Artículos de revistas: "Bactéries associées"

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Trifa, M., H. Douiri, A. Skhiri, S. Blidi, H. Ayeb, S. Ghorbel y S. Ben Khalifa. "Bactéries aérobies associées aux appendicites aiguës de l’enfant". Annales Françaises d'Anesthésie et de Réanimation 28, n.º 1 (enero de 2009): 24–27. http://dx.doi.org/10.1016/j.annfar.2008.10.015.

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Kane, Yaghouba, M. C. Kadja, Rianatou Bada-Alambedji, Ould El Mamy Bezeid, J. A. Akakpo y Y. Kaboret. "Lésions et bactéries des poumons du dromadaire (Camelus dromedarius) à l’abattoir de Nouakchott en Mauritanie". Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 58, n.º 3 (1 de marzo de 2005): 145. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.9926.

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Resumen

Les données sur les affections pulmonaires du dromadaire en Mauritanie sont rares. L’objectif de cette étude a été de déterminer la prévalence des lésions pulmonaires et les bactéries associées dans des poumons de dromadaires à l’abattoir de Nouakchott (Mauritanie). A cette fin, 729 poumons de dromadaires ont été examinés, soit 31,5 p. 100 (729/2315) des animaux abattus durant la période de l’étude. Parmi ces 729 poumons, 421 ont présenté des lésions, soit une prévalence de 57,7 p. 100. Les types lésionnels dominants ont été l’atélectasie focale (68,6 p. 100), la pleurésie isolée (64,4 p. 100) et l’emphysème partiel (59,1 p. 100). La prévalence des pneumonies a été de 24 p. 100 et celle des kystes hydatiques de 5,2 p. 100. Ces lésions ont été classées en lésions mineures et en lésions majeures. Ainsi 17,3 p. 100 (73/421) des lésions observées étaient des lésions majeures. La fréquence élevée (64,4 p. 100) et l’aspect macroscopique de la pleurésie ont été des faits particuliers. Enfin, une fréquence relativement élevée d’ecoffrage a été notée (26,5 p. 100). L’examen histopathologique a confirmé les aspects macroscopiques. En outre, cet examen a révélé des parasites et des bactéries dans les lésions pulmonaires. Seize genres bactériens et plusieurs espèces bactériennes ont été isolés. En dehors des germes banals (Bacillus, Proteus), les agents bactériens les plus fréquemment isolés dans les trois types de prélèvements ont été les streptocoques, les staphylocoques et Escherichia. Plusieurs associations d’espèces bactériennes ont été notées au sein d’un même échantillon. Les genres bactériens associés aux lésions pulmonaires majeures ont été les streptocoques, les staphylocoques, les klebsielles et les corynébactéries.

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Marais, A., P. Avenaud, L. Monteiro, B. Le Bail, P. Bioulac y F. Megraud. "Caractérisation moléculaire de bactéries potentiellement associées à certains cancers hépatobiliaires". Médecine et Maladies Infectieuses 30, n.º 4 (abril de 2000): 204. http://dx.doi.org/10.1016/s0399-077x(00)89123-4.

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SiddoFarka, O., O. Abdoualye, M. Doutchi, A. Biraima, O. Amadou, MLH Amadou y Et Al. "Détermination de la sensibilité aux antibiotiques des bactéries isolées de l'environnement du bloc opératoire de l'Hôpital National de Zinder, Niger". Revue Malienne d'Infectiologie et de Microbiologie 15, n.º 2 (27 de noviembre de 2020): 48–52. http://dx.doi.org/10.53597/remim.v15i2.1732.

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Resumen

Objectif : Dans un contexte de ressources limitées, la connaissance du profil des germes contaminant les blocs opératoires et leur résistance aux antibiotiques constitue un maillon de la prévention des infections associées aux soins. Ainsi, l'objectif de notre étude était de déterminer la sensibilité aux antibiotiques des bactéries isolées de l'environnement du bloc opératoire de l'Hôpital National de Zinder. Matériels et Méthodes : Nous avions mené une étude prospective, transversale et descriptive de Janvier à Mars 2020. Les prélèvements avaient été réalisés par écouvillonnage le matin avant le début des activités et avaient concerné les mains et blouses des chirurgiens, le matériel de chirurgie et les équipements du bloc opératoire. Nous avions effectué l'isolement, l'identification et l'antibiogramme des souches bactériennes au niveau du laboratoire de biologie par des techniques conventionnelles classiques. Résultats : Au total, 74 prélèvements avaient été effectués. La culture était positive dans 58,10% des cas (43/74). Les bactéries isolées étaient constituées de 25 souches de Bacillus spp (58,13%), 10 souches de bactéries Gram négatif non fermentaires avec Acinetobacter bamanii (14,0%), Pseudomonas aeruginosa (7,0%) et Stenotrophomonas maltophilia (2,3%) et 8 souches d'entérobactéries représentées par Serratia marcescens (4,7%), Enterobacter cloacae (4,7%), Enterobacter aerogenes (4,7%), Escherichia coli (2,3%) et Klebsiella pneumoniae (2,3%).Concernant la sensibilité des souches aux antibiotiques, une seule souche d'Enterobacter aerogenes était résistante à l'Imipenème et 3 des 9 entérobactéries isolées étaient productrices de bétalactamase à spectre élargi. Conclusion : Au vu de résultats de cette étude, il convient de mettre en place des procédures adaptées en vue d'une meilleure surveillance microbiologique des blocs opératoires. Cela contribuera sans doute à la prévention des infections associées aux soins.

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Masengo, Colette. "Profil épidémio-clinique de la Drépanocytose et Prédiction des propriétés pharmacocinétiques et toxicologiques des médicaments utilisés dans la prise en charge au Centre de Médecine Mixte et d’Anémie SS (Kinshasa, R.D. Congo)". Revue Congolaise des Sciences & Technologies 3, n.º 1 (31 de marzo de 2024): 67–77. http://dx.doi.org/10.59228/rcst.024.v3.i1.70.

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Resumen

La drépanocytose ou anémie SS est l’hémoglobinopathie la plus rependue au monde et constitue un problème majeur de santé publique en régions d’endémie. La présente étude a pour but de mener une enquête dans un centre spécialisé afin d’évaluer le coût des soins, d’identifier les maladies infectieuses associées à la drépanocytose et les médicaments utilisés pour les combattre et ensuite prédire les propriétés pharmacocinétiques et toxicologiques de ces médicaments et des phyto-marqueurs contenu dans Lippia multiflora, une plante utilisée dans la prise en charge alternative de cette hémoglobinopathie. Il ressort de cette étude que le sexe féminin est plus nombreux que le sexe masculin (54,5% vs 45,5%); la tranche d’âge de 6-15 ans est prédominante (81%) ; les grandes complications notées sont la septicémie (62%) ; les antibiotiques à large spectre d’action sont prescrits à 87,5% tandis que les antipaludéens sont prescrits à 47,0% ; le coût des soins des drépanocytaires est estimé à un montant supérieur à 100 USD (˃200.000 CDF) chez 52,5% des malades pour chaque crise ; la prise en charge de la drépanocytose par la médicine traditionnelle associée à la médecine moderne notamment l’association d’extrait des plantes avec les antibiotiques représente un risque d’interaction médicamenteuse pour les patients. Il est donc souhaitable que des études plus approfondies soient menées sur l’activité antibactérienne de Lippia multiflora afin de vérifier si cette plante n’est pas douée d’activité intrinsèque vis-à-vis des bactéries associées à la drépanocytose.

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Ige, O. T., O. Jimoh, S. O. Ige, I. P. Ijei, H. Zubairu y A. T. Olayinka. "Profile of bacterial pathogens contaminating hands of healthcare workers during daily routine care of patients at a tertiary hospital in northern Nigeria". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 22, n.º 1 (26 de enero de 2021): 103–8. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v22i1.14.

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Resumen

Background: Healthcare associated infections (HAIs) have been recognized as a critical challenge affecting the quality of healthcare services provided. A significant proportion of these infections result from cross-contamination of microorganisms which are often acquired and spread by direct contact with patients or contaminated adjacent environmental surfaces through the hands of healthcare workers (HCWs). The objectives of this study are to profile bacterial pathogens commonly found on the hands of health care workers while routinely attending to patients in thehealthcare facility and to determine their antibiotic susceptibility pattern.Methodology: The fingers of the dominant hand of 300 HCWs at the Barau Dikko Teaching Hospital (BDTH), Kaduna, Nigeria, were imprinted on 5% Sheep blood, MacConkey, and Mannitol salt agar plates and incubated at 37°C for 24 hours. Bacteria isolates were identified by Gram staining and conventional biochemical tests. The susceptibility of isolated bacteria to selected antibiotics was determined by the modified Kirby–Bauer disk diffusion method and interpreted using the 2012 guidelines of the Clinical and Laboratory Standards Institute.Results: Bacteria were isolated from the hands of all 300 HCWs, with coagulase negative staphylococci (CONS) being the most frequent (67.0%, 201/300). Other bacteria identified were Staphylococcus aureus (23.7%, MRSA of 3%), Streptococcus pyogenes (2.7%), and Enterobacteriaceae (6%). The isolates were highly sensitive to ofloxacin 96.7% (290/300), augmentin 87.7% (263/300) and ceftriaxone 87.3% (262/300).Conclusion: This study demonstrates a high rate of contamination of hands of HCWs with potentially pathogenic bacteria, some of which were multidrug resistant. Concerted efforts should be made to implement programs dedicated to improve hand hygiene practices in the tertiary health care facility. Keywords: Hand hygiene, bacterial, pathogen, healthcare workers, healthcare associated infection French title: Profil d'agents pathogènes bactériens contaminant les mains des travailleurs de la santé lors des soins quotidiens de routine auxpatients d'un hôpital tertiaire dans le nord du Nigéria Contexte: Les infections associées aux soins de santé (IHA) ont été reconnues comme un défi critique affectant la qualité des services de santé fournis. Une proportion importante de ces infections résulte de la contamination croisée de micro-organismes qui sont souvent acquis et propagés par contact direct avec des patients ou des surfaces environnementales adjacentes contaminées par les mains des travailleurs de la santé (TS). Les objectifs de cette étude sont de dresser le profil des agents pathogènes bactériens que l'on trouve couramment dans les mains des travailleurs de la santé tout en s'occupant régulièrement des patients dans l'établissement de santé et de déterminer leur profil de sensibilité aux antibiotiques.Méthodologie: Les doigts de la main dominante de 300 travailleurs de la santé au Barau Dikko Teaching Hospital (BDTH), Kaduna, Nigéria, ont été imprimés sur des plaques de gélose au sang de mouton à 5%, MacConkey et Mannitol et incubés à 37°C pendant 24 heures. Les isolats de bactéries ont été identifiés par coloration de Gram et tests biochimiques conventionnels. La sensibilité des bactéries isolées aux antibiotiques sélectionnés a été déterminée par la méthode de diffusion sur disque modifiée de Kirby-Bauer et interprétée en utilisant les lignes directrices de 2012 du Clinical and Laboratory Standards Institute.Résultats: les bactéries ont été isolées des mains des 300 TS, les staphylocoques à coagulase négative (CONS) étant les plus fréquents (67,0%, 201/300). Les autres bactéries identifiées étaient Staphylococcus aureus (23,7%, SARM de 3%), Streptococcus pyogenes (2,7%) et Enterobacteriaceae (6%). Les isolats étaient très sensibles à l'ofloxacine 96,7% (290/300), à l'augmentationin 87,7% (263/300) et à la ceftriaxone 87,3% (262/300).Conclusion: Cette étude démontre un taux élevé de contamination des mains des travailleurs de la santé par des bactéries potentiellement pathogènes, dont certaines étaient multirésistantes. Des efforts concertés devraient être faits pour mettre en œuvre des programmes visant à améliorer les pratiques d'hygiène des mains dans les établissements de soins de santé tertiaires. Mots-clés: hygiène des mains, bactérienne, pathogène, personnel de santé, infection associée aux soins de santé

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Lê, Sylvie, Matthieu Minty, Émile Boyer, Vincent Blasco-Baque, Martine Bonnaure-Mallet y Vincent Meuric. "Microbiote buccal et foie". médecine/sciences 40, n.º 1 (enero de 2024): 42–48. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2023194.

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Le foie possède de nombreuses fonctions biologiques importantes pour l’organisme. Il peut être atteint par diverses maladies, telles que les hépatites virales ou médicamenteuses, la fibrose et la cirrhose. Lors de ces affections, les hépatocytes endommagés sont progressivement remplacés par du tissu cicatriciel. Par ailleurs, une altération du microbiote oral peut être à l’origine d’une altération des réponses immunitaires et ainsi contribuer au développement d’une inflammation qui touchera également le foie. En effet, les personnes souffrant d’hémochromatose ou de stéatose hépatique non alcoolique présentent des anomalies importantes du microbiote oral. De même, des concentrations élevées de certaines bactéries colonisant la cavité buccale, telles que Porphyromonas gingivalis, sont associées à des facteurs de risque accrus de stéatose hépatique non alcoolique.

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CHATEIGNER-BOUTIN, Anne-Laure, Luc SAULNIER, Michel LESSIRE, Nathaële WACRENIER y Fabien ALLEMAN. "Les polymères de mannose en production animale. 1. focus sur les structures chimiques rencontrées dans les aliments et les propriétés biologiques". INRAE Productions Animales 33, n.º 4 (6 de abril de 2021): 283–94. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2020.33.4.4633.

