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Dissertations / Theses on the topic 'SDM ADC'
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Dahl, Jonas, and Jesper Porelius. "ABC+SCM=Sant?" Thesis, Linköping University, Department of Management and Economics, 2006. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-5738.
Full textAbstract:
Background:
Companies of today commonly search to gain competitive advantages throughout different forms of co-operation, one of which is referred to as Supply Chain Management. Although little research has been assigned to the topic of how to manage and control this type of relation, lately a growing number of academics has been arguing that ABC is an appropriate mean of controlling this type of relationships.
Purpose:
The purpose of this thesis is to investigate to what degree the ongoing debate on the use of ABC as a mean of control within SCM correspond to the present theories related to ABC and SCM respectively.
Research method:
The thesis takes it’s starting point within the literature, meaning that the empirical information consists of published articles in the ongoing debate. This information is put in relation to the original theories concerning both topics.
Conclusions:
The results shown in the thesis in some content agrees with the ongoing debate referring to the positive aspects that could result from using ABC as a mean of control within SCM. However the main result of the study is the discovery of a lack of discussion concerning the problems that implementing ABC within SCM might implicate, a fact that we believe contributes to the mainly positive view on using ABC within Supply Chain Management.
Bakgrund
Företag av idag ingår i allt större utsträckning i någon form av samarbete för att på så vis skapa sig konkurrensfördelar på marknaden, en av dessa samarbetsformer går under beteckningen Supply Chain Management. Hur styrningen i denna typ av relation bör se ut är ett relativt outforskat ämne, dock finns det i dagens forskningsdebatt flera forskare som förespråkar ABC-kalkylering som ett lämpligt styrinstrument för denna typ av relationer.
Syfte
Syftet med uppsatsen är att undersöka hur väl den pågående forskningsdebatten gällande användandet av ABC som styrverktyg inom SCM överensstämmer med befintlig teoribildning inom de respektive forskningsområdena.
Genomförande
Studien tar sin utgångspunkt i litteraturen, med detta avses att den empiri som studeras består av publicerade artiklar i den aktuella debatten. Informationen ställs sedan i relation till den existerande teoribildningen inom ABC respektive SCM.
Slutsats
De resultat som framkommer ur studien visar på att den aktuella debatten i vissa avseenden har rätt i de positiva effekter ett ABC-system skulle kunna generera inom SCM. Men vad studien huvudsakligen kommer fram till är att det i forskningsdebatten saknas en ordentlig problematisering av ämnet, vilket enligt oss också förklarar den övervägande positiva syn som föreligger till användandet av ABC inom SCM.
2
Mas, Lauriane. "Caractérisation fonctionnelle des protéines AdcB et AdcC, deux membres du clan arrestine de l'amibe sociale Dictyostelium discoideum." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017GREAV031/document.
Full textAbstract:
Les protéines de la membrane plasmique jouent un rôle fondamental dans la détection des informations véhiculées par le milieu extracellulaire et l’adaptation des cellules aux variations de l’environnement. Elles font l’objet d’une régulation fine qui permet de moduler leur présence à la membrane et de contrôler les voies de signalisation en aval. Dans ce contexte, les arrestines qui constituent une superfamille de protéines adaptatrices, se sont imposées comme des régulateurs clés depuis la découverte des β-arrestines et arrestines visuelles, spécifiques des eucaryotes supérieurs, et de leur rôle dans la régulation des récepteurs couplés aux protéines G hétéro-trimériques, jusqu’à l’identification plus récente de nouveaux membres apparentés, présents des mammifères jusqu’aux protistes, et partageant un rôle commun de régulation de cargos membranaires. Ce travail de thèse porte sur la caractérisation fonctionnelle de deux représentants du clan arrestine de l’amibe Dictyostelium discoideum, les protéines AdcB et AdcC. Ces deux protéines partagent une même organisation multimodulaire, spécifique aux Dictyostélides, qui associe au cœur arrestine, un domaine putatif C2 de type calcium-binding et deux modules SAMs, respectivement aux extrémités N- et C-terminales des protéines. Nous avons établi que ces domaines apportent des fonctions spécifiques à ces arrestines en leur conférant la capacité de lier des lipides anioniques in vitro en réponse au calcium à travers leur module C2, et de former des structures homo- et hétéro-oligomériques via leurs domaines SAMs. En dépit de ces similarités, AdcB et AdcC présentent un comportement différent in cellulo dans la mesure où seul AdcC transloque à la membrane plasmique en réponse à une élévation du calcium cytosolique, provoquée par la stimulation des cellules par les chimioattractants AMPc et acide folique ou le calcium lui-même. Ces résultats ont été complétés par une étude phénotypique des mutants invalidés pour ces arrestines et la recherche de partenaires qui ouvrent des pistes pour des études futuresIntegral proteins of the plasma membrane play a major role in the detection of environmental cues and in the adaptation of cells to variations of their environment. Regulatory mechanisms modulate their presence at the cell surface and control the signaling cascades activated in response to their stimulation. In this context, members of the arrestin revealed to be key regulators, since the discovery of β- and visual arrestins and their well-described role in the regulation of G-protein coupled receptors in complex organisms, and the more recent identification of arrestin-related proteins, present from mammals to protists and sharing functions in membrane cargo trafficking. This work aims at the functional characterization of two arrestin-related proteins of the social amoeba Dictyostelium discoideum, the AdcB and AdcC proteins. These two members of the arrestin clan share a similar multimodular organization, specific to Dictyostelids, with a putative N-terminal calcium-binding type C2 domain and two C-terminal SAM domains surrounding the arrestin module. We showed that the C2 domain confers calcium-dependent binding properties to anionic lipids in vitro and that the SAM domains allow the self-association and hetero-interaction of the two proteins in complexes of high molecular weight. Despite these similarities, AdcB and AdcC harbor a distinct behavior in vivo as only AdcC translocates to the plasma membrane in response to an intracellular calcium rise triggered by the chemoattractants acid folic and cAMP or extracellular calcium. In parallel, a phenotypic characterization of adcB and adcC single or double null mutants and a search for partners were conducted, that open new avenues for future research on these adaptor proteins
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Thalmann, Markus Andreas. "A SDH Add/Drop Multiplexer as "System-On-Chip" /." Konstanz : Hartung-Gorre, 2000. http://www.loc.gov/catdir/toc/fy0601/00465005.html.
Full text
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Mehrez, Hanen. "Interface Radio SDR pour récepteur GNSS multi constellations pour la continuité de positionnement entre l’intérieur et l’extérieur." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLL008/document.
Full textAbstract:
Dans le but d’améliorer la disponibilité des services fournis par un récepteur, la conception d’un récepteur GNSS permettant de recevoir plusieurs signaux de toutes les bandes simultanément semble être la solution. Une architecture à sous échantillonnage RF optimisée de type SDR (Software Defined Radio) comportant un étage RF intégrable et reconfigurable et un étage de traitement numérique avec une implémentation logicielle du traitement en bande de base est défini pour ce récepteur GNSS, tout en répondant aux exigences des spécifications des standards GNSS : des réseaux radio cellulaires : GPS, Glonass, Galileo, Beidou. Un choix des composants discrets suite au dimensionnement system est effectué et ceci pour installer un prototype de validation expérimental. Ensuite nous nous s’intéressons à la caractérisation de la chaine RF afin d’étudier les limitations causés par la non linéarité et d’étudier la stabilité du prototype proposé. Un étage de traitement numérique des signaux IF, capturés à la sortie de l’ADC, est implémenté sous Matlab. L’acquisition de ces données permet la détermination des satellites visible à un instant donné qui nous permet éventuellement la détermination d’une positionIn order to improve the availability of services provided by a receiver, designing a GNSS receiver to collect multiple signals from all bands simultaneously seems to be the solution. An optimized software-defined RF (SDR) sub-sampling architecture with an integral and reconfigurable RF stage and a digital processing stage with a software implementation of the baseband processing is defined for this GNSS receiver, while meeting the requirements GNSS standards specifications: cellular radio networks: GPS, Glonass, Galileo, Beidou. Many discrete components are selected after system dimensioning. Thus, experimental validation prototype is installed. Then we are interested in the characterization of the RF front-end in order to determine the limitations caused by the nonlinearity and to study the stability of the proposed prototype. A stage of digital processing of the IF signals, captured at the ADC output, is implemented under Matlab software. The acquisition of these data allows the determination of satellites visible at a given instant that allows us to determine a position
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Chandor-Proust, Alexia. "Réparation de l'ADN par une protéine "radical-SAM" : étude de la spore photoproduct lyase." Phd thesis, Grenoble 1, 2008. http://www.theses.fr/2008GRE10210.
Full textAbstract:
Chez les spores de bactéries, le photoproduit le plus abondant formé dans l'ADN irradié par les UV est un dimère de thymines appelé Photoproduit des spores (SP, 5-(a-thyminyl)-5,6-dihydrothymine). Au début de la germination, ce photoproduit est spécifiquement réparé par une enzyme, la Spore Photoproduct Lyase (SPL), régénérant les deux résidus thymine originaux. Cette enzyme est une protéine Fe-S qui appartient à la famille des « Radical-SAM ». Les protéines de cette famille d'enzymes possèdent un centre [4Fe-4S], coordiné par 3 cystéines conservées organisées selon le motif CxxxCxxC, et utilisent la SAdénosylméthionine comme cofacteur. Elles fonctionnent toutes selon un mécanisme radicalaire, initié par la formation du radical 5'-désoxyadénosyle issu de la coupure homolytique de la S-Adénosylméthionine par le centre [4Fe-4S] réduit. Dans ce travail, nous avons effectué une caractérisation biochimique et spectroscopique des SPL de Clostridium acetobutylicum et Bacillus subtilis. Par ailleurs, nous avons synthétisé un substrat minimum sous la forme d'un dinucléoside monophosphate appelé SPTpT, pour lequel une caractérisation structurale par RMN a été réalisée. Le SPTpT est reconnu et efficacement réparé par l'enzyme, ce qui nous a permis d'obtenir de nouvelles informations sur le mécanisme enzymatique de réparation. Enfin, la séquence primaire des SPL contient une 4e cystéine conservée, essentielle à la réparation, mais qui n'est pas impliquée dans la coordination du centre [Fe-S]. Nous nous sommes intéressés au rôle de cette cystéine dans le mécanisme de réparation grâce à l'étude biochimique et enzymatique du mutant SPLC141AThe major photoproduct of UV-irradiated DNA from bacterial spores is 5-(a-thyminyl)-5,6-dihydrothymine, a unique thymine dimer called Spore Photoproduct (SP). At the beginning of germination, this photoproduct is specifically repaired by the Spore Photoproduct Lyase (SPL), regenerating the two thymine monomers. SPL belongs to a family of iron-sulfur enzymes named « Radical-SAM ». In this family, proteins have a [4Fe-4S] cluster, chelated by three cysteines highly conserved constituting the “Radical-SAM” motif CxxxCxxC, and use S-Adenosylmethionine as a cofactor. They all use a radical based mechanism, initiated by 5'-deoxyadenosyl radical formation, derived from the homolytic cleavage of S-Adenosylmethionine by the reduced [4Fe-4S] cluster. Here, we have characterized, by biochemical and spectroscopic methods, the recombinant SPL from Clostridium acetobutylicum or Bacillus subtilis. Furthermore, we have synthesized a novel substrate called SPTpT under the form of a dinucleoside monophosphate. The structural characterization of this compound, using NMR spectroscopy, has been carried out. Moreover, this substrate is recognized and efficiently repaired by this enzyme, providing a convenient way to investigate the repair mechanism. Finally, the sequence of all SPL contains a fourth well-conserved cysteine. Site-directed mutagenesis shows that this residue is strongly involved in the repair mechanism but not in the cluster formation. The role of this cysteine 141 in the catalytic mechanism has been studied
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Gustafsson, Hanna, and Sofie Eskilsson. "Simulating ADS-B and CPDLC messages with SDR." Thesis, Linköpings universitet, Institutionen för datavetenskap, 2020. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-166587.
Full textAbstract:
Several studies have shown insufficient security in air traffic communication. The increase in air traffic in recent years also increases the need for improved security. CPDLC is used to communicate in text over the data link and ADS-B determines the position of an aircraft. These techniques are looked upon and simulated in the thesis. By proving that ADS-B and CPDLC messages can be transmitted and received with cheap and easy access equipment we want to show the simplicity in performing an attack. The thesis state a foundation to simulate attacks in the future so further work concerning the lack of security can be done.
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Gay, Virginie. "Analyse des réponses cellulaires induites par l'intégration d'un ADN étranger au sein du génome." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00550487.
