Academic literature on the topic 'Recherche de ligands/substrats'

Le séminaire annuel de la Commission de Recherche Translationnelle de la SRLF a eu lieu à Paris le 2 décembre 2022. Ce séminaire est un moment privilégié d’échange entre cliniciens et scientifiques autour des axes de recherche propres à la réanimation. La huitième édition a porté sur les défis et les promesses inhérents à la recherche translationnelle autour de la dysfonction métabolique au cours des états critiques. Les chercheurs ont présenté et discuté leurs travaux ainsi les dernières données animales et humaines dans ce domaine. Des altérations de la consommation en oxygène, une augmentation des taux des principaux substrats énergétiques circulants, une altération de l’oxydation du glucose et des lipides, ainsi qu’une dysfonction mitochondriale sont toutes associées à des dysfonctions d’organes et à un mauvais pronostic. Les données physiopathologiques récentes devraient permettre d’identifier de nouvelles approches diagnostiques et d’identifier des sous-groupes de patients susceptibles de bénéficier d’approches thérapeutiques métaboliques personnalisées dans le futur. Les actes du séminaire ont été rédigés par les membres de la Commission de la Recherche Translationnelle de la SRLF et validés par les orateurs.

Les hampes florales des bananiers, riches en lignocelluloses, font parties des résidus végétaux largement impliqués dans la pollution environnementale à Kinshasa. C’est dans ce contexte que cette recherche a utilisé les champignons lignolytiques Pleurotus sajor-caju dans l’objectif de bio-délignifier des hampes florales des bananiers et de produire des carpophores comestibles de ce champignon. Dans la méthodologie employée, lesdites hampes florales ont été utilisées pour la préparation de quatre types de substrats dans lesquels elles ont représentée 52% (A1), 95,5% (A2), 79,4% (A3) et 45,9% (A4) de la masse sèche totale. Toutes ces préparations ont été inoculées par des mycéliums de Pleurotus sajor-caju, incubées à 28 °C jusqu’à la production des carpophores dudit champignon en vue de déterminer (1) le mélange le plus efficace du point de vue de la durée d’incubation, (2) le rendement en carpophores comestibles et (3) l’efficience biologique des substrats. Les résultats obtenus sont : les durées d’incubation des cultures jusqu’à la production des carpophores ont varié de 45 jours (A4) à 83 jours (A2) ; le rendement en carpophores comestibles et l’efficience biologique obtenus à partir des substrats A1, A3 et A4 ne sont pas significativement différents, tandis que A2 donne les plus faibles valeurs. Cette recherche confirme que les champignons lignolytiques comestibles, dont le Pleurotus sajor-caju fait partie, sont des agents efficaces pour valoriser les déchets d’origine végétale, à la base de la pollution environnementale, dans une perspective de production alimentaire et de lutte contre la malnutrition et l’insécurité alimentaire à Kinshasa.Mots clés: fongique, lignolytique, efficience biologique, valorisation, biodégradation.English Title: Use of the fungus Pleurotus sajor-caju for the delignification of a substrate based on banana flower stalks (Musa spp.) and the production of edible fungiThe floral stalks of the banana trees, rich in lignocelluloses, are parts of the agricultural residues extensively implied in the environmental pollution in Kinshasa. It is in this context that this research used the lignolytic fungus Pleurotus sajor-caju in the objective of bio-delignification of these residues of banana harvest and the production of edible mushroom. As methodology, the floral stalks of banana trees have been used for the preparation of four types of substrate in which they represented 52% (A1), 95.5% (A2), 79.4% (A3) and 45.9% (A4) of the total dry mass. All these four preparations have been inoculated by spawns of Pleurotus sajor-caju, incubated at 28 °C until the production of the carpophores of the aforesaid mushroom in order to determine the most efficient mixture concerning (1) the length of carpophore production, (2) the output in edible carpophores and (3) the biological efficiency of the substrates. The gotten results are: the lengths of incubation of the cultures until the production of the carpophores varied of 45 days (A4) to 83 days (A2); the output in edible carpophores and the biological efficiency gotten from the substrates A1, A3 and A4 are not meaningfully different, while A2 gives the weakest values. This research confirms that the lignolytic edible fungi, whose Pleurotus sajor-caju belongs to, are efficient agents to valorize the vegetable wastes which cause the environmental pollution, in a perspective of food production and struggle against the malnutrition and the food insecurity in Kinshasa.Keywords: fungal, lignolytic, biological efficiency, valorization, biodegradation.

Résumé La Prisonnière, comme on sait, marque le début du retour sur soi de la Recherche. Les thèmes et les motifs principaux de Du Côté dé chez Swann s'y retrouvent mais y suivent une nouvelle ligne mélodique. C'est qu'en effet, parallèlement à la logique amoureuse qui a gouverné le récit jusqu'alors, commence à se faire sentir une logique d'une autre sorte, plus identitaire, faite d'intégrations et de rejets, d'identifications et d'exclusions, d'où émerge progressivement une notion nouvelle, l'artiste comme «citoyen d'une patrie» qu'il lui appartient de découvrir. Or, il me semble qu'Albertine est peut-être la première à faire les frais de cette nouvelle logique. C'est ce que nous fait comprendre entre autres le passage sur les « cris de Paris ». S'appuyant sur la très ancienne tradition iconographique et littéraire des vieux métiers, Proust là transforme à sa manière, en l'anoblissant. Grâce à la magie d'un matin de printemps interpolé dans l'hiver, les « cris de Paris » deviennent ces substrats grâce auquels des formes perdues (comme le plain-chant) ou nobles (comme l'opéra) retrouvent vie et jeunesse. Ce sera aussi l'occasion pour le texte de montrer combien, malgré son intelligence et sa bonne volonté, Albertine reste en dehors du sortilège, incapable de transcender l'immédiateté du réel et de la sensation. Son discours pastiche sur les glacés et les sorbets s'apparente ainsi à un « anti-Martinville » qui nous fait pressentir dans la « prisonnière » le sort que la suite de la Recherche réservera 'à la «fugitive ».

