Academic literature on the topic 'Vignobles – Maladies'

Passant de 150 ha (pour 36 exploitations) en 2018 à 300 ha (pour 64 exploitations) à la fin de 2021, la surface viticole wallonne (Belgique – figure 1.a) n’a cessé de croître ces dernières années. Cependant, en 2021, les vignobles wallons ont été fortement touchés par le mildiou (Plasmopara viticola) dû à des conditions météorologiques exceptionnellement humides et fraîches. Cette étude montre que les pertes quantitatives ont été hétérogènes entre les vignobles. Cette variabilité est expliquée principalement par le type de cépage, le mode de production et la gestion liée aux maladies.

Sur le plan historique, la viticulture de la Valteline s’est fondée sur la qualité de ses vins, forts recherchés des pays voisins transalpins. La demande provenant des pays au nord des Alpes, principalement du canton des Grisons, de la Suisse, du Tyrol, de l’Autriche, de l’Allemagne du Sud, de la Bohême et même de la Pologne, a encouragé le colossal travail d’aménagement en terrasses artificielles des versants les mieux exposés, jusqu’à réaliser un paysage presque unique dans la région alpine pour ce qui concerne l’expansion et la continuité territoriale des terrasses viticoles. Durant l’occupation des Ligues Grisonnes (1512-1797), le commerce extérieur (puisque les échanges vers l’Italie étaient interdits) concernait plus de 60% de la production vinicole de la vallée. Les meilleurs vins, issus des vignes de Chiavennasca, un cépage autochtone de la Valteline, étaient réservés aux exportations, alors que, pour l’autoconsommation locale, on utilisait d’autres raisins autochtones moins prestigieux. Le XIXe siècle en Valteline coïncide avec la fin difficile de la domination des Ligues et de l’intégration de la Vallée dans le nouveau Royaume d’Italie après les vicissitudes de la période napoléonienne et de la Restauration. La nouvelle situation politique a rendu nécessaire la réorientation du marché vers le Sud, où les vins de Valteline se sont mesurés à la concurrence des vins du Piémont, de l’Emilie-Romagne et de la Toscane, régions présentes déjà depuis longtemps sur le marché vinicole de la Lombardie. Pendant la seconde moitié du XIXe siècle pour résister à la compétition d’autres régions vinicoles italiennes, les viticulteurs de la Valteline, qui souffraient aussi des ravages provoqués par les maladies de la vigne d’origine américaine, tentent d’améliorer qualitativement leurs produits. En 1872, à l’initiative d’un groupe de producteurs fut créée la « Società Enologica Valtellinese » (Société Œnologique de Valteline) dans l’objectif de rationaliser les modes de culture. Les nouvelles prescriptions conduisirent à la modernisation des techniques œnologiques, à l’arrêt des cultures mixtes et des cépages mineurs, à l’adoption des vignes en rangs (en harmonie avec les terrasses), à l’abandon des vignobles situés sur les versants plus rudes et au-dessus de 800 m d’altitude. Pendant la seconde moitié du XIXe siècle, les 6.500 hectares de vignobles en terrasses recensés lors de l’apogée de la viticulture dans la vallée, entament leur marche vers la baisse de leurs surfaces. Ces décroissance s’amorce sous les coups du phylloxera, et perdure avec l’abandon progressif des zones les moins adaptées à la culture. Les premières certifications de qualité obtenues par les vins de Valteline dans les années 1930 ne parviennent pas à ralentir ce processus d’abandon des vignobles. Au contraire, au cours du siècle, le phénomène se creuse de plus en plus : la réduction de la demande, la transformation de l’économie de la vallée, la fragmentation excessive de la propriété foncière, les coûts et les sacrifices de la viticulture en terrasse, détournent beaucoup de petits producteurs de la viticulture (et de l’entretien du paysage) ; tout cela s’opère malgré les nouvelles qualifications remportées par le vin de Valteline, la seule région viticole italienne qui peut se targuer de deux vins DOCG issues d’une unique zone de production. Aujourd’hui, la surface en vigne est limitée à 1000 ha ; les abandons eurent lieu principalement dans les zones les moins favorables, actuellement en cours de renaturalisation. Seuls les vignobles situés à l’intérieure de la zone l’AOP, pour la plupart dans les mains des grands producteurs, semblent résister à la concurrence des autres produits agricoles et à l’appétit de l’industrie du bâtiment qui a commencé à coloniser les terrasses les plus proches de la plaine.