Full textAbstract:
Il existe un certain nombre de situations au cours desquelles l'intégrité du génome cellulaire est mise en danger. Ceci se produit notamment lors de mouvements de gènes (translocation, éléments mobiles), lors d'infections virales parfois intégratives (AAV, HBV, HPV) ou lors d'infections rétrovirales. En effet, le cycle de réplication des rétrovirus nécessite une étape d'intégration du génome viral dans l'ADN génomique de la cellule infectée. Malgré les nombreuses études menées sur les infections par le VIH, les cancers viro-induits ou non et les thérapies géniques basées sur les rétrovirus, aucune donnée n'est actuellement disponible sur les modifications cellulaires induites par de telles perturbations chromosomiques. L'objectif du projet était d'identifier des mécanismes cellulaires induits par des atteintes à l'intégrité du génome, plus précisément par l'insertion de molécules d'ADN non cellulaire dans les chromosomes. L'intégration de matériel génétique additionnel a été induite par des vecteurs lentiviraux dérivés du VIH-1. Les modifications cellulaires uniquement dues à l'intégration ont été isolées par comparaison de vecteurs intégratif et non intégratif. Des cellules primaires du derme humain ont été sélectionnées pour l'étude. Les temps post infection et les doses virales les plus adéquates ont été sélectionnés grâce à des expériences de cinétiques d'intégration couplées à une quantification des ADN viraux intégrés. L'analyse des modifications cellulaires induites par l'intégration de l'ADN étranger a portée sur l'ensemble du transcriptome et sur l'ensemble du protéome cellulaire. Dans le but d'effectuer une analyse transcriptomique, des puces à ADN, représentant le génome humain complet, ont été utilisées. Cette étude a démontré une forte répression transcriptionnelle induite par l'intégration. De plus, toutes les fonctions cellulaires sont perturbées par le processus. Finalement, une classification par interactions et fonctions biologiques a mis en évidence cinq processus cellulaires majoritairement affectés par l'intégration de l'ADN étranger, qui correspondent au cycle et à la mort cellulaire, au remodelage et à la réparation de la chromatine et à la réponse immunitaire ou au stress. Dans le but de compléter cette analyse transcriptomique, une étude protéomique a été réalisée. Les protéines cellulaires ont été séparées sur des gels bi-dimensionnels. Parmi les neuf protéines identifiées en spectrométrie de masse, certaines appartiennent au cytosquelette et d'autres aux mécanismes de réponse au stress. L'intégration d'un ADN étranger au sein du génome provoque donc bien des perturbations cellulaires. L'intégration de matériel génétique additionnel ne concernant pas seulement les rétrovirus, les données obtenues lors de cette étude pourront permettre (i) de développer des stratégies de défenses contre les rétrovirus ou contre les autres maladies caractérisées par des atteintes à l'intégrité du génome, (ii) d'évaluer les risques encourus par l'intégration d'un vecteur thérapeutique dans le génome cellulaire lors des thérapies géniques ou des expériences de transfert de gènes.
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au, jeremy shaw@uwa edu, and Jeremy Shaw. "Biomineralisation processes in the radula teeth of the chiton Acanthopleura hirtosa (Mollusca: Polyplacophora)." Murdoch University, 2007. http://wwwlib.murdoch.edu.au/adt/browse/view/adt-MU20080703.163505.
Full textAbstract:
A detailed row by row investigation of major lateral tooth cusp mineralisation, together with the concomitant development of the superior epithelial tissue surrounding the teeth of the chiton Acanthopleura hirtosa has been undertaken using a combination of light microscopy, and scanning and transmission electron microscopy. A holistic approach has been adopted that encompasses observations over a range of spatial scales, from whole radula mineralisation processes to those occurring within individual tooth cusps at various stages of development. In addition, mineralisation in radulae from freshly collected animals has been compared to that of animals maintained for extensive periods within a newly developed iron limited system, which restricts radula mineralisation without impeding the formation of the organic matrix.
An evaluation of the iron limitation technique has revealed that maintaining specimens of A. hirtosa within an iron poor environment results in a significant departure from the normal pattern of mineralisation in these animals. As a consequence of iron limitation, there is an obvious increase in the number of unmineralised tooth rows in addition to associated alterations in structure and composition at all stages of tooth development.
In normal specimens of A. hirtosa, the onset of mineralisation in the tooth cusps occurs following the prior accumulation of iron at the junction zone and the sudden accumulation of iron containing granules in the cusp epithelium at tooth row 13. The superior epithelium surrounding the tooth cusps undergoes a series of developmental changes leading up to, and following, the onset of mineralisation. In particular, the abundance of mitochondria within the apical cusp epithelium increases, presumably in order to provide the ideal conditions of pH, and thus solubility, needed for the supersaturation of iron and its nucleation at row 13. Once mineralisation has commenced, the microvilli attached to the cusps develop rapidly, and are suggested to do so in order to facilitate the transport of iron, and thereby ensure that a high concentration gradient of this element into the cusps is maintained.
The delivery of iron into the cusps occurs from two fronts, the first from the superior epithelium via the posterior surface, and the second from the junction zone via an internal pathway situated along the lepidocrocite boundary between the magnetite and core regions of the tooth. The existence of a plume of elements between this internal mineralisation pathway and the junction zone, provides the first direct evidence that the junction zone is involved in the storage and release of elements for cusp mineralisation. Data from iron limited radulae also indicate that iron continues to be deposited at the junction zone in preference to the superior epithelium or cusps, despite the disruption of mineralisation, highlighting the importance of this region in the mineralisation process.
Iron reinstatement experiments have also shown that the internal pathways of iron delivery within the organic matrix remain viable, despite prolonged periods of iron limitation. In addition, the reinstatement of iron has revealed that the plumes, situated between the junction zone and internal mineralising pathway of the cusp, stem from the centre of the plate like junction zone, directly above the stylus canal, a tube like cavity situated within the styli of each major lateral tooth.
An in depth study of the stylus canal has revealed that cells within the canal are remarkably similar to those of the epithelium surrounding the cusps, suggesting that this structure may also be involved in the delivery of ions to the junction zone. The stylus canal is shown to be present in the major lateral tooth cusps of 38 chiton species distributed worldwide, and is therefore likely to be a feature common to all chitons. The presence of the canal, and indeed its absence from the bases of all remaining non iron mineralised teeth, irrespective of chiton species, also points strongly to a functional relationship between the stylus canal and tooth cusp mineralisation.
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Seelam, Venkata Naga Siva. "Settings Protection Add-on: A User-Interactive Browser Extension to Prevent the Exploitation of Preferences." Wright State University / OhioLINK, 2017. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=wright1495032172983422.
Full text
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au, minakshi@murdoch edu, and Manickam Minakshi Sundaram. "Electrochemistry of Cathode Materials in Aqueous Lithium Hydroxide Electrolyte." Murdoch University, 2006. http://wwwlib.murdoch.edu.au/adt/browse/view/adt-MU20061210.143803.
Full textAbstract:
Electrochemical behavior of electrolytic manganese dioxide (EMD), chemically prepared battery grade manganese dioxide (BGM), titanium dioxide (TiO2), lithium iron phosphate (LiFePO4) and lithium manganese phosphate (LiMnPO4) in aqueous lithium hydroxide electrolyte has been investigated. These materials are commonly used as cathodes in non-aqueous electrolyte lithium batteries. The main aim of the work was to determine how the electroreduction/oxidation behavior of these materials in aqueous LiOH compares with that reported in the literature in non-aqueous electrolytes in connection with lithium batteries. An objective was to establish whether these materials could also be used to develop other battery systems using aqueous LiOH as electrolyte.
The electrochemical characteristics of the above materials were investigated by subjecting them to slow scan cyclic voltammetry and determining the charge/discharge characteristics of Zn/cathode material-aqueous LiOH batteries. The products of electroreduction/oxidation were characterized by physical techniques using X-ray diffraction (XRD), scanning electron micrography (SEM), X-ray photoelectron spectroscopy (XPS), secondary ion mass spectrometry (SIMS), Thermogravimetric analysis (TG) and infra-red spectrometry (IR).
The reduction of ã-MnO2 (EMD) in aqueous lithium hydroxide electrolyte is found to result in intercalation of Li+ into the host structure of ã-MnO2. The process was found to be reversible for many cycles. This is similar to what is known to occur for ã-MnO2 in non-aqueous electrolytes. The mechanism, however, differs from that for reduction/oxidation of ã-MnO2 in aqueous potassium hydroxide electrolyte. KOH electrolyte is used in the state-of-art aqueous alkaline Zn/MnO2 batteries. Alkaline batteries based on aqueous KOH as the electrolyte rely upon a mechanism other than K+ intercalation into MnO2. This mechanism is not reversible. This is explained in terms of the relative ionic sizes of Li+ and K+. The lithium-intercalated MnO2 lattice is stable because Li+ and Mn4+ are of approximately the same size and hence Li+ is accommodated nicely into the host lattice of MnO2. The K+ ion which has almost double the size of Li+ cannot be appropriately accommodated into the host structure and hence the K+ -intercalated MnO2 phase is not stable.
Chemically prepared battery grade MnO2 (BGM) is found to undergo electroreduction/oxidation in aqueous LiOH via the same Li+ intercalation mechanism as for the EMD. While the Zn/BGM- aqueous LiOH cell discharges at a voltage higher than that for the Zn/EMD- aqueous LiOH cell under similar conditions, the rechargeability and the material utilization of the BGM cell is poorer.
The cathodic behavior of TiO2 (anatase phase) in the presence of aqueous LiOH is not reversible. In addition to LiTiO2, Ti2O3 is also formed. The discharge voltage of the Zn/TiO2- aqueous LiOH cell and material utilization of the TiO2 as cathode are very low. Hence TiO2 is not suitable for use in any aqueous LiOH electrolyte battery.
LiFePO4 (olivine-type structure) as a cathode undergoes electrooxidation in aqueous LiOH forming FePO4. However the subsequent reduction forms not only the original LiFePO4 but also Fe3O4. Thus the process is not completely reversible and hence LiFePO4 is not a suitable material for use as a cathode in aqueous battery systems.
LiMnPO4 (olivine-type structure) undergoes reversible electrooxidation in aqueous LiOH forming MnPO4. The charge/discharge voltage profile of the Zn/MnPO4-aqueous LiOH cell, its coulombic efficiency and rechargeability are comparable to that of the cell using ã-MnO2. EMD and LiMnPO4 both have the potential for use in rechargeable batteries using aqueous LiOH as the electrolyte. Recommendations for further developmental work for such batteries are made.
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Pita, Zijad, and zijad pita@rmit edu au. "Strategic Information Systems Planning (SISP) in Australia Assessment and Measurement." RMIT University. Business Information Technology, 2007. http://adt.lib.rmit.edu.au/adt/public/adt-VIT20080514.162332.
Full textAbstract:
Strategic Information Systems Planning (SISP) is an important activity for helping Chief Information Executives (CIOs) and top management identify strategic applications and align Information Technology (IT) with business needs. Like all strategic planning, SISP requires measuring how well SISP is done and how planning is improving over time. The measurement of these intangibles is a complex exercise. There have been few efforts undertaken in the Information Systems (IS) literature to formally develop a model for assessing and measuring SISP efforts. In this study, two models were proposed: a five-stage SISP maturity model for defining SISP maturity and another one for assessing the degree of SISP maturity. The five SISP maturity levels were defined as: Rudimentary Planning, Ineffectual Planning, Attainable Planning, Sustainable Planning, and Adaptable Planning. The assessment model was structured as a third-order system, where eight first-order dimensions were termed as Form and Content, Collaboration, Policies, Stakeholders' Designation, Knowledge Bank, Technology, Time Dimension, and Viability. The first-order dimensions were grouped into three second-order constructs, namely Effectiveness, Efficiency and Manoeuvrability, which ultimately characterise the level of SISP success. This model was used to establish a theoretical benchmark for each SISP maturity level. To model the level of SISP maturity, an 'Integral Engineering' approach was established and the Analytic Network Process (ANP) theory was used. The study is a novel approach in using ANP to synthesize the measures of the various SISP constructs into a single overall measure of SISP maturity level. A survey was performed and data collected from 260 Australian organisations to examine the degree of SISP maturity and the relationships among SISP constructs. Structural equation modelling (SEM) was used to test the fit between the hypothesized model and the survey data The models were applied to the data collected and the findings suggested that the models fit the data well. While Effectiveness and Efficiency are well recognised planning constructs, Manoeuvrability as a measure of planning dynamics is not acknowledged in the literature as an equally important construct. This study confirmed a strong correlation between Manoeuvrability and SISP success and found it to be more important than the Efficiency construct. The empirical data did not confirm the existence of Rudimentary and Ineffectual planning levels of SISP maturity Australia-wide. SISP maturity in the majority of Australian organisations is at Sustainable and Attainable planning levels. A small percentage of the surveyed organisations have actually reached the highest planning level (Adaptable planning). The empirical data showed that current SISP is lacking strategic dimension and that the recently popularised one-year planning horizon may not be the best choice. Australian organisations did not consider the strategic relevance of IT as the key objective. IT/IS was seen as a business enabler, thus the strategic advan tage associated with IT came as a secondary objective.
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Goulpeau, Jacques. "Intégration de puce à ADN dans un microsystème fluidique." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2006. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00002226.