L'objectif de notre recherche était d'étudier les effets du Phénylalanine-arginine β-naphthylamide (PABN), seul ou en association avec des aminoglycosides et des macrolides sur des souches cliniques de P. aeruginosa isolées de patients atteints de Fibrose kystique (FK). Pour cela, nous avons comparé les concentrations minimales inhibitrices (CMI) et bactéricides (CMB) obtenues en milieu liquide (bouillon de Mueller-Hinton) du PABN, seul ou en association avec des antibiotiques. Même si PABN est un inhibiteur de la pompe à efflux hautement efficace in-vitro, son niveau élevé d'accumulation dans les organes, en particulier les reins, peut-être toxique (Watkins et collab., 2003, p. 4242). Étant donné que les aminoglycosides sont des substrats de pompes à efflux, l'inhibition de l'efflux devrait augmenter la puissance de ces médicaments contre P. aeruginosa. Nous avons constaté que PABN a augmenté l'activité des aminoglycosides et macrolides contre P. aeruginosa. Cependant, il n'a eu aucun effet sur la souche K2733, qui ne comportait aucune des quatre principales pompes retrouvées chez P. aeruginosa (MexABOprM, MexCD-OprJ, MexEF-OprN et MexXY-OprM). En outre, les bactéries traitées avec le PABN ont été plus sensibles à l'érythromycine, un antibiotique auquel P. aeruginosa est intrinsèquement résistante (Morita, Tomida et Kawamura, 2013).

Un des objectifs de cette recherche est d'examiner les différences entre les resultats obtenus par les tests de dosage des matières organiques biodégradables (MOB). L'autre objectif est de déterminer comment les résultats peuvent correspondre à la valeur vraie de la MOB. L'étude a été menée en employant un mode le mathématique qui tient compte des principes cinétiques et stoechiométriques. Le tableau 1 présente les exemples des équations de bilan de masse qui entrent dans le modèle. Celui-ci permet de suivre la croissance de la biomasse, la dégradation du substrat (MOB), le carbone organique dissous (COD), ainsi que la production et la dégradation des produits microbiens solubles (PMS). Les PMS, qui possèdent des poids moléculaires allant de moyens à élevés, sont produits durant le métabolisme normal des cellules (RITIMANN et al., 1987). Les PMS peuvent être divisés en deux groupes de produits associés: les PAU qui sont le résultat direct de l'utilisation du substrat et les PAB qui sont produits proportionnellement à la biomasse (PAB). Certaines hypothèses sont à la base des équations du bilan massique. La biomasse n'est constituée que d'hétérotrophes. La MOB est modélisée en tenant compte de substrats facilement et difficilement dégradables. Chaque substrat se distingue par sa valeur K inscrite au tableau 3. La densité de biomasse en début de test est de 1 mgA (2400 UFC/ml), sauf quand la densité est modifiée dans le modèle. Pour les besoins de la modélisation, les valeurs de MOB, de CODB et de biomasse ont eté converties en demande chimique en oxygène (DCO). Les facteurs de conversion utilisés sont: 1,42 mg de MOB exprimée en DCO/mg de MOB exprimee en solides volatils dissous, 4,16 x 10-7 mg DCO/cellule et 2,67 mg acétate exprimé en DCO/mg de C-acétate. Un ensemble de courbes typiques pour le modèle est présenté aux figures 1 et 2. La figure 1 montre les résultats obtenus pour un substrat facilement dégradable tandis que la figure 2 présente ceux obtenus pour un substrat difficilement dégradable. Dans les deux cas, la biomasse s'accroît graduellement pour atteindre un maximum, puis rediminue. Les vitesses et intensités de réaction dépendent toutefois beaucoup des cinétiques de dégradation de la MOB. Les deux figures traduisent l'accumulation continue des PMS, qui représentent des proportions respectives de 43% et 30% de la MOB d'origine pour les substrats facilement et difficilement dégradables. L'accumulation des PMS est importante, car la courbe de décroissance du COD est le résultat net de la MOB consommée moins les PMS accumulés. Ceci implique que le changement dans le niveau de COD, qui représente le paramètre de contrôle pour les tests CODB, n'égale pas la MOB vraie. Le CODB mesuré ne représenterait plutôt que 50 à 60 % de la MOB d'origine. La figure 3 montre la relation qui existe entre le CODB et la MOB pour les deux types de substrats. Le CODB n'est pas égal à la MOB, ce qui est démontré par l'écart observé par rapport à la droite d'équivalence de pente 1. Cette différence est due à deux phénomènes: I'accumulation des PMS dépend de la MOB, tandis que l'écart entre les deux types de substrat est le résultat des courbes s'approchant de Smin sur l'axe de la MOB, lorsque le CODB tend vers zéro. Ce résultat est significatif, car des études ont démontré que la MOB dans les eaux brutes contient surtout des substrats difficilement dégradables (LECHEVALLIER et al., 1991). Ainsi, faire l'hypothèse que le CODB soit égal à la MOB pour les substrats difficilement assimilables se traduirait par une importante sous-estimation de la MOB dans l'échantillon. La figure 4 montre la relation observée entre la biomasse maximum, employée avec les tests COA (carbone organique assimilable), et la vraie MOB pour les deux substrats. Cette figure présente aussi l'étalon de calibration proposé par van ter Kooij et al (1982), qui convertit le nombre de cellules en C-acétate (4,1 x 10 6 cellules par mg C-acétate). Ni le substrat facilement utilisable ni le substrat difficilement utilisable, ne s'approche de la courbe de calibration. Ces écarts sont causés par la variation du premier ordre en ordre zéro de l'équation de Monod et aussi parce que les courbes approchent le Smin où la croissance des cellules est presque nulle. Lorsque la MOB dans l'échantillon est principalement constituée d'un substrat difficilement dégradable, I'usage d'un étalon d'acétate produit une forte sous-estimation de la MOB vraie. La figure 5 montre la relation directe entre le CODB et le COA pour les deux types de substrats. L'augmentation du rapport CODB/COA avec la diminution de la MOB s'explique par le fait que la biomasse tend vers une croissance zéro lorsque la MOB s'approche de Smin. Cette figure démontre clairement qu'il existe une différence fondamentale entre les mesures des tests CODB et COA, lorsque la MOB tend vers Smin. Toutefois, le rapport CODB/COA est presque unitaire dans le cas du substrat facilement dégradable, quand la MOB se situe à l'intérieur des limites de détection pour le dosage du CODB (environ 100 mg/l à la figure 5). Ainsi, il est possible d'obtenir le même résultat avec les deux types de tests. Le modèle permet aussi d'examiner l'effet des concentrations en biomasse initiale pour une [MOB] fixée. Pour un substrat facilement dégradable, qui est entièrement consommé en présence d'un faible inoculum, la modélisation montre que le CODB et la biomasse maximum ne sont pas affectés. Cependant, le résultat diffère pour un substrat difficilement dégradable qui n'est pas entièrement consommé avec un inoculum de faible densité. Tel que présenté à la figure 6, le CODB et la biomasse maximum augmentent fortement avec la densité de l'inoculum. Cet effet est dû à la faible croissance de la biomasse qui survient en présence d'un inoculum de faible densité; la biomasse maximum et le COD minimum sont atteints après 30 jours. Avec un inoculum important, la biodégradation survient plus rapidement et le CODB maximum est atteint avant 30 jours.

