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Dissertations / Theses on the topic 'Structure des complexes de surface'
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Mora, Serge. "Structure d'interfaces de fluides complexes." Paris 11, 2003. http://www.theses.fr/2003PA112161.
Full textAbstract:
Une étude de la structure d'interfaces liquide-vapeur est détaillée dans cette thèse. Les surfaces étudiées sont étroitement liées, afin de pouvoir déterminer l'influence des différents types d'interactions moléculaires, et de cerner les mécanismes responsables des propriétés physiques de ces surfaces. La diffusion diffuse de rayons x a permis de mesurer, pour différents liquides, le spectre des fluctuations de hauteur d'une surface nue. Ces mesures ne concordent plus avec le modèle des ondes capillaires pour des vecteurs d'onde supérieurs à 10^8 m^(-1) : la notion de tension de surface n'est plus valable à ces échelles et doit être remplacée par l'énergie de surface effective. Il est montré que cette dernière décroît lorsque la longueur d'onde associée à la fluctuation est de l'ordre de quelques dizaines de distances moléculaires. Elle augmente pour les plus petites longueurs d'onde envisageables. L'accord remarquable avec la théorie proposée par K. Mecke et S. Dietrich. Ces mesures ont été étendues au cas d'interfaces décorées par un film moléculaire: l'énergie de surface effective est alors correctement décrite par une rigidité de courbure seule, qui est mesurée pour des films dans différentes phases. En particulier, l'effet de la renormalisation de la rigidité de courbure par l'élasticité lorsque le film s'apparente à un réseau bidimensionnel connecté à été mis en évidence. En complément de mesures de fluctuations de surfaces de solutions ioniques, nous avons montré que l'excès de concentration en ions au voisinage de la surface peut être mesuré par des expériences de fluorescence de rayons x et d'ellipsométrie. Cette mesure est essentielle pour comprendre les origines de la variation de la tension de surface, et plus généralement pour expliquer la spécificité des ions de la série de Hofmeister. Ces expériences ouvrent ainsi une voie pour comprendre un phénomène inexpliqué depuis plus d'un siècleThe structure of liquid-vapor interfaces is investigated in this thesis. Different kinds of surfaces have been examined in order to determine the influence of each component of molecular interactions on the physical properties of these surfaces. The height-height fluctuation spectrum of different bare liquid-vapor surfaces has been determined by x ray diffuse scattering. These measurements show that the cappilary-wave model fails at small length scales (wave-vector > 10^8 m^(-1)). The problem of the small scale structure can be addressed by considering corrections to the surface energy through an effective momentum-dependent surface energy. We show that the momentum-dependent surface energy first decrease from its macroscopic value and then increases with increasing wave vector. The agreement with a theory proposed by K. Mecke and S. Dietrich is excellent. We then turned to fatty acid films at the water-air interface: a bending energy is sufficient to describe the whole momentum-dependent surface energy. It has been measured for films in various phases. The particular case of a polimerized monolayer has been specially investigated, and a coupling between height fluctuations and in-plane phonons has been demonstrated. Surface of ionic solutions have also been investigated: height fluctuations spectrum has been measured. In addidition, x ray grazing incidence fluorescence and ellipsometry experiment have been performed in order to measure the adsorption excess of ions. Knowing this excess is essential to understand the origins of surface tension's variation when salts are added, and so to explain ion specificity and the Hofmeister effect. Then, these experiments are fundamental to account for a long time unexplained phenomenon
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Addou, Rafik. "Surfaces d'alliages métalliques complexes : structure, propriétés et nanostructuration." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2010. http://www.theses.fr/2010INPL011N/document.
Full textAbstract:
Ce travail a permis de déterminer les structures atomique et électronique de deux surfaces d'alliages métalliques complexes à l'aide d'une approche multi-techniques supportée par des calculs ab intio de structure électronique. Les surfaces de ces cristaux ont pu être corrélées à certains plans présents dans les modèles structuraux disponibles. La terminaison dominante de la surface (100) d'Al13Co4 est identifiée comme un plan corrugué incomplet du volume. La surface (010) de Al3(Mn, Pd) présente un nombre conséquent d'imperfections structurales. À l'exception de certains sites lacunaires, elle est identique au plan corrugué complet du massif. Dans une seconde étape, ces échantillons ont été utilisés comme substrat pour la croissance de films minces métalliques. Les atomes de Pb déposés sur ces deux surfaces suivent un mode de croissance pseudomorphique jusqu'à la formation de la monocouche. Dans le cas de l'Al13Co4, le coefficient de collage du Pb s'annule une fois cette monocouche formée. Sur la surface Al3(Mn, Pd), le croissance de couches additionnelles de Pb est observée. L'adsorption du Cu sur Al13Co4 mène de nouveau à un mode de croissance pseudomorphique jusqu'à la monocouche. Au-delà de ce dépôt, la phase ß-Al(Cu, Co) apparaît en surface. Pour des dépôts à des températures plus élevées, la phase- ß est suivie par la formation de la phase ?-Al4Cu9. Les phases ß et ? croissent suivant deux domaines (110) orientés l'un par rapport à l'autre avec un angle de 72°We report the investigation of pseudo-ten-fold surfaces on two complex metallic alloys considered as approximants to the decagonal quasicristal. The atomic and electronic structure of the both samples is investigated by means of a multi-technique approach supported by ab initio electronic structure calculations. The main termination of the (100) surface of Al13Co4 is attributed to an incomplete puckered layer. The (010) surface of Al3(Mn, Pd) exhibits an important amount of structural imperfections. With the exception of several vacancies, this surface is identical to the complete puckered layer. In a second stage, both surfaces have been used as templates for the growth of metallic thin films. On both surfaces, Pb adatoms adopt a pseudomorphic growth mode up to one monolayer. For the Al13Co4 surface, the sticking coefficient of Pb vanishes upon the completion of the monolayer. However, it remains sufficient for the growth of additional layers on the Al3(Mn, Pd) (010) surface. The adsorption of Cu on the Al13Co4 surface follows also a pseudomorphic growth mode up to one monolayer. The ß-Al(Cu, Co) phase appears for coverages greater than one monolayer. For higher temperature deposition, the ß-phase is followed by the formation of the ?-Al4Cu9 phase. Both ß and ? phases grow as two (110) domains rotated by 72° from each other
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Loustau, Brice. "La géométrie symplectique de l'espace des structures projectives complexes sur une surface." Toulouse 3, 2011. http://thesesups.ups-tlse.fr/2071/.
Full textAbstract:
Cette thèse est consacrée à l'étude de la géométrie symplectique complexe de l'espace de déformations des structures projectives complexes sur une surface. En explorant les connexions entre les différentes approches possibles de cette géométrie symplectique, l'auteur essaie d'en donner une description globale et unificatrice. La structure symplectique cotangente provenant de la paramétrisation schwarzienne est étudiée en détail et comparée à la structure symplectique canonique de la variété des caractères, clarifiant et généralisant un théorème de S. Kawai. Il s'en ensuit une généralisation de résultats dûs à C. McMullen, notamment de la réciprocité quasifuchsienne. La structure symplectique cotangente est également abordée à travers la notion de surfaces minimales dans les variétés hyperboliques de dimension 3. Enfin, cette géométrie symplectique est décrite dans un cadre hamiltonien en relation avec les coordonnées de Fenchel-Nielsen complexes sur l'espace quasifuchsien, précisant les résultats obtenus par I. PlatisThis thesis investigates the complex symplectic geometry of the deformation space of complex projective structures on a surface. The author attempts to give a global and unifying picture of this symplectic geometry by exploring the connections between different possible approaches. The cotangent symplectic structure given by the Schwarzian parametrization is studied in detail and compared to the canonical symplectic structure on the character variety, clarifying and generalizing a theorem of S. Kawai. Generalizations of results of C. McMullen are derived, notably quasifuchsian reciprocity. The cotangent symplectic structure is also addressed through the notion of minimal surfaces in hyperbolic 3-manifolds. Finally, the symplectic geometry is described in a Hamiltonian setting with the complex Fenchel-Nielsen coordinates on the quasifuchsian space, recovering results of I. Platis
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Makki, Ali. "Morphismes harmoniques et déformation de surfaces minimales dans des variétés de dimension 4." Thesis, Tours, 2014. http://www.theses.fr/2014TOUR4013/document.
Full textAbstract:
Dans cette thèse, nous étudions la structure d’un morphisme harmonique F d’une variété riemannienne M4 dans une surface N2 au voisinage d’un point critique mO. Si mO est un point I critique isolé ou si M4 est compact sans bord, nous montrons que F est pseudo-Holomorphe par rapport à une structure presque hermitienne definie dans un voisinage de mO. Si M4 est compact sans bord, les fibres singuliers de F sont des surfaces minimales avec points de branchement. Ensuite, nous étudions des exemples de morphismes harmoniques due a Burel de (S4, gk,l) dans S2 où (gk,I) est une famille de métriques conforme à la métrique canonique. Nous construisons tout d’abord une application semi-Conforme Φk,l de S4 dans S2 en composant deux applications semi-Conformes régulières, F de S4 dans S3 et Φk,i, de S3 dans S2. II résulte de Baird-Eells que le fibres régulier de øk,l pour tout k, I sont minimales. Si [k] = [l] = 1, l’ensemble des points critiques est donnée par l’image réciproque du pâle nord: il consiste en deux 2-Sphères ayant deux points d’intersection. Si k, I 6= 1 l’ensemble des points critiques sont les images réciproques du pôle nord (de la même façon que pour k = t = 1 deux sphères, mais avec une multiplicité I) ainsi que la pré-Image du pôle sud (un tore) avec multiplicité k. Enfin, nous étudions une construction due à Baird-Ou de morphismes harmoniques d’une ensembles ouverts de (S2×S2, can) dans S2. Nous vérifions qu’ils sont holomorphe par rapport à une des quatre structures complexes canoniques hermitiennesIn this thesis, we are interested in harmonic morphisms between Riemannian manifolds (Mm, g) and (Nn, h) for m > n. Such a smooth map is a harmonic morphism if it pulls back local harmonic functions to local harmonic functions: if ƒ : V → ℝ is a harmonic function on an open subset V on N and Φ-1(V) is non-Empty, then the composition ƒ ∘ Φ : Φ-1(V) → ℝ is harmonic. The conformal transformations of the complex plane are harmonic morphisms. In the late 1970's Fuglede and Ishihara published two papers ([Fu]) and ([Is]), where they discuss their results on harmonic morphisms or mappings preserving harmonic functions. They characterize non-Constant harmonic morphisms F : (M,g) → (N,h) between Riemannian manifolds as those harmonic maps, which are horizontally conformal, where F horizontally conformal means : for any x ∈ M with dF(x) ≠ 0, the restriction of dF(x) to the orthogonal complement of kerdF(x) in TxM is conformal and surjective. This means that we are dealing with a special class of harmonic maps
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Yoshida, Yuichiro. "Energy Surface Explorations of Clusters, Transition-Metal Complexes, and Self-Assembled Systems." Doctoral thesis, Kyoto University, 2021. http://hdl.handle.net/2433/263681.
