b473e79c5c9c8ab601f67a69 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG
Mushrooms have been valued as a functional food and dietary supplement for humanity, due to the presence of substances with high nutritional value and/or therapeutic. Among the mushrooms recognized for its therapeutic properties we have is the leafy Grifola, popularly known as “Maitake”, which has important pharmacological actions such as anti-tumor, immunomodulatory, antiinflammatory, antioxidant, and others, which have been mainly related to its carbohydrates. Nevertheless, this study aimed to review the chemistry of the polysaccharides from mushroom of the two lines ("white" and "gray", represented as Gfb and Gfc, respectively) of G. frondosa leafy that have been cultivated in Brazil. From these type it was obtained branched -glucans containing links of type (13) (16) and heteropolysaccharides formed mainly by galactose (heterogalactan) or mannose (heteromannan). The heterogalactan composed mainly of fucose (15.7%), mannose (20.5%) and galactose (63.8%) was denominated fucomannogalactan (FMG-Gfb). It contains a main chain consisting of units of α-D-Galp and 3-Me-O-α-D-Galp connected (16), which are present partially substituted by O-2 disaccharide 3-O- α-D-Manp-α-L-Fucp to a lesser extent with terminal non-reducing α-L-Fucp and α-D-Manp. The heteromannan composed of fucose (6.9%), xylose (33.1%) and mannose (60.0%), a fucoxylomannan (FXM-Gfc) was found to be composed of a backbone of units α-D-Manp (13) connected, and a part of them substituted by O-3 side chains made of fucose and xylose. The results of this study suggest that there are no significant differences between the carbohydrate of both strains, showing that white strain it provide the therapeutic effects attributed to carbohydrates of another strain.
Os cogumelos têm sido valorizados como alimento funcional e suplemento alimentar para a humanidade, devido à presença de substâncias com alto valor nutricional e/ou medicinal. Dentre os cogumelos reconhecidos pelas suas propriedades terapêuticas encontra-se o Grifola frondosa, popularmente conhecido como Maitake, o qual possui importantes ações farmacológicas como antitumoral, imunomoduladora, anti-inflamatória, antioxidante, entre outras, as quais têm sido relacionadas, principalmente, aos seus carboidratos. Diante do exposto, o presente trabalho teve como objetivo a avaliação química dos polissacarídeos dos basidiomas das duas linhagens (branca e cinza, representadas como Gfb e Gfc, respectivamente) de G. frondosa que vem sendo cultivadas no Brasil. A partir destes foram obtidas as -glucanas ramificadas contendo ligações do tipo (13) (16) e os heteropolissacarídeos formados principalmente por galactose (heterogalactana) ou manose (heteromanana). A heterogalactana constituída, principalmente, por fucose (15,7%), manose (20,5%) e galactose (63,8%), foi denominada de fucomanogalactana (FMG-Gfb). Esta contém uma cadeia principal formada por unidades de α-D-Galp e de 3-O-Me-α-D-Galp ligadas (16), as quais se apresentam parcialmente substituídas em O-2 pelo dissacarídeo 3-O-α-DManp- α-L-Fucp e em menor proporção com terminais não redutores de α-LFucp e α-D-Manp. A heteromanana, composta por fucose (6,9%), xilose (33,1%) e manose (60,0%), ou seja, uma fucoxilomanana (FXM-Gfc) mostrou ser constituída por uma cadeia principal composta por unidades de α-D-Manp (13) ligadas, sendo uma parte destas substituídas em O-3 por cadeias laterais formadas por fucose e xilose. Os resultados obtidos neste estudo sugerem que não há diferenças significativas entre os carboidratos de ambas as linhagens, evidenciando que a linhagem branca deve apresentar os efeitos terapêuticos atribuídos aos carboidratos da outra linhagem.

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Isidoro, Marsele Machado. « Estudo fitoquímico de Euxylophora paraensis e avaliação das substâncias isoladas frente à enzima gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase de Trypanosoma cruzi ». Universidade Federal de São Carlos, 2008. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6433.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2054.pdf: 3381379 bytes, checksum: b7e331b25f7899a9074fa9a68cff8f00 (MD5) Previous issue date: 2008-08-22
Financiadora de Estudos e Projetos
This work describe the phytochemical study of bark and leaves of the specie E. paraensis (Rutaceae). This dissertation aims at contributing with the chemistry of the Rutaceae family and evaluation of the antichagasic activity of substances isolated. The phythochemical study allowed to isolate fifteen secondary metabolites belonging to different classes: two alkaloids: N-methylflindersine and skimmianine; the mixture of three steroids: β-sitosterol, stigmasterol e campestanol; the limonoid limonin; six coumarins, which are: marmesin, 8-methoximarmesin, isooxypeucedanin, prangol, isopimpinellin and xanthotoxin; and three glycosides flavonoids: quercetin-3-β-O-rhamnopyranoside, myricetin-3-β- O-rhamnopyranoside and hesperidin, while there is still no reports on the isolation of flavonoids in this specie. The isolated compounds were evaluated as the enzyme inhibitory activity in Ggapdh (glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase) of T. cruzi. However, a strategy was used for virtual screening based on physical and chemical properties of substances isolated by the computer program Volsurf 3.0. The ability of the inhibitory compounds pre-classified was tested by isothermal titration calorimetry (ITC), which has characterized the mechanism of action of active substances on the enzyme GAPDH. Through the standardized test the following compounds were tested front of GAPDH: Limonin, quercetin-3-α-O-rhamnopyranoside and prangol showed that the inhibition constant ranging between 91.8 (± 18.08) and 384.8 (145 ± , 05) μM; hesperidin and marmesin that have not submitted activity against the enzyme.
Este trabalho descreve o estudo fitoquímico do caule e das folhas da espécie E. paraensis (Rutaceae). Este estudo visa contribuir com a química da família Rutaceae e verificar a atividade tripanocida das substâncias isoladas desta espécie. O estudo fitoquímico resultou no isolamento de 15 metabólitos secundários, divididos em: dois alcalóides N-metil-flindersina e esquimianina; mistura de três esteróides β-sitosterol, estigmasterol e campesterol; o limonóide limonina; seis cumarinas: marmesina, 8-metoximarmesina, isooxipeucedanina, prangol, isopimpenilina e xantotoxina; e três flavonóides glicosilados, quercetina 3-β-O-raminosídeo, miricetina 3-β-O-raminosídeo e hesperidina, sendo esta última classe inédita nesta espécie. Os compostos isolados foram avaliados quanto a atividade enzimática inibitória de gGAPDH (Gliceraldeído-3-fosfatodesidrogenase) de T. cruzi. Contudo, foi utilizada uma estratégia de triagem virtual baseada nas propriedades físico-químicas das substâncias isoladas através do programa computacional Volsurf 3.0. A capacidade inibitória dos compostos pré-classificados foi testada através de uma Titulação Calorimétrica Isotérmica (ITC), que permitiu caracterizar o mecanismo de ação das subtâncias ativas sobre a enzima GAPDH. Através do ensaio padronizado foram testados os seguintes compostos frente à GAPDH: Limonina, quercetina-3-α-O-L-raminosídeo e prangol que apresentaram constantes de inibição variando entre 91,8 (±18,08) e 384,8 (±145,05) μM; hesperidina e marmesina não apresentaram atividade contra a enzima.