Résumé En Algérie, l’eau et le sol, ressources vitales et de production, connaissent actuellement une dégradation en ce qui a trait à la quantité et la qualité. Ce processus ne cesse de s’amplifier et se traduit par la diminution et l’épuisement de ces ressources et l’aggravation des problèmes environnementaux. Sur les versants du nord-ouest algérien, les processus érosifs posent de sérieux problèmes : dégradation des sols, envasement des barrages, inondations et destruction des infrastructures. Face à ces enjeux, il s’est manifesté un besoin de recherche sur les facteurs conditionnels. Notre objectif visait la compréhension de la dynamique de l’érosion et l’analyse de l’influence de l’occupation du sol et de l’activité humaine sur la variation du ruissellement et de l’érosion. L’approche est basée sur le suivi de critères morphologiques et analytiques et sur l’étude du comportement hydrodynamique des sols sur des transects représentatifs de substrats marneux et gréseux le long desquels plusieurs occupations se succèdent. Les résultats montrent que les variations des caractéristiques du sol sont dues à la dynamique érosive. Ce sont surtout l’occupation du sol, les caractéristiques du couvert du sol, l’activité humaine et les aménagements qui conditionnent cette dynamique. Le coefficient de ruissellement maximal (Kr max) pendant la période de mesures (1993-2004) a dépassé 30 % sur le sol nu et a atteint 60 % durant les averses exceptionnelles (fréquence supérieure à 0,1) sur les sols fermés et tassés. L’érosion annuelle (érosion en nappe et en rigole) est de 1,5 à 6,8 t•ha‑1•an‑1 sur sol nu, mais l’érosion globale (érosion en nappe et linéaire (ravinement)) varie quant à elle dans des proportions encore plus grandes et peut atteindre des taux records (54 t•ha‑1•an‑1). Les indicateurs pertinents de l'érosion sont ceux qui sont relatifs aux sols et aux états de surface : les caractéristiques du sol, les surfaces fermées et ouvertes, la rugosité et la couverture du sol de même que les indicateurs relatifs à l’événement pluvieux (intensité, hauteur et fréquence). L’effet de la pente n’est pas négligeable et peut être atténué par une utilisation adéquate des versants.

En Italie, il existe un mécanisme très rigide d’accès à la profession journalistique, ce qui laisserait supposer que la gestion du système de l’information est solide et efficace. Cependant, en pratique, l’activité de ce gouvernement s’est révélée beaucoup moins incisive par rapport aux instruments qui sont mis à sa disposition, et ceci est confirmé par la grave période de crise, non seulement économique, que le système d’information italien traverse depuis des années. Cet submission se propose de réfléchir sur les structures, les faiblesses et les anomalies du système de gouvernement du journalisme italien. Après avoir présenté l’évolution et le rôle actuel de l’organe qui le gouverne, l’Ordine dei giornalisti, cet submission rappelle les résultats de trois différentes recherches, respectivement sur le sujet de la crédibilité du journalisme en Italie, sur les problématiques liées au journalisme politique, et enfin sur le rapport entre journalisme, communication institutionnelle et communication politique. L’objectif de notre réflexion est de comprendre si l’activité de l’Ordine dei Giornalisti s’est révélée régulière et incisive vis-à-vis de ces trois sujets (qui représentent trois « pathologies » du journalisme italien). Les résultats de ces recherches font émerger de nombreuses zones d’ombre, qui montrent que l’Ordine dei Giornalisti ne peut pas être considéré comme capable de faire face aux enjeux que l’évolution du journalisme pose à un système qui, de plus, se trouve dans le grave état de crise économique et de crédibilité. Le problème principal semble être de nature culturelle, et se trouve en amont des autres problématiques qui en découlent : la lacune la plus importante de l’Ordine se trouve dans son évidente incapacité à construire le substrat éthique et de valeurs sur lequel la profession devrait se fonder. Access to the journalistic profession in Italy is controlled by a very rigid mechanism, which would suggest that news industry management is sound and effective. In practice, however, its governing body has proved far less incisive than the instruments available to it would suggest, and this is confirmed by the severe crisis (not only economic) the Italian news industry has faced for years. This submission aims to study the structures, weaknesses and anomalies of the system of governance of Italian journalism. After presenting the evolution and current role of its governing body, the Ordine dei giornalisti, this submission will summarize the results of three studies: respectively on the issue of the credibility of journalism in Italy; on issues relating to political journalism; and finally on the relationship between journalism, institutional communication and political communication. The aim of the study is to gauge whether the activity of the Ordine dei giornalisti has been effective and incisive vis-à-vis these three issues (representing three “pathologies” of Italian journalism). These studies shed light on many grey areas and reveal that the Ordine dei giornalisti cannot be considered capable of meeting the challenges that the evolution of journalism poses to a system that already finds itself in a state of profound crisis, both economic and in terms of credibility. The main problem appears to be cultural and lies upstream of the other issues; the most important shortcoming of the Ordine being its obvious inability to build an ethical substratum of values on which to base the profession. Na Itália, existe um mecanismo bastante rígido de acesso à profissão jornalística, o que daria a impressão de que a gestão do meio jornalístico é sólida e eficaz. Contudo, na prática, a atividade desse tipo de governança se revela bem menos incisiva no uso dos instrumentos disponíveis, o que é confirmado pelo grave período de crise – não apenas econômica – que afeta meio jornalístico há alguns anos. Este artigo se propõe a refletir sobre essas estruturas, sobre as fraquezas e anomalias do sistema de governança do jornalismo italiano. Após ter apresentado a evolução e o papel do órgão responsável por essa gestão, a Ordine dei Giornalisti (“Ordem do Jornalista”), este artigo retoma os resultados de três pesquisas diferentes, que tratam, respectivamente, da credibilidade do jornalismo na Itália, das questões ligadas ao jornalismo político e, por fim, da relação entre jornalismo, comunicação institucional e comunicação política. O objetivo da nossa reflexão é compreender se a atividade da Ordine dei Giornalisti se revela efetivamente regular e incisiva face a esses três assuntos (que representam três “patologias” do jornalismo italiano). Os resultados dessas pesquisas revelam numerosas zonas de sombra e que mostram que a Ordine dei Giornalisti não pode ser considerada capaz de enfrentar as questões ligadas à evolução do jornalismo, instituídas por um sistema que, além do mais, se encontra em um grave momento de crise econômico e de credibilidade. O principal problema parece ser de natureza cultural e se encontra vinculado a outras questões que também emergem: a principal lacuna da Ordine se faz presente na sua clara incapacidade de construir o substrato ético e dos valores sob os quais a profissão deveria se constituir.