Full text
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Deschamps, Guillaume. "Espaces twistoriels et structures complexes exotiques." Phd thesis, Université Rennes 1, 2005. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00011091.
Full textAbstract:
Dans cette thèse, nous utilisons la théorie des espaces twistoriels afin de construire des structures complexes non standards (en un sens bien précis) sur des produits de 4-variétés réelles avec la sphère de dimension deux. Pour cela nous explicitons l'ensemble des surfaces complexes dont le fibré twistoriel est topologiquement trivial. Dans un deuxième temps nous déterminons parmi ces surfaces celles qui peuvent être munies d'une métrique riemannienne anti-autoduale. De ces résultats, nous déduisons une famille d'exemples simples de 4-variétés réelles parallélisables sans structure complexe. L'espace twistoriel associé à ces variétés admet une structure complexe. C'est notre première classe de 6-variétés munies d'une structure complexe non standard. Une deuxième classe d'exemple sera construite à partir de ces travaux. Enfin, et de façon indépendante, nous étudions brièvement les propriétés de connexités rationnelles des espaces twistoriels.
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Palmer, Darryl M. "Structural and surface chemical studies of zirconium and aluminium complexes." Thesis, University of Newcastle Upon Tyne, 1989. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.244862.
Full text
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Meier, Matthias. "Influence de la liaison chimique sur la structure des surfaces d'alliages métalliques complexes." Thesis, Université de Lorraine, 2015. http://www.theses.fr/2015LORR0257/document.
Full textAbstract:
Un alliage métallique complexe est un intermétallique dont la maille est constituée d'un nombre important d'atomes et dont la structure peut être souvent décrite comme un empilement de motifs d'atomes reliés par des liaisons de type covalent. Al5Co2 est l'un de ces composés et est un catalyseur potentiel pour la semi-hydrogénation d'acétylène. L'influence de la structure tridimensionnelle sur les surfaces bidimensionnelles et donc la réactivité est étudiée. Pour se faire, le système massif est analysé en utilisant la DFT afin d'éclaircir ses propriétés thermodynamiques, électroniques et vibrationnelles. Les valeurs calculées, expérimentales et celles de la littérature sont en bon accord. La structure des surfaces de bas indice, (001), (100) et (2-10) est étudiée. Une combinaison de techniques d'analyse de surface sous ultra-vide - LEED, STM - et de DFT est utilisée pour les déterminations structurales. Les résultats indiquent que: (i) la structure des surfaces dépend des conditions de préparation, comme la température de recuit, (ii) la structure des surfaces peut être interprétée comme étant constituée de motifs tronqués où certaines liaisons de type covalent sont brisées. Les sites et les énergies d'adsorption des molécules impliquées dans la réaction de semi-hydrogénation sont calculés pour les trois surfaces. Pour les sites favorables, des distances spécifiques entre atomes d'hydrogène adsorbés et atomes de Co de surface et de sous-surface peuvent être observées. Les atomes de Co de sous-surface ont un caractère donneur d'électrons, stabilisant les atomes adsorbés en surface. En se basant sur des calculs NEB, de possibles chemins réactionnels sur la surface (2-10) sont proposés. L'activité calculée est similaire à celle obtenue pour la surface d'Al13Co4, qui est considérée comme un bon catalyseur. La sélectivité - la compétition entre la désorption d'éthylène et son hydrogénation en éthyle - est discutéeA complex metallic alloy is an intermetallic with a large unit cell and whose structure can often be seen as a stacking of motifs of strongly covalent-like bonded atoms. Al5Co2 is such a compound and is a potential catalyst for the semi-hydrogenation of acetylene. The influence of the 3-dimensional structure on 2-dimensional surfaces is investigated. Therefore, the bulk system is analysed using DFT to gain insight in the thermodynamic, electronic and vibrational properties. Good agreements between calculated results, experimental ones and results found in the literature are obtained. The low index (001), (100) and (2-10) surfaces are investigated. A combination of surface analysis techniques under ultra high vacuum - LEED, STM - and DFT calculations is used for the structural investigations. The results show that: (i) the surface structure depends on the preparation conditions, such as the annealing temperature, (ii) the surface structure can be interpreted as truncated motif parts, where the covalent-like bonds are broken. Adsorption sites and energies of molecules involved in the semi-hydrogenation reaction are calculated for all three surfaces. For favourable adsorption sites, specific distances of adsorbed H atoms with Co surface and subsurface atoms are observed. These Co subsurface atoms have an electron donor character, stabilising the adsorbed atoms at the surface. Based on NEB calculations, possible reaction paths on the (2-10) surface are proposed. The calculated activity is similar to the one obtained for the Al13Co4 surface, which is considered a good catalyst. The selectivity - the competition between desorption of ethylene and its further hydrogenation - is discussed
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D'Ornelas, Lindora. "Chimie organométallique de surface réactivité des clusters moléculaires de rhuthénium et d'osmium à la surface des oxydes divisés, structure et réactivité des analogues moléculaires des complexes de surface." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37597436v.
Full text
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Sausse, Pascal. "Effets de composés polyphénoliques sur la structure et les propriétés de couches d'adsorption de caséine B en milieu hydro-alcoolique." Paris 6, 2003. http://www.theses.fr/2003PA066586.
Full text
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Berruyer, Pierrick. "Three-Dimensional Structure Determination of Surface Sites with Dynamic Nuclear Polarization Surface Enhanced NMR Spectroscopy." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSEN042/document.
Full textAbstract:
La capacité à déterminer les structures moléculaires en trois dimensions à partir de monocristaux par des méthodes de diffraction a transformé la chimie des matériaux. Le problème de la détermination de structure est en grande partie non résolu, en particulier si le système étudié est situé à une surface et n'a pas de périodicité, comme dans la plupart des matériaux fonctionnels actuels. La Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) à l’état solide serait une méthode de choix pour caractériser les surfaces mais la limite de détection de la RMN est beaucoup trop faible pour permettre à la RMN de caractériser les surfaces. L’introduction récente d’une nouvelle approche utilisant la Polarisation Dynamique Nucléaire (DNP) pour améliorer la sensibilité de la RMN des surfaces (DNP SENS) permet à présent de réaliser des expériences qui étaient totalement impossible il y a quelques années encore. Plus particulièrement, grâce à la méthode DNP SENS, les présents travaux de thèse aboutissent à la première structure tridimensionnelle d’un complexe organométallique supporté sur silice, avec une précision de 0,7 Å. De nombreux aspects de l’expérience DNP SENS ont été exploré. Le transport de de l’hyperpolarisation par diffusion de spin est primordial et un modèle numérique dans les matériaux mésoporeux a été développé. De plus, une nouvelle matrice aqueuse se basant sur des gels polyacrylamides a été mise au point et utilisée pour la caractérisation par RMN de nanoparticules permettant ainsi d’étendre les domaines d’application de DNP SENS. Enfin les premières expériences RMN DNP combinant hauts champs magnétiques et haute fréquence de rotation d’échantillon sont présentéesThe ability to understand the properties of chemical systems relies on their detailed description at the molecular level. Over the last century, several methods based on X-ray diffraction have allowed a structure-based understanding of many materials. However, several key questions often remain unanswered. In particular when the system under investigation is located on a surface. Although an extensive range of surface-sensitive methods are available for surface science and give valuable information, they only lead to a partial understanding of surfaces at the molecular level. Moreover, these methods are not compatible with all kinds of materials and usually require the use of a model and pristine surface. Solid-State NMR would be a method of choice to characterize surfaces. However, the approach suffers from its intrinsically low sensitivity and this is strongly emphasize in the case of surfaces where the atoms of interest are diluted in the matrix. Dynamic Nuclear Polarization (DNP) applied to surfaces (SENS) recently emerged as a very promising method to characterize surface sites. It offers a dramatic enhancement of NMR sensitivity and DNP applied to materials has led to many examples in the last ten years. In the present thesis, I have shown that DNP SENS, in combination with EXAFS, allowed the detailed 3D structure determination of the silica-supported organometallic complex determined with a precision of 0.7 angstroms. In parallel, some experimental aspect of DNP SENS have been explored. A spin diffusion has been developed to understand diffusion of hyperpolarization in porous media. A new aqueous DNP matrix, coined DNP Jelly, has been developed to characterize nanoparticles and thus expanding experimental range of DNP SENS. Finally, the first experiment of DNP NMR at fast magic angle spinning (up to 40 kHz) and high field are reported
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Blackwell, Anne. "Expanding the Role of Gas-Phase Methods in Structural Biology: Characterization of Protein Quaternary Structure and Dynamics by Tandem Mass Spectrometry and Ion Mobility." Diss., The University of Arizona, 2012. http://hdl.handle.net/10150/238912.
