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Relevant bibliographies by topics / Système CRISPR / Journal articles

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Journal articles on the topic 'Système CRISPR'

Author: Grafiati

Published: 13 April 2024

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1

Croteau, Félix R., Geneviève M. Rousseau, and Sylvain Moineau. "Le système CRISPR-Cas." médecine/sciences 34, no. 10 (October 2018): 813–19. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2018215.

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Abstract:

CRISPR-Cas est un système immunitaire adaptatif utilisé par de nombreux microbes pour se défendre contre l’invasion d’acides nucléiques tels que les génomes viraux et autres éléments génétiques mobiles. Le système microbien utilise son locus CRISPR pour stocker de l’information génétique afin de produire des ARN guides. Ces derniers, de concert avec des endonucléases (Cas), empêchent des invasions futures. Des parties de ce système microbien ont été exploitées pour développer un puissant outil d’édition des génomes dans une panoplie d’organismes. La capacité de CRISPR-Cas9 à couper efficacement et à des endroits très précis de l’ADN pourrait peut-être permettre un jour de guérir certaines maladies génétiques humaines. La malléabilité de cet outil d’édition rend possible une variété d’applications allant de la modulation de l’expression de gènes à des modifications épigénétiques. Les locus CRISPR représentent également une mine d’informations pouvant servir de méthode de typage de souches microbiennes ou encore une façon d’étudier les interactions entre les bactéries et leurs habitats.

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2

Ballouhey, Océane, Marc Bartoli, and Nicolas Levy. "CRISP(R)ation musculaire." médecine/sciences 36, no. 4 (April 2020): 358–66. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2020081.

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Abstract:

Les dystrophies musculaires sont un ensemble de pathologies musculaires rares, caractérisées par une faiblesse et une dégénérescence progressive du muscle. Ce sont des maladies d’origine génétique causées par la mutation d’un ou de plusieurs gènes impliqués dans les fonctions musculaires. Malgré des progrès significatifs réalisés dans le champ des biothérapies au cours des dernières années, il n’existe pas, à ce jour, de traitement curatif disponible pour ces pathologies. Les études menées depuis la découverte de l’outil d’édition génomique CRISPR-Cas9 ont néanmoins permis des avancées significatives et prometteuses dans le traitement des dystrophies musculaires. Le système CRISPR-Cas9 permet une édition stable et permanente du génome et doit permettre d’éviter les traitements longs et répétitifs. Dans cette revue, nous aborderons les dernières avancées thérapeutiques utilisant le système CRISPR-Cas9 dans le cadre des dystrophies musculaires d’origine génétique.

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3

Friot, Adèle, Blanche Dekeyzer, Armelle Guingand, Justine Guguin, Amélie Joly, and Sylvia Vuillier. "Du locus CRISPR bactérien, une forme d’immunité adaptative, à un outil général d’édition du génome." médecine/sciences 34, no. 5 (May 2018): 395–96. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20183405999.

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Abstract:

Les Nouvelles suivantes ont été rédigées par les étudiants de Master 1 de biologie de l’École normale supérieure de Lyon à l’issue de l’UE microbiologie moléculaire et structurale (2017-18). Le Master de biologie de l’ENS de Lyon, cohabilité par l’université Claude Bernard Lyon 1, accueille chaque année environ 50 étudiants en M1 et en M2 et propose une formation de haut niveau à la recherche en biosciences. Chaque étudiant y construit son parcours à la carte en choisissant ses options parmi un large panel de modules, favorisant ainsi une approche pluridisciplinaire des sciences du vivant, et ce en relation étroite avec les laboratoires de recherche du tissu local, national et international. À partir d’articles scientifiques publiés récemment dans le domaine de la microbiologie, les étudiants ont travaillé en binômes ou trinômes, accompagnés par l’équipe pédagogique, pour extraire les principaux messages à retenir de ces articles et les transmettre de façon claire aux lecteurs de médecine/sciences. Le dossier suivant illustre ainsi quelques aspects du système CRISPR/Cas en microbiologie, avec, d’une part, la description de nouveaux systèmes CRISPR/Cas et de leurs fonctions physiologiques chez les bactéries, et, d’autre part, leurs applications en bactériologie pour l’édition de génomes bactériens, mais aussi en virologie pour le criblage pangénomique de facteurs d’hôte pro- ou antiviraux ou pour la génération de modèles animaux.

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4

Casane, Didier, and Patrick Laurenti. "Le cas CRISPR, mutations «ready-made» et évolution lamarckienne d’un système immunitaire adaptatif." médecine/sciences 32, no. 6 (June 2016): 640–45. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20163206029.

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5

Tremblay, Jacques P. "CRISPR, un système qui permet de corriger ou de modifier l’expression de gènes responsables de maladies héréditaires." médecine/sciences 31, no. 11 (November 2015): 1014–22. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20153111016.

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6

Castino, Garance, Martin Guillemet, Amélie Joly, and Anaïs Vignon. "Le système CRISPR/Cas : un outil d’édition des génomes pour le développement de modèles animaux d’infections virales." médecine/sciences 34, no. 5 (May 2018): 403–5. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20183405011.

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7

Dekeyzer, Blanche, Marie Hoareau, and Gabriel Laghlali. "Utiliser le système CRISPR/Cas9 SAM (synergic activation mediator) pour identifier des facteurs de restriction antiviraux par criblage génomique." médecine/sciences 34, no. 5 (May 2018): 401–3. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20183405010.

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8

Chaudhry, Ahsen Tahir, and Daud Akhtar. "Gene Therapy and Modification as a Therapeutic Strategy for Cancer." University of Ottawa Journal of Medicine 6, no. 1 (May 11, 2016): 44–48. http://dx.doi.org/10.18192/uojm.v6i1.1564.