Les virus de l'enroulement de la vigne (Grapevine leafroll-associated virus, GLRaV) sont répandus mondialement et transmis à la vigne uniquement par cochenilles (Coccoidea). En France, l'enroulement viral affecte particulièrement les vignobles des régions septentrionales.L'approche biologique de la vection a montré la capacité de Phenacoccus aceris à transmettre à la vigne les GLRaV-1, -3, -4, -5, -6, -9 et ceux du bois strié Grapevine virus A et B. Cette étude est la première démonstration de la transmission du GLRaV-6 et confirme l'absence de spécificité des cochenilles dans la transmission des Ampelovirus. Les larves néonates de P. aceris et de Neopulvinaria innumerabilis représentent un stade de développement efficace pour la transmission de ces virus. En conséquence, leurs capacités vectrices, associées à leur fort potentiel de dissémination anémophile, impliquent un risque important de dispersion naturelle de ces virus dans un vignoble infesté. Les relevés sur quatre parcelles distinctes montrent que Parthenolecanium corni, Pulvinaria vitis, Heliococcus bohemicus et P. aceris sont communes, chaque vignoble différant par la diversité spécifique, le taux de ceps infestés et l'abondance des cochenilles. L'étude épidémiologique prouve le rôle des cochenilles dans la dispersion de l'enroulement viral dans les vignobles septentrionaux. A Bonzon, la responsabilité de P. aceris dans la diffusion rapide du GLRaV-1 est mise en évidence. Cette découverte représente la première preuve en Europe d'une dispersion naturelle du GLRaV-1. A Marsannayla-Côte, l'incidence du GLRaV-1 reste faible, la colonie de P. aceris ne semblant avoir qu'un rôle très limité dans la diffusion de la maladie. L'épidémiologie moléculaire à Bonzon révèle une diversité génétique importante du GLRaV-1 à l'échelle parcellaire et fournit pour la première fois des données sur le polymorphisme génétique d'une population de GLRaV-1 ayant été dispersée par des cochenilles.

La viticulture est constamment sous la menace de maladies, notamment fongiques. Au cours des dernières décennies, les maladies du bois de la vigne (MDB), des pathologies très destructives, menaçant la pérennité du vignoble, sont en pleine expansion. L'une des MDB les plus répandues dans le monde est le dépérissement à Botryosphaeriacées. Les champignons de cette famille utilisent de nombreuses armes biochimiques, y compris des enzymes dégradant les parois cellulaires des plantes (PCWDEs) et des métabolites secondaires phytotoxiques, pour coloniser la vigne. Nous souhaitions produire, purifier et caractériser des PCWDEs et des phytotoxines des Botryosphaeriaceae afin de mieux connaître les mécanismes qui sous-tendent leur pathogénicité et leur virulence. Nous cherchions également à tirer profit des Botryosphaeriaceae pour obtenir de nouvelles enzymes lignocellulolytiques qui pourraient être utiles au bioraffinage végétal. En utilisant des comparaisons génomiques, nous avons mis en évidence la richesse des enzymes actives sur les glucides (CAZymes), potentiellement impliquées dans la dégradation des parois cellulaires des plantes, dans le génome de Neofusicoccum parvum. Lorsqu'il est cultivé dans des fermentations en milieu liquide, N. parvum peut produire de nombreuses CAZymes et métabolites secondaires, notamment dans des milieux de croissance contenant des biomasses lignocellulosiques. Par ailleurs, nous avons établi une méthode de purification de la phytotoxine (R)-melléine en utilisant une approche innovante via la chromatographie de partage centrifuge. Enfin, nous avons également débuté une approche visant la production hétérologue de trois nouvelles CAZymes : une acétylxylane estérase, une pectate lyase et une cellulase encore non caractérisée. Dans l'ensemble, nos résultats ont permis de mieux comprendre l'influence de la biomasse lignocellulosique sur l'expression des facteurs de pathogénicité et de virulence chez N. parvum. Cette étude pourrait également être utile pour découvrir des enzymes plus efficaces pour des applications industrielles<br>Viticulture is constantly threatened by plant diseases, especially those caused by fungi. In the last decades, Grapevine Trunk Diseases (GTDs) have arisen as highly destructive and rapidly expanding pathologies. One of the most worldwide prevalent GTDs is Botryosphaeria dieback, caused by Botryosphaeriaceae. These fungal species may rely on many biochemical weapons, including Plant Cell Wall-Degrading Enzymes (PCWDEs) and phytotoxic secondary metabolites, to successfully