Full textAbstract:
This dissertation presents efforts to expand the role of mass spectrometry (MS) in structural biology. Determination of quaternary structure of a protein complex has been hindered by limited fragmentation from collision-induced dissociation (CID). As an alternative, surface-induced dissociation (SID) was implemented for a quadrupole - time-of-flight instrument in the Wysocki laboratory. This research tested the hypothesis that SID should produce fragmentation reflective of subunit organization. Furthermore, ion mobility (IM) was used to prove the direct relationship between precursor conformation and observed dissociation patterns, and the relationship between activation and product ion conformation. The structure and dynamics of a dimeric small heat shock protein (sHSP) with no solved structure was investigated. The importance of N- and C-terminal domains for dimerization was determined, and the dimers were shown to exchange subunits. From exchange kinetics it is proposed that subunit exchange is unrelated to heat shock activity. SID was used to elucidate the subunit architecture of heterogeneous protein assemblies, including one previously solved protein structure and two formerly uncharacterized proteins. The heterohexamer toyocamycin nitrile hydratase dissociated into trimers, revealing the hexamer to be a dimer of trimers. The bacterial ribonuclease toxin:antitoxin tetramer was shown to have an antitoxin dimer at its core, with flanking individual toxin subunits. The examples presented here are the first clear proof that SID results can clearly indicate the substructure of a protein assembly.IM was used to study the conformation of precursor and product ions. A greater understanding of the relationship between precursor conformation and observed dissociation patterns was developed. Different charge states of a dodecameric sHSP were found to have significantly different conformations, which were directly reflected in SID spectra. IM comparison of CID and SID product ions showed that the same charge state of a product ion from either method has the same CCS. This suggests the product ion conformation is dependent upon ion charge state, and independent of activation method and collision energy. The cause and effect relationship between precursor conformation and MS/MS patterns, and activation and product ion conformation were clearly illustrated. Together, this body of research expands the role of MS for structural biology.
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Hamid, Firas Abdel. "Surfaces d’alliages métalliques complexes : nanostructures et croissance moléculaire." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2019. http://www.theses.fr/2019LORR0155.
Full textAbstract:
Les alliages métalliques complexes (CMAs) sont des intermétalliques dont la maille élémentaire est caractérisée par un grand nombre d’atomes ainsi qu’une sous-structure en agrégats de haute symétrie. Les quasicristaux et leurs approximants périodiques font partie de cette classe de matériaux. Ici, nous avons étudié la structure atomique et électronique de la surface (100) d’un composé cage Ce3Pd20Si6 qui peut être également considéré comme un CMA. Sa structure est décrite par un assemblage de cages - Pd12Si6 et Pd16 – enfermant les atomes de Ce. La surface est analysée en utilisant des méthodes expérimentales d’analyse sous ultravide comme la photoémission, la diffraction d’électrons et la microscopie à effet tunnel (STM), ainsi que des méthodes de simulations atomistiques basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT). On trouve que la surface se forme par troncature du volume en des plans spécifiques qui conservent le sous-réseau de cage de type Pd12Si6, avec des atomes de Pd supplémentaires qui rendent la surface plus compacte. L’analyse de la fonction de localisation électronique et des volumes et charges de Bader montrent que, bien que le système soit clairement métallique, la structure de la surface est influencée par les interactions entre les atomes de Pd et Si formant les cages Pd12Si6. Du fait de la préservation de ces cages, la surface présente une nanostructuration intrinsèque, de périodicité légèrement inférieure au nanomètre. Cette surface est ensuite utilisée comme patron pour essayer de former des films moléculaires auto-organisés. Des premiers résultats sont présentés concernant l’auto-assemblage de C60 et de son dérivé (PTBC) sur différents substrats, Ce3Pd20Si6(100) mais aussi les surfaces d’ordre 5 des phases icosaédriques i-AlCuFe et i-AgInYb ainsi que les surfaces hexagonales simples Cu(111) et Au(111). Des modèles simples sont proposés pour décrire les structures formées par les PTBC sur Cu(111) et Au(111). Les dépôts de C60 sur la surface Ce3Pd20Si6(100) conduit à la formation de deux domaines rotationnels de structure hexagonale très faiblement organisés, alors que PTBC donne des films amorphes. Pour PTBC déposées sur les surfaces quasicristallines, on trouve dans les deux cas que les molécules sont orientées selon les axes de symétrie du substrat à bas taux de couverture. L’accord de symétrie molécules/substrat est essentiel. Lorsque la monocouche est saturée, le film est soit amorphe sur i-AlCuFe soit quasipériodique sur i-AgInYb mais avec beaucoup de désordreComplex metallic alloys (CMAs) are intermetallics with a unit cell characterized by a large number of atoms and a substructure of atomic clusters of high symmetry. Quasicrystals and their periodic approximants are part of this class of materials. Here, we have investigated the atomic and electronic structure of the (100) surface of a cage compound Ce3Pd20Si6 which can be also considered as a CMA. The assembly of Pd12Si6 and Pd16 cages in which guest Ce atoms are located describes its structure. The surface is analyzed using experimental methods under ultrahigh vacuum as well as atomistic simulations based on density functional theory (DFT). The surface forms at corrugated planes of the bulk structure that preserve intact the Pd12Si6 cages, with additional Pd surface atoms. It is concluded that despite this Pd-based cage compound being clearly metallic, stronger interactions between Pd and Si atoms on the host cage structure significantly influence its surface structure. Due to the cage preservation, the surface presents an intrinsic nanostructuration with a periodicity slightly less than one nanometer. This surface is further used as a pattern in an attempt to form self-organized molecular films. First results are presented concerning the self-assembly of C60 and its derivative (PTBC) on different substrates, including Ce3Pd20Si6(100) but also 5-fold surfaces of icosahedral phases i-AlCuFe and i-AgInYb and simple Cu (111) and Au (111) surfaces. Simple models are proposed to describe the structures formed by PTBC on Cu (111) and Au (111). C60 deposited on Ce3Pd20Si6(100) leads to the formation of hexagonal nanodomains,while PTBC leads to amorphous films. For PTBC deposited on quasicrystalline surfaces, preferential adsorption occurs at low coverage at 5-fold symmetric sites, dictated by symmetry matching between molecules and substrates. When the monolayer is saturated however, the film is either amorphous on i-AlCuFe or quasiperiodic on i-AgInYb, but with a large amount of disorder
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Gajan, David. "Sites de surface de systèmes complexes : monosites, particules supportées vs. matériaux hybrides : structure, réactivité et mécanisme de formation : un point de vue RMN." Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10221.
Full textAbstract:
Afin d’optimiser par une approche moléculaire des catalyseurs hétérogènes, qu’ils soient dits sites uniques ou des particules supportées, il est nécessaire d’accéder à une compréhension détaillée de leur structure et de leur processus de formation. Dans ce but, les techniques classiques de caractérisation (adsorption, IR, EXAFS, TEM…) ont été combinées à la RMN solide, pour accéder à la structure fine et à la dynamique des espèces présentes en surface. Dans ce cadre, nous avons tout d’abord montré que la formation d’espèces Au(I) (densité de surface de 0.35/nm2) entouré de fragments hydrophobes (OSiMe3) par greffage contrôlé de {AuN(SiMe3)2}4 sur silice se transforment en particules d’or de ca. 1.8nm supportées sur silice passivée par réduction ménagée sous H2 à 300°C. Ce système a démontré des propriétés particulières en oxydation et hydrogénation, et permet d’affiner les mécanismes d’activation de l’O2 sur les nanoparticules d’or. Cette approche a aussi été utilisée pour la préparation et la caractérisation de particules de ruthénium supportées. La réactivité de ces particules d’or et ruthénium vis-à-vis de petites molécules (H2, phosphines, éthylène et CO) a été étudiée, en particulier par RMN. Toutefois, la faible densité d’espèces de surface sur ces particules constitue un des problèmes majeurs pour obtenir des spectres RMN de bonne qualité. Ainsi, nous avons développé une méthode basée sur l’augmentation du signal RMN des espèces de surface de matériaux par polarisation dynamique nucléaire (DNP). Cette approche, très prometteuse, d’abord appliquée à des matériaux hybrides (inorganique-organiques), devrait lever un des freins majeurs de la caractérisation des sites de surface des matériaux et en particulier des catalyseurs hétérogènesIn order to optimize heterogeneous catalysts through a molecular approach, whether based on single-sites or supported nanoparticles, it is necessary to access to a detailed understanding of its structures and formation mechanism. To reach this goal, classical characterization techniques (adsorption, IR, EXAFS, TEM…) have been combined with solid state NMR in order to access to the detailed structure and the dynamics of surface species. Here, we showed that the formation of well-dispersed Au(I) surface species (0.35/nm2) surrounded by hydrophobic groups (OSiMe3) by the controlled grafting of {AuN(SiMe3)2}4 and its conversion into 1.8nm gold nanoparticles supported on fully passivated silica upon a mild reduction under H2 (300°C). This system displays good activity and selectivity in air oxidation and hydrogenation reactions and provides new information on the activation of O2 on gold nanoparticles. By a similar approach, supported ruthenium nanoparticles have been prepared and characterized. Reactivity of Au and Ru nanoparticles with probe molecules (H2, phosphines, ethylene and CO) has been studied, in particular by NMR. However, the low density of these surface species, especially for supported nanoparticles is still one of the main problems, making difficult to obtain high quality NMR spectra in a reasonable time. Therefore, we have developed a method based on the enhancement of NMR signals of surface species via dipolar nuclear polarization (DNP). This very promising approach has first been applied very successfully to hybrid materials and silica; this opens new avenues in the characterization of surface species of materials and particularly heterogeneous catalysts
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Yan, Jing. "Native mass spectrometry protein structural characterization via surface induced dissociation: instrumentation and applications." The Ohio State University, 2017. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1500570925461292.
Full text
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D'Ornelas, Lindora. "Chimie organométallique de surface, réactivité des clusters moléculaires de ruthénium et d'osmium à la surface des oxydes divisés : structure et réactivité des analogues moléculaires des complexes de surface : applications en catalyse d'hydrogénation et d'isomérisation des oléfines." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO10006.
Full text
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Alarcon, Villaseca Sebastian. "Surfaces d'Alliages Métalliques Complexes à base d'aluminium et de cobalt : structures atomique et électronique, stabilité et adsorption." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2011. http://www.theses.fr/2011INPL067N/document.