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Abstract:

Gene therapy is an exciting new field of personalized medicine, allowing for medical procedures that can target diseases such as cancer in novel ways. Technologies that involve gene transfer treatments allow for the insertion of foreign DNA into tumour cells, resulting in restored protein expression or altered function. Gene therapy can also be used as a form of immunotherapy, either by modifying cancer cells to make them better targeted by the immune system, or by modifying the body’s immune cells to make them more aggressive towards tumours. Additionally, oncolytic virotherapy uses classes of genetically modified viruses that can specifically target and interfere with tumour cells. The ongoing development of the CRISPR/Cas9 gene editing tool may also have promise in future therapeutic applications, with the tool being capable of removing cancer-causing, latent viral infections, such as HPV, from afflicted cells. Nonetheless, there are still many questions of safety, efficacy, and commercial viability which remain to be resolved with many gene therapy procedures. There is also emerging controversy over the ethical, legal, and moral implications that modifying the genetic content of human beings will have on society. These concerns must be confronted and addressed if the benefits promised by gene therapy are to be properly realized. La thérapie génétique est un nouveau domaine d’étude médicale personnalisée qui permet de cibler des maladies spécifiques comme le cancer de façon innovatrice. Cette thérapie utilise le transfert de gènes avec une insertion d’ADN étrangère dans les cellules cancéreuses dans le but de restaurer l’expression des protéines et de retrouver la fonction cellulaire. La thérapie génétique peut aussi être utilisée comme une forme d’immunothérapie, soit en modifiant les cellules cancéreuses pour qu’elles soient mieux ciblées par le système immunitaire ou en modifiant les cellules immunitaires du corps pour les rendre plus agressives envers les tumeurs. De plus, une virothérapie oncolytique utilise des virus génétiquement modifiés qui peuvent cibler spécifiquement et interférer avec des cellules cancéreuses. Le développement du système d’édition génétique CRISPR/Cas9 s’avère prometteur pour les applications thérapeutiques futures. Cet outil est capable d’enlever les infections virales latentes dans les cellules affectées qui peuvent causer le cancer, tel que l’HPV. Malgré ces découvertes, plusieurs questions importantes demeurent quant à la sécurité et à l’efficacité de leur application. Il s’agit d’un domaine controversé avec des implications éthiques, légales, et morales, car le tout implique une modification du contenu génétique humain. Ces inquiétudes doivent être adressées afin de pouvoir continuer à explorer les bienfaits de cette thérapie génétique. En poursuivant la recherche dans ce domaine, il serait possible de valider cette thérapie et optimiser ses bienfaits.

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9

Yanik, M., W. Wende, and K. Stieger. "Genome Editing Tools und ihr Einsatz in der experimentellen Augenheilkunde." Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde 234, no. 03 (January 23, 2017): 329–34. http://dx.doi.org/10.1055/s-0042-119205.

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Abstract:

ZusammenfassungNeue molekularbiologische Werkzeuge revolutionieren zurzeit die Genomchirurgie (genome editing) mit weitreichendem Einfluss auch auf die experimentelle Augenheilkunde. Neben den bereits etablierten Systemen wie den Zinkfingernukleasen (ZFN) oder Transcription-activator-like-Effector-Nukleasen (TALEN) sind es insbesondere die CRISPR-/Cas-Systeme (CRISPR: clustered regularly interspaced short palindromic repeats; Cas: CRISPR-associated), die überraschend einfach einen gezielten und präzisen Schnitt im Genom lebender Zellen ermöglichen. Dieser DNA-Doppelstrangbruch wird in der Zelle mittels NHEJ (non-homologous end joining) oder HDR (homology directed repair) repariert und kann ausgenutzt werden, um ein defektes Gen zu deaktivieren oder mithilfe einer korrekten Gensequenz zu reparieren. Die Genome-Editing-Technologie eröffnet damit bisher ungeahnte Möglichkeiten in der Grundlagenforschung, Biotechnologie, biomedizinischen Forschung bis hin zu ersten klinischen Anwendungen. Neurodegenerative Erkrankungen der Netzhaut stehen dabei aufgrund der guten Zugänglichkeit und des Immunprivilegs des Auges mit im Fokus des Interesses von Forschern und Firmen.

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10

Reboud-Ravaux, Michèle. "Dégradation induite des protéines par des molécules PROTAC et stratégies apparentées : développements à visée thérapeutique." Biologie Aujourd’hui 215, no. 1-2 (2021): 25–43. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2021007.

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Abstract:

Alors que, pour la plupart, les médicaments actuels sont de petites molécules inhibant l’action d’une protéine en bloquant un site d’interaction, la dégradation ciblée des protéines, découverte il y a une vingtaine d’années via les petites molécules PROTAC, connaît aujourd’hui un très grand développement, aussi bien au niveau universitaire qu’industriel. Cette dégradation ciblée permet de contrôler la concentration intracellulaire d’une protéine spécifique comme peuvent le faire les techniques basées sur les acides nucléiques (oligonucléotides antisens, ARNsi, CRISPR-Cas9). Les molécules PROTAC sont des chimères hétéro-bifonctionnelles capables de lier simultanément une protéine spécifique devant être dégradée et une E3 ubiquitine ligase. Les PROTAC sont donc capables de provoquer l’ubiquitinylation de la protéine ciblée et sa dégradation par le protéasome 26S. De nature peptidique, puis non peptidique, les PROTAC sont maintenant administrables par voie orale. Ce détournement du système ubiquitine protéasome permet aux molécules PROTAC d’élargir considérablement le champ des applications thérapeutiques puisque l’élimination de protéines dépourvues de poches ou de crevasses bien définies, dites difficiles à cibler, devient possible. Cette technologie versatile a conduit à la dégradation d’une grande variété de protéines comme des facteurs de transcription, des sérine/thréonine/tyrosine kinases, des protéines de structure, des protéines cytosoliques, des lecteurs épigénétiques. Certaines ligases telles que VHL, MDM2, cereblon et IAP sont couramment utilisées pour être recrutées par les PROTAC. Actuellement, le nombre de ligases pouvant être utilisées ainsi que la nature des protéines dégradées sont en constante augmentation. Deux PROTAC sont en étude clinique pour les cancers du sein (ARV471) et de la prostate (ARV110). La dégradation spécifique d’une protéine par le protéasome peut aussi être induite par d’autres types de molécules synthétiques : colles moléculaires, marqueurs hydrophobes, HaloPROTAC, homo-PROTAC. D’autres constituants cellulaires sont aussi éligibles à une dégradation induite : ARN-PROTAC pour les protéines se liant à l’ARN et RIBOTAC pour la dégradation de l’ARN lui-même comme celui du SARS-CoV-2. Des dégradations induites en dehors du protéasome sont aussi connues : LYTAC, pour des chimères détournant la dégradation de protéines extracellulaires vers les lysosomes, et MADTAC, pour des chimères détournant la dégradation par macroautophagie. Plusieurs techniques, en particulier des plates-formes de criblage, la modélisation mathématique et la conception computationnelle sont utilisées pour le développement de nouveaux PROTAC efficaces.

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11

Pourcel, Christine. "Historique de la découverte des systèmes CRISPR-Cas." Biologie Aujourd'hui 211, no. 4 (2017): 247–54. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2018001.

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Klein, Nathalie, Selina Rust, and Lennart Randau. "CRISPR-Cas-Systeme der Klasse 1: Genome Engineering und Silencing." BIOspektrum 28, no. 4 (June 2022): 370–73. http://dx.doi.org/10.1007/s12268-022-1775-9.

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Abstract:

AbstractClass 1 CRISPR-Cas systems are prevalent among prokaryotes and are characterized by effector complexes that consist of multiple Cas protein subunits. Type I systems recruit the DNA nuclease Cas3 for target DNA degradation. Type IV systems exhibit CRISPR interference in the absence of DNA cleavage. These mechanisms allow for versatile genome engineering and silencing approaches. Here, we indicate advantages and drawbacks in comparison to more commonly employed Cas9-based tools.

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Bikard, David, and Rodolphe Barrangou. "Les systèmes CRISPR-Cas comme arme contre les bactéries pathogènes." Biologie Aujourd'hui 211, no. 4 (2017): 265–70. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2018004.

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Müller-Esparza, Hanna, Daniel Gleditzsch, and Lennart Randau. "Vielfältige Genscheren: natürliche Aktivitäten von CRISPR-Cas-Systemen." BIOspektrum 24, no. 7 (November 2018): 704–6. http://dx.doi.org/10.1007/s12268-018-0978-6.

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Matthijs, Herman, and Micheline Goche. "Le système budgétaire des Communautés européennes." Courrier hebdomadaire du CRISP 1257-1258, no. 32 (1989): 1. http://dx.doi.org/10.3917/cris.1257.0001.

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Bragard-Desoroux, Eliane. "Le financement du système universitaire belge." Courrier hebdomadaire du CRISP 1261-1262, no. 36 (1989): 1. http://dx.doi.org/10.3917/cris.1261.0001.

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Magdalijns, Christophe, and Marjorie Gassner. "Propositions de réforme du système électoral." Courrier hebdomadaire du CRISP N° 1604, no. 19 (1998): 1. http://dx.doi.org/10.3917/cris.1604.0001.

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Soppa, Jörg. "Neue Funktion von CRISPR-Systemen: Basis für Archaea-Symbiosen." BIOspektrum 30, no. 2 (March 2024): 235–36. http://dx.doi.org/10.1007/s12268-024-2139-4.

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Lagasse, Charles-Etienne. "Le système des relations internationales dans la Belgique fédérale." Courrier hebdomadaire du CRISP 1549-1550, no. 4 (1997): 1. http://dx.doi.org/10.3917/cris.1549.0001.

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Riveros-Maidana, Rocío, Alejandro Méndez-Ferreira, Nidia Benítez-Candia, Eva Nara-Pereira, and Danilo Fernández-Ríos. "Sistema CRISPR/Cas: Edición genómica de precisión." Memorias del Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud 18, no. 1 (April 26, 2020): 97–107. http://dx.doi.org/10.18004/mem.iics/1812-9528/2020.018.01.97-107.

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Witmeur, Renaud, Daniel Désir, and Florence Hut. "La réforme Obama du système américain de soins de santé." Courrier hebdomadaire du CRISP 2160-2161, no. 35 (2012): 1. http://dx.doi.org/10.3917/cris.2160.0001.

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Demertzis, Vaïa. "Le système des prestations familiales en Belgique avant la sixième réforme de l’État." Courrier hebdomadaire du CRISP 2405, no. 40 (2018): 5. http://dx.doi.org/10.3917/cris.2405.0005.

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Astezan, Amélie, Jade Chargelegue, Eliot David, Julien Giraud, Clémentine Saunier, and Laurent Aussel. "Les bactériophages, nouveaux auteurs du génome." médecine/sciences 39, no. 8-9 (August 2023): 669–75. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2023103.

