Articles de revues sur le sujet « Β-lactamases – Résistance aux antibiotiques »

La résistance bactérienne aux antibiotiques est devenue une préoccupation mondiale de santé publique. En effet, un usage massif et parfois inadapté de ces médicaments a conduit à l’émergence de nombreuses bactéries multirésistantes (BMR) qui se sont diffusées à travers le monde. Ces bactéries, responsables d’épidémies et d’infections de gravité variable, entraînent des impasses thérapeutiques souvent associées à un taux élevé de morbi-mortalité. Parmi celles-ci, certaines font l’objet d’une surveillance accrue : Enterococcus faecium résistant à la vancomycine (EfRV), Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM), entérobactérales productrices de β-lactamases à spectre étendu (E-BLSE) ou de carbapénémases (EPC), Pseudomonas aeruginosa ultra-/pan-résistant et Acinetobacter baumannii résistant à l’imipenème (ABRI). L’épidémiologie de ces bactéries est extrêmement variable d’une région du monde à l’autre. Certaines tendances épidémiologiques sont rassurantes : ainsi, la prévalence du SARM tend diminuer et celle de P. aeruginosa ultra-/pan-résistant reste relativement stable dans de nombreux pays. À l’inverse, l’évolution de certaines espèces est inquiétante en raison de leur forte prévalence dans des pays en particulier (EfRV) ou mondialement (E-BLSE) ou de leur diffusion rapide et massive (EPC, ABRI).

Background: AmpC or class C or group 1 beta lactamases are class C cephalosporinases that hydrolyse a wide variety of beta-lactam antibiotics including alpha methoxy beta-lactams (cefoxitin), narrow and broad spectrum cephalosporins. This study was conducted to characterize plasmid-mediated AmpC producing enteric Gram- negative bacteria from patients with lower respiratory tract infections in Obafemi Awolowo University Teaching Hospital Complex (OAUTHC) Ile Ife, Osun State, NigeriaMethodology: A total of 149 patients with clinical features of lower respiratory tract infections (LRTI) were selected by simple random sampling for the study. All Gram-negative isolates recovered from standard microbiological cultures of respiratory specimens of these patients were tested against cefoxitin, third generation cephalosporins (3GCs), and other antibiotics using the disc diffusion AST method, and also screened for production of AmpC beta-lactamases phenotypically by the CLSI method. Plasmid DNA extraction was carried out on twenty-nine cefoxitin-resistant selected isolates using the Kado and Lin method, while genotypic detection of plasmid-mediated AmpC gene was carried out by the polymerase chain reaction (PCR) assay.Results: The results showed that 204 (43.3%) of 471 isolates recovered from the 149 selected patients were resistant to 3GC in the AST assay, among which 121 (59.3%) were resistant to cefoxitin, and 189 of the 471 isolates (40.1%) were AmpC producers. The AmpC producers concurrently showed multiple resistance pattern to other antibiotics tested in this study. Ninety six percent of the 29 selected isolates for plasmid analysis contained plasmids, 45% of which amplified positive on PCR for CMY, 38% for FOX, and 31% for ACC types of AmpC genes.Conclusion: This study showed a high degree of antibiotic resistance among enteric Gram-negative bacteria recovered from patients with LRTIs, as well as high degree of plasmid-encoded AmpC genes responsible for this high antibiotic resistance among the isolates. Proper antibiotic policy and regulation are required to limit the spread of plasmid mediated AmpC β-lactamase producing organisms because they can lead to therapeutic failure in infected patients in the nearest future. French title: Caractérisation phénotypique et génotypique des bêta-lactamases AmpC à médiation plasmidique dans les bactéries entériques Gram-négatives de patients atteints d'infections des voies respiratoires inférieures dans un hôpital tertiaire, sud-ouest du Nigéria Contexte: Les bêta-lactamases AmpC ou de classe C ou de groupe 1 sont des céphalosporinases de classe C qui hydrolysent une grande variété d'antibiotiques bêta-lactamines, y compris les alpha-méthoxy bêta-lactamines (céfoxitine), les céphalosporines à spectre étroit et large. Cette étude a été menée pour caractériser les bactéries à Gram négatif entériques produisant de l'AmpC à médiation plasmidique chez des patients atteints d'infections des voies respiratoires inférieures du complexe hospitalier universitaire d'Obafemi Awolowo (OAUTHC) Ile Ife, État d'Osun, NigériaMéthodologie: Un total de 149 patients présentant des caractéristiques cliniques d'infections des voies respiratoires inférieures (LRTI) ont été sélectionnés par échantillonnage aléatoire simple pour l'étude. Tous les isolats à Gram négatif récupérés à partir de cultures microbiologique standard d'échantillons respiratoires de ces patients ont été testés contre la céfoxitine, les céphalosporines de troisième génération (3GC) et d'autres antibiotiques en utilisant la méthode AST de diffusion sur disque, et également criblés pour la production de bêtalactamases AmpC phénotypiquement par le Méthode CLSI. L'extraction de l'ADN plasmidique a été réalisée sur 29 isolats sélectionnés résistants à la céfoxitine en utilisant la méthode Kado et Lin, tandis que la détection génotypique du gène AmpC à médiation plasmidique a été réalisée par le test de réaction en chaîne par polymérase (PCR).Résultats: Les résultats ont montré que 204 (43,3%) des 471 isolats récupérés des 149 patients sélectionnés étaient résistants à la 3GC dans le test AST, parmi lesquels 121 (59,3%) étaient résistants à la céfoxitine et 189 des 471 isolats (40,1%) étaient des producteurs d'AmpC. Les producteurs d'AmpC ont montré simultanément plusieurs profils de résistance à d'autres antibiotiques testés dans cette étude. Quatre-vingt-seize pour cent des 29 isolats sélectionnés pour l'analyse des plasmides contenaient des plasmides, dont 45% amplifiés positifs par PCR pour CMY, 38% pour FOX et 31% pour les types ACC des gènes AmpC.Conclusion: Cette étude a montré un degré élevé de résistance aux antibiotiques parmi les bactéries entériques Gram-négatives récupérées chez des patients atteints de LRTI, ainsi qu'un degré élevé de gènes AmpC codés par plasmide responsable de cette résistance élevée aux antibiotiques parmi les isolats. Une politique et une réglementation appropriées en matière d'antibiotiques sont nécessaires pour limiter la propagation des organismes producteurs β-lactamase d'AmpC à médiation plasmidique car ils peuvent conduire à un échec thérapeutique chez les patients infectés dans un avenir proche.