Full textAbstract:
Les alliages métalliques complexes (CMAs) sont des composés intermétalliques dont la structure cristallographique diffère des alliages habituels par le nombre conséquent d'atomes dans la cellule unitaire et par l'occurrence d'agrégats de haute symétrie comme briques élémentaires. La structure spécifique des CMAs leur confère des propriétés physico-chimiques originales par rapport aux alliages métalliques plus classiques, en particulier ce qui concerne les propriétés de surface. L'objet de cette thèse est la détermination de la structure atomique et électronique de surfaces d'alliages métalliques complexes à base d'aluminium et cobalt par des méthodes de calcul ab initio basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité. Plusieurs alliages de complexités différentes ont été considérés : Al5Co2, Al9Co2 et o-Al13Co4. Les résultats des calculs réalisés dans ce travail sont confrontés aux données expérimentales.Le manuscrit comporte trois parties. La première partie porte sur les méthodes numériques utilisées. La deuxième partie porte sur l'étude des surfaces nues. Un modèle structural est proposé pour la terminaison des surfaces (001) de Al9Co2 et (100) de o-Al13Co4, qui consiste en un plan dense, riche en aluminium, obtenu par troncature du système massif. Ce résultat est en bon accord avec ce qui a été observé dans le cas des quasicristaux, qui sont un cas particulier de CMAs. Cette étude montre également que pour toutes les surfaces étudiées, la présence d'atomes de cobalt en surface est défavorable. La nature quasi covalente de certaines liaisons présentes dans les CMAs étudiés joue également un rôle fondamental dans la sélection du plan de surface.La troisième partie de ce travail porte sur l'étude de l'adsorption de plomb et d'oxygène atomique sur les surfaces (001) de Al9Co2 et (100) de o-Al13Co4. L'étude réalisée révèle que les atomes de cobalt en surface et en sous-surface exercent une influence sur la détermination des sites d'adsorption préférentiels. La relaxation des atomes du substrat est importante dans le cas de l'adsorption d'oxygène atomique. Les distances Al-O calculées correspondent aux distances typiques d'adsorption d'oxygène atomique à la surface (111)Al, ainsi qu'aux distances Al-O dans l'oxyde Al2O3. Dans le cas de l'adsorption de plomb sur (100)o-Al13Co4, les premières étapes vers la formation d'un film pseudomorphique ont été simuléesComplex metallic alloys (CMAs) are intermetallic compounds whose crystal structure differs from the usual alloys by the number of atoms in the unit cell and the occurrence of high symmetry aggregates as building blocks. The specific structure of CMAs gives them unique physical and chemical properties compared to more conventional metallic alloys, particularly with regard to surface properties.The overall goal of this thesis is the determination of the atomic and electronic surface structure of alumnium-cobalt based complex metal alloys using ab initio calculation methods based on the density functional theory. Several alloys of different complexity were considered: Al5Co2, Al9Co2 and o-Al13Co4. The calculation results of this work are confronted with experimental data.The present manuscript contains three parts. The first part deals with numerical methods. The second part deals with the study of clean surfaces. A structural model is proposed for the termination of the (001)Al9Co2 and (100)o-Al13Co4 surfaces, which consist in a dense aluminum rich plan obtained by bulk truncation. This result is in good agreement with what is observed in the case of quasicrystals – a special case of CMAs. This study also shows that for all surfaces studied, the presence of cobalt atoms on the surface is unfavoured. The quasi-covalent bonds present in the studied CMAs plays a fundamental role in the selection of the surface plane.The third part of this work deals with the adsorption of lead and oxygen atoms on the (001)Al9Co2 and (100)o-Al13Co4 surfaces. The study reveals that the surface and subsurface cobalt atoms influence on the determination of the preferential adsorption sites. The substrate atomic relaxation is important in the case of atomic oxygen adsorption. The calculated Al-O distances correspond to typical atomic oxygen adsorption distances on the (111)Al surface and with the Al-O distances in the Al2O3 oxide. In the case of atomic lead adsorption on the (100)o-Al13Co4 surface, the first step towards the formation of a pseudomorphic film was simulated
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Collins, Clare R. "The chemistry and structure of surface complexes of Cd'2'+,Hg'2'+,Sr'2'+, and Zn'2'+ on goethite : insights from density functional theory and EXAFS spectroscopy." Thesis, University of Bristol, 1997. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.388020.
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Chaignon, Jérémy. "Materials for depollution based on the model of manganese dioxygenases." Thesis, Lyon, École normale supérieure, 2013. http://www.theses.fr/2013ENSL0877/document.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est la synthèse d'un matériau modèle de la dioxygénase à manganèse, une enzyme oxydant des cycles aromatiques type catéchol grâce au dioxygène. Pour ce faire, nous avons découpé notre stratégie trois étapes constituant les différents chapitres de ce manuscrit : - La synthèse et la caractérisation des complexes de manganèse(II) avec des ligands tridentates. - L'optimisation d'une synthèse de silice mésoporeuse par micro-onde. - La fonctionnalisation des matériaux et le greffage des complexes, ainsi que les tests catalytiques préliminaires.Les ligands utilisés sont des amines tertiaires avec un bras alcyne et deux coordinants type pyridine, imidazole ou carboxylate. Ces complexes ont été cristallisés et/ou caractérisés par IR, RPE, SQUID et voltampérométrie cyclique. La synthèse par micro-onde, basée sur des conditions de synthèse hydrothermale classiquenous a permis de réduire le temps de synthèse d'un jour à deux heures. La qualité de ces nouveaux matériaux a été vérifiée par IR, ATG, BET, et DRX sur poudre. Ces matériaux sont ensuite bifonctionnalisés en utilisant une méthode de pochoir moléculaire avec une fonction azoture pour le greffage du complexe via "click-chemistry" ainsi qu'une fonction pyridine ou triméthylsilyle pour créer un environnement coordinant ou non proche du métal.Ces complexes et matériaux sont actifs dans l'oxydation du catécholThe objective of this work is the synthesis of model material for manganese dioxygenase which is an enzyme that oxidizes catechol-like substrates with dioxygen. Our strategy comprises three main steps that form the different chapters of this thesis: - Synthesis and characterization of manganese(II) complexes with tridentate ligands. - Optimization of a microwave-assisted synthesis of a mesoporous silica. - Functionalization of these materials and complex grafting, as well as preliminary catalytic tests. The ligands used are tertiary amines containing an alkyne arm and two coordinating arms with functions such as pyridine, imidazole or carboxylate. The complexes were crystallized and/or characterized by IR, EPR, SQUID and cyclic voltamperometry. Microwave synthesis, based on the conditions of classical hydrothermal synthesis, allowed us to reduce the synthesis time from one day to two hours. The quality of these new materials was verified by IR, TGA, BET and powder XRD. These materials are then bi-functionalized using a molecular stencil patterning mehod with a an azide function for complex grafting via click chemistry and a function pyridine or trimethylsilyl to control the coordinating ability of the metal environment. These complexes and materials are active in catechol oxidation with O2
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Cox, Jennifer Jane. "Structure of organic molecular thin films vapour deposited on III-V semiconductor surfaces." Thesis, Imperial College London, 1999. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.327025.
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Boufarguine, Majdi. "Etude de la déformation de gouttes à interface et rhéologie complexes." Phd thesis, Université du Maine, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00954404.
Full textAbstract:
Ce travail de thèse est une contribution à l'étude des émulsions de Pickering qui ont vu unregain d'intérêt ces dernières années. Bien que l'effet Pickering ait été décrit depuis plus d'un siècle,des études plus systématiques pour comprendre l'activité des particules solides aux interfacesliquide/liquide n'est que partiellement entrepris, surtout en cours de déformation. Plusieurs questionsrestent d'actualité et, en premier, la localisation même des particules à l'interface et le mécanismed'adsorption associé.L'approche proposée dans ce travail de thèse s'inscrit dans cette optique avec en particulier laconsidération d'un événement élémentaire d'une émulsion : une goutte isolée dans une matrice etexaminée suite à un saut de déformation en cisaillement dans un dispositif de cisaillement contrarotatifdéveloppé à PCI. De manière générique, le but est de comprendre la relation entre le comportement dela goutte et la rhéologie complexe (en volume ou en surface) apportée par la dynamique de particulessolides aux interfaces liquide/liquide mobiles. Plusieurs paramètres ont été étudiés en commençant parl'affinité chimique des particules solides avec les phases liquides, la rhéologie des phases liquides, laconcentration et la taille des particules solides ; et pour finir, une attention particulière a été portée àl'effet de la déformation macroscopique et l'âge de la goutte.Plus particulièrement, la mise en évidence de la synergie entre la déformation macroscopiqueet l'âge de la goutte, sur la dynamique d'adsorption des particules à l'interface liquide/liquide et lastructuration de l'interface composée, a permis de proposer une méthodologie pour la modulation de" l'effet mémoire induite par la déformation " lors de la relaxation de la goutte en modifiant lasurface des particules par adsorption de tensioactifs choisis. Ainsi, il a été possible de figer les gouttesliquides dans des formes anisotropes contrôlées. Ce phénomène a été corrélé à une transition liquidesolidede l'interface composée mise en évidence par des mesures des modules rhéologiquesinterfaciaux. Ces derniers ont été, par ailleurs, reliés quantitativement à l'anisotropie des gouttesfigées.
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Jones, Christopher Michael. "Characterization of Macromolecular Protein Assemblies by Collision-Induced and Surface-Induced Dissociation: Expanding the Role of Mass Spectrometry in Structural Biology." Diss., The University of Arizona, 2008. http://hdl.handle.net/10150/193581.