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Les polysaccharides à base de mannose sont très largement répandus dans le monde vivant. D’un organisme à un autre, la longueur du squelette de mannose, le type de liaison entre les sucres, la composition et la longueur des ramifications sont extrêmement variables et confèrent à ces polymères des propriétés fonctionnelles et biologiques différentes. Au-delà de leur rôle structural ou encore de capteur de molécules d’eau dans les plantes, ils participent en particulier à la glycosylation des protéines et sont clairement impliqués dans les phénomènes d’interaction ligand-récepteur. Certains polymères de mannose viraux ou bactériens hautement conservés sont ainsi, chez les animaux supérieurs, reconnus très rapidement par l’hôte qui se défend en initiant une réponse non spécifique, dite « réaction immunitaire innée ». Plutôt reliées par les liaisons α chez les virus, les bactéries et les levures, les unités de mannose sont reliées par des liaisons β chez les végétaux supérieurs. Les β-mannanes sont présents dans tous les produits d’origine végétale, et à des teneurs particulièrement élevées dans certaines familles (palme, guar, coprah) et certains tourteaux utilisés en alimentation animale. Leurs propriétés anti-nutritionnelles observées chez les porcs et les volailles s’expliqueraient principalement par l’apparition d’inflammation intestinale induisant des baisses de performances, des baisses d’efficacité alimentaire et une augmentation des dépenses énergétiques associées à la mise en œuvre du système immunitaire.

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Chaix, Basile y Rémy Slama. "Changement climatique et santé : défis et opportunités pour la santé publique". Questions de santé publique, n.º 45 (febrero de 2023): 1–8. http://dx.doi.org/10.1051/qsp/2023045.

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Au-delà de la déshydratation, de l’hyperthermie et d’effets sur les systèmes cardiaque, respiratoire, endocrinien, immunitaire et nerveux, les fortes chaleurs sont associées à une augmentation de la mortalité, des accidents au travail, des suicides, ainsi que des violences domestiques et agressions. Les îlots de chaleur urbains amplifient les effets sanitaires des vagues de chaleur. Les événements climatiques extrêmes entraînent notamment décès et traumatismes. Plus indirectement, le change- ment climatique induit une modification de la distribution géographique de maladies à vecteurs et de bactéries aquatiques. Les températures élevées et les événements extrêmes sont associés à une diminution des rendements agricoles, qui peut induire malnutrition et troubles de la croissance. Le changement climatique pourrait renforcer la prolifération d’algues toxiques, et il a des implications en termes d’allergies. Il impactera aussi la concentration atmosphérique de polluants, augmentera la fréquence des feux de forêts et des tempêtes de sable et de poussière, associés à des problèmes respiratoires. L’augmentation du niveau de la mer pourrait contribuer à des migrations climatiques de masse, induisant des problèmes de maladies infectieuses et de conflits. L’acidification des océans pourrait déstabiliser les économies reposant sur la pêche. Les mesures de lutte contre et d’adaptation au changement climatique concernent les secteurs de l’agriculture, de l’urbanisme, des transports, de l’énergie et de l’industrie, qui façonnent des déterminants majeurs de la santé (alimentation, activité physique, pollution atmosphérique et bruit, contaminants chimiques). La lutte contre le changement climatique constitue ainsi une fantastique opportunité pour améliorer la santé.

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Jean, N., G. Boge, J. L. Jamet y D. Jamet. "Étude de l'activité phosphatasique particulaire au sein d'un écosystème pollué : le port de Toulon". Revue des sciences de l'eau 15, n.º 1 (12 de abril de 2005): 63–71. http://dx.doi.org/10.7202/705436ar.

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L'activité phosphatasique a été mesurée sur le matériel particulaire obtenu par filtration d'eau de mer sur des membranes de 90 µm, 5 µm et 0,25 µm de vide de maille, de décembre 1999 à mars 2000. Le substrat utilisé est du paranitrophénylphosphate (pNPP) dissous dans l'eau de mer. Dans ces conditions, deux types d'activités, à faible et à forte affinités, ont été caractérisés pour chaque classe de taille. La contribution de la classe de taille comprise entre 0,25 et 5 µm à l'ensemble de l'activité a été la plus faible des trois fractions, alors que celle de la classe de taille supérieure à 90 µm a souvent été la plus forte. Des activités associées à la présence de bactéries ont été mises en évidence sur les fractions zooplanctonique et phytoplanctonique. Toutefois, celles-ci n'ont pu rendre compte de la totalité des activités mesurées, en particulier pour le zooplancton.

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Abu-Samra, M. T. y Y. A. Shuaib. "Pathology and pathogenesis of bovine skin and meibomian gland demodicosis". Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 67, n.º 2 (1 de enero de 2015): 77. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.10188.

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Une enquête nationale menée au Soudan sur la démodécie bovine a concerné 48 000 animaux examinés soit au cours de campagnes de vaccination (44 800), soit lors d’inspections ante et post mortem dans des abattoirs (3 200). Sur l’ensemble des animaux enquêtés, 44 908 étaient des adultes (2-8 ans) dont 34,6 p. 100 étaient infectés, et 3 092 étaient des veaux (< 2 ans) dont 34,6 p. 100 étaient infectés. Trois cents bovins affectés par des lésions cutanées graves, dont 218 présentaient également des lésions de la glande de Meibomius, ont été sélectionnés. Les tableaux cliniques de la démodécie cutanée et de la démodécie de la glande de Meibomius ont été décrits. Proteus vulgaris, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Sta. epidermidis, Streptococcus pyogenes (groupe A) et Trueperella pyogenes ont été isolés dans les lésions cutanées, et Moraxella bovis et Sta. aureus l’ont été dans les lésions de la glande de Meibomius. Ces bactéries produisaient des toxines et des enzymes qui aggravaient les lésions causées par les acariens Demodex bovis et D. ghanensis, respectivement dans la peau et dans les glandes de Meibomius. Aucun de ces acariens n’a été retrouvé dans les tissus internes ni dans les organes, indiquant qu’il n’y a pas eu de phase endoparasitaire. Les modifications histopathologiques observées étaient liées à l’immunité à médiation cellulaire. L’écoulement du contenu des colonies de Demodex dans les couches sous-épidermique et dermique, et dans les tissus environnant les glandes de Meibomius a entraîné des modifications histopathologiques sévères, caractérisées par le renouvellement continu des réactions granulomateuses avec afflux de macrophages et de lymphocytes. La pathogenèse de la maladie a été décrite du stade d’invasion initiale des follicules pileux et des tubes collecteurs des glandes de Meibomius par les acariens et les bactéries associées, au stade de régression des lésions. Il a été conclu que la nature de l’association entre les acariens Demodex et les bactéries dans les lésions démodéciques était synergique et que les deux agents pathogènes avaient la même importance.

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Gervason, S., M. Defaye, D. Ardid, J. Y. Berthon, C. Altier, E. Filaire y F. A. Carvalho. "Influence du microbiote sur la douleur". Douleur et Analgésie 34, n.º 2 (5 de mayo de 2021): 86–96. http://dx.doi.org/10.3166/dea-2021-0144.

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De plus en plus d’études indiquent que le microbiote intestinal pourrait jouer un rôle important sur les fonctions du système nerveux en modulant l’activité des cellules nerveuses. Il a été montré que les produits dérivés des bactéries peuvent influencer la perception de la douleur. De plus, des perturbations du microbiote (ou dysbiose) sont souvent associées à des pathologies intestinales ou extraintestinales comme des désordres neurodégénératifs ou des troubles développementaux. Cette revue présente les études précliniques et cliniques mettant en évidence un impact du microbiote sur la perception de la douleur dans différents contextes pathologiques. Le lien entre le microbiote et l’activation des neurones est discuté au travers de l’interaction directe hôte–microbiote qui implique l’activation des nocicepteurs par les composés ou métabolites microbiens. De nouvelles études sur l’interaction entre le microbiote et le système nerveux devraient conduire à l’identification de nouveaux ligands microbiens et de médicaments ciblant les récepteurs de l’hôte, qui pourraient à terme améliorer la gestion de la douleur chronique et le « bien-être ».

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LETTAT, A., C. MARTIN, C. BERGER y P. NOZIÈRE. "Analyse quantitative de l’effet des bactéries probiotiques sur les fermentations dans le rumen et les performances des bovins en production". INRAE Productions Animales 25, n.º 4 (2 de octubre de 2012): 351–60. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2012.25.4.3223.

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L’acidose ruminale latente est une préoccupation majeure chez les ruminants à potentiel élevé de production. Sa prévention par la supplémentation des rations avec des Bactéries Probiotiques (BP) est une stratégie potentiellement intéressante compte tenu de leur capacité à s’adapter à l’environnement très compétitif du rumen. Une méta-analyse des données publiées regroupant 33 expériences (82 traitements) a permis de mettre en évidence l’effet des BP, seules ou associées à la levure Saccharomyces cerevisiae (BP + SC), sur les fermentations dans le rumen et les performances zootechniques de bovins laitiers et à viande. Chez ces derniers la supplémentation en BP ou en BP + SC n’a pas affecté en moyenne les performances animales. En revanche, chez la vache laitière la supplémentation en BP + SC a permis d’augmenter l’ingestion (+ 1,7 kg/j) et la production de lait (+ 2,36 kg/j) sans modifier sa composition. L’effet des probiotiques sur les fermentations dans le rumen est très variable et en moyenne relativement faible. La régulation du pH ruminal moyen par les BP seules ou les BP + SC n’est effective que lorsque la ration de base entraîne un pH ruminal inférieur à 5,75. Enfin, bien que non pris en compte dans le dispositif statistique du fait d’un nombre limité de données, les réponses des performances animales semblent également dépendre du type de BP employées.

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Agut, Henri. "Une histoire de la virologie". médecine/sciences 38, n.º 12 (diciembre de 2022): 979–89. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2022162.

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La virologie est née à la fin du XIXe siècle de la reconnaissance d’agents infectieux, dits filtrables, qui franchissaient les filtres destinés à retenir les bactéries. L’étude de ces agents, en particulier celle du virus de la mosaïque du tabac et les bactériophages, a conduit à montrer l’originalité de leurs propriétés structurales et physico-chimiques, tout en stimulant le développement de la biologie moléculaire. Les virus des animaux, en plus de leur caractérisation, ont servi de sondes pour explorer le fonctionnement moléculaire des cellules eucaryotes, notamment l’organisation du génome, la régulation transcriptionnelle et les mécanismes d’oncogenèse. Au début des années 1960, une définition précise des virions et du mode de réplication des virus, ainsi qu’une classification internationalement reconnue fondée sur les propriétés moléculaires de ces agents, ont été publiées. Au cours des dernières décennies, la compréhension de la physiopathologie des infections virales a conduit à identifier de nombreux nouveaux virus et à développer des procédures standardisées de diagnostic virologique, une chimiothérapie antivirale spécifique et des vaccinations efficaces. Associées au succès des études plus fondamentales, ces avancées ont contribué au bilan exceptionnellement positif de la virologie au cours des cent dernières années.

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Dominique AUBEL y Martin FUSSENEGGER. "FACTEURS DE VIRULENCE BACTÉRIENS ET MÉCANISMES DE PATHOGÉNICITÉ ASSOCIÉS". ACTUALITES PERMANENTES EN MICROBIOLOGIE CLINIQUE 18, n.º 03 (1 de septiembre de 2019): 38. http://dx.doi.org/10.54695/apmc.18.03.1519.

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Au cours de son évolution, l’homme a acquis des mécanismestrès complexes et diversifiés pour se protéger contre l’agressionde parasites tels que les bactéries. La peau est le premier obstacleauquel la bactérie doit faire face. Cette structure de nature légèrement acide, sèche, colonisée par une microflore de bactériesnon pathogènes, et constituée dans sa partie la plus externe decellules mortes constamment éliminées, n’est pas favorable audéveloppement des bactéries pathogènes. Toutefois certainesbactéries peuvent franchir cette barrière en raison d’altérationsdiverses telles que des coupures et des brûlures. La bactérie doitalors faire face au tissu lymphoïde sous-cutané constitué d’unensemble de cellules spécialisées dont le rôle est d’éliminer lesbactéries e

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Abdoulaye, O., B. Sidi Maman Bacha, N. Hama Aghali, I. Abdoulaye, M. B. Abdoulaye, G. Lo, A. Yacouba et al. "Profile of multidrug-resistant clinical bacterial isolates at the National Hospital of Zinder (NHZ), Niger Republic in 2021". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 23, n.º 4 (24 de octubre de 2022): 369–77. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v23i4.5.