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Abstract:

Dans le cadre de l’unité d’enseignement « Rédiger en sciences » proposée par Aix-Marseille université, les étudiants du Master 2 Microbiologie intégrative et fondamentale (MIF) - en partenariat avec l’institut de microbiologie, bioénergies et biotechnologie (IM2B) - ont été confrontés aux exigences de l’écriture scientifique. Trois thématiques leur ont été proposées en relation étroite avec les laboratoires de recherche du tissu local : l’homéostasie des métaux chez les pathogènes, la synthèse de la paroi bactérienne et les systèmes anti-CRISPR des bactériophages. Les étudiants ont ainsi rédigé une nouvelle soulignant les résultats majeurs et l’originalité des articles étudiés. Complété par un entretien avec leurs auteurs, l’ensemble offre un éclairage original sur la compréhension du vivant dans le domaine de la microbiologie et de la santé.

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Gao, Yuli, Guohui Chuai, Weichuan Yu, Shen Qu, and Qi Liu. "Data imbalance in CRISPR off-target prediction." Briefings in Bioinformatics 21, no. 4 (July 2, 2019): 1448–54. http://dx.doi.org/10.1093/bib/bbz069.

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Abstract:

Abstract For genome-wide CRISPR off-target cleavage sites (OTS) prediction, an important issue is data imbalance—the number of true OTS recognized by whole-genome off-target detection techniques is much smaller than that of all possible nucleotide mismatch loci, making the training of machine learning model very challenging. Therefore, computational models proposed for OTS prediction and scoring should be carefully designed and properly evaluated in order to avoid bias. In our study, two tools are taken as examples to further emphasize the data imbalance issue in CRISPR off-target prediction to achieve better sensitivity and specificity for optimized CRISPR gene editing. We would like to indicate that (1) the benchmark of CRISPR off-target prediction should be properly evaluated and not overestimated by considering data imbalance issue; (2) incorporation of efficient computational techniques (including ensemble learning and data synthesis techniques) can help to address the data imbalance issue and improve the performance of CRISPR off-target prediction. Taking together, we call for more efforts to address the data imbalance issue in CRISPR off-target prediction to facilitate clinical utility of CRISPR-based gene editing techniques.

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CORNUZ, J., and X. GOCKO. "LA PREMIERE LIGNE FRANCOPHONE ET LA CRISE DE LA COVID-19." EXERCER 34, no. 189 (January 1, 2023): 3. http://dx.doi.org/10.56746/exercer.2023.189.3.

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Abstract:

Le mot « crise » en chinois est décrit par deux idéogrammes signifiant « danger » et « opportunité ». Si nous avons facilement perçu la notion de danger à travers la crise de la COVID-19, celle d’opportunité semble moins évidente au premier abord. Comme le dieu Janus, la crise de la COVID-19 a deux faces, d’ailleurs souvent médiatisées. La face probablement la plus visible pour les soignants est la mise en tension sans égale des systèmes de soins à travers le monde. Les images de malades agonisant dans les couloirs témoignent de cette tension qui, comme la maladie, peut être qualifiée d’émergente. Alors même que les hôpitaux étaient débordés, les cabinets médicaux étaient désertés. En France, cet imbroglio a même été organisé par l’État avec une recommandation initiale aux patients de ne plus consulter la première ligne... L’État a par la suite inversé la vapeur. Était-ce une réelle prise de conscience du risque de négliger la prévention ou le soin des maladies chroniques ? Rien n’est moins sûr, c’était peut-être simplement une réponse d’apaisement aux professionnels qui avaient manifesté leur étonnement et mécontentement. Il n’est pas certain que l’État ait compris la notion de syndémie et son entrelacement de facteurs biologiques et environnementaux1. Il n’est pas certain que l’État ait compris l’importance de la première ligne, de la prévention et des soins apportés aux maladies chroniques avec la prise en compte des inégalités sociales. Et pourtant, les réanimations débordaient de patients avec des maladies chroniques, dont le gradient social est criant… Une première ligne forte pourrait donc modifier l’impact d’une maladie infectieuse émergente. Alors danger ou opportunité pour le système de santé ? L’autre face très médiatique est probablement celle de la crise des savoirs. Tous les savoirs ont été malmenés : scientifiques, médicaux, expérientiels, profanes… Utilité des masques, saga de l’hydroxychloroquine, hésitation vaccinale, efficacité du dépistage communautaire2, gains de fonctions, controverses scientifiques ont occupé les plateaux de télévision et les esprits. Comment la première ligne, les médecins généralistes, ont-ils vécu dans et avec ce brouhaha infodémique3? Comment ont-ils géré l’incertitude inhérente à leur métier, mais exacerbée par le contexte de crise ? Malgré toutes les incertitudes autour de tous ces savoirs, comment ne pas saluer aussi un séquençage du virus express, un développement vaccinal aussi rapide ? La première ligne a participé à la recherche avec le test de médicaments avant l’orage cytokinique. Elle a aussi assuré sa transposition didactique auprès des patients en leur expliquant le développement rapide des vaccins et leur balance bénéfices/risques. Alors danger ou opportunité pour les savoirs ? Face à toutes ces questions, un petit groupe de médecins de première ligne a témoigné, réfléchi, et réfléchit encore aux deux faces du mot « crise ». Vous découvrirez dans exercer un résumé de leurs réflexions par pays (Belgique, Canada, France, Suisse) et, pour aller plus loin, les minutes d’un symposium sur le sujet qui a eu lieu à Lausanne en septembre 2022 publié dans la Revue médicale suisse4. Tous ces travaux ne sont que le début de la réflexion de la première ligne francophone, puisque le dieu Janus regarde à la fois vers le danger et vers l’opportunité, vers le passé et vers l’avenir.

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Bernheim, Aude. "Incontournables et pourtant rares : les déterminants de la distribution des systèmes CRISPR-Cas dans les génomes bactériens." Biologie Aujourd'hui 211, no. 4 (2017): 255–64. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2018005.