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Ceugniez, Alexandre. « Recherche de levures antagonistes, à potentiel probiotique, dans les produits du Terroir du Nord-Pas-de-Calais : étude de Kluyveromyces marxianus et K. lactis, isolées d’un fromage artisanal, la Tomme d’Orchies ». Thesis, Lille 1, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL10035/document.

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Les fromages au lait cru présentent un écosystème microbien complexe où chaque acteur interagit avec ses voisins et avec le milieu. Parmi ces interactions, l’une d’elle est particulièrement intéressante, l’antagonisme, autrement dit la capacité d’un individu à inhiber la croissance d’un autre. Ces interactions antagonistes sont particulièrement étudiées dans les écosystèmes bactériens fromagers et ont conduit à l’identification de bactéries lactiques productrices de bactériocines. Parmi elles, certaines souches ont révélé des propriétés probiotiques et présentent ainsi un fort potentiel dans la lutte contre les résistances aux antibiotiques. D’un autre côté, l’écosystème fongique des fromages est encore peu étudié. Ce dernier est cependant prometteur, notamment par la possibilité d’abriter des levures productrices de mycocines et/ou possédant des propriétés probiotiques. Dans ce cadre, les présents travaux ont porté sur l’étude d’un fromage du terroir des Hauts-de-France, la Tomme d’Orchies. Ils ont permis la mise en évidence de deux levures antagonistes non-Saccharomyces, présentant un potentiel probiotique. L’écosystème microbien de la Tomme d’Orchies sera décrit et la recherche et la caractérisation de levures antagonistes seront effectuées au sein de son écosystème fongique. Deux souches de Kluyveromyces (K. marxianus S-2-05 et K. lactis S-3-05) seront mises en évidence. Ces dernières présentant un pouvoir antagoniste large, contre des bactéries à Gram positifs et négatifs et contre une levure pathogène. De plus, un haut potentiel d’utilisation comme agents probiotiques a été observé, complété par une activité antioxydante d’intérêt médical, observé chez K. marxianus
Raw milk cheeses show a complex microbial ecosystem, where each actor interacting with its neighbor and with its environment. Among these interactions, one is particularly interesting, the antagonism, in other words the capacity of an individual to inhibit the growth of another. Antagonistic interactions are massively studied in bacterial cheese ecosystems and lead to the identification of bacteriocin-producing lactic acid bacteria. Among these strains, some revealed probiotics properties and a high potential in the fight against antibiotics resistances. Additionally, cheese fungal ecosystems were poorly studied. However, this ecosystem is promising as it might contain mycocin-producing yeasts and/or showing probiotic properties. In this frame, our work focused on a local French cheese, the “Tomme d’Orchies”. Two non Saccharomyces antagonistic yeasts, with a probiotic potential, were identified in this cheese. Microbial ecosystems of the “Tomme d’Orchies” will be described before presenting the research and the characterization of antagonistic yeast in the fungal ecosystem. Two strains of Kluyveromyces (K. marxianus S-2-05 and K. lactis S-3-05) will be highlighted, with broad antagonistic properties, against Gram positive and negative bacteria, but also against pathogenic yeast. A high potential to be used as probiotic agents could be observed, in addition to antioxidative properties for K. marxianus, with medical relevance

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Ávila, Roberta Marques Dias de. « Obtenção de Derivados de Compostos Isolados de Zingiber officinale por Biotransformação e Semi-síntese e Avaliação Frente à Cisteinil-proteases ». Universidade Federal de São Carlos, 2016. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/8260.

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Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-10-26T16:49:22Z No. of bitstreams: 1 TeseRMDA.pdf: 4251540 bytes, checksum: 7f125ff1cf0456ee6c35cc31853e3ee2 (MD5)
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Made available in DSpace on 2016-11-08T18:23:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseRMDA.pdf: 4251540 bytes, checksum: 7f125ff1cf0456ee6c35cc31853e3ee2 (MD5) Previous issue date: 2016-07-01
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Several aromatic polyketide derivatives from Ginger (Zingiber officinale), like zingerone, 6-gingerol and 6-shogaol were obtained by biocatalytic reactions and semi-synthesis and both their antifungal and cysteine-proteinase inhibitory properties were investigated. The derivatives obtained by semi-synthesis were evaluated in the form of a first screening for inhibition property of growth of phytopathogenic fungi Colletotrichum gloesporioides and Fusararium oxysparum. The biotransformation of four compounds: zingerone purchased from Sigma Aldrich, 6-gingerol isolated from ginger and its derivatives 4-methyl-6-gingerol and 6-shogaol was investigated using whole cells of C. gloesporioides and showed recognition of the fungal pool of enzymes capable of using such compounds as substrates. All experiments were conducted in sterile liquid medium BD (Potato and Dextrose) under agitation (120 rpm) and constant temperature (30° C ), obtaining the methanol extract of mycelial mass (MM), the aqueous extract (Aq) and the ethyl acetate extract (Ac) of culture fluid. The ethyl acetate extract was analyzed by GC-MS and ESI-MS/MS using LC-MS techniques. The fungus C. gloesporioides proved able to promote a reaction of aromatic oxidative coupling of zingerone, forming a dimer of this molecule. This product was isolated, identified by NMR spectroscopy and high resolution mass spectrometry. The biotransformation experiment was also made with isotopically labeled zingerone with deuterium. Analysis of the ethyl acetate extract (Ac) by (-) ESI-MS / MS using LC-IT-MS showed that dimer formation since the first day once the isotopically labeled fragments were detected. The aromatic oxidative coupling reaction also occurs in the biotransformation to phenolic compound 6-gingerol by C. gloesporioides. It is probable that side chain of 6-gingerol was used as carbon source forming an alcohol with molecular mass 168 Da. The dimer of the alcohol appears as biotransformation product. Among the proposed semi-synthesis reactions, the insertion of an oxime ether subunit from zingerone as starting material was obtained. Despite the molecular modeling indicates good complementarity with the catalytic site model cysteinyl preoteases, the product obtained does not show inhibitory activity against the enzymes L and V to 25 uM. The oximine derivative of 8-gingerol, presented halo of inhibition against the proliferation of fungus C.gloesporioides in disk diffusion test on PDA (Potato Dextrose Agar) in a Petri dish. The ethyl acetate extract (Ac) from the tenth day showed a good result of inhibition of cathepsin V (80%). There are studies that investigate the relationship between the antifungal activity of compounds of the property of inhibiting cysteine-preoteases as papain and cathepsin B and L.
A obtenção de novos derivados de policetídeos aromáticos encontrados no gengibre (Zingiber officinale), como a zingerona, o 6-gingerol e o 6-shogaol, empregando-se reações de biocatálise e semi-síntese foram alcançados, bem como a avaliação frente à cisteíno-proteases. Os derivados obtidos por semi-síntese foram avaliados na forma de um primeiro screening quanto à capacidade de inibição do crescimento dos fungos fitopatogênicos como Colletotrichum gloesporioides e Fusararium oxysparum. A biotransformação de quatro compostos: a zingerona, obtida comercialmente, a biotransformação do 6-gingerol, isolado do gengibre e de seus derivados 4-metil-6- gingerol e 6-shogaol por células totais de C. gloesporioides foi investigada tendo-se o reconhecimento do pool enzimático do fungo capaz de utilizar tais compostos como substrato. Todos os experimentos foram conduzidos em meio líquido estéril BD (Batata e Dextrose) sob a agitação de 120 rpm e temperatura de 30°C, obtendo-se o extrato metanólico da massa micelial (MM), o extrato aquoso (Aq), sendo o sobrenadante após obtenção do extrato em acetato de etila (Ac) do fluido da cultura. Os extratos Ac foram analisados por GC-MS e ESI-MS/MS usando técnicas de LC-MS. O fungo C. gloesporioides mostrou ser capaz em promover uma reação de acoplamento oxidativo aromático da zingerona, formando um dímero desta molécula, tal produto foi isolado e a estrutura química proposta com as análises dos espectros de RMN obtidos bem como por espectrometria de massas de alta resolução; o experimento de biotransformação também foi realizado com a zingerona marcada com deutério. A análise do extrato Ac por (-) ESI-MS/MS usando LC-IT-MS mostrou que desde o primeiro dia há formação do dímero o que foi confirmado pela formação de fragmentos isotopicamente marcados. A reação de acoplamento oxidativo aromático também ocorre na biotransformação para o composto fenólico 6-gingerol pelo C. gloesporioides, sendo que, provavelmente há consumo da cadeia lateral pelo fungo como fonte de carbono formando um álcool com a massa molecular de 168 Da, sendo o dímero desse álcool que aparece como produto de biotransformação. Dentre a proposta de reação de semi-síntese, o produto da reação de inserção da subunidade éter de oxima, tendo zingerona como material de partida foi obtido e apesar da modelagem molecular indicar boa complementariedade com o modelo de sítio catalítico de cisteinil-preoteases, o produto obtido não apresentou atividade de inibição contra as enzimas L e V a 25 μM. O derivado oximínico do 8-gingerol, apresentou halo de inibição contra a proliferação do fungo C.gloesporioides em teste de difusão em disco em meio BDA (Batata-Dextrose-Ágar) em placa de Petri, sendo que existem trabalhos que investigam a relação entre a atividade antifúngica de compostos com a propriedade de inibição de cisteínopreoteases como papaína e catepsina B e L. O extrato acetato de etila (Ac) do décimo dia mostrou um bom resultado de inibição da catepsina V (80%).