Full textAbstract:
Ce travail de thèse présente la conception et la réalisation de dispositifs microfluidiques en PDMS (Polydiméthylsiloxane) pour l'intégration d'analyses biologiques. Dans un premier temps, des outils microfluidiques sont construits et améliorés dans ce but: une méthode de pompage passif et de mise en oeuvre du PDMS a fait l'objet d'un dépôt de brevet. Les micro-pompes, éléments clés d'une intégration poussée, sont étudiées expérimentalement et théoriquement, menant à un modèle prédictif basé sur une équivalence électrique. Ce travail a été publié dans \textit{Journal of Applied Physics}. La dispersion hydrodynamique, diluant les échantillons lors de leur transport est caractérisée. De cette analyse, une nouvelle méthode de génération de gradients de concentration est conçue et testée expérimentalement. Fort de ces développements, une plate-forme microfluidique originale intégrant des puces à ADN est fabriquée en une version de laboratoire et une version portable. Grâce à ce dispositif, les connaissances de la réaction d'hybridation sur une surface, base des puces à ADN, sont complétées par des mesures comparées de courbes de fusion et un modèle de couplage réaction-diffusion-advection est étendu expérimentalement au cas des puces à ADN. Finalement dans le cadre d'une collaboration avec l'IGH (Institut de Génétique Humaine) de Montpellier, deux méthodes originales de dosage d'allèles pour la trisomie 21 sont testées et des expériences sur des échantillons biologiques sont en cours de préparation. En conclusion, cette thèse a donné lieu au dépôt d'un brevet et à la publication deux articles. Elle aura abouti à la mise en oeuvre de méthodes et approches originales basées sur la technologie microfluidique, appliquées à différents domaines (dispersion, pompage, puce à ADN).
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REYMOND, Nancie. "Bioinformatique des puces à ADN et application à l'analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola." Phd thesis, INSA de Lyon, 2004. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00008630.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est l'étude par la technologie des puces à ADN, du transcriptome de la bactérie Buchnera aphidicola, qui vit en symbiose avec le puceron du pois Acyrthosiphon pisum. Le génome extrêmement réduit de Buchnera a perdu l'essentiel de ses gènes de régulation, mais conserve les voies de biosynthèse permettant la production des acides aminés essentiels pour son hôte. La première partie de cette thèse concerne le développement du logiciel ROSO, qui permet de déterminer les sondes oligonucléotidiques destinées aux puces. Une interface a été conçue pour son utilisation en ligne (http://pbil.univ-lyon1.fr/roso). Dans une seconde partie, la conception et l'utilisation d'une puce dédiée à Buchnera ont permis d'étudier le transcriptome de la bactérie, lorsque son hôte subit un stress nutritionnel et osmotique. Cette analyse montre que Buchnera est capable de réguler son expression génique et de réorienter son métabolisme, pour répondre à la demande changeante de son hôte.
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Belbahri, Lassaad. "Clonage du gène sam-1 d'Arabidopsis thaliana dans des cellules indifférenciées de tabac : effets métaboliques et co-suppression." Compiègne, 1998. http://www.theses.fr/1998COMP1095.
Full textAbstract:
La production des métabolites secondaires par les cultures de cellules indifférenciées est souvent limitée par la méconnaissance des voies métaboliques et de leur régulation. Dans le but d'étudier la relation entre l'accumulation de la S-adénosylméthionine (unique agent de méthylation dans les cellules) et la production des alcaloïdes nicotiniques du tabac, des protoplastes de tabac ont été transformés avec le gène sam-1 d'Arabidopsis thaliana. Des lignées transgéniques ont été obtenues et des plantes ont été régénérées à partir de certaines de ces lignées. L'analyse de l'activité SAM-s de ces lignées a permis de mettre en évidence qu'un certain nombre de transformant présente le phénomène de silence des gènes. L'analyse du contenu alcaloïdique dans ces cals de tabac a permis de mettre en évidence d'importants changements en fonction de la quantité de SAM présente dans les cellules. Les plantes transgéniques de tabac présentent jusqu'à deux fois plus de nicotine et de nornicotine que les témoins. Ces résultats confirment la notion de plasticité du métabolisme des plantes décrite par plusieurs auteurs. Le clonage d'ADNc correspondant à la S-adénosylhomocystéine hydrolase et à des homologues d'histones déacétylases d'Arabidopsis thaliana est aussi présenté.
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Neuvial, Pierre. "Contributions à l'analyse statistique des données de puces à ADN." Phd thesis, Université Paris-Diderot - Paris VII, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00433045.
Full textAbstract:
Cette thèse traite de questions statistiques soulevées par l'analyse de données génomiques de grande dimension, dans le cadre de la recherche contre le cancer. La première partie est consacrée à l'étude des propriétés asymptotiques de procédures de tests multiples visant à contrôler l'espérance (FDR) du taux de fausses découvertes (FDP) parmi les hypothèses rejetées. On introduit un formalisme flexible qui permet de calculer la loi asymptotique du FDP et les conditions de régularité associées pour une vaste famille de procédures de tests multiples, et de comparer la puissance de ces procédures. On s'intéresse ensuite aux liens en termes de contrôle du FDR entre les bornes intrinsèques à trois problèmes de tests multiples: la détection, l'estimation, et la sélection. On relie en particulier la vitesse de convergence dans le problème d'estimation à la régularité de la loi des probabilités critiques au voisinage de 1. La seconde partie est dédiée au développement de méthodes d'analyse des données de puces à ADN en cancérologie. On propose une méthode de pré-traitement des données de puces à ADN combinant une régression robuste et un modèle de mélange avec contrainte spatiale, qui permet d'éliminer les biais spatiaux en préservant le signal biologique. On développe ensuite une méthode d'inférence de régulations entre gènes à partir de données d'expression de gènes, qui repose sur des techniques d'apprentissage informatique et de tests multiples. Enfin, on construit un test génomique permettant de déterminer, pour une patiente traitée pour un cancer du sein, si un second cancer survenant sur le même sein est ou non une récidive du premier.
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Berthier, Alexandre. "Développement d'outils « biocapteurs/modèle cellulaire » pour l'identification de ligands et l'étude des interactions ADN/protéine et protéines/protéines." Phd thesis, Université de Franche-Comté, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00404562.
Full textAbstract:
Les estrogènes contribuent au contrôle de l'expression de nombreux gènes cibles en interagissant avec les Récepteurs aux Estrogènes (RE). Ces récepteurs sont des facteurs de transcription qui interagissent avec une séquence cis-régulatrice, appelée Elément de Réponse aux Estrogènes (ERE). Un criblage de molécules capables de lier les RE et de moduler l'expression génique apporte un intérêt thérapeutique (ménopause, cancers hormonodépendant) et des intérêts dans les domaines de la santé publique et de l'écologie (perturbateurs endocriniens). Nous avons développé deux modèles de biocapteurs reposant sur le principe de Résonance Plasmonique de Surface. Une telle démarche permet de réduire le coût et le temps expérimental nécessaire au criblage d'une chimiothèque. Par ailleurs, la validation de l'utilisation de tels outils nécessite la corrélation des résultats à ceux obtenus à l'aide d'un modèle biologique plus complexe. Ainsi, nous avons développé, un modèle de cellules humaines de cancer du sein (MCF-7) transfectées par un vecteur rapporteur. La mise en place en parallèle de ces deux modèles a permit d'identifier un nouveau phytoestrogène agoniste de REa : la 7-O-ß-Dglucopyranolychrysine. L'un de nos biocapteurs est compatible avec l'étude des interactions protéines/protéines. Nous avons donc appliqué ce modèle à la recherche de partenaires de la protéine GEC1 codé par un gène régulé par les estrogènes. En conclusion, nous avons développé en parallèle des biocapteurs ADN/protéine et un modèle cellulaire permettant l'identification de xénoestrogènes (7-O-ß-D-glucopyranolychrysine), ainsi qu'un biocapteur protéines/protéines permettant le criblage de partenaires protéiques.
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Le, Bihan Yann-VaÏ. "Etude structurale et fonctionnelle de la reconnaissance et de la métabolisation de lésions puriques et pyrimidiques dans l'ADN par la Formamidopyrimidine-ADN glycosylase." Phd thesis, Université d'Orléans, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00488816.
Full textAbstract:
Les oxydations sur les bases nucléiques constituent l'une des sources principale d'apparition de lésions sur l'ADN, qui peuvent être mutagènes ou létales pour les cellules en l'absence de réparation de l'ADN. La Formamidopyrimidine-ADN glycosylase (Fpg), une enzyme procaryote du système de réparation de l'ADN par excision de base (BER), initie la réparation d'un large panel de lésions de ce type via ses activités ADN glycosylase (excision de la base oxydée) et AP lyase (clivage du site abasique par ß,d-élimination). Nous avons réalisé des études fonctionnelles par des techniques biochimiques et structurales par cristallographie des rayons X afin de préciser la spécificité de substrat et le mécanisme catalytique de Fpg. Ainsi, nous avons pu mettre en évidence des déterminants structuraux permettant à cette enzyme d'accommoder des lésions de tailles très différentes dans son site actif, en l'occurrence des résidus 2,6-diamino-4-hydroxy-5-formamidopyrimidine (FapyG) substitués ou non en N7 par des adduits encombrants. D'autre part, nous avons caractérisé structuralement et fonctionnellement la reconnaissance et l'excision par Fpg d'une lésion pyrimidique, la 5-hydroxy-5-méthyle-hydantoïne (Hyd). Ainsi, nous avons montré que cette lésion appariée à une cytosine était un bon substrat pour l'enzyme, et nous avons précisé structuralement le mode de reconnaissance de l'Hyd par Fpg. D'autre part, nous avons mis en évidence un comportement inattendu de l'enzyme sur ce substrat. En l'occurrence, nous avons montré biochimiquement et structuralement qu'un pontage covalent se formait en quantités non négligeables entre Fpg et l'Hyd dans des conditions physiologiques.
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Dumont, Marylin. "Mecanismes impliques dans la formation des anomalies chromosomiques lors de la meiose en absence de brca2 chez la plante arabidopsis thaliana." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00632489.
Full textAbstract:
En phase somatique, plusieurs mécanismes de réparations de l'ADNinterviennent pour réparer les cassures double brin (CDB) de l'ADN. Enphase méiotique, les CDB de l'ADN engendrées de façon programmées parSpo11 sont réparées par la recombinaison homologue (RH) dont les acteursprincipaux sont Rad51 et Dmc1 aidés de Brca2. Chez Arabidopsis, en absencede Brca2, le déroulement méiotique est perturbé, les chromosomes nes'associent pas en bivalents, ils apparaissent emmêlés. Ainsi, en absencede Brca2, la recombinaison homologue pourrait ne plus être fonctionnelleet les anomalies chromosomiques observées pourraient être le résultat deréparations aberrantes des CDB de l'ADN effectuée par d'autres mécanismesde réparation de l'ADN. Nous avons montrés, chez Arabidopsis, que le Nonhomologous End Joining (NHEJ) et/ou le Single Strand Annealing (SSA),mécanismes de réparation des CDB de l'ADN en phase somatique,n'intervenaient pas en phase méiotique dans la formation des anomaliesobservées en absence de Brca2. Toujours dans l'hypothèse où ces figuresméiotiques soient le résultat de liaisons covalentes, nous avons regardési les ADN-ligases ne pourraient pas être impliquées. Ainsi, nous avons pumontrer que la Ligase 6, ADN-ligase spécifique des plantes, n'avait pas derôle dans les anomalies chromosomiques observées en méiose en absence deBrca2. D'ailleurs la Ligase 6 ne semble pas non plus intervenir dans lesfigures chromosomiques observées chez les mutants rad51 et mnd1. Le rôlede la Ligase 6 n'ayant pas été déterminé lorsque nous avons démarré cetravail, nous avons voulu identifier son le rôle en étudiant le mutantcorrespondant. Le mutant ligase 6 ne présente pas de sensibilité auxstress génotoxiques utilisés ce qui indique que la Ligase 6 ne semble pasintervenir dans la réparation de l'ADN. La mutation dans le gène LIGASE Iest létal à l'état homozygote, de plus nous avons pu observer uneségrégation anormale chez l'hétérozygote mutant pour le gène LIGASE I. Lalétalité du mutant ligase I a été contournée par l'utilisation d'unsystème ARNi pour éteindre l'expression du gène LIGASE I uniquement enméiose. Cependant, l'implication de la Ligase I, dans les anomaliesméiotiques observées en absence de Brca2 n'a pas pu être déterminée.Enfin, nous avons confirmé que, chez Arabidopsis, Xrcc4 avait un rôle dansle NHEJ via son interaction avec la Ligase IV et via la sensibilité dumutant xrcc4 à différents stress génotoxiques. En revanche, Xrcc4-like nesemble pas interagir avec les acteurs du complexe de ligation du NHEJ etle mutant ne présente pas de sensibilité aux stress génotoxique, indiquantque cette protéine n'est pas impliquée dans le NHEJ et plus généralementdans les mécanismes de réparation de l'ADN.
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Anderson, Christopher R. "A Software Defined Ultra Wideband Transceiver Testbed for Communications, Ranging, or Imaging." Diss., Virginia Tech, 2006. http://hdl.handle.net/10919/29026.
Full textAbstract:
Impulse Ultra Wideband (UWB) communications is an emerging technology that promises a number of benefits over traditional narrowband or broadband signals: extremely high data rates, extremely robust operation in dense multipath environments, low probability of intercept/detection, and the ability to operate concurrently with existing users. Unfortunately, most currently available UWB systems are based on dedicated hardware, preventing researchers from investigating algorithms or architectures that take advantage of some of the unique properties of UWB signals.