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Khan, Sehrish, Muhammad Mahmood, Sajjad Rahman, Farzana Rizvi, and Aftab Ahmad. "Evaluation of the CRISPR/Cas9 system for the development of resistance against Cotton leaf curl virus in model plants." Plant Protection Science 56, No. 3 (June 11, 2020): 154–62. http://dx.doi.org/10.17221/105/2019-pps.

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Abstract:

Over the last decade, the Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) CRISPR/Cas9 system has been used by biologists in various fields. In plant biology, the technology is being utilised to manufacture transgenic plants resistant to different diseases. In Pakistan, the Cotton leaf curl virus (CLCuV) (a begomovirus) affects cotton plants causing significant loss to the economy of this agriculturally based country. In the present study, we use the CRISPR/Cas9 system in Nicotiana benthamiana Domin (a model plant) to develop resistance against CLCuV. An interesting facet of the study was the comparison of two constructs (pHSE401 and pKSE401) with regards to their efficacy in the virus inhibition. The pKSE401 vector contained a Cas9 nuclease and two guide RNAs (gRNAs), one targeting the Replication associated protein (Rep) gene and the other targeted the βC1 gene of the Betasatellite. The vector pHSE401 had only one sgRNA that targeted the (Rep) gene. Both genes that are intended to be targeted play important roles in the replication of CLCuV. Plants infiltrated with pKSE401 exhibited a delay in the development of the symptoms of the disease and showed lower virus titres. Our proposed multiplexing approach gave efficient results of the resistance in the model plants, and the results in this communication may be extended to the CRISPR/Cas9 based editing of cotton plants.

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Yan, Jifang, Guohui Chuai, Chi Zhou, Chenyu Zhu, Jing Yang, Chao Zhang, Feng Gu, Han Xu, Jia Wei, and Qi Liu. "Benchmarking CRISPR on-target sgRNA design." Briefings in Bioinformatics 19, no. 4 (February 15, 2017): 721–24. http://dx.doi.org/10.1093/bib/bbx001.

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Kang Yue, 康玥, 廖雪瑶 Liao Xueyao, 谭向宇 Tan Xiangyu, 郭萍 Guo Ping, and 田训 Tian Xun. "CRISPR/Cas9系统活细胞成像技术进展（特邀）." Infrared and Laser Engineering 51, no. 11 (2022): 20220597. http://dx.doi.org/10.3788/irla20220597.

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Herm, Lukas-Valentin, Christian Janiesch, and Patrick Fuchs. "Der Einfluss von menschlichen Denkmustern auf künstliche Intelligenz – Eine strukturierte Untersuchung von kognitiven Verzerrungen." HMD Praxis der Wirtschaftsinformatik 59, no. 2 (March 2, 2022): 556–71. http://dx.doi.org/10.1365/s40702-022-00844-1.

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Abstract:

ZusammenfassungKünstliche Intelligenz (KI) dringt vermehrt in sensible Bereiche des alltäglichen menschlichen Lebens ein. Es werden nicht mehr nur noch einfache Entscheidungen durch intelligente Systeme getroffen, sondern zunehmend auch komplexe Entscheidungen. So entscheiden z. B. intelligente Systeme, ob Bewerber in ein Unternehmen eingestellt werden sollen oder nicht. Oftmals kann die zugrundeliegende Entscheidungsfindung nur schwer nachvollzogen werden und ungerechtfertigte Entscheidungen können dadurch unerkannt bleiben, weshalb die Implementierung einer solchen KI auch häufig als sogenannte Blackbox bezeichnet wird. Folglich steigt die Bedrohung, durch unfaire und diskriminierende Entscheidungen einer KI benachteiligt behandelt zu werden. Resultieren diese Verzerrungen aus menschlichen Handlungen und Denkmustern spricht man von einer kognitiven Verzerrung oder einem kognitiven Bias. Aufgrund der Neuigkeit dieser Thematik ist jedoch bisher nicht ersichtlich, welche verschiedenen kognitiven Bias innerhalb eines KI-Projektes auftreten können. Ziel dieses Beitrages ist es, anhand einer strukturierten Literaturanalyse, eine gesamtheitliche Darstellung zu ermöglichen. Die gewonnenen Erkenntnisse werden anhand des in der Praxis weit verbreiten Cross-Industry Standard Process for Data Mining (CRISP-DM) Modell aufgearbeitet und klassifiziert. Diese Betrachtung zeigt, dass der menschliche Einfluss auf eine KI in jeder Entwicklungsphase des Modells gegeben ist und es daher wichtig ist „mensch-ähnlichen“ Bias in einer KI explizit zu untersuchen.

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Kwon, Deok-Ho, Joong-Hee Park, Deok Yeol Jeong, Jae-Bum Park, Dong-Min Park, Kyoung-Gon Kang, Seo-Young Choi, Soo Rin Kim, and Suk-Jin Ha. "Application of Genome Editing Method on Kluyveromyces marxianus 17694-DH2 using CRISPR-Cas9 System for Enhanced Xylose Utilization." KSBB Journal 34, no. 4 (December 31, 2019): 243–47. http://dx.doi.org/10.7841/ksbbj.2019.34.4.243.

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Laplantine, François. "Penser anthropologiquement la religion." Anthropologie et Sociétés 27, no. 1 (October 2, 2003): 11–33. http://dx.doi.org/10.7202/007000ar.

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Abstract:

Résumé L’auteur montre d’abord qu’il existe dans les sociétés contemporaines deux formes de sensibilité religieuse : un religieux par soustraction et différenciation, revalorisant les traditions et tendant à se crisper sur les frontières, et un religieux par pluralisation des médiations du sacré, regroupant des croyants venus d’horizons spirituels différents. Puis il interroge la notion de communauté et, à travers cette dernière, la relation du religieux au corps, à la santé et à la maladie. Il questionne ensuite la pertinence anthropologique des notions de « sortie », de « retour » et de « recomposition » pour analyser les phénomènes religieux. Il propose enfin de repenser des processus microscopiques qui ne cessent de se transformer non plus en tant que systèmes de signes ou ensembles de symboles, mais dans la tension du rythme.