BackgroundMetastatic colorectal cancer (CRC) is common and lethal and generally not responsive to current immunotherapies. We hypothesize that efficacious T cell-based immunotherapy can be developed for this malignancy, provided that immune checkpoints relevant to liver metastasis, the first site of disease progression, are targeted. Here, we characterized CRC liver metastases by RNAseq, FACS and in vitro functional assays to identify candidate immune checkpoints.MethodsWe performed deep RNAseq clustering and differential gene expression analysis on bulk RNA extracted from 52 mismatch repair gene proficient CRC liver metastases. By multiparameter FACS, we analyzed the expression of candidate immune checkpoints in cell suspensions derived from 18 liver metastases, matched non-tumoral livers, and pre-operative PBMCs. We evaluated IFN-γ (ELISA) secretion and tumor lysis (Incucyte) of tumor-infiltrating T lymphocytes (TILs) expanded from liver metastases stimulated by autologous cancer cells with or without monoclonal antibodies blocking candidate immune checkpoints.ResultsOut of 52 metastases, 21 (40.3%) clustered as immune reactive (IR) defined by concurrent high expression of transcripts related to antigen processing, immune cell lineage, immune checkpoints, interferon-gamma response, cytokines, and chemokines, whereas 25 (48.1%) were classified as non-IR. Of all inhibitory ligands assessed, PVR and PVRL2 had the highest expression, both in IR and non-IR metastases, and higher than PD-L1 and PD-L2 expression. The expression of corresponding receptors TIGIT and CD226 was significantly higher in IR compared to non-IR metastases, at absolute levels higher than PD-1. By FACS analysis, PVR and PVRL2 expression by tumor-infiltrating myeloid and tumor cells was higher than PD-L1 and PD-L2 expression. High PVR expression was also found in hepatocytes, liver macrophages and circulating monocytes in the same patients. In TILs, TIGIT was significantly overexpressed in activated CD4+CD25+ (74.8 ±3.0%) and CD8+CD25+ (68.7 ± 8.4%) compared to resting CD25neg T cells, an expression pattern that was not seen for PD-1 or in T cells infiltrating the liver or circulating in the blood. The majority of cancer cell lines derived from liver metastases expressed PVR, but low levels of PD-L1. TIL clones expanded from liver metastases expressed TIGIT at various levels inducible by TCR stimulation. Upon co-culture with autologous cancer cell lines, TIL clones were more lytic and secreted more IFN-γ in presence of anti-TIGIT blocking antibody.ConclusionsBy expression and functional data, the TIGIT/PVR immune suppressive axis appears as a biologically promising target for the development of immunotherapy in patients with CRC metastatic to the liver.AcknowledgementsThis work is supported by Bristol Myers Squibb and by the Quebec Cancer Consortium. A.B. holds a postdoctoral scholarship award from the Institut du cancer de Montréal. S.T. holds a Junior 2 clinical-scientist salary award from the Fond de recherche Santé-Québec. The University of Montreal Roger des Groseillers Research Chair in hepatopancreatobiliary surgical oncology supports the biobanking and clinicopathological database associated with this project.Ethics ApprovalInstitutional review board approvals were obtain to conduct this project (16.262) and all patients provided informed consent to contribute to this project with biospecimens and clinicopathological data (09.237).

Guidée par une recherche continue de performance de production, de qualité de fabrication et de réduction des coûts, l’industrie utilise de manière croissante de nouveaux revêtements techniques, hybrides, multifonctionnels, assurant des fonctions critiques (anticorrosion, protection contre les impacts de foudre, blindage, furtivité…). Ces revêtements sont souvent conçus pour optimiser des propriétés thermiques, électromagnétiques, électriques, mais aussi acoustiques ou mécaniques. Leur complexité peut être plus ou moins importante avec la possibilité d’ajouter des fonctions supplémentaires selon leur cadre d’utilisation, comme par exemple l’utilisation en conditions extrêmes. L’aptitude des technologies THz pour la mesure d’épaisseur de revêtements a déjà été démontrée dans de nombreuses publications et en environnement industriel. Les gammes de mesure, la précision ainsi que la cadence d’acquisition et de traitement sont compatibles avec une grande partie des applications industrielles. Le capteur développé par Terakalis est rapide, sans contact et adapté au travail sur des pièces avec des surfaces complexes et de grandes dimensions. Il permet de déterminer l'épaisseur de chaque couche d’un revêtement multicouche et offre des avantages significatifs par rapport aux techniques existantes. Il est par exemple possible de : • Mesurer des épaisseurs multicouches très fines (à partir de 10μm), sur tous types de substrats (métalliques, composites, céramiques…), de manière rapide pour des cartographies, • Détecter des départs de corrosion sur substrat métallique sous le revêtement, • Détecter des défauts de cohésions entre le revêtement et le substrat (délaminations), • Mesurer les épaisseurs de revêtements même humides (gain de temps, détection plus rapide d’éventuels défauts). Cette technologie représente une rupture majeure pour le contrôle de la qualité et des processus dans l'application de peinture et offre des avantages économiques et environnementaux. Lors de cette communication, TERAKALIS, société spécialisée en fabrication d’équipements THz, présentera le principe des ondes TeraHertz, les principales méthodes de mesure, un état de la maturité des systèmes THz actuels avec leurs performances et limites pour la mesure de faibles épaisseurs et la détection de défauts dans les revêtements fins (<1mm) et aux interfaces. Elle s’appuiera sur des cas applicatifs en guise d’illustration.