This dissertation outlines the development of a general purpose software radio transceiver testbed for UWB signals. The testbed is an enabling technology that provides a development platform for investigating ultra wideband communication algorithms (e.g., acquisition, synchronization, modulation, multiple access), ranging or radar (e.g., precision position location, intrusion detection, heart and respiration rate monitoring), and could potentially be used in the area of ultra wideband based medical imaging or vital signs monitoring. As research into impulse ultra wideband expands, the need is greater now than ever for a platform that will allow researchers to collect real-world performance data to corroborate theoretical and simulation results.
Additionally, this dissertation outlines the development of the Time-Interleaved Analog to Digital Converter array which served as the core of the testbed, along with a comprehensive theoretical and simulation-based analysis on the effects of Analog to Digital Converter mismatches in a Time-Interleaved Sampling array when the input signal is an ultra wideband Gaussian Monocycle. Included in the discussion is a thorough overview of the implementation of both a scaled-down prototype as well as the final version of the testbed. This dissertation concludes by evaluating the of the transceiver testbed in terms of the narrowband dynamic range, the accuracy with which it can sample and reconstruct a UWB pulse, and the bit error rate performance of the overall system.Ph. D.
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Hsu, Jean Edwina, and n/a. "An exploratory study of student and instructor characteristics to determine the extent to which self-directed learning can be introduced in the undergraduate curriculum in the Philippines." University of Canberra. Professional and Community Education, 1998. http://erl.canberra.edu.au./public/adt-AUC20050418.100706.
Full textAbstract:
This research was in the area of self-directed learning, largely resulting from
the researcher's experience with it whilst in Australia. However, the intent of this
study was to consider factors which would affect the implementation of self-directed
learning principles into the Philippine context.
Education in the Philippines can be described as primarily engaged in the
transmission of knowledge. The structure and culture of education in the Philippines
is one that largely supports a teacher-directed learning environment. Students are
conditioned to be dependent on teachers and are used to studying with the security
of a clear structural plan with very limited opportunities to apply self-directed
learning principles. This approach to education produces static knowledge and
denies the expression and cultivation of the learner. Hence, there is a need to
promote self-directed learning as part of the curriculum.
In attempting to introduce self-directed learning (SDL) in the Philippines, it is
important to analyse student and instructor characteristics which could influence the
extent to which it is applied in the undergraduate university curriculum. This
research project gathers in-depth information on the conduciveness of integrating
self-directed learning in the undergraduate curriculum of De La Salle University
(DLSU) in the Philippines.
This exploratory study aimed to respond to the statement "What is the level of
readiness for self-directed learning of undergraduate students from De La Salle
University? What are the student's perceptions of education, their role in the
educational process, the role of peers and the role of their instructors? What is the
instructor's education orientation? What are the perception of instructors on the
purpose of education, the nature of learners, characteristics of learning
experiences, management of learning experiences, evaluation and the relationship
between the educators and learners and between learners themselves? Are these
perceptions similar and would it be possible to introduce self-directed learning
principles to an undergraduate curriculum for traditional students in De La Salle
University?" The response to these questions could be used in determining whether
self-directed learning principles could in fact be applied in the Philippines, as well as
determine the appropriate balance of pedagogical and andragogical instruction
techniques.
Twenty-three instructors and one hundred students from De La Salle University
in the Philippines participated in the study. Instructors completed the Educational
Orientation Questionnaire and students completed the Self-Directed Learning
Readiness Survey. Follow up intewiews were also conducted to confirm findings
resulting from the survey.
Findings indicate that instructors have an orientation that is a combination of
both pedagogical and andragogical techniques and that students perceive
themselves as having self-directed learning readiness. As a number of learning
situations already utilise andragogical and self-directed learning principles, the
challenge is to promote and encourage SDL and implement it on a wider scope.
Some recommendations have been included in this research on how to implement it
in De La Salle University.
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De, Rycker Manu. "Characterization of Tankyrase Structure & Function; Evidence for a Role as a Master Scaffolding Protein." University of Cincinnati / OhioLINK, 2005. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=ucin1102619078.
Full text
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Martin, del Campo Barba Sandra Teresita. "Identification des paramètres d'authenticité du lait et des produits laitiers." Phd thesis, INAPG (AgroParisTech), 2006. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00002659.
Full textAbstract:
Dans le présent travail, la pertinence de la spectroscopie moyen infrarouge à transformée de Fourier (IRTF), combinée avec des techniques chimiométriques, pour identifier quelques paramètres d'authenticité de laits et de fromages est évaluée. Les modèles discriminants, obtenus à partir des profils spectraux MIR, ont permis de : - classer les échantillons de lait et de produits similaires selon leur dénomination, - de prédire l'âge de fromages de type Camembert et Emmental, - de prédire différents paramètres physicochimiques caractéristiques de fromages de type Camembert pendant leur affinage. Les meilleurs modèles discriminants entre les échantillons de lait, en fonction de leur authenticité et de leur niveau d'adultération, ont été obtenus pour le profil des acides grases méthylés (FAMES). Les résultats montrent que la spectroscopie moyenne infrarouge à transformée de Fourier (IRTF) constitue une méthode rapide et directe pour identifier les laits et produits similaires, et pour prédire les durées d'affinage de fromages de type Camembert et Emmental. Mots Clés: Spectroscopie infrarouge, authenticité, lait, affinage de fromage, Camembert, Emmental, ACP, PLS, ADG
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Fils, Ebba, Clara Harrison, and Mathilda Nilsson. "Swedes only hate queue jumpers they don't know : A description of brand attitudes on Google's SERPs." Thesis, Linnéuniversitetet, Institutionen för marknadsföring (MF), 2018. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:lnu:diva-75866.
Full textAbstract:
Background: The Internet has developed the world of advertising by giving advertisers the possibility to track specific patterns among their consumers, which shows how consumers are clicking on online advertisements and what translates into sales for the brand. Lately, companies have actively starting to make use of search engines marketing (SEM). The paid advertising on search engines is one option to make a brand’s website visible to its consumers. The attitudes towards advertisements have previously been examined in traditional media and in other online settings, but the research in the context of search engines is limited. Therefore, it calls for deeper insights and knowledge in how consumers hold attitudes towards a brand and its paid advertising on search engines such as Google. Purpose: The purpose is to describe how users’ attitudes towards brands are influenced by the fact that brands have paid for advertising on search engine result pages. This is done through the ABC-model of attitudes. The question asked in this study was: How does paid advertising displayed on search engines affect the attitudes held towards a brand? Methodology: This thesis project used a qualitative approach and was of descriptive nature. The data was gathered through seven unstructured in-depths interviews based on a quota sample considering three criteria: age group, in this case, 18-29-year-olds, and the variable of regular e-commerce buyers, as well as the participants being users of the search engine Google. The researchers verified data saturation at seven interviews. Conclusion: The main finding in this study is that the level of familiarity influences the participants attitudes towards the brand. Previous experience and knowledge with a brand was an affecting factor of how they interpreted the brand’s advertising on Google’s search engine result pages. Knowledge and a positive experience with a brand generated a more positive attitude towards the brand when an unknown brand generated a neutral or more negative attitude towards the brand. Related factors that also influenced the study were the clicking pattern, the landing page, the choices of wording and the intended target groups by the brands. The study also presents a range of recommendations for future research, as well as theoretical and managerial implications.
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Hembury, Alexandra. "Barrière hémato-encéphalique humaine et endothéline 1 : régulation des transporteurs ABC et des cytokines inflammatoires." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00364210.
Full textAbstract:
Le système nerveux central est un organe complexe et privilégié, protégé, entre autres, par la barrière hémato-encéphalique (BHE), sur laquelle se trouvent des transporteurs d'efflux telle que la P-glycoprotéine (Pgp).La BHE est impliquée dans la neuro-inflammation et les maladies cérébrales associées, et la littérature laisse penser que l'endothéline 1 (ET-1) y joue un rôle important. En utilisant un modèle in vitro autologue de BHE humaine adulte et un modèle in vitro de BHE humaine fœtale (co-culture de cellules gliales et de cellules endothéliales microvasculaires cérébrales), nous avons étudié l'effet de l'ET-1 sur la Pgp.
Une différence, en termes de modulation de l'activité de la Pgp, a été observée entre la BHE fœtale et la BHE adulte suite à l'exposition à l'ET-1. Nous avons également évalué la modulation induite par l'ET-1 sur la sécrétion de la MCP-1 (Monocyte chemoattractant protein 1) et de l'IL-8. Les résultats montrent que l'ET-1 diminue l'activité de la Pgp et induit la sécrétion de MCP-1 et d'IL-8.
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Nzengue, Yves. "Comparaison des mécanismes de toxicité redox du cadmium, du cuivre et du zinc : place des métallothionéines et de p53." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00281577.
Full textAbstract:
Les dommages engendrés par l'exposition au cadmium (Cd) proviennent non seulement de l'inactivation de diverses molécules antioxydantes mais aussi de l'interférence du métal avec d'autres systèmes impliqués dans la régulation de l'homéostasie redox et de l'homéostasie de métaux essentiels comme le zinc (Zn) et le cuivre (Cu). Afin de mieux comprendre l'implication du stress oxydant dans les mécanismes de toxicité induits par ces métaux de transition, nous avons analysé leur impact sur la balance antioxydante (biomarqueurs de stress oxydant, activités des principales enzymes antioxydantes, synthèse d'autres facteurs antioxydants comme les métallothionéines, le glutathion intracellulaire) de deux lignées cellulaires ; une lignée cellulaire dérivée de kératinocytes humains et immortalisée par mutation du gène p53 (HaCaT); ainsi qu'une lignée issue du glioblastome de rat (C6). Nos résultats sont en faveur d'un effet globalement pro-oxydant. Ils montrent que les 3 métaux affectent le statut redox des cellules. Ceci est révélé par une augmentation du taux de glutathion oxydé (GSSG), du taux de MDA, des lésions de l'ADN, et une décroissance non seulement du taux des thiols protéiques (SH), de glutathion (GSH) mais aussi des activités glutathion peroxydase (GPx), catalase (CAT), glutathion réductase (GRase) et des superoxydes dismutases (SODs). L'impact des métaux sur les activités des enzymes antioxydantes s'accompagne d'une augmentation de la quantité de radicaux libres comme le radicale hydroxyle qui peut initier la peroxydation lipidique, ainsi que l'oxydation des protéines, du GSH et de l'ADN.Contrairement aux autres métaux, le Cd présente une toxicité relativement faible dans les cellules HaCaT pour des concentrations inférieures ou égales à 50 µM. Cette résistance s'explique principalement par la présence des métallothionéines (MTs) à l'état basal d'une part et par une synthèse induite par le Cd du GSH et des MTs d'autre part. L'induction des MTs par le Cd, le Cu ou le Zn et leur redistribution nucléaire fait de ces protéines un acteur prépondérant dans la protection du génome contre les dommages oxydatifs. L'expression des MTs est régulée non seulement par une synthèse induite par les métaux mais aussi par le GSH et la protéine p53 dont la mutation a un impact sur le taux intracellulaire de MTs et sur la résistance des HaCaT au Cd.
Ces études indiquent que le déséquilibre entre l'inhibition des activités antioxydantes et la synthèse des facteurs comme le GSH et les MTs est très impliqué dans la toxicité des métaux. C'est ce déséquilibre qui est à l'origine de l'augmentation du stress oxydant et qui explique la sensibilité et la forte mortalité des cellules C6 induite par le Cd. En effet dans ces cellules, les activités des enzymes antioxydantes et les taux de GSH et de MTs diminuent dès 20 µM. Cette diminution s'accompagne d'une mort cellulaire accrue. La mort cellulaire obtenue après incubation avec le Cd, le Cu ou le Zn est dose-dépendante et très différente entre les lignées C6 et HaCaT. En effet, les cellules HaCaT en présence de Cd ou de Cu présentent une mort non apoptotique alors que les cellules C6, incubées avec le Cd, meurent par une voie apoptotique p53-dépendante.
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Lefebvre, Gregory. "Developpement d'outils bioinformatiques et statistiques pour l'analyse du transcriptome hepatique humain par puces a ADN : application a la reponse inflammatoire aigue systemique." Phd thesis, Université de Rouen, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00182773.
Full textAbstract:
La phase aigue de l'inflammation sytemique est une periode de transition subsequente au trauma, coordonnee par des mediateurs telles les cytokines. Ces dernieres ciblent ma joritairement le foie, lequel regule alors principalement la production des APPs et des APRIPs. Ce travail montre d'abord la creation d'une plate-forme a puces a ADN dediee a l'etude du transriptome hepatique humain et fondee d'une part sur le developpement de la puce elle-meme par la designation des sondes ADNc qui la definissent, d'autre part sur la creation d'une base de donnees standardisee et ́egalement sur l'ecritre de programmes d'analyse statistique.
Il montre enfin comment cette plate-forme a permis de mettre en evidence d'une part une correlation entre 134 transcripts et le degre de l'inflammation et d'autre part une liste de genes repartis en 12 groupes fonctionnels subissant une alteration de leur transcription, de leur stabilite post-transcriptionnelle et de leur traduction durant la phase aigue de linflammation.