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Background: Today, bacterial resistance is a public health challenge throughout the world, and infections caused by resistant bacteria are associated with increased morbidity, mortality and health care costs. The objective of this descriptive study is to determine the prevalence and distribution of multi-drug resistant (MDR) clinical bacteria isolates at the National Hospital of Zinder, Niger Republic in 2021.Methodology: We conducted a descriptive cross-sectional study of in- and out-patients from whose clinical samples’ bacteria were isolated at the bacteriology unit of the laboratory. Bacteria were isolated from the clinical samples following standard aerobic cultures and identified using conventional biochemical test schemes. Antibiotic susceptibility testing (AST) was performed by the agar disk diffusion technique, and categorization of the isolates into sensitive, intermediate or resistant was done according to the recommendations of the Antibiogram Committee of the French Society of Microbiology (CA-SFM) 2020 version 1.2. MDR was defined as resistance to at least one antibiotic in three or more categories, while selected MDR bacteria such as ESBL was identified using double disk synergy test, and MRSA by cefoxitin disk diffusion test.Results: Seventy-seven (6.7%) bacterial species were isolated from 1153 clinical samples processed at the bacteriology unit of the hospital laboratory between June and December 2021, of which 65.0% (50/77) were members of the order Enterobacteriales. Escherichia coli represented 40.3% (40/77) of the isolated bacteria, Staphylococcus aureus 13.0% (10/77) and Pseudomonas aeruginosa 11.7% (9/77). The overall prevalence of MDR was 44.2% (34/77), including 61.8% (21/34) ESBL-producing Enterobacteriales (ESBL-E), 26.5% (9/34) multi-resistant P. aeruginosa and 11.7% (4/34) MRSA, with 67.6% (23/34) of the MDR isolates from outpatients. Resistance rates of the Enterobacteriales to ciprofloxacin, gentamicin, amikacin and imipenem were 62.0%, 52.0%, 38.0% and 8.0% respectively. Resistance rates of P. aeruginosa were 100.0%, 88.9%, 77.8%, 33.3%, 22.2%, and 22.2% respectively to ceftazidime, ticarcillin, imipenem, ciprofloxacin, levofloxacin, and amikacin. Resistance rates of S. aureus were 100.0%, 50.0%, 40.0%, 10.0%, 0% and 0% to penicillin G, erythromycin, cefoxitin, tetracycline, fusidic acid, and chloramphenicol respectively. ESBL-E were 47.6%, 85.7% and 0% resistant to amikacin, ciprofloxacin and imipenem, and MRSA resistance rates were 75.0%, 75.0%, 50.0% and 0% to erythromycin, tetracycline, gentamicin, and chloramphenicol respectively.Conclusion: This study reports high prevalence of MDR bacteria, mainly ESBL-E, with concerning high resistance to carbapenem. Rational use of antibiotics and implementation of surveillance system for MDR bacteria must be implemented in order to limit the emergence and spread of MDR bacteria in Niger Republic. Contexte: Aujourd'hui, la résistance bactérienne est un défi de santé publique dans le monde entier, et les infections causées par des bactéries résistantes sont associées à une augmentation de la morbidité, de la mortalité et des coûts des soins de santé. L'objectif de cette étude descriptive est de déterminer la prévalence et la distribution des isolats cliniques de bactéries multirésistantes (MDR) à l'Hôpital National de Zinder,République du Niger en 2021.Méthodologie: Nous avons mené une étude transversale descriptive des patients hospitalisés et ambulatoires dont les bactéries des échantillons cliniques ont été isolées à l'unité de bactériologie du laboratoire. Les bactéries ont été isolées des échantillons cliniques à la suite de cultures aérobies standard et identifiées à l'aide de schémas de tests biochimiques conventionnels. Les antibiogrammes (AST) ont été réalisés par la technique de diffusion sur disque de gélose, et la catégorisation des isolats en sensibles, intermédiaires ou résistants a été faite selon les recommanda- tions du Comité Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie (CA-SFM) 2020 version 1.2. La MDR a été définie comme la résistance à au moins un antibiotique dans trois catégories ou plus, tandis que certaines bactéries MDR telles que les BLSE ont été identifiées à l'aide d'un test de synergie à double disque et le SARM par le test de diffusion sur disque de céfoxitine.Résultats: Soixante-dix-sept (6,7%) espèces bactériennes ont été isolées à partir de 1153 échantillons cliniques traités à l'unité de bactériologie du laboratoire hospitalier entre juin et décembre 2021, dont 65,0% (50/77) appartenaient à l'ordre des Enterobacteriales. Escherichia coli représentait 40,3% (40/77) des bactéries isolées, Staphylococcus aureus 13,0% (10/77) et Pseudomonas aeruginosa 11,7% (9/77). La prévalence globale des MDR était de 44,2% (34/77), dont 61,8% (21/34) d'Enterobacteriales productrices de BLSE (BLSE-E), 26,5% (9/34) de P. aeruginosa multirésistantes et 11,7% (4/34) SARM, avec 67,6% (23/34) des isolats de MDR provenant de patients externes. Les taux de résistance des Enterobacteriales à la ciprofloxacine, à la gentamicine, à l'amikacine et à l'imipénème étaient respectivement de 62,0%, 52,0%, 38,0% et 8,0%. Les taux de résistance de P. aeruginosa étaient respectivement de 100,0%, 88,9%, 77,8%,33,3%, 22,2% et 22,2% à la ceftazidime, à la ticarcilline, à l'imipénème, à la ciprofloxacine, à la lévofloxacine et à l'amikacine. Les taux de résistance de S. aureus étaient respectivement de 100,0%, 50,0%, 40,0%, 10,0%, 0% et 0% à la pénicilline G, à l'érythromycine, à la céfoxitine, à la tétracycline, à l'acide fusidique et au chloramphénicol. Les BLSE-E étaient de 47,6%, 85,7% et 0% de résistance à l'amikacine, à la ciprofloxacine et à l'imipénème, et les taux de résistance au SARM étaient respectivement de 75,0%, 75,0%, 50,0% et 0% à l'érythromycine, la tétracycline, la gentamicine et le chloramphénicol. Conclusion: Cette étude rapporte une prévalence élevée de bactéries MDR, principalement des BLSE-E, avec une résistance élevée aux carbapénèmes. L'utilisation rationnelle des antibiotiques et la mise en place d'un système de surveillance des bactéries MDR doivent être mises en oeuvre afin de limiter l'émergence et la propagation des bactéries MDR en République du Niger.

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Akinjogunla, O. J., A. N. Umo, M. F. Alozie, G. O. Oshosanya y G. I. Saturday. "Antibacterial activity and time kill kinetics of Amlodipine, Thioridazine and Promethazine against pathogenic clinical bacterial isolates". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 22, n.º 3 (2 de julio de 2021): 397–406. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v22i3.11.

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Background: The emergence of multi-drug resistant bacterial strains worldwide has necessitated the scientific search for novel, potent, and affordable antimicrobial agents including medicinal plants and non-antibiotic drugs for therapy of infectious diseases. The objective of this study is to assess in vitro antibacterial activities and time kill kinetics of some non-antibiotic drugs against pathogenic clinical bacterial isolates.Methodology: In vitro antibacterial activities including minimum inhibitory concentration (MIC), minimum bactericidal concentration (MBC) and time kill kinetics of Amlodipine (AML), Thioridazine (THI) and Promethazine (PRO) against Staphylococcus aureus, coagulase negative staphylococci (CoNS), Streptococcus spp, Escherichia coli, Enterobacter spp, Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa clinical isolates were determined using disc diffusion, broth microdilution and plate count techniques.Results: The mean growth inhibition zones by the disc diffusion assay of AML, THI and PRO against the isolates were ≤15.1±1.0 mm with MIC and MBC values ranging from 12.5 to 50μg/ml and 25 to 100μg/ml respectively. The time-kill assay revealed bactericidal effect of AML, THI and PRO on Gram positive bacteria evidenced by mean log reductions in viable bacterial cell counts ranging from 0.13 Log10 to 2.41 Log10 CFU/ml for S. aureus, 0.88 Log10 to 2.08 Log10 CFU/ml for Streptococcus spp, and 0.26 Log10 to 2.34 Log10 CFU/ml for CoNS after ≤30hrs post inoculation at 1xMIC. The range of log reduction in viable cell counts of Gram-negative bacteria exposed to AML, THI and PRO were E. coli (0.11 to 3.23 Log10 CFU/ml), P. aeruginosa (0.52 to 2.56 Log10 CFU/ml), K. pneumoniae (0.85 to 3.0 Log10 CFU/ml) and Enterobacter spp (0.38 to 2.08 Log10 CFU/ml) after ≤30 hrs post inoculation at 1x MIC.Conclusion: These findings demonstrate in vitro antibacterial efficacies and time kill kinetics of AML, THI and PRO against pathogenic clinical bacterial isolates, which indicate that these non-antibiotic drugs may be useful therapeutic alternatives in the bid to reduce the burden of infectious diseases associated with antibiotic resistant pathogens. Keywords: Amlodipine, Thioridazine, Promethazine, Time-Kill, Kinetics, MIC, MBC, bacteria French title: Activité antibactérienne et cinétique de destruction du temps de l'amlodipine, de la thioridazine et de la prométhazine contre les isolats bactériens cliniques pathogènes Contexte: L'émergence de souches bactériennes multirésistantes dans le monde a rendu nécessaire la recherche scientifique d'agents antimicrobiens nouveaux, puissants et abordables, notamment des plantes médicinales et des médicaments non antibiotiques pour le traitement des maladies infectieuses. L'objectif de cette étude est d'évaluer les activités antibactériennes in vitro et la cinétique de destruction temporelle de certains médicaments non antibiotiques contre les isolats bactériens cliniques pathogènes. Méthodologie: activités antibactériennes in vitro, y compris la concentration minimale inhibitrice (CMI), la concentration bactéricide minimale (MBC) et la cinétique de destruction du temps de l'amlodipine (AML), de la thioridazine (THI) et de la prométhazine (PRO) contre Staphylococcus aureus, les staphylocoques à coagulase négative (CoNS), Streptococcus spp, Escherichia coli, Enterobacter spp, Klebsiella pneumoniae et Pseudomonas aeruginosa ont été déterminés en utilisant des techniques de diffusion sur disque, de microdilution en bouillon et de numération sur plaque. Résultats: Les zones moyennes d'inhibition de la croissance par le test de diffusion de disque d'AML, THI et PRO contre les isolats étaient ≤15,1±1,0mm avec des valeurs MIC et MBC allant de 12,5 à 50μg/ml et de 25 à 100μg/ml respectivement. Le dosage temporel a révélé un effet bactéricide de la LMA, du THI et du PRO sur les bactéries Gram positives, mis en évidence par des réductions logarithmiques moyennes du nombre de cellules bactériennes viables allant de 0,13 Log10 à 2,41 Log10 CFU/ml pour S. aureus, 0,88 Log10 à 2,08 Log10 CFU/ml pour Streptococcus spp et 0,26 Log10 à 2,34 Log10 CFU/ml pour CoNS après ≤ 30 heures après l'inoculation à 1 x MIC. La plage de réduction logarithmique du nombre de cellules viables de bactéries à Gram négatif exposées à la LMA, au THI et au PRO était E. coli (0,11 à 3,23 Log10 CFU/ml), P. aeruginosa (0,52 à 2,56 Log10 CFU/ml), K. pneumoniae (0,85 à 3,0 Log10 CFU/ml) et Enterobacter spp (0,38 à 2,08 Log10 CFU/ml) après ≤ 30 heures après l'inoculation à 1 x MIC. Conclusion: Ces résultats démontrent une efficacité antibactérienne in vitro et une cinétique de destruction du temps des LMA, THI et PRO contre les isolats bactériens cliniques pathogènes, ce qui indique que ces médicaments non antibiotiques peuvent être des alternatives thérapeutiques utiles dans le but de réduire le fardeau des maladies infectieuses associées aux antibiotiques pathogènes résistants. Mots-clés: Amlodipine, Thioridazine, Prométhazine, Time-Kill, Cinétique, MIC, MBC, bactéries

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Popoola, O. D., B. T. Thomas, J. B. Folorunso, H. T. Balogun-Abiola, H. A. Adekola, Q. O. Okulaja y M. O. Coker. "Widal antibody titre test versus blood culture; which is a better diagnostic for typhoid fever?" African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 23, n.º 4 (24 de octubre de 2022): 389–97. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v23i4.7.

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Background: The importance of accurate diagnosis of infectious diseases is central and crucial to the effectiveness of treatment and prevention of the associated long-term complications of such infections. The objective of this study was therefore to determine the accuracy of the Widal antibody titre test in the diagnosis of typhoid fever relative to the gold standard blood culture technique.Methodology: A total of 40 students attending the Olabisi Onabanjo University Health Services, Ago-Iwoye, Ogun State, Nigeria on account of suspected typhoid fever by positive Widal test (≥ 1/80) and not on antibiotic therapy, were recruited for the study. Stool and blood samples were collected from each participant and analysed at the medical laboratory of the health center using conventional culture techniques and confirmation of isolates by simplex and multiplex polymerase chain reaction (PCR) amplification assays of hilA (Salmonella enterica), ipaH (Shigella spp), rfc (Shigella flexneri) and wbgZ (Shigella sonnei) genes. Antibiotic susceptibility testing (AST) of isolated bacteria to 10 panel of antibiotics was done using the Kirby Bauer disk diffusion test and interpreted according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CSLI) guideline.Results: Of the 40 patients with suspected typhoid fever by the Widal test, 9 yielded Salmonella enterica giving a 22.5% isolation rate, with Salmonella enterica serovar Typhi (Salmonella Typhi) confirmed as sole bacterium from blood cultures in 5 (12.5%) patients and co-infection of Salmonella and Shigella from stool samples in 4 (10.0%) patients. A total of 52 enteric bacteria isolates were recovered from blood and stool samples of the 40 patients made of Salmonella enterica 9 (17.3%), Shigella spp 20 (38.5%), S. flexneri 9 (17.3%) and S. sonnei 14 (26.9%). All the enteric isolates were multi-drug resistant (MDR), with resistance rates to the antibiotic panel ranging from 33.3%-100%, and all the isolates were resistant to ceftriaxone and pefloxacin. Salmonella isolates were also 100% resistant to nitrofurantoin, ofloxacin and ciprofloxacin; S. flexneri were 100% resistant to nitrofurantoin, amoxicillin, cotrimoxazole, ofloxacin and ciprofloxacin; and S. sonnei were 100% resistant to nitrofurantoin and cotrimoxazole.Conclusion: These results showed that only 12.5% of typhoid fever diagnosis by Widal test had Salmonella Typhi isolated from their blood cultures while Salmonella enterica and Shigella spp were isolated from stool samples of other cases. There is need to adopt culture techniques for laboratory diagnosis of febrile illnesses in order to improve treatment regimen. The fact that AST can also be performed with culture technique could further guide antibiotic prescription and reduce the risk of emergence of resistant bacteria. Contexte: L'importance d'un diagnostic précis des maladies infectieuses est centrale et cruciale pour l'efficacité du traitement et la prévention des complications à long terme associées à ces infections. L'objectif de cette étude était donc de déterminer la précision du test de titre d'anticorps de Widal dans le diagnostic de la fièvre typhoïde par rapport à la technique d'hémoculture de référence.Méthodologie : Un total de 40 étudiants fréquentant les services de santé de l'Université Olabisi Onabanjo, Ago-Iwoye, État d'Ogun, Nigéria en raison d'une fièvre typhoïde suspectée par un test Widal positif (≥ 1/80) et non sous antibiothérapie, ont été recrutés pour l'étude. Des échantillons de selles et de sang ont été prélevés sur chaque participant et analysés au laboratoire médical du centre de santé à l'aide de techniques de culture conventionnelles et de confirmation des isolats par des tests d'amplification par réaction en chaîne par polymérase (PCR) simplex et multiplex de hilA (Salmonella enterica), ipaH (Shigella spp), les gènes rfc (Shigella flexneri) et wbgZ (Shigella sonnei). Les tests de sensibilité aux antibiotiques (AST) des bactéries isolées à 10 groupes d'antibiotiques ont été effectués à l'aide du test de diffusion sur disque de Kirby Bauer et interprétés conformément aux directives du Clinical and Laboratory Standards Institute (CSLI).Résultats: Sur les 40 patients suspects de fièvre typhoïde par le test de Widal, 9 ont révélé Salmonella enterica donnant un taux d'isolement de 22,5%, avec Salmonella enterica sérovar Typhi (Salmonella Typhi) confirmée comme bactérie unique à partir d'hémocultures chez 5 (12,5%) patients et co-infection de Salmonella et Shigella à partir d'échantillons de selles chez 4 (10,0%) patients. Un total de 52 isolats de bactéries entériques ont étérécupérés à partir d'échantillons de sang et de selles des 40 patients constitués de Salmonella enterica 9 (17,3%), Shigella spp 20 (38,5%), S. flexneri 9 (17,3%) et S. sonnei 14 (26,9%). Tous les isolats entériques étaient multirésistants (MDR), avec des taux de résistance au panel d'antibiotiques allant de 33,3% à 100%, et tous les isolats étaient résistants à la ceftriaxone et à la péfloxacine. Les isolats de Salmonella étaient également résistants à 100% à la nitrofurantoïne, à l'ofloxacine et à la ciprofloxacine; S. flexneri était résistant à 100% à la nitrofurantoïne, à l'amoxicilline, au cotrimoxazole, à l'ofloxacine et à la ciprofloxacine; et S. sonnei étaient 100% résistants à la nitrofurantoïne et au cotrimoxazole.Conclusion: Ces résultats ont montré que seuls 12,5% des diagnostics de fièvre typhoïde par le test de Widal avaient Salmonella Typhi isolée à partir de leurs hémocultures, tandis que Salmonella enterica et Shigella spp ont été isolées à partir d'échantillons de selles d'autres cas. Il est nécessaire d'adopter des techniques de culture pour le diagnostic en laboratoire des maladies fébriles afin d'améliorer le schéma thérapeutique. Le fait que l'AST puisse également être réalisée avec une technique de culture pourrait guider davantage la prescription d'antibiotiques et réduire le risque d'émergence de bactéries résistantes.

