Littérature scientifique sur le sujet « Computational docking »
Créez une référence correcte selon les styles APA, MLA, Chicago, Harvard et plusieurs autres
Consultez les listes thématiques d’articles de revues, de livres, de thèses, de rapports de conférences et d’autres sources académiques sur le sujet « Computational docking ».
À côté de chaque source dans la liste de références il y a un bouton « Ajouter à la bibliographie ». Cliquez sur ce bouton, et nous générerons automatiquement la référence bibliographique pour la source choisie selon votre style de citation préféré : APA, MLA, Harvard, Vancouver, Chicago, etc.
Vous pouvez aussi télécharger le texte intégral de la publication scolaire au format pdf et consulter son résumé en ligne lorsque ces informations sont inclues dans les métadonnées.
Articles de revues sur le sujet "Computational docking"
Xing, Bo. « Computational Intelligence in Cross Docking ». International Journal of Software Innovation 2, no 1 (janvier 2014) : 1–8. http://dx.doi.org/10.4018/ijsi.2014010101.
Texte intégralLengauer, Thomas, et Matthias Rarey. « Computational methods for biomolecular docking ». Current Opinion in Structural Biology 6, no 3 (juin 1996) : 402–6. http://dx.doi.org/10.1016/s0959-440x(96)80061-3.
Texte intégralKhamis, Mohamed A., Walid Gomaa et Walaa F. Ahmed. « Machine learning in computational docking ». Artificial Intelligence in Medicine 63, no 3 (mars 2015) : 135–52. http://dx.doi.org/10.1016/j.artmed.2015.02.002.
Texte intégralLee, Kyoungrim, et Joo-Woon Lee. « Computational Approaches to Protein-Protein Docking ». Current Proteomics 5, no 1 (1 avril 2008) : 10–19. http://dx.doi.org/10.2174/157016408783955083.
Texte intégralHecht, David, et Gary Fogel. « Computational Intelligence Methods for Docking Scores ». Current Computer Aided-Drug Design 5, no 1 (1 mars 2009) : 56–68. http://dx.doi.org/10.2174/157340909787580863.
Texte intégralAl-hussaniy, Hany Akeel. « The development of molecular docking and molecular dynamics and their application in the field of chemistry and computer simulation ». Journal of medical pharmaceutical and allied sciences 12, no 1 (31 janvier 2023) : 5552–62. http://dx.doi.org/10.55522/jmpas.v12i1.4137.
Texte intégralWang, Kai, Nan Lyu, Hongjuan Diao, Shujuan Jin, Tao Zeng, Yaoqi Zhou et Ruibo Wu. « GM-DockZn : a geometry matching-based docking algorithm for zinc proteins ». Bioinformatics 36, no 13 (5 mai 2020) : 4004–11. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa292.
Texte intégralButt, Sania Safdar, Yasmin Badshah, Maria Shabbir et Mehak Rafiq. « Molecular Docking Using Chimera and Autodock Vina Software for Nonbioinformaticians ». JMIR Bioinformatics and Biotechnology 1, no 1 (19 juin 2020) : e14232. http://dx.doi.org/10.2196/14232.
Texte intégralTaufer, M., R. Armen, Jianhan Chen, P. Teller et C. Brooks. « Computational multiscale modeling in protein--ligand docking ». IEEE Engineering in Medicine and Biology Magazine 28, no 2 (mars 2009) : 58–69. http://dx.doi.org/10.1109/memb.2009.931789.
Texte intégralBaskaran, C., et M. Ramachandran. « Computational molecular docking studies on anticancer drugs ». Asian Pacific Journal of Tropical Disease 2 (janvier 2012) : S734—S738. http://dx.doi.org/10.1016/s2222-1808(12)60254-0.
Texte intégralThèses sur le sujet "Computational docking"
Totrov, Maxim. « Computational studies on protein-ligand docking ». Thesis, Open University, 1999. http://oro.open.ac.uk/58005/.
