Academic literature on the topic 'Suivis acoustiques passifs'

Abstract The monitoring of bird species across their geographic ranges is essential in order to assess population status and trends and to inform conservation action. However, undertaking monitoring, particularly in the long-term, is often resource-intensive and costly. In recent years, the use of passive acoustic monitoring (PAM) has emerged as a useful monitoring tool. Birds are especially appropriate for bioacoustic monitoring because they regularly produce species-specific vocalizations. Here we report on pilot deployments of autonomous recording units (ARUs) on the island of Anguilla. ARUs were deployed for up to 7 days and the recorded data was subject to analysis by BirdNET, an automated bird recognition software. BirdNET identified 43,655 vocalizations from 75 species, of which 48 species were confirmed manually (27 were identified as false positives). The cumulative number of species recorded plateaued after approximately 3 days of recording and the highest level of activity (peak number of vocalizations) were found between 0400–0900 and 1800–1900. When compared to point counts, PAM identified more species at each site but did not record any species that had not been previously recorded in Anguilla. We conclude that PAM can serve as a useful tool for monitoring the presence of birds, particularly at remote sites where access may be difficult, and could prove to be valuable in the establishment of long-term monitoring programs. Keywords ARU, bioacoustics, BirdNET, Caribbean, Lesser Antilles, migratory birds, PAM Resumen Monitoreo acústico pasivo de aves en las Antillas Menores: ¿una herramienta útil para el monitoreo de sitios remotos? • El monitoreo de las especies de aves en toda su área de distribución geográfica es esencial para evaluar el estado y las tendencias poblacionales, y para fundamentar las acciones de conservación. Sin embargo, llevar a cabo el monitoreo, particularmente a largo plazo, a menudo requiere muchos recursos y es costoso. En los últimos años, el uso del monitoreo acústico pasivo (PAM) se ha revelado como una herramienta útil para el monitoreo. Las aves son especialmente apropiadas para el monitoreo bioacústico, porque producen regularmente vocalizaciones especie-específicas. Aquí presentamos un informe sobre la implementación piloto de unidades de grabación autónomas (ARU) en la isla de Anguila. Las ARU se utilizaron durante un máximo de 7 días y los datos registrados se analizaron con BirdNET, un software de reconocimiento automático de aves. BirdNET identificó 43.655 vocalizaciones de 75 especies, de las cuales 48 especies se confirmaron manualmente (27 se identificaron como falsos positivos). El número acumulado de especies registradas se estabilizó después de aproximadamente 3 días de grabación, y el nivel más alto de actividad (número máximo de vocalizaciones) se encontró entre las 0400–0900 y las 1800–1900. En comparación con los puntos de conteo, el PAM permitió identificar más especies en cada sitio, pero no se encontró ninguna que no se hubiera registrado previamente en Anguila. Concluimos que el PAM puede servir como una herramienta útil para monitorear la presencia de aves, particularmente en sitios remotos donde el acceso puede ser difícil, y que podría resultar valioso en el establecimiento de programas de monitoreo a largo plazo. Palabras clave Antillas Menores, ARU, aves migratorias, bioacústica, BirdNET, Caribe, PAM Résumé Suivi acoustique passif des oiseaux dans les Petites Antilles – Un outil utile pour le suivi de sites éloignés ? • Le suivi des espèces d’oiseaux sur l’ensemble de leur aire de répartition géographique est essentiel pour évaluer l’état et les tendances des populations et pour orienter les mesures de conservation. Toutefois, la mise en œuvre d’un suivi, en particulier à long terme, est coûteuse et nécessite souvent des ressources importantes. Ces dernières années, le suivi acoustique passif (PAM – passive acoustic monitoring) est apparu comme un outil de suivi utile. Les oiseaux se prêtent particulièrement bien au suivi bioacoustique, car ils émettent régulièrement des vocalisations propres à leur espèce. Nous présentons ici le déploiement pilote d’unités d’enregistrement autonomes (ARU – autonomous recording units) sur l’île d’Anguilla. Les unités ont été déployées pendant 7 jours et les données enregistrées ont été analysées par BirdNET, un logiciel de reconnaissance automatique des oiseaux. BirdNET a identifié 43 655 vocalisations de 75 espèces, dont 