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Abat, C., M. Rakotoharinome, M. Maeder, B. Contamin, Vincent Porphyre y E. Cardinale. "Contamination par Salmonella spp. des plats préparés à base de porc dans les gargotes d’Antananarivo (Madagascar) et détermination des facteurs de risque associés". Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 67, n.º 3 (30 de junio de 2015): 120. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.10160.

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Les toxi-infections alimentaires sont un problème majeur pour tous les Etats de la planète. Parmi les causes principales se trouvent Salmonella et Campylobacter, présents dans la nourriture vendue dans les restaurants de rue. Madagascar, plus grande île de l’océan Indien, possède peu de données exploitables pour quantifier l’ampleur de cette contamination. Or, ce pays possède une importante population porcine dont une partie de la viande est servie dans les plats des gargotes en ville. Pour ces raisons, le gouvernement malgache souhaite une meilleure maîtrise de la qualité microbiologique des produits. Cette étude a été conçue dans cette optique et regroupe la direction des services vétérinaires de Madagascar, le Cirad, la faculté de médecine et le Centre d’infectiologie Charles Mérieux d’Antananarivo.Les objectifs étaient de déterminer la prévalence potentielle de Salmonella spp. et de Campylobacter spp. directement présents dans les plats cuisinés à base de porc, vendus par les restaurants de rue de la capitale, ainsi que de caractériser les facteurs de risque à l’origine des contaminations des plats par ces bactéries.Pour la réaliser, soixante gargotes sélectionnées aléatoirement dans treize quartiers d’Antananarivo ont été visitées sur une période de trois mois. Les propriétaires des établissements ont été questionnés sur leurs pratiques de préparation et trois plats à base de porc ont été achetés à chacun d’eux. Chaque échantillon récolté a ensuite été traité suivant un protocole comprenant un pré-enrichissement non sélectif suivi d’un pré-enrichissement en bouillons sélectifs. Les colonies suspectées d’être du genre Salmonella ou Campylobacter ont été récupérées à partir de géloses sélectives, confirmées ou infirmées par tests biochimiques, puis par la méthode RapID ONE, et enfin isolées. Salmonella a ensuite été sérotypée selon la méthode de Kaufmann White Le Minor (2). En cas de contamination confirmée d’un plat échantillonné, le restaurant dont il était issu était défini comme contaminé, constituant ainsi la variable à expliquer. Dès lors, une analyse statistique en plusieurs étapes était réalisée afin de déterminer quelles pratiques de préparation des établissements enquêtés devaient être considérées comme des facteurs de risque.La confirmation des bactéries suspectes par la méthode RapID ONE a permis d’identifier uniquement neuf plats contaminés par des salmonelles. Aucun Campylobacter n’a été détecté. Les sérotypages réalisés ont mis en évidence trois sérotypes : Salmonella Typhimurium, Salmonella Newport et Salmonella Seftenberg. L’analyse globale des pratiques des gargotiers enquêtés a montré que ces derniers présentaient certaines lacunes concernant les bonnes pratiques d’hygiène à appliquer dans leur secteur d’activité. Enfin, l’analyse des facteurs de risque a révélé que, dans le contexte de l’étude, l’utilisation des nappes (odds ratio [OR] = 8,83 ; intervalle de confiance [IC] 95 % : [1,24–62,2]) et la température de service des plats (OR = 5,41 ; IC 95 % : [1,25–35,22]) étaient fortement associées à l’augmentation du risque de contamination des plats par Salmonella. A l’inverse, la situation géographique du quartier de l’établissement enquêté (OR = 0,15 ; IC 95 % : [0,022–0,98]), le type de construction (OR = 0,03 ; IC 95 % : [0,0025–0,29]), le port d’habits spécifiques (OR = 0,15 ; IC 95 % : [0,018–0,99]) et de couvre-chef intégral par le personnel (OR = 0,05 ; IC 95 % : [0,004-0,57]) ont semblé associés à une diminution des risques de contamination des plats par les salmonelles. Campylobacter n’a pas été retrouvé en raison notamment de sa sensibilité à la chaleur ; il a été vraisemblablement détruit par la cuisson. Une étape de sensibilisation a été engagée pour améliorer les pratiques et les propriétaires des restaurants ont été très réceptifs aux conseils prodigués.

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Illouz, Morgane, Matthéo Alcaraz, Françoise Roquet-Banères y Laurent Kremer. "Mycobacterium abscessus, un modèle de résistance aux différentes classes d’antibiotiques". médecine/sciences 37, n.º 11 (noviembre de 2021): 993–1001. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2021164.

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Mycobacterium abscessus est une bactérie non tuberculeuse, environnementale, à croissance rapide, qui est responsable d’infections pulmonaires sévères, notamment chez les patients atteints de mucoviscidose. Le traitement actuel combine l’utilisation d’une b-lactamine et d’un aminoglycoside associés à un macrolide. Cette bactérie est polyrésistante à la plupart des antibiotiques utilisés en clinique. Les mécanismes de résistance, innés ou acquis, qu’elle a développés, conduisent fréquemment à des échecs thérapeutiques, ce qui limite considérablement les moyens de lutte disponibles pour le clinicien. Une compréhension globale des mécanismes de résistance de cette bactérie s’avère ainsi nécessaire pour contrer les infections pulmonaires qu’elle provoque.

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Banito, Agnassim, Essotina Kossi Kpemoua, Roméo Komlan Dayiwo, Ekanao Tedihou y Rachidatou Sikirou. "Inventaire des maladies de l’anacardier (Anacardium occidentale L.) dans la préfecture de Tchamba au Togo". International Journal of Biological and Chemical Sciences 15, n.º 6 (23 de febrero de 2022): 2514–25. http://dx.doi.org/10.4314/ijbcs.v15i6.21.

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L’anacardier (Anacardium occidentale L.) est d’une grande importance socio-économique. Malheureusement, il est attaqué par bioagresseurs dont les maladies fongiques et bactériennes. La présente a pour but d’inventorier les maladies majeures de cette culture, d’évaluer leur prévalence, incidence et sévérité, et d’identifier les pathogènes associés dans 5 des 10 cantons de la préfecture de Tchamba au Togo. Trois vergers par canton ont été évalués par rapport aux symptômes de maladies. Les résultats ont révélé 7 maladies : dessèchement des bourgeons (DB), anthracnose, jaunissement foliaire, rouille noire, gommose, chancre bactérien et rouille rouge. Le DB a donné les taux d’incidence et de sévérité respectifs de 15,99% et 19,19%, supérieur à ceux des autres maladies (p = 0,03). La prévalence des maladies a varié de 20% à 100%. Les pathogènes associés identifiés sont Colletotrichum gloeosporioides pour l’anthracnose, Cochliobolus sp. pour le jaunissement foliaire, Cephaleuros virescens pour la rouille rouge, Lasiodiplodia theobromae pour la gommose et Xanthomonas sp. pour le chancre bactérien. Il ressort de ces résultats que l’anacardier est la cible de pathologiesaussi bien fongiques que bactériens et que de stratégies de lutte adaptées doivent être déployées. English title: Cashew (Anacardium occidentale L.) diseases’ inventory in the prefecture of Tchamba in Togo Cashew (Anacardium occidentale L.) is an important tropical crop worldwide. However, it is attacked by several bioagressors among which fungal and bacterial diseases. The present study aimed to survey the major diseases of cashew tree, assess their prevalence, incidence and severity, and to identify the associated pathogens in five from the ten districts of the prefecture of Tchamba in Togo. Three cashew plantations per district were visited and fungal and bacterial disease symptoms evaluated. The results revealed seven diseases occurring in the surveyed area: Dieback of buds, anthracnose, leaf yellowing, black rust, gum disease, bacterial canker and red rust. Dieback of buds recorded significantly higher disease incidence of 15.99% and severity of 19.19% than the other diseases (p = 0.03). The prevalence of the diseases varied from 20% to 100%. The associated pathogens of the diseases were Colletotrichum gloeosporioides for anthracnose, Cochliobolus sp. for leaf yellowing, Cephaleuros virescens for red rust, Lasiodiplodia theobromae for gum disease and Xanthomonas sp. for bacterial canker. These results revealed the importance of fungal and bacterial diseases occurring in the studied area, thus appropriate control measures must be developed.

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Payment, P. "Effets sur la santé de la recroissance bactérienne dans les eaux de consommation / Health significance of bacterial regrowth in drinking water [Tribune libre, texte anglais et français]". Revue des sciences de l'eau 8, n.º 3 (12 de abril de 2005): 301–14. http://dx.doi.org/10.7202/705225ar.

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La présence de bactéries hétérotrophes dans les eaux de consommation (robinet filtrée sur unités domestiques ou embouteillées) constitue un problème difficile à résoudre car on connaît très mal leurs effets sur la santé humaine. Deux points de vue s'affrontent: l'une perçoit ces bactéries comme des bactéries sans aucune importance quel que soit leur nombre, l'autre suppose que certaines d'entre elles sont potentiellement pathogènes et que l'on ne doit pas leur permettre de se multiplier indûment dans l'eau de consommation. Ces bactéries hétérotrophes sont présentes partout et elles trouvent dans l'eau de consommation une niche écologique qui permet parfois leur croissance en grand nombre (e.g., nodules du réseau, tuyauterie des maisons, chauffe-eau, eaux embouteillées, filtre à charbon actif, etc.). Elles ne sont généralement pas d'origine fécale et ne peuvent donc pas servir d'indicateur de pollution fécale. De plus, les indicateurs fécaux tels les coliformes ou Escherichia coli ne peuvent servir à décrire ce groupe de bactéries. Des études réalisées aux États-Unis chez des familles consommant de l'eau filtrée sur filtres à usage domestiques n'ont pas mis en évidence d'effet sur la santé de concentrations élevées de bactéries hétérotrophes. D'autres études ont suggéré qu'une forte croissance de ces bactéries pouvait même être inhibitrice de la croissance des coliformes fécaux et de certaines bactéries pathogènes. Enfin, on a mis en évidence dans certains cas un effet inhibiteur de la présence de grand nombre de ces bactéries lors de l'énumération des bactéries indicatrices par filtration sur membrane. Au contraire, des études canadiennes récentes suggèrent que la présence de bactéries hétérotrophes en grand nombre pourrait avoir des effets sur la santé des consommateurs d'eau. Ces effets ont été observés lors de la prolifération de la flore bactérienne hétérotrophe dans les réservoirs d'unités de filtration par osmose-inversée. Enfin, des bactéries possédant des facteurs de virulence, et pouvant donc initier des maladies, ont été identifiées dans les eaux de consommation et posent le problème sous un angle nouveau. Les indicateurs dont nous disposons pour évaluer les effets sur la santé des eaux de consommation sont de plus en plus remis en question. Les indicateurs de pollution fécale étant inadéquats pour l'évaluation des risques sur la santé il faudra maintenant nous tourner vers d'autres méthodes pour la surveillance des risques associés à la consommation d'eau. n est très difficile avec les informations dont nous disposons maintenant, de définir si l'on doit réglementer le nombre de bactéries hétérotrophes ou si l'on doit tout simplement faire tous les efforts pour éviter les recroissances non-contrôlées.

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Dembeng Yemelong, Sylvia Winifred, Algrient Towa Nana y Thomas Ewoukem Efole. "Effet de l’aliment artificiel et du zooplancton sur la flore intestinale bactérienne chez la carpe (Cyprinus carpio)". International Journal of Biological and Chemical Sciences 16, n.º 2 (8 de julio de 2022): 721–32. http://dx.doi.org/10.4314/ijbcs.v16i2.17.

