Academic literature on the topic 'Test fonctionnels prédictifs'

Introduction : Cet article présente une étude des analyses squelettiques structurales de Delaire et de Sassouni, indépendantes des compensations dentaires, comme prescripteurs des déplacements squelettiques en chirurgie orthognathique particulièrement dans les chirurgies de première intention (Surgery First) développées par Sugawara. Méthode : Les analyses céphalométriques ont été réalisées sur vingt cas chirurgicaux : les déplacements squelettiques induits ont été comparés pour quantifier les différences d’indications en fonction du type facial. Les morpho-simulations faciales obtenues avec le logiciel Dolphin 11.95 Premium à partir des photographies et scans préchirurgicaux ont été présentées à deux jurys (professionnel et non professionnel) pour valider l’outil Dolphin, puis comparer les analyses entre elles et à la chirurgie réalisée. Cette étude sur dix cas opérés dans le même cabinet a fait l’objet d’une étude statistique (laboratoire de statistique-CNRS). Résultats : L’analyse de Sassouni suggère beaucoup plus de déplacement vers l’avant du maxillaire (ENA +5,45*) et plus de modifications verticales (Me 1,595*). Les différences entre les deux analyses sont peu influencées par le type facial. La prédiction Dolphin jugée assez fiable (3,7/6) a permis de comparer l’effet esthétique des prescriptions des analyses avec la chirurgie réalisée. Le test de Student apparié n’est pas significatif (taille de l’échantillon), mais l’analyse par cotation montre une différence plus significative (chirurgie DO (17,4), Sassouni (16,6) et Delaire (14)). Conclusions : Les analyses de Delaire et Sassouni ne donnent pas les mêmes indications chirurgicales : plus d’avancée maxillaire et de modifications verticales pour Sassouni. L’outil Dolphin permet une prédiction raisonnable des effets d’une chirurgie. L’analyse de Sassouni donne des objectifs céphalométriques jugés plus esthétiques que ceux de Delaire (16,6/14 soit +2,6), mais l’analyse esthétique et fonctionnelle reste essentielle.

Les cancers ovariens constituent la deuxième cause de décès par cancers gynécologiques dans le monde, principalement en raison d'un diagnostic tardif associé au développement de résistances à la chimiothérapie. Environ la moitié de ces cancers présentent des altérations dans la recombinaison homologue (RH), ce qui les rend sensibles aux inhibiteurs des protéines PARP (PARPi), impliquées dans la réparation de l'ADN. Cependant, identifier les patientes répondeuses à la chimiothérapie et sélectionner celles éligibles aux PARPi demeure un défi pour les cliniciens. Dans ce contexte, l'utilisation de tumoroïdes pour des tests fonctionnels prédictifs représente une approche prometteuse pour orienter les choix thérapeutiques en première ligne et au-delà. L'objectif de cette thèse est d'étudier la faisabilité de tests fonctionnels basés sur des tumoroïdes afin d'évaluer leur applicabilité potentielle en médecine de précision. L’établissement d'un panel de tumoroïdes issus de divers sous-types histologiques ovariens a permis de démontrer que ces modèles récapitulent les caractéristiques histologiques et moléculaires de leurs tumeurs d'origine. Suite aux test fonctionnels d’exposition directe des tumoroïdes à des traitements de 1ère et 2nde ligne, nous avons pu montrer que ces modèles présentent des réponses hétérogènes aux traitements et notamment que les modèles tumoroïdes identifiés par le test prédictif comme sensibles au carboplatine provenaient principalement de patientes répondeuses. Parallèlement, nous avons étudié les résultats d'un test fonctionnel évaluant le statut RH, le test RECAP et avons démontré que ce test était complémentaire à la méthode actuelle de détermination du statut RH, qui repose sur des techniques de séquençage NGS. Bien que des investigations à plus grande échelle soient nécessaires pour confirmer le potentiel des tumoroïdes, ces résultats fournissent des arguments supplémentaires en faveur de l'utilisation des tumoroïdes ovariens dans un contexte de médecine de précision