Les champignons décomposeurs du bois jouent un rôle important dans le cycle du carbone en participant notamment au recyclage de la matière organique. Outre leur aptitude à minéraliser la biomasse lignocellulosique, ces organismes ont la capacité de dégrader des molécules potentiellement toxiques libérées lors de ce processus. Leur système de détoxication comprend différentes familles multigéniques dont les glutathion transférases. Ces enzymes ubiquitaires, sont regroupées en différentes classes dans le règne fongique, certaines d’entre elles étant étendues chez ces champignons. Dans ce contexte, l’objectif principal de cette thèse consistait à appréhender les fonctions des glutathion transférases de la classe Omega (GSTOs) étendue chez Trametes versicolor, un champignon de pourriture blanche. Une approche biochimique et structurale a été menée sur neuf protéines produites de façon recombinante. Dans un premier temps, une caractérisation enzymatique de ces isoformes a été réalisée à l’aide de substrats synthétiques montrant une similarité des propriétés catalytiques. Puis, à partir d’une banque de molécules pures et de mélanges complexes issus de différentes essences forestières, une méthode de screening à haut débit a permis d’identifier des ligands potentiels de ces enzymes. La résolution de la structure tridimensionnelle de trois isoformes a démontré l’état homodimérique de ces protéines et l’implication de deux sites de fixation dans la reconnaissance de ces ligands : le site H (présent dans chaque monomère) et le site L (à l’interface du dimère). Par exemple, l’isoforme TvGSTO3S est capable de fixer dans son site H plusieurs hydroxybenzophénones, mais également un flavonoïde, la dihydrowogonine. Dans ce dernier cas, cette interaction avec un ligand naturel issu d’extraits de bois de merisier a été démontré par une approche de cristallographie d’affinité. D’autre part, des expériences de co-cristallisation ont permis de détecter deux molécules d’un autre flavonoïde, la naringénine, dans le site L de l’isoforme TvGSTO6S. Enfin, une interaction spécifique impliquant les sites H et L de l’isoforme TvGSTO2S a été démontrée avec l’oxyresvératrol. L’analyse structurale a révélé que les deux configurations du stilbène étaient liées à la protéine : la configuration trans dans le site H et la configuration cis dans le site L. Ainsi, malgré une redondance fonctionnelle partielle, ces recherches ont démontré l’existence d’un spectre d’interactions spécifiques pour chaque isoforme testée. Le caractère étendu de la classe Omega indiquerait que ces enzymes seraient impliquées dans l’adaptation du champignon à son environnement. En effet, les ligands identifiés au cours de ces travaux suggèrent que les propriétés « ligandines » des TvGSTOs joueraient un rôle dans la détoxication des produits issus de dégradation du bois
Wood decaying fungi play an important role in the carbon cycle by participating in the recycling of organic matter. In addition to their ability to mineralize lignocellulosic biomass, these organisms have the ability to degrade potentially toxic molecules released during this process. Their detoxification system involves several multigenic families including glutathione transferases. These ubiquitous enzymes are grouped into several classes in the fungal kingdom, some of them are widespread in these fungi. In this context, the main objective of this thesis was to understand the functions of glutathione transferases of the Omega class (GSTOs) extended in Trametes versicolor, a white rot fungus. A biochemical and structural approach was led using nine recombinant proteins. Firstly, enzymatic characterization of these isoforms was performed using synthetic substrates, the obtained results demonstrating a similarity of catalytic properties. Then, using a library of pure molecules and another one of complex mixtures from different forest species, a high throughput screening method was applied to identify potential ligands for these enzymes. The resolution of the three-dimensional structure of three isoforms demonstrated the homodimeric state of these proteins and the involvement of two binding sites in the recognition of these ligands: the H site (present in each monomer) and the L site (at the dimer interface). For example, the isoform TvGSTO3S is able to bind several hydroxybenzophenones in its H site, but also a flavonoid, dihydrowogonin. In this case, this interaction with a natural ligand derived from wild-cherry tree extract was demonstrated by an affinity crystallography approach. On the other hand, co-crystallization experiments detected two molecules of another flavonoid, naringenin, in the L site of the isoform TvGSTO6S. Finally, a specific interaction involving the H and L sites of the isoform TvGSTO2S was demonstrated with oxyresveratrol. Structural analysis revealed that the presence of both configurations of the stilbene in the protein: the trans configuration in the H site and the cis configuration in the L site. Thus, despite partial functional redundancy, this research demonstrated the existence of a specific pattern of interactions for each tested isoform. The expansion of the Omega class could indicate that these enzymes are involved in the adaptation of the fungus in its environment. Indeed, the ligands identified during this work suggest that the "ligandin" properties of TvGSTOs play a role in detoxifying wood degradation products

Les champignons décomposeurs du bois jouent un rôle important dans le cycle du carbone en participant notamment au recyclage de la matière organique. Outre leur aptitude à minéraliser la biomasse lignocellulosique, ces organismes ont la capacité de dégrader des molécules potentiellement toxiques libérées lors de ce processus. Leur système de détoxication comprend différentes familles multigéniques dont les glutathion transférases. Ces enzymes ubiquitaires, sont regroupées en différentes classes dans le règne fongique, certaines d’entre elles étant étendues chez ces champignons. Dans ce contexte, l’objectif principal de cette thèse consistait à appréhender les fonctions des glutathion transférases de la classe Omega (GSTOs) étendue chez Trametes versicolor, un champignon de pourriture blanche. Une approche biochimique et structurale a été menée sur neuf protéines produites de façon recombinante. Dans un premier temps, une caractérisation enzymatique de ces isoformes a été réalisée à l’aide de substrats synthétiques montrant une similarité des propriétés catalytiques. Puis, à partir d’une banque de molécules pures et de mélanges complexes issus de différentes essences forestières, une méthode de screening à haut débit a permis d’identifier des ligands potentiels de ces enzymes. La résolution de la structure tridimensionnelle de trois isoformes a démontré l’état homodimérique de ces protéines et l’implication de deux sites de fixation dans la reconnaissance de ces ligands : le site H (présent dans chaque monomère) et le site L (à l’interface du dimère). Par exemple, l’isoforme TvGSTO3S est capable de fixer dans son site H plusieurs hydroxybenzophénones, mais également un flavonoïde, la dihydrowogonine. Dans ce dernier cas, cette interaction avec un ligand naturel issu d’extraits de bois de merisier a été démontré par une approche de cristallographie d’affinité. D’autre part, des expériences de co-cristallisation ont permis de détecter deux molécules d’un autre flavonoïde, la naringénine, dans le site L de l’isoforme TvGSTO6S. Enfin, une interaction spécifique impliquant les sites H et L de l’isoforme TvGSTO2S a été démontrée avec l’oxyresvératrol. L’analyse structurale a révélé que les deux configurations du stilbène étaient liées à la protéine : la configuration trans dans le site H et la configuration cis dans le site L. Ainsi, malgré une redondance fonctionnelle partielle, ces recherches ont démontré l’existence d’un spectre d’interactions spécifiques pour chaque isoforme testée. Le caractère étendu de la classe Omega indiquerait que ces enzymes seraient impliquées dans l’adaptation du champignon à son environnement. En effet, les ligands identifiés au cours de ces travaux suggèrent que les propriétés « ligandines » des TvGSTOs joueraient un rôle dans la détoxication des produits issus de dégradation du bois
Wood decaying fungi play an important role in the carbon cycle by participating in the recycling of organic matter. In addition to their ability to mineralize lignocellulosic biomass, these organisms have the ability to degrade potentially toxic molecules released during this process. Their detoxification system involves several multigenic families including glutathione transferases. These ubiquitous enzymes are grouped into several classes in the fungal kingdom, some of them are widespread in these fungi. In this context, the main objective of this thesis was to understand the functions of glutathione transferases of the Omega class (GSTOs) extended in Trametes versicolor, a white rot fungus. A biochemical and structural approach was led using nine recombinant proteins. Firstly, enzymatic characterization of these isoforms was performed using synthetic substrates, the obtained results demonstrating a similarity of catalytic properties. Then, using a library of pure molecules and another one of complex mixtures from different forest species, a high throughput screening method was applied to identify potential ligands for these enzymes. The resolution of the three-dimensional structure of three isoforms demonstrated the homodimeric state of these proteins and the involvement of two binding sites in the recognition of these ligands: the H site (present in each monomer) and the L site (at the dimer interface). For example, the isoform TvGSTO3S is able to bind several hydroxybenzophenones in its H site, but also a flavonoid, dihydrowogonin. In this case, this interaction with a natural ligand derived from wild-cherry tree extract was demonstrated by an affinity crystallography approach. On the other hand, co-crystallization experiments detected two molecules of another flavonoid, naringenin, in the L site of the isoform TvGSTO6S. Finally, a specific interaction involving the H and L sites of the isoform TvGSTO2S was demonstrated with oxyresveratrol. Structural analysis revealed that the presence of both configurations of the stilbene in the protein: the trans configuration in the H site and the cis configuration in the L site. Thus, despite partial functional redundancy, this research demonstrated the existence of a specific pattern of interactions for each tested isoform. The expansion of the Omega class could indicate that these enzymes are involved in the adaptation of the fungus in its environment. Indeed, the ligands identified during this work suggest that the "ligandin" properties of TvGSTOs play a role in detoxifying wood degradation products

