Dissertations / Theses: 'Vie biologique'

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Sangely, Matthieu. "Dégradation biologique des polychlorobiphényles." Thesis, Toulouse, INPT, 2010. http://www.theses.fr/2010INPT0094/document.

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Abstract:

Le sol est une interface complexe entre tous les compartiments de l'environnement. Leur pollution participe à la diffusion de nombreux polluants. Les polychlorobiphényles sont des molécules toxiques persistantes dans l'environnement. Largement utilisés notamment dans les huiles diélectriques, ils contaminent aujourd'hui de nombreux sols industriels. Le traitement thermique de ces sols est très onéreux et peut entraîner l'émission de dioxines. L'objectif de ce travail est d'étudier un procédé de traitement biologique pour la dégradation des PCB dans les sols. Une dégradation biologique de PCB a été observée en présence de deux organismes cultivés, Burkholderia xenovorans et Phanerochaete chrysosporium, confirmant leur potentiel technologique en condition aérobie. En condition anaérobie, une communauté microbienne présentant la capacité de dégrader les PCB a été développé. Une étude de la diversité du gène ADNr 16S au sein de cette communauté a permis d'identifier les espèces présentes dans cette communauté. Une analyse de cycle de vie évalue les performances environnementales de deux procédés de traitement de sols contaminés par des PCB, l'un thermique, l'autre biologique. Cette analyse permet de quantifier l’avantage environnemental du procédé biologique sur son concurrent thermique
Soil is a complex interface between all compartments of the environment. Their pollution contributes to the spread of many pollutants. PCBs are persistent toxic compounds in the environment. Widely used especially in dielectric oils, they now contaminate many industrial floors. Heat treatment of these soils is very expensive and can cause the emission of dioxins. The objective of this work is to study a biological treatment process for the degradation of PCBs in soils. Biological degradation of PCBs has been observed in the presence of two cultured organisms, Burkholderia xenovorans and Phanerochaete chrysosporium, confirming their technological potential under aerobic conditions. Under anaerobic conditions, a microbial community with the ability to degrade PCBs was developed. A study of the diversity of 16S rDNA gene within this community has identified the species in this community. An analysis of life cycle assess the environmental performance of two methods for treating soils contaminated with PCBs, one thermal and one biological. This analysis quantifies the environmental benefit of the biological process compared with the heat treatment

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Lebret, Nelly. "L'ammoniac biologique et ses dérivés : analyse et limitation dans la vie domestique." Toulouse, INPT, 1992. http://www.theses.fr/1992INPT043G.

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Abstract:

Le travail presente concerne l'etude des sources d'ammoniac biologique dans la vie domestique, le suivi des composants de cycle de l'azote dans ces memes conditions et la mise au point de systemes simples assurant la maitrise de la formation, de l'accumulation et du degagement de ce gaz malodorant et toxique. Ainsi des comprimes de reactifs ont ete prepares pour permettre le suivi analytique de l'ammonisation ou de la presence de produits additionnels de blocage. Dans les aquariums, un activateur biologique a permis l'instauration plus rapide du cycle de l'azote et ainsi un peuplement plus precoce en poissons. Dans les piscines, un diffuseur automatique de produits chlores offre la possibilite de lutter efficacement et economiquement contre les differentes substances azotees. Enfin, un melange de supports mineraux et un traitement chimique approprie ont conduit a la mise au point d'un produit pour litiere pour chats dont les performances techniques sont superieures a toutes celles des produits commerciaux

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Bonnardel, Claudine. "Etude sociologique, médicale et biologique des phénomènes d'alcoolisation et de vie à la rue." Paris 5, 1993. http://www.theses.fr/1993PA05P263.

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Pépin, Antonin. "Performance environnementale de fermes maraichères en Agriculture Biologique." Electronic Thesis or Diss., Rennes, Agrocampus Ouest, 2022. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-04059580.

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Abstract:

Les fermes maraîchères biologiques françaises sont diverses, allant de systèmes complexes agroécologiques reposant sur la biodiversité et produisant de nombreux légumes différents, à des systèmes simples reposant sur les intrants et produisant peu de légumes différents, ce qui suggère des impacts sur l'environnement différents. L’objectif de la thèse est d’évaluer les performances environnementales de fermes maraîchères biologiques contrastées, au moyen de l’analyse de cycle de vie (ACV). La thèse s’organise autour de : (1) la caractérisation de la diversité des fermes maraîchères biologiques, en mobilisant une typologie réalisée à partir d’enquêtes, et un cadre d’analyse de la diversité des formes d’agriculture ; (2) l’adaptation d’une méthode d’évaluation de la biodiversité au contexte du maraichage ;(3) l’évaluation de trois fermes contrastées par une approche « système » de l’ACV, abordant la ferme comme un tout et où tous les intrants, opérations, et émissions sont rapportés à la production annuelle totale. L’analyse des impacts, exprimés par kg de légume, ha de ferme et Euro de valeur, sur le changement climatique, sur l’eutrophisation marine, sur la biodiversité, la demande cumulative en énergie et l’usage de plastique, fait apparaître de grandes différences entre les systèmes dans leurs principaux postes d’impact, mais ne permet pas d’obtenir un classement clair entre les trois fermes. L’approche « système » de l’ACV correspond au fonctionnement agroécologique et apporte une réponse au défi posé par la complexité de certaines fermes maraichères. L’indicateur d’utilisation de plastique apporte un éclairage nouveau sur une préoccupation croissante
French organic vegetable farms are diverse, ranging from complex agroecological systems based on biodiversity and producing many different vegetables, to simple systems based on inputs and producing few different vegetables, suggesting different environmental impacts. The objective of the thesis is to assess the environmental performance of contrasting organic vegetable farms, using life cycle assessment (LCA). The thesis is organised as follows: (1) the characterisation of the diversity of organic vegetable farms, using a typology based on surveys and a framework for analysing farming system diversity; (2) the adaptation of a biodiversity assessment method to vegetable farming; 3) the assessment of three contrasting farms using a LCA "system" approach, considering the farm as a whole and in which all inputs, operations and emissions are related to the total annual production. The analysis of the impacts, expressed per kg of vegetable, ha of farmland and economic value expressed in Euro, on climate change, marine eutrophication, biodiversity, cumulative energy demand and plastic use, revealed large differences between the systems for their main impact contributors, but did not allow a clear ranking of the three farms. The LCA "system" approach corresponds to the agroecological functioning and addresses the challenge posed by the complexity of some vegetable farms. The plastic use indicator shed new light on a growing concern

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Delhommeau, François. "La sphérocytose héréditaire pendant la 1ère année de vie : étude biologique, essai préliminaire du traitement par érythropoiétine humaine recombinante." Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05P043.

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Tardieux, Isabelle. "Etudes prealables a l'utilisation en lutte biologique d'aphidius colemani vie : (hym, aphidiidae) : caracterisation taxonomique, relations hote-parasitoide, aspects demographiques." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066717.

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Grégoire, Dany. "Événements de vie et stratégies d'adaptation chez des personnes ayant un trouble bipolaire et chez des membres de leur parenté biologique." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2001. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp05/NQ65341.pdf.

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Laugier, Guillaume. "Evolution du fardeau génétique et des traits liés à la reproduction au cours d'une invasion biologique." Electronic Thesis or Diss., Montpellier, SupAgro, 2013. http://www.theses.fr/2013NSAM0029.

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Abstract:

Cette thèse porte un regard évolutif sur les invasions biologiques qui sont une menace écologique, économique et sanitaire grandissante.Qu'ils en soient la cause ou la conséquence, les invasions sont en effet le théâtre de changements évolutifs rapides et importants.Ces changements peuvent être liés à une différence de pression de sélection entre l'aire d'origine et l'aire envahie, mais peuvent aussi être initiés par des évènements démo-génétiques comme un goulot d'étranglement démographique ou l'admixture (hybridation intra-spécifique) entre populations génétiquement différentes.Les changements évolutifs concernent aussi bien des traits d'histoire de vie liés à la reproduction que le fardeau génétique et la dépression de consanguinité.La forte dérive génétique qui peut se produire au cours d'un goulot d'étranglement peut conduire à la purge ou la fixation rapide d'allèles délétères responsables du fardeau génétique.Les trais de reproduction peuvent eux aussi influencer directement l'issue d'une invasion, au travers du taux d'accroissement démographique de la population.Ils peuvent aussi avoir un effet indirect sur le succès d'introduction en modifiant l'intensité des effets des évènements démo-génétiques.Au cours de cette thèse, j'ai étudié l'évolution du fardeau génétique et de traits de reproduction au cours d'une invasion biologique grâce à (i) une série d'expériences sur l'espèce envahissante modèle Harmonia axyridis (la coccinelle asiatique) et à (ii) un modèle théorique de dynamique de la fréquence d'un allèle délétère dans une population subissant un goulot d'étranglement.Mes résultats montrent que les populations envahissantes ont des traits de reproduction plus performants que celles de l'aire native.En particulier, les femelles envahissantes présentent une fécondité plus élevée et fécondent leurs œufs avec le sperme d'un plus grand nombre de mâles.Il n'existe pas, chez cette espèce, de mécanisme évident d'évitement de la consanguinité, bien que les populations de l'aire native souffrent de dépression de consanguinité contrairement à celles de l'aire envahie.La dépression de consanguinité peut évoluer très vite chez cette espèce en cas de fort goulot d'étranglement.Dans les conditions expérimentales, les allèles délétères étaient parfois purgés, mais ont souvent été fixés dans la population au cours d'un goulot.Enfin, le modèle théorique a montré que les probabilités de perte ou de fixation d'un allèle délétère récessif peuvent toutes deux augmenter rapidement par dérive au cours d'un goulot d'étranglement d'intensité modérée.Ces résultats soulignent l'importance du hasard sur le succès d'une invasion biologique.Puisque la probabilité d'émergence de combinaisons génomiques favorables à l'invasion augmente avec le nombre d'introduction, limiter le nombre d'évènements d'introduction peut s'avérer déterminant pour prévenir de futures invasions biologiques
This thesis provides some evolutionary insights on biological invasions, which represent a growing threat on ecology, economy and public health.Biological invasions are a place of rapid and important evolutionary changes that can be the cause or the consequence of invasion success.These changes can be caused by differences in selective pressures between the native and the invaded area.They can also be due to demo-genetic events such as demographic bottlenecks and admixture (emph{i.e.} intra-specific hybridisation) between genetically distinct populations.Evolutionary changes affect life-history traits (including reproductive traits) as well as the genetic load and inbreeding depression.Genetic drift can be strong during a bottleneck and can induce the rapid purging or fixation of deleterious alleles responsible for the genetic load.Reproductive traits can also influence the fate of an invasion by changing the demographic growth rate.Moreover, they can have an indirect impact on the success of introduction by altering the intensity of demo-genetic events.Throughout this thesis, I studied the evolution of the genetic load and of reproductive traits by the mean of (i) laboratory experiments using the invasive Harlequin ladybird Harmonia axyridis as a model species and (ii) through the study of a theoretical model of the dynamics of allele frequencies during a bottleneck.My results show that invasive populations have better reproductive traits than those from the native area.Particularily, invasive females display an increased fecundity and fertilize their eggs with the sperm of a higher number of males.In this species, there is no obvious mechanism of inbreeding avoidance, even though native populations suffer to inbreeding depression contrarily to invasive ones.Inbreeding depression can evolve quickly in this species if the population goes through a severe bottleneck.In my experiments, deleterious alleles were often fixed in the population during the bottleneck, but were sometimes purged.Finally, the theoretical model studied described show that the probability of complete loss or fixation of a deleterious recessive allele can both increase by drift during a bottleneck.These results highlight the importance of chance on the success of a biological invasion.Because the probability of emergence of genomic combinations that can favour an invasion increases with the number of introduction events, limiting the number of introduction events might be an efficient way to prevent or minimise upcoming biological invasions

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Laugier, Guillaume. "Evolution du fardeau génétique et des traits liés à la reproduction au cours d'une invasion biologique." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2013. http://www.theses.fr/2013NSAM0029/document.

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Abstract:

Cette thèse porte un regard évolutif sur les invasions biologiques qui sont une menace écologique, économique et sanitaire grandissante.Qu'ils en soient la cause ou la conséquence, les invasions sont en effet le théâtre de changements évolutifs rapides et importants.Ces changements peuvent être liés à une différence de pression de sélection entre l'aire d'origine et l'aire envahie, mais peuvent aussi être initiés par des évènements démo-génétiques comme un goulot d'étranglement démographique ou l'admixture (hybridation intra-spécifique) entre populations génétiquement différentes.Les changements évolutifs concernent aussi bien des traits d'histoire de vie liés à la reproduction que le fardeau génétique et la dépression de consanguinité.La forte dérive génétique qui peut se produire au cours d'un goulot d'étranglement peut conduire à la purge ou la fixation rapide d'allèles délétères responsables du fardeau génétique.Les trais de reproduction peuvent eux aussi influencer directement l'issue d'une invasion, au travers du taux d'accroissement démographique de la population.Ils peuvent aussi avoir un effet indirect sur le succès d'introduction en modifiant l'intensité des effets des évènements démo-génétiques.Au cours de cette thèse, j'ai étudié l'évolution du fardeau génétique et de traits de reproduction au cours d'une invasion biologique grâce à (i) une série d'expériences sur l'espèce envahissante modèle Harmonia axyridis (la coccinelle asiatique) et à (ii) un modèle théorique de dynamique de la fréquence d'un allèle délétère dans une population subissant un goulot d'étranglement.Mes résultats montrent que les populations envahissantes ont des traits de reproduction plus performants que celles de l'aire native.En particulier, les femelles envahissantes présentent une fécondité plus élevée et fécondent leurs œufs avec le sperme d'un plus grand nombre de mâles.Il n'existe pas, chez cette espèce, de mécanisme évident d'évitement de la consanguinité, bien que les populations de l'aire native souffrent de dépression de consanguinité contrairement à celles de l'aire envahie.La dépression de consanguinité peut évoluer très vite chez cette espèce en cas de fort goulot d'étranglement.Dans les conditions expérimentales, les allèles délétères étaient parfois purgés, mais ont souvent été fixés dans la population au cours d'un goulot.Enfin, le modèle théorique a montré que les probabilités de perte ou de fixation d'un allèle délétère récessif peuvent toutes deux augmenter rapidement par dérive au cours d'un goulot d'étranglement d'intensité modérée.Ces résultats soulignent l'importance du hasard sur le succès d'une invasion biologique.Puisque la probabilité d'émergence de combinaisons génomiques favorables à l'invasion augmente avec le nombre d'introduction, limiter le nombre d'évènements d'introduction peut s'avérer déterminant pour prévenir de futures invasions biologiques
This thesis provides some evolutionary insights on biological invasions, which represent a growing threat on ecology, economy and public health.Biological invasions are a place of rapid and important evolutionary changes that can be the cause or the consequence of invasion success.These changes can be caused by differences in selective pressures between the native and the invaded area.They can also be due to demo-genetic events such as demographic bottlenecks and admixture (emph{i.e.} intra-specific hybridisation) between genetically distinct populations.Evolutionary changes affect life-history traits (including reproductive traits) as well as the genetic load and inbreeding depression.Genetic drift can be strong during a bottleneck and can induce the rapid purging or fixation of deleterious alleles responsible for the genetic load.Reproductive traits can also influence the fate of an invasion by changing the demographic growth rate.Moreover, they can have an indirect impact on the success of introduction by altering the intensity of demo-genetic events.Throughout this thesis, I studied the evolution of the genetic load and of reproductive traits by the mean of (i) laboratory experiments using the invasive Harlequin ladybird Harmonia axyridis as a model species and (ii) through the study of a theoretical model of the dynamics of allele frequencies during a bottleneck.My results show that invasive populations have better reproductive traits than those from the native area.Particularily, invasive females display an increased fecundity and fertilize their eggs with the sperm of a higher number of males.In this species, there is no obvious mechanism of inbreeding avoidance, even though native populations suffer to inbreeding depression contrarily to invasive ones.Inbreeding depression can evolve quickly in this species if the population goes through a severe bottleneck.In my experiments, deleterious alleles were often fixed in the population during the bottleneck, but were sometimes purged.Finally, the theoretical model studied described show that the probability of complete loss or fixation of a deleterious recessive allele can both increase by drift during a bottleneck.These results highlight the importance of chance on the success of a biological invasion.Because the probability of emergence of genomic combinations that can favour an invasion increases with the number of introduction events, limiting the number of introduction events might be an efficient way to prevent or minimise upcoming biological invasions

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Javal, Marion. "Invasion du capricorne asiatique Anoplophora glabripennis : génétique, traits d’histoire de vie et écologie." Thesis, Orléans, 2017. http://www.theses.fr/2017ORLE2034/document.

