Dissertations / Theses: 'Streptococcus thermophilus'

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Tremblay, Denise. "Caractérisation génomique d'un phage de Streptococcus thermophilus." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape7/PQDD_0004/MQ44975.pdf.

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Bergeron, Claudia. "Transcriptome du bactériophage DT1 de Streptococcus thermophilus." Thesis, Université Laval, 2006. http://www.theses.ulaval.ca/2006/24042/24042.pdf.

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Vaillancourt, Katy. "Étude comparative des opérons galactose de Streptococcus salivarius et Streptococcus thermophilus." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2000. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape2/PQDD_0021/MQ56776.pdf.

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Sturino, Joseph Miland. "Bacteriophage Defense Systems and Strategies for Streptococcus thermophilus." NCSU, 2003. http://www.lib.ncsu.edu/theses/available/etd-12152003-034319/.

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Abstract:

The genomes of six Streptococcus thermophilus bacteriophages were compared to identify genes that could be targeted by engineered phage defense systems with potentially widespread efficacy. The genes associated with the S. thermophilus phage Sfi21-prototype genome replication module, including a putative primase and a putative helicase, were found to be among the best candidates due to their frequency of distribution in industrial phage isolates, striking sequence conservation between independent isolates, and intrinsic strategic importance in early phage development. Fourteen antisense RNA cassettes targeting the phage k3-derived helicase (hel3) or primase (pri3) genes were expressed in S. thermophilus NCK1125. These constructs consistently reduced the efficiency of plaquing (EOP) of phage k3 to between 5 x 10-1 and 2.0 x 10-3 depending on the (i) gene targeted and (ii) region of the gene that was targeted. The largest antisense RNAs were generally found to confer the largest reductions in EOP, however shorter antisense RNAs designed to the 5' region of the gene retained much of the inhibitory function, especially if they contained sequences complementary to the ribosome binding site. Expression of antisense RNAs correlated with decreased levels of phage encoded primase transcripts, likely due to increased degradation of the dsRNA complex. This, in turn, correlated with diminished phage genome replication and aborted phage development. In a separate study, invariant and highly conserved amino acids within a primase consensus sequence were targeted by site-specific mutation within the S. thermophilus phage k3-encoded putative primase. PCR products containing the desired mutation(s) were cloned and expressed in S. thermophilus NCK1125. The majority of the examined constructs remained sensitive to phage k3, however four constructs conferred strong phage resistance to the bacterial host. The mutated residues resided within a putative ATPase/helicase domain suspected to be critical for primase function in vivo. The co-expression in trans of the K238(A/T) or RR340-341AA mutant proteins suppressed the function of the native, phage-encoded primase protein in a dominant negative fashion via a proposed subunit poisoning mechanism. According to this model, the plasmid-encoded mutant primase subunits are structurally intact and form stable interactions with the native, phage-encoded primase subunits, thus inhibiting their activity. These constructs completely inhibited phage genome synthesis and reduced the efficiencies of plaquing more that nine log cycles. Given the magnitude of the resistance conferred, it was concluded that the putative primase is essential for genome replication in S. thermophilus Sfi21-type phages. Further, it was also clear that host-encoded factors were unable to complement the resultant deficiency. Amber mutations introduced upstream of the transdominant RR340-341AA and K238(A/T) mutations restored phage genome replication and phage sensitivity of the host, indicating that translation was required to confer phage resistance. Residues within a critical oligomerization domain were also identified through genetic analysis. Introduction of an E437A mutation downstream of the transdominant K238T mutation completely suppressed phage resistance, indicating that the E437A mutation precluded the association of the mutant and native subunits. To our knowledge, this is the first use of subunit poisoning to inhibit phage replication in the lactic acid bacteria.

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Garneau, Josiane. "Caractérisation du système CRISPR-CAS chez Streptococcus thermophilus." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26441/26441.pdf.

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HUSSON, KAO CLARA. "Etude des mecanismes moleculaires d'autolyse de streptococcus thermophilus." Massy, ENSIA, 1999. http://www.theses.fr/1999EIAA0097.

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Abstract:

L'autolyse bacterienne peut etre definie comme l'eclatement cellulaire resultant de la degradation du peptidoglycane par des enzymes appelees peptidoglycane-hydrolases (pgh). Ce phenomene est reconnu chez les bacteries lactiques pour avoir un impact positif sur le developpement des caracteristiques organoleptiques des produits laitiers fermentes. Il a ete peu etudie chez streptococcus thermophilus malgre l'importance economique de ce levain qui est utilise pour la production de yoghourts, de fromages italiens et de fromages a pate pressee cuite. L'objectif du present travail a ete d'acquerir, en vue de sa maitrise, une connaissance physiologique et moleculaire du phenomene d'autolyse chez s. Thermophilus. A cette fin, un interet tout particulier a ete porte sur le contenu en pgh de cet organisme. Six souches de s. Thermophilus spontanement autolytiques ont ete identifiees dans une premiere phase de travail. Elles presentent l'interet de se lyser massivement dans des conditions compatibles avec la technologie laitiere. Leur phenotype autolytique est lie a leur caractere lysogene, et semble resulter d'une repression incomplete du prophage. La lyse apparait etre le fait de l'action des proteines de lyse phagiques, en particulier de l'endolysine de 31 kda detectee par electrophorese sds-page renaturante exclusivement les souches autolytiques. Parallelement, deux pgh endogenes ont ete identifiees chez s. Thermophilus. L'une a ete detectee par electrophorese sds-page renaturante a 51 kda. L'autre mur 1, possedant une masse moleculaire de 24,7 kda, a ete identifiee par une approche genetique et presente la particularite, par rapport a d'autres pgh bacteriennes, de ne pas posseder dans sa sequence de domaine specifique de liaison a la paroi. Ce travail a ainsi permis d'elucider le mecanisme de lyse des souches autolytiques de s. Thermophilus et d'acceder a une connaissance plus fondamentale du systeme autolytique de cette espece.

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Morice, Michel. "Étude de la congélation de streptococcus thermophilus : influence des cations sur la croissance en chaînes et la détermination de la cryorésistance, hétérogénéité du comportement de variants morphologiques." Nancy 1, 1990. http://www.theses.fr/1990NAN10486.

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Abstract:

Steptococcus thermophilus CNRZ 368 comprend 4 variants morphologiques. Leur croissance en chaînes conduit à une surestimation de leurs taux de survie à la congélation si l'on utilise la technique de numération en boite de petri car les chaines sont rompues au cours du traitement. L'étude de la croissance et la production d'ATP des variants avant et après congélation révèle qu'ils résistent différemment au traitement. L'addition au milieu de culture de cations (magnésium, sodium ou lithium) impliqués dans la séparation des cellules-filles lors de la division cellulaire améliore la précision des numérations. Deux milieux à base de bicarbonate de sodium ont été élaborés pour étudier l'influence de la congélation sur les 2 variants les plus extrêmes du point de vue morphologique. Les influences respectives du milieu de culture, du stade physiologique des bactéries au moment de la congélation, des vitesses de refroidissement et de dégel sur la survie des deux variants sont différentes. De plus, ces variants montrent des sensibilités différentes à la protection exercée par plusieurs substances (glycérol, DMSO, adonitol, xylitol et raffinose). Ces sensibilités différentes aux divers facteurs de la congélation sont susceptibles de provoquer un déséquilibre des populations bactériennes lors de leur congélation

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Larbi, Derouiche Djela. "Études génétique et biologique de neuf bactériophages de streptococcus salivarius ssp thermophilus : études des interactions phages-bactéries." Nancy 1, 1991. http://www.theses.fr/1991NAN10013.

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Abstract:

Dans cette étude neuf bactériophages de streptococcus salivarius ssp. Thermophilus ont été caractérises. Leur génome est constitue d'ADN double brin linéaire possédant des extrémités cohésives. Sur la base de leurs profils de restriction, ces phages ont été classés en deux souches phagiques. L'étude génétique et biologique de deux bactériophages, représentatifs de ces deux souches montre qu'ils sont très apparentes. L'étude des interactions phages-bactéries suggère la présence de systèmes de résistance variés chez streptococcus salivarius ssp. Thermophilus, notamment l'existence de systèmes de restriction/modification et la présence d'un système de résistance thermo-dépendant qui induirait une infection abortive. Par ailleurs, ces mécanismes n'affectent pas tous les phages d'une même souche, ce qui suggère que les phages peuvent développer des parades à ces mécanismes

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Varga, Ferenc. "The origins, production and control of acetaldehyde in yoghurt." Thesis, University of Reading, 1997. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.271185.

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Doco, Thierry. "Les exopolysaccharides des bactéries lactiques : isolement, structure et propriétés de l'exopolysaccharide excrété dans un milieu lacté par Streptococcus thermophilus." Lille 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LIL10139.

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Abstract:

Streptococcus thermophilus, bactérie lactique, est utilisé en association avec Lactobacillus bulgaricus dans la fabrication du yaourt. La production d'exopolysaccharides par ces bactéries modifie la texture qui constitue l'un des critères de qualité du yaourt. Les recherches que nous avons effectuées, concernent la caractérisation de l'hydrocolloïde secrété par Streptococcus thermophilus dans un milieu lacté et la détermination de ses propriétés physico-chimiques et biologiques. L'utilisation des méthodes classiques de fractionnement a permis d'isoler une macromolécule glucidique de masse moléculaire 1 000 000 daltons. L'application des méthodes chimiques et spectroscopiques à ce polysaccharide nous a fourni la structure primaire de l'unité tétrasaccharidique de répétition constituée de deux résidus de galactose, un résidu de glucose, et un résidu de n-acetylgalactosamine. La modélisation d'un enchaînement de six unités tétrasaccharidiques de répétition, permet d'envisager une structure hélicoïdale pour l'édifice macromoléculaire. Cette conformation spatiale est responsable des propriétés hydrodynamiques de la macromolécule glucidique dans son milieu. La mise en œuvre d'une technique rapide de dosage par HPLC, de polysaccharides excrétés dans le milieu lacté nous a permis de mener une étude sur la production de polysaccharides par des souches de Streptococcus thermophilus, productrices et hyperproductrices et sur la viscosité du lait fermenté, et en particulier, de mettre en évidence l'augmentation de la viscosité du lait fermenté corrélée à l'augmentation de l'excrétion du polysaccharide. L'application d'un réacteur enzymatique couplé à un module d'ultrafiltration pour éliminer les protéines du lait, nous a permis l'isolement de quantités significatives de polysaccharides. Les premières études menées sur le pouvoir antitumoral du polysaccharide (régression des tumeurs de sarcome 180 chez la souris) sont positives.

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Layec, Séverine Decaris Bernard. "Le gène cse, de création récente, code une hydrolase du peptidoglycane impliquée dans la séparation des cellules de Streptococcus thermophilus." S. l. : Nancy 1, 2008. http://www.scd.uhp-nancy.fr/docnum/SCD_T_2008_0066_LAYEC.pdf.

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Colmin, Catherine. "Polymorphisme génétique et typage moléculaire chez la bactérie streptococcus salivarius subsp. Thermophilus." Nancy 1, 1991. http://www.theses.fr/1991NAN10135.

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Abstract:

La réalisation de profils de restriction de l'ADN a permis de mettre en évidence l'existence d'un polymorphisme génomique intraspécifique chez streptococcus salivarius subsp. Thermophilus. A partir de l'ADN de la couche nst7, un fragment de 4,2 kb appelé i21 a été cloné dans le plasmide pbr322. Utilisé comme sonde sur des profils de restriction NDEII et HAEIII des ADN des 28 souches, ce fragment permet de révéler le polymorphisme génomique. Sur la base de ces résultats, il est possible de classer ces souches en 10 groupes dont 5 ne comprennent qu'une seule souche. La nature polymorphe du locus i21 a été mise en évidence : le génome de toutes les souches examinées ne contient pas la totalité de ce fragment. Des hybridations ont été réalisées en utilisant séparément comme sonde trois parties de ce fragment. Ces expériences ont permis de montrer que pour les 8 souches examinées, il existe au moins 7 situations différentes caractérisées chacune par une structure particulière de cette région du génome. Un deuxième fragment d'ADN qui semble affecté par le même type de phénomène a été mis en évidence. D'autre part, la partie c du fragment i21 contient une séquence de taille inferieure ou égale a 1 kb qui est répétée dans les génomes de toutes les souches de s. Salivarius subsp. Thermophilus examinées. Le degré de spécificité de la sonde pnst21 a été testé par hybridation sur les ADN de 34 souches appartenant à 19 espèces différentes de s. Salivarius subsp. Thermophilus et cette sonde s'est révélée être spécifique de l'espèce s. Salivarius. La sonde pnst21 a été hybridée sur les ADN de 107 souches de s. Salivarius subsp. Thermophilus appartenant a la collection du CNRZ. Des ribotypes des souches de la collection du laboratoire ont également été réalisés. Ils permettent de caractériser de manière unique un plus grand nombre de souches. Enfin, une estimation du pourcentage de divergence nucléotidique existant entre les régions ribosomiques des génomes de ces souches a été réalisée

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Almiron-Roig, Eva. "The exopolysaccharide from Streptococcus thermophilus NCFB2393 : structure, biochemistry and genetics." Thesis, University of East Anglia, 2000. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.323337.

