Tesis: "Données physiologique"

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El, Abed Rafia. "Modèles et données sur l'anticipation du geste d'arrondissment en français." Grenoble 3, 1996. http://www.theses.fr/1996GRE39031.

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Resumen

Dans la parole, les mouvements articulatoires ne presentent pas une correlation lineaire avec les elements de haut niveau. En effet, ils se chevauchent de maniere complexe, et c'est cette difficulte qui a cree le concept de coarticulation, qui peut etre soit anticipatoire soit retentive. Nous avons etudie l'anticipation des gestes vocaliques d'arrondissement (i)-(y) dans le cadre de la pause silencieuse, en prena t en compte le comportement des deux composantes du geste d'arrondissement, a savoir, la protrusion et la constriction. Ensuite, nous avons compare nos resultats a ceux obtenus sur un autre corpus etudiant aussi l'anticipation mais a travers une chaine de consonnes. Nos resultats ne confirment aucun des modeles de production classiquement proposes (time-locked, look-ahead ou encore hybrid). Par contre, ils se rapprochent beaucoup du modele d'expansion du mouvement (mem) propose a l'icp de grenoble,et observe justement sur les donnees du corpus avec la suite de consonnes. Ce modele est dependant du locuteur et pose que le mouvement est extensible (autrement dit, il peut connaitre une expansion lineaire en fonction du nombre de consonnes) sans etre compressible au dela d'une constante d'execution aux alentours de 100 millisecondes nos donnees confirment bien que le mouvement connait une expansion lineaire (dans notre cas, en fonction de la duree de la pause silencieuse). La constante initiale serait une fois et demi superieure a l'enchainement pour la pause. Quant a la loi de croissance, elle serait, a partir de 100 millisecondes, pratiquement identique pour le geste de protrusion et passible d'etre augmentee pour le geste de constriction.

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Drobe, Björn. "Influence de la position de vergence sur la fusion et la refusion sensorielles." Paris, EHESS, 1999. http://www.theses.fr/1999EHES0011.

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Resumen

Les aires de fusion et de refusion sensorielles sont déterminées sur un champ de 24' pour sept observateurs à l'aide d'un dispositif expérimental dichoptique permettant de présenter une image différente a chaque œil. Les mesures ont été effectuées pour des positions de vergence (1) symétriques dans le plan horizontal entre 400 et 900 mm de l'observateur, (2) asymétriques a 400 mm dans le plan horizontal et (3) symétrique a 400 mm dans un plan incline de 30' vers le bas. La taille et le taux de variation avec l'excentricité des aires de fusion et de refusions présentent de fortes différences interindividuelles. Les résultats en convergence symétrique mettent en évidence deux profils de variation des aires fusionnelles avec l'excentricité, illustrant ainsi les résultats contradictoires de la littérature : augmentation de la taille des aires fusionnelles avec l'excentricité ou quasi-constance avec l'excentricité. Pour toutes les positions de vergence et pour toutes les excentricités, la taille des aires de refusions est inférieure à celle des aires de fusion. La taille des aires de fusion diminue linéairement avec la distance de fixation pour toutes les excentricités testées. En convergence asymétrique, la taille des aires de fusion augmente en périphérie avec l'angle de rotation du plan médian jusqu'à une valeur seuil pour ensuite diminuer. La convergence basse a pour effet de diminuer la taille des aires fusionnelles en région fovéale. Nos résultats montrent que le système visuel intègre non seulement l'angle de vergence, mais aussi la position relative de chacun des deux axes visuels. Pour nos conditions expérimentales, cette intégration semble être essentiellement d'origine extra-rétinienne. L’étude séparée des disparités croisées et homonymes conforte l'existence de deux voies de traitement de la disparité en fonction de son signe.

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Zhang, Bo. "Reconnaissance de stress à partir de données hétérogènes." Thesis, Université de Lorraine, 2017. http://www.theses.fr/2017LORR0113/document.

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Resumen

Dans la société moderne, le stress s’avère un problème omniprésent. Un stress permanent peut entraîner divers problèmes mentaux et physiques notamment pour des personnes confrontées à des situations d'urgence comme par exemple des pompiers en intervention: il peut modifier leurs actions et les mettre en danger. Par conséquent, dans ce contexte, il est pertinent de chercher à évaluer le stress de la personne. Sur la base de cette idée, a été proposé le projet Psypocket qui vise à concevoir un système portable capable d'analyser précisément l'état de stress d'une personne en fonction de ses modifications physiologiques, psychologiques et comportementales, puis de proposer des solutions de rétroaction pour réguler cet état. Cette thèse s’inscrit dans le cadre du projet Psypocket. Nous y discutons de la faisabilité et de l'intérêt de la reconnaissance du stress à partir de données hétérogènes. Non seulement les signaux physiologiques, tels que l'électrocardiographie (ECG), l'élecchtromyographie (EMG) et l'activité électrodermale (EDA), mais aussi le temps de réaction (RT) sont adoptés pour discriminer différents états de stress d'une personne. Pour cela nous proposons une approche basée sur un classifieur SVM (Machine à Vecteurs de Support). Les résultats obtenus montrent que le temps de réaction peut-être un moyen d’estimation du niveau de stress de l’individu en complément ou non des signaux physiologiques. En outre, nous discutons de la faisabilité d'un système embarqué à même de réaliser la chaîne globale de traitement des signaux. Cette thèse contribue donc à la conception d’un système portable de reconnaissance du stress d'une personne en temps réel en adoptant des données hétérogènes, en l’occurrence les signaux physiologiques et le temps de réaction In modern society, the stress of an individual has been found to be a common problem. Continuous stress can lead to various mental and physical problems and especially for the people who always face emergency situations (e.g., fireman): it may alter their actions and put them in danger. Therefore, it is meaningful to provide the assessment of the stress of an individual. Based on this idea, the Psypocket project is proposed which is aimed at making a portable system able to analyze accurately the stress state of an individual based on his physiological, psychological and behavioural modifications. It should then offer solutions for feedback to regulate this state.The research of this thesis is an essential part of the Psypocket project. In this thesis, we discuss the feasibility and the interest of stress recognition from heterogeneous data. Not only physiological signals, such as Electrocardiography (ECG), Electromyography (EMG) and Electrodermal activity (EDA), but also reaction time (RT) are adopted to recognize different stress states of an individual. For the stress recognition, we propose an approach based on a SVM classifier (Support Vector Machine). The results obtained show that the reaction time can be used to estimate the level of stress of an individual in addition or not to the physiological signals. Besides, we discuss the feasibility of an embedded system which would realize the complete data processing. Therefore, the study of this thesis can contribute to make a portable system to recognize the stress of an individual in real time by adopting heterogeneous data like physiological signals and RT

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Gouba, Elisée. "Identification de paramètres dans les systèmes distribuées à données manquantes : modèles mathématiques de la performance en sport." Antilles Guyane, 2010. http://www.theses.fr/2010AGUY0330.

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Resumen

Deux thèmes ont été abordés dans cette thèse: Identification de paramètres dans les systèmes distribués à données manquantes en première partie et modèles mathématiques de la performance en sport en seconde partie. La première partie concerne donc l'identification de la perméabilité d'un réservoir pétrolier en écoulement monophasique. Le modèle non linèaire dont nous disposons est incomplet dans le sens où la condition initiale, la condition aux limites et certains paramètres pétrophysiques du modèle ne sont que partiellement connus. Deux approches sont possibles, l'une classique utilisant la méthode des moindres carrés et l'autre plus ciblée utilisant la méthode des sentinelles développée par J. L. Lions. Dans ce travail, nous montrons d'abord que le problème de la sentinelle est équivalent à un problème de contrôlabilité à zéro. Nous résolvons ensuite ce problème de contrôlabilité par la méthode variationnelle rendue possible grâce aux inégalités de Carleman. La seconde partie de cette thèse est consacrée au modèle mathématique de la performance en sport proposé par Banister en 1975. Nous appliquons ce modèle pour la première fois aux données physiologiques d'une nageuse monopalme puis nous proposons un modèle qui améliore celui de Banister Two topics were studied in this thesis: parameter's identification in distributed systems with missing data in first part and mathematical models of performance in sports in second part. The aim of the first part of this thesis is to identify the permeability parameter of an oil tanks in monophasic flow. The nonlinear model w have is a system with incomplete data in the sense that the initial condition, the boundary conditions and some petro-physical parameters of the model are partially known. Two approaches are possible, one using the classical method of least squares and the other more targeted using the sentinel method developed by J. L. Lions. Ln this work, we first show that the sentinel problem is equivalent to a null controllability problem. And we solves the problem of null controllability by the variational method made possible by the Carleman inequalities. The second part of this thesis is devoted to the mathematical model of performance in sports proposed by Banister in 1975. We firstly apply this model at physiological data of monofin swimmer and we propose a model that improves Banister's mode/

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Fayet, Guillemette. "Vieillissement du tissu musculaire squelettique : données morphométriques nouvelles et analyse des altérations mitochondriales." Paris 6, 2002. http://www.theses.fr/2002PA066138.

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Larnicol, Sylvie. "Étude de l'organisation du champ perceptif en fonction des données configurationnelles du stimulus et analyse physiologique des principes pouvant l'expliquer." Paris 1, 1995. http://www.theses.fr/1995PA010576.

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La domaine d'investigation est la perception visuelle dans la premiere partie, les resultats obtenus par des adultes et des adolescents, soumis a une serie de tests, sont compares. Ils consistent a evaluer le decalage, par rapoort, au centre, d'un segment compris dans une configuration plane. Les effets inducteurs revelent l'existence d'un centre subjectif different du centre objectif. Ils mettent en evidence l'existence de deux strategies operatoires distinctes, l'une basee sur l'evaluation par symetrisation des intervalles a partir d'un axe central, l'autre basee sur l'evaluation relative des surfaces autour du point de centration. Dans la seconde partie, l'etude de certains ouvrages scientifiques, comme celui de mrs buser et imbert intitule : "la vision" permet d'aboutir a une interpretation des donnees psychophysiologiques pouvant expliquer les techniques operatoires observees lors de l'experimentation. A cette dualite correspondraient celle de l'organisation des champs recepteurs, celle des systemes phoptopique et scotopique, ainsi que celle des reseaux postretiniens. L'hypothese emise suppose l'existence d'un principe de detection precoce et de double analyse des frequences spatio-temporelles, activable a partir de certains seuils The field of investigfation is the visual perception. Adults and teenagers are compared. It consists in estimating the unwedeging in relation to the centre of a segment inclued in a plan drawing figure. The inductive effects reveal the existence of a szubjective centre, different from the objective centre. It shows how two different operative strategies can exist, based on the evalution of intervals by symetrisation, starting from the central axis, the other by the relative evaluation of the surgace around the central neeelow. In the second part, the study of fondamental ideas extracted from scientifical pieces of works like the book by messrs buser and imbert called: "the sight" leads to interprete the psychophysiologicaly data which can explain the technical operative observed during the experimentation. To this duality would correspond the duality of the receptors field, of the photoor scotopical system, and of the postretinal plexis. This assumption allows the principal of early detection and of double analysis of space-time frecency, actived from some threshold of sensitivity

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Blaha, Georges. "Données sur la diversité physiologique des populations de Phytophthora megakarya et de P. Palmivora responsables de la pourriture brune des cabosses du cacaoyer (Theobroma cacao L. )." Toulouse, INPT, 1995. http://www.theses.fr/1995INPT008A.

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La diagnose de phytophthora megakarya et de p. Palmivora agents de la pourriture brune des cabosses du cacaoyer (theobroma cacao l. ) a d'abord ete verifiee a l'aide des electrophoretypes enzymatiques notamment avec les phosphogluco-isomerases (pgi) et les malate-deshydrogenases (mdh). Les travaux qui ont suivi ont eu alors pour objectifs l'utilisation de facteurs pouvant influencer l'expression specifique ou non specifique des caracteres observables, mycologiques et pathogeniques: croissances et caracteres morphoculturaux sur milieu de culture semi-naturel a des ph et sous des eclairements differents, developpements sur milieu synthetique en presence de differents additifs (oligoelements, beta-sitosterol), glucides ou polysaccharides, composes phenoliques. Quelques activites enzymatiques et le comportement infectieux sur epicotyles de semenceaux de cacaoyer ont ete egalement etudies alors que les donnees quantitatives ont ete exploitees par les methodes statistiques inferentielles et que les classements statistiques ont ete obtenus par differents tests (de duncan, de newman et keuls), les donnees qualitatives ont ete analysees, seules ou conjointement avec les donnees quantitatives, par des methodes descriptives comme l'analyse factorielle par composantes principales (acp) et les analyses factorielles des correspondances (afc) ou discriminantes (afd). Les typologies obtenues ont permis d'identifier des axes possibles de differenciations ou de strategies adaptatives de la pathogenie

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Carbillet, Thomas. "Monitoring en temps réel de la vitesse de déplacement sur dispositif connecté : modélisation mathématique sur plateforme mobile interfacée avec une base de données d'entraînement et d'audit physiologique." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019GREAM013/document.

