Academic literature on the topic 'Stratification pronostique'

Le schéma de turbulence Toucans est utilisé dans la configuration opérationnelle Alaro du modèle Aladin depuis début 2015. Son développement a été initié, guidé et en grande partie conçu par Jean-François Geleyn. Ce développement a commencé avec le prédécesseur du schéma Toucans, le schéma « pseudo-pronostique » en énergie cinétique turbulente, lui-même basé sur l'ancien schéma de turbulence de Louis, mais étendu dans Toucans à un schéma pronostique. Le schéma Toucans a pour objectif de traiter de manière cohérente les fonctions qui dépendent de la stabilité verticale de l'atmosphère, de l'influence de l'humidité et des échelles de longueur de la turbulence (de mélange et de dissipation). De plus, de nouvelles caractéristiques ont été ajoutées : une représentation améliorée pour les stratifications très stables (absence de nombre de Richardson critique), une meilleure représentation de l'anisotropie, un paramétrage unifié de la turbulence et des nuages par l'ajout d'une deuxième énergie turbulente pronostique et la paramétrisation des moments du troisième ordre. The Toucans turbulence scheme is a turbulence scheme that is used in the operational Alaro configuration of the Aladin model since early 2015. Its development was initiated, guided and to a large extend authored by Jean-François Geleyn. The development started with the predecessor of the Toucans scheme, the "pseudo-prognostic" turbulent kinetic energy scheme which itself was built on the "Louis" turbulence scheme, but extended to a prognostic scheme. The Toucans scheme aims for a consistent treatment of stability dependency functions, influence of moisture, and turbulence length scales. Additionally, new features were added to the turbulence scheme: improved representation of turbulence in very stable stratification (absence of critical gradient Richardson number), better representation of anisotropy, unified parameterization of turbulence and clouds via addition of second prognostic turbulence energy, and parameterization of third order moments.

Introduction : Cette étude a pour objectif de connaître l’incidence et la nature des événements indésirables (EI) se produisant lors des transports interhospitaliers (TIH) des patients souffrant d’un syndrome coronarien aigu sans sus-décalage du segment ST (SCA non ST+). L’objectif secondaire est d’étudier les performances pronostiques des différentes évaluations de risque existantes de ces malades (score de GRACE, score de TIMI, grille de Fiancette et niveau de risque de la Société européenne de cardiologie [ESC]) dans la prédiction de ces EI. Méthode : Il s’agit d’une étude de cohorte multicentrique rétrospective. Du 1er novembre 2016 au 31 octobre 2017, les patients SCA non ST+ et bénéficiant d’un transport secondaire ont été inclus à partir des fiches de régulation de trois Samu du sud-ouest de la France. Les types d’EI ont été recueillis. Les différents scores ont été calculés pour chaque patient ainsi que leur performance pronostique (sensibilité, spécificité, valeurs prédictives positives [VPP] et négatives [VPN]). Résultats : Sur un an, 315 patients ont été inclus, et neuf patients (3 % ; IC 95 % : 1,3–5,3) ont présenté un EI. Soixante-dix-huit pour cent des événements recueillis n’ont pas engagé le pronostic vital des patients, et 40 % n’ont pas nécessité d’intervention thérapeutique nécessitant la présence physique d’un médecin. Aucun score n’est retrouvé statistiquement significatif dans la prédiction des EI. Toutefois, la stratification du risque de la ESC semble être la plus simple d’utilisation tout en assurant une valeur prédictive négative de 98 % (IC 95 % : 94–99). Conclusion : Il y a peu d’EI lors du transport des SCA non ST+. L’utilisation en régulation de l’évaluation du risque ischémique de la ESC pourrait réduire la surmédicalisation de ces malades au bénéfice des TIH.

