Tesis: "Leucémie aiguë lymphoblastique B"

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Bayet, Manon. "Modélisation de la leucémie aiguë lymphoblastique B induite par la mutation PAX5 P80R". Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2024. http://www.theses.fr/2024TLSES005.

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Resumen

L'équipe s'intéresse aux altérations de facteurs de transcription impliquées dans les leucémies aiguës, dont PAX5 qui est essentiel pour le développement des cellules B. C'est pourquoi le modèle murin transgénique PAX5-ELN a été généré, qui exprime la protéine de fusion oncogénique durant le développement des lymphocytes B, et récapitule le processus multi-étapes des LAL-B (Jamrog L et al., PNAS, 2018). J'ai participé à l'identification des cellules à l'origine de la LAL-B et à la caractérisation de leur propriétés fonctionnelles et moléculaires. Nos travaux indiquent qu'au stade pré-leucémique, PAX5-ELN induit l'émergence d'une population aberrante de progéniteurs B avec une propriété anormale d'auto-renouvellement. Cette population est enrichie en cellules quiescentes résistantes aux agents de chimiothérapie, activent un programme moléculaire de cellule souche, et sont le support de l'initiation leucémique à long terme. Ce travail fait l'objet d'une publication récente que je signe en deuxième auteure (Fregona V, Bayet M et al., J Exp Med, in press). En parallèle, ma thèse s'est tournée vers la modélisation de l'initiation et de la transformation leucémique induite par la mutation PAX5P80R, une altération initiatrice fréquente chez les patients. J'ai donc utilisé des cellules de foie fœtal issus d'embryon de souris Pax5-/- pour sélectionner les progéniteurs lymphoïdes non engagés dans le lignage B. Après transduction avec des rétrovirus CTL, PAX5 Wt ou PAX5P80R, j'ai montré que PAX5P80R ne restaure pas efficacement l'engagement définitif des cellules vers le lignage B. Les études de transplantation ont permis de montrer que PAX5P80R induit un potentiel de prise de greffe aberrant suivi du développement de la LAL-B. Cette transformation leucémique est associée à la sélection de clones porteurs de mutations additionnelles affectant la voie JAK/STAT. Nos analyses ont permis d'identifier Hif2 comme un candidat potentiel dans la leucémogenèse. Enfin, un criblage pharmacologique d'inhibiteurs de Hif révèle l'Acriflavine comme un composé intéressant ciblant les cellules leucémiques. Ainsi, la modélisation de la LAL-B par la mutation PAX5P80R fournit à l'équipe un nouvel outil mimant le processus multi-étapes de la LAL-B, et permet de déchiffrer les mécanismes biologiques par lesquels la mutation mène à la transformation tumorale. Ce travail fait l'objet d'un manuscrit en préparation que je signe en première auteure (Bayet M, Fregona V, et al., in preparation). Les modèles PAX5-ELN et PAX5P80R permettent non seulement d'étudier les différentes étapes de la leucémogenèse B, mais servent aussi de support pour le développement de criblage de petites molécules sur cellules primaires. J'ai donc mis en place un protocole miniaturisé et robuste par FACS pour cribler des composés chimiques ciblant les cellules pré-leucémiques. Notre approche multiparamétrique permet d'évaluer simultanément l'effet des composés sur les cellules pré-leucémiques et les sous-populations B normales. J'ai donc criblé une banque de 1040 composés synthétiques et naturels (chimiothèque essentielle) reflétant la diversité chimique de la chimiothèque nationale française. Ce criblage, associé à des contre-criblages en dose-réponse, m'a permis d'identifier 5 molécules d'intérêt. Dans l'ensemble, mon travail montre la faisabilité d'un criblage de petites molécules sur une population enrichie en cellules initiatrice de la leucémie et prenant en compte la complexité intrinsèque des cellules primaires du lignage B. Enfin, j'ai procédé à la rédaction et la publication d'une revue dans le journal Cancers qui expose les concepts d'hétérogénéité tumorales des cellules leucémiques des patients, l'utilité des modèles de souris transgéniques pour explorer le compartiment des cellules initiatrices de la leucémie, et les efforts actuels visant à découvrir de nouvelles thérapies ciblées (Fregona V*, Bayet M* et al, Cancers (Basel), 2021), que je signe en co-première auteure
The team is interested in alterations in transcription factors involved in acute leukemia, including PAX5, which is essential for B-cell development. This is why the PAX5-ELN transgenic mouse model was generated, which expresses the oncogenic fusion protein during B-cell development, and recapitulates the multi-step process of B-ALL (Jamrog L et al., PNAS, 2018). I was involved in identifying the cells at the origin of-B-ALL and characterizing their functional and molecular properties. Our work indicates that at pre-leukemic stage, PAX5-ELN induces the emergence of an aberrant population of B-progenitors with an abnormal self-renewal property. This population is enriched in quiescent cells resistant to chemotherapeutic agents, activating a molecular stem cell program and supporting long-term leukemic initiation. This work is the subject of a recent publication signed by myself as second author (Fregona V, Bayet M et al., J Exp Med, in press). In parallel, my thesis focused on modeling the initiation and leukemic transformation induced by the PAX5P80R mutation, a frequent initiating alteration in patients. I used fetal liver cells derived from Pax5-/- mouse embryos to select lymphoid progenitors not committed to the B lineage. After transduction with CTL, PAX5 Wt or PAX5P80R retroviruses, I showed that PAX5P80R does not restore efficiently definitive commitment of cells to the B lineage. Transplantation experiments have shown that PAX5P80R induces aberrant engraftment potential followed by the development of B-ALL. This leukemic transformation is associated with the selection of clones carrying additional mutations affecting the JAK/STAT signaling pathway. Our analyses identified Hif2 as a potential candidate for leukemogenesis. Finally, pharmalogical screening of Hif inhibitors revealed Acriflavine as an interesting compound targeting leukemic cells. Thus, the modeling of B-ALL by the PAX5P80R mutation provides the team with a new tool to mimic the multi-step process of B-ALL, and to decipher the biological mechanisms by which the mutation leads to tumor transformation. This work is the subject of a manuscript in preparation which I have signed as first author (Bayet M, Fregona V, et al., in preparation). The PAX5-ELN and PAX5P80R models not only make it possible to study the various stages of B leukemogeneis, but also serve as a basis for the development of small molecule screening on primary cells. I therefore set up a miniaturized and robust protocol by FACS to screen chemical compounds targeting pre-leukemic cells. Our multiparametric approach enables us to simultaneously assess the effect of compounds on pre-leukeic cells and normal B subpopulations. I screened a bank of 1040 synthetic and natural compounds (essential chemical library) reflecting the chemical diversity of the French national chemical library. This screening, combined with dose-response counter-screening, enabled me to identify 5 molecules of interest. Overall, my work demonstrates the feasibility of small-molecule screening on a population enriched in leukemia-initiating cells, taking into account the intrinsic complexity of primary B-cells. Finally, I edited and published a review in the journal Cancers outlining the concepts of tumor heterogeneity in patients' leukemic cells, the utility of transgenic mouse models to explore the leukemia initiating cell compartment, and current efforts to discover new targeted therapies (Fregona V*, Bayet M* et al, Cancers (Basel), 2021), wich I co-authored

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Familiades, Julien. "Anomalies moléculaires du gène PAX5 dans les leucémies aiguës lymphoblastiques de la lignée B". Toulouse 3, 2010. http://thesesups.ups-tlse.fr/1269/.

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Resumen

Les lymphocytes B sont la clé de voute de cellules de l'immunité adaptative humorale. La mise en place de la lignée B dépend de l'expression coordonnée de facteurs de transcription. Parmi ceux-ci, PAX5 a un rôle prépondérant en activant des gènes spécifiques de la lignée B et en réprimant des gènes nécessaires à l'engagement vers les autres lignages hématopoïétiques. Son expression est finement régulée durant la lymphopoïèse B jusqu'à son extinction dans les cellules matures permettant la différenciation terminale en cellules plasmocytaires productrices d'anticorps. La délétion homozygote de Pax5 dans les modèles murins conduit à une trans ou une dédifférenciation des cellules B dans plusieurs autres lignées hématopoïétiques. Les mutations de facteurs de transcription clés sont fréquemment détectées dans les hémopathies malignes. Dans ce contexte, PAX5 a été décrit comme la cible préférentielle de mutations somatiques dans les LAL-B de l'enfant dans 38. 9% de cas. Nous avons réalisé une étude des mutations de PAX5 dans les LAL-B de l'adulte, inclus dans le protocole clinique GRAALL03 (Group of Research in Adult Acute Lymphoblastic Leukemia) et avons montré que PAX5 était altéré dans 34% des cas. De plus les délétions de PAX5 sont associées à la présence de BCR-ABL1 alors que les mutations ponctuelles sont toujours isolées. Ceci laisse penser que ces deux types d'altérations de PAX5 ne sont pas équivalents, la mutation ponctuelle pourrait être un événement princeps de la leucémogenèse alors que la délétion de PAX5 ne serait qu'une conséquence de l'instabilité génétique d'une cellule dans un processus leucémique. Nous avons également réalisé une recherche de translocations impliquant PAX5 dans une cohorte du GFCH (Groupe Francophone de Cytogénétique Hématologique) de 153 patients LAL-B possédant un réarrangement du 9p. Enfin nous avons entrepris la caractérisation fonctionnelle des mutants de PAX5 en utilisant le système de différenciation ex vivo décrit par Rolink et montré que les différents types de mutations n'ont pas le même impact sur la pathogenèse B
B cell lymphocytes are essential for humoral adaptive immunity. The expression of transcription factors drives the commitment of cells in B lineage. Among those factors, PAX5 fulfils a dual role by repressing B lineage ‘inappropriate’ genes and simultaneously activating B lineage–specific genes. PAX5 is expressed at similar levels throughout B cell development from the pro-B to the mature B cell stage and is subsequently repressed during terminal plasma cell differentiation. When Pax5–/– pro-B cells are stimulated with other lineageappropriate cytokines, they are able to differentiate into functional macrophages, granulocytes, dendritic cells, osteoclasts and natural killer cells. Transcription factors mutations are frequently detected in hematopoietic cancers. The PAX5 gene was the prevalent target of somatic mutation, being altered in 38. 9% of cases. We screened PAX5 mutations in a unique cohort of adult BCP-ALL treated according to the protocols of the GRAALL03 (Group of Research on Adult Acute Lymphoblastic Leukemia) and we reported that PAX5 is mutated in 34% of cases. Moreover, PAX5 complete loss and PAX5 point mutations differ. Indeed, PAX5 complete loss is significantly associated with BCR-ABL1 fusion gene and seems to be a secondary event consequence of genetic instability, whereas PAX5 point mutation might be the initial event in leukemogenesis. Using classic cytogenetic techniques and a newly developed molecular strategy, we investigated 9p abnormalities, focusing especially on the PAX5 locus, on 153 childhood and adult B-ALL include in the Groupe Francophone de Cytogénétique Hématologique (GFCH). Finally we undertook the functional characterization of PAX5 mutants using the ex vivo differentiation system described by Rolink and showed that the various kind of muations not have the same impact on the B cell pathogenesis

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Clappier, Emmanuelle. "Génétique somatique et oncogenèse des leucémies aiguës lymphoblastiques T". Paris 7, 2008. http://www.theses.fr/2008PA077087.

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Resumen

Les leucémies aiguës lymphoblastiques de la lignée T (LAL-T) sont des proliférations malignes présentant les caractéristiques de précurseurs lymphoïdes thymiques bloqués dans leur différenciation. La mise en évidence et la caractérisation des remaniements/mutations somatiques du génome, permettant d'identifier des gènes dérégulés, constitue une étape majeure pour progresser dans la compréhension des mécanismes de leucémogenèse et l'identification des voies biologiques critiques des cellules tumorales. Nous avons entrepris un crible des remaniements génomiques à partir d'une grande série de cas de LAL-T annotés pour l'immunophénotype et l'expression des principaux oncogènes (TAL1, TLX1, TLX3, LMO2. . . ). Deux approches génétiques pan-génomes ont été utilisées : i) un criblage par FISH des translocations associées aux gènes du TCR puis l'identification des régions partenaires par clonage par PCR cerclée, ii) un profilage chromosomique par CGH-array à la recherche de délétîons ou duplications cryptiques. Nous avons ainsi identifié plusieurs nouveaux remaniements récurrents des LAL-T et montré qu'ils dérégulaient l'expression de gènes importants pour la différenciation thymique : les gènes HOXA, Cycline D2 et C-MYB. Ces anomalies ont été intégrées dans un vaste portrait moléculaire des LAL-T établi par une analyse de données d'expression à large échelle. De nouveaux sous-types oncogéniques ont été définis, notamment un groupe HOXA incluant les cas avec translocations TCRB-HOXA ou microdélétion SET-NUP214, et un sous-type homogène de leucémies T du très jeune enfant associé à la translocation TCRB-MYB
T-cell acute lymphoblastic leukemia are malignancies derived from lymphoid thymic precursors arrested in their differentiation. Identification and characterization of somatic rearrangements/mutations of the genome is a major step for leukemogenesïs mechanisms understanding and identification of the critical biological pathways of tumoral cells. We performed a screen for genomic rearrangements in a series of adult and pediatric T-ALL cases annotated for immunophenotypic data and expression of known oncogenes (TAL1, TLX1, TLX3, LMO2. . . ). Two genome-wide approaches were used: i) FISH screening for TCR-mediated translocations and breakpoint doning using cirded-PCR to identify partner sequences, ii) genomic profiling using array-CGH in a search for cryptic deletions or duplications. We thus identified several new recurrent rearrangements of T-ALL and showed that they lead to dysregulated expression of genes critical for thymic differentation: HOXA, Cylin D2 and C-MYB gènes. These abnormalities were included in a general molecular portrait of T-ALL performed by lange-scale gene expression analysis. Importantly, new oncogenic subtypes were defined, including a HOXA-group including cases with TCRB-HOXA translocation and SET-NUP214 microdeletion, and a homogeneous subtype of T-cell leukemias in very young children with TCRB-MYB translocation

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El, Chaar Tiama. "Nouveaux gènes suppresseurs de tumeurs dans les leucémies aiguës lymphoblastiques T". Paris 7, 2012. http://www.theses.fr/2012PA077088.

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Resumen

Les leucémies aiguës lymphoblastiques de la lignée T (LAL-T) sont des proliférations malignes présentant les caractéristiques de précurseurs lymphoïdes thymiques bloqués dans leur différenciation. La mise en évidence et la caractérisation des remaniements/mutations somatiques du génome, permettant d'identifier des gènes dérégulés, constitue une étape majeure de l'identification des voies biologiques critiques des cellules tumorales. Dans ce travail nous avons utilisé des approches combinées d'analyses génomiques et fonctionnelles afin de démontrer le rôle de l'haplo-insuffisance combinée via une délétion interstitielle de deux gènes contigus localisés sur le chromosome 6ql4, SYNCR1P (codant pour une ribonucleoprotéine, hnRNP-Q) et SHNG5 (un gène hôte non codant hébergeant deux small nucleolar RNA, les snoRNAs U50 A et B). Ces deux gènes sont impliqués dans la maturation des ARN messagers et dans la régulation de la traduction des protéines, et ils sont spécifiquement perdus via les del(6q) dans un sous-type de LAL-T dit TAL-related, caractérisé par une expression aberrante du facteur de transcription oncogénique TAL1. Nous avons utilisé des modèles in vivo de cellules de souris Tal1tg/Lmo1tg/Notch1-ICNtransduit, et un modèle de xénogreffes de cellules leucémiques de patients SIL-TAL, pour montrer que l'inactivation combinée des deux gènes SYNCRIP et SHNG5 était associée à un gain de malignité. Notre étude apporte une preuve génétique et fonctionnelle pour un rôle de tumeur suppresseur par haplo-insuffisance combinée de deux gènes dans les leucémies aiguës lymphoblastiques T. Dans un travail mené en parallèle nous avons participé à l'identification d'un nouveau gène suppresseur de tumeur des LAL-T, le gène PTPN2. L'analyse par CGH array a révélé la présence d'une micro-délétion acquise située sur le chromosome 18pll dans 6% de cas de LAL-T, fortement associée au sous-type oncogénique des LAL-T corticale TLX1. L'inhibition du gène PTPN2 augmente la prolifération des cellules T ainsi que leur sensibilité aux cytokines. Par ailleurs PTPN2 est un régulateur négatif de la protéine tyrosine kinase oncogénique chimérique NUP214-ABL1. Cette étude génétique et fonctionnelle montre le rôle tumeur suppresseur du gène PTPN2 et suggère que les niveaux d'expressions de ce gène pourraient moduler la réponse au traitement dans les LAL-T
T-cell acute lymphoblastic leukemia are malignancies derived from lymphoid thymic precursors arrested in their differentiation. Identification and characterization of somatic rearrangements/mutations of the genome is a major step for leukemogenesis mechanisms understanding and identification of the critical biological pathways of tumoral cells. We used a whole set of integrative genomics and functional approaches and identified the role of the combined haploinsufflciency of two contiguous genes at 6ql4, namely SYNCRIP (encoding hnRNP-Q) and SNHG5 (a non-protein-coding gene that hosts snoRNAs), both involved in mRNA maturation and protein translation. These genes were specifically deleted in a subtype of T-ALLs characterized by aberrant expression of the TAL1 transcription factor oncogene. In vivo knockdown models using Tal1tg/Lmo1tg/Notch1-ICNtransduced mouse cells, and xenograft of patient's SIL-TAL leukemic cells, showed that the combined silencing of both genes was associated to a gain of malignancy. Our study provides genetic and functional evidence for a tumor suppressor role of a combined haploinsufflciency of two genes at chromosome 6ql4. In a parallel work, we identified a novel genetic aberrations involved in the development of T-ALL, that is the biallelic deletion of the PTPN2 gene at 18p11. We found focal homozygous deletion of this gene using microarray-based comparative genomic hybridization and large scale expression analysis of a cohort of T-ALL. These cases were restricted to the TLX1 subtype and frequently associated to the fusion gene NUP214-ABL1 Functional experiments performed in Jan Cools' team at Leuven University showed a hyperactivation of the JAK/STAT pathways in these cases, with possible therapeutic targeting

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Drivet, Elsa. "Etude préclinique personnalisée d'une translocation rare T(1 ; 9)(Q24 ; Q34) "PH-LIKE" et perspectives d'optimisation des traitements contre les LAL-B de mauvais pronostic". Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0664.

