Academic literature on the topic 'Traitement d'images 3D'

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Journal articles on the topic "Traitement d'images 3D"

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Delvit, Jean-Marc, and Céline L'Helguen. "Observer la Terre en 3D avec Pléiades-HR." Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection, no. 209 (January 29, 2015): 11–16. http://dx.doi.org/10.52638/rfpt.2015.155.

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Abstract:
La connaissance de modèles numériques d'élévation est un élément essentiel pour un grand nombre d'applications de télédétection, notamment à très haute résolution. Cette information d'élévation peut être déduite de couples d'images stéréoscopiques en combinant des techniques photogrammétriques et des techniques de type corrélation. L'amélioration de la résolution des système spatiaux d'observation de la Terre, comme PleiadesHR (pas d'échantillonnage au sol de 70 cm) ainsi que les capacités croissantes d'acquisitions en mode stéréoscopique et multi-stéréoscopique permettent de générer de manière plus systématique des modèles numériques de terrain prenant également en compte le sursol fins (bâtis, véhicules, végétation), avec une précision de restitution de l'ordre du mètre. Une méthode générique de restitution de modèles en « vrai » 3D fortement parallélisable est ici utilisée autorisant le traitement simultané de 2 à N images sur une même zone.
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Rossi, Lucile. "Développement de systèmes de mesure basés sur la Stéréovision dédiés aux feux en propagation." Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection, no. 201 (April 16, 2014): 2–12. http://dx.doi.org/10.52638/rfpt.2013.41.

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Abstract:
Les feux de forêt représentent un risque majeur pour de nombreux pays dans le monde. Pour lutter contre ce danger, des actions de gestion, de prévention et de lutte sont réalisées. L'efficacité de ces trois types d'action est liée à la connaissance des phénomènes qui interviennent lors de la propagation des feux et à l'amélioration des modèles de comportement. Les feux sont caractérisés par l'évolution temporelle de leur position, vitesse, hauteur, surface et volume. Il est donc nécessaire de développer des systèmes permettant la mesure de ces caractéristiques géométriques. Depuis une dizaine d'années, des travaux utilisant le traitement d'image et la vision ont été menés pour obtenir des données estimées sur des feux expérimentaux. Trois familles de systèmes sont apparues : la première est dédiée aux feux se propageant en laboratoire. Elle utilise des informations 2D et ne permet l'estimation que d'un nombre restreint de caractéristiques. La deuxième est dédiée aux feux se propageant à l'extérieur sur de grands terrains de pente uniforme aménagés. Elle utilise des méthodes de traitement d'images et de vision et permet l'obtention d'un modèle de perception 3D du feu à partir d'information 2D. Ces méthodes nécessitent le positionnement sur le terrain de repères de position et de hauteur et sont difficilement transposables sur différentes configurations de terrain ; d'autre part, elles ne permettent pas l'estimation de la surface et du volume d'un feu. Une troisième famille de systèmes utilise la stéréovision pour obtenir un ensemble de points tridimensionnels de feu à partir desquels les caractéristiques géométriques des feux sont estimées. Cet article présente les travaux de recherche menés par l'auteur qui est à l'origine de la troisième famille de systèmes de mesure dédiés aux feux en propagation.
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Gademer, Antoine, Loïca Avanthey, Laurent Beaudouin, Michel Roux, and Jean-Paul Rudant. "Micro-charges utiles dédiées à l'acquisition de données par drone pour l'étude des zones naturelles." Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection, no. 213 (March 31, 2017): 19–31. http://dx.doi.org/10.52638/rfpt.2017.192.