Introduction - La stratification du risque chez les patients atteints de syndromecoronarien aigu (SCA) sans sus décalage du segment ST est l’étape primordiale dela prise en charge et il n’y a pas de données sur les patients algériens. Nos objectifsétaient l’identification et l’analyse des facteurs prédictifs d’événements cardiovasculaireset cérébrovasculaires majeurs à un an.Matériels et méthodes - Étude prospective incluant tous les patients admis au servicede cardiologie du CHU Oran pour SCA sans sus-décalage du segment ST (ST-) deNovembre 2015 à Octobre 2016 et avec un suivi d’une année. Les caractéristiquesdes patients recueillies individuellement et avec le calcul des différents scores derisque et angiographiques, ont été corrélés aux ECVM (évènements cardiovasculaireset cérébrovasculaires majeurs) à 1 an en analyse univariée et multivariée. Ona procédé également à une analyse des courbes de survie, de survenue des ECVMet à des courbes de ROC .Résultats - Deux cent quatre-vingt-seize (296) patients ont été inclus, les taux deECVM à 30 jours et à 1 an ont été respectivement de 5.1% et 13.2%, les taux demortalité d’origine cardiovasculaire à 30 jours et à 1 an respectivement de 2.4%et 5.4%.Les facteurs pronostiques issus de l’analyse multivariée sont l’angor persistant etrécidivant, les complications tardives, le sous décalage du segment ST descendant,les troubles du rythme ventriculaire, une créatinine sanguine > 12.1 mg/l, un Syntaxscore ? 20 et un traitement médical avec lésions non revascularisées.Conclusion - La promesse d’une médecine personnalisée passe par l’intégrationdes résultats des différentes études dans la prise en charge réelle de nos patients.

Les cancers du sein triple-négatifs (TN), négatifs pour le récepteur alpha aux œstrogènes, le récepteur à la progestérone et HER2, le récepteur de type 2 au facteur de croissance épidermique, représentent 15–20% des cancers du sein de la Femme. Il n’existe pas encore de thérapie ciblée spécifique de ce type tumoral agressif, de mauvais pronostic. Des études transcriptomiques montrent que les cancers du sein TN sont hétérogènes, comportant certains sous-types au pronostic particulier et pouvant relever d’une thérapie ciblée. Nous avons montré que 68% des carcinomes mammaires invasifs de chattes (FMC) sont TN, suggérant que les chattes sont des modèles animaux spontanés prometteurs pour de futurs essais de thérapie ciblée de ces cancers. L’hypothèse de la thèse est que les FMC-TN spontanés de la chatte comportent comme chez la Femme, différents sous-groupes au pronostic différent et aux possibilités thérapeutiques différentes. Une cohorte rétrospective de 180 chattes spontanément porteuses de FMC a été constituée et analysée par immunohistochimie mettant en évidence entre autres AR, le récepteur aux androgènes, des cytokératines basales et le marqueur de lymphocytes T régulateurs FoxP3. Les résultats de thèse montrent que la chatte développe spontanément l’équivalent des sous-groupes luminal-AR et basal immunosupprimé de cancer du sein TN humain. Ceci suggère qu’il sera possible d’évaluer dans l’espèce féline, avant leur application en cancérologie humaine, l’efficacité et la toxicité de stratégies thérapeutiques anti-androgènes ou d’immunothérapie, pressenties pour améliorer la prise en charge des patientes ayant un cancer du sein triple-négatif
Triple-negative (TN) breast cancers, negative for estrogen receptor, progesterone receptor and HER2, the epidermal growth factor receptor type 2, account for 15-20% of breast cancers in women. There exists yet no targeted therapy for this aggressive, poor-prognosis subtype of breast cancer. Gene expression studies have shown that TN breast cancers are heterogeneous, with certain subtypes associated with a particular prognosis, which may possibly benefit from targeted therapies. We have shown that 68% of invasive mammary carcinomas in cats are TN, suggesting that cats are promising spontaneous animal models for future targeted therapy trials of these aggressive cancers.The hypothesis of the PhD thesis is that spontaneous TN mammary carcinomas of the cat (FMC) comprise, as in women, different subgroups with different prognoses (associated with a more or less unfavorable patient outcome) and with different therapeutic possibilities.180 cats, diagnosed with spontaneous invasive mammary carcinoma, were included in a retrospective study and analyzed by immunohistochemistry, to identify among other markers, AR, the androgen receptor, basal cytokeratins and the regulatory T-cell marker FoxP3. The results obtained show that the cat spontaneously develops the equivalent of the "luminal-AR" and "basal immunosuppressed" subgroups of human TN breast cancers. This implies that future targeted therapies for triplenegative breast cancer could be tested for their efficacy and toxicity in the feline species, including antiandrogen therapeutic strategies or cancer immunotherapy, designed to improve the management of women with triple-negative breast cancer

