Tesis sobre el tema "Effet de position télomérique"

Notre laboratoire s’intéresse depuis de nombreuses années à l’implication des télomères en pathologie humaine. Les télomères sont des structures nucléoprotéiques présentes aux extrémités des chromosomes. Ils jouent un rôle important dans le bon fonctionnement et la durée de vie des cellules, et ils nécessitent, de ce fait, une régulation et une protection stricte. De plus, dans différents organismes, les télomères sont associés à la répression des gènes proximaux. Ce phénomène épigénétique appelé effet de position télomérique (TPE) implique la propagation d’une structure chromatinienne répressive. Très étudié chez S. Cerevisiae, cet effet a aussi été démontré chez l’homme et dépend de protéines télomériques et de remodelages chromatiniens. Ainsi, le traitement des cellules humaines par des agents modifiant l’architecture chromatinienne tels que l’inhibiteur des histones déacetylases, la Trichostatine A, permet de lever le TPE et d’induire l’expression d’un gène en position subtélomérique. En revanche, la 5-aza-2’-deoxycytidine, un inhibiteur de la méthylation de l’ADN, n’abroge pas ce type de silencing suggérant l’implication de modifications spécifiques de ces régions dont l’organisation nucléosomale est particulière. Afin d’identifier de nouveaux composant chimiques capables d’inhiber les effets de position télomériques dans les cellules humaines, nous avons effectué le criblage d’une banque de molécules bioactives «Prestwick Chemical Library » sur la plateforme du Centre pour les Molécules Bioactives (CMBA) au CEA de Grenoble. Les criblages primaires et secondaires de cette chimiothèque ont permis à nos collaborateurs de nous livrer une liste de 15 touches confirmées, inhibitrices de la répression transcriptionnelle dépendante des télomères et observée expérimentalement grâce au gène rapporteur de la luciférase. Après avoir testé l’ensemble de ces molécules dans notre laboratoire, deux polyphénols (Acacetine et Chrysine) étaient capables de lever spécifiquement le TPE sans modifier l’expression du gène rapporteur placé hors contrôle télomérique. Nous nous sommes dès lors demandé à quel niveau ces deux molécules agissent sur le TPE (raccourcissement ou prolongement des tailles des télomères, perte ou gain de protéines associées aux télomères et/ou création ou pas d’un dysfonctionnement télomérique). L’ensemble de ces analyses a montré que le traitement des cellules humaines avec ces deux molécules est accompagné par un raccourcissement de la taille des télomères, un dysfonctionnement télomérique et la création de fusion entre chromatides sœurs. La découverte de ces molécules ouvre de nouvelles perspectives sur le traitement des maladies associées à des mécanismes télomériques, le cancer mais aussi des maladies rares comme la dystrophie facio-scapulo-Humérale, dont nous avons parallèlement étudié les mécanismes moléculaires
Telomeres are protective structures present at the ends of linear chromosomes and consist of simple repeated DNA sequences and specialized proteins. They are essential for the stable maintenance of eukaryotic chromosomes and they can regulate the lifespan of cells. In addition to their essential functions, telomeres are, in diverse organisms, specialized sites with regard to gene expression. Indeed, the transcription of genes located next to telomeres is repressed: this phenomenon was termed telomere position effect (TPE). As observed in the yeast, S. Cerevisiae -where TPE is best characterized- TPE in human cells depends of both telomere length and architecture. The treatment of cells with Trichostatin A, an inhibitor of class I and II histone deacetylases antagonizes TPE while treating the cells with 5-aza-2’-deoxycytidin, a demethylating agent, has no apparent effect on telomeric repression. Overall, position effects at human chromosome ends are dependent on a specific higher-order organization of the telomeric chromatin. In order to identify new molecules able to modulate TPE in human cells, we carried out the screening of the «Prestwick Chemical Library », a bank of bioactive molecules, on the CMBA-CEA platform in Grenoble. A total of 15 molecules were identified as anti-TPE factors after primary and secondary screening based on the increase in fluorescence measurement. After testing all of these molecules in our laboratory, two polyphenols, Acacetin and Chrysin, were retained as potent inhibitors of TPE and further characterized as drugs targeting telomeres specifically. We then asked whether TPE reversal was dependent on telomere length. The incubation in the presence of Acacetin and Chrysin affects telomere length suggesting that increased expression of the subtelomeric reporters is associated with a shortening of telomeres. To check whether these molecules revert telomeric silencing, by affecting telomere integrity, we analyzed chromosome stability in cells treated with Acacetin or Chrysin. The two molecules exhibit a rapid increase in the frequency of telomere induced DNA damage foci, suggesting that these drugs trigger telomeric dysfunction. Drug treatment also significantly increases the frequency of telomeric abnormalities observed in metaphase with a significant increase of end-to-end fusions between sisters chromatid. The discovery of these new compounds targeting specifically chromosome ends opens new avenue for the targeted treatment of diseases linked to telomeric pathways such as cancer but also rare diseases such as Facio-Scapulo-Humeral dystrophy for which we investigated the molecular mechanisms