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L'amélioration de la performance en course à pied, lors de courses sur du plat, raisonne avec l'actualité et l'objectif de voir un athlète descendre en dessous des deux heures sur Marathon. Cependant, il existe peu d'équipes travaillant de façon transverse sur les sujets de préparation et de stratégie de course à destination du grand public. Les programmes d'entraînement, fondés sur l'expérience des entraîneurs, ne sont pas, ou peu, personnalisés ce qui conduit à des risques de blessures et une perte de la motivation. Une limite de l'analyse actuelle des programmes d'entraînement semble avoir été atteinte et l'entreprise BillaTraining® a pour objectif de construire un pont entre la recherche scientifique et les coureurs amateurs.L'objectif principal de ce travail de thèse est double. Premièrement, nous avons essayé d'apporter une contribution à la recherche dans le domaine de la course à pied. Après avoir accumulé et formaté des données d'entraînements et de courses provenant de différentes sources, nous avons cherché à décrire des phénomènes tels que l'accélération humaine ou encore les différentes stratégies de course employées sur Marathon pour des coureurs dont les performances de durée de course sont comprises entre 2h30 et 4 heures.Deuxièmement, nous avons développé une application web intégrant les trois phases de la méthode BillaTraining®. La première étape est un audit énergétique qui n'est autre qu'un entraînement de trente minutes à la sensation, permettant de connaitre les capacités physiques d'un coureur. La second étape, le radar énergétique, est le bilan de l'audit et agit comme point d'entrée de l'entraînement sur-mesure qui est la troisième et dernière étape.Afin de répondre à ces deux objectifs, nous avons intégré des notions de physiologie, de mathématiques et d'informatique.Les connaissances en physiologie sont basées sur l'état de l'art ainsi que les recherches passées et présentes du professeur Véronique Billat. Par extension, il s'agit du coeur de métier de l'entreprise BillaTraining®. Les idées de recherche présentent dans cette thèse émanent de la physiologie.Les mathématiques, quand à elles, nous ont permis de décrire certains phénomènes physiologiques grâce notamment aux statistiques. Nous avons eu l'occasion d'utiliser le modèle d'Ornstein-Uhlenbeck de retour à la moyenne ou encore la méthode PELT (Pruned Exact Linear Time) pour la détection d'instants de ruptures dans une série temporelle.Finalement, l'informatique permet de faire communiquer les mathématiques et la physiologie à des fins de recherche scientifique et commerciales The improvement running performance has become a major topic lately. We are getting closer to running a marathon in under 2 hours. However, there are not so many professionals working transversally regarding pre-race and in-race preparation concerning the general public. Training plans are based on trainers' experience and are often not custom-made. This exposes the runners to injury risk and motivation loss. It seems that the current analysis of training plans has reached a limit. The aim for BillaTraining® is to go beyond this limit by connecting the research with the general public of runners.This PhD has two main goals. The first one is trying to contribute to the research about running. After gathering and formatting trainings and races data from different origins, we tried to isolate and describe how humans run marathons including 2.5 to 4-hour performances. We studied acceleration, speed and heart rate time series among other things, with the idea of understanding the different running strategies.The second one is the development of a web application embracing the three steps of the BillaTraining® method. The first step is an energetic audit which is a 30-minute running session guided by the runner's sensations. The second step is the energetic radar which is the results of the audit. The last step is a tailor-made training plan built depending on the runner's objectives.In order to come up with a solution, we had to bring together Physiology, Mathematics and Computer Science.The knowledge we had in Physiology was based on professor Véronique Billat's past and current researches. These researches are now part of BillaTraining® and are central for the growth of the company.We used Mathematics to try to describe physiological phenomenons thanks to Statistics. By applying the Ornstein-Uhlenbeck model, we found that humans are able to run at an even acceleration. By using the PELT (Pruned Exact Linear Time) method we automated changepoints detection in time series.Finally, Computer Science allowed a communication between Physiology and Mathematics for research, as well as marketing training tools at the forefront of innovation

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Fayard, Jean-Dominique. "Données électrocardiographiques d'une population de 950 marathoniens et de 61 coureurs de 100 km." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR2M109.

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Yang, Wenlu. "Personalized physiological-based emotion recognition and implementation on hardware." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2018. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2018SORUS064.pdf.

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Cette thèse étudie la reconnaissance des émotions à partir de signaux physiologiques dans le contexte des jeux vidéo et la faisabilité de sa mise en œuvre sur un système embarqué. Les défis suivants sont abordés : la relation entre les états émotionnels et les réponses physiologiques dans le contexte du jeu, les variabilités individuelles des réponses psycho-physiologiques et les problèmes de mise en œuvre sur un système embarqué. Les contributions majeures de cette thèse sont les suivantes. Premièrement, nous construisons une base de données multimodale dans le cadre de l'Affective Gaming (DAG). Cette base de données contient plusieurs mesures concernant les modalités objectives telles que les signaux physiologiques de joueurs et des évaluations subjectives sur des phases de jeu. A l'aide de cette base, nous présentons une série d'analyses effectuées pour la détection des moments marquant émotionnellement et la classification des émotions à l'aide de diverses méthodes d'apprentissage automatique. Deuxièmement, nous étudions la variabilité individuelle de la réponse émotionnelle et proposons un modèle basé sur un groupe de joueurs déterminé par un clustering selon un ensemble de traits physiologiques pertinents. Nos travaux mettent en avant le fait que le modèle proposé, basé sur un tel groupe personnalisé, est plus performant qu'un modèle général ou qu'un modèle spécifique à un utilisateur. Troisièmement, nous appliquons la méthode proposée sur un système ARM A9 et montrons que la méthode proposée peut répondre à l'exigence de temps de calcul This thesis investigates physiological-based emotion recognition in a digital game context and the feasibility of implementing the model on an embedded system. The following chanllenges are addressed: the relationship between emotional states and physiological responses in the game context, individual variabilities of the pschophysiological responses and issues of implementation on an embedded system. The major contributions of this thesis are : Firstly, we construct a multi-modal Database for Affective Gaming (DAG). This database contains multiple measurements concerning objective modalities: physiological signals (ECG, EDA, EMG, Respiration), screen recording, and player's face recording, as well as subjective assessments on both game event and match level. We presented statistics of the database and run a series of analysis on issues such as emotional moment detection and emotion classification, influencing factors of the overall game experience using various machine learning methods. Secondly, we investigate the individual variability in the collected data by creating an user-specific model and analyzing the optimal feature set for each individual. We proposed a personalized group-based model created the similar user groups by using the clustering techniques based on physiological traits deduced from optimal feature set. We showed that the proposed personalized group-based model performs better than the general model and user-specific model. Thirdly, we implemente the proposed method on an ARM A9 system and showed that the proposed method can meet the requirement of computation time

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Meghnoudj, Houssem. "Génération de caractéristiques à partir de séries temporelles physiologiques basée sur le contrôle optimal parcimonieux : application au diagnostic de maladies et de troubles humains." Electronic Thesis or Diss., Université Grenoble Alpes, 2024. http://www.theses.fr/2024GRALT003.

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Dans cette thèse, une nouvelle méthodologie a été proposée pour la génération de caractéristiques à partir de signaux physiologiques afin de contribuer au diagnostic d'une variété de maladies cérébrales et cardiaques. Basée sur le contrôle optimal parcimonieux, la génération de caractéristiques dynamiques parcimonieuses (SDF) s'inspire du fonctionnement du cerveau. Le concept fondamental de la méthode consiste à décomposer le signal de manière parcimonieuse en modes dynamiques qui peuvent être activés et/ou désactivés au moment approprié avec l'amplitude adéquate. Cette décomposition permet de changer le point de vue sur les données en donnant accès à des caractéristiques plus informatives qui sont plus fidèles au concept de production des signaux cérébraux. Néanmoins, la méthode reste générique et polyvalente puisqu'elle peut être appliquée à un large éventail de signaux. Les performances de la méthode ont été évaluées sur trois problématiques en utilisant des données réelles accessibles publiquement, en abordant des scénarios de diagnostic liés à : (1) la maladie de Parkinson, (2) la schizophrénie et (3) diverses maladies cardiaques. Pour les trois applications, les résultats sont très concluants, puisqu'ils sont comparables aux méthodes de l'état de l'art tout en n'utilisant qu'un petit nombre de caractéristiques (une ou deux pour les applications sur le cerveau) et un simple classifieur linéaire suggérant la robustesse et le bien-fondé des résultats. Il convient de souligner qu'une attention particulière a été accordée à l'obtention de résultats cohérents et significatifs avec une explicabilité sous-jacente In this thesis, a novel methodology for features generation from physiological signals (EEG, ECG) has been proposed that is used for the diagnosis of a variety of brain and heart diseases. Based on sparse optimal control, the generation of Sparse Dynamical Features (SDFs) is inspired by the functioning of the brain. The method's fundamental concept revolves around sparsely decomposing the signal into dynamical modes that can be switched on and off at the appropriate time instants with the appropriate amplitudes. This decomposition provides a new point of view on the data which gives access to informative features that are faithful to the brain functioning. Nevertheless, the method remains generic and versatile as it can be applied to a wide range of signals. The methodology's performance was evaluated on three use cases using openly accessible real-world data: (1) Parkinson's Disease, (2) Schizophrenia, and (3) various cardiac diseases. For all three applications, the results are highly conclusive, achieving results that are comparable to the state-of-the-art methods while using only few features (one or two for brain applications) and a simple linear classifier supporting the significance and reliability of the findings. It's worth highlighting that special attention has been given to achieving significant and meaningful results with an underlying explainability

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Hommais, Valérie. "Présentation de l'antigène : données actuelles." Paris 5, 1990. http://www.theses.fr/1990PA05P134.

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Roger, Thierry. "La motricité caeco-colique chez le cheval : données histologiques, physiologiques et pharmacologiques." Toulouse, INPT, 1989. http://www.theses.fr/1989INPT029A.

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La motricite du segment cco-colique se divise en une composante tonique localisee et en une composante phasique propagee. Le tonus presente des variations cycliques dont le rythme caracterise chacun des reservoirs. Il est renforce apres la prise de nourriture et apres l'administration de cholinomimetiques ou d'antagonistes alpha#2 adrenergiques. Il freine le transit et donc favorise la degradation microbienne du contenu et sa deshydratation. L'activite propagee est constituee de spikes qui apparaissent soit isolement, soit groupes en complexes migrants. Les spikes isoles brassent le contenu alors que les complexes migrants assurent la vidange des reservoirs. Ceux-ci apparaissent a la pointe du ccum et se propagent jusqu'au colon dorsal. Leur migration entraine la fermeture reflexe respectivement de la jonction ileo-ccale et de la jonction cco-colique. Celles-ci presentent des caracteres structuraux et fonctionnels de sphincters et leur finalite est d'empecher le reflux, un phenomene controle par le systeme alpha#1 adrenergique. Lorsque le contenu ccal franchit cependant la jonction ileo-ccale son acidite favorise le peristaltisme ileal et son expulsion de l'ileon, un phenomene controle par le systeme serotoninergique

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Leperlier, Cédric. "Données écologiques et physiologiques pour l’utilisation d’espèces indigènes de La Réunion en revégétalisation." Thesis, La Réunion, 2019. http://www.theses.fr/2019LARE0023.

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Comme observé ailleurs dans le monde, les zones sèches de basse altitude de La Réunion connaissent un développement démographique important entraînant une destruction des habitats et la perte de nombreuses espèces végétales indigènes. Afin d’enrayer ce phénomène, la sélection d’espèces indigènes pour la revégétalisation d’espaces dégradés est aujourd’hui largement proposée. Cependant, la méconnaissance de la biologie et de l’écologie de ces espèces limite leur utilisation. Les objectifs de cette thèse ont donc été de déterminer les facteurs majeurs influençant les étapes cruciales de transition d’une graine semée à l’établissement de la plantule (germination, émergence, survie et établissement) pour 14 espèces végétales indigènes (10 ligneuses et 4 herbacées) de zones sèches de La Réunion. Les stratégies de germination ont été évaluées en laboratoire pour 13 espèces. Un phénomène de dormance a été identifié pour 12 d’entre elles : 2 espèces herbacées et 5 espèces ligneuses présentent des graines à dormance physique, 4 espèces ligneuses possèdent des graines à dormance physiologique à composante mécanique et 1 espèce herbacée possède des graines à dormance physiologique et à photosensibilité positive. Chaque fois que nécessaire, un traitement pré-germinatif a pu être mis au point afin d’augmenter le rendement de germination. L’efficacité de ces méthodes ainsi que l’effet de paramètres abiotiques sur les performances d’émergence de plantules ont ensuite été observés en pépinière pour 10 espèces (7 ligneuses et 3 herbacées). Une faible disponibilité en eau a réduit ces performances, notamment pour les espèces ligneuses arbustives. Si pour les espèces herbacées, l’utilisation de la technique d’hydro-ensemencement a favorisé l’émergence de plantules, cette technique seule a été insuffisante pour les espèces ligneuses. Enfin, la capacité d’établissement des différentes espèces a été déterminée en parcelles expérimentales pour 10 espèces (7 ligneuses et 3 herbacées). Les pressions abiotiques et de compétition ont limité la survie et l’établissement des espèces indigènes étudiées. La technique d’hydro-ensemencement conjointe à la maîtrise des densités et de la diversité de semis et à un contrôle temporaire des pressions de compétitions exercées par les adventices, a permis de favoriser l’établissement des espèces herbacées et de 4 espèces ligneuses. Les méthodes utilisées lors de ces travaux de thèse pourraient être appliquées à d’autres espèces indigènes afin d’améliorer le succès de revégétalisation des zones sèches de La Réunion As observed at a world scale, dry lowlands of Reunion Island are facing an important demographic development causing habitat degradation and leading to native plant species loss. In order to limit this phenomenon, selection of native species for revegetation is widely proposed. However, the lack of knowledge about biology and ecology of such species hinders their use. The aim of this study was to determine major factors influencing the very first steps from a sown seed to the resulting established seedling (germination, emergence, survival and establishment) for 14 natives plant species (10 woody and 4 herbaceous species) of dry habitats of Reunion Island. Germination strategies were evaluated in laboratories for 13 of them. A dormancy phenomenon could be identified for 12 species : 2 herbaceous and 5 woody species possess seeds with physical dormancy, 4 woody species possess seeds with physiological dormancy with a mechanical component and 1 species possess seeds with physiological dormancy and positive photoblasty. For each species, a pre-treatment improved germination. The efficiency of these methods and the influence of abiotic parameters on seedling emergence were observed in greenhouse experiments for 10 species (7 woody and 3 herbaceous species). A low water availability decreased performances, especially for woody species. While for herbaceous species, hydroseeding increased seedling emergence, this technique alone was not sufficient for woody species. Finally, establishment capacity was determined on field plots for 10 species (7 woody and 3 herbaceous species). The abiotic and competition pressures limited survival and establishment of the studied species. However, the use of hydroseeding along with the control of sowing density and diversity and a temporary control of weed competition enhanced establishment for the herbaceous and 4 woody species. The described methods of this thesis could be applied to other native species in order to improve revegetation in Reunion Island dry lowlands

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Abdat, Faiza. "Reconnaissance automatique des émotions par données multimodales : expressions faciales et des signaux physiologiques." Thesis, Metz, 2010. http://www.theses.fr/2010METZ035S/document.