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Abstract:

Le capricorne asiatique Anoplophora glabripennis est un exemple d’insecte ayant bénéficié du commerce international depuis l’Asie pour envahir une partie de l’Amérique du Nord où il est présent depuis les années 1990, et de l’Europe où sa présence a été détectée au début des années 2000. Cette espèce hautement polyphage se développe dans les arbres urbains et peut causer leur mort, soulignant l’importance du contrôle de sa population. En utilisant une approche pluridisciplinaire sur la base du modèle A. glabripennis, cette thèse vise à apporter de nouveaux éléments pour la compréhension globale des invasions biologiques. Dans un premier temps, j’ai cherché à retracer son cheminement dans le monde. Dans un second temps, j’ai cherché à savoir si certaines de ses caractéristiques biologiques avaient contribué au succès de son invasion. Enfin, j’ai abordé la question de l’impact écologique d’A.glabripennis en me focalisant sur les modifications de la faune de xylophages que sa présence aurait pu entrainer. Les résultats obtenus au cours de cette thèse ont permis de mettre en évidence une invasion complexe incluant plusieurs introductions ainsi qu’un scénario de tête de pont entre l’Amérique du Nord et l’Europe. Il apparait également que certains traits de l’espèce ont contribué à modeler son schéma de distribution. Sa résistance au stress thermique notamment a probablement favorisé son installation sous des climats variés. Par ailleurs, la dispersion naturelle d’A. glabripennis semble très limitée, mais mes résultats indiquent que l’espèce n’est pas restreinte par ses capacités physiologiques pour disperser. Enfin, l’étude préliminaire des faunes envahies ne révèle pas pour le moment d’effet de l’espèce sur les autres Cérambycidés. Au regard des autres cas d’invasion documentés, le cas d’A.glabripennis souligne donc la diversité des caractéristiques des espèces devenant invasives, et confirme la difficulté d’en dresser un portrait type
The Asian longhorned Beetle Anoplophora glabripennis provides a good example of insects that benefited from international trade from Asia. It partly invaded North America, where it has been present since the 1990s, and Europe where its presence was detected in the early 2000s. This highly polyphagous species develops in urban trees and can cause their death, highlighting the importance of its management. The aim of this thesis was to use a multidisciplinary approach to study the invasion of A. glabripennis in order to bring new elements to the global understanding of biological invasions. I therefore first wanted to retrace its invasion route through the world. Secondly, I sought to know whether some of its biological characteristics had contributed to the success of its invasion. Finally, I addressed the question of the ecological impact of A. glabripennis by focusing on the alterations of the xylophagous fauna that its presence could have caused. The results obtained in this thesis revealed a complex invasion which includes several introductions as well as a bridgehead scenario between North America and Europe. It also appeared that some traits of the species contributed to shaping its distribution pattern. Notably, its resistance to thermal stress probably favored its installation in various climates. Furthermore, the natural dispersion of A. glabripennis seems very limited, but my results indicated that the species is not limited by its physiological capacities to disperse. Finally, the preliminary study of the invaded fauna did not reveal any effects of the species on the other Ceramycidae for the moment. In the light of the other cases of invasion documented, the case of A. glabripennis highlights the diversity of the characteristics of species becoming invasive, and confirms the difficulty of drawing a typical portrait

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Perez, Emilie. "L'enfant au miroir des sépultures médiévales (Gaule, VIe-XIIe siècle)." Phd thesis, Université Nice Sophia Antipolis, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00975133.

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Abstract:

Entre le VIe et le XIIe siècle, en Gaule, le traitement funéraire des enfants connut certaines évolutions, corrélées à une transformation plus large de l'espace des morts. À la lumière d'une étude interdisciplinaire, qui combine l'analyse des sources écrites (hagiographiques et normatives), archéologiques et biologiques du haut Moyen Âge, je propose d'appréhender l'organisation des sépultures et les modes d'inhumation des enfants, à travers l'analyse de seize sites funéraires, sept nécropoles rurales et neuf cimetières, utilisés du VIe au XIIe siècle. Le développement d'une nouvelle méthode de répartition des enfants en classes d'âges " sociales " (0-2, 3-7, 8-12, 13-17 ans) a permis de repérer des césures et des étapes importantes durant l'enfance, notamment autour de l'âge d'un et de sept ans, qui témoignent de l'évolution de l'identité sociale et se manifestent différemment selon les contextes. Dans les nécropoles, le mobilier déposé auprès des enfants s'accroît en qualité, en quantité et en diversité à partir de huit ans, le genre étant marqué de manière beaucoup plus nette. L'analyse des sources hagiographiques et normatives des VIe-VIIIe siècles permet de lier ce phénomène à la puberté et à l'entrée dans l'âge adulte. Dans les cimetières, on observe un processus de regroupement des tombes d'enfants, attestant une sorte de sectorisation de l'espace funéraire selon l'âge des individus, sans doute vers l'époque carolingienne : les enfants de moins de sept ans sont, en effet, inhumés au plus près des murs des édifices ecclésiaux, selon une tendance qui semble perdurer jusqu'à la fin de la période médiévale.

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Kunach, Margaret. "Effets du sexe biologique et des habitudes de vie sur les anomalies du métabolisme postprandial des acides gras chez les patients intolérants au glucose." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2015. http://hdl.handle.net/11143/7607.

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Abstract:

Résumé : La résistance à l’insuline est un facteur de risque important pour le développement du diabète de type 2. Un désordre au niveau du métabolisme postprandial, qui se manifeste par une diminution relative du stockage des acides gras (AG) dans les tissus adipeux, mène à un débordement plasmatique des AG et à leur canalisation dans les tissus maigres tels que le cœur, le foie et les muscles squelettiques sous forme de dépôts ectopiques. Ce phénomène, connu sous le nom de lipotoxicité, se développe dans un contexte de balance énergétique positive chronique favorisée par la consommation alimentaire excessive ainsi que la sédentarité et peut varier entre les hommes et les femmes. Plusieurs études démontrent que le changement des habitudes de vie peut corriger ces désordres métaboliques. Notre laboratoire a développé une méthode unique pour étudier le métabolisme des AG de façon non invasive à l’aide d’un traceur radioactif, l’acide 14(R,S)-fluoro-6-thia-heptadécanoïque ([indice supérieur 18]F-FTHA), un analogue des acides gras à longue chaines utilisé en tomographie par émission de positrons. Nos études antérieures ont démontré que chez les sujets intolérants au glucose (IG+) on observe des niveaux de captage des AG dans le myocarde plus élevés associés à une fraction d’éjection du ventricule gauche ainsi qu’un volume d'éjection systolique diminués. À la suite d’une intervention d’un an axée sur les habitudes de vie des sujets IG+, on note une diminution du captage des AG dans le myocarde ainsi qu’une amélioration des paramètres de la fonction cardiaque. Cependant, chez des sujets IG+ ayant suivi une restriction calorique d’une semaine sans modifications de leur niveau d’activité physique, nous avons observé une augmentation du captage des AG dans le myocarde en parallèle avec une diminution de la fraction d’éjection du ventricule gauche. La restriction calorique, l’activité physique et la perte de poids influencent le métabolisme des substrats énergétiques et la fonction cardiaque chez les IG+, mais le sexe biologique est aussi un facteur important qui agit sur ces derniers. Le captage élevé des AG par le cœur chez les hommes est expliqué par des niveaux de chylomicrons plus élevés alors que chez les femmes il est associé à l’obésité. Bien que nos études ne nous ont pas permis de faire un lien entre les habitudes de vie des sujets IG+ et les anomalies métaboliques observées en période postprandiale chez ces sujets ni d’identifier quels changements dans leurs habitudes de vie ont contribué aux améliorations métaboliques dans le myocarde, elles nous ont amenées à redéfinir nos outils méthodologiques pour mieux étudier les habitudes de vie et de prendre en considération les différences entre les hommes et les femmes dans nos études futures.
Abstract : Insulin resistance is a major risk factor for the development of type 2 diabetes. Abnormalities in postprandial metabolism, which are characterized by a relative decrease in fatty acid storage capacity in adipose tissue leading to fatty acid spillover into the systemic circulation, give rise to ectopic fat deposition in non adipose tissues such as the heart, the liver and skeletal muscles. This phenomenon, commonly referred to as lipotoxicity, arises within the context of a chronic positive energy balance which is the direct result of excessive food consumption together with decreased energy expenditure and may be different in men and women. Many studies have shown, however, that metabolic abnormalities are reversible with changes in lifestyle habits. Our laboratory has developed a unique non-invasive method to study dietary fatty acid (DFA) metabolism using a radioactive tracer, 14(R,S)-[[superscript 18]F]-fluoro-6-thia-heptadecanoic acid ([superscript 18]F-FTHA), a long-chain fatty acid analogue, in combination with positron emission tomography. Our previous work demonstrated that patients with impaired glucose tolerance (IGT+) display an increase in myocardial DFA partitioning associated with a decreased left ventricular ejection fraction and stroke volume. Following a one-year lifestyle intervention regimen in IGT+ subjects, a reduction in myocardial DFA uptake as well as an improvement in cardiac function parameters was observed. However, IGT+ subjects who participated in a short-term caloric restriction while maintaining their usual level of physical activity, experienced an increase in myocardial DFA partitioning in parralel with a decreased left ventricular ejection fraction. Caloric restriction, physical activity and weight loss all have an impact on energy substrate metabolism and cardiac function in IGT+ patients, but gender is a major determinant as well. Increased myocardial DFA uptake in men is driven largely by elevated circulating chylomicron-TG levels whereas in women it appears to be associated with obesity. Although it was not possible for us to establish a link between IGT+ patients’ lifestyle habits and the postprandial metabolic abnormalities that they display nor to identify which lifestyle changes contributed to the metabolic improvements in the heart observed after the intervention, our studies helped redefine our methodological tools for assessing lifestyle parameters and underlined the importance of considering gender differences in our future studies.

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Liard, Vincent. "Origine évolutive de la complexité des systèmes biologiques : Une étude par évolution expérimentale in silico." Thesis, Lyon, 2020. http://www.theses.fr/2020LYSEI085.

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Abstract:

L'origine évolutive de la complexité des systèmes biologiques interroge les sciences du vivant depuis de nombreuses années. Dans cette thèse nous avons utilisé la plateforme d'évolution expérimentale in silico « Aevol » pour tester l'existence d'un « cliquet de complexité », c'est à dire d'un processus historique augmentant la complexité même dans des conditions où celle-ci n'est pas requise. Pour ce faire nous avons fait évoluer des populations d'organismes numériques dans des conditions environnementales telles que des organismes simples puissent se reproduire et prospérer. Malgré cela nous observons que dans une large majorité des simulations la complexité des organismes augmente continument. L'étude a posteriori des simulations montre pourtant que ces organismes complexes sont beaucoup moins adaptés que les organismes simples et qu'ils n'ont aucun avantage de robustesse ou d'évolvabilité. Cela exclut la sélection de l'ensemble des explications possibles pour l'évolution de la complexité. Par ailleurs, des expériences complémentaires ont montré que la sélection est néanmoins nécessaire pour que la complexité évolue, excluant également les effets non sélectifs. En analysant le devenir à long terme des organismes complexes, nous avons enfin montré que les ces organismes ne reviennent presque jamais à la simplicité malgré le bénéfice potentiel en termes de fitness. Cela suggère l'existence d'un cliquet de complexité alimenté par une épistasie négative : les mutations conduisant à des solutions simples, favorables en début de simulation, deviennent délétères après la fixation d'autres mutations. Nos résultats suggèrent également que ce cliquet de complexité serait plus puissant que la sélection, mais qu'il peut être inversé par la robustesse en raison des contraintes qu'elle impose sur la capacité de codage du génome
The complexity of biological systems and its evolutionary origin has been questioning life sciences for many years. In this thesis, by means of the Aevol in silico experimental evolution platform, we have tested the existence of a complexity ratchet, that is to say: the existence of a historical process that makes complexity rise even in conditions where it is not mandated. To that aim, we have got numerical organisms populations to evolve in environmental conditions such that simple organisms could reproduce and thrive. Despite that we observe that a vast majority of simulations, organisms' complexity continuously grows. However, the a posteriori study of the simulations shows that these complex organisms are far less adapted than the simple ones and that they neither have any fitness nor evolvability advantage over them. This rules out selection from the possible explanations to complexity evolution. Furthermore, complementary experiences have shown that selection is necessary for complexity to evolve, which,in turns, rules out non selective effects. Finally, with an analysis of the long term fate of complex organisms, we have shown that these complex organisms hardly ever go back to being simple ones despite the huge fitness gain it would incur. This fact suggests that there exists a complexity ratchet fueled by negative epistasis: beneficial mutations that yield simple solutions at the beginning of a simulation, become deleterious after other mutations have been fixated. Our results also suggest that this complexity ratchet is stronger than selection but that it can be inverted by robustness because of the constraints it casts on genome encoding ability

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Guiot, Elvire. "Microscopie de fluorescence sous excitation à deux photons : application à des études de corrélations et de déclins de fluorescence en milieu biologique." Paris 11, 2001. http://www.theses.fr/2001PA112307.

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Abstract:

Ce mémoire présente la mise en place d'un système complet de microscopie de fluorescence basé sur le processus non linéaire d'absorption à deux photons. Cette technique récente de microscopie biphotonique est caractérisée par de nombreux avantages pour l'étude d'échantillons biologiques, notamment en terme de limitation des photodommages. Combinée à des méthodes d'analyse de la dynamique d'émission de fluorescence, elle permet l'étude à la fois spatiale et temporelle de l'émission de fluorescence. Dans ce contexte, nous avons développé deux techniques d'analyse résolue en temps de la fluorescence. Une première technique d'analyse dynamique, la microscopie de corrélation de fluorescence, basée sur des mesures en micro-volume et sur une faible concentration moléculaire, a essentiellement été appliquée à l'étude du processus de diffusion translationnelle. En particulier, la microscopie de corrélation de fluorescence a permis, avec la sensibilité de détection d'une molécule unique, la détermination des coefficients de diffusion de sondes souvent utilisés en biologie. .
This thesis presents the development of a fluorescence microscope based on the non linear process of two-photon absorption. This new type of fluorescence microscopy characterized by a intrinsic three-dimensional spatial resolution comparable to those of the confocal microscope, offers also many advantages for biological studies, in particular in terms of restriction of the photodamages. Combined with time resolved techniques, two-photon microscopy allows imaging with high space and time resolutions and opens up new opportunities for biological dynamics studies. In this context, two time resolved techniques for fluorescence analysis under two-photon excitation have been developed. The first time resolved technique, the fluorescence correlation microscopy, based on measurements in micro-volumes with weak molecular concentration, has been essentially applied to the study of translational diffusion processes. In particular, the technique has allowed the determination, at the single molecule level, of the diffusion coefficient of various fluorescent biological probes. .