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Resumen

La translocation t(1;9)(q24 ;q34), qui engendre la protéine de fusion RCSD1-ABL1, a été identifiés dans des cas de LAL de mauvais pronostic. Les propriétés oncogéniques du partenaire RCSD1, sa structure et son rôle dans l’activité et la signalisation de RCSD1-ABL1 restent inconnus. Nous avons récemment rapporté le cas d’une LAL-B t(1;9)(q24 ;q34) montrant une résistance à un grand nombre d’ITK, mais une sensibilité inattendue au ponatinib, en l’absence de mutation d’ABL1 susceptible d’expliquer ces réponses.Dans le but de caractériser la protéine RCSD1-ABL1, de comprendre ces profils de réponse aux ITK et de rechercher un traitement optimal de ces leucémies, nous avons cloné le produit de fusion à partir des blastes leucémiques de la patiente. Les constructions obtenues ont été transfectées dans le modèle cellulaire BaF3, ce qui nous a permis : 1) de démontrer et 2) de disséquer pour la première fois l’oncogénicité et la signalisation de la protéine de fusion, au moins partiellement distincte de celle de BCR-ABL1 et notamment concernant l’activation de la voie JAK/STAT; 3) de purifier RCSD1-ABL1 et de révéler l’impact inattendu du bras N-terminal RCSD1 sur l’activité catalytique de l’enzyme et sa sensibilité aux ITK ; 4) d’intégrer ces données et de démontrer l’effet potentialisateur d’inhibiteurs de la voie JAK/STAT sur l’activité des ITK dans les cellules transduites par RCSD1-ABL1 mais pas celles exprimant BCR-ABL1. Enfin, le profilage chémo-génomique de prélèvements issus de 3 patients nous a permis de conforter nos résultats, et de proposer des bases précliniques de traitements personnalisés ciblant ces mécanismes
The t(1;9)(q24;q34) translocation, generating the RCSD1-ABL1 fusion protein, is found in bad prognosis LAL cases. The oncogenic properties of RCSD1-ABL1 are unknown and the structure of the RCSD1 portion as well as its impact on RCSD1-ABL1 activity and signaling is yet to be determined. We recently reported the case of a patient with ALL associated with a RCSD1-ABL1 rearrangement that was resistant or poorly responsive to a large number of TKIs but was sensitive to Ponatinib, with no mutation that could explain this.In order to characterize this fusion protein, understand its response profile to TKI and optimize therapeutic approaches for these patients, we cloned the RCSD1-ABL1 gene from the patient sample and expressed it in the cellular model BaF3. This allowed us to 1) Demonstrate and 2) Study for the first time the oncogenic properties and signaling of the fusion protein, which is partially distinct from that of BCR-ABL1, especially regarding the JAK/STAT pathway; 3) Purify RCSD1-ABL1 and reveal the impact of the RCSD1 N-terminal portion on the enzyme activity and its TKI sensitivity; 4) Integrate this data and demonstrate the potentiating effect of JAT/STAT pathway inhibitors on TIK activity in cells expressing RCSD1-ABL1 but not in cells expressing BCR-ABL1.Finally, the chemo-genomic profiling of samples from three B-ALL t(1;9)(q24 ;q34) allowed us to consolidate our results and to propose preclinical bases for personalized treatments targeting the identified mechanisms

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Pelletier, Jeoffrey. "Régulation de la prolifération des leucémies aiguës lymphocytaires de type B (LAL-B) par le microenvironnement de la moëlle osseuse". Thesis, Aix-Marseille, 2019. http://www.theses.fr/2019AIXM0693.

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Chez l’adulte les premières étapes de développement hématopoïétique sont mises en place dans la moelle osseuse (MO). La contribution dans ce processus de cellules spécialisées appelées niches stromales a été démontrée dans le cas du développement précoce des lymphocytes B (LB). L’expression d’une chaine d’immunoglobuline lourde (IgH) fonctionnelle commencée au stade Pro-B et son association à la pseudo chaine légère pour former le Pré-BCR marque l’entrée au stade Pré-B. Précédemment, le laboratoire a démontré que les Pré-B se relocalisent au contact d’une niche constituée de cellules stromales caractérisées par la sécrétion de la Galectine-1 (Gal-1), ligand du pré-BCR. Cette interaction permet alors l’amplification des signaux de prolifération et de différenciation dépendants du Pré-BCR, puis le réarrangement des gènes codant pour la chaine légère (IgL) au stade de LB Immature.Les leucémies aiguës lymphoblastiques de type B (LAL-B), sont l'équivalents pathologiques des lymphocytes B en différenciation dans la MO. Afin de déterminer si la Gal-1 sécrétée par la niche spécifique des cellules Pré-B normales pouvait influencer la survie ou la prolifération des LAL-BIII qui expriment le Pré-BCR, nous avons tout d’abord utilisé des modèles maîtrisés de souris génétiquement modifiées. Pour cela, nous avons injecté des LAL-BIII (Pré-BCR+) primaires murines à des souris WT ou Gal-1 -/- et constaté que les LAL-BIII ont un développement fortement limité en absence de la Gal-1. Ces résultats montrent un intérêt à cibler l’interactionGal-1/Pré-BCR ou la signalisation Pré-BCR en pathologie humaine dans le but d’améliorer la prise en charge thérapeutique des LAL-BIII
In adults, the first stages of hematopoietic development are implemented in the bone marrow (BM). The contribution in this process of specialized cells called stromal niches has been demonstrated in the case of the early development of B lymphocytes (LB). The expression of a functional heavy immunoglobulin (IgH) chain started at the Pro-B stage and its association with the surrogate light chain to form the Pre-BCR marks the entry into the Pre-B stage. Previously, the laboratory demonstrated that Pre-B relocates on contact with a niche made up of stromal cells characterized by the secretion of Galectin-1 (Gal-1), a ligand of pre-BCR. This interaction then allows the amplification of proliferation and differentiation signals dependent on the Pre-BCR, then the rearrangement of the genes coding for the light chain (IgL) at the stage of Immature LB. Acute lymphoblastic leukemias type B (B-ALL ) are the pathological equivalents of differentiating B lymphocytes in BM. In order to determine if the Gal-1 secreted by the specific niche of normal Pre-B cells could influence the survival or the proliferation of LAL-BIII which express Pre-BCR, we first used genetically controlled mouse models changed. To do this, we injected murine primary BIII- ALL (Pre-BCR +) into WT or Gal-1 mice - / - and found that BIII-ALL have a very limited development in the absence of Gal-1. These results show an interest in targeting the Gal-1 / Pre-BCR interaction or the Pre-BCR signaling in human pathology in order to improve the therapeutic management of BIII-ALL

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Virely, Clémence. "Rôle des facteurs de transcription STATs et Ikaros dans les leucémies aiguës lymphoblastiques". Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077164.

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Resumen

Les facteurs de transcription STAT3, STAT5 et Ikaros sont impliqués dans rhématopoïèse normale et leur expression est fréquemment dérégulée dans les hémopathies humaines. Dans une première partie de mon travail, nous avons mis en évidence que STAT5 est essentiel pour l'initiation de la leucémie aiguë lymphoblastique (LAL) induite par F oncogene TEL-JAK2. Nous avons également montré que les leucémies TEL-JAK2 requièrent nécessairement l'expression des facteurs STAT3 ou STAT5 pour leur maintien à long terme. Parallèlement à ce projet, nous avons mis en évidence une interaction fonctionnelle entre le facteur de transcription STAT5 et le produit du gène suppresseur de tumeur Ikzfl in vitro. In vivo, nous avons montré une synergie entre l'oncogène BCR-ABL et la perte de fonction d'un allèle du gène Ikzfl dans les LAL-B STAT5 dépendantes. Les cellules tumorales déficientes ou non pour l'expression d'Ikaros n'expriment pas d'isoforme dominantes négatives d'Ikaros. Les analyses du réarrangement des gènes codant les chaînes des immunoglobulines montrent que les cellules leucémiques BCR-ABL⁺/⁰ ; Ik⁺/⁺ sont monoclonales alors que les leucémies accélérées sont polyclonales. La perte de fonction d'Ikzfl atténue la pression de sélection d'autres mutations pro-oncogéniques. Des analyses génomique par CGH indiquent que les tumeurs BCR-ABL⁺/⁰; Ik⁺/⁺ présentent de multiples anomalies chromosomiques récurrentes. En revanche, très peu d'anomalies chromosomiques sont observées dans les tumeurs accélérées. L'étude transcriptomique des tumeurs BCR-ABL⁺/⁰; Ik⁺/⁺ et BCR-ABL⁺/⁰; IkL/⁺ nous a permis d'identifier 293 sondes dérégulées entre les tumeurs de deux génotypes
Transcription factors STAT3, STAT5 and Ikaros are involved in normal hematopoiesis and expression of these factors is frequently deregulated in human leukemias. In the first part of my thesis, we have demonstrated that STAT5 expression is essential for the initiation of acute lymphoblastic leukemia (ALL) induced by TEL-JAK2 oncogene. Then, we have shown that TEL-JAK2 leukemia require necessarily STAT3 or STAT5 expression for their long-term maintenance. In a second part, we have demonstrated a functional interaction between the transcription factor STAT5 and Ikzfl a tumor suppressor gene in vitro. In vivo, we have shown a synergy between BCR-ABL oncogene and the loss of function of one allele of Ikzfl gene in STAT5 dependent B-ALL. Leukemic blasts deficient or not for Ikaros expression do not express dominant negative Ikaros isoforms. The loss of a single Ikzfl allele is suffïcient to cooperate with BCR-ABL in leukemogenesis. Analysis VH-to-DJH immunoglobulin heavy chain locus rearrangement showed that leukemic cells BCR-ABL⁺/⁰; Ik⁺/⁺ are monoclonal while fast arising leukemia are polyclonal. These observations suggest that loss of function of a single Ikzfl allele alleviates the requirement for the selection of additional oncogenic events that characterize disease progression in BCR-ABL-induced leukemogenesis. In line with this notion, CGH array analysis showed quantitative and qualitative reductions of chromosomal numerical abnormalities in Ikaros-deficient BCR-ABL tumors as compared to BCR-ABL⁺/⁰; Ik⁺/⁺ tumors. Global Transcriptomic analysis revealed that 293 probsets are deregulated between BCR-ABL⁺/⁰; Ik⁺/⁺ and BCR-ABL⁺/⁰; IkL/⁺ tumors

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Gandemer, Virginie. "Utilisation des puces à adn pour l’étude fonctionnelle du génome dans les leucémies aiguës lymphoblastiques de la lignée B de l’enfant". Rennes 1, 2007. http://www.theses.fr/2007REN1S040.

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Les LAL-B représentent le 1er cancer de l’enfant. Les mécanismes moléculaires mis en jeu dans le processus de leucémogenèse et dans leur pronostic sont peu connus. L’étude des profils d’expression génique nous a permis d’explorer la pathogénie d’un groupe homogène de LAL-B caractérisée par le transcrit TEL/AML1. Nous avons mis en évidence et validé 14 gènes regroupés en 5 processus biologiques caractérisant ces LAL. Parmi eux, RUNX1 s’est avéré plus représentatif de ce groupe que le transcrit TEL/AML1. Pour la première fois, nous avons mis en évidence le processus de mobilité cellulaire et explorons les mécanismes de régulation épigénétique des deux seuls gènes sous-exprimés. Au sein des LAL-B sans anomalie cytogénétique récurrente, notre étude n’a pu retrouver de profils d’expression en rapport avec les groupes pronostiques clinico-biologiques (âge et leucocytose au diagnostic). Ces données conduisent à rechercher de nouveaux marqueurs de caractérisation et de pronostic des LAL-B
B-ALL is a common pediatric malignancy but leucemogenesis and prognostic biological mechanisms still remain uncertain. We explored critical pathways of TEL/AML1 B-ALL with gene expression profile approach. We highlighted 5 enriched Gene Ontology categories characterized by 14 genes, able to discriminate the TEL/AML1 sub-group. Over-expression of RUNX1 was proposed to become a additional surrogate marker of this subgroup. Cell motility was for the first time identified as a representative process of this subgroup and epigenetic regulation of the 2 underexpressed genes is underanalysis. We could not show patterns of expression in pediatric B-ALL lacking common cytogenetic abnormatities that correlated with the NCI risk factors (age and blood cell count). Our results suggest the refinement of existing classification and risk algorithms

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Tanguy, Schmidt Aline. "Les leucémies aiguës lymphoblastiques en 2015 : contribution des facteurs de risque cytogénétiques et moléculaires à une thérapeutique adaptée". Thesis, Angers, 2015. http://www.theses.fr/2015ANGE0041/document.

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Les leucémies aiguës (LA) sont un groupe hétérogène d'hémopathies malignes dues à latransformation oncogénique clonale des cellules souches hématopoïétiques (CSH). On distingue les LA myéloblastiques etlymphoblastiques (LAL). Les LAL sont classées selon le type de précurseur lymphoïde atteint, leur degré de maturité et leurs anomalies cytogénétiques.Le traitement permettant d'obtenir 80 à 90 % de rémission complète (RC) comporte une chimiothérapie d'induction, une consolidation et une intensification(intensification retardée ou allogreffe de CSH selon la situation pronostique). Néanmoins la survie globale à long terme n'est que de 40 à 50 %, du fait de la survenue de rechutes et de la toxicité des traitements. Différents groupes pronostiques basés sur la cytogénétique et la biologie moléculaire se dégagent,pouvant bénéficier de thérapeutiques adaptées. Dans les LAL à chromosome philadelphie (LAL à Ph),antérieurement de mauvais pronostic, les inhibiteurs de tyrosine kinase (ITK) permettent d'obtenir 80% de RCavec cependant un taux de rechute non négligeable. Nous avons démontré qu'une intensification thérapeutique par autogreffe chez des patients avec une maladie résiduelle indétectable permettait une survie à long terme prolongée avec une toxicité moindre que celle de l'allogreffe. En montrant l'implication de l'autotaxine dans les mécanismes de résistance aux ITK dans les LAL à Ph, nous ouvrons la voie à l'utilisation potentielle de nouvelles thérapeutiques. Dans les LAL T, groupe considéré de bon pronostic, un tiers des patients rechute. Nous avons démontré que l'absence de mutation de Notch et/ou FBXW7 ou la présence de mutations de RAS ou PTEN était de mauvais pronostic identifiant un sous-groupe de LAL T dont le traitement devait être renforcé. Nos travaux ont ainsi contribué à l'identification des groupes pronostiques dans les LAL et à l'adaptation des traitements afin d'améliorer les chances de survie
Acute leukemias are a heterogeneous groups of malignant hematological diseases due to the clonaloncogenic transformation of hematopoietic stem cells(HSTs). We distinguish acute myeloblastic leukaemiafrom acute lymphoblastic leukemia (ALL). ALLs are classified according to the type of lymphoid precursoraffected, its degree of maturity, and with associated cytogenetic abnormalities.Treatment incorporating induction therapy,consolidation, and intensification – delayedintensification or allogeneic stem cell transplantation(SCT) according to prognostic factors – enable 80 to 90% of complete remission (CR). Nevertheless, long-termoverall survival is only 40 to 50% because of relapseand treatment-related toxicity. Different prognosticgroups based on cytogenetic abnormalities andmolecular biology are emerging and patients from eachprognostic group can benefit from adapted therapies.In chromosome Philadelphia-positive ALL (Ph+ ALL) which used to be of particular bad prognosis, tyrosinekinase inhibitors (TKIs) enables 80% of CR but with ahigh-relapse risk. We demonstrated that high-dosetherapy followed by autologous SCT enables prolongedlong-term survival with less drug-related toxicity ascompared to allogeneic SCT in patients with undetectable minimal residual disease. By showing the implication of autotaxine in the resistance to TKIs inPh+ LAL, we enable the use of novel therapeutics inclinical practice.T-cell ALL is considered of poor prognosis as one thirdof patients relapse. In this group of patients we showedthat the absence of a Notch and/or a FBXW7 mutation or the presence of mutations in RAS or PTEN identified a subgroup of patients in whom the treatmentmust be intensified. Our research has contributed to the identification of prognostic groups in ALL and to theadjustment of treatment according to potential survival

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Jamrog, Laura. "Impact des altérations génétiques de PAX5 sur le développement de la lignée lymphoïde B et dans la leucémogenèse des LAL-B". Electronic Thesis or Diss., Toulouse 3, 2021. http://www.theses.fr/2021TOU30306.

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Le gène PAX5 (Paired boX 5) code un facteur de transcription essentiel pour la différenciation lymphoïde B. Nous avons montré que les deux isoformes PAX5A et PAX5B étaient différentiellement régulées mais pouvaient exercer une fonction équivalente durant l'induction de la différenciation lymphoïde B et pourraient présenter des différences fonctionnelles à la suite de l'activation des lymphocytes B. Le contrôle précis de leur expression peut ainsi refléter un moyen d'ajuster finement le dosage de PAX5 pendant le processus de différenciation des cellules de la lignée lymphoïde B. PAX5 est la cible principale d'une large diversité d'altérations somatiques dans les LAL-B de l'enfant et de l'adulte. Cependant, le rôle des protéines de fusion impliquant PAX5 dans l'initiation et la transformation des LAL-B est encore méconnu. Nous avons précédemment décrit une nouvelle translocation chromosomique récurrente t(7;9)(q11;p13) dans les LAL-B qui juxtapose PAX5 à la séquence codante du gène de l'élastine (ELN). Pour étudier la fonction de la protéine de fusion résultante, PAX5-ELN, au cours du développement leucémique, nous avons créé un modèle murin dans lequel le transgène PAX5-ELN est exprimé spécifiquement dans le compartiment B. Les souris exprimant PAX5-ELN développent un phénotype de LAL-B avec une pénétrance de 80%. Leur transformation leucémique est associée à l'acquisition de mutations secondaires récurrentes des gènes Ptpn11, Kras, Pax5, et Jak3 affectant d'importantes voies de signalisation requises pour la prolifération cellulaire. Nos études fonctionnelles ont démontré que PAX5-ELN altérait in vitro et in vivo le développement lymphoïde B et pouvait induire une expansion aberrante du compartiment progéniteur B (pro-B) au stade préleucémique. Nos approches moléculaires et computationnelles ont identifié des gènes-candidats régulés par PAX5-ELN et pouvant être impliqués dans l'initiation leucémique. Nos données fournissent ainsi un nouveau modèle d'étude in vivo récapitulant la leucémogenèse multi-étapes des LAL-B décrites chez les patients et impliquent fortement les protéines de fusion engageant PAX5 en tant que puissantes oncoprotéines dans le développement leucémique. Par ailleurs, il existe de plus en plus de preuves d'une base génétique héréditaire de prédisposition aux LAL-B pédiatriques. Dans ce contexte, quatre cas de familles non-apparentées affectées par des LAL-B et exprimant des mutations ponctuelles germinales et hétérozygotes de PAX5 ont récemment été rapportés : la mutation PAX5 G183S altérant le domaine octapeptide de PAX5 a été décrite chez trois familles alors que la mutation PAX5 R38H altérant le domaine de liaison à l'ADN de PAX5 a été identifiée chez une autre. Nous avons renforcé l'hypothèse du caractère héréditaire des LAL-B familiales avec la description de trois nouveaux cas de LAL-B au sein d'une même famille exprimant la mutation germinale PAX5 R38H. Pour étudier l'effet intrinsèque de la protéine mutée PAX5 R38H dans le développement lymphoïde B, nous avons effectué des tests fonctionnels in vitro et in vivo combinés à une analyse d'expression génique, basés sur une approche de complémentation rétrovirale. Nos résultats ont indiqué que PAX5 R38H agissait comme un fort variant hypomorphique qui échouait à induire la différenciation lymphoïde B et n'exerçait pas d'effet dominant-négatif sur la forme sauvage de PAX5. Des transplantations syngéniques de cellules exprimant PAX5 R38H ont démontré qu'elles maintenaient une capacité de prise de greffe et menaient au développement leucémique chez la souris. Notre analyse transcriptomique a confirmé la perte de fonction de PAX5 sur ses gènes cibles et a révélé une signature moléculaire spécifique au mutant. Nos données mettent ainsi en évidence l'importance de la dérégulation transcriptionnelle dans la leucémogenèse des LAL-B familiales, en particulier des gènes impliqués dans la différenciation lymphoïde B
The PAX5 (Paired boX 5) gene encodes a key transcription factor crucial for B-cell differentiation. We showed that the two PAX5 isoforms are differentially regulated but have equivalent function during early B-cell differentiation. Indeed, PAX5A and PAX5B isoforms can both induce B-cell program but may have functional differences after B-cell activation. The tight control of their expression may thus reflect a way to finely tune PAX5 dosage during B-cell differentiation process. PAX5 is a well-known haploinsufficient tumor suppressor gene in human B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP-ALL) and is the main target of a wide diversity of somatic alterations in childhood and adult BCP-ALL, occurring in one third of sporadic cases. However, the role of PAX5 fusion proteins in BCP-ALL initiation and transformation is ill-known. We previously reported a new recurrent t(7;9)(q11;p13) chromosomal translocation in human BCP-ALL that juxtaposed PAX5 to the coding sequence of elastin (ELN). To study the function of the resulting PAX5-ELN fusion protein in BCP-ALL development, we generated a mouse model in which the PAX5-ELN transgene is expressed specifically in B cells. PAX5-ELN-expressing mice efficiently developed BCP-ALL phenotype with a penetrance of 80%. Leukemic transformation was associated with clonal Immunoglobulin gene rearrangement and recurrent secondary mutations in Ptpn11, Kras, Pax5, and Jak3 genes affecting key signaling pathways required for cell proliferation. Our functional studies demonstrated that PAX5-ELN impairs B-cell development in vitro and in vivo and induces an aberrant expansion of the pro-B cell compartment at the preleukemic stage. Our molecular and computational approaches identified PAX5-ELN-regulated candidate genes that establish the molecular bases of the preleukemic state to drive BCP-ALL initiation. In conclusion, our study provides a new in vivo model recapitulating the multistep leukemogenesis process of human BCP-ALL and strongly implicates PAX5 fusion proteins as potent oncoproteins in leukemia development. Furthermore, there is increasing evidence for an inherited genetic basis of susceptibility to childhood BCP-ALL. In this context, four unrelated families with childhood BCP-ALL expressing heterozygous PAX5 germline point mutations were recently reported: the recurrent mutation PAX5 G183S affecting the octapeptide domain of PAX5 has been described in three families while PAX5 R38H affecting its DNA-binding paired domain has been identified in another one. We strengthen the hypothesis of inherited character of familial BCP-ALL with the description of three novel familial BCP-ALL cases in related patients that express the germline PAX5 R38H mutation. To uncover the intrinsic effect of PAX5 R38H mutant in B-cell development, we performed in vitro, and in vivo functional assays combined with a gene expression analysis, based on a retroviral complementation approach. Our results indicated that PAX5 R38H mutant acts as a strong hypomorphic variant that fails to drive B-cell differentiation and does not exert a dominant-negative effect on wild-type PAX5. Syngeneic transplantation of PAX5 R38H-expressing cells demonstrated maintenance of engraftment capacity and led to development of BCP-ALL phenotype in mice. Our transcriptomic analysis of these PAX5 R38H-expressing cells showed that PAX5 R38H drastically alters the pattern of expression of PAX5 target genes but also revealed a distinct molecular signature specific to PAX5 R38H. Together with previous unrelated family study, our observations allow to establish the recurrence of the germline PAX5 R38H mutation associated with BCP-ALL. Our data also highlight the importance of transcriptional dysregulation in leukemogenesis of familial BCP-ALL, particularly of genes involved in B-cell differentiation

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Nicoletti, Simon. "Natural Killer Cells and Pre-B Acute Lymphoblastic Leukemia : Evidence for an Unconventional Cytotoxicity Pathway". Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS383.