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La digestion et l’absorption des aliments chez le poisson sont facilitées tout au long de son tractus digestif par des sécrétions de substances et l’activité des micro-organismes contenus dans son tube digestif. Cyprinus carpio en particulier entretient des relations avec sa flore bactérienne intestinale dont la composition peut être influencée par le type d’aliment ingéré. A cet effet, un essai été mené de Mars à Juin 2020 à la station aquacole de l’Université de Dschang avec pour objectif général de contribuer à l’amélioration de la production piscicole à travers une meilleure connaissance de l’effet de l’aliment sur la flore bactérienne intestinale de Cyprinus carpio. Il a été effectué sur un effectif de 405 carpes communes nourris au zooplancton et à l’aliment artificiel. Des échantillons du contenu de l’intestin ont été prélevés sur 54 poissons et ont été soumis à des cultures bactériennes pour l’identification des genres de bactéries. Les résultats relatifs à l’identification des Firmicutes et Protéobactéries présents dans l’intestin des poissons en fonction du type d’aliment montrent que sept genres de bactéries à savoir Lactobacillus, Staphylococcus, Streptococcus (Firmicutes), Salmonella, Shigella, Klebsiella et Escherichia (protéobactéries) ont été présents. En ce qui concerne l’évaluation des effets du type d’aliment sur l’état de bactéries utiles et pathogènes de la flore intestinale les résultats montrent que quatre étaient pathogènes (Staphylococcus, Streptococcus, Salmonella, Shigella) et trois étaient utiles (Klebsiella, Escherichia et Lactobacillus) pour les poissons. Les résultats relatifs aux abondances des genres de bactérie montrent que les genres Lactobacillus, Klebsiella, Streptococcus et Salmonella sont plus abondants dans l’intestin des carpes qui ont été nourri au zooplancton et à l’association zooplancton et aliment artificiel. Des abondances relatives identiques de 27,78% ont été obtenues pour les genres Staphylococcus, Shigella, Escherichia et Streptococcus dans l’intestin des carpes ayant reçu l’aliment artificiel uniquement. Elles sont supérieures à celles des poissons qui ont reçu le zooplancton uniquement. Les tests de la corrélation effectués entre les caractéristiques de croissances et les caractéristiques de la microflore intestinale de la carpe commune ont révélés que le gain moyen quotidien (0,19 g/j), le gain de poids (2,60 g) et le taux de croissance spécifique (1,94%), sont plus élevées chez les poissons qui ont reçu l’aliment artificiel associé au zooplancton et les plus faible chez ceux qui ont reçu l’aliment artificiel uniquement respectivement pour des valeurs de 0,17 g/j ; 2,44 g et 1,87%. Les bactéries du genre Shigella chez les carpes nourris uniquement au zooplancton ont eu des effets statiquement significatifs sur leur gain de poids et leur gain moyen quotidien. Il ressort de cette étude que le type d’aliment influence la composition bactérienne dans l’intestin des carpes et par conséquent sa croissance. Au vue de ces résultats, il est idéal d’utiliser le zooplancton dans l’aliment pour poisson.

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Chadha, A., W. Jamal y V. O. Rotimi. "Emergence of nosocomial-acquired extensively drug-resistant and pandrug-resistant Enterobacterales in a teaching hospital in Kuwait". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 23, n.º 4 (24 de octubre de 2022): 426–36. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v23i4.11.

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Background: The emergence and high ascendancy of infections caused by extensively-drug-resistant (XDR) and pandrug-resistant (PDR) Enterobacterales isolates is a serious clinical and public health challenge. Isolation of PDR Gram-negative bacteria (GNB) in clinical setting is very rare and rarer is the infection caused by XDR GNB. Apart from restricted therapeutic options, these infections are associated with increased mortality and morbidity. Urgent studies to re-evaluate existing therapeutic options and research into new antibiotic molecules are desperately needed. The objectives of this study are to report the emergence of rarely encountered multidrug-resistant (MDR), difficult-to-threat, CRE infections in our hospital and investigate their molecular epidemiology.Methodology: This was a retrospective observational analysis of six patients with severe infections caused by XDR and PDR Enterobacterales isolates at Mubarak AL Kabeer Teaching Hospital, Jabriya, Kuwait, over a period of one and half years. The mechanisms of resistance in these isolates were then prospectively investigated by molecular characterization and genomic studies.Results: The majority of infections were caused by Klebsiella pneumoniae (83.3%, 5/6) and one (16.6%) was caused by Escherichia coli. Three patients had bloodstream infection (BSI), one had both BSI and urinary tract infection (UTI), one had respiratory tract infection, and the last one had UTI. Two patients were infected with OXA-48 producers, one patient was infected with NDM-1 producer, one patient was infected with NDM-5 producer, one patient was infected with both NDM-1 and OXA-48 producer and the last patient was infected with both NDM-5 and OXA-181 producer. For definite treatment, all patients received combination therapy. The mortality rate was high (50.0%).Conclusion: The high mortality rate associated with XDR and PDR Enterobacterales infections and the limited antimicrobial options for treatment highlight the need for improved detection of these infections, identification of effective preventive measures, and development of novel agents with reliable clinical efficacy against them. Contexte: L'émergence et la montée en puissance des infections causées par des isolats d'entérobactéries ultrarésistantes (XDR) et pandrug-résistantes (PDR) constituent un sérieux défi clinique et de santé publique. L'isolement de bactéries Gram-négatives PDR (GNB) en milieu clinique est très rare et plus rare est l'infection causée par XDR GNB. En dehors des options thérapeutiques restreintes, ces infections sont associées à une augmentation de la mortalité et de la morbidité. Des études urgentes pour réévaluer les options thérapeutiques existantes et la recherche de nouvelles molécules antibiotiques sont désespérément nécessaires. Les objectifs de cette étude étaient de signaler l'émergence d'infections à CRE multirésistantes (MDR), difficiles à menacer, rarement rencontrées dans notre hôpital et d'enquêter sur leur épidémiologie moléculaire.Méthodologie: Il s'agissait d'une analyse observationnelle rétrospective de six patients atteints d'infections graves causées par des isolats d'entérobactéries XDR et PDR à l'hôpital universitaire Mubarak AL Kabeer, Jabriya, Koweït, sur une période d'un an et demi. Les mécanismes de résistance de ces isolats ont ensuite été étudiés de manière prospective par caractérisation moléculaire et études génomiques.Résultats: La majorité des infections ont été causées par Klebsiella pneumoniae (83,3%, 5/6) et une (16,6%) a été causée par Escherichia coli. Trois patients avaient une infection du sang (BSI), un avait à la fois une BSI et une infection des voies urinaires (UTI), un avait une infection des voies respiratoires et le dernier avait une UTI. Deux patients ont été infectés par des producteurs d'OXA-48, un patient a été infecté par un producteur de NDM-1, un patient a été infecté par un producteur de NDM-5, un patient a été infecté par un producteur de NDM-1 et d'OXA-48 et le dernier patient a été infecté avec le producteur NDM-5 et OXA-181. Pour un traitement définitif, tous les patients ont reçu une thérapie combinée. Le taux de mortalité était élevé (50.0%).Conclusion: Le taux de mortalité élevé associé aux infections XDR et PDR Enterobacterales et les options antimicrobiennes limitées pour le traitement soulignent la nécessité d'améliorer la détection de ces infections, l'identification de mesures préventives efficaces et le développement de nouveaux agents avec une efficacité clinique fiable contre elles.

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Obaro, H. K., B. Abdulkadir y S. Abdullahi. "In vitro antibiotic susceptibility of bacterial pathogens and risk factors associated with culture positive neonatal sepsis in two hospitals, Katsina metropolis, Nigeria". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 23, n.º 4 (24 de octubre de 2022): 378–88. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v23i4.6.

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Background: Neonatal sepsis is one of the most important causes of morbidity and mortality among neonates, particularly in developing countries. This study aimed to determine the risk factors and in vitro antibiotic susceptibility patterns of bacterial pathogens associated with neonatal sepsis in Federal Medical Centre (FMC) and Turai Umaru Yar’adua Maternal and Children Hospital (TUYMCH), Katsina, Nigeria.Methodology: A total of 60 hospitalized neonates evaluated for neonatal sepsis at the special care baby units (SCBU) of the two healthcare facilities whose parents gave informed consent were enrolled for the study between July and December 2020. Blood samples were aseptically collected from the neonates and cultured on BacT/Alert automated platform (BioMérieux, Mercy-Etoile, France) machine. Bacteria were identified from all positive cultures and in vitro susceptibility test was performed on the isolates to determine their minimum inhibitory concentrations (MICs) to eight selected antibiotics using the Vitek-2 compact system. Data were analyzed by SPSS version 22.0.Results: A total of 60 neonates with clinical features suggestive of sepsis were enrolled. The mean age of the neonates is 1.35±0.48 days while the mean weight is 2.13±0.89 kg. Neonates with early onset sepsis (<3 days) constituted 65% while those with late-onset sepsis (>3 days) constituted 35%. Thirty-one (51.7%) neonates were culture positive while 29 (48.3%) were culture negative for bacterial pathogens. Gram-positive bacteria predominated, constituting 80.6% while Gram-negative bacteria constituted 19.4%. The most frequent Gram-positive bacteria were coagulase-negative staphylococci (51.6%, 16/31), with Staphylococcus haemolyticus 5 (16.1%) predominating, while the most frequent Gram-negative bacteria isolate was Escherichia coli 2 (6.5%). A high degree of antibiotic resistance (>50% rate) was exhibited by the isolates against most of the tested antibiotics including third generation cephalosporins and fluoroquinolones. Gentamicin was the only antibiotic effective, with 65.5% of all isolates sensitive to it; 68.0% Gram-positives and 50.0% Gram-negatives. Vancomycin was also effective against Gram-positive bacteria, with 68.0% of the isolates sensitive to it. Previous premature delivery (64.5%, 20/31) and baby delivery at home were respectively the only maternal and neonatal factors significantly associated with culture-positive neonatal sepsis (OR=2.975, 95% CI=1.040-8.510). There was no significant difference between culture positive and negative neonatal sepsis with respect to clinical manifestations such as refusal of feeds, fever, jaundice, fast breathing, convulsion and body temperature (p>0.05).Conclusion: Neonatal sepsis is a substantial cause of mortality and morbidity among neonates admitted at the FMC and TUYMCH, Katsina, Nigeria. There is a need for regular surveillance of the risk factors, causative organisms, and antibiotic susceptibility patterns of isolated pathogens, to inform the choice of empirical antibiotic treatment pending the results of blood cultures. Contexte: La septicémie néonatale est l'une des causes les plus importantes de morbidité et de mortalité chez les nouveau-nés, en particulier dans les pays en développement. Cette étude visait à déterminer les facteurs de risque et les schémas de sensibilité aux antibiotiques in vitro des agents pathogènes bactériens associés à la septicémie néonatale dans le Centre Médical Fédéral (FMC) et le Turai Umaru Yar'adua Hôpital de la Mère et de l'Enfant (TUYMCH), Katsina, Nigeria.Méthodologie: Un total de 60 nouveau-nés hospitalisés évalués pour une septicémie néonatale dans les unités de soins spéciaux pour bébés (SCBU) des deux établissements de santé dont les parents ont donné leur consentement éclairé ont été inclus dans l'étude entre juillet et décembre 2020. Des échantillons de sang ont été prélevés de manière aseptique sur les nouveau-nés et cultivés sur la plate-forme automatisée BacT/Alert (BioMérieux, Mercy-Etoile, France). Les bactéries ont été identifiées à partir de toutes les cultures positives et un test de sensibilité in vitro a été effectué sur les isolats pour déterminer leurs concentrations minimales inhibitrices (CMI) à huit antibiotiques sélectionnés à l'aide du système compact Vitek-2. Les données ont été analysées par SPSS version 22.0.Résultats: Au total, 60 nouveau-nés présentant des caractéristiques cliniques évoquant une septicémie ont été recrutés. L'âge moyen des nouveau-nés est de 1,35±0,48 jours alors que le poids moyen est de 2,13±0,89 kg. Les nouveau-nés atteints d'un sepsis précoce (<3 jours) représentaient 65% tandis que ceux atteints d'un sepsis tardif (>3 jours) représentaient 35%. Trente et un (51,7%) nouveau-nés étaient positifs à la culture tandis que 29 (48,3%) étaient négatifs à la culture pour les pathogènes bactériens. Les bactéries Gram-positives prédominaient, constituant 80,6% tandis que les bactéries Gram-négatives constituaient 19,4%. Les bactéries à Gram positif les plus fréquentes étaient les staphylocoques à coagulase négative (51,6%, 16/31), Staphylococcus haemolyticus 5 (16,1%) prédominant, tandis que l'isolat de bactéries à Gram négatif le plus fréquent était Escherichia coli 2 (6,5%). Un degré élevé de résistance aux antibiotiques (> 50% de taux) a été présenté par les isolats contre la plupart des antibiotiques testés, y compris les céphalosporines de troisième génération et les fluoroquinolones. La gentamicine était le seul antibiotique efficace, avec 65,5% de tous les isolats qui y étaient sensibles; 68,0% de Gram positifs et 50,0% de Gram négatifs. La vancomycine était également efficace contre les bactéries Gram-positives, 68,0% des isolats y étant sensibles. Un accouchement prématuré antérieur (64,5%, 20/31) et un accouchement à domicile étaient respectivement les seuls facteurs maternels et néonatals significativement associés à une septicémie néonatale à culture positive (OR=2,975, IC 95%=1,040-8,510). Il n'y avait pas de différence significative entre la septicémie néonatale positive et négative à la culture en ce qui concerne les manifestations cliniques telles que le refus de s'alimenter, la fièvre, la jaunisse, la respiration rapide, les convulsions et la température corporelle (p>0,05).Conclusion: La septicémie néonatale est une cause importante de mortalité et de morbidité chez les nouveau-nés admis au FMC et TUYMCH, Katsina, Nigeria. Il est nécessaire de surveiller régulièrement les facteurs de risque, les organismes responsables et les schémas de sensibilité aux antibiotiques des agents pathogènes isolés, afin d'éclairer le choix d'un traitement antibiotique empirique en attendant les résultats des hémocultures.