Background: The extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producing Enterobacteriaceae are a major cause of nosocomial bacteraemia. The objectives of this study are to describe the antibiotic resistance pattern of ESBL producing Enterobacteriaceae responsible for bacteraemia and identify factors associated with these infections in a University Hospital in Madagascar.Methodology: This is a descriptive cross-sectional study of 300 randomly selected patients with clinical features of bacteraemia whose blood cultures were processed for isolation and identification of bacterial pathogens over a period of six months (October 2019 to March 2020) at the laboratory of the University Hospital of Befelatanana. Blood culture samples were processed by conventional microbiological method for isolation of Enterobacteriaceae, which were identified to species level using Analytical Profile Index (API) 20E® test system. Antibiotic susceptibility of each isolate was performed by the disk diffusion technique and ESBL production was detected by the ‘synergy’ method.Results: Of the 300 patients, 54 were positive for bacteria, giving a prevalence rate of 18% for microbiologically documented bacteraemia. Of the 54 bacterial pathogens, Enterobacteriaceae isolates constituted 37 (68.5%), with 23 (42.6%) being ESBL producing and 14 (25.9%) non-ESBL producing isolates, 14 (25.9%) were staphylococci and 3 (5.6%) were streptococci isolates. All 23 (100%) ESBL producing Enterobacteriaceae isolates were resistant to amoxicillin, amoxicillin-clavulanic acid and the third generation cephalosporins (3GC), 19 (82.6%) to gentamycin and 18 (78.3%) to cotrimoxazole. On the other hand, the non-ESBL producing isolates were more sensitive because only 10 (71%) were resistant to amoxicillin, 7 (50%)to cotrimoxazole, 2 (14%) to amoxicillin-clavulanic acid, 1 (7.1%) to gentamycin, and none (0%) was resistant to 3GC. All 54 Enterobacteriaceae isolates were sensitive to amikacin and imipenem. Age less than 20 years (93.8%) (p=0.001) and hospitalization in intensive care units (90.9%) (p=0.04) were significant risk factors associated with infection by ESBL producing Enterobacteriaceae.Conclusion: ESBL producing Enterobacteriaceae responsible for bacteraemia in University Hospital of Befelatanana, Madagascar, are resistant to many classes of antibiotics. Carbapenems and amikacin are the antibiotics of choice. Keywords: ESBL, Enterobacteriaceae, bacteraemia, antibiotic resistance French Title: Prévalence et facteurs associés à la bactériémie à entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu dans l'hôpital universitaire de Befelatanana, Madagascar Contexte: Les entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu (BLSE) sont une cause majeurede bactériémie nosocomiale. Les objectifs de cette étude sont de décrire le profil de résistance aux antibiotiques des entérobactéries productrices de BLSE responsables de bactériémie et d'identifier les facteurs associés à ces infections dans un hôpital universitaire de Madagascar.Méthodologie: Il s'agit d'une étude transversale descriptive de 300 patients sélectionnés au hasard présentantdes caractéristiques cliniques de bactériémie dont les hémocultures ont été traitées pour l'isolement etl'identification des bactéries pathogènes sur une période de six mois (octobre 2019 à mars 2020) au laboratoiredu Hôpital universitaire de Befelatanana. Les échantillons d'hémoculture ont été traités par une méthodemicrobiologique conventionnelle pour l'isolement des entérobactéries, qui ont été identifiées au niveau del'espèce à l'aide du système de test Analytical Profile Index (API) 20E®. La sensibilité aux antibiotiques dechaque isolat a été réalisée par la technique de diffusion sur disque et la production de BLSE a été détectée parla méthode «synergie».Résultats: Sur les 300 patients, 54 étaient positifs pour les bactéries, ce qui donne un taux de prévalence de18% pour une bactériémie microbiologiquement documentée. Parmi les 54 bactéries pathogènes, les isolatsd'entérobactéries constituaient 37 (68,5%), 23 (42,6%) produisant des BLSE et 14 (25,9%) isolats neproduisant pas de BLSE, 14 (25,9%) étaient des staphylocoques et 3 (5,6%) l'étaient isolats de streptocoques.Les 23 isolats (100%) de BLSE produisant des Enterobacteriaceae étaient tous résistants à l'amoxicilline, àl'amoxicilline-acide clavulanique et aux céphalosporines de troisième génération (3GC), 19 (82,6%) à lagentamycine et 18 (78,3%) au cotrimoxazole. En revanche, les isolats non producteurs de BLSE étaient plussensibles car seuls 10 (71%) étaient résistants à l'amoxicilline, 7 (50%) au cotrimoxazole, 2 (14%) àl'amoxicilline-acide clavulanique, 1 (7,1%) à la gentamycine, et aucun (0%) n'était résistant à la 3GC. Les 54isolats d'Enterobacteriaceae étaient tous sensibles à l'amikacine et à l'imipénème. L'âge de moins de 20 ans(93,8%) (p=0,001) et l'hospitalisation en unité de soins intensifs (90,9%) (p=0,04) étaient des facteurs derisque importants associés à l'infection par les entérobactéries productrices de BLSE.Conclusion: Les entérobactéries productrices de BLSE responsables de bactériémie à l'hôpital universitaire deBefelatanana, Madagascar, sont résistantes à de nombreuses classes d'antibiotiques. Les carbapénèmes etl'amikacine sont les antibiotiques de choix. Mots clés: BLSE, entérobactéries, bactériémie, résistance aux antibiotiques

Background: The family Enterobacteriaceae belongs to the order Enterobacterales, a large diverse group of Gramnegative, facultatively anaerobic bacteria that sometimes cause multidrug-resistant infections which treatment options are often challenging. They are the leading cause of nosocomial bloodstream infection (BSI) and urinary tract infections (UTI). The objective of the study was to carry out a point-prevalence survey of antimicrobial resistance and carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) clinical isolates in two hospitals in Kuwait and Nigeria.Methodology: Clinically significant bacterial isolates of patients from Kuwait and Nigeria, identified by VITEK-2 and MALDI-TOF mass spectrometry analysis were studied. Susceptibility testing of selected antibiotics was performed using E-test and broth dilution methods. Genes encoding carbapenemase, β-lactamases, and extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) were detected by conventional PCR and sequencing, and whole genome sequencing (WGS) analyses.Results: Of 400 isolates from Kuwait and Nigeria, 188 (47.0%) and 218 (54.5%) were Escherichia coli and 124 (31.0%) and 116 (29.0%) Klebsiella pneumoniae, respectively. The prevalence of CRE was 14.0% in Kuwait and 8.0% in Nigeria. The resistance rates of CRE isolates against colistin and tigecycline in Kuwait were 6.6% versus 25.0%, and in Nigeria were 14.2% versus 14.2%, respectively. blaOXA-181 gene was the commonest in CRE isolates in Kuwait and blaNDM-7 in Nigeria. The commonest ESBL gene among the CRE isolates was blaCTX-M-15 in both countries. AmpC resistance genes were present in only Kuwait isolates and mediated by blaEBC, blaCIT and blaDHA. WGS analysis of 12 selected CRE isolates with carbapenem MICs>32μg/ml but no detectable genes from conventional PCR, revealed the presence of multidrug efflux pump genes such as major facilitator superfamily antibiotic efflux pump and resistance-nodulation-cell division antibiotic efflux pump groups.Conclusion: The prevalence of CRE was higher among isolates from Kuwait than Nigeria and the genes encoding resistance in CRE were different. The presence of efflux pump was a main mechanism of resistance in most of the Nigerian CRE isolates. Contexte: La famille des Entérobactéries appartient à l'ordre des Entérobactéries, un grand groupe diversifié de bactéries anaérobies facultatives à Gram négatif qui provoquent parfois des infections multirésistantes dont les options de traitement sont souvent difficiles. Ils sont la principale cause d'infections nosocomiales du sang (BSI) et d'infections des voies urinaires (UTI). L'objectif de l'étude était de mener une enquête sur la prévalence ponctuelle de la résistance aux antimicrobiens et des isolats cliniques d'entérobactéries résistantes aux carbapénèmes (CRE) dans deux hôpitaux au Koweït et au Nigeria.Méthodologie: Des isolats bactériens cliniquement significatifs de patients du Koweït et du Nigéria, identifiés par analyse par spectrométrie de masse VITEK-2 et MALDI-TOF, ont été étudiés. Les tests de sensibilité des antibiotiques sélectionnés ont été effectués à l'aide des méthodes de test E et de dilution en bouillon. Les gènes codant pour la carbapénémase, les β-lactamases et les β-lactamases à spectre étendu (BLSE) ont été détectés par PCR et séquençage conventionnels et analyses de séquençage du génome entier (WGS).Résultats: Sur 400 isolats du Koweït et du Nigéria, 188 (47,0%) et 218 (54,5%) étaient Escherichia coli et 124 (31,0%) et 116 (29,0%) Klebsiella pneumoniae, respectivement. La prévalence de la CRE était de 14,0% au Koweït et de 8,0% au Nigeria. Les taux de résistance des isolats CRE à la colistine et à la tigécycline au Koweït étaient de 6,6% contre 25,0%, et au Nigeria de 14,2% contre 14,2%, respectivement. Le gène blaOXA-181 était le plus courant dans les isolats CRE au Koweït et blaNDM-7 au Nigeria. Le gène BLSE le plus courant parmi les isolats CRE était blaCTX-M-15 dans les deux pays. Les gènes de résistance à l'AmpC étaient présents uniquement dans les isolats du Koweït et médiés par blaEBC, blaCIT et blaDHA. L'analyse WGS de 12 isolats CRE sélectionnés avec des CMI de carbapénème >32 μg/ml mais aucun gène détectable par PCR conventionnelle, a révélé la présence de gènes de pompe d'efflux multidrogues tels que la pompe d'efflux antibiotique de la superfamille facilitatrice majeure et les groupes de pompe d'efflux antibiotique de division cellulaire de résistance-nodulation.Conclusion: La prévalence de la CRE était plus élevée parmi les isolats du Koweït que du Nigeria et les gènes codant pour la résistance à la CRE étaient différents. La présence d'une pompe à efflux était un mécanisme principal de résistance dans la plupart des isolats CRE Nigérians.