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Terrat, Sébastien. "Nouveau design de sondes pour biopuces ADN fonctionnelles et caractérisation des capacités de biodégradation des communautés bactériennes de sols pollués par des hydrocarbures." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00629656.
Full textAbstract:
Les activités humaines sont à l'origine de nombreuses pollutions par des hydrocarbures au niveau des écosystèmes, et plus particulièrement au niveau des sols. Afin de préserver la santé humaine et environnementale, il est nécessaire d'éliminer les polluants présents. Dans ce but, les techniques de bioremédiation apparaissent aujourd'hui comme de réelles alternatives aux techniques classiques, invasives et onéreuses. Cependant, l'utilisation optimale de tels procédés nécessite une meilleure connaissance des capacités métaboliques des communautés microbiennes impliquées dans la biodégradation de ces polluants. Dans ce cadre, l'utilisation des biopuces ADN fonctionnelles pour analyser ces écosystèmes semble très appropriée.Cependant, une de ses limitations actuelles est la détermination des sondes, qui ne ciblent que les gènes dont les séquences ont été caractérisées. Pour cela, un outil informatique (Metabolic Design) a été mis au point, afin de déterminer des sondes exploratoires pour biopuces fonctionnelles. L'étude, avec notre biopuce fonctionnelle, des capacités métaboliques de dégradation des HAP de la souche Sphingomonas paucimobilis sp. EPA505 a permis de mettre en évidence la sensibilité et la spécificité des sondes développées, ainsi que leur aspect exploratoire. Puis, nous nous sommes attachés à caractériser les capacités métaboliques des communautés bactériennes d'un sol pollué principalement par des HAP, sans à priori sur les séquences ou les organismes présents, montrant l'efficacité de notre approche.
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Charles, Hubert. "Analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola, la bactérie symbiotique du puceron Acyrthosiphon pisum." Habilitation à diriger des recherches, INSA de Lyon, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00482270.
Full textAbstract:
Les progrès fulgurants de ces dix dernières années réalisés dans les domaines de la microinformatique et de la microfluidique associés au génie génétique (PCR et séquençage) ont permis un changement d'échelle dans la quantité des données acquises au cours d'une même expérience. La transcriptomique est directement issue de ces avancées technologiques. Ce mémoire présenté pour l'obtention d'une Habilitation à Diriger des Recherdes porte sur l'analyse du transcriptome de la bactérie intracellulaire obligatoire des pucerons, Buchnera aphidicola. Dans la première partie, les principales méthodes d'analyses statistiques différentielles et d'intégration des données transcriptomiques sont présentées sous la forme d'une analyse bibliographique. La deuxième partie est consacrée au développement d'outils bioinformatiques : ROSO, un logiciel d'optimisation des sondes oligonucléotidiques, la puce Buchnera et SITRANS, un système d'information pour la gestion et la publication des données d'expression. Enfin, la dernière partie est consacrée à la caractérisation du transcriptome de Buchnera en condition de stress trophique de son hôte, le puceron du pois Acyrthosiphon pisum. La régulation transcriptionnelle chez les bactéries symbiotiques intracellulaires à génome réduit est encore actuellement très mal connue. Cette question sera abordée chez Buchnera tout d'abord au niveau évolutif par l'étude de la relation entre l'expression des gènes et leur organisation dans le génome, puis au niveau fonctionnel, par la caractérisation de la réponse de la bactérie à une diminution de la quantité d'acides aminés essentiels dans le substrat nutritif du puceron, combinée à un stress osmotique.
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Gerigny, Olivia. "Hydrologie et hydrodynamisme dans les bouches de Bonifacio : mesures in-situ, modélisation, influence sur la biomasse." Phd thesis, Université Pascal Paoli, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00603946.
Full textAbstract:
Les bouches de Bonifacio (Corse du Sud) sont connues pour leur hydrodynamisme violent et la présence d'écosystème marin riche et complexe, géré par une réserve internationale. Pour avoir une bonne connaissance des eaux où vit cette biomasse, des mesures in-situ (courantologiques et hydrologiques) ont été faites lors de 7 missions océanographiques (CYRCE). Grâce à des enregistrements de courant, par deux ADCP (profileurs de courants), l'un mouillé et l'autre embarqué sur le N/o Tethys II (INSU-CNRS), les conditions de courant régissant le milieu sont décrites, globalement et par l'étude de différents cas en relation avec les deux vents dominants (NE et SO). Le traitement statistique des données et leur intégration par un maillage numérique de la zone a permis une première approche des phénomènes majeurs du système des courants. Les données de température, salinité, oxygène dissous, turbidité et fluorescence ont montré les structures caractéristiques et leur variabilité dans l'espace et le temps. Enfin le modèle de simulation 3D Symphonie (laboratoire POC-CNRS-Toulouse) a été adapté aux bouches de Bonifacio sur près d'une année. Ce modèle, a d'abord élargi notre vision de la courantologie sur les parties non couvertes par les mesures in-situ, et permis de comparer les données réelles et simulées. De plus, des outils d'application du modèle, ont permis des simulations de la dispersion de larves à partir des cantonnements de réserve et de dilution de matière, par lâchers de traceurs virtuels et d'en suivre l'évolution sur plusieurs jours, sous différentes configurations.
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Fraz?o, Maria do Carmo de Luna Malheiros. "Cacacteriza??o da Cobertura de Sinais na faixa de 700 MHZ em Ambientes Internos considerando os Efeitos da Polariza??o e do Azimute da Antena Diretiva." reponame:Repositório Institucional do IFPB, 2016. http://repositorio.ifpb.edu.br/jspui/handle/177683/280.
Full textAbstract:
Submitted by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2016-12-06T13:13:30Z
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15- Maria do Carmo de Luna Malheiros Fraz?o - CARACTERIZA??O DA COBERTURA DE SINAIS NA FAIXA DE 700 MHZ EM AMBIENTES INTERNOS CONSIDERANDO OS EFEITOS DA POLARIZA??O E DO AZIMUTE D.pdf: 3902705 bytes, checksum: 36e170471d2e520bd62d1b40bdd640a9 (MD5)Approved for entry into archive by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2016-12-06T13:14:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 15- Maria do Carmo de Luna Malheiros Fraz?o - CARACTERIZA??O DA COBERTURA DE SINAIS NA FAIXA DE 700 MHZ EM AMBIENTES INTERNOS CONSIDERANDO OS EFEITOS DA POLARIZA??O E DO AZIMUTE D.pdf: 3902705 bytes, checksum: 36e170471d2e520bd62d1b40bdd640a9 (MD5)
Made available in DSpace on 2016-12-06T13:14:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 15- Maria do Carmo de Luna Malheiros Fraz?o - CARACTERIZA??O DA COBERTURA DE SINAIS NA FAIXA DE 700 MHZ EM AMBIENTES INTERNOS CONSIDERANDO OS EFEITOS DA POLARIZA??O E DO AZIMUTE D.pdf: 3902705 bytes, checksum: 36e170471d2e520bd62d1b40bdd640a9 (MD5) Previous issue date: 2016-12-06
Com o aparecimento dos sistemas de comunica??o pessoal, tornou-se importante a caracteriza??o da propaga??o em ambientes fechados. A atenua??o no espa?o livre, a propaga??o por multipercurso e as intera??es que a onda mant?m com obst?culos s?o fen?menos mais relevantes associados ? propaga??o em ambientes interiores. Entretanto, se o canal indoor for bem caracterizado os efeitos das perdas de propaga??o eletromagn?ticas podem ser minimizadas, atrav?s da varia??o angular da antena do transmissor, a fim de encontrar a posi??o adequada para a localiza??o do transmissor. No contexto de uma rede sem fio, um ambiente interno difere de um ambiente externo em dois aspectos: menor raio de cobertura e maior variabilidade no ambiente. Constata-se, na pr?tica, que a propaga??o dentro de edifica??es ? influenciada por aspectos espec?ficos, tais como sua arquitetura e pelos materiais usados na constru??o. Nas ?ltimas d?cadas foram desenvolvidos e aperfei?oados v?rios modelos de predi??o que consideram as caracter?sticas do ambiente interno. O presente trabalho tem por objetivo estabelecer a caracteriza??o da cobertura de sinais de comunica??o sem fio em ambientes interiores na faixa de frequ?ncia em torno de 700 MHz. Essa banda foi escolhida devido a sua destina??o para ser utilizada pelos sistemas de comunica??o em banda larga 4G/LTE no Brasil. Os resultados simulados foram obtidos utilizando o programa comercial WinProp?, com base no m?todo do Tra?ado de Raios. Durante as simula??es foi proposto um m?todo simplificado de predi??o de cobertura, onde foram considerados transmissores virtuais, posicionados pr?ximos ?s paredes de in?cio de cada corredor transversal (situa??o sem visada entre transmissor e receptor), que consideraram como pot?ncias de sa?das as mesmas pot?ncias aferidas naqueles pontos ou locais, a partir do transmissor real. As campanhas de medi??es para a caracteriza??o experimental da cobertura de sinal foram realizadas, obtendo-se valores m?dios do sinal em intervalos regularmente espa?ados, de modo a se garantir uma menor influ?ncia do fen?meno de desvanecimento r?pido e uma maior espacialidade entre elas. Deste modo, os resultados obtidos mostraram uma boa concord?ncia entre os valores simulados, medidos e te?ricos, calculados a partir da f?rmula de Friis, nas situa??es com visada e sem visada direta.
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Najafi, Aghdam Esmaeil. "Nouvelles techniques d'appariement dynamique dans un CNA multibit pour les convertisseurs sigma-delta." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00278389.
Full textAbstract:
Les convertisseurs analogiques-numériques fondés sur le principe de la modulation §¢ sont capables de fonctionner à des résolutions très élevés. L'utilisation en interne d'un CAN et d'un CNA multibit permet de réduire le taux de suréchantillonnage, les contraintes imposées par les circuits actifs, amé- liore la stabilité de la boucle du modulateur, mais rend celui-ci très sensible aux imperfections des composants du convertisseur numérique analogique (CNA) interne situé dans le chemin de retour. Les erreurs statiques dues aux non idéalités des circuits constitutifs de ce CNA peuvent être corrigées au moyen de techniques d'appariement dynamique des composants (DEM). Ce travail de thèse est consacré entre autre à l'étude théorique de ces techniques de correction des défauts des cellules des CNA multibits. Après avoir rappelé le principe de la conversion §¢ d'une part, et les différentes sources d'erreurs dominantes dans le cas multibit d'autre part, les techniques d'appariement existantes sont analysées et comparées. Nous soulignons les avantages, les inconvénients, et les domaines d'applications préférentiels de chacune. Le coeur du travail consiste en la proposition de quatre nouvelles techniques d'appariement dynamique. Les deux premières dérivent de la méthode de la moyenne des données (DWA), l'une pour le cas passe-bas du premier ordre, l'autre dans le cas passe-bande du second ordre. Les deux dernières propositions (appelées MDEM et STDEM) dérivent des deux algorithmes de tri (SDEM) et d'arborescence (TDEM) : elles conviennent à une mise en forme des erreurs d'ordre élevé et sont destinées aux applications passe-bas et passe-bande de haute performance. Ces quatre méthodes proposées ont été mises en équation et leurs performances confirmées par diverses simulations. Une implantation des algorithmes MDEM et STDEM a été faite au niveau cellule standard jusqu'à l'étape finale de routage en technologie CMOS 0.35 ¹m. L'ensemble des résultats des simulations au niveau système et au niveau transistor conforme l'avantage des techniques développées dans ce travail en termes de surface occupée et aussi de fréquence maximale d'application, si on les compare avec les algorithmes conventionnels de SDEM. Dans une dernière partie, les erreurs dynamiques du CNA, en particulier l'effet de la gigue d'horloge, le glitch, la dissymétrie des temps de transition, l'injection de charge (CFT) et la métastabilité du quantificateur sont également analysés. A l'issue de ces réflexions, une nouvelle cellule de CNA incluant un bloc limitant la plage dynamique de la commande d'entrée (SRD) est proposée. Elle possède une structure de remise à zéro partielle (semi-RZ) qui permet de bénéficier à la fois de l'avantage de la cellule RZ et non RZ. De plus, l'effet du retard du bloc de DEM est compensé par une modification dans l'architecture convenant aux applications passe-bande haute fréquence.
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Sultan, Audrey. "Tau nucléaire : un acteur clé dans le stress neuronal." Phd thesis, Université du Droit et de la Santé - Lille II, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00627214.