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Tytgat, G. N. J., E. A. J. Rauws, W. Langenberg y H. j. Houthoff. "Le rôle du traitement anti-bactérien dans la gastrite associée auCampylobacter pylori: Expérience hollandaise". Acta Endoscopica 17, n.º 5 (septiembre de 1987): 243–49. http://dx.doi.org/10.1007/bf02968450.

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Loubet, P., G. Voiriot, M. Neuville, B. Visseaux y J. F. Timsit. "Virus respiratoires dans les pneumonies associées aux soins". Médecine Intensive Réanimation 27, n.º 3 (mayo de 2018): 217–27. http://dx.doi.org/10.3166/rea-2018-0049.

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Les pneumonies acquises à l’hôpital (PAH) sont fréquentes. À l’ère des techniques diagnostiques de biologie moléculaire (multiplex polymerase chain reaction), les rares données disponibles estiment que les virus respiratoires sont impliqués dans 22 à 32 % des épisodes. Les patients immunodéprimés constituent probablement la population la plus à risque. La présentation clinique et radiologique ne diffère pas entre pneumonies bactériennes, virales et mixtes (virus–bactérie). L’excrétion prolongée de virus respiratoires dans les voies aériennes a été rapportée chez les patients immunodéprimés. Elle pourrait promouvoir la co-infection bactérienne, associée à des durées d’hospitalisation prolongées. L’acquisition intrahospitalière a été démontrée chez tous les virus respiratoires. Elle encourage la mise en œuvre et le respect des mesures d’hygiène et de confinement, dans l’objectif de protéger soignants, visiteurs et patients. De nombreux points restent largement méconnus, relatifs aux interactions entre virus respiratoires et pathogènes non viraux, aux périodes d’incubation, ou encore aux durées d’excrétion virale. L’amélioration des techniques diagnostiques et l’accumulation de données épidémiologiques et cliniques devraient permettre de mieux appréhender le rôle des virus respiratoires dans les PAH. Cette meilleure connaissance aidera à rationaliser l’utilisation des tests de détection et facilitera l’interprétation de leurs résultats. Elle guidera aussi le clinicien dans l’utilisation future des nombreuses molécules antivirales actuellement en développement clinique chez l’homme.

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SANDERS, P., A. BOUSQUET-MELOU, C. CHAUVIN y P. L. TOUTAIN. "Utilisation des antibiotiques en élevage et enjeux de santé publique". INRAE Productions Animales 24, n.º 2 (7 de abril de 2011): 199–204. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2011.24.2.3254.

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Les antibiotiques, sous forme de médicaments vétérinaires, doivent être utilisés dans le cadre du traitement de maladie animale d’étiologie bactérienne. Leur usage à bon escient est de la responsabilité du vétérinaire qui doit se donner les moyens d’un choix raisonné basé sur ses connaissances épidémiologiques, sur son sens du diagnostic et sur les examens complémentaires notamment bactériologique. Utiliser les antibiotiques conduit à créer une pression de sélection pour des bactéries résistantes pathogènes ou commensales. Des dispositifs de surveillance épidémiologique de la résistance aux antibiotiques et de l’usage des antibiotiques ont été mis en place en France pour évaluer la nature et l’ampleur des usages et les taux de résistance aux principaux antibiotiques. Ces données sont complétées par l’étude des gènes et des mécanismes de résistance, de la pharmacologie des antibiotiques et de la pharmaco- épidémiologie des phénomènes de résistance c’est-à-dire l’étude de la relation entre l’usage des antibiotiques et les mesures préventives associés aux phénomènes d’émergence et de diffusion des gènes de résistance et des bactéries de résistance.

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Côté, Nathalie y Jean-Charles Pasquier. "La prématurité spontanée et le microbiote maternel". médecine/sciences 34, n.º 10 (octubre de 2018): 799–805. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2018205.

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Des millions d’enfants naissent prématurément chaque année et les cliniciens restent démunis face à la difficulté de maîtriser la physiopathologie associée, ce qui limite les options thérapeutiques. Récemment, il a été suggéré que le microbiote maternel pouvait contribuer au bon déroulement de la grossesse et qu’une dysbiose pourrait entraîner une naissance avant terme. Certaines espèces commensales de Lactobacillus participeraient à une fonction de « filtre vaginal », empêchant une propagation ascendante de pathogènes vers la cavité utérine. Ce compartiment peut par ailleurs être colonisé par des bactéries buccales, suggérant la possibilité de leur dissémination par voie hématogène vers l’utérus.

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Nicolas, J. y J. L. Vasel. "Modélisation des échanges thermiques et de la circulation d'air dans un lit bactérien". Revue des sciences de l'eau 3, n.º 3 (12 de abril de 2005): 303–24. http://dx.doi.org/10.7202/705077ar.

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La température dans un lit bactérien a une influence prépondérante sur les réactions biologiques qui s'y déroulent. Le modèle développé ici présente une formulation qui permet de calculer un profil de température, et donc une température moyenne de l'eau à l'intérieur du lit bactérien, à partir des grandeurs suivantes : débit et température d'entrée du liquide, température et humidité de l'air extérieur et caractéristiques d'échange thermique de la tour. De plus, il permet d'appréhender la circulation de l'air induite par tirage naturel dans la tour, moyennant la connaissance des coefficients de pertes de charge associés au garnissage utilisé, ainsi qu'aux ouïes d'aération. En sus de la formulation du modèle, les tout premiers résultats d'ajustement du modèle obtenus sur installations pilotes sont présentés. Le développement de la méthode devrait permettre d'optimiser la température de fonctionnement du lit tout en garantissant une circulation suffisante de l'air dans l'appareil.

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Voland, L., J. Debédat, E. Belda, S. Adriouch, T. Le Roy y K. Clément. "L’obésité sévère est associée à une altération du métabolisme bactérien et de l’hôte de la biotine". Nutrition Clinique et Métabolisme 36, n.º 1 (febrero de 2022): S90. http://dx.doi.org/10.1016/j.nupar.2021.12.178.

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Furuya, Kento y Naoya Itoh. "Bactérie Listeria monocytogenes associée à une spondylite pyogène chez une femme de 92 ans". Canadian Medical Association Journal 194, n.º 7 (22 de febrero de 2022): E274—E275. http://dx.doi.org/10.1503/cmaj.210205-f.

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GUILLAUMÈS, J., G. HOUDEAU, R. GERMAIN y J. M. OLIVIER. "Amélioration de la lutte biologique contre Pseudomonas tolaasii par utilisation de bactériophages associés à une bactérie antagoniste". EPPO Bulletin 18, n.º 1 (marzo de 1988): 77–82. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2338.1988.tb00351.x.

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ROGEL-GAILLARD, C. "Les banques de grands fragments d’ADN". INRAE Productions Animales 13, HS (22 de diciembre de 2000): 79–85. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2000.13.hs.3815.

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Les banques de grands fragments d’ADN constituent depuis une quinzaine d’années une avancée technologique remarquable pour l’étude des génomes complexes. En effet, chaque fragment cloné, jusqu’à 2 mégabases dans des chromosomes artificiels de levures (YAC) et 200 kilobases dans des chromosomes artificiels de bactéries (BAC), représente une petite région chromosomique qui contient un ou plusieurs gènes avec des éléments de régulation proximaux et distaux, ainsi que des marqueurs associés. Des collections de clones représentatives d’un génome entier ont été produites. Ces banques de grands fragments d’ADN sont intensivement utilisées pour la cartographie intégrée des génomes et sont les éléments fondateurs des programmes de grand séquençage, dont celui de l’Homme. Les clones de grands fragments d’ADN constituent, de plus, un matériel puissant pour élaborer les outils et concepts de la génomique fonctionnelle de demain.

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Adeyemo, A. T., A. T. Adeyemo, B. W. Odetoyin y A. O. Onipede. "Prevalence and risk factors for extended-spectrum β-lactamase-producing Gram-negative bacterial infections in hospitalized patients at a tertiary care hospital, southwest Nigeria". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 23, n.º 2 (13 de mayo de 2022): 149–58. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v23i2.5.

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Background: Clinical infections caused by extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing bacteria constitute great burden to healthcare delivery with these resistant pathogens contributing largely to the magnitude and spread of antimicrobial resistance globally. Hence, knowledge of the risk factors for acquisition of infection caused by ESBL-producing bacteria is crucial to instituting prompt and appropriate treatment as well as prevention and control measures. This study investigated the risk factors associated with the prevalence of ESBL-producing Gram-negative bacteria (GNB) infections among hospitalized patients in Uniosun Teaching Hospital (UTH), Osogbo, Nigeria. Methodology: A total of 359 hospitalized patients with clinical infections from whose clinical samples we isolated non-duplicate GNB were consecutively recruited. GNB were isolated following aerobic cultures of appropriate clinical samples and MicrobactTMGNB 24E kit was used for species identification. All isolates were screened for ESBL production by the combination disc method. Relevant clinical and demographic information was obtained using a designed data collection form, and multivariate logistic regression analysis was used to identify associated risk factors. Results: Ninety-four (26.2%) of the 359 patients had ESBL-producing GNB isolated from their clinical samples, with a preponderance of Escherichia coli (26.6%, n=25/94), although the most frequent ESBL-producer was Stenotrophomonas maltophilia (100%, n=2/2) and least frequent was Pseudomonas aeruginosa (2.6%, n=1/39). The study indicated that male gender, age group >60 years and farming were socio-demographic factors associated with significantly higher prevalence of ESBL-producing GNB infection. Other independent risk factors significantly associated with high prevalence of ESBL GNB infections were; (i) admission into intensive care unit and male surgical ward, (ii) presence of invasive devices such as intravenous line, endotracheal tube and urinary catheter, (iii) underlying conditions such as diabetes mellitus and benign prostatic hyperplasia, and (iv) immunocompromised state. Conclusion: The information obtained from this study can serve as baseline data for designing strategy to prevent drug-resistant infections and transmission in our hospital. French title: Facteurs de prévalence et de risque pour les infections de bactéries gram-négatives de la β-lactamase prolongées de la β-lactamase chez les patients hospitalisés dans un hôpital de soins tertiaires, au sud-ouest du Nigéria Contexte: Les infections cliniques causées par des bactéries de la β-lactamase de spectre prolongée (ESBL) constituent une grande charge à la livraison des soins de santé avec ces agents pathogènes résistants contribuant en grande partie à la magnitude et à la propagation de la résistance antimicrobienne mondiale. Par conséquent, la connaissance des facteurs de risque d'acquisition d'une infection causée par les bactéries produisant des ESBL est essentielle à l'institution de traitement rapide et approprié, ainsi que des mesures de prévention et de contrôle. Cette étude a enquêté sur les facteurs de risque associés à la prévalence des bactéries gram-négatives de l'ESBL (GNB) parmi les patients hospitalisés dans l'hôpital d'enseignement Uniosun (Uth), Osogbo, Nigéria. Méthodologie: Un total de 359 patients hospitalisés avec des infections cliniques de laquelle les échantillons cliniques de laquelle nous avons isolé le GNB non dupliqué ont été recrutés consécutivement. GNB ont été isolés à la suite de cultures aérobies d'échantillons cliniques appropriés et de kit MicroBactTM GNB 24E a été utilisé pour l'identification des espèces. Tous les isolats ont été criblés pour la production ESBL par la méthode des disques combinées. Des informations cliniques et démographiques pertinentes ont été obtenues à l'aide d'un formulaire de collecte de données conçu et une analyse de régression logistique multivariée a été utilisée pour identifier les facteurs de risque associés. Résultats: Quatre-vingt-quatorze (26,2%) des 359 patients avaient des GNB producteurs de BLSE isolés de leurs échantillons cliniques, avec une prépondérance d'Escherichia coli (26,6%, n=25/94), bien que le producteur de BLSE le plus fréquent soit Stenotrophomonas maltophilia (100.0%, n=2/2) et la moins fréquente était Pseudomonas aeruginosa (2,6%, n=1/39). L'étude a indiqué que le sexe masculin, le groupe d'âge > 60 ans et l'agriculture étaient des facteurs sociodémographiques associés à une prévalence significativement plus élevée d'infections à GNB productrices de BLSE. D'autres facteurs de risque indépendants significativement associés à une prévalence élevée d'infections à BLSE GNB étaient; (i) admission en unité de soins intensifs et en salle de chirurgie pour hommes, (ii) présence de dispositifs invasifs tels qu'une ligne intraveineuse, un tube endotrachéal et un cathéter urinaire, (iii) conditions sous-jacentes telles que le diabète sucré et l'hyperplasie bénigne de la prostate, et (iv) immunodéprimé Etat. Conclusion: les informations obtenues à partir de cette étude peuvent servir de données de base pour la conception de la stratégie visant à prévenir les infections et la transmission résistantes à la drogue dans notre hôpital.

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Got, P., B. Baleux y M. Troussellier. "Dénombrements directs des bactéries des milieux aquatiques par microscopie en épifluorescence : comparaison entre un système d'analyse d'images automatisé (Mudicam®) et l'observation visuelle". Revue des sciences de l'eau 6, n.º 3 (12 de abril de 2005): 269–84. http://dx.doi.org/10.7202/705176ar.

