Littérature scientifique sur le sujet « Cation moléculaire »
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Articles de revues sur le sujet "Cation moléculaire"
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Colin, Jean-Christophe, et Yves Journaux. « Une famille d’aimants bimétalliques Cu II Mn II à précurseurs moléculaires et contre-cations chiraux : synthèse et propriétés magnétiques ». Comptes Rendus de l'Académie des Sciences - Series IIC - Chemistry 4, no 3 (mars 2001) : 207–13. http://dx.doi.org/10.1016/s1387-1609(00)01218-4.
Texte intégralThèses sur le sujet "Cation moléculaire"
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Daigle, Nikolas. « Caractérisation moléculaire de SLC12A8 et SLC12A9, deux protéines membranaires appartenant à la famille des cotransporteurs cation-CL ». Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/28236/28236.pdf.
Texte intégral
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Van, Severen Marie-Céline. « Apports théoriques à la compréhension du comportement de la paire de valence du cation Pb2+ ». Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066310.
Texte intégralRésumé :
Le plomb, et en particulier son cation Pb2+, est responsable des empoisonnements regroupés sous le nom de saturnisme. Il s’agit cependant d’un métal dont la physico-chimie est encore mal connue et qui requiert des investigations théoriques de manière à mieux comprendre son influence dans un environnement biologique. A un niveau plus fondamental, il convient également de mieux comprendre l’origine des transitions structurales entre complexes de type holodirigés et complexes de type hémidirigés. A cet effet, une étude systématique des séries [PbLn]2+ est présentée. La structure électronique des différents systèmes obtenus a été étudiée au moyen de l’analyse topologique ELF (Electron Localization Function). On montre comment la transition holo- / hémidirigée se traduit au niveau de la densité électronique du bassin monosynaptique V(Pb) correspondant à la paire libre externe du cation Pb2+. Cette étude a été étendue aux ligands anioniques et ligands mixtes. Dans un second temps, la recherche d’un chélatant plus spécifique du Pb2+ a mené à l’étude de ligands pouvant stabiliser la paire libre 6s2. Dans un troisième temps, une étude sur des cas réels de métalloenzymes et métallorégulatrices a été réalisée afin de mieux comprendre l’impact de Pb2+ sur l’organisme. Enfin, le besoin de prendre en compte la solvatation et l’environnement protéique dans nos études a mené à la Mécanique Moléculaire (SIBFA). La prise en compte de Pb2+ et donc sa paramétrisation est la première étape à franchir.
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Lorriaux-Rubbens, Annick. « Spectroscopie moléculaire de quelques anions halogènes tétraèdriques de métaux du groupe III B (Al, In) : calcul de champs de forces : évolution en fonction du cation alcalin associé ». Lille 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LIL10020.
Texte intégralRésumé :
Une étude approfondie des trétrachloroalumates alcalins et pseudo-alcalins à l'état solide par spectrométrie moléculaire a été nécessaire pour une meilleure compréhension des phénomènes électrochimiques se produisent soit en solution, soit au voisinage immédiat de l'électrode. Les résultats issus des attributions faites à partir des interprétations des spectres de vibration enregistrés dans diverses conditions expérimentales, ne nous autorisent pas à mener une étude comparative de ces sels comme elle a pu être proposée par radiocritallographie. La réalisation de calculs dde champs de forces dans les cristaux à partir d'une version dérivée du programme de T. Shimanouchi, permet d'établir une corrélation entre les résulats des études structurales et vibrationnelles. Nous avons montré une variation linéaire des constantes de forces Al-Cl et Cl. . . Cl d'un anion, de la distribution d'énergie potentielle de la liaison Al-Cl et de l'interaction liaison-liaison de l'ion tétrachloroaluminate en fonction du rayon minimum calculé du cation associé. Des relations entre certaines valeurs de constantes de force ont pu être établies et concernent les édifices ioniques tétraédriques dans un cristal associés à des ions monovalents. Nos études ont été étendues aux halogénoindates de potassium issus des diagrammes ternaires KX-InX3-H2O (X= Cl, Br)
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Mihai, Simona. « Systèmes biomimétiques multifonctionnels via des interactions cation-π, sucres-protéines et autoassemblages de quartets de guanosine ». Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20217.
