Thèses sur le sujet « Amino Acid Sequence Homology »
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Menlove, Kit J. « Model Detection Based upon Amino Acid Properties ». BYU ScholarsArchive, 2010. https://scholarsarchive.byu.edu/etd/2253.
Texte intégralShah, Anuj R. « Improving protein remote homology detection using supervised and semi-supervised support vector machines ». Online access for everyone, 2008. http://www.dissertations.wsu.edu/Dissertations/Spring2008/A_Shah_042408.pdf.
Texte intégralWistrand, Markus. « Hidden Markov models for remote protein homology detection / ». Stockholm, 2005. http://diss.kib.ki.se/2006/91-7140-598-4/.
Texte intégralChelliah, Vijayalakshmi. « Functional restraints on amino acid substitution patterns : application to definition of binding sites and sequence-structure homology recognition ». Thesis, University of Cambridge, 2005. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.615170.
Texte intégralLindholm, Cecilia K. « Shb and its homologues : signaling in T lymphocytes and fibroblasts / ». Uppsala : Acta Universitatis Upsaliensis : Univ.-bibl. [distributör], 2002. http://publications.uu.se/theses/91-554-5260-4/.
Texte intégralSantos-Ciminera, Patricia Dantas Ciminera Patricia Dantas Santos Santos Patricia. « Molecular epidemiology of epidemic severe malaria caused by Plasmodium vivax in the state of Amazonas, Brazil / ». Download the dissertation in PDF, 2005. http://www.lrc.usuhs.mil/dissertations/pdf/Santos2005.pdf.
Texte intégralChu, Yi-wen 1962. « Amino acid sequence requirements for ornithine decarboxylase activity ». Thesis, The University of Arizona, 1988. http://hdl.handle.net/10150/276838.
Texte intégralForsberg, Hanna. « Genetic and biochemical characterization of a novel sensor of extracellular amino acids in yeast / ». Stockholm : Karolinska Univ. Press, 2001. http://diss.kib.ki.se/2001/91-89428-06-4/.
Texte intégralOppermann, Madalina. « Chemical and mass spectrometrical methods in protein analysis / ». Stockholm, 2000. http://diss.kib.ki.se/2000/91-628-4542-x/.
Texte intégralGallina, Serafina. « Structural Characterization of Donkey Lactoferrin : Amino Acid Sequence and Glycan Compositions ». Doctoral thesis, Università di Catania, 2016. http://hdl.handle.net/10761/3880.
Texte intégralCheng, Fang. « Development and application of strategies for the analysis of modification patterns in chondroitin and dermatana sulphate ». Lund : Dept. of Cell and Molecular Biology, Lund University, 1997. http://catalog.hathitrust.org/api/volumes/oclc/39693809.html.
Texte intégralGanapathy, Ashwin. « Computational analysis of protein identification using peptide mass fingerprinting approach / ». free to MU campus, to others for purchase, 2004. http://wwwlib.umi.com/cr/mo/fullcit?p1426056.
Texte intégralLi, Ran. « Signal peptide prediction in the space-frequency domain ». Access to citation, abstract and download form provided by ProQuest Information and Learning Company ; downloadable PDF file 0.44 Mb., 68 p, 2006. http://gateway.proquest.com/openurl?url_ver=Z39.88-2004&res_dat=xri:pqdiss&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:dissertation&rft_dat=xri:pqdiss:1432421.
Texte intégralFalah, Mizied. « Evolutionary studies based on the 70-kDa heat shock family of protein sequences ». Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1997. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/tape16/PQDD_0012/NQ30084.pdf.
Texte intégralVarmeh-Ziaie, Shohreh. « Cloning and characterization of a p53-inducible gene, WIG-1 / ». Stockholm : [Karolinska institutets bibl.], 2001. http://diss.kib.ki.se/2001/91-7349-079-2/.
Texte intégralWang, Yuqin. « Protein and lipid interactions of mammalian antibacterial peptides / ». Stockholm, 2001. http://diss.kib.ki.se/2001/91-628-4698-1/.
Texte intégralJonsson, Andreas. « Mass spectrometry in protein structure analysis / ». Stockholm, 2001. http://diss.kib.ki.se/2001/91-628-4716-3/.
Texte intégralLiu, Agatha H. « Motif-based mining of protein sequences / ». Thesis, Connect to this title online ; UW restricted, 2002. http://hdl.handle.net/1773/6894.
Texte intégralSÌŒali, Andrej. « Modelling three-dimensional structure of a protein from its amino acid sequence ». Thesis, Birkbeck (University of London), 1991. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.415316.
Texte intégralTung, Wai Na Viola. « Sequence analysis and modelling of the gp130 cytokines and receptors ». Click to view the E-thesis via HKUTO, 2004. http://sunzi.lib.hku.hk/hkuto/record/B31972251.
Texte intégralTung, Wai Na Viola, et 董維娜. « Sequence analysis and modelling of the gp130 cytokines and receptors ». Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2004. http://hub.hku.hk/bib/B31972251.