Full textAbstract:
This dissertation presents an investigation into the structure of macromolecular protein assemblies by mass spectrometry. The experiments described within are designed to systematically assess the analytical utility of surface-induced dissociation (SID) tandem mass spectrometry in the characterization of multi-subunit protein complexes. This is accomplished by studying the effects of ion-surface collision on the fragmentation products of protein assemblies that vary by mass, number of subunits, and protein structural features. The dissociation energetics and mechanisms of protein complexes are considered by examining the influence of ion internal energy and sub-oligomeric protein structure on the dissociation process. Conditions are first established for the preservation of “native” protein quaternary structure and applied to previously characterized systems for proof-ofconcept. These conditions are subsequently extended to determine the molecular weight and subunit stoichiometry of several small heat shock proteins. Native mass spectrometry is then combined with limited proteolysis experiments to characterize the subunit interface of a unique small heat shock protein, Hsp18.5 from Arabidopsis thaliana, identifying regions of the protein essential for preservation of the native dimer. The dissociation of non-covalent protein assemblies is then explored on a quadrupole time-of-flight (Q-TOF) mass spectrometer, modified for the study of ion-surface collisions. This instrument allows ions to be dissociated through collisions with a surface or more conventional collisions with gas atoms. The dissociation of protein complexes is explored by both activation methods beginning with specific and non-specific dimers with masses less than 40 kDa. These studies are extended to larger assemblies with as many as 14 subunits weighing over 800 kDa, and are applied to both homo- and hetero-oligomeric protein complexes. Activation of a protein complex with “n” subunits through multiple collisions with inert gas atoms results in asymmetric dissociation into a highly charged monomer and complementary (n-1)-mer regardless of protein size or subunit architecture. This process is known to occur through an unfolding of the ejected subunit, and limits the amount of structural insight that can be gleaned from such studies. Collision at a surface however, results in more charge and mass symmetric fragmentation, and in some instances reflects the substructure of the protein assembly under investigation. The differences observed between the CID and SID of protein complexes is attributed to the rapid deposition of large amounts of internal energy deposited upon collision at a more massive target such as a surface. The ion activation time-frame and energy transfer efficiency are proposed to induce dissociation on a time-scale that precedes subunit unfolding providing access to dissociation pathways that are inaccessible by traditional means of activation. The systems studied here represent the largest ions fragmented via surface collisions within a mass spectrometer, and the fragmentation products observed by SID demonstrate its promise for expanding the role of mass spectrometry in the field of structural biology.
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Gao, Pengyuan. "Theoretical Studies of the Interaction between U(VI) and Mineral Surfaces." Electronic Thesis or Diss., Orléans, 2023. http://www.theses.fr/2023ORLE1074.
Full textAbstract:
L'étude des processus d'adsorption des radionucléides sur les surfaces minérales est fondamentale pour la conception et l'évaluation de la sûreté des futurs systèmes de stockage des déchets radioactifs, ainsi que pour les diagnostics environnementaux des milieux pollués par des radionucléides. Parmi ces radionucléides, l'uranium a une abondance relativement élevée dans les systèmes naturels et a un rôle central dans le cycle du combustible nucléaire. L’uranium peut se trouver sous plusieurs états d’oxydation. L'U(VI) est l'état d'oxydation le plus pertinent dans la plupart des eaux de surface et des eaux souterraines oxygénées. L'adsorption de l'U(VI) sur les surfaces de divers minéraux a été largement étudiée par des expériences en batch complémenté par des techniques spectroscopiques. Des sites de complexation possibles et des espèces de surface ont été proposés, mais il est encore difficile d'obtenir des informations précises sur les mécanismes moléculaires responsables des processus d’adsorption. Ces informations sont essentielles pour comprendre les mécanismes physico-chimiques impliqués dans les expériences et pour développer des modèles prédictifs pour les environnements concernés. Les calculs théoriques à l’échelle moléculaire se sont avérés être un outil efficace pour étudier les processus d’adsorption des radionucléides à l'interface minéral-eau. Dans cette thèse, les caractéristiques structurales et les mécanismes d'adsorption des espèces d'U(VI) sur les surfaces des principaux minéraux constitutifs du granite (orthoclase et quartz) et des matériaux tampons/remblais (montmorillonite) des futurs systèmes de stockage en couche géologique profonde ont été obtenus à l'aide de calculs de dynamique moléculaire ab initio. Les mécanismes de polymérisation des espèces d'U(VI) en solution aqueuse et sur les surfaces minérales ont été étudiés. En outre, l’influence de la variabilité des sites d’adsorption des minéraux argileux de type montmorillonite sur les réactions d'adsorption a également été étudiée de manière systématiqueStudies of the adsorption characteristics of key radionuclides in the host rock and buffer/backfill materials of deep geological repositories for high-level waste (HLW) are fundamental to the designand safety assessment. Uranium is a radionuclide of widespread interest due to its relatively high abundance in nature and its central role in the nuclear fuel cycle, while U(VI) is the most relevant oxidation state in most surface waters and oxygenated groundwater. The adsorption of U(VI) on the surfaces of various minerals has been extensively investigated by conventional batch experimentsand spectroscopic techniques. Possible complexation sites and surface species have been proposed,but it is still challenging to able to obtain mechanistically precise insights at the microscopic level.Information at the molecular level is essential to understand the physicochemical mechanisms involved in the experiments and to develop predictive models for the relevant environments.Theoretical computations have been proven to be an effective tool for studying the chemical processesof radionuclides at the mineral-water interface. In this thesis, the structural characteristics and adsorption mechanisms of U(VI) species on the surfaces of the main component minerals of granite(orthoclase and quartz) and buffer/backfill materials (montmorillonite) of the deep geological repository were calculated by first-principles calculations. The polymerization mechanisms of U(VI) species in aqueous solution and on mineral surfaces were investigated. In addition, the effect of local structural changes of montmorillonite on the nature of the adsorption reaction on the surface was also systematically investigated
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Benzerga, Mohamed. "Structures réelles sur les surfaces rationnelles." Thesis, Angers, 2016. http://www.theses.fr/2016ANGE0081.
Full textAbstract:
Le but de cette thèse est d’apporter des éléments de réponse au problème de la finitude du nombre de classes de R-isomorphisme de formes réelles d’une surface rationnelle projective complexe lisse X quelconque, i.e. du nombre de classes d’isomorphisme de R-schémas dont le complexifié est isomorphe à X. Nous étudions ce problème en termes de structures réelles (ou involutions antiholomorphes, généralisant la conjugaison complexe) sur X : l’intérêt de cette approche est qu’elle permet une réécriture du problème faisant intervenir les groupes d’automorphismes de surfaces rationnelles, à travers la cohomologie galoisienne. Grâce à des résultats récents concernant ces groupes et en nous appuyant sur de la géométrie hyperbolique et aussi dans une moindre mesure sur de la dynamique holomorphe et de la géométrie métrique, nous prouvons plusieurs résultats généraux de finitude qui dépassent largement le seul cadre des surfaces de Del Pezzo et peuvent s’appliquer à certaines surfaces rationnelles à grands groupes d’automorphismesThe aim of this PhD thesis is to give a partial answer to the finiteness problem for R-isomorphism classes of real forms of any smooth projective complex rational surface X, i.e. for the isomorphism classes of R-schemes whose complexification is isomorphic to X. We study this problem in terms of real structures (or antiholomorphic involutions, which generalize complex conjugation) on X: the advantage of this approach is that it helps us rephrasing our problem with automorphism groups of rational surfaces, via Galois cohomology. Thanks to recent results on these automorphism groups, using hyperbolic geometry and, to a lesser extent, holomorphic dynamics and metric geometry, we prove several finiteness results which go further than Del Pezzo surfaces and can apply to some rational surfaces with large automorphism groups
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Zhou, Mowei. "Incorporation of Surface Induced Dissociation into a Commercial Ion Mobility - Tandem Mass Spectrometer and Application of Mass Spectrometry Methods for Structural Analysis of Non-covalent Protein Complexes." The Ohio State University, 2013. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1373977026.
Full text
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Chaignon, Jérémy, and Jérémy Chaignon. "Materials for depollution based on the model of manganese dioxygenases." Phd thesis, Ecole normale supérieure de lyon - ENS LYON, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01015623.
Full textAbstract:
The objective of this work is the synthesis of model material for manganese dioxygenase which is an enzyme that oxidizes catechol-like substrates with dioxygen. Our strategy comprises three main steps that form the different chapters of this thesis: - Synthesis and characterization of manganese(II) complexes with tridentate ligands. - Optimization of a microwave-assisted synthesis of a mesoporous silica. - Functionalization of these materials and complex grafting, as well as preliminary catalytic tests. The ligands used are tertiary amines containing an alkyne arm and two coordinating arms with functions such as pyridine, imidazole or carboxylate. The complexes were crystallized and/or characterized by IR, EPR, SQUID and cyclic voltamperometry. Microwave synthesis, based on the conditions of classical hydrothermal synthesis, allowed us to reduce the synthesis time from one day to two hours. The quality of these new materials was verified by IR, TGA, BET and powder XRD. These materials are then bi-functionalized using a molecular stencil patterning mehod with a an azide function for complex grafting via click chemistry and a function pyridine or trimethylsilyl to control the coordinating ability of the metal environment. These complexes and materials are active in catechol oxidation with O2.
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Ghazouani, Selim. "Structures affines complexes sur les surfaces de Riemann." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017PSLEE022/document.
Full textAbstract:
Cette thèse s'intéresse à des aspects divers des structures affines complexes branchées sur les surfaces de Riemann.Dans une première partie, nous étudions un invariant algébrique de ces structures appelé holonomie, qui est une représentation du groupe fondamental de la surface sous-jacente dans le groupe affine. Nous démontrons un théorème caractérisant les représentations se réalisant comme l'holonomie d'une structure affine.Nous nous intéressons ensuite à la géométrie de certains espaces de modules de telles structures qui viennent naturellement avec une structure hyperbolique complexe. Nous décrivons cette géométrie en terme de dégénérescences de structures affines.Enfin, nous regardons une sous-classe de structures affines dont chaque élément induit une famille de feuilletages sur la surface sous-jacente. Nous relions ces feuilletages à des systèmes dynamiques unidimensionnels appelés échanges d'intervalles affines et nous étudions un cas particulier en détailsThis thesis deals with several aspects of branched, complex affine structures on Riemann surfaces.In a first chapter, we study an algebraic invariant of these structures called holonomy, which is a representation of the fundamental group of the underlying surface into the affine group. We prove a theorem characterising such representations that arise as the holonomy of an affine structure.In a second part, we study certain moduli spaces of affine tori which happen to have an additional complex hyperbolic structure. We analyse the geometry of this structures in terms of degenerations of the underlying affine tori.Finally, we narrow our interest to a subclass of affine structures each element of which inducing a family of foliations on the underlying topological surface. We link these foliations to 1-dimensional dynamical systems called affine interval exchange transformations and study a particular case in details
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Aviles-Moreno, Juan-Ramón. "Flexibilité conformationnelle dans les amines, les sucres et leurs complexes hydratés étudiée par spectroscopie à impulsions microondes et calculs de chimie quantique." Lille 1, 2006. https://ori-nuxeo.univ-lille1.fr/nuxeo/site/esupversions/65353286-2f4b-4a09-9c9a-243841438735.