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Albarici, Tatiane Regina. « Estudo fitoquímico de Rauia sp e Conchocarpus macrophyllus (Rutaceae) e avaliação da atividade antiparasitária de extratos e substãncias isoladas ». Universidade Federal de São Carlos, 2006. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6078.

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Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseTRA.pdf: 6023275 bytes, checksum: 87890c0b29cd99b76805b302af8bc9ac (MD5) Previous issue date: 2006-05-17
This work involved the study of plant extracts of the Rutaceae species. Among 16 extracts tested in assays carried out with T. cruzi gGAPDH and L. tarentolae APRT enzymes and trypomastigote forms of T. cruzi, four showed significant activities at least in one of them. The petroleum ether extract of stems of Conchocarpus macrophyllus (CMCF) and the methanolic extract of leaves of Rauia sp (RFM) showed 94% and 75% of parasitic lyses on trypomastigote forms of T. cruzi. The methanolic extract of leaves of Rauia sp1 (RF1M) showed 74% of inhibition of gGAPDH enzyme and the dichloromethane extract of stems of Conchocarpus macrophyllus (CMCD) showed 74% of inhibition of APRT enzyme. The methanolic extract of leaves of Rauia sp1 (RF1M) showed 67,9% of inhibition on the APRT enzyme assay. The phytochemical study of Rauia sp allowed the isolation of 30 substances among them 4 are described for the first time, the coumarins 3-ethylrauianin and 5-methoxyrauianin and the alkaloids 7-hydroxy-8-methoxy-N-methylflindersine and 8- hydroxy-Nmethylflindersine that is described as a natural product at first time. Among them 26 have already been described in the literature the coumarins murranganone, 7- methoxy-8-(2-acetyloxy-3-methyl-1-oxobut-2-enyl)-coumarin, isomurranganone, murralongin, murrangatin, munomicrolin, murrangatin diacetate, rauianin, umbeliferone e isoescopoletin, the alkaloids N-methyl-4-methoxy-2-quinolone, mirtopsine, dictamine, γ-fagarine, skimmianine, Z-dimethylrhoifolinate, zantobungeanine, zantodioline and veprissine, the amides paprazine and N-transferuloyltyramine, the flavone 3,7,4 -trimethoxy-5-hydroxyflavone, the lignan siringaresinol, the fenolic coumpound vanilic acid and the steroids β-sitosterol and stigmasterol. The phytochemical study of Conchocarpus macrophyllus allowed the isolation of 4 substances the alkaloids arborinine and methylarborinine and the steroids β-sitosterol and stigmasterol. Among the substances tested in one or more assays none of them showed satisfactory results, leading to conclude that either the active compounds have not been isolated or their activity is related to the combination effects.
Este trabalho envolveu estudo fitoquímico de plantas pertencentes à família Rutaceae. Foram testados 16 extratos de plantas pertencentes à família Rutaceae em ensaios sobre as enzimas GAPDH de T. cruzi e APRT de L. tarentolae e sobre formas tripomastigotas de T. cruzi quatro apresentaram atividades satisfatórias em pelo menos um dos ensaios a que foram submetidos. O extrato em éter de petróleo do caule de Conchocarpus macrophyllus (CMCE) e o extrato metanólico das folhas de Rauia sp (RFM) apresentaram 94% e 75% de lise parasitária frente às formas tripomastigotas de T. cruzi. O extrato metanólico das folhas de Rauia sp1 (RF1M) apresentou 74% de inibição frente à enzima GAPDH e o extrato diclorometânico do caule de Conchocarpus macrophyllus (CMCD) apresentou 77% de inibição sobre a enzima APRT. O extrato metanólico das folhas de Rauia sp1 (RF1M) apresentou resultado próximo ao considerado satisfatório (67,9% de inibição) no ensaio sobre a enzima APRT. O estudo fitoquímico de Rauia sp resultou no isolamento de 30 substâncias. Destas, 4 são inéditas na literatura; as cumarinas 3-etilrauianina e 5-metoxirauianina e os alcalóides 7-hidroxi-8-metoxi-N-metilflindersina e 8-hidroxi-N-metilflindersina, este último não foi ainda relatado como produto natural e 26 já foram descritas na literatura; as cumarinas murranganona, 7-metoxi-8-(2-acetoxi-3-metil-1-oxobut-2- enil)-cumarina, isomurranganona, murralongina, murrangatina, munomicrolina, acetato de murrangatina, rauianina, umbeliferona e isoescopoletina, os alcalóides Nmetil- 4-metoxi-2-quinolona, mirtopsina, dictamina, γ-fagarina, esquimianina, Zrhoifolinato de dimetila, zantobungeanina, zantodiolina e veprissina, as amidas paprazina e N-trans-feruloiltiramina, a flavona 3,7,4 -trimetoxi-5-hidroxi flavona, a lignana siringaresinol, o composto fenólico ácido vanílico e a mistura dos esteróides sitosterol e estigmasterol. O estudo de Conchocarpus macrophyllus resultou no isolamento de 4 substâncias, os alcalóides acridônicos arborinina e metilarborinina e a mistura dos esteróides sitosterol e estigmasterol. Dentre as substâncias que tiveram o potencial biológico avaliado frente a um ou mais ensaios nenhuma apresentou resultado satisfatório.