Texte intégralLivoti, Elsa Livoti. « Experimentally validated computational docking to characterize protein-protein interactions ». Thesis, University of Kent, 2017. https://kar.kent.ac.uk/67450/.
Texte intégralMoont, Gidon. « Computational modelling of protein/protein and protein/DNA docking ». Thesis, University College London (University of London), 2005. http://discovery.ucl.ac.uk/1445703/.
Texte intégralTantar, Alexandru-Adrian. « Hybrid parallel metaheuristics for molecular docking on computational grids ». Thesis, Lille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LIL10166.
Texte intégralThe thesis proposes an extensive analysis of adaptive hierarchical parallel metaheuristics for ab initio conformational sampling. Standing as an NP, combinatorial, highly multi-modal optimization problem, conformational sampling requires for high-performance large scale hybrid approaches to be constructed. Following an incremental definition, minimum complexity conformational sampling mathematical models are first analyzed, entailing a review of different force field formulations. A comprehensive analysis is conducted on a large set of operators and local search algorithms including adaptive and dynamic mechanisms. As determined by the analysis outcomes, complex a priori and online parameter tuning stages are designed. finally, highly scalable hierarchical hybrid distributed algorithm designs are proposed. Experimentation is carried over multiple parallelization models with afferent cooperation topologies. Expenmentations resulted in unprecedented results to be obtained. Multiple perfect conformational matches have been determined, on highly difficult protein structure prediction and molecular docking benchmarks, with RMSD average values below 1.0A. The validation of the proposed hybrid approaehes was performed on Grid'5000, a French computational grid, with almost 5000 computational cores. A Globus Toolkit hased Grid'SOOO system image has been developed, sustaining large scale distributed deployments. The constructed hierarchical hybrid distributed algorithm has been deployed on multiple clusters, with almost 1000 computing cores. Finally, a parallel AutoDock version was developed using the ParadisEO framework, integrating the developed algorithms
Turzo, SM Bargeen Alam. « Computational Investigation of Protein Assemblies ». Cleveland State University / OhioLINK, 2018. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=csu1532714714406789.
Texte intégralJiménez, García Brian. « Development and optimization of high-performance computational tools for protein-protein docking ». Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2016. http://hdl.handle.net/10803/398790.
Texte intégralGràcies als recents avenços en computació, el nostre coneixement de la química que suporta la vida ha incrementat enormement i ens ha conduït a comprendre que la química de la vida és més sofisticada del que mai haguéssim pensat. Les proteïnes juguen un paper fonamental en aquesta química i són descrites habitualment com a les fàbriques de les cèl·lules. A més a més, les proteïnes estan involucrades en gairebé tots els processos fonamentals en els éssers vius. Malauradament, el nostre coneixement de la funció de moltes proteïnes és encara escaig degut a les limitacions actuals de molts mètodes experimentals, que encara no són capaços de proporcionar-nos estructures de cristall per a molts complexes proteïna-proteïna. El desenvolupament de tècniques i eines informàtiques d’acoblament proteïna-proteïna pot ésser crucial per a ajudar-nos a reduir aquest forat. En aquesta tesis, hem presentat un nou mètode computacional de predicció d’acoblament proteïna-proteïna, LightDock, que és capaç de fer servir diverses funcions energètiques definides per l’usuari i incloure un model de flexibilitat de la cadena principal mitjançant la anàlisis de modes normals. Segon, diverses eines d’interès per a la comunitat científica i basades en tecnologia web han sigut desenvolupades: un servidor web de predicció d’acoblament proteïna-proteïna, una eina online per a caracteritzar les interfícies d’acoblament proteïna-proteïna i una eina web per a incloure dades experimentals de tipus SAXS. A més a més, les optimitzacions fetes al protocol pyDock i la conseqüent millora en rendiment han propiciat que el nostre grup de recerca obtingués la cinquena posició entre més de 60 grups en les dues darreres avaluacions de l’experiment internacional CAPRI. Finalment, hem dissenyat i compilat els banc de proves d’acoblament proteïna-proteïna (versió 5) i proteïna-ARN (versió 1), molt importants per a la comunitat ja que permeten provar i desenvolupar nous mètodes i analitzar-ne el rendiment en aquest marc de referència comú.