Plus de 5000 transplantations cardiaques sont réalisées chaque année dans le monde, avec une survie médiane après la transplantation supérieure à 12 ans. La stratification du risque de résultats post-transplantation est devenue une priorité pour la communauté de transplantation notamment face au nouveau système français d’allocation et suite à la récente révision du système américain d'allocation cardiaque. L’objectif de ce travail était d’identifier des pistes d’amélioration de la stratification du risque d’événements cardio-vasculaires et de mortalité chez les patients transplantés cardiaques. Tout d’abord, dans notre analyse d'une cohorte contemporaine de l'UNOS (United Network for Organ Sharing - USA), nous avons montré que le statut d'assistance circulatoire au moment de la transplantation était associé à des différences majeures dans les caractéristiques des patients et leur pronostic, et avait une influence sur les modèles prédictifs post-transplantation. Cependant, le développement de modèles prédictifs spécifiques pour chaque type d'assistance circulatoire a eu un impact limité sur la performance statistique des modèles prédictifs. Au-delà des limitations que peuvent représenter ces approches sur de grandes bases de données nationales (faible niveau de granularité avec l’absence de données immunologiques, données manquantes dans le suivi), nous avons constitué une base francilienne prospective multicentrique et hautement phénotypée de transplantés cardiaques. Au sein de cette population spécifique et suite à une relecture médicale détaillée des causes de décès, nos résultats retrouvaient que la mort subite était une cause majeure de décès au-delà de la première année post-transplantation. Nous avons démontré que l'incidence annuelle de la mort subite était 25 fois plus importante que dans la population générale. Le risque de mort subite était nettement plus élevé chez les plus jeunes receveurs. Cinq variables étaient indépendamment associées à la mort subite : l'âge du donneur plus élevé, l'âge du receveur plus jeune, l'origine ethnique, les anticorps préexistants spécifiques au donneur et la fraction d'éjection ventriculaire gauche. Nos résultats fournissent des données nouvelles concernant l'épidémiologie de la mort subite après transplantation cardiaque. Enfin, nous avons identifié, pour la première fois, 4 trajectoires distinctes de la progression à long terme de la coronaropathie du greffon en utilisant une approche innovante non supervisée. Ces 4 trajectoires étaient cohérentes et validées dans des cohortes géographiquement distinctes (Europe et États-Unis). Nous avons constaté que ces trajectoires étaient associées à des caractéristiques spécifiques du donneur et du receveur, aux processus pathologiques en cours dont le rejet et aux profils immunologiques précoces après la transplantation. Ainsi, l'évaluation de la trajectoire des patients qui peut être effectuée à un stade précoce après la transplantation peut optimiser la stratification du risque post-transplantation. Ces différentes pistes permettent d’aboutir au développement de nouveaux outils de stratification du risque, parfois transposables à la pratique quotidienne. L’identification de sous-groupes de patients à haut risque nous amènerait à des stratégies préventives plus agressives afin d'améliorer la survie globale à long terme
More than 5000 heart transplants are performed each year worldwide, with a median post-transplant survival of more than 12 years. Risk stratification of post-transplant outcomes has become a priority for the transplant community, particularly in the face of the new French allocation system and following the recent revision of the US cardiac allocation system. The objective of this work was to identify ways to improve the risk stratification of cardiovascular events and mortality in heart transplant patients. First, in our analysis of a contemporary United Network for Organ Sharing (UNOS) cohort, we showed that circulatory support status at the time of transplantation was associated with large differences in patient characteristics and prognosis, and influenced post-transplant predictive models. However, the development of specific predictive models for each type of circulatory support had a limited impact on the statistical performance of the predictive models. Beyond the limitations that these approaches may represent on large national databases (low level of granularity with the absence of immunological data, missing data in the follow-up), we have constituted a multicentric and highly phenotyped prospective Ile-de-France database of heart transplant patients. Within this specific population and following a detailed medical review of the causes of death, our results showed that sudden death was a large cause of death beyond the first year post-transplant. We demonstrated that the annual incidence of sudden death was 25 times higher than in the general population. The risk of sudden death was significantly higher in younger recipients. Five variables were independently associated with sudden death: older donor age, younger recipient age, ethnicity, pre-existing donor-specific antibodies and left ventricular ejection fraction. Our results provide new insights into the epidemiology of sudden death after heart transplantation. Finally, we