Les glutathion transférases (GSTs) constituent une famille multigénique d’enzymes ubiquitaires impliquées notamment dans la détoxication des xénobiotiques et le métabolisme secondaire. Les GSTs canoniques sont constituées d’un domaine N-terminal de type thiorédoxine et d’un domaine C-terminal formé d’hélices α. Chez les plantes terrestres, les GSTs peuvent être regroupées en 14 classes et selon le résidu conservé au sein de leur motif catalytique en GSTs à cystéine (Cys-GSTs) ou à sérine (Ser-GSTs). Les Ser-GSTs présentent des activités de réduction des peroxydes et/ou de conjugaison de glutathion (GSH) alors que les Cys-GSTs portent des activités de déglutathionylation et déshydroascorbate réductase. Certaines d’entre elles présentent également des propriétés non-catalytiques de type ligandine à des fins de transport ou de stockage de molécules diverses. Les GSTs Tau (GSTUs) correspondent à la classe regroupant le plus d’isoformes chez les plantes et leur sont spécifiques. Les GSTUs sont souvent surexprimées lors de stress biotiques et abiotiques et participent notamment à la détoxication des herbicides. Toutefois, le rôle physiologique des GSTUs reste encore lacunaire in planta. En combinant des approches phylogénétiques, biochimiques et structurales, ces travaux ont conduit à la caractérisation de neuf GSTUs d’Arabidopsis thaliana (AtGSTUs) et de six GSTUs de Populus trichocarpa (PtGSTUs). L’analyse phylogénétique des Ser-GSTs d’organismes photosynthétiques a révélé que l’expansion des GSTUs est apparue de façon concomitante à l’apparition du réseau vasculaire chez les plantes bien que quelques mousses et bryophytes possèdent des GSTUs. Au sein d’un organisme, les GSTUs peuvent être classées en groupes distincts en fonction de leur motif catalytique. Les essais enzymatiques réalisés ont montré que quasiment toutes les GSTUs d’intérêt portent des activités de conjugaison du GSH et de réduction des peroxydes envers différents substrats modèles (CDNB, dérivés d’isothiocyanates, hydroperoxydes). Les structures tridimensionnelles de deux GSTUs ont été résolues et ces dernières présentent le repliement classique des GSTs canoniques avec des différences notables entre elles. Les analyses biochimiques et structurales réalisées sur les protéines AtGSTUs et PtGSTUs d’intérêt ont montré que certaines d’entre elles lient des porphyrines bactériennes et d’autres des composés polyphénoliques. Parmi les complexes enzyme-ligand identifiés, la structure d’un complexe baicaléine-GSTU a été résolue. L’utilisation d’échantillons enrichis en métabolites extraits de plantes représente la prochaine étape sur le chemin de l’analyse fonctionnelle des GSTUs
Glutathione transferases (GSTs) constitute a ubiquitous multigene superfamily of enzymes involved in xenobiotic detoxification and secondary metabolism. Canonical GSTs consist of an N-terminal thioredoxin domain and a α-helical C-terminal domain. In terrestrial plants, GSTs can be grouped in 14 classes but also according to the conserved residue found in their catalytic site either cysteine (Cys-GSTs) or serine (Ser-GSTs) GSTs. Ser-GSTs exhibit reduction of peroxides and/or glutathione (GSH) conjugation activities while Cys-GSTs rather exhibit deglutathionylation and dehydroascorbate reductase activities. Some of them also appear to have non-catalytic ligandin properties for the transport or storage of various molecules. The plant-specific Tau GST (GSTU) class is usually the most expanded one. The GSTUs are often over-expressed during biotic and abiotic stresses contributing notably to herbicide detoxification. However, the physiological role of most GSTUs is still poorly documented in planta. By combining phylogenetic, biochemical and structural approaches, this work led to the characterisation of nine GSTUs from Arabidopsis thaliana (AtGSTUs) and six GSTUs from Populus trichocarpa (PtGSTUs). Phylogenetic analysis of the Ser-GSTs present in photosynthetic organisms revealed that the expansion of GSTUs occurred concomitantly with the appearance of vasculature in plants, although some mosses and bryophytes possess GSTUs. Within an organism, GSTUs can be classified into distinct groups according to their catalytic motif. Enzymatic tests using recombinant proteins showed that almost all studied GSTUs exhibit GSH conjugation and peroxide reduction activities against different model substrates (CDNB, isothiocyanate derivatives, hydroperoxides). The three-dimensional structures of two GSTUs have been resolved and these adopt the classical canonical GST fold with some notable difference between them. The biochemical and structural analyses of these AtGSTUs and PtGSTUs further showed that some of them bind bacterial porphyrins while others bind polyphenolic compounds. Among the enzyme-ligand complexes identified, the structure of a bacalein-GSTU has been solved. The use of metabolites enriched samples extracted from A. thaliana and P. trichocarpa is the next step to decipher the role of GSTUs in planta