Full textAbstract:
Les protéines Tau sont impliquées dans plusieurs maladies neurodégénératives dénommées tauopathies, dont la plus fréquente est la maladie d'Alzheimer. Ces maladies se caractérisent par une accumulation intracellulaire de protéines Tau hyper- et anormalement phosphorylées sous forme de filaments. Ces lésions, dont l'origine et le rôle exact restent mal connus, sont au cœur d'un processus dégénératif conduisant à de nombreux troubles cognitifs et/ou moteurs et aboutissant le plus souvent à un syndrome de démence. Les protéines Tau appartiennent à la famille des protéines associées aux microtubules. Elles sont principalement neuronales et majoritairement localisées dans les axones où elles modulent l'assemblage et la stabilisation des microtubules. La mise en évidence d'autres localisations au sein des neurones, notamment dans le noyau, suggère néanmoins que Tau pourrait être une protéine multifonctionnelle. Cependant, bien que Tau soit observée dans le noyau des neurones, sa fonction n'a jamais été étudiée. Des études in vitro ont montré que la protéine Tau purifiée est capable de se lier et de stabiliser l'ADN en le protégeant de la dégradation par les DNAses ainsi que des altérations provoquées par les radicaux libres. Les travaux présentés dans cette thèse ont eu pour objectif d'étudier in situ, la fonction de Tau nucléaire sur l'intégrité de l'ADN en condition de stress. Dans ce but, nous avons développé et caractérisé des modèles dans lesquels un stress thermique ou un stress oxydant, un mécanisme précocement impliqué dans la maladie d'Alzheimer, modulent la quantité de Tau dans le noyau de neurones. Nos résultats indiquent qu'en réponse à une hyperthermie, stress non toxique pour les cellules, Tau est déphosphorylée et s'accumule dans le noyau des neurones où elle se lie à l'ADN. Afin d'étudier le rôle de Tau nucléaire, nous avons analysé par Comet assay l'effet de l'hyperthermie sur l'intégrité de l'ADN dans des neurones sauvages ou déficients en Tau. Les résultats ont montré que ce type de stress entraîne des dommages à l'ADN spécifiquement dans les neurones déficients en Tau. Dans ces neurones, l'expression à l'aide de vecteurs adénoviraux de la Tau humaine possédant ou non une séquence de localisation nucléaire pour cibler Tau dans le compartiment nucléaire, prévient les dommages induits par le stress. Inversement, une hypothermie induit une hyperphosphorylation de Tau et prévient son accumulation dans le noyau. Dans ce contexte, nous avons observé la présence de dommages à l'ADN dans les neurones sauvages. L'ensemble de ces résultats suggèrent que l'accumulation de Tau dans les noyaux protège l'ADN neuronal des dommages induits par un stress. En conclusion, ce travail montre, pour la première fois, un nouveau rôle de Tau en tant qu'acteur essentiel de la réponse précoce à un stress dans le neurone où la protéine Tau protège l'intégrité de l'ADN. Dans les tauopathies, l'altération pathologique de Tau pourrait avoir un impact délétère sur sa fonction neuroprotectrice de l'ADN et contribuer ainsi à la physiopathologie de ces maladies.
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Zahradníčková, Iva. "Studie logistických služeb v obchodě." Master's thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta podnikatelská, 2007. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-221544.
Full textAbstract:
The Master´s thesis deals with the logistics services studies in Sika CZ, Ltd. Company. Considering the fact that the principal activity of the company is trading, it uses logistics as a substantial instrument to achieve the customers’ satisfaction. The main objective of the thesis is to create logical structures of services and project suitable metrics for measuring customers’ satisfaction of the provided services.
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Paditz, Ludwig. "The basics of set theory - some new possibilities with ClassPad." Saechsische Landesbibliothek- Staats- und Universitaetsbibliothek Dresden, 2012. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:14-qucosa-82943.
Full text
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De, Vos John. "Analyse moléculaire du myélome : vers de nouvelles perspectives thérapeutiques." Phd thesis, Université Montpellier I, 2001. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00006190.
Full textAbstract:
Le myélome multiple (MM) est une néoplasie hématopoïétique chimiosensible. Si une chimiothérapie intensive associée à une autogreffe de cellules souches hématopoïétiques permet de doubler la médiane de survie, la rechute reste cependant inéluctable et ce cancer est incurable à l'heure actuelle.Plusieurs exemples ont montré récemment qu'une connaissance précise de la physiopathologie d'un cancer pouvait conduire à l'élaboration de traitements spécifiques. Ces nouveaux traitements anti-cancéreux ciblant un sous-groupe de tumeurs caractérisées par une altération moléculaire commune sont une voie de développement thérapeutique prometteuse.
Mon travail de thèse a consisté à étudier la biologie du MM dans une perspective de ciblage pharmacologique de la cellule plasmocytaire maligne. L'utilisation d'anticorps anti-gp130 agonistes a permis de montrer que l'activation de la signalisation par la chaîne gp130 du récepteur de l'interleukine-6 (IL-6) est indispensable à la survie et la prolifération des cellules de MM. En corollaire, l'interruption de cette voie de signalisation par la tyrphostin AG490, inhibiteur de la kinase JAK2, bloque la croissance et induit une apoptose dans les plasmocytes tumoraux. Des membranes comportant les ADNc de 268 gènes nous ont permis de rechercher l'expression des gènes d'autres cytokines et récepteurs de cytokines pouvant jouer un rôle dans la physiopathologie du MM. Nous avons mis en évidence dans des lignées de MM une boucle autocrine, cruciale pour la survie du plasmocyte tumoral, qui implique la cytokine HB-EGF et son récepteur ErbB1. Le développement d'un modèle de génération in vitro de plasmocytes normaux purifiés a permis ensuite la comparaison du transcriptome de plasmocytes tumoraux avec leur contrepartie normale par des puces à ADN analysant l'expression de 6800 gènes différents. De nombreux gènes sont différentiellement exprimés entre ces deux populations cellulaires et certains gènes surexprimés dans les cellules myélomateuses codent pour des protéines qui sont des cibles thérapeutiques potentielles, telles que ABL, CBS, RAR? ou RhoC.
La possibilité de comparer pour chaque malade le transcriptome des cellules tumorales par rapport à leur équivalent normal va permettre de progresser rapidement dans la compréhension des mécanismes impliqués dans l'émergence du clone tumoral et l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques. Cette approche pourrait aboutir sur la mise en place d'un traitement « à la carte » du MM basé sur l'examen du transcriptome du clone tumoral de chaque patient.
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Carpentier, Anne-Sophie. "Le transcriptome : un domaine d'application pour lesstatistiques, de nouveaux horizons pour la biologie." Phd thesis, Université d'Evry-Val d'Essonne, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00067855.
Full textAbstract:
Les mesures des niveaux d'expression de tous les gènes d'un génome requièrent une analysestatistique afin d'obtenir des conclusions fiables. Les biologistes ont du mal à faire un choix dans la
foule de méthodes existantes. Afin de déterminer quelle méthode est la plus adéquate pour la
problématique abordée, des comparaisons de méthodes d'analyse disponibles sont nécessaires.
Actuellement les critères de comparaison se révèlent soit lacunaires ou soit non pertinents du point de
vue biologique.
Nous avons introduit un nouveau critère biologique de comparaison des méthodes d'analyse du
transcriptome fondé sur une structure des génomes bactériens : les opérons. Les gènes d'un opéron
sont généralement transcrits sur un même ARNm. Si un gène d'un opéron bactérien est identifié, les
autres gènes de l'opéron devraient l'être également. Nous avons ainsi comparé des méthodes
d'analyse appliquées au transcriptome : l'ACP et l'ACI, respectivement analyses en composantes
principales et indépendantes, l'ANOVA, analyse de variance, la régression des moindres carrés
partiels PLS et différents t-tests. Chaque méthode aborde le nuage de données d'un point de vue
différent ce qui donne des résultats complémentaires. Globalement, l'ACI a fourni les meilleurs
résultats tant en sensibilité qu'en terme de précision.
Un autre aspect, en plein développement, de l'analyse du transcriptome est la méta-analyse de
données d'origines diverses malgré les biais inhérents à cette technologie. Généralement ces métaanalyses
visent à préciser les résultats concernant des gènes différentiellement exprimés ou coexprimés.
Elles ouvrent également la possibilité d'étudier de nouveaux champs en biologie. Nous
avons utilisé des données de transcriptome indépendantes afin d'étudier l'organisation de l'expression
des gènes et, ainsi, celle du chromosome bactérien. L'étude du transcriptome de trois bactéries, B.
subtilis, E. coli et S. meliloti a révélé des corrélations d'expression à longue distance valables quel que
soit le gène étudié. Les structures en opéron se manifestent clairement au travers de cette étude, qui
a également permis de préciser que la co-expression de gènes proches s'étend au-delà des opérons
dans une région qui se répand jusqu'à une centaine de gènes.
Pour conclure, l'analyse du transcriptome n'a pas réellement nécessité la mise au point de méthodes
d'analyse statistiques spécifiques. Cependant, elle permet d'aborder de nouveaux horizons dans la
biologie, et notamment l'organisation chromosomique du génome bactérien.
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Timpone, Luá Taibo [UNESP]. "Energética alimentar em Rã-manteiga, Leptodactylus latrans (Anura, Leptodactylidae)." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2016. http://hdl.handle.net/11449/153362.
Full textAbstract:
Submitted by Luá Taibo Timpone null (101010913@rc.unesp.br) on 2017-01-18T20:52:13Z
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Dissertação_VersãoFinal_Completa_Luá.pdf: 1544050 bytes, checksum: 3ff859d190848f5e447a8680e9b509cb (MD5)Rejected by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: No campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” foi informado que seria disponibilizado o texto completo porém no campo “Data para a disponibilização do texto completo” foi informado que o texto completo deverá ser disponibilizado apenas 12 meses após a defesa. Caso opte pela disponibilização do texto completo apenas 12 meses após a defesa selecione no campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” a opção “Texto parcial”. Esta opção é utilizada caso você tenha planos de publicar seu trabalho em periódicos científicos ou em formato de livro, por exemplo e fará com que apenas as páginas pré-textuais, introdução, considerações e referências sejam disponibilizadas. Se optar por disponibilizar o texto completo de seu trabalho imediatamente selecione no campo “Data para a disponibilização do texto completo” a opção “Não se aplica (texto completo)”. Isso fará com que seu trabalho seja disponibilizado na íntegra no Repositório Institucional UNESP. Por favor, corrija esta informação realizando uma nova submissão. Agradecemos a compreensão. on 2017-01-24T13:40:19Z (GMT)
Submitted by Luá Taibo Timpone null (101010913@rc.unesp.br) on 2018-03-02T20:05:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_VersãoFinal_Completa_Luá.pdf: 1544050 bytes, checksum: 3ff859d190848f5e447a8680e9b509cb (MD5)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
O tamanho do alimento e a temperatura corpórea são dois fatores que reconhecidamente influenciam a resposta metabólica pós-prandial dos vertebrados ectotérmicos. Leptodactylus latrans é uma espécie generalista que consome desde invertebrados até pequenos vertebrados, de forma que sua dieta é composta por itens de tamanho variável, os quais sempre são ingeridos inteiros. A temperatura corpórea de L. latrans está sujeita a disponibilidade de nichos térmicos adequados nos ambientes onde ocorre, os quais são possivelmente explorados através da termorregulação comportamental. No presente estudo, nós avaliamos os efeitos do tamanho da presa e da temperatura corpórea sobre a resposta metabólica pós-prandial, em indivíduos adultos da rã-manteiga, Leptodactylus latrans (Anura, Leptodactylidae) através da quantificação das taxas de consumo de oxigênio antes e após a alimentação. A resposta metabólica pós-prandial de L. latrans pode ser caracterizada por um rápido aumento nas taxas de consumo de oxigênio logo após a ingestão do alimento, até atingir valores máximos entre 85,93 ± 9,92 e 224,54 ± 26,08 mLO2.kg-1. h-1, dentro de 1-2 dias. Após este pico, houve um retorno paulatino da taxa metabólica aos níveis de jejum entre 3 a 7 dias após a alimentação. De maneira geral, encontramos que a ingestão de presas maiores causa um maior incremento metabólico e aumenta a duração da digestão. Já o incremento da temperatura é acompanhado pela diminuição da duração da digestão às expensas de taxas metabólicas pós-prandiais mais elevadas. Tanto em um caso como no outro, não encontramos indicações de que fatores cardiorrespiratórios pudessem atuar na limitação do tamanho da presa ou na temperatura na qual a digestão pode ocorrer. No entanto, é plausível que outros fatores de cunho ecológico sejam relevantes na consideração dos efeitos do tamanho do alimento e da temperatura na digestão de L. latrans. Em especial, um maior retorno energético absoluto ao se alimentar de presas maiores e a diminuição do tempo de digestão em temperaturas mais elevadas, ambos aspectos documentados em L. latrans, podem representar benefícios ecológicos importantes.
Meal size and body temperature affect markedly the post-prandial metabolic response of ectothermics vertebrates. Leptodactylus latrans is a generalist anuran species feeding on diverse prey itens, from invertebrates to small vertebrates, with considerable size variation and that are always ingested whole. The body temperature of L. latrans is largely dependent of the availability of thermal niches in the environment, which are possibly explored by means of behavioral thermoregulation. In the present study, we investigated the effects of meal size and body temperature on the post-prandial metabolic response of adults of the Neotropical leptodatylid frog, Leptodactylus latrans (Anura, Leptodactylidae) by quantifying the rates of oxygen consumption before and after meal ingestion. The post-prandial metabolic response of L. latrans can be characterized by the rapid increase in the rates of oxygen consumption shortly after meal ingestion, until reach peak between 85,93 ± 9,92 e 224,54 ± 26,08 mLO2.kg-1. h-1, within 1-2 days post-feeding. Thereafter, metabolism gradually return to the pre-feeding values within 3 to 7 days post-feeding. In general, we found that the ingestion of larger meals were followed by greater metabolic increment and by longer digestion duration. Temperature increment caused digestion duration to decrease at the expenses of greater post-prandial metabolic rates. In both cases, we did not found evidences that cardiorespiratory compromises could limit meal size or the temperature in which meal digestion could occur. On the other hand, some ecological considerations seems to be relevant in considering the effects of meal size and body temperature on the digestion of L. latrans. More specifically, the greater gross energetic gain when feeding on larger prey and the shortening of digestion duration at higher temperatures, both observed in L. latrans, are likely to yield substantial ecological advantages.