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Les cellules Natural Killer (NK) représentent une population de cellules innées lymphoïdes aux fonctions anti-infectieuses et antitumorales. Les leucémies aiguës lymphoblastiques pré-B (LAL pré-B) constituent le cancer de l’enfant le plus fréquent et ont été décrites comme résistantes à la cytotoxicité médiée par les NK bien que les bases moléculaires demeurent inconnues.L’objectif de ces travaux a été de caractériser cette résistance. En développant un essai de cytotoxicité par cytométrie en flux et en utilisant des cellules effectrices activées in vitro, nous avons établi la sensibilité retardée des LAL pré-B à la cytotoxicité NK : initialement résistantes après 4h d’incubation, elles sont fortement tuées après 25h.Cette cytotoxicité est contact-dépendante mais ni la voie de l’exocytose des granules cytotoxiques ni celle des récepteurs de mort n’y contribuent. La mort cellulaire des cibles est de profil apoptotique mais indépendante des caspases ; la signalisation mitochondriale l’amplifie partiellement. Interférer avec les dérivés de l’oxygène par un antioxydant diminue la cytotoxicité. Nous montrons que les cellules NK de patients atteints de granulomatose septique chronique liée à l’X présentent un défaut de cette nouvelle cytotoxicité. Nous démontrons l’expression par les NK des composants clefs d’une NADPH oxydase distincte du complexe utilisé par les phagocytes. Nos travaux établissent l’existence d’une voie de cytotoxicité non conventionnelle et en définissent les principaux prérequis moléculaires
Natural Killer (NK) cells are innate lymphoid cells with anti-infectious and anti-tumoral activities. Among neoplasia, pre-B acute lymphoblastic leukemias (pre-B ALL) represent the most common form of cancer in childhood and were shown to be resistant to NK cell mediated cytotoxicity although the mechanisms explaining this phenomenon are incompletely understood.In the present work, we investigated the relative immune resistance of pediatric pre-B ALL targets to activated NK cells. We developed a flow cytometry based cytotoxicity assay to assess the NK activity and the involvement of long term cytotoxic pathways. Although pre-B ALL blasts were strongly resistant at 4h, we found a considerable delayed NK killing at 25h.Further investigations revealed that cell contact was mandatory for efficient killing but also that neither the granule exocytosis nor the death receptor pathway were involved. Target cell death was caspase independent but mitochondria signaling amplified it. We then showed that NK cells from patients with X-linked chronic granulomatous disease could not kill efficiently ALL blasts and that NK cells expressed key components of a NADPH oxidase complex that was distinct from the phagocyte type. Our work reveals an uncharacterized effector pathway among cytotoxic lymphocytes and establishes key molecular requirements for this unconventional pathway

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Balzano-Foucher, Marielle. "Influence du microenvironnement stromal de la moelle osseuse sur le développement des lymphocytes B normaux et pathologiques". Thesis, Aix-Marseille, 2016. http://www.theses.fr/2016AIXM4048.

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Chez l’adulte les premières étapes du développement hématopoïétique se déroulent dans la moelle osseuse (MO). La contribution de cellules d’origine mésenchymateuse, appelées niches stromales, a été démontrée dans le cas de la maintenance des cellules souches hématopoïétiques (CSH) et du développement des lymphocytes B (LB). Ainsi la maintenance des CSH dépend de niches périvasculaires sécrétant CXCL12 et SCF. Par ailleurs les LB les plus précoces (preproB) sont en contact de cellules stromales CXCL12+, puis migrent vers des cellules stromales exprimant l’interleukine-7 lors de leur différentiation en cellules proB. L’expression du préBCR, marque ensuite l’entrée dans le stade préB. À ce stade, les cellules sont au contact de cellules stromales galectine-1+.Malgré les progrès obtenus dans la compréhension du rôle des niches stromales, leur hétérogénéité et les mécanismes contrôlant la migration et l’adhésion des cellules hématopoïétiques en différenciation restent à mieux définir. Dans cet objectif, nous avons caractérisé phénotypiquement les cellules stromales de la MO mais aussi démontré l’existence d’une niche multi-spécifique, associée aux sinusoïdes et capable de soutenir les CSH et les LB.La contribution des niches dans le développement et la résistance aux traitements des Leucémies Aigues Lymphoblastiques de type B (LAL-B), équivalents pathologiques des LB en développement, a aussi été démontrée. Au cours de mon travail de thèse nous avons révélé l'influence d'un facteur exprimé par des cellules stromales de la MO sur la prolifération des LAL-B. À terme, ces travaux permettront de développer des traitements ciblant les fonctions protectrices des niches tumorales
In adults, the early stages of hematopoietic development take place in the bone marrow (BM). The contribution of specialized cells of mesenchymal origin, called stromal niches, has been demonstrated in the case of hematopoietic stem cell (HSC) maintenance and B lymphocyte development. Indeed, the maintenance of HSC depends on perivascular niches secreting CXCL12 and SCF. Furthermore progenitor B cells (preproB) are in contact with CXCL12+ stromal cells and migrate towards interleukin 7 expressing stromal cells during their differentiation into proB cells. PreBCR expression then marks the entrance into the preB cell stage. At this point, the cells are in contact with galectin-1+ stromal cells.Although progress have been made in understanding the role of stromal cell niches, their heterogeneity and the mechanisms controlling migration and adhesion of differentiating hematopoietic cells are controversial and remain to be defined. With this objective, we characterized phenotypically BM stromal cells but also demonstrated the existence of a multi-specific niche, associated to sinusoids and able to support both HSC and early B cells.The contribution of BM niches in the development and resistance to treatment of B cell Acute Lymphoblastic Leukemia (B-ALL), pathological equivalent of developing B cells has also been demonstrated. During my PhD, our work revealed the influence of a factor expressed by BM stromal cells on the proliferation of B-ALL. Ultimately, this work will allow the development of treatments targeting the protective functions of tumor niches

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Coyaud, Etienne. "Caractérisation des réarrangements de PAX5 dans les leucémies aiguës lymphoblastiques B". Toulouse 3, 2011. http://thesesups.ups-tlse.fr/1411/.

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PAX5 est un facteur de transcription essentiel dans le développement lymphocytaire B. Il est altéré dans près de 40% des leucémies aiguës lymphoblastiques de type B (LAL-B). Nous avons caractérisé des anomalies cytogénétiques l'impliquant dans les LAL-B. Sa délétion est associée à BCR-ABL1 ou E2A-PBX1, ce qui suggère que cette altération est secondaire dans la leucémogenèse. En présence d'une cassure interne de PAX5, les caryotypes sont simples. Ceci souligne le caractère initiateur de ces d'altérations. Nous avons identifié NCoR1, DACH2, GOLGA6 et TAOK1 comme nouveaux partenaires de fusion de PAX5. Ces fusions n'ont pas de caractéristiques communes exceptées la conservation du domaine de liaison à l'ADN de PAX5. Nous avons testé l'impact de ces mutants sur la différenciation B par un système murin inductible ex-vivo. Nos travaux présentent des modifications des propriétés de différenciation, de survie cellulaire et d'apoptose inhérentes à l'expression de divers mutants
PAX5 is an essential transcription factor of B-cell differentiation. It is altered in almost 40% of B-cell acute lymphoblastic leukaemia (B-ALL). We have described its cytogenetic alterations in these diseases. Its allelic deletion is associated with BCR-ABL1 or E2A-PBX1. PAX5 deletion appears as a secondary event in B-ALL. We have shown that patients harbouring an intragenic PAX5 breakpoint display simple karyotypes. This result highlights that these events are initiating events in B-ALL. We have identified NcoR1, DACH2, GOLGA6 and TAOK1 as new PAX5 fusion partners. We have not identified common function or structure between all these partners, excepted that all the fusion genes conserve the DNA binding domain of PAX5. To evaluate the involvement of several mutants in leukemogenesis, we have tested their effect using a murine ex-vivo inducible B-cell differentiation system. Our work shows that these mutants are able to modify parameters such as differentiation, apoptosis and proliferation

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Catherinet, Claire. "Etude des effecteurs de la voie Ca2+/Calmoduline dans les leucémies aiguës lymphoblastiques T". Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCC293/document.

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Les leucémies aigües lymphobastiques (LAL) représentent un tiers des leucémies et constituent le cancer pédiatrique le plus fréquent chez l’enfant. Les LAL de type T (LAL-T)sont caractérisées par l’expansion anormale de progéniteurs de lymphocytes T. Aujourd’hui,la réponse curative aux traitements est proche de 80% chez l’enfant et 50% chez l’adulte. La rechute reste donc fréquente et souvent de mauvais pronostic. Pour ces raisons,l’identification de nouvelles voies de signalisation en vue de développer de nouvelles stratégies thérapeutiques est cruciale afin d’améliorer le traitement des LAL-T.Les résultats précédents du laboratoire ont révélé l’activation soutenue de la voie calcineurine (Cn)/NFAT dans des échantillons humains de lymphomes et de LAL, ainsi que dans des modèles murins de ces pathologies. Le laboratoire a ensuite montré que Cn est intrinsèquement requise pour la capacité des cellules leucémiques de LAL-T à propager la maladie (activité LIC « Leukemia Initiating Cells ») dans un modèle murin de LAL-T induit parun allèle activé de NOTCH1 (ICN1). Puisque l’inhibition pharmacologique de Cn induit de nombreux effets secondaires, la recherche de cibles thérapeutiques en aval de Cn constitue un axe de recherche important. J’ai participé à une étude du laboratoire montrant que l’expression à la surface cellulaire de CXCR4 est régulée par Cn et requise pour la migration des cellules de LAL-T, mais non suffisante pour rétablir le potentiel de ré-initiation suggérant que d’autres effecteurs doivent être impliqués dans cette activité.Les facteurs de transcription NFAT (NFAT1, NFAT2 et NFAT4) sont des effecteurs importants de Cn en réponse à la signalisation calcique lors du développement des thymocytes, mais également dans les lymphocytes T. L’essentiel de ce travail de thèse a utilisé des LAL-T induites par ICN1 dans lesquelles l’inactivation génique des trois facteurs NFAT par recombinaison homologue. Nous avons ainsi montré que (i) les facteurs NFAT sont requis en aval de Cn pour le potentiel LIC des LAL-T-ICN1 in vivo, (ii) leur inactivation altère la survie, la prolifération et la migration des cellules de LAL-T in vitro, (iii) NFAT1,NFAT2 et NFAT4 ont une fonction largement redondante dans les LAL-T. Nous avons également par une approche transcriptomique identifié deux gènes dont l’expression estsous contrôle des facteurs NFAT et impliqués dans la régulation de la survie et de la prolifération des LAL-T in vitro : CDKN1A et MAFB.Tout comme la voie Cn/NFAT, les CaMKs sont des protéines kinases activées en aval de la signalisation calcique dans les lymphocytes T. Nous avons montré par une approche pharmacologique que l’inhibition des CaMKs dans les LAL-T-ICN1 in vitro altère la survie etla prolifération des cellules leucémiques. L’inhibition spécifique par une approche d’ARN interférence de deux isoenzymes CaMKIIγ et CaMKIIδ suggèrent que ces protéines jouent dans le maintien des cellules leucémiques in vitro
T cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is an aggressive malignancy of T cell progenitors. Despite initial response to chemotherapy, relapses remain frequent in children and adults. Previous results identify sustained activation of Calcineurin (Cn)/NFAT signaling pathway in human T-ALL and murine T-ALL models. Importantly, they also demonstrated Cn is essential for T-ALL Leukemia Initiating Cells (LIC) activity in a murine model of T-ALL induced by an activated allele of NOTCH1 (ICN1). Since pharmacologic inhibition of Cn induces side effects, we aim to identify downstream effectors involved in T-ALL. NFAT (Nuclear Factor of Activated T cells) factors play crucial roles downstream Cn during development and activation of T cells. To address their role in T-ALL, we generated mouse ICN1-induced T-ALL in which NFAT genes can be inactivated either single or in combination following Cre-mediated gene deletion. We demonstrated that (i) NFAT factors are required downstream Cn for LIC activity in T-ALL in vivo (ii) ex vivo NFAT factors deletion alters survival, proliferation and migration of T-ALL (iii) NFAT1, 2 and 4 have a largely redundant function in T-ALL. Moreover, the NFAT-dependant transcriptome allowed to identify important targets (CDKN1A, MAFB) involved in T-ALL survival and proliferation in vitro. Calmodulin-dependant kinases (CaMK) are kinases activated by calcium signaling in T cells. We showed that pharmacologic inhibition of CaMKs in ICN1-induced T-ALL alters survival and proliferation of T-ALL in vitro. Beside, specific inhibition by RNA interference of CaMKIIg and CaMKIId suggests a putative role of these kinases in T-ALL maintenance

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Hornych, Joséphine. "Une technique d'amplification de la région CDR3 des gènes des chaînes lourdes des immunoglobulines appliquée à l'étude de la maladie résiduelle dans les leucémies aiguës lymphoblastiques, étude sur 10 cas". Bordeaux 2, 1995. http://www.theses.fr/1995BOR23080.

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Donadieu, Jean. "Evaluation des études pronostiques dans la leucémie aiguë lymphoblastique de l'enfant". Paris 11, 2001. http://www.theses.fr/2001PA11T009.

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Dans ce travail, nous nous sommes intéressés aux difficultés pragmatiques qui sont rencontrées dans les études pronostiques biomédicales. A travers l'exemple de la leucémie aiguë lymphoblastique de l'enfant, une maladie létale en l'absence de traitement, mais guérissable dans deux cas sur trois par un traitement adapté, nous nous sommes attachés à évaluer la qualité des études pronostiques. Après une étude exhaustive de la littérature concernant une famille de facteurs pronostiques évaluant la réponse précoce au traitement, nous avons constaté qu'aucune étude ne remplissait les critères de qualité minimaux de Simon et Altman. Nous avons identifié plusieurs difficultés récurrentes dans ces études. La reproductibilité des variables n'est jamais explorée de façon satisfaisante. Le choix des points de césure ne repose pas sur une méthodologie acceptable. Enfin l'apport d'information d’une nouvelle variable pronostique n'est pas évalué. Dans une deuxième partie de ce travail, à partir d'un échantillon de 1545 patients traités par les protocoles Fralle 83, Fralle 87 et Fralle 89, nous avons étudié la variation du risque pour les variables pronostiques continues dans la LAL de l'enfant et nous avons évalué l'apport d'information des variables pronostiques. Notre travail démontre que les variables les plus pertinentes utilisées aujourd'hui dans la leucémie aiguë lymphoblastique apportent peu d'information. L'ensemble de ces résultats encourage à avoir une approche plus rigoureuse concernant le développement des facteurs pronostiques. Un tel constat encourage très vivement à simplifier les classifications thérapeutiques, basées sur de telles études pronostiques, et à élargir les critères d'inclusion des essais thérapeutiques.

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Su, Xinying. "Etude structurelle des translocations t(5;14)(q35;q32) des leucémies aiguës lymphoblastiques de type T". Paris 7, 2005. http://www.theses.fr/2005PA077122.

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España, Alexandre. "Caractérisation des enhancers dérégulés dans la leucémie aiguë lymphoblastique de type T". Thesis, Aix-Marseille, 2019. http://www.theses.fr/2019AIXM0481.

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Un certain nombre d'anomalies génétiques dans la leucémie aiguë lymphoblastique de type T (LAL-T) touche généralement des facteurs de transcription ou des régulateurs épigénétiques et ont principalement pour effet de bloquer la différenciation des lymphocytes T, délimitant ainsi des sous-groupes de LAL-T avec des profils d'expression génétique spécifiques. La régulation de l’expression des gènes spécifiques d’un type cellulaire nécessite l’interaction de différents types d’éléments cis-régulateurs (promoteurs, amplificateurs/enhancers, isolateurs, inactivateurs. Etant donné le rôle bien reconnu de la dérégulation épigénétique dans la leucémogenèse, il est probable qu’une fraction importante des enhancers oncogéniques reste à découvrir et à évaluer sur le plan fonctionnel, et ce fût l'objet de mon travail de thèse. Nous avons identifié des enhancers potentiels dans des sous-populations de cellules du thymus sain et dans des cellules tumorales de patients atteints de LAL-T et ainsi déterminé 17406 enhancers potentiels dérégulés dans la LAL-T. Parmi eux se trouvent des enhancers proches d’une liste de gènes connus pour être altérés dans la LAL-T et des enhancers dont la présence est corrélée avec la surexpression d’oncogènes proches (NKX3-1, NKX3-2, TAL1, MYC, LMO2, ou JDP2). Nous avons également identifié un nouvel enhancer de TAL1 apparu à la suite d’une mutation somatique monoallélique incorporant un site MYB. Nous avons également mis en place deux stratégies de criblage haut-débit pour évaluer l’activité et la fonction des potentiels enhancers, et valider par une approche de CRISPR/Cas9 la pertinence oncogénique de l'enhancer de NKX3-2 et du gène HHEX
Several genetic abnormalities in T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) affect transcription factors or epigenetic regulators and mainly block the differentiation of T cells, thus delimiting subgroups of AL-T with specific genetic expression profiles. The regulation of the expression of cell-type-specific genes requires the interaction of different types of cis-regulatory elements (promoters, enhancers, isolators, inactivators. Given the well-recognized role of epigenetic deregulation in leukemogenesis, it is likely that a significant fraction of oncogenic enhancers remains to be discovered and functionally evaluated, and this was the subject of my thesis work. We identified potential enhancers in subpopulations of healthy thymus cells and tumor cells of LAL-T patients and thus determined 17,406 potential enhancers deregulated in T-ALL. Enhancers close to a list of genes known to be altered in LAL-T and enhancers whose presence is correlated with the overexpression of close oncogenes (NKX3-1, NKX3-2, TAL1, MYC, LMO2, or JDP2) are among them. We have also identified a new enhancer of TAL1 that appeared following a monoallelic somatic mutation incorporating a MYB site. Additionally, two high-throughput screening strategies (CapSTARR-seq and CRISPRi) have been implemented to evaluate the activity and function of potential enhancers, as well as validate the oncogenic relevance of the NKX3-2 enhancer and the HHEX gene through a CRISPR/Cas9 approach

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Aspirot-Buron, Virginie y Virginie Aspirot-Buron. "Évaluation des capacités cardiorespiratoires et physiques d'enfants en traitement de chimiothérapie pour une leucémie lymphoblastique aiguë". Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/37636.