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Ismaeil, Ibrahim. "Effets d’un stress thermique chaud sur les traits de vie et le succès parasitaire du parasitoïde de pucerons Aphidius ervi (Aphidiidae), agent de lutte biologique." Amiens, 2011. http://www.theses.fr/2011AMIE0105.

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Abstract:

Les changements thermiques sont fréquents dans la nature et les organismes poïkilothermes tels que les insectes sont particulièrement exposés et sensibles à de telles variations qui affectent leurs traits d'histoire de vie. La présente étude porte sur l’endoparasitoïde solitaire Aphidius ervi Haliday (Hymenoptera : Braconidae Aphidiidae), un agent de contrôle biologique utilisé efficacement contre les pucerons, dont le puceron de la pomme de terre, Macrosiphum euphorbiae Thomas (Sternorrhyncha: Aphididae). Dans ce travail de thèse, nous avons évalué les effets de stress thermiques modérés (à 25°C et 28°C, appliqués pendant 1h ou 48h) sur les jeunes adultes d’A. Ervi et sur la fitness de leurs descendants de première génération (F1). Seuls les stress thermiques de 48h ont un impact fort sur la mortalité des guêpes alors que l’ensemble des traitements réduit la longévité des mâles. Un stress thermique appliqué aux femelles mères d’A. Ervi a également des conséquences sur leur descendance (F1) dont le développement, les taux de momification et le succès parasitaire sont affectés négativement. De façon surprenante, la fécondité des femelles de génération F1 est augmentée lorsque leur mère a été soumise à un stress thermique de 25°C. Il est suggéré que l’augmentation de la fécondité de ces femelles F1 pourrait être l’expression d’un phénomène d’hormèse, qui repose sur une certaine plasticité phénotypique trans-générationnelle, une réponse adaptative aux variations de l’environnement qui tend à optimiser la fitness des phénotypes induits. Nos résultats illustrent la complexité des réponses des insectes, et des parasitoïdes en particulier, aux conditions fluctuantes de leur environnement
Natural populations are commonly exposed to fluctuations of temperature and poikilothermic organisms such as insects are particularly sensitive to such variations which can represent potential stresses, ultimately affecting their life history traits and their overall fitness. The present study focused on the solitary endoparasitoid Aphidius ervi Haliday (Hymenoptera: Braconidae Aphidiidae), an efficient biological control agent commercially used against aphids such as the potato aphid Macrosiphum euphorbiae Thomas (Sternorrhyncha: Aphididae). We here evaluated the effects of mild heat stresses (at 25°C or 28°C, applied for either 1h or 48h) on young adults of A. Ervi and on the fitness of their first generation (F1) progeny. Only heat stresses of 48h had a strong impact on the wasps’ mortality while all treatments reduced the male longevity. Heat-stresses applied to A. Ervi parents also had consequences on their F1 progeny whose developmental time, rate of mummification and success of parasitism were negatively affected. Surprisingly, the fecundity of the F1 female progeny was increased when their mother had been submitted to a mild heat stress of 25°C. The increased fecundity of the F1 female progeny is suggested to result from a homeostatic, hormesis-like effect implying trans-generational phenotypic plasticity, thus illustrating the complexity of insect responses, and underlying mechanisms, to fluctuating conditions of their natural environment. Such phenomenon is believed to be adaptive as organisms with the induced phenotype are expected to experience a greater fitness

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Lyon, Florent. "Amélioration de la durée de vie d'essences de bois peu durables à l'aide d'un traitement combiné boates/huiles végétales." Phd thesis, Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00567069.

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Abstract:

Le marché de la préservation du bois recherche des alternatives aux traitements anciens, efficaces mais généralement toxiques pour l'environnement comme pour l'Homme. L'étude propose d'évaluer l'amélioration de résistance biologique apportée par l'utilisation de borates combinés à des huiles végétales. Les borates reconnus pour leur efficacité biocide mais lessivés sont en partie retenus par l'ajout d'huile végétale, le tout forme un traitement efficace et à faible impact environnemental contre les champignons et les termites. Les combinaisons simples se sont avérées plus efficaces que les émulsions. La synthèse d'un sel d'ammonium borate oléate s'est également montrée prometteuse. L'amélioration des traitements à l'huile s'est en revanche montrée compliquée, l'impossibilité de fixer l'huile sur le bois, la sensibilité des huiles dégradées aux moisissures et la réaction au feu des bois huilés sont autant de facteurs limitant pour l'instant l'usage de ces traitements.

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Lacour, Sandrine. "Impact médico-économique et biologique d'une stratégie de prévention basée sur la pollution par l'ozone dirigée vers des patients insuffisants respiratoires." Tours, 2006. http://www.theses.fr/2006TOUR3307.

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Abstract:

En Europe, la population est informée lorsque le seuil de 180 µg/m³/h d’ozone dans l’air est dépassé. Cependant, des concentrations d’ozone inférieures à ce seuil et qui se prolongent dans le temps peuvent avoir des effets néfastes sur la santé de personnes fragiles. L’étude PAPRICA (Pollution Aérienne et Pathologie Respiratoire : Impact de la communication sur l’air) reposait sur l’hypothèse qu’une information anticipée des dépassements du seuil de 110 µg/m³/8h d’ozone serait bénéfique à la santé de personnes atteintes d’insuffisance respiratoire chronique. Les résultats de cette étude ont montré que les patients avaient eu une meilleure perception de leur état de santé et de leur qualité de vie ainsi qu’une consommation de médicaments moindre lorsqu’ils avaient été informés à l’avance des dépassements du seuil de 110 µg/m³/8h d’ozone, seuil de protection de la santé pour lequel la législation française ne prévoit pas d’information
In Europe, the public is warned when ozone concentrations reach the 180 µg/m³/h threshold. However, persistent ambient ozone concentrations below this threshold can induce adverse effects on the health of people at risk. The PAPRICA study (French acronym for “ air pollution and respiratory disease : impact of communication about the air” ) assessed the impact on the health of patients with chronic respiratory insufficiency of a prevention strategy based on ozone pollution notification (110 µg/m³/8h : ozone threshold value for the protection of human health ). Patients had a better feeling of their health and their quality of life as well as a lower medication consumption when they had been informed in advance about crossing of the 110 µg/m³/8h threshold, for which the public does not receive specific information currently

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Thomas, Fabrice. "Complexation du fer par des ligands tripodes originaux et la calcéine : étude thermodynamique, cinétique et biologique." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1999. http://www.theses.fr/1999GRE10108.

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Abstract:

L'etude thermodynamique, cinetique et biologique des ligands du fer est primordiale pour concevoir de nouveaux medicaments, des outils agronomiques ou des outils physiologiques. La premiere partie concerne l'etude de ligands tripodes possedant des sous unites catechol (trencams), 8-hydroxyquinoleine + catechol (trensoxcams 2) et pyridinophenol (trenpypols). La caracterisation des ligands et complexes ferriques a permis de mettre en evidence que le trencams est un fort complexant de fe i i i a ph 7,4 (pfe i i i = 29,6) mais tres labile ; il ne complexe pas fe i i. Le ligand mixte trensoxcams2 est egalement un tres bon complexant mais moins labile ; la presence d'une sous unite 8-hydroxyquinoleine renforce ses proprietes complexantes en milieu acide. Le trenpypols est le tripode qui complexe le moins bien le fer du fait d'un cycle de chelation a 6 chainons a ph physiologique. L'hydrolyse acide du complexe ferrique se fait en 5 etapes distinctes. Les complexes du trencams et du trenpypols se sont averes etre des sources de fer utilisables par les cellules vegetales. Une etude de lipophilie a ete effectuee sur les ligands tripodes et un modele de transport au travers de la membrane biologique developpe. La calceine et la calceine bleue sont des complexants du fer moins forts que les ligands tripodes ; la calceine est une mauvaise sonde pour fe i i ; la presence de fe i i i dans le milieu eteint leur fluorescence. Cette propriete a ete mise a profit pour etudier la nutrition siderique de cellules d'arabidopsis thaliana en temps reel par fluorescence. L'evaluation du lip en utilisant cette molecule est discutee. L'etude spectroscopique met en evidence la formation de complexes de type 1 : 1 et 2 : 1 fer:calceine. Le type de coordination observe n'est pas celui qui avait ete specule dans la litterature. La derniere partie de ce travail concerne l'etude de l'interaction de derives d'acridine avec l'adn ou un oligonucleotide comportant un analogue de site abasique. Des specificites d'interaction ont ete mises en evidence.

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Ismail, Mohannad. "Plasticité de la réponse à l'exposition au froid chez Aphidius ervi dans le cadre des processus de stockage utilisés en lutte biologique." Phd thesis, Université Rennes 1, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00588289.

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Abstract:

Dans le cadre de la lutte biologique par lâchers inondatifs, le stockage au froid est utilisé pour obtenir des quantités importantes d'ennemis naturels. L'objectif de cette thèse est de comparer une grande variété de traitements de stockage au froid, considérés comme un stress thermique, et d'évaluer leurs effets sur la fitness des survivants, en utilisant comme modèle biologique le parasitoïde Aphidius ervi. Pour chacune des conditions de stockage, les effets du stress ont été évalués sur différents traits de vie, comme la longévité, la fécondité à l'émergence, la fécondité totale, la capacité d'accouplement, le sexe ratio des descendants, et sur différents paramètres physiologiques dont la quantité de lipides. Les principaux résultats montrent que les régimes de température fluctuants améliorent considérablement le taux de survie (principalement après quatre semaines de stockage), mais que les parasitoïdes stockés dans ces conditions consomment une plus grande proportion de lipides. Pour une longue durée de stockage (4 semaines), les régimes fluctuants à basse température (0°C) permettent d'obtenir le meilleur taux de survie associé aux meilleures performances de fitness et cet aspect n'avait jamais été mis en évidence auparavant. Lorsque le taux de mortalité lié au stockage est négligeable, le premier trait de vie atteint est la longévité. La fécondité n'est pas modifiée mais le sexe-ratio des descendants est plus biaisé vers les mâles. Lorsque le taux de mortalité est important, on peut observer la sélection d'individus résistants au stockage, dont les performances sont identiques à celle des témoins non stockés. Cependant, ces individus ont une taille réduite par rapport à celle des témoins. Lors du stockage au froid, les individus de plus grande taille sont plus affectés par ce stress que les individus de petite taille. Ces derniers ont de plus une reproduction plus précoce. Ce point n'avait encore jamais été mis en évidence; sachant que chez les parasitoïdes, les individus les plus grands ont potentiellement une meilleure fitness, ce point peut avoir des répercussions négatives en lutte biologique.

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Ayata, Sakina-Dorothée. "Importance relative des facteurs hydroclimatiques et des traits d'histoire de vie sur la dispersion larvaire et la connectivité à différentes échelles spatiales (Manche, Golfe Gascogne)." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00517082.

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Abstract:

En assurant la dispersion, la phase larvaire joue un role fondamental dans la dynamique des populations d'invertébrés marins à cycle de vie bentho-pélagique et détermine la connectivité au sein des métapopulations marines. La connectivité en milieu marin influence ainsi directement la dynamique des métapopulations et la persistance des populations locales, les potentialités d'expansion des espèces en réponse à des changements des conditions environnementales ou les limites biogéographiques d'aire de distribution des espèces. Dans ce contexte, le but du présent travail a été de mieux comprendre les roles relatifs joués par les processus hydrodynamiques et hydroclimatiques, et les traits d'histoire de vie des invertébrés sur la dispersion larvaire et la connectivité en milieu cotier dans le Golfe de Gascogne et la Manche occidentale. Pour répondre à cette question, une approche couplée a été mise en oeuvre, alliant l'observation in situ et la modélisation biologie-physique à deux échelles spatiales : régionale et locale. Dans le Nord du Golfe de Gascogne, la description de la distribution larvaire de trois espèces cotières de polychètes (Pectinaria koreni, Owenia fusiformis, et Sabellaria alveolata) a mis en évidence le role prépondérant de l'organisation spatiale des structures hydrologiques à méso-échelle (i.e. plumes estuariennes) dans la variabilité de la distribution des abondances larvaires. à l'échelle régionale du Golfe de Gascogne et de la Manche occidentale, la simulation lagrangienne de la dispersion larvaire en conditions hydroclimatiques réalistes a souligné l'importance de la variabilité saisonnière des conditions hydroclimatiques et des traits d'histoire de vie (mois de ponte, durée de vie larvaire, comportement natatoire) dans le transport larvaire et la connectivité entre populations. Ces résultats ont suggéré de possibles échanges larvaires depuis les populations cotières du Golfe de Gascogne vers celles de la Manche occidentale, i.e. à travers une zone de transition biogéographique. Ils ont aussi permis de tester plusieurs hypothèses sur les conséquences possibles du changement climatique sur la dispersion et la connectivité entre populations marines, i.e. via une période de ponte précoce et une durée de vie larvaire raccourcie. à l'échelle locale du Golfe Normand-Breton, un modèle eulérien de dispersion a permis d'estimer la connectivité entre les récifs biogéniques construits par une espèce à forte valeur patrimoniale, Sabellaria alveolata. Ce modèle a permis de déterminer les influences relatives de la variabilité intra- et inter-annuelle des conditions hydroclimatiques sur la connectivité, dans un contexte de gestion et de conservation d'un patrimoine naturel.

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Sauser, Christophe. "Les oiseaux marins polaires, sentinelles de la glace de mer : Réponses démographiques et traits d’histoire de vie." Thesis, La Rochelle, 2020. http://www.theses.fr/2020LAROS027.