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Resumen

Cette thèse présente une méthode générique de reconnaissance automatique des émotions à partir d’un système bimodal basé sur les expressions faciales et les signaux physiologiques. Cette approche de traitement des données conduit à une extraction d’information de meilleure qualité et plus fiable que celle obtenue à partir d’une seule modalité. L’algorithme de reconnaissance des expressions faciales qui est proposé, s’appuie sur la variation de distances des muscles faciaux par rapport à l’état neutre et sur une classification par les séparateurs à vastes marges (SVM). La reconnaissance des émotions à partir des signaux physiologiques est, quant à elle, basée sur la classification des paramètres statistiques par le même classifieur. Afin d’avoir un système de reconnaissance plus fiable, nous avons combiné les expressions faciales et les signaux physiologiques. La combinaison directe de telles informations n’est pas triviale étant donné les différences de caractéristiques (fréquence, amplitude de variation, dimensionnalité). Pour y remédier, nous avons fusionné les informations selon différents niveaux d’application. Au niveau de la fusion des caractéristiques, nous avons testé l’approche par l’information mutuelle pour la sélection des plus pertinentes et l’analyse en composantes principales pour la réduction de leur dimensionnalité. Au niveau de la fusion de décisions, nous avons implémenté une méthode basée sur le processus de vote et une autre basée sur les réseaux Bayésien dynamiques. Les meilleurs résultats ont été obtenus avec la fusion des caractéristiques en se basant sur l’Analyse en Composantes Principales. Ces méthodes ont été testées sur une base de données conçue dans notre laboratoire à partir de sujets sains et de l’inducteur par images IAPS. Une étape d’auto évaluation a été demandée à tous les sujets dans le but d’améliorer l’annotation des images d’induction utilisées. Les résultats ainsi obtenus mettent en lumière leurs bonnes performances et notamment la variabilité entre les individus et la variabilité de l’état émotionnel durant plusieurs jours This thesis presents a generic method for automatic recognition of emotions from a bimodal system based on facial expressions and physiological signals. This data processing approach leads to better extraction of information and is more reliable than single modality. The proposed algorithm for facial expression recognition is based on the distance variation of facial muscles from the neutral state and on the classification by means of Support Vector Machines (SVM). And the emotion recognition from physiological signals is based on the classification of statistical parameters by the same classifier. In order to have a more reliable recognition system, we have combined the facial expressions and physiological signals. The direct combination of such information is not trivial giving the differences of characteristics (such as frequency, amplitude, variation, and dimensionality). To remedy this, we have merged the information at different levels of implementation. At feature-level fusion, we have tested the mutual information approach for selecting the most relevant and principal component analysis to reduce their dimensionality. For decision-level fusion we have implemented two methods; the first based on voting process and another based on dynamic Bayesian networks. The optimal results were obtained with the fusion of features based on Principal Component Analysis. These methods have been tested on a database developed in our laboratory from healthy subjects and inducing with IAPS pictures. A self-assessment step has been applied to all subjects in order to improve the annotation of images used for induction. The obtained results have shown good performance even in presence of variability among individuals and the emotional state variability for several days

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Zongo, Charly Sagite. "Données biologiques et physiologiques sur les semences de quelques espèces de milieux ultramafiques néo-calédoniens." Nouvelle Calédonie, 2010. http://portail-documentaire.univ-nc.nc/files/public/bu/theses_unc/TheseCharlyZongo2010.pdf.

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Meunier, Karine. "Données actuelles sur l'interleukine-3 en hématologie." Paris 5, 1995. http://www.theses.fr/1995PA05P052.

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Avendaño, Diaz Miguel. "Données sur la biologie de Argopecten Purpuratus (Lamarck, 1819), mollusque bivalve du Chili." Brest, 1993. http://www.theses.fr/1993BRES2033.

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Resumen

Le mollusque bivalve Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819), de la famille des pectinidae se rencontre sur les cotes chiliennes depuis Arica jusqu'a Valparaiso. Il présente un intérêt commercial élevé du a une forte demande du marche international. Cependant, la surexploitation ayant entraîné une inquiétante diminution des bancs naturels, des centres d'élevages expérimentaux ont été construits en 1986. Malheureusement, jusqu'a ce jour, les résultats obtenus par ces ecloseries-nourriceries restent faibles en raison de la méconnaissance de divers aspects du cycle biologique de l'espèce. L’objectif de l'étude est de fournir des éléments fondamentaux permettant d'établir les bases biologiques de l'aquaculture de A. Purpuratus. Pour cela, des individus provenant de deux populations différentes: celle de la baie de mejillones et celle de la rinconada sont retenues et 5 aspects sont analyses: la reproduction, l'influence de facteurs environnementaux sur les cycles gamétiques, les caractéristiques biométriques, la morphogenèse des coquilles larvaires et la structure génétique des populations. Les données obtenues révèlent des différences concernant le nombre d'allèles, le polymorphisme enzymatique, le poids du muscle, le déroulement des cycles gamétiques et l'intensité des émissions. Outre une meilleure connaissance de la biologie de l'espèce, ces résultats devraient permettre de choisir les individus servant de géniteurs en écloserie industrielle et de pouvoir ainsi améliorer leurs performances.

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Helequin, Brigitte. "Données actuelles concernant les relations entre magnesium et pathologie cardiovasculaire." Paris 5, 1989. http://www.theses.fr/1989PA05PA43.

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Rossetti, Yves. "Variations annuelles des donnees psychopathologiques et physiologiques humaines : description phylogenetique et mecanismes de regulation." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO1M099.

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Yang, Wenlu. "Personalized physiological-based emotion recognition and implementation on hardware." Thesis, Sorbonne université, 2018. http://www.theses.fr/2018SORUS064.

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Resumen

Cette thèse étudie la reconnaissance des émotions à partir de signaux physiologiques dans le contexte des jeux vidéo et la faisabilité de sa mise en œuvre sur un système embarqué. Les défis suivants sont abordés : la relation entre les états émotionnels et les réponses physiologiques dans le contexte du jeu, les variabilités individuelles des réponses psycho-physiologiques et les problèmes de mise en œuvre sur un système embarqué. Les contributions majeures de cette thèse sont les suivantes. Premièrement, nous construisons une base de données multimodale dans le cadre de l'Affective Gaming (DAG). Cette base de données contient plusieurs mesures concernant les modalités objectives telles que les signaux physiologiques de joueurs et des évaluations subjectives sur des phases de jeu. A l'aide de cette base, nous présentons une série d'analyses effectuées pour la détection des moments marquant émotionnellement et la classification des émotions à l'aide de diverses méthodes d'apprentissage automatique. Deuxièmement, nous étudions la variabilité individuelle de la réponse émotionnelle et proposons un modèle basé sur un groupe de joueurs déterminé par un clustering selon un ensemble de traits physiologiques pertinents. Nos travaux mettent en avant le fait que le modèle proposé, basé sur un tel groupe personnalisé, est plus performant qu'un modèle général ou qu'un modèle spécifique à un utilisateur. Troisièmement, nous appliquons la méthode proposée sur un système ARM A9 et montrons que la méthode proposée peut répondre à l'exigence de temps de calcul This thesis investigates physiological-based emotion recognition in a digital game context and the feasibility of implementing the model on an embedded system. The following chanllenges are addressed: the relationship between emotional states and physiological responses in the game context, individual variabilities of the pschophysiological responses and issues of implementation on an embedded system. The major contributions of this thesis are : Firstly, we construct a multi-modal Database for Affective Gaming (DAG). This database contains multiple measurements concerning objective modalities: physiological signals (ECG, EDA, EMG, Respiration), screen recording, and player's face recording, as well as subjective assessments on both game event and match level. We presented statistics of the database and run a series of analysis on issues such as emotional moment detection and emotion classification, influencing factors of the overall game experience using various machine learning methods. Secondly, we investigate the individual variability in the collected data by creating an user-specific model and analyzing the optimal feature set for each individual. We proposed a personalized group-based model created the similar user groups by using the clustering techniques based on physiological traits deduced from optimal feature set. We showed that the proposed personalized group-based model performs better than the general model and user-specific model. Thirdly, we implemente the proposed method on an ARM A9 system and showed that the proposed method can meet the requirement of computation time

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Pham, Mac Thu Trang. "Données récentes sur la toxicité de l'arsenic : son comportement dans l'environnement et ses effets biologiques chez l'homme." Paris 5, 1990. http://www.theses.fr/1990PA05P179.

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Goichot, Bernard. "Secretion de l'hormone thyreotrope (tsh) au cours des etats de veille et de sommeil. Donnees physiologiques et applications cliniques." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1997. http://www.theses.fr/1997STR13113.

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Resumen

La thyrotropine (tsh) chez l'homme normal varie au cours du nycthemere avec une augmentation progressive dans la journee, un maximum proche de l'endormissement puis une diminution progressive dans la nuit. Ce rythme est d'origine circadienne, mais soumis a un effet inhibiteur du sommeil puisque lors d'une privation de sommeil le maximum de la tsh est plus eleve et survient plus tardivement. Nous avons etudie les relations entre l'horaire et la structure du sommeil et les fluctuations de la tsh et des hormones thyroidiennes chez le sujet normal au cours de nuits de sommeil normal, au cours de privations partielles et completes de sommeil et au cours d'un decalage abrupt du sommeil. Le rythme de la tsh et ses relations avec le sommeil ont egalement ete etudies dans deux modeles pathologiques, la trypanosomiase africaine et l'hypothyroidie primitive. Les fluctuations nocturnes de la tsh sont fortement liees a la structure du sommeil, le sommeil a ondes lentes survenant constamment lors des phases descendantes de la tsh alors que les eveils s'accompagnent d'une augmentation de la tsh. Les hormones thyroidiennes presentent des oscillations de faibles amplitudes qui ne sont liees ni a celles de la tsh ni a la structure du sommeil. Le decalage abrupt du sommeil s'accompagne des le deuxieme jour d'un decalage des rythmes de la tsh, de la melatonine et du cortisol temoignant d'un effet du decalage du sommeil sur l'horloge circadienne, mais aussi d'une modulation de l'amplitude du rythme de la tsh qui semble participer au processus adaptatif de l'horloge aux manipulations du cycle veille-sommeil. Les relations entre les fluctuations de la tsh et la structure du sommeil persistent dans les deux modeles pathologiques etudies. Les mecanismes a l'origine de la persistance ou de la disparition du pic nocturne de la tsh dans ces deux pathologies sont discutes.

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Lourme, Bertrand. "Traitement de données physiques et physiologiques effectué sur des kayakistes de course en ligne : caractérisation du geste et optimisation du rendement énergétique." Lille 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LIL10165.

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Resumen

Après la présentation du système d'acquisition, sont exposées les différentes campagnes de mesure à partir desquelles une première analyse a été faite. Ces expérimentations ont permis, en outre, de mettre en évidence un certain nombre de problèmes et de faire évoluer le système. A partir de ces premiers résultats, de nouveaux logiciels d'analyse sont présentes qui permettent de solutionner des problèmes spécifiques, comme le transfert de l'énergie ou l'optimisation du geste

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Dhif, Imen. "Compression, analyse et visualisation des signaux physiologiques (EEG) appliqués à la télémédecine." Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2017. http://www.theses.fr/2017PA066393.