identified, for the first time, 4 distinct trajectories of long-term progression of cardiac allograft vasculopathy using an innovative unsupervised approach. These 4 trajectories were consistent and validated in geographically distinct cohorts (Europe and USA). We found that these trajectories were associated with specific donor and recipient characteristics, ongoing disease processes including rejection, and early immunological profiles after transplantation. Thus, patient trajectory assessment that can be performed at an early stage after transplantation can optimise post-transplant risk stratification. These different avenues can lead to the development of new risk stratification tools, which can sometimes be transposed to daily practice. The identification of subgroups of high-risk patients would lead to more aggressive preventive strategies to improve overall long-term survival

Le pronostic est depuis longtemps un concept de base de la médecine. Hippocrate envisageait déjà le pronostic des maladies par l’étude des circonstances passées, l’établissement des faits présents, et enfin la prédiction des phénomènes à venir. Pour lui, tout l’art du pronostic était de savoir interpréter intelligemment ces informations, et ainsi moduler le pronostic en fonction de leur valeur relative. Une recherche à visée pronostique consiste toujours actuellement en l’examen des relations entre un état de santé connu au moment de l’investigation et un évènement futur. L’augmentation de l’espérance de vie implique que de plus en plus de personnes vivent avec une ou plusieurs maladies ou problèmes altérant leur santé. Dans ce contexte, l’étude du pronostic n’a jamais été aussi importante. Cependant, contrairement au domaine des essais cliniques randomisés dans lequel les recommandations CONSORT sont appliquées depuis plus de 20 ans et garantissent une recherche de qualité, la recherche pronostique commence seulement à se doter d’initiatives similaires. En effet, des recommandations TRIPOD ont été élaborées en 2015 et un groupe de travail, PROGRESS, s’est constitué en 2013 au Royaume-Uni et a fait le constat que les recherches a visée pronostique sont réalisées de façon très hétérogènes et malheureusement ne respectent pas toujours des standards de qualité nécessaires pour supporter leurs conclusions et garantir la reproductibilité des résultats (...)
Prognosis is historically a basic concept of medicine. Hippocrates already considered the prognosis of disease as the study of the past circumstances, the establishment of the present state of health and finally the prediction of future events. He presented the prognosis as the ability to interpret these elements and to adapt the prognosis regarding their relative values. Currently, the prognostic research is still based on the examination of the relationship between a well-established health condition at the time of the investigation and the occurrence of an event. The increase in life expectancy implies that more and more people are living with one or more diseases or with problems that can impair their health status. In this context, the study of the prognosis has never been more important. However, in comparison with the field of randomized clinical trials in which the CONSORT statement recommendations are implemented for more than 20 years in order to guarantee quality research, the prognostic research only begins to develop similar initiatives. Indeed, in 2015 the TRIPOD statement recommendations were provided and in 2013 a working group called PROGRESS was constituted in the United Kingdom and its members made the observation that prognostic researches are developed with considerable heterogeneity in the methodology used and unfortunately do not always meet the quality standards required to support their conclusions and their reproducibility (...)

La transplantation hépatique (TH) est la seule intervention possible en cas de défaillance hépatique terminale. Une des limitations majeures à la TH est la pénurie d'organes. Pour pallier ce problème, les critères de sélection des donneurs ont été élargis avec l'utilisation de foie de donneurs dits à "critères étendus" (extended criteria donor (ECD)). Cependant, il n'existe pas de définition univoque de ces foies ECD. Un score donneur américain a donc été mis en place : le Donor Risk Index (DRI), pour qualifier ces greffons. Mais à qui doit-on donner ces greffons "limites"? En effet, une utilisation appropriée des greffons ECD pourrait réduire la pénurie d'organes. Le but de cette thèse est d'établir un nouveau système d'allocation des greffons qui permettrait à chaque greffon d'être transplanté au candidat dont la transplantation permettra le plus grand bénéfice de survie et d'évaluer l'appariement entre donneurs et receveurs en tenant compte des greffons ECD.La première étape a consisté à effectuer une validation externe du DRI ainsi que du score qui en découle : l'Eurotransplant-DRI. Toutefois la calibration et la discrimination n'étaient pas maintenus dans la base française. Un nouveau score pronostique donneur a donc été élaboré : le DRI-Optimatch, à l'aide d'un modèle de Cox donneur ajusté sur les covariables