48 espèces confirmées manuellement (27 ont été identifiées comme faux positifs). Le nombre cumulé d’espèces enregistrées a atteint un plateau après environ 3 jours d’enregistrement et le niveau d’activité le plus élevé (nombre maximal de vocalisations) a été observé de 04h00 à 09h00 et de 18h00 à 19h00. En comparaison avec les points d’écoute, le suivi acoustique passif a identifié plus d’espèces sur chaque site, mais n’a pas enregistré d’espèces qui n’avaient pas été contactées auparavant à Anguilla. Nous concluons que le suivi acoustique passif peut être un outil utile pour suivre la présence d’oiseaux, en particulier sur les sites éloignés où l’accès peut être difficile, et qu’il pourrait s’avérer précieux pour la mise en place de programmes de suivi à long terme. Mots clés ARU, bioacoustique, BirdNET, Caraïbes, oiseaux migrateurs, PAM, Petites Antilles, suivi acoustique passif, unités d’enregistrement autonomes

Ce dernier siècle, les lumières électriques ont proliféré, modifiant l’environnement nocturne. Des études scientifiques alertent sur les effets négatifs de la lumière artificielle nocturne (LAN) qui perturbe de nombreux processus écologiques et de taxons. Notre objectif a ainsi été de combler des manques de connaissances afin d’aider à une meilleure considération des effets de la pollution lumineuse sur la biodiversité dans les mesures de conservation. Nous avons utilisé les chiroptères comme modèles biologiques car ce sont de bons bioindicateurs de l’effet des pressions anthropiques sur la biodiversité et, étant nocturnes, ils sont directement exposés à la LAN. Nous avons préconisé de considérer la distribution temporelle des espèces dans les mesures de conservation, un prérequis étant de connaître leur écologie temporelle. Nous avons utilisé les données d’un programme national de suivis acoustiques des chiroptères (Vigie-Chiro) pour étudier leur rythme d’activité nocturne (9807 nuits, 20 espèces). Nous avons montré que les espèces pouvaient être séparées en trois groupes ayant une activité crépusculaire, en cœur de nuit ou intermédiaire, avec des variations des rythmes d’activité selon les saisons. La prise en compte de ces rythmes complexes aiderait à concevoir des mesures de conservation efficaces, par exemple, en définissant des extinctions partielles de la LAN adaptées à des espèces cibles. La plupart des chiroptères émergeant tôt sont des espèces « tolérantes à la lumière » pouvant se nourrir sous les lampadaires. Cependant, à l’échelle du paysage, ces espèces semblent moins abondantes à cause de la LAN. Cela pourrait s’expliquer par des perturbations de leur rythme d’activité influant possiblement les dynamiques de population. A l’aide des données Vigie-Chiro, nous avons testé si la LAN induisait de telles perturbations pour une de ces espèces (Eptesicus serotinus). La LAN, et dans une moindre mesure la lumière de la lune, réduisaient son abondance. La LAN retardait son activité, ce décalage était amplifié par la couverture nuageuse, possiblement à cause de son effet amplificateur du halo lumineux. Des analyses complémentaires ont suggéré que la LAN retardait l’activité de deux autres espèces « tolérantes à la lumière ». Ainsi, même ces espèces devraient être protégées de la LAN. Lorsqu’éclairer est nécessaire, changer l’intensité, la direction ou le spectre des éclairages sont des mesures de réduction possibles. Nous assistons à une modernisation des éclairages avec des diodes électroluminescentes (LEDs). Malgré des impacts potentiels sur la biodiversité, peu d’études se sont intéressées à cette évolution. En réanalysant les données d’une étude publiée, nous avons montré que les changements de spectre et d’intensité accompagnant cette évolution avaient des effets additifs et interactifs sur les chiroptères. Quand l’intensité des LEDs augmentait, leur activité décroissait. Avec les données Vigie-Chiro, nous avons montré que les LEDs pouvait réduire la connectivité du paysage pour les chiroptères, cet impact étant atténué en orientant mieux les lumières. Nous avons recommandé d’utiliser des LEDs avec des couleurs plus chaudes et de moindre intensité. Evaluer l’effet de la LAN sur la biodiversité implique des approches spatio-temporelles multi-échelles. Malgré les manques, il y a désormais suffisamment de preuves de l’impact de la LAN sur les écosystèmes. Les mesures de réduction étant en développement, évaluer leur efficacité et les améliorations possibles est indispensable. Penser la réduction de la LAN à l’échelle du paysage est une évolution impérative, d’où l’émergence du concept de trame noire. Un projet pluridisciplinaire sur les pratiques communales d’éclairage et leurs évolutions a été initié pendant cette thèse. En effet, puisque la LAN n’a pas que des implications écologiques, mais aussi sanitaires et socio-culturelles, une perspective transdisciplinaire est indispensable pour changer nos façons d’éclairer