Ovarian cancers are the second leading cause of death from gynecological cancers worldwide, primarily due to late diagnosis combined with the development of resistance to chemotherapy. Approximately half of these cancers exhibit alterations in homologous recombination (HR), making them sensitive to PARP protein inhibitors (PARPi), which are involved in DNA repair. However, identifying patients who respond to chemotherapy and selecting those eligible for PARPi remains a challenge for clinicians. In this context, the use of patient-derived tumor organoids (PDTO) for predictive functional testing represents a promising approach to guide therapeutic choices in first-line treatment and beyond. The aim of this thesis is to study the feasibility of functional tests based on PDTO to evaluate their potential applicability in precision medicine. Establishing a panel of PDTO derived from various ovarian histological subtypes has demonstrated that these models recapitulate the histological and molecular characteristics of their tumors of origin. Following direct exposure functional tests of the tumor organoids to first- and second-line treatments, we showed that these models exhibit heterogeneous responses to treatments, and particularly that PDTO identified by the predictive test as sensitive to carboplatin mainly originated from responding patients. Additionally, we investigated the results of a functional test assessing HR status, the RECAP test, and demonstrated that this test is complementary to the current method for determining HR status, which relies on NGS sequencing techniques. Although larger-scale investigations are needed to confirm the potential of tumor organoids, these results provide further support for the use of ovarian tumor organoids in the context of precision medicine

La syncope est une perte brusque de conscience. Bien qu'elle ne soit pas généralement mortelle, elle présente un impact économique sur le système de soins et sur la vie personnelle de personnes en souffrant. L'objet de la présente étude est de réduire la durée du test clinique (environ 1 heure) et d'éviter aux patients de développer une syncope en la prédisant. L'ensemble de travail s'inscrit dans une démarche de datamining associant l'extraction de paramètres, la sélection des variables et la classification. Trois approches complémentaires sont proposées, la première exploite des méthodes d'analyse non-linéaires de séries temporelles extraites de signaux acquises pendant le test, la seconde s'intéresse aux relations cardiovasculaires en proposant des indices dans le plan temps-fréquence et la troisième, plus originale, prendre en compte leurs dynamiques temporelles
Syncope is a sudden loss of consciousness. Although it is not usually fatal, it has an economic impact on the health care system and the personal lives of people suffering. The purpose of this study is to reduce the duration of the clinical test (approximately 1 hour) and to avoid patients to develop syncope by early predicting the occurrence of syncope. The entire work fits into a data mining approach involving the feature extraction, feature selection and classification. 3 complementary approaches are proposed, the first one exploits nonlinear analysis methods of time series extracted from signals acquired during the test, the second one focuses on time- frequency (TF) relation between signals and suggests new indexes and the third one, the most original, takes into account their temporal dynamics

Ce travail de thèse avait pour objectif principal d’étudier l’influence de certains paramétrages deslogiciels de prédiction de mots et d’un programme d’entraînement ciblé sur la vitesse de saisie detexte chez des personnes tétraplégiques. Six études ont été menées. L’étude 1 nous a permis demettre en évidence des vitesses de saisie de texte chez les personnes tétraplégiques et d’étudierl’influence de leurs aides techniques d’accès à l’outil informatique sur cette vitesse. L’étude 2 nous apermis de mettre en avant l’hétérogénéité des résultats d’un logiciel de prédiction de mots sur lavitesse de saisie de texte sur une population hétérogène et sans paramétrage de ces logiciels.L’étude 3 nous a permis d’étudier les habitudes de préconisations et de paramétrages des logiciels deprédictions de mots par les professionnels. Les études 4 et 5 nous ont permis d’évaluer l’influencedes paramétrages (nombre de mots affichés dans la liste de prédiction et l’adaptation du logiciel auvocabulaire de l’utilisateur) sur cette saisie de texte. Enfin, l’étude 6 nous a permis d’étudierl’influence d’un entraînement dirigé par des professionnels sur les logiciels de prédictions de motschez des personnes tétraplégiques, sur la vitesse de saisie de texte.Les résultats montrent que seule l’aide technique d’accès à l’outil informatique influence la vitessede saisie de texte. Les logiciels de reconnaissance vocale permettent une vitesse de saisie de texteéquivalente à celle des personnes valides utilisant un clavier standard. Les paramétrages (nombre demots affichés dans la liste de prédiction et l’adaptation du logiciel au vocabulaire de l’utilisateur) ontune influence différente en fonction du niveau lésionnel des personnes tétraplégiques sur la vitessede saisie de texte, le nombre d’erreurs ou le confort. De plus, une différence entre