Literatura académica sobre el tema "Activité anti bactérienne"

L’infection urinaire (IU) est un problème majeur de Santé publique. La cystite aiguë touchant principalement les femmes est la plus fréquente des IU. La bactérie la plus fréquemment isolée au cours de ces IU est Escherichia coli. Une des particularités de la cystite est sa propension à récidiver. Le traitement préconisé pour ces infections est la prise d’antibiotiques, qui peut être fréquente en cas de cystites récidivantes. C’est dans ce contexte que de nouvelles stratégies doivent être développées afin de prévenir et traiter les IU récidivantes. Parmi ces différentes stratégies, l’utilisation de produits naturels tels que la canneberge (Vaccinium macrocarpon) apparaît comme prometteuse. En effet, des études précédentes ont montré que la canneberge a un effet négatif sur l’adhésion des bactéries aux cellules superficielles de l’épithélium vésical facilitant l’élimination des bactéries par le flux urinaire. Cette activité est portée par la proanthocyanidine de type A (PAC-A). D’autre part, une étude menée par notre équipe a montré que l’effet de la canneberge sur l’adhésion et la virulence de souches d’E. coli uropathogènes pouvait être potentialisé par l’ajout d’un autre composé naturel : la propolis. Depuis l’Antiquité ses propriétés anti-bactériennes sont reconnues et des études plus récentes ont démontré son impact sur des bactéries à Gram positif mais également sur deux bactéries à Gram négatif : E. coli et Pseudomonas aeruginosa. Ce travail de thèse a permis : i) de décrire l’impact de la canneberge, de la propolis et de leur association sur le transcriptome d’une souche clinique d’E. coli uropathogène (G50). Cette analyse transcriptomique a montré que la canneberge entrainait une sous-expression de gènes liés à l’adhésion, mais également de gènes liés à la mobilité et à la formation de biofilm. En revanche, la canneberge augmentait l’expression des gènes liés au métabolisme du fer ainsi qu’à la réponse au stress. Ces effets étaient potentialisés par l’ajout de la propolis. En parallèle, des tests phénotypiques menés sur une collection de souches d’E. coli uropathogènes sur la mobilité et la formation de biofilm ont confirmé les résultats précédents ; ii) de développer un test, basé sur les précédents travaux de transcriptomique, permettant une évaluation standardisée de l’effet de la PAC-A sur E. coli, indépendamment de sa concentration car il n’existe pas de techniques standardisées pour doser cette molécule. C’est ainsi que 4 gènes (tsr, ftnA, fecB, feoB) ont été sélectionnés, le suivi de leur expression permettant une mesure de l’activité anti-bactérienne de la canneberge; iii) de mesurer l’effet potentialisateur de la propolis sur l’activité des antibiotiques utilisés dans le traitement des IU. C’est ainsi qu’il a été montré que l’ajout de la propolis permettait d’augmenter l’activité bactéricide des antibiotiques testés et de diminuer les concentrations minimales inhibitrices de ces antibiotiques<br>Urinary Tract Infection (UTI) is a major problem of public health. Acute cystitis which touches mostly women is the most common form of UTI. The bacteria which is mostly isolated in an UTI is Escherichia coli. A particularity of cystitis is to come back. In this context news strategies have to be developed to prevent and cure recurrent UTI. One of these strategies is the utilization of natural products like the cranberry (Vaccinium macrocarpon) which is promising. Indeed, previous studies showed the negative impact of cranberry on the adhesion of bacteria on the superficial cells of bladder which help the elimination of bacteria by the urinary flux. This activity is carried by the type A proanthocyanidin (PAC-A). Moreover, a study lead by our team has demonstrated an improvement of the activity of cranberry on the adhesion and the virulence of uropathogenic E. coli (UPEC) by another natural product: the propolis. Since Antiquity its antibacterial activities have been recognize and more recent studies have demonstrated its impact of Gram positive bacteria and also on two Gram negative bacteria: E. coli and Pseudomonas aeruginosa. This thesis has allowed for: i) the description of the impact of cranberry, propolis and its association on the transcriptome of a clinical strain of UPEC (G50). This transcriptomic analyze have shown that the cranberry down regulated genes linked to the adhesion and also genes linked to the motility and biofilm formation. However the cranberry up regulated genes linked to the iron metabolism and the stress response. These