Background: The escalating issue of bacterial resistance is a profound universal peril. This looming crisis has evolved from a mere forecast to a tangible reality globally. Urinary tract infections (UTIs) significantly influence antibiotic prescriptions in primary care, thus crucially impacting the selective pressure and the emergence of antibiotic-resistant bacteria. A profound comprehension of the microorganisms involved in UTIs and their resistance patterns is crucial, particularly in Daloa city, Côte d’Ivoire. This research aims to review the antibiotic resistance profiles of uropathogens isolated from patients in the Regional Hospital Center (CHR) of Daloa, Côte d’Ivoire from January 2019 to December 2022. Methodology: This was a descriptive cross-sectional study of 1,513 patients whose voided urine samples were received at the Bacteriology-Virology Laboratory of CHR for cyto-bacteriological examination and aerobic culture using standard microbiological protocols over a period of 4 years. Bacterial isolates were routinely identified by colony morphology, Gram staining reaction and conventional biochemical tests. The antibiotic susceptibility of the bacterial isolates was determined by the agar diffusion method and interpreted following the Antibiogram Committee of the French Society of Microbiology (CASFM) guidelines. Results: Of the 1,513 patient urine samples examined, 246 (16.3%) were positive for microbial organisms, 216 (14.3%) were positive for significant bacterial isolates, 9 (0.6%) were positive for fungi, and 21 (1.4%) were positive for ova of Schistosoma haematobium. Among the samples with significant bacteriuria, 91.2% were due to Gram-negative bacilli, 5.9% to Gram-positive cocci, and 2.9% to Gram-negative cocci. Escherichia coli was the most predominant bacterial pathogen, accounting for 73.2% of the isolates. Antibiotic susceptibility testing showed high in vitro resistance of the bacterial isolates to tested antibiotics, with Enterobacteriaceae exhibiting resistance rate between 56.0% for nalidixic acid (NAL) and 67.0% for amoxicillin/clavulanic acid (AMC). Pseudomonas aeruginosa isolates exhibited 50.0% resistance rate to ceftazidime (CAZ), ciprofloxacin (CIP), and ticarcillin (TIC) while Staphylococcus isolates demonstrated 100.0% resistance rate to ofloxacin (OFX), clindamycin (CMN), erythromycin, trimethoprim/sulfamethoxazole (SXT), and fusidic acid (FA). The extendedspectrum beta-lactamase (ESBL)-producing isolates were identified in 15.1% of the Enterobacteriaceae. Conclusion: The high prevalence of antibiotic resistant bacterial isolates from significant bacteriuria in our study highlights the pressing need for the formulation and implementation of strategies to address this potential public health menace. The findings of our study may be useful for healthcare authorities to plan strategic interventions that will assist in optimizing the management of bacteriuria and UTI in the city of Daloa. French title: Profils de résistance aux antibiotiques des isolats bactériens uropathogènes dans la région du Haut-Sassandra, Côte d’Ivoire de janvier 2019 à décembre 2022 Contexte: Le problème croissant de la résistance bactérienne constitue un grave péril universel. Cette crise imminente est passée d’une simple prévision à une réalité tangible à l’échelle mondiale. Les infections des voies urinaires (IVU) influencent considérablement les prescriptions d'antibiotiques en soins primaires, ayant ainsi un impact crucial sur la pression sélective et l'émergence de bactéries résistantes aux antibiotiques. Une compréhension approfondie des micro-organismes impliqués dans les infections urinaires et de leurs modèles de résistance est cruciale, en particulier dans la ville de Daloa, en Côte d’Ivoire. Cette recherche vise à examiner les profils de résistance aux antibiotiques des uropathogènes isolés chez les patients du Centre Hospitalier Régional (CHR) de Daloa, Côte d’Ivoire de janvier 2019 à décembre 2022. Méthodologie: Il s'agit d'une étude transversale descriptive portant sur 1513 patients dont les échantillons d'urine vidés ont été reçus au Laboratoire de Bactériologie-Virologie du CHR pour examen cyto-bactériologique et culture aérobie selon des protocoles microbiologiques standards sur une période de 4 ans. Les isolats bactériens ont été systématiquement identifiés par la morphologie des colonies, la réaction de coloration de Gram et les tests biochimiques conventionnels. La sensibilité aux antibiotiques des isolats bactériens a été déterminée par la méthode de diffusion sur gélose et interprétée selon les directives du Comité Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie (CASFM). Résultats: Sur les 1513 échantillons d'urine de patients examinés, 246 (16,3%) étaient positifs pour les organismes microbiens, 216 (14,3%) étaient positifs pour des isolats bactériens significatifs, 9 (0,6%) étaient positifs pour des champignons et 21 (1,4%) étaient positifs pour ovules de Schistosoma haematobium. Parmi les échantillons présentant une bactériurie significative, 91,2% étaient dus à des bacilles à Gram négatif, 5,9% à des coques à Gram positif et 2,9% à des coques à Gram négatif. Escherichia coli était le pathogène bactérien le plus prédominant, représentant 73,2% des isolats. Les tests de sensibilité aux antibiotiques ont montré une résistance in vitro élevée des isolats bactériens aux antibiotiques testés, les Enterobacteriaceae présentant un taux de résistance compris entre 56,0% pour l'acide nalidixique (NAL) et 67,0% pour l'amoxicilline/acide clavulanique (AMC). Les isolats de Pseudomonas aeruginosa présentaient un taux de résistance de 50,0% à la ceftazidime (CAZ), à la ciprofloxacine (CIP) et à la ticarcilline (TIC), tandis que les isolats de Staphylococcus présentaient un taux de résistance de 100,0% à l'ofloxacine (OFX), la clindamycine (CMN), l'érythromycine, le triméthoprime/ sulfaméthoxazole (SXT) et l'acide fusidique (FA). Les isolats producteurs de bêta- lactamases à spectre étendu (BLSE) ont été identifiés chez 15,1% des Enterobacteriaceae. Conclusion: La forte prévalence d'isolats bactériens résistants aux antibiotiques provenant d'une bactériurie importante dans notre étude souligne le besoin urgent de formuler et de mettre en œuvre des stratégies pour faire face à cette menace potentielle pour la santé publique. Les résultats de notre étude pourraient être utiles aux autorités sanitaires pour planifier des interventions stratégiques qui contribueront à optimiser la gestion de la bactériurie et des infections urinaires dans la ville de Daloa.