Full textAbstract:
En spectroscopie le couplage expérience-théone permet notamment la déterminatIon des structures des conformères les plus stables de (bio)molécules ainsi que l'analyse de mouvements de grande amplitude et de structures hyperfines. Nous avons réalIsé des expériences de spectroscopie à Impulsions mlcroondes par transformée de Fourier en jet supersonique et des calculs de chimie quantique (ab initio et DFT). Nos principaux résultats concernent l'étude de sucres CnH2nOn et de leurs complexes hydratés. Dans le complexe glycolaldéhyde-eau (n=2), la molécule d'eau s'insère avec unc sélectivité au niveau des liaisons hydrogéne en cassant la liaison intramoléculaire et en formant deux lIaisons intermoléculaires. De plus. Nous avons mis en évidence une flexibilité conformationnelle au sein du complexe, modélIsée avec une surface d'énergie potentielle rendant compte des mouvements de grande amplitude des groupes hydroxyles du complexe. Cette étude d intérêt général a été étendue aux complexes hydratés des sucres C3. Par ailleurs, la structure hyperfine spin nucléaire - spin nucléaire des sucres en C2 et C3 (1. 3-dihydroxyacétone) a été observée et modélisée. Ce modèle pourrait être appliqué à tous les sucres CnH2nOn. Enfm, nous avons développé une méthodologie pour caractériser les conformères les plus stables des sucres en C. Pour les amines avec liaison peptidique, nous avons résolu la controverse sur l'énergie relative des conforméres E et Z du N-phénylformamide, avec une méthodologie adaptée. Qui a ensuite été appliquée au benzamide et au complexe urée-eau. La structure hyperfine de la molécule chirale CHCIFI a été caractérisée et sa structure a l'équilibre calculée ab initio.
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Miras, Thomas. "Effets de la viscosité et de la capillarité sur les vibrations linéaires d'une structure élastique contenant un liquide incompressible." Phd thesis, Conservatoire national des arts et metiers - CNAM, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00877348.
Full textAbstract:
Ce travail de recherche traite du couplage entre un liquide incompressible, irrotationnel et son contenant : une structure élastique. Cette interaction fluide-structure est traitée dans le cadre des petites déformations autour d'un état d'équilibre.Dans un premier temps, on présente une méthode d'introduction des sources dissipatives visqueuses dans le liquide à partir des équations du système couplé conservatif en s'appuyant sur une approche de type fluide potentiel généralement utilisée pour traiter les problèmes de couplage fluide-structure linéarisés non amortis. Un modèle d'amortissement diagonal est alors choisi pour le liquide et les effets dissipatifs de celui-ci sont pris en compte en calculant les coefficients d'amortissement modaux. Seuls les effets dissipatifs liées à la viscosité du liquide sont alors pris en compte. Le système couplé dissipatif obtenu possède une matrice d'amortissement non symétrique. Une résolution de ce système à amortissement non classique est alors présentée et les expressions des réponses fréquentielle et temporelle linéarisées sont données pour différents types d'excitations.Dans un deuxième temps, le liquide est supposé non visqueux et les forces de tension surfacique sont prises en compte. Cette configuration concerne principalement les satellites où le système couplé est en situation de microgravité. Une formulation du problème conservatif permettant de prendre en compte l'incompressibilité du fluide, la condition de continuité à l'interface fluide structure, les effets de capillarité du fluide ainsi que les effets éventuels de précontraintes statiques est alors établie. On se propose pour cela d'utiliser une méthode énergétique via le Principe de Moindre Action. La démarche est alors décomposée en deux étapes : une étude statique afin de déterminer la position de référence, puis une étude dynamique linéarisée autour de cette position d'équilibre. Cette formulation forme notamment une base pour l'introduction des sources dissipatives liées aux effets de capillarité via la méthode précédemment introduite.
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Castanié, Aurore. "Surface plasmon hybridization in the strong coupling regime in gain structures." Thesis, Montpellier 2, 2013. http://www.theses.fr/2013MON20093/document.
Full textAbstract:
Les plasmons de surface sont des modes non-radiatifs qui vivent à l'interface d'un diélectrique et d'un métal. Ils peuvent confiner la lumière à des échelles sub-longueur d'onde. Néanmoins, leur propagation reste limitée par les pertes inhérentes au métal qui entraînent une absorption rapide du mode. L'objet de cette thèse est l'étude du couplage des plasmons de surface dans des structures planes métallo-diélectriques. L'obtention des propriétés des différents modes nécessite le prolongement des solutions dans le plan complexe définissant la constante de propagation. La méthode mise en œuvre consiste à déterminer les pôles de la matrice de diffusion en utilisant les intégrales de Cauchy. Une première solution pour résoudre le problème de propagation des plasmons de surface consiste à coupler ces modes entre eux. Dans un milieu symétrique, lorsque l'épaisseur d'un film métallique devient suffisamment faible, le couplage entre les modes plasmons existants sur chaque surface devient possible. L'un des deux modes couplés ainsi créé, dit plasmon longue portée, a une longueur de propagation supérieure à celle du plasmon de surface usuel tandis que l'autre, dit plasmon à courte portée, se propage moins. Nous présentons une configuration permettant l'excitation du mode longue portée sans le mode courte portée grâce à une couche métallique déposée sur un substrat infiniment conducteur. Cette excitation peut alors être effectuée dans l'air et permettre des applications comme la détection et la caractérisation de molécules. Ensuite, nous présentons le couplage entre deux guides d'ondes diélectriques, et plus particulièrement la théorie des modes couplés, étendue au cas de la polarisation transverse magnétique. Nous considérons aussi le cas de la PT symétrie. La dernière partie de ce mémoire présente la démonstration du régime de couplage fort entre un plasmon de surface et un mode guidé. Nous mettons alors en évidence une augmentation de la longueur de propagation pour le mode hybride plasmon dont le confinement reste celui d'un mode de surface. Un gain linéaire est ensuite ajouté dans les différentes couches de la structure pour en étudier l'effet. L'ajout de gain dans la couche intermédiaire entre les deux modes couplés a pour conséquence l'exaltation de la longueur de propagation des modes et plus particulièrement du mode hybride plasmon qui peut alors se propager au-delà du millimètreSurface plasmon polaritons are non radiative modes which exist at the interface between a dielectric and a metal. They can confine light at sub-wavelength scales. However, their propagation is restricted by the intrinsic losses of the metal which imply a rapid absorption of the mode. The aim of this thesis is the study of the coupling of surface plasmons in metallo-dielectric planar structures. Obtaining the properties of the modes implies the extension of the solutions to the complex plane of propagation constants. The method used consists in determining the poles of the scattering matrix by means of Cauchy's integrals. The first solution to solve the problem of propagation of the surface plasmons consists in coupling these modes to one another. In a symmetric medium, when the thickness of the metallic film becomes thin enough, the coupling between the plasmon modes which exist on each side becomes possible. One of the coupled modes which is created, the so-called long range surface plasmon, has a bigger propagation length than the usual plasmon whereas the other coupled mode, named short range surface plasmon, has a smaller propagation length. We present a configuration which allows the excitation of the long range surface plasmon without the short range mode with a metallic layer deposited on a perfect electric conductor substrate. This excitation can be done in air and allows applications, such as the detection and the characterisation of molecules. Then, we present the coupling between dielectric waveguides, and, in particular, the coupled-mode theory in the case of the transverse magnetic polarisation. We consider also the case of PT symmetric structure. The last part of this work presents the demonstration of the strong coupling regime between a surface plasmon and a guided mode. We demonstrate an increase of the propagation length of the hybrid surface plasmon, which still has the confinement of a surface mode. A linear gain is added in the different layers of the structure. When the gain is added in the layer between both coupled modes allows an enhancement of the propagation lengths of the modes, and more precisely of the hybrid surface plasmon mode, which can propagate at the millimeter scale
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Mirmohades, Djalal. "Simplicial Structure on Complexes." Licentiate thesis, Uppsala universitet, Algebra och geometri, 2014. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-221410.
Full text
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Lam, Yan-ting, and 林殷霆. "Absence of jump of complex structures on Fano hypersurfaces under certain conditions." Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2011. http://hub.hku.hk/bib/B47049091.
Full text
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Jane, Reuben Thomas. "Cobalt(III) Complexes For Surface Engineering." Thesis, University of Canterbury. Chemistry, 2010. http://hdl.handle.net/10092/4424.
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This thesis addresses the potential for use of cobalt(III) complexes for functionalisation of lightly oxidised iron surfaces.
In Chapter 2 the preparation of cobalt(III) complexes of a series of ligands based on 1,1,1-tris(aminomethyl)ethane is described. The synthesis was approached in two ways. Firstly, preparation of functionalised triol molecules as precursors to functionalised triamine ligands was investigated. This approach utilised the Tollens condensation of aldehydes with formaldehyde. In a second approach, the functionalisation of tetrakis(aminomethyl)methane in which one amine arm has been differentiated was used. The tetraamine was reacted with benzaldehyde and reduced with borohydride ion to give a secondary amine molecule that was then functionalised using alkyl or aryl sulfonyl chloride molecules.
Chapter 3 describes the measurement of the binding of some cobalt(III) complexes to the surface of high surface area goethite. It was observed that complexes that have three exchangeable ligands bind more strongly than those with two exchangeable ligands. This is rationalised as being due to there being more bonds to the surface formed by complexes with three exchangeable ligands. It was also observed that complexes with three exchangeable ligands give greater surface coverage than those with two. This is likely due to the larger cross sectional area of the complexes with two exchangeable ligands in comparison to that of those with three, which blocks potential adjacent sites.
Preliminary experiments on the use of the contact angle, SEM, EDS and QCM to characterise complex binding are explored in Chapter 4 . The results from the EDS and QCM experiments show that these may be valuable tools for measuring this binding and the subsequent surface properties, but have not yielded detailed results at this point.