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Abstract:

L’impact du changement climatique sur la glace de mer et les écosystèmes polaires qui en dépendent est reconnu depuis plusieurs décennies. Cependant, ces milieux sont généralement difficiles à étudier en raison de leur climat extrême, de leur isolement et des difficultés logistiques associées. Le manque de connaissances concernant les mécanismes reliant les traits d’histoire de vie des organismes polaires et la variation de la glace de mer est particulièrement préjudiciable à notre compréhension des conséquences du changement climatique sur les espèces longévives comme les oiseaux marins polaires. Ces derniers, généralement situés au sommet des réseaux trophiques, pourraient cependant constituer des espèces sentinelles des écosystèmes liés à la glace de mer. L’objectif de cette thèse est d’améliorer les connaissances sur les processus impliqués dans les réponses des populations de prédateurs marins polaires aux variations environnementales, et principalement les mécanismes liés à la glace de mer. Pour répondre à cet objectif nous nous sommes basés sur le suivi individuel à long terme de deux espèces d’oiseaux marins polaires, le pétrel des neiges (Pagodroma nivea) et le damier du Cap (Daption capense). Les deux espèces se reproduisent en milieu polaire. L’une est particulièrement dépendante de la glace de mer pour s’alimenter (le pétrel des neiges) tandis que l’autre préfère un habitat libre de glace (le damier du Cap). Au cours de ce travail, nous avons estimé l’influence de facteurs extrinsèques (forçages ascendants, descendants, météorologie locale) et intrinsèques (âge, expérience de reproduction, sexe, colonie) sur les réponses démographiques des espèces à l’aide de modèles multi-états de capture-marquage-recapture. Nous avons également testé l’influence des facteurs environnementaux sur les traits phénotypiques (condition corporelle et phénologie de reproduction) du pétrel des neiges. Chez les damiers du Cap nous montrons une diminution du succès reproducteur ainsi que l’influence de plusieurs paramètres extrinsèques (température de surface de l’eau de mer, prédation, météorologie locale) sur celui-ci. En parallèle nous montrons une augmentation de la survie des adultes et une corrélation de celle-ci avec l’oscillation Antarctique. Chez le pétrel des neiges, nous avons mis en évidence l’influence de la glace de mer et d’autres facteurs extrinsèques (prédation, oscillation Antarctique, météorologie locale) et intrinsèques (sexe, colonie, expérience de reproduction) sur de multiples traits démographiques. Nous avons également montré un décalage (retard) dans la phénologie de reproduction des pétrels des neiges en réponse à des changements environnementaux (concentration de glace de mer, vents) et nous avons constaté que la reproduction retardée avait un impact négatif sur la probabilité d'envol des poussins. Enfin nous avons aussi montré que la concentration de glace de mer et l’oscillation Antarctique ont une influence négative sur la survie et la condition corporelle des juvéniles de pétrel des neiges. Cette thèse permet d’apporter de nouvelles connaissances sur les liens entre glace de mer et les traits d’histoire de vie d’une espèce pagophilique, le pétrel des neiges et d’une espèce moins associée à la glace, le damier du Cap. Ces connaissances permettent de mieux appréhender les conséquences du changement climatique sur les oiseaux marins polaires et les écosystèmes polaires en général, et apporte une contribution à la compréhension de la dynamique des populations concernant les variations démographiques intra spécifiques à fine échelle spatiale
The impact of climate change on sea ice and polar ecosystems has been well recognized. However, these environments are generally difficult to study because of their extreme climate, isolation and the associated logistical difficulties. The lack of knowledge regarding the mechanisms linking the life history traits of polar organisms and sea ice variation limit our understanding of the consequences of climate change on long-lived species such as polar seabirds and sea ice ecosystems. Seabirds, generally located at the top of food webs, could however constitute sentinel species of ecosystems linked to sea ice. The objective of this thesis is to improve knowledge on the processes involved in the responses of polar marine predators to environmental variations, and mainly the mechanisms linked to sea ice. For this purpose we have based our analyses on the long-term monitoring of two polar seabirds, the snow petrel (Pagodroma nivea) and the Cape petrel (Daption capense). Both species breed in polar environments of the Southern Ocean. One is particularly dependent on sea ice for foraging (snow petrel) while the other prefers ice-free habitats (Cape petrel). During this PhD, we estimated the influence of extrinsic factors (top-down, bottom-up, local weather) and intrinsic factors (age, breeding experience, sex and colony) on the demographic responses of these two species using multi-states capture-recapture models. We also tested the influence of environmental factors on phenotypic traits (body condition and breeding phenology) of snow petrels. For the Cape petrel, we show a decrease in breeding success as well as an influence of several extrinsic parameters (sea surface temperature, predation, local weather) on this demographic parameter. We also show an increase in adult survival linked to variations of a large scale climate index, the southern annular mode. Modelling of the population dynamics using a matrix population model indicated a positive population growth rate and suggest that this species probably beneficiates from current climate changes. In snow petrels, we demonstrate the influence of sea ice and other extrinsic factors (predation, southern annular mode, local weather) as well as intrinsic factors (sex, colony, breeding experience) on multiple demographic traits (probabilities of survival, breeding, hatching, and fledging). We also show a shift (delay) in the breeding phenology of snow petrels in response to environmental changes (sea ice concentration, winds), and found that delayed reproduction negatively impacted the probability of fledging. Finally, we show that the sea ice concentration and the southern annular mode have a negative influence on the survival and body condition of juvenile snow petrels. This thesis provides new knowledge on the links between sea ice and the life history traits of two Antarctic polar seabirds characterized by specific dependence to sea ice. This knowledge helps to better understand the consequences of climate change on polar seabirds and polar ecosystems in general, and contributes to the understanding of population dynamics concerning intra-specific demographic variations at a fine spatial scale

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Ducharme, Vincent. "Simulation de systèmes chimique et physiologique." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2013. http://hdl.handle.net/11143/6580.

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Abstract:

Ce mémoire est compose de deux parties, chacune correspondant à un article publié. La première présente une nouvelle approche de simulation pour une chimie virtuelle utilisée dans le domaine de la vie artificielle. Cette approche innovante est basée sur les échanges d'énergies lors des collisions entre les différents atomes du système. Les échanges d'énergie permettent de mieux diriger les réactions, tout en laissant une grande liberté au système. Cette chimie est developpée dans l'optique d'étudier l'émergence de certains phénomènes chimiques en lien avec l'origine de la vie. La deuxième partie du mémoire traite d'une simulation d'un corps humain. Le système développé simule certains métabolismes importants du corps humain dans le but d'obtenir un humain virtuel pouvant être utilisé dans le cadre de la formation en sciences de la santé. Le système cardiovasculaire ainsi que le système respiratoire du patient virtuel ont été développés et sont présentés dans ce mémoire.

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Guiot, Elvire. "microscopie de fluorescence par excitation à deux photons : application à des études de corrélations et de déclins de fluorescence en milieu biologique." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2001. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00010025.

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Abstract:

Ce mémoire présente la mise en place d'un système complet de microscopie de fluorescence basé sur le processus non linéaire d'absorption à deux photons. Cette technique récente de microscopie biphotonique est caractérisée par de nombreux avantages pour l'étude d'échantillons biologiques, notamment en terme de limitation des photodommages. Combinée à des méthodes d'analyse de la dynamique d'émission de fluorescence, elle permet l'étude à la fois spatiale et temporelle de l'émission de fluorescence. Dans ce contexte, nous avons développé deux techniques d'analyse résolue en temps de la fluorescence. Une première technique d'analyse dynamique, la microscopie de corrélation de fluorescence, basée sur des mesures en micro-volume et sur une faible concentration moléculaire, a essentiellement été appliquée à l'étude du processus de diffusion translationnelle. En particulier, la microscopie de corrélation de fluorescence a permis, avec la sensibilité de détection d'une molécule unique, la détermination des coefficients de diffusion de sondes souvent utilisées en biologie : le FITC-dextran, la GFP (Green Fluorescent Protein) et la fluorescéine. Les performances de cette technique pour les études en milieux biologiques ont par ailleurs été validées par une application novatrice et originale à l'étude des mécanismes de la diffusion moléculaire au sein de biofilms de bactéries. Une deuxième technique d'analyse dynamique, l'imagerie des durées de vie fluorescence sous excitation à deux photons a été développée. La durée de vie de fluorescence d'une molécule, ou durée de vie de l'état excité singulet, est un paramètre caractéristique de l'état physico-chimique et de l'environnement d'une sonde fluorescente. Elle renseigne donc sur de nombreuses propriétés moléculaires essentielles à la compréhension des mécanismes intracellulaires. De premières applications concluantes de cette technique sont présentées, notamment des études in vitro de la réactivité de molécules d'intérêt pharmacologique ainsi que de premières mesures réalisées in vivo.

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Koh, Byoung-Seol. "Le cycle de vie d'Owenia fusiformis (Annélide Polychète) en Méditerranée : les processus locaux de recrutement et la distribution géographique de l'espèce à l'échelle mondiale." Paris 6, 2002. http://www.theses.fr/2002PA066198.

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Moreau, Géraldine. "Contribution à l'étude du rôle de Fas au cours de l'hématopoïèse." Paris 5, 2000. http://www.theses.fr/2000PA055016.

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Abstract:

L'apoptose par la voie Fas joue un rôle important dans la régulation de la réponse immune, notamment au cours de l'aicd (apoptosis inducing cell death). Par ailleurs, une inhibition de l'hématopoïèse par le couple Fas/Fasl a été mise en évidence in vitro. C'est pourquoi, au cours de ce travail nous avons étudié in vivo les répercussions de la déficience en Fas sur l'hématopoïèse. Chez les souris adultes déficientes en Fas fonctionnel (souris lpr), l'hématopoïèse extramédullaire (sang, foie, rate, cavité péritonéale) et fœtale est augmentée. Dans la rate, la fréquence des progéniteurs qui forment des colonies en méthylcellulose (cfu-c) est dix fois supérieure à la normale, et les progéniteurs plus primitifs (cfu-s) y sont également plus nombreux. Ces modifications sont également présentes chez les souris déficientes en Fasl (souris gld) et ne sont pas la conséquence de l'accumulation des lymphocytes DN B220 + chez ces souris. Contrairement aux organes périphériques, la moelle osseuse est peu touchée par l'absence de Fas, puisque seules les CFU-Sj8 sont faiblement augmentées peu après la naissance. Cependant, la diminution de la fréquence des CFU-S médullaires après le pontage de Fas in vitro, en présence d'IFNу, est en accord avec une sensibilité des progéniteurs hématopoïétiques de la moelle osseuse à la voie de mort de Fas. Les travaux entrepris in vitro, pour étudier la sensibilité des progéniteurs hématopoïétiques à la voie Fas, nous ont permis de mettre en évidence dans la rate l'influence de l'environnement cellulaire. En effet, alors que le pontage de Fas, en présence d'IFNу, diminue les CFU-C dans la rate de souris normales, l'élimination des cellules non B (CD19) qui expriment le marqueur B220 rend ces CFU-C insensibles à la voie Fas. La déplétion des cellules NK abolit l'effet du pontage de Fas en présence d'IFNу, qui est restaure par l'addition de TNF exogène. La mise en évidence de la production de TNF par ces cellules suggère que ces dernières participent, via la production de TNF, à la sensibilisation des CFU-C de la rate à la voie Fas. Dans la rate, le pontage de Fas en présence d'IFNу affecte également des cellules plus engagées dans la voie de différenciation : les cellules promyélocytes de la lignée basophile. L'IL-12 et l'IL-18, deux cytokines pro-inflammatoires, stimulent l'expression de FasL et la production d'IFNу par les cellules TNK ou les cellules NK. Au cours de ce travail, nous avons établi que l'IL-12 plus IL-18 inhibe dans la rate, in vitro et in vivo, la production d'histamine en réponse à l'IL-3 caractéristique de ces cellules. L'action de ces cytokines est dépendante du couple Fas/Fasl. Les cellules NK, qui sont capables d'exprimer Fasl et de produire de l'IFN en réponse à l'IL-12 et à l'IL-18, sont essentielles à l'effet de ces cytokines sur la production d'histamine par les cellules de la rate. Alors que certains auteurs ont récemment décrit un rôle régulateur de l'histamine dans la production de cytokines de la réponse immune, nous avons démontré qu'en retour, la production d'histamine est elle-même régulée par ces cytokines.

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Marinosci, Cassandra. "Sélection, plasticité et dérive façonnent les traits d’histoire de vie chez l’acarien ravageur de cultures Tetranychus urticae suite à un changement d'hôte." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT148/document.

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Abstract:

Les herbivores polyphages sont des généralistes capables d’exploiter une large gamme de plantes hôtes. Au cours des travaux de cette thèse en évolution expérimentale, nous étudions l’évolution de traits d’histoire de vie de différentes populations d’une espèce de ravageur de culture, l’acarien Tetranychus urticae, suite à la colonisation d’un même nouvel hôte, la tomate. Au cours des deux premiers chapitres, des mesures de traits d’histoire de vie ont été collectées depuis le stade œuf jusqu’à la mort des individus permettant de décrire finement le cycle de vie de cet acarien en réponse à l’exploitation de la tomate. Dans le chapitre 1, j’ai montré que la survie au stade juvénile était étroitement liée à des effets maternels. Notamment, les mères s’étant préalablement développées sur la plante de tomate conféraient à leurs descendants une meilleure survie juvénile sur cet hôte. Cependant, ces juvéniles quittaient davantage la plante une fois adulte et avaient une fécondité (pour les femelles) réduite. De plus, l’histoire évolutive des populations affectait la proportion de femelles produites par les mères améliorant potentiellement la démographie des populations. Dans le second chapitre, j’ai montré que plusieurs traits d’histoire de vie (survie juvénile, survie adulte mâle et fécondité) avaient évolué dans les populations exposées à la tomate depuis plusieurs générations à comparer des populations témoins ayant évolué sur haricot. Néanmoins, l’étude du succès reproducteur total des femelles intégrant l’effet de plusieurs traits de vie montre paradoxalement un signal clair d’adaptation au nouvel hôte seulement pour des populations ayant évolué sur cet hôte pendant environ 38 générations et non pour des populations ayant évolué sur cette plante hôte pendant environ 78 générations. L’étude de la diversité génétique, sur la base de marqueurs microsatellites, suggère que ces dernières populations ont souffert de goulots d’étranglement, ce qui pourrait avoir compromis leur adaptation. Pour finir, dans le chapitre 3, je teste si les populations nouvellement adaptées à la tomate sont plus tolérantes aux défenses de la plante, induites par l’attaque d’herbivores, ou bien si ces populations induisent différents niveaux de défense chez les plantes attaquées, affectant la performance des acariens qui les colonisent ultérieurement. Pour cela, des acariens ont été mis en ponte sur des plantes de tomates non pré-infestées, pré-infestées par des acariens adaptés à la tomate ou pré-infestées par des acariens non adaptés à cet hôte. Les populations adaptées à la tomate ont une fécondité plus forte sur cette plante, quel que soit le traitement de la plante, tandis que toutes les populations d’acariens voient leur mortalité augmenter sur les plantes pré-infestées par des acariens adaptés à la tomate. Mes résultats semblent indiquer que l’évolution sur tomate se manifeste par une plus grande capacité à tolérer les défenses de cette plante et une plus grande induction de ces défenses.Ainsi, mon étude décrit un continuum de réponses évolutives chez un polyphage allant de l’absence de détection d’adaptation, conduisant à l’extinction des populations, à la présence de réponses plastiques adaptatives, jusqu’au processus d’adaptation à la plante hôte via possiblement l’acquisition de la capacité à tolérer les défenses de la plante hôte. Ces travaux soulignent l’importance d’intégrer l’effet des variations contrastées de différents traits d’histoire de vie dans une mesure de valeur sélective afin de décrire l’adaptation à une nouvelle plante hôte. Des investigations futures en ce sens permettraient d’enrichir la littérature sur la persistance des herbivores suite à la colonisation de nouvelles plantes hôtes mais aussi d’affiner nos compétences en terme de contrôle d’espèces de ravageurs
Polyphagous herbivores are generalists able to exploit a large range of host-plants. In this thesis, using experimental evolution, I study the evolution of life history traits in different populations of a crop pest, the spider mite Tetranychus urticae, after colonization of a new host, the tomato plant. In the first two chapters, measures of life history traits were collected from the egg stage to the death of individuals allowing the precise description of the life cycle of mites in response to the exploitation of tomato plants. As described chapter 1, I found that juvenile survival on the new host was influenced by maternal effects. In particular, mothers having developed on tomato had offspring surviving better on this host as juvenile. However, these juveniles left more often the plant as adults and had a reduced fecundity (for females). Moreover, the evolutionary history of populations affected the proportion of females produced by mothers, potentially enhancing demography of populations having previously evolved on this host. In chapter 2, I show that several life history traits (juvenile survival, male adult lifespan and fecundity) had evolved in all populations exposed to tomato for several generations relative to control populations evolving on bean. Nevertheless, the study of female lifetime reproductive success integrating the effect of several successive traits only showed, paradoxically, an adaptive signal for populations having evolved on this host for approximately 38 generations and not for populations having evolved on tomato for approximately 78 generations. The study of genetic diversity with microsatellite markers suggests that these latter populations may have suffered from bottlenecks, which could have compromised their adaptation. Finally, as shown chapter 3, I test whether populations newly adapted to tomato are more tolerant to the host-plant defenses, induced by herbivore attacks, and/or whether these populations differentially trigger the defences of damaged plants, affecting the performance of mites that subsequently colonize this host. For that purpose, I recorded the fecundity and mortality of female adult mites put on clean tomato plants, or on tomato plant pre-infested by tomato-adapted mites or by mites not adapted to this host. Populations adapted to tomato had a higher fecundity on this host irrespective of the plant treatment, while mortality increased for all populations on plants pre-infested with tomato-adapted mites. My results thus suggest that evolution on tomato leads to an increased capacity to tolerate host-plant defences and also to a higher induction of such defences. My studies describe a continuum of evolutionary responses in a polyphagous species from failure of adaptation, leading to the eventual extinction of populations, to the presence of adaptive plastic responses and finally to host-plant adaptation via the possible acquisition of higher tolerance to host-plant defenses. My work also underlines the relevance of integrating the effects of different life history traits with contrasted variations within a same fitness measure to describe host-plant adaptation. Further investigations in this direction should enrich our understanding of mechanisms of herbivore persistence on a new host-plant but also allow developing better crop pest management strategies