Electric lights have proliferated rapidly over the last century and have changed the night-time environment globally. Over the past decades, scientific studies have shown the effects of artificial light at night (ALAN) on biodiversity. Light pollution has been shown to disrupt a wide range of ecological processes and taxa. In this PhD, we aimed to fill some of the knowledge gaps that could prevent the effects of light pollution on biodiversity from being effectively addressed by mitigation measures. We used bats as model species because they are considered good indicators of the effect of anthropogenic pressures on biodiversity and because, being nocturnal, they are directly exposed to ALAN.We advocated considering the temporal distribution of species in conservation measures, a prerequisite being to have access to knowledge on their temporal ecology. We used data from a national bat monitoring program (Vigie-Chiro) based on acoustic monitoring to characterise bat diel activity patterns (9807 nights monitored, 20 species). We found that bat species could be separated into three functional groups characterised by a crepuscular activity, an activity that occurs when it is completely dark or an intermediate activity. We showed variations of diel activity patterns depending on the season. Accounting for these complex diel activity patterns would help to design efficient mitigation measures. For instance, it would allow the design of part-night lighting schemes covering the range of activity of the target species. Early emerging bats are mostly “light tolerant” species known to feed on insects attracted to lights. However, at the landscape scale, these species tend to be less abundant because of ALAN. This could be explained by disruptions in the diel activity patterns of bats due to ALAN, with potential consequences for population dynamics. Using the Vigie-Chiro dataset, we tested whether ALAN was responsible for such disruptions on a “light tolerant” species (Eptesicus serotinus). ALAN, and to a lesser extent moonlight, reduced its abundance. ALAN delayed activity, this delay was amplified during overcast nights, probably because cloud cover amplified skyglow. Further analyses suggested that two other “light tolerant” species might delay their activity because of ALAN. Thus, even “light tolerant” species should be protected from light pollution. Where it is not possible to switch off lights, other mitigation measures include changing the intensity, directionality and spectrum of light. Many countries are retrofitting lighting equipment with light emitting diodes (LEDs). Despite potential impacts on biodiversity, few studies have focused on this shift. By reanalysing the data from a previously published study, we found that changes in light spectrum and intensity during such a shift have additive and interactive effects on bats. Bat activity decreased with increasing LED intensity. Using the Vigie-Chiro dataset, we showed that the adoption of LEDs would decrease landscape connectivity for bats, with this impact possibly being mitigated by better orienting the light flux. We recommended using LEDs with warmer colours and reduced light intensity. Multiscale spatiotemporal approaches are needed to assess ALAN effect on biodiversity. Although some knowledge gaps remain, there is overwhelming evidence of the impact of light pollution on ecosystems. Mitigation measures are being developed, so there is a need to assess their effectiveness and possible improvements. Considering the reduction of ALAN at the landscape scale is a necessary next step, hence the emergence of the concept of dark ecological networks. A transdisciplinary project on lighting practices and their evolution in municipalities was initiated during this PhD. Indeed, as ALAN has not only ecological but also health and socio-cultural implications, a transdisciplinary perspective is needed to shift the paradigm from conventional lighting to new forms of lighting