Buonfiglio, Rosa <1985>. « Computational strategies to include protein flexibility in Ligand Docking and Virtual Screening ». Doctoral thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2014. http://amsdottorato.unibo.it/6330/1/Tesi_Buonfiglio.pdf.
Texte intégralBuonfiglio, Rosa <1985>. « Computational strategies to include protein flexibility in Ligand Docking and Virtual Screening ». Doctoral thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2014. http://amsdottorato.unibo.it/6330/.
Texte intégralMoreno, Nascimento Érica Cristina. « Understanding Acetylcholinesterase Inhibitors : Computational Modeling Approaches ». Doctoral thesis, Universitat Jaume I, 2017. http://hdl.handle.net/10803/406125.
Texte intégralPatel, Dharmeshkumar. « Computational Studies of Ion Channel Blockers and Protein Aggregation ». Thesis, The University of Sydney, 2017. http://hdl.handle.net/2123/17134.
Texte intégralLivres sur le sujet "Computational docking"
Zaheer Ul-Haq et Angela K. Wilson, dir. Frontiers in Computational Chemistry : Volume 6. BENTHAM SCIENCE PUBLISHERS, 2022. http://dx.doi.org/10.2174/97898150368481220601.
Texte intégralChapitres de livres sur le sujet "Computational docking"
Ehrlich, Lutz P., et Rebecca C. Wade. « Protein-Protein Docking ». Dans Reviews in Computational Chemistry, 61–97. New York, USA : John Wiley & Sons, Inc., 2001. http://dx.doi.org/10.1002/0471224413.ch2.
Texte intégralMuegge, Ingo, et Matthias Rarey. « Small Molecule Docking and Scoring ». Dans Reviews in Computational Chemistry, 1–60. New York, USA : John Wiley & Sons, Inc., 2001. http://dx.doi.org/10.1002/0471224413.ch1.
Texte intégralBitencourt-Ferreira, Gabriela, et Walter Filgueira de Azevedo. « SAnDReS : A Computational Tool for Docking ». Dans Methods in Molecular Biology, 51–65. New York, NY : Springer New York, 2019. http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9752-7_4.
Texte intégralPrandi, Davide. « A Formal Approach to Molecular Docking ». Dans Computational Methods in Systems Biology, 78–92. Berlin, Heidelberg : Springer Berlin Heidelberg, 2006. http://dx.doi.org/10.1007/11885191_6.
Texte intégralWalters, D. Eric. « Computational Docking to Sweet Taste Receptor Models ». Dans Sweetness and Sweeteners, 162–67. Washington, DC : American Chemical Society, 2008. http://dx.doi.org/10.1021/bk-2008-0979.ch011.
Texte intégralMachado, K. S., A. T. Winck, D. D. Ruiz et O. Norberto de Souza. « Discretization of Flexible-Receptor Docking Data ». Dans Advances in Bioinformatics and Computational Biology, 75–79. Berlin, Heidelberg : Springer Berlin Heidelberg, 2010. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-15060-9_10.
Texte intégralKim, Chong-Min, Chung-In Won, Jae-Kwan Kim, Joonghyun Ryu, Jong Bhak et Deok-Soo Kim. « Protein-Ligand Docking Based on Beta-Shape ». Dans Transactions on Computational Science IX, 123–38. Berlin, Heidelberg : Springer Berlin Heidelberg, 2010. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-16007-3_6.
Texte intégralNovoa, Eva Maria, Lluis Ribas de Pouplana et Modesto Orozco. « Small Molecule Docking from Theoretical Structural Models ». Dans Computational Modeling of Biological Systems, 75–95. Boston, MA : Springer US, 2012. http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4614-2146-7_4.