Les télomères sont des structures nucléoprotéiques, localisés à l’extrémité de l’ADN des cellules eucaryotes, qui préservent l’intégrité des chromosomes. Ces structures subissent des changements au cours du développement et du vieillissement, comme un raccourcissement de leurs tailles ou une altération dans leur composition en protéines (notamment le complexe shelterin). Cependant, les télomères n’ont pas qu’une fonction protectrice et peuvent aussi réguler l’expression des gènes présent dans les régions adjacentes, i.e. subtélomères, voir plus distantes. Ce processus est connu comme l’Effet de Position Télomérique (TPE), découvert initialement chez la levure Saccaromyces cerevisiae, puis chez la drosophile et Schizosaccharomyces pombe et plus récemment chez l’humain. Dans ces organismes, les gènes situés en position subtélomérique sont réprimés par un mécanisme épigénétique qui est dépendant de la taille des télomères et des protéines les composant ainsi que des structures tridimensionnelles adoptées par la chromatine télomérique et subtélomérique. Le TPE peut être décrit comme un mécanisme de propagation de l’hétérochromatine, du télomère vers le centromère, accompagné de boucle de chromatine permettant d’étendre la répression de la transcription dans des régions plus interne.Dans ce contexte, le but de ma thèse est de déterminer l’impact des télomères sur les changements transcriptionnels observés lors de la sénescence cellulaire. A cette fin, nous avons séquencé les ARNm de fibroblastes de poumon (MRC-5) jeunes et sénescents (RNAseq). Nous avons observé un enrichissement subtelomérique des gènes dont l’expression est augmentée en sénescence. Ce résultat suggère une levée de la répression induite par le TPE à la sénescence. Cette dérépression ne concerne que certains gènes et certains subtélomères.Nous avons aussi testé l’hypothèse que les protéines shelterin puissent prendre part au TPE, notamment TRF2 (Telomeric Repeat Binding Factor 2) dont l’expression est diminuée à la senescence. Nous avons donc augmenté le niveau d’expression de TRF2 dans les cellules sénescentes. Ainsi, nous avons pu observer que TRF2 modulait l’expression de certains gènes subtélomériques dans les cellules sénescentes. Par 3D-FISH, nous avons montré que cet effet de TRF2 s’accompagnait d’un remodelage spatial des subtélomères.Dans son ensemble, ce travail révèle la contribution des télomères au programme transcriptionnel des cellules sénescentes et jette ainsi les bases de l’importance du TPE dans le processus de la senescence
Telomeres, the nucleoprotein structures located at the end of eukaryotic DNA, protect chromosomal integrity. These structures undergo changes during development and aging, including length shortening and alterations in the levels of the proteins associated to them called sheltering, all this affecting genome stability as the cells age. However, telomeres also behave as transcriptional regulators acting not only on genes present at subtelomeres but also on more distantly located genes presented throughout the genome. This process is referred as Telomere Position Effect (TPE) and was initially discovered in budding yeast, but also seen in drosophila, fission yeast, plasmodium and more recently in humans. In all these organisms, genes located in the subtelomeres are repressed by an epigenetic mechanism that is dependent on telomere DNA length, telomere nucleoprotein composition and higher order chromatin organization adopted by telomeres and subtelomeres. The TPE mechanism can be described as the spreading of a heterochromatin-like structure toward the centromere most likely accompanied by the formation of large chromatin loops to further extend the transcriptional regulation emanating from a telomere to genes internally located.In this context, the goal of my thesis is to decipher whether telomeres are involved in the transcriptional remodelling occurring in human cellular senescence. For that, we performed RNA-sequencing in young versus replicative senescent lung fibroblast MRC-5 cells. Interestingly, we found an enrichment of upregulated genes in the subtelomeric regions of senescent cells suggesting a TPE alleviation. This alleviation is not homogeneous in the genome, as only some subtelomeres were enriched in upregulated genes at senescence.Finally, we tested the hypothesis that shelterin proteins may also be part of the TPE regulation. For that, we re-stored the levels of the shelterin protein TRF2 (Telomeric Repeat Binding Factor 2) whose expression is decreased as the cells approach senescence. We found that TRF2 is indeed modulating the expression of subtelomeric genes in senescent cells, and this is in part mediated by a long-range chromatin reorganization of subtelomeres as observed by conformation changes in 3D chromatin conformation by FISH.Overall, this work reveals the contribution of telomeres in the transcriptional program of senescent cells and set the basis for the relevance of TPE in the senescence/aging process