l’importancedonnée aux paramétrages par les professionnels préconisateurs et les paramétrages effectivementréglés a été mise en évidence. Enfin, l’influence d’un entraînement dirigé sur la vitesse de saisie detexte a été mise en évidence sur la vitesse de saisie de texte. Au regard de l’ensemble de cesrésultats, il apparait nécessaire de paramétrer les logiciels de prédictions de mots, mais aussi deconnaitre l’influence des différents réglages et de diffuser cette information au sein des réseauxprofessionnels. La recherche doit être poursuivie pour améliorer les logiciels de prédiction de mots,mais aussi pour favoriser de nouveaux outils tels les tablettes tactiles et les logiciels dereconnaissance vocale. Une systématisation des entraînements dirigés sur les logiciels de prédictionde mots nécessite une réflexion et une validation sur les modalités et la nature de cesaccompagnements
The main objective of this work was to study the influence of key settings of word predictionsoftware as well as a training program on the use of word prediction, on text input speed in personswith cervical spinal cord injury.Study 1 determined text input speed in persons with cervical spinal cord injury and the influence ofpersonal characteristics and type of computer device on text input speed. Study 2 evaluated theeffect of a dynamic virtual keyboard coupled with word prediction software on text input speed inpersons with functional tetraplegia. Study 3 analysed the word prediction software settingscommonly prescribed by health-related professionals for people with cervical spinal cord injury.Studies 4 and 5 evaluated the influence of the number of words displayed in the prediction list andthe frequency of use setting on text input speed. Finally, study 6 evaluated the influence of a trainingprogram on the use of word prediction software for persons with cervical spinal cord injury on textinput speed.The results showed that only the type of computer device influenced text input speed; voicerecognition software increased the text input speed of persons with cervical spinal cord injury to thatof able-bodied people using a standard keyboard. The influence of the different word predictionsoftware settings (number of words displayed in the prediction list and the frequency of use) on textinput speed, the number of errors or comfort of use, differed depending on the level of injury. Wealso found differences between the perception of the importance of some settings by healthprofessionalsand data in the literature regarding the optimization of settings. Moreover, althoughsome parameters were considered as very important, they were rarely configured. Finally, trainingpersons with cervical spinal cord injury in the use of word prediction software increased text inputspeed.The results of this work highlighted that word prediction software settings influence text input speedin persons with cervical spinal cord injury, however not all professionals are aware of this.Information should therefore be disseminated through professional networks. Further studies shouldaim to improve word prediction software and should also focus on new devices such as tablets andvoice recognition software. Persons with cervical spinal cord injury training programs in the use ofword prediction software need to be developed and validated

.La consommation journalière de fructose est en augmentation croissante, jusqu'à plus de 50g par jour aux Etats-Unis et en Europe de l'Ouest. Le fructose est de plus en plus incorporé dans les boissons, les produits laitiers et les conserves, les produits cuisinés ou transformés. Le fructose peut déclencher ou aggraver les symptômes digestifs chez des volontaires sains, mais aussi dans le syndrome de l'intestin irritable. Le rôle de l'hypersensibilité viscérale dans le déclenchement des symptômes, lié à la prise de fructose a été suspecté mais n'a jamais été évalué. La prévalence de la malabsorption du fructose était mal documentée chez les patients souffrant d'un syndrome de l'intestin irritable, principalement en raison de l'hétérogénéité des méthodes diagnostiques. Le premier objectif de ce travail a été de définir, dans une population de patients souffrant d'un syndrome de l'intestin irritable, la prévalence de la malabsorption du fructose. Notre test de malabsorption du fructose a été défini par une dose de charge de 25g. Chez nos patients souffrant d'un syndrome de l'intestin irritable, 22% présentaient une malabsorption du fructose. Les patients jeunes et de sexe masculin étaient plus à risque de malabsorption du fructose. Nous avons également étudié l'association de la malabsorption du fructose avec d'autres anomalies physiopathologiques connues dans le