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BERRUTI, GIANGIACOMO. "Caratterizzazione molecolare di geni per l'antibiotico resistenza in Streptococcus Thermophilus." Doctoral thesis, Università Cattolica del Sacro Cuore, 2007. http://hdl.handle.net/10280/78.

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Abstract:

Obiettivo di questo lavoro è stato valutare la diffusione di AR in differenti ceppi di S. thermophilus isolati tra il 1947 e il 2004 e provenienti da differenti ambienti, in modo da avere un chiaro andamento del fenomeno; questo è stato possibile analizzando un numero significativo di ceppi isolati in un periodo di tempo che va da prima dell'utilizzo degli antibiotici fino ai giorni nostri. L'espressione fenotipica è stata valutata con tre differenti metodi (microdiluizioni in brodo, E-test e Disk Diffusion), in accordo con gli standard NCCLS, per la determinazione delle MICs (Minimum Inhibitory Concentration, ovvero Concentrazioni Minime Inibenti). Per la valutazione genetica è stata impiegata la tecnica dei microarrays a DNA utilizzando oligonucleotidi da 50 e 60-mer, per un totale di 300, appartenenti a 10 diverse classi di antibiotici. La conferma dei risultati è stata ottenuta mediante PCR e sequenziamento. In 9 ceppi di S. thermophilus è stato possibile mettere in evidenza la presenza di almeno uno dei geni tetS ed ermB responsabili della resistenza agli antibiotici Tetraciclina e Eritromicina rispettivamente.
The aim of the present work was to assess the AR diffusion in a total of 70 different strains of Streptococcus thermophilus, collected between 1950 and 2004 and from different environments; in this way we had the possibility to obtain a clear overview of the response of these bacteria to a large variety of antibiotics, having been able to analyze a significant number of different strains, originated from different areas and distributed over a wide time period, since before the use of antibiotics up to the present day. The phenotypic expression has been evaluated by using three different methods: microdilution, E-test and disk diffusion. The genetic analysis was performed using 50 and 60-mer oligonucleotides DNA based micro array for the identification of AR genes; the AR genes represented by the oligonucleotides on the micro array belong to: Aminoglycoside, Extended Spectrum ?-lactamase (ESBL), Chloramphenicol, Macrolide Lincosamides and Streptogramin (MLS) group, Sulfonamide, Tetracycline, Trimethoprim and Vancomycin. tetS and ermB genes were found and sequenced in 4 out of the total of the S. thermophilus investigated. Furthermore we have wanted to establish the genetic location of above-mentioned genes and assess their transfer intra and inter species adopting the conjugation technique in plate.

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BERRUTI, GIANGIACOMO. "Caratterizzazione molecolare di geni per l'antibiotico resistenza in Streptococcus Thermophilus." Doctoral thesis, Università Cattolica del Sacro Cuore, 2007. http://hdl.handle.net/10280/78.

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Abstract:

Obiettivo di questo lavoro è stato valutare la diffusione di AR in differenti ceppi di S. thermophilus isolati tra il 1947 e il 2004 e provenienti da differenti ambienti, in modo da avere un chiaro andamento del fenomeno; questo è stato possibile analizzando un numero significativo di ceppi isolati in un periodo di tempo che va da prima dell'utilizzo degli antibiotici fino ai giorni nostri. L'espressione fenotipica è stata valutata con tre differenti metodi (microdiluizioni in brodo, E-test e Disk Diffusion), in accordo con gli standard NCCLS, per la determinazione delle MICs (Minimum Inhibitory Concentration, ovvero Concentrazioni Minime Inibenti). Per la valutazione genetica è stata impiegata la tecnica dei microarrays a DNA utilizzando oligonucleotidi da 50 e 60-mer, per un totale di 300, appartenenti a 10 diverse classi di antibiotici. La conferma dei risultati è stata ottenuta mediante PCR e sequenziamento. In 9 ceppi di S. thermophilus è stato possibile mettere in evidenza la presenza di almeno uno dei geni tetS ed ermB responsabili della resistenza agli antibiotici Tetraciclina e Eritromicina rispettivamente.
The aim of the present work was to assess the AR diffusion in a total of 70 different strains of Streptococcus thermophilus, collected between 1950 and 2004 and from different environments; in this way we had the possibility to obtain a clear overview of the response of these bacteria to a large variety of antibiotics, having been able to analyze a significant number of different strains, originated from different areas and distributed over a wide time period, since before the use of antibiotics up to the present day. The phenotypic expression has been evaluated by using three different methods: microdilution, E-test and disk diffusion. The genetic analysis was performed using 50 and 60-mer oligonucleotides DNA based micro array for the identification of AR genes; the AR genes represented by the oligonucleotides on the micro array belong to: Aminoglycoside, Extended Spectrum ?-lactamase (ESBL), Chloramphenicol, Macrolide Lincosamides and Streptogramin (MLS) group, Sulfonamide, Tetracycline, Trimethoprim and Vancomycin. tetS and ermB genes were found and sequenced in 4 out of the total of the S. thermophilus investigated. Furthermore we have wanted to establish the genetic location of above-mentioned genes and assess their transfer intra and inter species adopting the conjugation technique in plate.

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CHEGDANI, FATIMA. "Effects of Streptococcus Thermophilus Bacteria on rat gene expression profiles." Doctoral thesis, Università Cattolica del Sacro Cuore, 2011. http://hdl.handle.net/10280/962.

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Abstract:

In questo studio abbiamo analizzato l'impatto dellethermophiluds Streptococcus sull'epitelio del colon di ratto. Dopo la generazione del modello di ratto axenico e inoculato con S. thermophilus abbiamo investigato l'interazione tra il batterio e epithelo del colon di ratto. Dopo questo studio integrativo abbiamo analizzato l’espressione genica del colon usando due diversi approcci: Ibridazione sottrattiva I trascritti ottenuti dopo il sequenziamento dei cloni ottenuti con la SSH sono stati raggruppati in diversi categorie funzionali: arresto del ciclo cellulare e induzione del differenziamento, comunicazione cellulare e binding . due geni candidati sono stati privilegiati, krupel like fattore 4 e 14-3-3σ. Questi geni candidati sono stati analizzati mediante RT-PCR, qRT-PCR e Western Blot in animali mono-associati e in animali germ-free. I test hanno confermato che l’espressione dei geni candidati aumenta in presenza di S. thermophilus. Microarray Analysis. L’spressione genica è stata misurata per due gruppi di animali: i) ratti privi di germi, ii) ratti mono-associati con il ceppo LMD9 di Streptococcus thermophilus. I risultati delle analisi dei dati di microarray indicano che Streptococcus thermophilus influenza notevolmente l'espressione genica nelle cellule epiteliali del colon.
In this study we have investigated the impact of Streptococcus thermophiluds on the rat colonic epithelium. After generation of the model axenic rat and inoculated with S. thermophilus we have investigated the interplay between bacteria and host colon. Colonic epithelium gene expression was investigated also, with two different approaches: Suppressive Subtractive Hybridization. The subtraction library was prepared subtracting mRNA between epithelial cells from colonic mono-associated rats and germ-free rats. The transcripts generated by SSH were grouped into divers Functional groups: cell-cycle arrest and induction of differentiation; cell-communication and binding. Tow candidates genes were privileged, krupel like factor 4 and 14-3-3σ. These candidate genes were tested by RT-PCR, qRT-PCR and Western blot in mono-associated animals and in germ-free animals. The tests confirmed that candidate genes increase their expression in the presence of S. thermophilus. Microarray analysis. Gene expression was measured in tow groups of animals: i) germ-free rats; ii) mono-associated rats inoculated with LMD9 strain of Streptococcus thermophilus. The results of microarray analysis data show that Streptococcus thermophilus remarkably affected gene expression in the colonic epithelial cells. Streptococcus thermophilus enhanced the expression of genes involved in different pathways in the host, compared to the gem free group.

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CHEGDANI, FATIMA. "Effects of Streptococcus Thermophilus Bacteria on rat gene expression profiles." Doctoral thesis, Università Cattolica del Sacro Cuore, 2011. http://hdl.handle.net/10280/962.

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Abstract:

In questo studio abbiamo analizzato l'impatto dellethermophiluds Streptococcus sull'epitelio del colon di ratto. Dopo la generazione del modello di ratto axenico e inoculato con S. thermophilus abbiamo investigato l'interazione tra il batterio e epithelo del colon di ratto. Dopo questo studio integrativo abbiamo analizzato l’espressione genica del colon usando due diversi approcci: Ibridazione sottrattiva I trascritti ottenuti dopo il sequenziamento dei cloni ottenuti con la SSH sono stati raggruppati in diversi categorie funzionali: arresto del ciclo cellulare e induzione del differenziamento, comunicazione cellulare e binding . due geni candidati sono stati privilegiati, krupel like fattore 4 e 14-3-3σ. Questi geni candidati sono stati analizzati mediante RT-PCR, qRT-PCR e Western Blot in animali mono-associati e in animali germ-free. I test hanno confermato che l’espressione dei geni candidati aumenta in presenza di S. thermophilus. Microarray Analysis. L’spressione genica è stata misurata per due gruppi di animali: i) ratti privi di germi, ii) ratti mono-associati con il ceppo LMD9 di Streptococcus thermophilus. I risultati delle analisi dei dati di microarray indicano che Streptococcus thermophilus influenza notevolmente l'espressione genica nelle cellule epiteliali del colon.
In this study we have investigated the impact of Streptococcus thermophiluds on the rat colonic epithelium. After generation of the model axenic rat and inoculated with S. thermophilus we have investigated the interplay between bacteria and host colon. Colonic epithelium gene expression was investigated also, with two different approaches: Suppressive Subtractive Hybridization. The subtraction library was prepared subtracting mRNA between epithelial cells from colonic mono-associated rats and germ-free rats. The transcripts generated by SSH were grouped into divers Functional groups: cell-cycle arrest and induction of differentiation; cell-communication and binding. Tow candidates genes were privileged, krupel like factor 4 and 14-3-3σ. These candidate genes were tested by RT-PCR, qRT-PCR and Western blot in mono-associated animals and in germ-free animals. The tests confirmed that candidate genes increase their expression in the presence of S. thermophilus. Microarray analysis. Gene expression was measured in tow groups of animals: i) germ-free rats; ii) mono-associated rats inoculated with LMD9 strain of Streptococcus thermophilus. The results of microarray analysis data show that Streptococcus thermophilus remarkably affected gene expression in the colonic epithelial cells. Streptococcus thermophilus enhanced the expression of genes involved in different pathways in the host, compared to the gem free group.

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Burrus, Vincent. "Identification d'éléments intégratifs et potentiellement conjugués chez Streptococcies thermophilus : évolution par échange-acquisition de modules et de domaines." Nancy 1, 2001. http://www.theses.fr/2001NAN10027.

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Abstract:

Un élément de 34,7 kb, ICESt1, est intégré dans l'extrémité 3' de l'ORF fda chez la bactérie lactique Streptococcus thermophilus CNRZ368. Cet élément s'excise par recombinaison site-spécifique. En outre, il code un système de conjugaison putatif apparenté à celui de Tn916, un transposon conjugatif (CTn) d'Enterococcus faecalis. ICESt1 serait donc un élément intégratif et conjugatif (ICE). Le séquençage partiel de quatre éléments intégrés au même site qu'ICESt1 dans d'autres souches de S. Thermophilus a révélé l'existence d'un ICE potentiel, ICESt3, et de trois autres éléments dont la structure suggère qu'ils ne seraient ni intégratifs ni conjugatifs (IE). [. . . ]

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BOUNAIX, STEPHANE. "Taxinomie biochimique, physiologique et moleculaire d'une collection de souches de streptococcus thermophilus et de streptococcus salivarius." Caen, 1992. http://www.theses.fr/1992CAEN2019.

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Abstract:

L'etude d'une collection de 27 souches de streptococcus thermophilus et de 11 souches de streptococcus salivarius avait deux objectifs: d'une part, determiner les differences existant entre un ensemble de 20 souches proches de la souche-type (groupe a) ayant un profil fermentaire de 3 a 5 caracteres positifs et un groupe de 8 souches atypiques de streptococcus thermophilus (groupe b) ayant un profil fermentaire de plus de 17 caracteres positifs, d'autre part rechercher des differences significatives entre les deux sous-especes ou especes. De l'etude d'hybridation quantitative adn-adn en milieu liquide, il ressort que 7 souches atypiques sont etroitement liees a la souche-type. Les profils des proteines solubles totales confirment cette proximite. Par analyse discriminante, la spectrometrie infrarouge par transformee de fourier montre que les souches du groupe b appartiennent au meme ensemble que celles du groupe a. Elles se distinguent de la souche-type par un taux de croissance eleve a 45c, l'absence d'activite ureasique et des profils electrophoretiques plus complexes en champ pulse. Aucun rapprochement n'est possible entre les souches atypiques et les souches de streptococcus salivarius. Par hybridation quantitative adn-adn en milieu liquide et spectrometrie infrarouge par transformee de fourier, il s'avere que les deux especes streptococcus thermophilus et streptococcus salivarius sont distinctes. Les autres techniques utilisees (profil biochimique api50, activite ureasique, taux de croissance en fonction de la temperature, profil electrophoretique de l'adn en champ pulse et profil des proteines solubles totales) mettent en evidence l'heterogeneite du groupe de souches de streptococcus salivarius

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Maazouzi, Nadia. "Étude du métabolisme du saccharose et production de polyosides chez streptococcus salivarius subsp thermophilus." Nancy 1, 1991. http://www.theses.fr/1991NAN10206.