effects are improve by the addition of propolis. Concurrently phenotypics tests have been conducted on a collection of UPEC on the motility and the biofilm formation and they confirmed the previous results; ii) the development of a test, based on our transcriptomic results, enable to performed a standardized evaluation of the impact of PAC-A on E. coli, independently of its concentration. Indeed, this molecule cannot be measure in a standard way. Four genes have been selected (tsr, ftnA, fecB, feoB), the monitoring of their expression allow us to measure the anti-bacterial efficiency of the cranberry; iii) the measurement of the potential effect of the propolis of the antibiotic’s activities used to treat UTIs. Thus it have been observed that the addition of propolis improve the bactericide activity of the antibiotics tested and reduces the minimal inhibitory concentration of these antibiotics

Les biofilms microbiens peuvent avoir des conséquences néfastes dans des domaines aussi divers que les activités marines ou le domaine biomédical. Ce travail a été entrepris afin d'approfondir les résultats obtenus avec des analogues d'hémibastadines à noyau 1,2,3-triazole. Il a porté sur des composés de cette famille résultant de variations de structures approfondies. Les essais menés ont permis de confirmer que ces composés sont bien actifs comme inhibiteurs de formation de biofilms sans activité antibactérienne, même lorsqu'il s'agit de biofilms multi-souches. Cependant, les tests ont montré leur toxicité vis-à-vis du phyto et du zooplancton. Les études de relation structures­ activité ont permis de déterminer les éléments favorables l'activité anti-biofilm : nécessité de la présence d'au moins un hydroxyle phénolique sur l'un des noyaux aromatiques, intérêt des atomes de brome, perte d'activité lorsqu'il y a présence de chaînes alkylamines. En plus des bactéries marines, des essais ont également été menés sur des biofilms formés par une souche clinique de Candida albicans. Ils ont montré que ces composés sont également actifs comme inhibiteurs de formation de biofilms de cette levure, toujours sans activité antifongique<br>Microbial biofilms can produce adverse consequences in various domains, for example: marine activities and biomedical. This work has been led to deepen results obtained with previous hemibastadins with 1,2,3-triazole moiety. it was led with new compounds of this family. Biological tests showed that these compounds were really able to inhibit bacterial biofilms, even with multispecies biofilm. But these compounds were toxic for phyto and zooplankton. Structure-activity relationships studies showed important elements to have anti-biofilm activity: minimum one phenolic hydroxyle on an aromatic ring, importance of bromine, activity loss with alkylamines. Biologie tests have been also led on a Candida albicans clinical strains. These tests showed that these compounds are also actives on biofilm of this fungi, without antifungal activity

L'alginate, polymere d'acides mannronique et guluronique, est un facteur de virulence de pseudomonas aeruginosa. Il protege la bacterie de la phagocytose et de l'action des antibiotiques. Le but de mon travail etait d'obtenir des anticorps anti-alginate et de produire en grande quantite des alginate lyases actives sur l'alginate de p. Aeruginosa. Des anticorps monoclonaux igm anti-alginate ont ete obtenus par immunisation de souris avec un conjugue bsa/alginate de p. Aeruginosa. Ils ont ete purifies puis reduits en monomeres pour un couplage avec la peroxydase. Le conjugue fonctionnel obtenu a permis de valider la methode pour la synthese du conjugue alginate lyase/anticorps anti-alginate. L'alginate lyase alxm de la bacterie marine atcc 433367 a ete surproduite chez e. Coli et purifiee en une seule etape: sa masse est de 30 kda, le rendement de purification est de 90% (32 mg/l de culture). Les conditions optimales d'activite de alxm ont ete determinees, puis utilisees pour l'etude de sa specificite. Alxm est une mannuronate lyase, elle produit, par un mecanisme de -elimination avec retention de configuration, un oligomere de dp3 quel que soit le substrat. Ses parametres cinetiques ont ete determines pour des substrats oligomeriques de structure definie. Le gene algi codant pour l'alginate lyase produite par pseudomonas alginovora a ete amplifie par pcr directe et inverse, sequence puis clone dans le vecteur de surexpression pet-22b. L'enzyme surproduite a 18c dans e. Coli, algisur, a ete purifiee en une seule etape par chromatographie d'affinite avec un rendement de 67% (5 mg/l de culture). Conformement a la strategie de surexpression, sa masse de 24635 da correspond a celle de algi additionnee de la sequence poly(his). Algi et algisur ont le meme profil d'activite avec une specificite de type mannuronate lyase. Une etude par hca sur alxm, algi et quatre autres alginate lyases de structures primaires connues a permis de classer ces enzymes deux par deux en trois familles