La localisation des objets dans l'espace est l'une des fonctions centrales du système visuel. Lorsqu'un observateur ou une cible se déplace, le mouvement de l’œil ou de l'objet peut être pris en compte pour calculer la position de l'objet à n'importe quel moment. Il a été démontré à plusieurs reprises que le mouvement visuel peut fortement influencer la position perçue d'un objet. Par exemple, la position d'un stimulus contenant une texture en mouvement (De Valois & De Valois, 1991; Ramachandran & Anstis, 1990), celle d'un flash présenté sur (Cavanagh & Anstis, 2013) ou à côté (Whitney & Cavanagh, 2000) d'une texture en mouvement, et même les positions d'apparition et de disparition d'objets en mouvement (Fröhlich, 1923) sont perçus comme étant déplacées dans le sens du mouvement. Dans le cadre de cette thèse, nous avons exploré la relation entre ces changements de position provoqués par le mouvement et différentes formes d'attention visuelle: 1) l'attention spatiale temporaire, 2) l'attention globale et locale, 3) l'attention spatiale maintenue, et 4) l'attention centrée sur les objets. Dans une première série d'expériences, nous avons étudié dans quelle mesure et de quelle manière l'attention module l'effet Fröhlich (i.e la position perçue du début du mouvement est déplacée dans le sens du mouvement). Dans les expériences 1 et 2, nous avons mesuré l'effet Fröhlich dans différentes conditions de d'indiçage et nous avons montré que les indices non valides ou tardifs entraînent des déplacements perceptifs plus importants. Dans l'expérience 3, nous avons comparé les déplacements provoqués par le mouvement lorsque les sujets portaient leur attention sur un ensemble d'objets en mouvement qui formaient un groupe à quand ils portaient leur attention à un seul stimulus parmi cet ensemble. Les résultats montrent que l'effet Fröhlich n'était présent que lorsque l'attention sélectionne un seul objet et qu'il disparaît lorsque le stimulus est perçu dans un contexte de groupe (global). Ainsi, ces résultats suggèrent que l'attention sélective est à la fois à l'origine de et module l'effet Fröhlich. Ayant établi que les délais temporels de l'attention augmentent les changements de la position provoqués par le mouvement, l'étude suivante était conçue pour explorer si la distribution spatiale de l'attention a le même effet. Dans cette étude, nous avons utilisé le « flash grab » - un changement de position illusoire aperçu quand une cible est brièvement présentée brièvement sur un fond en mouvement au moment de l'inversion du sens du mouvement (Cavanagh & Anstis, 2013). Les essais étaient regroupés en différents blocks au début desquels un indice indiquait la région de l'espace dans laquelle la cible était susceptible d'apparaître. Nos résultats mettent en évidence une diminution du flash-grab quand la distribution spatiale des cibles était limitée à une plage de 90° ou moins. Dans la dernière étude, nous nous sommes demandés si l'effet du mouvement sur la position perçue affecte l'objet dans son ensemble ou si il affecte les caractéristiques distinctes d'un même objet indépendamment les uns des autres. Pour cela nous avons utilisé le paradigme flash grab en présentant brièvement une forme sur un fond en mouvement au moment de l'inversion du sens du mouvement. Les résultats indiquent que les attributs de la cible orthogonaux au mouvement du fond étaient déplacés, alors que les attributs parallèles au mouvement restaient intacts. Ceci suggère que le mouvement interagit avec la position des attributs de l'objet (et que l'attention focale sélectionne) avant que ces attributs ne soient regroupés en un objet. En conclusion, nous avons utilisé une variété de manipulations attentionnelles à des changements de position provoqués par le mouvement pour étudier le lien entre l'amplitude de l'illusion et les caractéristiques attentionnelles utilisé
Localizing objects in space is one of the central functions of the visual system. When an observer or a target is moving, the motion of the eye or the object can be taken into account to compute the current object locations. It has been shown many times that visual motion can strongly influence the perceived position of an object. For example, a stationary patch containing moving texture (De Valois & De Valois, 199; Ramachandran & Anstis, 1990), a flash presented on (Cavanagh & Anstis, 2013) or next to (Whitney & Cavanagh, 2000) a moving texture, and even the onset and offset positions of the moving targets (Fröhlich, 1923) are perceived as shifted in the direction of motion. In this thesis we explore the relationship between these motion-induced position shifts and visual attention in the following forms: 1) transient spatial attention, 2) global and local attention, 3) sustained spatial attention, and 4) object-based attention. In the first series of experiments we looked at whether and how attention modulates the shift in localization of motion onset (Fröhlich effect). In Experiments 1 and 2 we measured Fröhlich effect under different cueing conditions and established that invalid or late cues produced larger perceptual shifts. In Experiment 3 we compare the motion-induced shifts when the subjects attended to a set of moving stimuli as a group and when they attended to an orientation singleton. We showed that the Fröhlich effect was only present when the target was individuated and disappeared when the stimulus was perceived globally. Thus, the Fröhlich effect appeared to be both produced and modulated by focal attention. Having established that temporal delays of attention increase motion-induced position shifts, the next study explored if spatial distribution of attention has a similar effect. In this study we used flash grab - an illusory position shift seen when a target is briefly flashed on top of a moving background that abruptly changes direction (Cavanagh & Anstis, 2013). Trials were presented in blocks and before each block a cue indicated a range of possible target locations. We found that the flash grab was reduced if the spatial distribution of targets was limited to a range of 90° or less. The final study asked whether motion shifts the perceived position of an object as a whole or if separate features of a single object are shifted independently. To test this we used the flash grab paradigm and briefly presented a shape on top of a moving background at the moment it changed direction. The results showed that the features of the target that were orthogonal to the background motion were shifted, whereas the features parallel to the motion were intact. This suggests that motion interacts with the position of the object's features (and focal attention selects them) before they are bound together into an object. In conclusion, we applied a variety of attentional manipulations to motion-induced position shifts, and examined the link between the strength of the illusion and the characteristics of attention used in a particular task. We found that 1) motion-induced position shifts require focused attention and the possibility to track an individual motion trajectory; 2) allowing attention to be allocated more efficiently in space reduces the illusion; and 3) motion-induced shifts operate on the feature-based and not object-based level

Les transistors organiques à effet de champ (OFETs) dans lesquels le transport des charges se fait à travers un film mince de molécules organiques représentent une transformation de la technologie des transistors à effet de champ au regard de la technologie au silicium. Ils permettent notamment d’envisager le développement d’une électronique flexible à bas coût. Ce travail porte sur la synthèse, l’étude et l’utilisation en tant que couche active dans des OFETs de type n de couples d’isomères para- et méta-indacénodithiophènes (para- et méta-IDT) appauvris en électrons inédits. Une introduction aux OFETs de type n est tout d’abord présentée. Elle est suivie par la présentation de la synthèse des dérivés IDT et de l’analyse comparée de leurs propriétés physico-chimiques. La fabrication des OFETs, leur caractérisation et l’optimisation de leur architecture est enfin décrite, leurs performances montrant l’intérêt des IDTs pour les OFETs de type n. Différentes fonctionnalisations menant à des IDTs d’architecture 3π-2spiro sont également synthétisées afin d’étudier les propriétés intrinsèques de ces dérivés π-conjugués et d’envisager leur incorporation comme matrice hôte dans des diodes électrophosphorescentes organiques
Organic Field Effect Transistors (OFETs), in which the charge transport is carried through a thin film made of organic molecules represent a transformation of the FET technology regarding that based on Silicon. They offer in particular the possibility to manufacture low cost flexible electronics. This work is focused on the synthesis, the study and the use as active layer in n-type OFETs of novel, electron poor, couples of para- and meta-indacenodithiophenes isomers (para- and meta-IDT). First of all, an introduction to the field of n-type OFETs is presented, followed by the presentation of the synthesis of the IDT derivatives and the comparative analysis of their properties. Finally, the fabrication of the OFETs, their characterization and the optimization of their architecture is described. The performances recorded attest that these derivatives are of great interest for the n-type OFETs. Different 3π-2spiro IDT derivatives are also presented in order to study the IDTs intrinsic properties and to envisage their incorporation as host in phosphorescent organic light-emitting diodes