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Resumen

En raison de la grande quantité d’EEG acquise sur plusieurs journées, une technique de compression efficace est nécessaire. Le manque des experts et la courte durée des crises encouragent la détection automatique des convulsions. Un affichage uniforme est obligatoire pour assurer l’interopérabilité et la lecture des examens EEG transmis. Le codeur certifié médical WAAVES fournit des CR élevés et assure une qualité de diagnostic d’image. Durant nos travaux, trois défis sont révélés : adapter WAAVES à la compression des signaux, détecter automatiquement les crises épileptiques et assurer l’interopérabilité des afficheurs EEG. L’étude du codeur montre qu’il est incapable de supprimer la corrélation spatiale et de compresser des signaux monodimensionnels. Par conséquent, nous avons appliqué l’ICA pour décorréler les signaux, la mise en échelle pour redimensionner les valeurs décimales et la construction d’image. Pour garder une qualité de diagnostic avec un PDR inférieur à 7%, nous avons codé le résidu. L’algorithme de compression EEGWaaves proposé a atteint des CR de l’ordre de 56. Ensuite, nous avons proposé une méthode d’extraction des caractéristiques des signaux EEG basée sur un nouveau modèle de calcul de la prédiction énergétique (EAM) des signaux. Ensuite, des paramètres statistiques ont été calculés et les Réseaux de Neurones ont été appliqués pour détecter les crises épileptiques. Cette méthode nous a permis d’atteindre de meilleure sensibilité allant jusqu’à 100% et une précision de 99.44%. Le dernier chapitre détaille le déploiement de notre afficheur multi-plateforme des signaux physiologiques. Il assure l’interopérabilité des examens EEG entre les hôpitaux Due to the large amount of EEG acquired over several days, an efficient compression technique is necessary. The lack of experts and the short duration of epileptic seizures require the automatic detection of these seizures. Furthermore, a uniform viewer is mandatory to ensure interoperability and a correct reading of transmitted EEG exams. The certified medical image WAAVES coder provides high compression ratios CR while ensuring image quality. During our thesis, three challenges are revealed : adapting WAAVES coder to the compression of the EEG signals, detecting automatically epileptic seizures in an EEG signal and ensure the interoperability of the displays of EEG exams. The study of WAAVES shows that this coder is unable to remove spatial correlation and to compress directly monodimensional signals. Therefore, we applied ICA to decorrelate signals, a scaling to resize decimal values, and image construction. To keep a diagnostic quality with a PDR less than 7%, we coded the residue. The proposed compression algorithm EEGWaaves has achieved CR equal to 56. Subsequently, we proposed a new method of EEG feature extraction based on a new calculation model of the energy expected measurement (EAM) of EEG signals. Then, statistical parameters were calculated and Neural Networks were applied to classify and detect epileptic seizures. Our method allowed to achieve a better sensitivity up to 100% and an accuracy of 99.44%. The last chapter details the deployment of our multiplatform display of physiological signals by meeting the specifications established by doctors. The main role of this software is to ensure the interoperability of EEG exams between healthcare centers

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Hars, Mélany. "Contribution à l'étude du contrôle de l'équilibre à la poutre lors de la réalisation de mouvements acrobatiques de renversement par des gymnastes expertes." Valenciennes, 2007. http://ged.univ-valenciennes.fr/nuxeo/site/esupversions/6dc99473-6fb7-4bc2-954d-6f92e5fd3658.

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Resumen

Le travail de recherche présenté dans ce mémoire traite de l’équilibre des gymnastes lors de l’exécution de mouvements acrobatiques à la poutre. A cet agrès, l’équilibre du corps doit être maintenu alors que les conditions de réalisation de la performance sont extrêmement contraignantes au regard de la largeur du support des évolutions gymniques (10cm) et de la hauteur à laquelle il se situe (125cm). Plus spécifiquement, ce travail contribue à mieux cerner le contrôle de l’équilibre dynamique, chez les gymnastes expertes, lors de la réalisation de mouvements fondamentaux de renversement, dont la difficulté réside principalement dans le passage d’un appui pédestre debout à un appui manuel renversé et impliquant une rotation de 180° du corps. La démarche expérimentale et méthodologique présentée permet le recueil de données pertinentes pour investiguer l’équilibre lors de la réalisation de mouvements volontaires. Elle s’appuie sur un dispositif intégrant une poutre instrumentée permettant de mesurer les efforts externes développés au niveau des appuis pédestres et manuels, complété par un système optoélectronique d’analyse en trois dimensions du mouvement. La première étude a pour objectif de dégager les caractéristiques biomécaniques des mouvements acrobatiques de renversement, réalisées par des gymnastes expertes, en exploitant les données cinématiques et dynamiques du mouvement. La deuxième étude présente pour objectif de déterminer dans quelle mesure les gymnastes sont affectées par la hauteur de la poutre lors de la réalisation de ces acrobaties. La troisième étude évalue ensuite dans quelle mesure la réduction des informations sensorielles disponibles, notamment par la modulation des entrées visuelles et du positionnement de la tête, influe sur le contrôle de l’équilibre lors de la réalisation du mouvement de renversement avant. Les principaux résultats illustrent les effets liés à la réalisation à poutre haute réglementaire ou à l’altération des entrées sensorielles sur le contrôle des mouvements du CM (centre de masse) en interaction avec le CP (centre de pression) The research presented in this thesis deals with gymnasts’ balance while performing acrobatic skills on the balance beam apparatus. During this event, body balance has to be maintained while performance is extremely constrained due to beam’s width (10 cm) and the altitude at which it is held (125 cm). More specifically this work contributes to a better understanding of dynamic balance control for female elite gymnasts while performing fundamental acrobatic skills, which difficulty mostly comes from the change from a foot support to a reverse hand support and involving a 180° rotation of the whole body. Experimental approach and methodology described in this thesis allows for relevant data collection in order to investigate balance while performing voluntary skills. It relies on an experimental setting including an instrumented beam allowing for the measure of external forces as well as an optoelectronic 3D motion analysis device. The first study described in this thesis aims at selecting biomechanical variables of interest in walkover skills using kinematic and kinetic data. The second study deals with the determination of how elite gymnasts are affected by beam’s height while performing these skills. A third study then evaluates to which extent sensory information availability reduction, especially implied by eyesight modulation and head positioning, influences balance control while forward walkover movement performance. The most important results shed light on modifications of centre of mass (COM) movements and center of mass-centre of pressure (COP) interaction

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Carre, Catherine. "Transfert de radionucléides dans les organismes vivants : analyse de données et modélisation : application au domaine de la Manche." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10238.

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De nombreuses donnees issues de prelevements effectues sur le pourtour de la manche entre 1984 et 1993 concernant les concentrations de differents radionucleides (ru-106, co-60, sb-125, cs-137, cs-134) chez plusieurs organismes marins (algues et mollusques) sont analysees a l'aide de methodes statistiques (analyses univariees, multivariees, spectrales). Ce bilan met en evidence l'heterogeneite spatiale et temporelle du domaine d'etude. Un lien etroit apparait entre les series temporelles representant les rejets de l'usine de retraitement de la hague et les concentrations dans l'eau de mer et les bioindicateurs. Des sources secondaires, comme l'accident de tchernobyl en mai 1986, interviennent aussi ponctuellement dans le temps et dans l'espace. Les phenomenes de transfert sont egalement influences par d'autres parametres comme le type d'effluents, les formes physico-chimiques des radionucleides, les processus hydrodynamiques et la physiologie des organismes. L'etude du k-40, un radionucleide naturel, a montre l'existence d'une rythmicite annuelle a relier aux cycles physiologiques des organismes. Plusieurs types de modelisation sont aussi engages. Le transfert global entre la source radioactive et les concentrations dans les organismes vivants peut etre represente par des parametres statistiques (ajustement a des equations traduisant la decroissance spatiale ou methode basee sur des correlations croisees). Ces modeles sont en general limites dans leur champ d'application. Un deuxieme type de modele conceptualise le transfert des radionucleides entre l'eau de mer et la matiere vivante. L'utilisation du facteur de concentration permet d'effectuer une estimation rapide des concentrations dans les bioindicateurs. Un modele base sur la theorie des compartiments est egalement valide. Malgre son contenu cognitif important, son application parait essentiellement adaptee aux cas de rejets accidentels. L'ensemble de ces methodes a permis de preciser les caracteristiques de certains radionucleides, de decrire l'environnement radioecologique de la manche, d'ameliorer les strategies de suivi et de rejets et de tester differents modeles

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Picot, Antoine. "Détection d'hypovigilance chez le conducteur par fusion d'informations physiologiques et vidéo." Phd thesis, Grenoble INPG, 2009. http://www.theses.fr/2009INPG0087.

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Resumen

L'hypovigilance correspond à la transition entre la veille et le sommeil durant laquelle l'organisme voit ses facultés d'observation et d'analyse fortement réduites. Elle est responsable de nombreux accidents sur la route. Le but de cette thèse est de proposer un système de détection de cette phase accidentogène à partir de l'analyse conjointe de l'activité cérébrale (électroencéphalogramme ou EEG) et d'une vidéo du conducteur. Dans un premier temps, une méthode non-supervisée de détection d'hypovigilance fonctionnant à l'aide d'un unique canal EEG a été proposée. Cette méthode, qui met en oeuvre différentes techniques de traitement du signal et de diagnostic, obtient de bonnes performances sur un ensemble de conducteurs, sans qu'il soit nécessaire de régler de paramètres. Dans un deuxième temps, nous nous sommes intéressés à la caractérisation des signes visuels de l'hypovigilance par une analyse vidéo des clignements. Une comparaison entre l'approche vidéo développée et l'approche traditionnelle par électro-oculogramme (EOG) a permis d'étudier dans quelle mesure la vidéo peut remplacer l'EOG pour la caractérisation des clignements. Elle a également permis de souligner la nécessité d'utiliser d'une caméra rapide (pouvant aller jusqu'à 200fps) pour caractériser les clignements. Un algorithme de détection d'hypovigilance à partir de la caractérisation vidéo des clignements a ainsi été développé. Pour finir, un algorithme de détection d'hypovigilance fusionnant, à l'aide de logique floue, les informations obtenues par les approches physiologique et vidéo est présenté. Toutes ces méthodes ont été testées et validées sur une base de données conséquente de conduite en état d'hypovigilance, la base de données ayant été expertisée par un spécialiste Drowsiness is the transition between the awake state and sleep where one's abilities to observe and analyse are strongly reduced. So, drowsiness is responsible for a huge number of road accidents. A drowsiness detection system is presented in this PhD. This system uses both driver's brain activity (through electroencephalogram or EEG) and driver's video analysis to detect drowsiness. A non-supervised method using a single EEG channel is first proposed. Several techniques of diagnostic and signal processing are used in this method. The method obtains good results on a large number of different drivers without tuning any parameters. Drowsiness visual indicatiors have also been studied thanks to a video analysis. The proposed video analysis has been compared to the traditional electro-oculogram (EOG) approach to study the relevance of the video analysis. This comparison highlights the need of a high frame rate camera (which frame rate can reach 200fps) for blinks characterisation. This study leads to drowsiness detection system based on blinks video characterisation. Both EEG and video methods are at last been merged using fuzzy logic to obtain a 2-levels drowsiness detection system. All these methods have been tested and validated on a consistent database of twenty different drivers which was evaluated by a specialist doctor

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Picot, Antoine. "Détection d'hypovigilance chez le conducteur par fusion d'informations physiologiques et vidéo." Phd thesis, Grenoble INPG, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00440959.

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L'hypovigilance correspond à la transition entre la veille et le sommeil durant laquelle l'organisme voit ses facultés d'observation et d'analyse fortement réduites. Elle est responsable de nombreux accidents sur la route. Le but de cette thèse est de proposer un système de détection de cette phase accidentogène à partir de l'analyse conjointe de l'activité cérébrale (électroencéphalogramme ou EEG) et d'une vidéo du conducteur. Dans un premier temps, une méthode non-supervisée de détection d'hypovigilance fonctionnant à l'aide d'un unique canal EEG a été proposée. Cette méthode, qui met en oeuvre différentes techniques de traitement du signal et de diagnostic, obtient de bonnes performances sur un ensemble de conducteurs, sans qu'il soit nécessaire de régler de paramètres. Dans un deuxième temps, nous nous sommes intéressés à la caractérisation des signes visuels de l'hypovigilance par une analyse vidéo des clignements. Une comparaison entre l'approche vidéo développée et l'approche traditionnelle par électro-oculogramme (EOG) a permis d'étudier dans quelle mesure la vidéo peut remplacer l'EOG pour la caractérisation des clignements. Elle a également permis de souligner la nécessité d'utiliser d'une caméra rapide (pouvant aller jusqu'à 200fps) pour caractériser les clignements. Un algorithme de détection d'hypovigilance à partir de la caractérisation vidéo des clignements a ainsi été développé. Pour finir, un algorithme de détection d'hypovigilance fusionnant, à l'aide de logique floue, les informations obtenues par les approches physiologique et vidéo est présenté. Toutes ces méthodes ont été testées et validées sur une base de données conséquente de conduite en état d'hypovigilance, la base de données ayant été expertisée par un spécialiste.

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Ouerdani, Aziz. "Modélisation de données pharmacologiques précliniques et cliniques d'efficacité des médicaments anti-angiogéniques en cancérologie." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016GREAM018/document.