L'étude des plantes utilisées en médecine traditionnelle au Togo est compliquée à cause de l’absence de matériel de pointe. L'identification assistée par ordinateur de produits basés sur des utilisations en médecine traditionnelle (CAPITURE) a été évaluée dans le cadre d'une enquête ethnobotanique sur le traitement traditionnel des maladies fongiques dans la Préfecture de Tchamba (Togo). Cette méthode a prédit et identifié les plantes les plus biologiquement actives parmi les 43 espèces recensées au cours de l’enquête : Pterocarpus erinaceus prédit être plus actif contre les champignons, et Daniellia oliveri contre les bactéries. Les plantes ont ensuite été testées contre les champignons, les bactéries et les cellules cancéreuses. Comme prédit par CAPITURE, P. erinaceus était plus actif contre les champignons et D. oliveri contre les bactéries. Fait intéressant, les deux plantes ont présenté une activité sur les cellules cancéreuses sans être toxique pour les cellules humaines normales. Dans une troisième étape, en utilisant la chimie analytique, les composés responsables des activités biologiques ont été identifiés. La plupart de ces composés n'ont jamais été signalés dans les espèces végétales ou dans la nature, avec une activité biologique dans la gamme micro-molaire. Enfin, en réduisant la poudre des organes végétaux à la taille de nano-particules, une meilleure activité biologique a été observée par rapport à celle de l'extrait organique. En conclusion, cette recherche a mené à la découverte de nouvelles molécules avec une activité biologique intéressante, molécules qui nécessiteront une étude approfondie et détaillée<br>The investigation of plants used for traditional medicine in Togo is complicated as modern techniques are not available. Computer-aided product identification from traditional usage records (CAPITURE) was evaluated in the context of an ethnobotanical survey on the traditional treatment of fungal diseases in Tchamba District (Togo). This method predicted and identified the most biologically active plants out of the 43 species survey-recorded: Pterocarpus erinaceus predicted to be more active against fungi and Daniellia oliveri against bacteria. The plants were then tested against fungi, bacteria and cancer cells. As predicted with CAPITURE, P. erinaceus was more active against fungi and D. oliveri against bacteria. Interestingly, both plants presented activity on cancer cells without being toxic to normal human cells. In a third step, using analytical chemistry, the compounds responsible for the biological activities were identified. Most of those compounds have never been reported in the plant species or in nature at all, with biological activity in the micromolar range. Finally, pharmaceutical technology was used: by nanosizing the powder of the plant organs, a better biological activity was observed in comparison to that of the organic extract. In conclusion, this research led to the discovery of new molecules with an interesting biological activity that will need further and more detailed investigation

Notre étude s’inscrit dans un processus de recherche de nouveaux composés d’origine naturelle à activités biologiques avérées à partir de macroalgues brunes, avec d’éventuelles perspectives d’exploitation industrielle. Ainsi, dans un premier volet nous avons testé des méthodologies innovantes en matière d‘extraction en utilisant trois espèces d’algues brunes comme modèles. Nous avons optimisé le protocole d’extraction solide/liquide en estimant divers paramètres cruciaux qui influent sur le rendement d’extraction et sur les activités antiradicalaires des composés extraits. Soucieux de trouver une méthodologie innovante d’extraction plus « verte » répondant aux normes européennes, nous avons donc testé des méthodes d’extraction utilisant des solvants dans leur état supercritique ou sous forme pressurisés. La comparaison avec le procédé d’extraction solide/liquide nous a permis de sélectionner l’extraction par fluides pressurisés (PLE) employée avec un mélange Ethanol-Eau pour l’extraction de composés antiradicalaires avec une haute efficacité. Dans une deuxième partie nous nous sommes intéressés aux variations