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Seidl, Renata Aparecida. "A agricultura ecologica sob o angulo da qualidade de vida dos agricultores : abordagem comparativa entre duas regiões metropolitanas na França e no Brasil." Thesis, Paris 10, 2016. http://www.theses.fr/2016PA100103.

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Abstract:

Après la Révolution Verte, qui débuta dans les années 1960, l’agriculture a pris de nouvelles directions grâce à l’introduction de technologies et de pratiques agricoles modernes (modification génétique de semences, usage intensif d’engrais agricoles, mécanisation des coûts d’exploitation) qui ont permis d’intensifier la production et la productivité agricoles. Ce modèle de production s’est formé au sein de l’agriculture conventionnelle. Cependant, après moins d’un siècle de développement, ce modèle d’agriculture a généré un certain nombre de préoccupations quant à son impact sur l’environnement et la santé de la population. En tant qu’alternative à l’agriculture conventionnelle, l’agriculture écologique - qui se présente sous diverses dénominations (organique, agro-écologique, biologique, entre autres) - se distingue en termes de production et de commercialisation dans des systèmes agroalimentaires locaux et globaux. Son développement a été rendu possible grâce à des investissements économiques du fait aussi bien de grandes entreprises agroalimentaires que de petits agriculteurs qui ont converti leurs exploitations à un mode écologique de production. C’est dans ce contexte que l’on observe les motifs d’adhésion des petits agriculteurs à ce type d’agriculture. Nous privilégions dans cette analyse la place que représente la Qualité de Vie (QV) dans le choix de l’agriculteur familial brésilien et du paysan français, en l’occurrence des horticulteurs maraîchers dans deux régions métropolitaines, la Région Métropolitaine de Belo Horizonte (Brésil) et la Région Métropolitaine de l’Île-de-France (France). Ce questionnement recoupe l’idée de « durabilité », comprise non seulement comme la préservation de l’environnement et des écosystèmes, mais aussi comme la prise en compte du tissu social et des conditions de vie des individus, dans ce cas des agriculteurs. En d’autres termes, nous considérons que l’auto-estime et la satisfaction professionnelle sont intrinsèquement liées aux relations sociales et à l’organisation de l’espace dans lequel elles s’insèrent. A partir d’un échantillon intégrant des agriculteurs écologiques et conventionnels, on montre qu’au-delà de valeurs communes représentant une aspiration à une bonne qualité de vie (possibilités de développer un travail salubre - sans risque pour la santé -, prospère - avec un retour financier suffisant - et plaisant - en tant que source de satisfaction et de reconnaissance sociale -), certaines spécificités propres à chacun de ces groupes existent, par-delà l’appartenance régionale. Mais, dans le même temps, il apparaît également que le rapport à la QV vient renforcer la durabilité des exploitations lorsqu’il est incorporé ou relayé dans les projets de développement agricole local. Le rapprochement entre deux contextes régionaux métropolitains permet de comprendre en quoi il existe une spécificité brésilienne autour des questions de sécurité alimentaire et à quelles conditions certaines approches de gestion en France pourraient inspirer les politiques publiques de la région métropolitaine de Belo Horizonte
After the Green revolution, which began in the years 1960, agriculture took new directions thanks to the introduction of technologies and modern practices (genetic modification of seeds, intensive use of manures, and mechanization of the farms) which made it possible to intensify the production and raise the agricultural productivity. This model of production was formed within the conventional agriculture. However, after less than one century of development, this model of agriculture generated a number of concerns as well for its environmental impact and as well on public health. As an alternative to the conventional agriculture, the ecological agriculture - with its various denominations (Organic, Agro-ecological, Biological, inter alia) - has created its own marks in terms of production and marketing in local and global agro- alimentary systems. Its development was maintained thanks to growing demand and investment of large agro- alimentary companies and family farmers who converted their surfaces to an ecological mode of production. In this context, the inclusion and the adhesion of the small farmers to this type of agriculture is the main framework of this research. The thesis proposes therefore to carry out a reflection around the social sustainability of the farmers with this main question: “Is ecological agriculture a sustainable solution for all?” - which emerges within a social perspective through the analysis of quality of life of Brazilian family farmers and the French peasants, actives within market-gardening inside metropolitan regions of Belo Horizonte (Brazil) and the Metropolitan region of the Ile-de-France (France). This questioning cross the idea of “sustainability”, understood not only like safeguarding of the environment and the ecosystems, but also as taking into account the "social factory" and the living conditions of the individuals, in this case, of the farmers. Thus, the question of the quality of life (QOL) of the farmers – where self-esteem and the job satisfaction are intrinsically related to the social relations and the organization of the space of which they form part – is analysed. The results show inter alia, that the permanence of the production units depends on the conditions given to its owner, taking account of possibilities of developing a salubrious work (without health risk), prosper (with a sufficient financial return) and pleasant (as a source of satisfaction and social recognition). Our work reaffirms thus that ecological agriculture is in fact sustainable for all when the variables of the QOL of the farmers are potentiated and incorporated in the local agricultural development. In addition it's observed that the relation between the values of the QOL and the regional contexts reflects as well in the capacities of the farmers to carry their work as in their feelings of pleasure and self-confidence, i.e. of personal and professional wellbeing. The specificities around the questions of food security in the Brazilian context direct the future research towards arrangements of management strategies used in France and liable to be adapted to the reality of the Belo Horizonte metropolitan region
Após a Revolução Verde, iniciada na década de 1960, a agricultura tomou novos rumos graças à introdução de tecnologias e práticas agrícolas modernas (modificação genética de sementes, uso intensivo de insumos industriais, mecanização e redução de custo de manejo) que permitiram intensificar a produção e a produtividade agrícola. Esse modelo de produção conformou-se na agricultura convencional. No entanto, a menos de meio século de seu desenvolvimento, este tipo de agricultura tem causado preocupações sobre o seu impacto no meio ambiente e na saúde da população. Como uma proposta alternativa à agricultura convencional, a agricultura ecológica, sob diversos nomes (Orgânica, Agroecológica, Biologique, dentre outras) tem-se destacado no âmbito dos sistemas agroalimentares locais e globais, tanto em termos de produção quanto de área e comercialização. Seu desenvolvimento tem se sustentado por um mercado de investimentos econômicos, representado por grandes empresas agroalimentares e por pequenos agricultores, que converteram suas áreas para uma maneira ecológica de produção. Diante desse contexto, a inclusão ou adesão dos pequenos agricultores a esse tipo de agricultura motiva uma investigação na esfera social. Assim, a proposta dessa tese é trazer uma reflexão acerca da sustentabilidade social dos agricultores, cuja questão: “A agricultura ecológica é uma solução sustentável para todos?” surge com uma perspectiva social sobre as condições de vida e de trabalho do agricultor familiar brasileiro, e do paysan francês, investidos na prática da horticultura ecológica. Este questionamento recai sobre a ideia de “sustentabilidade”, compreendida não somente no aspecto da preservação do meio ambiente e dos ecossistemas, mas também quanto ao tecido social e à qualidade de vida (QV) dos indivíduos, nesse caso, os agricultores. Desta forma, discute-se a QV dos agricultores, cujas autoestima e satisfação profissional encontram-se intrínsecas às relações sociais e às organizações do espaço ao qual eles se inserem. Os limites espaciais da pesquisa englobam duas regiões metropolitanas, a saber: 1) Região Metropolitana de Belo Horizonte – Brasil e; 2) Região Metropolitana de Île-de-France – França

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Musset, Murielle. "Nature des récepteurs (intégrines et lectines) et des signaux de transduction impliqués dans l'adhérence des cellules Hep G2." Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05S018.

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Abstract:

Au même titre que les hormones, les facteurs de croissance et les autres cellules, la matrice extracellulaire exerce un rôle fondamental dans le contrôle des fonctions cellulaires. Les informations codées par la matrice sont transmises à la cellule par des récepteurs membranaires, via des interactions entre le cytosquelette et des protéines kinases. Notre étude a porté sur la caractérisation de l'adhérence des cellules hep g2 sur différents composes matriciels, l'identification des signaux émis et des récepteurs impliqués lors de cette adhérence. Les cellules hep g2 adhèrent de façon similaire sur la fn, la lm, les collagènes i et iv, mais elles adoptent des morphologies différentes. Contrairement à l'hypothèse généralement admise, nous avons montre que, quelle que soit la matrice, l'adhérence de ces cellules implique des signaux de même nature : protéines kinases c (pkc), protéines tyrosine kinases (ptk) et protéines kinases ca 2 +/calmoduline-dépendantes (camk). Les ptk et les camk sont indispensables pour entrainer l'attachement cellulaire, tandis que les pkc sont impliquées dans la phase d'étalement et la réorganisation du cytosquelette. Les intégrines sont des récepteurs membranaires de la matrice, connus pour permettre la transmission de signaux de la matrice vers la cellule. Nous avons déterminé que les cellules hep g2 expriment et utilisent de nombreux récepteurs intégrines (11, 21, 31, 51, 61, v3), spécifiques d'un ou plusieurs ligand(s) matriciel(s). Ceci montrait que, (1) les signaux émis ne dépendaient pas d'une intégrine particulière a une matrice, et que (2) d'autres types de récepteurs étaient impliques pour permettre l'adoption de morphologies cellulaires spécifiques. Notre étude a permis de démontrer la présence membranaire de deux lectines de spécificité n-acetylglucosamine, capables d'interagir avec la laminine. Ces lectines n'ont pas un rôle direct dans l'adhérence cellulaire, mais sont recrutées dans les sites focaux.

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Taquet, Alizée. "Évolution de la résistance aux insecticides au sein d’un complexe d’espèces de ravageurs dans un contexte d’invasion biologique : coût de la résistance et rôle de l’hybridation." Thesis, La Réunion, 2020. http://www.theses.fr/2020LARE0014.

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Abstract:

Bemisia tabaci est un insecte ravageur d’importance mondiale de par sa capacité à transmettre des phytovirus. Trois espèces d’aleurodes coexistent à La Réunion : l'espèce indigène IO, et deux espèces exotiques MEAM1 et MED-Q, qui ont successivement envahi l’île en 1997 et 2010. La principale stratégie de lutte contre ces espèces est l'utilisation d'insecticides, ce qui peut mener à l'émergence de résistances. Le principal objectif était de comprendre l’évolution de la distribution de ces espèces dans les agrosystèmes insulaires, au regard de leur spectre de résistance aux insecticides dans un contexte d’hybridation interspécifique. À cette fin, des aleurodes ont été échantillonnés dans 56 sites, génotypés pour 11 marqueurs microsatellites et pour deux loci kdr impliqués dans la résistance aux pyréthroïdes. Quinze populations ont été phénotypées pour la résistance à la pymétrozine et à l’acétamipride, et le coût de la résistance à l’acétamipride a été évalué. Les deux espèces envahissantes se retrouvent principalement dans les agrosystèmes, et possèdent des mutations de résistance kdr. La plupart des populations de MEAM1 sont résistantes à l'acétamipride, à la pymétrozine ou aux deux insecticides. La résistance à l’acétamipride ne semble pas soumise à un coût. L'espèce indigène IO a été principalement échantillonnée dans les zones non agricoles, ou en bordure d’agrosystèmes. Elle n'a aucune mutation de résistance aux pyréthrinoïdes et est sensible aux insecticides testés. Enfin, l'hybridation interspécifique (MEAM-IO) observée ne conduirait pas à l'introgression de mutations résistantes dans l’espèce indigène, mais possiblement à l’introgression de sensibilité chez MEAM1
Bemisia tabaci is a major insect pest distributed worldwide because of its ability to transmit phytoviruses. Three whitefly species coexist in Reunion Island: the native species IO, and two exotic species MEAM1 and MED-Q, which successively invaded the island in 1997 and 2010. The main control strategy against these species is the use of insecticides, which can lead to the emergence of resistance. The main objective was to understand the evolution of the distribution of the whitefly species, with regards to their insecticide resistance in a context of interspecific hybridization. To this aim, whiteflies were sampled in 56 sites, genotyped at 11 microsatellite markers and for two kdr loci involved in pyrethroid resistance. Fifteen populations were phenotyped for resistance to pymetrozine and acetamiprid using bioassays, and the cost of acetamiprid resistance was evaluated in MEAM1 populations displaying different resistance levels. The two invasive species are mainly found in agroecosystems and both have kdr resistance mutations. Most of the MEAM1 populations were also found to be resistant to acetamiprid, pymetrozine or both pesticides. No fitness costs appeared to be associated with resistance to acetamiprid in MEAM1. On the contrary, the indigenous species IO was mainly sampled in non-crop areas, or at the edge of agrosystems. It has no pyrethroid resistance mutations and is sensitive to the insecticides tested. Finally, the interspecific hybridization (MEAM-IO) observed between IO and MEAM1 did not lead to the introgression of resistant mutations into the indigenous species, but possibly to the introgression of susceptibility in MEAM1

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Tournamille, Christophe. "Bases moléculaires et relations structure/fonction des antigènes de groupe sanguin Duffy : récepteur de chimiokines et de Plasmodium vivax." Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05S001.