colonize the grapevine. Here, we aimed to produce, purify, and characterize PCWDEs and phytotoxins from Botryosphaeriaceae to increase knowledge of their mechanisms underlying pathogenicity and virulence. We were also interested in taking advantage of Botryosphaeriaceae pathogens to obtain novel lignocellulolytic enzymes that may benefit plant biorefining. Using genomic comparisons, we highlighted the remarkable richness of Carbohydrate-Active Enzymes (CAZymes), potentially involved in the plant cell wall degradation, in the genome of Neofusicoccum parvum. When cultured in submerged fermentations, N. parvum could produce numerous CAZymes and secondary metabolites, notably in growth media containing lignocellulosic biomasses. Furthermore, we established a purification method for the virulence-factor-candidate phytotoxin (R)-mellein using an innovative approach via Centrifugal Partition Chromatography. We also started an approach to heterologously produce three novel CAZymes: an acetylxylan esterase, a pectate lyase, and an uncharacterized cellulase. Overall, our results provided insights into the influence of lignocellulosic biomass in the expression of pathogenicity and virulence factors in N. parvum. This study may also be helpful for the discovery of more efficient enzymes for industrial applications

La pourriture grise causée par le champignon phytopathogène Botrytis cinerea, omniprésent et très polyphage, a clairement un impact dans de nombreuses régions en raison de la large gamme d'hôtes y compris la vigne (Vitis vinifera L.), causant de graves dommages dépassant 10 à 100 milliards de dollars dans le monde. Les fongicides chimiques, qui sont la mesure la plus importante pour assurer un rendement adéquat, restent la méthode la plus courante pour lutter contre la pourriture grise. Cependant, malgré la diversité des produits utilisés, des cas de résistance sont détectés. Aussi, la lutte chimique a révélé des effets néfastes sur l'environnement et la santé du consommateur ce qui a remis en cause son application. Pour y remedier, des méthodes de lutte alternatives en l’occurrence l'efficacité des agents de lutte biologique a été étudiée avec un grand succès. Ainsi, l’objectif de notre étude portera sur l'utilisation de bactéries bénéfiques pour lutter contre la pourriture grise de la vigne. La rhizosphère de la vigne est riche en microorganismes qui présentent de fortes aptitudes dans la lutte biologique contre les maladies des plantes. Dans la présente étude, l’isolement de microorganismes bénéfiques a été réalisé sur des plantes de vigne saines. Quarante deux bactéries ont été isolées de différents sols rizosphériques échantillonnés dans les principaux vignobles de la région de Meknès au Maroc (Latitude 33.75989, Longitude -5.43909). Le test d’antagonisme in vitro des différents isolats envers B. cinerea a révélé que parmi l’ensemble des isolats testés les souches S3, S4, S5 et S6 ont montré un résultat positif. Ces isolats inhibent la croissance du B. cinerea. Les quatres souches ont été identifiées par l’étude des caractères biochimiques et l’analyse phylogénétique des séquences du gène de l’ARNr 16S. Les résultats des analyses ont montré que les souches bactériennes retenues ont été apparentées aux espèces, du genre Bacillus, suivantes : S3 : B. velezensis ; S4 : B. velezensis ; et S5 : B. halotollerans. L’isolat S6 a été classé dans le genre Enterobacter et identifié comme étant E. cloacae. Le test d’antagonisme effectuén planta sur des vitroplants de vigne indique que les quatres rhizobactéries réduisent de façon plus ou moins significative, (59 %, 39 %, 55 %, et 17 %, respectivement), les symptômes de la maladie et réduisent les dommages de l’activité photosynthétique (PSII) dus à l’attaque de B. cinerea. Cette étude a permis de révéler que les souches du genre Bacillus et Enterobacter isolées de la rhizosphère de la vigne pourraient être utilisées comme agents de lutte biologique dans la protection de la vigne<br>The gray mold caused by Botrytis cinerea has a devastating impact on various economically important crops, including grapevine (Vitis vinifera L.), with annual economic losses exceeding10 to 100 billion dollars worldwide. Currently, pesticides remain the main method used to reduce the incidence of this phytopathogenic fungus. However, in addition to emergence of multidrug resistance, chemicals must be increasingly restricted in order to limit their impact on the environment and human health. Thus, in recent years, biological protection