Dissertations / Theses: 'Réponse immunitaire – Recherche – Analyse'

1

Remot, Aude. "Facteurs immunologiques de la sensibilité néonatale au virus respiratoire syncytial." Electronic Thesis or Diss., Paris, AgroParisTech, 2013. http://www.theses.fr/2013AGPT0022.

Full text

Abstract:

Le virus respiratoire syncytial (VRS) est la cause majeure des bronchiolites du nourrisson. Mon travail de thèse a porté sur les réponses immunitaires et inflammatoires propres au poumon en période néonatale, à l’homéostasie, lors d’une infection par le VRS et en réponse à un vaccin.A l’homéostasie, l’environnement pulmonaire du souriceau BALB/c de 6 jours est pauvre en cellules dendritiques (DC) plasmacytoïdes et conventionnelles mais riches en lymphocytes exprimant le facteur GATA3 qui semblent à l’origine du biais Th2 des réponses néonatales. Les évènements précoces mis en jeu au niveau pulmonaire lors de l’infection VRS ont été appréhendés par une étude transcriptomique comparant le souriceau nouveau-né à l’adulte. J’ai ainsi montré que le recrutement des DC et les voies interférons (IFN) sont déficients chez le souriceau infecté. Le traitement des souriceaux par un facteur d’expansion des DC, le Flt3-L, avant une primo-infection par le VRS, augmente le nombre de DC pulmonaires, restaure les voies IFN et prévient l’exacerbation de la pathologie pulmonaire lors d’une ré-infection à l’âge adulte. Enfin, j’ai évalué le potentiel protecteur d’un vaccin contre le VRS basé sur l’administration nasale de nanostructures formées par la nucléoprotéine virale. J’ai montré que la nature des adjuvants combinés à notre antigène est un élément critique pour générer des réponses immunitaires antivirales protectrices sans risque d’exacerbation de l’inflammation pulmonaire.En conclusion, l’étude des réponses pulmonaires du nouveau-né a montré leurs spécificités par rapport à celles de l’adulte et m’a permis de proposer des pistes pour adapter les traitements à cet âge
The respiratory syncytial virus (RSV) is the main causative agent of bronchiolitis during infancy. During my thesis, I have characterized the immunological and inflammatory responses in the lung during the neonatal period, at steady-state, during an RSV infection and in response to a vaccine.At steady-state, the lung environment of 6-days-old BALB/c pups is poor in plasmacytoid and conventional dendritic cells (DC), but rich in T lymphocytes expressing GATA-3, suggesting that the Th2 bias of immune responses is an intrinsic feature of the neonatal T lymphocytes. Then, I used a global transcriptomic approach to gain more insight into early events to RSV infection, by comparing pups and adult mice lung responses. I showed that DC recruitment and interferon (IFN) pathways were deficient in infected neonates. Pups treated with the widely used DC growth factor, Flt3-L, prior to RSV infection, have an increased lung DC number and their IFN pathways were partially restored. They were protected against enhanced weight loss and airway inflammation upon reinfection at adult age. Finally, I evaluated a nasal vaccine against RSV (recombinant viral nucleoproteins) in BALB/c pups. I showed that the nature of adjuvants combined with our antigen is a critical component to generate antiviral immune responses that protect against virus replication without exacerbating lung inflammation.Thus, the study of neonatal lung immune responses showed specificities in comparison with those of adults, and allowed me to propose new strategies to prevent RSV disease at this age

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

2

Leulier, François. "Analyse génétique de la réponse immunitaire de Drosophila melanogaster." Paris 7, 2003. http://www.theses.fr/2003PA077068.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

3

Perrodou, Emmanuel. "Caractérisation chez la drosophile de molécules de la famille C3 du complément / α2-macroglobuline : Recherche de fonction." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2003. http://www.theses.fr/2003STR13047.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

4

Girel, Simon. "Modélisation de la réponse Immunitaire T-CD8 : analyse mathématique et modèles multiéchelles." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSE1250/document.

Full text

Abstract:

L'infection d'un organisme par un agent pathogène déclenche l'activation des lymphocytes T-CD8 et l'initiation de la réponse immunitaire. Il s'ensuit un programme complexe de prolifération et de différenciation des lymphocytes T-CD8, contrôlé par l'évolution de leur contenu moléculaire. Dans ce manuscrit, nous présentons deux modèles mathématiques de la réponse T-CD8. Le premier se présente comme une équation différentielle à impulsions grâce à laquelle nous étudions l'effet du partage inégal des protéines lors des divisions cellulaires sur la régulation de l'hétérogénéité moléculaire. Le second est un modèle à base d'agents couplant la description d'une population discrète de lymphocytes T-CD8 à celle du contenu moléculaire de ces derniers. Ce modèle s'avère capable de reproduire les différentes phases caractéristiques de la réponse T-CD8 aux échelle cellulaire et moléculaire. Ces deux travaux supportent l'hypothèse que la dynamique cellulaire observée in vivo est le reflet de l'hétérogénéité moléculaire qui structure la population de lymphocytes T-CD8
Infection of an organism by a pathogen triggers the activation of the CD8 T-cells and the initiation of the immune response. The result is a complex program of proliferation and differentiation of the CD8 T-cells, controlled by the evolution of their molecular content. In this manuscript, we present two mathematical models of the CD8 T-cell response. The first one is presented as an impulsive differential equation by which we study the effect of unequal molecular partitioning at cell division on the regulation of molecular heterogeneity. The second one is an agent-based-model that couples the description of a discrete population of CD8 T-cells and that of their molecular content. This model can reproduce the different typical phases of the CD8 T-cell response at both the cellular and the molecular scales. These two studies support the hypothesis that the cell dynamics observed in vivo is a consequence of the molecular heterogeneity structuring the CD8 T-cell population

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

5

Levy, Francine. "Analyse de la réponse immunitaire de la drosophile par une approche protéomique." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2005/LEVY_Francine_2005.pdf.

Full text

Abstract:

Grâce au séquençage du génome de la drosophile en mars 2000, les analyses post-génomiques sur cet insecte ont connu un essor exceptionnel. L'étude de l'expression des gènes et de leurs produits peut être abordée soit en mesurant le niveau quantitatif des ARN messagers (transcriptomique), soit en étudiant directement les peptides/protéines présents à un instant donné (peptidomique/protéomique). Ces deux approches sont complémentaires, cependant seule la seconde permet d'étudier les modifications post-traductionnelles, jouant un rôle essentiel dans la fonctionnalité des protéines, ou encore les interactions au sein de complexes multiprotéiques fonctionnels. Au cours de ma thèse, j'ai mis en place une stratégie d'étude protéomique afin d'analyser les protéines de l'hémolymphe de drosophile contrôles ou infectées expérimentalement. Pour cela, deux techniques ont été utilisées : la première est basée sur l'électrophorèse bidimensionnelle, et la seconde sur le marquage différentiel isotopique des échantillons. En comparant les profils protéiques de l'hémolymphe des drosophiles avant et après infection, j'ai mis en évidence et identifié de nombreuses molécules dont la concentration relative varie significativement suite à l'infection. Certaines correspondent à des protéases ou des inhibiteurs de protéase, d'autres à des protéines sensorielles, des molécules antioxydantes, des protéines de liaison aux lipides, au calcium et au fer. Les résultats obtenus ont permis de mettre en évidence de nouveaux candidats dont l'implication dans la réponse immunitaire était insoupçonnée jusqu'alors. L'analyse protéomique globale réalisée au cours de ma thèse nous a ainsi permis d'ouvrir de nouvelles perspectives pour aborder l'étude des mécanismes de défense de la drosophile
Sequencing of the genome of the insect model, Drosophila melanogaster, which was completed in 2000, gave a great impetus to post-genomic studies. Investigation of gene and gene product expression can be achieved by transcriptomic and peptidomic/proteomic analyses. These approaches are complementary, however, only the latter allows the study of post-translational modifications, which play an important role in protein functionality, or interactions within protein complexes. Improvements in advanced techniques and bioinformatics provide new tools to characterize proteins involved in physiological processes, such as the immune response of Drosophila. Profiling of the proteins present in the hemolymph of noninfected flies versus flies infected by various microorganisms, was realized by two-dimensional gel electrophoresis and differential isotope labelling of samples. Through this differential analysis, various families of molecules were found to be regulated after the infection. Among them, I identified proteases, protease inhibitors, odorant binding proteins and molecules involved in the binding of lipids, calcium or iron. These molecules are thus new candidates for the further detailed investigation of innate immune mechanisms. In summary, this differential proteomic analysis of the immune response of Drosophila, provides new prospects for the study of proteins regulated during innate immunity

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

6

Hauvespre, Caroline. "Analyse des variantes d'épissage de l'Interleukine-4 dans l'étude de la réponse immunitaire." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00994430.

Full text

Abstract:

L'interleukine-4, cytokine clef du système immunitaire, est l'une des composantesprincipales de la réponse humorale. Un variant d'épissage de l'IL-4 humaine, nommé IL-4δ2est caractérisé par une délétion de l'exon 2. L'expression d'isoformes de cytokines peut êtrespécifique d'un tissu, d'un stimulus ou d'un état pathologique. Un intérêt particulier leur estaccordé car leur présence ou leur niveau d'expression peut en faire des biomarqueurspotentiels de certains stades pathologiques. Ainsi, ce projet a été consacré à l'étude del'expression et de la fonctionnalité de l'IL-4δ2 dans le but de mieux caractériser son rôle ausein de la réponse immunitaire.Une étude cinétique des niveaux d'expression de l'interleukine-4 et de son variant,réalisée chez des donneurs sains, montre une expression de ces deux variants dépendante dudonneur. L'étude a été poursuivie pour déterminer le type cellulaire capable de produire l'IL-4δ2. Ainsi, l'IL-4δ2 ne semble pas être exprimée par les cellules CD4+ et CD8+ à l'inversedes granulocytes.La fonction agoniste ou antagoniste à l'IL-4, de l'isoforme δ2, sujette à controverse, ajustifié une exploration de sa fonctionnalité. Nous avons ainsi évalué la capacité de l'IL-4δ2 àactiver les voies de signalisation de l'IL-4. Une absence d'activation de mécanismescellulaires similaires à l'IL-4 nous suggère un potentiel rôle inhibiteur de ce variant.Au cours du travail sur l'IL-4δ2, un nouveau variant d'épissage de l'IL-4 a étédécouvert chez l'homme. Par épissage alternatif, un nouvel exon est retenu dans l'ARNm dece variant. L'étude de celui-ci nous a permis de proposer, pour cet ARNm, une dégradationpar le mécanisme de Nonsens-Mediated Decay (NMD). Cette découverte apporte un niveausupplémentaire dans la compréhension du système de régulation de l'IL-4.Ce sujet d'étude apporte de nouveaux éléments quant à l'expression et la fonction del'IL-4δ2. De plus, l'identification d'un nouveau variant d'épissage enrichit la connaissancesur la régulation de l'expression du gène de l'Il4. D'une façon générale, la prise en comptedes variants d'épissage des cytokines devrait permettre de mieux caractériser la réponseimmunitaire, essentielle dans un contexte de vaccinologie.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

7

Defendini, Maria Léria. "Réponse immune à l'apamine : analyse de la restriction génétique, du traitement antigénique et de la spécificité de reconnaissance des anticorps poylclonaux ey monoclonaux." Aix-Marseille 2, 1990. http://www.theses.fr/1990AIX22030.

Full text

Abstract:

L'apamine, peptide toxique extrait du venin d'abeille, comporte 18 acides amines. De par une structure compacte reticulee par deux ponts disulfure, elle s'est averee constituer un modele de choix pour l'etude de la reponse immune a un antigene peptidique. Nous montrons dans ce travail que la reponse du systeme immunitaire contre l'apamine est assujettie au controle genetique opere par les molecules de classe ii du complexe majeur d'histocompatibilite, i-a#b et i-a#d. Tel un antigene proteique conventionnel, sa presentation aux lymphocytes t auxiliaires competents necessite un remaniement antigenique, impliquant essentiellement un depliement de la structure native. L'epitope reconnu par des hybridomes t anti-apamine correspond a la region n-terminale de la molecule. D'autre part, ce peptide genere de fortes reponses humorales chez les animaux de laboratoire auxquels elle est administree (lapin, souris). L'etude de la reponse polyclonale anti-apamine montre que la specificite des antiserums produits chez le lapin concerne majoritairement la partie centrale de la toxine (helice ). L'obtention d'anticorps monoclonaux a permis une caracterisation detaillee des epitopes b. La reponse monoclonale anti-apamine corrobore les resultats observes au niveau polyclonal et se trouve de meme, dirigee essentiellement contre les residus rassembles par la conformation native en helice. Le greffage de l'apamine sur un vecteur proteique (serum albumine bovine) elargit considerablement le champ de la reponse immune, montrant que toute la surface du peptide est potentiellement antigenique

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

8

Bain, Christine. "Réponse immunitaire antitumorale dans le modèle de l'adénocarcinome du rein : analyse des mécanismes d'immunosuppression." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO1T275.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

9

Chirica, Mircea. "Analyse de la réponse immunitaire anti-tumorale selon les caractéristiques oncogénétiques du cancer colorectal." Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015USPCC082.

Full text

Abstract:

Les cancers colorectaux (CCR) se développent en face d'un système immunitaire important associé à la muqueuse intestinale. Les avancées récentes en immunologie tumorale ont mis en évidence le rôle de la réponse immunitaire dans le développement, l'évolution et le pronostic des cancers. Le système immunitaire est capable de modifier activement les cellules précancéreuses à fur et à mesure qu'elles apparaissent dans les tissus. La qualité de la réponse immunitaire contre la tumeur est un facteur pronostique important chez les patients atteints de CCR. Différents types de mutations génétiques impliqués dans le CCR ont étés décrites. Certaines sont associées à un meilleur pronostic (instabilité des microsatellites, MSI) et d'autres à un mauvais pronostic (BRAF). Ces résultats s'expliquent par la capacité de la tumeur à modeler la réponse immunitaire anti tumorale. D'autres biomarqueurs prédictifs ont été décrits tels les mutations des gènes KRAS, NRAS, PIK3CA et TP53 mais leur rôle pronostique reste incertain. Dans ce travail, nous avons étudié de façon comparative les lymphocytes T infiltrant la tumeur (TIL), la muqueuse non tumorale et les lymphocytes T du sang périphérique. Nous avons observé que les TIL ont un phénotype activé, avec engagement de la voie NKG2D dans des LT CD8. Nous montrons l'expansion d'une sous population de LT CD4 exprimant NKG2D qui présentent des fonctions cytotoxiques parmi les TIL et dans la muqueuse non tumorale. Enfin, nous montrons que les caractéristiques ontogénétiques des CCR influencent la réponse immunitaire à l'intérieur de la tumeur car les populations de TIL différent selon le statut MSI et de la présence d'une mutation KRAS ou NRAS
Colorectal cancers (CRC) develop in the face of an important immune system associated with the intestinal mucosal tissue. Recent advances in tumor immunology have highlighted the role of the immune response in the development, evolution and outcome of cancers. The immune system is thought to actively edit out pre-cancerous tells in tissues as they appear. The quality of the immune response against the tumor has emerged as an important prognostic factor in patients with CRC. Several studies have highlighted the different type of mutations and developmental processes involved in CRC. Some of these mutations are associated with better prognosis (microsatellite instability, MSI) and other with poor outcome (BRAF mutations). Some studies suggest that part of these differential outcomes is driven by the capacity of the tumor to induce a strong immune response. Several other predictive biomarkers have been described including mutations of the KRAS, NRAS, PIK3CA and TP53 genes but their prognostic role remains uncertain. In this study T tells infiltrating the tumor were compared to tells populating the unaffected neighboring mucosal tissue and tells from the peripheral blood. We observed that T tells from the tumor harbor an activated phenotype, with engagement of the NKG2D pathway in CD8 T tells. We show that mucosal and tumor-infiltrating T tells are enriched in NKG2D CD4 T tells, which exhibit cytotoxic functions. Finally, the oncogenic status of the cancer appears to influence the immune response within the tumor as T tell populations differ in MSI compared to MSS tumors and KRAS/NRAS mutated tumors compared to their wild type counterparts

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

10

Rutschmann, Sophie. "La Réponse immunitaire humorale de la drosophile : Analyse génétique par mutagenèse systématique à l'EMS." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2002. http://www.theses.fr/2002STR13042.