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Abstract:
Les dernières années ont montré l'intérêt croissant de la télédétection basse altitude (TBA) pour l'étude de zones na-turelles. Mais au-delà de la problématique d'accès au milieu, la cartographie de ces zones à grande échelle pose denombreuses contraintes sur la partie capteurs d'acquisition. En effet, ce sont des milieux difficiles pour les algorithmesclassiques de traitement d'images : intrinsèquement en mouvement (aux échelles d'observations des individus), com-posés d'objets difficilement discernables, ces milieux présentent des conditions météorologiques variables, voir hostiles(éclairage, humidité, température, etc.). Cette cartographie se place généralement dans une étude thématique qui ra-joute ses propres contraintes opérationnelles (besoin d'information 3D comme le relief ou la rugosité, signature spectralespécifique, prises de vues obliques pour simplifier l'identification visuelle par les experts, etc.). Par ailleurs, l'utilisationen télédétection basse altitude de porteurs légers, comme les micro-drones, limite fortement les ressources disponiblespour les capteurs : puissance de calcul embarquée, encombrement, poids, etc.. Nous présenterons dans cet article deuxcapteurs : le capteur tri-caméras et le banc stéréoscopique uEye. Le capteur tri-caméras a été développé en 2009 pour l'ac-quisition d'images stéréoscopiques ou obliques à basse altitude. En analysant l'expérience tirée des campagnes terrainseffectuées, nous soulignerons l'importance cruciale de la synchronisation précise des prises de vues. Nous présenteronsalors notre nouveau banc stéréoscopique amphibie en développement depuis 2013, et qui vise la possibilité d'acquisitionsstéréoscopiques parfaitement synchronisées, ce qui en fait un outil idéal pour l'étude des zones littorales (pour la télédé-tection basse altitude ou in situ à faible profondeur). Nous terminerons par une présentation des premiers résultats obtenusavec ce nouveau banc.
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Heinkelé, Christophe, Pierre Charbonnier, Philippe Foucher, and Emmanuel Moisan. "Pré-localisation des données pour la modélisation 3D de tunnels : développements et évaluations." Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection 1, no. 221 (March 2, 2020): 49–63. http://dx.doi.org/10.52638/rfpt.2019.440.

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Abstract:
Le présent article décrit l'implémentation d'une méthode de pré-location décimétrique d'images au sein de grands volumes de données dans des tunnels navigables et routiers. Elle repose sur une technique d'odométrie visuelle simplifiée, ce qui la rend rapide et facile à mettre en oeuvre. Cette méthode permet de structurer les données afin d'améliorer les traitements postérieurs, comme par exemple la reconstruction 3D par photogrammétrie. La méthode est évaluée sur la précision de la localisation par comparaison avec des techniques de localisation plus conventionnelles. La structuration des données qui découle de cette localisation des images au sein de l'ouvrage constitue l'aspect le plus important du travail présenté ici.
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LEMOINE, Thierry. "Imagerie médicale par rayons X - Traitements d'image 3D." Technologies biomédicales, June 2015. http://dx.doi.org/10.51257/a-v1-med204.

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Dissertations / Theses on the topic "Traitement d'images 3D"

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Desbarats, Pascal. "Structuration d'images segmentées 3D discrètes." Bordeaux 1, 2001. http://www.theses.fr/2001BOR12486.

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Abstract:
Le but de ce travail de recherche est de fournir un cadre pour l'analyse et la segmentation d'images. Pour cela, nous présentons un nouveau modèle pour décrire à la fois la géométrie et la topologie d'une scène discrète 3D, une telle scène étant constituée d'objets 6-connexes qui peuvent être adjacents ou non adjacents. Ce modèle est composé d'un niveau géométrique, basé sur la définition des surfaces inter-voxels, et d'un niveau topologique, codé par des cartes combinatoires de dimension 3 (appelées 3-cartes) auxquelles est associée une relation d'inclusion. Dans ce document, nous expliquons dans un premier temps la problématique et décrivons les modèles existants en 2D et en 3D. Nous définissons ensuite notre modèle en décrivant le modèle géométrique, le modèle topologique puis la correspondance entre les deux. Nous expliquons alors la construction de ce double modèle avant de définir des primitives d'insertion et de suppression d'éléments. Ces primitives nous permettent enfin de définir des opérateurs de division et des opérateurs de fusion, qui sont à la base d'algorithmes de segmentation de type " division-fusion ".
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Itthirad, Frédéric. "Acquisition et traitement d'images 3D couleur temps réel." Thesis, Saint-Etienne, 2011. http://www.theses.fr/2011STET4011.