is gaining renewed interest. Therefore, the aim of our project is the development of new biotechnologies allowing the grapevine to better resist pathogenic pressures, through the use of beneficial microorganisms. The rhizosphere is a rich source of microorganisms with strong abilities in the biocontrol of plant diseases. In the present study, isolation of plant beneficial microorganisms was carried out on healthy plants. A total of 42 micro-organisms were isolated from different rhizospheric semi-arid soils collected in vineyards of Meknes in Morocco (Latitude 33.75989, Longitude -5.43909). The in vitro antagonism test of the various isolates towards B. cinerea evealed that among all the isolates tested the strains S3, S4, S5 and S6 showed a positive result. These isolates inhibit the growth of B. cinerea. The four strains were identified by the study of biochemical characters and phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequences. The results of the analyzes showed that the bacterial strains retained were related to the following species, of the Bacillus genus: S3: B. velezensis; S4: B. velezensis; and S5: B. halotollerans. Isolate S6 was classified in the genus Enterobacter and identified as E. cloacae. The antagonism test carried out in planta on vine vitroplants indicates that the four rhizobacteria reduce significantly (59%, 39%, 55%, and 17%, respectively), the symptoms of the disease and reduce damage to photosynthetic activity (PSII) due to attack by B. cinerea. This study revealed that strains of the genus Bacillus and Enterobacter isolated from the rhizosphere of the vine could be used as biological control agents in the protection of the vine

L’identification des états sanitaires du raisin au moment de la vendange est un enjeu majeur afin de produire des vins de qualité. Pour répondre à cet enjeu, des données sont acquises par spectrométrie, imagerie hyperspectrale et imagerie RGB sur des échantillons de raisin au cours des vendanges.Plusieurs prétraitements adaptés à chaque type de données sont appliqués tels que la normalisation, la réduction, l’extraction de vecteurs de caractéristiques et la segmentation de zones utiles. D’un point de vue imagerie, la reconstitution en fausses couleurs des images hyperspectrales, éloignée de la réalité, ne permet pas d’étiqueter toute la diversité intra-classe. En revanche, la qualité visuelle de l’imagerie RGB favorise l’étiquetage des classes avec précision. A partir de cet étiquetage, des classifieurs tels que les machines à vecteurs de support, les forêts aléatoires, l’estimation du maximum de vraisemblance, la mise en correspondance spectrale, les k-moyennes sont testés et entrainés sur les bases étiquetées. En fonction de la nature des données, le plus performant est appliqué sur les images entières de grappes ou caisses de raisins de plusieurs cépages provenant de différentes parcelles.Les indices de qualité obtenus à partir du traitement des images RGB sont très proches des estimations effectuées par les experts du domaine<br>Identifying the health conditions of the grapes at harvest time is a major issue in order to produce quality wines. To meet this issue, data are acquired by spectrometry, hyperspectral imaging and RGB imaging on grape samples during harvest.Several pre-treatments adapted to each type of data are applied such as normalization, reduction, extraction of characteristic vectors, and segmentation of useful areas. From an imaging point of view, the reconstruction in false colors of hyperspectral images, far from reality, doesn’t allow to label all the intra-class diversity. On the other hand, the visual quality of RGB imaging enables accurate class labelling. From this labelling, classifiers such as support vector machines, random forests, maximum likelihood estimation, spectral mapping, k-means are tested and trained on labelled bases. Depending on the nature of the data, the most effective is applied to whole images of grape clusters or crates of grapes of several grape varieties from different parcels.The quality indices obtained from RGB image processing are very close to the estimates made by experts in the field