Background: Klebsiella pneumoniae is a bacterial pathogen commonly associated with severe nosocomial and community acquired infections especially through the acquisition of extended spectrum β-lactamases (ESβL) and biofilm formation capacity. The objectives of this study are to determine the prevalence of K. pneumoniae ESβL (KP-ESβL)-producing isolates in the Regional Military University Hospital of Oran (HMRUO) Algeria,characterize their antibiotic resistance profile, genetically detect blaTEM and blaCTX-M genes, and evaluate their biofilm formation capacity.Methodology: Different clinical specimens including blood, cerebrospinal fluids, urine and catheter, pus, perirectal abscess, and surgical wounds were collected from patients with suspected clinical infections in different units and departments of the hospital. The specimens were cultured on Blood, MacConkey and CLED agar (for urine only) plates and incubated aerobically for 24 hours at 37°C for preliminary identification of bacteria using conventional colony morphology, Gram stain reaction, and disk diffusion test for antibiotic susceptibility testing (AST). Confirmation of isolates, antibiogram, minimum inhibitory concentration (MIC) and detection of resistance phenotypes, were carried out by the automated Vitek 2 (BioMérieux) identification and susceptibility method. ESβL production was confirmed by the synergy and combination disk tests. ESβL genes were detected by conventional simplex PCR and biofilm formation was detected by the tissue culture plate (TCP) method.Results: A total of 630 patients’ clinical samples (one sample per patient) were processed. Klebsiella pneumoniae was isolated in 40 (6.3%) samples, and 15 of these (37.5%) produced ESβL. In the disk diffusion AST assay, all 40 K. pneumoniae isolates were resistant to ampicillin and ticarcillin while all 40 isolates were sensitive to cefoxitin, imipenem and ertapenem. KP-ESβL producing isolates were more frequently recovered from intensive care unit (33.3%) and from urine (46.7%) samples. Group 1 blaCTX-M genes were detected in 13 of the 15 (86.7%) KP-ESβL isolates, and 46.7% of these isolates were moderate biofilm producers.Conclusion: There is need for health departments to put in place preventative measures through regular surveillance of these resistant pathogens and initiating appropriate infection prevention and control strategies to limit their spread in Algerian hospitals and worldwide. Keywords: Klebsiella pneumoniae, ESβL, biofilm, PCR, antibacterial resistance French title: Klebsiella pneumoniae productrice de-lactamase spectre tendu dans l'hôpital universitaire militaire régional d'Oran, Algérie: résistance aux antibiotiques, formation de biofilm et détection desgènes blaCTX-M et blaTEM Contexte: Klebsiella pneumoniae est un pathogène bactérien communément associé aux infectionsnosocomiales et communautaires sévères, en particulier par l'acquisition de β-lactamases à spectre étendu(ESβL) et la capacité de formation de biofilm. Les objectifs de cette étude sont de déterminer la prévalence desisolats de K. pneumoniae producteurs de βLSE (KP-βLSE) au CHU d'Oran (HMRUO) Algérie, caractériser leurprofil de résistance aux antibiotiques, détecter génétiquement les gènes blaTEM et blaCTX-M, et évaluer leurcapacité de formation de biofilm.Méthodologie: Différents échantillons cliniques, y compris du sang, des liquides céphalo-rachidiens, de l'urinemictionnelle et du cathéter, du pus, des abcès périrectal et des plaies chirurgicales ont été prélevés despatients suspectés d'infections cliniques dans différentes unités et départements de l'hôpital. Les échantillonsont été cultivés sur des milieu de culture: deglose au sang, MacConkey et CLED (pour l'urine uniquement) etincubés en aérobie pendant 24heures à 37°C pour l'identification préliminaire des bactéries en utilisant lamorphologie conventionnelle des colonies, la coloration de Gram et le test de diffusion sur disque pour les testsde sensibilité aux antibiotiques (AST). La confirmation des isolats, l'antibiogramme, la concentration minimaleinhibitrice (CMI) et la détection des phénotypes de résistance ont été réalisés par la méthode automatiséed'identification et de sensibilité sur Vitek 2 (BioMérieux). La production de βLSE a été confirmée par les tests desynergie et de double disques. Les gènes de βLSE ont été détectés par PCR simplex conventionnelle et laformation de biofilm a été détectée par la méthode de la plaque de culture tissulaire (TCP).Résultats: Un total de 630 échantillons cliniques de patients (un échantillon par patient) ont été traités.Klebsiella pneumoniae a été isolé dans 40 échantillons (6,3%) et 15 d'entre eux (37,5%) ont produit des βLSE.Dans le test AST à diffusion sur disque, tous les 40 isolats de K. pneumoniae étaient résistants à l'ampicilline età la ticarcilline, tandis que les 40 isolats étaient sensibles à la céfoxitine, à l'imipénème et à l'ertapénème. Lesisolats producteurs de KP-βLSE ont été plus fréquemment récupérés dans les unités de soins intensifs (33,3%)et dans les échantillons d'urine (46,7%). Les gènes blaCTX-M du groupe 1 ont été détectés dans 13 des 15 isolatsde KP-βLSE (86,7%), et 46,7% de ces isolats étaient des producteurs de biofilm modérés.Conclusion: Il est nécessaire que les services de santé mettent en place des mesures préventives grâce à unesurveillance régulière de ces pathogènes résistants et à la mise en place de stratégies appropriées deprévention et de contrôle des infections pour limiter leur propagation dans les hôpitaux algériens et dans lemonde. Mots clés: Klebsiella pneumoniae, βLSE, biofilm, PCR, résistance antibactérienne