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Resumen

La leucémie est un cancer qui touche les cellules souches du sang. Il existe plusieurs types de leucémies, toutefois nous nous sommes intéressés à la leucémie lymphoblastique aiguë (LLA) pédiatrique. L’anomalie se trouve au niveau des cellules souches lymphoïdes, et se développe de manière soudaine, en quelques jours ou quelques semaines. De nombreuses conséquences néfastes sont connues au niveau cardiorespiratoire, musculaire, de l'énergie et de l’activité physique d’enfants en fin de chimiothérapie. L’objectif premier de l’étude était de mesurer les capacités cardiorespiratoires et musculaires réelles d’enfants atteints d’une LLA à trois temps de la chimiothérapie : l’induction (T1), la consolidation 2 (T2) et l’entretien (T3). Un deuxième objectif était de tester la faisabilité d’une épreuve d’effort maximal cardiorespiratoire pendant ou après l’induction. Le protocole de l’étude comprenait une épreuve d’effort physique sur ergocycle pour évaluer la consommation maximale d’oxygène (V ̇ O2max) un questionnaire sur la qualité de vie et un sur l’activité physique. La force musculaire était évaluée par un audit des dossiers (N=16) de physiothérapie d’anciens patients et des participants à l’étude. Une patiente a complété le test V ̇ O2max aux T1 et T2, et s’est améliorée de 54,5% entre les deux tests, mais restait nettement sous les valeurs normales. Pour l’ensemble des données de force musculaire : force de préhension, moment de force des extenseurs du genou et des fléchisseurs dorsaux de la cheville, les valeurs étaient inférieures à celles d’enfants sains, et avaient diminuées entre l’induction et la consolidation 2. Les résultats de ce mémoire démontrent que certains enfants atteints d’une LLA présentent un déconditionnement cardiorespiratoire et musculaire dès l’induction. Elles démontrent également la faisabilité d’un exercice cardiorespiratoire soutenu après la phase d’induction. Ces données importantes serviront aux professionnels de la santé dans la mise en place d’interventions en activité physique adaptée aux capacités d’enfants atteints d’une LLA.
La leucémie est un cancer qui touche les cellules souches du sang. Il existe plusieurs types de leucémies, toutefois nous nous sommes intéressés à la leucémie lymphoblastique aiguë (LLA) pédiatrique. L’anomalie se trouve au niveau des cellules souches lymphoïdes, et se développe de manière soudaine, en quelques jours ou quelques semaines. De nombreuses conséquences néfastes sont connues au niveau cardiorespiratoire, musculaire, de l'énergie et de l’activité physique d’enfants en fin de chimiothérapie. L’objectif premier de l’étude était de mesurer les capacités cardiorespiratoires et musculaires réelles d’enfants atteints d’une LLA à trois temps de la chimiothérapie : l’induction (T1), la consolidation 2 (T2) et l’entretien (T3). Un deuxième objectif était de tester la faisabilité d’une épreuve d’effort maximal cardiorespiratoire pendant ou après l’induction. Le protocole de l’étude comprenait une épreuve d’effort physique sur ergocycle pour évaluer la consommation maximale d’oxygène (V ̇ O2max) un questionnaire sur la qualité de vie et un sur l’activité physique. La force musculaire était évaluée par un audit des dossiers (N=16) de physiothérapie d’anciens patients et des participants à l’étude. Une patiente a complété le test V ̇ O2max aux T1 et T2, et s’est améliorée de 54,5% entre les deux tests, mais restait nettement sous les valeurs normales. Pour l’ensemble des données de force musculaire : force de préhension, moment de force des extenseurs du genou et des fléchisseurs dorsaux de la cheville, les valeurs étaient inférieures à celles d’enfants sains, et avaient diminuées entre l’induction et la consolidation 2. Les résultats de ce mémoire démontrent que certains enfants atteints d’une LLA présentent un déconditionnement cardiorespiratoire et musculaire dès l’induction. Elles démontrent également la faisabilité d’un exercice cardiorespiratoire soutenu après la phase d’induction. Ces données importantes serviront aux professionnels de la santé dans la mise en place d’interventions en activité physique adaptée aux capacités d’enfants atteints d’une LLA.
Leukemia is a blood cancer and can be expressed in many forms, but the main focus of this thesis will be on acute lymphoblastic leukemia (ALL) in the pediatric population. The anomaly develops in the lymphoid stem cells and the disease develops rapidly, within a few days to a few weeks. Leukemia and chemotherapy have been shown to have many deleterious on the children cardiorespiratory and muscular status, energy level and engagement in physical activity mainly reported for children in the last phase of chemotherapy. The first aim of our work was to collect data on their cardiorespiratory and muscular status during three phases of the chemotherapy: induction (T1), consolidation 2 (T2) and maintenance (T3). The second aim was to test the feasibility of maximal oxygen consumption test ((V ̇ O2max) during or post induction. The protocol comprised a (V ̇ O2max) test on ergocycle, a quality of life and physical activity questionnaires. Data on muscular strength was collected through auditing the physical therapy files (n=16) of past and current patients. One participant completed the T1 and T2 (V ̇ O2max) testing and showed a 54.5% increase from T1 to T2. Despite this improvement, her score at T2 was still poor compared to her expected value. Data collected on muscular strength were: grip strength, moments of force of the knee extensors and the ankle dorsiflexors. They all showed lower values than expected compared to normative value at T1 and a decline from T1 to T2. The results outlined in this thesis show that children with ALL may present with decreased cardiorespiratory and muscular fitness with an onset as early as induction chemotherapy. Nonetheless, the results showed that high intensity cardiorespiratory exercise was feasible post induction. The data are of importance as they will help health care professionals build physical activity interventions adapted to the physical capacities of children with ALL.
Leukemia is a blood cancer and can be expressed in many forms, but the main focus of this thesis will be on acute lymphoblastic leukemia (ALL) in the pediatric population. The anomaly develops in the lymphoid stem cells and the disease develops rapidly, within a few days to a few weeks. Leukemia and chemotherapy have been shown to have many deleterious on the children cardiorespiratory and muscular status, energy level and engagement in physical activity mainly reported for children in the last phase of chemotherapy. The first aim of our work was to collect data on their cardiorespiratory and muscular status during three phases of the chemotherapy: induction (T1), consolidation 2 (T2) and maintenance (T3). The second aim was to test the feasibility of maximal oxygen consumption test ((V ̇ O2max) during or post induction. The protocol comprised a (V ̇ O2max) test on ergocycle, a quality of life and physical activity questionnaires. Data on muscular strength was collected through auditing the physical therapy files (n=16) of past and current patients. One participant completed the T1 and T2 (V ̇ O2max) testing and showed a 54.5% increase from T1 to T2. Despite this improvement, her score at T2 was still poor compared to her expected value. Data collected on muscular strength were: grip strength, moments of force of the knee extensors and the ankle dorsiflexors. They all showed lower values than expected compared to normative value at T1 and a decline from T1 to T2. The results outlined in this thesis show that children with ALL may present with decreased cardiorespiratory and muscular fitness with an onset as early as induction chemotherapy. Nonetheless, the results showed that high intensity cardiorespiratory exercise was feasible post induction. The data are of importance as they will help health care professionals build physical activity interventions adapted to the physical capacities of children with ALL.

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Charrad, Rachida-Sihem. "Différenciation des blastes de patients atteints de leucémie aiguë myéloblastique par la molécule d'adhérence CD44". Paris 11, 2001. http://www.theses.fr/2001PA11T010.

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Resumen

Les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) se manifestent par un blocage de la différenciation granulocytaire et macrophagique, le stade de blocage et la lignée atteinte définissant les types LAM1 à LAMS. La thérapie différenciatrice, qui consiste à redonner aux blastes leucémiques une différenciation normale, est la thérapie la plus efficace, mais la seule molécule différenciatrice connue, l'acide rétinoïque, n'est active que dans les LAM3, type rare de LAM. L'antigène de surface CD44, qui est exprimé sur les blastes de tous les types de LAM, joue un rôle dans la différenciation myéloïde normale. Nous avons montré que la ligation de cet antigène soit par son ligand naturel, l'acide hyaluronique, soit par des anticorps monoclonaux (AcM) anti-CD44 de type activateur (A3D8, H90), permet de lever le blocage de différenciation de tous les types de LAM (LAMl/2 à LAMS). La différenciation terminale des blastes leucémiques est démontrée par l'acquisition de caractéristiques spécifiques des cellules granulocytaires et macrophagiques différenciées: capacité d'effectuer une réaction d'oxydo-réduction (test NBT), expression d'antigènes de différenciation, modifications cytologiques. Ces résultats ouvrent de nouvelles perspectives pour le développement d'une thérapie différenciatrice CD44-ciblée pour tous les types de LAM (LAMl/2 à LAM5). Afin d'étudier les mécanismes impliqués dans la différenciation induite par le CD44, nous avons défini des modèles expérimentaux in vitro, car les blastes provenant des patients ne survivent que quelques jours ex vivo. Nous avons démontré que les lignées de cellules leucémiques humaines THP-1 (phénotype monoblastique), NB4 (phénotype promyélocytaire) et HL60 (phénotype myéloblastique) sont des modèles intéressants des LAMS et des LAM3, car la ligation du CD44 par H90 ou A3D8 induit leur différenciation terminale. D'autre part, nous avons observé que l'AcM A3D8 induit une apoptose massive des cellules NB4 suggérant que cet AcM pourrait être particulièrement efficace in vivo. De plus, nous avons étudié l'effet l'effet de la ligation du CD44 sur la prolifération et la différenciation des cellules leucémiques KG1a. En effet, ces cellules sont bloquées à un stade très immature de la différenciation et leur immunophénotype est semblable à celui des cellules souches leucémiques. Elles peuvent donc être un modèle d'une part pour les blastes LAMO, d'autre part pour les cellules souches leucémiques. Nous avons trouvé que la ligation du CD44 inhibe fortement la prolifération des cellules KG1a et, en combinaison avec l'acide rétinoïque, induit leur différenciation dans la voie monocytaire. Ces résultats indiquent qu'il pourrait être possible, via le CD44, d'inhiber la prolifération des cellules souches leucémiques et représentent une base expérimentale pour le développement d'une thérapie différenciatrice des LAMO, associant ligation du CD44 et acide rétinoïque. . Enfin nous avons recherché l'effet de la ligation du CD44 sur l'apoptose des cellules leucémiques induite par des drogues cytotoxiques, en particulier la daunorubicine (DNR), dont la voie de signalisation apoptotique est bien élucidée. En utilisant les cellules HL60 et NB4, nous avons montré que, sur un temps d'observation de 40heures, l'apoptose induite par les drogues cytotoxiques est fort ment inhibée par la ligation du CD44, lorsque cette ligation est effectuée avant l'administration de la drogue. Dans le cas des cellules HL60 traitées par la daunorubicine, la ligation du CD44 bloque la voie de signalisation apoptotique au niveau de la production de céramide. Ces résultats suggèrent que l'utilisation thérapeutique de la ligation du CD44 ne doit pas être effectuée avant l'administration de la drogue cytotoxique. L'utilisation de ces résultats pour le développement d'une thérapie différenciatrice des types LAM1 à LAMS est discutée.

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Vallée, Audrey. "Études transcriptionnelle et fonctionnelle du gène CD9 dans les leucémies aigües lymphoblastiques de la lignée cellulaire B chez les enfants à remaniement TEL/AML1". Rennes 1, 2011. http://www.theses.fr/2011REN1S047.

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Resumen

La translocation t(12 ;21)(p13 ;q22) entre les gènes TEL et AML1 est la plus retrouvée dans les leucémies aigues lymphoblastiques de la lignée B (LAL-B) de l’enfant. Les bases moléculaires de la leucémogenèse et les rechutes tardives (5%) restent cependant peu documentées. Dans une analyse transcriptomique des LAL-B TEL/AML1, nous avons identifié 14 gènes associés à 5 voies biologiques. Le gène CD9 a été identifié dans la voie de la mobilité cellulaire. Bien que déjà associé à la progression tumorale dans de nombreux cancers solides, ses fonctions dans les hémopathies malignes restent peu connues. Nous nous sommes donc intéressés à sa régulation transcriptionnelle et à ses fonctions dans les LAL-B TEL/AML1. Les résultats de l’étude transcriptionnelle suggèrent qu’un miARN pourrait être responsable de la sous-expression de CD9 chez les patients TEL/AML1. Ces résultats sont actuellement en cours de validation. Dans notre étude fonctionnelle, nous montrons, en utilisant des blastes de patients et des lignées cellulaires, que CD9 module négativement les propriétés d’adhésion. Nous montrons aussi que CD9 est un acteur majeur de la migration induite par CXCL12 et pour la première fois par imagerie confocale que CD9, CXCR4 et l’actine sont étroitement liés à la membrane pour la formation d’extensions d’actine en réponse au CXCL12. Nous concluons que CD9 est un acteur important de la mobilité cellulaire en favorisant les réarrangements d’actine en réponse au CXCL12 sur les cellules de LAL-B et en particulier sur les blastes TEL/AML1. Ces résultats nous amènent ainsi à postuler que CD9 pourrait jouer un rôle majeur dans les rechutes tardives des patients à LAL-B TEL/AML1
The translocation (12;21) resulting in a TEL/AML1 fusion transcript is the most common chromosomal rearrangement occurring in childhood B-lineage acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). However the molecular basis underlying leukemogenesis and late relapse remain poorly understood. In a transcriptomic profiling study characterizing TEL/AML1-positive B-ALL, we previously identified 14 genes linked related to five biological processes. CD9, which belongs to the mobility pathway, was one of the genes identified. While it is an important marker of cancer progression in solid tumours, the role of CD9 has never been investigated in B-ALL. First, our analysis of CD9 transcriptional regulation suggests that in TEL/AML1 positive patients, the downregulation of CD9 could be due to a miRNA regulation. This result has to be confirmed by a functional analysis of the identified miARN. We then performed a functional analysis of the CD9 protein and our data show, using blasts derived from B-ALL patients and cell lines, that CD9 has a negative impact on cell adhesion and that it plays a major role in the CXCL12 induced migration pathway. We also show for the first time using confocal imaging, that there is a close relationship between CD9, actin and CXCR4 in the formation of long actin extensions induced by the CXCL12 signal. We conclude that CD9 may be an important player in the actin rearrangement in response to CXCL12 for ALL cells. These results raise the possibility that CD9 confers particular motility properties to blasts of ALL, which has important implications for the clinical outcome of TEL/AML1-positive patients

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Nugues, Anne-Lucie. "Altération du ripoptosome dans la leucémie aiguë myéloïde". Phd thesis, Université du Droit et de la Santé - Lille II, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01018661.

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Resumen

Les protéines receptor-interacting protein kinase 1 (RIP1) et RIP3 ont été identifiées comme intervenant dans la régulation de la mort cellulaire apoptotique ou nécroptotique mais également dans la survie cellulaire. Ces deux protéines possèdent un domaine sérine/thréonine kinase, un domaine d'interaction spécifique RHIM (RIP homotypic interacting motif) et diffèrent dans leur domaine C-terminal car seule RIP1 possède un domaine de mort. Ces protéines font partie d'un ensemble de protéines régulatrices nommé ripoptosome. Des études ont montré une altération du ripoptosome dans les leucémies lymphoïdes chroniques (LLC) et les leucémies aigües lymphoïdes (LAL). Nous nous sommes intéressés aux leucémies aigües myéloïdes (LAM). L'analyse de l'expression des protéines RIP1 et RIP3 a été réalisée dans des blastes triées CD34+ de patients atteints de LAM ou dans des cellules CD34+ de donneurs sains en Q-RT-PCR. Les premières analyses montrent que RIP3 est significativement sous-exprimée chez les patients atteints de LAM en comparaison avec les cellules CD34+ issues de donneurs sains. Aucune différence n'a été mise en évidence pour l'expression de RIP1 dans les deux types de cellules CD34+. Afin de comprendre l'implication de l'extinction de RIP3 dans les LAM, nous avons étudié sa réexpression dans une lignée cellulaire leucémique murine (DA1-3b) où RIP3 n'est pas exprimée par métylation de son promoteur, au moyen d'un système d'expression conditionnelle (LacSwith II, IPTG). Après 10h d'induction de l'expression, on constate que la protéine RIP3 sauvage (RIP3-WT) induit une apoptose dans les cellules DA1-3b. Afin de déterminer l'implication des domaines de RIP3, nous avons utilisé une protéine mutante kinase Dead (RIP3-KD, activité kinase abolie) et une protéine mutante dans la séquence d'interaction spécifique avec RIP1 (RIP3-RHIM). L'analyse de la mortalité cellulaire en cytométrie en flux et en microscopie électronique montre que les protéines RIP3-WT et -KD induisent toutes les deux la mort apoptotique des cellules DA1-3b respectivement de 15% et de 50% après 10h d'expression. On constate donc que la protéine RIP3-KD induit une mort plus importante et plus précoce que la protéine sauvage. La protéine RIP3 mutée dans son domaine RHIM ne peut plus induire de mort cellulaire. Il semble donc que le domaine kinase de RIP3 jouerait un rôle régulateur dans la mort cellulaire induite par RIP3. L'utilisation du modèle de leucémie murine DA1-3b a permis de réaliser un étude in vivo de l'expression conditionnelle de RIP3-WT et -KD. Seule l'expression de RIP3-KD est capable de prolonger significativement la survie des souris.De plus, il a été démontré que RIP3 pouvait également induire la nécroptose dans les cellules lorsque l'apoptose ne peut aboutir, notament lorsque les caspases sont inhibées à l'aide d'un inhibiteur de pan-caspases le Z-VAD-FMK. Le traitement des cellules exprimant RIP3-WT par 50µM de Z-VAD-FMK induit une plus forte mortalité (45%) des cellules tandis que dans les cellules exprimant RIP3-KD, l'inhibiteur des caspases inhibe complètement le processus apoptotique et permet la survie des cellules (10%). Une étude en microscopie électronique a permis de déterminer que la présence de Z-VAD-FMK induit un switch de l'apoptose vers la nécroptose. Il semble donc que le domaine de kinase possède un rôle important dans la signalisation de la nécroptose car la protéine RIP3-KD n'est plus capable d'initier le switch entre l'apoptose et la nécroptose. Quelques données préliminaires semblent indiquer que les calpaïnes ainsi que la caspase 12 pourraient également être impliquées dans la balance apoptose/nécroptose. [...]

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Naci, Dalila. "Implication de l'intégrine alpha2beta1 liant le collagène dans la survie et la chimiorésistance des leucémies aiguës". Doctoral thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25458.