quantitatives et qualitatives des principales macromolécules présentes chez l’espèce invasive Sargassum muticum en Europe. L’emploi de deux techniques analytiques, RMN HR-MAS et spectroscopie IR, nous a permis d’avoir une vue d’ensemble des compartiments susceptibles de subir des variations selon la position géographique d’une même espèce à large répartition. Cette étude nous a montré comment une espèce est capable de changer sa composition biochimique en fonction de son environnement et ainsi s’acclimater à des milieux assez différents. Ce travail a mis en évidence les effets de différents paramètres environnementaux sur les compartiments lipidique (analysés en GC), protéique ainsi que sur les quantités de carbohydrates et de pigments (analysés en HPLC). L’influence de ces paramètres sur la taille des individus de Sargassum muticum a également été discutée. La dernière partie de cette étude nous a permis de décrire les variations quantitatives et qualitatives des phlorotannins chez l’espèce invasive Sargassum muticum sur une grande échelle spatiale, le long d’un gradient latitudinal (Norvège-Portugal). Dans un premier temps cette variabilité a été appréhendée grâce à un suivi temporel et spatial des teneurs en phlorotannins. L’étude des variabilités intra-spécifiques et intra-individuelles nous a permis de mettre en évidence un effet du stade de développement et de la partie de l’algue considérée : les teneurs et activités des phlorotannins sont plus importantes dans les crampons et chez les individus matures. Après la recherche d’un protocole simple pour la semi-purification des composés phénoliques présent chez Sargassum muticum, nous avons pu mettre en évidence la présence de composés de type phlorethol au moyen de techniques de RMN à deux dimensions (2D). Ces fractions semi-purifiées possèdent des activités antiradicalaire et antibactérienne notoires. Enfin, l’utilisation de plusieurs techniques de séparation membranaires nous a permis d’estimer le poids moléculaire des différents composés présents dans le pool de composés phénoliques extrait. Enfin, suite aux constats effectués sur les populations, l’effet de l’intensité lumineuse et de la température de l’eau a pu être apprécié isolément : les radiations UVA et UVB boostent la production de CP alors qu’une augmentation de la température fait chuter la production de CP chez S. muticum<br>Our study is part of the research process for new compounds of natural origin with biological activities and possible industrial perspectives. In a first part, we tested innovative extraction methodologies using three brown algae species as model. We optimized the solid/liquid extraction protocol by estimating diverse crucial parameters which influence the extraction yield and radical scavenging activities of extracts. In order to find an innovative and more "green" extraction methodology answering the European standards, we thus tested more recent extraction methods using solvents in their supercritical state or under pressure. The comparison with the solid/liquid process allowed us to select pressurized liquid extraction (PLE) using an ethanol-water mixture for the extraction of active compounds with a high efficiency, but also to select Sargassum muticum as an interesting model for further investigations. In a second part, we were interested in the quantitative and qualitative variations of the main macromolecules present in the invasive species S. muticum in Europe. The employment of two analytical techniques (NMR HR-MAS and IR spectroscopy), allowed us to have an overview of biochemical parts of the algae, which vary according to the geographical position of this wide spread species. This study showed how a species is able to modify its biochemical composition, and then to acclimate, according to the environment. We then focused on molecules, which showed important variations along the latitudinal range of S. muticum. This work highlighted the effects of environmental parameters on lipid (GC analysis) and protein compartments as well as on carbohydrates and pigments quantities (HPLC analysis). The influence of these parameters on the size of individuals was also discussed. The last part of this study allowed us to describe the quantitative and qualitative variations of phlorotannins in S. muticum on a large spatial scale, along a latitudinal gradient (Norway-Portugal). At first this variability was measured thanks to temporal and spatial follow-up of the phlorotannins contents. The study of intra-specific and intra-individual variabilities allowed us to highlight an effect of