Capes Demanda Social
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Tesařová, Hana. "Strukturní a mechanické charakteristiky niklových litin s kuličkovým grafitem." Doctoral thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství, 2010. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-233891.
Full textAbstract:
The aim of this dissertation work is the evaluation of the influence of nickel alloying on the structure and mechanical properties, both monotonic and dynamic, of nodular cast iron with ferritic and bainitic matrix. Two chock melts with 0.5 and 2.7 % Ni were used to study the nickel influence. The quantitative evaluation of structure of these melts using image analysis was done and basic tensile mechanical properties were determined. Subsequently, the time optimization of two-stage ferritic annealing and isothermal austempered heat treatment at 375 °C was performed with the aim to obtain optimal ferritic and bainitic structures with best static and dynamic mechanical properties. After ferritic annealing the nickel alloying contributes to substitution hardening of ferritic matrix which positively affects its strength and other mechanical properties. The higher nickel content in the bainitic structure causes the shift of phase transformation times to longer times which results in restricted production of small carbides and in bigger volume of retained austenite. These features were confirmed by observation in transmission electron microscope. Precise tensile and low cycle fatigue tests at temperatures 23 and – 45 °C were performed on the optimized structures of both nodular cast irons. As a result of the notch effect of graphite nodules, microplastic deformation of both nodular cast irons was observed at stresses which were lower than the yield stress. The Hollomon's equation very well describes the individual parts of tensile curves for both nodular cast irons including their mutual comparison. From the low cycle fatigue tests, the cyclic hardening/softening curves, the evolution of elastic modulus and hysteresis loop shape parameters, cyclic stress-strain curves and fatigue life curves were obtained for both temperatures and materials. Moreover, the decrease of retained austenite volume was measured by neutron diffraction and the evolution of surface relief was characterized during cyclic straining for both austempered nodular cast irons at both temperatures. On the basis of these results both cyclic plasticity and fatigue degradation mechanisms in relation to the cyclic strain localization were described for both nodular cast irons.
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Laffaire, Julien. "Modifications du transcriptome au cours du développement postnatal du cervelet dans un modèle murin de Trisomie 21." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2008. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00004252.
Full textAbstract:
La Trisomie 21, ou syndrome de Down, est causée par la présence d'une troisième copie du chromosome 21. De récentes analyses ont démontré une surexpression des gènes en 3 copies avec des effets de compensation ou d'amplification pour certains d'entre eux. Cependant, l'impact de l'effet de dosage génique sur l'ensemble du transcriptome est encore débattu. C'est pourquoi nous avons mené une analyse de l'expression des gènes chez la souris Ts1Cje, un modèle murin de la Trisomie 21, au cours du développement postnatal du cervelet. En effet, nous avons montré dans ce modèle une diminution de la prolifération dans le cervelet à la naissance ainsi qu'une diminution du volume du cervelet chez l'adulte. L'analyse statistique de données de puces à ADN a révélé un effet majeur de dosage génique des gènes en 3 copie ainsi que de gènes présents sur un fragment délété de 2 Mb que nous avons pour la première caractérisé par hybridation génomique comparative. Cet effet de dosage génique n'influe que modérément sur le transcriptome : 2,4 à 7,5% des gènes exprimés sont régulés. De plus, nous n'avons trouvé que 13 gènes significativement régulés tout au long du développement postnatal du cervelet dont 6 correspondants à des gènes en 3 copies. Enfin, l'analyse de transcriptome à partir de dissections de la couche granulaire externe de cervelet, où nous avons démontré une réduction de la prolifération à la naissance, a révélé un effet majeur de dosage génique mais pas de déstabilisation globale du transcriptome. Toutes ces données suggèrent qu'un nombre restreint de gènes présents en 3 copies sont responsables du phénotype présent dans le cervelet des souris Ts1Cje. Nous proposons une liste courte de gènes candidats.
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Marot, Guillemette. "Modélisation statistique pour la recherche de gènes différentiellement exprimés: modèles de variance-covariance, analyse séquentielle et méta-analyse." Phd thesis, AgroParisTech, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00458988.
Full textAbstract:
Les puces à ADN permettent d'étudier simultanément l'expression de plusieurs milliers de gènes à partir de peu d'individus biologiques. Trois approches sont considérées dans cette thèse pour résoudre les problèmes de sensibilité dans la recherche de gènes différentiellement exprimés: la modélisation des variances-covariances, l'analyse séquentielle et la méta-analyse. La première et la troisième partie reposent principalement sur des approches dites de 'shrinkage' qui estiment les valeurs de chaque gène à partir de l'information provenant de l'ensemble des gènes. En diminuant le nombre de paramètres à estimer, elles permettent d'augmenter la sensibilité. La modélisation des variances se révèle particulièrement utile dans le cas d'expériences avec de petits échantillons. La modélisation des covariances est quant à elle particulièrement pertinente pour les études de suivi longitudinal où les mesures sont répétées sur les mêmes individus au cours du temps. Côté analyse séquentielle, la sensibilité est étudiée en tant que règle d'arrêt. On cherche alors à arrêter une expérience en cours dès que ce critère dépasse un certain seuil, afin d'en diminuer les coûts. La méta-analyse est ensuite étudiée dans un contexte beaucoup plus général que celui de l'analyse séquentielle où on combinait les analyses intermédiaires. Elle permet de gagner de la sensibilité en regroupant des résultats d'études individuelles qui ne sont pas comparables directement mais qui répondent à une même question biologique. La méta-analyse est abordée à la fois sous l'angle fréquentiste (combinaison de grandeurs des effets ou combinaison de p-values) et sous l'angle bayésien.
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Gustafson, Anders. "Interna flöden och processer på Å&R Carton : processbaserad verksamhetsanalys och förbättringsförslag för ledtidsreduktion." Thesis, Linköping University, Department of Science and Technology, 2003. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-2141.
Full textAbstract:
Denna rapport syftar till att, på Å&R Carton i Norrköping, analysera de interna flödena och processerna samt ge förslag på hur ledtider ska kunna reduceras väsentligt. Ett sätt att uppfylla syftet är att dela in verksamheten i processer genom olika metoder och kriterier förprocessbestämning. Valda metoder i rapporten är; kvalitativ ansats med hög validitet och reliabilitet, processbaserad verksamhetsanalys och procedurbeskrivning.
Genom omfattande litteraturstudier, insamlande av data i form av intervjuer, benchmarking, platsundersökningar och interna dokument har nulägesmodeller arbetats fram. Analysen av dessa visar bland annat på att såväl planeringsprocessen som inköpsprocessen idag inte fungerar värdeadderande och bör ses över. Därutöver finns också andra processer som bidrar till ett komplext flöde. Dessa behöver effektiviseras eller ändras för att korta ledtider. Vidare visar analysen på att en omfattande attitydsundersökning behövs, dels för att komma till rätta med vissa stämningar och dels för att på sikt skapa en effektiv arbetsmiljö.
Till förbättringsförslagen hör, förutom en attitydsundersökning, förslaget att utarbeta tydliga mål och strategier. Sedan måste dessa kommuniceras till samtliga anställda, till exempel genom arbetsgrupper. Vidare föreslås att Å&R Carton tittar på automatisk datafångst som ett mycket kostnadseffektivt sätt att kontrollera det totala flödet. På lång sikt bör också företaget titta på att implementera processorientering. Dock behöver företaget först och främst se till att skapa en förändringsvillig attityd för att nå framgång i sitt effektiviseringsarbete. Slutsatsen blir att Å&R Carton har stor potential att väsentligt förkorta sina ledtider om företaget hanterar situationen rätt. För att lyckas kan delar av denna rapport användas där det viktigaste är att en engagerad ledning visar vägen.
The purpose of this final thesis is to analyse the internal processes at Å&R Carton in Norrköping and give proposals to reduce time in the Supply Chain. One way to fulfill the purpose is to use Process Based Analys and split the organisation in different processes. Process Based Models have then been constructed by studying litterature, benchmarking, internal documents and making a lot of interviews. The analys shows that different processes must be changed to make the flow through the Supply Chain more efficient. The analys give us also recommendations like attitude investigations and implementation of ECR. The conclusion is that Å&R Carton have great potential to reduce time in the Supply Chain if the management are active, follow the recommendations and show the employees the way about.
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Schmidt, Marek Wojciech, and Marek Schmidt@rl ac uk. "Phase formation and structural transformation of strontium ferrite SrFeOx." The Australian National University. Research School of Physical Sciences and Engineering, 2001. http://thesis.anu.edu.au./public/adt-ANU20020708.190055.
Full textAbstract:
Non-stoichiometric strontium iron oxide is described by an abbreviated formula SrFeOx (2.5 ≤ x ≤ 3.0) exhibits a variety of interesting physical and chemical properties over a broad range of temperatures and in different
gaseous environments. The oxide contains a mixture of iron in the trivalent and the rare tetravalent state. The material at elevated temperature is a mixed oxygen conductor and it, or its derivatives,can have practical
applications in oxygen conducting devices such as pressure driven oxygen
generators, partial oxidation reactors in electrodes for solid oxide fuel cells
(SOFC).
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This thesis examines the behaviour of the material at ambient and elevated temperatures using a broad spectrum of solid state experimental
techniques such as: x-ray and neutron powder diffraction,thermogravimetric and calorimetric methods,scanning electron microscopy and Mossbauer
spectroscopy. Changes in the oxide were induced using conventional thermal
treatment in various atmospheres as well as mechanical energy (ball milling).
The first experimental chapter examines the formation of the ferrite from
a mixture of reactants.It describes the chemical reactions and phase transitions that lead to the formation of the oxide. Ball milling of the reactants prior to annealing was found to eliminate transient phases from the reaction route and to increase the kinetics of
the reaction at lower temperatures.
Examination of the thermodynamics of iron oxide (hematite) used for the
reactions led to a new route of synthesis of the ferrite frommagnetite and
strontium carbonate.This chapter also explores the possibility of synthesis
of the material at room temperature using ball milling.
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The ferrite strongly interacts with the gas phase so its behaviour was studied under different pressures of oxygen and in carbon dioxide.The changes in ferrite composition have an equilibrium character and depend on temperature and oxygen concentration in the
atmosphere. Variations of the oxygen
content x were described as a function of temperature and oxygen partial
pressure, the results were used to plot an equilibrium composition diagram.
The heat of oxidation was also measured as a function of temperature and oxygen partial pressure.
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Interaction of the ferrite with carbon dioxide below a critical temperature
causes decomposition of the material to strontium carbonate and SrFe12O19 .
The critical temperature depends on the partial pressure of CO2 and above
the critical temperature the carbonate and SrFe12O19 are converted back into
the ferrite.The resulting SrFe12O19 is very resistant towards carbonation and
the thermal carbonation reaction does not lead to a complete decomposition
of SrFeOx to hematite and strontium carbonate.
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The thermally induced oxidation and carbonation reactions cease at room
temperature due to sluggish kinetics however,they can be carried out at ambient temperature using ball milling.The reaction routes for these processes are different from the thermal routes.The mechanical oxidation induces two
or more concurrent reactions which lead to samples containing two or more
phases. The mechanical carbonation on the other hand produces an unknown
metastable iron carbonate and leads a complete decomposition of the ferrite
to strontiumcarbonate and hematite.
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Thermally and mechanically oxidized samples were studied using Mossbauer
spectroscopy. The author proposes a new interpretation of the Sr4Fe4O11
(x=2.75) and Sr8Fe8O23 (x=2.875)spectra.The interpretation is based
on the chemistry of the compounds and provides a simpler explanation of
the observed absorption lines.The Mossbauer results froma range of compositions
revealed the roomtemperature phase behaviour of the ferrite also
examined using x-ray diffraction.
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The high-temperature crystal structure of the ferrite was examined using
neutron powder diffraction.The measurements were done at temperatures
up to 1273K in argon and air atmospheres.The former atmosphere protects
Sr2Fe2O5 (x=2.5) against oxidation and the measurements in air allowed
variation of the composition of the oxide in the range 2.56 ≤ x ≤ 2.81.
Sr2Fe2O5 is an antiferromagnet and undergoes phase transitions to the paramagnetic
state at 692K and from the orthorhombic to the cubic structure
around 1140K.The oxidized formof the ferrite also undergoes a transition
to the high-temperature cubic form.The author proposes a new structural
model for the cubic phase based on a unit cell with the Fm3c symmetry.
The new model allows a description of the high-temperature cubic form of
the ferrite as a solid solution of the composition end members.The results
were used to draw a phase diagramfor the SrFeOx system.
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The last chapter summarizes the findings and suggests directions for further research.