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Narch, Hilda. "Crisis Management Communications System." Rhetoric and Communications, no. 58 (January 31, 2024): 96–109. http://dx.doi.org/10.55206/dmjz3080.

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Abstract:

Abstract: The article is devoted to the clarification of basic concepts related to crisis management, communications systems, leadership, strategic leadership and its relation to the internal and external factors of crisis management. The study highlights the concept of both strategic leadership and a strategic leader and their significant role in managing educational organizations, maintaining their balance, and evolving and improving their performance in the light of the globalization imposed. The aim is to present study highlights regarding topics that might deter the strategic leader’s work in achieving safety and security in public schools after detecting structural crisis. The research is based on the following hypotheses to examine and analyse the associations between strategic leadership represented by dimensions including internal environment, external factors, change management and method and strategic planning and their impact on crisis management. H1. The higher the association between strategic leadership and coping with the internal environment, the greater the lead to crisis management. H2. The higher the association between strategic leadership and coping with the external factors, the greater the lead to crisis management. The methodology includes the method of desk research. The research provides a theoretical review of previous studies of strategic leadership and its impact on crisis management; clarifying the characteristics, attributes, tasks and skills of strategic leadership; and identifying the strategic criteria and types of crises. Keywords: crisis management, information system, strategic leader, strategic leadership, educational organization, internal and external factors. Rhetoric and Communications Journal, issue 58, January 2024

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Burnight, Erin R., Joseph C. Giacalone, Jessica A. Cooke, Jessica R. Thompson, Laura R. Bohrer, Kathleen R. Chirco, Arlene V. Drack, et al. "CRISPR-Cas9 genome engineering: Treating inherited retinal degeneration." Progress in Retinal and Eye Research 65 (July 2018): 28–49. http://dx.doi.org/10.1016/j.preteyeres.2018.03.003.

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Wu, Wenyi, Luosheng Tang, Patricia A. D'Amore, and Hetian Lei. "Application of CRISPR-Cas9 in eye disease." Experimental Eye Research 161 (August 2017): 116–23. http://dx.doi.org/10.1016/j.exer.2017.06.007.

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MOGILENKO, A. V., D. A. PAVLYUCHENKO, and V. Z. MANUSOV. "DEVELOPMENT OF FUZZY REGRESSION MODELS USING GENETIC ALGORITHMS." International Journal of Uncertainty, Fuzziness and Knowledge-Based Systems 11, no. 04 (August 2003): 429–44. http://dx.doi.org/10.1142/s021848850300217x.

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Abstract:

This paper presents the comparative study for fuzzy regression model using linear programming and fuzzy regression model using genetic algorithms. Two cases were considered: crisp X – crisp Y and crisp X – fuzzy Y. Simulation was carried out with a tool developed in MATLAB.

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Hossein-Abad, Hadi Mahdipour, Mohsen Shabanian, and Iman Abaspur Kazerouni. "Vectorized Kernel-Based Fuzzy C-Means: a Method to Apply KFCM on Crisp and Non-Crisp Numbers." International Journal of Uncertainty, Fuzziness and Knowledge-Based Systems 28, no. 04 (August 2020): 635–59. http://dx.doi.org/10.1142/s0218488520500270.

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Abstract:

Kernel methods are a class of algorithms for pattern analysis to robust them to noise, overlaps, outliers and also unequal sized clusters. In this paper, kernel-based fuzzy c-means (KFCM) method is extended to apply KFCM on any crisp and non-crisp input numbers only in a single structure. The proposed vectorized KFCM (VKFM) algorithm maps the input (crisp or non-crisp) features to crisp ones and applies the KFCM (with prototypes in feature space) on them. Finally the resulted crisp prototypes in the mapped space are influenced by an inverse mapping to obtain the prototypes’ (centers’) parameters in the input features space. The performance of the proposed method has been compared with the conventional FCM and KFCM and other new methods, to show its effectiveness in clustering of gene expression data and segmentation of land-cover using satellite images. Simulation results show good accuracy of proposed method in compare to other methods.

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Değirmenci, Laura, Dietmar Geiger, Fábio Luiz Rogé Ferreira, Alexander Keller, Beate Krischke, Martin Beye, Ingolf Steffan-Dewenter, and Ricarda Scheiner. "CRISPR/Cas 9-Mediated Mutations as a New Tool for Studying Taste in Honeybees." Chemical Senses 45, no. 8 (September 24, 2020): 655–66. http://dx.doi.org/10.1093/chemse/bjaa063.

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Abstract:

Abstract Honeybees rely on nectar as their main source of carbohydrates. Sucrose, glucose, and fructose are the main components of plant nectars. Intriguingly, honeybees express only 3 putative sugar receptors (AmGr1, AmGr2, and AmGr3), which is in stark contrast to many other insects and vertebrates. The sugar receptors are only partially characterized. AmGr1 detects different sugars including sucrose and glucose. AmGr2 is assumed to act as a co-receptor only, while AmGr3 is assumedly a fructose receptor. We show that honeybee gustatory receptor AmGr3 is highly specialized for fructose perception when expressed in Xenopus oocytes. When we introduced nonsense mutations to the respective AmGr3 gene using CRISPR/Cas9 in eggs of female workers, the resulting mutants displayed almost a complete loss of responsiveness to fructose. In contrast, responses to sucrose were normal. Nonsense mutations introduced by CRISPR/Cas9 in honeybees can thus induce a measurable behavioral change and serve to characterize the function of taste receptors in vivo. CRISPR/Cas9 is an excellent novel tool for characterizing honeybee taste receptors in vivo. Biophysical receptor characterization in Xenopus oocytes and nonsense mutation of AmGr3 in honeybees unequivocally demonstrate that this receptor is highly specific for fructose.