In Chapter 5 the use of cobalt(III) complexes as inhibitors of corrosion of iron in hydrochloric acid is investigated. All the complexes tested, even those that showed no binding to goethite surfaces, inhibit the corrosion to some degree. The level of inhibition is dependent on the complex, with [Co(tren)Cl2]Cl showing maximum inhibition of 81% and [Co(tame)Cl3] showing maximum inhibition of 53%. For some of the complexes, their concentration in solution over the course of the experiment was monitored by UV-vis. It was found that the complex disappears in a zero order reaction, the rate of which is dependent on the complex. However, the exact nature of this reaction is unknown. Furthermore, it was observed that inhibition of corrosion continues after the complex is no longer observed in solution. There is a difficulty in rationalising the inhibition being dependent on the complex identity, but not its continued presence in solution. Consequently, the mechanism of corrosion inhibition that explains all of these observations is still not known.
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Mora, Serge. "Structure d'interface de fluides complexes." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2003. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00003830.
Full textAbstract:
Une étude de la structure d'interfaces liquide-vapeur est présentée dans cette thèse. Les surfaces étudiées sont étroitement liées, afin de pouvoir déterminer l'influence des différents types d'interactions moléculaires, et de cerner les mécanismes responsables des propriétés physiques de ces surfaces. La diffusion diffuse de rayons x a permis de mesurer, pour différents liquides, le spectre des fluctuations de hauteur d'une surface nue. Ces mesures ne concordent plus avec le modèle des ondes capillaires pour des vecteurs d'onde supérieurs à 108 m-1 : la notion de tension de surface n'est plus valable à ces échelles et doit être remplacée par une énergie de surface effective. Il est montré que cette dernière décroît lorsque la longueur d'onde associée à la fluctuation est de l'ordre de quelques dizaines de distances moléculaires. Elle augmente pour les plus petites longueurs d'onde envisageables. L'accord remarquable avec la théorie proposée par K. Mecke et S. Dietrich. Ces mesures ont été étendues au cas d'interfaces décorées par un film moléculaire : l'énergie de surface effective est alors correctement décrite par une rigidité de courbure seule, qui est mesurée pour des films dans différentes phases. En particulier, l'effet de la renormalisation de la rigidité de courbure par l'élasticité lorsque le film s'apparente à un réseau bidimensionnel connecté a été mis en évidence. En complément de mesures de fluctuations de surfaces de solutions ioniques, nous avons montré que l'excès de concentration en ions au voisinage de la surface peut être mesuré par des expériences de fluorescence de rayons x et d'ellipsométrie. Cette mesure est essentielle pour comprendre les origines de la variation de la tension de surface, et plus généralement pour expliquer la spécificité des ions de la série de Hofmeister.
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Pantazis, Dimitrios A. "Electronic structure of polymorphic complexes." Thesis, University of York, 2005. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.440979.
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Busayaporn, Wutthikrai. "TiO2(110) surface structure." Thesis, University of Manchester, 2010. https://www.research.manchester.ac.uk/portal/en/theses/tio2110-surface-structure(9641eaab-818a-4928-a0b2-78312de050d5).html.
Full textAbstract:
In this thesis three studies of the geometric structure of the (110) surface of single crystal rutile TiO2 are presented. Firstly, quantitative low energy electron diffraction (LEED-IV) data acquired from TiO2(110)(1x1) are reanalysed to confirm the integrity of the previously reported optimized geometries by performing structural optimisation as a function of depth into the selvedge. The second study addresses the geometry of the x-linked (1x2) reconstruction of the same surface. Again, LEED-IV data are analysed to quantitatively determine the surface structure. Part of this effort involved substantial development of the code (SATLEED) employed for simulating the experimental data, to allow simultaneous optimisation of more than one surface termination. In contrast to recent scanning probe work, the analysis indicates that the surface consists of two differently relaxed Ti2O3 added rows. The last study concerns ab initio calculations of the structure of benzoate on TiO2(110)(1x1). Of particular interest is the impact of surface coverage on the orientation of the benzene ring. It is predicted that the benzene ring twists and tilts away from high symmetry with increasing coverage due to adsorbate-adsorbate interactions. No evidence is found to support the formation of benzoate dimers or trimers, as was concluded in earlier experimental work.
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Muldoon, James. "Protein Surface Recognition by Designed Metal Complexes." Thesis, University of Leeds, 2009. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.515371.
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Wilhelm, Kristina. "Protein complexes : assembly, structure and function." Doctoral thesis, Umeå universitet, Medicinsk kemi och biofysik, 2009. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-29792.
Full textAbstract:
Most proteins must fold into their native conformations to fulfil their biological functions. Failure of proteins to fold leads to cell pathology and a broad range of human diseases referred to as protein misfolding disease, e.g., Alzheimer’s disease, Parkinson’s disease, and type II diabetes. More than 40 proteins are known to be connected with misfolding diseases. These proteins share no sequence homology but all assemble into cross-b sheet containing insoluble fibrillar aggregates. Despite the pathological conditions that these proteins can induce, living organisms can take advantage of the inherent ability of these proteins to form such structures and to generate novel and diverse biological function, the functional amyloid. This thesis examines different aspects of cross-b sheet containing aggregates. The first paper describes the humoral response to aggregated structures of insulin and the astrocytical biomarker S100B in patients suffering from Parkinson’s disease. We show that the patients have an increased immunreactivity towards insulin and S100B in Parkinson’s disease patients compared to a control group. The second part of this work focuses on a functional amyloid. HAMLET (human a-lactalbumin made lethal for tumour cells) is a complex of a-lactalbumin and oleic acid, which kills tumour cells but not healthy differentiated cells. We wish to expand the concept of HAMLET to a structurally related protein and therefore create and characterize a complex of equine lysozyme and oleic acid (Paper II). We chose equine lysozyme because both proteins (equine lysozyme and a-lactalbumin) share common ancestors and are spatially related. The newly designed complex was named ELOA, for equine lysozyme with oleic acid. ELOA represents a functional oligomer due to its multimeric state and its ability to bind amyloid specific dyes. In the third paper, we investigate the interaction of the cytotoxic ELOA with live cells in real time to find a mechanistic model (Paper III). It is known that HAMLET is not only tumouricidal but is also toxic towards many bacteria. Therefore in the last part of the thesis, we investigated the effects of ELOA on different bacterial strains and focused on its interplay Streptococcus pneumoniae (Paper IV). These studies have added significantly to many aspects of protein folding and misfolding from its involvement in Parkinson’s disease to the newly gained functions and structural aspects of de novo produced ELOA.
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Moody, Aidan G. "The electronic structure of diazabutadiene complexes." Thesis, University of Oxford, 1997. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.389183.
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Redfern, C. M. "Electronic structure of transition metal complexes." Thesis, University of Oxford, 1988. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.235094.
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Wilhelm, Kristina Rebecca. "Protein complexes assembly, structure and function /." Umeå : Umeå university, 2009. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-29792.
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Davarpanah, Abdol Mahmood. "Electronic structure of surface alloys." Thesis, University of Liverpool, 2004. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.404704.
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Jardine, Nicole. "Surface structure and saccadic control." Diss., University of Iowa, 2018. https://ir.uiowa.edu/etd/6147.
Full textAbstract:
Saccadic eye movements are guided by attention. Indeed, some saccade trajectory effects serve as an index the attentional strength of visual objects in the map of visual space used to plan a saccade. One approach to understanding saccade planning relies on simple tasks in sparse displays (containing a single target and distractor object) to develop neurophysiologically plausible models of saccade behavior. Under tightly controlled conditions, saccade trajectories can be well predicted by representing displays of objects with simple visual features and their relative salience.
But the world in which the saccade system typically operates is not sparse, and observer eye movements are guided by more than just salience. As such, another approach has been to examine saccadic behavior in complex scenes and complicated goals. Such scene context can drastically affect saccades in ways that are not well predicted by a context-free and expectation-free representation of visual salience.
This dissertation starts to bridge this gap between these literatures by focusing on object surfaces. Covert shifts of attention operate on representations informed not just by stimulus salience and location-based expectations, but also by the perceptual organization of object surfaces. Covert attention can be guided by surface context, such that targets and distractors are processed differently as a function of whether they are on the same or different surface. These effects are fragile, however, and have previously only been demonstrated in relatively engaging tasks and with strong perceptions of objecthood.
The present work tested the strength of the relationship between attention and saccades by testing whether surface context guides orienting eye movements. Observers made saccades to objects that could be organized with different surface structure. In four experiments (Chapters 2 and 3) I found no evidence that the saccade map encoded surface context. But in two experiments (Chapters 4 and 5) I demonstrate saccade trajectories are sensitive to surface context, independently of low or high task engagement. This demonstrates that object surface-based representations are not necessarily fragile and can affect the oculomotor map even for simple saccadic orienting for which the surface is task-irrelevant. This lends evidence to the theory that the nature of the representation of vision is one of object surfaces, and suggests that the strength of object encoding is stronger than has been previously demonstrated.
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Nakkach, Mohamed. "Imagerie multidimensionnelle en mode de résonance de plasmons de surface de structures de biopuces : expérience et modélisation." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00734650.
Full textAbstract:
Dans cette thèse nous avons ajouté le contrôle du paramètre spectral pour donner plus de degré de liberté à l'instrument basé sur l'Imagerie par Résonance des Plasmons de Surface (SPRI), développant un système instrumental à interrogation angulo-spectrale. Pour valider notre travail, nous avons pris comme modèle d'étude un milieu diélectrique absorbant à unelongueur d'onde visible. La fonction diélectrique complexe est traitée par le modèle de Lorentz et la relation entre la partie réelle et imaginaire de l'indice optique est assurée par la relation de Kramers-Kronig. Nous avons commencé par injecter dans la cellule de mesure un colorant absorbant à 630 nm et mesuré la réflectivité angulo-spectrale avec ce milieu. Ensuite, un programme d'ajustement, que nous avons développé, a été utilisé pour le calcul inverse et la détermination des paramètres optiques à partir des données de l'expérience. Cet ajustement permet d'extraire la partie réelle et la partie imaginaire de l'indice de réfraction démontrant la possibilité d'applications de type spectroscopique. Nous avons également intégré successivement à la surface des molécules d'ADN marquées par différents chromophores pour voir l'effet de la position d'absorption sur la variation de réflectivité angulo-spectrale. En plus des milieux absorbants, nous avons fabriqué des réseaux diélectriques et métalliques et les avons intégrés à la surface du prisme. Les structures utilisées avaient une période de 250 nm et une épaisseur de 300 nm en PMMA. Cette condition nous a permis de voir un plasmon bandgap centré à 735 nm. Cette étude expérimentale est validée par une étude théorique en utilisant la méthode RCWA pour simuler la réponse des réseaux périodiques.