Les protéines kinases sont responsables de la phosphorylation des protéines, une modification post-traductionnelle qui contrôle ainsi de manière très efficace et presque instantanée une multitude de processus cellulaires. Elles sont impliquées dans la régulation des voies métaboliques dans les organismes permettant leurs adaptations aux changements environnementaux. Chez les procaryotes, l'existence de sérine/thréonine et tyrosine kinases est resté pendant longtemps un sujet de controverse. Cependant, au cours des deux dernières décennies, de nombreuses études ont montré que ces types de phosphorylation (Ser/Thr/Tyr) existent chez les bactéries et sont impliqués dans la régulation d'une grande variété de processus biologiques. En plus de protéines kinases apparentés à des enzymes eucaryotes, les bactéries ont également des protéines kinases spécifiques n’ayant aucune ressemblance structurale avec des protéines eucaryotes ce qui, lorsqu’elles sont essentielles, les qualifient en tant que cible pour de nouveaux agents antimicrobiens. YdiB est une nouvelle protéine kinase bactérienne de Bacillus subtilis. La localisation d’YdiB a été étudiée par immunofluorescence révélant sa présence à proximité de la membrane plasmique. L'interaction d’YdiB avec les phospholipides a été étudiée par des essais de flottation et résonance plasmonique de surface. Ceci révèle la présence d'une interaction stable et forte entre la kinase et deux phospholipides: la phosphatidylsérine et la phosphatidyléthanolamine. En outre, la constante d'affinité (KD) entre YdiB et la phosphatidylsérine a été identifiée et est de l’ordre de 13.3x10-9 M. De plus, ces deux phospholipides, ainsi que leur têtes polaires, sont capables d'induire de manière significative l'autophosphorylation d’YdiB.Par ailleurs, le rôle d’YdiB dans la croissance bactérienne en particulier lors d’un stress oxydant a également été étudié dans la souche sauvage et dans le mutant ∆ydiB. Dans des conditions de stress oxydant, la souche ∆ydiB est incapable de survivre alors qu’une complémentation conditionnelle de ce mutant a permis de restaurer un profil de croissance normale de la bactérie. Cela révèle le rôle important joué par YdiB dans la résistance bactérienne au stress oxydant. En outre, des protéines impliquées dans la résistance au stress oxydant comme la superoxide dismutase F (SodF) et superoxide dismutase A (SodA) ont été testés comme substrats potentiels pour YdiB. Par des tests de trans-phosphorylation, nous avons pu montrer que SodA pourrait être un substrat potentiel pour YdiB expliquant ainsi son implication dans la résistance au stress oxydatif dans Bacillus subtilis
Protein kinases are responsible of protein phosphorylation, a post-translational modification and a very effective and almost instantaneous control of a multitude of cellular processes. They are involved in the regulation of metabolic pathways in living organisms enabling their adaptation to environmental changes. In prokaryotes, the existence of serine/threonine and tyrosine kinases was, for a long time, a subject of controversy. However, over the past two decades, many studies have shown that these types of phosphorylation (Ser/Thr/Tyr) do exist in bacteria and are involved in the regulation of a wide variety of biological processes. In addition to protein kinases related to eukaryotic enzymes, bacteria also have some specific protein kinases having no structural resemblance to their eukaryotic homologues which, if essential, made them a possible target for new antimicrobial agents. YdiB is a novel bacterial protein kinase from Bacillus subtilis. In situ localisation of YdiB has been studied by immunofluorescence which reveals its presence near the plasma membrane. The interaction of YdiB with the membrane phospholipids was assessed by flotation assay and surface plasmon resonance demonstrating the presence of a stable and strong interaction between the kinase and two phospholipids: phosphatidylserine and phosphatidylethanolamine. In addition, the affinity constant (KD) between YdiB and phosphatidylserine was found to be equal to 13.3 x 10-9 M. Moreover, these two phospholipids or just their charged headgroups were able to significantly induce the autophosphorylation of YdiB.On the other hand, the role of YdiB in the bacterial growth especially under oxidative stress was also studied in the wild-type strain and in ∆ydiB mutant. Under oxidative stress conditions, the deleted strain was unable to survive whereas a conditional complementation of ∆ydiB mutant was able to restore a normal growth profile for the bacterium. This reveals the important role played by YdiB in the bacterial resistance to oxidative stress. In addition, protein involved in the resistance to oxidative stress like Superoxide dismutase F (SodF) and superoxide dismutase A (Sod A) were tested as potential substrates for YdiB. Doing the trans-phosphorylation assay, we were able to prove that Sod B could be a potential substrate for YdiB thus explaining its involvement in the resistance to oxidative stress in Bacillus subtilis

La première partie de ce manuscrit décrit l’utilisation de sulfoxydes en catalyse au palladium. Nous avons ainsi mis au point l’alkylation allylique palladocatalysée de carbanions a-sulfinylés en conditions biphasiques. Par la suite, un essai de double alkylation nous a permis de postuler un mécanisme faisant intervenir l’attaque d’un ion sulfénate sur un complexe p-allylpalladium. Cette réactivité étant inédite, nous nous sommes intéressés plus en détail à cette réaction. Ainsi, les produits d’allylation ont été isolés avec de bons rendements à partir de b-sulfinylesters comme précurseurs de sulfénates. La réactivité d’ions sulfénates en arylation palladocatalysée a ensuite été étudiée avec de bons résultats. Une deuxième partie présente la synthèse de nouveaux ligands soufrés, en exploitant une méthodologie faisant intervenir un ion thiiranium. Les tests en alkylation allylique énantiosélective ont révélé une activité intéressante pour l’un de ces ligands, conduisant à un e. E. De 79%.