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Abstract:
Les capteurs 3D existants sont encore peu utilisés et ne permettent que l’acquisition de données 3D. En cas de nécessité de données 2D monochrome ou couleur, il faut alors obligatoirement ajouter un capteur supplémentaire et procéder au recalage des données. La société NT2I a décidé de développer sa propre solution afin de pouvoir rester maître de la chaîne d’acquisition. Mon travail a consisté en la conception d’un capteur spécifique intégrant couleur et calibration et au traitement des images issues de celui-ci. Pour cela, j’ai été amené à travailler sur l’extension du modèle LIP (Logarithmic Image Processing) pour des images couleur et à l’implémentation d’algorithmes temps réel
The existing 3D sensors aren’t much used and are only capable of capturing 3D dat. When 2D data are necessary, one has to use another camera and correlate the 2 images. NT2I has decided to develop its own solution in order to control the acquisition chain. My work has been to develop a specific camera with color, calibration, and image processing algorithms. In that purpose, I've worked on the extension of the LIP model (Logarithmic Image Processing) for color images and on the implementation of real time algorithms
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Voisin, Sophie. "3D model acquisition, segmentation and reconstruction using primitive fitting." Dijon, 2008. http://www.theses.fr/2008DIJOS056.

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Abstract:
La rétro-conception d'un objet 3D consiste à retrouver les parties principales, ou primitives, qui reconstruisent au mieux le nuage de points qui le décrit. Le succès du processus de reconstruction étant grandement influencé par les erreurs engendrées le long de la chaîne de rétro-conception, nous nous sommes intéressés à améliorer deux des étapes du procédé. Dans un premier temps, afin de minimiser les erreurs liées à l’acquisition du nuage de point au moyen d'un scanneur à projection de lumière structurée, nous présentons une méthode permettant de choisir les conditions optimales d’éclairage et les couleurs les plus adaptées pour l'apparence de l'objet en fonction des possibilités du scanneur utilisé. Puis, afin d’obtenir une représentation plus abstraite de l’objet tout en gardant une certaine précision et réalité des parties le composant, nous présentons des méthodes entrant dans le cadre de la représentation du modèle via les étapes de reconstruction et de segmentation. L’originalité de ces méthodes est l’utilisation des algorithmes génétiques permettant la représentation du modèle au moyen de primitives, dans notre cas des superquadriques ou des supershapes. Les particularités de ces méthodes résident dans la flexibilité apportée par les algorithmes génétiques dans le mécanisme de résolution des problèmes d’optimisation qui ne dépend pas de l’initialisation du processus, et dans possibilités de la représentation par supershapes permettant la reconstruction d’objets de formes très complexes. En dépit de temps de calcul relativement importants, les résultats obtenus montrent de bonnes performances en termes de reconstruction et de segmentation d’objets ou de scènes
The reverse engineering of a 3D object consists to identify the main parts or primitives, which best reconstruct its 3D point cloud. Because the success of the reconstruction process is greatly influenced by the errors generated along the reverse engineering chain, we focus our research on improving two phases of the process. Firstly, in order to minimize the point cloud acquisition errors associated with the use of a structured light projection scanner, we present a method to select the best illumination source and the best object appearance colors depending on the characteristics of the scanner used. Secondly, in order to obtain a simplified representation of the object while maintaining accuracy and realistic representation, we present novel 3D reconstruction and segmentation methods. The originality of these methods is the use of genetic algorithms to obtain the representation of the model using primitives, in our case using superquadriques or supershapes. The particularities of these methods lie in the flexibility provided by the genetic algorithms in solving optimization problems since they do not depend on the initialization process, and lie on the capabilities of the supershapes representation allowing to reconstruct very complex 3D shapes. Despite computing time relatively expensive, we present good performance results in terms of reconstruction and segmentation of objects and/or scenes
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Rigaudière, Dominique. "Reconstruction et modélisation 3D à l'aide de squelettes et de surfaces implicites." Dijon, 2002. http://www.theses.fr/2002DIJOS038.