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Shigemori, Hiroki, Satoshi Fujita, Eiichi Tamiya, and Hidenori Nagai. "Miniaturization of CRISPR/Cas12-Based DNA Sensor Array by Non-Contact Printing." Micromachines 15, no. 1 (January 17, 2024): 144. http://dx.doi.org/10.3390/mi15010144.

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Abstract:

DNA microarrays have been applied for comprehensive genotyping, but remain a drawback in complicated operations. As a solution, we previously reported the solid-phase collateral cleavage (SPCC) system based on the clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein 12 (CRISPR/Cas12). Surface-immobilized Cas12-CRISPR RNA (crRNA) can directly hybridize target double-stranded DNA (dsDNA) and subsequently produce a signal via the cleavage of single-stranded DNA (ssDNA) reporter immobilized on the same spot. Therefore, SPCC-based multiplex dsDNA detection can be performed easily. This study reports the miniaturization of SPCC-based spots patterned by a non-contact printer and its performance in comprehensive genotyping on a massively accumulated array. Initially, printing, immobilization, and washing processes of Cas12–crRNA were established to fabricate the non-contact-patterned SPCC-based sensor array. A target dsDNA concentration response was obtained based on the developed sensor array, even with a spot diameter of 0.64 ± 0.05 mm. Also, the limit of detection was 572 pM, 531 pM, and 3.04 nM with 40, 20, and 10 nL-printing of Cas12–crRNA, respectively. Furthermore, the sensor array specifically detected three dsDNA sequences in one-pot multiplexing; therefore, the feasibility of comprehensive genotyping was confirmed. These results demonstrate that our technology can be miniaturized as a CRISPR/Cas12-based microarray by using non-contact printing. In the future, the non-contact-patterned SPCC-based sensor array can be applied as an alternative tool to DNA microarrays.

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GHIYASVAND, MEHDI. "A NEW APPROACH FOR SOLVING THE MINIMUM COST FLOW PROBLEM WITH INTERVAL AND FUZZY DATA." International Journal of Uncertainty, Fuzziness and Knowledge-Based Systems 19, no. 01 (February 2011): 71–88. http://dx.doi.org/10.1142/s0218488511006897.

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Abstract:

In particular, imprecise observations or possible perturbations mean that data in a network flows may well be better represented by intervals or fuzzy numbers than crisp quantities. In this paper we first consider the minimum cost flow problem with compact interval-valued lower and upper bounds, flows, and costs. We present a new method that shows this problem is solved using two minimum cost flow problems with crisp data. Then this result is extended to networks with fuzzy lower and upper bounds, flows, and costs. One of the best algorithms to solve the minimum cost flow problem with crisp data is the cost scaling algorithm of Goldberg and Tarjan.17 In this paper, the cost scaling algorithm is modified for fuzzy lower and upper bounds, flows and costs. The running time of the modified algorithm is equal to the running time of the cost scaling algorithm with crisp data.

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Schmierer, Bernhard, Sandeep K. Botla, Jilin Zhang, Mikko Turunen, Teemu Kivioja, and Jussi Taipale. "CRISPR/Cas9 screening using unique molecular identifiers." Molecular Systems Biology 13, no. 10 (October 2017): 945. http://dx.doi.org/10.15252/msb.20177834.

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Yoon, Hak Yol. "Development Trend of Crisis Management System in Korea." Korean Journal of Policy Studies 6 (December 31, 1991): 113–36. http://dx.doi.org/10.52372/kjps06007.

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Abstract:

From the beginning of history, a great number of wars caused by conflict of ideologies, racial discrimination, needs to reserve natural resources, and territorial ambitions have changed global maps and streams of history with heavy damage to mankind in all parts of the world. As mentioned above, a lot of events have also happened in persons, families, and every side of society. As results of wars, conflicts, party strifes, and ets., small or great events are inevitable at home and abroad. These kinds of great or small events always follow a crisis. Good crisis management can prevent one from causing great or small events by way of overcoming national strifes and international collision. Looking back upon the past history, wars around 900 times had caused sufferings of the Korean.

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Šabović, Šerif. "UTICAJ KRIZE NA RAČUNOVODSTVENI SISTEM." Socioeconomica 2, no. 4 (December 28, 2013): 349–62. http://dx.doi.org/10.12803/sjseco.246313.

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COUSO, INÉS, and SUSANA MONTES. "AN AXIOMATIC DEFINITION OF FUZZY DIVERGENCE MEASURES." International Journal of Uncertainty, Fuzziness and Knowledge-Based Systems 16, no. 01 (February 2008): 1–17. http://dx.doi.org/10.1142/s0218488508005017.

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Abstract:

The representation of the degree of difference between two fuzzy subsets by means of a real number has been proposed in previous papers, and it seems to be useful in some situations. However, the requirement of assigning a precise number may lead us to the loss of essential information about this difference. Thus, (crisp) divergence measures studied in previous papers may not distinguish whether the differences between two fuzzy subsets are in low or high membership degrees. In this paper we propose a way of measuring these differences by means of a fuzzy valued function which we will call fuzzy divergence measure. We formulate a list of natural axioms that these measures should satisfy. We derive additional properties from these axioms, some of them are related to the properties required to crisp divergence measures. We finish the paper by establishing a one-to-one correspondence between families of crisp and fuzzy divergence measures. This result provides us with a method to build a fuzzy divergence measure from a crisp valued one.