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Abstract:

Une souche de streptococcus salivarius subsp. Thermophilus a été sélectionnée, après modification du milieu m17 et optimisation des conditions de culture, pour son aptitude à métaboliser le saccharose avec un rendement élevé en polyosides. Le saccharose pénètre dans la cellule par l'intermédiaire d'une permease atp dépendante puis il est hydrolysé par une invertase intracellulaire, de mm=180000 da. Le glucose libéré est incorporé rapidement dans la glycolyse tandis que le fructose est excrété avant d'être réutilise grâce à une perméase atp dépendante lorsque la concentration du saccharose résiduel n'est plus inhibitrice. Des enzymes de type isomérases, mutases ou pyrophosphorylases permettent à la bactérie, en déviant le flux carbone, de synthétiser à partir de différents oses, des polymères osidiques qui ont été isolés suivant leur charge et leur masse moléculaire. Quelle que soit la source carbonée, les polyosides contiennent tous globalement, en proportion variable selon la charge nette, du glucose, du galactose, du mannose, des acides uroniques et des traces d'hexosamines. Ils sont localisés majoritairement autour de la paroi sous forme de capsule, le stockage des polyosides sous forme de réserve intracellulaire étant très minoritaire. La source carbonée influe sur la proportion respective des oses au sein des polymères mais pas sur leur nature. L'ensemble des résultats suggère que la perméation des oses met en œuvre des mécanismes plus ou moins spécifiques tandis que leur incorporation au sein des polymères passe par des voies de synthèse communes

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Letort, Catherine. "Relation entre croissance et nutrition azotée de deux bactéries lactiques thermophiles : streptococcus thermophilus et lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus." Poitiers, 2001. http://www.theses.fr/2001POIT2326.

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Petit, Chantal. "Régulation de la biosynthèse de métabolites d'intérêt industriel par les bactéries lactiques : 1. production de didactyle chez lactococcus lactis subsp. diacetylactis : 2. production de polyosides chez streptococcus thermophilus." Nancy 1, 1991. http://www.theses.fr/1991NAN10308.

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Abstract:

Lactococcus lactis diacetylactis et streptococcus thermophilus sont employés en industrie laitière pour leur capacité à produire des substances aromatiques et polyosidiques respectivement. Après croissance cellulaire, lactococcus lactis diacetylactis produit à partir du co-métabolisme du pyruvate un excès de pyruvate, précurseur de la synthèse de diacetyle et d'acetoine. Les conditions physiologiques ont été optimisées pour une production maximale de diacetyle. Le phénomène de réduction du diacetyle en acetoine peut être largement minimisé par une étape de jeune cellulaire ou par refroidissement des cellules des l'épuisement du milieu en critère. Le devenir du lactose pour trois souches industrielles de streptococcus thermophilus a été suivi. Ces souches, sélectionnées sur leur capacité à produire des polyosides disposent d'un comportement variable vis-à-vis du galactose. Les activités enzymatiques détectées permettent, en déviant le flux carbone issu de la glycolyse de synthétiser des polymères osidiques dont la composition primaire a été déterminée; ils contiennent tous, en proportion variable selon les souches, du glucose, du galactose, du mannose et des acides uroniques. L'analyse génétique révèle de plus la présence de plasmides dans 2 des 3 souches testées. Leur taille varie de 2,9 kb a 10,6 kb. Ces plasmides restent cryptiques cependant qu'un produit transcriptionnel correspondant à l'un d'entre eux a été détecté

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Kebouchi, Mounira. "Caractérisation des propriétés d'adhésion de Streptococcus thermophilus LMD-9 aux cellules épithéliales intestinales : 1. Rôle des protéines de surface dans la résistance aux sels biliaires et dans l’adhésion, 2. Impact de l’adhésion sur l’expression des gènes eucaryotes et bactériens." Thesis, Université de Lorraine, 2017. http://www.theses.fr/2017LORR0209.

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Abstract:

Les bactéries lactiques présentent un grand intérêt économique de par leur large utilisation dans l’industrie agroalimentaire. Parmi elles, Streptococcus thermophilus (ST) est d’une importance majeure puisqu’elle est la plus utilisée après Lactococcus lactis, pour la fabrication de produits laitiers fermentés et de fromages. De plus, cette bactérie est le seul streptocoque à bénéficier du statut GRAS (Generally Recognized As Safe). Outre son intérêt en industrie laitière, ST présente des effets bénéfiques sur la santé intestinale de l’Homme. Bien que ces effets soient largement documentés, le statut probiotique de ST reste encore à conforter. C’est pourquoi des études sont actuellement menées afin de sélectionner des souches de ST à fort potentiel probiotique. Parmi les critères importants figurent leur capacité à survivre aux conditions drastiques du tube digestif (TD) et leur capacité à adhérer aux cellules intestinales. Dans cette optique, les objectifs de cette thèse étaient d’étudier, dans un premier temps, la capacité d’adhésion in vitro de la souche ST LMD-9 à différentes lignées cellulaires intestinales d’origine humaine et d’évaluer la survie de cette souche au stress biliaire. Afin de mettre en évidence un rôle potentiel de certaines protéines de surface dans ces deux processus, trois mutants issus de cette souche et inactivés dans les gènes prtS (protéase pariétale), srtA (sortase A) et mucBP (protéine de liaison aux mucines), ont été inclus dans cette étude. Dans un second temps, l’impact de l’adhésion de LMD-9 a été analysé, d’une part sur l’expression de gènes codant certaines mucines dans les cellules eucaryotes, et d’autre part sur l’expression de gènes qui seraient spécifiquement induits durant le processus d’adhésion, ceci en utilisant la technologie R-IVET (Recombinase-based In Vivo Expression Technology). Les résultats obtenus ont permis de montrer que la souche LMD-9 était capable de survivre jusqu’à une concentration de 3 mM en sels biliaires et que les protéines de surface PrtS, SrtA et MucBP seraient impliquées dans la résistance à ce stress. Nos résultats ont également montré que LMD-9 adhérait aux trois différentes lignées cellulaires, suggérant ainsi que la souche pourrait interagir avec les différentes mucines qu’elle peut rencontrer dans le TD. De plus, l’implication de certaines protéines de surface dans l’adhésion de LMD-9 s’est avérée dépendante des caractéristiques de ces lignées, qu’il s’agisse de cellules entérocytaires (Caco-2) ou productrices de mucus (HT29-MTX et HT29-CL.16E). Concernant l’impact de l’adhésion de la souche LMD-9 sur l’expression des gènes MUC2 et MUC5AC, aucun effet sur le taux de transcrits n’a été observé dans nos conditions expérimentales. Par ailleurs, nos résultats ont permis, pour la première fois, d’identifier les gènes spécifiquement induits dans la souche LMD-9 durant l’adhésion aux cellules épithéliales. Nous avons ainsi montré que l’adhésion de la souche LMD-9 ne dépend pas uniquement des protéines de surface, mais d’autres fonctions et voies métaboliques seraient également impliquées. Ce travail de thèse contribue ainsi à apporter de nouvelles connaissances liées (i) au choix du modèle cellulaire dans les études d’adhésion bactérienne in vitro, (ii) à l’aptitude de la souche LMD-9 à survivre au stress biliaire en faisant intervenir certaines protéines de surface et (iii) à la compréhension des mécanismes moléculaires de l’adhésion de LMD-9 aux cellules épithéliales intestinales
Lactic acid bacteria are of great economic interest because of their use in the food industry. Among them, Streptococcus thermophilus (ST) is of major interest since it is the most used after Lactococcus lactis, for the manufacture of fermented dairy products and cheese. In addition, this bacterium is the only streptococcus to benefit from GRAS status (Generally Recognized As Safe). Beside its interest in the dairy industry, ST has beneficial effects on human intestinal health. Although these effects are widely documented, the probiotic status of ST remains to be consolidated. Therefore, studies are currently being conducted in order to select strains of ST with a high probiotic potential. Among criteria that are important to select ST strains include their ability to survive stress the drastic conditions of the digestive tract (DT) and their ability to adhere to intestinal cells. In this context, the aim of this thesis was to investigate firstly the in vitro adhesion capacity of the ST LMD-9 strain to different human intestinal cell lines and to evaluate the survival of this strain to bile salt stress. In order to highlight the potential role of some surface proteins in these two processes, three mutants derived from this strain and inactivated in the genes prtS (parietal protease), srtA (sortase A) and mucBP (Mucin Binding-protein) were also included in this study. Secondly, the impact of LMD-9 adhesion was analyzed, on one hand on the expression of some mucin-encoding genes in eukaryotic cells, and on the other hand on the expression of genes that would be specifically induced during adhesion process using the R-IVET (Recombinase-based In Vivo Expression Technology) approach. The results obtained demonstrated the ability of LMD-9 to survive up to the concentration of 3 mM of bile salts and that the PrtS, SrtA and MucBP surface proteins would be involved in the resistance to this stress. Our results also showed that the LMD-9 strain was capable of adhering to three cell lines used suggesting that this strain could interact with different mucins that may encounter in the DT. Moreover, the involvement of some surface proteins in the adhesion of LMD-9 has been found to be dependent on the surface characteristics of these cell lines, whether they are enterocytic (Caco-2) or mucus-secreting cells (HT29-MTX and HT29-CL.16E). Regarding the impact of LMD-9 adhesion on MUC2 and MUC5AC gene expression, no effect has been observed on the transcript level under our experimental conditions. Furthermore, for the first time, our results allowed us to identify genes specifically induced in the LMD-9 strain during adhesion process to epithelial cells. We have thus shown that the LMD-9 adhesion does not depend solely on surface proteins, but other functions and metabolic pathways are also involved. This thesis work contributes thus to new knowledge related to (i) the choice of the cellular model in in vitro bacterial adhesion studies, (ii) the ability of LMD-9 to survive bile salt stress by involving some surface proteins and (iii) understanding the molecular mechanisms of LMD-9 adhesion to epithelial cells

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Desiere, Frank. "Ecology and evolution of Streptococcus thermophilus bacteriophages in industrial milk fermentations /." [S.l.] : [s.n.], 1999. http://e-collection.ethbib.ethz.ch/show?type=diss&nr=13332.

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Dupuis, Marie-Ève. "Caractérisation du mode d'action du système CRISPR1/Cas de Streptococcus thermophilus." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/28652/28652.pdf.

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Rul, Françoise. "Contribution a l'etude du systeme peptidasique de streptococcus thermophilus cnrz 302." Caen, 1994. http://www.theses.fr/1994CAEN2022.

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Abstract:

Streptococcus thermophilus est une bacterie lactique qui ne possede pas de protease de paroi et dont le systeme peptidasique a ete peu caracterise jusqu'a present. Notre travail a donc consiste a dresser un inventaire des peptidases presentes chez une souche de s. Thermophilus. Apres chromatographie d'echanges d'ions d'un extrait intracellulaire de la souche cnrz 302, nous avons mis en evidence la presence d'au moins 10 peptidases. Par la suite, deux aminopeptidases de cette souche, apii et apiii, ont ete purifiees. Il s'agit de deux metalloenzymes presentant une activite optimale a ph 7 et 8,5 a 36 et 60c, respectivement. Apii est une enzyme monomerique de masse moleculaire 97 kda alors qu'apiii est multimerique (360 kda). Apii est une aminopeptidase de large specificite alors qu'apiii est une glutamyl aminopeptidase specifique des acides amines acides. Elles presentent des homologies avec les aminopeptidases pepn (apii) et pepa (apiii) des lactocoques. Le gene codant pour une aminopeptidase generale de s. Thermophilus cnrz 302 a ensuite ete clone dans e. Coli. Cette aminopeptidase, surexprimee chez e. Coli, semble identique a l'aminopeptidase pepc des lactocoques. Nos resultats montrent que le systeme peptidasique de s. Thermophilus est tres analogue a celui des lactocoques

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Altay, Dede Neslihan. "Characterization Of Lactobacillus Delbrueckii Subspecies Bulgaricus And Streptococcus Thermophilus As Lactic Cultures Isolated From Traditional Turkish Yogurts And Subtyping Of Streptococcus Thermophilus Using Crispr Analysis And Mlst." Phd thesis, METU, 2010. http://etd.lib.metu.edu.tr/upload/3/12612009/index.pdf.