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Ripoche, Xavier. "Méthodes de traitement d'images radiologiques 3D : applications thérapeutiques et chirurgicales." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA112040.

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Bonnard, Jennifer. "Génération d'images 3D HDR." Thesis, Reims, 2015. http://www.theses.fr/2015REIMS014/document.

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Abstract:
L’imagerie HDR et l’imagerie 3D sont deux domaines dont l’évolution simultanée mais indépendante n’a cessé de croître ces dernières années. D’une part, l’imagerie HDR (High Dynamic Range) permet d’étendre la gamme dynamique de couleur des images conventionnelles dites LDR (Low Dynamic Range). D’autre part, l’imagerie 3D propose une immersion dans le film projeté avec cette impression de faire partie de la scène tournée. Depuis peu, ces deux domaines sont conjugués pour proposer des images ou vidéos 3D HDR mais peu de solutions viables existent et aucune n’est accessible au grand public. Dans ce travail de thèse, nous proposons une méthode de génération d’images 3D HDR pour une visualisation sur écrans autostéréoscopiques en adaptant une caméra multi-points de vue à l’acquisition d’expositions multiples. Pour cela, des filtres à densité neutre sont fixés sur les objectifs de la caméra. Ensuite, un appareillement des pixels homologues permet l’agrégation des pixels représentant le même point dans la scène acquise. Finalement, l’attribution d’une valeur de radiance est calculée pour chaque pixel du jeud’images considéré par moyenne pondérée des valeurs LDR des pixels homologues. Une étape supplémentaire est nécessaire car certains pixels ont une radiance erronée. Nous proposons une méthode basée surla couleur des pixels voisins puis deux méthodes basées sur la correction de la disparité des pixels dontla radiance est erronée. La première est basée sur la disparité des pixels du voisinage et la seconde sur la disparité calculée indépendamment sur chaque composante couleur. Ce pipeline permet la générationd’une image HDR par point de vue. Un algorithme de tone-mapping est ensuite appliqué à chacune d’elles afin qu’elles puissent être composées avec les filtres correspondants à l’écran autostéréoscopique considéré pour permettre la visualisation de l’image 3D HDR
HDR imaging and 3D imaging are two areas in which the simultaneous but separate development has been growing in recent years. On the one hand, HDR (High Dynamic Range) imaging allows to extend the dynamic range of traditionnal images called LDR (Low Dynamic Range). On the other hand, 3Dimaging offers immersion in the shown film with the feeling to be part of the acquired scene. Recently, these two areas have been combined to provide 3D HDR images or videos but few viable solutions existand none of them is available to the public. In this thesis, we propose a method to generate 3D HDR images for autostereoscopic displays by adapting a multi-viewpoints camera to several exposures acquisition.To do that, neutral density filters are fixed on the objectives of the camera. Then, pixel matchingis applied to aggregate pixels that represent the same point in the acquired scene. Finally, radiance is calculated for each pixel of the set of images by using a weighted average of LDR values. An additiona lstep is necessary because some pixels have wrong radiance. We proposed a method based on the color of adjacent pixels and two methods based on the correction of the disparity of those pixels. The first method is based on the disparity of pixels of the neighborhood and the second method on the disparity independently calculated on each color channel. This pipeline allows the generation of 3D HDR image son each viewpoint. A tone-mapping algorithm is then applied on each of these images. Their composition with filters corresponding to the autostereoscopic screen used allows the visualization of the generated 3DHDR image
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Cinquin, Philippe. "Application des fonctions-spline au traitement d'images numériques." Habilitation à diriger des recherches, Grenoble 1, 1987. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00325721.