Texte intégralRésumé :
Le fonctionnement du monde vivant repose sur des processus de reconnaissance moléculaire entre les différents partenaires. Cette reconnaissance a lieu grâce à diverses interactions faibles non covalentes. Dans le cadre de ce travail de thèse nous nous sommes intéressés aux processus de reconnaissance moléculaire impliquant les chaînes latérales d'aminoacides aromatiques rencontrées dans l'adhésion cellulaire, le transport de divers cations et la reconnaissance de neurotransmetteurs au niveau des synapses du système nerveux central. Nous avons ainsi mis en évidence la compléxation de carbohydrates par des noyaux aromatiques au travers d'interactions CH-pi ainsi que la complexation de divers sels organiques et inorganiques au travers d'interactions cation-pi par ces mêmes récepteurs. Nous avons ainsi réalisé le transport compétitif de neurotransmetteurs au travers d'une membrane hybride alumino-siliciée fonctionnalisée par nos récepteurs synthétiques. D'autre part, nous avons accordé une importance particulière à la superstructure dynamique formée de quartets de guanosine et cherché notamment à observer le transfert de chiralité de cette structure à la matrice inorganique durant un processus sol gel. Nous avons également stabilisé les G-quadruplexes dans un milieu confiné silicié et avons développé une méthode d'encapsulation de principes actifs basée sur la reconnaissance spécifique des G4The functioning of the living world rests on processes of molecular recognition between the various partners. This recognition takes place thanks to diverse weak interactions not covalentes. Within the framework of this work of thesis we were interested in the processes of molecular recognition involving the side chains of aromatic aminoacides met in the cellular membership, the transport of diverse cations and the recognition of neurotransmitters at the level of the synapses of the central nervous system. We so put in evidence the compléxation of carbohydrates by aromatic nuclei through interactions CH-pi as well as the compléxation of diverse organic and inorganic salts through interactions cation-pi by these same receivers. We so realized the competitive transport of neurotransmitters through a hybrid membrane alumino-siliciée fonctionnalisée by our synthetic receivers. On the other hand, we granted a particular importance for the dynamic superstructure formed by quartets of guanosine and tried in particular to observe the transfer of chirality of this structure in the inorganic matrix during a sol-gel process. We also stabilized G-quadruplexes in a stuffy silicié environment and developed a method of encapsulation of active principles based on the specific recognition of G4
5
Escax-Bastet, Virginie. « Photomagnétisme dans des analogues cobalt-fer du bleu de Prusse : de l'excitation moléculaire à l'aimantation macroscopique ». Paris 6, 2002. http://www.theses.fr/2002PA066125.
Texte intégral
6
Jeannin, Marc. « Reconnaissance moléculaire dans des solutions ioniques paramagnétiques par relaxation nucléaire ». Université Joseph Fourier (Grenoble), 1994. http://www.theses.fr/1994GRE10070.