Full text

Abstract:

Les Insectes se défendent contre les agressions microbiennes par un ensemble de réactions très efficaces qui comportent la synthèse de peptides antimicrobiens à large spectre d'activité. Une étude génétique menée chez la drosophile a montré qu'au moins deux voies indépendantes contrôlent l'expression des peptides antimicrobiens : la voie Toll qui régule la réponse antifongique, et la voie imd qui est responsable de l'activation de la réponse antibactérienne. De nombreux aspects de la régulation de la réponse innée de la drosophile restaient à élucider : quels sont les mécanismes de reconnaissance des pathogènes? Quelles sont les cascades d'activation dans l'hémolymphe induites par cette reconnaissance? Quels sont les acteurs non encore identifiés des voies imd et Toll? Pour tenter de répondre à ces questions, l'équipe au sein de laquelle j'ai effectué ce travail de thèse a mis en oeuvre une mutagenèse saturante à l'EMS (Ethyle Méthane Sulfonate) du chromosome II de drosophile. Cette approche a pour but d'isoler tous les gènes du chromosome II impliqués dans la régulation de l'expression des peptides antimicrobiens. Lors de la mutagenèse, nous avons réalisé plus de 27000 croisements et établi 7600 lignées homozygotes pour des mutations du chromosome II. Le crible des mutants a permis d'isoler plusieurs souches mutantes de drosophiles dont la réponse innée est affectée. Les résultats issus de l'analyse de deux de ces mutants nous ont permis de montrer que Dif, un facteur de transcription de la famille Rel, est un médiateur essentiel de la réponse antifongique et contre certaines bactéries (Gram positif). De plus, nous avons isolé des mutations dans kenny, qui sont caractérisées par une perte de réponse aux infections bactériennes (Gram négatif). Ainsi, l'identification de nouveaux gènes de la réponse immunitaire de la drosophile a contribué à démontrer que les voies Toll et imd sont largement indépendantes au niveau de la transduction du signal
Insects are able to mount an efficient host defense to fight against microbial infections. A hallmark of their immune response is the synthesis and release in the hemolymph of a cocktail of antimicrobial peptides. Genetic studies have shown that, in Drosophila, at least two independent pathways control the expression of antimicrobial peptides : the Toll pathway, that regulates the antifungal response, and the imd pathway, that is responsible for the antibacterial response. Nevertheless, some aspects of the regulation of the immune response remained to be elucidated : what are the mechanisms that allow self versus self-non self recognition? What are the components of the activating cascades through hemolymph that signal the presence of pathogens? Which are the members of the imd and Toll pathways that are still unknown? To address these questions, the team in which I accomplished my Ph. D. Thesis realized an EMS (Ethyl Methan Sulfonate) mutagenesis screen of the second chromosome of Drosophila. The aim of this approach is to identify all the genes involved in the regulation of the antimicrobial peptide genes expression. During the mutagenesis screen, we performed more than 27000 crosses and established 7600 fly strains homozygote for mutations carried by the second chromosome. Screening these mutants allowed us to recover several Drosophila lines affected either in the antifungal or the antibacterial response. Analysis of these mutants suggest that the two distinct pathways controlling Drosophila immune response result in the activation of two different Rel proteins : Dif (antifungal pathway) and Relish (antibacterial pathway). The cloning of the genes identified during the screen allowed us to show that the two pathways mediating antimicrobial immune response in Drosophila are largely independant

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

11

Cornet, Sébastien. "Optimisation de la réponse immunitaire dirigée contre les antigènes de tumeurs universels : de la recherche au développement clinique." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066283.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

12

Pestel, Joël. "Analyse de mécanismes régulateurs de la réponse immunitaire vis-à-vis de la schistosomiase : rôle du macrophage, du lymphocyte et de l'IgE." Lille 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LIL10129.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

13

Bouziat, Romain. "Analyse des répertoires lymphocytaires T CD8+ murins éduqués par et mobilisés contre la molécule HLA-A02. 01." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066267.

Full text

Abstract:

Au cours de l’éducation thymique ou de réponses allogéniques, le TCR  reconnaît une molécule du CMH présentant un peptide. Bien que les structures cristallographiques, obtenues à ce jour, de complexes TCR/CMH-peptide aient apporté des informations importantes sur l’orientation du TCR, les règles gouvernant ces interactions restent encore mal comprises. A l’aide de différentes lignées de souris HLA classe I transgéniques exprimant, suite à des rétrocroisements appropriés (souris H-2 Kb, Db, beta2 microglobuline murine triple KO) les allèles HLA-A1. 3, -A2. 1 et -B27. 5, sous forme de monochaînes, dans un contexte H-2 classe I KO, nous avons analysé par PCR quantitative les répertoires TCR AV des lymphocytes T CD8 de ces souris et observé au niveau éducationnel un répertoire diversifié mais utilisant préférentiellement une chaîne AV donnée. L’analyse complète des répertoires éduqués par la molécule HLA-A2. 1 par comparaison à une souris C57BL/6 normale, nous a permis de documenter une expansion très importante de lymphocytes T CD8+ exprimant un TCR avec une chaîne alpha à segment variable de la famille AV9. Chez ces mêmes animaux, cette famille AV9 n’est présente qu’à hauteur de 7% au sein des lymphocytes T CD4. Corrélativement, la stimulation in vitro de splénocytes de souris C57BL/6 par la molécule HLA-A2. 1 induit une réponse d’amplitude très inhabituelle avec une expansion très significative (10 %  30 %) des T CD8 à chaîne alpha AV9. Ces observations faites sur des populations lymphocytaires globales ont été confirmées, lors de cultures mixtes lymphocytaires primaires, au niveau clonal, par obtention et analyse d’hybridomes T : 75 % des hybridomes reconnaissant spécifiquement HLA-A2. 1 portent une chaîne alpha AV9. Dans les 3 cas (répertoire naïf, populations alloréactives, hybridomes), le séquençage des CDR3 des chaînes alpha AV9 a révélé une grande diversité structurale et l’identification (hybridomes T) des chaînes beta associées, comme l’analyse du CDR3 de ces chaînes, ont également documenté une diversité très large. Il semble donc que l’on soit devant un exemple de réaction allogénique particulièrement intense et déterminée (bien que la diversité des CDR3 suggère que ces TCR réagissent avec des peptides différents) par les particularités structurales des hélices alpha de la molécule HLA-A2. 1 et le développement d’interactions particulièrement fortes avec les CDR1 et CDR2 des segments variables de la famille AV9. Ces observations pourraient rendre compte de l’intensité de certaines réponses allogéniques en transplantation humaine.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

14

Lhomme, Édouard. "Analyse des déterminants et modélisation de la réponse immunitaire post-vaccination dans des stratégies vaccinales expérimentales." Thesis, Bordeaux, 2019. http://www.theses.fr/2019BORD0271.

Full text

Abstract:

Les essais cliniques de vaccins posent des défis méthodologiques particuliers, principalement liés à la spécificité du développement des vaccins, les schémas des essais cliniques, de l'absence d'un corrélat de protection validé et de la complexité des techniques immunologiques évaluant l'immunogénicité des candidats vaccins. Celles-ci nécessitent des recherches méthodologiques pour définir les méthodes les plus appropriées. Cette thèse porte sur la recherche méthodologique visant à optimiser les méthodes utilisées dans le développement clinique des vaccins, notamment pour proposer et développer des méthodes statistiques de modélisation de l'immunogénicité, en prenant comme exemple les essais cliniques des vaccins contre le VIH et le virus Ebola.Nous avons d'abord étudié la dynamique des réponses immunitaires après la vaccination et montré qu'il faudrait tenir compte des temps de mesure précoce dans les futurs essais cliniques pour mieux comprendre le rôle des lymphocytes T CD4 auxiliaires et évaluer leur rôle prédictif dans la réponse immunitaire aux vaccins. Ensuite, nous avons développé une nouvelle approche de modélisation bivariée pour l'analyse de la réponse cellulaire mesurée par la technique de cytométrie en flux de marquage des cytokines intracellulaires (ICS). Cette nouvelle méthode a montré de très bonnes performances statistiques et devrait devenir la nouvelle méthode statistique standard pour les analyses ICS dans les essais vaccinaux. Ce travail aura un impact direct sur l'évaluation de la réponse du ICS dans les essais cliniques de vaccins.En ce qui concerne la réponse humorale, nous avons montré qu'il subsiste des incertitudes importantes sur les déterminants de la réponse anticorps après une vaccination préventive contre le virus Ebola. Cela met l'accent sur l'intérêt d'harmoniser les méthodes de mesure et les schémas d'étude. De plus, il indique le besoin de mettre en place des essais cliniques randomisés à bras multiples sur le vaccin contre le virus Ebola pour une comparaison précise de l'immunogénicité entre les différentes stratégies vaccinales.Nous avons présenté enfin la méthodologie d’un essai randomisé de phase 2 contre le virus Ebola évaluant trois stratégies vaccinales dans quatre pays d’Afrique de l’Ouest, et plus particulièrement pour finir une réflexion méthodologique et éthique sur la question de l’inclusion des personnels de l’essai dans un essai clinique vaccinale contre le virus Ebola en période non-épidémique.Les méthodes développées dans le cadre de cette thèse contribueront à améliorer la conception et l'analyse des futurs essais vaccinaux, et pourraient également être transposées plus largement à d'autres domaines de recherche
Specific methodological challenges exist in vaccine clinical trials, due principally to specificities of vaccine development, clinical trial design, absence of validate correlate of protection, and complexities of new immunological assays for evaluating immunogenicity of vaccine candidates. These require methodological research to define the most appropriate methods. This thesis focuses on methodological research to optimize methods used in the clinical development of vaccines, especially to propose and develop statistical methods to model immunogenicity, using HIV and Ebola vaccine clinical trials as an example.We first investigated the dynamics of the immune responses post-vaccination and showed that early sampling time points should be considered in future clinical trials to better understand the role of the early CD4 helper T cells and to evaluate their predictive role in the immune response to vaccines. Then, we developed a new bivariate modelling approach for the analysis of the cellular immune response (assessed by intracellular cytokine staining, ICS) that showed good statistical performances and should become the new statistical standard method for ICS analyses in vaccine trials. This work will have a direct impact on the assessment on the ICS response in vaccine clinical trials.Regarding the humoral response, we showed that there are still significant uncertainties in the determinants of the antibody response after preventive vaccination against Ebola virus disease. This emphasizes the interest of harmonizing measurement methods and study designs. Furthermore, it indicates the need of randomized multi arm Ebola vaccine trials for accurate comparison of immunogenicity between different vaccine strategies.Finally, we presented the methodology of an international randomized phase 2 trial against Ebola, and in particular a methodological and ethical reflection related to the enrollment of study personnel in Ebola vaccine trial in a non-epidemic context.Methods developed in this thesis will contribute to improve the design and analysis of future vaccine trials, and also could be transposable more widely to other research domains

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

15

Zaidman-Rémy, Anna. "Analyse génétique de la fonction des peptidoglycan recognition proteins dans la réponse immunitaire de la drosophile." Paris 7, 2007. http://www.theses.fr/2007PA077216.

Full text

Abstract:

L'immunité innée est un mécanisme de défense essentiel et très conservé. Chez la drosophile, la réponse immunitaire inclut la synthèse de peptides antimicrobiens contrôlée par deux voies de signalisation en réponse aux infections par des bactéries à Gram-positif (voie Toll) ou à Grain-négatif (voie Imd). Leur activation repose sur la reconnaissance du peptidoglycane (PG) de l'enveloppe des bactéries par une famille de protéines, les Peptidoglycan Récognition Proteins (PGRPs). Parmi ces PGRPs, certains possèdent une activité enzymatique de dégradation du PG. Des approches biochimiques et fonctionnelles in vivo nous ont permis de déterminer les rôles de deux de ces PGRPs dits catalytiques. PGRP-LB est une protéine sécrétée qui dégrade spécifiquement le PG des bactéries à Gram-négatif et lui fait perdre sa capacité immuno-stimulante. PGRP-LB diminue ainsi le niveau d'activation de la voie Imd en dégradant son éliciteur : le PG. La régulation de l'expression de PGRP-LB par cette même voie crée une boucle de rétroaction négative qui ajuste la réponse immunitaire à la sévérité de l'infection. Nous montrons aussi un rôle de PGRP-LB dans le contrôle de la réponse immunitaire intestinale et la tolérance aux commensaux. PGRP-SB1 possède quant à elle une activité bactéricide in vivo requise dans la défense contre certains germes bactériens. Cette enzyme est exprimée très fortement via la voie Imd pendant l'infection, et est sécrétée dans l'hémolymphe où elle participe à l'élimination des bactéries. Nos données soulignent le rôle central des PGRPs de drosophile dans la reconnaissance des agents infectieux, la modulation de la réponse immunitaire et l'élimination des bactéries
In Drosophila, two pathways regulate the expression of antimicrobial peptides in response to bacterial infection. The activation of these pathways relies on the detection of the peptidoglycan (PGN) of the bacterial cell wall by a conserved family of proteins, the Peptidoglycan Recognition Proteins (PGRPs). The receptors PGRP-SA and SD function upstream of the Toll pathway in the sensing of PGN from gram-positive bacteria while PGRP-LC and LE activate the Imd pathway upon recognition of PGN from gram-negative bacteria. In addition to these recognition PGRPs that can bind and recognize PGN, a second class of PGRPs named catalytic PGRPs can degrade PGN. A combination of biochemical and genetic approaches allowed us to determine two important functions for catalytic PGRPs. First, we shown that PGRP-LB is a secreted protein regulated by the Imd pathway, which specifically degrades gram-negative bacterial PGN into non-immunostimulatory fragments. We demonstrated that the regulation of PGRP-LB by the Imd pathway provides a negative feedback regulation to tightly adjust immune activation to infections. We also revealed a role of PGRP-LB in the control of the gut immune response and the tolerance to commensals. Second, we demonstrated in vivo an essential bactericidal function for the enzyme PGRP-SB1, which is strongly induced by the Imd pathway after an infection and is secreted into the hemolymph, where it participates in the elimination of bacteria. Collectively, our work indicates that PGRPs are essential components of the Drosophila host defence that act not only in the sensing of microbes but also as regulators and effectors of the antibacterial response

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

16

Bascove, Matthieu. "Etude du système immunitaire d'un amphibien et analyse des effets de l'environnement sur sa réponse humorale." Thesis, Nancy 1, 2009. http://www.theses.fr/2009NAN10129/document.

Full text

Abstract:

During my PhD, I have participated to the characterization of Pleurodeles waltl (urodele amphibian) antibody heavy chains and to the discovery of a new isotype that we named IgP. I have also demonstrated that each antibody heavy chain has its human counterpart. P. waltl IgM are the counterpart of human IgM. IgY are expressed in mucosa and are therefore the physiological counterpart of human IgA. Finally, IgP are predominantly expressed in larvae and are less diverse than IgM. These two characteristics are shared with antibodies produced by mammalian B1 cells. These studies allowed me to approach the effects of a long term spaceflight on the humoral immune response, i.e. the antibody mediated response, which up to now has been poorly studied. The Development and Immunogenetics team, JE 2537, has immunized adult P. waltl during their five month stay onboard the Mir space station and showed that heavy chain variable domains of specific IgM are encoded by genes belonging to the VHII and VHVI families. However, these families are used in different proportions in animals immunized onboard Mir by comparison to animals immunized on Earth. To better understand this difference, I have determined how these animals use their individual VHII and VHVI genes. My work revealed that only one VHII gene and four VHVI genes (A, B, C and D) are used by immunized animals. I observed an increase in the expression of IgM heavy chain mRNAs encoded by the VHII, VHVI.C and VHVI.D genes and a strong decrease in the expression of IgM heavy chain mRNAs encoded by the VHVI.A and VHVI.B genes in spaceflight animals, demonstrating that this environment affects the humoral response. These observations may be due to a change in B-cell selection under spaceflight conditions. Furthermore, I described for the first time the effects of spaceflight on somatic hypermutations. I isolated and characterized the P. waltl mRNA coding for the main effector of these mutations: the activation-induced cytidine deaminase (AID). I demonstrated that this protein is present and conserved in P. waltl. Then, I described somatic hypermutations in P. waltl. I mapped somatic hypermutations, studied their distribution and calculated their frequency in animals immunized on Earth and in animals immunized onboard the Mir space station. This work revealed a strong depression of somatic hypermutations in animals immunized onboard Mir. This observation does not result from a change in AID transcription. We believe that this may be the consequence of a lower B lymphocyte survival under spaceflight conditions
Durant ma thèse, j'ai participé à la caractérisation des isotypes de chaînes lourdes d'anticorps chez le pleurodèle (Pleurodeles waltl, amphibien urodèle) et à la mise en évidence d'un nouvel isotype d'anticorps : les IgP. J'ai également montré que chaque chaîne lourde a son équivalent humain. Les IgM du pleurodèle sont l'équivalent des IgM humaines. Les IgY sont exprimées principalement au niveau des muqueuses tout comme les IgA humaines. Enfin, les IgP sont observées majoritairement chez les larves et ont une diversité plus faible que les IgM. Ces deux caractéristiques sont partagées avec les anticorps produits par les cellules B1. Ces travaux m'ont ensuite permis d'aborder l'impact d'un séjour de longue durée dans l'espace sur la réponse immunitaire humorale, c'est-à-dire la réponse médiée par les anticorps qui, jusqu'à présent, a été très peu étudiée. L'équipe Développement et Immunogénétique, JE 2537, a immunisé des pleurodèles lors d'un séjour de 5 mois à bord de la station spatiale Mir et a montré que les chaînes lourdes d'IgM produites en réponse à la stimulation antigénique sont fabriquées à partir de gènes des familles VHII et VHVI. Cependant ces familles sont utilisées dans des proportions différentes chez les animaux immunisés dans Mir. Mes travaux ont permis d'approfondir ces résultats par une étude des gènes VHII et VHVI utilisés dans ces chaînes lourdes. J'ai ainsi montré qu'un seul gène VHII et quatre gènes VHVI (A, B, C et D) sont utilisés par les animaux immunisés. Les gènes VHII, VHVI.C et VHVI.D sont plus exprimés chez les animaux immunisés dans Mir alors que l'expression des gènes VHVI.A et VHVI.B est fortement diminuée chez ces mêmes animaux. Ces résultats démontrent clairement que le séjour dans Mir a affecté la réponse immunitaire humorale de ces animaux. Ces observations pourraient résulter d'un changement de la distribution et de sélection des lymphocytes B dans l'espace. Par ailleurs, j'ai décrit pour la première fois les effets d'un séjour dans l'espace sur les hypermutations somatiques. Avant d'étudier ce phénomène, j'ai isolé et caractérisé chez le pleurodèle l'ARNm codant l'effecteur indispensable pour ces mutations : la protéine AID (activation-induced cytidine deaminase). J'ai ainsi montré que cette protéine est bien présente et conservée dans cette espèce. J'ai ensuite mis en évidence et caractérisé pour la première fois le phénomène des hypermutations somatiques chez le pleurodèle. Pour cela, j'ai étudié les profils des mutations observées, cartographié ces dernières et calculé leur fréquence. Ces différents critères ont été comparés entre les animaux immunisés sur Terre et les animaux immunisés à bord de la station Mir. Ainsi, j'ai pu montrer que la fréquence des hypermutations somatiques est diminuée chez les pleurodèles immunisés dans Mir. Cette diminution n'est pas due à un changement de la transcription d'AID mais pourrait être due à une diminution de la survie des lymphocytes B dans l'espace

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

17

Bastos, Viana Da Costa Alexandra Monica. "L'infection murine par Schistosoma bovis : analyse des paramètres parasitaires et immunologiques : approche des mécanismes protecteurs induits par la S. Bovis 28 kda glutathion s-transférase." Lille 1, 1998. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1998/50376-1998-45.pdf.