La surveillance par acoustique passive est un outil d'importance croissante pour l'étude des mammifères marins. Cette thèse pose des nouveaux modèles pour l'étude du plus grand d'entre eux, la baleine bleue (Balaenoptera musculus), qui émet de très basses fréquences. Pour ce faire, nous avons enregistré un corpus inédit dans l'archipel de Humboldt au nord du Chili. Nos données révèlent un chant caractéristique de la baleine bleue 'chilienne', dont nous étudions la structure pulsée et l'évolution au cours des dernières décennies. Le classement en signal tonal ou non-tonal nous permet, en nous focalisant sur la fréquence fondamentale mise à jour, de quantifier la baisse en fréquence des chants et d'effectuer une comparaison des signaux au niveau mondial. Notre troisième contribution est une méthode de localisation mono-hydrophone basée sur des simulations de propagation par éléments spectraux. C'est à notre connaissance le premier modèle de ce type, implémenté en milliers d'heures de calcul haute performance. Nous concluons en soulignant l'intérêt des méthodes en bioacoustique comme moyen de suivi et de connaissance du milieu marin
Passive acoustic monitoring has a growing importance in marine mammals studies. This work is concerned with the largest of marine mammals, the blue whale (Balaenoptera musculus). We obtained a new corpus of acoustic data in the northern part of Chile, in the Humboldt archipelago. We show the presence of a song characteristic of the 'Chilean' blue whale, formerly described in southern Chile and Galapagos islands. Based on this sang type, we propose new methods of analysing and classifying pulsed sounds. Using the fundamental frequency thus obtained, we analyse the blue whale's sang, showing a general evolution of the frequency on a decadal scale. We also construct a method of mono­hydrophone source localisation based on high performance simulation of the acoustic wave field, by spectral elements methods. We conclude emphasizing on the importance of bioacoustic for monitoring the marine world

Le trafic maritime est le principal contributeur des bruits sous-marins anthropique : depuis les années 1970, l’augmentation du trafic maritime hauturier a provoqué dans certaines zones une augmentation du bruit ambiant de plus de 10 dB. En réponse à cette préoccupation, la Directive Cadre pour la Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) recommande un suivi acoustique. Peu d’études s’intéressent à l’activité côtière et aux bruits rayonnés par les petites embarcations ainsi qu’à leurs conséquences sur la faune marine alors que ces environnements côtiers sont les pourvoyeurs de 41.7 % des services écosystémiques produits par les océans.A mi-chemin entre le monde académique et le monde industriel, le travail présenté aux différents questions scientifiques et industrielles sur la thématique du trafic côtier, en termes de l’étude de son influence dans le paysage acoustique et de capacité à détecter et classifier les embarcations côtières.En l’absence d’information sur le trafic maritime côtier, un protocole d’identification visuelle par traitement d’images GoPro® produisant les mêmes données que l’AIS (position, vitesse, taille et type d’embarcation) est proposé et permet la création de carte du trafic maritime sur un disque de 1.6km de rayon. D’un point de vue acoustique, le trafic est caractérisé par deux descripteurs acoustiques, le SPL lié à la distance du bateau le plus proche et l’ANL caractérisant le nombre de bateaux dans un disque de 500 m de rayon. Le suivi spatio-temporel de ces descripteurs permet d’identifier l’impact du trafic maritime dans le paysage acoustique des environnements côtiers. La détection et la classification sont réalisées après caractérisation individuelle du bruit par un ensemble de paramètres acoustiques et par l’utilisation d’algorithmes d’apprentissage supervisé. Un protocole spécifique pour la création de l’arborescence de classification est proposé par comparaison des données acoustiques aux caractéristiques physiques et contextuelle de chaque bateau.Les travaux présentés sont illustrés sur la flottille d’embarcations côtières présente dans la baie de Calvi (Corse) durant la saison estivale