L'objet de ce travail est de contrôler la position et la vitesse d'une masse en mouvement avec une exactitude nanométrique sur une course de 80 mm. Pour la vitesse l'objectif fixé est d'obtenir une stabilité de 10-9 en valeur relative. L'application essentielle est la balance du watt du Bureau National de Métrologie. Une méthode originale a été développée et mise en œuvre, basée sur l'utilisation d'un interféromètre de Michelson hétérodyne et une électronique haute fréquence. Le système interférométrique est associé à un système mécanique de translation double étage constitué d'un moteur linéaire et d'un actionneur piézo-électrique. Des déplacements de 4,945 nm sont contrôlés et mesurés avec des répétabilités et des exactitudes inférieures au nanomètre. Les résultats montrent qu'une incertitude relative sur la vitesse de 10-9 peut être atteinte
The aim of this work is to control the position and the velocity of a moving mass with a nanometric accuracy on a translation range of 80 mm. For the velocity, the objective is to obtain a stability of 10-9 in relative value. The essential application is the watt balance of the Bureau National de Métrologie. A novel method was developed and implemented, based on the use of both a heterodyne Michelson's interferometer and a home made electronic circuit. The interferometric system is associated to a mechanical system of double translation stages made up of a linear stage and a piezoelectric actuator. Displacement of 4. 945 nm was controlled and measured with repeatabilities and accuracies less than the nanometer. Results show that relative uncertainty of 10-9 on velocity can be reached

Ce travail présente une voie de synthèse courte d'androst-5-ènes modifiés au niveau de la position 11, peu réactive. Elle consiste premièrement en une addition de dérivés organométalliques (lithiens, magnésiens) à la cétone encombrée et énolisable libre de l'adrénostérone commerciale protégée. Cette addition se produit de préférence dans un solvant apolaire et ce résultat a été étendu à d'autres cétones encombrées et énolisables. Deuxièmement, des alcools tertiaires encombrés, découlant de cette première étape, ont été déoxygénés par voie radicalaire. Cette méthode ouvre la voie, pour la première fois et avec des rendements raisonnables, à des 11a et 11b-allyl-testostérones notamment. Cette séquence addition/déoxygénation est applicable au cas de dérivés aryles, alkyles, allyles et éthynyles. Finalement, la 11b-hydroxyméthyl-testostérone a été préparée par hydroboration-oxydation d'un dérivé 11-méthylidèn-androst-5-ène. Ce précurseur a été obtenu avec un excellent rendement par la réaction de Peterson. La voie de synthèse choisie a été ainsi menée à terme avec la préparation d'une première série de testostérones modifiées en 11 utilisables pour l'étude de leurs relations structure/activité. Ce travail a aussi été étendu à la chimie bioorganométallique.

La reconnaissance visuelle de séquences de lettres implique un traitement orthographique qui peut être décomposé en trois phases activées en parallèle et de façon interactive : le traitement des traits visuels, le traitement des lettres et le traitement des séquences de lettres. L'influence des connaissances lexicales sur l'identification de lettres a souvent été mise en évidence par l'effet de supériorité du mot : une lettre étant mieux reconnue quand elle est présentée dans un mot que dans un non- mot ou isolément. L'un des objectifs de ce travail était de voir à quelle(s) phase(s) du traitement ces influences lexicales interviennent durant l'acquisition de la lecture. Pour ce faire, la technique des potentiels évoqués a été utilisée chez des enfants normo-lecteurs et dyslexiques dans une tâche d'identification de lettre présentée dans un mot ou un non-mot. Par ailleurs, il est admis par de nombreux auteurs que dans les langues alphabétiques et avec un sens de lecture de gauche à droite, les mots sont mieux reconnus quand ils sont fixés légèrement à gauche de leur centre. Cet effet de position optimale a également été étudié dans notre protocole afin de voir si les influences lexicales intervenaient quelque soit la position de la lettre dans le mot. Nos résultats comportementaux révèlent un effet de supériorité du mot uniquement chez les enfants normo-lecteurs reflétant l'intervention des connaissances lexicales. Nous postulons dès lors que les dyslexiques pourraient souffrir d'un déficit d'effet " top-down " lexical. Les analyses en fonction de la position ne montre pas l'effet de position optimale attendu. On observe des résultats similaires dans les deux groupes avec un gradient de performances diminuant de la première à la cinquième position qui pourrait s'expliquer par un traitement sériel et automatisé des stimuli de la gauche vers la droite et ce quelque soit le point de fixation. En potentiels évoqués, les premières différences entre mots et non-mots sont observées sur l'onde N2 reflétant le traitement lexical et elles s'observent pour les 2 groupes d’enfants. L'absence d'effet lexical sur l'onde N170 est en désaccord avec l'hypothèse d'une influence des représentations lexicales en mémoire sur l'identification de lettres à un niveau pré-lexical
Orthographic processes that take place during visual recognition of letter sequences can be dissociated into three different stages activated in an interactive and parallel manner : visual feature analysis, letter processing and letter sequence processing. The lexical influences on letter identification have often been observed with the well-known Word Superiority Effect : a letter is better identified when presented in words than in non-words or in isolation. One aim of this study was to understand which processing stages are influenced by lexical knowledge during reading acquisition. To do this, we performed an Event-Related Potential study with dyslexic children and typically achieving ones. The task consists in identifying a letter presented in a word or a non-word. Furthermore, it is well accepted that, in alphabetic and left-to-right languages, words are better identified when fixated slightly left of the center. Our task was designed in such a way that we were able to study this Optimal Viewing Position. The aim was to analyse if the lexical influences intervene in the same manner for all position in the word. Our behavioral results show a Word Superiority Effect only for typically achieving children suggesting influences of the lexical knowledge for them. We hypothesise that dyslexics present a deficit on these "top-down" lexical influences. Analyses based on the position do not show the Optimal Viewing Position expected. The results are similar in both groups with a diminution of the performance between the first and the last position. It suggests a serial and automatic processing of the stimuli from left to right whatever the fixation point. The firsts ERPs differences between words and non-words appears on the N2 reflecting the lexical processing and the same effect is shown in both groups. The lack of effect on the N170 is in disagreement with the hypothesis of lexical influences on letter identification at a pre-lexical level