Texte intégralRésumé :
Nous etudions la structure locale de solutions d'electrolytes comportant des impuretes parama/gnetiques par des mesures des temps de relaxation nucleaire en rmn. Grace aux equations integrales de la theorie des liquides et au modele de debye-huckel d'ecrantage du potentiel coulombien, nous avons obtenu des potentiels de force moyenne, puis des fonctions de correlation de paire pour des ions attractifs en solution. Nous expliquons ainsi les taux de relaxation intermoleculaires d'origine dipolaire magnetique des protons des cations tetramethylphosphonium couples aux spins electroniques des anions radicalaires nitrosodisulfonate en solution dans l'eau lourde. Nous avons ensuite developpe un modele permettant d'evaluer l'amplitude de la forte interaction hyperfine scalaire du spin electronique avec les noyaux de phosphore dont nous etudions les deplacements des raies de resonance en fonction de la concentration en ions paramagnetiques. Nous avons pu interpreter remarquablement le rapport anormal des temps de relaxation longitudinale et transverse intermoleculaires voisin de 1. 5 des noyaux de phosphore du tetramethylphosphonium en presence de radicaux nitrosodisulfonate a diverses concentrations ioniques. Nous confirmons ainsi la validite de notre modele decrivant les proprietes dynamiques d'ions attractifs dilues dans l'eau. Pour les valeurs absolues des taux de relaxation des phosphores, nos calculs conduisent a des valeurs un peu trop faibles. Notons cependant que notre modele ne dispose d'aucun parametre ajustable. Il convient de tenir compte egalement des effets d'anisotropie dans les processus diffusionnels a courte distance dus a la forme non spherique des ions. L'importance de ces effets d'anisotropie vient d'etre prouve sur un systeme plus simple constitue par une solution de radicaux tempol dans l'eau. L'introduction d'un potentiel effectif electrostatique anisotrope de paire donne alors un tres bon accord avec l'experience
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Golebiowski, Jérôme. « Modélisation d'extractants spécifiques de cations métalliques par des méthodes ab initia et hybrides mécanique quantique / mécanique moléculaire ». Nancy 1, 2000. http://www.theses.fr/2000NAN10120.
Texte intégralRésumé :
Jusqu'à présent, les molécules les plus efficaces pour l'extraction sélective du césium d'effluents radioactifs acides se trouvent dans la famille des calix[4]arènes portant des groupements éther couronne. Des études théoriques par dynamique moléculaire utilisant des potentiels additifs ont permis d'identifier certains phénomènes (préorganisation, effet de la solvatation,. . . ) influençant la sélectivité dans la série des cations alcalins. Cependant, les effets de polarisation électronique n'ont pas pu être pris en compte avec ces potentiels. Afin de quantifier le plus précisément possible les effets non additifs, nous, proposons une étude par calculs ab initio de tels systèmes. Dans la première partie, l'interaction intrinsèque entre les cations et les différentes parties du macrocycle calixarène couronne a été analysée au travers d'une étude approfondie d'éthers couronne de la famille du 21C7 et d'un calixarène de base, le dérivé tétraméthoxy dans sa conformation 1,3-alternée. La comparaison des résultats avec ceux ,obtenus sur le calixarène couronne6 met aussi en évidence pour ce dernier la présence d'interactions cation-TC dans le complexe du césium, contrairement au complexe du cation sodium. Le comportement dynamique est ensuite étudié dans la seconde partie par la mise en oeuvre de simulations de dynamique moléculaire par potentiel hybride ,mécanique quantique / mécanique moléculaire. L'analyse des trajectoires permet de décomposer l'énergie d'interaction entre les cations alcalins et le calixarène-couronne. Les charges atomiques des atomes d' oxygène et dles atomes de carbone de la cavité aromatique sont analysées dans les différents complexes et permettent d'estimer qualitativement la polarisation électronique du ligand et l'influence du contre-ion nitrate lors des trajectoires clans les solvants eau, acétonitrile et chloroforme. Ces études ont mis l'accent sur la nécessité de la prise en compte explicite d'effets non additifs dans les phénomènes de complexation ion - macrocycle pour une représentation précise des effets électroniques et peuvent être à la base de la mise au point de champs de forces classiques utilisant des potentiels polarisables.
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Kapota, Catherine. « Interactions du cation sodium avec des molécules d'intérêt biologique : acides aminés et oligopeptides ». Phd thesis, Ecole Polytechnique X, 2005. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00001365.