Marine traffic is the main contributor to anthropogenic underwater noise: since the 1970s, the increase in deep-sea shipping has increased the ambient noise by more than 10 dB in some areas. In response to this concern, the Marine Strategy Framework Directive (MSFD) recommends acoustic monitoring. Few studies are concerned with coastal activity and the noises radiated by small craft while these coastal environments are the purveyors of 41.7% of the ecosystem services produced by the oceans.Between the academic and the industrial world, this PhD was to answer the different scientific and industrial questions on the topic of the coastal traffic in terms of the influence in the soundscape and the detection and classification of the coastal craft.Without information on the coastal maritime traffic, a visual identification protocol is proposed using GoPro® images processing and produced the same data as the AIS (position, speed, size and type of craft); It allows to create maritime traffic maps on a disk of 1.6km radius. The traffic is characterized by two acoustic descriptors: the SPL linked to the distance of the nearest boat and the ANL linked to the number of boats present in a 500 m radius disc. The spatiotemporal monitoring of these descriptors allows to identify the impact on the maritime traffic on the coastal acoustic landscape. The acoustic detection and the classification are performed after individual characterization of the noise by a set of acoustic parameters and using of supervised machine learning algorithm. A specific protocol for the creation of the classification tree is proposed by comparing the acoustic data with the physical and contextual characteristics of each boat.The methods are applied on the flotilla of coastal boats present in the Bay of Calvi (Corsica) during summer

Le nombre croissant de travaux réalisés ces dernières années a montré que la bioacoustique est particulièrement intéressante pour le suivi d’espèces discrètes. L’émergence de dispositifs d’enregistrement autonomes, associée à de nouvelles méthodes d’analyse, ont récemment participé à l’accroissement des études dans ce domaine. Au cours des 30 dernières années, le Loup gris (Canis lupus), mammifère carnivore aux mœurs discrètes connu pour ses hurlements de longue portée, a fait l’objet de nombreuses études acoustiques. Ces dernières visaient notamment à améliorer son suivi, qui s’avère complexe du fait des grandes capacités de déplacement des loups, de l’étendue de leurs territoires et de la diversité des milieux dans lesquels ils vivent. Cependant, la bioacoustique passive a jusqu’alors très peu été exploitée pour le suivi du Loup. C’est dans ce contexte que la présente thèse s’est organisée autour de trois axes de recherche. Les deux premiers axes portent sur l’apport de la bioacoustique passive pour le suivi du Loup gris en milieu naturel. En combinant des analyses acoustiques, statistiques et cartographiques, le premier objectif a été d’élaborer une méthode pour l’échantillonnage spatial de vastes zones d’étude, afin d’y détecter des hurlements de loups à l’aide de réseaux d’enregistreurs autonomes. Ce même dispositif a ensuite permis, dans un second temps, de tester la possibilité de localiser les loups grâce à leurs hurlements. Les expérimentations conduites en milieu de moyenne montagne (Massif des Vosges) et de plaine (Côtes de Meuse), sur deux zones d’étude de 30 km² et avec un réseau de 20 enregistreurs autonomes, ont permis de démontrer l’intérêt de la bioacoustique passive pour le suivi du Loup gris. En effet, près de 70% des émissions sonores (son synthétique aux propriétés similaires à celles de hurlements de loups) ont été détectés par au moins un enregistreur autonome en milieu de moyenne montagne et plus de 80% en milieu de plaine, pour des distances enregistreurs– source sonore atteignant respectivement plus de 2.7 km et plus de 3.5 km. Grâce à un modèle statistique et à un Système d’Information Géographique, la probabilité de détection des hurlements a pu être cartographiée sur les deux zones. En moyenne montagne, elle était forte à très forte (>0.5) sur 5.72 km² de la zone d’étude, contre 21.43 km² en milieu de plaine. Les sites d’émission ont été localisés avec une précision moyenne de 315 ± 617 (SD) m, réduite à 167 ± 308 (SD) m après l’application d’un seuil d’erreur temporelle défini d’après la distribution des données. Le troisième axe de travail porte quant à lui sur l’application d’indices de diversité acoustique pour estimer le nombre d’individus participant à un chorus et ainsi contribuer au suivi de l’effectif des meutes. Les valeurs obtenues pour les six indices (H, Ht, Hf, AR, M et ACI) étaient corrélées avec le nombre de loups hurlant dans les chorus artificiels testés. De bonnes prédictions de l’effectif ont été obtenues sur des chorus réels avec l’un de ces indices (ACI). L’influence de plusieurs biais sur la précision des prédictions de chacun des six indices a ensuite pu être étudiée, montrant que trois d’entre eux y étaient relativement peu sensibles (Hf, AR et ACI). Finalement, les résultats obtenus avec les enregistreurs autonomes montrent le potentiel des méthodes acoustiques passives pour la détection de la présence de loups mais aussi pour les localiser avec une bonne précision, dans des milieux contrastés et à de larges échelles spatiale et temporelle. L’utilisation des indices de diversité acoustique ouvre également de nouvelles perspectives pour l’estimation de l’effectif des meutes. Prometteuses, l’ensemble des méthodes émergeant de ce travail nécessite à présent quelques investigations complémentaires avant d’envisager une application concrète pour le suivi du Loup gris dans son milieu naturel