the development stage and of the seaweed part: phlorotannins contents and activities are more important in holdfast and in mature individuals. After the research of a simple protocol for the phenolic compounds semi-purification present in Sargassum muticum, we were able to highlight the presence of compounds of only phlorethol type in this species by means of 2D RMN techniques. These semi-purified fractions possess notorious radical scavenging and antibacterial activities. Finally, the use of several membrane separation techniques allowed us to consider the molecular weight of the various compounds present in the extracted pool of phenolic compounds. Finally, under controlled conditions, the effects of the light quality and the seawater temperature were tested: UV-A and UV-B radiations boost the production of CP while an increase of the temperature makes the phlorotannins production decreasing in S. muticum

L'objectif principal de ce travail de Thèse consiste à étudier le pouvoir antioxydant et anti-inflammatoire de métabolites secondaires rejetés directement dans l'eau par certaines bactéries isolées de torrents ou de sources de moyenne montagne et pouvant être ingérés par les autochtones. Différents modèles sont développés, soit de type acellulaire, permettant de visualiser les effets directs des extraits bactériens testés sur les espèces réactives de l'oxygène, soit de type cellulaire permettant d'étudier l'impact de ces extraits sur les voies de transduction du signal et les systèmes de production des espèces réactives de l’oxygène de cellules macrophagiques placées en simple culture ou interagissant avec d'autres cellules de la muqueuse intestinale. Dans ce dernier cas, il s'agit de mettre au point un modèle de barrière intestinale original pouvant être dédié à l'étude de l'impact des extraits sur les processus inflammatoires intestinaux. Un travail d'identification bactérienne recherchant de nouvelles espèces est réalisé, faisant intervenir la spectrométrie de masse, la spectrométrie de masse en tandem, l'étude de l'acide ribonucléique 16 S et celle du génome. Les résultats obtenus ont donné lieu à publications<br>The main objective of this thesis work was to study the antioxidant and anti-inflammatory properties of secondary metabolites released directly into water by some bacteria isolated from torrents or spring water from mid-mountain that can be ingested by aboriginal people. Different models were used or developed for these purposes, either of pharmacological cell-free type, making it possible to visualize the scavenging effects of bacterial extracts tested on reactive oxygen species, or of cellular type in order to study the impact of these extracts on the signal transduction pathways and reactive oxygen species production systems of macrophagic cells placed in single culture or interacting with other cells from the intestinal mucosa. In the latter case, the aim was to develop an original intestinal barrier model that can be dedicated to studying the impact of extracts on intestinal inflammatory processes. A bacterial identification work looking for new species was carried out in this thesis project, which involved mass spectrometry, tandem mass spectrometry, the study of 16S ribonucleic acid and that of the genome. The results obtained have given rise to publications

Le dépérissement du pommier est une maladie tellurique causée par plusieurs espèces Pythiacée. Il est responsable de graves dommages et de pertes d'arbres dans de nombreux vergers en Tunisie. Comme la lutte chimique contre cette maladie pose des problèmes éco toxicologiques et les moyens prophylactiques ont des efficacités limitées, d’autres moyens de lutte sont activement recherchés. L’objectif de cette thèse était d’identifier un nouvel agent de lutte biologique contre les oomycètes responsables de cette maladie à partir d’une collection d’isolats fongiques et bactériens Tunisiens comme alternative au contrôle chimique. Les isolats fongiques étudiés appartenaient aux genres Trichoderma, Aspergillus et Penicillium spp., les isolats bactériens appartenaient au genre Bacillus spp. clade subtilis. Les isolats fongiques ont fortement inhibé la croissance in vitro des Pythiacées (&gt; 40%) par rapport aux isolats bactériens ; en particulier, les filtrats de culture des isolats A. westerdijkiae A7 et T. simmonsii A2. L'évaluation de l’activité préventive et curative contre les Pythiacées sur des porte-greffes du pommier de ces deux isolats fongiques et de la souche Bacillus B2 a montré que T. simmonsii A2 était le plus efficace lorsqu'il était