L'Esca est une des plus dévastatrices des maladies du bois de vigne, qui affectent les vignobles du monde entier. L'un de ses principaux symptômes est la formation de pourriture blanche dans le bois, également appelée amadou. Au sein de cette pourriture blanche, Fomitiporia mediterranea (M. Fischer) est l'espèce majoritairement identifiée en Europe. Les champignons de pourriture blanche ont co-évolué avec leurs substrats et ont pu développer des mécanismes de dégradation et de détoxication spécifiquement adaptés. L'objectif principal de cette thèse est de mieux comprendre en quoi F. mediterranea est adapté à son substrat, le bois de vigne. Son comportement au cours de la dégradation de bois de différentes espèces a été étudié. Le taux de minéralisation, la perte de masse, la composition chimique du bois en composés structuraux et extractibles, la production de biomasse fongique et la sécrétion de protéines (sécrétome) au cours de cultures sur sciure ont été suivis. Dans un second temps, la colonisation par F. mediterranea de bûchettes de bois a été étudiée. En complément des approches physiologiques, une approche de métabolomique non-ciblée, à l'aide de réseaux moléculaires, a été utilisée pour décrire les métabolomes des bois et du champignon au cours de la colonisation. F. mediterranea est capable de dégrader des espèces de bois différentes, dont le bois de vigne cv. ‘Gewurztraminer' et ‘Riesling', de hêtre et de chêne, en sciure et en bûchettes, en adoptant pour toutes un schéma de dégradation de type simultané. En parallèle, une régulation de son sécrétome est observée en fonction de son substrat : un plus grand nombre d'oxydoréductases sont sécrétées sur la sciure de vigne. Cette régulation pourrait être liée à la dégradation observée de la lignine et des métabolites spécialisés du bois de vigne, principalement des stilbènes. Plusieurs facteurs, autres que la composition chimique et structurale du substrat, pourraient être impliqués dans l'adaptation de F. mediterranea à son substrat et sont également discutés. Ce travail contribue à enrichir les connaissances sur la physiologie de F. mediterranea¸ une des espèces clés dans le complexe fongique associé à l'Esca<br>Esca is one of the most devastating of the grapevine trunk diseases, that affect vineyards around the world. One of its main symptoms is white rot, also called amadou. In white rot, Fomitiporia mediterranea (M. Fischer) is the major species identified in Europe. White-rot fungi have evolved with their substrates and may have developed specifically adapted degradation and detoxification mechanisms. The main objective of this thesis is to understand how F. mediterranea is adapted to its substrate, grapevine wood. The behavior of F. mediterranea during wood degradation on different wood species was monitored. Carbon mineralization rate, wood mass loss, chemical composition in structural compounds and extractives, fungal biomass production and protein secretion (secretome) upon cultures on sawdust were measured. In a second step, the colonization of F. mediterranea on wood blocks was followed. In addition to the physiological approach, a non-targeted metabolomic approach, with molecular networking, was used to describe fungal and wood metabolomes during colonization. F. mediterranea is able to degrade several wood species, including grapevine cv. ‘Gewurztraminer' and ‘Riesling', beech and oak, in sawdust or blocks, using a simultaneous degradation pattern. Parallely, the fungus regulates its secretome in relation with its substrate: a larger number of oxidoreductases were secreted on grapevine sawdust. This could be correlated with the observed degradation of grapevine lignin and specialized metabolites, mainly stilbenes. Other factors than the structural and chemical composition of the substrate, which could be involved in the adaptation of F. mediterranea, are discussed. This work contributes to a better knowledge of the physiology of F. mediterranea, one of the key fungal species in Esca complexe disease

Le développement de nouvelles alternatives à la lutte chimique contre Botrytis cinerea chez la vigne, notamment par recours à l’utilisation des bactéries issues du vignoble champenois fait l’objet de cette thèse. Ces bactéries, isolées de la rhizosphère et de différents organes de vignes non contaminées, sont deux Acinetobacter lwoffii PTA-113 et PTA-152, une Bacillus subtilis PTA-271, deux Pantoea agglomerans PTA-AF1 et PTA-AF2 ainsi que deux Pseudomonas fluorescens PTA-268 et PTA-CT2. Les expériences réalisées de manière principale en conditions du vignoble, font apparaître que ces bactéries appliquées en souches pures ou en mélanges de souches sont capables d’induire des réactions de défense chez la vigne matérialisées par une stimulation des activités de chitinase et β-1,3-glucanase dans les feuilles et les baies de vigne. Ces réactions