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Abstract:

Yogurt is a characteristic fermented dairy product of Turkey and Bulgaria and its popularity has been increasing all over the world. Streptococcus thermophilus and Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus (Lactobacillus bulgaricus) are used together as starter culture in production of yogurt. The objective of this study was to isolate and characterize yogurt cultures from traditionally produced yogurts (i.e. produced without using commercial starter cultures) and to search the genotypic diversity within traditional S. thermophilus isolates. Yogurt cultures were isolated from traditionally produced yogurts collected from different regions of Turkey and identified biochemically. Acidification ability of the isolates was examined and the cultures giving best acidifying rates were further subjected to a selection in terms of their acetaldehyde production ability. Then, phage resistance and proteolytic activity of chosen isolates were tested. Finally, twenty-five L. bulgaricus and twenty-two S. thermophilus isolates were selected as cultures having best technological properties. Furthermore, subtyping studies were carried out to indicate strain diversity among isolates. S. thermophilus was selected as target organism for subtyping in this study. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) loci are highly polymorphic genetic regions, which are composed of partially palindromic direct repeats interspaced by sequences called spacers. In order to characterize S. thermophilus isolates genotypically, CRISPR1 locus of the isolates were analyzed. Additionally, nineteen isolates selected after CRISPR1 analysis were characterized using multilocus sequence typing (MLST). This provided to compare CRISPR1 analysis with MLST as a typing method. According to CRISPR1 analysis S. thermophilus isolates were grouped into 6 main clusters with a total of 15 sub-clusters. MLST results demonstrated an evolutionary relationship among these strains compatible with that derived from the CRISPR1 analysis.

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Thevenard, Benoît. "Implication des systèmes à deux composants dans les réponses de Streptococcus thermophilus à des changements environnementaux, dont la coculture avec Lactobacillus bulgaricus." Phd thesis, AgroParisTech, 2011. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00734426.

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Abstract:

S. thermophilus est une bactérie lactique largement utilisé dans l'industrie laitière et, comme toute bactérie, doit s'adapter à des environnements variés tels que le lait, le yaourt et même le tractus digestif, après que le produit ait été ingéré. Les systèmes à deux composants (TCS) constituent un des mécanismes essentiels qu'utilisent les bactéries pour percevoir et s'adapter à des changements environnementaux. D'un point de vue structural, les TCS sont constitués de deux composants: un " senseur " ou protéine histidine kinase (HK) qui s'auto-phosphoryle en réponse à un stimulus puis transfère son groupement phosphate au " response regulator " (RR), le deuxième composant. Celui-ci se comporte alors le plus souvent comme un régulateur transcriptionnel permettant une réponse physiologique adaptée. Afin de mieux comprendre ces phénomènes de régulation impliqués dans la réponse aux changements environnementaux, nous avons étudié la contribution de chacun des 8 TCS de Streptococcus thermophilus LMD-9 à son adaptation dans le lait. Ainsi, des études transcriptionnelles effectuées sur des cultures en lait montrent que tous les RR sont exprimés, à des niveaux et profils d'expression différents. Nous avons noté en coculture avec Lactobacillus bulgaricus, le partenaire de Streptococcus thermophilus dans le yaourt, une induction de l'expression de 4 RR qui atteint, pour rr02 et rr09, un facteur 6. Nous avons construit par ailleurs des mutants négatifs pour 7 des 8 RR de S. thermophilus et montré l'essentialité de RR05, un orthologue de YycF chez B. subtilis ou de or de WalR chez S. aureus. Pour les 7 autres mutants RR, l'absence d'un seul gène rr n'impacte pas suffisamment la croissance du streptocoque en lait. Enfin, la détermination du régulon du TCS06 par des études post-génomiques a permis de montrer que ce système est impliqué dans la résistance à la bacitracine en modulant entre autres la voie de biosynthèse du polysaccharide à rhamnose (RGP).

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Galia, Wessam. "Caractérisation de la variabilité du système protéolytique de surface de la bactérie lactique Streptococcus thermophilus." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2011. http://www.theses.fr/2011INPL053N/document.

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Abstract:

La variabilité du système protéolytique de surface a été étudiée chez 30 souches de St. thermophilus. Cette variabilité consiste en la présence ou l’absence du gène prtS, en la présence de deux allèles différents de ce gène, en la présence d'une protéase PrtS ancrée et/ou soluble et enfin en l'expression variable, due à une variabilité de la régulation du système protéolytique, du gène prtS et d'autres gènes qui interviennent, pour la plupart, dans le métabolisme azoté. L’expression des gènes prtS, pepX, pepC, pepN, amiA1CDEF, dtpT, livJHMGF, ilvC, ilvDBN, bcaT, ackA, ldh, codY et relA a été quantifiée chez les souches PB302 et PB18O en lait et en milieu M17. La souche PB302 est représentative des souches qui se développent rapidement en lait alors que la souche PB18O l’est de celles qui ont une croissance intermédiaire dans ce milieu. Alors que l’expression des gènes étudiés est peu différente en milieu M17 où les deux souches ont une croissance similaire, cette expression diverge lorsque les deux souches sont cultivées en lait.Globalement, la différence de croissance observée en lait entre les deux souches pourrait résulter d'une variabilité de la capacité protéolytique et de l’expression, entre autres, des gènes codant PrtS, le régulateur CodY, les transporteurs des oligopeptides (Ami), des di-tripeptides (DtpT) et des acides aminés ramifiés (LivJ) et de ceux codant des enzymes impliquées dans la voie de biosynthèse des acides aminés ramifiés (IlvC, IlvB et BcaT), ces derniers étant nécessaires pour la croissance en lait. Tous ces gènes possèdent en amont de leur promoteur une boîte CodY potentielle et pourraient donc appartenir au régulon CodY
The variability of the cell envelope-associated proteolytic system was studied in 30 strains of St. thermophilus. Variations in strains consist in the presence or absence of the gene prtS, the presence of two allelic forms of prtS, the presence of an anchored and/or soluble form of the protease PrtS and in the variable expression of the gene prtS and other genes involved mainly in nitrogen metabolism, thus in the variability of the regulation genetic of this system. Expression of the genes prtS, pepX, pepC, pepN, amiA1CDEF, dtpT, livJHMGF, ilvC, ilvDBN, bcaT, ackA, ldh, codY and relA was quantified in the PB302 and PB18O strains. The strain PB302 is representative of strains which exhibit a rapid growth in milk. The strain PB18O is representative those with intermediate growth in milk. In M17 medium, where both strains have similar growth, little difference in the expression of genes tested was observed. Conversely, the two strains did not express the selected genes in the same way when grown in milk. Overall, the difference in growth observed between strains in milk could result from variable proteolytic activities and variable expression of genes encoding, for example, the proteinase PrtS, the regulator CodY, transporters of oligo- or di-tri- peptides (Ami or DtpT) or branched chain amino acids, or BCAA (LivJ) and enzymes in the biosynthetic pathway of BCAA (IlvC, IlvB et BcaT) which are necessary for growth in milk. All these genes have a potential CodY box at the upstream of their promoter and could therefore belong to the regulon CodY

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Uriot, Ophelie. "Etude de la survie et identification des fonctions exprimées par la bactérie lactique Streptococcus thermophilus dans le tractus digestif." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2016. http://www.theses.fr/2016CLF1PP06/document.

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Abstract:

Streptococcus thermophilus est la bactérie lactique la plus utilisée après Lactococcus lactis dans l’industrie laitière pour la fabrication de yaourts et de fromages. Il s’agit du seul streptocoque à avoir le statut de bactérie GRAS (Generally Recognized As Safe). Malgré de récentes études montrant sa capacité à survivre dans le tractus digestif humain et des effets santé intéressants, le statut probiotique de S. thermophilus reste l’objet d’interrogations. Ainsi, les objectifs de cette thèse ont été (i) d’approfondir les connaissances sur la capacité de survie de S. thermophilus en conditions digestives humaines simulées, grâce, en particulier, au système dynamique multi-compartimenté TIM (TNO gastro-intestinal model) et (ii) d’identifier des gènes de S. thermophilus spécifiquement activés dans des conditions complexes comme l’environnement digestif, à l’aide de la technologie R-IVET (Recombinase-based In Vivo Expression Technology) basée sur l’excision d’un gène rapporteur. Le système R-IVET est composé d’un vecteur plasmidique portant la recombinase cre démunie de son promoteur et d’une cassette chromosomique composée d’un gène marqueur entouré de sites loxP reconnus par Cre. Ainsi, dans un premier temps, nous avons implanté la technologie R-IVET chez S. thermophilus LMD-9. Sa fonctionnalité a été testée et validée in vitro et dans le tractus digestif de la souris. Puis, l’étude de la survie de quatre souches de S. thermophilus dans le système TIM a montré que trois d’entre elles étaient plus résistantes que la quatrième, très sensible aux stress gastro-intestinaux. Ces résultats confirment donc que la survie de S. thermophilus dans l’environnement digestif est souche-dépendante. Ils montrent également que la survie de S. thermophilus est influencée par la matrice alimentaire, celle-ci étant plus importante en lait fermenté qu’en lait liquide. Enfin, dans un troisième temps, nous avons construit une première banque génomique R-IVET, en clonant en amont de cre des fragments d’ADN génomiques provenant de LMD-9. Cette banque a été testée uniquement en conditions gastriques simulées dans le TIM. Puis, après avoir optimisé notre outil chez S. thermophilus en améliorant la méthode d’identification des gènes activés, une seconde banque R-IVET a été testée dans l’ensemble du tractus gastro-intestinal (TIM) et en système batch en présence du microbiote intestinal. Ces expériences nous ont permis de mettre en évidence, pour la première fois, des gènes de S. thermophilus spécifiquement activés dans les différents compartiments digestifs de l’homme. Ce travail de thèse contribue ainsi à approfondir les connaissances sur le comportement de cette bactérie dans le tractus gastro-intestinal humain. A moyen terme, ces travaux devraient permettre d’identifier des marqueurs de survie de S. thermophilus et de mieux comprendre son activité métabolique dans l’environnement digestif, facilitant la sélection de souches dans la perspective de développement d’aliments fonctionnels
Streptococcus thermophilus is the lactic acid bacterium most commonly used after Lactococcus lactis in the dairy industry for the production of yogurt and cheese. It is the only streptococcus strain to have the GRAS status (Generally Recognized As Safe). Despite recent studies showing its ability to survive through the human digestive tract and valuable health effects, the probiotic status of S. thermophilus remains questioned. Thus, the objectives of this pHD work were (i) to increase knowledge on the survival of S. thermophilus in human digestive environment, by using the dynamic multi-compartmental TIM system (TNO gastro-intestinal model) and (ii) to identify the genes from S. thermophilus that are specifically activated in complex digestive environment using the R-IVET technology (Recombinase-based In Vivo Expression Technology). R-IVET is based on the excision of a reporter gene and consists of a plasmid vector carrying the promoterless recombinase cre and a chromosomal cassette composed of a marker gene flanked by loxP recognized by Cre. First, we introduced the R-IVET technology in S. thermophilus LMD-9. Its functionality was tested and validated in vitro and in the mice digestive tract. Then, the survival of four S. thermophilus strains was investigated in the TIM system and we showed that 3 of these strains were more resistant than the other one, very sensitive to gastrointestinal stresses. These results strengthen the idea that the survival of S. thermophilus is strain-dependent. We also highlighted that the survival of S. thermophilus was influenced by the food matrix, being higher in fermented compared to liquid milk. Lastly, we constructed a first genomic R-IVET library, by cloning upstream of cre genomic DNA fragments from LMD-9. This library was tested only in gastric condition (TIM). After optimization of our tool in S. thermophilus (improvement of the method allowing identification of the activated genes), a second R-IVET library was tested throughout the gastrointestinal system (TIM) and in batch system including intestinal microbiota. By identifying bacterial genes specifically activated in human digestive conditions, this work contributes to extend our knowledge on the behavior of S. thermophilus in the human gastrointestinal tract. This could open up opportunities in determining survival markers for S. thermophilus and better describing its metabolic activity in the human gut, then facilitating the selection of strains that can be included in functional foods

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Carraro, Nicolas. "Analyse comparative de la dynamique de deux éléments intégratifs conjugatifs de streptococcus thermophilus." Thesis, Nancy 1, 2011. http://www.theses.fr/2011NAN10080/document.