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Resumen

Le rôle de la matrice extracellulaire (MEC) du microenvironnement médullaire dans la chimiorésistance des leucémies lymphoblastiques aiguës de type T (T-ALL) n’est pas encore établi. Nos travaux ont permis de démontrer que le collagène, mais pas la fibronectine, induit la résistance des cellules T-ALL contre l’apoptose induite par la chimiothérapie. L’effet anti-apoptotique du collagène est induit par l’intégrine α2β1. L’activation par le collagène de la voie MAPK/ERK mais pas PI3K/AKT est requise pour l’inhibition de l’apoptose mitochondriale induite par la doxorubicine et ceci grâce au maintien de la stabilité de la protéine anti-apoptotique Mcl-1 et à l’augmentation de l’expression du transporteur d’efflux des drogues ABCC1 (MRP-1). Le maintien de Mcl-1 par le collagène est dû à l’inhibition de la voie pro-apoptotique Rac1/ JNK induite par la doxorubicine. L’activation de la voie α2β1/ERK/Mcl-1 permet également la survie des cellules T-ALL en absence de facteurs de croissance. En conclusion, nos données suggèrent que l’intégrine α2β1 serait une voie importante dans l’induction de la chimiorésistance et la progression des leucémies T-ALL.
The role of the extracellular matrix (ECM) of the tumor microenvironment in the chemoresistance of T cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is not yet established. Through our results, we demonstrate that collagen, but not fibronectin, induces the resistance of T-ALL cells against apoptosis induced by chemotherapy. The anti-apoptotic effect of collagen is mediated by α2β1 integrin and is dependent on the activation of the MAPK/ERK pro-survival pathway but not of the PI3K/AKT pathway. Collagen induced MAPK/ERK pathway is required for the inhibition of the mitochondrial apoptosis induced by doxorubicin through the maintenance of the stability of the anti-apoptotic protein Mcl-1 and the up-regulation of doxorubicin efflux by the drug transporter ABCC1. Mcl-1 stabilization by collagen is du to the inhibition of Rac1/JNK pro-apoptotic pathway induced by doxorubicin. In addition to its role in chemoresistance, α2β1 integrin ligation allows the survival of T-ALL cells in the absence of growth factors via ERK/Mcl-1 pathway. In conclusion, our data indicate that α2β1 integrin may constitute an important pathway favoring T-ALL leukemia chemoresistance and progression.

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Asnafi, Vahid. "Lal-t : modèle d'étude de l'ontogénie et de l'oncogenèse lymphoïdes T chez l'homme". Paris 7, 2003. http://www.theses.fr/2003PA077195.

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Flandrin-Gresta, Pascale. "La protéine HSP90 : expression et ciblage dans les hémopathies malignes". Thesis, Lyon 1, 2012. http://www.theses.fr/2012LYO10226.

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Resumen

Les protéines de choc thermiques (HSP) sont des chaperons moléculaires qui stabilisent le pliage et la conformation de protéines normales et oncogéniques, prévenant la formation d'agrégats protéiques. Elles sont impliquées dans la régulation de l'apoptose, de la survie cellulaire et dans la cancérogénèse. HSP90 est la protéine chaperone majeure de stabilisation d'oncogènes impliqués dans les hémopathies malignes. L'objectif de notre travail était de déterminer l'implication de HSP90 dans différents types d'hémopathies malignes, les Leucémies Aiguës Myéloïdes (LAM), les Syndromes Myélodysplasiques (SMD) et les Leucémies Aiguës Lymphoblastiques (LAL), et de tester son inhibition par un inhibiteur spécifique, la tanespimycine (17- AAG). Dans les LAM, nous avons évalué l'implication des différentes isoformes de la protéine dans la résistance aux chimiothérapies et aux inhibiteurs de HSP90. Ce travail met en évidence la valeur péjorative de l'expression de HSP90 dans les différents sous types d'hémopathies, corrélant avec un risque de rechute élevé ou d'évolution vers des formes plus agressives. L'utilisation de la tanespimycine a permis de déclencher l'apoptose dans les cellules immatures impliquées dans ces pathologies. HSP90 constitue donc une protéine majeure de la cellule leucémique, et son ciblage offre des perspectives intéressantes dans le traitement des hémopathies malignes
Heat shock proteins (HSP) are molecular chaperones that stabilize the folding and conformation of normal and oncogenic proteins, preventing the formation of protein aggregates. They are involved in the regulation of apoptosis, cell survival and carcinogenesis. HSP90 is the major chaperone implicated in stabilization of oncogenes involved in hematologic malignancies. The aim of our study was to determine the involvement of HSP90 in various types of malignancies, Acute Myeloid Leukemia (AML), Myelodysplastic Syndromes (MDS) and Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) and to test its inhibition by a specific inhibitor, the tanespimycine (17-AAG). In acute myeloid leukemia, we evaluated the involvement of different isoforms of the protein in resistance to chemotherapy and inhibitors of HSP90. This work highlights the pejorative value of HSP90 expression in different subtypes of malignancies, correlated with a high risk of relapse or progression to more aggressive forms. Use of tanespimycine has triggered apoptosis in immature cells involved in these diseases. HSP90 is therefore a major protein of the leukemic cell and its targeting offers interesting perspectives in the treatment of hematologic malignancies

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Carlier, Marie-Christine. "Étude du suivi sérologique des virus des hépatites A et B chez les enfants leucémiques traités par les protocoles EORTC n°58831 et n°58832". Lyon 1, 1988. http://www.theses.fr/1988LYO1T051.

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Pandrau, Dominique. "Étude de la prolifération et de la différenciation in vitro des précurseurs leucémiques lymphoïdes B de l'enfant". Lyon 1, 1993. http://www.theses.fr/1993LYO1T056.

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Touzart, Aurore. "Leucémies aigüs lymphoblastiques T (LAL-T) et dérégulation épigénétique Site- and allele-specific polycomb dysregulation in T-cell leukaemia Epigenetic silencing affects L-asparaginase sensitivity and predicts outcome in T-ALL Low level CpG island promoter methylation predicts a poor outcome in adult T-ALL". Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2018. http://www.theses.fr/2018USPCB221.

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Resumen

Les LAL-T sont des proliférations malignes de précurseurs lymphoïdes T bloqués à un stade précis de leur maturation. Si les anomalies génétiques impliquées dans la leucémogenèse T sont de mieux en mieux connues, les modifications de la régulation épigénétique sont beaucoup moins étudiées. Mon travail de thèse a consisté à étudier la dérégulation épigénétique intervenant dans les LAL-T au travers de 3 projets principaux. Dans le premier travail, nous avons identifié un mécanisme original de dérégulation de l’oncogène TAL1 consistant en la création d’un « neo-enhancer » oncogénique. TAL1 est l’un des oncogènes les plus fréquemment dérégulés dans les LAL-T. Cette dérégulation résulte principalement de translocations avec le locus du TCR ou des micro-délétions interstitielles SIL-TAL1, anomalies chromosomiques altérant des éléments de cis-régulation engendrant une expression ectopique monoallélique de TAL1. Mais dans une proportion importante de cas (environ 50%) de LAL-T TAL1+, une expression aberrante de TAL1 est observée sans que le mécanisme en cause ne soit identifié suggérant l’existence de mécanismes génétiques ou épigénétiques non connus. Nous avons découvert une nouvelle anomalie somatique consistant en une micro-insertion focale et récurrente 7 kpb en amont de TAL1, dans une région intergénique non-codante, responsable de la création d’un « neo-enhancer » oncogénique accompagné d’une modification des marques épigénétiques d’histones i.e. une substitution des marques répressives H3H27me3 par des marques activatrices H3K27ac. Ces micro-insertions sont un événement récurrent dans les LAL-T et ont été retrouvées dans 20% des LAL-T TAL1+ inexpliquées. Au travers du deuxième projet, j’ai tenté de mieux comprendre les bases biologiques à l’origine de différences de réponse au traitement. En effet, considérant deux groupes oncogéniques proches, le pronostic des patients TLX1+, déjà plutôt favorable dans le protocole LALA-94, n’a pas été significativement amélioré dans le protocole thérapeutique intensifié d’inspiration pédiatrique GRAALL 2003-2005 alors que les patients TLX3+ semblent avoir particulièrement bénéficié de ce dernier; les deux protocoles différant majoritairement par les doses de L-asparaginase. Nous avons montré que les patients TLX1+ exprimaient moins d’ASNS (Asparagine synthétase) que les patients TLX3+ et TLX- et que cette moindre expression résultait d’une inhibition épigénétique d’ASNS, à la fois par méthylation du promoteur et diminution des marques histones activatrices. Un niveau de méthylation d’ASNS bas est par ailleurs associé à une moindre sensibilité in vitro à la L-asparaginase. Enfin, la méthylation d’ASNS est un facteur pronostic indépendant pour les patients inclus dans le protocole GRAALL 2003-2005 suggérant que le statut de la méthylation d’ASNS au diagnostic pourrait intervenir dans l’adaptation des doses de L-asparaginase. Dans le troisième projet, je me suis intéressée à la méthylation globale de l’ADN. L’étude de la méthylation par MeDIP-array d’une série de 24 LAL-T nous a permis d’identifier des signatures de méthylation différentielle et de définir un panel minimum de 9 promoteurs de gènes dont l’étude de la méthylation par MS-MLPA a permis de déterminer un ratio de méthylation pour une large série de LAL-T adultes du GRAALL 2003-2005. Le statut de méthylation semble dicté par l’oncogène dérégulé avec en particulier les LAL-T TLX1+ ou TLX3+ associées à une signature d’hyperméthylation et les LAL-T SIL-TAL1+ à une signature d’hypométhylation. Ce statut de méthylation est par ailleurs un facteur pronostique indépendant. Ainsi, les patients hypométhylés ont un pronostic significativement plus défavorable que les patients hyperméthylés. Ensemble, ces résultats illustrent comment des perturbations de la régulation épigénétique peuvent intervenir à la fois dans l’oncogénèse des LAL-T mais aussi dans la réponse au traitement
T-ALLs are rare lymphoid neoplasms characterized by the proliferation of immature T precursors arrested at specific stages of maturation. While the genetic abnormalities involved in T-ALL leukemogenesis are becoming better known, alterations in epigenetic regulation, a very important component of the cellular homeostasis, are much less studied. My work was to tsudy the epigenetic deregulation in T-ALL through 3 main projects. In the first project, we identified an original mechanism of TAL1 oncogene deregulation. TAL1 is one of the most frequently deregulated oncogenes in T-ALL. This deregulation results mainly from translocations with the TCRδ locus or micro-deletions SIL-TAL1, two chromosomal abnormalities altering cis-regulatory elements leading to monoallelic TAL1 expression. But in a significant proportion of cases (about 50%) of TAL1+ T-ALL, an aberrant expression of TAL1 is observed without recognized mechanism suggesting unknown genetic or epigenetic mechanisms. We discovered a new somatic alteration consisting of a focal and recurrent microinsertion 7 kbp upstream of TAL1, in a non-coding intergenic region, responsible for the creation of an oncogenic "neo-enhancer" accompanied by a modification of epigenetic histone marks i.e. a “switch” from H3H27me3 repressive marks to H3K27ac activating marks. These microinsertions are a recurrent event in T-ALL and have been found in 20% of “unresolved” TAL1+ T-ALL. Through the second project, I tried to better understand the biological bases for discrepancies in patients related response to treatment. Indeed, considering two close oncogenic groups, the prognosis of TLX1+ patients, already rather favourable in the LALA-94 protocol, has not been significantly improved in the paediatric-inspired GRAALL2003-2005 trial , whereas TLX3+ patients seem to have benefited particularly from the latter; the two protocols differing mainly by L-asparaginase doses. We showed that TLX1+ patients expressed less ASNS (Asparagine synthetase) than TLX3+ and TLX- patients and that this lower expression resulted from ASNS epigenetic silencing, both by methylation of the promoter and reduction of active histone marks. A low level of ASNS methylation is also associated with lower in vitro sensitivity to L-asparaginase. Finally, ASNS methylation is an independent prognostic factor for patients included in the 2003-2005 GRAALL trial suggesting that the ASNS methylation status may be relevant for the adaptation of L-asparaginase doses. In the third project, I was interested in the global DNA methylation. MeDIP-array methylation data of a series of 24 T-ALLs allowed us to identify differential methylation signatures. We then studied the methylation status in a large series of adult T-ALL by MS-MLPA using a predictor containing 9 gene promoters. We observed that main driver oncogenes dictated methylation status. TLX1+ and TLX3+ T-ALLs displayed a hypermethylated profile and conversely, SIL-TAL1+ cases were associated with a hypomethylated profile. This methylation status is also an independent prognostic factor and hypomethylated patients have a significantly unfavorable prognosis compared to hypomethylated patients. Together, these results illustrate how disruptions in epigenetic regulation can be involved both in the T-ALL oncogenesis and in the response to treatment

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Guillaume, Nicolas. "Implications des facteurs de transcription et des voies de signalisation cellulaire dans les leucémies aigües lymphoblastiques B : mise en évidence de l'expression et de l'activation de ZAP-70". Amiens, 2007. http://www.theses.fr/2007AMIED009.

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Resumen

Au cours de ce travail, nous nous sommes intéressés à la leucémie aiguë lymphoblastique à cellules B (LAL-B). Nous avons, dans un premier temps, étudié l’expression d’un panel de facteurs de transcription et de molécules impliquées dans les voies de signalisation cellulaire. Nous décrivons, dans les LAL-B, l’expression de ZAP-70, une tyrosine kinase de la famille Syk, dont l’expression n’avait été jusqu’alors décrite chez l’homme seulement dans les cellules T, NK et les cellules B matures d’une population de leucémie lymphoïde chronique (LLC) de mauvais pronostic. Nous décrivons également son expression dans les progéniteurs lymphoïdes physiologiques B humains pro-B et pré-B précoces. Dans un second temps, pour étudier le rôle de ZAP-70 dans les cellules de LAL-B, nous avons développé une protéine chimérique fusionnant le domaine de transduction protéique de la protéine TAT du virus HIV avec soit une forme sauvage de ZAP-70 ou une forme mutée dans son domaine kinase. La protéine produite ne s’est pas révélée active dans les lignées cellulaires T témoins testées et n’a donc pas permis d’appréhender, par ce biais, le rôle physiopathologique de cette kinase dans les cellules de lignées B. Nous nous sommes intéressés également à la signification de l’expression de ZAP-70 dans les LLC de mauvais pronostic. Nous montrons que l’expression de ZAP-70 dans ce contexte n’est pas corrélée à une résistance pléïotropique aux drogues médiée par l’hyperexpression de la glycoprotéine P

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Della, Marina Filippo. "Dissection of the function and pre-clinical targeting of IGF1R in Acute Lymphoblastic Leukemia induced by the BCR-ABL fusion oncoprotein". Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015USPCC309.

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Resumen

Contrairement aux réponses cliniques favorables chez les patients porteurs de Leucémie Myéloïdes Chronique traités avec des inhibiteurs ciblant l'activité tyrosine kinase de l'oncoprotéine de fusion BCR-ABL, les Leucémie Aigues Lymphoblastiques (LAL-B) BCR-ABL-positives restent de mauvais pronostic et requièrent de nouvelles stratégies thérapeutiques. Cette situation résulte de la présence d'autres altérations génétiques récurrentes, telle que la délétion mono- ou bi-allélique du gène codant le facteur de transcription Ikaros, observée dans plus de 83% des patients. Notre laboratoire a créé un modèle murin permettant l'analyse des conséquences de la perte de fonction d'Ikaros dans les LAL-B BCR-ABL+, et identifié une signature transcriptomique liée à l'absence d'un allèle sauvage d'Ikaros dans ces cellules. Cette signature transcriptomique inclut la surexpression du récepteur tyrosine kinase IGF1R. Mon travail de thèse montre : (i) que l'inhibition pharmacologique de IGF1R sensibilise les LAL-B BCR-ABL+ déficientes pour Ikaros aux effets antiprolifératifs et pro-apoptotiques de Nilotinib, (ii) que la délétion du gène IGF1R inhibe l'expansion de ces cellules in vivo, (iii) que le traitement des souris leucémiques avec NVP-AEW541 (un inhibiteur de IGF1R) en combinaison avec Nilotinib augmente significativement la survie des souris traitées par rapport aux souris contrôles, (iv) que l'augmentation de la survie des souris traitées est accompagnée par une augmentation de l'apoptose et une diminution de la prolifération des cellules leucémiques, et (v) que la voie AKT/mTORC1/S6K est une cible moléculaire de cette combinaison d'inhibiteurs
In recent years several inhibitors have been developed targeting the tyrosine kinase activity of the BCR-ABL fusion oncoprotein in Chronic Myeloid Leukemia (CML). Unlike the favorable clinical response observed in CML cases, BCR¬ABL` B-cell Acute Lymphoblastic Leukemias (B-ALLs) remain of poor prognosis. The likely reason for this aggressive behavior is the presence in these leukemias of additional genetic alterations. The most frequent of these is the mono-or bi-allelic deletion of the gene encoding the Ikaros transcription factor (IKZF1), observed in over 83% of patients. Our laboratory has studied the functional consequences of IKZF1 haploinsufficiency in a BCR-ABL-induced B-ALL mouse model and identified an Ikaros-dependent transcriptomic signature in these leukemic cells. This signature includes the overexpression of IGF1R, a tyrosine kinase receptor for IGF1. Based on these premises my PhD thesis work shows (i) that pharmacological inhibition of IGF1R sensitizes Ikaros-deficient BCR-ABL+ B-ALL to the antiproliferative and pro-apoptotic effects of Nilotinib, (ii) that IGF1R gene deletion impairs in vivo expansion of these leukemias in vivo, (iii) that treatment of leukemic mice with NVP-AEW541 (an IGF1R inhibitor) in combination with Nilotinib significantly increases survival of treated mice as compared to control mice, (iv) that the increased survival of treated mice is accompanied by an increase in apoptosis and a decrease in the proliferation of leukemic cells and (v) that inhibition of the AKT/mTORC1/S6K signalling pathway is a point of convergence of these inhibitor combination

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Malti, Talby Leïla [Faiza]. "Etude de leucémies aigue͏̈s lymphoblastiques de type B de l'enfant par la technique de puces ADN : identification de gènes prédictifs de la chimiosensibilité des cellules leucémiques au diagnostic". Aix-Marseille 2, 2005. http://www.theses.fr/2005AIX22007.

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Bernard, Natacha. "Mise au point d'un modèle de leucémie aigue͏̈ lymphoblastique de type B, chimiquement induite chez le rat pour l'étude d'agents leucémogènes : application aux champs magnétiques de 50 Hz". Paris 5, 2004. http://www.theses.fr/2004PA05P638.

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Les leucémies aigue͏̈s lymphoblastiques de type B représentent le type de leucémie le plus fréquemment rencontré chez les enfants. Cependant les causes de cette pathologie ne sont pas connues. Par ailleurs, aucun modèle induit de ce type de leucémie n'existe à l'heure actuelle. Nous avons donc cherché à mettre au point un modèle de leucémie aigue͏̈ lymphoblastique de type B chez le rat. Nous avons utilisé comme agent initiateur de leucémie un dérivé des nitrosourées (le butylnitrosourée), connu comme agent leucémogène. Nous avons caractérisé les leucémies obtenues. 65 % étaient de type lymphoblastique B. Nous avons ensuite testé sur ce modèle (320rats), l'effet des champs magnétiques (CM) de 50 Hz, avec ou sans harmoniques de 150, 250 et 350Hz, les CM étant suspectés d'avoir une incidence sur les leucémies de l'enfant. Aucun effet de l'exposition aux CM de 50 Hz, avec ou sans harmoniques n'a été trouvé sur la survie, l'incidence des leucémies et le type de leucémie obtenu
B acute lymphoblastic leukemia is the most common type of leukemia among children. However the causes of this disaese are not totally understood. At this time, no induced model of this type of leukemia exists. We therefore, decided to settle an induced model of B acute lymphoblastic leukemia in rats. The induction was obtained using butylnitrosourea, a nitrosourea compound reported as a leukemogenic agent. We characterized the leukemia obtained in our experiment. 65% of the rats developped B acute lymphoblastic leukemia. In a second time, using this model (320 rats), we tested, the effect of 50Hz magnetic fields (MFs), with or without harmonics of 150, 250 and 350Hz. Indeed, MFs are suspected to have an effect on children leukemia development. No effect of MF exposure, with or without harmonics, was detected, neither on survival, nor on the incidence of total leukemia, nor on the type of leukemia obtained

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Ben, Abdelali Raouf. "Détection des anomalies génétiques dans les LAL-T : de la biologie à la clinique". Thesis, Paris 11, 2011. http://www.theses.fr/2011PA11T013.