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Abstract:
Étude portant sur la modélisation d'images a traiter. Application des fonctions spline. Diverses techniques d'approximation sont mises en œuvre et des algorithmes spécifiques sont développés pour s'adapter au volume important des données. L'intérêt de cette représentation confirmée est illustré sur trois exemples d'origine médicale
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Lubniewski, Pawel. "Recalage 3D/2D d'images pour le traitement endovasculaire des dissections aortiques." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2014. http://www.theses.fr/2014CLF1MM24/document.

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Abstract:
Nous présentons dans cette étude nos travaux concernant le recalage 3D/2D d'images de dissection aortique. Son but est de de proposer une visualisation de données médicales, qui pourra servir dans le contexte de l'assistance peropératoire durant les procédures endovasculaires.Pour effectuer cette tâche, nous avons proposé un modèle paramétrique de l'aorte, appelé enveloppe tubulaire. Il sert à exprimer la forme globale et les déformations de l'aorte, à l'aide d'un nombre minimal de paramètres.L'enveloppe tubulaire est utilisée par les algorithmes de recalage proposés dans cette étude.Notre méthode originale consiste à proposer un recalage par calcul direct de la transformation entre image 2D, i.e. sans procéssus d'optimisation, et est appelée recalage par ITD .Les descripteurs, que nous avons définis pour le cas des images d'aorte, permettent de trouver rapidement un alignement grossier des données. Nous proposons également l'extension de notre approche pour la mise en correspondance des images 3Det 2D.La chaîne complète du recalage 3D/2D, que nous présentons dans ce document, est composée de la technique ITD et de méthodes précises iconiques et hybrides. L'intégration de notre algorithme basé sur les descripteurs en tant qu'étape d'initialisation réduit le temps de calcul nécessaire et augmente l'efficacité du recalage, par rapport aux approches classiques.Nous avons testé nos méthodes avec des images médicales, issues de patients trîtés par procédures endovasculaires. Les résultats ont été vérifiés par les spécialistes cliniques et ont été jugés satisfaisants; notre chaine de recalage pourrait ainsi être exploitée dans les salles d'interventions à l'avenir
In this study, we present our works related to 3D/2D image registrationfor aorti dissition. Its aim is to propose a visualization of medial datawhih an be used by physians during endovas ular proedures.For this purpose, we have proposed a parametrimodel of aorta, alleda Tubular Envelope. It is used to express the global shape and deformationsof the aorta, by a minimal number of parameters. The tubular envelope isused in our image registration algorithms.The registration by ITD (Image Transformation Descriptors) is our ori-ginal method of image alignment : itomputes the rigid 2D transformation between data sets diretly, without any optimization process.We provide thedefinition of this method, as well as the proposition of several descriptors' formulae, in the base of images of aorta. The technique allows us to quickly and a poarse alignment between data. We also propose the extension of theoriginal approach for the registration of 3D and 2D images.The complete chain of 3D/2D image registration techniques, proposedin this document, consists of the ITD stage, followed by an intensity basedhybrid method. The use of our 3D/2D algorithm, based on the image trans-formation descriptors as an initialization phase, reduces the computing timeand improves the efficiency of the presented approach.We have tested our registration methods for the medical images of several patients after endovasular treatment. Results have been approved by our clinical specialists and our approach.We have tested our registration methods for the medical images of several patients after endovascular treatment. Results have been approved by our clinical specialists and our approach may appear in the intervention rooms in the futur
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El-Hajjaji, Abdellah. "Traitement numérique en 3D d'un couple d'images stéréo du satellite SPOT." Rouen, 1993. http://www.theses.fr/1993ROUES028.