typiques de défense sont variables selon la souche, les combinaisons de souches et leur mode d’application, et sont pour la plupart associées à une protection des différents organes de la vigne contre Botrytis cinerea. Les souches les plus actives sont représentées par les A. Lwoffi, P. Fluorescens et P. Agglomerans PTA-AF1 chez les feuilles et P. Agglomerans PTA-AF1 et PTA-AF2 chez les baies. L’association des deux P. Agglomerans (AF1+AF2) ou encore P. Agglomerans en présence de B. Subtilis ou d’A. Lwoffi se traduit aussi par une protection significative contre B. Cinerea, ne dépassant pas celle obtenue en présence des bactéries individuelles<br>The development of new alternatives to chemicals against Botrytis cinerea in grapevine, especially by using bacteria originated from Champagne vineyard is the objective of this thesis. These bacteria isolated from the rhizosphere and from different healthy grapevine organs, are two Acinetobacter lwoffii PTA-113 and PTA-152, a Bacillus subtilis PTA-271, two Pantoea agglomerans PTA-AF1 and PTA-AF2 and two Pseudomonas fluorescens PTA-268 and PTA-CT2. Experiments performed mainly in vineyard demonstrated that these bacteria applied individually or in combination are able to induce defence reactions in grapevine as evidenced by a stimulation of chitinase and β-1,3-glucanase activities in leaves and berries. The intensity of these defence reactions is dependent on bacterial strain, combination of bacteria and their application method. They are associated to an induced protection of both organs against Botrytis cinerea. The most active strains are A. Lwoffi, P. Fluorescens and P. Agglomerans PTA-AF1 in leaves and P. Agglomerans PTA-AF1 and PTA-AF2 in berries. The combination of two P. Agglomerans (AF1+AF2) or P. Agglomerans with B. Subtilis or with A. Lwoffi also lead to a significant protection against B. Cinerea, which is not higher than that obtained with individual bacteria

L'obj'ectif de cette thèse est d'étudier les différentes sous-populations de B. Cinerea,champignon responsable de la Pourriture grise de la vigne, d'un point de vue moléculaire et biologique afin de mieux comprendre le développement épidémique de la maladie qui est actuellement souvent mal maîtrisée. La répartition de deux sous-populations (vacuma et transposa) vivant en sympatrie au vignoble s'est montrée très dépendante du stade phénologique ainsi que de l'organe de la vigne considéré. Les analyses de diversité obtenues par l'AFLP montrent une relation de parenté étroite entre ces deux sous-populations. Néammoins, l'étude de leurs aptitudes biologiques a permis de mettre en évidence des exigences biologiques et des potentialités parasitaires différentes. La population vacuma serait plus adaptée au saprophytisme alors que la population transposa aurait un comportement plus pathogène<br>The objective of this thesis is to study the various subpopulations of B. Cinerea, fungus responsible for the gray mold of the vine, from a molecular and biological point of view, in order to understand the epidemic development of the disease which is currently often badly controlled. The distribution of two subpopulations (vacuma and transposa) found in sympatry in the vineyard was shown very dependent of the phenological stage as well as of the grapevine organ considered. The analyses of diversity obtained by AFLP show a narrow relationship between these two subpopulations. Nevertheless, their biological study made it possible to highlight biological requirements and different parasitic potentialities. The vacuma subpopulation would be adapted to saprophytism whereas the transposa subpopulation would have a more pathogenic behavior

Contre la pourriture grise et les maladies du bois (MdBs), qui sont des maladies cryptogamiques majeures de la vigne, la lutte biologique a un potentiel de développement considérable dans le contexte actuel de réduction des intrants chimiques en viticulture.L’objectif de cette thèse est de sélectionner et d'étudier des souches bactériennes antagonistes de Botrytis cinerea (Pourriture grise) et de deux champignons pathogènes clefs liés aux MdBs: Phaeomoniella chlamydospora et Neofusicoccum parvum. Les expériences de screening principales sont réalisées in vivo et in planta sur 46 souches bactériennes isolées dans le vignoble bordelais. Le niveau de protection par les souches antagonistes dépend significativement de la souche bactérienne, de l’espèce de champignon pathogène ciblée, du tissu ou organe végétal hôte, mais aussi pour