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Resumen

Les leucémies aiguës lymphoblastiques T (LAL-T) sont caractérisées par la prolifération maligneincontrôlée de précurseurs lymphoïdes T bloqués dans la différenciation. Les stades d’arrêt dematuration observés dans les LAL-T reproduisent fidèlement les différentes étapes de la maturationthymique humaine. Ainsi nous avons montré que le facteur de transcription myéloïde CEBPA, expriméuniquement dans les précurseurs thymiques les plus immatures (ETP), est réprimé par un mécanismed’hyperméthylation dans les LAL-T à l’exception des formes les plus immatures. Il est aujourd’huicommunément admis que les LAL-T constituent une pathologie dite « multi-hits » où les oncogènesde type A affectent la différenciation tandis les oncogènes de type B sont impliqués dans la régulationdu cycle cellulaire, l’auto-renouvellement et/ou l’engagement dans la lignée T. La voie de signalisationde NOTCH, cruciale pour le développement lymphoïde T, est constitutivement activée par la survenuede mutations des gènes NOTCH1 et/ou FBXW7 (N/F) dans environ 60% des LAL-T. La valeurpronostique de ces mutations est controversée. Dans notre travail, nous avons montré que lesmutations de N/F sont plus fréquentes dans les LAL-T arrêtées à un stade de maturation cortical etconfèrent un bon pronostic qui semble toutefois dépendre de la chimiothérapie administrée. Grâce àl’étude de cette large cohorte de LAL-T nous avons pu également établir la fréquence de l’anomalieoncogénique CALM-AF10. Cette dernière est très fréquente dans les LAL-T qui se développent àpartir des ETP dites de mauvais pronostic. Nous avons montré que c’est la présence de l’anomalieCALM-AF10 qui confère le pronostic défavorable à ce sous-type de LAL-T. Contrairement à lalittérature nous n’avons pas retrouvé de valeur pronostique liée à la surexpression des gènes ERG etBAALC. L’étude des anomalies génétiques des LAL-T permet de mieux comprendre l’oncogénèse etd’identifier les anomalies avec une valeur pronostique. L’intérêt de ces travaux est d’apporter une aideaux cliniciens pour une stratification thérapeutique adaptée afin de donner les meilleures chances desurvie aux patients
T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) are lymphoid neoplasms characterized by theproliferation of malignant T lymphoblasts arrested at early stages of maturation. Maturation arrest in TALLmirrors normal lymphopoiesis. Thus we have shown that the myeloid transcription factor CEBPA,expressed only in the most immature thymic precursors (ETP), is commonly repressed byhypermethylation in T-ALL with the exception of the most immature subset. It is now widely acceptedthat T-ALL is a “multi-hits” disease where the type A oncogenes affect the differentiation while type Boncogenes are involved in cell cycle regulation, self-renewal and T-cell commitment. The Notchsignaling pathway, crucial for T cell development, is constitutively activated by the occurrence ofmutations in NOTCH1 and /or FBXW7 (N / F) genes in approximately 60% of T-ALL. The prognosticvalue of these mutations is controversial. In our study, we showed that N/F mutations are morefrequently observed in T-ALL arrested at a cortical stage of maturation and confer a good prognosiswhich seems to be influenced by the therapeutic regimen. In this large cohort of T-ALL we could alsodetermine the frequency of the CALM-AF10 oncogenic abnormality. The latter is very common in TALLdeveloped from ETP wich are of very poor prognosis. We have shown that this is the presence ofCALM-AF10 which confers the poor prognosis in this subtype of T-ALL. Contrary to the litterature wedid not find any prognostic value associated with the overexpression of ERG and BAALC genes. Thestudy of genetic abnormalities in T-ALL provides a better understanding of oncogenesis and identifyabnormalities with prognostic value. The interest of this work is to assist clinicians for an efficienttherapeutic stratification to overcome the poor outcome of T-ALL patients

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Renou, Laurent. "Etude des relations entre le facteur de transcription HOX11L2/TLX3 et les micro-ARNs dans le développement des leucémies aiguës lymphoblastiques T humaines". Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015USPCC311.

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Les leucémies aiguës lymphoblastiques T (LAL-T) résultent de l'accumulation de lésions génétiques conduisant à une prolifération aberrante et à un blocage du développent de progéniteurs T. La dérégulation de l'expression des micro¬ARNs (miRs) a été associée à l'initiation et à la progression des hémopathies malignes. Les résultats d'une analyse du miRnome sur un panel de LAL-T ont permis d'identifier un groupe de miRs (125b/99a/100) significativement surexprimé dans les leucémie caractérisée par l'expression inappropriée du facteur de transcription TLX3. L'objectif de notre étude était d'étudier les relations fonctionnelles entre l'expression aberrant de TLX3, des miRs et leurs contributions dans le développement de la LAL-T. Par des expériences de perte et gain de fonction de TLX3, nous avons mis en évidence : (1) un lien entre l'expression de TLX3 et le miR-125b ; (2) un rôle similaire de TLX3 et miR¬125b dans le blocage de la différenciation des progéniteurs T qui ressemble à l'arrêt de différenciation observé dans les LAL-T TLX3+; (3) un rôle de promotion de la croissance cellulaire à la fois par TLX3 et miR-125b. En utilisant l'approche de ChIP-seq, nous avons trouvé des sites de liaison de TLX3 dans le locus d'un long ARN non codant le LINC000478 qui fonctionne probablement comme pri-miR pour le cluster miR-99a/Let-7c/125b-2. L'activation transcriptionnelle de miR-125b contribue à l'arrêt de différenciation par la régulation négative de cibles potentielles: ETS1 et CBFP qui jouent un rôle dans la régulation des réarrangements du TCR. Nos résultats révèlent pour la première fois un lien fonctionnel entre l'oncogène TLX3, miR125b et le développement des LAL-T
T cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) result from the accumulation of genetic lesions leading to aberra proliferation and developmental arrest of T-cell progenitors. Deregulation of expression of microRNAs (miRs) has be( linked to the initiation and progression of human malignancies. The results of a miRnome analysis on a panel of T-AL allowed us to identify a cluster of miRs (125b/99a/100) significantly overexpressed in a group of leukemia characteriz( by inappropriate expression of transcription factor TLX3. We challenged on this to study the functional relationshi] between TLX3, the miRs and their contributions in the development of T-ALL. By the experience of loss and gain function , we highlight: 1) a correlation between TLX3 and miR-125b expression; (2) a similar role of TLX3 and mil 125b in the differentiation blockage of notmal T-cells progenitors that phenocopies the differentiation arrest observed TLX3+ T-ALL patients ; (3) a T-cell growth promotion by both TLX3 and miR-125b. Using ChIP-seq approach, also found TLX3 binding sites in the locus coding a long non-coding RNA LINC00478 that probably functions as pi miR for miR-99a/Let-7c/125b-2 cluster. Transcriptional activation of miR-125b contribute to the differentiation arrest I the downregulation of putative targets: ETS1 and CBFf3 which play an important role in the regulation of TC rearrangements. Our results reveal for the first time new functional link between the TLX3 oncogene, miRl25b and ' ALL development

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Gaudichon, Jérémie. "Effets de l’hypoxie sur la régulation de l’expression et la fonction de la tétraspanine CD9 dans les leucémies aiguës lymphoblastiques de l’enfant". Thesis, Rennes 1, 2018. http://www.theses.fr/2018REN1B026.

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Les leucémies aiguës lymphoblastiques (LAL) sont le cancer le plus fréquent chez l’enfant et dérivent le plus souvent de précurseurs lymphoïdes B. D’importants progrès thérapeutiques ont permis d’améliorer considérablement le pronostic. Néanmoins, 15 à 20 % des enfants rechutent encore. Ces rechutes peuvent survenir de façon isolée ou combinée dans la moelle osseuse, le site primitif des lymphoblastes, et/ou dans des organes extramédullaires tels que le testicule ou le système nerveux central. Notre équipe a montré que la protéine transmembranaire CD9 jouait un rôle majeur dans la migration des blastes dans ces sites et notamment le testicule, par l’activation de la voie RAC1 en réponse à la stimulation des cellules par le CXCL12. Ici, nous avons mis en évidence qu’un faible niveau d’oxygène, caractéristique commune aux niches médullaire et extramédullaires, régulait positivement l’expression de CD9 aux niveaux transcriptionnel et protéique, via la voie majeure de réponse à l’hypoxie, dépendante du facteur de transcription Hypoxia Inducible Factor 1a (HIF1a). Nous montrons que HIF1a se fixe directement sur le promoteur de CD9 pour induire sa transcription. Nous montrons aussi que la protéine CD9 est essentielle aux propriétés d’adhérence et de migration des blastes dans des conditions de basse oxygénation, et que son action pourrait s’exercer à travers RAC1 comme en normoxie. Nos résultats dans des expériences de xénogreffe à des souris indiquent que la voie HIF1a favorise la dissémination des blastes, possiblement à travers la régulation qu’elle exerce sur CD9. Ainsi, ce travail contribue à mieux comprendre le rôle de CD9 dans la pathogenèse des LAL de l’enfant
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) are the most frequent cancer in children and derive most often from B-cell precursors. Huge therapeutic improvements have allowed to reach high survival rates near 90% at 10 years from diagnosis. However, 15-20% of children still relapse with a significant risk of death. Relapses can occur in bone marrow and/or extramedullary sites such as testis or central nervous system, usually referred as “sanctuary sites”. Our previous work showed that the transmembrane protein CD9 plays a major role in lymphoblasts migration into these sites, especially in testis, through the activation of RAC1 signaling upon blasts stimulation with C-X-C chemokine ligand 12 (CXCl12). Here, we addressed the question of putative common factors shared by bone marrow and extramedullary niches which could upregulate CD9 expression and function. Consequently, we found that low oxygen levels could actually enhance CD9 expression both at mRNA and protein levels. We further determined that Hypoxia Inducible Factor 1a (HIF1a), the master transcription factor involved in hypoxia response, binds directly CD9 promoter to induce its transcription. We also showed that CD9 protein is crucial for leukemic cell adhesion and migration at low oxygen levels, possibly through its action on RAC1 signaling. Mouse xenograft experiments indicate that HIF1a signaling pathway favors ALL cells dissemination, which may involve CD9 as well. The present work increments our understanding of CD9 implication in ALL pathogenesis

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Avran, David. "Oncogenèse et modélisation des leucémies aigues lymphoblastiques T". Paris 7, 2013. http://www.theses.fr/2013PA077254.

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Les leucémies aiguës lymphoblastiques T (LAL-T) sont des proliférations malignes présentant le. Caractéristiques de précurseurs thymiques bloqués dans leur différenciation. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés aux délétions du bras long du chromosome 6 (del6q) dont la/les cible(s) ne sont, à ce jour, pas identifiées. En utilisant à la fois des approches génomiques à large échelle et fonctionnelles, nous avons pu démontrer le rôle oncogénique de l'haplo-insuffisance combinée de deux gènes contigus localisés en 6q14: SYNCRIP (codant pour hnRNP¬Q) et SHNG5 (gène non codant hébergeant deux snoRNAs). Ces deux gènes sont impliqués dans la maturation des ARNm et dans la régulation de la traduction. Ils sont situés dans la région minimale délétée des del6q dans le sous-type de LAL-T caractérisé par une expression aberrante de l'oncogène TAL1. Nous avons utilisé des modèles in vivo de cellules murines Talrg/Lmor9/Notch1-ICNtransduit, et un modèle de xénogreffes de cellules leucémiques de patients SIL-TAL non del6q, pour montrer que l'inactivation combinée de SYNCRIP et SHNG5 était associée à un gain de malignité. Dans un travail mené en parallèle, nous avons identifié, dans des LAL-T, des anomalies récurrentes d'un gène classiquement inactivé dans des hémopathies myéloïdes, le gène TET2. L'analyse par CGH array d'une série de LAL-T a révélé la présence d'une micro-délétion acquise ciblant TET2 dans un cas du sous-groupe oncogénique TAL-R. Nous avons de plus identifié des mutations dans 3 autres cas appartenant à des sous-groupes oncogéniques différents. Cette étude génétique révèle que le gène TET2 peut aussi jouer un rôle dans la leucémogenèse T, soulignant le caractère ubiquitaire des altérations somatiques épigénétiques liées à ce gène
T-celé acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) are malignancies derived from lymphoid thymic precursors arrested in their differentiation. We focused on the deletion of the long arm of chromosome 6 (del6q), the most common caryotypic abnormality in T-ALL, which target(s) are, to date, not known. By using both a whole set of integrative genomics and functional approaches, we identified the role of the combined haploinsufficiency of two contiguous genes at 6q14 (by mimicking in vivo an interstitial microdeletion we identified), namely SYNCRIP (encoding hnRNP-Q) and SNHG5 (a non-protein-coding gene that hosts snoRNAs), involved in mRNA maturation and protein translation. These genes are included in the common deleted region in a subtype of T-ALLs characterized by aberrant expression of the TAL1 transcription factor oncogene. In vivo knockdown models using Talr9/Lmolt9/Notch1-ICNtransduced mouse cells, and xenograft of patient's SIL-TAL, not 6q deleted leukemic cells, showed that the combined silencing of both genes was associated to a gain of malignancy. In a parallel work, we identified in T-ALL, recurrent aberrations of a gene usually involved in myeloid malignancies, TET2. Using microarray-based CGH to screen a cohort of T-ALL, we found a focal heterozygous deletion of this gene in one case belonging to the TAL-related oncogenic sub¬group. Moreover, we found mutations in cases belonging to other oncogenic sub-groups. This genetic study reveals that TET2 can play a role in T leukemogenesis, highlighting the ubiquitous nature of epigenetic alterations linked to TET2

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Hajingabo, Leon. "Analyzing molecular network perturbations in human cancer: application to mutated genes and gene fusions involved in acute lymphoblastic leukemia". Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2015. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/209126.

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Le séquençage du génome humain et l'émergence de nouvelles technologies de génomique à haut débit, ont initié de nouveaux modèles d'investigation pour l'analyse systématique des maladies humaines. Actuellement, nous pouvons tenter de comprendre les maladies tel que le cancer avec une perspective plus globale, en identifiant des gènes responsables des cancers et en étudiant la manière dont leurs produits protéiques fonctionnent dans un réseau d’interactions moléculaires. Dans ce contexte, nous avons collecté les gènes spécifiquement liés à la Leucémie Lymphoblastique Aiguë (LLA), et identifié de nouveaux partenaires d'interaction qui relient ces gènes clés associés à la LLA tels que NOTCH1, FBW7, KRAS et PTPN11, dans un réseau d’interactions. Nous avons également tenté de prédire l’impact fonctionnel des variations génomiques tel que des fusions de gènes impliquées dans LLA. En utilisant comme modèles trois différentes translocations chromosomiques ETV6-RUNX1 (TEL-AML1), BCR-ABL1, et E2A-PBX1 (TCF3-PBX1) fréquemment identifiées dans des cellules B LLA, nous avons adapté une approche de prédiction d’oncogènes afin de prédire des perturbations moléculaires dans la LLA. Nous avons montré que les circuits transcriptomiques dépendant de Myc et JunD sont spécifiquement dérégulés suite aux fusions de gènes TEL-AML1 et TCF3-PBX1, respectivement. Nous avons également identifié le mécanisme de transport des ARNm dépendant du facteur NXF1 comme une cible directe de la protéine de fusion TCF3-PBX1. Grâce à cette approche combinant les données interactomiques et les analyses d'expression génique, nous avons fourni un nouvel aperçu à la compréhension moléculaire de la Leucémie Lymphoblastique Aiguë.
Doctorat en Sciences
info:eu-repo/semantics/nonPublished

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Marceau, Alice. "Profil moléculaire des leucémies aiguës myéloïdes pédiatriques". Thesis, Lille 2, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL2S003/document.

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Malgré une amélioration de la prise en charge thérapeutique au cours des dernières années, les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) pédiatriques sont des hémopathies graves, avec des taux de rechute pouvant atteindre 30% et des taux de survie inférieurs à 75%. Une meilleure description des anomalies moléculaires chez les enfants atteints de LAM est nécessaire pour affiner le pronostic de ces patients. En utilisant le séquençage haut débit ciblé sur 36 gènes et la technique de LD (ligation-dependent) RT-PCR, ce travail décrit le profil moléculaire ainsi que sa signification pronostique chez 385 enfants atteints de LAM de novo inclus dans l’essai clinique prospectif ELAM02. 76 % des patients présentent au moins une mutation parmi les gènes étudiés. Les mutations les plus fréquentes concernent les gènes contrôlant les voies de signalisation des tyrosine kinases (61 %), suivis par les facteurs de transcription (16 %), les suppresseurs de tumeurs (14 %), les modificateurs de la chromatine (9 %), la méthylation de l'ADN (8 %), la cohésine (5 %) et le spliceosome (3 %). De plus, un transcrit de fusion est détecté dans près de la moitié des cas. Au final, les réarrangements impliquant le CBF, les mutations de NPM1 et double-mutations de CEBPA (CEBPA-dm) représentent 37% de la cohorte et définissent un sous-groupe moléculaire au pronostic favorable (survie globale à 3 ans: 92,1%) alors que les fusions impliquant NUP98, les mutations WT1, RUNX1 et PHF6 (15% de la cohorte) constituent un sous-groupe moléculaire au pronostic péjoratif (survie globale à 3 ans: 46,1%). Les réarrangements de KMT2A (21 % de la cohorte) sont associés à un risque intermédiaire. Malgré quelques similitudes, le profil moléculaire et sa signification pronostique diffèrent entre les LAM de l’enfant et de l’adulte. Ces résultats contribuent à affiner la stratification du risque pronostique des LAM pédiatriques et ainsi améliorer leur prise en charge thérapeutique. Cette classification moléculaire reste à valider dans d’autres cohortes pédiatriques indépendantes
Despite major treatment improvements over the past decades, pediatric acute myeloid leukemia (AML) is still a life-threatening malignancy with relapse rates up to 30% and survival rates below 75%. A better description of the pattern of molecular aberrations in childhood AML is needed to refine prognostication in such patients. We report here the comprehensive molecular landscape using both high-throughput sequencing focused on 36 genes and ligation-dependent RT-PCR in 385 children with de novo AML enrolled in the prospective ELAM02 trial and we evaluated their prognostic significance. 76% of patients had at least one mutation among the genes we screened. The most common class of mutations involved genes that control kinase signaling (61%) followed by transcription factors (16%), tumor suppressors (14%), chromatin modifiers (9%), DNA methylation controllers (8%), cohesin genes (5%) and spliceosome (3%). Moreover, a recurrent transcript fusion was detected in about a half of pediatric patients. Overall, CBF rearrangements, NPM1 and double CEBPA mutations represented 37% of the cohort and defined a favorable molecular subgroup (3-years overall survival: 92.1%) while NUP98 fusions, WT1, RUNX1 and PHF6 mutations (15% of the cohort) segregated into a poor molecular subgroup (3-years overall survival: 46.1%). KMT2A-rearrangements (21% of the cohort) were associated with an intermediate risk. Despite some overlaps, the spectrum of molecular aberrations and their prognostic significance differ between childhood and adult AML. These data have important implications to contribute in refining risk stratification of pediatric AML and show the need for further validations in independent pediatric cohorts

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Koubi, Myriam. "PLZF et les protéines du groupe Polycomb : interaction et implication dans la différenciation hématopoïétique normale et pathologique". Thesis, Aix-Marseille, 2015. http://www.theses.fr/2015AIXM5066/document.