Background: The rising global emergence of Gram-negative bacteria (GNB) producing β-lactam hydrolysing enzymes in clinical infections constitutes a growing public health threat. This study investigated the occurrence of co-production of extended spectrum β-lactamase (ESβL), AmpC β-lactamases, and carbapenemases among GNB isolated from HIVinfected patients in two tertiary healthcare facilities in southwest Nigeria.Methodology: A total of 115 GNB isolates previously recovered from HIV-infected patients at the Obafemi Awolowo University Teaching Hospitals Complex, Ile-Ife, and the State Specialist Hospital, Akure, were investigated. The isolates were characterized to species level with the Microbact 24E kit and screened for ESβL production using the double-disc test (DDT) and combination disc methods, AmpC using modified Hodge test (MHT) and AmpC EDTA disc, and carbapenemase production using the MHT and EDTA disc test. Antibiotic susceptibility testing (AST) was performed by the Kirby-Bauer disc diffusion method.Results: A total of 15 species of GNB were characterized. The AST profile of the isolates revealed high resistance rates to ampicillin (94.5%), tetracycline (74.5%), sulphamethoxazole-trimethoprim (66.3%), and lowest resistance to imipenem (10.9%). Multi-drug resistance (MDR) was observed in 93.6% while 98.8% of ESβL, AmpC, and carbapenemase-producing isolates had multiple antibiotic resistance (MAR) indices ≥ 0.2. ESβL production was detected in 53.9%, AmpC in 20.9% and carbapenemase in 25.2% of the isolates. ESβL, AmpC or carbapenemase or co-production of two or all three enzymes was detected in 80 (69.6%) isolates, while only 10.0% produced all three enzymes.Conclusion: The isolation of MDR bacteria and isolates co-producing β-lactam hydrolysing enzymes in immunocompromised individuals portend grave consequences. Routine screening for these enzymes in MDR bacteria will be highly essential to guide the institution of appropriate antibiotic therapy and infection control measures. Keywords: ESβL, AmpC, carbapenemase, HIV, MDR, clinical isolates, MHT, DDST French Title: Coproduction d'ESβL, AmpC et carbapénémase dans des bactéries Gram-négatives multirésistantes de patients infectés par le VIH dans le sud-ouest du Nigéria Contexte: L'émergence mondiale croissante de bactéries à Gram négatif (GNB) produisant des enzymes d'hydrolyse de β-lactame dans les infections cliniques constitue une menace croissante pour la santé publique. Cette étude a examiné l'occurrence de la coproduction de β-lactamases à spectre étendu (ESβL), de β-lactamases AmpC et de carbapénémases parmi les GNB isolés de patients infectés par le VIH dans deux établissements de santé tertiaires du sud-ouest du Nigéria. Méthodologie: Un total de 115 isolats de GNB précédemment récupérés de patients infectés par le VIH au complexe hospitalier universitaire Obafemi Awolowo, Ile-Ife, et au State Specialist Hospital, Akure, ont été étudiés. Les isolats ont été caractérisés au niveau des espèces avec le kit Microbact 24E et criblés pour la production d'ESβL en utilisant le test à double disque (DDT) et les méthodes de disques combinés, AmpC en utilisant le test Hodge modifié (MHT) et le disque AmpC EDTA, et la production de carbapénémase en utilisant le MHT et test de disque EDTA. Le test de sensibilité aux antibiotiques (AST) a été effectué par la méthode de diffusion de disque de Kirby-Bauer Résultats: Un total de 15 espèces de GNB ont été caractérisées. Le profil AST des isolats a révélé des taux derésistance élevés à l'ampicilline (94,5%), à la tétracycline (74,5%), au sulfaméthoxazole-triméthoprime (66,3%) età la plus faible résistance à l'imipénème (10,9%). Une résistance à plusieurs médicaments (MDR) a été observéedans 93,6% tandis que 98,8% des isolats producteurs d'ESβL, AmpC et carbapénémase avaient de multiples indices de résistance aux antibiotiques (MAR) ≥ 0,2. La production d'ESβL a été détectée dans 53,9%, AmpC dans 20,9% et carbapénémase dans 25,2% des isolats. ESβL, AmpC ou carbapénémase ou la coproduction de deux ou des trois enzymes a été détectée dans 80 isolats (69,6%), tandis que seulement 10,0% ont produit les trois enzymes. Conclusion: L'isolement des bactéries MDR et des isolats co-producteurs d'enzymes d'hydrolyse des β-lactamines chez les individus immunodéprimés laisse présager de graves conséquences. Le dépistage systématique de ces enzymes dans les bactéries MDR sera très essentiel pour guider la mise en place d'une antibiothérapie appropriée et de mesures de contrôle des infections. Mots-clés: ESβL, AmpC, carbapénémase, VIH, MDR, isolats cliniques, MHT, DDST

Introduction : Selon l’OMS, la résistance des bactéries aux antibiotiques constitue un problème de santé publique. Elle évolue aussi au Niger. La présente étude visait à faire un état de lieu à l’échelle nationale. Méthodologie : Une méta-analyse a été conduite à partir des données recueillies dans les bibliothèques numériques, sur Pub Med et Google schoolar. Résultats : Vingt et une études sur la résistance des bactéries aux antibiotiques ont été retenues. Il était ressorti de l’analyse qu’à Zinder la prévalence des entérobactéries productrices de bêta-lactamase à spectre élargi étaient de 42% et 40% des souches de Staphylococcus aureus isolées étaient résistantes à la Céfoxitine. Parmi les causes recensées, la consommation excessive, l’usage inapproprié et la distribution par des circuits informels des antibiotiques étaient les plus citées. La mauvaise hygiène hospitalière, l’automédication et les comorbidités étaient aussi des facteurs favorisants. À cela s’ajoute la mauvaise qualité des antibiotiques. L’évaluation des agents de santé vis-à-vis de la résistance bactérienne aux antibiotiques a montré un faible niveau de connaissance des mécanismes de l’antibiorésistance et des pratiques et attitudes non recommandées. Enfin, nous avions noté l’insuffisance des données dans les volets de l’élevage et l’environnement. Conclusion : Les résultats de cette étude permettent une meilleure compréhension de la situation de la résistance des bactéries aux antibiotiques au Niger. Il est donc plus que nécessaire de prendre conscience de la gravité de ce problème pouvant s’aggraver si aucune stratégie de lutte n’est proposée. C’est pourquoi un plan national multisectoriel de lutte contre la résistance bactérienne s’impose.

Les infections urinaires causées par Escherichia coli sont une des principales causes de morbidité et de mortalité dans le monde, représentant 70 à 95 % des infections urinaires. L'objectif est de contribuer à la réduction de la résistance aux antibiotiques des souches de Escherichia coli diagnostiquées aux Cliniques Universitaires de Lubumbashi. Les objectifs spécifiques sont de décrire la fréquence d’infection par E. coli, de déterminer la distribution de la résistance dans la population et d'analyser l'impact médico-économique de ces infections. Une étude descriptive transversale a été réalisée à partir des données de 297 cas d’Escherichia coli isolés des urines aux Cliniques Universitaires de Lubumbashi, entre janvier 2019 et décembre 2021. L’analyse des données a été effectuée avec les logiciels Microsoft Excel 2007 et Epi Info version 7.2. Parmi les 297 cas, 63,6% étaient des femmes et 36,4% des hommes. La tranche d'âge la plus touchée par les infections urinaires était celle des 18-27 ans (27,95%). Concernant le profil de résistance, sur un total de 767 disques d’antibiotiques testés, 73,1% des disques ont montré une résistance, 20,9% étaient sensibles et 5,8% présentaient une résistance intermédiaire. Le taux de résistance à l’Amoxyclav a atteint 95,5%. L’impact économique des infections urinaires causées par E. coli a montré une dépense moyenne par patient, dépassant le budget prévu dans le Plan National de Développement Sanitaire (PNDS). L’étude met en évidence une prévalence élevée des infections urinaires causées par Escherichia coli, ainsi qu’une résistance croissante aux antibiotiques, notamment aux bêta-lactamines. Il est essentiel de renforcer les mesures de prévention et de contrôle, ainsi que l’éducation sur l’utilisation rationnelle des antibiotiques, afin de limiter la propagation des souches résistantes. Mots-clés : Escherichia coli, infections urinaires, bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE), résistance aux antibiotiques, Lubumbashi, profil épidémiologique.