Ce travail concerne l'étude des collisions entre des ions multichargés et des cibles atomiques neutres, a des énergies de l'ordre de 10 kev. Plus particulièrement, l'attention est focalisée sur les processus au cours desquels plusieurs électrons sont échangés entre la cible et le projectile. La méthode expérimentale utilise une technique de mesure multiparamétrique, basée sur une méthode de spectroscopie de gain d'énergie. Un analyseur électrostatique, muni d'un détecteur sensible à la position de l'impact dans les 2 directions horizontale et verticale, permet la mesure de la charge finale du projectile diffuse, son angle de déflection dans un plan vertical et le gain d'énergie de la réaction. Simultanément, une cellule d'extraction des cibles ionisées permet de déterminer en coïncidence les charges des ions de recul produits par les collisions. On obtient ainsi une description très complète du collisionnel. Une caractéristique importante des collisions impliquant des ions très charges est mise en évidence, à savoir la mesure de sections efficaces non négligeables pour des processus ou 6 ou même 7 électrons sont transférés de la cible vers l'ion incident. La mesure des distributions angulaires des projectiles indique clairement que plus le nombre d'électrons transférés est important, plus les processus correspondent à des trajectoires a petits paramètres d'impact. L'ensemble des résultats expérimentaux est discuté dans le cadre du modèle moléculaire de la barrière coulombienne. La comparaison avec les mesures permet une étude critique des prédictions de ce modèle

Plusieurs arguments théoriques et expérimentaux indiquent que l’intervention de signaux oculomoteurs est nécessaire aux différentes étapes allant de la perception visuelle à l’élaboration de mouvements. Les systèmes visuel et moteur utilisant des systèmes de coordonnées différents, l’élaboration de comportements visuellement guidés implique plusieurs changements de coordonnées. L’un de ces changements concerne la conversion de l’image rétinienne de coordonnées rétinotopiques en coordonnées égocentriques en tenant compte de la position de l’œil. Les études effectuées chez l’animal ont révélé qu’il existe une influence de la position oculaire dans de nombreuses aires corticales. Toutefois, la question du rôle de l’aire visuelle primaire (V1) dans ce processus reste posée. Cette thèse avait pour objectif de déterminer s’il existe chez l'homme une prise en compte de la position oculaire dès V1, premier relais cortical du traitement visuel. Une première étude en potentiels évoqués (PE) visuels montre que l’amplitude de la composante C1 est modulée par la position oculaire, indiquant que l’activité précoce de V1 est modulée par la position oculaire. Cet effet sur l’activité de V1 a été confirmé par une étude en Imagerie par Résonance Magnétique fonctionnelle (IRMf), montrant également que seule l’activité évoquée de V1 est modulée. Enfin, cette même étude a été menée dans le cadre de la mise au point d’acquisitions simultanées IRMF/PE afin de bénéficier de la complémentarité des deux techniques. D’une manière générale cette thèse montre l’existence d’une prise en compte de la position oculaire dès le début du traitement visuel et expose l’utilité des études combinant IRMf et PE.

L'investissement et l'innovation jouent un rôle important dans le secteur agricole, permettant aux exploitations de s'adapter aux changements de politiques et aux conditions du marché. Au cours des dernières décennies, les exploitations agricoles de l'Union européenne (UE) ont été confrontées à des changements substantiels à travers la politique agricole commune (PAC). C'est notamment le cas du secteur laitier, qui a vu la fin du régime de quotas laitiers et également vu une volatilité accrue des prix. De tels changements pourraient affecter la productivité et l’efficacité des exploitations agricoles, la compétitivité du secteur laitier et les changements structurels. Comprendre les mécanismes sous-jacents au comportement d’investissement des exploitations pourrait permettre d’identifier les principaux facteurs qui influent sur les tendances observées. Cela pourrait aider à anticiper les futurs changements structurels, prévoir les besoins des exploitations et aider les décideurs publicet les autres acteurs du secteur agricole à adapter leurs politiques. La thèse contribue à cet objectif en analysant pour les exploitations laitières d'une sous-région de Bretagne (Ille-et-Vilaine) en France, (i) l'impact de la suppression du quota laitier sur les décisions d'investissement des agriculteurs et l'hétérogénéité de leurs réactions (ii) le lien entre la performance agricole et les décisions d'investissement des agriculteurs, (iii) le rôle des interactions sociales liées aux effets de voisinage sur la décision d'investissement des agriculteurs. Les résultats montrent que la fin
: Investment and innovation play an important role in the agricultural sector, allowing farms to adapt to policy changes and market condition changes. In the last decades, farms in the European Union (EU) have faced substantial changes in the Common Agricultural Policy (CAP). This is particularly the case of the dairy sector, which has seen the end of milk quota regime and increased price volatility. Such changes could affect farm productivity and efficiency, the dairy sector’s competitiveness and structural change. Understanding the mechanisms underlying farms’ investment behaviour could allow identifying key drivers that influence the observed trends. This could help anticipate future structural changes, predict farms’ needs and help policy makers and other stakeholders in farming to adapt their policy. The thesis contributes to this objective by analysing for dairy farms in a sub-region of Brittany (Ille-et-Vilaine) in France, (i) the impact of the termination of the milk quota onfarmers’ investment decisions and the heterogeneity of farm investment behaviour, (ii) the link between farm performance and farmers’ investment decisions, (iii) the role of social interactions related to neighbourhood effects on farmers' investment decision. Findings show that the termination of the dairy quota policy increased farmers’ incentive to invest, contributing to the trend towards larger, more capital intensive and more specialised dairy farms. In addition, the thesis underlines the need to take into account farmers’ heterogeneity in modelling investment behaviour. Doing so allows