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Abstract:

Les antigènes de groupe sanguin duffy présentent un grand intérêt en médecine clinique car ils sont impliqués non seulement dans les risques transfusionnels et occasionnellement dans la maladie hémolytique du nouveau-né, mais aussi dans l'invasion des globules rouges par l'hemoparasite plasmodium vivax. Le locus duffy localise sur le chromosome 1 en position Q22-Q23, est compose de quatre allèles : fy*a et fy*b, codant respectivement les antigènes fy a et fy b, fy*x et fy*fy. Chez les caucasiens, les trois phénotypes fy(a+b), fy (ab+) et fy (a+b+), définis avec les sérums anti-fy a et anti-fy b, ont une fréquence de 0,182, 0,33 et 0,47. Les antigènes Duffy sont portes par une glycoprotéine de 336 acides aminés, nommée duffy antigen/receptor for chemokines (DARC), qui peut fixer avec une forte affinité les chimiokines appartenant aux familles CXC OU CC. Nous avons déterminé les bases moléculaires du polymorphisme fy a/fy b. Les allèles fy*a et fy*b diffèrent par une mutation du nucléotide 131 (g131a) entrainant une substitution d'acide amine en position 42 (gly42asp) dans la partie extracellulaire n-terminale de la protéine duffy. L'allèle fy*fy, qui ne produit aucun des antigènes fy a ou fy b phénotype fy (ab), est très rare chez les caucasiens mais représente l'allèle majeur dans la population noire (fréquence 70%). Nous avons montre que l'allèle fy*fy possède la séquence codante normale de l'allèle fy*b mais porte une mutation dans le promoteur en position 46. Cette mutation abolit la transcription erythroide du gène DARC en empêchant la fixation du facteur de transcription erythroide hgata-1. L'allèle fy*x est caractérisé par une faible expression de l'antigène fy b et des épitopes fy3, fy5 et fy6. Nous avons montre que l'antigène fy x correspond à une expression très réduite de l'antigène fy b du fait d'une substitution r89c sur le polypeptide fy b. DARC n'est pas exprimée seulement dans les cellules erythroides, mais aussi à la surface des cellules endothéliales des veinules post-capillaires de la plupart des tissus et par les cellules de Purkinje dans le cervelet. Des ARNS de 1,35kb et de 7,5kb, ont été détectes dans des extraits de cerveau. Nous avons démontré que le même polypeptide DARC est exprimé dans tous les tissus mais que l'ARN de 7,5kb retrouve dans le cerveau est produit par l'utilisation d'un promoteur spécifique. La fonction précise de DARC n'est pas encore élucidée, mais ses fonctions réceptrices pour les chimiokines et l'agent paludéen p. Vivax nous ont amené à analyser les interactions récepteur/ligand. Nos résultats indiquent que la formation de la poche de fixation des chimiokines sur la protéine DARC nécessite le rapprochement des premier et quatrième domaines extracellulaires par un pont disulfure.

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Imbert, Daniel. "Nouveaux ligands à charpente tripodale carbonée en vue de la complexation du fer en milieu hydrophile ou lipophile." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2000. http://www.theses.fr/2000GRE10112.

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Abstract:

De nouveaux ligands tripodaux possedant deux types de sous-unites chelatantes (8-hydroxyquinoleine et catechol) ont ete prepares. Pour ce faire, un nouvel espaceur tripodal comportant un motif tris (aminopropyl)methane diversement fonctionnalise a ete developpe, permettant le greffage de ces sous-unites par des liaisons de type amide. Les complexes de fer correspondants ont ete prepares et caracterises par spectrometrie de masse et spectrophotometrie uv-visible. Des etudes physico-chimiques ont permis de determiner les caracteristiques thermodynamiques en solution aqueuse (constantes d'acidite des ligands, constantes de formation des complexes, courbes de distribution des especes en fonction du ph) de deux ligands choisis pour leur interet biologique. Une etude de lipophilie a ete conduite sur ces ligands tripodaux, montrant leur aptitude a mobiliser le fer en milieu aqueux et/ou organique en fonction de leurs caracteristiques structurales. Deux modeles de transport du fer au travers d'une membrane biologique ont ete developpes. Des etudes biologiques sur des cultures cellulaires ont permis de montrer l'aptitude de ces ligands a la nutrition siderique des cellules vegetales et le traitement de la chlorose ferrique ainsi que leur capacite a mobiliser le fer de cellules animales surchargees et prevenir les effets toxiques.

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Merabet-Bouraoui, Naïma. "Synthèse et évaluation biologique d'inhibiteurs de la dimérisation de la protéase du VIH-1." Paris 11, 2004. http://www.theses.fr/2004PA110048.

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Abstract:

La protéase (PR) joue un rôle prépondérante dans le cycle de réplication du VIH-1. Dans ce travail, nous avons poursuivi la stratégie élaborée dans notre laboratoire en développant des pinces moléculaires constituées du naphtalène ou de la quinoléine et portant deux brins peptidiques différents dont le tripeptide V-L-V-OMe. L'autre brin est soit un peptide qui reproduit la séquence N- ou C- terminale du monomère de la PR, soit un analogue de PamY-E-L de Schramm ou un peptidomimétique ayant une structure contrainte. Les études cinétiques de l'activité inhibitrice de ces pinces ont confirmé la validité du concept d'antidimères à noyau central rigide et le choix du peptide V-L-V-OMe comme un des brins
New "molecular tongs" based on naphthalene and quinoline scaffolds linked to two peptidic strands were synthesized. They were designed to prevent dimerization of RN -1 protease, at the antiparallelj3- sheet structure level involving N- and C-termini of each monomer. Seventeen new molecular tongs were synthesized with dipeptidic or tripeptidic strands. These molecules were assayed on HIV-1 protease following Zhang kinetic techniques. Twelve molecules were shown as pure dimerization inhibitors, mostly in submicromolar range. Dimerization inhibition was ascertained using ANS fluorescence and gel filtration experiments which showed the dissociation of HIV-1 protease dimeric form in presence of synthesized molecular tongs

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Normand-Bayle, Marie. "Synthèse et activité biologique de nouvelles styrylquinoléines inhibitrices de l'intégrase du VIH-1." Paris 11, 2004. http://www.theses.fr/2004PA114822.

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Abstract:

Le Laboratoire de Synthèse organique de la Faculté de Pharmacie a récemment développé des styrylquinoléines polyhydroxylées qui sont de puissants inhibiteurs de l'intégrase du VIH-1 et bloquent sa réplication en culture cellulaire. Dans ce travail, nous décrivons la synthèse et l'activité biologique de nouvelles styrylquinoléines, modifiées soit au niveau de leur partie ancillaire, soit en leur position C-7. Certaines de ces molécules présentent une activité submicromolaire in vitro et micromolaire sur culture cellulaire
It is known that AIDS can nowadays be temporarily controlled, but not eradicated with current treatments. It is therefore important to identify new agents targeting HIV-1 at a step of its replicative cycle which is not yet affected by the above combination therapy. In this respect, it is essential to develop inhibitors of the third essential enzyme of HIV-1 : integrase (IN). Our Laboratory has recently reported that polyhydroxylated styrylquinolines are potent inhibitors of IN that block the replication of the virus in cell culture. In this, we describe the synthesis of styrylquinolines with new ancillary aromatic nuclei. We also deveoped a method to introduce several functionnalized groups in the C-7 position of the quinoline moiety. The results show that some of these new compounds have micromolar or submicromolar activities in teh same range as styrylquinolines

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YOU, BRUNO. "Caracterisation biologique et moleculaire d'isolats vih-1 de republique centrafricaine." Paris 6, 1993. http://www.theses.fr/1993PA066720.

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Abstract:

Les isolats vih-1 de centrafrique (rca) montrent une variabilite importante au niveau de leurs proprietes biologiques, et de leurs sequences genetiques etudiees ici. Les phenotypes replicatif et cytopathogene que nous avons observes pourraient correspondre a ceux deja decrits dans la litterature. Neanmoins aucune correlation entre le stade clinique de l'infection chez ces patients et le phenotype biologique des virus n'est observee. L'analyse phylogenetique a partir des sequences d'une region du gene gag et de la region v3, indiquent une importante divergeance des isolats de rca, non seulement avec les isolats d'autres region du monde mais aussi entre eux. Sur la base des sequences nucleiques v3, les 19 isolats de rca se distribuent dans 5 sous-types phylogenetiques correspondant a ceux definis par g. Myers et coll. La classification des sequences aminees realisee sur des criteres de similitudes entre les acides amines (incluant la charge, le caractere, l'encombrement spatial) indique que les isolats de rca pourraient ne se regrouper qu'en 3 groupes majeurs, suggerant alors la presence d'homologies structurales entre des sequences phylogenetiquement distantes. Dans une perspective vaccinale, basee sur les proprietes immunogeniques de la region v3, ces resultats pourraient etre encourageants. Toutefois une importante variabilite du motif octapeptidique central, decrit comme l'epitope lineaire majeur de neutralisation, est observe. Ces divergeances entre les isolats de centrafrique doivent desormais etre investiguees par des experiences de neutralisation croisee, pour etablir le degre de correlation entre la classification des sequences aminees de la region v3 et le serotypage

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Bénard, Christophe. "Synthèse et activité biologique de nouveaux inhibiteurs de l'intégrase du VIH-1." Paris 11, 2003. http://www.theses.fr/2003PA114820.

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Abstract:

Actuellement les efforts en chimiothérapie du SIDA portent sur deux principales cibles: la transcriptase inverse et la protéase. Cependant l'émergence rapide de résistances à ces traitements rend hautement souhaitable le développement d'inhibiteurs de la troisième enzyme clé de la réplication du virus : l'intégrase. Notre Laboratoire a récemment développé des styrylquinoléines polyhydroxylées qui sont de puissants inhibiteurs de l'intégrase du VIH-1 et bloquent sa réplication en culture cellulaire. Dans ce travail, nous décrivons la synthèse et l'activité biologique d'une nouvelle classe d'inhibiteurs apparentés aux styrylquinoléines, mais possédant un bras espaceur modifié: amide, hydrazide, urée, dicétone-1,3. Les molécules obtenues présentent une activité micromolaire ou submicromolaire du même ordre de grandeur que les styrylquinoléines avec une nette amélioration de la cytotoxicité
It is known that AIDS can nowadays be temporarily controlled, but not eradicated with current treatments against reverse transcriptase and protease. It is therefore important to identify new agents targeting HIV-1. Ln this respect, it is essential to develop inhibitors of the third essential enzyme of HIV-1 : integrase (IN). Our Laboratory bas recently reported that polyhydroxylated styrylquinolines are potent inhibitors of IN that block the replication of the virus in cell culture. In the present work, we report the preliminary results of our expanded SAR investigation directed towards the replacement of the ethylenic linker of the styrylquinolines by functionalized spacers: amide, hydrazide, urea or diketone-1,3 linker in order to increase affinity with the core domain of the protein. The results show that some of these new compounds have micromolar or submicromolar activities in the same range as styrylquinolines. However, an improvement of cytotoxicity is clearly noticed

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Liotard, Jean-François. "Un nouveau type de prodrogues anti-VIH : principe, synthèse et évaluation biologique." Nice, 2004. http://www.theses.fr/2004NICE4113.

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Abstract:

Le traitement actuel des malades séropositifs (VIH+) est un traitement au long cours puisque l’éradication du virus n’est, pour le moment, pas possible. La diminution de la toxicité des médicaments actuellement utilisés est donc un sujet d’intérêt. Dans ce cadre, nous avons pris comme modèle l’AZT pour analyser s’il est possible de diminuer sa toxicité par couplage de cet analogue de nucléoside à des peptides susceptibles d’être libérés par la protéase du VIH tout en conservant son activité antivirale. L’hydrolyse par la protéase du VIH pourrait conduire à une libération préférentielle dans les cellules affectées. 19 composés peptidiques esters de l’AZT différents ont été synthétisés. Leur stabilité dans différents milieux biologiques a été évaluée. L’évaluation de l’activité anti-VIH montre que certains composés sont aussi actifs que l’AZT. Cependant, aucun des sept composés sélectionnés n’est hydrolysé par la protéase virale. 9 composés phosphoramidates différents de l’AZT-MP ont été préparés. Seuls trois d’entre eux sont stables dans le milieu de culture. Les six autres se dégradent rapidement. L’évaluation de leurs activités anti-VIH montre qu’ils sont moins actifs que l’AZT et que les 19 composés esters
The actual treatment of HIV patients is a long treatment because the virus eradication is not yet possible. The toxicity’s diminution of the actual drugs used is then an interesting subject. Within this framework, we chose the AZT like a model for analysing if it’s possible to reduce its toxicity by connecting this nucleoside to peptides ; which are possibly liberated by the HIV protease while conservating this activity. The HIV protease hydrolysis may conduct to a preferential liberation in infected cells. 19 different AZT-peptidics esters compounds have been synthesised. Their stability in different biological medium has been evaluated. The anti-HIV activity shows some compounds are as active as AZT. However, no one of these 7 selected compounds is hydrolysed by the viral protease. 9 different AZT-MP phosphoramidates compounds have been prepared. Only 3 of them are stable in the culture medium. The 6 others are deteriorating quickly. Their anti-HIV activity shows that they are less active than the AZT and than the 19 ester compounds

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Jourdes, Michaël. "Réactivité, synthèse, couleur et activité biologique d'ellagitannins C-glycosidiques et flavano-ellagitannins." Bordeaux 1, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR12721.

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Abstract:

Les vins de qualité son généralement élevé en fûts de chêne pendant 6 à 18 mois ce qui permet au vin d'améliorer ces qualités organoleptiques. Au cours de ce contact avec le bois, le vin s'enrichit en ellagitannins C-glycosidiques. Au cours de ce travail, nous nous sommes notamment intéressés au mécanisme d'évolution des ellagitannins C-glycosidiques en milieu acide conduisant à formation de divers produits de substitution nucléophile entre la vescalagine et différents nucléophiles présent dans le vin. L'hemisynthèse des flavano-ellagitannins (les acutissimines et les épiacutissimines) a été réalisée par une substitution nucléophile en milieu acide entre la vescalagine et la catéchine ou l'épicatechine. Leurs identifications et leurs dosages dans un vin rouge élevé en fûts de chêne a été effectuées par HPLC-ESI-MS. L'orientation stéréospécifique de l'attaque nucléophile sur le carbocation intermédiaire a été rationalisé par modélisation moléculaire. L'hémisynthèse du premier membre d'une nouvelle famille de composés, les anthocyano-ellagitannins, a également été réalisé par la condensation entre la malvidine et la vescalagine. La formation de ces produits dans le vin représente la première hypothèse vérifiée de l'évolution chimique des ellagitannins C-glycosidiques dans les vins
Great red wines are generally aged in oak barrels for a period from 6 to 18 months, which contributes to improve their organoleptic quality. During this contact with wood in the barrel the wine solution extracts many substances including some C-glucosidic ellagitannins. During this work, we focused on the evolution of C-glucosidic ellagitannins in acidic medium leading to the formation of various products from nucleophilic substitution reactions with vescalagine and various nucleophilic species present in wine. The hemisynthesis of flavano-ellagitannins (acutissimins and epiacutissimins) was achieved via a nucleophilic substitution reaction between vescalagin and catechin and epicatechin in an acidic medium. Their identification and quantification in a red wine aged in oak barrel were carried out by HPLC-ESI-MS. The remarkable stereospecificity of these substitution reactions was examined by molecular modelling of the benzylic cation intermediate. The hemisynthesis of the first member of a new class of compounds called anthocyano-ellagitannins was achieved via a nucleophilic substitution reaction between vescalagin and malvidin. This new complex shows a bathochromic shift of about 15 nm compared to the maximum wavelength of the initial anthocyanin

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Heurtebise, Jean-Yves. "Penser la Vie : la Vie comme Liaison." Aix-Marseille 1, 2007. http://www.theses.fr/2007AIX10046.