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En l’espace d’une quarantaine d’année, les connaissances sur l’angiogenèse tumorale ont littéralement explosé. Dans les années 1970, Judah Folkman démontre que les tumeurs ont besoin d’être vascularisées pour continuer à proliférer. Peu de temps après, les protagonistes principaux de l’angiogenèse tumorale ont été découverts, de même que les mécanismes dans lesquels ils sont impliqués. La décennie suivante marque le début des recherches sur les molécules à visée anti-angiogénique et c’est en 2004 que le bevacizumab (Avastin, Roche), premier médicament anti-angiogénique utilisé en oncologie, voit le jour. Parallèlement à cela, l’essor de la modélisation à effets-mixtes couplée aux progrès des outils informatiques ont permis de développer des méthodes d’analyses de données de plus en plus performantes. Dès 2009 L’agence de régulation FDA (Food and Drug Administration) aux Etats-Unis a identifié le rôle central de la modélisation numérique pour mieux analyser les données d’efficacité et de toxicité, préclinique et clinique en cancérologie. Le but de ce projet est d’étudier les effets de différents inhibiteurs de l’angiogenèse sur la dynamique tumorale, en se basant sur une approche populationnelle. Les modèles développés seront des modèles à base d’équations différentielles ordinaires intègrant des données et des informations issues de la littérature. L’objectif de ces modèles est de caractériser la dynamique des tailles tumorales chez les animaux et chez les patients, afin de comprendre les effets des traitements anti-angiogéniques et apporter un soutien pour le développement de ces molécules ou pour la prise de décisions thérapeutiques par les cliniciens Within the last 40 years, knowledge of tumor angiogenesis has literally exploded. In the seventies, Judah Folkman demonstrated that tumors need to be vascularized to continue to proliferate. Shortly after, the main protagonists of tumor angiogenesis have been discovered, as well as the mechanisms in which they are involved. The next decade is the beginning of the research on molecules with anti-angiogenic effects and in 2004 bevacizumab (Avastin, Roche), the first antiangiogenic drug used in oncology, was available for treating solid cancer patients. Along with this, the increasing interest of mixed-effects modeling coupled with advances in computer tools allowed developing more efficient methods of data analysis. In 2009, the regulatory agency FDA (Food and Drug Administration) in the United States has identified the central role of numerical modeling to better analyze the efficacy and toxicity preclinical and clinical oncology data. The aim of this project is to study the effects of different angiogenesis inhibitors on tumor dynamics, based on a population approach. The developed models are models based on ordinary differential equations and that integrate data and information from the literature. The objective of these models is to characterize the dynamics of tumor sizes in animals and patients in order to understand the effects of anti-angiogenic treatments and provide support for the development of these molecules, or to help clinicians for therapeutic decision making

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Codaccioni, Marc. "Évaluation de l’exposition fœtale aux substances chimiques grâce à la modélisation pharmacocinétique basée sur la physiologie (PBPK) et son application aux données d’imprégnation des populations." Thesis, Paris, Institut agronomique, vétérinaire et forestier de France, 2020. http://www.theses.fr/2020IAVF0019.

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Des études de biosurveillance ont montré l’exposition des femmes enceintes à des substances de synthèse. Parallèlement, plusieurs études épidémiologiques ont mis en évidence des associations entre des concentrations mesurées dans le sang des femmes enceintes ou dans le sang de cordon et des effets néfastes sur le nouveau-né comme sur sa santé plus tard dans la vie. Néanmoins, ce type de mesures n’offre pas la certitude d’être représentatif des expositions intra-utérines tout au long de la grossesse, et il n’est pas envisageable de mesurer longitudinalement les concentrations fœtales pour des raisons éthiques évidentes. Les modèles pharmacocinétiques basés sur la physiologie pour la femme enceinte et son fœtus (pPBPK) permettent de simuler les expositions internes d’un xénobiotique dans différents organes au cours de la grossesse. Ils fournissent donc l’opportunité de parfaire les estimations de la relation entre dose et risque de survenue d’effets toxiques par une amélioration de la dosimétrie au niveau des tissus. Toutefois, même si les modèles pPBPK peuvent intégrer les changements physiologiques liés à la grossesse, la connaissance de certains processus reste parfois limitée. C’est notamment le cas du passage transplacentaire (PT). L’objectif de la thèse consiste à améliorer la prise en compte du PT dans la modélisation pPBPK en vue de prédire des expositions internes fœtales à partir de données de biosurveillance.Une revue de la littérature sur la modélisation du PT dans les modèles pPBPK a été menée. Ce travail a permis d’identifier 12 structures parmi 50 modèles originaux qui correspondent à 4 types de profils cinétiques liés au nombre de constantes de passage. Les données animales représentaient leur principale source de paramétrisation, même si celles-ci ne sont pas directement extrapolables à l’homme et impliquent le sacrifice de nombreux animaux. A partir de notre revue, nous avons développé un modèle pPBPK intégrant quatre modèles de PT non basés sur des données animales afin d’évaluer leurs performances prédictives de la dosimétrie fœtale sur 10 composés. Nos résultats montrent que ces performances variaient suivant les modèles et les substances, empêchant d’identifier un modèle prédictif de référence. Des simulations Monte-Carlo ont permis de montrer qu’un des modèles différait des trois autres concernant les variations de profils d’exposition fœtale au cours des trimestres de grossesse. Enfin, une analyse de sensibilité globale a souligné l’influence majeure des constantes de passage et dans une moindre mesure de la clairance métabolique comme de la fraction libre sur l’exposition fœtale simulée. La dernière partie de la thèse a consisté à utiliser le modèle pPBPK développé pour estimer les concentrations internes fœtales des enfants de la cohorte française ELFE pour deux PCB et deux PBDE à partir de concentrations plasmatiques maternelles. Pour ce faire, nous avons sélectionné un modèle de PT spécifique à chaque composé sur la base de la qualité de prédiction de ratios de concentrations fœtale sur maternelle à terme. Le classement des substances basé sur des indicateurs d’exposition simulés s’est révélé être variable entre la mère et le fœtus à terme, comme entre le premier et les deux autres trimestres dans le plasma fœtal.En conclusion, ce travail souligne le potentiel de la modélisation pPBPK pour l’évaluation des expositions prénatales. Il démontre la capacité d’un modèle à simuler des indicateurs d’exposition interne adéquats d’un point de vue mécanistique et temporel, notamment à partir de données de biosurveillance. Aussi, dans un contexte de fortes contraintes éthique et réglementaire, ce travail éclaire sur l’apport des méthodes alternatives dans la paramétrisation de processus clé de la dose interne fœtale tel que le passage transplacentaire. L’apport de cette thèse pourra être mis œuvre dans l’étude de l’exposome prénatal comme dans l’évaluation du risque de toxicité développementale d’une substance Numerous biomonitoring studies have shown the exposure of pregnant women to synthetic substances. In parallel, several epidemiological studies have highlighted associations between maternal blood concentrations measured during pregnancy or cord blood concentrations measured at birth and adverse effects in the offspring at birth or later in life. However, this type of measurements does not guarantee being representative of in utero exposures throughout pregnancy. Furthermore, it is not possible to measure longitudinally fetal concentrations due to obvious ethical reasons. Pregnancy physiologically-based pharmacokinetic (pPBPK) models allow the simulation of xenobiotic internal exposures in different maternal and fetal organs during gestation. Therefore, they offer an opportunity to better estimate the relationship between the dose and the risk of a toxic effect by considering tissue dosimetry. Although pPBPK models often incorporate physiological changes associated with pregnancy, some processes are still poorly known such as placental transfer (PT). The aim of the thesis is to improve the integration of PT in pPBPK modelling in order to predict fetal internal exposures from biomonitoring data.First, a scientific literature review of the published pPBPK models was conducted with a focus on the various model structures used to describe PT. It allowed the identification of 12 structures among 50 original models which corresponded to 4 types of kinetic profiles according to the number of transfer constants. Animal in vivo data were identified as the main source to support their parameterization although they cannot be directly extrapolated to humans and imply the killing of numerous animals. From this basis, we developed a pPBPK model which integrated four transfer models calibrated using non-animal methods so as to assess their performance to predict the fetal dosimetry on a set of ten substances. Our results show that the performance varied among models and substances, preventing the identification of a reference predictive model. Monte-Carlo simulations showed that one of the transfer models differed from the others in terms of fetal exposure variation across trimesters. Finally, a global sensitivity analysis shed light on a great extent of influence of the transfer constants as well as the metabolic clearance and fraction unbound, to a lesser extent, on simulated fetal exposure. The last part of the thesis consisted in applying the developed pPBPK model to estimate the internal fetal concentrations of two PCB and two PBDE substances from observed maternal plasma concentrations taken from the French ELFE cohort. To that end, we selected a specific PT model for each compound based on the prediction of fetal to maternal concentrations ratio at term. The ranking of chemicals based on the simulated exposure indicators varied between mother and fetus at term, as between the first and the other two trimesters in fetal plasma.In conclusion, this work highlights the potential of pPBPK modelling in the prenatal exposures assessment. It demonstrates the ability of a model to simulate adequate internal exposure indicators from a mechanistic and temporal points of view, notably from biomonitoring data. Furthermore, in light of strong ethical and regulatory constraints, this work indicates the role of alternative methods in the parameterization of key processes of the internal fetal dose such as the transplacental passage. This work could be used for the assessment of the prenatal exposome as well as in the developmental toxicity risk assessment of a substance

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Rondeau, Virginie. "Analyse par vraisemblance pénalisée de données de survie groupées : application à la relation entre aluminium et démence." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR28719.

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ROUSSEL, ERIC. "Analyse des donnees d'un questionnaire sportif et de cadre de vie et du suivi physiologique de 22 gymnastes de haut niveau ages de 8 a 17 ans." Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO1M052.

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Lourme, Bertrand. "Traitement de données physiques et physiologiques effectué sur des kayakistes de course en ligne caractérisation du geste et optimisation du rendement énergétique." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37599275p.

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Douros, Ioannis. "Towards a 3 dimensional dynamic generic speaker model to study geometry simplifications of the vocal tract using magnetic resonance imaging data." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2020. http://www.theses.fr/2020LORR0115.

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Resumen

Dans cette thèse, nous avons utilisé les données de l’IRM du conduit vocal pour étudier la production de la parole. La première partie consiste en l’étude de l’impact que le vélum, l’épiglotte et la position de la tête a sur la phonation de cinq voyelles françaises. Des simulations acoustiques ont été utilisées pour comparer les formants des cas étudiés avec la référence afin de mesurer leur impact. Pour cette partie du travail, nous avons utilisé des IRM statiques en 3D. Comme la parole est généralement une phénomène dynamique une question s’est posée, à savoir s’il serait possible de traiter les données 3D afin d’incorporer des informations temporelles de la parole continue. Par conséquent, la deuxième partie présente quelques algorithmes que l’on peut utiliser pour améliorer les données de production de la parole. Plusieurs transformations d’images ont été combinées afin de générer des estimations des formes du conduit vocal qui sont plus informatives que les originales. À ce stade, nous avons envisagé, outre l’amélioration des données de production de la parole, de créer un modèle de référence générique qui pourrait fournir des informations améliorées non pas pour un sujet spécifique, mais globalement pour la parole. C’est pourquoi nous avons consacré la troisième partie l’étude d’un algorithme permettant de créer un atlas spatio-temporel de l’appareil vocal qui peut être utilisé comme référence ou standard pour l’étude de la parole car il est indépendant du locuteur. Enfin, la dernière partie de la thèse, fait référence à une sélection de questions ouvertes du domaine qui restent encore sans réponse, quelques pistes intéressantes que l’on peut développer à partir de cette thèse et quelques approches potentielles qui pourraient être envisager afin de répondre à ces questions In this thesis we used MRI (Magnetic Resonance Imaging) data of the vocal tract to study speech production. The first part consist of the study of the impact that the velum, the epiglottis and the head position has on the phonation of five french vowels. Acoustic simulations were used to compare the formants of the studied cases with the reference in order to measure their impact. For this part of the work, we used 3D static MR (Magnetic Resonance) images. As speech is usually a dynamic phenomenon, a question arose, whether it would be possible to process the 3D data in order to incorporate dynamic information of continuous speech. Therefore the second part presents some algorithms that one can use in order to enhance speech production data. Several image transformations were combined in order to generate estimations of vocal tract shapes which are more informative than the original ones. At this point, we envisaged apart from enhancing speech production data, to create a generic speaker model that could provide enhanced information not for a specific subject, but globally for speech. As a result, we devoted the third part in the investigation of an algorithm that one can use to create a spatiotemporal atlas of the vocal tract which can be used as a reference or standard speaker for speech studies as it is speaker independent. Finally, the last part of the thesis, refers to a selection of open questions of the field that are still left unanswered, some interesting directions that one can expand this thesis and some potential approaches that could help someone move forward towards these directions

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Fournel, Arnaud. "Classification automatique de données IRMf : application à l'étude des réseaux de l'émotion." Thesis, Lyon 2, 2013. http://www.theses.fr/2013LYO20066.