Full text

Abstract:

L'évolution de l'infection par le parasite schistosoma bovis et l'expression de la reponse immune ont ete etudiees dans un modele d'infection experimentale murin, au cours d'experiences d'infection et de reinfection homologue. L'analyse des parametres parasitologiques indique une elimination naturelle des vers entre la 8 eme et la 10 eme semaine, associee a une augmentation du nombre d'oeufs tissulaires. Une reponse immune de type 2 qui predomine apres l'oviposition est observee et se traduit par la production au niveau serique d'anticorps specifiques d'isotypes igg1, iga et ige associee in vitro a la secretion d'il-4, d'il-5 et d'il-10 par les splenocytes de ces animaux. Les experiences d'infection secondaire effectuees dans ce modele revelent l'existence d'une immunite a la reinfection, qui se manifeste par une absence d'installation de l'infection d'epreuve et suggerent une reponse immune protectrice ciblant le stade de reinfection : le schistosomule. Le serum d'animaux doublement infectes reconnait, dans les extraits de vers adultes ou d'oeufs, des antigenes de poids moleculaires differents. Parallelement, l'incidence de la reponse immune specifique de l'antigene sb 28gst sur l'expression de la fecondite parasitaire et la viabilite des oeufs a ete envisagee selon deux approches
L'immunisation par cet antigene ou le transfert passif d'anticorps monoclonaux specifiques associe a une infection se traduit par l'inhibition significative de la maturation et de la viabilite des oeufs. L'identification des epitopes reconnus par ces anticorps monoclonaux sur la proteine sb 28gst indique l'implication de la partie c-terminale dans la constitution du site enzymatique. D'autre part, la reconnaissance d'epitopes conformationnels suggere l'importance de la structure tertiaire dans l'expression de l'activite catalytique de cette proteine. L'ensemble de nos etudes indique que l'antigene sb 28gst serait une cible de l'immunite anti-fecondite et anti-viabilite, en rendant les oeufs plus vulnerables a la reponse immune ou en ayant un effet sur la physiologie du parasite

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

18

Rucheton, Marcel. "Anticorps humains anti-MLV spontanés : réactions avec des antigènes nucléaires de l'autoimmunité." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20072.

Full text

Abstract:

L'existence chez le sujet sain d'anticorps anti gag du virus de la leucemie murine, est demontree. L'expression de ces anticorps est fortement amplifiee dans le cas de certains cancers, du sida, et de certaines maladies autoimmunes qui montrent l'existence d'anticorps diriges contre certaines snrnp nucleaires. Purification d'anticorps reconnaissant un epitope commun aux proteines virale p30 et nucleaire snrqnpu1-70 k a partir de serum de malades autoimmuns et d'animaux immunises avec des proteines retrovirales

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

19

Sebbag, Mireille. "Identification des antigènes de differenciation malpighienne définis par les autoanticorps anti-stratum corneum, spécifiques de la polyarthrite rhumatoide. Développement d'un test diagnostique par immunotransfert [Thèse en partie soutenue sur un ensemble de travaux]." Toulouse 3, 1992. http://www.theses.fr/1992TOU30161.

Full text

Abstract:

Les autoanticorps seriques de classe g, dits anti-keratines, qui marquent en immunofluorescence indirecte (ifi) la couche cornee de l'epithelium sophagien de rat et de l'epiderme humain sont, de par leur specificite pour la polyarthrite rhumatoide (pr) et leur association a ses formes les plus severes et/ou actives, d'un grand interet diagnostique et pronostique. La determination en ifi du profil isotypique g de ces autoanticorps anti-stratum corneum (asc) montre que 58% des serums presentent des igg#1 isolees ou associees a des igg#4. La predominance des igg#1 suggere la nature proteique du(des) antigene(s) reconnu(s). La caracterisation moleculaire des antigenes epitheliaux humains et murins reconnus par les asc a ete realisee, apres divers types d'electrophoreses, par immunotransfert d'extraits tissulaires en tampons de faibles forces ioniques avec des serums rhumatoides et des serums temoins. Dans un extrait epidermique humain, les serums rhumatoides reconnaissent specifiquement une proteine de 37-40 kd et de pi variant de 5,8 a 7,2. Plusieurs caracteristiques antigeniques et biochimiques et cet antigene ont permis son identification a un variant acide de la filaggrine, elle-meme reconnue specifiquement par les serums rhumatoides. Dans un extrait d'epithelium sophagien de rat, les asc definissent trois proteines a, b et c. Les proteines a (210 kd) et b (120-90 kd) ont des pi variant de 5,8 a 8,5. La proteine c a des pi repartis entre 4,5 et 7,2 tandis que sa masse molaire apparente decroit de 130 a 60 kd. Leurs proprietes antigeniques et biochimiques differencient ces trois proteines des cytokeratines epitheliales sophagiennes. Elles sont probablement apparentees a la (pro)filaggrine. Les performances diagnostiques d'un test par immunotransfert a partir des antigenes sophagiens murins sont respectivement comparables ou superieures a celles de l'ifi selon qu'est consideree la reactivite a l'encontre des proteines a ou b ou celle a l'encontre de la proteine c. Cet immunotransfert apparait donc adapte au diagnostic de la pr

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

20

Huot, Louise. "Analyse moléculaire de la réponse immunitaire du lépidoptère Spodoptera frugiperda au complexe nématobactérien entomopathogène Steinernema carpocapsae-Xenorhabdus nematophila." Thesis, Montpellier, 2019. http://www.theses.fr/2019MONTG084.

Full text

Abstract:

Les complexes nématobactériens (CNBs) entomopathogènes sont des associations naturelles symbiotiques et mutualistes entre des nématodes et des bactéries parasites d’insectes. Dans le cadre de ces associations, le nématode sert tout d’abord de vecteur à la bactérie, qu’il transporte dans le sol et libère à l’intérieur du corps des insectes. La bactérie augmente quant à elle la virulence du CNB, puis sert de ressource nutritive au nématode dans le cadavre de l’insecte. En raison de l’originalité de ces pathogènes et de leur potentiel en lutte biologique contre les insectes ravageurs de cultures, les modalités de leurs interactions avec les insectes ont fait l’objet de nombreuses études. Ces travaux ont permis d’établir que la capacité d’un CNB à infecter et à tuer un hôte dépend d’une combinaison de facteurs écologiques et comportementaux, ainsi que du dialogue s’établissant entre chaque membre du CNB et le système immunitaire de l’insecte. Les insectes possèdent un système immunitaire élaboré et capable de répondre de façon adaptée à une grande diversité d’agents infectieux. Ce système est basé sur trois composantes principales : des barrières épithéliales, des réponses cellulaires et humorales locales et des réponses humorales systémiques. Bien qu’un grand nombre de stratégies et de facteurs permettant aux nématodes et aux bactéries de contrer ces trois composantes ait été identifié au sein de différents modèles d’interaction CNB-insecte, l’étude du dialogue s’établissant entre chaque partenaire et le système immunitaire des hôtes souffre d’un déficit de connaissance des aspects signalétiques et moléculaires des réponses immunitaires que les insectes opposent à ces infections duales.L’objectif premier de cette thèse était de contribuer au développement de ces connaissances au travers d’une analyse transcriptionnelle détaillée et structurée des réponses immunitaires d’un modèle d’insecte lépidoptère, Spodoptera frugiperda, à l’un des CNBs les plus étudiés, l’association S. carpocapsae-X. nematophila. Dans le contexte scientifique actuel, ce travail était tout d’abord caractérisé par deux nouveautés méthodologiques : l’utilisation d’une approche transcriptomique sur tissus immuno-compétents pour identifier les gènes de l’immunité affectés par l’infection par le CNB, et l’utilisation d’une méthode d’infection par injection de la bactérie et du nématode pour discriminer les réponses immunitaires induites par chaque partenaire. Ce travail a permis d’obtenir une image très résolutive et structurée des réponses immunitaires de l’insecte qui servira de base de travail pour (i) la caractérisation fonctionnelle des interactions des gènes de l’immunité identifiés avec chaque partenaire du CNB et (ii) l’étude détaillée du dialogue moléculaire entre le système immunitaire de S. frugiperda et le CNB. Ce travail a également été marqué par la découverte de deux potentiels nouveaux clusters de gènes immunitaires, les GBHs et les UNKs, qui sont parmi les gènes les plus fortement induits lors de l’interaction tripartite. Nos analyses bioinformatiques et tests d’activité préliminaires suggèrent que les GBHs pourraient avoir été acquis par tranfert horizontal de gènes bactériens et que les UNKs pourraient résulter d’une co-évolution d’insectes de la famille des noctuelles avec des CNBs Steinernema-Xenorhabdus. Cette hypothèse ouvre de nouvelles pistes de recherches pour la compréhension des variations de sensibilité aux CNBs entomopathogènes au sein de la diversité des insectes
Entomopathogenic nematobacterial complexes (NBCs) are natural symbiotic associations between nematodes and bacteria that are pathogenic for insects. In these associations, the bacterial partner uses the nematode as a vector, which transports it in the soil and releases it inside the insect’s body. The bacterium then increases the NBC’s virulence and is used as a food supply by the nematode partner in the insect’s dead body. Due to the originality of these dual pathogens and to their potential for biological control of insect crop pests, studies have been conducted on diverse aspects of their interactions with insects. These works have shown the ability of an NBC to infect and kill an insect depends on a combination of ecological and behavioral factors, as well as on the dialogue between the two partners of the NBC and the insect’s immune system. Insects possess an elaborate immune system which is able the respond by adapted ways to a huge diversity of infectious agents. This system relies on three main components: epithelial barriers, local cellular and humoral responses and systemic humoral responses. A large number of strategies and factors used by NBCs to counteract these three components have already been identified in several NBC-insect interaction models. However, the study of the dialogue between each NBC partner and the hosts’ immune systems is currently suffering from a lack of knowledge of the signaling and molecular aspects of the insects’ immune responses to these dual infections.The first goal of this thesis was to increase this knowledge through a detailed and structured transcriptional analysis of the immune responses of a lepidopteran model, Spodoptera frugiperda, to one of the most studied NBCs, the S. carpocapsae-X. nematophila association. In the current scientific context, this work was mainly characterized by two methodologic novelties: the use of a topologic approach for the transcriptomic analysis of the induced immune responses to the infection by the NBC, and the use of an infection by injection method for the discrimination between the nematode- and the bacterium-induced immune responses. This work allowed the observation of a structured and highly resolutive picture of the induced immune responses, which will be used as a working base for (i) the functional characterization of the interactions of identified immune genes with each partner of the NBC, and (ii) for the detailed analysis of the molecular dialogue between the immune system of S. frugiperda and the NBC. Finally, this work also allowed the identification of two potential new clusters of immune genes, the GBHs and the UNKs, which are among the most overexpressed genes during the tripartite interaction. Our preliminary bioinformatics analyses and activity tests suggest the GBHs could have been acquired by horizontal gene transfer from bacteria and the UNKs could result from a coevolution between noctuids and some Steinernema-Xenorhabdus NBCs. This hypothesis opens new research trails for the understanding of the NBC-sensitivity variations within insect diversity

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

21

Gottar, Marie. "Analyse de la réponse immunitaire innée de Drosophila melanogaster : Vers un déchiffrement des mécanismes de reconnaissance des infections." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2003. http://www.theses.fr/2003STR13135.

Full text

Abstract:

Toute espèce vivante est confrontée à des microorganismes variés, pathogènes, opportunistes ou symbiotiques, d'où la nécessité d'un système de défense efficace. Un des phénomènes fondamentaux à la base de la réponse immunitaire est la capacité à reconnaître les molécules du non-soi infectieux et de les distinguer du soi inoffensif. Le système immunitaire inné est une forme de défense originelle qui a été sélectionnée au cours de l'évolution pour pouvoir détecter, contenir et détruire les agents pathogènes. Une théorie stipule que l'activation du système immunitaire inné est déclenchée par la reconnaissance de pathogènes grâce à des récepteurs moléculaires, les Pattern Recognition Receptors (PRRs). Ces récepteurs, codés par le génome et non soumis à des réarrangements somatiques, reconnaissent des motifs moléculaires conservés et portés par les microorganismes, les Pathogens Associated Molecular Patterns (PAMPs). Les PAMPs sont caractéristiques de larges classes de microorganismes et correspondent à des constituants essentiels, et donc peu modifiables, des microorganismes, malgré la pression des systèmes immunitaires. Sélectionnés au cours de l'évolution, les PRRs définissent un répertoire de reconnaissance qui constitue une mémoire immunitaire de l'espèce. La recherche et la caractérisation des PRRs représentent donc des enjeux majeurs pour la compréhension de la réponse immunitaire. Par la puissance de sa génétique, la drosophile constitue un modèle idéal pour aborder l'étude de l'immunité, du niveau moléculaire au niveau de l'organisme entier. Une facette importante de la défense contre les infections est la réponse humorale qui repose sur la sécrétion de peptides à activité antimicrobienne. La synthèse de ces peptides est induite par les infections et est régulée par deux voies de type NF-kB, les voies Toll et imd. La première est requise dans la lutte contre les infections fongiques et les infections par certaines souches de bactéries à Gram-positif tandis que la deuxième joue un rôle essentiel dans la défense contre les bactéries à Gram-négatif. Au cours de ma thèse, j'ai participé à la réalisation d'un crible génétique de " deuxième génération " et à la caractérisation de trois nouveaux PRRs :La Peptidoglycan Recognition Protein-LC (PGRP-LC) est un co-récepteur transmembranaire de la voie imd qui est impliqué dans la reconnaissance du peptidoglycane de type DAP, caractéristique des bactéries à Gram-négatif, mais aussi de l'acide lipoteichoique (LTA) des bacilles. La Gram Negative Binding Protein 1 (GNBP1) forme un complexe avec la PGRP-SA qui reconnaîtrait le peptidoglycane de type Lysine et/ou le LTA et activerait ensuite la voie Toll. La GNBP3 est un PRR impliqué dans la reconnaissance spécifique des PAMPs de champignon. Cependant, l'activation de la voie Toll en réponse à des infections par des champignons entomopathogènes ne repose pas uniquement sur la reconnaissance des PAMPs. Il semblerait que la drosophile ait sélectionné un système complémentaire de détection des facteurs de virulence fongiques qui dépend d'au moins une protéase de l'hôte : Perséphone. La drosophile utilise un répertoire relativement limité de PRRs. Les récepteurs identifiés jusqu'à présent appartiennent à deux familles : les PGRPs et les GNBPs. Ces protéines de reconnaissance constituent un répertoire de détection de motifs microbiens variés. L'étude des relations hôte-pathogène devrait permettre de mieux comprendre l'adaptation réciproque de chacun des protagonistes.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

22

Hanin, Véronique. "Utilisation d'immunogènes synthétiques de type "résine polyacrylique-peptide" pour l'obtention d'anticorps anti-peptides : caractérisation et application à l'étude de quelques protéines." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20106.