OBJECTIF : Évaluer la présence d’un effet d’interaction entre les facteurs de risque posturaux et psychosociaux de l’environnement de travail sur la proportion d’incidence des troubles musculosquelettiques (TMS) au cou et aux épaules, au bas du dos, et aux membres supérieurs, selon le genre. MÉTHODES : Les participants, composant une cohorte de 2 431 cols blancs, ont répondu à un questionnaire auto-administré. Les facteurs de risque posturaux du travail au poste informatique, les facteurs de risque psychosociaux de l’environnement de travail ainsi que plusieurs facteurs socio-démographiques et individuels ont été mesurés par ce questionnaire. Les modèles de la tension au travail de Karasek et du déséquilibre efforts-reconnaissance de Siegrist ont été utilisés pour caractériser l’environnement psychosocial du travail. Après un suivi de trois ans, la proportion d’incidence des TMS a été évaluée pour chacun des trois sites anatomiques étudiés. La fraction étiologique due à l’interaction et son intervalle de confiance à 95% ont été utilisés comme indicateurs de la présence d’interaction dans le modèle additif. RÉSULTATS : Une interaction significative entre les facteurs de risque posturaux et psychosociaux selon le modèle de la tension au travail a été observée chez les hommes pour les TMS au bas du dos. Deux interactions significatives entre les facteurs de risque posturaux et psychosociaux selon le modèle du déséquilibre efforts-reconnaissance ont été observées chez les femmes pour les TMS aux sites du cou et des épaules et des membres supérieurs. Plusieurs indications (non significatives) de la présence d’interaction ont également été observées. CONCLUSION : Ces résultats suggèrent que la présence simultanée des facteurs de risque posturaux et psychosociaux étudiés accroît l’effet pathogène individuel de chacun de ces facteurs. Ces résultats sont des plus encourageants pour le domaine de la santé et sécurité au travail puisque cela implique que le fait de retirer un de ces deux facteurs de risque, selon ce qui est possible de modifier pour un poste de travail, aura l’effet bénéfique additionnel d’éliminer la proportion d’incidence des TMS due à l’interaction.
OBJECTIVE: To investigate interaction between psychosocial and postural work factors on the incidence of self-reported musculoskeletal symptoms among a group of white-collar workers. METHODS: Psychosocial and postural work factors were assessed in a cohort of 2,431 white-collar workers (baseline participation: 76%, follow up participation: 91%). The job strain (Karasek’s) model and the effort-reward (Siegrist’s) model were used to characterize the psychosocial work environment. Postural factors related to Visual Display Unit work were assessed using a self-report questionnaire. Three years later, the incidence proportion of musculoskeletal symptoms at three different anatomical sites (shoulder-neck, lower back, and upper limbs) was estimated with a modified version of the Nordic questionnaire. Analyses were stratified for gender. Interaction was defined as a departure from the addition of individual risk factors and its importance was estimated with the attributable proportion due to interaction and its 95% interval. RESULTS: A significant interaction between job strain and postural factors was observed for men for the lower back. Two significant interactions between effort-reward and postural factors were observed for women in the shoulder-neck and the upper limbs regions. Several indications of interaction between psychosocial and postural work factors were observed. CONCLUSION: The simultaneous presence of postural and psychosocial risk factors seems to increase the individual pathogenic effect of each risk factor on the incidence of musculoskeletal symptoms. This interaction effect is of primary importance for work intervention practices as it means that succeeding to reduce anyone of these two risk factors will likely have the additional benefit to reduce the interaction effect of the incidence proportion of musculoskeletal symptoms.
Inscrite au Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures

Des méthodologies innovantes semblent être nécessaires pour mieux détecter l'origine des polluants, et pour la compréhension des processus physiques impliqués dans leur évolution dans le milieu. En outre, il est indispensable de vérifier si le traitement conduit à une minéralisation complète (efficacité du nettoyage). La mesure isotopique est un outil fondamental pouvant être utilisé dans la gestion d'une pollution : confinement, propagation et possibilités de bioremédiation est proposée dans le projet ISOTO-POL. En illustration de ce principe, le MTBE, fréquemment détecté dans les zones aquifères, est donné comme exemple. Les isotopes stables ont été utilisés avec succès pour démontrer la biodégradation naturelle ou améliorée des hydrocarbures pétroliers et additifs dans le sol et les eaux souterraines. Jusqu'à présent, seul le fractionnement isotopique total en 13C a été exploité, en utilisant la teneur en isotope mesurée par spectrométrie de masse de rapport isotopique (irm-MS). Mais cela conduit à une perte d'information importante concernant le site de la molécule concerné par la transformation. En revanche, la spectrométrie RMN offre la capacité de mesurer, site par site les rapports 13C/12C, donnant accès à de nouvelles informations. La méthodologie RMN isotopique permettra de déterminer les effets isotopiques position-spécifiques impliqués dans les transformations physiques (volatilisation et migration), chimiques (hydrolyse et oxydation) ainsi que la dégradation par les microorganismes. La construction d’un modèle fournira un moyen unique permettant la détection et le traçage détaillé d'un polluant donné, mais également la détermination de son origine
Better methodologies appear to be necessary for detecting the origins of given pollutants, and for understanding the natural processes involved in their migration routes, biodegradation and eventual disappearance. In addition, it is essential to check whether treatment leads to complete mineralization or if cleaning of the polluted area is effective. Isotopic measurement is a fundamental tool that can be used in the management of a pollution to provide indicators as to containment, spread and bioremediation possibilities is proposed in the ISOTO-POL project. As a complete illustration of this principle, MTBE, which is frequently detected in surface and ground water, is given as an example. Stable isotopes have been used successfully to demonstrate the natural or enhanced biodegradation of petroleum hydrocarbons, solvents, and gasoline additives in soil and groundwater. So far, overall isotopic fractionation in 13C has been exploited, the isotope content being measured by isotope ratio mass spectrometry (irm-MS), but this leads to the loss of valuable position-related information. In contrast, NMR spectrometry offers the capability to measure position-specific 13C/12C ratios, giving new information. Isotopic NMR methodology will allow to determine position-specific isotope effects involved in physical transformations (volatilization and migration), chemical (hydrolysis and oxidation) as well as degradation by microorganisms. The construction of a model will provide a unique means to allow detailed detection and tracing of a given pollutant and the determination of its origin as well