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Resumen

Depuis une quinzaine d'années, l'Imagerie par Résonance Magnétique fonctionnelle (IRMf) permet d'extraire de l'information sur le fonctionnement cérébral et particulièrement sur la localisation des processus cognitifs. L'information contenue par les acquisitions en IRMf est extraite à l'aide du modèle linéaire général et du processus d'inférence statistique. Bien que cette méthode dite « classique » ait permis de valider la plupart des modèles lésionnels de manière non invasive, elle souffre de certaines limites. Pour résoudre ce problème, différentes techniques d'analyse ont émergé et proposent une nouvelle façon d'interpréter les données de la neuroimagerie. Nous présentons deux nouvelles méthodes multivariées basées sur les cartes de Kohonen. Nos méthodes analysent les données IRMf avec le moins d'a priori possibles. En parallèle, nous tentons d'extraire de l'information sur les réseaux neuronaux impliqués dans les émotions. La première de ces méthodes s'intéresse à l'information de spécialisation fonctionnelle et la seconde à l'information de connectivité fonctionnelle. Nous présentons les résultats qui en découlent, puis chacune des méthodes est comparée à l'analyse dite classique en termes d'informations extraites. De plus, notre attention s'est focalisée sur la notion de valence émotionnelle et nous tentons d'établir l'existence d'un éventuel réseau partagé entre valence positive et valence négative. La constance de ce réseau est évaluée à la fois entre modalités perceptives et entre catégories de stimuli. Chacune des méthodes proposées permet de corroborer l'information recueillie par la méthode classique, en apportant de nouvelles informations sur les processus étudiés. Du point de vue des émotions, notre travail met en lumière un partage du réseau cérébral pour les va-lences négative et positive ainsi qu'une constance de cette information dans certaines régions cérébrales entre modalités perceptives et entre catégories In the last fifteen years, functional magnetic resonance imaging (fMRI) have been used to extract information about cognitive processes location. The information contained in fMRI acquisitions is usually extracted using the general linear model coupled to the statistical inference process. Although this classical method has validated noninvasively most of the lesional models, it suffers from some limitations. To solve this problem, various analysis techniques have emerged and propose a new way of interpreting neuroimaging data. In this thesis, we present two multivariate methods to analyze fMRI data with the least possible a priori. In parallel, we are trying to extract information about brain emotion processing. The first method focuses on the brain functional specialization and the second method on the brain functional connectivity. After results presentation, each method is compared to the so-called classical analysis in terms of extracted information. In addition, emphasis was put on the concept of emotional valence. We try to establish the existence of a possible split between positive and negative valence networks. The consistency of the network is evaluated across both perceptual modalities and stimuli categories. Each of the proposed methods are as accurate as the conventional method and provide new highlights on the studied processes. From the perspective of emotions, our work highlights a shared brain network for positive and negative valences and a consistency of this information in some brain regions across both perceptual modalities and stimuli categories

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Handouzi, Wahida. "Traitement d'information mono-source pour la validation objective d'un modèle d'anxiété : application au signal de pression sanguine volumique." Thesis, Université de Lorraine, 2014. http://www.theses.fr/2014LORR0237/document.

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Resumen

La détection et l’évaluation des émotions sont des domaines qui suscitent un grand intérêt par de nombreuses communautés tant au niveau des sciences humaines que des sciences exactes. Dans cette thèse nous nous intéressons à la reconnaissance de l’anxiété sociale qui est une peur irrationnelle ressentie par une personne lors de toute forme de relation sociale. L’anxiété peut être révélée par un ensemble de traits physiques et physiologiques tels que l’intonation de la voix, les mimiques faciales, l’augmentation du rythme cardiaque, le rougissement… etc. L’avantage de l’utilisation des mesures physiologiques est que les individus ne peuvent pas les manipuler, c’est une source continue de données et chaque émotion est caractérisée par une variation physiologique particulière. Dans ce travail, nous proposons un système de mesure d’anxiété basé sur l’utilisation d’un seul signal physiologique « signal de pression sanguine volumique (Blood volume pulse BVP)». Le choix d’un seul capteur limite la gêne des sujets due au nombre de capteurs. De ce signal nous avons sélectionné des paramètres pertinents représentant au mieux les relations étroites du signal BVP avec le processus émotionnel de l’anxiété. Cet ensemble de paramètres est classé en utilisant les séparateurs à vastes marges SVM. Les travaux engagés dans le domaine de la reconnaissance des émotions utilisent fréquemment, pour support d’information, des données peu fiables ne correspondant pas toujours aux situations envisagées. Ce manque de fiabilité peut être dû à plusieurs paramètres parmi eux la subjectivité de la méthode d’évaluation utilisée (questionnaire, auto-évaluation des sujets, …etc.). Nous avons développé une approche d’évaluation objective des données basée sur les dynamiques des paramètres sélectionnés. La base de données utilisée a été enregistrée dans notre laboratoire dans des conditions réelles acquises sur des sujets présentant un niveau d’anxiété face aux situations sociales et qui ne sont pas sous traitement psychologique. L’inducteur utilisé est l’exposition à des environnements virtuels représentant quelques situations sociales redoutées. L’étape d’évaluation, nous a permis d’obtenir un modèle de données fiable pour la reconnaissance de deux niveaux d’anxiété. Ce modèle a été testé dans une clinique spécialisée dans les thérapies cognitives comportementales (TCC) sur des sujets phobiques. Les résultats obtenus mettent en lumière la fiabilité du modèle construit notamment pour la reconnaissance des niveaux d’anxiété sur des sujets sains ou sur des sujets phobiques ce qui constitue une solution au manque de données dont souffrent les différents domaines de reconnaissances Detection and evaluation of emotions are areas of great interest in many communities both in terms of human and exact sciences. In this thesis we focus on social anxiety recognition, which is an irrational fear felt by a person during any form of social relationship. Anxiety can be revealed by a set of physical and physiological traits such as tone of voice, facial expressions, increased heart rate, flushing ... etc. The interest to the physiological measures is motivated by them robustness to avoid the artifacts created by human social masking, they are a continuous source of data and each emotion is characterized by a particular physiological variation. In this work, we propose a measurement system based on the use of a single physiological signal "Blood volume pulse BVP". The use of a single sensor limits the subjects’ discomfort. From the BVP signal we selected three relevant features which best represents the close relationship between this signal and anxiety status. This features set is classified using support vector machine SVM. The work undertaken in the field of emotion recognition frequently use, for information support, unreliable data do not always correspond to the situations envisaged. This lack of reliability may be due to several parameters among them the subjectivity of the evaluation method used (self-evaluation questionnaire, subjects…etc.). We have developed an approach to objective assessment of data based on the dynamics of selected features. The used database was recorded in our laboratory under real conditions acquired in subjects with a level of anxiety during social situations and who are not under psychological treatment. The used stimulus is the exposition to virtual environments representing some feared social situations. After the evaluation stage, we obtained a reliable model for the recognition of two levels of anxiety. The latter was tested in a clinic specializing in cognitive behavioral therapy (CBT) on phobic subjects. The results highlight the reliability of the built model specifically for the recognition of anxiety levels in healthy subjects or of phobic subjects, what constitutes a solution to the lack of data affecting different areas of recognition

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Morlan-Salesse, Carole. "Aide à la formulation des formes pateuses à l'usage cutané." Toulouse 3, 1994. http://www.theses.fr/1994TOU32053.

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Migault, Lucile. "Exposition maternelle aux champs électromagnétiques, prématurité et petit poids de naissance pour l’âge gestationnel : données des cohortes Elfe et Epipage2." Thesis, Bordeaux, 2018. http://www.theses.fr/2018BORD0263/document.

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Resumen

Les champs électromagnétiques présents dans l’environnement - qu’ils soient d’extrêmement basses fréquences ou radiofréquences - sont responsables d’expositions continuelles des populations. Toutefois, leur potentiel impact sur la santé néonatale est encore aujourd’hui mal connu, notamment en raison des difficultés des études épidémiologiques à évaluer l’exposition ubiquitaire à ces champs de façon suffisamment détaillée et précise. Le premier objectif de cette thèse était d’étudier le lien entre l’exposition maternelle aux champs électromagnétiques d’extrêmement basses fréquences et deux indicateurs de la santé néonatale : la prématurité et le petit poids de naissance pour l’âge gestationnel. Le second objectif était de construire un outil permettant une estimation quantitative de l’exposition professionnelle aux radiofréquences. Les travaux menés en réponse au premier objectif s’appuient sur les données de deux cohortes de naissances françaises. L'exposition cumulée aux champs électromagnétiques d’extrêmement basses fréquences au cours de la grossesse a été évaluée grâce à l’application d’une matrice emploi exposition. Les résultats obtenus étaient en faveur d’une absence d’association avec le risque de petit poids de naissance pour l’âge gestationnel. Une association modeste pour le risque de prématurité spontanée a été rapportée chez les mères dont l’exposition cumulée jusqu’à 28 semaines d’aménorrhée était la plus élevée. Les travaux menés en réponse au second objectif reposent sur une collaboration internationale. A partir des calendriers professionnels recueillis dans le cadre d’une étude cas-témoins internationale et de mesures d’exposition extraites de la littérature, ces travaux ont permis la création d’une première matrice emploi exposition quantitative spécifique aux hautes fréquences et applicable dans les études épidémiologiques Electromagnetic fields in the environment - whether extremely low frequency or radiofrequency - are responsible for continuous population exposure. However, the potential impact of exposure to electromagnetic fields on neonatal health during pregnancy is still not well known, in particular due to the difficulties for epidemiological studies to assess in sufficient detail and precision the exposure to electromagnetic fields, which is ubiquitous. The first objective of this thesis was to study the relationship between maternal exposure to extremely low frequency electromagnetic fields and two indicators of neonatal health: prematurity and small for gestational age. The second objective was to build a tool for quantitative estimation of occupational exposure to radiofrequencies. The work carried out in response to the first objective is based on data from two French birth cohorts. Cumulative exposure to extremely low frequency electromagnetic fields during pregnancy was assessed using a job-exposure matrix. The results were in favor of an absence of association with the risk of small for gestational age. However, for the risk of spontaneous prematurity, a modest association was reported among the most exposed mothers up to 28 weeks of gestation. The work carried out in response to the second objective is based on an international collaboration. On the basis of the job calendars collected in an international case-control study and exposure measurements extracted from the literature, a first quantitative job-exposure matrix to estimate occupational exposure to high frequency electromagnetic fields in epidemiological studies was created

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Roux, Aurélie. "Analyse du métabolome urinaire humain par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse à haute résolution." Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066575.

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Resumen

L’objectif de ce travail de thèse est de développer une base de données spectrale pour faciliter l’annotation et l’interprétation biologique des jeux de données d’analyse métabolomique obtenus en utilisant la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse. Deux approches ont été utilisées : l’identification par comparaison aux spectres de masse de composés de références et l’identification directement à partir des données biologiques. Pour la première approche une chiomiothèque de métabolite a été constituée et analysée. L’identification à partir de données biologiques a été réalisée sur une cohorte de volontaires de 227 individus travaillant au CEA. 244 métabolites ont ainsi été identifiés dans les urines humaines, donc 78 jamais été décrits comme faisant parti du métabolome urinaire. 139 métabolites ont également était caractérisés sur la base de leur masse précise mais sans identification formelle. Ces 383 métabolites représentent environ 1000 ions dans chacun des modes d’ionisation. Les variations physiologiques au sein de la cohorte, en fonction de l’âge, du poids et du genre, de ces différents métabolites ont été étudiées afin de construire une base de données relationnelle. Enfin, le métabolome urinaire pouvant être affecté par les conditions de prélèvement des échantillons d’urines, nous avons réalisé des études de stabilité dans les conditions de prélèvement des métabolites précédemment caractérisés. Ces études nous ont permis de proposer des recommandations en termes de conditions de prélèvement et de stockage à court terme des urines et de mesurer l’impact de la contamination bactérienne sur les concentrations de différents métabolites urinaires

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Vouriot, Alexandre Perrin Philippe. "Identification de facteurs posturaux individuels et environnementaux à l'origine de troubles de l'équilibre chez l'homme au travail." [S.l.] : [s.n.], 2005. http://www.scd.uhp-nancy.fr/docnum/SCD_T_2005_0023_VOURIOT.pdf.

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Sambron-Di, Prizio Anne-Catherine Rat Cédric. "La prescription d'hypnotiques par le médecin généraliste en dehors d'une consultation étude rétrospective à partir des données de remboursement des CPAM de Loire Atlantique et de Vendée /." [S.l.] : [s.n.], 2008. http://castore.univ-nantes.fr/castore/GetOAIRef?idDoc=48071.

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FOUCHER, JEAN-LUC. "Etude des proteines de liaison des steroides sexuels chez la truite arc en ciel (oncorhynchus mykiss) : 1) donnees physiologiques et biochimiques; 2) aspects in vivo et in vitro de leur regulation chez le male." Rennes 1, 1990. http://www.theses.fr/1990REN10121.

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Resumen

Nous avons etudie les proteines de liaison des steroides sexuels dans le testicule (abp) et le plasma sanguin (sbp) de truite male; ceci dans un double but: recherche un marqueur de l'activite des cellules de sertoli (role joue par l'abp chez les mammiferes), et mieux apprehender la regulation de l'action des steroides sexueles a travers celle des proteines liant ces steroides. Resultats: les proteines testiculaire ou plasmatique lient toutes les deux la testosterone avec une forte affinite (kd=2. 5 nm) et les autres steroides selon l'ordre d'affinite suivant: testosterone>stradiol>>progesterone>11 kt>>cortisol. Les cinetiques de liaison des complexes proteine-testosterone sont tres rapides (t 1/2 dissociation=1 min). Par ailleurs, les deux proteines ont le meme comportement electrophoretique et sont toutes deux glycosylees. In vivo, la concentration testiculaire de proteine de liaison est superieure a ce que laisse supposer une simple contamination sanguine. L'hypophysectomie entraine une baisse significative (40%) de la concentration plasmatique de sbp mais, apres 12 jours, aucune variation de la concentration de la proteine de liaison testiculaire n'est mesuree. La castration n'entraine aucune baisse de la sbp plasmatique. Durant la periode de spermiation, une baisse tres importante (80%) de la concentration de sbp et une baisse de 50% de la concentration d'abp sont mesurees alors que la mise a jeun prolongee entraine une baisse moderee de la sbp. Enfin, l'administration parenterale d'stradiol s'accompagne d'une augmentation de la concentration de sbp alors que l'administration de testosterone, de cortisol ou de gh est sans effet sur la proteine. In vitro, si une production apparente d'abp par des explants testiculaires a pu etre mesuree, cette proteine n'a pu etre detectee dans des cultures de cellules somatiques testiculaires et aucune influence de l'hormone gonadotrope maturante ou d'extrait

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Galinier, Thomas. "Analyse multifactorielle de la performance des cultures - Méthodes et automatisation pour l’intégration de données agronomiques, environnementales, sociales et économiques - Exemple du maïs grain non-irrigué en Amérique du Nord." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLC026.