The growing number of studies carried out in recent years has shown that bioacoustics is particularly interesting for the monitoring of secretive species. The emergence of autonomous recording devices, combined with new methods of analysis, have recently contributed to the increase of studies in this field. Over the last 30 years, many bioacoustic studies have been developed for the Grey wolf (Canis lupus), a secretive large carnivore known for its howls spreading over distances up to several kilometers. These researches notably aimed to improve its monitoring, which is complex because of the strong wolf dispersal capacities over long distances, the large extent of their territories and the various natural contexts in which they live. In this context, this PhD thesis was organized around three research axes. The first two axes focused on the contribution of passive bioacoustics for the Grey wolf monitoring in the field. By combining acoustic, statistical and cartographic analysis, the first objective was to develop a spatial sampling method adapted to large study areas for the detection of wolf howls by using autonomous recorders. Then, the same protocol was used to investigate the possibility to localize wolves thanks to their howls. Field experimentations, conducted in mid-mountain (Massif des Vosges) and lowland (Côtes de Meuse) environments, in two study areas of 30 km² and with an array of 20 autonomous recorders, demonstrated the high potential of passive bioacoustics for the Grey wolf monitoring. Indeed, nearly 70% of broadcasts (synthetic sound with similar acoustic properties to howls) were detected by at least one autonomous recorder in mid-mountain environment and more than 80% in lowland environment, for sound source-recorders distances of up to 2.7 km and 3.5 km respectively. By using statistical model and Geographic Information System, the detection probability of wolf howls was modeled in both study areas. In the mid-mountain environment, this detection probability was high or very high (greater than 0.5) in 5.72 km² of the study area, compared with 21.43 km² in lowland environment. The broadcast sites were localized with an overall mean accuracy of 315 ± 617 (SD) m, reducing until 167 ± 308 (SD) m after setting a temporal error threshold defined from the data distribution. The third axe focused on the application of acoustic diversity indices to estimate the number of howling wolves in choruses and thus to contribute to pack size monitoring. Index values of the six indices (H, Ht, Hf, AR, M, and ACI) were positively correlated with the number of howling wolves in the artificial tested choruses. Interesting size predictions based on real choruses were obtained with one of the indices (ACI). The effects of several biases on the reference values for the acoustic indices were then explored, showing that three of them were relatively insensitive (Hf, AR and, ACI). Finally, results obtained with autonomous recorders confirm the real potential of passive acoustic methods for detecting the presence of wolves but also for localizing individuals with high precision, in contrasting natural environments, at large spatial and temporal scales. The use of acoustic diversity indices also opens new perspectives for estimating pack sizes. All of the promising methods emerging from this thesis require now further investigations before considering a concrete application for monitoring the Grey wolf in its natural environment