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ABBASBANDY, S., and T. ALLAHVIRANLOO. "THE ADOMIAN DECOMPOSITION METHOD APPLIED TO THE FUZZY SYSTEM OF FREDHOLM INTEGRAL EQUATIONS OF THE SECOND KIND." International Journal of Uncertainty, Fuzziness and Knowledge-Based Systems 14, no. 01 (February 2006): 101–10. http://dx.doi.org/10.1142/s0218488506003868.

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Abstract:

In this work, the Adomian decomposition(AD) method is applied to the Fuzzy system of linear Fredholm integral equations of the second kind(FFIE). First the crisp Fredholm integral equation is solved by AD method and then the crisp solution is fuzzified by extension principle. The proposed algorithm is illustrated by solving a numerical example.

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Yu, Xiaohui, and Qiang Zhang. "Core for Game with Fuzzy Generalized Triangular Payoff Value." International Journal of Uncertainty, Fuzziness and Knowledge-Based Systems 27, no. 05 (October 2019): 789–813. http://dx.doi.org/10.1142/s0218488519500351.

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Abstract:

In this paper, we investigate cooperative game with fuzzy payoff value in the generalized triangular fuzzy number directly. Based on the fuzzy max order, we define three kinds of fuzzy cores, i.e., fuzzy strong core, fuzzy non-dominated core and fuzzy weak core. All three kinds of fuzzy cores can be regarded as the generalization of crisp core. Convexity is one of the sufficient conditions for the existence of fuzzy core. By the balanced cooperative game, a necessary and sufficient existence condition of fuzzy strong core is also given. Further, the fuzzy strong core is represented by crisp core, and the relationship between fuzzy strong core and crisp one is shown. For the fuzzy non-dominated core and fuzzy weak core, we show their necessary and sufficient existence condition, and their properties to construct the fuzzy imputations. Hence, the verification of fuzzy non-dominated core and fuzzy weak core become easier. The above three fuzzy cores are all the extensions of crisp core, but their stable conditions are not different. The weak core is least restricted, but is least stable. Hence, we could choose the fuzzy core according the stable neediness of fuzzy cooperative game.

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Aly, S., and I. Vrana. "Integrating multiple fuzzy expert systems under restricting requirements ." Agricultural Economics (Zemědělská ekonomika) 52, No. 4 (February 17, 2012): 187–96. http://dx.doi.org/10.17221/5015-agricecon.

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Abstract:

The multiple, different and specific expertises are often needed in making YES-or-NO (YES/NO) decisions for treating a variety of business, economic, and agricultural decision problems. This is due to the nature of such problems in which decisions are influenced by multiple factors, and accordingly multiple corresponding expertises are required. Fuzzy expert systems (FESs) are widely used to model expertise due to its capability to model real world values which are not always exact, but frequently vague, or uncertain. In addition, they are able to incorporate qualitative factors. The problem of integrating multiple fuzzy expert systems involves several independent and autonomous fuzzy expert systems arranged synergistically to suit a varying problem context. Every expert system participates in judging the problem based on a predefined match between problem context and the required specific expertises. In this research, multiple FESs are integrated through combining their crisp numerical outputs, which reflect the degree of bias to the Yes/No subjective answers. The reasons for independency can be related to maintainability, decision responsibility, analyzability, knowledge cohesion and modularity, context flexibility, sensitivity of aggregate knowledge, decision consistency, etc. This article presents simple algorithms to integrate multiple parallel FES under specific requirements: preserving the extreme crisp output values, providing for null or non-participating expertises, and considering decision-related expert systems, which are true requirements of a currently held project. The presented results provides a theoretical framework, which can bring advantage to decision making is many disciplines, as e.g. new product launching decision, food quality tracking, monitoring of suspicious deviation of the business processes from the standard performance, tax and customs declaration issues, control and logistic of food chains/networks, etc. 

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Kursunel, Fahri. "The impact of accounting information system on reducing the severitiy of crisis during the crisis period." New Trends and Issues Proceedings on Humanities and Social Sciences 2, no. 2 (January 12, 2016): 131–37. http://dx.doi.org/10.18844/gjhss.v2i2.425.

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KAO, CHIANG, and SHIANG-TAI LIU. "DATA ENVELOPMENT ANALYSIS WITH IMPRECISE DATA: AN APPLICATION OF TAIWAN MACHINERY FIRMS." International Journal of Uncertainty, Fuzziness and Knowledge-Based Systems 13, no. 02 (April 2005): 225–40. http://dx.doi.org/10.1142/s0218488505003412.

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Abstract:

Technology and management are two broad categories of factors that have major influence on the productivity of manufacturing firms. The ratio of the actual productivity of a firm to its maximal productivity is a measure of efficiency. Since the automation technology level and production management achievement of a firm cannot be measured precisely, a fuzzy data envelopment analysis (FDEA) model is applied to calculate the efficiency scores of a sample of machinery firms in Taiwan. Different from the conventional crisp DEA, the efficiency scores calculated from the FDEA model are fuzzy numbers, in that ranges of values at different possibility levels rather than a single crisp value are provided. When the observations are fuzzy in nature, the FDEA methodology avoids the top management from being over-confident with the results as opposed to that of using the conventional DEA methodology by simplifying the fuzzy observations to crisp values.

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Hung, Sandy S. C., Tristan McCaughey, Olivia Swann, Alice Pébay, and Alex W. Hewitt. "Genome engineering in ophthalmology: Application of CRISPR/Cas to the treatment of eye disease." Progress in Retinal and Eye Research 53 (July 2016): 1–20. http://dx.doi.org/10.1016/j.preteyeres.2016.05.001.

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