Full text

Abstract:

Une nouvelle methode de production d'anticorps anti-peptides a ete mise au point, a partir d'immunisations chez l'animal contre des peptides lies a une resine polyacrylamide sur laquelle la synthese peptidique est effectuee. Les anticorps obtenus ont ete caracterises, compares (pour certains) aux anticorps produits contre le meme peptide couple a une proteine porteuse et utilises pour l'etude immunochimique des proteines correspondantes: actine, interferon gamma humain, dystrophine et recepteur d2 de la dopamine. Cette nouvelle procedure s'avere simple, rapide, efficace et tout a fait comparable aux techniques d'immunisation anti-peptides classiques. Elle presente plusieurs avantages d'ordre chimique: specificite et stabilite de la liaison resine-peptide, connaissance et modulation possible du rapport resine/peptide et absence d'etapes fastidieuses de clivage, purification et couplage du peptide a un porteur proteique

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

23

Astagneau, Pascal. "Réponse immunitaire spécifique dirigée contre l'antigène P1155/RESA de "Plasmodium falciparum" : recherche d'indicateurs de protection au cours d'études épidémiologiques en zone d'endémie." Paris 11, 1994. http://www.theses.fr/1994PA11T022.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

24

Barbarroux, Loïc. "Contributions à la modélisation multi-échelles de la réponse immunitaire T-CD8 : construction, analyse, simulation et calibration de modèles." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSEC026/document.

Full text

Abstract:

Lors de l’infection par un pathogène intracellulaire, l’organisme déclenche une réponse immunitaire spécifique dont les acteurs principaux sont les lymphocytes T-CD8. Ces cellules sont responsables de l’éradication de ce type d’infections et de la constitution du répertoire immunitaire de l’individu. Les processus qui composent la réponse immunitaire se répartissent sur plusieurs échelles physiques inter-connectées (échelle intracellulaire, échelle d’une cellule, échelle de la population de cellules). La réponse immunitaire est donc un processus complexe, pour lequel il est difficile d’observer ou de mesurer les liens entre les différents phénomènes mis en jeu. Nous proposons trois modèles mathématiques multi-échelles de la réponse immunitaire, construits avec des formalismes différents mais liés par une même idée : faire dépendre le comportement des cellules TCD8 de leur contenu intracellulaire. Pour chaque modèle, nous présentons, si possible, sa construction à partir des hypothèses biologiques sélectionnées, son étude mathématique et la capacité du modèle à reproduire la réponse immunitaire au travers de simulations numériques. Les modèles que nous proposons reproduisent qualitativement et quantitativement la réponse immunitaire T-CD8 et constituent ainsi de bons outils préliminaires pour la compréhension de ce phénomène biologique
Upon infection by an intracellular pathogen, the organism triggers a specific immune response,mainly driven by the CD8 T cells. These cells are responsible for the eradication of this type of infections and the constitution of the immune repertoire of the individual. The immune response is constituted by many processes which act over several interconnected physical scales (intracellular scale, single cell scale, cell population scale). This biological phenomenon is therefore a complex process, for which it is difficult to observe or measure the links between the different processes involved. We propose three multiscale mathematical models of the CD8 immune response, built with different formalisms but related by the same idea : to make the behavior of the CD8 T cells depend on their intracellular content. For each model, we present, if possible, its construction process based on selected biological hypothesis, its mathematical study and its ability to reproduce the immune response using numerical simulations. The models we propose succesfully reproduce qualitatively and quantitatively the CD8 immune response and thus constitute useful tools to further investigate this biological phenomenon

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

25

Fournier-Betz, Véronique. "Le système immunitaire intestinal du turbot (Scophthalmus maximus L. ) : relation avec le système immunitaire général et recherche des mécanismes immuns induits lors de vaccinations par voie orale contre la vibriose à Vibrio anguillarum." Brest, 2000. http://www.theses.fr/2000BRES2011.

Full text

Abstract:

Afin d'étudier la distribution des lymphocytes b-like et t-like dans les organes lymphoïdes rein, rate, thymus et le tissu lymphoïde associe à l'intestin du turbot et de la truite arc-en-ciel, des ac polyclonaux de lapin dirigés spécifiquement contre les immunoglobulines (ig) et les thymocytes de chaque espèce ont été produits. Un manque de spécificité des sérums antithymocytes n'a pas permis la détection des lymphocytes t-like. Seuls les anticorps anti-ig ont donc été utilisés dans cette étude menée sur des poissons, indemnes de toute maladie. Quels que soient les organes considérés, un plus grand nombre de cellules ig + est observé chez la truite. En ce qui concerne l'intestin des différences majeures sont notées entre les deux espèces : les cellules ig + sont présentes à la fois dans la lamina propria et la lamina epithelialis chez la truite alors qu'elles ne sont détectées que dans la lamina propria chez le turbot. Dans un second temps la mise au point de techniques de prélèvement du mucus intestinal, et d'isolement des cellules mononuclées présentes dans l'intestin postérieur du turbot, avec la possibilité d'obtenir séparément les cellules issues de la lamina epithelialis et de la lamina propria, a permis d'appréhender les mécanismes de déclenchement de la réponse immune au niveau intestinal a la suite de vaccinations orales (vo) contre la vibriose à vibrio anguillarum. L’absorption de l'ag et la réponse immune systémique ont également été étudiées. Différentes formulations vaccinales ont été testées : des vaccins constitués de corps bactériens entiers, gastroproteges (vog) ou non (voe), et des vaccins constitués d'ag solubles (vos). La voie intraperitoneale a toujours été testée en parallèle car utilisée comme référence. A la suite des vaccinations par vo, l'ag est detecte dans la lamina propria et dans les organes systémiques, où il est transporte jusqu'aux cellules immunocompetentes. En réponse a cette stimulation antigénique des cellules b-like et/ou des plasmocytes apparaissent dans l'intestin au niveau de la lamina propria, puis dans la rate et le rein. Contrairement aux cellules intestinales issues de la lamina propria et aux cellules rénales qui possèdent une aptitude a la phagocytose et sont capables de sécréter des ac, aucune activité comparable n'est mise en évidence sur les cellules issues de la lamina epithelialis. Les réponses observées dans l'intestin restent modérées. A la suite d'une vaccination par vo, une réponse immunitaire locale et générale existe donc et ceci malgré l'absence d'ac anti-vibrio anguillarum, dans le mucus intestinal et dans le sérum. L’injection parentérale, a montré quant à elle que l'ag atteint les organes systémiques mais parvient également dans la lamina propria, dans laquelle une lymphoprolifération de cellules b-like est observée. De plus des ac sont détectés dans le plasma et le mucus indiquant que le système immunitaire général et intestinal sont conjointement sollicites. Enfin, l'étude d'un transfert passif d'immunité, démontre l'existence d'une réaction immunitaire humorale consécutive aux vaccinations par ip mais aussi par vo avec l'ag soluble, sans que la protection induite soit réellement attribuable aux ig.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

26

Bordet, Elise. "Réponse immunitaire innée et adaptative du porc face au virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLA024/document.

Full text

Abstract:

Le virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin (SDRPv) est un pathogène à l’origine de problèmes respiratoires et de reproduction. La réponse immunitaire face au SDRPv est caractérisée par une virémie persistante et un retard dans la mise en place des anticorps neutralisants. Les macrophages alvéolaires (AM) sont la cible principale du virus mais plusieurs études in vitro suggèrent une infection des cellules dendritiques (DC). Dans ce manuscrit, de nouvelles cibles cellulaires du virus ont été découvertes dans le poumon et dans les ganglions trachéo-bronchiques. Les cellules du parenchyme pulmonaire AM-like sont infectés in vivo par le SDRPv de Type 1 alors que les cDC1, cDC2 et moDC du poumon ne sont pas infectées. La souche Lena Type 1.3 se distingue des autres souches par sa capacité à induire une polarisation vers une réponse Th1 in vitro. Une expérience de transfert de lymphocytes T mémoires in vivo suggèrent une réponse cellulaire accrue et délétère lors de l’infection par la souche Lena. Trois populations de macrophages ont été identifiées dans les ganglions et nommées : macrophages périfolliculaires (PFMacro), macrophages des cordons lymphatiques (cordMacro) et macrophages efférents (effMacro). Les effMacro et les PFMacro sont infectés par les souches européennes. Quant à la réponse humorale, 5 stades de différenciation des LB dans les ganglions ont été identifiés et une étude de l’impact de l’infection sur la différenciation des lymphocytes B est en cours
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is a single-stranded RNA virus that causes reproductive failure and respiratory problems in swine. Immune response against PRRSV is characterized by a persistent viremia and a delay in neutralizing antibodies’ production. Main targets of PRRSV are Alveolar Macrophages (AM) but in vitro studies suggest that PRRSV could replicate in dendritic cells (DC). In this manuscript, new cellular targets of PRRSV in the lung and the tracheo-bronchial lymph nodes have been depicted. This work revealed that pulmonary parenchymal AM-like are susceptible to PRRSV in vivo. Moreover, study of DC infection in the lung reveals that cDC1, cDC2 and moDC are not infected by Type 1 PRRSV. In tracheo-bronchial lymph nodes, 3 populations of pig macrophages (Macro) have been identified and called perifollicular macrophages (PFMacro), lymphatic cord macrophages (cordMacro) and efferent macrophages (effMacro). In vivo infection revealed that PFMacro and effMacro are susceptible to Type 1 PRRSV infection. In order to understand the delay in humoral response establishment, 5 populations of B cells have been identified in the lymph nodes. The interaction of SDRPv with these populations is under study

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

27

Weiss, Emmanuel. "Altérations de la réponse immunitaire innée au LPS des cellules immunitaires des malades atteints de cirrhose alcoolique décompensée." Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015USPCC188.

Full text

Abstract:

La stimulation de TLR4 par le lipopolysaccharide (LPS) déclenche l'induction de cytokines, et d'interferons (IFNs) de type I. Des altérations de la réponse immunitaire innée ont été montrées dans les cellules immunitaires cirrhotiques. Néanmoins, la réponse génique globale au LPS des cellules immunes cirrhotiques n'a jamais été étudiée. Nous avons étudié le profil d'induction génique par le LPS des cellules mononuclées périphériques (PBMCs) de patients cirrhotiques et de sujets sains. Les gènes communément régulés par LPS chez les patients et les témoins étaient impliqués dans la production cytokiniques et l'induction d'une immunoparalysie. La validation par RT-qPCR a montré une surexpression de certaines cytokines proinflammatoires dans les PBMCs cirrhotiques. La comparaison des gènes régulés par LPS dans les PBMCs cirrhotiques et sains a permis de définir un phénotype des patients. Dans les PBMCs cirrhotiques, le LPS stimulait spécifiquement des gènes de l'apoptose et inhibait des gènes de l'endocytose. Un programme de gènes stimulés par l'IFN (ISG) était induit dans les PBMCs sains mais pas dans les PBMCs cirrhotiques. Ce déficit d'expression des ISGs a été confirmé dans une cohorte indépendante de malades par RT-qPCR. Les mécanismes de ce déficit impliquaient la production d'IFN-β et la voie de signalisation des IFNs de type I. L'expression de certains ISGs était associée au pronostic. Plus l'expression basale des ISGs était élevée, plus le risque de décès était important. Ainsi, l'inhibition de la voie des IFNs de type 1 dans les PBMCs cirrhotiques serait un mécanisme adaptatif limitant l'immunopathologie et pourrait servir de base pour de futures études
TLR4 engagement by lipopolysaccharide (LPS) triggers the induction of genes encoding cytokines and type I interferons (IFNs). Alterations of innate immune response to LPS have been shown in cirrhotic immune cells. However, the global gene response to LPS is unknown in these cells. We performed a gene-expression profiling in PBMCs from cirrhotic patients and healthy subjects. LPS-regulated genes shared by cirrhotic and healthy cells were involved in cytokine production/activity and induction of "immune paralysis". RT-qPCR validation experiments showed an enhanced induction of some proinflammatory cytokines in cirrhotic cells. Comparison of functions associated with genes specifically regulated by LPS in cirrhotic and in healthy cells allowed to define a cirrhosis phenotype. In cirrhotic PBMCs, LPS specifically induced molecules involved in apoptosis and downregulated others involved in endocytic trafficking. LPS specifically failed to induce an interferon-mediated program consisting in 173 Interferon-stimulated genes (ISGs) in cirrhotic cells. RT-qPCR confirmed this defect in ISG expression in PBMCs from an independent cohort of patients. Mechanisms of this defect were lower IFN-β production and multilevel alterations in type-I IFN signaling. We found a strong relationship between the level of expression of some ISGs and patient's outcome. The higher ISG expression the higher the risk of death. This decrease in type I IFN signaling in cirrhotic immune cells may be an adaptive mechanism aiming at limit immunopathology. Our results provide new information to understand the severity of the immune response to LPS in cirrhosis and can serve as a resource for future studies

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

28

Boucraut-Baralon, Corine. "Mise en évidence et caractérisation des antigènes du virus de la myxomatose. Implication dans la réponse immunitaire chez le lapin infecté." Toulouse 3, 1992. http://www.theses.fr/1992TOU30170.

Full text

Abstract:

La myxomatose constitue une dominante pathologique chez le lapin europeen (oryctolagus cuniculus), qui pose de graves problemes economiques et ecologiques. La prophylaxie de cette maladie passe par la vaccination systematique dans les elevages au moyen de souches virales attenuees ou d'un virus proche non pathogene pour le lapin europeen (virus du fibrome de shope). Afin d'identifier les proteines jouant un role dans l'etablissement de l'immunite, les antigenes de plusieurs souches virales ont ete caracterises avec des serums de lapin immunises. En depit de caracteristiques pathogenes extremement variables, les souches etudiees partagent les memes antigenes. De plus, la plupart des antigenes myxomateux identifies partagent des epitopes avec ceux du virus du fibrome de shope, confirmant une parente serologique etroite entre ces deux leporipoxvirus. L'expression de ces proteines au cours du cycle viral ainsi que certaines modifications post-traductionnelles qu'elles subissent, ont egalement ete etudiees. Il apparait ainsi que les antigenes sont synthetises de facon sequentielle au cours du cycle viral et que certains d'entre eux subissent une maturation par clivage. La localisation des antigenes sur des particules virales purifiees montre qu'ils sont situes aussi bien en position interne (core viral) qu'externe (enveloppe). Enfin, l'exploration de l'immunite a mediation cellulaire par des tests de transformation lymphoblastique indique que plusieurs proteines impliquees dans la reponse humorale sont egalement capables de stimuler la proliferation de lymphocytes de lapins sensibilises. Il apparait donc que plusieurs des antigenes identifies sont des candidats potentiels pour une utilisation vaccinale (vaccins sous-unites et vaccins a virus recombinants)

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

29

Asselin, de Beauville-Paturel Carine. "Analyse de l'activité antitumorale de l'interleukine-12 : rôle dans la régulation de la réponse cytotoxique t et effet antiangiogénique." Paris 11, 1999. http://www.theses.fr/1999PA11T005.

Full text

Abstract:

Les cytokines jouent un rôle déterminant dans le conflit entre le système immunitaire et la tumeur. Certaines d'entre elles suscitent un grand intérêt en immunothérapie antitumorale, pour leur capacité à stimuler la réponse immune, alors que les cytokines immunosuppressives sécrétées par les tumeurs participent activement au processus d'échappement tumoral. Les activités biologiques de l'interleukine 12 (IL-12), dont l'induction de la production d'IFNy et la stimulation des lymphocytes cytotoxiques, font de cette cytokine une molécule thérapeutique prometteuse pour le traitement du cancer. Nous avons analysé l'activité antitumorale de l'IL-12 dans un modèle murin et dans un modèle humain. In vitro, alors que l'IL-12 stimule la voie classique (perforine) de cytotoxicité des lymphocytes T, elle. N'a pas d'effet sur les voies alternes de cette réponse, médiées par le ligand de Fas et le TNF membranaire. In vivo, nous avons transféré les gènes de l'IL-12 dans des cellules tumorales, à l'aide d'un nouveau vecteur lytique, issu du virus de la forêt Semliki (SFV). Une injection intratumorale du vecteur SFV recombinant pour l'IL-12 murine inhibe la croissance de tumeurs du mélanome murin B16. Dans ce modèle, l'IL-12 ne semble pas stimuler l'activité cytotoxique de type T ou NK. En revanche, nous avons montré par échographie Dopppler que cet effet est corrélé à une inhibition par l'IL-12 de la vascularisation tumorale. Nous avons enfin analysé l'activité antitumorale de l'IL-12 humaine in vivo. Les cancers bronchiques non à petites cellules ont un profil d'expression de cytokine de type 2, avec une forte expression de cytokines immunosuppressives, dont le TGFf3 et l'IL-l O. A l'aide d'un modèle in vivo de lymphocytes T cytotoxiques transférés dans des tumeurs humaines autologues, nous avons démontré la dualité de l'action de l'IL-12 humaine, c'est-à-dire son activité antitumorale aux faibles doses et son activité immunosuppressive aux fortes doses.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

30

Dubois, Florian. "Caractérisation et génération des lymphocytes B régulateurs à partir de cellules souches pluripotentes." Thesis, Nantes, 2020. http://www.theses.fr/2020NANT1014.