Texte intégralRésumé :
Il existe, aujourd'hui, de nombreuses et efficaces méthodes de caractérisation structurale tridimensionnelle de composés biologiques en phase condensée (RMN, diffraction des rayons X ou dichroïsme circulaire). Depuis une dizaine d'années, ce champ d'études s'est étendu à la phase gazeuse. Ce travail s'inscrit dans ce contexte et concerne le rôle structurant de Na+ sur les acides aminés Gly et Pro et sur des oligo-peptides de Gly et Ala, en combinant approches théoriques et expérimentales de spectroscopie infrarouge d'ions gazeux par dissociation multiphotonique (IRMPD) couplée à la spectrométrie de masse. Les spectres IRMPD expérimentaux des complexes sodiés d'acide aminé, nous ont permis d'identifier la présence exclusive de la forme zwitterionique dans le cas de Pro-Na+ et la présence de la forme non-zwitterionique dans le cas de Gly-Na+, conformément aux résultats de chimie quantique. Ainsi nous avons fourni la première démonstration directe de la présence d'un zwitterion d'acide aminé en phase gazeuse. Il s'agissait des premiers spectres infrarouge d'ions biologiques en phase gazeuse. L'étude théorique des complexes Glyn-Na+ et Alan-Na+ a montré que, pour n<=5, les conformères de plus basse énergie maximisent l'interaction électrostatique du métal avec les n groupements carbonyles, avec ou sans l'amine terminale. Ce comportement a été confirmé d'une part, par des expériences de spectroscopie IRMPD pour n=2,3 et d'autre part, par la détermination des énergies de liaison de ces complexes par la méthode cinétique de Cooks (n=2-4). Pour l'étude théorique de Glyn-Na+, 5<=n<=10, nous avons couplé des recherches conformationnelles Monte-Carlo basées sur des calculs de champ de forces AMBER, à des optimisations par calculs de type ri-BLYP utilisant l'approximation "résolution de l'identité". Cette approche a permis d'explorer en détail des sur! faces de potentiel très complexes. On peut distinguer deux classes limites de conformères, celle où le peptide est globulaire et celle où il adopte une conformation en hélice alpha ou 310. Nous avons montré que les structures les plus basses en énergie présentent le plus souvent une complexation tétradentate avec une forte auto-solvatation. Ces structures sont toutes globulaires pour n<10. Dans le cas de Gly10-Na+, le conformère le plus bas en énergie a une structure globulaire autour du sodium et un domaine de cinq résidus en hélice 310.
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Auffinger, Pascal. « Simulations de dynamique moléculaires d'ARN – Structures et environnements ». Habilitation à diriger des recherches, Université Louis Pasteur - Strasbourg I, 2004. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00265627.
Texte intégralRésumé :
Les ARN, seules molécules à la fois informatives et catalytiques, interviennent à tous les niveaux de la vie cellulaire. Pour certaines molécules d'ARN, comme les ARN messagers, la fonction réside dans la séquence. Pour d'autres, comme les ARN de transfert, la fonction réside dans l'adoption et le maintien d'une structure tridimensionnelle compacte. Ces derniers, dits ARN structurés, nécessitent des ions Mg2+ pour maintenir leur structure tertiaire et assurer leur fonction de catalyse. Dans l'équipe d'Eric WESTHOF, de nombreux modèles tridimensionnels de ces ARN structurés, élaborés à partir de contraintes fournies par des méthodes de cartographie chimique en solution et de comparaison de séquences, ont été construits. Ces modèles regroupent l'ensemble des données expérimentales existantes pour un système donné et permettent ainsi de proposer des mécanismes de réaction ou de reconnaissance pertinents. Toutefois, ces modèles ne prétendent pas atteindre la résolution atomique de structures cristallographiques. C'est pourquoi des méthodes de simulations de dynamique moléculaire (DM) sont développées afin d'affiner les structures modélisées et, ultérieurement, de mieux comprendre les relations structure-fonction de ces ARN.Les progrès récents dans les techniques de simulation de DM réalisés au laboratoire, nous permettent maintenant de simuler la dynamique de molécules de la taille d'un ARN de transfert ou de petits ribozymes avec un degré de précision jusqu'alors rarement atteint. Pour mieux comprendre les fonctions des ARN, qui sont par nature des processus dynamiques, nous utilisons les méthodes de DM pour compléter les informations structurales fragmentaires qui sont disponibles sur l'hydratation de ces ARN et le rôle d'agents structurants (ions monovalents, divalents et anions). En effet, cette connaissance préalable est indispensable pour la compréhension du repliement et de la stabilité de ces ARN. De plus, elle contribuera à la construction de modèles structuraux plus précis. Parmi les systèmes que nous nous proposons d'étudier se trouvent les ARN de transfert ainsi que des fragments d'ARN ribosomaux. Des complexes entre ARN et antibiotiques ainsi que des complexes ARN/protéines sont en cours d'étude.