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La technique de comptage par microscopie en épitluorescence est la méthode la plus performante pour dénombrer la totalité des bactéries présentes dans les milieux aquatiques. Cependant cette technique est longue, fastidieuse et subjective. Afin d'automatiser et de rendre objectif le dénombrement, le microscope à épifluorescence est couplé à un analyseur d'images. Si les systèmes d'analyse d'images sont utilisés pour les mesures de taille des bactéries aquatiques, très peu d'études font état de comparaison entre les dénombrements par analyse d'image et ceux réalisés de façon traditionnelle. Cet article présente les résultats des dénombrements de souches bactériennes de référence et de bactéries des milieux aquatiques, par la technique de microscopie en épifluorescence des cellules bactériennes marquées au DAPI, réalisés simultanément par observation microscopique visuelle (visuel) et par analyse d'images automatisée (automatique). Le système d'analyse d'images est composé d'une caméra vidéo (Lhesa LH40036) de sensibilité de 510-4 lux, d'une carte de numérisation (512 x 512 pixels, 8 bits, cyclope v 2.32, Digital vision) d'un micro-ordinateur 80-386 et d'un logiciel de dénombrement (Mudicam®. EAU). Le système est couplé à un microscope en épilluorescence Olympus BH2.Les dénombrements ont été réalisés d'une part sur des suspensions de souches bactériennes de référence (n = 30) à différents états physiologiques et sur des échantillons d'eaux (n = 50) d'origines diverses (fleuve, eaux saumâtre, marine et résiduaire). La comparaison des deux méthodes est réalisée par un modèle de régression linéaire et une analyse de variance. Les tests statistiques associés permettent de conclure à une bonne concordance entre les deux méthodes. A partir de l'ensemble des dénombrements réalisés, 18 d'entre eux pris au hasard ont été dénombrés de façon manuelle par deux opérateurs et par le système d'analyse d'image. Il apparaît que les différences de comptage les plus élevées correspondent aux dénombrements effectués par chacun des deux opérateurs. Ceci met en évidence que non seulement le système d'analyse d'image permet une quantification rapide des abondances bactériennes, mais en outre il supprime la subjectivité de l'opérateur tout en réalisant des dénombrements aussi précis.

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Duponnois, Robin, Jean Thioulouse, Mireille Fargette, Keith Davies y Sabine Fould. "Diversity of the bacterial hyperparasite Pasteuria penetrans in relation to root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) control on Acacia holosericea". Nematology 2, n.º 4 (2000): 435–42. http://dx.doi.org/10.1163/156854100509295.

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Resumen

AbstractPasteuria penetrans isolates sampled from different geographical areas were characterised both for the heterogeneity of the endospore surface using monoclonal antibodies and for the ability of spores to attach to different isolates of Meloidogyne spp. The efficacy of these different Pasteuria isolates as biological control agents was tested in a glasshouse experiment with M. incognita from Senegal on Acacia holosericea. The immunoprofiles divided the P. penetrans isolates broadly differently from the attachment tests. Isolate PP16 from Senegal was associated with better seedling development of M. incognita-inoculated A. holoceria than were other isolates. Substantial variation in root and shoot biomass was not related to the observed variation in spore attachment tests. The difficulties involved in obtaining consistent biological control with Pasteuria are discussed in relation to the high degree of variability of this bacterium. Diversité chez l'hyperparasite bactérien Pasteuria penetrans en relation avec le contrôle du nématode Meloidogyne spp. sur Acacia holosericea - Des isolats de Pasteuria penetrans provenant de différentes régions géographiques ont été caractérisés en ce qui concerne, d'une part l'hétérogénéité de la surface des endospores - par utilisation d'anticorps monoclonaux -, d'autre part la capacité des spores à s'attacher à différentes souches de Meloidogyne spp. L'efficacité de ces différents isolats de P.penetrans en tant qu'agent de contrôle a été testée lors d'une expérience en serre utilisant un M. incognita d'origine sénégalaise et Acacia holosericea. Les isolats de P.penetrans ont montré des différences dans les profils immunologiques, différences non corrélées avec celles observées lors des tests d'attachement. En comparaison avec d'autres isolats, l'isolat PP16 provenant du Sénégal était associé à une meilleure croissance des plants de A. holosericea infestés par M. incognita. La variabilité importante touchant les biomasses aérienne et souterraine ne montrait aucune relation avec les différences observées lors des tests d'attachement. Les difficultés rencontrées pour obtenir un contrôle valable à l'aide de P.penetrans sont discutées en tenant compte du degré important de variabilité chez cette bactérie.

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Tamber, Sandeep, Brendan Dougherty y Kimberly Nguy. "Sérovars de Salmonella enterica associés à des bactériémies au Canada, 2006 à 2019". Relevé des maladies transmissibles au Canada 47, n.º 56 (9 de junio de 2021): 284–93. http://dx.doi.org/10.14745/ccdr.v47i56a03f.

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Contexte : Les membres du genre bactérien Salmonella sont à l’origine de la salmonellose, une maladie dont les manifestations cliniques varient d’une gastro-entérite autolimitée à une bactériémie plus grave, une défaillance organique et une septicémie. Le genre se compose de plus de 2 600 variantes sérologiques (sérovars). On a remarqué des différences importantes dans la pathogenèse des sérovars de Salmonella. Objectif : Le but de cette étude était de déterminer quels sérovars de Salmonella étaient plus susceptibles d’être associés à des bactériémies au Canada. Méthodes : Pour chaque sérovar, on a extrait les informations sur le nombre total d’infections à Salmonella et d’isolats sanguins signalés au Programme national de surveillance des maladies entériques de 2006 à 2019. Le risque (proportion) et la probabilité (cote) de bactériémie ont été calculés pour tous les sérovars. Résultats : Sur les 96 082 cas de salmonellose signalés au Programme national de surveillance des maladies entériques pendant la période d’étude de 14 ans, 4,4 % (IC 95 % : 4,3 %–4,6 %) étaient bactériémiques. Vingt sérovars de Salmonella non typhique ont été associés à des taux plus faibles de bactériémie par rapport à tous les sérovars de Salmonella non typhique, et 19 sérovars de Salmonella non typhique ont été identifiés comme ayant des taux plus élevés, Heidelberg, Oranienburg, Schwarzengrund, Virchow, Panama et Poona comptant parmi les 25 sérovars les plus fréquemment signalés au Canada pendant la période d’étude. Conclusion : L’identification des sérovars associés aux bactériémies à Salmonella au Canada est un premier pas vers la compréhension des différences dans la pathogenèse et la présentation de la maladie.

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Makanera, Abdoulaye, M. Conde, MA Diallo, O. Sy, T. Diakité, M. Conde, AO Barry y D. Camara. "Ewingella americana : une bactérie pathogène émergente isolée de selles diarrhéiques à l'Hôpital de l'Amitié Sino-Guinéenne de Kipé/Conakry". Revue Malienne d'Infectiologie et de Microbiologie 14, n.º 2 (4 de diciembre de 2019): 43–46. http://dx.doi.org/10.53597/remim.v14i2.1369.

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Ewingella americana (E. americana), est une bactérie appartenant à la famille des Enterobacteriaceae autrefois rarement associée à des infections humaines. L'objectif était de décrire une souche d'E. americana isolée de selles diarrhéiques à l'Hôpital de l'Amitié Sino-Guinéenne de Kipé/Conakry. L'échantillon de selles diarrhéiques a été prélevé chez un patient de sexe masculin, âgé de 18 ans. La culture a été faite sur différents milieux gélosés pendant 24 heures à 37°C. L'identification bactérienne, l'antibiogramme et la détermination des concentrations minimales inhibitrices ont été faits sur l'automate Vitek2 Compact 15. La souche d'E. Americana identifiée était sensible à la majorité des antibiotiques testés. En revanche, cette souche était résistante à la céfoxitine, l'amikacine, et l'acide nalidixique et présentait une sensibilité intermédiaire à la céfalotine, la gentamicine et la tobramycine. Ce présent travail rapporte à notre connaissance, la première description d'E. americana isolée des selles diarrhéiques avec une multi-résistance à certains antibiotiques.

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MARTIN, C., L. BROSSARD y M. DOREAU. "Mécanismes d’apparition de l’acidose ruminale latente et conséquences physiopathologiques et zootechniques". INRAE Productions Animales 19, n.º 2 (13 de marzo de 2006): 93–108. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2006.19.2.3488.

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Alors que sa forme aiguë est devenue rare, l’acidose ruminale se développe dans nos systèmes de production intensive sous sa forme latente, plus discrète mais touchant un nombre important d’animaux avec des impacts financiers négatifs. L’acidose ruminale aiguë a pour origine une surconsommation accidentelle de glucides rapidement fermentescibles. Elle apparaît comme un état de perturbation bien défini : chute du pH à des valeurs inférieures à 5, associée à une accumulation de lactate dans le rumen. Ceci est dû à l’appauvrissement de l’écosystème microbien ruminal (protozoaires, bactéries) au profit d’une flore productrice de lactate acido-tolérante. L’acidose latente apparaît plus spécialement lors des périodes de transitions alimentaires vers des régimes à forte densité énergétique. Elle représente un état de déséquilibre transitoire plus ou moins fréquent ou durable. La baisse du pH, proche des valeurs physiologiques inférieures (pH moyen entre 5 et 6,25), n’est pas liée à l’accumulation de lactate, mais à celle des acides gras volatils. La proportion d’acétate diminue en relation avec la baisse de l’activité cellulolytique. Pour une baisse de pH modérée, les protozoaires se développent et les fermentations s’orientent vers le butyrate. Pour des pH plus faibles, les protozoaires disparaissent au profit des bactéries amylolytiques, avec une orientation fermentaire vers le propionate. Ces modifications ruminales peuvent avoir des conséquences physiopathologiques à plus ou moins long terme au niveau digestif (inhibition de la motricité ruminale, diarrhées, lésions de la paroi ruminale…), des troubles métaboliques ou encore des complications infectieuses et locomotrices. Les conséquences négatives sur les quantités ingérées et les performances, bien que réelles, sont très difficiles à quantifier du fait que les régimes acidogènes, riches en concentré, vont généralement de pair avec des quantités ingérées et des performances élevées. L’état d’acidose se traduirait par des diminutions de courte durée, et donc une plus grande irrégularité de l’ingestion et de la production.

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Gschwind, Rémi, Thierry Fournier, Marie-José Butel y Sandra Wydau-Dematteis. "Établissement du microbiote". médecine/sciences 34, n.º 4 (abril de 2018): 331–37. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20183404014.

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Certaines pathologies semblent avoir une origine développementale et, aujourd’hui, le microbiote apparaît comme un déterminant de l’état de santé de l’homme et son établissement, une étape importante chez le nouveau-né. Des variations dans sa constitution, incluant un déséquilibre (ou dysbiose), ont ainsi été associées à de nombreuses pathologies. De récents travaux suggèrent qu’une colonisation bactérienne de l’utérus, du liquide amniotique ou encore du placenta, des sites auparavant pensés stériles, existerait. Durant les phases de son développement, le foetus pourrait ainsi rencontrer des bactériesin utero. Elles contribueraient à l’établissement de son microbiote avant même l’accouchement et donc avant la rencontre avec les microorganismes des microbiotes vaginal, fécal et cutané, ceux-ci variant selon les modes d’accouchement (voie basse ou césarienne). Les premières études sur l’existence d’un microbiotein utero, qui se caractérise par une faible biomasse, sont cependant controversées.

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Vincent, Bryan. "Contribution de la symbiose fixatrice d’azote dans l’adaptation d’une légumineuse à des sols contrastés : le modèle Acacia spirorbis et les contraintes édaphiques extrêmes rencontrées en Nouvelle-Calédonie". BOIS & FORETS DES TROPIQUES 341 (20 de julio de 2019): 87. http://dx.doi.org/10.19182/bft2019.341.a31757.

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Acacia spirorbis est une légumineuse endémique de Nouvelle-Calédonie se développant sur des sols calcaires, métallifères et volcano-sédimentaires, établissant des symbioses avec des bactéries fixatrices d’azote. Pour comprendre la contribution de la symbiose dans l’adaptation de la plante à des milieux contrastés et parfois extrêmes, nous avons évalué la fixation d’azote en conditions naturelles, caractérisé les rhizobia associés à cette plante et analysé la réponse adaptative de la plante aux éléments traces métalliques dans ses tissus racinaires, notamment au niveau des nodules.Nous avons mis en évidence que la symbiose rhizobienne fournissait plus de 80 % de l’azote total chez des populations naturelles d’A. spirorbis se développant sur des sites d’étude présentant des sols calcaires, métallifères et volcano-sédimentaires. Cette valeur est remarquable puisque, pour A. mangium, A.melanoxylon et A.mucronata, les valeurs moyennes sont respectivement de 50 %, 43 % et 58 %. Les rhizobia symbiotiques associés à A. spirorbis appartiennent aux α- et β-protéobactéries, genres Bradyrhizobium et Paraburkholderia, révélant ainsi une très large gamme de symbiontes et une faible sélectivité de partenaire. De manière remarquable, la taxonomie et le phénotype de ces souches sont structurés et adaptés aux conditions édaphiques. Enfin, les signatures chimiques des tissus internes des nodules reflètent les propriétés chimiques des sols dans lesquels ils se sont développés, indiquant une potentielle gestion des éléments traces métalliques dans ces tissus. Tous ces éléments suggèrent que la symbiose fixatrice d’azote contribue de manière significative dans l’adaptation d’Acacia spirorbis à des sols contrastés et pouvant présenter une toxicité polymétallique extrême.

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Lelouvier, B. "CA-181: Identification d'un profil bactérien associé à la fibrose du foie dans le sang de patients obèses". Diabetes & Metabolism 42 (marzo de 2016): A85. http://dx.doi.org/10.1016/s1262-3636(16)30313-5.

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Bodet, C., F. Chandad y D. Grenier. "Potentiel pathogénique de Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola et Tannerella forsythia, le complexe bactérien rouge associé à la parodontite". Pathologie Biologie 55, n.º 3-4 (abril de 2007): 154–62. http://dx.doi.org/10.1016/j.patbio.2006.07.045.

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Luna, S., M. Taylor, E. Galanis, R. Asplin, J. Huffman, D. Wagner, L. Hoang et al. "Éclosion d'infections à la bactérie Salmonella Chailey associée à des morceaux de noix de coco précoupés — États-Unis et Canada, 2017". Relevé des maladies transmissibles au Canada 44, n.º 10 (4 de octubre de 2018): 299–302. http://dx.doi.org/10.14745/ccdr.v44i10a05f.

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Jamiu, M. O., A. O. Okesola, V. O. Ogunleye y P. E. Fasulu. "Prevalence of and factors associated with significant bacteriuria among pregnant women attending the antenatal clinic of Adeoyo Maternity Hospital, Yemetu, Ibadan, Nigeria". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 22, n.º 4 (27 de septiembre de 2021): 489–97. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v22i4.9.