Background: According to the World Health Organization (WHO), bacterial resistance to antibiotics is a global public health challenge, which is also developing in Niger. The aim of this study was to determine the prevalence of antibiotic resistance genes in Gram-negative bacilli isolated from clinical samples in the biological laboratories of two selected health facilities in Niger. Methodology: Clinical bacterial isolates were randomly collected from two biological laboratories of Zinder National Hospital and Niamey General Reference Hospital. These were multi-resistant Gram-negative bacteria that have been routinely isolated from pathological samples of patients. Molecular detection of resistance genes was carried out by polymerase chain reaction (PCR) amplification using specific primers. These include plasmid-mediated AmpC beta lactamase genes (blaCITM, blaDHAM, blaFOXM), ‘Cefotaxime-Munich’ type beta lactamase genes (blaCTX-M-1, blaCTX-M-2, blaCTX-M-9), KPC-type beta lactamase gene (blaKPC), Oxa-type beta lactamase gene (blaOXA-48), SHV-type beta lactamase gene (blaSHV), TEM-type beta lactamase gene (blaTEM), quinolone resistance genes (qnrA, qnrB, qnrS), and sulfonamide resistance genes (sul1, sul2, sul3). Results: A total of 24 strains of multidrug-resistant Gram-negative bacteria isolated from different clinical samples were analysed. The distribution of the resistance genes detected is as follows; AmpC blaCITM (n=6; 25.0%), AmpC blaDHAM (n=4; 17.0%), AmpC blaFOXM (n=0), blaCTX-M-1 (n=11; 46.0%), blaCTX-M-2 (n=0), blaCTX-M-9 (n=0), blaKPC (n=0), blaOXA-48 (n=2; 8..0%), blaSHV (n=5; 21.0%), blaTEM (n=0), qnrA (n=0), qnrB (n=5; 21.0%), qnrS (n=17; 71.0%), sul1 (n=22; 92.0%), sul2 (n=12; 50.0%), and sul3 (n=0). All isolates tested had at least two resistance genes. Conclusion: The results of this study provide a better understanding of the resistance situation of clinical isolates in Niger. Therefore, it is more than necessary to intensify the detection on a larger number of samples and on a national scale. This will make it possible to assess the true extent of the phenomenon and consequently guide control strategies through a national multisectoral plan. Contexte: Selon l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS), la résistance bactérienne aux antibiotiques constitue un défi mondial de santé publique, qui se développe également au Niger. Le but de cette étude était de déterminer la prévalence des gènes de résistance aux antibiotiques chez les bacilles Gram négatif isolés à partir d'échantillons cliniques dans les laboratoires de biologie de deux formations sanitaires sélectionnées au Niger. Méthodologie: Des isolats bactériens cliniques ont été collectés de manière aléatoire dans deux laboratoires de biologie de l'Hôpital National de Zinder et de l'Hôpital Général de Référence de Niamey. Il s’agissait de bactéries Gram-négatives multirésistantes qui ont été systématiquement isolées à partir d’échantillons pathologiques de patients. La détection moléculaire des gènes de résistance a été réalisée par amplification par réaction en chaîne par polymérase (PCR) à l'aide d'amorces spécifiques. Il s'agit notamment des gènes de bêta-lactamase AmpC à médiation plasmidique (blaCITM, blaDHAM, blaFOXM), des gènes de bêta-lactamase de type «Céfotaxime-Munich» (blaCTX-M-1, blaCTX-M-2, blaCTX-M-9), du gène de bêta-lactamase de type KPC (blaKPC), du gène de bêta-lactamase de type Oxa (blaOXA-48), le gène bêta-lactamase de type SHV (blaSHV), le gène bêta-lactamase de type TEM (blaTEM), les gènes de résistance aux quinolones (qnrA, qnrB, qnrS) et les gènes de résistance aux sulfamides (sul1, sul2, sul3). Résultats: Au total, 24 souches de bactéries Gram-négatives multirésistantes isolées de différents échantillons cliniques ont été analysées. La répartition des gènes de résistance détectés est la suivante; AmpC blaCITM (n=6; 25,0%), AmpC blaDHAM (n=4; 17,0%), AmpC blaFOXM (n=0), blaCTX-M-1 (n=11; 46,0%), blaCTX-M-2 (n=0), blaCTX-M-9 (n=0), blaKPC (n=0), blaOXA-48 (n=2; 8,0%), blaSHV (n=5; 21,0%), blaTEM (n=0), qnrA (n=0), qnrB (n=5; 21,0%), qnrS (n=17; 71,0%), sul1 (n=22; 92,0%), sul2 (n=12; 50,0%) et sul3 (n=0). Tous les isolats testés possédaient au moins deux gènes de résistance. Conclusion: Les résultats de cette étude permettent de mieux comprendre la situation de résistance des isolats cliniques au Niger. Il est donc plus que nécessaire d’intensifier la détection sur un plus grand nombre d’échantillons et à l’échelle nationale. Cela permettra d'évaluer l'ampleur réelle du phénomène et par conséquent d'orienter les stratégies de lutte à travers un plan national multisectoriel.

Introduction : Cette étude avait pour but d'étudier le profil de sensibilité aux antibiotiques des isolats d'Escherichia coli provenant de suppurations au Centre Hospitalier Universitaire Sourô Sanou. Méthodologie : Une étude transversale descriptive a été menée du 1er janvier au 31 décembre 2020 au Centre Hospitalier Universitaire Sourô SANOU, hôpital de référence de Bobo-Dioulasso. Des échantillons de pus de patients hospitalisés ont été prélevés et soumis à des tests cytologiques et bactériologiques. Résultats : Sur 552 échantillons traités dans cette étude, 324 étaient positifs à la culture. La prévalence des infections à E. coli était de 17,64 % [IC 95 % : 14,66 - 21,06] dans les suppurations. Le sexe masculin était prédominant avec un sex-ratio de 1,5. Le groupe d'âge [20-24 ans] était le plus touché et représentait 10,30 %. Les infections à E. coli étaient plus fréquentes dans les services de chirurgie (50,52%). Les souches d'E. coli étaient très sensibles à l'imipenem (96%), à l'amikacine (93%) et à la gentamicine (52%). Mais certaines souches étaient résistantes au céfotaxime (23 %), à la ciprofloxacine (27 %), à l'amoxicilline (7 %) et à l'amoxicilline + acide clavulanique (3 %). Une bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) a été produite par 34 % (33/97) des souches d'E. coli.Conclusion : Cette étude a mis en évidence que l'imipenem, l'amikacine et la gentamicine étaient actifs dans les infections suppuratives causées par des souches d'E. coli. La prescription de ces antibiotiques doit être rationnelle dans le cabinet de chirurgie.

L'antibiorésistance est une préoccupation croissante en termes de santé humaine et animale au niveau international. Escherichia coli est responsable de nombreuses infections chez l'Homme comme les infections urinaires, mais aussi des infections plus sévères (septicémies). Le but du travail est de suivre l'impact des eaux usées sur la qualité de l'eau et d'évaluer la capacité des E. coli résistantes aux céphalosporines de 3ème génération ou C3G (productrices de beta-lactamase à spectre élargi ou BLSE de type CTX-M) à se propager et survivre dans les eaux du bassin versant de l'Ouche (Bourgogne, France). Une stratégie pour l'échantillonnage des eaux de surface et souterraines a été déployée selon les contextes hydrogéologiques, l'utilisation des terres et les rejets de STEU. L'approche hydrochimique s'appuie sur l'analyse des paramètres chimiques tels que les nitrates et le bore complétés par l'analyse de Terres rares dont le gadolinium et le suivi de produits pharmaceutiques (caféine, carbamazépine, paracétamol, ibuprofène). Les premiers résultats montrent une contamination des eaux de surface par des souches d'E. coli productrices de BLSE. Cette dissémination est associée au rejet des eaux usées dans le milieu. On note néanmoins qu'au niveau de la nappe alluviale le transfert d'E. coli est nul à faible et celui des d'E. coli productrices de BLSE est nul. Dans ce contexte, la filtration des eaux de surface par les berges et potentiellement les temps de transfert jouent en faveur de l'épuration des E. coli A l'inverse en secteur karstique, on note la présence d'E. coli productrices de BLSE au niveau des émergences. Contrairement aux eaux de la nappe alluviale qui bénéficie d'une épuration naturelle, les eaux karstiques semblent fortement vulnérables.