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Abstract:
L'objectif de notre recherche est d'extraire les altitudes h d'une scène donnée prise en image sous deux angles différents donnés par le satellite SPOT. Dans ce but nous avons modélisé le mouvement du satellite et de son système optique afin de transformer les deux images initiales en images épipolaires, ce qui nous permettra de réduire le temps d'appariement et de trouver les pixels homologues avec succès. Pour la mise en correspondance, nous avons utilisé une technique qui est à base de la corrélation et de la programmation dynamique. Cette méthode nous a permet d'apparier 96 % des pixels homologues avec une erreur inférieure à 5 mètres. Ce problème de mise en correspondance reste toujours ouvert
The aim of our research was to extract the level h of a precise landscape taken over two differents angles by the satellite SPOT. To do so, we have modelised the movement of the satellite and his optical system to transform the two first images in another one, epipolar which will allow us to reduce the matching time and to find with success the equivalent pixels. For the pairing, we have utilised a technic wich is based on the corrolation and of the dynamic programming. This method was very satisfactory and allow us to match 96 % of the equivalent pixels, with an error of less than 5 meters, but the original problem is still a matter of research for complimentary studing
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Peyrin, Françoise. "Méthodes de reconstruction d'images 3D a partir de projections coniques de rayons X." Lyon, INSA, 1990. http://www.theses.fr/1990ISAL0028.

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Abstract:
Ce travail concerne la reconstruction d'images en tomographie réellement 3D par rayons X, qui consiste à reconstruire un volume à partir de ses radiographies sous différents angles de vue. La technique est. Tout d'abord située par rapport aux autres modalités d'imagerie en tomographie assistée par ordinateur. Deux approches au problème de la reconstruction d'images 3D à partir de projections coniques de rayons X sont alors considérées, en utilisant soit une méthode de type analytique, soit une méthode de type algébrique. Après une étude bibliographie des méthodes analytiques de reconstruction d'images, la généralisation d'une formule d'inversion est démontrée, dans le cas où la source se déplace sur la surface d'une sphère. Ce résultat traduit l'invariance spatiale du système linéaire projection-rétroprojection. L'étude de ce système montre que pour d'autres trajectoires de la source, l'invariance est perdue, à moins de négliger la divergence du faisceau. L'algorithme découlant de la formule d'inversion est mis en œuvre sur un calculateur vectoriel et testé sur des simulations. Les résultats obtenus montrent que les images reconstruites sont satisfaisantes si l'on respecte un certain nombre de conditions (nombre. Suffisant de vues, répartition des vues suivant une géométrie 47t). Dans les autres cas l'image obtenue peut être considérée comme une première approximation de l'objet. Afin d'être moins dépendant des conditions d'acquisition, une approche algébrique à ce problème est considérée. Après une étude bibliographie, l'utilisation de trois algorithmes de reconstruction itératifs par blocs pouvant inclure des contraintes simples (positivité, bornes, support. . . ) est proposée. Les propriétés de convergence de ces algorithmes sont ensuite testées. Dans tous les cas d'acquisition, les images reconstruites sont satisfaisantes, toutefois l'isotropie de l'acquisition influe sur la vitesse de convergence des algorithmes. Une méthode hybride, combinant simultanément les deux approches analytique et algébrique permet d'accélérer la convergence d'un algorithme de type SIRT bénéficiant de bonnes propriétés de stabilité. Les diverses méthodes sont ensuite appliquées à la reconstruction d'un fantôme osseux à partir de projections physiques acquises sur un banc expérimental. Les images obtenues sont comparables et de qualité acceptable. Enfin, quelques conclusions concernant la réalisation d'un scanner réellement tridimensionnel, sont présentées
[This work is concerned with truly X-ray 3D tomography. The method consists in the acquisition of radiographs of an object for different positions of a X-ray cone beam source. Then the Image is obtained by solving a 3D reconstruction from cone-beam projection problem. The method is first situated with respect to the other imaging modalities in tomography. After a bibliographic study of reconstruction technicals, the generalisation of the back-projection theorem for cone-beam projection is proved. It leads to an inversion formula, which is exact when the source describes the surface of a sphere. The subsequent algorithm iS implemented on a super calculator and tested on simulations. When the source trajectory satisfies the theorem hypothesis, the reconstructed images are satisfying. Other while they can be considered as a first approximation of the object. In order to be less sensitive to the acquisition conditions, an algebraic approach to this problem is considered. The use of three bloc Iterative reconstruction algorithms including or not some simple constraints is proposed. At last, the different methods are applied to the reconstruction of a bony phantom from physical projections, and some conclusions concerning the realisation of a truly 3D X-ray scanner are presented. ]
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Books on the topic "Traitement d'images 3D"