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Resumen

La demande mondiale de nourriture et d’energie est en constante augmentation. L’accès à de nouvelles terres arables étant limité, les agriculteurs devront produire environ 70% de plus par hectare d'ici 2050. L'optimisation et la rationalisation des systèmes de production agricole sont essentielles pour assurer la sécurité alimentaire des populations dans des conditions durables. La communauté agricole serait en mesure d'optimiser les performances des cultures en ayant accès à une meilleure compréhension des systèmes de production, notamment concernant leur potentiel et principaux facteurs limitants. Dans ce contexte, la caractérisation des conditions de croissance des cultures prenant en compte leurs impacts sur le potentiel de production et sur les pertes de rendement est importante pour identifier les marges de progrès et proposer des systèmes agricoles améliorés.Dans cette étude une approche est proposée pour caractériser l'environnement de grandes zones géographiques prenant en compte les impacts des ressources clés au développement des plantes (température, rayonnement, eau et azote) sur la performance des cultures. Le niveau de disponibilité de ces ressources a été estimé en utilisant des approches de modélisation de culture, intégrant données météorologiques et caractéristiques de sol. L'efficacité d'utilisation des ressources disponibles a été caractérisée par les pratiques culturales ainsi que la stratégie et l’environnement technique des agriculteurs. Une procédure générique d’intégration de la donnée a été établie et utilisée pour décrire la production de maïs grain en Amérique du Nord de 1991 à 2013. Le jeu de données résultant de cette intégration couvre 84% des superficies plantées en maïs, décrites par 1 558 unités spatiales élémentaires, pour un total de 28 303 scénarios indépendants. Cette méthode combine et harmonise les observations de rendement issues des statistiques agricoles avec un large ensemble de descripteurs pertinents de conditions de croissance.Un sous-ensemble de 21 facteurs limitants a été identifié par une analyse de sélection de variables pour expliquer 66% de la variabilité des pertes de rendement observées. Compte tenu du nombre de dimensions du jeu de donnée, la méthode relaxed lasso a été choisie comme un compromis intéressant entre capacité de prédiction et d’interprétation. Les descripteurs sélectionnés montrent la contribution de la gestion des cultures à la variabilité des pertes de rendement, en particulier les niveaux d'intensification de l’agriculture et l’environnement technique des agriculteurs. Le troisième facteur principal est la disponibilité en eau et la sécheresse qui en résulte. L’utilisation des connaissances en physiologie dans la conception de descripteurs a considérablement amélioré la capacité d’interprétation de la proposition et la confiance des utilisateurs finaux dans l'approche.La structure des facteurs limitant le rendement a été utilisée pour identifier les Environnements Types les plus fréquents. Deux approches ont été proposes : l’une axée uniquement sur les facteurs physiologiques et l’autre intégrant également l’identification de marchés de taille homogène. 11 Environnements Types ont été identifiés en fonction des facteurs physiologiques et 8 en combinant facteurs physiologiques et contraintes de taille de marché. Les Environnements Types basés sur les facteurs physiologiques sont très informatifs sur l'évolution historique des pratiques culturales et les changements de stratégie des agriculteurs au cours du temps. Une telle catégorisation des conditions de croissance a montré des capacités à reproduire l'expertise de terrain et à soutenir l'évaluation de génotypes. Trois cas d'utilisation ont servi à illustrer l'intérêt de l'approche pour (i) décrire l'historique environnemental d'un marché, (ii) définir des populations d’Environnements cibles (TPE) et (iii) évaluer la pertinence de l'échantillonnage environnemental de réseaux multi-lieux (MET) The global demand for food and energy is constantly increasing. As access to spare arable land is limited, growers will have to produce about 70% more per hectare by 2050. Optimization and rationalization of the agricultural production systems is then critical to ensure food security under sustainable conditions. The agricultural community would be in a position to optimize crop performance by better understanding the cropping systems, especially regarding potential production and limiting factors. In this context, the ability to characterize crop growing conditions in regards to their impacts on potential yield and yield gap is important in order to identify margins of progress and propose improved farming systems.An approach is proposed to characterize the crop environment of large geographical areas taking into consideration the impact on crop performance of the key resources for plant development (temperature, solar radiation, water and nitrogen). The level of availability of each resource was estimated by using crop modeling approaches integrating weather data and soil characteristics as inputs. The efficiency of use of the available resources was characterized by crop practices, grower strategy and grower technical environment. A generic integration procedure was established and used to describe corn production for grain in North America from 1991 to 2013. The resulting dataset covers 84% of the total corn planted area, deciphered in 1,558 elementary spatial units, for a total of 28,303 independent scenarios. Such a method combines and harmonizes, at scale, yield observations from agricultural statistics with a large set of relevant descriptors of growing conditions.A subset of 21 main limiting factors was identified through variable-selection analysis to explain 66% of the observed yield-gap variability. The relaxed lasso method resulted in an interesting compromise between interpretability and prediction ability. The selected descriptors highlighted the contribution of crop management in yield-gap variability, especially regarding levels of crop intensification and the technical environment of growers. The third main factor is water availability and resulting drought. The integration of knowledge in crop physiology into descriptor design significantly improved the interpretability of the proposal and the confidence of end-users in the approach.Yield-gap patterns were used to identify the set of most frequent Environment Types. Two approaches were proposed: one focused on crop physiology drivers and another also considered market-size homogeneity among Environment Types. This resulted in 11 Environment Types based on crop physiology drivers and 8 Environment Types when combining crop physiology drivers and market constraints. Crop-physiology Environment Types are very informative on the historical evolution of cultural practices and the changes in grower strategies over the studied period. Such categorization of growing conditions demonstrated the ability to reproduce field expertise and support genotype evaluation. Three business Use Cases were used to illustrate the interest of the approach in (i) describing the environmental history of a market, (ii) defining relevant Target Population Environments (TPE) and (iii) evaluating the environmental sampling relevance of Multi-Environment Trials (MET)

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Firmo, Drumond Thalita. "Apports croisées de l'apprentissage hiérarchique et la modélisation du système visuel : catégorisation d'images sur des petits corpus de données." Thesis, Bordeaux, 2020. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03129189.

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Resumen

Les réseaux neuronaux convolutifs profonds ("deep convolutional neural networks" ou DCNN) ont récemment révolutionné la reconnaissance d'objets à grande échelle, modifiant les pratiques en vision par ordinateur, consistant à définir des caractéristiques représentatives "à la main", désormais apprises de façon hiérarchique à partir des données, tout en les classifiant. Fort de la progression des performances matérielles, on exploite efficacement des quantités toujours croissantes d'images recueillies en ligne. Mais, dans des domaines spécifiques, comme en santé ou pour certaines applications, les données sont moins abondantes, et les coûts d'étiquetage par des experts sont plus élevés. Cette rareté conduit à la question centrale de cette thèse : Ces domaines à données limitées peuvent-ils bénéficier des avantages des DCNN pour la classification des images ? Ce travail repose sur une étude approfondie de la littérature, divisée en deux parties principales, avant de proposer des modèles et des mécanismes originaux, expérimentés.La première partie couvre la reconnaissance des objets d'un double point de vue. Tout d'abord, la fonction visuelle biologique, est comparée et contrastée avec la structure, la fonction et les capacités des modèles DCNN. Puis, une revue de l'état-de-l'art identifie les principales catégories d'architectures et les innovations dans les DCNN récents. Cette base interdisciplinaire favorise l'identification des mécanismes — biologiquement et artificiellement inspirés — qui améliorent la reconnaissance d'images dans des situations difficiles. Le traitement récurrent en est un exemple clair : peu présent au niveau de la vision profonde, sauf le traitement aux vidéos — en raison du caractère naturellement séquentiel. Mais la biologie montre clairement qu'un tel traitement joue aussi un rôle dans l'affinement de notre perception d'une scène fixe. Ce thème est approfondi à travers une revue de la littérature consacrée aux architectures convolutionnelles récurrentes utilisées en catégorisation d'images.La deuxième partie se concentre sur notre question centrale~: l'apprentissage profond sur de petits corpus de données. Tout d'abord, le travail propose une discussion plus précise et détaillée de ce problème et de sa relation avec l'apprentissage hiérarchique des caractéristiques réalisé par des modèles profonds. Cette discussion est suivie d'une revue structurée du domaine, organisant et discutant les différentes voies possibles vers l'adaptation des modèles profonds à des données limitées. Plus qu'une simple liste, ce travail vise à trouver du sens dans la myriade d'approches du domaine, en regroupant les méthodes ayant un objectif ou un mécanisme d'action similaire, pour guider le développement d'application particulières, à petits corpus. Cette étude est complétée par une analyse expérimentale, explorant l'apprentissage de petits jeux de données avec des modèles et mécanismes originaux (précédemment publié comme papier de journal).En conclusion, l'apprentissage profond sur des petits corpus de données peut donner de bons résultats, si cela se fait de manière réfléchie. Au niveau des données, il faut essayer de recueillir plus d'informations à partir de sources de données supplémentaires connexes. Au niveau de la complexité, l'architecture et les méthodes d'entraînement peuvent être calibrées afin de tirer le meilleur parti de toute connaissance spécifique au domaine. Des propositions sont discutées en détail au fil du document. Il existe de multiples façons de réduire la complexité de l'apprentissage profond avec de petits échantillons de données, mais il n'y a pas de solution universelle. Chaque méthode a ses propres inconvénients et difficultés pratiques, devant toujours être adaptée spécifiquement à l'application, c'est-à-dire à la tâche perceptive à accomplir Deep convolutional neural networks (DCNN) have recently protagonized a revolution in large-scale object recognition. They have changed the usual computer vision practices of hand-engineered features, with their ability to hierarchically learn representative features from data with a pertinent classifier. Together with hardware advances, they have made it possible to effectively exploit the ever-growing amounts of image data gathered online. However, in specific domains like healthcare and industrial applications, data is much less abundant, and expert labeling costs higher than those of general purpose image datasets. This scarcity scenario leads to this thesis' core question: can these limited-data domains profit from the advantages of DCNNs for image classification? This question has been addressed throughout this work, based on an extensive study of literature, divided in two main parts, followed by proposal of original models and mechanisms.The first part reviews object recognition from an interdisciplinary double-viewpoint. First, it resorts to understanding the function of vision from a biological stance, comparing and contrasting to DCNN models in terms of structure, function and capabilities. Second, a state-of-the-art review is established aiming to identify the main architectural categories and innovations in modern day DCNNs. This interdisciplinary basis fosters the identification of potential mechanisms - inspired both from biological and artificial structures — that could improve image recognition under difficult situations. Recurrent processing is a clear example: while not completely absent from the "deep vision" literature, it has mostly been applied to videos — due to their inherently sequential nature. From biology however it is clear such processing plays a role in refining our perception of a still scene. This theme is further explored through a dedicated literature review focused on recurrent convolutional architectures used in image classification.The second part carries on in the spirit of improving DCNNs, this time focusing more specifically on our central question: deep learning over small datasets. First, the work proposes a more detailed and precise discussion of the small sample problem and its relation to learning hierarchical features with deep models. This discussion is followed up by a structured view of the field, organizing and discussing the different possible paths towards adapting deep models to limited data settings. Rather than a raw listing, this review work aims to make sense out of the myriad of approaches in the field, grouping methods with similar intent or mechanism of action, in order to guide the development of custom solutions for small-data applications. Second, this study is complemented by an experimental analysis, exploring small data learning with the proposition of original models and mechanisms (previously published as a journal paper).In conclusion, it is possible to apply deep learning to small datasets and obtain good results, if done in a thoughtful fashion. On the data path, one shall try gather more information from additional related data sources if available. On the complexity path, architecture and training methods can be calibrated in order to profit the most from any available domain-specific side-information. Proposals concerning both of these paths get discussed in detail throughout this document. Overall, while there are multiple ways of reducing the complexity of deep learning with small data samples, there is no universal solution. Each method has its own drawbacks and practical difficulties and needs to be tailored specifically to the target perceptual task at hand

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Raguideau, Sébastien. "Analyse de données de métagénomique fonctionnelle par NMF pour la modélisation de la dégradation des fibres par le microbiote intestinal humain." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLA027/document.