Cette thèse est centralisée sur cette question : comment est-ce que le système visuel peut coder efficacement la position des objets en mouvement, en dépit des diverses sources d'incertitude ? Cette étude déploie une hypothèse sur la connaissance a priori de la cohérence temporelle du mouvement (Burgi et al 2000; Yuille and Grzywacz 1989). Nous avons ici étendu le cadre de modélisation précédemment proposé pour expliquer le problème de l'ouverture (Perrinet and Masson, 2012). C'est un cadre d'estimation de mouvement Bayésien mis en oeuvre par un filtrage particulaire, que l'on appelle la prévision basé sur le mouvement (MBP). Sur cette base, nous avons introduit une théorie du codage de position basée sur le mouvement, et étudié comment les mécanismes neuronaux codant la position instantanée de l'objet en mouvement pourraient être affectés par le signal de mouvement le long d'une trajectoire. Les résultats de cette thèse suggèrent que le codage de la position basé sur le mouvement peut constituer un calcul neuronal générique parmi toutes les étapes du système visuel. Cela peut en partie compenser les effets cumulatifs des délais neuronaux dans le codage de la position. En outre, il peut expliquer des changements de position basés sur le mouvement, comme par example, l'Effect de Saut de Flash. Comme un cas particulier, nous avons introduit le modèle de MBP diagonal et avons reproduit la réponse anticipée de populations de neurones dans l'aire cortical V1. Nos résultats indiquent qu'un codage en position efficace et robuste peut être fortement dépendant de l'intégration le long de la trajectoire
Coding the position of moving objects is an essential ability of the visual system in fulfilling precise and robust tracking tasks. This thesis is focalized upon this question: How does the visual system efficiently encode the position of moving objects, despite various sources of uncertainty? This study deploys the hypothesis that the visual systems uses prior knowledge on the temporal coherency of motion (Burgi et al 2000; Yuille and Grzywacz 1989). We implemented this prior by extending the modeling framework previously proposed to explain the aperture problem (Perrinet and Masson, 2012), so-called motion-based prediction (MBP). This model is a Bayesian motion estimation framework implemented by particle filtering. Based on that, we have introduced a theory on motion-based position coding, to investigate how neural mechanisms encoding the instantaneous position of moving objects might be affected by motion. Results of this thesis suggest that motion-based position coding might be a generic neural computation among all stages of the visual system. This mechanism might partially compensate the accumulative and restrictive effects of neural delays in position coding. Also it may account for motion-based position shifts as the flash lag effect. As a specific case, results of diagonal MBP model reproduced the anticipatory response of neural populations in the primary visual cortex of macaque monkey. Our results imply that an efficient and robust position coding might be highly dependent on trajectory integration and that it constitutes a key neural signature to study the more general problem of predictive coding in sensory areas

Localisation des molécules d'eau par RMN à l'état solide à la température de l'azote liquide ; mise en évidence d'un comportement conducteur protonique à partir de 235 K. Insertion redox de ferrocène conduisant au composé VOPO::(4). 0,22FECP::(2)**(+); MISE EN EVIDENCE DE L'EXISTENCE DE L'ION FERRICINIUM PAR SPECTROMETRIE MOESSBAUER ET DE LA NATURE DIPOLAIRE DES INTERACTIONS ENTRE FECP::(2)**(+) ET L'ION VANADYLE PAR DES MESURES MAGNETIQUES (RPE ET SUSCEPTIBILITE). ISOLEMENT ET CARACTERISATION DE LA PHASE PARTIELLEMENT REDUITE VOH::(0,16)PO::(4). 1,9H::(2)O