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Ament, Daiane Alice Henrique. « Invariantes de germes de aplicações ». Universidade Federal de São Carlos, 2017. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/8976.

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Submitted by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-08-09T18:34:01Z No. of bitstreams: 1 TeseDAHA.pdf: 605987 bytes, checksum: 218da6f6f0b14c9296bc76440e616467 (MD5)
Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-08-09T18:34:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseDAHA.pdf: 605987 bytes, checksum: 218da6f6f0b14c9296bc76440e616467 (MD5)
Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-08-09T18:34:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseDAHA.pdf: 605987 bytes, checksum: 218da6f6f0b14c9296bc76440e616467 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-08-09T18:34:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseDAHA.pdf: 605987 bytes, checksum: 218da6f6f0b14c9296bc76440e616467 (MD5) Previous issue date: 2017-04-19
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
In this work, we show relations between invariants of map germs. First, we consider an analytic function germ f : (X, 0) —(C, 0) on an isolated determinantal singularity and we present a relation between the Euler obstruction of f and the determinantal Milnor number of f. In the particular case where (X, 0) is an isolated complete intersection singularity, we obtain a simple way to calculate the Euler obstruction of f as the difference between the dimension of two algebras. After, we work with map germs f : (X, 0) —— (C2, 0), where (X, 0) is a plane curve with isolated singularity. We introduce the image Milnor number to these map germs and we present a positive answer to the Mond’s conjecture in this context. The Mond’s conjecture proposes an inequality between two other invariants, the A^-codimension and the image Milnor number, in the case of map germs f : (Cn, 0) —(Cn+1, 0) when the dimensions (n,n + 1) is in Mather’s nice dimensions. The conjecture is true for n = 1, 2, and for the cases n > 3 is an open problem.
Neste trabalho, mostramos relações entre invariantes de germes de aplicações. Primeiro, consideramos um germe de funçao analítica f : (X, 0)^(C, 0) sobre uma singularidade determinantal isolada e apresentamos uma relaçao entre a obstrução de Euler de f e o número de Milnor determinantal de f. No caso particular em que (X, 0) e uma interseçao completa com singularidade isolada, obtemos um modo simples de calcular a obstrucao de Euler de f como a diferenca entre dimensães de duas algebras. Depois, trabalhamos com germes de aplicacoes f : (X, 0)^(C2, 0), onde (X, 0) e uma curva plana com singularidade isolada. Introduzimos o número de Milnor da imagem para estes germes de aplicacães e apresentamos uma resposta positiva para a conjectura de Mond neste contexto. A conjectura de Mond propoe uma desigualdade entre outros dois invariantes, a A^-codimensao e o numero de Milnor da imagem, para o caso de germes de aplicacoes f : (Cn, 0)^(Cn+1,0) quando as dimensoes (n,n + 1) estao nas boas dimensoes de Mather. A conjectura e verdadeira para n = 1, 2, e para os casos n > 3 e um problema em aberto.

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Montoia, Andreia. « Semi-síntese de derivados da elipticina e atividade antimalárica de isolados e infusões de Aspidosperma vargasii ». Universidade Federal do Amazonas, 2013. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3313.

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Made available in DSpace on 2015-04-22T22:01:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andreia Montoia.pdf: 3824551 bytes, checksum: 75e621941cc5f0f5383f36e0472f3ec2 (MD5) Previous issue date: 2013-03-08
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The growing number of cases of resistance to the common antimalarials chloroquine and the ACTs (artemisinin-based combined therapy) favors the search for new substances with antiplasmodial activity. In 2007, the Amazonian Active Principles Laboratory (LAPAAM) at the National Institute for Amazon Research (INPA) discovered the in vitro antimalarial activity of the indole alkaloid ellipticine (10) against Plasmodium falciparum. A bibliographic search revealed that many indole alkaloids of relatively simple structure exhibited in vitro and in vivo antimalarial activity. In the present study, substances that are structurally related to 10 were obtained by isolation or semi-synthesis and their in vitro antimalarial activity was investigated. 10 and 2-methyl-1, 2, 3 ,4-tetrahydroellipticine (12) were isolated from the alkaline extracts of the bark of carapanaúba (Aspidosperma vargasii, Apocynaceae) by column chromatography. UPLC-MS analysis revealed the presence of 10 and 12 in an infusion of A. vargasii bark. Nitration (HNO3/AcOH) and bromination (Br2/CHCl3) reactions using 10 as starting material formed electrophilic aromatic substitution products 7-nitroellipticine (20, new substance) and a 3:1 mixture of 7,9-dibromoellipticine (17, a new substance) and 9-bromoellipticine (18), respectively. All substances inhibited the K1 strain of P. falciparum in vitro as evidenced by IC50 values 0,19 (10), 1,10 (12), 0,43 (20) and 0,30 (17+18) μg/mL. Compounds 10, 12, 17, 18 and 20 were not cytotoxic to human fibroblasts (IC50 > 50 μg/mL). 10 administered by mouth was highly active in the 4 day suppressive test against Plasmodium berghei in mice and inhibited parasitemia by 92% on the 5th day at a dose of 10 mg/kg/day. In the future, 17, 18 and 20 will be prepared in larger quantity and evaluated for in vivo antimalarial activity.
O aumento de casos de resistência aos antimaláricos comuns cloroquina e TCA (Tratamentos Combinados baseados na Artemisinina) favorece a busca por novas substâncias com atividade antiplasmodial. Em 2007, o Laboratório de Princípios Ativos da Amazônia (LAPAAM) do Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia (INPA) descobriu a atividade antimalárica in vitro contra Plasmodium falciparum do alcaloide indólico elipticina (10). Um levantamento bibliográfico revelou que diversos alcaloides indólicos de estruturas relativamente simples possuem atividade antimalárica in vitro e in vivo. No presente estudo, substâncias relacionadas estruturalmente a 10 foram obtidas por isolamento ou semi-sintése e sua atividade antimalárica in vitro foi investigada. 10 e 2-metil-1, 2, 3, 4-tetraidroelipticina (12) foram isoladas a partir dos extratos alcalinos das cascas de carapanaúba (Aspidosperma vargasii, Apocynaceae) por cromatografia em coluna. Análise por UPLC-ESI-MS revelou a presença de 10 e 12 em uma infusão das cascas de A. vargasii. As reações de nitração (HNO3/HOAc) e bromação (Br2/CHCl3) utilizando 10 como material de partida levou à formação dos produtos de substituição eletrofílica aromática 7-nitroelipticina (20, substância inédita) e uma mistura 3:1 de 7,9- dibromoelipticina (17, substância inédita) e 9-bromoelipticina (18), respectivamente. Todas as substâncias inibiram a cepa K1 de P. falciparum in vitro apresentando valores de IC50 de 0,19 (10); 1,10 (12); 0,43 (20) e 0,30 (17+18) μg/mL. As substâncias 10, 12, 17, 18 e 20 não exibiram toxicidade para fibroblastos humanos (IC50 > 50 μg/mL). 10 via oral exibiu elevada atividade in vivo no teste de supressão de 4 dias contra P. berghei em camundongos e inibiu em 92 % a parasitemia no quinto dia na dose de 10 mg/kg/dia. Futuramente, 17, 18 e 20 deverão ser preparados em maior quantidade e avaliados para atividade antimalárica in vivo.