Le rôle des rats bruns urbains en tant que porteurs de bactéries résistantes aux antimicrobiens a été peu étudié. Notre étude visait à évaluer la prévalence de la résistance aux antimicrobiens chez les rats urbains sur deux sites densément peuplés de Vienne en Autriche. De 2016 à 2017, nous avons échantillonné l'intestin et le nasopharynx de 62 rats bruns. La culture et la caractérisation des isolats ont été réalisées à l'aide d'une combinaison de techniques microbiologiques et génétiques. Nous avons mis en évidence, chez 9/62 rats, huit souches d'Escherichia coli multirésistantes ainsi que deux souches d'Enterobacter xiangfangensis ST114 (complexe Enterobacter cloacae) productrices de New Delhi métallo-β-lactamase, présentant une résistance étendue aux antibiotiques. De plus, 44 staphylocoques résistants à la méticilline, appartenant à sept espèces, ont été identifiés chez 37 rats. Notre étude démontre le rôle potentiel des rats urbains comme réservoir de bactéries multirésistantes et l'importance des mesures de contrôle des rongeurs en ville.

La résistance aux antimicrobiens est un problème de santé publique avec un impact considérable en milieu hospitalier. Cette étude visait à déterminer l'écologie bactérienne et les gènes de résistance présents dans deux hôpitaux du Bénin. Au total, 146 échantillons environnementaux et de cathéters ont été collectés au Centre Hospitalier Universitaire d'Abomey-Calavi/So-Ava et à l'Hôpital des Armées Béninoises de Cotonou. Ils ont été ensemencés sur géloses Mannitol-Salt et Eosine-Bleu de Méthylène. Les colonies obtenues ont été identifiées et leur sensibilité aux antibiotiques testée par la technique de Kirby-Bauer. Quatre gènes de résistance codant pour la production de bêta-lactamases à spectre étendu (blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaCTX-M9, blaCTX-M15) et le gène codant pour la résistance à la méticilline (mecA) ont été criblés. Au total, 69 (53,49%) et 60 (46,51%) souches appartenant à la famille des entérobactéries et des staphylocoques ont été identifiées, respectivement. Une prédominance de Staphylococcus aureus (25,6 %) suivie d'Enterobacter cloacae (21,0 %) et de Staphylocoque à coagulase négative (21,0 %) a été observée. Ces souches bactériennes présentaient une multirésistance, notamment aux bêta-lactamines, aux fluoroquinolones, aux aminoglycosides et aux macrolides. blaCTX-M15 (42,8%) a été le gène bêta-lactamase la plus prédominante dans le génome des entérobactéries. Chez les staphylocoques, la fréquence de mecA était de 50%. Ces résultats montrent l'ampleur de la résistance aux antimicrobiens dans les hôpitaux étudiés. Ils peuvent aider à un plaidoyer pour une action urgente au niveau national notamment en ce qui concerne la gestion et l'utilisation responsable et efficace des antimicrobiens au Bénin.

Background: The main reservoir of Enterobacterales is the human gut, which has been reported as a source of hospital acquired infection. Enterobacterales carrying the extended spectrum β-lactamase (ESBL) genes have emerged over the years as significant multidrug resistant (MDR) pathogens, that have hindered effective therapy of infections caused by them, and limited treatment to a small number of drugs such as carbapenems, leading to selection pressure and emergent resistance to carbapenems. The objective of this study was to determine the faecal carriage of ESBL-producing Enterobacterales (ESPL-PE) among children under 5 years of age at the Ladoke Akintola University of Technology Teaching Hospital, Ogbomoso, Nigeria. Methodology: A total of 144 children under 5 years of age were consecutively recruited over a period of 5 months from the paediatrics outpatient clinic, children emergency, paediatrics ward, and neonatal unit of the hospital. Rectal swabs were collected from selected children and transported to the medical microbiology laboratory of the hospital for inoculation on MacConkey agar plates and aerobic incubation at 37oC for 24 hours. All positive growth on the culture plates were identified by colony morphology, Gram stain reaction and conventional biochemical tests scheme. Antimicrobial susceptibility test was performed by the disc diffusion method against selected antibiotics, and ESBL production was confirmed by the double disc synergy test (DDST). Association of risk factors with ESBL-PE faecal carriage was determined using Chi‑square or Fisher Exact test, with statistical significance set at p< 0.05. Results: The prevalence of ESBL-PE faecal carriage was 37.5% (54/144), with 34.7% (50/144) for Escherichia coli and 2.1% (3/144) for Klebsiella pneumoniae. The overall resistance rate of both ESBL and non-ESBL producing isolates were to ampicillin (100.0%), amoxicillin- clavulanic acid (96.2%), ceftazidime (94.3%) and ciprofloxacin (90.6%), while resistance to carbapenems was low at 22.2%. Significant risk factors associated with ESBL-PE faecal carriage were age group 24-59 months (p=0.0187), prior intake of antibiotics (p=0.014), and intake of antibiotics without prescription (p=0.0159), while gender (p=0.8877), mother’s education level (p=0.3831) and previous hospital visit (p=0.8669) were not significantly associated with faecal ESBL carriage. Conclusion: The relatively high faecal carriage rate of ESBL-PE in children <5 years of age in our study highlights the risk for antimicrobial resistance transmission within the hospital and community. French title: Transport fécal d'entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu (ESBL-PE) chez des enfants de moins de cinq ans dans un hôpital tertiaire du sud-ouest du Nigéria Contexte: Le principal réservoir d’Enterobacterales est l’intestin humain, qui a été signalé comme source d’infections nosocomiales. Les Entérobactéries porteuses des gènes des β-lactamases à spectre étendu (BLSE) sont apparues au fil des années comme d'importants agents pathogènes multirésistants (MDR), qui ont entravé le traitement efficace des infections provoquées par elles et ont limité le traitement à un petit nombre de médicaments tels que les carbapénèmes, conduisant à une pression de sélection et à une résistance émergente aux carbapénèmes. L'objectif de cette étude était de déterminer le portage fécal d'entérobactéries productrices de BLSE (ESPL-PE) chez les enfants de moins de 5 ans à l'hôpital universitaire de technologie Ladoke Akintola, à Ogbomoso, au Nigeria. Méthodologie: Au total, 144 enfants de moins de 5 ans ont été recrutés consécutivement sur une période de 5 mois dans la clinique externe de pédiatrie, les urgences pédiatriques, le service de pédiatrie et l'unité néonatale de l'hôpital. Des écouvillons rectaux ont été prélevés sur des enfants sélectionnés et transportés au laboratoire de microbiologie médicale de l'hôpital pour inoculation sur plaques de gélose MacConkey et incubation aérobie à 37°C pendant 24 heures. Toutes les croissances positives sur les plaques de culture ont été identifiées par la morphologie des colonies, la réaction de coloration de Gram et le schéma de tests biochimiques conventionnels. Le test de sensibilité aux antimicrobiens a été réalisé par la méthode de diffusion sur disque contre des antibiotiques sélectionnés, et la production de BLSE a été confirmée par le test de synergie à double disque (DDST). L'association des facteurs de risque avec le portage fécal des BLSE-PE a été déterminée à l'aide du test du Chi carré ou de Fisher Exact, avec une signification statistique fixée à p<0,05. Résultats: La prévalence du portage fécal des BLSE-PE était de 37,5% (54/144), dont 34,7% (50/144) pourEscherichia coli et 2,1% (3/144) pour Klebsiella pneumoniae. Le taux de résistance global des isolats produisant et non des BLSE était à l'ampicilline (100,0%), à l'amoxicilline-acide clavulanique (96,2%), à la ceftazidime (94,3%) et à la ciprofloxacine (90,6%), tandis que la résistance aux carbapénèmes était faible à 22,2%. Les facteurs de risque significatifs associés au portage fécal de BLSE-PE étaient le groupe d'âge de 24 à 59 mois (p=0,0187), la prise antérieure d'antibiotiques (p=0,014) et la prise d'antibiotiques sans ordonnance (p= 0,0159), tandis que le sexe (p=0,8877), le niveau d'éducation de la mère (p=0,3831) et la visite antérieure à l'hôpital (p=0,8669) n'étaient pas significativement associés au portage fécal de BLSE. Conclusion: Le taux de portage fécal relativement élevé d'EP-BLSE chez les enfants de moins de 5 ans dans notre étude met en évidence le risque de transmission de la résistance aux antimicrobiens au sein de l'hôpital et de la communauté.