L’exploration d’une nouvelle physique à l’échelle d’énergie des « Tera electron Volt » (TeV) nécessite de collisionner des leptons dans de grands accélérateurs linéaires à grande luminosité. Ces collisionneurs linéaires requiert une taille de faisceau à l’echelle nanométrique au Point d’Interaction (IP).Parmi les multiples effets participant à la degradation de la luminosité, la correction de la chromaticité, l’effet du rayonnement synchrotronique et la correction des erreurs dans la ligne sont parmi les trois effets à maîtriser afin de réduire la taille du faisceau dans la Section Finale de Focalisation (FFS).Cette these propose un nouveau schéma de correction de la chromaticitè que l’on appelera “non-entrelacé”, appliqué ici au projet CLIC. Lors de l’implementation de cette nouvelle methode, il a été mis en evidence que le probléme principal est la dispersion de deuxième ordre au Doublet Final (FD), qui traverse un sextupole utilisé pour annuler les composantes géometriques restantes.L’effet du rayonnement peut être evalué par méthode de tracking des particules ou par des approximations analytiques. Afin d’inclure ces effets du rayonnement et les paramétres optiques de la ligne pendant la conception et le processus d’optimisation, l’effet Oide et le rayonnement dû aux aimants dipolaires ont été etudiés.Le résultat analytique du rayonnement synchrotronique dans les aimants dipolaires fut generalisé dans les cas avec alpha et dispersion non-nulles à l’IP. Cette généralisation est utilisée pour améliorer le code de simulation PLACET.Le rayonnement dans les aimants quadripolaires finaux imposent une limite à la taille verticale minimale du faiceau, connu comme l’effet Oide. Celui-ci est uniquement important à 3 TeV, donc deux possibilités sont explorées pour atténuer sa contribution dans la taille du faisceau : doubler la longueur et réduire le gradient du dernièr quadripole (QD0), ou integrer une paire d’aimants octupolaires, un en amont et un en aval du QD0.Une partie des exigences du FFS pour les nouveaux collisionneurs linéaire à leptons est testée expérimentalement dans l’« Accelerator Test Facility » (ATF). La réduction de la taille du faisceau d’électrons en utilisant le schéma local de correction de la chromaticité est explorée dans une extension de la ligne originale, appellé ATF2, oú deux buts furent fixés : atteindre 37 nm de taille verticale du faisceau à l’IP, et stabiliser de l’ordre du nanomètre la position verticale du faisceau à l’IP. Depuis 2014, une taille de 44 nm avec un nombre de particules d’environ 0.1 × 10^10 par paquet est atteint de manière regulière.Des cavités radio-frequence seront utilisées pour la stabilisation du faisceau, et également pour détecter le déplacement/les fluctuations du faisceau au dehors la marge tolerable pour le systéme de mesure, ainsi que des erreurs non detectées dans l’optique.Un set de trois cavités furent installées et sont utilisées pour mesurer la trajectoire du faiceau dans la région de l’IP, fournissant ainsi des informations pour reconstruire la position et l’angle à l’IP. Les specifications pour l’optique nominale d’ATF2, i.e. 1 nm de résolution sur 10 μm de gamme dynamique à un nombre de particules de 1.0 × 10^10 par paquet, n’ont pas encore été atteint.La meilleur résolution atteinte jusqu’ici correspond à 50 nm pour 0.4 × 10^10 particules par paquet, où le bruit de l’éléctronique impose une limite de 10 nm par cavité sur la résolution. La gamme dynamique est de 10 μm à 0.4 × 10^10 particules par paquet et 10 dB d’attenuation du signal des cavités, nécéssitant de mettre l’électronique à niveau. Le test du système d’asservissement pour stabiliser le faisceau a atteint une réduction de la fluctuation jusqu’a 67 nm, compatible avec la résolution des cavités
The exploration of new physics in the “Tera electron-Volt” (TeV) scale with precision measurements requires lepton colliders providing high luminosities to obtain enough statistics for the particle interaction analysis. In order to achieve design luminosity values, linear colliders feature nanometer beam spot sizes at the Interaction Point (IP).Three main issues to achieve the beam size demagnification in the Final Focus Section (FFS) of the accelerator are the chromaticity correction, the synchrotron radiation effects and the correction of the lattice errors.This thesis considers two aspects for linear colliders: push the limits of linear colliders design, in particular the chromaticity correction and the radiation effects at 3 TeV, and the instrumentation and experimental work on beam stabilization in a test facility.A new chromaticity correction scheme, called non-interleaved, is proposed to the local and non-local chromaticity corrections for CLIC. This lattice is designed and diagnosed, where the main issue in the current state of lattice design is the non-zero second order dispersion in the Final Doublet (FD) region where a strong sextupole is used to correct the remaining geometrical components.The radiation effect can be evaluated by tracking particles through the lattice or by analytical approximations during the design stage of the lattices. In order to include both, radiation and optic parameters, during the design optimization process, two particular radiation phenomena are reviewed: the Oide effect and the radiation caused by bending magnets .The analytical result of the radiation in bending magnets in was generalized to the case with non-zero alpha and non-zero dispersion at the IP, required during the design and luminosity optimization process. The closed solution for one dipole and one dipole with a drift is compared with the tracking code PLACET, resulting in the improvement of the tracking code results.The Oide effect sets a limit on the vertical beamsize due to the radiation in the final quadrupole. Only for CLIC 3 TeV this limit is significant, therefore two possibilities are explored to mitigate its contribution to beam size: double the length and reduce the QD0 gradient, or the integration of a pair of octupoles before and after QD0.Part of the requirements of the FFS for new linear accelerators are tested in The Accelerator Test Facility (ATF). The beam size reduction using the local chromaticity correction is explored by an extension of the original design, called ATF2 with two goals: achieve 37 nm of vertical beam size at the IP, and the stabilization of the IP beam position at the level of few nanometres. Since 2014 beam size of 44 nm are achieved as a regular basis at charges of about 0.1 × 10^10 particules per bunch.A set of three cavities (IPA, IPB and IPC), two upstream and one downstream of the nominal IP and on top of separate blocks of piezo-electric movers, were installed and are used to measure the beam trajectory in the IP region, thus providing enough information to reconstruct the bunch position and angle at the IP. These will be used to for beam stabilization and could detect beam drift/jitter beyond the tolerable margin and undetected optics mismatch affecting the beam size measurements. The specifications required of 1 nm resolution over 10 μm dynamic range at 1.0 × 10 10 particules per bunch with the ATF2 nominal optics have not been yet achieved.The minimum resolution achieved is just below 50 nm at 0.4 × 10^10 particules per bunch with a set of electronics impossing a noise limit on resolution of 10 nm per cavity. The dynamic range is 10 μm at 10 dB attenuation and 0.4 × 10^10 particules per bunch, indicating the need to upgrade theelectronics. The integration to the ATF tuning instruments is ongoing. Nonetheless, feedback has been tested resulting in reduction of beam jitterdown to 67 nm, compatible with resolution