Texte intégralPeh, Sally Chen Woon, et Jer Lang Hong. « Protein Ligand Docking Using Simulated Jumping ». Dans Computational Science and Its Applications -- ICCSA 2016, 1–10. Cham : Springer International Publishing, 2016. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-42111-7_1.
Texte intégralOhue, Masahito. « Re-ranking of Computational Protein–Peptide Docking Solutions with Amino Acid Profiles of Rigid-Body Docking Results ». Dans Advances in Computer Vision and Computational Biology, 749–58. Cham : Springer International Publishing, 2021. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-71051-4_58.
Texte intégralActes de conférences sur le sujet "Computational docking"
Hui, Liu, Lin Feng, Yang Jianli et Liu Xiu-Ling. « Side-chain flexibility in protein docking ». Dans 2015 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB). IEEE, 2015. http://dx.doi.org/10.1109/cibcb.2015.7300315.
Texte intégralJanežič, Dušanka, Janez Konc, Matej Penca, Ksenija Poljanec, George Maroulis et Theodore E. Simos. « Protein Binding Sites Prediction and Docking ». Dans COMPUTATIONAL METHODS IN SCIENCE AND ENGINEERING : Advances in Computational Science : Lectures presented at the International Conference on Computational Methods in Sciences and Engineering 2008 (ICCMSE 2008). AIP, 2009. http://dx.doi.org/10.1063/1.3225337.
Texte intégralVAUGHAN, R., et E. BERGMANN. « Manually augmented proximity operations and docking control ». Dans 7th Computational Fluid Dynamics Conference. Reston, Virigina : American Institute of Aeronautics and Astronautics, 1985. http://dx.doi.org/10.2514/6.1985-1941.
Texte intégralBoisson, Jean-Charles, Laetitia Jourdan, El-Ghazali Talbi et Dragos Horvath. « Parallel multi-objective algorithms for the molecular docking problem ». Dans 2008 IEEE Symposium on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB 2008). IEEE, 2008. http://dx.doi.org/10.1109/cibcb.2008.4675777.
Texte intégralLi, Hongjian, Kwong-Sak Leung et Man-Hon Wong. « idock : A multithreaded virtual screening tool for flexible ligand docking ». Dans 2012 IEEE Symposium on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB). IEEE, 2012. http://dx.doi.org/10.1109/cibcb.2012.6217214.
Texte intégralGhosh, Preetam, Samik Ghosh, Kalyan Basu, Sajal K. Das et Simon Daefler. « A Stochastic model to estimate the time taken for Protein-Ligand Docking ». Dans 2006 IEEE Symposium on Computational Intelligence and Bioinformatics and Computational Biology. IEEE, 2006. http://dx.doi.org/10.1109/cibcb.2006.330963.
Texte intégralCinar, Iraz, Irem Aksoy et Gunnur Guler. « Spectroscopic and Computational Molecular Docking studies on the protein-drug interactions ». Dans 2020 Medical Technologies Congress (TIPTEKNO). IEEE, 2020. http://dx.doi.org/10.1109/tiptekno50054.2020.9299322.
Texte intégralLiu, Shang, et Wei Huo. « Terminal Sliding Mode Control for Space Rendezvous and Docking ». Dans 2015 International Conference on Computational Intelligence and Communication Networks (CICN). IEEE, 2015. http://dx.doi.org/10.1109/cicn.2015.297.
Texte intégralDu, Xiaoxu, et Huan Wang. « Analysis of Hydrodynamic Characteristics in the Process of Autonomous Underwater Vehicle Docking ». Dans ASME 2015 34th International Conference on Ocean, Offshore and Arctic Engineering. American Society of Mechanical Engineers, 2015. http://dx.doi.org/10.1115/omae2015-42323.
Texte intégralAdamson, Torin, Selina Bauernfeind, Bruna Jacobson et Lydia Tapia. « Using player generated data to elucidate molecular docking ». Dans BCB '20 : 11th ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Health Informatics. New York, NY, USA : ACM, 2020. http://dx.doi.org/10.1145/3388440.3414704.
Texte intégral