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Semrouni, David. « Énergétique et spectroscopie de polypeptides par dynamique moléculaire : champ de force de seconde génération et chimie quantique ». Phd thesis, Ecole Polytechnique X, 2010. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00528244.
Texte intégralRésumé :
La spectroscopie de dissociation par absorption de multiples photons infrarouge ou IRMPD permet d'obtenir les signatures vibrationnelles d'espèces chargées en phase gazeuse. L'attribution des modes de vibration pour établir une relation entre spectre et structure moléculaire n'est cependant pas triviale et nécessite le recours à la modélisation moléculaire. Ce mémoire présente une méthodologie complète de calcul de spectres vibrationnels et son application à des peptides attachés à un cation sodium. Nous commençons par l'exploration efficace de l'espace conformationnel complexe de ces systèmes, en utilisant la dynamique moléculaire par échange de répliques, pour sélectionner les structures les plus probables. Nous avons utilisé le champ de force polarisable AMOEBA pour traiter les systèmes cation-peptide, et (ré)optimisé des paramètres en fonction des problèmes abordés, notamment pour améliorer le calcul de spectres vibrationnels de composés modèles. La simulation spectrale pour les structures sélectionnées a été effectuée avec des méthodes quantiques DFT et MP2, après avoir évalué les performances d'une série de fonctionnelles, incluant ou non une correction pour les interactions de dispersion. Nous présentons finalement la transformation de Fourier de la fonction d'auto-corrélation du moment dipolaire (DACF) calculée pour une trajectoire de dynamique moléculaire classique, comme moyen de simulation de spectre infrarouge incluant les effets de température et les couplages anharmoniques nécessaires à une réelle comparaison avec l'expérience. La pertinence de la combinaison DACF/AMOEBA pour reproduire les spectres IRMPD est discutée. Cet ensemble de méthodes a été appliqué à la structure, à l'énergétique et à la spectroscopie infrarouge de poly-glycines contenant de deux à huit résidus, attachées à un cation sodium. Les spectres calculés pour les structures de plus basses énergies permettent l'attribution des bandes expérimentales, et ainsi d'établir les structures de ces complexes. L'enroulement du peptide autour de l'ion sodium est réalisé via les atomes d'oxygène des groupes amides. Lorsque la coordination de l'ion est saturée, la structuration du peptide est complétée par des coudes.
Livres sur le sujet "Cation moléculaire"
1
C, Gleitzer, Goodenough J. B, O'Keefe M, Hyde B. G et Weser Ulrich, dir. Cation ordering and electron transfer. Berlin : Springer-Verlag, 1985.
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2
Structure and Bonding : Cation Ordering and Electron Transfer (Structure and Bonding). Springer, 1985.
Trouver le texte intégralChapitres de livres sur le sujet "Cation moléculaire"
1
« 11. Associations avec anions, cations et molécules inorganiques ». Dans Chimie moléculaire et supramoléculaire des sucres, 177–97. EDP Sciences, 1995. http://dx.doi.org/10.1051/978-2-7598-0267-8.c012.
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