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Abstract:

Il y a deux manières communes de définir la vie : comme organisme à travers la science biologique ou comme sujet à travers l'analyse psychologique. Or, la définition classique du vivant repose sur une opposition entre le monde organique et le monde inorganique dont la biologie contemporaine a montré la limite. La cosmologie montre qu'on ne peut plus définir la vie matérielle objective par référence au seul vivant : tout dans l'univers vit et devient, naît et se transforme. D'autre part, la définition psychologique du vécu implique une concepion idéaliste refermant le sujet sur lui-même. Or, la vie psychique subjective est l'aventure d'une individuation singulière au contact d'événements trouant la trame ordinaire d'existence. "Penser la vie de façon philosophique demande de replacer le biologique à l'intérieur du cosmologique et de trouver, derrière la personne et ses propriétés, l'individu et ses devenirs". La vie comme liaison désigne moins une chose (sujet psychologique ou objet biologique) qu'un processus défini par les événements de relations le constituant dans le temps.

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Peyrollier, Karine. "Clonage et caractérisation de l'endosulfine-α, un régulateur potentiel des canaux KATP sensibles aux sulfonylurées." Paris 5, 1998. http://www.theses.fr/1998PA05S025.

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Abstract:

Les sulfonylurees hypoglycémiants sont les médicaments les plus utilisés dans le traitement du diabète de type II. Un récepteur spécifique de ces molécules a récemment été cloné. Il est étroitement associe à une sous-unité de la famille KIR 6. X pour former un canal K A T P fonctionnel. Ce canal est localise dans de nombreux tissus comme le système nerveux central, les muscles squelettiques, le cœur, le pancréas l'existence d'un ligand endogène se trouvant à proximité de ce canal a été prouvée, dans le système nerveux central de rat, de porc et de mouton. Ce ligand endogène, appelé endosulfine existe sous deux formes moléculaires, et la forme a été purifiée. Les séquences partielles obtenues après digestion trypsique de la protéine, ont montrées de fortes homologies avec une protéine précédemment purifiée l'ARPP-19. L'ARPP-19 ayant été cloné chez le bœuf et l'endosulfine- chez le porc, nous nous demandions si les différences observées reflétaient les différences d'espèces ou s’il s'agissait de deux protéines distinctes. Pour répondre à cette question, l'endosulfine- et l'ARPP-19 ont été cloné chez le porc, le bœuf, le rat et la souris. Il est alors apparu que ces deux protéines étaient différentes mais avaient de fortes homologies de séquences. L'ARPP-19 et l'endosulfine- sont très conservées entre les espèces ce qui indique leur importance. La répartition tissulaire de ces deux protéines a été envisagée. L'endosulfine- a été localisée dans tous les tissus à un état basal, mais en plus grande quantité dans les tissus du système nerveux central, particulièrement dans le cervelet, ainsi que dans le muscle squelettique et les ilots de Langerhans. Quant à l'ARPP-19, sa répartition tissulaire est très différente de celle de l'endosulfine. En effet, cette protéine a été détectée à un niveau basal dans tous les tissus, mais elle est particulièrement abondante dans le bulbe olfactif, le rein et le pancréas.

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Gauchet, Aurélie. "Observance thérapeutique et VIH : enquête sur les facteurs biologiques et psychosociaux /." [Paris] : l'Harmattan, 2008. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb41402415x.

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Abstract:

Thèse de doctorat--Psychologie--Metz--Université Paul Verlaine, 2005. Titre de soutenance : Les déterminants psychosociaux de l'observance thérapeutique chez les personnes infectées par le VIH : représentations et valeurs.
Bibliogr. p. 231-242.

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Chacón, Leiva Natalia. "Βίος et ζωή chez Aristote : qu’est-ce que la vie pour un biologiste?" Electronic Thesis or Diss., Paris 8, 2014. http://www.theses.fr/2014PA080042.

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Abstract:

Le présent travail s’inscrit dans une démarche de reconstitution de la notion de vie au sein de la pensée antique. Il s’agit de rétablir son sens au coeur de la langue et de la culture grecque, et particulièrement, à l’intérieur de la philosophie et de la pensée aristotélicienne. L’étude s’organise autour de deux termes fondamentaux et propres à la langue grecque, à savoir les mots βίος et ζωή. La première partie s’attache à dégager la forme et le sens «original» des mots, et étudie les facteurs linguistiques et culturels intervenant dans la formation et l’évolution de la forme et du sens des mots en question. Les mots βίος et ζωή se présentent donc comme les éléments structurants de cette étude. La reconstitution du contexte historico-linguistique des mots conduit à la deuxième partie de ce travail, où sont analysés le travail de poètes tels Homère et Hésiode, ainsi que des premiers philosophes, usuellement nommés présocratiques. Dans cette partie du travail de recherche, la notion de vie est dégagée de l’enquête naturelle menée par les premiers penseurs, ainsi que des images fournies par la tradition poétique. Après avoir replacé la notion de vie au sein de son contexte historico-culturel et linguistique, on entame l’étude de la pensée aristotélicienne sur la vie. L’interrogation de départ tient au fait de déterminer si la notion de «vie» chez Aristote passe nécessairement et uniquement par l’étude des êtres vivants et de l’âme, ou si elle dépasse la finalité biologique pour embrasser autres domaines de sa philosophie. Cette partie vise une approche intégrationniste et dynamique de la vie à l’intérieur de la pensée aristotélicienne. La reconstitution de la notion de vie chez Aristote amène à une réflexion sur son lien avec l’enquête naturelle menée par les premiers penseurs. En dernier ressort, l’hétérogénéité de cette étude permet de voir de quelle façon Aristote, certes pionnier dans les recherches sur la vie, conserve pourtant toujours une structure de pensée propre à la Grèce antique : Aristote élabore sa pensée à partir et à l’intérieur de son temps et de la tradition qui lui précède
The reconstitution of the notion of life within the ancient philosophy is the principal idea of the present study. The aim is to re-establish the conception of this notion within the Greek language and culture, especially within the knowledge of early philosophers and the philosophy of Aristotle. The arrangement of this contribution is based on the meaning and relation of the words βίος and ζωή, two fundamental terms, exclusive to the Greek language. The first part of the study shed new light on the formal constitution and «original» meaning of these words. In particular the linguistic and cultural factors which converge in their formation and evolution are investigated in detail. The reconstruction of the historical and linguistic context of the words βίος and ζωή gives rise to the second part of the study by the means of reconstructing the notion of life within the poetical tradition and investigation of nature, conducted by the early philosophers. The third part of the study approaches the notion of life in the philosophy of Aristotle from the principle question at issue: whether the idea of life is reduced to the investigation of living organisms and his theory of soul or if it exceeds the biologic purpose to encompass other categories of his philosophy. This analysis of the notion of life within the philosophy of Aristotle is conducted by an integrating and dynamic perspective. The reconstitution of the notion of life in the work of Aristotle leads to a reflection about the closeness of his ideas to anterior investigations of natural objects and processes done by the early philosophers. Apart from being a pioneer in the investigation of life, he is also tributary to a particular kind of thinking in ancient Greece. Aristotle’s way of thinking, although far-reaching, is based within his period and preceding traditions

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Chacón, Leiva Natalia. "Βίος et ζωή chez Aristote : qu’est-ce que la vie pour un biologiste?" Thesis, Paris 8, 2014. http://www.theses.fr/2014PA080042.

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Abstract:

Le présent travail s’inscrit dans une démarche de reconstitution de la notion de vie au sein de la pensée antique. Il s’agit de rétablir son sens au coeur de la langue et de la culture grecque, et particulièrement, à l’intérieur de la philosophie et de la pensée aristotélicienne. L’étude s’organise autour de deux termes fondamentaux et propres à la langue grecque, à savoir les mots βίος et ζωή. La première partie s’attache à dégager la forme et le sens «original» des mots, et étudie les facteurs linguistiques et culturels intervenant dans la formation et l’évolution de la forme et du sens des mots en question. Les mots βίος et ζωή se présentent donc comme les éléments structurants de cette étude. La reconstitution du contexte historico-linguistique des mots conduit à la deuxième partie de ce travail, où sont analysés le travail de poètes tels Homère et Hésiode, ainsi que des premiers philosophes, usuellement nommés présocratiques. Dans cette partie du travail de recherche, la notion de vie est dégagée de l’enquête naturelle menée par les premiers penseurs, ainsi que des images fournies par la tradition poétique. Après avoir replacé la notion de vie au sein de son contexte historico-culturel et linguistique, on entame l’étude de la pensée aristotélicienne sur la vie. L’interrogation de départ tient au fait de déterminer si la notion de «vie» chez Aristote passe nécessairement et uniquement par l’étude des êtres vivants et de l’âme, ou si elle dépasse la finalité biologique pour embrasser autres domaines de sa philosophie. Cette partie vise une approche intégrationniste et dynamique de la vie à l’intérieur de la pensée aristotélicienne. La reconstitution de la notion de vie chez Aristote amène à une réflexion sur son lien avec l’enquête naturelle menée par les premiers penseurs. En dernier ressort, l’hétérogénéité de cette étude permet de voir de quelle façon Aristote, certes pionnier dans les recherches sur la vie, conserve pourtant toujours une structure de pensée propre à la Grèce antique : Aristote élabore sa pensée à partir et à l’intérieur de son temps et de la tradition qui lui précède
The reconstitution of the notion of life within the ancient philosophy is the principal idea of the present study. The aim is to re-establish the conception of this notion within the Greek language and culture, especially within the knowledge of early philosophers and the philosophy of Aristotle. The arrangement of this contribution is based on the meaning and relation of the words βίος and ζωή, two fundamental terms, exclusive to the Greek language. The first part of the study shed new light on the formal constitution and «original» meaning of these words. In particular the linguistic and cultural factors which converge in their formation and evolution are investigated in detail. The reconstruction of the historical and linguistic context of the words βίος and ζωή gives rise to the second part of the study by the means of reconstructing the notion of life within the poetical tradition and investigation of nature, conducted by the early philosophers. The third part of the study approaches the notion of life in the philosophy of Aristotle from the principle question at issue: whether the idea of life is reduced to the investigation of living organisms and his theory of soul or if it exceeds the biologic purpose to encompass other categories of his philosophy. This analysis of the notion of life within the philosophy of Aristotle is conducted by an integrating and dynamic perspective. The reconstitution of the notion of life in the work of Aristotle leads to a reflection about the closeness of his ideas to anterior investigations of natural objects and processes done by the early philosophers. Apart from being a pioneer in the investigation of life, he is also tributary to a particular kind of thinking in ancient Greece. Aristotle’s way of thinking, although far-reaching, is based within his period and preceding traditions

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Vauzour, David. "Etude des propriétés biologiques des constituants des vins de champagne." Montpellier 1, 2004. http://www.theses.fr/2004MON13513.

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Abstract:

"Il a été observé dans le cadre d'enquête épidémiologiques tentant d'expliquer le " French paradox " qu'une consommation modérée et journalière de vin permet d'abaisser quantitativement les risques d'apparition d'accident cardiovasculaires et/ou de cancer. La communauté scientifique s'est particulièrement intéressée aux vins rouges ou blancs, mais les études portant sur le vin de Champagne sont rares. Partant du champagne en bouteille, il s'est donc agi dans un premier temps de préparer trois " blocs " représentant la totalité des constituants de champagne en distinguant les blancs de blanc des blancs de noirs. Ils ont été séparés par chromatographie de partage centrifuge, bioguidée en fonction des réponses des fractions à des tests d'activité biologique. Ainsi, en plus de celles connues jusque là, six nouvelles molécules ont pu être caractérisées par Résonance Magnétique Nucléaire et/ou spectrométries de masses et ultraviolette. "

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Monziols, Guillaume. "La dématérialisation de l’accès aux tests génétiques au regard des droits et obligations des partenaires à la relation de soins." Thesis, Montpellier, 2017. http://www.theses.fr/2017MONTD047.

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Abstract:

La dématérialisation de l’accès aux tests génétiques apparaît comme un outil concourant à satisfaire l’ensemble des composantes du droit à la protection de la santé. En effet, en la matière, la spécialisation de la médecine induit une limitation des personnes habilitées à prescrire des tests génétiques. Aussi, la recherche de la meilleure sécurité sanitaire possible pour la réalisation des tests génétiques induit des problématiques d’égal accès aux laboratoires de biologie médicale autorisés à cet effet, mais auxquelles la dématérialisation peut apporter des réponses. Aussi, elle n’apparaît pas être antinomique de l’autonomie des patients, bien qu’elle présente des faiblesses
The dematerialization of access to genetic testing appears to be a tool to satisfy all the aspects of the right to health protection. Indeed, in this field, the specialization of medicine induces a limitation of the numbers of persons entitled to prescribe genetic tests. The quest for the best quality and health security for the realization of the genetic tests induces problems of equal access to the laboratories of medical biology authorized for this purpose, but to which dematerialization can give answers. Also, dematerialization does not appear to be antinomic of patient autonomy, although it presents weaknesses

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Carasso, Anne. "Forme, organisme, connaissance : le statut de la connaissance mis en question par les philosophies de la forme et du vivant." Aix-Marseille 1, 2006. http://www.theses.fr/2006AIX10107.

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Abstract:

Ce travail pose la question des rapports complexes et multiples qui relient la connaissance à la vie, et s'efforce de retrouver ce cheminement de la connaissance qui semble la conduire, jusque dans l'épistémologie contemporaine, à ne pouvoir traiter du vivant ou de l'humain autrement qu'au regard des décisions métaphysiques ou ontologiques qui sont à son fondement. Les philosophies contemporaines de la forme et du vivant, abordées ici à partir de la lecture commune que Merleau-Ponty et Canguilhem vont faire de "La Structure de l'organisme" de Goldstein, constituent une étape essentielle de la rupture opérée avec la pensée duelle de la vie et de la connaissance, et de l'engagement de l'épistémologie contemporaine vers l'élaboration d'une nouvelle intelligibilité du vivant, à la lumière des résultats de la reurobiologie de Goldstein : les troubles organiques compromettent la totalité de l'organisme, et ce n'est que dans une vision du tout que l'on peut comprendre les phénomènes vivants. Mais plus que les développements philosophiques de Goldstein, sur lesquels prend appui Merleau-Ponty pour élaborer sa philosophie du vécu, nous situerons avec Canguilhem l'apport majeur de Goldstein dans l'enseignement que l'on peut tirer de la méthode mise en oeuvre : celle d'une clinique pathologique seule en mesure de restituer l'activité du vivant dans sa temporalité propre, qui contribue à mettre en lumière la nature de cet "impensé du concept" sur lequel buttent les sciences du vivant. N'est-ce pas cette part d'impensé qui concentre l'essence même du vivant ? Nous réfléchirons à cette question à la lumière de l'ergologie, et des travaux de Prigogine sur les structures dissipatives et l'historicité de la matière active.

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Legendre, Christophe. "Interactions virus de l'immunodéficience humaine (VIH)/lymphocytes B au sein des tissus lymphoïdes secondaires." Paris 5, 1998. http://www.theses.fr/1998PA05S002.