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Resumen

Background: Significant bacteriuria is commonly reported in pregnancy which greatly predisposes pregnant women to urinary tract infection (UTI), one of the commonest health challenges in pregnancy worldwide especially in developing countries such as Nigeria. The objectives of this study are to determine the prevalence of and factors associated with significant bacteriuria among pregnant women attending the antenatal clinic (ANC) of Adeoyo Maternity Hospital, Yemetu, Ibadan, Nigeria, as well as determine the bacterial aetiology and antimicrobial susceptibility patterns of the isolates.Methodology: This is a laboratory-based cross-sectional study of 206 pregnant women between the ages of 15 and 47 years attending the ANC of the hospital, selected by simple random sampling method. Demographic and clinical data were obtained from the subjects using a structured questionnaire. Clean-catch specimen of mid-stream voided urine was collected from each subject participant. Urine samples were processed for culture and isolation of significant bacterial pathogens using standard bacteriological methods, and isolates identified to species level by the combination of colony morphology, Gram reaction, conventional biochemical tests and Analytical Profile Index (API) 20E test kits. Antibiotic susceptibility testing of the isolates to selected antibiotics was performed using the disk diffusion method.Results: The prevalence of significant bacteriuria in the study population was 8.7% (18/206), with 27.8% (5/18) symptomatic and 72.2% (13/18) asymptomatic. All isolated bacteria were Gram-negative with the most frequent being Escherichia coli 9 (50.0%), followed by Klebsiella pneumoniae 6 (33.3%), Pseudomonas aeruginosa 1 (5.6%), Acinetobacter haemolyticus 1 (5.6%) and Enterobacter aerogenes 1 (5.6%). The isolates were most sensitive to gentamicin (100%) and nitrofurantoin (94.4%), while they demonstrated highest resistance to amoxicillin-clavulanic acid (33.3%). Significant bacteriuria was associated with pyuria (p=0.01) and past history of UTI (p=0.004).Conclusions: The high prevalence of asymptomatic significant bacteriuria in this study necessitates the need for screening and treatment of pregnant women for this entity to prevent the subsequent development of UTI that may have grave consequences on pregnancy outcome. French title: Prévalence et facteurs associés à une bactériurie significative chez les femmes enceintes fréquentant la clinique prénatale de la maternité Adeoyo, Yemetu, Ibadan, Nigéria Contexte: Une bactériurie importante est couramment signalée pendant la grossesse, ce qui prédispose grandement les femmes enceintes aux infections des voies urinaires (IVU), l'un des problèmes de santé les plus courants pendant la grossesse dans le monde, en particulier dans les pays en développement comme le Nigéria. Les objectifs de cette étude sont de déterminer la prévalence et les facteurs associés à une bactériurie significative chez les femmes enceintes fréquentant la clinique prénatale (CPN) de l'hôpital de maternité Adeoyo, Yemetu, Ibadan, Nigéria, ainsi que de déterminer l'étiologie bactérienne et les modèles de sensibilité aux antimicrobiens de les isolats. Méthodologie: Il s'agit d'une étude transversale en laboratoire portant sur 206 femmes enceintes âgées de 15 à 47 ans fréquentant les CPN de l'hôpital, sélectionnées par une méthode d'échantillonnage aléatoire simple. Les données démographiques et cliniques ont été obtenues auprès des sujets à l'aide d'un questionnaire structuré. Un échantillon propre d'urine évacuée à mi-chemin a été recueilli auprès de chaque participant sujet. Les échantillons d'urine ont été traités pour la culture et l'isolement d'agents pathogènes bactériens importants à l'aide de méthodes bactériologiques standard, et les isolats ont été identifiés au niveau de l'espèce par la combinaison de la morphologie de la colonie, de la réaction de Gram, des tests biochimiques conventionnels et des kits de test de l'indice de profil analytique (API) 20E. Les tests de sensibilité aux antibiotiques des isolats aux antibiotiques sélectionnés ont été effectués à l'aide de la méthode de diffusion sur disque. Résultats: La prévalence de la bactériurie significative dans la population étudiée était de 8,7% (18/206), avec 27,8% (5/18) symptomatique et 72,2% (13/18) asymptomatique. Toutes les bactéries isolées étaient Gram-négatives, la plus fréquente étant Escherichia coli 9 (50,0%), suivie de Klebsiella pneumoniae 6 (33,3%), Pseudomonas aeruginosa 1 (5,6%), Acinetobacter haemolyticus 1 (5,6%) et Enterobacter aerogenes 1 (5,6%). Les isolats étaient les plus sensibles à la gentamicine (100%) et à la nitrofurantoïne (94,4%), alors qu'ils présentaient la résistance la plus élevée à l'amoxicilline-acide clavulanique (33,3%). Une bactériurie significative était associée à une pyurie (p=0,01) et à des antécédents d'infection urinaire (p=0,004). Conclusions: La prévalence élevée de bactériurie significative asymptomatique dans cette étude nécessite le dépistage et le traitement des femmes enceintes pour cette entité afin de prévenir le développement ultérieur d'infections urinaires pouvant avoir de graves conséquences sur l'issue de la grossesse.

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Poline, J., C. Ducrocq, G. Dingulu, R. Wheeler, B. Postal, D. Berrebi, M. Roy et al. "L’augmentation de la perméabilité intestinale est associée à une augmentation de la translocation de composants bactériens et à la sévérité de l’arthrite". Revue du Rhumatisme 87 (diciembre de 2020): A83—A84. http://dx.doi.org/10.1016/j.rhum.2020.10.141.

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Boyd, Eva, Aljosa Trmcic, Marsha Taylor, Sion Shyng, Paul Hasselback, Stephanie Man, Christine Tchao et al. "Éclosion d’Escherichia coli O121 associée à un fromage au lait cru de type Gouda en Colombie- Britannique, au Canada, 2018". Relevé des maladies transmissibles au Canada 47, n.º 1 (29 de enero de 2021): 13–19. http://dx.doi.org/10.14745/ccdr.v47i01a03f.

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Contexte : En 2018, une éclosion d’Escherichia coli O121 produisant la toxine de Shiga avec sept cas a été associée à la production de fromage au lait cru de type Gouda en Colombie-Britannique, au Canada. Objectifs : Décrire l’enquête sur l’éclosion d’E. coli O121 et recommander des mesures de contrôle plus strictes pour les fromages au lait cru de type Gouda. Méthodes : Les cas d’E. coli O121 ont été identifiés grâce aux résultats d’analyses en laboratoire et aux données de surveillance épidémiologique. Ils ont ensuite été interrogés en fonction de l’exposition d’intérêt, puis analysés en fonction des valeurs du Rapport Foodbook pour la Colombie-Britannique. Une investigation a été effectuée dans l’usine laitière et des prélèvements ont été effectués dans les produits de fromage afin de déterminer la source de contamination. Le typage de séquence multilocus pour le génome entier a été effectué sur tous les isolats cliniques et alimentaires positifs pour E. coli O121 au laboratoire provincial. Résultats Quatre des sept cas avaient consommé le même fromage au lait cru de type Gouda entre août et octobre 2018. Ce fromage avait été affiné pendant une période supérieure au minimum requis de 60 jours, et aucun défaut n’a été constaté dans sa production. Un échantillon du fromage visé a cependant obtenu un résultat positif à l’analyse de dépistage de la bactérie E. coli O121. Sept isolats cliniques et un isolat de fromage ont été jugés identiques par typage de séquence multilocus pour le génome entier avec une différence de 0 à 6,5 allèles. Conclusion Le Gouda au lait cru et les fromages de type Gouda au lait cru avaient déjà été impliqués dans trois éclosions antérieures d’E. coli producteur de toxines Shiga en Amérique du Nord. Il a donc été recommandé d’étiqueter les produits afin de sensibiliser les consommateurs au risque et de thermiser le lait afin de réduire le risque de maladie associé au Gouda au lait cru et au fromage de type Gouda au lait cru.

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Iordache, L., A. Depontfarcy, A. Pitsch, S. Galmiche, G. Tebano, G. Lezmi, M. Monchi y S. Diamantis. "Facteurs associés au portage et à l’acquisition de bactéries multirésistantes par des patients déclarés ou pas allergiques à la pénicilline admis en réanimation pour une infection". Médecine et Maladies Infectieuses 48, n.º 4 (junio de 2018): S45—S46. http://dx.doi.org/10.1016/j.medmal.2018.04.118.

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Rakotovao-Ravahatra, Z. D., F. M. Randriatsarafara, A. L. Rakotovao y A. Rasamindrakotroka. "Prevalence and factors associated with extended-spectrum βlactamase producing Enterobacteriaceae bacteraemia in University Hospital of Befelatanana, Madagascar". African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 22, n.º 1 (26 de enero de 2021): 52–59. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v22i1.7.

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Resumen

Background: The extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producing Enterobacteriaceae are a major cause of nosocomial bacteraemia. The objectives of this study are to describe the antibiotic resistance pattern of ESBL producing Enterobacteriaceae responsible for bacteraemia and identify factors associated with these infections in a University Hospital in Madagascar.Methodology: This is a descriptive cross-sectional study of 300 randomly selected patients with clinical features of bacteraemia whose blood cultures were processed for isolation and identification of bacterial pathogens over a period of six months (October 2019 to March 2020) at the laboratory of the University Hospital of Befelatanana. Blood culture samples were processed by conventional microbiological method for isolation of Enterobacteriaceae, which were identified to species level using Analytical Profile Index (API) 20E® test system. Antibiotic susceptibility of each isolate was performed by the disk diffusion technique and ESBL production was detected by the ‘synergy’ method.Results: Of the 300 patients, 54 were positive for bacteria, giving a prevalence rate of 18% for microbiologically documented bacteraemia. Of the 54 bacterial pathogens, Enterobacteriaceae isolates constituted 37 (68.5%), with 23 (42.6%) being ESBL producing and 14 (25.9%) non-ESBL producing isolates, 14 (25.9%) were staphylococci and 3 (5.6%) were streptococci isolates. All 23 (100%) ESBL producing Enterobacteriaceae isolates were resistant to amoxicillin, amoxicillin-clavulanic acid and the third generation cephalosporins (3GC), 19 (82.6%) to gentamycin and 18 (78.3%) to cotrimoxazole. On the other hand, the non-ESBL producing isolates were more sensitive because only 10 (71%) were resistant to amoxicillin, 7 (50%)to cotrimoxazole, 2 (14%) to amoxicillin-clavulanic acid, 1 (7.1%) to gentamycin, and none (0%) was resistant to 3GC. All 54 Enterobacteriaceae isolates were sensitive to amikacin and imipenem. Age less than 20 years (93.8%) (p=0.001) and hospitalization in intensive care units (90.9%) (p=0.04) were significant risk factors associated with infection by ESBL producing Enterobacteriaceae.Conclusion: ESBL producing Enterobacteriaceae responsible for bacteraemia in University Hospital of Befelatanana, Madagascar, are resistant to many classes of antibiotics. Carbapenems and amikacin are the antibiotics of choice. Keywords: ESBL, Enterobacteriaceae, bacteraemia, antibiotic resistance French Title: Prévalence et facteurs associés à la bactériémie à entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu dans l'hôpital universitaire de Befelatanana, Madagascar Contexte: Les entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu (BLSE) sont une cause majeurede bactériémie nosocomiale. Les objectifs de cette étude sont de décrire le profil de résistance aux antibiotiques des entérobactéries productrices de BLSE responsables de bactériémie et d'identifier les facteurs associés à ces infections dans un hôpital universitaire de Madagascar.Méthodologie: Il s'agit d'une étude transversale descriptive de 300 patients sélectionnés au hasard présentantdes caractéristiques cliniques de bactériémie dont les hémocultures ont été traitées pour l'isolement etl'identification des bactéries pathogènes sur une période de six mois (octobre 2019 à mars 2020) au laboratoiredu Hôpital universitaire de Befelatanana. Les échantillons d'hémoculture ont été traités par une méthodemicrobiologique conventionnelle pour l'isolement des entérobactéries, qui ont été identifiées au niveau del'espèce à l'aide du système de test Analytical Profile Index (API) 20E®. La sensibilité aux antibiotiques dechaque isolat a été réalisée par la technique de diffusion sur disque et la production de BLSE a été détectée parla méthode «synergie».Résultats: Sur les 300 patients, 54 étaient positifs pour les bactéries, ce qui donne un taux de prévalence de18% pour une bactériémie microbiologiquement documentée. Parmi les 54 bactéries pathogènes, les isolatsd'entérobactéries constituaient 37 (68,5%), 23 (42,6%) produisant des BLSE et 14 (25,9%) isolats neproduisant pas de BLSE, 14 (25,9%) étaient des staphylocoques et 3 (5,6%) l'étaient isolats de streptocoques.Les 23 isolats (100%) de BLSE produisant des Enterobacteriaceae étaient tous résistants à l'amoxicilline, àl'amoxicilline-acide clavulanique et aux céphalosporines de troisième génération (3GC), 19 (82,6%) à lagentamycine et 18 (78,3%) au cotrimoxazole. En revanche, les isolats non producteurs de BLSE étaient plussensibles car seuls 10 (71%) étaient résistants à l'amoxicilline, 7 (50%) au cotrimoxazole, 2 (14%) àl'amoxicilline-acide clavulanique, 1 (7,1%) à la gentamycine, et aucun (0%) n'était résistant à la 3GC. Les 54isolats d'Enterobacteriaceae étaient tous sensibles à l'amikacine et à l'imipénème. L'âge de moins de 20 ans(93,8%) (p=0,001) et l'hospitalisation en unité de soins intensifs (90,9%) (p=0,04) étaient des facteurs derisque importants associés à l'infection par les entérobactéries productrices de BLSE.Conclusion: Les entérobactéries productrices de BLSE responsables de bactériémie à l'hôpital universitaire deBefelatanana, Madagascar, sont résistantes à de nombreuses classes d'antibiotiques. Les carbapénèmes etl'amikacine sont les antibiotiques de choix. Mots clés: BLSE, entérobactéries, bactériémie, résistance aux antibiotiques

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