Texte intégralSenekal, Frederick Petrus. « Protein secondary structure prediction using amino acid regularities ». Diss., Pretoria : [s.n.], 2008. http://upetd.up.ac.za/thesis/available/etd-01232009-120040/.
Texte intégralNdhlovu, Andrew, Scott Hazelhurst et Pierre M. Durand. « Robust sequence alignment using evolutionary rates coupled with an amino acid substitution matrix ». BioMed Central, 2015. http://hdl.handle.net/10150/610270.
Texte intégralSilvia, Christopher Paul. « The isolation, partial peptide sequence, and cDNA sequence of aromatic L-amino acid decarboxylase from bovine adrenal medulla / ». The Ohio State University, 1990. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1487677267729241.
Texte intégralShenoy, Nalini. « Investigation of the replacement of cysteine residues in DOTA-(Tyr³)-octreotate synthesis, characterization and evaluation of biological activities / ». Diss., Columbia, Mo. : University of Missouri-Columbia, 2006. http://hdl.handle.net/10355/4440.
Texte intégralThe entire dissertation/thesis text is included in the research.pdf file; the official abstract appears in the short.pdf file (which also appears in the research.pdf); a non-technical general description, or public abstract, appears in the public.pdf file. Title from title screen of research.pdf file (viewed on August 8, 2007) In the 520 where natIn-DOTA⁰ appears nat should be superscripted. Includes bibliographical references.
McIninch, James David. « Prediction of protein coding regions in unannotated DNA sequences using an inhomogeneous Markov model of genetic information encoding ». Diss., Georgia Institute of Technology, 1997. http://hdl.handle.net/1853/25224.
Texte intégralKo, Ming-him. « A multi-agent model for DNA analysis / ». Hong Kong : University of Hong Kong, 1999. http://sunzi.lib.hku.hk/hkuto/record.jsp?B21949116.
Texte intégralMoreland, Rodney J. « Molecular interactions in RNA polymerase II and III transcription systems / ». Full-text version available from OU Domain via ProQuest Digital Dissertations, 1998.
Trouver le texte intégralLópez, Ferrando Víctor. « Functional characterization of single amino acid variants ». Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2019. http://hdl.handle.net/10803/668545.
Texte intégralLes mutacions puntuals d’aminoàcids són la principal causa de moltes malalties mendelianes, i juguen un paper important en el desenvolupament de moltes malalties complexes. Alhora, són el tipus de variant més comuna que afecta l’ADN codificant de proteïnes, sense provocar, en general, cap efecte advers. Amb l’adveniment de la seqüenciació de nova generació, la detecció d’aquestes variants en pacients i en la població general és més fàcil que mai, però la caracterització dels efectes funcionals de cada variant segueix sent un repte. El nostre objectiu en aquest treball és abordar aquest problema desenvolupant predictors de patologia in silico basats en l’aprenentatge automàtic. Prenent el predictor clàssic PMut com a punt de partida, hem repensat tot el procés d’aprenentatge supervisat, elaborant nous conjunts d’entrenament, descriptors i classificadors. PMut2017 és el primer resultat d’aquests esforços, un nou predictor basat en SwissVar i entrenat amb 12 mètriques de conservació de seqüència. La seva precisió, mesurada mitjançant validació creuada i amb tests cecs, s’ha mostrar en línia amb els millors predictors publicats a dia d’avui. Continuant els nostres esforços en la cerca de predictors més acurats, hem desenvolupat PMut-S, un conjunt de 215 predictors específics per cada proteïna. Similar a PMut en la seva concepció, PMut-S introdueix l’ús de descriptors basats en la coevolució i conjunts d’entrenament balancejats, millorant el rendiment de PMut2017 en 0.1 punts del coeficient de correlació de Matthews. Comparant PMut-S a d’altres predictors específics hem provat que és possible entrenar predictors específics seguint un únic procediment automatitzat i assolir uns resultats tan bon com els de la majoria de predictors específics publicats. La implementació del procediment d’aprenentatge automàtic tant de PMut com de PMut-S ha sigut publicat com a un mòdul de Python de codi obert: PyMut, el qual inclou les funcions que implementen el càlcul dels descriptors i la seva selecció, l’entrenament i avaluació dels classificadors, el dibuix de diverses gràfiques... Les prediccions també estan disponibles en un portal web que inclou un repositori precalculat amb els anàlisis de més de 700 milions de variants en més de 100 mil proteïnes humanes, junt a rellevant informació de context com visualitzacions 3D de les proteïnes, enllaços a bases de dades, anotacions funcionals i molt més.
Thompson, James. « Genetic algorithms applied to biological sequence analysis / ». Link to online version, 2006. https://ritdml.rit.edu/dspace/handle/1850/2269.