Full text

Abstract:

Les lymphocytes B régulateurs (Bregs) sont d’importants acteurs de l’immunité intervenant dans plusieurs pathologies. Cependant, les Bregs regroupent plusieurs populations cellulaires sans consensus concernant leur phénotype, ce qui complique leur étude et leur potentielle utilisation en thérapie cellulaire ou en tant que biomarqueur. Nous avons identifié une population Breg capable de bloquer une réponse T effectrice par des mécanismes dépendant du granzyme B (GZMB) et du contact cellulaire. Mon travail de thèse, centré sur l’étude de ces Bregs GZMB+, avait comme objectifs 1) de générer des Bregs GZMB+ possédant une expression répressible du GZMB, induite par génie génétique, à partir de cellules souches pluripotentes, et 2) de mieux caractériser ces Bregs GZMB+ ainsi que les sous-types de Bregs décrits par une méta analyse transcriptomique. Malgré une faible proportion de lymphocytes B différenciés à partir de cellules souches, nous avons amélioré la génération de progéniteurs hématopoïétiques CD34+CD43+ mais qui s’avèrent insuffisants pour la production de lymphocytes B. Nous avons montré que le phénotype CD31intCD45int pourrait enrichir les progéniteurs capables de se différencier en lymphocyte B et validé les outils CRISPR/Cas9 nécessaires aux étapes de modifications géniques pour induire l’expression du GZMB. Notre méta-analyse a permis d’identifier deux signatures transcriptomiques de 165 et 93 gènes spécifiques respectivement des Bregs humains et murins et soutient l’hypothèse d’une plasticité des lymphocytes B et d’une différenciation des Bregs en réponse à leur environnement. Ces travaux constituent une première étape vers la compréhension et l’utilisation de ces Bregs GZMB+
Regulatory B cells (Bregs) are key players in the immune response and are involved in various pathological situations. However, Bregs is a heterogeneous family with no consensual phenotype that has been proposed thus far rending there study and their use in cellbased therapy or as biomarker very difficult. We identified a Breg subset able to block a T cell effector response in a Granzyme B (GZMB) production and in a cell contact dependent manner. The objectives of my thesis work, focused on GZMB+ Bregs study, were 1) to generate GZMB+ Bregs with a repressible GZMB expression, induced by genetic engineering, from pluripotent stem cells and 2) to better characterize these GZMB+ Bregs and their different described subsets by performing a transcriptomic meta-analysis. While we obtained a low yield of B cells from stem cells, we improved the generation of CD34+CD43+ hematopoietic progenitors, which appeared insufficient for B cell production. We found that the CD31intCD45int phenotype might enrich the progenitors suitable for B cell differentiation and we validated CRISPR/Cas9 tools needed for the first step of genetic modification leading to GZMB expression. Our meta-analysis identified two distinct and unique transcriptional signatures of 165 and 93 genes, respectively associated with human and mouse Bregs and support the hypothesis of B cells plasticity into Bregs wich acquire their regulatory function under certain environmental conditions. This thesis work constitute a first step in the understanding and for the use of these GZMB+ Bregs

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

31

Pilon, Caroline. "Analyse de la réponse allogénique chez le porc : orientation de la réponse lymphocytaire T effectrice par les cellules dendritiques et étude de la régulation de la réponse immune." Thesis, Tours, 2009. http://www.theses.fr/2009TOUR3121/document.

Full text

Abstract:

L’apport des modèles de transplantation chez le rongeur pour des protocoles d’induction de tolérance chez l’homme est limité. La création d’un modèle pré-clinique visant à induire une tolérance aux allogreffes chez le gros animal comme le porc s’avère pertinent. L’activation de cellules dendritiques (DC) porcines par le CD40L ou le mélange de TNFa, d’INFa et de LPS augmente l’expression des molécules B7, induit l’expression de novo de CD25 et augmente leur capacité allostimulatrices. Par ailleurs, le CD40L ou le mélange TNF+INF+LPS induit des DC orientant la réponse allogénique vers Th1 et Th17. Les lymphocytes T régulateurs naturels CD4+CD25+ porcins ont été mis en évidence grâce à l’expression de Foxp3. Une stimulation de cellules CD4+ par la PHA en présence de TGFß induit l’expression de Foxp3. L’ajout de rapamycine maintien cette expression et renforce l’activité suppressive ce qui pourrait être expliqué par le fait que la rapamycine bloque l’expression d’IL 17 induite par le TGFß
The contribution of rodent models of transplantation for protocols of induction of tolerance in humans has been disappointing. It therefore seems relevant to create a pre-clinic model in large animals. The activation of swine dendritic cells (DC) by CD40L or a combination of TNF+INF+LPS increases the expression of B7 molecules and induced de novo expression of CD25 on DC associated with an increase of allogeneic lymphocyte stimulation ability. In addition, CD40L and TNF+IFN+LPS induced DC polarizing to Th1 and Th17 response respectively. Swine natural CD4+CD25+ regulatory T lymphocytes have been highlighted through the expression of Foxp3. Stimulation of CD4+ cells by PHA and IL-2 in the presence of TGFß induces the expression of Foxp3 and the addition of rapamycin enhances the suppressive activity while maintaining the expression of Foxp3. Rapamycin blocks the expression of IL-17 induced by TGFß. This effect could explain the increase of the suppressive activity caused by rapamycin

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

32

Hamdi, Leila. "Recherche de facteurs de risque immunologiques associés au lymphome hodgkinien de l’enfant." Thesis, Paris 11, 2013. http://www.theses.fr/2013PA114844/document.

Full text

Abstract:

Le risque de LH est augmenté en cas de déficit immunitaire acquis ou inné. Les déficits immunitaires innés associés à un risque accru de LH, sont les DICV (Déficit Immunitaire Commun Variable), XLP (Syndrome lymphoprolifératif lié au chromosome X) et ALPS (Syndrome lymphoprolifératif Autoimmun). L’objectif de notre travail était d’évaluer la prévalence de ces déficits immunitaires chez des enfants atteints de LH. Nous avons reçu, 395 prélèvements de patients atteints de LH au diagnostic. L’âge médian de la population étudiée est de 13 ans, allant de 3 à 18 ans. Le sex-ratio M/F est de 1.1. Il augmente à 3 au dessous de l’âge de 10 ans. Parmi les biopsies (n=84) qui ont été relues, 87% sont de type scléro-nodulaires (SN), 7% à cellularité mixte (CM) et 6% non spécifié. L’EBV est détecté in situ dans 23% des cas de LH. Les patients atteints de LH-EBV+ sont significativement plus jeunes que ceux atteints de LH-EBV- (p=3.10-4). Ce sont plus fréquemment des garçons que des filles (63% ; M/F : 1,7) et fréquemment de sous-type CM (40%). Enfin, ils ont une charge virale EBV significativement plus élevée (p=3.10-3) que les enfants qui ont un LH-EBV-.Parmi les 83 premiers enfants analysés, un immunophénotypage approfondi a montré une diminution de la population lymphocytaire par rapport aux témoins et une lymphopénie B fréquente (31 patients sur 83 soit 37% des patients). La lymphopénie B était corrélée aux facteurs pronostiques connus du LH. Dans un cas parmi les 31, une baisse des immunoglobulines a été mise en évidence ce qui est évocateur de DICV. Nous avons montré que dans les autres cas, les lymphopénies se corrigeaient à distance de la maladie. La recherche de profil cytokinique associé à ces lymphopénies (TGF, BAFF, IL-7) n’a pas permis de mettre en évidence de mécanisme physiopathologique simple pour expliquer ces lymphopénies. Nous émettons l’hypothèse qu’elles sont liées à l’exposition au contact des cellules tumorales à des signaux favorisant l’apopotose.En ce qui concerne la recherche d’autres déficits immunitaires innés, aucun cas évocateur de XLP n’a été mis en évidence sur la base de la quantification des lymphocytes NKT. Cinq cas parmi les 83 (6%) avaient une expansion de lymphocytes T DN (Lymphocytes TCRαβ CD4-CD8-) dans le sang périphérique. Des dosages de Fas ligand et d’IL-10 plasmatiques ont permis d’exclure un ALPS. Au total, nous n’avons pas pu affirmer de défaut qualitatif des sous-populations lymphocytaires évoquant les déficits immunitaires de type XLP et ALPS. Seule une lymphopénie B avec baisse des IgG est évocatrice de DICV. Nous avons étendu l’analyse à l’ensemble des patients (395patients) avec un contrôle à distance du diagnostic pour ceux qui étaient anormaux. Nous avons identifié 4 patients potentiellement atteints de DICV, 1,5%. Parallèlement, nous avons recherché un déficit de la réponse T anti-EBV par cytomètrie de flux et l’Elispot. L’étude de la réponse T anti-EBV par la cytométrie de flux, a montré une tendance vers une baisse de la production d’IL-2 par les CD4 et les CD8 de patients avec une charge virale EBV élevée en réponse à une stimulation par des peptides EBV en présence de lignées autologues. L’étude de la réponse T anti EBV par la technique d’ELISPOT sur 9 patients n’a pas montré globalement de déficit du contrôle de l’EBV sauf pour une jeune patiente de 10 ans ayant une charge virale EBV très élevée sans réponse T anti-EBV efficace. Les résultats que nous avons obtenus restent à approfondir, ce qui permettra d’enrichir les connaissances actuelles sur cette pathologie
Hodgkin’s Lymphoma (HL) is one of the most frequent lymphomas occurring in childhood. In young children, there is a high predominance in boys and frequent association with Epstein-Barr Virus (EBV). Cohort studies have shown that patients affected by several immune deficiency syndromes - e.g. X-linked lymphoproliferative syndrome (XLP), functional deficit of Fas/FasL pathway and common variable immunodeficiency (CVID) - are risk factors of HL. We intend to search for qualitative and quantitative immune deficiencies as susceptibility factors to child's HL in a prospective study related to Euronet –PHL C1 protocol. Eighty-three patients at diagnosis of HL have been analysed. Median age of the study population is 13 years, (5-18 years). Gender-ratio M/F is 1.1 with a larger male predominance before the age of 10 (gender-ratio of 3). The search for a defect of NKT population that would be suggesting of XLP was negative in all patients. A moderate expansion of circulating TCRαβ+ double negative cells (DNT) has been detected in 5 patients. This expansion has been further explored in the hypothesis of a defect of Fas/FasL pathway by plasmatic quantification of Fas ligand and Il-10. This led to the exclusionof the diagnosis of ALPS. An unexpected high frequency of B-cell lymphopenia has been detected in 31 out of 83 patients (37%). Peripheral B cell lymphopenia was associated with the following poor prognostic factors: advanced stages (p<0.04), low hemoglobin (p<0.06) and B symptoms (p<0.01). B-cell lymphopenia was not statistically correlated with morphology (subtype, amount of tumor cells and necrosis). Remarkably, B-lymphocytic counts were significantly higher in patients with in situ EBV (<0.05).Only a B lymphopenia with low IgG level suggesting DICV was detected. We extended the analysis to all the 395 patients included in the protocol EURONET, so we identified 4 patients with CVID. These cases will be further explored by molecular analyses. In parallel, the specific T-cells response against EBV was studied by flow cytometry in 15 patients and ELISPOT assay in 9 patients with HL. Flow cytometry , suggested a decrease in production of IL-2 by CD4 T cells in patients with high EBV viral load in response to EBV latent and lytic-cycle peptides and autologous lymphoblatoid cells lines compared to controls or patients with LH-EBV-. The ELISPOT-IFNγ assay was used to determine the frequency of T cells that produced IFNγ in response to peptides. One patient demonstrated inappropriate EBV-specific T-cell IFNγ production (<10 IFNγ secreted T cells and >1,000 EBV copies per 250000 PBMCs). These cases will be further explored by molecular analyses.Our findings confirm the known epidemiological data of HL now mainly associated to NS subtype in children and adolescents and EBV status in HL at this age. We show that peripheral B cell lymphopenia in paediatric and adolescent HL patients is frequent and associated with poor prognosis factors. We confirm the association between CVID and HL

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

33

Hamdi, Leila. "Recherche de facteurs de risque immunologiques associés au Lymphome Hodgkinien de l'enfant." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01011174.

Full text

Abstract:

Le risque de LH est augmenté en cas de déficit immunitaire acquis ou inné. Les déficits immunitaires innés associés à un risque accru de LH, sont les DICV (Déficit Immunitaire Commun Variable), XLP (Syndrome lymphoprolifératif lié au chromosome X) et ALPS (Syndrome lymphoprolifératif Autoimmun). L'objectif de notre travail était d'évaluer la prévalence de ces déficits immunitaires chez des enfants atteints de LH. Nous avons reçu, 395 prélèvements de patients atteints de LH au diagnostic. L'âge médian de la population étudiée est de 13 ans, allant de 3 à 18 ans. Le sex-ratio M/F est de 1.1. Il augmente à 3 au dessous de l'âge de 10 ans. Parmi les biopsies (n=84) qui ont été relues, 87% sont de type scléro-nodulaires (SN), 7% à cellularité mixte (CM) et 6% non spécifié. L'EBV est détecté in situ dans 23% des cas de LH. Les patients atteints de LH-EBV+ sont significativement plus jeunes que ceux atteints de LH-EBV- (p=3.10-4). Ce sont plus fréquemment des garçons que des filles (63% ; M/F : 1,7) et fréquemment de sous-type CM (40%). Enfin, ils ont une charge virale EBV significativement plus élevée (p=3.10-3) que les enfants qui ont un LH-EBV-.Parmi les 83 premiers enfants analysés, un immunophénotypage approfondi a montré une diminution de la population lymphocytaire par rapport aux témoins et une lymphopénie B fréquente (31 patients sur 83 soit 37% des patients). La lymphopénie B était corrélée aux facteurs pronostiques connus du LH. Dans un cas parmi les 31, une baisse des immunoglobulines a été mise en évidence ce qui est évocateur de DICV. Nous avons montré que dans les autres cas, les lymphopénies se corrigeaient à distance de la maladie. La recherche de profil cytokinique associé à ces lymphopénies (TGF, BAFF, IL-7) n'a pas permis de mettre en évidence de mécanisme physiopathologique simple pour expliquer ces lymphopénies. Nous émettons l'hypothèse qu'elles sont liées à l'exposition au contact des cellules tumorales à des signaux favorisant l'apopotose.En ce qui concerne la recherche d'autres déficits immunitaires innés, aucun cas évocateur de XLP n'a été mis en évidence sur la base de la quantification des lymphocytes NKT. Cinq cas parmi les 83 (6%) avaient une expansion de lymphocytes T DN (Lymphocytes TCRαβ CD4-CD8-) dans le sang périphérique. Des dosages de Fas ligand et d'IL-10 plasmatiques ont permis d'exclure un ALPS. Au total, nous n'avons pas pu affirmer de défaut qualitatif des sous-populations lymphocytaires évoquant les déficits immunitaires de type XLP et ALPS. Seule une lymphopénie B avec baisse des IgG est évocatrice de DICV. Nous avons étendu l'analyse à l'ensemble des patients (395patients) avec un contrôle à distance du diagnostic pour ceux qui étaient anormaux. Nous avons identifié 4 patients potentiellement atteints de DICV, 1,5%. Parallèlement, nous avons recherché un déficit de la réponse T anti-EBV par cytomètrie de flux et l'Elispot. L'étude de la réponse T anti-EBV par la cytométrie de flux, a montré une tendance vers une baisse de la production d'IL-2 par les CD4 et les CD8 de patients avec une charge virale EBV élevée en réponse à une stimulation par des peptides EBV en présence de lignées autologues. L'étude de la réponse T anti EBV par la technique d'ELISPOT sur 9 patients n'a pas montré globalement de déficit du contrôle de l'EBV sauf pour une jeune patiente de 10 ans ayant une charge virale EBV très élevée sans réponse T anti-EBV efficace. Les résultats que nous avons obtenus restent à approfondir, ce qui permettra d'enrichir les connaissances actuelles sur cette pathologie.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

34

Prieur, Eric. "Analyse in vitro de la réponse immunitaire T dirigée contre des antigènes du cytomégalovirus humain sous forme soluble ou associés à des biovecteurs synthétiques." Toulouse 3, 1997. http://www.theses.fr/1997TOU30036.