1

Jähne, Bernd. Digital image processing: Concepts, algorithms, and scientific applications. Berlin: Springer-Verlag, 1991.

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2

Digital image processing. 6th ed. Berlin: Springer, 2005.

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3

Digital image processing: Concepts, algorithms, and scientific applications. 4th ed. Berlin: Springer, 1997.

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4

Jähne, Bernd. Digital image processing: Concepts, algorithms, and scientific applications. 3rd ed. Berlin: Springer-Verlag, 1995.

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5

Jähne, Bernd. Digital image processing: Concepts, algorithms, and scientific applications. 2nd ed. Berlin: Springer-Verlag, 1993.

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6

Zhang, Song. High-Speed 3D Imaging with Digital Fringe Projection Techniques. Taylor & Francis Group, 2018.

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7

High-Speed 3D Imaging with Digital Fringe Projection Techniques. Taylor & Francis Group, 2016.

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8

Zhang, Song. High-Speed 3D Imaging with Digital Fringe Projection Techniques. Taylor & Francis Group, 2019.

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9

Workshop proceedings production process of 3D computer graphics: Applications - structures, roles and tools ; ACM SIGGRAPH and eurographics campfire, June 1 - June 4, 2002, Snowbird, Utah, USA. Aachen: Shaker, 2002.

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10

Image Synthesis Theory and Practice. Springer Verlag, 1988.

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Conference papers on the topic "Traitement d'images 3D"

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Lefort, Claire, Mathieu Chalvidal, Alexis Parenté, Véronique BLANQUET, Henri Massias, Laetitia MAGNOL, and Emilie Chouzenoux. "Imagerie 3D par microscopie multiphotonique appliquée aux sciences du vivant : la chaine instrumentale et computationnelle FAMOUS." In Les journées de l'interdisciplinarité 2022. Limoges: Université de Limoges, 2022. http://dx.doi.org/10.25965/lji.221.

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Abstract:
Nous présentons une nouvelle stratégie instrumentale et computationnelle appelée FAMOUS (pour fast algorithm for three-dimensional (3D) multiphoton microscopy of biomedical structures) basée sur une approche de microscopie multiphotonique assistée par calcul. Le but est l’amélioration visuelle des images d'échantillons biologiques épais offrant ainsi un nouveau point de vue sur les structures biologiques. L'approche de post-traitement repose sur un algorithme de restauration d'image régularisé, alimenté par une estimation 3D précise de la fonction d'étalement du point (Point Spread Function en anglais, PSF) de l'instrument sur toute la profondeur des structures. Cette dernière étape revient à mesurer, grâce à un algorithme d'ajustement de modèle avancé, les distorsions variant en profondeur de l'image résultant de la combinaison entre la contribution instrumentale et les hétérogénéités du milieu. Les performances du pipeline FAMOUS sont évaluées pour un milieu hétérogène constitué d’un muscle entier de souris. La génération de seconde harmonique (SHG), émise par l'assemblage des chaines de myosine du muscle est enregistrée. Les artefacts optiques issus de la chaîne d'acquisition incluant des hétérogénéités dans les 3 dimensions sont estimés avec les spécificités propres à l’échantillon puis retirées numériquement. Des images brutes et restaurées sur 5 µm de l’ultrastructure fine du muscle illustrent la robustesse du pipeline FAMOUS.
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