receveur. Le modèle a été validé par bootstrap avec correction de la performance par l'optimisme.La seconde étape consista à explorer l'appariement entre donneur et receveur afin d'attribuer les greffons ECD de manière optimale. Il a été tenu compte des critères donneurs et receveurs, tels qu'évalués par le DRI-Optimatch et par le MELD (Model for End-stage Liver Disease, score pronostique receveur), respectivement. La méthode de stratification séquentielle retenue s'inspire du principe de l'essai contrôlé randomisé. Nous avons alors estimé, à l'aide de rapport de risques, quel bénéfice de survie un patient donné (repéré à l'aide du MELD) pourrait avoir avec un greffon donné (repéré à l'aide du DRI-Optimatch) en le comparant avec le groupe de référence composé des patients (même MELD), éligibles à la greffe, restés sur liste dans l'attente d'un meilleur greffon (DRI-Optimatch plus petit).Dans une troisième étape, nous avons développé un système d'allocation basé sur le bénéfice de survie alliant deux grands principes dans l'allocation de greffons; l'urgence et l'utilité. Dans ce type de système, un greffon alloué est attribué au patient avec la plus grande différence entre la durée de vie post-transplantation prédite et la durée estimée sur la liste d'attente pour un donneur spécifique. Ce modèle est principalement basé sur deux modèles de Cox : un pré-greffe et un post-greffe. Dans ces deux modèles l'évènement d'intérêt étant le décès du patient, pour le modèle pré-greffe, la censure dépendante a été prise en compte. En effet, sur liste d'attente le décès est bien souvent censuré par un autre évènement : la transplantation. Une méthode dérivée de l'Inverse Probability of Censoring Weighting a été utilisée pour pondérer chaque observation. De plus, données longitudinales et données de survie ont aussi été utilisées. Un modèle "en partie conditionnel", permettant d'estimer l'effet de covariables dépendantes du temps en présence de censure dépendante, a été utilisé pour modéliser la survie pré-greffe.Après avoir développé un nouveau système d'allocation, la quatrième et dernière étape, nous a permis de l'évaluer à travers de simulation d'évènement discret ou DES : Discret Event Simulation
Liver transplantation (LT) is the only life-saving procedure for liver failure. One of the major impediments to LT is the shortage of organs. To decrease organ shortage, donor selection criteria were expanded with the use of extended criteria donor (ECD). However, an unequivocal definition of these ECD livers was not available. To address this issue, an American Donor Risk Index (DRI) was developed to qualify those grafts. But to whom should those ECD grafts be given? Indeed, a proper use of ECD grafts could reduce organ shortage. The aim of this thesis is to establish a new graft allocation system which would allow each graft to be transplanted in the candidate whose LT will allow the greatest survival benefit; and to evaluate the matching between donors and recipients taking into account ECD grafts.The first step was the external validation of the DRI as well as the resultant Eurotransplant-DRI score. However, calibration and discrimination were not maintained on the French database. A new prognostic donor score: the DRI-Optimatch was then developed using a Cox donor model with adjustment on recipient covariates. The model was validated by bootstrapping with correction of the performance by the optimism.The second step was to explore the matching between donors and recipients in order to allocate ECD grafts optimally. Consideration should be given to the donor and recipient criteria, as assessed by the DRI-Optimatch and the Model for End-stage Liver Disease (MELD), respectively. The sequential stratification method retained is based on the randomized controlled trial principle. We then estimated, through hazard ratios, the survival benefit for different categories of MELD and DRI-Optimatch compared against the group of candidates remaining on the wait list (WL) and waiting for a transplant with a graft of better quality (lower DRI-Optimatch).In the third step, we have developed an allocation system based on survival benefit combining the two main principles in graft allocation; urgency and utility. In this system, a graft is allocated to the patient with the greatest difference between the predicted post-transplant life and the estimated waiting time for a specific donor. This model is mainly based on two Cox models: pre-LT and post-LT. In these two models the event of interest being the death of the patient, for the pre-graft model, the dependent censoring was taken into account. Indeed, on the WL, death is often censored by another event: transplantation. A method derived from Inverse Probability of Censoring Weighting was used to weight each observation. In addition, longitudinal data and survival data were also used. A partly conditional model, to estimate the effect of time-dependent covariates in the presence of dependent censoring, was therefore used for the pre-LT model.After developing a new allocation system, the fourth and final step was to evaluate it through Discrete Event Simulation (DES)