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Elkandari, Bader M. H. M. "Excimer laser surface melting treatment on 7075-T6 aluminium alloy for improved corrosion resistance." Thesis, University of Manchester, 2013. https://www.research.manchester.ac.uk/portal/en/theses/excimer-laser-surface-melting-treatment-on-7075t6-aluminium-alloy-for-improved-corrosion-resistance(c2da3b82-eeb5-4eae-a1dc-e4aefba18c62).html.
Full textAbstract:
High strength 7xxx aluminium alloys are used extensively in the aerospace industry because the alloys offer excellent mechanical properties. Unfortunately, the alloys can suffer localised corrosion due to the presence of large intermetallic particles at the alloy surface that are aligned in the rolling direction. Laser surface melting (LSM) techniques offer the potential to reduce and/or to eliminate the intermetallic phases from the surface of the alloy without affecting the alloy matrix.The present study concerns the application of LSM using an excimer laser to enhance the corrosion resistance of AA 7075-T6 aluminium alloy. The initial stage of the project was aimed at optimising the laser conditions for production of a uniform microstructure, with the increase in the corrosion resistance of the alloy being determined by potentiodynamic polarization measurements in sodium chloride solution. Low and high laser energy densities were used with a different number of pulses per unit area to treat the alloy surface, which were achieved by changing both the laser fluence and the pulse repetition frequency. A laser fluence of 3.3 J/cm2 with 80 pulses was subsequently selected as the optimum condition to treat the surface of the alloy. The composition and microstructure of the alloy before and after LSM treatment, and following corrosion tests, were characterized by scanning electron microscopy (SEM), transmission electron microscopy (TEM) and X-ray diffraction (XRD).After the laser treatment, the surface and the cross-sections of the alloy showed a significant reduction in the number of large intermetallic particles and a relatively homogenous melted layer was generated that provided significant improvement in the resistance of the alloy against corrosion, as assessed by several corrosion test methods, including exfoliation corrosion (EXCO) tests. However, delamination of the melted layer was observed after extended testing in the EXCO solution which is possibly related to the formation of bands of fine magnesium and zinc-rich precipitates within the melted layer. Therefore, anodising in sulphuric acid was applied to the LSM alloy, in order to further increase the corrosion resistance and to protect the laser treated layer from delamination by generating a thin oxide film over the LSM layer. The results revealed that the anodic treatment increased the resistance of the alloy to exfoliation attack.
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Bécavin, Christophe. "Reduction de dimensionalité et analyse des réseaux de voies de signalisation pour les données de transcriptome: Appliquation à la caractérisation des cellules T." Phd thesis, Ecole Normale Supérieure de Paris - ENS Paris, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00563238.
Full textAbstract:
Dans le contexte de l'étude pan-génomique de données d'expression des gènes (transcriptome), différents outils existent déjà. Parmi eux, les techniques de réduction de dimensionnalité cherchent les formes remarquables et les composants importants du système qui peuvent aider à résumer les données. Au cours de ma thèse, j'ai étudié en profondeur les différentes techniques existantes dans ce domaine. Nous avons ensuite développé notre propre approche basée sur la combinaison de la décomposition en valeurs singulières (Singular Value Decomposition) et le Multidimensional Scaling. Nous avons prouvé son utilité et sa précision. En plus des outils d'analyse de données spécifiques à l'étude de l'expression des gènes, nous avons développé un logiciel qui permet de correler l'expression des gènes à des réseaux d'interactions protéine-protéine. Et ceci afin de lier l'information sur l'expression des gènes à celle des interactions entre protéines (protéome) qui ont lieu au sein de la cellule. Tous les outils venant d'être décrits et de nombreux autres ont été utilisés afin d'analyser différent types de données biologiques. La première application a été de corréler l'expression d'auto-anticorps et de cytokines dans le corps humain lors d'une infection au paludisme. Nous avons déterminé des marqueurs spécifiques du paludisme cérébral, permetant à termes de prévenir et détecter plus tôt la maladie. La plus grande analyse que nous avons réalisé visait à définir le profil du transcriptome des cellules T régulatrices (Treg). Ces cellules sont détruites au cours d'une infection par le VIH, une bonne caractérisation moléculaire de celles-ci permettrait par exemple de mieux suivre l'évolution des Treg au cours des traitements pour le SIDA. Parmi les nouveaux marqueurs moléculaires de Treg que nous avons étudié, un nouveau facteur de transcription FOXLF a été découvert, qui pourrait jouer un rôle important dans l'apparition du caractère de "regulation" chez les Treg.
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Nguyen, Nhung Phuong. "Axial Ligand Mutant: H229A." Digital Archive @ GSU, 2008. http://digitalarchive.gsu.edu/honors_theses/1.
Full textAbstract:
Many pathogenic bacteria use their iron acquisition mechanisms to live inside hosts. Streptococcus pyogenes is a pathogenic bacterium that uses streptococcal iron acquisition ABC transporter to obtain heme. SiaA (HtsA, spy1795), a lipoprotein located on the cell surface, serves as a heme binding protein. To understand the iron-uptake mechanism, histidine 229, one of the two proposed axial ligands in SiaA, was mutated to alanine. SiaA H229A was expressed in E. coli, lysed by French Press, and purified by fast protein liquid chromatography (FPLC). SDS-PAGE indicated that pure protein was isolated. Nickel affinity FPLC gave purer H229A when 0.5 M imidazole was added to the binding buffer. Overall, histidine 229 is likely to be an axial ligand in wild type SiaA, as shown by the fact the mutant readily lost heme as evidenced by UV-vis spectra.
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Kalous, Martin. "Srovnání reklamních systémů a vybrání nejvhodnější varianty pro "Pension 48"." Master's thesis, Vysoká škola ekonomická v Praze, 2011. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-124559.
Full textAbstract:
This work deals with internet advertising. Describes the basic characteristics of Internet marketing, survey errors that nascent entrepreneurs engage in formulating goals. Discusses the different types of advertising on the Internet usable in terms of functionality, payment options. It also offers an overview of advertising systems that provide these types of ads. In connection with advertising, the work deals with the problem of blocking. On show are the best known systems that block ads, but also ways to bypass such systems. The aim is to give people who want to invest money into advertising, relevant information about our services and help them choose the right type of promotion for your website. According to predefined criteria to verify the suitability of advertising and advertising system on the guesthouse accommodation in Spindleruv Mlyn. The performance is selected advertising system, its functions, a detailed procedure for creating the campaign and its optimization. The results presented show that the ad was chosen correctly. In addition, there are suggested ways to improve an existing campaign.
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Bousquet, Laurence. "Etude comparative des thérapies anti-VIH : rôle des transporteurs d'efflux sur le passage transmembranaire des antirétroviraux au niveau des cellules CD4+ et de la barrière hémato-encéphalique." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00364246.
Full textAbstract:
Les inhibiteurs de la protéase (PI) du virus de l'immunodéficience humain (VIH) doivent, pour être actifs, pénétrer à l'intérieur des cellules cibles du VIH, comme les lymphocytes et être présents à des concentrations suffisantes au niveau de la protéase virale.Certaines protéines d'efflux pourraient diminuer les concentrations intracellulaires d'IP. Ce travail étudie la pharmacocinétique intracellulaire des IP et leurs mécanismes de transfert à travers la membrane cellulaire à l'aide de modèles cellulaires.
Les IP pénètrent dans la cellule par diffusion passive et s'accumulent par fixation aux protéines cytosoliques.
Nous avons également étudié l'expression de la P-glycoprotéine à l'aide de cellules mononucléées du sang périphérique de patients infectés par le VIH et traités par des multithérapies antivirales à base d'IP.
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Cotillard, Aurélie. "Développement d'une méthodologie robuste de sélection de gènes dans le cadre d'une activation pharmacologique de la voie PPAR." Phd thesis, Ecole Centrale Paris, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00451969.
Full textAbstract:
De part leur dimension élevée, les données de puces à ADN nécessitent l'application de méthodes statistiques pour en extraire une information pertinente. Dans le cadre de l'étude des différences entre deux agonistes de PPAR (Peroxisome Proliferator-Activated Receptor), nous avons sélectionné trois méthodes de sélection de variables : T-test, Nearest Shrunken Centroids (NSC) et Support Vector Machine – Recursive Feature Elimination. Ces méthodes ont été testées sur des données simulées et sur les données réelles de l'étude PPAR. En parallèle, une nouvelle méthodologie, MetRob, a été développée afin d'améliorer la robustesse ce ces méthodes vis à vis de la variabilité technique des puces à ADN, ainsi que leur reproductibilité. Cette nouvelle méthodologie permet principalement d'améliorer la valeur prédictive positive, c'est-à-dire la confiance accordée aux résultats. La méthode NSC s'est révélée la plus robuste et ce sont donc les résultats de cette méthode, associée à MetRob, qui ont été étudiés d'un point de vue biologique.
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Lespinats, Sylvain. "Style du génome exploré par analyse textuelle de l'ADN." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00151611.
Full textAbstract:
Les séquences d'ADN peuvent être considérées comme des textes écrits dans un alphabet de 4 lettres. Des techniques inspirées de l'analyse textuelle permettent donc de les caractériser, entre autres à partir de fréquences d'apparition de courtes suites de caractères (les oligonucléotides ou mots). L'ensemble des fréquences des mots d'une longueur donnée est appelé « signature génomique » (cet ensemble est spécifique de l'espèce, ce qui justifie le terme de « signature »). La signature d'espèce est observable sur la plupart des courts fragments d'ADN, ce qui donne à penser qu'elle résulte d'un « style d'écriture ». De plus, la proximité entre espèces du point de vue de la signature génomique correspond bien souvent à une proximité en terme taxonomique. Pourtant, l'analyse des signatures génomiques se confronte rapidement à des limitations dues à la malédiction de la dimension. En effet, les données de grande dimension (la signature génomique a généralement 256 dimensions) montrent des propriétés qui mettent en défaut l'intuition. Par exemple, le phénomène de concentration des distances euclidiennes est bien connu.Partant de ces constatations, nous avons mis en place des procédures d'évaluation des distances entre signatures de façon à rendre plus manifeste les informations biologiques sur lesquelles s'appuient nos analyses. Une méthode de projection non-linéaire des voisinages y est associée ce qui permet de s'affranchir des problèmes de grande dimension et de visualiser l'espace occupé par les données. L'analyse des relations entre les signatures pose le problème de la contribution de chaque variable (les mots) à la distance entre les signatures. Un Z-score original basé sur la variation de la fréquence des mots le long des génomes a permis de quantifier ces contributions. L'étude des variations de l'ensemble des fréquences le long d'un génomes permet d'extraire des segments originaux. Une méthode basée sur l'analyse du signal permet d'ailleurs de segmenter précisément ces zones originales.
Grâce à cet ensemble de méthodes, nous proposons des résultats biologiques. En particulier, nous mettons en évidence une organisation de l'espace des signatures génomiques cohérente avec la taxonomie des espèces. De plus, nous constatons la présence d'une syntaxe de l'ADN : il existe des « mots à caractère syntaxique » et des « mots à caractère sémantique », la signature s'appuyant surtout sur les mots à caractère syntaxique. Enfin, l'analyse des signatures le long du génome permet une détection et une segmentation précise des ARN et de probables transferts horizontaux. Une convergence du style des transferts horizontaux vers la signature de l'hôte a d'ailleurs pu être observée.
Des résultats variés ont été obtenus par analyse des signatures. Ainsi, la simplicité d'utilisation et la rapidité de l'analyse des séquences par signatures en font un outil puissant pour extraire de l'information biologique à partir des génomes.
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Regulus, Peggy. "Détection, caractérisation et mesure d'un nouveau dommage radio-induit de l'ADN isolé cellulaire." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00134380.
Full textAbstract:
L'acide désoxyribonucléique (ADN) est porteur de l'information génétique et les conséquences biologiques des lésions survenant sur cette molécule peuvent être importantes. Nous avons utilisé la chromatographie liquide haute performance couplée à la spectrométrie de masse en mode tandem (CLHP/SM-SM) pour mettre en évidence la formation de nouvelles lésions radio-induites de l'ADN. L'analyse par CLHP/SM-SM en mode « perte de neutre » utilise la perte de 116 unités de masse, spécifique de la fragmentation de la majorité des nucléosides. Ainsi, 4 nouvelles lésions radio-induites, dont la quantité formée est proportionnelle à la dose d'irradiation, ont été détectées dans l'ADN isolé. L'une d'elles, la dCyd341 est de plus formée dans l'ADN cellulaire. Il s'agit d'une modification de la 2'-désoxycytidine (dCyd) ayant un poids moléculaire de 341 uma. La synthèse chimique de ce nucléoside modifié nous a permis de le caractériser par résonance magnétique nucléaire (RMN) et de déterminer sa masse exacte. Un mécanisme de formation a été proposé, dans lequel l'évènement initiateur est l'arrachement de l'atome d'hydrogène en position 4 du 2-désoxyribose (dR) génèrant un intermédiaire aldéhydique capable de réagir sur une cytosine voisine. La dCyd341 peut être considérée comme un dommage complexe, sa formation impliquant une cassure de la chaîne d'ADN et un pontage entre un produit de modification du dR et une dCyd voisine. En plus de sa caractérisation, de premières études biologiques portant sur la réparation de la dCyd341 ont révélé que la lésion est excisée de l'ADN avec une certaine efficacité.