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Resumen

Ce travail de thèse a pour but de modéliser la capacité de dégradation des polysaccharides non digestibles par le microbiote intestinal humain. Nous exploitons pour cela des données métagénomiques. Il s'agit de données d'abondances de séquences de nucléotides dans 1408 échantillons dont les fonctions métaboliques sont assignées par annotation contre une base de données. Les séquences sont annotées par des marqueurs fonctionnels. Après une étape de sélection manuelle de 86 marqueurs fonctionnels pertinents à l'activité de métabolisation des polysaccharides, nous étudions leurs variations d'abondances parmi les échantillons métagénomiques.Nous proposons une approche de modélisation écologique du microbiote intestinal humain et considérons principalement la sélection fonctionnelle intense de cet écosystème pour faire l'hypothèse que des regroupements identiques de fonctions métaboliques sont présents en proportions différentes dans tous les microbiotes intestinaux humains. Nous proposons le terme d'assemblage fonctionnel qui rend compte de la co-occurrence spatiale et temporelle d'un groupement de fonctions. Ces assemblages sont en pratiques déterminés par leur composition en marqueurs fonctionnels, et peuvent s'interpréter comme une combinaison de traits fonctionnels agrégés au niveau des microorganismes composant l'assemblage.Les assemblages fonctionnels sont inférés par le biais d'une factorisation en matrice positive aussi nommée NMF de l'anglais Non-Negative Matrix Factorisation. Cette méthode permet de déterminer les assemblages fonctionnels, à la fois concernant leur composition et à la fois concernant leur abondance dans chacun des 1408 échantillons. Nous exploitons par ailleurs une information métabolique provenant de 190 génomes microbiens et de la bibliographie qui permet de préciser la composition de ces assemblages fonctionnels. Cette information se traduit sous forme d'une contrainte.Nous trouvons 4 assemblages en considérant un consensus entre différents critères. L'utilisation de l'information métabolique nous permet d'interpréter biologiquement ces assemblages. Les métadonnées associées aux 1408 échantillons nous permettent d'observer un comportement différent pour les échantillons provenant d'individus atteints de la maladie de Crohn. Nous validons cette observation sur des données extérieures.Nous avons proposé une approche réductionniste permettant de représenter un processus métabolique important à l'échelle du microbiote. Nous trouvons un nombre réduit de 4 assemblages fonctionnels qui sont biologiquement vraisemblables et permettent de bien approcher les 1408 échantillons métagénomiques The purpose of this work of thesis is to model the capacity of degradation of non-digestible polysaccharides by the human intestinal microbiote. To this end we exploit metagenomic data. We use abundances of nucleotide sequences in 1408 samples whose metabolic function are assigned by annotation against a database. The sequences are annotated with functional markers. Upon manual selection of 86 functional markers relevant to the activity of metabolisation of polysaccharides, we their abundances variation among the metagenomic samples are studied.We propose an ecological approach in modeling the human intestinal microbiote. We consider the intense functional selection of this ecosystem and assume that identical cluster of metabolic functions can be found in different proportions in every human gut microbiota. We propose the term of functional assembly as to account for spacial and temporal co-occurence of functional cluster. In practice, theses assemblies are determined by their composition and can be interpreted as combinations of functional traits aggregated at the levels of the cluster of microorganisms composing each assembly. Functional assemblies are inferred by the means of Non-Negative Matrix Factorization (NMF). This method allows to determine the composition of functional assemblies and their abundance in each of the 1408 metagenomic sample.Furthermore, we exploit metabolic information from bibliographic resources and 190 microbial genomes in order to specify the composition of these functional assemblies. This information is translated in the form of a constraint.We find 4 assemblies by considering a consensus between various criteria. The use of metabolic information allow to interpret theses assemblies biologically. By exploiting the metadata of the 1408 samples, we observe a different behaviour for the samples coming from individuals suffering from Crohn disease. We validate this observation on external data.We proposed a reductionistic approach allowing to represent an important metabolic process at the level of the microbiota. We find a small number of 4 functional assemblies which are biologically likely and approach well the 1408 metagenomic samples

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Plante, Pierre-Alphée. "Effets d'un supplément alimentaire de protéines provenant de levures donné à des truies en lactation sur leurs performances et celles de leurs porcelets." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/27742/27742.pdf.

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Messé, Arnaud. "Caractérisation de la relation structure-fonction dans le cerveau humain à partir de données d'IRM fonctionnelle et de diffusion : méthodes et applications cognitive et clinique." Phd thesis, Université de Nice Sophia-Antipolis, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00845014.

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La compréhension des mécanismes cognitifs est un défi que les prouesses technologiques en imagerie par résonance magnétique fonctionnelle et de diffusion permettent de relever. Les réseaux neuronaux, ensembles de régions interconnectées anatomiquement et fonctionnellement, sont à l'ori- gine des processus cognitifs. Nous nous sommes intéressés à la relation entre la structure anatomique et la fonction de ces réseaux, au travers des deux principes fondamentaux du fonctionnement céré- bral que sont la ségrégation et l'intégration, ainsi que via la notion d'intégrité. En premier lieu, nous nous sommes penchés sur la ségrégation anatomique des noyaux gris centraux et son interprétation fonctionnelle. Puis, nous avons abordé le principe d'intégration, d'un point de vue descriptif par le biais de la théorie des graphes, puis explicatif par l'utilisation du modèle spatial autorégressif. Enfin, nous avons étudié l'intégrité structurelle du cerveau en présence de déficits neurocomportementaux suite à un traumatisme crânien léger. Nous avons ainsi mis en évidence l'existence d'un substrat ana- tomique sous-jacent aux réseaux fonctionnels. Nos résultats suggèrent que la structure anatomique des réseaux cérébraux est un substrat complexe optimisant les processus fonctionnels. De plus, une perte d'intégrité de ce substrat anatomique lors d'un traumatisme crânien léger se répercute sur le comportement et les performances cognitives. Ceci démontre que le fonctionnement cérébral, traduit par les réseaux neuronaux, est intimement lié à la structure anatomique de ces réseaux.

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Perriot, Bruno. "Analyse de l’activité physique, de la position corporelle et de la qualité de sommeil chez les patients atteints de maladies chroniques : Traitement des signaux, fusion de données et stratégie de prise en charge." Thesis, Lyon, INSA, 2015. http://www.theses.fr/2015ISAL0069.

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Les maladies chroniques impliquant le système respiratoire nécessitent un suivi sur la durée. L’activité physique et les paramètres cardiovasculaires sont essentiels pour ces pathologies. Nous nous sommes intéressés en particulier à la BPCO et à l’apnée obstructive du sommeil. La BPCO est caractérisée par un cercle vicieux d’inactivité : une gêne respiratoire entraîne une diminution de l’activité, qui elle-même augmente la gêne respiratoire par désentraînement. Le monitoring de l’activité, en lien avec la SpO2 est donc essentiel pour cette pathologie. Les désaturations nocturnes sont un paramètre cardinal de l’apnée du sommeil. Un actimètre permet d’évaluer la qualité du sommeil, complétant ainsi le suivi de cette pathologie. De plus, l’activité diurne est un indicateur de l’asthénie provoquée par le syndrome. Le but de ce travail a donc été la mise au point d’un actimètre communicant, capable de mesurer l’activité diurne, d’évaluer le temps de sommeil et de s’interfacer avec un oxymètre de pouls pour synchroniser la collecte de données. À partir des données récoltées durant 26 jours d’enRégistrements, nous avons mis au point et évalué un algorithme permettant de mesurer le temps passé assis, debout et allongé. Cet algorithme a été conçu pour être embarqué dans un microcontrôleur, ayant des ressources de calcul limitées. Nous avons également proposé un algorithme de détection des pas, dont le fonctionnement a été validé sur plus de 5 heures de marche, sur 22 patients différents, contre un comptage manuel. Nous avons enfin proposé une méthode de détection des transitions assis-debout pour l’instrumentation du test de levers de chaise de 3 minutes. Lors de l’analyse nocturne, nous avons mis au point un algorithme de détection du temps de sommeil, testé sur 25 nuits. Nous avons également proposé une méthode d’analyse de l’onde de pouls permettant d’extraire le rapport LF/HF de la variabilité cardiaque, permettant de détecter le sommeil paradoxal. Nous avons montré le résultat de l’agrégation des différentes données acquises par le système formé de l’actimètre et de l’oxymètre lors d’une nuit d’examen, comme outils à disposition du praticien. L’actimètre mis au point dans le cadre de ces travaux et les méthodes d’analyse du signal associées sont adaptés au suivi non invasif de pathologies respiratoires. Ils peuvent également être intégrés à un système de télémédecine via une passerelle informatique pour un suivi de long terme Chronic diseases affecting the respiratory system require a long-term monitoring. Physical activity and cardiovascular parameters are essential in those pathologies. We focused on two of those diseases : COPD and obstructive sleep apnea. COPD is characterized by a downward cycle of inactivity : a respiratory impairment leads to a reduction of activity, whose in turn worsen the respiratory impairment by a conditioning loss. As a consequence, activity monitoring and SpO2 are essential for the monitoring of this pathology. Nocturnal oxygen desaturation are a main feature of sleep apnea. An actimeter allows for sleep quality evaluation, and is a logical choice for a complementary measure of this disease. Moreover, diurnal activity is an indicator of the degree of physical weakness that can occur as a consequence of sleep apnea. The main goal of the work has been the developement of a connected actimeter, able to monitor diurnal activity, estimate the duration of sleep and collect data from a pulse oximeter to synchronise the data. From 26 days of accelerometric measures, we designed and validated an algorithm that compute the time spend sitting, standing and lying. This algorithm has been designed to be embedded in a microcontroler with limited computing power. We also proposed a step detection algorithm validated on 5 hours of walking, on 22 different patients, against a visual count. Finally, we designed a method to detect the sitting-standing change of posture to monitor the 3-minutes chair stand test. On the nocturnal aspect, we designed an algorithm used to estimate the sleep duration during a night. It as been tested on 25 nights. We also proposed a pulse wave analysis method to extract the LF/HF ratio of cardiac variability, to detect REM sleep. We showed the result of the aggregation of the different parameters collected by the system composed of the actimeter and the oximeter during a monitored night, as a tool to the healthcare professional. The actimeter design in the context of this work and the associated signal processing methods are appropriate to the monitoring of respiratory pathologies with a light equipment. They also can be integrated into a telemedecine system through a gateway computer, allowing for a long-term monitoring

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Martinelli, Julien. "On learning mechanistic models from time series data with applications to personalised chronotherapies." Thesis, Institut polytechnique de Paris, 2022. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03686289.

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Resumen

La modélisation mathématique des processus biologiques vise à fournir desreprésentations formelles de systèmes complexes afin d’en permettre des étudesqualitative et quantitative. Le besoin d’explicabilité suggère le recours à des mod-èles mécanistes qui décrivent explicitement les interactions moléculaires. Cepen-dant, l’utilisation de ces derniers est conditionnée à l’existence de connaissances apriori sur la structure du réseau de réactions sous-jacent. En outre, leur conceptiondemeure un art qui nécessite créativité et de multiples interactions avec les outilsd’analyse et de calibration aux données expérimentales. Cela écarte de nombreusesapplications imaginables en médecine de précision personnalisée, et appelle àdes développements méthodologiques pour l’automatisation de l’apprentissagede modèles adaptés aux données du patient. Cette thèse participe d’un effort deconception d’algorithmes d’apprentissage de modèles d’interactions dynamiquesà partir de données temporelles, avec le souci de l’explicabilité à un modélisateurhumain. Elle a pour champ d’application la chronothérapie personnalisée qui viseà administrer les médicaments aux horaires optimaux en fonction des rythmesbiologiques du patient sur 24h. Ainsi, trois grands thèmes sont abordés : modélisa-tion mécaniste, inférence de réseaux et personnalisation des traitements. Le premierchapitre décrit le développement du premier modèle mécaniste de l’horloge circadi-enne cellulaire complètement quantitatif, intégrant des données de transcriptome,proteome et localisation sub-cellulaire. Ce modèle a été connecté avec succès à unmodèle de la pharmacologie cellulaire d’un anticancéreux, l’irinotecan, afin d’enpersonnaliser l’horaire optimal d’administration. Le deuxième chapitre présenteun protocole original d’inférence des contrôles systémiques qu’exerce le corps en-tier sur les horloges des tissus périphériques. Cette approche permettra, à terme,d’intégrer des données individuelles issues d’objets connectés pour la personnali-sation des chronothérapies. Le troisième chapitre présente un algorithme générald’inférence de réactions avec cinétiques chimiques à partir de séries temporelles Mathematical modeling of biological processes aims at providing formal repre-sentations of complex systems to enable their study, both in a qualitative and quan-titative fashion. The need for explainability suggests the recourse to mechanisticmodels, which explicitly describe molecular interactions. Nevertheless, such mod-els currently rely on the existence of prior knowledge on the underlying reactionnetwork structure. Moreover, their conception remains an art which necessitatescreativity combined to multiple interactions with analysis and data fitting tools.This rules out numerous applications conceivable in personalized medicine, andcalls for methodological advances towards machine learning of patient-tailoredmodels. This thesis intends to devise algorithms to learn models of dynamicalinteractions from temporal data, with an emphasis on explainability for the humanmodeler. Its applications are in the context of personalized chronotherapies, thatconsist in optimizing drug administration with respect to the patient’s biologicalrhythms over the 24-hour span. Three main themes are explored: mechanisticmodeling, network inference and treatment personalization. The first chapter de-scribes the development of the first quantitative mechanistic model of the cellularcircadian clock integrating transcriptomic, proteomic and sub-cellular localizationdata. This model has been successfully connected to a model of cellular pharmacol-ogy of an anticancerous drug, irinotecan, achieving personalization of its optimaladministration timing. The second chapter introduces a novel protocol for inferringwhole-body systemic controls enforced on peripheral clocks. On the long run, thisapproach will make it possible to integrate individual data collected from wearablesfor personalized chronotherapies. The third chapter presents a general algorithmto infer reactions with chemical kinetics from time series data

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Tesis sobre el tema "Données physiologique"

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