Texte intégralWang, Xiao-yu. « Deduced amino acid sequence and gene sequence of microvitellogenin, a female specific hemolymph and egg protein from the tobacco hornworm, Manduca sexta ». Diss., The University of Arizona, 1988. http://hdl.handle.net/10150/184329.
Texte intégralCronshaw, Andrew D. « Amino acid sequence studies of lysyl oxidase and TRAMP (tyrosine rich acidic matrix protein) ». Thesis, University of Edinburgh, 1994. http://hdl.handle.net/1842/19663.
Texte intégralCherry, Melissa A. « Sequence dependence of the activity of amphipathic peptides ». View electronic thesis, 2008. http://dl.uncw.edu/etd/2008-2/rp/cherrym/melissacherry.pdf.
Texte intégralTsoi, Carrie. « Cloning and characterization of canine sulfotransferases / ». Stockholm, 2003. http://diss.kib.ki.se/2003/91-7349-679-0/.
Texte intégralMcLennan, Neil F. « Studies on the carboxyl-terminal amino acid sequence of the chaperonin GroEL from Escherichia coli ». Thesis, University of Edinburgh, 1993. http://hdl.handle.net/1842/11140.
Texte intégralTolliver, Benjamin M., Devaiah P. Shivakumar et Cecelia A. McIntosh. « Effects of Amino Acid Sequence Insertion on the Substrate Preference of a Citrus Paradisi Glucosyltransferase ». Digital Commons @ East Tennessee State University, 2013. https://dc.etsu.edu/etsu-works/347.
Texte intégralLeonchiks, Ainars. « Regulation of protein degradation by virus derived repeated amino acid sequences / ». Stockholm, 2002. http://diss.kib.ki.se/2002/91-7349-206-x/.
Texte intégralNanuwa, Sundeep. « Investigation into the role of sequence-driven-features and amino acid indices for the prediction of structural classes of proteins ». Thesis, De Montfort University, 2013. http://hdl.handle.net/2086/9033.
Texte intégralMaitland, Murray E. « A correlation between the distribution of biological apatite and amino acid sequence of type I collagen ». Thesis, University of British Columbia, 1989. http://hdl.handle.net/2429/27591.
Texte intégralMedicine, Faculty of
Graduate
Båvner, Ann. « Molecular mechanisms of transcriptional repression by the orphan receptor SHP / ». Stockholm, 2005. http://diss.kib.ki.se/2005/91-7140-212-8/.
Texte intégralPinali, Cristian. « Cross-correlation of amino acid sequence data to explain fibril formation in a number of collagen subtypes ». Thesis, Cardiff University, 2008. http://orca.cf.ac.uk/54916/.
Texte intégralBartfeld, Neil Stuart. « Isolation, characterization, cDNA cloning and deduced amino acid sequence of transferrin from the tobacco hornworm, Manduca sexta ». Diss., The University of Arizona, 1990. http://hdl.handle.net/10150/185213.
Texte intégralZhao, Jing. « Protein Structure Prediction Based on Neural Networks ». Thèse, Université d'Ottawa / University of Ottawa, 2013. http://hdl.handle.net/10393/23636.
Texte intégralBakeman, Valerie R. « Pacific and Atlantic coast mollusk shells chromatographic amino acid racemization kinetics and interlaboratory comparisons / ». Access to citation, abstract and download form provided by ProQuest Information and Learning Company ; downloadable PDF file 4.12 Mb., 271 p, 2006. http://catalog.hathitrust.org/api/volumes/oclc/133182881.html.
Texte intégralNorin, Annika. « Medium chain dehydrogenases/reductases : alcohol dehydrogenases of novel types / ». Stockholm, 2003. http://diss.kib.ki.se/2003/91-7349-675-8/.
Texte intégralNg, Pauline Crystal. « PSSMs : not just roadkill on the information superhighway / ». Thesis, Connect to this title online ; UW restricted, 2002. http://hdl.handle.net/1773/8116.
Texte intégralLutya, Portia Thandokazi. « Expression and purification of the novel protein domain DWNN ». Thesis, University of the Western Cape, 2002. http://etd.uwc.ac.za/index.php?module=etd&.
Texte intégralPiriyapongsa, Jittima. « Origin and evolution of eukaryotic gene sequences derived from transposable elements ». Diss., Atlanta, Ga. : Georgia Institute of Technology, 2008. http://hdl.handle.net/1853/24766.
Texte intégralCommittee Chair: Jordan, I. King; Committee Member: Borodovsky, Mark; Committee Member: Bunimovich, Leonid; Committee Member: Choi, Jung; Committee Member: McDonald, John.
Lin, Jasper Chua. « Application of the Trp-cage motif to polypeptide folding questions / ». Thesis, Connect to this title online ; UW restricted, 2007. http://hdl.handle.net/1773/8684.
Texte intégralSankala, Marko. « Role of macrophage receptor MARCO in host defense / ». Stockholm, 2003. http://diss.kib.ki.se/2003/91-7349-686-3.
Texte intégral