Full text

Abstract:

L'infection par le cytomegalovirus humain (cmvh) represente un probleme majeur de sante publique. Environ 80% de la population mondiale est infectee par ce virus. Chez les personnes immunodeprimees naturellement (nouveau-nes), pathologiquement (sida, cancer), ou iatrogeniquement (greffes), l'infection s'accompagne de pathologies souvent mortelles. Lors d'une primo-infection chez une femme seronegative en cours de grossesse, le developpement du ftus risque d'etre affecte, aboutissant a des pathologies invalidantes dont les plus courantes sont associees a des anomalies du systeme nerveux central (deficits sensoriels, retards psychomoteurs). Les proteines virales cibles de la reponse immunitaire naturelle sont connues. Un taux eleve de precurseurs cellulaires t cd4 anti-ie1 et t cd8#+ anti-pp65 a ete mesure chez des donneurs de sang seropositifs asymptomatiques. Les glycoproteines de l'enveloppe virale, en particulier gb et gh, sont les cibles majeures des anticorps neutralisants. L'expression dans la levure saccharomyces cerevisiae de fragments peptidiques de ie1 a permis de localiser l'epitope presente par hla-dr3 a des clones t cd4#+ anti-ie1 dans un fragment correspondant aux 166 acides amines n-terminaux de l'exon 4 (e4, 406 aa) de ie1 (491 aa). Nous developpons un vaccin sous-unitaire constitue par l'association des proteines ie1 et pp65 a des nanoparticules synthetiques de 80 nm de diametre chargees positivement nommees biovecteur (biovector therapeutics, toulouse). Les proteines virales ont ete produites dans escherichia coli fusionnees avec gst ; gst-e4, gst-ie1 et gst-pp65. Une autre construction a permis la production d'une proteine chimere ; gst-ie1-pp65. Le rendement de l'association de l'antigene aux biovecteurs en milieu aqueux etait superieur a 90%. L'association de l'antigene etait stable et le protegeait de la proteolyse. La microscopie optique confocale a permis de montrer que les biovecteurs etaient internalises par des lymphocytes b. In vitro, des clones t cd4#+ anti-ie1 proliferaient lorsque les antigenes solubles ou associes aux biovecteurs etaient presentes par des pbmc, des splenocytes, des lymphocytes b, des macrophages ou des cellules dendritiques. La quantite d'antigene necessaire pour obtenir une proliferation de cellules t cd4#+ anti-ie1 equivalente etaient 25 fois inferieure lorsqu'il etait associe aux biovecteurs. Cette amplification etait accompagnee par une secretion accrue des cytokines il-4 et ifn-gamma. Des travaux ont ete inities afin de determiner les conditions dans lesquelles les formulations associant ie1-pp65 a des biovecteurs permettraient la sensibilisation de cellules cibles a la cytolyse par des effecteurs t cd8 #+anti-cmvh. Ces formulations pourraient permettre l'induction de telles cellules effectrices in vivo. Nous avons montre que des peptides provenant de la degradation par la trypsine de gst-ie1-pp65 sensibilisaient des lymphocytes b a la lyse par des lignees cellulaires t cd8 #+anti-pp65. La presentation de ces peptides etait inhibee par un pretraitement des cellules cibles par la chloroquine. Ceci suggere que ces produits necessitent un appretement dans un compartiment cellulaire acide avant d'etre presente par les molecules hla de classe i. Des formulations synthetiques comme celles que nous proposons permettraient d'eviter les risques lies a l'utilisation de souches virales attenuees. Elles pourraient etre utilisees dans des protocoles de vaccination a visee immunoprophylactique au sein de populations a risques (femmes seronegatives, transfert de cellules apres greffes)

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

35

Jary, Marine. "Analyse du microenvironnement et de l'oncogenèse des cancers colorectaux surexprimant l’Angiopoiétine 2." Thesis, Bourgogne Franche-Comté, 2019. http://www.theses.fr/2019UBFCE016.

Full text

Abstract:

Le cancer colorectal est une maladie grave et fréquente, pour laquelle la survie s'est considérablement améliorée du fait de l'essor des thérapeutiques et des stratégies de combinaisons médico-chirurgicales, même en situation métastatique. C'est également une entité hétérogène, pour laquelle la personnalisation de la prise en charge reste réduite, de par l'absence de scores pronostiques ou prédictifs utilisés en routine et guidant les pratiques. Les classifications moléculaires établies n'ont pas de caractère prédictif et semblent inadaptées au stade métastatique, mais elles peuvent apporter de l'aide à la meilleure compréhension de la biologie des cancers colorectaux et de leur microenvironnement. L'utilisation de tests sériques récapitulant les caractéristiques de la tumeur serait probablement plus simple et moins couteux. La recherche de biomarqueurs résumant les caractéristiques de la tumeur, et guidant les traitements, est donc un enjeu majeur.Ce travail de thèse a porté sur l'étude de l'Angiopoietine 2, de la signature génique et protéique qui lui est associée, et sur l'analyse du microenvironnement et de la réponse immunitaire périphérique Th1 chez des patients atteints d'un cancer colorectal.La première partie du travail a consisté à étudier la valeur pronostique de l'Angiopoietine 2 au sein d'une cohorte de patients atteints d'un cancer colorectal métastatique. Un seuil discriminant de l'Angiopoietine 2 a été établi, définissant les patients de mauvais pronostic, indépendamment associé à la survie globale. Ce dosage améliorait la capacité discriminante de scores pronostiques classiques. La seconde partie du travail a consisté à identifier, à partir de bases de données transcriptomiques, les caractéristiques des patients porteurs de cancer colorectaux et surexprimant l'Angiopoietine 2. Les voies de signalisation et les gènes associés à cette entité de tumeur ont été analysés, pour mieux comprendre les éléments qui confèrent un mauvais pronostic, et pour définir des candidats, protéines sécrétées, pouvant être dosées chez les patients. Une signature génique puis sérique a été élaborée, reflétant le stroma l'angiogenèse l'invasion et la chimiorésistance. Le dosage des marqueurs ANGPT2, CD138 et STC1 sur une cohorte de patients a confirmé l'association de ces biomarqueurs au caractère de chimiorésistance. Cette signature associée aux tumeurs surexprimant l'Angiopoietine 2 est inversement corrélée à la réponse immunitaire dans les premières approches réalisées. Ceci nous a incité à étudier l'effet de la réponse immunitaire périphérique CD4 de type Th1 anti télomérase, COA1 et mésothéline, sur la survie globale des patients atteints de cancers colorectaux métastatiques. L'étude sérique de l'Angiopoietine 2 y a été associée. Nous avons ainsi validé des données récemment publiées dans d'autres localisations tumorales, attestant de la valeur pronostique de la réponse immunitaire périphérique, sur la survie globale pour les cancers du côlon métastatiques (étude prospective Epitopes-CRC02). Une corrélation inverse entre réponse immunitaire CD4 de type Th1 et l'ANGPT2 a été confirmée.Ces travaux ouvrent la voie sur le ciblage spécifique des tumeurs présentant la signature Angiopoietine 2 de chimiorésistance et de stroma abondant, par une approche combinatoire associant des thérapeutiques ciblant le microenvironnement tumoral. Un monitoring est également réalisable pour accompagner ces futurs projets de recherche, et les modèles pronostiques à venir intégreront ces données au sein des tests de survie multi-paramétriques
Colorectal cancer (CRC) is a severe and frequent disease, with important survival improvement due to therapeutic new approaches and surgical methods, even in metastatic setting. It is an heterogeneous entity, and personalized strategies are mandated, whereas few predictive and prognostic biomarkers are available in practical care. Molecular classifications are useful to better understand CRC biological characteristics, but they do not have predictive values, and seem to be inadequate for metastatic setting. Seric biomarkers are attractive since they could recapitulate tumor features, while being simpler and less expansive. There is a need to investigate surrogacy biomarkers illustrating intra tumoral microenvironment, in order to adapt treatment strategies.This thesis is about the clinical and molecular characterization of Angiopoietin 2 (ANGPT2) associated colorectal cancer. Assessment of microenvironment and peripheral immune Th1 response are performed and correlated with this entity.Prognostic value of ANGPT2 in metastatic colorectal cancer was studied in the first part of the manuscript. We described that ANGPT2 plasmatic levels were associated with a worst overall survival in metastatic setting. In the second part, using the open source transcriptomic tools, we decided to define the specific molecular signaling pathways correlated to ANGPT2 expression in CRC and its prognostic value in localized CRC. A specific signature was drawn, combining genes associated with stroma, invasion, angiogenesis, and chemo-resistance. Looking for associated secreted proteins, we could identify a seric signature (combining STC1, CD138 and ANGPT2), predictive for chemo-resistance. An negative correlation was observed between ANGPT2 signature and immune response. The last part of the thesis then explored the prognostic value of anti TERT peripheral immune Th1 response in metastatic colorectal cancer (Epitopes-CRC02 study), and validated its beneficial role for predicting OS. A negative correlation was confirmed, in seric measurement between CD4 immune response and ANGPT2.This work paves the way for individualized treatments in tumors harboring ANGPT2 associated characteristics', targeting the stromal and immune microenvironment. This immune and stromal biomonitoring is feasible and have to be associated to futures clinical studies. Future prognostic scores should probably assess the place of these biomarkers in order to improve their discriminant values

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

36

Chaouni, Benabdallah Ilham. "Etude phénotypique, génotypique et fonctionnelle des lymphocytes T à récepteur gamma/delta dans la polyarthrite rhumatoi͏̈de : analyse comparative avec les lymphocytes T alpha/bêta." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20221.

Full text

Abstract:

Afin d'evaluer les interactions entre le repertoire du recepteur des lymphocytes t (tcr) et l'induction et/ou le maintien d'une maladie autoimmune, la polyarthrite rhumatoide (pr), nous avons analyse le taux d'expression et la distribution des lymphocytes t alpha-beta et gamma-delta, ainsi que leur utilisation de certains produits de genes variables dans le sang peripherique et le site synovial des patients. Un role eventuel du polymorphisme des genes trgvi dans la susceptibilite a la maladie a ete ecarte. Une etude comparative en situation normale et pathologique montre une reactivite et une activation differentielles des lymphocytes t alpha beta et t gamma-delta, en particulier sous l'effet du tgf beta. L'ensemble des resultats obtenus n'est pas en faveur de l'implication d'une reponse specifique des lymphocytes t gamma delta dans la pathogenie de la pr mais indique une restriction individuelle du repertoire t alpha-beta dans le site synovial

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

37

Jabot-Hanin, Fabienne. "Recherche des facteurs génétiques contrôlant la réponse à l’infection par Mycobacterium tuberculosis et le développement d’une tuberculose maladie." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCB253/document.

Full text

Abstract:

La tuberculose, causée par Mycobacterium tuberculosis, connaît actuellement une résurgence inquiétante, et l’OMS estime à plus de 10 millions le nombre de nouveaux cas cliniques en 2015 avec environ 1,8 millions de décès dus à la maladie. Environ un tiers de la population mondiale est exposée à M.tuberculosis, et après exposition, la plupart des individus sont infectés par la mycobactérie. La grande majorité (~90%) des individus infectés ne présentera jamais de symptomatologie clinique. Parmi les 10% qui développent la maladie, environ la moitié le fera dans les deux années suivant l’infection, ce qui est en général considéré comme une forme primaire de tuberculose. Les autres patients présenteront leur maladie à distance de l’infection primaire (parfois plusieurs dizaines d’années plus tard) ; il s’agit des formes pulmonaires classiques de l’adulte. Chez l’homme, le rôle de certains facteurs génétiques a été maintenant démontré dans le développement d’une tuberculose active, à la fois la tuberculose pulmonaire de l’adulte et les formes plus disséminées de l’enfant, et aussi dans le contrôle de l’infection tuberculeuse. Cependant, la plus grande part de ces facteurs génétiques reste à identifier. Le premier objectif de ma thèse était d'identifier les facteurs génétiques de l'hôte modulant les phénotypes immunologiques de production d'Interféron gamma in vitro (IGRA) après exposition à M. tuberculosis dans un échantillon de 590 individus ayant été en contact avec un cas avéré de tuberculose dans le Val de Marne, en région parisienne. Puis, dans un second temps, de voir si les facteurs trouvés pouvaient être répliquées dans un échantillon familial d'Afrique du Sud, zone de très forte endémie tuberculeuse. Pour cela, j'ai tout d'abord réalisé des analyses de liaison génétique à l'échelle du génome entier sur plusieurs phénotypes quantitatifs d'IGRA. Celles-ci ont permis de mettre en évidence 2 loci majeurs (p < 10-4) répliqués en Afrique du Sud et liés à la production d'interféron gamma induite pour l’un par le bacille du BCG, et pour l’autre, par la part spécifique de l'antigène ESAT6 de M. tuberculosis (absent de la plupart des mycobactéries environnementales et du BCG), indépendamment de la capacité intrinsèque de réponse aux mycobactéries. La seconde étape a consisté en la réalisation d'une étude d'association sur les régions de liaison ainsi identifiées. Un variant associé au phénotype spécifique de l’ESAT6 (p < 10-5) a ainsi été trouvé, variant contribuant de manière significative au pic de liaison précédemment découvert (p<0.001) et ayant été rapporté comme modulant l’expression du gène ZXDC. Le second objectif de la thèse concernait l’identification de variants génétiques rares sous-jacents à la déclaration d’une tuberculose pulmonaire chez les individus infectés par le bacille. A cette fin, j’ai comparé les exomes de 120 patients tuberculeux à ceux de 136 individus infectés par le bacille mais non malades, tous originaires du Maroc. Cette étude m’a permis d’identifier le gène BTNL2, en bordure de la région HLA, dans lequel près de 10% des patients comportaient un variant rare perte de fonction contrairement aux contrôles qui n’en présentaient aucun
Tuberculosis remains a major public health concern, with approximately 10.4 million new cases and 1.8 million deaths due to the disease in 2015 according to WHO. While an estimated one third of the world population is estimated to be infected with Mycobacterium tuberculosis, only about 10% of infected individuals go on to develop a clinical disease. Among them, half will declare the disease in the 2 years following infection, which is generally considered as primary tuberculosis. The other patients will develop the disease more distant in time of primary infection, sometimes several tens of years latter; these are classical pulmonary forms in adults. In humans, the role of genetic factors have been demonstrated in the development of active tuberculosis, in pulmonary forms as in disseminated forms in childhood, et also in the control of M.tuberculosis infection. Nevertheless, most of these genetic factors remain to identify. The first aim of my PhD was to identify genetic factors controlling in vitro interferon-gamma production phenotypes (IGRA) after exposure to M.tuberculosis in a sample of 590 subjects who were in contact with a proven tuberculous patient in Val-de-Marne, Paris suburbs, and in a second time, to try to replicate the findings in a south African familial sample where the tuberculosis is highly endemic. For this purpose, I first performed genome-wide genetic linkage analysis for several quantitative IGRA phenotypes. They led to identify 2 major loci (p<10-4) replicated in South-Africa and linked to the interferon-gamma production induced by live BCG for the first one, and for the second one, by the specific part of the ESAT6 antigen of M.tuberculosis (absent from most of environmental mycobacteria and from BCG), independently of intrinsic ability to respond to mycobacteria. The second step was an association study in the identified linkage regions. A variant associated to the specific ESAT6 phenotype was found (p<10-5), which was significantly contributing to the linkage peak (p<0.001) and previously reported as eQTL of ZXDC gene. The second objective of my PhD was the identification of rare genetic variants underlying the development of pulmonary tuberculosis in infected individuals. To this end, I compared exome data from 120 tuberculous patients and 136 infected individuals without any clinical symptoms. All of them were from Morocco. This study resulted in the lighting of BTNL2 gene, very closed to the HLA region, in which around 10% of patients had a rare loss of function variant whereas the controls didn’t have any

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

38

Hamrouni, Abdelbasset. "Identification des clones de lymphocytes T spécifiques de l'antigène liés au m^eme réarrangement VDJβ ancestral." Lyon, École normale supérieure (sciences), 2003. http://www.theses.fr/2003ENSL0259.