N. parvum, du mode d’application de la souche bactérienne et, pour B. cinerea, du génotype lié aux transposons : transposa ou vacuma.Une réduction significative de 40 à 64% de la taille des nécroses dues à P. chlamydospora et/ou N. parvum est induite par trois souches bactériennes Pantoea agglomerans (S1), Paenibacillus sp. (S19) et Bacillus pumilus (S32) sur des boutures de vigne non greffées. Ces souches ont fait l'objet d'investigations approfondies pour déterminer leurs principaux modes d’action : Antibiose, production de composés volatils qui ont été identifiés et/ou induction de différents gènes de défense de la vigne.Concernant B. cinerea, les souches Enterobacter cowanii (S22), Enterobacter sp. (S23), Bacillus ginsengihumi (S38) et Bacillus sp. (S43, S46) présentent un pouvoir antagoniste important par production de composés volatils et diffusibles anti-Botrytis, ainsi que par compétition pour les nutriments par E. cowanii (S22)<br>Biological control of gray mold and grapevine trunk diseases (GTDs), which are major fungal diseases of grapevine, has a considerable potential development in the current context of reduction of chemical input in viticulture.The aim of this study was to select and study bacterial strains for antagonism against Botrytis cinerea, the causal agent of gray mold, and two key pathogens involved in GTDs: Phaeomoniella chlamydospora and Neofusicoccum parvum. The main screening experiments for antagonistic activity of 46 bacterial strains, isolated from Bordeaux vineyards, have been carried out under different in vivo and in planta conditions. The efficacy of protection by the antagonistic strains significantly depended on the bacterial strain, the targeted pathogen species, the host plant tissue or organ and, for N. parvum, also on the application mode of the bacterial strain and, for B. cinerea, on the transposon genotype: transposa or vacuma.A significant reduction in length of necrosis due to P. chlamydospora and/or N. parvum, ranging between 40 and 64% in non-grafted vine cuttings, resulted from three bacterial strains: Pantoea agglomerans (S1), Paenibacillus sp. (S19) and Bacillus pumilus (S32). These strains were thoroughly further investigated to determine their major modes of action by i) Antibiosis ii) production of antifungal volatile organic compounds, which have been identified, and/or iii) induction of different grapevine defense genes. Concerning B. cinerea, Enterobacter cowanii (S22), Enterobacter sp. (S23) Bacillus ginsengihumi (S38), Bacillus sp. (S43, S46) were of prime importance in the biocontrol by producing anti-Botrytis volatile and diffusible compounds or by competing for nutrients (case of E. cowanii S22)

La réduction des effets secondaires des produits phytosanitaires sur l’environnement est un enjeux majeur du Grenelle de l’environnement. L’utilisation prolongée du cuivre comme fongicide a entrainé son accumulation dans les sols viticoles. Le cuivre étant phytotoxique,son accumulation dans la plante pourrait modifier la morphologie, la biochimie ou la physiologie des organes végétaux et perturber les interactions vigne-bio-agresseur. Nousavons donc évalué les effets de la contamination cuprique des sols viticoles sur la sensibilitéde la vigne à un cortège de bio-agresseurs par une approche plus intégrée de la culture et deson patho-système.Pour cela, nous avons mesuré les teneurs en cuivre total et disponible des parcelles viticoles.Nous avons exposé au cuivre trois cépages puis nous avons mesuré la distribution du cuivre et ses effets dans la plante. Enfin nous avons évalué l’impact induit pour trois bio-agresseurs de la vigne. Nos résultats montrent que la teneur en cuivre disponible du sol dépend surtout de la teneur total en cuivre (qui résulte de l’historique parcellaire) mais aussi des teneurs en carbone total et en particules fines du sol. L’absorption du cuivre et son transfert vers les parties aériennes varient selon les cépages. Lorsque la contamination cuprique augmente, les interactions vigne-bio-agresseurs sont modifiées : si les effets semblent négatifs pourScaphoideus titanus et Plasmopara viticola, la contamination cuprique semble favorable au développement de Neofusicoccum Parvum. Ces résultats soulignent la nécessité d’avoir une vision la plus intégrée possible du système, et d’intensifier les interactions de recherches entre l’agronomie et l’écologie évolutive<br>Following the ‘Grenelle of the environment’ conference, one of the current critical issues in agriculture is reducing