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VIALI, Wesley Renato. « Síntese e Caracterização de nanopartículas de maghemita revestidas com ácido oléico para obtenção de fluidos magnéticos a base de óleos isolantes ». Universidade Federal de Goiás, 2009. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tde/1059.

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Résumé :

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:12:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao - Wesley Renato Viali.pdf: 3929545 bytes, checksum: b4e900de56f7f751a05beaeb0b326f0b (MD5) Previous issue date: 2009-03-18
In this work maghemite nanoparticles were synthesized by co-precipitating Fe2+ and Fe3+ in alkaline medium. The freshly prepared magnetite was oxidized by two different routes: by bubbling O2 through an acid suspension of magnetite nanoparticles or by hydrothermal treatment of magnetite with ferric nitrate/nitric acid solution. After oxidation, the nanoparticles were covered with oleic acid and the grafting coefficient was evaluated according to the oxidation method and pH employed in the adsorption experiments. The covered particles were dispersed in mineral and vegetable insulating oils, resulting in magnetic fluids whose colloidal stability was investigated in regard to the following parameters: dilution, heating, water content, chemical composition of insulating oils and addition of oleic acid. The nanoparticles were characterized by X-ray diffratometry, thermogravimetric and differential thermal analyses and infrared spectroscopy. The Fe3+/Fe2+ molar ratio in the solids was determined by UV-Vis spectrometry. The magnetic fluids were characterized regarding the volume fraction of nanoparticles, the water content, and their colloidal stability was monitored by dynamic light scattering measurements and visual observations. The results obtained from the analyses indicated that the oxidized magnetite nanoparticles (5 to 10 nm) have inverse spinel structure and Fe3+/Fe2+ molar ratio varied from 20 to 70, depending on the oxidation method and employed conditions. The grafting coefficient varied from 2,1 to 4,8, reflecting the oleic acid adsorption conditions, and the further treatments. It was also observed that by controlling the experimental conditions, a grafting coefficient very close to a Langmuir s monolayer can be achieved, together with a decrease in the amount of physisorbed species which contribute negatively to the colloidal stability. The study of colloidal stability showed that dilution, heating and XVII water content have a great influence in the sedimentation of diluted magnetic fluids, when they are diluted with minerals insulating oils. It was verified that the magnetic fluids diluted with vegetable insulating oil showed very high colloidal stability in the accelerated thermal aging experiment
Neste trabalho foram preparadas nanopartículas de maghemita pelo método da coprecipitação de íons Fe3+ e Fe2+ em meio básico. A magnetita inicialmente obtida foi oxidada utilizando-se gás oxigênio ou solução de nitrato férrico/ácido nítrico. Após a oxidação, as nanopartículas foram revestidas com ácido oleico e a eficiência deste processo foi avaliada em função do método de oxidação e do pH de adsorção. As partículas revestidas foram dispersas em óleos isolantes dos tipos naftênico, parafínico ou vegetal, resultando em fluidos magnéticos cujas estabilidades coloidais foram avaliadas em função dos seguintes parâmetros: diluição, aquecimento, teor de água, natureza do meio dispersante e adição de ácido oleico. As nanopartículas foram caracterizadas por difratometria de raios X, análise termogravimétrica e térmica diferencial e espectroscopia de infravermelho. A razão Fe3+/Fe2+ nos sólidos foi determinada por espectrofotometria no visível. Os fluidos magnéticos foram caracterizados quanto à fração volumétrica de nanopartículas e ao teor de água, e sua estabilidade coloidal foi acompanhada por espalhamento dinâmico de luz e por medidas visuais de turbidez. Os resultados das análises e experimentos indicaram que as nanopartículas de magnetita oxidada (5 a 10 nm) apresentaram estrutura espinélio inverso e razão Fe3+/Fe2+ desde 20 até 70, dependendo do método e condições de oxidação empregadas. O coeficiente de revestimento variou de 2,1 a 4,8, refletindo tanto as condições utilizadas nos procedimentos de adsorção do ácido oleico, como também os tratamentos subseqüentes. Demonstrou-se que através do controle das condições experimentais pode-se obter um revestimento muito próximo ao de uma monocamada de Langmuir, bem como reduzir a quantidade de XV espécies moleculares fisissorvidas que contribuem negativamente para a estabilidade coloidal. O estudo da estabilidade coloidal mostrou que a diluição, o aquecimento e o teor de água favorecem a sedimentação dos fluidos magnéticos quando estes são diluídos em óleos isolantes naftênico e parafínico. Verificou-se que os fluidos magnéticos em óleo vegetal quando em frações volumétricas baixas apresentaram alta estabilidade coloidal em experimentos de envelhecimento acelerado

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Alves, Maurício Marcelino de Sousa. « Potencial biotecnológico de bactérias e leveduras isoladas da casca do Coco-verde (Cocos Nucifera) em fermentação ». Universidade Federal de Alagoas, 2017. http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/1900.

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Résumé :