syndrome de l'intestin irritable. Nous n'avons pas retrouvé d'association entre la présence d'une inflammation digestive et la présence ou non d'une malabsorption du fructose. En revanche, une association a été retrouvée entre malabsorption du fructose et hypersensibilité viscérale. L'efficacité du régime appauvri en fructose dans le syndrome de l'intestin irritable est connue. L'existence ou non d'une malabsorption du fructose associée pourrait être un facteur prédictif d'efficacité d'un tel régime. Le deuxième objectif de ce travail a été de déterminer si le test de dépistage de la malabsorption au fructose permettait de prédire l'efficacité du régime appauvri en fructose sur les symptômes digestifs des patients souffrant d'un syndrome de l'intestin irritable. Les résultats de notre étude ont confirmé l'efficacité du régime appauvri en fructose dans le syndrome de l'intestin irritable. En revanche, la présence ou non d'un test respiratoire au fructose positif n'impactait pas l'efficacité du régime. Le dernier objectif de ce travail était de modéliser la malabsorption du fructose sur des modèles murins, pour permettre d'identifier les mécanismes physiopathologiques sous-jacents. La modélisation sur 3 modèles murins de malabsorption du fructose (par régime riche en fructose, par délétion des gènes codant les transporteurs du fructose GLUT5 et GUT2) permettait d'induire une hypersensibilité viscérale associée à une augmentation de la perméabilité intestinale, deux anomalies déjà rapportées dans le syndrome de l'intestin irritable. L'étude des mécanismes physiopathologiques sous-jacents a permis d'écarter l'implication d'une inflammation de bas grade qui n'était pas retrouvée chez nos souris. L'augmentation d'activité élastase dans les selles de souris avec malabsorption du fructose était associée à l'hypersensibilité viscérale. Or il a déjà été démontré que l'activité protéasique pouvait être responsable d'une hypersensibilité viscérale et d'une augmentation de la perméabilité intestinale. Les récepteurs associés à la protéase-2 sont connus pour être associés à l'hypersensibilité viscérale et l'augmentation de la perméabilité intestinale. Les résultats obtenus dans le cadre de ce travail soulignent le rôle de la malabsorption du fructose, qui entraine la survenue d'une hypersensibilité viscérale et d'une augmentation de la perméabilité intestinale, dans le syndrome de l'intestin irritable. Un régime appauvri en fructose n'améliore pas de manière ciblée les symptômes des patients souffrant d'un syndrome de l'intestin irritable avec malabsorption du fructose
Fructose intake has increased by up to 50 g per day in the USA and Western Europe. Fructose is increasingly incorporated in beverages, dairy products and canned, baked or processed foods worldwide. Fructose has been shown to trigger or worsen digestive symptoms not only in healthy volunteers, but also in patients with irritable bowel syndrome. The involvement of visceral hypersensitivity has been suspected but has never been assessed. The prevalence of fructose malabsorption in patients with irritable bowel syndrome in Western Europe remains poorly documented, due to the heterogeneity of available tests. Therefore, the first objective of this present work was to assess the prevalence of fructose malabsorption in patients with irritable bowel syndrome. We assessed fructose malabsorption with a fructose breath test, after a 25 g load. We systematically ruled out small intestinal bacterial overgrowth which could promote false positive. In our irritable bowel syndrome patients, 22% had fructose malabsorption. Young, male patients were more likely to have fructose malabsorption. We also assessed the association between fructose malabsorption and other abnormalities. We did not observe any association between low-grade inflammation (with faecal calprotectin dosage) or fructose malabsorption. In contrast, an association between fructose malabsorption and visceral hypersensitivity was evidenced. Low fructose diet is known to improve symptoms in patients with irritable bowel syndrome. The presence of fructose malabsorption could be predictive of the efficacy of a low fructose diet. The second objective of this work was to determine if an abnormal fructose breath test was a predictor of symptomatic response to low fructose diet in irritable bowel syndrome. Our study has confirmed the efficacy of low fructose diet on irritable bowel syndrome. However, the results of the fructose breath test had no impact on its efficacy. One explanation for this result could be the presence of other abnormalities (including visceral hypersensitivity) that were not addressed only with a diet. The last objective of