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Abstract:

Les éléments intégratifs conjugatifs (ICE) sont des îlots génomiques qui codent leur excision du chromosome, leur transfert par conjugaison et leur intégration. Ils présentent une organisation modulaire, chaque module incluant tous les gènes nécessaires pour conférer une fonction biologique. Ce travail a porté sur l'étude de la régulation ainsi que les modalités de transfert et de maintien d'ICESt1 et ICESt3, deux ICE de Streptococcus thermophilus présentant une région core étroitement apparentée et une région variable non apparentée. Les résultats obtenus ont montré que, bien qu'ICESt3 s'excise et se transfère à beaucoup plus haute fréquence qu'ICESt1, l'excision des deux éléments est activée par des stimuli identiques et est dépendante de la souche hôte. Chacun de ces ICE code des homologues de deux types de régulateurs différents, cI et ImmR, ce qui implique un mécanisme de régulation complexe et original qui pourrait être conservée chez de nombreux ICE apparentés identifiés lors de ce travail. Selon la définition initiale, les ICE se maintiendraient uniquement sous forme intégrée et ne se répliqueraient pas de façon intracellulaire. Cependant, les dommages à l'ADN induisent non seulement l'excision et le transfert d'ICESt3, mais aussi sa présence en copies multiples extrachromosomiques. Les résultats obtenus impliquent une réplication sous forme extrachromosomique, réplication codée par la région core et qui serait impliquée dans le maintien de l'élément. Une telle réplication pourrait être impliquée dans le maintien de nombreux ICE en plus de leur intégration
Integrative and Conjugative Elements (ICEs) are genomic islands, which excise from the chromosome, self-transfer by conjugation and integrate. They harbor a modular organization: genes and sequences involved in the same biological process are grouped in the same region. This work concerns the modality of transfer and maintenance of ICESt1 and ICESt3, two ICEs of Streptococcus thermophilus that share closely related core region. ICESt1 excises much less frequently than ICESt3. Nevertheless, excision of the two elements is activated by the same stimuli (DNA damage, stationary phase and/or cell density) and depends of the host strain. Bioinformatical and transcriptional analyses highlight several differences in their organization. However, each of these two ICEs would encode two different regulators, cI and ImmR, suggesting that a complex and original pathway govern to ICESt1' and ICESt3' regulation. This regulation would be shared with numerous ICEs that we identified in the genome of various commensal or pathogenic streptococci. According to the original definition, ICE's maintenance would be exclusively due to their integration in the host chromosome, and ICEs would not be able of extracellular replication. However, in addition to the induction of ICESt3' excision and transfer, DNA damage cause replication of its extrachromosomal form. This unexpected property is encoded by the core region and would be implicated in the maintenance of the element. Comparision with data recently published on other ICEs suggest that intracellular replication could be involved in the maintenance of numerous ICEs, besides their integration

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Telles, Francisco Jose Siqueira. "Proteolytic changes in goat's milk during yogurt manufacture." Diss., The University of Arizona, 1987. http://hdl.handle.net/10150/184282.

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Abstract:

The biochemical activity of Streptococcus thermophilus and Lactobacillus bulgaricus in a 1:1 ratio (Chr. Hansen's Lab - CH-III) were studied at 43 C in goat and cow milk during the manufacture and storage of yogurt. Determination of pH, titratable acidity, lactose content, proteolytic activity, and enumeration of the starters were performed on samples taken at hourly intervals until the yogurt became set, and after 8, 16, 24 hours, 11 and 22 days of storage at 4 C. In goat milk the number of starter culture organisms showed higher values than those in cow milk. Fermentation was considered to be finished when the pH decreased to 4.7 and 0.7% of lactic acid was produced. Those values were reached after 3 and 4 hours for goat and cow milk respectively. The values for pH in both milks were stable at 4.7 during storage at 4 C. Goat milk and goat milk yogurt had higher levels of free amino acids (12.65 mg/dl and 24.39 mg/dl respectively) than cow milk (10.31 mg/dl) or cow milk yogurt (20.20 mg/dl). During storage at 4 C free amino acids in goat milk decreased by 20%, in cow milk they increased by 70% from values found in fresh yogurt. The proteinase activity in goat milk during elaboration of yogurt was from 2 to 3 hours after incubation, was then stable until 24 hours of storage at 4 C and then decreased. No change in the proteinase activity in cow milk yogurt was seen until 4 hours of incubation for experiments 1 and 2 and 3 hours in experiment 3. During the storage at 4 C, proteinase activity in cow milk yogurt was stable. Polyacrylamide gel electrophoresis of caseins failed to reveal marked changes during the manufacture of yogurt and storage after 22 days at 4 C. However, a scanning gel densitometer showed that the area corresponding to alpha-casein decreased by 22% and for beta-casein 13.32% during the elaboration of goat milk yogurt. After 22 days of storage at 4 C, the alpha-casein fraction decreased an additional 14%, but no change was observed in beta-casein. The area corresponding to alpha- and beta-caseins decreased by 7.16 and 14.48% respectively during yogurt manufacture and an additional 6.74 and 8% during storage of cow milk yogurt. The overall results found in this study suggest that the metabolic activity of S. thermophilus and L. bulgaricus is greater in goat milk than in cow milk during elaboration and storage of yogurt.

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Girard, Florence. "Caracterisation biochimique, serologique et genetique d'une collection de souches de streptocoques thermophiles : mise au point d'une methode rapide d'hybridation adn-adn." Caen, 1987. http://www.theses.fr/1987CAEN2037.

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Chaves, Ana Carolina Sampaio Doria. "Engenharia metabolica de Streptococcus thermophilus para produção de acetaldeido em leites fermentados." [s.n.], 2002. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/256713.

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Abstract:

Orientador : Alda Luiza Santos Lerayer
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
Made available in DSpace on 2018-08-01T22:30:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Chaves_AnaCarolinaSampaioDoria_D.pdf: 30225787 bytes, checksum: 23269875fe498ebad72acea3cde56c4b (MD5) Previous issue date: 2002
Resumo: o processo de formação de acetaldeído pela bactéria láctica Streptococcus thermophilusfoi investigadonestatese.O cetaldeídoresponsávelpelo sabore aroma característicosde iogurte,é produzidopor diferentesvias metabólicaspelas diversas bactérias lácticas. Neste trabalho, a atenção foi focada especificamente na reação para a formação de acetaldeído, catalisada pela enzima serina hidroximetil transferase (SHMT), codificada pelo gene glyA. A enzima SHMT cataliza diversas reações e no caso da bactéria S. thermophilus, ela exerce também a atividade característica da enzima treonina aldolase (TA), definida como a interconversão do aminoácido treonina em glicina e acetaldeído. Neste estudo, 34 linhagens selvagens de S. thermophilus da coleção do NIZO Food Research foram avaliadas quanto à produção de acetaldeído na presença e na ausência do aminoácido L-treonina. A suplementação do meio com L-treonina levou ao aumento da produção de acetaldeído. Foi detectada uma clara diferença na quantidade de acetaldeído formado pelas diversas linhagens; enquanto algumas produziram pouco ou não produziram quantidades detectáveis, outras formaram quantidades consideráveis de acetaldeído. A capacidade de produção de acetaldeído durante a fermentação foi correlacionada com a atividade da enzima treonina aldolase. Com o objetivo de se estudar a função da enzima SHMT, foi construída uma linhagem com o gene glyA interrompido. A inativação deste gene resultou em acentuada redução da atividade TA assim como também na perda completa da capacidade de produção de acetaldeído durante a fermentação. Subseqüentemente, foi construída uma linhagem de S. thermophilus na qual o gene glyA foi clonado sob o controle de um forte promotor (PLacA)' Quando esta linhagem foi cultivada em meio M17 e em leite foi observada a super expressão do gene glyA, constatada por meio do aumento da atividade TA, da produção de acetaldeído e ácido fólico. Estes resultados mostraram que, em S. thermophilus, a enzima SHMT apresenta atividade de treonina aldolase, sendo esta a principal via para a formação de acetaldeído nas condições destes experimentos
Abstract: The process of acetaldehyde formation by the yogurt bacterium Streptococcus thermophilus is described here. The typical yogurt flavor is caused by acetaldehyde produced through many difIerent pathways by the yogurt starter bacteria Lactobacillus bulgaricus and S. thermophilus. In this thesis, the attention was focused on one specmc reaction for acetaldehyde formation catalyzed by serine hydroxymethyltransferase(SHMT), encoded by the glyA gene. In S. thermophilus, this enzyme SHMT also plays the typical role of the enzyme threonine aldolase (TA) tOOtis the interconvertion of threonine into glycine and acetaldehyde. In this work, 34 wild type S. thermophilus strains ftom the NIZO Food Research Collection were screened for acetaldehyde production in the presence and absence of L-threonine. Supplementation of the growth medium with L-threonine led to an increase in acetaldehyde production. A clear difIerence in the amount of acetaldehyde formed could be detected among the difIerent strains. While some strains produce very small or no detectable amounts other strains produce a considerable high amount of acetaldehyde. Furthermore, acetaldehyde formation during fermentation could be correlated to threonine aldolase activity of SHMT. To study the physiological role of SHMT, aglyA mutant was constructed by gene disruption. lnactivation of glyA resulted in a severe reduction of TA activity and complete loss of acetaldehyde formation during fermentation. Subsequent1y,aS. thermophilus strain was constructed in which the glyA gene was cloned under control of a strong promoter (PLacA)' When this strain was used for fermentation it was possible to observe tOOtglyA gene was overexpressed through the increase in TA activity, in acetaldehyde and folic acid production. These results show tOOt, in S. thermophilus, SHMT, displaying threonine aldolase activity, constitutes the main pathway for acetaldehyde formation under our experimental conditions. These findings can be used to control and improve acetaldehyde and folic acid production in fermented (dairy) products with S. thermophilus as starter culture
Doutorado
Doutor em Tecnologia de Alimentos

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Lingeswaran, Abarna. "Rôle clé du transporteur PptAB dans le quorum sensing chez Streptococcus thermophilus." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASB013.

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Abstract:

Chez Streptococcus thermophilus, le cycle de vie des signaux peptidiques appelés phéromones contribuant aux mécanismes de communication dit quorum sensing (QS) est divisé en quatre étapes. La synthèse des phéromones est suivie par leur maturation par la protéase Eep et leur sécrétion. Enfin, leur re-internalisation par le transporteur d’oligopeptides Ami est indispensable pour leur détection intracellulaire par les régulateurs transcriptionnels dit Rgg-like contrôlant l’expression des gènes cibles. L’objectif de ma thèse était de valider le rôle du transporteur PptAB dans la sécrétion des phéromones avant d’identifier les gènes dont l’expression est dépendante de ce transporteur chez S. thermophilus.En premier, nous avons confirmé le rôle du transporteur PptAB dans l’activation de trois systèmes de QS impliquant les régulateurs Rgg-like. Pour cela nous avons utilisé des fusions transcriptionnelles entre un gène rapporteur codant la luciférase et le promoteur de trois gènes cibles de ces sytèmes. Nous avons ensuite montré que le transporteur PptAB n’exporte probablement que la forme mature des phéromones par LC-MS/MS. Enfin, nous avons découvert que l’expression d’un ensemble des gènes situé en aval des gènes codant les régulateurs Rgg-like est dépendante du transporteur PptAB mais aussi du transporteur Ami et de la protéase Eep par une approche globale transcriptomique. Ainsi, les transporteurs PptAB et Ami et la protéase Eep contrôlent ces cibles par un même mécanisme.Notre travail a mis en évidence des interférences entre ces systèmes qui devront être élucidées
In Streptococcus thermophilus, the life cycle of signaling peptides called pheromones contributing to communication mechanisms named quorum sensing (QS) is divided into four steps. The synthesis of pheromones is followed by their maturation by the protease Eep and their secretion. At last, their re-internalisation by the oligopeptide transporter Ami is essential for their intracellular detection by transcriptional regulators called Rgg-like controlling the expression of target genes. The aim of my thesis was to valid the role of the transporter PptAB in the secretion of pheromones before identifying genes whose expression is dependent of this transporter in S. thermophilus.First, we confirmed the role of the transporter PptAB in the activation of three QS systems involving Rgg-like regulators. For that we used transcriptional fusions between a reporter gene coding the luciferase and the promoter of three target genes of these systems. We then showed that the transporter PptAB exports more likely only the mature form of pheromones by LC-MS/MS. Finally, we discovered that the expression of a set of genes located downstream of genes coding Rgg-like regulators is dependant of the transporter PptAB and also of the transporter Ami and the protease Eep by a global transcriptomic approach. Thereby, the transporters PptAB and Ami and the protease Eep regulate these targets by a same mechanism.Our work brought light on cross-talks between these systems which need to be deciphered

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Pébay, Mireille. "Instabilité chromosomique chez la bactérie, streptococcus thermophilus cnrz368 : variabilité du phénotype des colonies et du nombre de Loci RRN." Nancy 1, 1993. http://www.theses.fr/1993NAN10021.