The culture of coconut is economically relevant to Brazil but suffers with the breeding of pests that target coconut trees and bring on economic losses. One of the pests responsible for such is the palm weevil R. palmarum L., which is attracted to the infestation site by the odor released from the fermentation of plant tissues. This is particularly problematic when the crop, processing and disposal sites are in close location, for the residue discarded (i.e. green coconut shell) undergoes the action of microorganisms that produce volatile compounds and attract the pest to the crop site. This research had as its objective the isolation and characterization of bacteria and yeasts responsible for the fermentation of green coconut shell and production of volatile compounds that are attractive to the palm weevil. For such, green coconut shells were exposed to the local environment for the development of the fermentative processes, having the emitted volatiles analyzed on five different days of fermentation (0, 3, 5, 7, and 10 days). Thirty different compounds belonging to different chemical classes were detected for all of the analyzed days, being alcohols, ketones, aldehydes and hydrocarbons the most frequently found. Isolation procedures were performed immediately after the opening of the coconuts and at the sixth day of fermentation. After purification, thirty eight strains (15 bacteria and 23 yeasts) were obtained and characterized. The characterization of the strains was based on the determination of orphological, physiological and biochemical characteristics and the evaluation of the biotechnological potential. The isolated strains presented variable biochemical profile, although each of them displayed at least one positive result for the tested enzymes. Although bacterial isolates were halotolerant, yeast strains were more. Among the bacterial strains, the isolate A5 stood out for displaying activity for all of the tested enzymes except for laccase besides being capable of degrading filter paper in liquid media. The isolate E4 stood out among the yeast strains for presenting activity for five of the tested enzymes (amylases, pectinases, xylanases, proteases and lipases/esterases) besides displaying tolerance up to 10% NaCl. Therefore each strain presented different biotechnological potential, some of them being potential candidates for the production of volatile compounds by fermentation of the green coconut shell. A few strains were identified to the genus level by the technique of MILDI-TOF, resulting in identification of three bacterial (Bacillus, Pantoea e Arthrobacter) e three yeasts (Pichia, Cryptococcus e Rhodotorula) genera. The production of volatile compound by four selected strains was investigated and resulted on the detection of over 100 different compounds, among which are included ketones, carboxylic acids, pyrazines, esters, hydrocarbons, aldehydes, terpenes and terpenoids. A few of the detected volatiles had been previously reported as attractive to R. palmarum confirming that there is a relationship between the metabolic activity of the isolated microorganisms and production of volatiles attractive to this pest.
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
A cultura do coqueiro é economicamente importante para o Brasil, mas sofre com a proliferação de pragas que almejam os coqueiros e causam prejuízo econômico. Uma das pragas é a broca-do-olho-do-coqueiro, R. palmarum L., que é atraído para os locais de infestação pelo odor de fermentação de tecidos vegetais. Isto é particularmente problemático quando os locais de plantação, de processamento dos frutos e de descarte de resíduos são próximos, pois o resíduo gerado (casca do coco-verde, por exemplo) sofre ação de microrganismos que produzem compostos voláteis e atraem o inseto para a plantação. Esta pesquisa teve como objetivo o isolamento e a caracterização de bactérias e leveduras responsáveis pela fermentação da casca do coco-verde com concomitante produção de compostos voláteis atrativos para a broca-do-olho-do-coqueiro. Para tanto, cascas de coco-verde recém-abertas foram expostas ao ambiente para desenvolvimento de processo fermentativo, sendo a emissão de voláteis analisada em cinco dias diferentes de fermentação (dias 0, 3, 5, 7 e 10). Trinta compostos de classes químicas variadas foram detectados para os diferentes dias de fermentação, sendo encontrados álcoois, cetonas, aldeídos e hidrocarbonetos com maior frequência. Isolamentos foram realizados após abertura dos cocos e no sexto dia de fermentação. Após purificação, trinta e oito linhagens (15 bactérias e 23 leveduras) foram obtidas e caracterizadas. A caracterização teve como base a determinação de características morfológicas, fisiológicas e bioquímicas e a avaliação do potencial biotecnológico. As linhagens isoladas exibiram perfil bioquímico variado, sendo que todos apresentaram pelo menos um resultado positivo para alguma das enzimas extracelulares testadas. Embora as bactérias tenham sido halotolerantes, as leveduras foram mais. Dentre as bactérias isoladas, o isolado A5 se destacou por apresentar atividade para todas as enzimas testadas exceto lacases, além de demostrar capacidade de degradar papel de filtro em meio líquido. O isolado E4 se destacou entre as leveduras por apresentar atividade para cinco enzimas (amilases, pectinases, xilanases, proteases e lipases/esterases), além de apresentar tolerância a 10% de NaCl. Portanto, cada linhagem isolada apresentou potencial biotecnológico variável, algumas sendo potenciais candidatas para a produção de voláteis pela fermentação da casca do coco-verde. Alguns isolados foram identificados a nível de gênero pela técnica de MALDI-TOF, resultando na identificação de três gêneros de bactérias (Bacillus, Pantoea e Arthrobacter) e três de leveduras (Pichia, Cryptococcus e Rhodotorula). A produção de voláteis por culturas puras de quatro isolados selecionados foi estudada, sendo encontrados mais de 100 compostos diferentes, principalmente cetonas, ácidos carboxílicos, pirazinas, ésteres, hidrocarbonetos, aldeídos, terpenos e terpenóides. Alguns dos voláteis detectados já haviam sido relatados como atrativos para o R. palmarum., confirmando que existe relação entre a atividade metabólica dos microrganismos isolados e produção de voláteis atrativos para esta praga.

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Mendonça, Marcelo da Costa. « Contribuição ao controle biológico de Rhynchophorus palmarum - atividade de vôo, eficiência de autoinoculação e caracterização molecular de isolados de Beauveria bassiana ». Universidade Federal de Alagoas, 2007. http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/2405.

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Résumé :