Le système tubuline/microtubules joue un rôle essentiel au cours de la mitose et il est possible de bloquer la division cellulaire en perturbant son équilibre dynamique. Il existe deux classes d’agents antitubuline : l’une regroupe les agents se liant aux microtubules empêchant leur dépolymérisation ; l’autre. Cible le dimère de la tubuline et empêche la formation des microtubules. Ces composés possèdent une structure relativement complexe et restent difficiles à synthétiser. Nous avons utilisé la chimie combinatoire dynamique combinée à la formation réversible d’imines dans l’eau, afin d’identifier de nouveaux ligands du système tubuline/microtubules. La chimie combinatoire dynamique est basée sur l’assemblage réversible de briques élémentaires pour former des bibliothèques en équilibre thermodynamique. L’ajout d’une cible biologique entraîne le déplacement de l’équilibre vers la formation des composés les plus affins pour la cible. L’analyse des échantillons par une méthode adéquate permet d’identifier les amplifications. Nous avons montré que la chimie combinatoire dynamique pouvait être utilisée avec le système tubuline/microtubules, et qu’il était possible de cibler soit la tubuline sous forme dimérique soit les microtubules en adaptant les conditions. Parmi nos bibliothèques, plusieurs composés ont été amplifiés. Des analogues d’imines amplifiées ont été synthétisés et testés sur la tubuline. Nous avons ainsi pu identifier une nouvelle classe d’agents de type Taxol et mettre en évidence une corrélation entre l’orientation spatiale de deux résidus aromatiques et le type d’activité sur la tubuline
The system tubulin/microtubules plays a key-role during mitosis and disturbing its dynamic equilibrium can prevent cell division and induce apoptosis. Antitubulin agents are divided into two classes: those that bind to microtubules, stabilizing them and preventing their depolymerization, and those that bind to tubulin dimer, preventing the formation of microtubules. Most of the known antitubulin agents are characterized by a very complex structure, and therefore are relatively hard to synthesize. We planned to use dynamic combinatorial chemistry combined with the reversible formation of imines in water to identify new potential antitubulin agents. This approach is based on the reversible connection between different building blocks to form a chemical library under thermodynamic equilibrium. In the presence of a target, the distribution of the library may be altered, with an amplification for the best binders, which can be detected by an adequate analytical method after fixation of the library’s distribution. We have demonstrated that dynamic combinatorial chemistry is applicable to the dynamic macromolecular system tubulin/microtubules. Using adequate conditions, we have shown that it is possible to target either the tubulin dimer or microtubules. Then we have designed and synthesized two types of scaffolds in order to use them in dynamic libraries. Among the numerous dynamic libraries we prepared some amplifications were identified. Analogues of amplified imines were synthesized and tested on tubulin. Therefore we were able to identify a new class of microtubules ligands and to show that the orientation of two aromatic moieties plays a key role for the type of activity

Les lymphocytes T jouent un rôle central dans la réponse immunitaire adaptative. par l'intermédiaire d'un récepteur distinctif - le RCT (Récepteur des Cellules T), qui est responsable de la reconnaissance spécifique de peptides étrangers dans le corps. Les interactions moléculaires entre le RCT et son ligand, présenté par des cellules spécialisées (CPA cellules présentatrices d'antigène) sont suivies par un processus d'adhésion et d'étalement cellulaire caractérisé par d'importantes réorganisations à l'échelle supramoléculaire et cellulaire. Le rôle des propriétés physiques des cellules à ces échelles est encore mal compris. Dans cette thèse, nous nous sommes intéressés aux événements suivant cette reconnaissance en mimant la CPA par des substrats artificiels contrôlés exploitant plusieurs techniques de microscopie avancé. Nous avons réalisé une étude systématique de la dynamique d'étalement ainsi que de la morphologie (en terme d'aire d'adhésion et d'organisation de l'actine) des lymphocytes T humains de la lignée Jurkat sur des substrats présentant des anti-CD3 (un ligand spécifique du RCT) mobiles ou non. L'étalement des LT est fortement réduit sur les ligands mobiles par rapport aux ligands fixes. De plus le blocage de la myosine-II ou l'inclusion d'ICAM (le ligand des intégrines LFA-1) sur les substrats permettent de compenser ces différences. Nous proposons un modèle, inspiré de ceux sur la migration ou la croissance du cône neuronal , qui lie la dynamique du front d'étalement des lymphocytes T à la friction générée au niveau de la surface en tirant ou en fixant les ligands
T- cells play a central role in cell mediated adaptive immune response. They are a class of lymphocytes that carry distinctive receptors - the TCRs (T cell receptor), which are responsible for specific recognition of foreign peptides in the body. Molecular interactions between the TCR complex and its ligand is followed by cell adhesion and spreading accompanied by dramatic changes at molecular and cellular scale. In this thesis we focus on the events that immediately follow recognition. I report a systematic study of the spreading dynamics and morphology (in terms of adhesion area and actin organization) of T lymphocytes on substrates with mobile or immobilized anti-CD3 (a ligand targeting the TCR complex). The spreading behaviour is seen to be dramatically different on the two types of substrates. Interestingly, on blocking myosin-II or by inclusion of ICAM (ligand of LFA1 integrins) on the substrate, these differences tend to disappear. We propose a model, partially inspired by earlier models of neuronal growth cones and filopodia, that links the dynamics of the leading edge of the spreading T cell to the friction generated at the surface by dragging or pinning of the ligands. I also report studies on T cells interacting with substrates decorated with nano-scale islands of anti-CD3 in a sea of repulsive PEG or a supported lipid bilayer. Dramatic differences in adhesion, organization of actin, and receptor distribution are observed on different geometries. I report advances in multi channel RICM towards the reconstruction of not only the topography of the proximal membrane of the T cell with high level of confidence but also the distal surface of lamellipodia

La thèse présentée est divisée en cinq chapitres qui traitent de la synthèse, de la réactivité, des structures et du comportement dynamique des molécules étudiées. Trois problèmes concernant la chimie des complexes acétylénique dinucléaire du molybdène ont été étudiés: leur capacité à former des radicaux est partir d'espèces neutres ou d'ions carbenium par réduction chimique et électrochimique. Cette chimie a été jusqu'à présent relativement peu étudiée. Les résultats obtenus laissent présager un intérêt synthétique à cette chimie radicalaire des complexes binucléaires acétyléniques. La réactivité vis-à-vis de nucléophiles chargés ou non d'ions carbenium du molybdène. La possibilité d'obtenir des précurseurs de nouveaux ligands cyclopentadienyle possédant un cluster binucléaire du molybdène a été mise en évidence. La chimie des dérivés allenylidene binucléaire du molybdène. Une voie d'accès originale et générale a ces dérivés a été décrite. Ils ont été étudiés de façon détaillée sur le plan structural (structure rx) et théorique (calculs ehmo)

Ce travail est une contribution à l'étude de la dynamique de cycles de substrats, un trait d'union entre l'empirisme et la théorie. Les modèles proposés représentent ou prédisent les faits expérimentaux mais dans un langage non empirique. Le choix des modèles expérimentaux tient compte de cette démarche. Dans une première partie, nous avons fait une approche théorique et expérimentale des systèmes cycliques binaires simples. Le système modèle comporte deux enzymes ayant une cinétique Michaelienne et le phénomène à mettre en évidence est l'amplification. Dans la deuxième partie, nous avons couplé un cycle binaire comportant une non-linéarité avec un transfert de masse. Une des deux enzymes présente une cinétique avec inhibition par excès de substrat. Nous avons mis en évidence l'existence d'états stationnaires multiples présentant des phénomènes de bistabilité ou de transitions irréversibles. Dans la troisième partie, nous avons étudié notre deuxième modèle selon la théorie du contrôle métabolique. Notre but n'était pas de trouver des comportements nouveaux, sinon de faire par une méthode l'étude d'un cycle de substrats. Dans ce cas, l'évolution des coefficients de contrôle est comparée à l'évolution des différents états stationnaires.