Full text

Abstract:

Le schéma du développement des lymphocytes T dans le thymus est compatible avec la génération à partir d'un même précurseur VDJβ de plusieurs cellules filles exprimant des TRCα différents. Mais l'énorme diversité du répertoire TCR chez la souris normale rend difficile la détection de tels groupes. Les différents modèles de diversité restreinte du répertoire, les souris TCRβ transgéniques, suggèrent que la diversité du répertoire TCRα, associé à un TCRβ donné au niveau des lymphocytes T matures, pourrait être fortement réduite par les processus de sélection. Nous avons considéré que si certains descendants d'un même réarrangement VDJβ expriment des TCRα similiaires, certaines de ces cellules pourraient reconnaître le même épitope. Dans ce cas, il serait possible de les détecter par l'analyse détaillée des répertoires TCRαβ spécifiques de l'antigène sélectionnés lors des réponses immunitaires qui se traduisent par une forte expansion clonale. Nous avons utilisé un modèle de réponse lymphocytaire T CD8 qui permet l'indentification ex vivo et la purification d'une sous-population fortement enrichie en cellules spécifiques de l'antigène à partir de souris individuelles. En plus, cette réponse immunitaire est dirigée essentiellement contre un seul peptide le HLA-CW3(170-179) présenté par les molécules H-2Kd dont le répertoire est caractérisé par une diversité relativement étroite facilitant ainsi son analyse à partir de cellules individuelles. En faisant appel à des techniques de "single-cell RT-et DNA-PCR" très efficaces, nous avons pu détecter des clones de cellules T qui partagent le même réarrangement VDJβ associé à des TCRα différents dans des clones distincts. En outre, ces cellules dont l'origine commune a pu être prouvée par l'amplification des réarrangements DJβ résiduels, peuvent être sélectionnées par le même antigène chez une souris normale et contribuent au répertoire immun à des proportions inégales. Ces résultats suggèrent que, chez la souris normale, la diversité du répertoire TCRα associé à un réarrangement VDJβ pourrait être en fait très limitée.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

39

Rombouts, Yoann. "Analyse structurale et fonctionnelle des glycolipides pariétaux de Mycobacterium marinum : une mycobactérie modèle dans l’étude de la tuberculose." Thesis, Lille 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LIL10145/document.

Full text

Abstract:

Mycobacterium marinum est une mycobactérie pathogène des ectothermes génétiquement proche de M. tuberculosis. Ce modèle peut être utilisé pour mieux comprendre la formation des granulomes tuberculeux et déterminer le rôle des glycoconjugués pariétaux dans la régulation de la réponse immunitaire. Dans ce contexte, nos travaux ont porté sur la purification des glycolipides polaires et apolaires extraits de la paroi de M. marinum et leur caractérisation en utilisant la résonance magnétique nucléaire et la spectrométrie de masse. Nos résultats concernant l’analyse structurale de la famille des lipooligosaccharides polaires (LOSs, comprenant les LOS-I à LOS-IV) ont démontré la présence de monosaccharides rares, dont le caryophyllose et un monosaccharide N-acylé, spécifique du LOS-IV. Nous avons également observé que tous les LOSs inhibent la sécrétion macrophagique d’une cytokine pro-inflammatoire, le TNF-α. En revanche, seul le LOS-IV stimule l’expression d’antigènes (ICAM-1 et CD40) à la surface des macrophages et la production de chimiokine (IL-8). Cet effet inducteur du LOS-IV pourrait être lié à la présence du monosaccharide terminal N-acylé. Par ailleurs, les autres glycolipides polaires analysés, incluant les phosphatidyl-myo-inositol mannosides (PIM), le lipomannane (LM) et le lipoarabinomannane (LAM), possèdent des structures similaires à celles de M. tuberculosis.L’étude des glycolipides apolaires a permis de préciser la structure des glycolipides phénoliques (PGL) et des tréhaloses di-mycolates (TDM). De plus, une famille de glycolipides méconnue comprenant le Di-Mycolyl-Di-Arabinoglycérol (DMDA) a été identifiée. Le DMDA présente une structure très proche de la partie terminale du mycolyl-arabinogalactane-peptidoglycanne (mAGp), macro-complexe pariétal majoritaire des mycobactéries. Des études complémentaires effectuées chez M. bovis BCG ont démontré que ce glycolipide était lié au métabolisme du mAGp, ce qui ouvre de nouvelles pistes pour la compréhension du mode d’action de certaines drogues anti-tuberculeuses telles que la thiacétazone
Mycobacterium marinum is a natural pathogen of ectotherms genetically close to M. tuberculosis. This pathogen model is useful for deciphering the role of mycobacterial cell wall glycolipids in granulomatous infection. In this context, our work focused on the purification of both polar and apolar glycolipids extracted from M. marinum cell wall and their structural characterization using nuclear magnetic resonance and mass spectrometry. Analysis of the polar lipooligosaccharide family (LOSs, including LOS-I to LOS-IV) demonstrated the presence of several rare or even unique monosaccharides including caryophyllose, derivatives and a N-acylated monosaccharide specific of LOS-IV. Biological activity assays showed that LOSs exert an important pro-inflammatory effect by decreasing the TNF-α secretion from macrophages. Moreover, LOS-IV was found to stimulate the expression of the chemokine IL-8 and cell surface antigens (CD40 and ICAM-1) on macrophages. This specific immunostimulatory property was related to the presence of the terminal N-acylated monosaccharide in LOS-IV. In addition, other polar glycolipids analyzed, including phosphatidyl-myo-inositol mannosides (PIM), lipomannane (LM) and lipoarabinomannan (LAM), possess similar structures than M. tuberculosis. The study of apolar glycolipids permitted to precise the structure of phenolic glycolipids (PGL) and trehalose di-mycolates (TDM). Moreover, a family of unusual glycolipids, including Di-Mycolyl-Di-Arabinoglycérol (DMDA), was identified. DMDA structure is very close from the terminal part of peptidoglycan-arabinogalactan-mycolyl (mAGp), the mycobacterial cell wall macro-complex. Additional studies performed in M. bovis BCG showed that this glycolipid is related to mAGp, providing new insights about the mode of action of anti-tuberculous drugs such as thiacetazone

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

40

Maman, David. "Analyse multicentrique du devenir des patients vivants avec le VIH dans les cohortes suivies par Médecins Sans Frontières France en Afrique subsaharienne." Thesis, Lyon 1, 2015. http://www.theses.fr/2015LYO10146.

Full text

Abstract:

Près des deux tiers des patients vivant avec le VIH habitent en Afrique sub-saharienne. Dans ces pays à ressources limitées, la question du niveau optimal de CD4 pour débuter le traitement antirétroviral (ARV) est un enjeu majeur de santé publique. Nous avons étudié la reconstitution immunitaire à long terme sous ARV et son association avec la survie dans quatre projets de prise en charge du VIH soutenus par Médecins Sans Frontières (MSF) en Afrique sub-Saharienne entre 2001 et 2010. Nous avons utilisé des modèles mixtes pour prendre en compte les mesures de CD4 répétées aussi bien dans la modélisation de la réponse immunitaire que dans l'analyse de survie. Dans la première partie modélisant la reconstitution immunitaire, nous avons montré que les femmes ont une meilleure reconstitution immunitaire que les hommes et que la capacité de reconstitution immunitaire est la même quel que soit le taux de CD4 au démarrage des ARV. La deuxième étude a mis en évidence que la survie était améliorée sous ARV chez les patients atteignant un taux de CD4 courant supérieur à 500 cellules/μL par rapport à ceux qui ont un taux de CD4 entre 350 et 499 cellules/μL. Le sexe, l'âge et l'observance ont aussi été identifiés comme prédicteurs indépendants de mortalité après neuf mois sous ARV. En conclusion, nous montrons que les femmes ont une meilleure reconstitution immunitaire et atteignent plus vite un taux de CD4 de 500 cellules/μL qui est associé à une meilleure survie. Ce travail suggère qu'un démarrage plus précoce des ARV, avant que le taux de CD4 ne tombe en dessous de 500 cellules/μl, pourrait améliorer la survie et confirme le besoin d'essais cliniques évaluant les bénéfices individuels d'une telle stratégie
Almost two third of individuals living with HIV are in sub-Saharan Africa. In these resource limited countries, the optimal CD4 cell count level to initiate antiretroviral treatment (ART) is still debated. We studied long term immune reconstitution on ART and its association with survival in four HIV programs supported by Médecins Sans Frontières in sub-Saharan Africa between 2001 and 2010. We used mixed models to account for repeated CD4 measurements in the modelling of the immune reconstitution and the survival analysis. In the first part modelling immune response to ART, we showed that women achieved a better immune reconstitution compared to men and that the immune reconstitution capacity is the same for each level of CD4 at ART initiation. The second study showed that survival is improved for patient with an updated CD4 above 500 cells/μL compared to those with CD4 levels between 350-499 cells/μL. Furthermore, gender, age and adherence are independently associated with mortality. As a conclusion, women have a better immune reconstitution and achieved quicker

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

41

De, la Chevrotière Claudia. "Analyse de la variabilité génétique de la résistance aux strongles gastro-intestinaux chez les chèvres créoles à des fins de sélection et de compréhension des mécanismes." Thesis, Antilles-Guyane, 2011. http://www.theses.fr/2011AGUY0407/document.

Full text

Abstract:

Les deux principaux objectifs de ce travail sont de proposer des outils pour la selection d'animaux résistants aux strongles gastro-intestinaux, parasites du tube digestif, et de faire progresser la compréhension des mécanismes de résistance chez la chèvre créole. La variabilité génétique du caractère de résistance au parasitisme digestif a été étudiée afin de vérifier quels critères décrivant le mieux la résistance, peuvent être utilisés pour la sélection. L'ensemble des résultats obtenus suggèrent que le critère d'excrétion d'oeufs et le critère d'éosinophilie sont les plus adaptés pour un schéma de sélection puisqu'ils possèdent une héritabillté moyenne et représentent le mieux la résistance. De plus, ils ne semblent pas en opposition avec le poids, principal critère de production. Le déterminisme génétique de la résistance aux strongles gastro-intestinaux a été étudié et a permis de mettre en évidence l'existence d'un gène majeur pour la résistance chez la population de chèvre créole. De plus, la primo-détection de qtl a permis d'identifier 13 régions du génome ayant un effet sur les critères de résistance. Les mécanismes responsables de la résistance aux strongles gastro-intestinaux ont également été à l'étude. L'ensemble des résultats met en évidence le rôle des éosinophiles dans la mise en place de la résistance aux strongles gastro-intestinaux. L'activité des immunogobulines e semblent dirigés vers les larves l3 d'haemonchus contortus et suggère la mise en place d'une réaction protectrice. Chez la chèvre créole. Ces deux mécanismes semblent donc jouer un rôle important dans la mise en place de la résistance aux strongles gastro-intestinaux
The two main objectives of this work are to propose tools for the selection of resistant animals to gastrointestinal nematodes and advance knowledge on mechanisms of resistance of creole goats. this work has analysed the genetic variability of resistance to digestive parasitism in order to determine which criteria best describes the resistance and can be use for selection. the overall results suggest that the egg excretion and the eosinophilia are the criteria most suitable for a breeding scheme because they have moderate heritability estimates and best represent the resistance. moreover, they do not seem in conflict with the weight, the main criterion of production. the genetic determinism of resistance to gastrointestinal parasites has been studied and has highlighted the existence of a major gene for resistance in creole goats. in addition, the primodetection of qtl identified 13 genomic regions that affect the resistance. the mechanisms behind the resistance to gastrointestinal parasites were also studied and first hypothesis regarding the involvment of the immune response in resistance have been made in goats. the overall results highlighted the role of eosinophils in the development of resistance to gastrointestinal nematodes. the activity of immunoglobulin e seems directed toward l3 larvae of haemonchus contortus and may be imply in the establishment of a protective response agasint nematode parasites. in creole goats, these two mechanisms seem to play an important role in the development of resistance to gastrointestinal nematode infections

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

42

Vailleau, Fabienne. "Rôle d'AtMYB30, facteur de transcription associé à la mort cellulaire hypersensible chez Arabidopsis thaliana : analyse de lignées transgénique et recherche des cibles par analyse du transcriptome." Toulouse 3, 2003. http://www.theses.fr/2003TOU30216.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

43

Carré, Thibault. "Analyse des bases moléculaires de la résistance tumorale à la cytotoxicité spécifique et naturelle dans le contexte microenvironnemental." Thesis, Paris 11, 2012. http://www.theses.fr/2012PA11T057.

Full text

Abstract:

Au cours de la réponse immunitaire antitumorale, l’instabilité génétique des tumeurs combinée à la pression de sélection du système immunitaire peut conduire, via l’immunoediting, à l’émergence de variants tumoraux résistants à la lyse par les effecteurs cytotoxiques. Une meilleure compréhension de ces mécanismes potentiellement impliqués dans la susceptibilité tumorale à la lyse naturelle et/ou spécifique pourrait permettre le développement de stratégies d’immunothérapie intégratives plus efficaces. Dans ce cadre nous avons étudié un modèle de résistance à la lyse spécifique impliquant un remaniement du cytosquelette d’actine (i). Nous avons pu mettre en évidence que l’inhibition conjointe de protéines interagissant avec l’actine (caldesmone, ézrine, radixine et moésine) générait une réduction de la susceptibilité des cellules tumorales à la lyse par les lymphocytes T cytotoxiques (CTLs). Parallèlement, nous avons identifié les microARNs différentiellement exprimés entre le variant résistant et la lignée parentale et étudié leur implication dans la susceptibilité tumorale à la lyse par les CTLs. Dans le but de déterminer le rôle d’une pression de sélection par les cellules tueuses naturelles (NK pour Natural Killer), de l’immunité innée, sur les cellules tumorales et l’émergence de variants résistants, nous avons aussi établi un modèle de coculture continue de cellules tumorales de mélanomes avec des cellules NK (ii). Les cellules tumorales obtenues sont résistantes à la lyse NK (mais toujours sensibles à la lyse spécifique par un clone lymphocytaire T cytotoxique) et établissent moins de contact et de synapse immunologique avec les cellules NK que la lignée parentale. L’analyse transcriptomique a révélé la baisse d'expression de B7-H6 (ligand d'un récepteur activateur des cellules NK) qui contribue partiellement au phénomène de résistance. De nombreux gènes impliqués dans les phénomènes de migration/invasion/adhérence sont également modulés et certaines propriétés cellulaires (croissance en milieu semi-solide, adhérence, migration) semblent refléter l’acquisition d’une agressivité tumorale accrue suite à la coculture. Nous avons finalement analysé l’impact sur la réponse antitumorale de la connexine-43, impliquée dans la formation des jonctions communicantes (GJ pour Gap Junction) (iii). Nous avons montré que sa présence à la synapse entre cellules tumorales et CTL n'exerce aucun impact sur la susceptibilité à la lyse. Néanmoins, les GJs sont impliquées dans l’émergence par stimulation antigénique de lymphocyte T CD8+ spécifique hautement réactif
During antitumor immune response, cancer cells genetic instability combined with immune system selective pressure may drive to the emergence of tumor variant resistant to lysis by cytotoxic effector cells through a phenomenon called immunoediting. A better understanding of those mechanisms putatively involved in tumor susceptibility to natural and/or specific lysis would enable new integrative and more effective immunotherapeutic strategies. In this context, we studied a model of resistance to specific lysis linked to actin cytoskeleton remodeling (i). We showed that combined inhibition of actin interacting protein (caldesmone, ezrin, radixin and moesin) reduced tumor cells susceptibility to cytotoxic T lymphocytes (CTLs) lysis. Moreover, we identified microRNAs differentially expressed between parental cell line and resistant variant and are currently studying their impact on tumor susceptibility to CTLs lysis. In order to depict the role of innate immunity Natural Killer (NK) cells selective pressure, on tumor cells and on the emergence of resistant variants, we also established a maintained coculture model of melanoma cells with NK cells (ii). Selected cells obtained were resistant to NK cells-mediated lysis (but still susceptible to CTLs-mediated specific lysis) and formed less contact and immune synapse with NK cells than parental cell line. Transcriptomic analysis revealed the reduced expression of B7-H6 (ligand of an NK cells activating receptor) partially contributing to the resistance phenotype. The expression of several genes involved in migration/invasion/adhesion is also modulated and some cell characteristics (cell growth in semi-solid medium, adhesion, migration) tend to reflect the acquisition through coculture of an increased aggressiveness. Finally, we evaluated the impact of connexin-43 (Cx43), involved in the establishment of Gap Junctions (GJs), on antitumor response (iii). We showed that despite localization at the immune synapse between tumor target cell and CTL, Cx43 and GJs do not modulate susceptibility to CTL-mediated specific lysis. Nevertheless, GJs contribute to the emergence of highly reactive specific CD8+ T lymphocytes following antigen stimulation

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

44

Girardot, Fabrice. "Recherche et analyse de facteurs génétiques impliqués dans la résistance au stress et le contrôle de la longévité chez Drosophila melanogaster." Paris 6, 2002. http://www.theses.fr/2002PA066525.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

45

Feuillard, Jean. "Etude des rôles des protéines ReL/NF-kappa B dans la réponse immune : analyse in situ de l'expression des proteines Rel/NF-kappa B dans le thymus et les organes lymphoïdes secondaires." Paris 7, 1997. http://www.theses.fr/1997PA077210.