The coleoptera Rhynchophorus palmarum (L.), vulgarly known as palm weevil is considered on of mainly pest of several palm trees of economic importance. In coconut tree their larvae destroy the plant culms and their adults act like a vector of nematode Bursaphelenchus cocophilus that cause the red ring disease. With the objective of subside the practices of biological control of R. palmarum already utilized it was carried out tests aiming to determine the flight activity of the insect in coconut fields; to validate the technique of autoinoculation of adults of R. palmarum using traps like vegetal traps bait inoculated with the Beauveria bassiana enthomopatogenic fungi; and to characterize genetically isolates of the fungi by molecular makers of RAPD, microsatellites and ITS-DNAr. To determine the flight activity of the insect it was installed, around the commercial field, traps of capture/monitoring for population of R. palmarum adult’s insect, containing attractive feed (culms of sugar cane) added with pheromone of aggregation. For the autoinoculation tests it was used the randomized statistical design, in a factorial scheme 3x4 (3 spores concentration of the fungi and 4 periods of autoinoculation), using four replications constituted by 5 pairs of males and females. The insects were separated, cleaned with distilled water and transfer to buckets with sugar cane culms inoculated with B. bassiana on concentrations 107, 108 and 109 spores/mL of suspension), keeping in contact with the inoculums for 45min.; 90min.; 3h00 and 6h00. After this period of exposition the insects were individualized being the mortality/infection evaluated for 20 days. For genetic characterization it was used 11 isolates obtained from monospores cultures that posterior were inoculated in a liquid medium at 25ºC±1ºC under constant shaking in dark conditions. After seven days the mycelium were filtered, lyophilized and after DNA extracted in SDS buffer at 10%. It was tested 20 decamer primers of arbitrary sequence of IDT Company. The amplifications were carried out in termocycler (Biometra/Unisciense) programmed for initial temperature of 94°C for 5min. and 45 cycles of: 94°C for 1min., 36°C for 2min. and 72°C for 1min.. For microsatellites analyses it was used four pairs of primers. The amplification reactions were carried out using a volume of 25µL. The amplifications consisted by one initial cycle of 94ºC and 30 cycles of 94ºC for 1min.; 50ºC for 1min. and 72ºC for 2min., and a end cycle of 72ºC for 7min.. The amplified fragments were separated by electrophoresis in agarose gel using TBE buffer, and the gel stained with ethidium bromete (0.5µg/mL) after visualized under UV light. The insect initiates flight activity at 5h00 am through 6h00 pm o’clock occurring the population maximum at 9h00 am to11h00 am. It was verified the mortality increase of adults of R. palmarum in accord to fungi concentration and period of exposition of the inoculums. The higest index of mortality (53%) occurred nine days after the autoinoculation by B. bassiana. The RAPD analysis generated 138 polymorphic and 14 monomorphic bands being the patterns used to calculate the genetic similarity that varies of 2% to 77%. The 57.99 (Betume2-SE) and 53.96 (Mojú-PA) isolates presented high similarity (77%), followed by 64.99 (Egypt) and 53.96 (Mojú-PA), with similarity of 73% by RAPD test. For microssatellite the BC.05 and 32.91 isolates presented genetic similarity of 82%, followed by 64.99 and 57.99 with genetic similarity of 80%. It was not observed amplifications variations using ITS regions for B. bassiana isolates.
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas
O coleóptero Rhynchophorus palmarum (L.), vulgarmente conhecido como broca-doolho-do-coqueiro é considerado uma das principais pragas de palmeiras de importância econômica. Suas larvas destroem a estipe da planta e os adultos atuam como vetores do nematóide Bursaphelenchus cocophilus causador da doença “anel vermelho”. Com o objetivo de subsidiar as práticas de controle biológico do R. palmarum já empregadas, foram realizados testes visando: determinar a atividade de vôo do inseto em plantios de coco; validar a técnica de autoinoculação de adultos de R. palmarum usando armadilhas com iscas vegetais inoculadas com o fungo entomopatogênico Beauveria bassiana e caracterizar geneticamente isolados do fungo por meio de marcadores moleculares do tipo RAPD, microssatélite e ITS-DNA. Para determinar a atividade de vôo do inseto foram instaladas, na periferia de pomares comerciais de coco, armadilhas de captura/monitoramento da população de adultos de R. palmarum, contendo atrativo alimentar (colmos de cana-de-açúcar) mais feromônio de agregação. Nos testes de autoinoculação utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3x4 (3 concentrações do fungo e 4 tempos de autoinoculação), com 4 repetições de 5 casais. Os insetos foram separados, limpos em água destilada e transferidos para baldes contendo cana-de-açúcar inoculada com B. bassiana nas concentrações padronizadas (107, 108 e 109 esporos/mL de suspensão), permanecendo em contato com o inóculo por 45min.; 90min.; 3h00 e 6h00. Após o período de exposição ao fungo, os insetos foram individualizados, sendo a mortalidade/infecção avaliada por 20 dias. Na caracterização genética foram utilizados 11 isolados, para os quais foram obtidas culturas monospóricas que posteriormente foram repicadas, em meio líquido a 25ºC±1ºC, em agitação constante e no escuro. Após sete dias os micélios foram filtrados, liofilizados e em seguida seu DNA genômico extraído em tampão de extração SDS 10%. Foram testados 20 primers decâmeros de seqüência arbitrária da marca IDT. As amplificações foram realizadas em termociclador (Biometra/Unisciense) programado com temperatura inicial de 94°C por 5min. e 45 ciclos a 94°C por 1min., 36°C por 2min. e 72°C por 1min.. Para as análises de microssatélites foram empregados quatro pares de primers. As reações de amplificação foram feitas em um volume de 25µL. As amplificações consistiram de um ciclo inicial de 94ºC e 30 ciclos de: 94ºC por 1min.; 50ºC por 1min. e 72ºC por 2min., ao final 1 ciclo de 72ºC por 7min. Os fragmentos amplificados foram separados em gel de agarose, submetidos à eletroforese em tampão TBE, corados com brometo de etídio (0,5 µg/mL) e visualizados sob luz UV. Observou-se que o inseto inicia sua atividade de vôo as 5h00 até às 18h00, ocorrendo um pico populacional máximo das 9h00 às 11h00. Verificou-se uma mortalidade crescente de adultos de R. palmarum em função do aumento da concentração do fungo e dos tempos de exposição ao inóculo. O maior índice de mortalidade (53%) ocorreu nove dias após a autoinoculação do inseto. As análises de RAPD geraram 138 bandas polimórficas e 14 monomórficas, sendo os padrões empregados para o cálculo das similaridades genéticas que variaram de 2% a 77%. Os isolados 57.99 (Betume2-SE) e 53.96 (Moju-PA) apresentaram maior similaridade (77%), seguidos de 64.99 (Egito) e 53.96 (Moju-PA), com uma similaridade de 73% pelo teste de RAPD. Enquanto que para o microssatélite os isolados BC.05 e 32.91 apresentaram maior similaridade genética (82%), seguidos de 64.99 e 57.99 com similaridade genética de 80%. Não foram observadas variações na amplificação das regiões ITS de DNAr para os isolados de B. bassiana.

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Prud?ncio, Edlene Ribeiro. « Estudo do potencial antioxidante de diferentes classes de mol?culas isoladas de mel e pr?polis em c?lulas de Saccharomyces cerevisiae ». Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, 2016. https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/1626.

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Résumé :

Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2017-05-11T13:41:47Z No. of bitstreams: 1 2016 - Edlene Ribeiro Prud?ncio.pdf: 1465673 bytes, checksum: 5714fb486b0694f0e6ac0482d5b775a5 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-05-11T13:41:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016 - Edlene Ribeiro Prud?ncio.pdf: 1465673 bytes, checksum: 5714fb486b0694f0e6ac0482d5b775a5 (MD5) Previous issue date: 2016-08-04
Honey and propolis are produced by bees from the nectar and sap collected from plants. In the process, the phenolic compounds derived from secondary metabolism of plants are incorporated into the products mentioned. Honey and propolis samples from multiple regions have been characterized and phenolic compounds can be divided into: hydroxybenzoic acid derivatives, hydroxycinnamic acid derivatives, flavonoids and glycosylated flavonoids. In the literature, there is no consensus among the authors about the values for in vitro antioxidant activity. Moreover, these methods do not represent physiological conditions such as concentration of substrates and metabolites interaction. The yeast Saccharomyces cerevisiae is an alternative tool for a biological assays, since it is similar to mammalian cells. The main goal of this study is to compare the antioxidant potential of different phenolic compounds classes using representatives morin, rutin, chlorogenic acid and syringic acid in control strains (BY4741) and mutant (?sod1 and ?gsh1) of S. cerevisiae. They were evaluated in dose-dependent toxicity, stress tolerance, and lipid peroxidation. All tested phenolic compounds were effective in reducing intracellular oxidative damage, especially the chlorogenic acid in the control strain. When compared to stressed cells, it promoted 75% increase on cell survival rates, compared with 57% on average for the other treatments; and 60% decrease in levels of lipid peroxidation, compared to reductions close to 47% with other treatments. In mutant strains, all compounds presented similar results. Thus, two components of the class hydroxycinnamic acid, caffeic acid and caffeic acid phenethyl ester (CAPE) were tested comparatively. Both acted as an antioxidant in S. cerevisiae, however CAPE was the most toxic substance promoting the most significant increase on reduced glutathione levels among hydroxycinnamic derivatives. This result supports some related research that claims phenolic compounds protectection is related to activation of the antioxidant system as xenobiotic action of these substances
O mel e a pr?polis s?o produzidos por abelhas, a partir da coleta de n?ctar e seiva das plantas. No processo, os compostos fen?licos oriundos do metabolismo secund?rio dos vegetais s?o incorporados aos produtos mencionados. Amostras de mel e pr?polis de diferentes regi?es foram caracterizadas e o conte?do de compostos fen?licos pode ser dividido em: derivados do ?cido hidroxibenzoico, derivados do ?cido hidroxicin?mico, flavonoides e flavonoides glicosilados. Na literatura, valores de atividade antioxidante in vitro descritos divergem consideravelmente entre os autores. Al?m disso, os m?todos in vitro (DPPH, ABTS, FRAPP, dentre outros) n?o representam condi??es fisiol?gicas como concentra??o de substratos e intera??o de metab?litos. A levedura Saccharomyces cerevisie ? uma ferramenta para ensaio biol?gico, uma vez que apresenta elevada semelhan?a com c?lulas de mam?feros superiores no sistema de defesa antioxidante. O objetivo deste trabalho foi comparar o potencial antioxidante de diferentes classes de compostos fen?licos, utilizando os representantes morina, rutina, ?cido sir?ngico e clorog?nico em cepas controle (BY4741) e mutantes (?sod1 e ?gsh1) de S. cerevisiae. Foram avaliados toxidez dose-dependente, toler?ncia ao estresse e peroxida??o lip?dica. Todos os compostos fen?licos testados foram efetivos em reduzir danos oxidativos intracelulares, com destaque para o ?cido clorog?nico na cepa controle. Quando comparado ?s c?lulas estressadas, este promoveu aumentos de 75% de sobreviv?ncia, contra 57% em m?dia dos demais tratamentos; e diminui??o de 60% em n?veis de peroxida??o lip?dica, contra redu??o pr?xima a 47% dos demais tratamentos. Nas cepas mutantes, todas as subst?ncias tiveram resultados semelhantes entre si. Desta forma, outros dois componentes da classe do ?cido hidroxicin?mico, ?cido cafeico e ?ster fenet?lico do ?cido cafeico (CAPE), foram testados comparativamente. Ambos atuaram como antioxidante em S. cerevisiae, entretanto CAPE foi a subst?ncia mais t?xica e tamb?m a que promoveu aumento mais significativo de glutationa reduzida dentre os derivados hidroxicin?micos. Esse resultado corrobora com dados de estudos que apontam que a atividade protetora dos compostos fen?licos est? relacionada a ativa??o do sistema antioxidante por a??o xenobi?tica dessas subst?ncias