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Les protéines du groupe Polycomb (PcG) sont des facteurs épigénétiques dont le rôle est de maintenir la répression de leurs gènes cibles au niveau de la chromatine via la modification des protéines histones. EZH2 est une protéine clé dans les mécanismes de régulation puisqu’elle catalyse la mise en place de la marque répressive H3K27me3. Dans le cadre de ma thèse, je me suis intéressée au modèle des leucémies aiguës myéloïdes (LAM) dans lesquelles, contrairement à d’autres pathologies myéloïdes, des mutations affectant EZH2 ou des membres Polycomb ne sont retrouvées que très rarement (˂1%). Des études ont montré que dans ce type de leucémies, de nombreux gènes cibles d’EZH2 sont dérégulés bien que son activité répressive soit toujours présente, mettant en évidence d’éventuels défauts de recrutement de cette protéine. Parmi les facteurs de transcription susceptibles de réguler l’association des protéines PcG à la chromatine, se trouve PLZF qui est un candidat intéressant. En effet, le laboratoire a mis en évidence une interaction entre PLZF et la protéine Polycomb BMI-1 et a montré que la distribution génomique de PLZF concorde avec celle de certains composants des Polycomb. L’objectif de mon travail de thèse a donc été de déterminer dans quelle mesure PLZF intervient dans le recrutement ou l’activité d’EZH2
Polycomb group (PcG) proteins are epigenetic factors which play a major role in maintaining epigenetic silencing via histone modifications at the chromatin level. EZH2 is a key regulator that catalyzes the trimethylation of H3K27, which is a repressive mark. During my PhD, I was interested in the acute myeloid leukemia (AML) model in which, unlike other myeloid malignancies, EZH2 or other PcG protein mutations are very rare (˂1%). Studies have shown that in this type of leukemia, many of EZH2 target genes are deregulated although its repressive activity is still present highlighting possible EZH2 recruitment defects. Among the transcription factors that regulate the association of PcG proteins to chromatin, the transcription factor PLZF is an interesting candidate. Indeed, the laboratory has demonstrated an interaction between PLZF and the Polycomb protein BMI -1 and showed that the genomic distribution of PLZF is consistent with that of some Polycomb components. The aim of my thesis was therefore to determine in which extent PLZF is involved in the recruitment or activity of EZH2

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Vilasco, Myriam. "Rôles de la kinase IKKE lors de l'infection par le virus de l'Hépatite C et dans la réponse immune dépendante de RIG-MAVS". Paris 7, 2008. http://www.theses.fr/2008PA077088.

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Prés de 3% de la population mondiale est infectée par le Virus de l'Hépatite C (VHC). Chez la plupart des patients, le virus inhibe le système immunitaire, comme la réponse Interféron (IFN), et permet l'établissement d'une infection chronique pouvant mener à une cirrhose, à puis un cancer du foie et à la mort. Nos études portent sur la réponse antivirale médiée par l'IFN et plus spécifiquement sur la kinase IKKe capable de phosphoryler IRF-3/-7, un acteur clé de l'induction IFN. Nous avons tout d'abord démontré la capacité de cette kinase à contourner l'inhibition de la réponse IFN exercée par le VHC. IKKe met en place une réponse antivirale spécifique contre le VHC via l'induction d'un panel de gènes antiviraux. De plus, nous avons confirmé son importance physiologique chez les patients infectés par le VHC. Nous avons aussi montré, que suite à une infection virale le recrutement d'IKKe est régulé par une polyubiquitination de MAVS, l'adaptateur mitochondrial qui est mobilisé par RIG-I suite à la détection d'ARN double brin. Cette ubiquitination de MAVS favorise l'expression des gènes régulés par IRF-3/-7, mais diminue celle des gènes spécifiquement induits par IKKe via STAT-1. Ainsi, l'interaction entre MAVS et IKKe peut être considérée comme un point déterminant pour la régulation du choix des cibles de la kinase
An estimated 3% of the world population is infected with hepatitis C virus (HCV). In most infected individuals, this virus evades the immune System, as the Interferon (IFN) response, and establishes a chronic infection that can lead to cirrhosis, liver cancer and death. Our studies focus on the IFN mediated antiviral response and more specifically on the IRF-3/-7 phosphorylating kinase IKKx, a key actor of the IFN induction. We first demonstrate its participation in circumventing the HCV interference with the production of IFN, by its ability to induce specific antiviral response trough a panel of genes, that leads to an effective antiviral response against HCV. Furthermore, we confirm its physiological importance in HCV-infected patients. We also demonstrate that IKKe recruitment following viral infection is regulated through polyubiquitination of MAVS, a mitochondrial adapter that relays the signal initiated by RIG-I's dsRNA detection. This ubiquitination of MAVS favors expression of IRF-3/-7 regulated genes but diminishes the expression of IKKe-specific genes through STAT-1, demonstrating that the interaction between MAVS and IKKe acts as a molecular switch to regulate kinase target specificity

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Moraes, Cabe Carolina. "Rôle et fonction du facteur de transcription Ets-1 dans le développement précoce des lymphocytes B". Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC030.

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Le développement des cellules B est conduit par l'action combinée de facteurs de transcription, de facteurs solubles et d'interactions cellulaires, qui régulent leur engagement et différenciation. La signalisation par l'IL-7R et le pré-BCR régule la prolifération et la survie des cellules B précoces, en même temps qu'elle coordonne l'expression et le réarrangement des Ig. Un des facteurs de transcription impliqués dans le développement des cellules B est Etsl, un facteur fortement exprimé dans les lignées lymphoïdes, où il contrôle la différenciation des cellules B, T et NK. Son inactivation altère le développement des cellules B, en particulier dans la différenciation des cellules pro-B à pré-B. La dérégulation du processus de différenciation des cellules B est à l'origine des leucémies. La Leucémie Aiguë Lymphoblastique (LAL) est une prolifération clonale qui se développe à partir d'une cellule lymphoïde bloquée à un stade précoce de différenciation. Il existe plusieurs formes de LAL ayant des altérations génétiques diverses, parmi elles la translocation t(9,22), qui induit l'expression de la protéine oncogénique BCR-ABLI et est associée à un mauvais pronostic. BCR-ABL I active constitutivement STAT5, et contribue à leucémogenèse à travers la voie de signalisation JAK/STAT. L'objectif de cette thèse est d'étudier la fonction du facteur de transcription Etsl dans le développement des cellules B précoces. Nos résultats montrent une nouvelle fonction de Etsl dans la régulation de l'activité de STAT5 dans le développement des cellules B et dans le contrôle du programme de transcription en aval de BCR-ABLI pendant les étapes initiales de leucémogenèse dans les cellules pré-B
B-cell development is driven through combined actions of transcription factors, soluble factors and cellular interactions, which regulate the commitment and differentiation of B tells. Signaling through IL-7R and pre-BCR regulates the transcription of genes involved in proliferation and survival of early B tells, while it coordinates the expression and rearrangement of Ig genes. One of the transcription factors involved on B tell development is Etsl, which is a member of the ETS family of transcription factors and it is highly expressed in the lymphoid lineages where it controls the differentiation of B, T and NK tells. Its inactivation impairs B tell development, particularly during the differentiation of pro-B into pre-B tells. Deregulation of the process of B tells development causes leukemia. Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is a clonai proliferation that develop from a lymphoid tell blocked at an early stage of differentiation. This can be due to diverse genetic alterations, among them the t(9,22) translocation induces the expression of an oncogenic fusion protein, called BCR-ABL1, which is associated with poor prognosis. BCR-ABL1 activates constitutively STAT5 and thus likely contributes to leukemogenesis by signaling via the JAK/STAT pathway. The aim of this thesis is to study the role and function of Ets I transcription factor in early B tell development. These findings demonstrate a nove] function for the Etsl transcription factor in the regulation of STAT5 activity during early B-tell development and in the control of the transcription program downstream BCR-ABL1 during the initial steps of leukemogenesis in pre-B tells

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Kaveri, Deepika. "Study of the role of Wnt pathway in a murine model of T-ALL". Phd thesis, Université de Strasbourg, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00912330.

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We report a murine model, R26-βcat, expressing a stable form of β-catenin in T cells. R26-βcat pre-leukemic mice show a developmental block in T-cell differentiation and exhibit increased resistance to apoptosis. Interestingly, the mice develop T cell lymphomas independent of the Notch pathway. Furthermore, we showed that loss of the tumour suppressor Pten and over-expression of Myc was favoured; and may constitute the secondary events contributing to this leukemogenesis. We also demonstrated that R26-βcat tumours are malignant, heterogeneous and that leukaemia stem cells (LSC) were enriched in DP cells. Furthermore, the self-renewal capapcity of R26-βcat LSCs can to be exhausted.We propose that the R26-βcat model defines a new sub-group of Notch-independent T-ALL and the β-catenin may serve as a potential therapeutic target for these tumours.

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Pégahi, Rassa. "Production des métalloprotéinases par les cellules souches hématopoïétiques saines et leucémiques : Rôle du micro-environnement cellulaire". Rouen, 2005. http://www.theses.fr/2005ROUES051.

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Les métalloprotéinases (MMPs) jouent un rôle crucial dans la migration des cellules souches hématopoïétiques saines (CSH) et malignes (LAL pré-B). La production de ces enzymes est régulée par de nombreux facteurs tels que les cytokines, les chémokines et d'autres éléments de la matrice extracellulaire (MEC). Dans ce travail, nous avons tout d'abord montré que l'acide hyaluronique (AH) comme la chimiokine SDF-1 induisait la production des MMPs par les progéniteurs CD34+ sains. Cette production est associée à une augmentation du calcium cytosolique. Contrairement à l'effet stimulateur de l'AH, celui du SDF-1 est dose dépendante. Nous avons également montré que les cellules CD34+ exprimaient la protéine membranaire Syndecan-4, un nouveau récepteur sélectif de SDF-1. D'autre part, nous avons étudié l'activité sécrétoire des cellules leucémiques pré-B LAL provenant de la moelle osseuse (MO) et du sang périphérique (SP) d'enfants malades. La production basale des MMPs ainsi celle stimulé par les cytokines (SDF-1, GM-CSF, b-FGF et VEGF) a été évaluée. Parallèlement l'expression génétique de ces gélatinases au niveau transcriptionnel a également été étudiée. Une large hétérogénéité a été observée parmi les patients étudiés. Les cytokines b-FGF et VEGF se sont révélées comme des stimulateurs de la production des MMPs, avec une préférence pour la MMP-2 tandis que le GM-CSF induisait essentiellement la production de la MMP-9, notamment dans les cellules du SP. Nous nous sommes intéressés aux mécanismes moléculaires de ces réponses cellulaires en utilisant des inhibiteurs spécifiques des trois voies de signalisation (NFkB, MEK1 et PI3K). L'expression de la MMP9 empruntait la voie de MEK1/PI3K tandis que celle de la MMP2 semblait être indépendante des voies étudiées. Nous avons mis en évidence que tous ces effets stimulateurs étaient calcium dépendants. De plus, b-FGF semblait favoriser la prolifération des cellules leucémiques en augmentant leur survie. A la suite de ces résultats, nous avons recherché si les cellules LAL pouvaient elles-mêmes produire ces cytokines stimulatrices de façon autocrine. Nous avons détecté la présence de l'ARNm de VEFG dans les cellules pré-B chez la majorité des patients étudiés. L'ARNm de VEGF-R1 a été observé pour tous les patients, alors que ceux de VEGF-R2 et VEGF-R3 ont été détectés chez une partie des patients. L'ensemble de ces résultats indique que les différents éléments de la MEC étudiés dans ce travail (AH, SDF-1, GM-CSF, b-FGF et VEGF) jouerait un rôle important dans la migration des cellules souches saines et leucémiques via leur action régulatrice sur la production des MMPs. Ce travail constitue une base pour suggérer de nouvelles stratégies thérapeutiques
The metalloproteinases (MMPs) play a key role in the migration of haematopoietic stem cells. The production of these enzymes is regulated by different components of the extracellular matrix (ECM). In this study, we have shown that in normal CD34+ cells hyaluronic acid (HA) as well as SDF-1, induces MMPs secretion. This stimulatory effect is associated with an increase of cytosolic calcium. In contrast to HA induced-effect, SDF-1-induced MMPs secretion appears to be dose-dependent. We have also shown that CD34+ cells express syndecan-4, a selective membrane receptor of SDF-1. Besides, we have studied the secretory activity of pre-B acute lymphoblastic (ALL) cells derived from bone marrow (BM) or peripheral blood (PB) of leukaemic children. The MMPs secretion has been evaluated at basal and stimulated (by SDF-1, GM-CSF, b-FGF and VEGF) levels. A large heterogeneity has been observed among the studied patients. VEGF and b-FGF are found to be able to provoke predominantly MMP-2 secretion while GM-CSF mainly induces MMP-9 production, more particularly in SP cells. The molecular mechanisms involved in these responses have been investigated by using specific inhibitors of NFB, MEK1 and PI3K pathways. The expression of MMP-9 has appeared to be mediated through MEK1/PI3K pathways. It has been shown that all stimulatory effects observed in the present work are calcium-dependent. In addition, b-FGF favours the leukaemia proliferation by strengthening cell survival. Thereafter, we have investigated whether the pre-ALL cells themselves could produce through an autocrine loop these stimulating cytokines. The presence of mRNA of VEGF in pre-B ALL cells has been detected in most of studied patients, while the presence of mRNA of VEGF-R1 has been observed in all patients. Altogether, the present findings strongly suggest that different ECM components studied in this work (HA, SDF-1, GM-CSF, b-FGF and VEGF) would play a crucial role in the migration of leukaemic and normal haematopoietic stem cells by regulating the MMPs secretion. These data constitute a basis to consider new strategies of therapies

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Simand, Célestine. "Fonction d’Ikaros dans la transformation des progéniteurs des cellules B1". Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ097.

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Le développement lymphocytaire B murin comprend 2 lignages, B1 et B2, différentiables par leurs progéniteurs, leurs fonctions et leurs localisations. Le facteur de transcription Ikaros, codé par le gène Ikzf1, a un rôle essentiel dans le développement lymphocytaire B2. Cependant, son rôle dans le développement lymphocytaire B1 reste à déterminer. Les altérations génétiques d’IKZF1 sont souvent associées aux leucémies aiguës lymphoblastiques B (LAL-B) de haut risque. Considérant que la lymphopoïèse s’établit par une vague fœtale, majoritairement de type B1, puis une vague adulte, majoritairement de type B2, les progéniteurs B1 pourraient-être à l’origine de certaines LAL-B pédiatriques.En utilisant un modèle murin avec une délétion conditionnelle du gène Ikzf1 dans les progéniteurs B (Ikzf1f/f Mb1-Cre), nous avons montré qu’Ikaros est nécessaire à la différenciation lymphocytaire B1 de manière équivalente à la différenciation B2. En utilisant l’oncogène BCR-ABL, nous avons également montré que les progéniteurs B1 peuvent être à l’origine de LAL-B chez les murins et qu’Ikaros a un rôle suppresseur de tumeur dans ces cellules.La poursuite de ce travail consistera à déterminer si des LAL-B de type B1 existent chez l’Homme
Murine B cell development comprises 2 main B cell lineages, B1 and B2, with distinct progenitors, functions and localization. The transcription factor Ikaros, encoded by the Ikzf1 gene, is a major regulator of lymphopoiesis and plays a crucial role in B2 cell differentiation. However, the role of Ikaros in B1 cell differentiation is unclear. Genetic alterations of IKZF1 are a hallmark of high-risk B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP-ALL). Considering that lymphopoiesis takes place in distinct fetal and adult waves, with B1 cell lymphopoiesis predominating in fetuses and neonates and B2 cell progenitors predominating in adults, some pediatric BCP-ALL cases may originate from B1 cell progenitors. Using a mouse model with a conditional deletion of Ikzf1 in B cell progenitors (Ikzf1f/f Mb1-Cre), we show that Ikaros is critical for normal B1 cell differentiation, similarly to B2 cell differentiation. Using the BCR-ABL oncogene, we show that B1 progenitor can induce BCP-ALL in the murine model and that Ikaros has a tumor suppressor function in these cells. Further studies are required to determine if B1 cell progenitors can contribute to B1-like BCP-ALL in human

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Berbis, Julie. "Quelle utilité à la mise en œuvre du suivi des enfants et adolescents survivant à une leucémie dans la prise de décision ? : A propos de la cohorte LEA". Thesis, Aix-Marseille, 2014. http://www.theses.fr/2014AIXM5086.

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Les progrès thérapeutiques réguliers ont transformé le pronostic des enfants atteints de leucémie aiguë, posant avec une grande acuité le problème des effets secondaires tardifs, de l'insertion sociale mais aussi de la qualité de vie des patients et de leur entourage, ainsi que des déterminants mis en jeu. L'ensemble des acteurs du système de soins ont la responsabilité de l'étude de ces effets secondaires tardifs et de leur prise en compte. En 2004, le projet LEA (Leucémie de l'Enfant et de l'Adolescent) a débuté avec pour objectif d'évaluer l'état de santé et la qualité de vie à moyen et long terme de patients traités pour une leucémie aiguë de l'enfance après 1980. La volonté était de mettre en oeuvre un système pouvant produire de la connaissance dans une démarche de recherche traditionnelle, mais aussi de s'inscrire rapidement dans une démarche pragmatique de production d'informations susceptibles de modifier les pratiques de prise en charge et de suivi. L'objectif général de ce travail cherche à démontrer l'utilité de dispositifs lourds comme la mise en oeuvre d'une cohorte, dans la double logique de fournir une information d'une part directement utile à la décision clinique, et d'autre part susceptible d'éclairer la décision publique. Les travaux scientifiques s'articulent autour de : 1. La visibilité de la cohorte LEA au regard des autres dispositifs existants au niveau international ; 2. Les conséquences à distance des traitements lourds reçus par les patients ; 3. La qualité de vie de l'entourage à distance de l'épisode aigu de la maladie ; 4. L'utilité d'un suivi systématisé dans la diminution des inégalités d'accès au système de santé entre les classes sociales
Regular advances in cancer treatment have dramatically improved the prognosis of children with acute leukemia, raising with a great acuity the problem of the late physical side effects, social integration, quality of life of the patients and their family as well as identification of the determinants of these outcomes. It is the responsibility of all the care system actors to consider these objective and subjective late effects. The LEA project (Leucémie de l'Enfant et de l'Adolescent - childhood and adolescent leukemia) was initiated in 2004 with the aim of studying the long-term health status and quality of life of children treated for leukemia after January 1980. As soon as the project began, the aim was to implement a system that can produce knowledge in a traditional research approach, but also to rapidly become a pragmatic approach of producing information that could affect both care and monitoring practices. The general objective of this manuscript seeks to demonstrate the utility of heavy plan such as the implementation of a cohort, in the double approach of providing information on the one hand directly relevant to clinical decision, and on the other hand likely to enlighten public decision. The present scientific works are based on: 1. The visibility of LEA in relation to other cohorts of childhood cancer survivors existing internationally; 2. The long-term impact of the heavy modalities of treatment, as the hematopoietic stem cell transplantation or irradiation; 3. The quality of life of the family long after the completion of cancer therapy; 4. The usefulness of a systematic follow-up in reducing inequalities in access to health care among social classes

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Arnaud, Marie-Pierre. "Physiopathologie des leucémies aigues lymphoblastiques de la lignée B à remaniement ETV6/RUNX1 : rôle de la protéine CD9". Thesis, Rennes 1, 2015. http://www.theses.fr/2015REN1S064/document.