<p><strong>ABSTRACT</strong></p><p><strong>Background:</strong> Broad-spectrum antibiotics are often used to treat urinary tract infections (UTIs) due to drug-resistant species of Enterobacteriaceae and Enterococcus (e.g., organisms producing extended-spectrum ß-lactamase [ESBL] or AmpC ß-lactamase, as well as vancomycin-resistant enterococci [VRE]). However, this type of therapy can promote selection of resistant organisms and may necessitate venous access. Fosfomycin is an orally administered, single-dose antibiotic for the treatment of uncomplicated UTI. Little is known about its microbiologic activity against urinary isolates, including in southwestern Ontario, since fosfomycin susceptibility testing is not routinely performed.</p><p><strong>Objective:</strong> To explore a cost-effective alternative for the treatment of lower UTIs caused by multidrug-resistant Enterobacteriaceae and VRE organisms resistant to usual first-line therapies by determining fosfomycin susceptibility rates.</p><p><strong>Methods:</strong> Urinary isolates were collected prospectively from November 2015 to April 2016 at 3 hospitals in southwestern Ontario. Susceptibility testing was completed according to guidelines of the Clinical and Laboratory Standards Institute, with interpretation by zone of inhibition (as diameter in millimetres). Patients 18 years of age or older with isolation of multidrug-resistant Enterobacteriaceae or VRE were eligible for inclusion. Urinary isolates from these patients were subjected to susceptibility testing. The primary outcome was the rate of fosfomycin susceptibility of these isolates.</p><p><strong>Results:</strong> A total of 137 urinary isolates were tested: 106 positive for ESBL or AmpC ß-lactamase producing Enterobacteriaceae (95 Escherichia coli, 11 Klebsiella spp.) and 31 positive for vancomycin-resistant Enterococcus faecium. Susceptibility rates for ESBL- and AmpC ß-lactamase producing E. coli were 100% for ertapenem, 96% for fosfomycin, 83% for nitro - furantoin, 72% for gentamicin, 56% for trimethoprim-sulfamethoxazole, and 14% for ciprofloxacin. Susceptibility rates of vancomycin-resistant E. faecium urinary isolates were 100% for linezolid, 81% for fosfomycin, 68% for tetracycline, 6% for ampicillin, 3% for penicillin, and 0% for both nitrofurantoin and ciprofloxacin.</p><p><strong>Conclusion:</strong> Given susceptibility rates at the study institutions, fosfomycin was deemed the most reliable oral option for the treatment of lower UTI in patients with suspected or documented multidrug-resistant uropathogens.</p><p><strong>RÉSUMÉ</strong></p><p><strong>Contexte :</strong> Les antibiotiques à large spectre sont souvent employés pour traiter les infections urinaires causées par des espèces d’entérobactériacées et d’Enterococcus résistantes aux médicaments (par exemple, des organismes qui produisent des ß-lactamases à spectre étendu [BLSE] ou des ß-lactamases AmpC de même que des entérocoques résistants à la vancomycine [ERV]). Or, ce type de traitement peut favoriser la sélection d’organismes résistants et peut nécessiter un accès veineux. La fosfomycine est un antibiotique oral à dose unique servant au traitement d’infections urinaires non compliquées. On connaît peu de choses sur son activité microbiologique contre les isolats urinaires, en l’occurrence dans le sudouest de l’Ontario, car on ne teste pas systématiquement la fosfomycine dans les antibiogrammes.</p><p><strong>Objectif :</strong> Chercher une solution ayant un bon rapport coût-efficacité pour le traitement des infections urinaires basses causées par des espèces d’entérobactériacées multirésistantes aux antibiotiques et des ERV qui ne répondent pas aux traitements de première intention normalement utilisés en déterminant les degrés de sensibilité à l’égard de la fosfomycine.</p><p><strong>Méthodes :</strong> Des isolats urinaires ont été recueillis de façon prospective entre novembre 2015 et avril 2016 dans trois hôpitaux du sud-ouest de l’Ontario. Des antibiogrammes ont été réalisés selon les lignes directrices du Clinical and Laboratory Standards Institute, et l’interprétation était fondée sur la zone d’inhibition (soit le diamètre en millimètres). Les patients de 18 ans et plus chez qui on avait isolé des entérobactériacées ou des ERV multirésistants aux antibiotiques étaient admissibles à l’étude. Les isolats urinaires provenant de ces patients étaient soumis à un antibiogramme. Le principal paramètre d’évaluation était le taux de sensibilité à la fosfomycine des isolats urinaires.</p><p><strong>Résultats :</strong> Au total, 137 isolats urinaires ont été testés; 106 étaient positifs pour des espèces d’entérobactéricées produisant des BLSE ou des ßlactamases AmpC (95 Escherichia coli, 11 espèces de Klebsiella) et 31 étaient positifs pour l’Enterococcus faecium résistant à la vancomycine. Les taux de sensibilité d’E. coli produisant des BLSE et des ß-lactamases AmpC étaient de 100 % pour l’ertapénem, 96 % pour la fosfomycine, 83 % pour la nitrofurantoïne, 72 % pour la gentamicine, 56 % pour le co-trimoxazole et 14 % pour la ciprofloxacine. Les taux de sensibilité pour les isolats urinaires d’Enterococcus faecium résistant à la vancomycine étaient de 100 % pour le linézolide, 81 % pour la fosfomycine, 68 % pour la tétracycline, 6 % pour l’ampicilline, 3 % pour la pénicilline et 0 % pour la nitrofurantoïne et la ciprofloxacine.</p><p><strong>Conclusion :</strong> En raison des taux de sensibilité obtenus aux établissements à l’étude, la fosfomycine a été jugée comme le médicament oral le plus fiable pour le traitement des infections urinaires basses chez les patients pour lesquels la présence d’uropathogènes multirésistants aux antibiotiques est soupçonnée ou connue.</p>