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ALVES, Eliane Santana Fernandes. « Estudo estrutural por 1h-rmn de peptídeos bioativos isolados da secreção cutânea de Hypsiboas Albopunctatus E Leptodactylus Labyrinthicus ». Universidade Federal de Goiás, 2012. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tde/1049.

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Made available in DSpace on 2014-07-29T15:12:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Quimica Eliane S F Alves.pdf: 4161656 bytes, checksum: 36361e76b0e7ad73aea61043645102f1 (MD5) Previous issue date: 2012-02-24
Currently, the emergence of fungi, bacteria and viruses resistant to multiple drugs has stimulated interest in the development of antimicrobial peptides with increased therapeutic potential. They generally have properties of extreme importance as antimicrobial selective toxicity, rapid action, specific mechanisms of action and a broad spectrum of antimicrobial action. Many of these features can be found in peptides isolated from frog skin secretions. The main factor that differentiates antimicrobial peptides from other commonly antibiotics used in the conventional therapy is related to their mechanism of action. The driving force for much of the action of antimicrobial peptides is their ability to lysis cell membranes, rapidly killing a broad spectrum of microorganisms. Accordingly, the conformation of the peptide has a great importance in their interaction with the amphiphilic structure of biological membranes. The determination of the tridimensional structure by Nuclear Magnetic Resonance (NMR) technique allows the identification of the spatial position of each amino acid residue and highlighting those that are important for its action and, therefore, could be modified to increase the antimicrobial activity. The study of the three-dimensional structure of peptides in solution is an advantage of the NMR spectroscopy, since it can simulate the physiological environment, by means of surfactants. In this context, the tridimensional structures of two synthetic peptides: ocellatin-P1G16 (GLLDTLKGAAKNVVGGLASKVMEKL-NH2), isolated from the amphibians Leptodactylus labyrinthicus, and hylin a1 (IFGAILPLALGALKNLIK-NH2), isolated from Hypsiboas Albopunctatus, were proposed by NMR. The amphipathic caracter can be visualized by separation of the helix into two distinct sides, one hydrophobic (nonpolar) and the other hydrophilic (polar). The peptide hylin a1 in presence of SDS-d25 showed helical structure between residues Ile-5 to Ile-17 and the peptide ocellatin-P1G16 in SDS-d25 micelles showed a α-helical structure between residues Leu-3 to Lys-24, both are presented in amphipathic α-helix Finally, the molecular analyses of amphipathicity, electrostatic interaction, polarity and exchange hydrogen/deuterium, corroborate the proposed model, suggesting a model of parallel orientation to the peptide hylin a1 and the peptide ocellatin-P1G16 a parallel orientation, but with the cterminal portion immersed in the micelle SDS-d25 between residues Ser-19 to Leu-25, as observed by analyzing exchange hydrogen/deuterium. These structural characteristics make these peptides promising candidates for the development of a new antimicrobial drug.
Atualmente o surgimento de fungos, bactérias e vírus resistentes a múltiplos fármacos tem estimulado o interesse pelo desenvolvimento de peptídeos antimicrobianos com maior potencial terapêutico. Eles em geral possuem propriedades de extrema importância como um amplo espetro ação antimicrobiana, toxicidade seletiva, ação rápida e mecanismos de ação específicos. Muitas dessas características podem ser encontradas em peptídeos isolados da secreção cutânea de anuros. O principal fator que diferencia peptídeos antimicrobianos de antibióticos utilizados na terapia convencional está relacionado com o seu mecanismo de ação. A força motriz para a ação de grande parte de peptídeos antimicrobianos é sua habilidade em provocar lise em membranas celulares, matando rapidamente um amplo espectro de microorganismos. Nesse sentido, a conformação do peptídeo tem uma grande importância em sua interação com a estrutura anfifílica das membranas biológicas. Nesse contexto, a determinação da estrutura tridimensional por meio da espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (RMN) possibilita a identificação da posição espacial de cada resíduo de aminoácido na estrutura terciaria, destacando aqueles que são importantes para a sua ação e que, portanto, poderiam ser modificados para aumentar a atividade antimicrobiana. O estudo da estrutura 3D dos peptídeos em soluçao é uma vantagem da espectroscopia de RMN, pois se consegue simular o ambiente fisiológico por meio de sulfactantes. Nesse contexto, determinou-se através da RMN a estrutura tridimensional de dois peptídeos sintéticos: ocellatina-P1G16 (GLLDTLKGAAKNVVGGLASKVMEKL-NH2) isolado dos anfíbios Leptodactylus labyrinthicus, e o peptídeo hilina a1 (IFGAILPLALGALKNLIKNH2), isolado do anfíbio Hypsiboas albopunctatus. A anfipaticidade da estrutura pode ser observada pela separação da estrutura em duas faces distintas, uma hidrofobica (apolar) e outra hidrofilica (polar). O peptídeo hilina a1, em presença de SDS-d25, apresentou estrutura helicoidal entre os resíduos Ile-5 a Ile-17 e o peptídeo ocellatina-P1G16, em presença de SDS-d25, apresentou estrutura em α-hélice entre os resíduos Leu-3 a Lys-24, ambos em α-hélice anfipática. Por fim, as análises moleculares de anfipaticidade, interação eletrostática, polaridade e troca H2O/D2O, apontaram a mesma face de interação dos peptídeos com a membrana, propondo um modelo de orientação paralela para o peptídeo hilina a1 e para o peptídeo ocellatina- P1G16 uma orientação paralela, porém com a porção c-terminal mergulhada na micela de SDS-d25 entre os resíduos Ser-19 e Leu-25. Tais características estruturais tornam esses peptídeos candidatos promissores para o desenvolvimento de um novo fármaco antimicrobiano.

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Thèses sur le sujet « Isolats de terrain »

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