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Labatut, Patrick. "Labeling of data-driven complexes for surface reconstruction." Paris 7, 2009. http://www.theses.fr/2009PA077106.
Full textAbstract:
Cette thèse introduit une nouvelle approche pour la reconstruction de surface à partir d'acquisitions de nuages de points. Cette approche construit un complexe cellulaire à partir du nuage de points puis formule la reconstruction comme un problème d'étiquetage binaire des cellules de ce complexe sous un ensemble de contraintes de visibilité. La résolution du problème se ramène alors au calcul d'une coupe minimale s-t permettant d'obtenir efficacement une surface optimale d'après ces contraintes. Dans la première partie de cette thèse, l'approche est utilisée pour la reconstruction générique de surface. Une première application aboutit à un algorithme très robuste de reconstruction de surface à partir de nuages denses issus d'acquisitions laser. Une seconde application utilise une variante de cet algorithme au sein d'une chaîne de photo-modélisation en combinaison avec un raffinement variationnel photométrique. La chaîne complète est adaptée à la reconstruction de scènes de grande échelle et obtient d'excellents résultats en terme de complétude et de précision des reconstructions obtenues. La seconde partie de cette thèse considère le problème de la reconstruction directe de modèles géométriques simples à partir de nuages de points. Un algorithme robuste est proposé pour décomposer hiérarchiquement des nuages de points denses en formes issues d'un ensemble restreint de classes de formes. Lorsque que cet ensemble de classes est réduit aux plans seulement, la reconstruction de modèles de très faible complexité est possfcle. Une extension à d'autres classes de forme échange cet avantage contre la gestion de nuages de points plus difficilesThis thesis introduces a new flexible framework for surface reconstruction from acquired point sets. This framework casts the surface reconstruction problem as a cells binary labeling problem on a point-guided cell complex under a combination of visibility constraints. This problem can be solved by Computing a simple minimum s-t cut allowing an optimal visibility-consistent surface to be efficiently found. In the first part of this thesis, the framework is used for general surface reconstruction problems. A first application leads to an extremely robust surface reconstruction algorithm for dense point clouds from range data. A second application consists in a key component of a dense multi-view stereo reconstruction pipeline, combined with a carefully designed photometric variational refmement. The whole pipeline is suitable to large-scale scenes and achieves state-of-the-art results both in completeness and accuracy of the obtained reconstructions. In the second part of this thesis, the problem of directly reconstructing geometrically simple models from point clouds is addressed. A robust algorithm is proposed to hierarchically cluster a dense point clouds into shapes from a predefined set of classes. If this set of classes is reduced to planes only, the concise reconstruction of models of extremely low combinatorial complexity is achieved. The extension to more general shapes trades this conciseness for a more verbose reconstruction with the added feature of handling more challenging point clouds
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Zaidi, Faraz. "Analyse, Structure et Organisation des Réseaux Complexes." Phd thesis, Université Sciences et Technologies - Bordeaux I, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00542703.
Full textAbstract:
La Science des Réseaux est apparue comme un domaine d'étude fondamental pour modéliser un grand nombre de systèmes synthetiques ou du monde réel. La découverte du graphe petit monde et du graphe sans échelle dans ces réseaux a révolutionné la façon d'étudier, d'analyser, de modéliser et de traiter ces réseaux. Dans cette thèse, nous nous intéressons à l'étude des réseaux ayant ces propriétés et souvent qualifiés de réseaux complexes. À notre avis, les recherches menées dans ce domaine peuvent être regroupées en quatre catégories: l'analyse, la structure, le processus/organisation et la visualisation. Nous abordons des problèmes relatifs à chacune de ces catégories tout au long de cette thèse. Les premiers chapitres introduisent l'état de l'art nécessaire aux lecteurs. Les chapitres 3,4,5,6 et 7 abordent chacun un problème spécifique auquel nous proposons une solution. Dans le chapitre 3, nous présentons une méthode de visualisation analytique pour analyser les réseaux complexes. En s'appuyant sur cette méthode, nous introduisons une nouvelle métrique pour déterminer la présence de sommets largement connectés. Nous détaillons dans le chapitre 4 un ensemble de modèles pour générer des réseaux artificiels ayant les propriétés petit monde et sans échelle. Nous proposons un nouveau modèle générant des réseaux de ce type et qui contiennent, de plus, des structures communautaires. En extension des résultats d'analyse obtenus au chapitre 3, nous introduisons un algorithme de clustering agglomératif dans le chapitre 5. Dans le chapitre 6, nous abordons la question de la visualisation de ces réseaux complexes grâce à un système qui combine simplification et clustering avec des algorithmes de mise en page dédiée. Nous abordons enfin dans le chapitre 7 la question de l'évaluation de la qualité des clusters pour les réseaux complexes qui n'ont pas de sommets largement connectés. Nous concluons chaque chapitre par des perspectives de recherches dédiées. Enfin, nous résumons nos résultats et concluons cette thèse en proposant quelques futurs axes de recherches basés sur nos découvertes.
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Khatter, Heena. "Structure-function studies of human ribosome complexes." Thesis, Strasbourg, 2014. http://www.theses.fr/2014STRAJ072/document.
Full textAbstract:
L’architecture et la régulation de la traduction eucaryote fut pendant longtemps un mystère pour les biologistes. Je présente ici un protocole détaillé pour purifier de manière homogène des ribosomes à partir de cellules HeLa, pour des études biochimiques mais également structurales. En utilisant ces ribosomes, j’ai obtenu des cristaux diffractant à faible résolution, pouvant être utilisés pour de futurs travaux. Une analyse par cryo-microscopie électronique (CME) a abouti à une structure à 5 A de résolution, permettant la construction d’un modèle. De plus, les facteurs eRF1 et eRF3 ont permis des premières études de la terminaison de la traduction par CME. Ces protéines en complexe ont également été étudiées par cristallographie aux rayons-X, montrant des interactions jusqu’alors jamais observées. L’ensemble de ce travail fournit des résultats importants pour la préparation et la description de la structure du ribosome humain, pavant la voie vers l’analyse de complexes fonctionnelsRibosomes comprise the translational machinery engaged in synthesizing proteins. The architecture and translation regulation of eukaryotic especially, human ribosomes, has been an enigma for a long time. I established a protocol for purifying homogenous ribosomes from HeLa cells which can be used for structural as well as biochemical analysis. Using these ribosomes, I obtained plate-like crystals of 80S diffracting to low resolution. A cryo electron microscopy analysis of these ribosomes yielded 5 Å resolution structure with secondary structures of rRNA and protein clearly visible. Furthermore, these ribosomes, along with the eukaryotic release factors (eRF1 and eRF3) purified by over-expression in bacteria, formed the basis for translation termination studies using cryo electron microscopy. Simultaneously, eRF1-eRF3 protein complex was explored by X-ray crystallography revealing new interactions. Together, this work paves the way for the analysis of functional ribosome complexes
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Skouteris, Dimitris. "Structure and dynamics of weakly bound complexes." Thesis, University of Oxford, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.301422.
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Mougel, Victor. "Complexes polynucléaires d'Uranium : structure réactivité et propriétés." Phd thesis, Université de Grenoble, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00770328.
Full textAbstract:
L'étude et la compréhension de la chimie fondamentale des actinides constitue un axe de recherche privilégié notamment dans le cadre de la technologie nucléaire tant en amont pour le développement de nouveaux combustibles qu'en aval pour l'étude du retraitement des déchets nucléaires. Une des problématiques principales au cours de ces études réside dans la capacité que possèdent les actinides à subir des réactions rédox et à former des assemblages polynucléaires. Néanmoins, très peu d'assemblages polynucléaires peuvent être synthétisés de manière reproductible, la plupart des complexes polynucléaires d'actinides décrits dans la littérature sont formés de façon fortuite plutôt que par conception rationnelle. En outre, les assemblages polynucléaires s'uranium ont été identifiés comme particulièrement prometteurs pour l'élaboration de matériaux magnétiques et pour leur réactivité. L'objectif de ce travail réside dans la synthèse d'assemblages polymétalliques à base d'uranium en mettant à profit quelques aspects de sa réactivité redox et de sa chimie de coordination. De nouvelles voies de synthèse de composés polynucléaires d'uranium ont été développées, et l'étude des propriétés physico-chimique des composés a été réalisée. La première approche utilisée repose sur la synthèse d'assemblages d'uranyle pentavalent. L'uranyle pentavalent est connu pour sa facilité d'agrégation via des interactions entre groupement uranyles appelées interaction cation-cation, mais l'isolation de ce type de composé a été très largement limitée par l'instabilité de l'uranyle(V) vis-à-vis de la dismutation. L'utilisation de ligands base de Schiff de type salen a permis dans ces travaux l'isolation du premier assemblage polynucléaire d'uranyle(V). Sur la base de ce résultat, la variation des ligands et des contre-ions utilisés a permis l'isolation d'une large famille d'assemblages polynucléaires d'uranyle(V) et l'étude fine des paramètres régissant leur stabilité. Par ailleurs, l'étude des propriétés magnétiques de ces assemblages a mis en valeur de rares exemples couplages antiferromagnétiques. En outre, cette voie de synthèse a été exploitée pour synthétiser le premier cluster 5f/3d présentant des propriétés de molécule aimant. Le deuxième axe d'approche suivi dans ce travail repose sur l'isolation de clusters oxo/hydroxo d'uranium. La réactivité d'hydrolyse de complexes d'uranium trivalent en présence de ligand à pertinence environnementale à permis la synthèse d'assemblages d'uranium dont la taille à pu être variée en fonction des conditions de synthèse employées. Enfin, de nouveaux assemblages présentant des topologies originales ont été isolés en exploitant la réactivité de dismutation de précurseurs d'uranium pentavalent.
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Lietha, Daniel. "Structure and function of NK1-heparin complexes." Thesis, Birkbeck (University of London), 2004. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.407953.
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