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Abstract:

Une instabilité affectant les Loci RRN a été mise en évidence chez streptococcus thermophilus. Leur nombre est variable, non seulement à l'intérieur de l'espèce, mais aussi parmi les clones issus de la souche cnrz368. Celle-ci possède 6 Loci RRN alors que 5% de ses descendants n'en possèdent que 5. Dans tous les cas observés, une délétion s'est produite à l'intérieur du tandem RRND-RRNE, résultant très vraisemblablement de recombinaisons homologues, et conduisant à la formation d'un locus hybride RRND/e et a la perte de la région inter-operonique. Un autre phénomène d'instabilité génétique chez streptococcus thermophilus est mis en évidence par la variabilité morphologique des colonies. Toutes les lignées obtenues à partir de la souche cnrz368 sont instables. Les mutations portées par trois de ces variants ont été étudiées. La souche nst1404, de phénotype diffus, porte une mutation ponctuelle à l'extrémité 3 d'un des gènes d'arnr23s. Une délétion d'environ de 1,5 kb a été mise en évidence chez la souche nst1401 de phénotype opaque. La souche nst1403 de phénotype auréolé, porte une duplication de 167pb dans la région 3 du gène gor. Ce gène code pour la glutathion réductase, enzyme impliquée dans la réponse au stress oxydatif. L'ORF n'est pas modifiée mais la duplication est transcrite. La régulation de l'expression du gène est modifiée dans la souche mutante. La diversité des mutations portées par les clones variants suggère que l'instabilité génétique chez s. Thermophilus résulte d'une faible efficacité des systèmes de conservation du matériel génétique

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Cebeci, Aydin Aysun. "Molecular Identification And Typing Of Lactobacillus Delbrueckii Subspecies Bulgaricus And Streptococcus Thermophilus." Phd thesis, METU, 2008. http://etd.lib.metu.edu.tr/upload/3/12609333/index.pdf.

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Abstract:

Lactic acid bacteria are associated with preservation of foods, including milk, meat and vegetables. Yoghurt is produced by the cooperative action of two starter bacteria
S. thermophilus and L. delbrueckii subsp. bulgaricus. In this study, identification and typing of yoghurt starter bacteria were aimed. Traditional home made yoghurts were collected from different areas of Turkey, identification of those isolates at species and subspecies level and typing at strain level were achieved using PCR based methods. In our study, identification of yogurt starter bacteria was studied using species specific primers and ARDRA. These methods were inefficient in identification of yoghurt starter bacteria, at species and subspecies level. Consequently, a reliable and quick method for accurate identification of yoghurt starter bacteria was developed. The new method focuses on amplification of methionine biosynthesis genes, for selective identification of yoghurt starter bacteria together with some cheese starters. Further discrimination by ARDRA enabled differentiation of yoghurt starter bacteria from cheese starters. Confirmation of the proposed method has been accomplished by partial sequencing of the 16S rRNA gene. After correct identification of starter bacteria had been achieved, the strains were typed at strain level using RAPD-PCR and MLST. RAPD-PCR with primer 1254 resulted better fingerprints, compared to primer M13 at strain level. Comparisons of the two typing methods showed that RAPD-PCR revealed strain diversity better than MLST, however MLST was a more robust and reliable method and resulted in clustering of the strains depending on the isolation source.

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Garault, Peggy. "Les fonctions essentielles à la croissance dans le lait de Streptococcus thermophilus." Paris 11, 2001. http://www.theses.fr/2001PA112128.

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Abstract:

Streptococcus thermophilus est une bacterie lactique largement utilisee en fabrication de fromages et de laits fermentes. Au cours des procedes de fabrication, sa croissance rapide et reguliere est requise pour permettre l'acidification et le developpement des proprietes organoleptiques des produits laitiers. Elle n'est cependant pas toujours obtenue et les interactions bacterie-substrat de fermentation restent encore mal maitrisees. Notre objectif a donc ete d'identifier les fonctions essentielles a la croissance optimale de cette bacterie dans le lait. Une mutagenese au hasard dans une souche de s. Thermophilus a croissance rapide dans le lait nous a permis d'obtenir 14 mutants qui ont ete caracterises. Nous avons identifie les fonctions touchees dans 9 d'entre eux. Nous avons montre que les voies de biosynthese des bases puriques et des acides amines a chaine branchee sont fonctionnelles et indispensables a la croissance dans le lait de cette bacterie. Ce resultat suggere que le lait ne contient pas suffisamment de bases et d'acides amines a chaine ramifiee pour permettre la croissance de s. Thermophilus. Le systeme de transport des oligopeptides joue egalement un role essentiel dans la nutrition azotee de s. Thermophilus et donc dans sa croissance optimale. Ce systeme ressemble, par son organisation genetique, a ceux d'autres streptocoques et par sa specificite a celui de lactococcus lactis. C'est un abc transporteur comprenant 3 proteines affines pour les oligopeptides fonctionnant avec le meme systeme permease. Ces 3 proteines sont fortement homologues et ont des specificites chevauchantes. Le systeme parait tres performant puisqu'il est capable de transporter des peptides de 3 a 23 acides amines. Ce travail a permis de mieux comprendre et donc de mieux maitriser les interactions qui existent entre s. Thermophilus et son substrat de fermentation. Mots cles : streptococcus thermophilus, lait, croissance, transport des oligopeptides, mutageneses, biosynthese, acides amines a chaine ramifiee, purine.

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Carvalho, Juliane Doering Gasparin. "Caracterização da microbiota latica isolada de queijo de coalho artesanal produzido no Ceara e suas propriedades tecnologicas." [s.n.], 2007. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/255732.

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Abstract:

Orientador: Arnaldo Yoshiteru Kuaye, Laura Maria Bruno
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
Made available in DSpace on 2018-08-08T22:18:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carvalho_JulianeDoeringGasparin_D.pdf: 1954120 bytes, checksum: 4ba23fd784559801ff2b5568f4ba02c0 (MD5) Previous issue date: 2007
Resumo: O conhecimento da microbiota lática dos queijos de Coalho produzidos de forma artesanal a partir de leite cru, e suas propriedades tecnológicas são fundamentais para preservar as características originais do produto tradicional em queijos de Coalho industrializados, elaborados com leite pasteurizado. Para alcançar este conhecimento, foi realizado um trabalho de pesquisa dividido em três etapas: I) caracterização físico-química de queijos de Coalho artesanais produzidos no Ceará e de sua microbiota lática; II) estudo do comportamento das bactérias ácido láticas (BAL) durante o processamento do queijo; III) caracterização de propriedades tecnológicas das culturas láticas isoladas a partir deles. As análises físico-químicas caracterizaram as amostras avaliadas como sendo queijo de médio conteúdo de umidade (42%), baixa acidez (0,24%), com pH de 6,30; elevada atividade de água (0,959) e teor de NaCl de 2,88%. Dentre as BAL (643) isoladas destas amostras, foram encontrados os gêneros Enterococcus (59,6%), Lactobacillus (22%), Streptococcus (12,8%), Lactococcus (1,7%) e Leuconostoc (0,6%). A identificação de gênero não foi conclusiva para 3,3% de isolados. As espécies prevalecentes foram Enterococcus faecium, Lactobacillus paracasei subsp. paracasei, Streptococcus thermophilus e Lactococcus lactis subsp. lactis. O acompanhamento da evolução da microbiota lática em amostras de leite cru, massa de queijo e do produto final, coletadas em duas unidades produtoras, revelou a presença de Lactococcus no leite e sua ausência no queijo. A presença de Enterococcus aumentou das amostras de matéria-prima para o queijo, indicando a transferência e multiplicação destes microrganismos ao longo do processamento. Estes resultados evidenciaram uma seleção de microrganismos resistentes às temperaturas elevadas no processamento do queijo, durante o cozimento da massa. Quanto às propriedades tecnológicas avaliadas, 15 isolados foram considerados produtores rápidos de ácido, com predominância dos Lactococcus e Streptococcus (40% cada). Os Lactobacillus exibiram maior variabilidade e extensão proteolítica, além de maior produção de aroma. As culturas analisadas mostraram boa tolerância a 3 e 4% de sal. As cepas de Enterococcus faecium apresentaram a maior produção de bacteriocinas ativas contra Listeria spp., com potencial de emprego na produção de queijo de Coalho, como cultura protetora
Abstract: Understanding the lactic microbiota of the artisanal Coalho cheeses produced from raw milk, and its technological properties, is important to preserve the characteristics of the traditional product in the industrialized Coalho cheeses, elaborated with pasteurized milk. In order to achieve such knowledge, a research work was carried out in three stages: I) the physical-chemical characterization of the artisanal Coalho cheeses from Ceara-Brazil and its lactic microbiota, II) the study of the behaviour of the lactic acid bacteria (LAB) along the processing of cheese, III) characterization of technological properties of the lactic cultures isolated from the cheese. The physical-chemical analyses characterized the evaluated cheese samples with medium moisture content (42%), low acidity (0.24%), pH of 6.30, high water activity (0.959) and 2.88% NaCl content. Amongst the 643 LAB isolated from these samples, Enterococcus (59.6%), Lactobacillus (22%), Lactococcus (1.7%), Leuconostoc (0.6%) and Streptococcus (12.8%) genera were found. The identification was not conclusive for 3.3% of the isolates. The main species were Lactococcus latis subsp. latis, Lactobacillus paracasei subsp. paracasei, Streptococcus thermophilus and Enterococcus faecium. Following the evolution of lactic microbiota in raw milk, curd and cheese samples collected in two dairies, Lactococcus was found to be present in the milk, but absent in the cheese. The presence of Enterococcus increased from the raw material to the cheese samples, indicating the transference and multiplication of these microorganisms throughout the cheesemaking. Such results evidenced a selection of high temperature resistant microorganisms at the curd cooking stage of cheesemaking. According to the technological properties evaluated, 15 isolates were considered fast producers of acid, with predominance of the Lactococcus and Streptococcus (40% each). The Lactobacillus showed high variability and provided the widest range of proteolytic activity and production of flavour. The lactic cultures also showed good tolerance to 3 and 4 % of NaCl. Strains of Enterococcus faecium produced active bacteriocins against Listeria spp., with potential use in the production of Coalho cheese like protective culture
Doutorado
Doutor em Tecnologia de Alimentos

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Souza, Cínthia Hoch Batista de. "Influência de uma cultura \'starter\' termofílica sobre a viabilidade de \'Lactobacillus acidophilus\' e as características de queijo minas frescal probiótico." Universidade de São Paulo, 2006. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9133/tde-07122006-153517/.

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Abstract:

Os alimentos funcionais probióticos contêm microrganismos vivos que, quando administrados em quantidades adequadas, conferem saúde ao hospedeiro. Diversos tipos de queijos, incluindo os queijos frescos, têm se revelado adequados como veículos para a incorporação de bactérias probióticas. O presente trabalho teve como objetivos: verificar a viabilidade de Lactobacillus acidophilus La-5 em queijo minas frescal processado com a adição desse microrganismo probiótico associado a uma cultura starter de Streptococcus thermophilus e verificar a influência de um teor reduzido de gordura sobre essa viabilidade; avaliar a aceitabilidade do produto sob o ponto de vista sensorial e suas características físico-químicas, microbiológicas e de textura instrumental, durante o seu armazenamento a 5±1oC por 21 dias, em comparação ao queijo preparado com a adição isolada de L. acidophilus e ao queijo controle (sem adição de culturas). Três queijos foram produzidos (em triplicata) com leite integral e por acidificação direta com ácido lático: T1 (controle), T2 (adição de L. acidophilus) e T3 (adição de L. acidophilus + S. thermophilus). T2 e T3 também foram produzidos (em triplicata) com leite desnatado, para o monitoramento da viabilidade do probiótico em queijo com teor reduzido de gordura (T2L e T3L). T1, T2 e T3 foram avaliados sensorialmente, após 7 e 14 dias de armazenamento a 5±1ºC. As características físico-químicas (umidade, acidez titulável e pH), microbiológicas (sobrevivência do microrganismo probiótico, starter e a população de contaminantes - coliformes, E. coli e Staphylococcus spp.) e a textura instrumental (teste de dupla compressão de amostras cilíndricas, em texturômetro TA-XT2, Stable Micro System) desses queijos foram monitoradas durante o armazenamento refrigerado a 5±1ºC por até 21 dias. Além disso, o índice de extensão da proteólise foi avaliado entre o 1º e o 21º dia de armazenamento. Os queijos T2, T3, T2L e T3 apresentaram populações de L. acidophilus acima do mínimo recomendado para um alimento probiótico (6 log UFC/g), exceto para T3, que apresentou populações de 5,74 log UFC/g ao 1º dia de armazenamento. Ao 14º dia, T2 alcançou populações de 7,04 log UFC/g; T2L e T3L apresentaram populações superiores aos demais queijos durante a produção (dia 0), permanecendo com populações acima de 7 log UFC/g entre o 7º e o 21ºdia de armazenamento. A adição de culturas impediu a multiplicação de Staphylococcus spp. nos queijos T2 e T3, enquanto que T1 apresentou aumento nessas populações ao longo do armazenamento. Todos os queijos apresentaram aumento na proteólise durante o armazenamento (p<0,05). Entretanto, o maior aumento ocorreu em T3, devido à presença da cultura starter (p<0,05). A análise sensorial revelou que a adição de L. acidophilus resultou em benefícios sensoriais aos produtos, uma vez que as características sensoriais de T2 e T3 mantiveram-se estáveis, com boa aceitação após 7 e 14 dias de armazenamento, enquanto que T1 obteve menor aceitação no mesmo período (p<0,05). A suplementação de queijo minas frescal com Lactobacillus acidophilus La-5, isoladamente ou em co-cultura com uma cultura starter termofílica (S. thermophilus), resultou em um produto potencialmente funcional, com populações acima do mínimo requerido para um produto probiótico (particularmente quando produzido com leite com um teor reduzido de gordura), apresentando propriedades sensoriais, microbiológicas e de textura adequadas e superiores aos queijos produzidos somente com acidificação direta do leite com ácido lático.
Functional foods are foods that claim to promote human health over and above the provision of basic nutrition. Probiotics are live microorganisms that, when administered in adequate amounts, confer a health benefit on the host, improving his intestinal microbial balance. Lactobacillus acidophilus strains have been shown to be able to survive at favorable concentrations for a probiotic food in a variety of cheeses, including fresh cheeses. The objective of this study was to verify the viability of Lactobacillus acidophilus La-5 added solely or in co-culture with a Streptococcus thermophilus starter culture during production of minas fresh cheese. Three different trials of minas fresh cheese were prepared (in triplicates): T1 (produced with no addition of cultures), T2 (supplemented with L. acidophilus) and T3 (supplemented with L. acidophilus + S. thermophilus). T2 and T3 were also produced with reduced fat milk in order to verify the influence of reduced fat on viability of L. acidophilus added to minas fresh cheese (T2L and T3L). The physicochemical (moisture, pH and titratable acidity) and microbiological (counts of L. acidophilus, S. thermophilus, coliforms, E. coli and Staphylococcus spp.) properties were monitored during 21 days of refrigerated storage at 5±1ºC. The instrumental texture profile (TA-XT2 Texture Analyser) was also determined. In addition, the proteolytic index after the 1st and the 21st day of storage was determined. Counts of L. acidophilus and S. thermophilus were also monitored in cheeses T2L and T3L. Sensory evaluation was performed for cheeses T1, T2 and T3, after 7 and 14 days of storage at 5±1°C, employing the acceptability test, with a 9-point hedonic scale, by 30 untrained panelists. All cheeses supplemented with L. acidophilus presented populations above 6 log cfu/g, during the whole storage period, except for T3, which presented counts of 5.74 log cfu/g, but only in the 1st day of storage. Cheeses T2L and T3L, presented initials counts above 6 log cfu/g, which increased after the 7th day of storage, remaining above 7 log cfu/g up to the last day of storage. Cheeses produced only through direct acidification of milk (T1) presented increase in counts of Staphylococcus spp. during storage, whereas the presence of lactic acid cultures inhibited the growth of these contaminants in cheeses T2 e T3. All cheeses presented an increase in the proteolytic index between the first and the last day of storage. However, the major increase was detected for T3 (95.4%) due to the presence of S. thermophilus. With respect to sensory evaluation, no significant differences were detected among cheeses after 7 days of storage (p>0.05). After 14 days, cheeses T2 and T3 presented higher acceptance and differed significantly from cheeses T1. A decrease in acceptability was observed for cheeses T1 between 7 and 14 days of storage (p<0.05), whereas probiotic cheeses T2 and T3 revealed to be stable in the same period (p>0.05). The supplementation of minas fresh cheese with Lactobacillus acidophilus La-5, either solely or in co-culture with a thermophilic starter culture (S. thermophilus), resulted in a product with great potential as a functional food, with populations above the minimum required for a probiotic product (particularly when produced with reduced fat milk), improving sensory performance of the product during storage, as well as microbiological and textural properties.

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Gandara, Ana Lourdes Neves 1953. "Caracteristicas de crescimento de uma linhagem selvagem de Streptococcus thermophilus, sua adesão em superficie de aço inoxidavel e comportamento frente a detergencia e sanificação." [s.n.], 1995. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/254614.

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Abstract:

Orientador: Jose Satiro de Oliveira
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
Made available in DSpace on 2018-07-20T18:33:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gandara_AnaLourdesNeves_M.pdf: 3743755 bytes, checksum: 3f218d4e0033af33507f6b97386b0038 (MD5) Previous issue date: 1995
Resumo: Microrganismo selvagem isolado de leite pasteurizado, obtido de processo contínuo de pasteurização HTST com 4 h de operação foi identificado como Streptococcus thermophilus, formando a maior densidade celular em caldo M11 a 45°C em 6h. O número de células viáveis desse microrganismo foi avaliado em meios de cultura PCA, APT, MRS e Ml1 sendo os meios M11 e MRS os que permitiram melhor crescimento. Menores contagens do microrganismo foram observadas no meio APT em relação aos meios anteriores, não ocorrendo crescimento em meio PCA. Em leite foram avaliados o tempo de geração, destruição térmica a 12°C, armazenamento da cultura a 10°C e formação de estruturas de adesão. O microrganismo apresentou um tempo de geração de 15,2 minutos a 45°C e um valor Dn de 1,4 minutos. Na temperatura de 10°C, armazenado por 6 dias, 51,1% das células desse Streptococcus permanecem viáveis; esse microrganismo também forma em 20 h estruturas de adesão em superfícies de aço inoxidável, observada através de microscopia eletrônica de varredura. A produção de ácido lático em leite foi avaliada a 35,40, 45 e 50°C por 8 h, os maiores teores foram obtidos a 45°C (0,35%) e 40°C (0,34%), menores teores ocorreram respectivamente a 50 e 35°C. Em leite a adesão desse S. thermophilus em superfícies de aço inoxidável foi estudada em 6 h de contato a 45°C sob agitação e uma higienização com etapas de limpeza com detergentes alcalino e ácido, seguidas de sanificação foi utilizada para avaliação do comportamento das células aderidas frente à higienização. Esse microrganismo aderiu às superfícies de aço inoxidável produzindo uma carga de 104 células/cm2. Após a limpeza alcalina não foram detectadas células aderidas, porém, em seguida a limpeza ácida, 6 células/cm2 ainda foram detectadas nessa superfície. A sanificação com hipoclorito de sódio a 100 ppm após a limpeza foi suficiente para reduzir a níveis não detectáveis a carga de S. thermophilus selvagem aderidas às superfícies de aço inoxidável
Abstract: A wild microorganism, isolated from HTST pasteurized milk processed in a continuous 4 hour operation, was identified as Streptococcus thermophilus, giving greater celular growth in M17 broth, incubated for 6 hours at 45°C. The viable cell count was evaluated in PCA, APT, :MRS e M17, the media M17 and MRS being shown to allow for better growth. Microorganism lower count was observed in APT in relation to M17 and MRS and no growth occurred in PCA medium. The generation time, thermal destruction at 72°C, storage of the culture at 10°C and formation of adhesive structures were evaluated in milk The organism showed a generation time of 15.2 minutes at 45°C and a Dn value of 7.4 minutes. After storage at 10°C for 6 days, 57.1% of Streptococcus cells remained viable, and organism formed adhesive structures on stainless steel surfaces in 20 hours, these being observed using a scanning eletronic microscope. The production of lactic acid was determined after 8 hours incubation at 35,40,45 and 50°C, greatest values being obtained at 45°C ( 0.35%) and at 40°C (0.34%), lower values being obtained at 50 and 35°C respectively. The adhesion of this S. thermophilus onto stainless steel surfaces was studied afier 6 hours of contact at 45°C with agitation. A cleansing process involving cleaning stages with alkaline and acid detergents followed by sanification was used to evaluate the resistence of the adhered cells. The microorganism adhered to stainless steel surfaces producing a cell load of 104 cells/cm2. After alkaline cleasing, no adhered cells were detected but afier acid cleasing, 6 cells/cm2 were still detected on surface. Cleasing followed by sanification with 100 ppm sodium hypochorite was sufficient to reduce the load of wild S. thermoplilus on the stainless steel surface to non detectable levels
Mestrado
Mestre em Tecnologia de Alimentos

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Hervé, Luciana. "Une nouvelle vision de la proto-coopération entre Streptococcus thermophilus et Lactobacillus delbrueckii spp. Bulgaricus par des approches post-génomiques." Paris, AgroParisTech, 2008. http://www.theses.fr/2008AGPT0034.

Full text

Abstract:

S. Thermophilus et L. Bulgaricus sont les bactéries lactiques utilisées dans la fabrication du yaourt. En milieu laitier, cette association est appelée proto-coopération lorsqu’elle est bénéfique au développement de chacune des espèces. Même si quelques facteurs nutritionnels impliqués dans cette coopération ont été identifiés, ce phénomène reste encore peu connu au niveau moléculaire. Notre objectif est d’identifier plus amplement les bases moléculaires de cette association, d’évaluer la nature et l’étendue des échanges bactériens et d’estimer si des phénomènes de régulation interviennent entre les deux espèces. Nous avons sélectionné le couple de souches, S. Thermophilus LMG18311 et L. Bulgaricus ATCC11842, dont les génomes sont séquencés, pour lequel nous avons observé un effet proto-coopératif. En utilisant des analyses protéomique et transcriptomique, nous avons comparé la croissance en lait de S. Thermophilus en présence (co-culture) ou en absence (monoculture) de L. Bulgaricus et à deux stades de croissance différents. Nous avons obtenu la variation de 88 différents gènes ou protéines (4. 6% des CDS) de S. Thermophilus qui variaient en présence de L. Bulgaricus. Notamment des variations concernant les métabolismes azoté, des purines et du fer. De plus, la co-culture conduit à des changements de régulation chez S. Thermophilus avec la variation d’un régulateur de réponse, homologue au régulateur de réponse CovR des streptocoques. Cette étude révèle des échanges nutritionnels inattendus et des relations de régulation entre St. Thermophilus et Lb. Bulgaricus offrant de nouvelles pistes pour la compréhension du comportement proto-coopératif entre ces deux bactéries.

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TOSI, LORENZO. "Antibiotico resistenza in S. thermophilus, tratti fenotipici, coniugazione e aggregazione." Doctoral thesis, Università Cattolica del Sacro Cuore, 2007. http://hdl.handle.net/10280/77.

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Abstract:

Negli ultimi decenni l'utilizzo degli antibiotici a scopo terapeutico o come promotori della crescita nell'allevamento animale ha portato alla comparsa e alla diffusione di microrganismi resistenti. In questo contesto, la presenza di Lattobacilli (LAB) antibiotico resistenti non rappresentano di per sé un rischio clinico. Tuttavia la possibilità che essi ma possono essere veicolo di geni codificanti l'antibiotico-resistenza verso batteri patogeni presenti negli alimenti o nel tratto gastro-intestinale umano (inclusi enterococchi, streptococchi e listeria), costituisce un possibile rischio per la salute umana che deve essere attentamente valutato. Obiettivo di questo lavoro è stato quello di valutare attraverso metodi di indagine fenotipica con le tecniche delle microdiluizioni in brodo, Etest e disc-diffusion, i livelli di antibiotico resistenza per le specie S. thermophilus e L. plantarum verso gli antibiotici tetraciclina, eritromicina, clindamicina, streptomicina, gentamicina, ampicillina. Ceppi atipici appartenenti alla specie S. thermophilus sono stati sottoposti ad analisi genetiche con lo scopo di caratterizzare e localizzare i geni responsabili della resistenza. E' stato inoltre testato il possibile trasferimento orizzontale dei geni di antibiotico resistenza nativi da S. thermophilus verso i batteri Gram-positivi E. faecalis e Listeria monocytogenes. In alcuni ceppi di S. thermophilus resistenti si sono infine osservati e studiati particolari caratteri fenotipici ( fitness ) correlati alla presenza delle determinanti genetiche di antibiotico resistenza nell'ospite batterico.
In the last decades, the use of antibiotics in human therapy or in animal husbandry as growth promoters has induced the development and the diffusion in antibiotic resistant micro-organisms. In this context antibiotic resistant Lactic Acid Bacteria (LAB) do not represent a clinical risk in themselves. However, the possibility that S. thermophilus cultures might transfer antibiotic resistance genes to pathogenic species either present in food or in the gastrointestinal tract (including enterococci, streptococci and listeria) represents a potential clinical risk that needs to be carefully evaluated. The aim of this study was to evaluate by means of phenotypic methods (microdilution, E-test, disc-diffusion) the levels of antibiotic resistance for S. thermophilus and L. plantarum species against the antibiotic tetracycline, erythromycin, clyndamicin, streptomycin, gentamycin and ampicillin. The atypical resistant S. thermophilus strains were subjected to genetic analyses in order to characterise and to localise the antibiotic resistance determinants. Furthermore the ability of the resistant S. thermophilus strains in transferring the antibiotic resistant determinant was assessed in mating experiments using as recipients the Gram-positive bacteria E. faecalis and Listeria monocytogenes. In same resistant S. thermophilus strains, special bacterial fitness related with the presence of the antibiotic resistance determinants in the bacterial hosts were observed and studied.

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TOSI, LORENZO. "Antibiotico resistenza in S. thermophilus, tratti fenotipici, coniugazione e aggregazione." Doctoral thesis, Università Cattolica del Sacro Cuore, 2007. http://hdl.handle.net/10280/77.