Les récifs coralliens sont l’écosystème marin le plus complexe, mais aussi le plus menacé par les perturbations croissantes liées aux activités anthropiques. Leur conservation représente un véritable défi. Alors que le maintien des récifs au plus proche de leurs configurations et dynamiques actuelles doit être privilégié, nous devons également nous préparer à une évolution rapide de leur fonctionnement et adapter réseaux et outils de suivis à cette nouvelle situation. Des avancées technologiques récentes ont permis l’émergence d’outils innovants qui pourraient permettre à court terme d’augmenter considérablement la résolution spatio-temporelle des suivis. Parmi eux, l’acoustique passive est en plein essor. L’objet de cette thèse a été d’affiner son cadre d’utilisation pour évaluer et suivre l’état écologique et le fonctionnement des écosystèmes coralliens. Des enregistrements des paysages sonores et des relevés écologiques (assemblages de poissons et habitat) ont été réalisés sur 31 récifs de pente externe autour de trois îles de l’Indo-pacifique avec des caractéristiques environnementales variables, incluant des pressions anthropiques contrastées. L’analyse des résultats obtenus avec différentes combinaisons de paramètres d’échantillonnage (bande de fréquences, moment du cycle journalier choisi pour réaliser l’enregistrement, durée des échantillons de son) a permis de sélectionner un protocole d’échantillonnage basé sur les deux types d’indices écoacoustiques les plus utilisés pour l’étude des récifs coralliens. Ce protocole permet la caractérisation rapide et fiable de l’état écologique des récifs. En se basant sur ces lignes directrices, la capacité de six indices écoacoustiques à évaluer des fonctions clé de l’écosystème corallien a ensuite été démontrée. En comparant les apports de l’acoustique passive et de données environnementales pouvant être collectées par télédétection, la plus-value de l’utilisation d’indices écoacoustiques pour prédire la structure des assemblages de poissons récifaux a été identifiée et quantifiée. Une application de l’approche écoacoustique au suivi continu d’un site isolé a mis en évidence le potentiel particulièrement important de l’acoustique passive comme outil d’appui à la gestion dans ce type de contexte. Face à l’ampleur et à la vitesse des changements climatiques annoncés, les méthodes de suivi employées aujourd’hui, basées sur la présence d’observateur in situ, seront vraisemblablement insuffisantes. Combinée à d’autres outils de suivi, l’acoustique passive pourrait contribuer à détecter rapidement les perturbations des écosystèmes, condition indispensable pour en comprendre les causes et mettre en œuvre des réponses rapides et adaptées
Coral reefs are the most complex of marine ecosystems, but also the most threatened by ecological disruption resulting directly or indirectly from human activities. Their conservation represents a huge challenge. While maintaining coral reefs as close as possible to their current configurations and dynamics is among the highest priorities, we must also prepare for rapid changes in their functioning and adapt monitoring tools and networks to this new situation. Recent technological advances enabled the emergence of innovative tools with the potential to drastically increase the spatio-temporal resolution of coral reef monitoring. Among these, Passive Acoustic Monitoring (PAM) is on the rise. The aim of this thesis was to improve and facilitate the use of PAM as a tool for the assessment and monitoring of coral reefs’ ecological states and functioning. Soundscape recordings and ecological surveys (reef fish assemblages and habitat) were performed at 31 outer reef slope sites around three Indo-Pacific islands with variable environmental characteristics, including contrasted anthropogenic pressures. Analysing the results obtained with multiple combinations of sampling settings (frequency bandwidth, time of sampling (day/night), and sample duration) allowed the selection of a sampling scheme based on the two types of indices mostly used in coral reef studies. This scheme enables a rapid and reliable categorisation of reef’s ecological states. Based on these sampling guidelines, the capacity of six ecoacoustic indices to evaluate coral reef key functions was demonstrated. By comparing the contributions of PAM and coarse environmental data that could be sampled remotely, the added value of using ecoacoustic indices to predict reef fish assemblage structure was identified and quantified. An application of ecoacoustics to the continuous monitoring of a remote site highlighted the strong potential of PAM as a supporting tool for managers in such context. In view of the amplitude and velocity of expected climatic changes, current observer-based monitoring methods are likely to be exceeded. Combined to other monitoring tools, PAM could contribute to promptly detect ecosystem disturbances, which is essential to understand their causes and put in place rapid and adapted responses