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Malgré l'amélioration des traitements, environ 20% des patients atteints de leucémie aigue lymphoblastiques (LAL) rechutent dans la moelle osseuse ou dans des sites extra-médullaires tels que les ovaires et les testicules, ce qui est particulièrement fréquent dans les rechutes tardives de LAL-B présentant un remaniement ETV6/RUNX1. Les travaux réalisés par Virginie Gandemer en 2007, ont montré que l'expression de CD9 permettait de distinguer les leucémies ETV6/RUNX1 des autres types de leucémie. Le gène CD9 code pour une protéine de la famille des tétraspanines dont l'expression a été corrélée avec le risque métastatique et la survie des patients. Par ailleurs il a été démontré que la protéine CD9 était impliquée dans le homing et la prise de greffe des cellules souches hématopoïétiques et leucémiques. Nous avons donc émis l'hypothèse qu'à travers ses propriétés fonctionnelles sur la migration et le homing, CD9 pourrait être un acteur clé des rechutes de LAL-B. Le but de ce travail de thèse était donc premièrement de déterminer le mode de régulation de CD9 dans les LAL-B ETV6/RUNX1 et deuxièmement de déterminer les effets de l'expression de CD9 sur la motilité et la prise de greffe des LAL-B. Les analyses préalablement réalisées au laboratoire avaient suggéré que CD9 pouvait être régulé par des miARNs. Nous avons identifié un cluster de 3 miARNs potentiellement impliqués dans la régulation de CD9 dans les LAL-B ETV6/RUNX1. Ces résultats doivent cependant être complétés par d'autres analyses fonctionnellles afin d'être confirmés. Nous avons étudié le rôle de la protéine CD9 dans la dissémination des cellules de LAL-B. Nous avons démontré que CD9 était un régulateur potentiel de l'adhésion et un nouveau facteur impliqué dans la migration et le homing dépendants de CXCR4 en favorisant l'activation de RAC1 et les réarrangements de l'actine en réponse au CXCL12. Enfin, nous avons décrit pour la première fois l'influence de CD9 sur la migration et le homing dans les testicules via RAC1. Nos résultats montrent donc que CD9 favorise la dissémination des cellules de LAL-B dans les testicules et suggèrent que cette protéine pourrait constituer un acteur majeur des rechutes tardives de LAL-B dont les mécanismes d'apparitions sont peu connus
Despite improvements in survival rates, approximately 20% of children suffering from acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) present relapses from bone marrow or from B-extramedullary sites, such as the testes or ovaries, particularly in cases of late relapse of ETV6/RUNX1-ALL. Virgine Gandemer showed in 2007, that the expression of CD9, a protein from the tetraspanin superfamily, can be used to distinguish ETV6/RUNX1 lymphoblastic leukemia from other types of ALL. CD9 expression has been correlated with the risk of metastasis and is associated with a poor clinical outcome in various types of cancer. Moreover CD9 has been implicated in hematopoietic and leukemic stem cell homing. We hypothesized, that CD9 protein, through its functional properties on migration and homing, could be a key actor of B-ALL relapses. The purpose of our study was then to investigate, first the transcriptional regulation of CD9 in ETV6/RUNX1 B-ALL and secondly, the effect of CD9 expression on motility and engrafment of B lymphoblasts. The analysis of CD9 transcriptional regulation previously made in the team, suggested that it could be regulated by miRNAs. We identified a cluster of 3 miRNAs potentially implicated in the regulation of CD9 expression in ETV6/RUNX1 B-ALL. This result has to be confirmd by more functional analysis. We investigated the role of CD9 in the dissemination of B-ALL. We identified CD9 as a potential regulator of B-ALL cell adhesion and a new factor involved in CXCR4-mediated migration and homing, through the promotion of actin rearrangement in response to CXCL12. We also characterized the effect of CD9 protein expression on RAC1 activation, which had an impact on blast migration and engraftment. Finally, we described, for the first time, the influence of CD9, mediated by RAC1 signaling, on B-cell chemotactic migration and homing in the testis. Our work provides evidence for an impact of CD9 on the ability of pre-B leukemic cells to disseminate to testes, through its effects on migration and homing, and suggests that CD9 may be a key player in late relapses of B-ALL, which are currently poorly understood

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Spinella, Jean-François. "Paysage génomique de la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant". Thèse, 2016. http://hdl.handle.net/1866/18534.

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Resumen

La leucémie aiguë lymphoblastique (LAL) est une maladie complexe à l’étiologie multifactorielle. Elle représente la forme la plus commune de cancer pédiatrique et malgré une augmentation significative du taux de survie des patients, près de 15% d’entre eux ne répondent pas aux traitements classiques et plus de 2/3 subissent les effets du traitement à long terme. Réduire ces chiffres passe par une meilleure compréhension des causes sous-jacentes de la LAL. À travers l’analyse des données de séquençage de nouvelle génération (SNG) de la cohorte QcALL du CHU Sainte-Justine, je me suis intéressé aux déterminants génomiques contribuant aux différents aspects de la LAL (prédispositions, développement/progression et rechutes). Dans un premier temps, j’ai développé un outil d’analyse (SNooPer) basé sur un algorithme d’apprentissage intégrant les données SNG normales et tumorales des patients, permettant d’identifier les mutations somatiques au sein de données à faible couverture (low-pass). Cet outil, couplé aux analyses prédictives in silico et aux validations fonctionnelles adéquates, nous a permis de caractériser les événements rares ou récurrents impliqués dans le processus leucémogène. En analysant les données de LALs pré-B, j’ai pu mettre en évidence une série de mutations drivers rares au niveau de gènes (ACD, DOT1L, HCFC1) qui n’avaient jamais été associés à la LAL. L’étude fonctionnelle de la mutation identifiée au niveau d’ACD, membre du complexe shelterin, a démontré qu’elle conduit à une réduction de l’apoptose et une augmentation de la taille des télomères. Outre l’intérêt de la découverte de ces nouveaux drivers, je souhaitais démontrer l’importance des mutations somatiques rares afin d'établir la spécificité interindividuelle, généralement sous-estimée, et d’identifier l’ensemble des fonctions cellulaires impliquées. Au cours de ces travaux, j'ai également mis en évidence de nouveaux évènements récurrents de la LAL à cellules T (LAL-T), en particulier au niveau de patients présentant un phénotype immature encore mal caractérisé. J'ai démontré l’influence d'une mutation dans le gène codant pour U2AF1, membre de la machinerie d’épissage (spliceosome), sur l’épissage de gènes d’intérêt et ainsi confirmer l’importance du dysfonctionnement de l’épissage dans le développement de la leucémie. J'ai également identifié deux suppresseurs de tumeurs portés par le chromosome X, MED12 et USP9X, qui n’avaient jamais été associés à la LAL-T auparavant et qui représentent un intérêt particulier étant donné le débalancement de l'incidence en fonction du sexe (ratio garçon:fille =1.22). Enfin, grâce à l’étude longitudinale de patients LAL-B ayant subi une ou plusieurs rechutes, j'ai analysé l'architecture et l'évolution clonales des tumeurs. J’ai ainsi identifié 2 profils évolutifs distincts gouvernant les rechutes précoces et tardives: d'un côté, une dynamique élevée alimentée par un dysfonctionnement des mécanismes de réparation de l'ADN et conduisant à l'émergence rapide de clones mieux adaptés – de l'autre, une dynamique réduite, quasi-inerte, suggérant l'échappement de cellules en dormance épargnée par la chimiothérapie. De manière générale, cette thèse a permis de contribuer à la caractérisation des déterminants génomiques qui constituent la variabilité inter- et intra-tumorale, participent au processus leucémogène et/ou aux mécanismes de résistance au traitement. Ces nouvelles connaissances contribueront à un raffinement de la stratification des patients et leur prise en charge personnalisée.
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is a complex disease with a multi-factorial etiology. It represents the most frequent pediatric cancer and despite a significant increase of survival rate, about 15% of the patients still do not respond to current treatment protocols and over 2/3 of survivors experience long-term treatment related side effects. To reduce these numbers, a better understanding of the underlying causes of ALL is needed. Through the analysis of next-generation sequencing (NGS) data obtained from the established Quebec cALL (QcALL) cohort of the Sainte-Justine hospital, I have been particularly concerned about the genomic determinants that contribute to different phases of ALL (predispositions, onset/progress and relapses). First, I developed an analysis tool (SNooPer) based on a machine learning algorithm integrating both normal and tumor NGS data of the patient to identify somatic mutations from low-pass sequencing. This tool, combined to in silico predictive analysis and to adequate functional validations, allowed us to characterize rare or recurrent events involved in the leukemogenesis process. Through the analysis of pre-B ALLs, I have been able to identify several rare driver genes which had never been associated to ALL before (ACD, DOT1L, HCFC1). The functional study of the identified mutation in ACD, a member of the shelterin complex, showed a concomitant lengthening of the telomeres and decreased apoptosis levels in leukemia cells. Besides the interest aroused by the discovery of these new drivers, I wanted to demonstrate the importance of low-frequency somatic events to establish the generally underestimated interindividual specificity and identify all cellular functions involved. During this work, I also identified new recurrent driver events in T-cell ALL (T-ALL), particularly among poorly characterized immature T-ALL patients. For example, I demonstrated the impact of a recurrent mutation in U2AF1, member of the spliceosome, on alternative splicing of cancer-relevant genes, further suggesting the importance of aberrant splicing in leukemogenesis. I also identified two new X-linked tumor suppressors, MED12 and USP9X, never associated to T-ALL before and obtained results supporting a potential role for these genes in the male-biased sex ratio observed in T-ALL (ratio male:female =1.22). Finally, through the longitudinal study of pre-B cALLs who suffered one or multiple relapses, I analyzed the clonal architecture and evolution of the tumors. I identified two distinct evolution patterns governing either early or late relapses: on one hand a highly dynamic pattern, sustained by a defect of DNA repair processes, illustrating the quick emergence of fitter clones - and on the other hand, a quasi-inert evolution pattern suggesting the escape from dormancy of neoplastic stem cells likely spared from initial cytoreductive therapy. Overall, this thesis contributed to the characterization of genomic determinants that constitute the inter- and intra-tumor variability, participate in leukemogenesis and/or in resistance mechanisms. This new knowledge will contribute to refine patient stratification and treatment.

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Labonté, Jennifer. "Optimisation de l'évaluation de l'aptitude physique des survivants de leucémie lymphoblastique aiguë". Thèse, 2019. http://hdl.handle.net/1866/23646.

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Resumen

Introduction : Le Test de Marche de 6 Minutes (6MWT) est le test le plus utilisé chez les patients atteints de cancer, évaluant la capacité fonctionnelle, tout en demeurant simple, sécuritaire et standardisé. Toutefois, aucune équation actuelle ne peut prédire la consommation maximale d’oxygène ("V" ̇O2 max) chez les survivants de cancer. Ainsi, l’objectif principal est de valider une équation spécifique pour prédire le "V" ̇O2 max à partir du 6MWT, alors que le second est de valider une équation spécifique pour prédire la distance de marche (6MWD) à partir du 6MWT. Méthodes : Au total, 250 survivants d’au moins cinq ans de la leucémie lymphoblastique aigüe (LLA) (n=80 femmes (48%); n=88 hommes (52%)) avec un âge moyen de 22 ans (22.2 ± 6.3) ont été recrutés. Parmi ceux-ci, 168 survivants ont réalisé un 6MWT ainsi qu’un test d’effort maximal sur ergocycle pour évaluer respectivement leur capacité fonctionnelle et leur fonction cardiorespiratoire. Une évaluation de leur pratique d’activités physiques a été réalisée par questionnaire. Les survivants ont ensuite été randomisés en deux groupes : le premier (n=118 (70%)) pour créer les équations et le deuxième groupe (n=50 (30%)) pour valider les équations créées. Des régressions linéaires multiples ont été réalisées pour prédire chacune des équations ("V" ̇O2 max et 6MWD) à partir du 6MWT. Les variables incluses dans les équations comprenaient l’âge, le poids, la taille, la fréquence cardiaque à la fin du test (FCfin), la distance de marche effectuée (6MWD), le niveau de la pratique d’activités physiques (MVLPA), la perception d’effort (EPE) ainsi que la durée des traitements (DT). La méthode de Bland et Altman a été utilisée pour valider chacune des équations en déterminant les différences moyennes et en comparant nos équations avec des équations de références. Résultats : Équation spécifique "V" ̇O2 max (différence moyenne = 2.51mL.kg-1.min-1) = (-0,236 * âge(années)) - (0,094 * poids(kg)) - (0,120 * FCfin(bpm)) + (0,067 * 6MWD(mètres)) + (0,065 * MVLPA(min/jour)) - (0,204 * DT(années)) + 25,145 ; R2=0.61. Équation spécifique 6MWD (différence moyenne = 10.86 mètres) = (3,948 * taille(cm)) - (1,223 * poids(kg)) + (1,913 * FCfin(bpm)) - (6,863 * EPE(/10)) + (0,556 * MVLPA(min/jour)) - 242,241 ; R2=0.36. Conclusion : Il s’agit de la première étude qui prédit le "V" ̇O2 max et la 6MWD en utilisant des variables cliniques et spécifiques des survivants de LLA. Nos résultats permettent d’évaluer la capacité cardiorespiratoire des survivants de LLA et facilitera leur suivi.
Introduction: In cancer patients, the 6-Minute Walking Test (6MWT) is the most widely used test because it can assess the functional capacity in patients, while remaining simple, safe and standardized. However, it is reported that the actual equations cannot accurately predict a valid "V" ̇O2 peak value or a 6-minute walk distance (6MWD) in cancer survivors. Thus, the first aim is to validate a specific equation using the 6MWT to predict "V" ̇O2peak, while the second is to validate a specific equation to predict walk distance during 6MWT. Methods: A total of 250 childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL) survivors were enrolled in this study, among which 168 participants aged 22 years on average (22.2 ± 6.3) (n=80 females (48%); n=88 males (52%)) underwent a cardiopulmonary exercise test (CPET) and a 6MWT to assess their functional capacity and their cardiorespiratory fitness. Additionally, participants completed a physical activity questionnaire. Participants were randomly divided in two groups to create (n=118 (70%)) and to validate (n=50 (30%)) the equations. Multiple linear regression analyses were used to determine a new prediction equation for "V" ̇O2 peak and 6MWD from 6MWT. The validity in between the measured and predicted "V" ̇O2 peak and between the measured and predicted 6MWD was assessed using the Bland and Altman method. Results: Specific "V" ̇O2 peak equation (mean of bias=2.51mL.kg-1.min-1) = (-0.236*age(years)) - (0.094*weight(kg)) - (0.120*HR end(bpm)) + (0.067*6MWD(meters)) + (0.065*MVLPA(min/day)) - (0.204*DT(years)) + 25.145. Specific 6MWD equation (mean of bias=10.86meters) = (3.948*height(cm)) - (1.223*weight(kg)) + (1.913*HR end(bpm)) - (6.863*RPE) + (0.556*MVLPA(min/day)) - 242.241 Conclusion: This is the first study that predicted "V" ̇O2 peak and 6MWD using clinical and specific variables related to the disease from a 6MWT in childhood ALL survivors. It refines an already available tool that will strengthen an objective evaluation of the patient.

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Jimenez, Cortes Camille. "L’implication de la peptide-déformylase (PDF) dans la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant". Thèse, 2017. http://hdl.handle.net/1866/21356.

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Bérard, Sophie. "Qualité nutritionnelle et santé cardiométabolique chez les survivants de la leucémie lymphoblastique aiguë". Thesis, 2020. http://hdl.handle.net/1866/24722.

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Resumen

Contexte. Bien qu'il s'agisse d'une population à haut risque, il existe peu d'informations sur la manière dont l'alimentation peut influencer la santé cardiométabolique des survivants de la leucémie lymphoblastique aiguë (LLA) chez les enfants. Objectifs. Cette étude vise à explorer les associations entre l'indice de la qualité de la diète et les indicateurs de santé cardiométabolique dans cette population. Méthodologie. Les participants ont été recrutés dans le cadre de l'étude PETALE (n=241, 49,4% d'hommes ; âge médian : 21,7 ans). L'adhérence à 6 scores alimentaires a été calculée : MEDAS (14-point Mediterranean Diet Adherence Screener), KIDMED (Mediterranean Diet Quality Index for Children and Adolescents), HDI-2018 (Healthy Diet Indicator), HEI-2015 (Health Eating Index), E-DII (Energy Adjusted Dietary Inflammatory Index) et FRAP (ferric-reducing antioxidant potential). L'apport calorique des aliments ultra-transformés a été déterminé selon la classification NOVA. Des régressions logistiques multivariées, des tests t de Student et des tests de Mann-Whitney ont évalué les associations entre l’alimentation, les issues de santé cardiométabolique et inflammatoire. Résultats. Nous avons constaté que 88 % des adultes et 46 % des enfants adhèrent peu à la diète méditerranéenne. En effet, moins du quart des adultes consommaient au moins 3 portions de légumineuses ou de poisson par semaine, alors que plus du tiers des enfants mangeaient des pâtisseries telles que des chocolatines au déjeuner et 96% d’entre eux prenaient des bonbons régulièrement. 36,9 % avaient une mauvaise adhérence aux recommandations de l'OMS, où l’on a observé un apport excédant 2g de sodium par jour chez plus de 95% de tous les participants. 76,3 % avaient une alimentation pouvant être améliorée selon le score HEI-2015, lequel a démontré que les survivants de notre cohorte consommaient en moyenne 7 portions de produits céréaliers raffinés par jour ainsi qu’un apport quotidien en sucres libres atteignant 15% de l’énergie totale. En moyenne, les aliments ultra-transformés représentaient 51% de l'apport énergétique total. Un faible taux de HDL-C était associé à une alimentation plus inflammatoire (score E-DII) et à une consommation plus importante d'aliments ultra-transformés. Un score E-DII plus élevé était associé à indice HOMA-IR plus élevé et une consommation plus importante d'aliments ultra-transformés a été associée à des taux plus élevés de triglycérides. Les participants ayant une meilleure adhérence au score HEI-2015 avaient des niveaux de TNF-α circulant plus faibles. Les niveaux d'adiponectine étaient plus élevés chez ceux qui avaient une meilleure adhérence à la diète méditerranéenne. Conclusion. Les survivants de la LLA ont une faible adhérence aux recommandations nutritionnelles, ce qui pourrait affecter négativement leur santé cardiométabolique et leur statut inflammatoire.
Context. Although they are a high-risk population, there is little information about how diet may influence the cardiometabolic health of childhood acute lymphoblastic leukemia (cALL) survivors. Objectives. This study aims to explore the associations between diet quality index and cardiometabolic health indicators in this population. Methodology. Participants were recruited as part of the PETALE study (n=241, 49.4% males; median age: 21.7 years). Adherence to 6 dietary scores were calculated: MEDAS (14-point Mediterranean Diet Adherence Screener), KIDMED (Mediterranean Diet Quality Index for Children and Adolescents), HDI-2018 (Healthy Diet Indicator), HEI-2015 (Health Eating Index), E-DII (Energy Adjusted Dietary Inflammatory Index) and FRAP (ferric-reducing antioxidant potential). Caloric intake from ultra-processed foods was determined based on the NOVA Classification. Multivariate logistic regressions, Student t-tests and Mann-Whitney tests evaluated the associations between diet, cardiometabolic and inflammatory outcomes. Results. We found that 88% of adults and 46% of children adhered poorly to the Mediterranean diet. In fact, less than a quarter of adults consumed at least 3 servings of legumes or fish per week, while more than a third of children ate pastries such as chocolate croissant at breakfast and 96% of them took sweets regularly. Also, 36.9% had poor adherence to the WHO recommendations, where more than 95% of all participants had a sodium consumption exceeding 2g per day. 76.3% had a diet to be improved according to the HEI-2015 score, which showed that the survivors of our cohort consumed an average of 7 servings of refined grain products per day and a daily intake of free sugars of up to 15% of total energy. On average, ultra-processed foods accounted for 51% of total energy intake. Having low HDL-C was associated with a more inflammatory diet (E-DII score) and higher consumption of ultra-processed foods. A higher E-DII score was associated with elevated HOMA-IR and consumption of ultra-processed foods with having high triglycerides. Participants with a better adherence to the HEI-2015 score had lower levels of circulating TNF-α. Adiponectin levels were higher in those who better adhered to the Mediterranean diet. Conclusion. Survivors of cALL have poor adherence to dietary recommendations, negatively affecting their cardiometabolic health and inflammatory status.

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Tesis sobre el tema "Leucémie aiguë lymphoblastique B"

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