Full text

Abstract:

Le système immunitaire nécessite le recrutement et la différenciation coordonnée de nombreux types cellulaires. Or, les facteurs transcriptionnels déterminent en grande partie le phénotype et le degré de différenciation des cellules. Parmi ces facteurs transcriptionnels, la famille Rel/NF-kappa B est sans doute importante. Les protéines Rel/NF-kappa constituent une famille de 5 facteurs transcriptionnels ubiquitaires, p50, p52, p65, c-Rel et RelB. Ces protéines sont caractérisées par l'existence d'un domaine d'homologie commun appelé domaine Rel, et sont fonctionnelles à l'état d'homo ou d'hétérodimères, formant les complexes Rel/NF-kappa B. Ces complexes participent à la régulation positive de la transcription des gènes ayant un site spécifique, appelé site kappa B, dans leur région régulatrice. Les sites kappa B sont retrouvés au sein des régions régulatrices de nombreux gènes de la réponse immune. Les complexes Rel/NF-kappa B contenant les protéines c-Rel ou p65 sont retenus dans le cytoplasme par interaction avec des inhibiteurs spécifiques, les protéines I-kappa B. L'activation NF-kappa B consiste en la dissociation de ces complexes d'avec ses inhibiteurs I-kappa B suivi de leur translocation dans le noyau, où leur activité transcriptionnelle s'exerce. La diversité de signaux activateurs et le nombre de gènes cibles potentiels posent la question du rôle effectif des protéines Rel/NF-kappa B dans la réponse immune in vivo. In vitro, l'activation NF-kappa B peut être obtenue dans tous les tous les types cellulaires, quelle que soit l'origine embryologique, par des agents de nature très variée. Ainsi, il est très difficile d'extrapoler les résultats expérimentaux obtenus in vitro pour déduire les rôles réels des protéines Rel/NF-kappa B in vivo dans le système immunitaire. C'est pourquoi, afin d'aborder ce problème, nous avons analysé l'expression des protéines Rel/NF-kappa B in situ dans le thymus et les organes lymphoïdes secondaires. En effet il existe une relation étroite entre la différenciation cellulaire et la microanatomie dans ces organes lymphoïdes. De plus, il est possible de reconnaître individuellement les cellules dans ces tissus, soit morphologiquement, soit à l'aide d'immunomarquages. Enfin, nous avons analysé l'activité NF-kappa B in situ dans les organes lymphoïdes de souris transgéniques ayant comme transgène le gène de la (3galactosidase sous contrôle des sites kappa B. Nos résultats montre que, i) la localisation nucléaire de p50, p52 et RelB n'est constatée que pour les cellules accessoires de l'immunité avec p50 pour les cellules épithéliales du thymus, p52 et RelB pour les cellules accessoires de l'immunité, p50, p52 et RelB pour les cellules présentatrices de l'antigène, suggérant un rôle majeur de ces protéines dans cette catégorie de cellules, ii) Dans le thymus, c-Rel est absent des thymocytes corticaux, mais présent dans les thymocytes médullaires et, dans les organes lymphoïdes secondaires, c-Rel prédomine dans les lymphocytes B vierges, suggérant que c-Rel joue un rôle dans la différenciation thymocytaire et dans la différenciation lymphocytaire B et, iii) p65 est retrouvée de façon dispersée dans les organes lymphoïdes secondaires et dans le thymus; cependant, dans le thymus, p65 prédomine dans les thymocytes médullaires. Ces résultats suggèrent donc que, dans le système immunitaire, la localisation nucléaire des protéines Rel/NF-kappa B est associée à l'accomplissement d'un programme génétique particulier en rapport avec la fonction et ou la différenciation de la cellule. La nature exacte du(des) complexe(s) déterminerait(aient) alors l'ensemble des gènes ciblés pour la réalisation de ce programme génétique.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

46

Normand, Alexia Delannoy. "Recherche de gènes impliqués dans l'installation du strongle Haemonchus contortus par une approche transcriptomique." Thesis, Tours, 2010. http://www.theses.fr/2010TOUR4034/document.

Full text

Abstract:

Parmi les nématodes gastro-intestinaux ayant un impact majeur sur la santé des ruminants Haemonchus contortus est l’espèce la plus pathogène. Actuellement, le contrôle des populations parasitaires repose sur les traitements anthelminthiques dont l’efficacité est limitée par l’émergence de parasites résistants. L'établissement de nouvelles stratégies de lutte (thérapeutiques ou vaccinales) repose actuellement sur l'identification de nouvelles cibles moléculaires. Ainsi, les gènes spécifiquement régulés lors de la phase précoce d’interaction du parasite H. contortus avec son hôte sont des cibles de choix. Afin d’identifier ces gènes, 4 banques d’H. contortus enrichies en ADNc spécifiquement exprimés au stade L4 (5 jours après infestation) ont été obtenues par la technique d’Hybridation Suppressive et Soustractive (SSH). Sur 400 clones criblés (dot-blot, RT-PCR), 51 clones d’intérêts ont été regroupés en 10 contigs. Les candidats possédant un peptide signal de sécrétion ont fait l’objet d’une étude plus approfondie. Les homologues de ces candidats ont été recherchés chez les deux autres principales espèces de strongles gastro-intestinaux (T. circumcincta et T. colubriformis) dans le but d’évaluer leur polymorphisme. La production et la purification des protéines recombinantes correspondant à ces candidats a également été réalisée afin de tester leur éventuel pouvoir immunogène
Gastro-intestinal nematodes such as Haemonchus contortus have a major impact on health of small ruminants world-wide. The control of infections remains largely based on anthelminthic treatments, but spreading of resistance has reduced their efficiency. An attractive solution would be the development of anti-nematode vaccines. Genes expressed during the early parasitic stage of H. contortus constituted our main targets. We have developed an approach based on SSH (Suppressive Subtractive Hybridization) technique and generated 4 subtracted cDNA libraries of H. contortus enriched in cDNA specifically expressed during L4 stage (five days post infection). 400 clones were analyzed by dot-blotand 51 clones regrouped in 10 contigs. All contigs were validated by RT-PCR. Homologues of candidates possessing a signal peptide were searched in T. colubriformis and T. circumcincta to evaluate their polymorphism. Recombinant proteins of theses candidates were produced and purified in order to know if they have a good vaccine potential with cross protection against two major gastro-intestinal nematodes

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

47

Ibanez, Adriana. "Analyse d'une banque d'ADNc enrichie en protéines membranaires et associées aux membranes chez Arabidopsis thaliana et recherche des gènes différentiellement exprimés en réponse à une contrainte hydrique." Toulouse 3, 2004. http://www.theses.fr/2004TOU30156.

Full text

Abstract:

3Au cours de l'évolution les végétaux ont développé des mécanismes leur permettant de s'adapter aux contraintes environnementales, comme le manque d'eau. Au niveau cellulaire, les protéines membranaires jouent un rôle essentiel dans la tolérance au stress hydrique et l'interface que constitue le plasmalemme est probablement le site de perception et d'initiation de la transduction des signaux. A l'heure actuelle, les études fonctionnelles des protéines membranaires de la cellule végétale sont peu développées. L'objectif général de ma thèse visait à analyser une banque d'ADNc enrichie en gènes codant des protéines membranaires chez Arabidopsis thaliana et à identifier de gènes différentiellement exprimés en réponse à la contrainte hydrique. Ce travail concerne le séquençage complet de la banque, l'annotation des clones par une analyse bioinformatique et la création d'une base de données interne. Les résultats montrent que la proportion d'ADNc codant des protéines membranaires est égale à 30 % des clones et que 34 % des protéines déduites ne possèdent de fonction connue. Dans une seconde partie, l'identification des gènes différentiellement exprimés en réponse au stress hydrique a été effectuée, en utilisant l'approche basée sur la technique de macroarrays. Pour cela, des test physiologiques réalisés sur plantules d'Arabidopsis ont permis de sélectionner deux intensités de stress hydrique. Le stress modéré, qui n'affecte pas la croissance racinaire, réprime des gènes de fonction inconnue et d'autres impliqués dans la synthèse protéique et le transport cellulaire. Le stress fort, qui provoque une diminution de la croissance racinaire, induit des gènes de fonction inconnue, du métabolisme, de la synthèse et modification protéique et le transport cellulaire. L'expression des gènes codant des protéines membranaires est altérée. L'analyse fonctionnelle de ces gènes candidats, ouvre des perspectives dans la définition de leur rôles lors de la réponse au stress hydrique
During evolution, plants have developed mechanisms enabling them to adapt to environnemental constraints, as water stress. At cellular level, plasma membrane is probably the site of perception and initiation of signal transduction. Membrane proteins play essential roles in water stress tolerance. At present, functional studies of plant membrane proteins are scarce. The aim of my thesis was to analyze an ordered cDNA library enriched in genes encoding membrane proteins of Arabidopsis thaliana and to identify differentially expressed genes in water stress conditions using this model plant and a macroarray approach. The first part of work included systematically sequencing of the library, clones annotation and creation of an internal database. Results show that the proportion of cDNA encoding membrane proteins is 30 % of total clones and 34 % of deduced proteins have no known function. The second part of work include the identification of differentially expressed genes involved in water stress responses. Physiological tests were performed to evaluate responses of Arabidopsis thaliana seedlings to water stress and to define the intensity of stress treatments. Two stress treatments were choosen, representing similar conditions to those met by plants in natural environnements. In order to screen the library using a macroarray approach these treatments were applied to seedlings. A moderate stress, without effect on root growth, provoked down-regulation of genes taking part in protein synthesis and cellular transport. On the other hand, a more severe stress, which causes root growth reduction, provoked up-regulation of genes taking part in general metabolism and intracellular transport. Transcriptional data show expression of genes encoding membrane proteins are affected in response to water stress. Functional analysis of genes encoding membrane proteins of unknown

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

48

Laligant, Anne. "Evaluation des modifications de conformation de la }b-lactoglobuline soumise à̄ des traitements thermiques à pH neutre." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20123.

Full text

Abstract:

Ce travail a pour objectif de mettre au point un ou plusieurs procedes rapides et discriminants d'evaluation de la conformation native ou denaturee de la beta-lactoglobuline (blg), dans le but de les correler a des proprietes technologiques. Une etude comparative de la liaison de trois sondes fluorescentes hydrophobes (acide cis parinarique, acide anilino-naphthalene sulfonique, retinol) sur la blg-native ou la serum albumine bovine est menee systematiquement en fonction des conditions experimentales (concentrations, modele mathematique de la liaison) et permet de mettre au point une methodologie d'evaluation de l'hydrophobicite de surface des proteines. Les resultats sont reproductibles. Les caracteristiques de la liaison du retinol sur la blg-native (nombre de sites, constante de dissociation) sont mises a profit pour suivre les modifications de conformation induites par traitements thermiques (75-90#oc) a des ph proches de la neutralite ou par simples variatons de ph. Une seconde approche fait appel a la production d'anticorps polyclonaux anti-blg-native et anti-blg-hcoooh, la blg-hcoooh ayant subi une oxydation performique. Ces deux outils sont capables de detecter les modifications de conformation, l'immunserum anti-blg-denaturee permettant d'atteindre une meilleure sensibilite. Les traitements thermiques etudies se manifestent par une baisse de l'hydrophobicite quelque soit le ph et des modifications des determinants antigeniques qui se traduisent par un accroissement de la reactivite des anticorps anti-blg-native et anti-blg-hcoooh pour les proteines denaturees. Des resultats similaires ont ete observes en presence d'un isolat proteique enrichi en blg

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

49

Grandpierre, Catherine Bergonier. "Immunogénicité et antigénicité de produits de substitution dans les intolérances aux protéines de lait de vache." Toulouse 3, 1991. http://www.theses.fr/1991TOU30271.

Full text

Abstract:

L'auteur a teste l'immunogenicite et l'antigenicite de proteines de lait de chevre (plc), d'un extriat de volaille (poul) et de plusieurs hydrolysats de proteines: deux hydrolysats de caseine (tip et ami dont les poids moleculaires (pm) sont respectivement inferieurs a 1500 et 2000 daltons (d)), un hydrolysat de proteines du lactoserum (gal de pm inferieur a 5000 d) et un hydrolysat de collagene de buf et d'isola de soja (mil de pm inferieur a 10000 d). L'immunogenicite a ete appreciee en recherchant, grace aux methodes d'electrosynerese, de dot-blot et elisa (enzyme linked immuno sorbent assay), la presence d'anticorps de type igg chez des lapins immunises avec les divers produits. La reactivite des anticorps de lapins anti-proteines de lait de vache (plv) avec les peptides et les proteines a ete testee par des tests directs et d'inhibition de trois methodes deja citees; celle des ige specifiques a ete analysee avec le test d'inhibition de la methode phadezym ige rast/eia#. Une immunisation des lapins a ete decelee vis-a-vis des plv, d'ami et de gal. Par contre, les lapins ne semblent pas s'etre immunises contre tip, mil et poul. Les hydrolysats de plv reagissent avec les anticorps de lapins diriges contre les plv entieres contrairement a mil et poul. L'inhibition des ige specifiques par tip, mil et poul est faible, elle est un peu plus forte avec ami et gal et s'avere tres importante avec les plc. L'analyse des resultats a permis, en particulier, d'indiquer que pour diminuer notablement les proprietes immunogenes et antigeniques des hydrolysats de plv, il est necessaire d'abaisser le pm en dessous de 1500 d. Par contre, pour des produits issus de proteines differentes des plv, il n'est pas indispensable que l'hydrolyse soit si poussee. Enfin, la possibilite d'utiliser les divers produits en nutrition infantile fait l'objet d'une discussion rapide

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

50

Novelli, Sophie. "Pronostic à long terme des personnes diagnostiquées en primo-infection VIH-1." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASS079.

Full text

Abstract:

Les personnes vivant avec le VIH développent souvent des comorbidités sévères, en partie attribuables à la persistance d’une inflammation chronique, y compris sous traitement antirétroviral. Cette thèse portait sur le suivi à long terme des personnes diagnostiquées en primo-infection VIH-1 et sur l’impact du traitement immédiat préconisé par les recommandations internationales sur cette inflammation chronique. Elle a été menée à partir des données de la cohorte française ANRS CO6 PRIMO. Avec un suivi médian de 7 ans, nos résultats confirmaient l’intérêt certain du traitement en primo-infection pour accélérer la restauration immunitaire et réduire la taille du réservoir viral. En revanche, nous ne mettions pas en évidence de bénéfice du traitement en primo-infection par rapport à un traitement différé en infection chronique sur les niveaux d’activation immunitaire, d’inflammation et de réplication virale résiduelle atteints sous traitement à long terme. De plus, comparés à deux groupes contrôles non infectés par le VIH, présentant respectivement une fréquence faible et élevée de comportements de santé dits « à risque », les individus en succès virologique prolongé maintenaient des niveaux élevés pour des marqueurs spécifiques des composantes mono-macrophagique et lymphocytaire de l’inflammation et de l’activité de l’épithélium intestinal, y compris après prise en compte de cofacteurs d’inflammation non liés au VIH. Enfin, les femmes, qui à l’initiation du traitement avaient déjà des caractéristiques immunovirologiques plus favorables que les hommes, présentaient une meilleure réponse virologique et immunologique que leurs homologues masculins, dont les répercussions cliniques restent toutefois à préciser.Ces travaux centrés sur les paramètres immunovirologiques seront poursuivis et complétés par une meilleure caractérisation de l’état de santé des personnes vivant avec le VIH en France par rapport à la population générale
This thesis focused on the long-term follow-up of individuals diagnosed with primary HIV-1 infection and the impact of early antiretroviral therapy (ART) initiation, particularly on chronic inflammation, which has been linked to the development of severe co-morbidities in people aging with HIV. Data came from the French ANRS CO6 PRIMO cohort. First, we confirmed the benefit of immediate ART initiation during primary infection, as recommended by international guidelines, to enhance the immune recovery and achieve long-term reduction of HIV reservoir size. However, we did not observe any effect of ART initiation in primary infection versus deferred in chronic infection on the levels of inflammation, nor immune activation or residual viral replication, after nearly 7 years of effective ART. Moreover, compared to two non HIV infected control groups, with respectively low and high frequency of health risk behaviours, HIV participants under long-term suppressive ART showed increased levels of markers associated with the mono-macrophagic and lymphocytic components of inflammation and intestinal mucosal integrity, even after taking into account major non-HIV related cofactors of inflammation. Besides, women, who already had more favourable immunovirological characteristics than men in primary infection, showed a better virological and immunological response than men following ART initiation in primary infection. However, the clinical benefit of these immunological advantages remains to be determined.This work focused on immunovirological parameters and will be continued with a better characterization of the health status of people living with HIV in France on common health parameters, compared to the general population

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Dissertations / Theses on the topic 'Réponse immunitaire – Recherche – Analyse'

Create a spot-on reference in APA, MLA, Chicago, Harvard, and other styles