the side effects of pesticides on the environment. Prolonged use of copper as a fungicide has led to copper accumulation in vineyard soils. Copper can induce aphytotoxicity. Its accumulation in plants may modify the morphology, biochemistry orphysiology of plant organs and may disturb the plant-pest interactions. The effects of coppercontamination of vineyard soils on the vine sensitivity to the pests received until now a verylimited attention. The present work investigates such effects.To carry out this work, we measured the levels of total and available copper in vineyard soils.We contaminated three grapevine cultivars with copper and measured the copper distributionand its effects on plant. Then, we evaluated the impact induced on three pests of the vine. Ourresults show that the available copper content in the soil is related to the total copper content(which results from the history of the plot), but also to total carbon and fine soil particlescontents. The copper absorption and the copper transferred to the aerial parts of the vine varyaccording to the cultivar. When copper contamination increases, the vine-pests interactionsare modified: a negative effects appears for Scaphoideus titanus and Plasmopara viticola,while important copper contaminations appears to promote the development ofNeofusicoccum parvum.These results underscore the need for a more integrated system approach, and to intensifyinteractions between agronomy and evolutionary ecology research

La vigne est une culture pérenne sensible à de nombreux bioagresseurs et sur laquelle il est nécessaire de réaliser de nombreux traitements pesticides, susceptibles de causer des problèmes environnementaux, de santé humaine et d’apparition de résistance au sein des populations de bioagresseurs. Aujourd’hui, il est indispensable de développer des stratégies nouvelles de lutte contre les bioagresseurs, plus raisonnées mais permettant de conserver une viticulture compétitive. L’utilisation de produits de biocontrôle semble, en ce sens, être une approche prometteuse permettant d’allier agriculture durable et intensive.Deux écoproduits généralistes à fort potentiel ont été identifiés, comme possédant des actions intéressantes sur les principales maladies cryptogamiques de la vigne. Le premier est un extrait naturel de plante, sans action fongicide directe mais capable de stimuler efficacement et de façon systémique les défenses de la plante. Le second, quant à lui, est un microorganisme qui possède une forte action antagoniste fongicide, mais aussi la capacité à stimuler les défenses de plante. Dans un premier temps, des études en conditions contrôlées ont mis en évidence l’efficacité des deux actifs pour inhiber le développement de diverses souches d’Erysiphe necator, Plasmopara viticola, Botrytis cinerea et Botryosphaeriaceae. En parallèle, des expérimentations au vignoble, ont confirmé le fort potentiel de ces produits de biocontrôle, avec des bonnes efficacités, particulièrement stable avec l’extrait naturel. Ces différentes études nous ont permis d’identifier et d’élaborer des stratégies d’utilisation pour ces deux produits de biocontrôle<br>Grapevine is a perennial crop sensitive to many fungal pathogens that require numerous pesticide treatments. However, its uses lead to environmental, human health and fungicide resistance problems. Developing sustainable pest management strategies while keeping a good wine quality is of major importance. In this sense, the use of bio-pesticides products seems to be a promising approach to combine sustainable and intensive agriculture.Two generalist bio-pesticides of great potential have been preliminary identified, forits actions on major fungal diseases of grapevine. The first one is a natural plant extract, with no direct fungicide action but able to systemically stimulate plant defenses. The second one is a microorganism showing strong antagonist fungicide actions, and important ability to stimulate plant defenses. First, the studies conducted in controlled conditions have demonstrated the effectiveness of both products in the suppression of various isolates of Erysiphe necator, Plasmopara viticola, Botrytis cinerea and Botryosphaeriaceae. In parallel,the good efficiencies of these products have been confirmed during vineyard assays. This was especially well demonstrated for the natural extract. As a whole, these studies confirm thepotential of these two products as promising bio-pesticides, of which the strategy of application have been further defined