this work was to model fructose malabsorption in mice, in order to identify the underlying mechanisms. We used three models of fructose malabsorption (high fructose diet, invalidation of GLUT5 and GLUT2 coding gene). In these models, fructose malabsorption induced visceral hypersensitivity and increased intestinal permeability, the two abnormalities being reported in irritable bowel syndrome. In our models, there was no low-grade inflammation. Increased elastase activity in mice faeces was associated with visceral hypersensitivity. Protease-activated receptor-2 is known to be associated with visceral hypersensitivity and increases intestinal permeability. Further works are warranted to determine the involvement of protease-activated receptor-2 in fructose malabsorption-associated visceral hypersensitivity. The results of this work underlined the role of fructose malabsorption in irritable bowel syndrome, in the onset of visceral hypersensitivity and increased intestinal permeability. A low fructose diet is not helpful to improve symptoms of irritable bowel syndrome with fructose malabsorption

Chaque année, plus de 150 000 décès sont associés aux cancers épithéliaux de l’ovaire dans le monde, notamment en raison du développement d’une résistance à la chimiothérapie. Environ la moitié de ces cancers présentent des altérations moléculaires provoquant une déficience de la réparation de l’ADN par recombinaison homologue (HRD) qui les sensibilise à l’action des inhibiteurs de la protéine PARP (PARPi). A ce jour, il n’existe pas de test capable d’appréhender le phénotype HRD dans sa globalité, limitant ainsi l’accès à ces traitements. Dans ce contexte, nous avons entrepris de mettre au point des tests fonctionnels basés sur l’utilisation d’explants tumoraux tranchés puis sur l’utilisation d’organoïdes tumoraux dérivés de tumeurs ovariennes de patientes chimio-naïves ou antérieurement traitées. La culture d’explants s’est révélée inappropriée pour la réalisation de ces tests et nous avons alors focalisé nos travaux sur les organoïdes tumoraux. Ces derniers ont été exposés au carboplatine (traitement de 1e ligne) et à deux inhibiteurs de PARP (l’olaparib et le niraparib) utilisés en traitement d’entretien. En parallèle, nous avons collecté les données cliniques des patientes (survie, intervalle sans platine, RECIST, traitements) afin d’évaluer le potentiel prédictif de ces modèles. Les organoïdes tumoraux établis ont répondu de façon hétérogène aux différents médicaments testés, et nos résultats montrent que les tests réalisés sur les organoïdes sont capables d’identifier des patientes présentant un niveau de résistance élevé au carboplatine, suggérant que ce test fonctionnel pourrait présenter un intérêt prédictif vis-à-vis de ce médicament. Concernant le potentiel prédictif des organoïdes vis-à-vis des PARPi, des profils de sensibilité variés ont été identifiés, mais la corrélation avec la réponse clinique reste à établir par des études menées sur des échantillons de tumeurs issus de patientes traitées par ces médicaments
Worldwide each year, more than 150 000 women die from epithelial ovarian cancer largely due to emergence of resistance to chemotherapy. Approximately half of these cancers display molecular alterations that cause deficiency of DNA repair via homologous recombination (HRD), which confer sensitivity to PARP protein inhibitors (PARPi). To date, there is no test capable of fully identifying the HRD phenotype, thus limiting access to these treatments. In this context, we are developing functional assays based on the use of tumor explant slices and then, on the use of tumor organoids derived from ovarian tumors of chemotherapy-naive or previously treated patients. The culture of explants was unsuitable for this application and we then focused our work on tumor organoids. Tumor organoids were exposed to carboplatin (first-line treatment) and two PARP inhibitors (olaparib and niraparib) used for maintenance therapy. In parallel, we collected clinical data from patients (survival, platinum-free interval, RECIST, treatments) to evaluate the predictive potential of these models. The established tumor organoids responded heterogeneously to different drugs, and our results show that the organoid-based assay is capable of identifying patients highly resistant to carboplatin, suggesting that this functional assay could have a predictive value for patients treated with carboplatin. Regarding the potential of organoids in predicting PARPi response, multiple sensitivity profiles have been identified, but the correlation with clinical response has yet to be determined by studies conducted on tumor samples from patients treated with these drugs