appliqué à titre préventif. De même, la combinaison de la souche Bacillus B2 et de l’isolat A. westerdijkiae A7 a induit une bonne protection contre les Pythiacées en préventif. La combinaison des isolats T. simmonsii A2 et A. westerdijkiae A7 a entraîné une meilleure protection en traitement curatif, alors que la combinaison des trois isolats ensemble réduisait fortement l’activité protectrice. Notre étude révèle le potentiel des isolats Tunisiens, seuls ou en combinaison, en tant qu'agents de lutte biologique contre le dépérissement du pommier ainsi qu'un effet bénéfique supplémentaire sur la croissance végétale observé au niveau des racines et de la longueur des tiges. Ainsi, nous avons sélectionnés les meilleurs candidats agissant par antibiose pour l'identification des principaux agents actifs responsables de l'activité anti-oomycète. L'isolat A. westerdijkiae A7 a été retenu avec 100% d'inhibition de la croissance mycélienne des isolats de Pythiacées testés. Plusieurs étapes de purification successives du filtrat de culture ont permis d’identifier l'acide pénicillique (acide 3-méhoxy-5-méthyl-4-oxo-2,5-hexadiénoïque) en tant que principale molécule responsable de l’inhibition la croissance mycélienne des Pythiacées testées. Étant donné que l’acide pénicillique possède des propriétés toxiques pour la santé humaine et animale, l’isolat A. westerdijkiae A7 ne pourra pas être utilisé en tant que BCA puisqu’il produit cette mycotoxine malgré nos résultats prometteurs in planta. L’ensemble de ces travaux montre le potentiel anti-oomycète des micro-organismes in vitro qui peut différer de l’activité protectrice contre les Pythiacées in planta. Ils révèlent également la nécessité de caractériser l’ingrédient actif pour les études de toxicité nécessaire au développement d’un produit de bio-contrôle<br>Apple dieback is a telluric disease caused by several Pythiaceae species. It is responsible for serious damage and loss of trees in many orchards in Tunisia. As the chemical control of this disease poses eco-toxicological problems and the prophylactic means have limited effectiveness, other means of fight are actively sought. The objective of this thesis was to identify a new biological control agent against oomycetes responsible for this disease from a collection of Tunisian fungal and bacterial isolates as an alternative to chemical control. The fungal isolates studied belonged to the genera Trichoderma, Aspergillus and Penicillium spp., The bacterial isolates to the genus Bacillus spp. clade subtilis. Fungal isolates strongly inhibited the growth of Pythiaceae in vitro (&gt; 40%) compared to bacterial isolates; in particular, the culture filtrates of isolates A. westerdijkiae A7 and T. simmonsii A2. The evaluation of the preventive and curative activity against Pythiaceae on apple rootstocks of these two fungal isolates and of the Bacillus B2 strain showed that T. simmonsii A2 was the most effective when applied preventively. Likewise, the combination of the Bacillus B2 strain and the A. westerdijkiae A7 isolate induced good protection against Pythiaceae as a preventive measure. The combination of the T. simmonsii A2 and A. westerdijkiae A7 isolates resulted in better protection in curative therapy, while the combination of the three isolates together greatly reduced the protective activity. Our study reveals the potential of Tunisian isolates, alone or in combination, as biological control agents against apple dieback as well as an additional beneficial effect on plant growth observed at the level of the roots and the length of the stems. Thus, we have selected the best candidates acting by antibiosis for the identification of the main active agents responsible for anti-oomycete activity. The A. westerdijkiae A7 isolate was retained with 100% inhibition of mycelial growth of the Pythiaceae isolates tested. Several successive purification steps of the culture filtrate made it possible to identify penicillic acid (3-mehoxy-5-methyl-4-oxo-2,5-hexadienoic acid) as the main molecule responsible for inhibiting growth mycelia of the Pythiaceae tested. Since penicillic acid has toxic properties for human and animal health, isolate A. westerdijkiae A7 cannot be used as BCA since it produces this mycotoxin despite our promising results in planta. All of this work shows the anti-oomycete potential of microorganisms in vitro, which may differ from the protective activity against Pythiaceae in planta. They also reveal the need to characterize the active molecule for the toxicity studies necessary for the development of a biocontrol product