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Abstract:

L'infection à VIH entraine, dès ses phases initiales, de graves perturbations du compartiment lymphocytaire b, tant au plan de l'activation et de l'ontogénie, qu'au plan fonctionnel. Au plan théorique, trois types de mécanismes peuvent participer à l'altération du compartiment b au cours de la maladie lentivirale : 1) l'infection des lymphocytes b par le VIH, 2) la stimulation directe des lymphocytes b par les antigènes viraux et 3) les désorganisations viro-induites des divers microenvironnements successifs des cellules b, et plus particulièrement des centres germinatifs. L'objet de notre travail a été de préciser les conséquences de l'infection par le VIH pour les lymphocytes b et leurs fonctions, avec un intérêt plus spécial pour les conditions micro-environnementales des centres germinatifs. Aucune infection des lymphocytes b n'a pu être démontrée à ce jour, in vivo. Toutefois, les lymphocytes b peuvent constituer une cible potentielle du VIH puisqu'une infection in vitro de ces cellules a pu être obtenue. A l'aide de notre modèle in vitro d'infection des cellules b, nous avons, tout d'abord, déterminé avec précision les mécanismes d'entrée du virus dans les lymphocytes b normaux des organes lymphoïdes secondaires. Deux voies majeures d'entrée du virus ont été trouvées : la voie classique impliquant le récepteur cd4, et la voie des récepteurs au complément cd21 et cd35. Nous avons ensuite étudié les effets des interactions cd40-cd154, et des cytokines du microenvironnement folliculaire, sur la régulation de la réplication du VIH au sein des lymphocytes b infectes in vitro. Les résultats ont montré qu'une pré-activation des cellules b, avant infection par le VIH, par des esters de phorbol ou des anticorps anti-cd40 additionnes d'il-4 augmentait de manière substantielle la réplication du VIH dans les lymphocytes b. Indépendamment de toute pré activation, l'ajout d'il-2, avec ou sans il-4, et dans une moindre mesure, les interactions cd40-cd154 conduisaient, après la mise en culture des lymphocytes b infectes, a une augmentation importante de la réplication virale. Cette réplication induite par les cytokines est régulée négativement lorsque de l'il-10 est ajoute au milieu de culture. Au niveau des tissus lymphoïdes, les lymphocytes t cd4+ des centres germinatifs sont les principales cellules répliquant le virus. Nous nous sommes donc intéressés aux conséquences de la costimulation t-b sur la réplication virale des lymphocytes t infectes par le VIH. Les résultats ont montré que les signaux induits par le récepteur cd86 jouaient un rôle plus important sur la réplication du VIH dans les lymphocytes t que ceux induits par le récepteur cd80. En final, nous avons recherche les conséquences in vivo de l'infection sur les lymphocytes b des centres germinatifs par une étude immunohistochimique effectuée à l'aide de coupes congelées de ganglions hyperplasiques de patients séronégatifs et séropositifs pour le VIH. Les résultats ont révélé, en plus de ceux déjà décrits par la littérature, une perte importante de la polarisation des centres germinatifs des patients infectes par le VIH. De plus, nous avons observé une diminution importante de l'expression du marqueur cd80 chez les patients infectés alors que l'expression de cd86 demeurait présente chez ces derniers, avec une intensité comparable à celle observée chez les patients séronégatifs. L'ensemble de ces résultats montre que le microenvironnement spécialisé qu'est le centre germinatif, constitue, tant par la présence des virions opsonises que par la nature des interactions cellulaires, un site très favorable à l'infection des cellules et a la réplication du virus dans les lymphocytes b et t. Ces centres participent donc activement à la chronicité et à l'évolution de la maladie notamment en raison de leur forte altération architecturale et fonctionnelle.

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Agnaniet, Huguette. "Synthèse et activité biologique d'antiviraux dérivant de la thymidine." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20041.

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Abstract:

Ce travail porte sur la synthese et l'activite biologique de deux series d'antiviraux potentiels derivant de la thymidine. La premiere serie est axee sur la synthese par la reaction de mitsunobu de bioconjugues de l'azt par association avec des acides carboxyliques a chaines saturees ou non. L'evaluation biologique de ces derives debouche sur une etude de correlation structure-activite qui montre que la lipophilie et la constante catalytique d'hydrolyse enzymatique sont les parametres majeurs controlant l'activite biologique. La deuxieme serie porte sur la synthese de phosphonates derivant de la thymidine par une reaction de michaelis-arbuzov. Une nouvelle methode de preparation des phosphonates a partir de derives anhydros et d'hydrogenophosphites a ete mise au point. Une evaluation biologique de ces composes sur des cellules mt#4 ou cem montre que ceux-ci presentent une activite contre le virus du sida, ainsi que sur d'autres virus. Enfin, une amorce de synthese de pseudodinucleotides derivant de ces phosphonates est decrit dans ce dernier paragraphe

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Huneman, Philippe. "Métaphysique et biologie : Kant et la constitution du concept d'organisme." Paris 1, 2000. http://www.theses.fr/2000PA010620.

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Abstract:

Cette thèse étudie les rapports de la philosophie kantienne avec la constitution, à la fin du XVIIIème siècle, de l'évidence du concept d'organisme comme auto-organisation (et non plus complexe âme-corps), schème récurrent pour appréhender scientifiquement le vivant, présent à la base de la biologie naissante comme science autonome. Elle spécifie plusieurs moments de ce processus : la revendication d'une irréductibilité de l'organique au mécanique chez Stahl et Leibniz, la théorie de l'économie animale comme intelligible à partir de propriétés vitales chez les vitalistes français ou Haller, la nouvelle définition de l'espèce chez Buffon, et surtout l'embryologie wolffienne, dont elle montre l'importance dans la définition kantienne de l'organisme; elle étudie enfin la dimension régulatrice, au sens kantien, du concept goethéen de type et surtout du principe cuvierien des conditions d'existence dans l'anatomie comparée. Elle démontre comment la critique par Kant de la notion métaphysique de contingence chez Leibniz, à partir de la pensée de l'ordre dans l'unique fondement. . . , aboutit dans la seme critique à un concept de contingence comme essentiellement relatif à la forme de notre pensée finie, forme qui rend nécessaire un concept de « fin naturelle », lequel à un usage régulateur pour la formation des énoncés biologiques. L'autonomie scientifique de la biologie se traduit philosophiquement chez Kant, grâce à l'éviction des connotations démiurgiques et utilitaires de la finalité, par la naturalisation de la finalité, donc la rupture entre histoire naturelle et théologie. On en déduit certaines caractéristiques des rapports entre philosophie et sciences de la vie après Kant - en particulier la possibilité des «philosophies de la nature », et l'actualité de la finalité dans le darwinisme.

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Le, Vu Stéphane. "Estimation de l'incidence de l'infection par le VIH en France à l'aide d'un test biologique d'infection récente." Paris 11, 2010. http://www.theses.fr/2010PA11T013.

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Abstract:

La connaissance de l'incidence de l'infection par le VIH est cruciale pour appréhender la dynamique de l'épidémie de VIH/sida, afin de mesurer les besoins en termes de prévention ou l'impact des interventions pour contrôler cette maladie. Cependant, les méthodes classiques d'estimation sont difficiles à mettre en oeuvre pour estimer l'incidence de cette infection. Une nouvelle approche d'estimation, reposant sur la caractérisation, par un test biologique, d'individus récemment infectés parmi une population de personnes séropositives a été proposée au milieu des années 1990. Cette approche présente l'avantage de pouvoir fournir une estimation d'incidence à partir d'un échantillon constitué à un moment donné de personnes diagnostiquées, sans suivi longitudinal. En France, la surveillance des diagnostics d'infection par le VIH par l'institut de veille sanitaire a intégré, dès sa mise en place en 2003, l'utilisation d'un test d'infection récente. Cette thèse a pour objectif d'estimer, par cette nouvelle approche, l'incidence de l'infection par le VIH en France à partir des données de surveillance des diagnostics et de la caractérisation de l'infection récente. Une première partie consiste en une revue des méthodes d'estimation basées sur la mise en évidence de marqueurs biologiques de l'infection récente. La deuxième partie est consacrée à la calibration du test d'infection récente utilisé en France à partir d'un échantillon de référence de patients suivis dans le cadre de cohortes. La troisième partie fournie les estimations d 'incidence en population en France. Le développement de cette méthode d'estimation contribue à mieux décrire la dynamique de transmission du virus en France dans les différents groupes de population, afin de mieux cibler la prévention
Knowledge of HIV incidence is essential to provide a timely picture of the HIV epidemie, in arder to target and evaluate prevention efforts. However, current methods of HIV incidence estimation can hardly provide data on current transmission patterns. A new approach based on biological procedures that discriminate recent from long-standing HIV infection has been developed since the mid 1990s. Its major advantage is that it can provide incidence estimates from a single population sample without the need for a longitudinal follow-up. The French national HIV/AIDS case reporting system has included aroutine testing for recent infection since its debut in 2003. The objective of this PhD thesis is to estimate population-based HIV incidence in France by using HIV case reporting data and results from recent infection testing. Its first part is a review of laboratory-based methods for HIV incidence estimation. The second part is dedicated to the calibration of the test for recent infection used in France using a reference sample of population. The third partis giving estimates of population-based HIV incidence in France. Based on this new method applied at a national scale, HIV incidence will be tracked over time in arder to monitor the HIV transmission dynamics in the various risk groups of the population and to better target prevention

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Alimi, Mickaël. "Nouvelle stratégie de véctorisation d'antibactériens via des métallodrogues : Principe, Synthèse et Activité biologique." Thesis, Paris 5, 2012. http://www.theses.fr/2012PA05P637.

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Abstract:

L'enveloppe cellulaire des bactéries à Gram négatif constitue la première ligne de défense contre les antibiotiques. Sous l’effet, d’une part, de la faible perméabilité de la membrane externe qui s'oppose à la pénétration des agents antibactériens, d’autre part des pompes d'efflux qui favorisent leur expulsion, elle empêche nombre de composés potentiellement actifs in vitro d'atteindre leur cible, limitant l’effet antibactérien. Un enjeu important pour restaurer l’activité de ces molécules est de trouver une stratégie pour en augmenter la concentration intracellulaire. L'objectif de cette thèse est de développer des métallodrogues comme nouvelle stratégie de vectorisation de drogues dans les cellules. Cette stratégie repose sur l’association d'une drogue active in vitro, et d’un ligand auxiliaire ayant des propriétés perméabilisantes ou inhibitrices de pompe d’efflux, dans un complexe qui jouera le rôle de chaperone. Les agents antibactériens utilisés sont des inhibiteurs (dérivés d’acides hydroxamiques) de peptide déformylase (PDF) et de méthionine aminopeptidase (MetAP) développés au laboratoire. Tout d’abord, une étude globale de la stratégie de vectorisation a été réalisée (i) étude de stabilité de métallodrogues modèles : en utilisant un acide hydroxamique fluorescent, nous avons montré que, seules, des métallodrogues à Co(III), à la différence de celles à Cu(II) et Fe(III), satisfaisaient aux conditions de stabilité compatibles avec les conditions de tests biologiques. (ii) Etude de la libération de la drogue : nous avons établi par une étude RMN 1H et UV-vis qu’en milieu tampon pH = 7,4, la libération de la drogue se faisait par échange de ligand avec un thiol exogène. Récemment, une nouvelle série d’inhibiteurs de PDF a été synthétisée au laboratoire. Elle est basée sur un squelette hétérocyclique à 5 chaînons fonctionnalisé par une chaîne en C4, puis via un espaceur monocarboné, à un acide hydroxamique. Les meilleurs résultats ont été obtenus avec un oxadiazole (AT002 16 µg/ml sur E. coli en présence de perméabilisant PMBN). Au cours de cette thèse, pour améliorer la lipophilie, des groupements aromatiques ont été fixés sur cet hétérocycle. Les MICs sur la souche d’E. coli sauvage n’ont pas été améliorées mais en présence de PMBN, le dérivé présentant la meilleure activité est le composé AT015 (2 µg/ml sur E. coli en présence de PMBN) qui a donc été choisi pour concevoir des métallodrogues. La métallodrogue réunit autour d’un métal deux parties: (i) un ligand auxiliaire fonctionnalisé via un espaceur par un perméabilisant peptidique analogue de peptide antimicrobien ou par un modulateur de l’efflux (ii) un acide hydroxamique inhibiteur de PDF. Au cours de la SAR réalisée en faisant varier la drogue, le ligand auxiliaire et le métal, nous avons montré que les meilleures métallodrogues permettent d’améliorer l’activité de la drogue sur la souche d’E. coli sauvage d’un facteur 16. Un des ligands auxiliaires fonctionnalisé par un tétrapeptide présente, seul, une activité sur une souche d’E. aerogenes résistante aux fluoroquinolones. Sur ce cas, l’activité biologique a été reliée, par des expériences de mapping par fluorescence, à son accumulation intracellulaire, en utilisant un analogue fluorescent de ce composé
The gram negative bacterias’ cell envelopes are the first line of defense against antibiotics. First thanks to the low permeability of the external membrane that prevents the penetration of the antibiotics, but also thanks to the efflux pumps that help expelling the antibiotics from the cell. These mechanisms prevent many compounds, potentially active in vitro, from reaching their targets, thus limiting the antimicrobial effect. To increase the molecules’ intracellular concentration is one of the means to restore their activity. This thesis’ objective is to develop metallodrugs as a new drug vectorization strategy in cells. We here associate an active drug in vitro and an auxiliary ligand with permeabilization or efflux pumps inhibition abilities in a complex playing the role of a chaperone. We used peptide deformylase (PDF) and methionine aminopeptidase (MetAP) inhibitors (derived from hydroxamic acids) developed at the laboratory as antimicrobial agents. I’ll begin with a global study of the vectorization strategy we’ve adopted (i) Stability study of the metallodrugs models: using a fluorescent hydroxamic acid, we showed that only Co(III) metallodrugs are in agreement with the stability conditions compatible with the biological tests, in opposition with the Cu(II) and Fe(III) ones. (ii) Drug release study: we showed in 1H NMR and UV-vis studies that in a buffer solution pH 7.4, a ligand exchange with an exogenous thiol is responsible for the drug release. Recently, a new series of PDF inhibitors was synthesized at the laboratory. It is composed of a 5 membered heterocyclic skeleton functionalized by a chain in C4 followed by an hydroxamic acid via a monocarbonated spacer. The best results were obtained with an oxadiazole (AT002 16 µg/ml with E. coli and PMBN as permeabilizing agent). During this thesis, to enhance lipophilicity, we attached aromatic groups on the heterocycle. CMIs on the E. coli strain have not been increased but the compounds displaying the best activity in presence of PMBN (AT015, 2 µg/ml with E. coli and PMBN) was chosen to conceive metallodrugs. The metallodrug is composed of a metal center and two other parts: (i) an auxiliary ligand functionalized via a spacer by a permeabilizing peptide, an antimicrobial peptide analogue, or by an efflux modulator. (ii) An hydroxamic acid PDF inhibitor. We showed that the best metallodrugs enhance the drug activity on the wild E.coli strain by a 16 factor, with the SAR we realized, changing the drug, the auxiliary ligand and the metal. One of the auxiliary ligands functionalized by a tetrapeptide show an activity on a fluoroquinolone-resistant E. aerogenes strain while alone. Utilizing a fluorescent analogous of this compound, we linked the biological activity to its intracellular accumulation with fluorescence mapping experiments

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