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Abstract:

Negli ultimi decenni l'utilizzo degli antibiotici a scopo terapeutico o come promotori della crescita nell'allevamento animale ha portato alla comparsa e alla diffusione di microrganismi resistenti. In questo contesto, la presenza di Lattobacilli (LAB) antibiotico resistenti non rappresentano di per sé un rischio clinico. Tuttavia la possibilità che essi ma possono essere veicolo di geni codificanti l'antibiotico-resistenza verso batteri patogeni presenti negli alimenti o nel tratto gastro-intestinale umano (inclusi enterococchi, streptococchi e listeria), costituisce un possibile rischio per la salute umana che deve essere attentamente valutato. Obiettivo di questo lavoro è stato quello di valutare attraverso metodi di indagine fenotipica con le tecniche delle microdiluizioni in brodo, Etest e disc-diffusion, i livelli di antibiotico resistenza per le specie S. thermophilus e L. plantarum verso gli antibiotici tetraciclina, eritromicina, clindamicina, streptomicina, gentamicina, ampicillina. Ceppi atipici appartenenti alla specie S. thermophilus sono stati sottoposti ad analisi genetiche con lo scopo di caratterizzare e localizzare i geni responsabili della resistenza. E' stato inoltre testato il possibile trasferimento orizzontale dei geni di antibiotico resistenza nativi da S. thermophilus verso i batteri Gram-positivi E. faecalis e Listeria monocytogenes. In alcuni ceppi di S. thermophilus resistenti si sono infine osservati e studiati particolari caratteri fenotipici ( fitness ) correlati alla presenza delle determinanti genetiche di antibiotico resistenza nell'ospite batterico.
In the last decades, the use of antibiotics in human therapy or in animal husbandry as growth promoters has induced the development and the diffusion in antibiotic resistant micro-organisms. In this context antibiotic resistant Lactic Acid Bacteria (LAB) do not represent a clinical risk in themselves. However, the possibility that S. thermophilus cultures might transfer antibiotic resistance genes to pathogenic species either present in food or in the gastrointestinal tract (including enterococci, streptococci and listeria) represents a potential clinical risk that needs to be carefully evaluated. The aim of this study was to evaluate by means of phenotypic methods (microdilution, E-test, disc-diffusion) the levels of antibiotic resistance for S. thermophilus and L. plantarum species against the antibiotic tetracycline, erythromycin, clyndamicin, streptomycin, gentamycin and ampicillin. The atypical resistant S. thermophilus strains were subjected to genetic analyses in order to characterise and to localise the antibiotic resistance determinants. Furthermore the ability of the resistant S. thermophilus strains in transferring the antibiotic resistant determinant was assessed in mating experiments using as recipients the Gram-positive bacteria E. faecalis and Listeria monocytogenes. In same resistant S. thermophilus strains, special bacterial fitness related with the presence of the antibiotic resistance determinants in the bacterial hosts were observed and studied.

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Fayard, Blandine. "Caractérisation de 69 bactériophages de Streptococcus salivarius subsp. Thermophilus, incluant 10 bactériophages tempérés." Nancy 1, 1993. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_1993_0011_FAYARD.pdf.

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Abstract:

Douze des 118 souches de Streptococcus salivarius subsp. Thermophilus de la collection CNRZ présentent une phase lytique après induction avec la mitomycine C et contiennent des phages actifs. Les phages temperés correspondants ont été multipliés sur des souches indicatrices et comparés à 56 phages isolés comme lytiques. Toutes les souches lysogènes se caractérisent par des propriétés autolytiques, dans certaines conditions de cultures. Du point de vue morphologique, les 69 phages étudiés, temperés ou virulents, appartiennent tous au groupe B de la classification de Bradley (1967) ou a la famille des Siphoviridae de l'International Committee on Taxonomy of Viruses (Matthews, 1982). Les profils protéiques des virions sont de 2 types. Les ADN phagiques sont pour la plupart linéaires, avec des extrémités cohésives et leur taille varie de 35 a 50 kb. Ils présentent un polymorphisme de restriction important. De l'homologie existe entre tous les ADN phagiques, en particulier entre les ADN des phages tempers et ceux des phages virulents. L'étude des interactions phages-bactéries a montré que certaines des souches lysogènes sont sensibles aux surinfections par de nombreux phages et que ces souches remanient alors le génome des phages infectants. Les résultats obtenus suggèrent que les souches lysogènes de S. Salivarius subsp. Thermophilus pourraient jouer un rôle majeur dans la genèse des infections phagiques et dans l'évolution de la population phagique spécifique de ce streptocoque
Twelve of the 118 strains of Streptococcus salivarius subsp. Thermophilus of the CNRZ collection exhibited a Iytic phase after mitomycin C induction and contained active phages. The corresponding temperate phages were multiplied on indicator strains and compared to 56 phages isolated as Iytic. All Iysogenic strains were characterized by autolytic properties in certain conditions of culture. Morphologically, the 69 temperate or virulent phages studied all belonged to Bradley's (1967) group B, or to the family of the Siphoviridae of the International Committee on Taxonomy of Viruses (Matthews, 1982). There were 2 types of virion protein profiles. Most phage DNA were linear with cohesive ends, and size varied trom 35 to 50 kb. There was considerable restriction polymorphism. Homology existed among all phage DNA, in particular between the DNA of temperate phages and those of virulent phages. The study of phage-bacteria interactions showed that some Iysogenic strains were sensitive to superinfections by numerous phages and that in this case, these Iysogenic strains rearranged the genome of infecting phages. The results suggest that Iysogenic strains of S. Salivarius subsp thermophilus could play a major role in the genesis of phage infections and in the evolution of the phage population specific to this streptococcus

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Pavlovic, Guillaume. "Evolution d'une famille d'éléments intégratifs potentiellement conjugatifs et/ou mobilisables de Streptococcus thermophilus." Nancy 1, 2004. http://www.theses.fr/2004NAN10009.

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Abstract:

Lors de ce travail, quatre types d'îlots génomiques apparentés à ICESt1 ont été caractérisés. Ils sont intégrés au même site que lui chez sept souches de S. Thermophilus. L'un des éléments, ICESt3 est probablement un ICE. Deux autres types d'éléments, CIME19258 et CIME302 sont flanqués par des sites attL et attR apparentés à ceux d'ICESt1 et d'ICESt3 tandis que DCIME308 possède uniquement un site attR. Ces éléments dérivent d'un ICE par délétion des modules de conjugaison et de recombinaison. La comparaison des ICE et CIME (CIs Mobilisable Element ) de S. Thermophilus et des études fonctionnelles réalisées avec des plasmides portant tout ou partie du module de recombinaison d'ICESt1 suggèrent que ces éléments évoluent selon un modèle original. La forme circulaire d'un ICE acquise par conjugaison s'intégrerait par recombinaison site-spécifique dans le site attR du CIME formant ainsi une structure attL-CIME-attI-ICE-attR. Le site attI serait ensuite partiellement ou totalement délété stabilisant la structure. Cet ensemble constituerait un nouvel ICE qui s'exciserait par recombinaison site-spécifique puis se transférerait par conjugaison. Les ICE acquerraient ainsi de nouveaux modules par un mécanisme inconnu jusqu'alors : l'accrétion et la mobilisation site-spécifique de CIME. En conclusion, les ICE et probablement les CIME joueraient un rôle important dans l'évolution par transfert horizontal des génomes bactériens et participeraient à l'acquisition de nouvelles fonctions par ces génomes
In this work, four types of genomic islands related to ICESt1 were characterized. They are integrated in the same location as ICESt1 in seven other strains of S. Thermophilus. One of these elements, ICESt3, is probably an ICE. Two other types of elements, CIME19258 and CIME302, are flanked by site-specific attachment sites closely related to attL and attR of ICESt1 and ICESt3 whereas DCIME308 only possesses a putative attR site. They have arisen from ICEs by deletion of there conjugation and recombination modules. Comparisons between ICE and CIME (cis-mobilizable element) from Streptococcus thermophilus and functional analysis, using plasmids harbouring the entire or a part of the recombination module of ICESt1, suggest that these elements evolve by a novel model. ). The circular form of an ICE, acquired by conjugation, integrates by site-specific in the attR site of the CIME, leading to the structure attL-CIME-attI'-ICE-attR'. Then partial or entire deletion of the attI site would stabilise the composite element. The whole structure would be a novel ICE and could be excised by recombination between attL and attR and transferred to a new host bacterium. This suggests that ICEs have acquired novel modules by a new mechanism: accretion / mobilization of CIMEs. In conclusion, ICE and probably CIME would be important in the evolution of bacterial genomes by horizontal gene transfer and contribute to the acquisition of new functions by these genomes

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Low, Deborah. "Influence of Streptococcus thermophilus MR-1 C Capsular Exopolysaccharide on Cheese Moisture Level." DigitalCommons@USU, 1998. https://digitalcommons.usu.edu/etd/5440.

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Abstract:

This study investigated the role of exopolysaccharide (EPS) in cheese moisture retention. Analysis of low-fat Mozzarella cheese made with different combinations of EPS-producing (Streptococcus thermophilus MR-1C and Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus MR-lR) and non-EPS-producing (S. thermophilus TA061 and L. helveticus LH100) starters showed significantly higher moisture levels in cheese made with S. thermophilus MR-1C. To determine if the S. thermophilus MR-1C EPS was responsible for increased moisture retention, gene replacement was used to inactivate the epsE gene in this bacterium. Low-fat Mozzarella cheese made with L. helveticus LH100 plus the EPS-negative mutant, S. thermophilus DM1O, had significantly lower moisture content than cheese made with LH100 and MR-1C, which confirmed that the MR-1C capsular EPS was responsible for the water-binding properties of this bacterium in cheese. Chemical analysis of the S. thermophilus MR-lC EPS indicated that it had a repeating unit composed of D-galactose, L-rhamnose, and L-fucose in a ratio of 5:2:1. Interestingly, carbohydrate utilization tests showed that DMlO had acquired the ability to ferment galactose.

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Arioli, S. "Carbon dioxide metabolism in Streptococcus thermophilus : physiological and ecological importance, and dairy applications." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano, 2008. http://hdl.handle.net/2434/50715.

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Ben, Yahia Leila. "Étude du dialogue hôte/bactéries lactiques du yaourt chez des rats gnotobiotiques." Thesis, Paris, AgroParisTech, 2012. http://www.theses.fr/2012AGPT0028/document.

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Abstract:

L'amélioration de la digestion de lactose est une allégation "santé" liée aux ferments viviants du yaourt : Streptococcus thermophilus (S. thermophilus) et Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus (L. bulgaricus) validée par l'EFSA en 2010. La physiologie de S. thermophilus et de L. bulgaricus est connue dans le lait et particulièrement le yaourt, alors qu'elle n'a été que peu étudiée dans le tractus digestif (TD). Mon travail de thèse est basé sur l'hypothèse de travail suivante : l'utilisation de modèles animaux gnotobiotiques permet de mieux connaître la physiologie des bactéries lactiques et de proposer des mécanismes d'action de leurs effets "santé". La stratégie a donc été d'obtenir des animaux mono-associés avec chacune des deux bactéries du yaourt ou les deux en même temps. Les principaux résultats obtenus sont : 1/ S. thermophilus colonise le TD en s'adaptant progressivement à l'environnement colique et y induit une glycolyse massive et une production de lactate. La glycolyse est la signature majeure de S. thermophilus dans le TD et le lactate pourrait être est la molécule "signal" qui induit une réponse chez l'hôte par une augmentation des transporteurs de mono-carboxylates (SLC16A1 et SLC5A8) et d'une protéine impliquée dans l'arrêt du cycle cellulaire p27kip1. 2/ L'apport de lactose stimule la colonisation du TD, la glycolyse ainsi que la production de L-lactate par S. thermophilus in vivo. 3/ Contrairement à ce qui est observé pour S. thermophilus, L. bulgaricus ne s'implante pas en absence de lactose. Quand les deux bactéries sont en co-culture, S. thermophilus est toujours avantagé numériquement par rapport à L. bulgaricus aussi bien in vitro qu' in vivo. Au niveau nutritionnel, tous nos résultats sont cohérents avec les allégations "santé" du yaourt avec un effet prébiotique du lactose. L'étude d'animaux gnotobiotiques a permis de proposer des nouvelles voies de régulation du métabolisme des sucres de bactéries lactiques et de nouvelles voies moléculaires (via le lactate) par lesquelles des bactéries lactiques et de nouvelles voies moléculaires (via le lactate) par lesquelles des bactéries lactiques pourraient influencer la physiologie de l'hôte
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Bédard, Nathalie. "Rejet de galactose par Streptococcus thermophilus au cours d'une croissance sur milieu lactosé : role de GaIM." Master's thesis, Université Laval, 2007. http://hdl.handle.net/20.500.11794/19110.

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Dissertations / Theses on the topic 'Streptococcus thermophilus'

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